New URL for NEMO forge!   http://forge.nemo-ocean.eu

Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
This present forge is now archived and remained online for history.
sedrst.F90 in trunk/NEMO/TOP_SRC/SED – NEMO

source: trunk/NEMO/TOP_SRC/SED/sedrst.F90 @ 1179

Last change on this file since 1179 was 1179, checked in by cetlod, 16 years ago

add new routines for the sediment model, see ticket:249
File size: 8.9 KB
Line 
1MODULE sedrst
2#if defined key_sed
3   !!======================================================================
4   !!                       *** MODULE sedrst ***
5   !!   Read and write the restart files for sediment
6   !!======================================================================
7
8   !!----------------------------------------------------------------------
9   !! * Modules used
10   !! ==============
11   USE sed
12   USE sedarr
13
14
15   !! * Accessibility
16   IMPLICIT NONE
17   PRIVATE
18
19   !! * Accessibility
20   PUBLIC sed_rst_read
21   PUBLIC sed_rst_write
22
23   !! * Module variables
24   INTEGER, PUBLIC ::   numrsr, numrsw   !: logical unit for sed restart (read and write)
25   
26   
27CONTAINS
28
29
30   SUBROUTINE sed_rst_read 
31      !!----------------------------------------------------------------------
32      !!                   ***  ROUTINE sed_rst_read  ***
33      !!
34      !! ** Purpose :  Initialization of sediment module
35      !!               - sets initial sediment composition
36      !!                 ( only clay or reading restart file )
37      !!
38      !!   History :
39      !!        !  06-07  (C. Ethe)  original
40      !!----------------------------------------------------------------------
41      !! * Modules used
42      USE iom
43
44      !! * local declarations
45      INTEGER :: &
46         ji, jk, jn
47      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpksed,jptrased) :: &
48         zdta
49
50      REAL(wp), DIMENSION(:,:), ALLOCATABLE :: &
51         zhipor
52
53      REAL(wp) :: zkt
54      CHARACTER(len = 20)  ::  cltra
55      !--------------------------------------------------------------------
56 
57
58      WRITE(numsed,*) ' '     
59      WRITE(numsed,*) ' Initilization of Sediment components from restart'
60      WRITE(numsed,*) ' '
61
62      ALLOCATE( zhipor(jpoce,jpksed) ) 
63
64      CALL iom_open( 'restart_sed', numrsr, kiolib = jprstlib )     
65      CALL iom_get( numrsr, 'kt'     , zkt      )   ! time-step
66 
67      DO jn = 1, jptrased - 1
68         cltra = sedtrc3d(jn)
69         CALL iom_get( numrsr, jpdom_unknown, cltra, zdta(:,:,:,jn), &
70            &          kstart=(/1,1,1/), kcount=(/jpi,jpj,jpksed/) )
71      ENDDO
72       
73
74      CALL pack_arr( jpoce, solcp(1:jpoce,1:jpksed,jsopal), &
75         &            zdta(1:jpi,1:jpj,1:jpksed,1), iarroce(1:jpoce) )
76
77      CALL pack_arr( jpoce, solcp(1:jpoce,1:jpksed,jsclay), &
78         &             zdta(1:jpi,1:jpj,1:jpksed,2), iarroce(1:jpoce) )
79
80      CALL pack_arr( jpoce, solcp(1:jpoce,1:jpksed,jspoc), &
81         &             zdta(1:jpi,1:jpj,1:jpksed,3), iarroce(1:jpoce) )
82
83      CALL pack_arr( jpoce, solcp(1:jpoce,1:jpksed,jscal), &
84         &             zdta(1:jpi,1:jpj,1:jpksed,4), iarroce(1:jpoce) )
85
86      CALL pack_arr( jpoce, pwcp(1:jpoce,1:jpksed,jwsil), &
87         &             zdta(1:jpi,1:jpj,1:jpksed,5), iarroce(1:jpoce) )
88
89
90      CALL pack_arr( jpoce, pwcp(1:jpoce,1:jpksed,jwoxy), &
91         &             zdta(1:jpi,1:jpj,1:jpksed,6), iarroce(1:jpoce) )
92
93
94      CALL pack_arr( jpoce, pwcp(1:jpoce,1:jpksed,jwdic), &
95         &             zdta(1:jpi,1:jpj,1:jpksed,7), iarroce(1:jpoce) )
96
97      CALL pack_arr( jpoce, pwcp(1:jpoce,1:jpksed,jwno3), &
98         &             zdta(1:jpi,1:jpj,1:jpksed,8), iarroce(1:jpoce) )
99
100      CALL pack_arr( jpoce, pwcp(1:jpoce,1:jpksed,jwpo4), &
101         &             zdta(1:jpi,1:jpj,1:jpksed,9), iarroce(1:jpoce) )
102
103      CALL pack_arr( jpoce, pwcp(1:jpoce,1:jpksed,jwalk), &
104         &             zdta(1:jpi,1:jpj,1:jpksed,10), iarroce(1:jpoce) )
105
106      CALL pack_arr( jpoce, pwcp(1:jpoce,1:jpksed,jwc13), &
107         &             zdta(1:jpi,1:jpj,1:jpksed,11), iarroce(1:jpoce) )
108
109      zhipor(:,:) = 0.
