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trclsm.pisces.h90 in trunk/NEMO/TOP_SRC/SMS – NEMO

source: trunk/NEMO/TOP_SRC/SMS/trclsm.pisces.h90 @ 719

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  • Property svn:eol-style set to native
  • Property svn:executable set to *
  • Property svn:keywords set to Author Date Id Revision
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Line 
1!!----------------------------------------------------------------------
2!!                    ***  trclsm.pisces.h90 ***
3!!----------------------------------------------------------------------
4CONTAINS
5
6   SUBROUTINE trc_lsm
7      !!----------------------------------------------------------------------
8      !!
9      !!                       trclsm.pisces.h
10      !!                       ****************
11      !!
12      !!  PURPOSE :
13      !!  ---------
14      !!     READs and PRINT options for PISCES namelist
15      !!
16      !!   MODIFICATIONS:
17      !!   --------------
18      !!      original  : 99-10 (M.A. Foujols, M. Levy) passive tracer
19      !!      addition  : 00-01 (L. Bopp) hamocc3,p3zd
20      !!     
21      !!----------------------------------------------------------------------
22      !!----------------------------------------------------------------------
23      !! local declarations
24      !! ==================
25      CHARACTER (len=32) clname
26
27      !!---------------------------------------------------------------------
28      !!  TOP 1.0 , LOCEAN-IPSL (2005)
29   !! $Header$
30   !! This software is governed by the CeCILL licence see modipsl/doc/NEMO_CeCILL.txt
31      !!---------------------------------------------------------------------
32
33      ! 0. initializations
34      ! ------------------
35      !
36      NAMELIST/natext/ atcco2
37      NAMELIST/natbio/caco3r, kdca, nca, part,                       &
38         &          dispo0,conc0,oxymin,grosip, sedlam,              &
39         &          sedlostpoc,sedlostcal,sedlostsil,nrdttrc,        &
40         &          pislope, excret,wsbio,wchl,wchld,resrat,mprat,mzrat,   &
41         &          grazrat,xprefc,xprefp,unass,xkgraz,xkmort,xksi1, &
42         &          xksi2,xremip,xremik,xsirem,xkdoc1,xkdoc2, &
43         &          excret2,resrat2,mprat2,mpratm,mzrat2,grazrat2,   &
44         &          xprefz,xprefpoc,unass2,xkgraz2,xlam1,      &
45         &          ferat3,conc1,conc2,conc3,concnnh4,concdnh4,      &
46         &          nitrif,epsher,epsher2,pislope2,wsbio2,sigma1,    &
47         &          sigma2, zprefc, zprefp, zprefd,fecnm,fecdm,      &
48         &          chlcnm,chlcdm, sedfeinput
49      NAMELIST/natsms/bdustfer, briver, bndepo, bsedinput
50#if defined key_trc_kriest
51      NAMELIST/natkriest/xkr_eta,xkr_zeta,xkr_sfact,xkr_mass_min,xkr_mass_max,&
52         &               xkr_dnano,xkr_ddiat,xkr_dmeso,xkr_daggr,xkr_stick
53#endif
54
55      ! initialize the number of LOGICAL UNIT used
56      ! ------------------------------------------
57
58      IF(lwp) THEN
59         WRITE(numout,*) ' '
60         WRITE(numout,*) ' ROUTINE trclec'
61         WRITE(numout,*) ' **************'
62         WRITE(numout,*) ' '
63         WRITE(numout,*) ' namelist for PISCES model'
64         WRITE(numout,*) ' ***********************'
65         WRITE(numout,*) ' '
66      ENDIF
67
68      clname ='namelist.trc.sms'
69      CALL ctlopn( numnat, clname, 'OLD', 'FORMATTED', 'SEQUENTIAL',   &
70         &           1, numout, .FALSE., 1 )
71
72      ! 1 Namelist natext :
73      ! -------------------
74      READ(numnat,natext)
75
76      IF(lwp) THEN
77         WRITE(numout,*) ' '
78         WRITE(numout,*) 'natext'
79         WRITE(numout,*) ' '
80         WRITE(numout,*) 'atmospheric pCO2= ',atcco2
81         WRITE(numout,*) ' '
82      ENDIF
83
84
85      READ(numnat,natbio)
86      IF(lwp) THEN
87         WRITE(numout,*) 'natbio'
88         WRITE(numout,*) ' '
89         WRITE(numout,*)      &
90            &   ' mean rainratio                             =', caco3r
91         WRITE(numout,*)      &
92            &   ' diss. rate constant calcite (per month)    =', kdca
93         WRITE(numout,*)      &
94            &   ' order of reaction for calcite dissolution  =', nca
95         WRITE(numout,*)      &
96            &   ' part of calcite not dissolved in guts      =', part
97         WRITE(numout,*)      &
98            &   ' mean Si/C ratio                            =', grosip
99         WRITE(numout,*)      &
100            &   ' Calcite dissolution half saturation        =', dispo0
101         WRITE(numout,*)      &
102            &   ' Phosphate half saturation                  =', conc0