110      CALL pack_arr( jpoce, zhipor(1:jpoce,1:jpksed), &
111         &             zdta(1:jpi,1:jpj,1:jpksed,12), iarroce(1:jpoce) )
112
113      ! Initialization of [h+] in mol/kg
114      DO jk = 1, jpksed
115         DO ji = 1, jpoce
116            hipor (ji,jk) = 10.**( -1. * zhipor(ji,jk) )
117         ENDDO
118      ENDDO
119     
120      CALL pack_arr( jpoce, co3por(1:jpoce,1:jpksed), &
121         &             zdta(1:jpi,1:jpj,1:jpksed,13), iarroce(1:jpoce) )
122
123      ! Initialization of sediment composant only ie jk=2 to jk=jpksed
124      ! ( nothing in jk=1)
125      solcp(1:jpoce,1,:) = 0.
126      pwcp (1:jpoce,1,:) = 0.
127
128      DEALLOCATE( zhipor )
129     
130   END SUBROUTINE sed_rst_read
131
132
133   SUBROUTINE sed_rst_write( kt )
134      !!----------------------------------------------------------------------
135      !!                   ***  ROUTINE sed_rst_write  ***
136      !!
137      !! ** Purpose :  save field which are necessary for sediment restart
138      !!
139      !!   History :
140      !!        !  06-07  (C. Ethe)  original
141      !!----------------------------------------------------------------------
142      !!* Modules used
143      USE ioipsl
144      !! *Arguments
145      INTEGER, INTENT(in) ::   kt       ! number of iteration
146      !! * local declarations
147
148      CHARACTER (len=50) :: clname,cln
149
150      INTEGER ::  &
151         ic,jc,jn,      &
152         itime
153
154     REAL(wp) ::  &
155         zdate0
156
157     REAL(wp), DIMENSION(1) :: &
158        zinfo
159
160      CHARACTER(len = 20)  ::  cltra 
161
162      INTEGER   :: ji, jk
163      REAL(wp), DIMENSION(:,:) , ALLOCATABLE  :: zdta   
164      !! -----------------------------------------------------------------------
165
166      ALLOCATE( zdta(jpoce,jpksed) )
167
168      IF( MOD(kt,nstock) == 0 .OR. kt == nitsedend ) THEN
169         
170         !! 0. initialisations
171         !! ------------------
172         
173         IF(lwp) WRITE(numsed,*) ' '
174         IF(lwp) WRITE(numsed,*) 'sed_rst_write : write the sediment restart file in NetCDF format ',   &
175            'at it= ',kt
176         IF(lwp) WRITE(numsed,*) '~~~~~~~~~'
177         
178         !! 1. WRITE in nutwrs
179         !! ------------------
180
181         ic = 1
182         DO jc = 1,16
183            IF( cexper(jc:jc) /= ' ') ic = jc
184         END DO
185         WRITE( cln,'("_",i4.4,i2.2,i2.2,"_restart.sed")') nyear, nmonth, nday
186         clname = cexper(1:ic)//cln
187         itime = 0
188         CALL ymds2ju( nyear, nmonth, nday, 0.0, zdate0 )
189         CALL restini( 'NONE', jpi, jpj, glamt, gphit, jpksed, dz, &
190            &         clname, itime, zdate0, dtsed*nstock, numrsw, domain_id=nidom )
191         zinfo(1) = REAL( kt)
192         CALL restput( numrsw, 'kt', 1,1, 1,0, zinfo  )
193
194
195
196         ! Back to 2D geometry
197         CALL unpack_arr( jpoce, trcsedi(1:jpi,1:jpj,1:jpksed,1) , iarroce(1:jpoce), &