103         WRITE(numout,*)      &
104            &   ' Sediment bioturbation factor               =', sedlam
105         WRITE(numout,*)      &
106            &   ' Sediment burying ratio for POC             =', sedlostpoc
107         WRITE(numout,*)      &
108            &   ' Sediment burying ratio for CACO3           =', sedlostcal
109         WRITE(numout,*)      &
110            &   ' Sediment burying ratio for SI              =', sedlostsil
111         WRITE(numout,*)      &
112            &   ' frequence pour la biologie                 =', nrdttrc
113         WRITE(numout,*)      &
114            &   ' P-I slope                                  =', pislope
115         WRITE(numout,*)      &
116            &   ' excretion ratio of phytoplankton           =', excret
117         WRITE(numout,*)      &
118            &   ' POC sinking speed                          =', wsbio
119         WRITE(numout,*)      &
120            &   ' quadratic mortality of phytoplankton       =', wchl
121         WRITE(numout,*)      &
122            &   ' maximum quadratic mortality of diatoms     =', wchld
123         WRITE(numout,*)      &
124            &   ' exsudation rate of zooplankton             =', resrat
125         WRITE(numout,*)      &
126            &   ' phytoplankton mortality rate               =', mprat
127         WRITE(numout,*)      &
128            &   ' zooplankton mortality rate                 =', mzrat
129         WRITE(numout,*)      &
130            &   ' zoo preference for phyto                   =', xprefc
131         WRITE(numout,*)      &
132            &   ' zoo preference for POC                     =', xprefp
133         WRITE(numout,*)      &
134            &   ' maximal zoo grazing rate                   =', grazrat
135         WRITE(numout,*)      &
136            &   ' non assimilated fraction of phyto by zoo   =', unass
137         WRITE(numout,*)      &
138            &   ' half sturation constant for grazing        =', xkgraz
139         WRITE(numout,*)      &
140            &   ' half saturation constant for mortality     =', xkmort
141         WRITE(numout,*)      &
142            &   ' half saturation constant for Si uptake     =', xksi1
143         WRITE(numout,*)      &
144            &   ' half saturation constant for Si/C          =', xksi2
145         WRITE(numout,*)      &
146            &   ' remineralisation rate of POC               =', xremip
147         WRITE(numout,*)      &
148            &   ' remineralization rate of DOC               =', xremik
149         WRITE(numout,*)      &
150            &   ' remineralization rate of Si                =', xsirem
151         WRITE(numout,*)      &
152            &   ' 1st half-sat. of DOC remineralization      =', xkdoc1
153         WRITE(numout,*)      &
154            &   ' 2nd half-sat. of DOC remineralization      =', xkdoc2
155         WRITE(numout,*)      &
156            &   ' excretion ratio of diatoms                 =', excret2
157         WRITE(numout,*)      &
158            &   ' exsudation rate of mesozooplankton         =', resrat2
159         WRITE(numout,*)      &
160            &   ' Diatoms mortality rate                     =', mprat2
161         WRITE(numout,*)      &
162            &   ' Phytoplankton minimum mortality rate       =', mpratm
163         WRITE(numout,*)      &
164            &   ' mesozooplankton mortality rate             =', mzrat2
165         WRITE(numout,*)      &
166            &   ' zoo preference for zoo                     =', xprefz
167         WRITE(numout,*)      &
168            &   ' zoo preference for poc                   =', xprefpoc
169         WRITE(numout,*)      &
170            &   ' maximal mesozoo grazing rate               =', grazrat2
171         WRITE(numout,*)      &
172            &   ' non assimilated fraction of P by mesozoo   =', unass2
173         WRITE(numout,*)      &
174            &   ' Efficicency of Mesozoo growth              =', epsher2
175         WRITE(numout,*)      &
176            &   ' Efficiency of microzoo growth              =', epsher
177         WRITE(numout,*)      &
178            &   ' half sturation constant for grazing 2      =', xkgraz2
179         WRITE(numout,*)      &
180            &   ' Maximum aggregation rate for diatoms       =', wchld
181         WRITE(numout,*)      &
182            &   ' scavenging rate of Iron                    =', xlam1
183         WRITE(numout,*)      &
184            &   ' Fe/C in zooplankton                        =', ferat3
185         WRITE(numout,*)      &
186            &   ' Phosphate half saturation for diatoms      =', conc1
187         WRITE(numout,*)      &
188            &   ' Iron half saturation for phyto             =', conc2
189         WRITE(numout,*)      &
190            &   ' Iron half saturation for diatoms           =', conc3
191         WRITE(numout,*)      &
192            &   ' NH4 half saturation for phyto              =', concnnh4
193         WRITE(numout,*)      &
194            &   ' NH4 half saturation for diatoms            =', concdnh4
195         WRITE(numout,*)      &
196            &   ' NH4 nitrification rate                     =', nitrif
197         WRITE(numout,*)      &
198            &   ' P-I slope  for diatoms                     =', pislope2
199         WRITE(numout,*)      &
200            &   ' Big particles sinking speed                =', wsbio2
201         WRITE(numout,*)      &
202            &   ' Fraction of microzoo excretion as DOM      =', sigma1
203         WRITE(numout,*)      &
204            &   ' Fraction of mesozoo excretion as DOM       =', sigma2
205         WRITE(numout,*)      &
206            &   ' Microzoo preference for POM                =', zprefc
207         WRITE(numout,*)      &
208            &   ' Microzoo preference for Nanophyto          =', zprefp
209         WRITE(numout,*)      &
210            &   ' Microzoo preference for Diatoms          =', zprefd
211         WRITE(numout,*)      &
212            &   ' Minimum Chl/C in nanophytoplankton         =', chlcnm
213         WRITE(numout,*)      &
214            &   ' Minimum Chl/C in diatoms                   =', chlcdm
215         WRITE(numout,*)      &
216            &   ' Maximum Fe/C in nanophytoplankton          =', fecnm
217         WRITE(numout,*)      &
218            &   ' Minimum Fe/C in diatoms                    =', fecdm
219         WRITE(numout,*)      &
220            &   ' Coastal release of Iron                 =', sedfeinput
221      ENDIF
222
223      READ(numnat,natsms)
224      IF(lwp) THEN
225         WRITE(numout,*) ' '
226         WRITE(numout,*) 'natsms'
227         WRITE(numout,*) ' '
228         WRITE(numout,*) 'Dust input from the atmosphere : ', bdustfer
229         WRITE(numout,*) ' '
230         WRITE(numout,*) 'River input of nutrients : ', briver
231         WRITE(numout,*) ' '
232         WRITE(numout,*) 'Atmospheric deposition of N : ', bndepo
233         WRITE(numout,*) ' '
234         WRITE(numout,*) 'Fe input from sediments : ', bsedinput
235         WRITE(numout,*) ' '
236      ENDIF
237
238#if defined key_trc_kriest
239
240      READ(numnat,natkriest)
241      IF(lwp) THEN
242         WRITE(numout,*) ' '
243         WRITE(numout,*) 'natkriest'
244         WRITE(numout,*) ' '
245         WRITE(numout,*) 'Sinking  exponent                    xkr_eta       = ', xkr_eta
246         WRITE(numout,*) 'N content exponent                   xkr_zeta      = ', xkr_zeta
247         WRITE(numout,*) 'Sinking factor                       xkr_sfact     = ', xkr_sfact
248         WRITE(numout,*) 'Stickiness                           xkr_stick     = ', xkr_stick
249         WRITE(numout,*) 'Minimum mass for Aggregates          xkr_mass_min  = ', xkr_mass_min
250         WRITE(numout,*) 'Maximum mass for Aggregates          xkr_mass_max  = ', xkr_mass_max
251         WRITE(numout,*) 'Size of particles in nano pool       xkr_dnano     = ', xkr_dnano
252         WRITE(numout,*) 'Size of particles in diatoms pool    xkr_ddiat     = ', xkr_ddiat
253         WRITE(numout,*) 'Size of particles in mesozoo pool    xkr_dmeso     = ', xkr_dmeso
254         WRITE(numout,*) 'Size of particles in aggregates pool xkr_daggr     = ', xkr_daggr
255     ENDIF
256
257
258     ! Computation of some variables
259     xkr_massp     = 5.7E-6 * 7.6 * xkr_mass_min**xkr_zeta
260     ! max and min vertical particle speed
261     xkr_wsbio_min = xkr_sfact * xkr_mass_min**xkr_eta
262     xkr_wsbio_max = xkr_sfact * xkr_mass_max**xkr_eta
263     WRITE(numout,*) ' max and min vertical particle speed ',xkr_wsbio_min,xkr_wsbio_max
264     !
265     !    effect of the sizes of the different living pools on particle numbers
266     !    nano = 2um-20um -> mean size=6.32 um -> ws=2.596 -> xnum=xnnano=2.337
267     !    diat and microzoo = 10um-200um -> 44.7 -> 8.732 -> xnum=xndiat=3.718
268     !    mesozoo = 200um-2mm -> 632.45 -> 45.14 -> xnum=xnmeso=7.147
269     !    aggregates = 200um-10mm -> 1414 -> 74.34 -> xnum=xnaggr=9.877
270     !    doc aggregates = 1um
271     ! ----------------------------------------------------------
272
273     xkr_nnano = 1. / ( xkr_massp * xkr_dnano )
274     xkr_ndiat = 1. / ( xkr_massp * xkr_ddiat )
275     xkr_nmeso = 1. / ( xkr_massp * xkr_dmeso )
276     xkr_naggr = 1. / ( xkr_massp * xkr_daggr )
277   
278
279#endif
280
281   END SUBROUTINE trc_lsm
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.