198            &                    solcp(1:jpoce,1:jpksed,jsopal ) )
199         
200         CALL unpack_arr( jpoce, trcsedi(1:jpi,1:jpj,1:jpksed,2) , iarroce(1:jpoce), &
201            &                    solcp(1:jpoce,1:jpksed,jsclay ) )
202         
203         CALL unpack_arr( jpoce, trcsedi(1:jpi,1:jpj,1:jpksed,3) , iarroce(1:jpoce), &
204            &                    solcp(1:jpoce,1:jpksed,jspoc  ) )
205         
206         CALL unpack_arr( jpoce, trcsedi(1:jpi,1:jpj,1:jpksed,4) , iarroce(1:jpoce), &
207            &                    solcp(1:jpoce,1:jpksed,jscal  ) )   
208         
209         CALL unpack_arr( jpoce, trcsedi(1:jpi,1:jpj,1:jpksed,5) , iarroce(1:jpoce), &
210            &                    pwcp(1:jpoce,1:jpksed,jwsil  )  )
211         
212         CALL unpack_arr( jpoce, trcsedi(1:jpi,1:jpj,1:jpksed,6)  , iarroce(1:jpoce), &
213            &                    pwcp(1:jpoce,1:jpksed,jwoxy  ) )
214         
215         CALL unpack_arr( jpoce, trcsedi(1:jpi,1:jpj,1:jpksed,7)  , iarroce(1:jpoce), &
216            &                    pwcp(1:jpoce,1:jpksed,jwdic  ) )
217         
218         CALL unpack_arr( jpoce, trcsedi(1:jpi,1:jpj,1:jpksed,8)  , iarroce(1:jpoce), &
219            &                    pwcp(1:jpoce,1:jpksed,jwno3  ) )
220         
221         CALL unpack_arr( jpoce, trcsedi(1:jpi,1:jpj,1:jpksed,9)  , iarroce(1:jpoce), &
222            &                    pwcp(1:jpoce,1:jpksed,jwpo4  ) )
223         
224         CALL unpack_arr( jpoce, trcsedi(1:jpi,1:jpj,1:jpksed,10)  , iarroce(1:jpoce), &
225            &                    pwcp(1:jpoce,1:jpksed,jwalk  ) )
226         
227         CALL unpack_arr( jpoce, trcsedi(1:jpi,1:jpj,1:jpksed,11)  , iarroce(1:jpoce), &
228         &                    pwcp(1:jpoce,1:jpksed,jwc13  ) )
229         
230         ! porosity
231         zdta(:,:) = 0.
232         DO jk = 1, jpksed
233            DO ji = 1, jpoce
234               zdta(ji,jk) = -LOG10( hipor(ji,jk) / densSW(ji) )
235            ENDDO
236         ENDDO
237         CALL unpack_arr( jpoce, trcsedi(1:jpi,1:jpj,1:jpksed,12)  , iarroce(1:jpoce), &
238            &                   zdta(1:jpoce,1:jpksed)  )
239         
240         CALL unpack_arr( jpoce, trcsedi(1:jpi,1:jpj,1:jpksed,13)  , iarroce(1:jpoce), &
241            &                   co3por(1:jpoce,1:jpksed)  )
242     
243         ! prognostic variables
244         ! --------------------
245
246
247         DO jn = 1, jptrased - 1
248            cltra = sedtrc3d(jn)
249            CALL restput( numrsw, cltra, jpi, jpj, jpksed, 0, trcsedi(:,:,:,jn) )
250         ENDDO
251
252         CALL restclo( numrsw )
253
254      ENDIF
255
256      DEALLOCATE( zdta ) 
257         
258   END SUBROUTINE sed_rst_write
259#else
260   !!======================================================================
261   !! MODULE sedrst :   Dummy module
262   !!======================================================================
263
264#endif
265
266END MODULE sedrst
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.