New URL for NEMO forge!   http://forge.nemo-ocean.eu

Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
This present forge is now archived and remained online for history.
Changeset 11222 for NEMO/branches/2019/dev_r11219_TOP-01_cethe_PISCES_LBC/cfgs – NEMO

Ignore:
Timestamp:
2019-07-05T16:52:07+02:00 (5 years ago)
Author:
cetlod
Message:

PISCES_LBC : 1st step of dev

Location:
NEMO/branches/2019/dev_r11219_TOP-01_cethe_PISCES_LBC/cfgs
Files:
4 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • NEMO/branches/2019/dev_r11219_TOP-01_cethe_PISCES_LBC/cfgs/ORCA2_OFF_PISCES/EXPREF/namelist_pisces_cfg

    r10227 r11222  
    8383&nampissbc     !   parameters for inputs deposition 
    8484!----------------------------------------------------------------------- 
     85   sn_dust     = 'dust.orca.new'       ,     -1            , 'dust'        ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     86   ln_ironsed  =  .true.   ! boolean for Fe input from sediments 
     87   ln_ironice  =  .true.   ! boolean for Fe input from sea ice 
     88   ln_hydrofe  =  .true.   ! boolean for from hydrothermal vents 
     89/ 
     90!----------------------------------------------------------------------- 
     91&nampissed     !   parameters for sediments mobilization 
     92!----------------------------------------------------------------------- 
    8593/ 
    8694!----------------------------------------------------------------------- 
  • NEMO/branches/2019/dev_r11219_TOP-01_cethe_PISCES_LBC/cfgs/ORCA2_OFF_PISCES/EXPREF/namelist_top_cfg

    r10375 r11222  
    2020! 
    2121   ln_trcdta     =  .true.  !  Initialisation from data input file (T) or not (F) 
    22 !                !           !                                         !            !                               ! 
    23 !                !    name   !           title of the field            !   units    ! initial data from file or not !  
    24    sn_tracer(1)   = 'DIC     ' , 'Dissolved inorganic Concentration      ',  'mol-C/L' ,  .true. 
    25    sn_tracer(2)   = 'Alkalini' , 'Total Alkalinity Concentration         ',  'eq/L '   ,  .true. 
    26    sn_tracer(3)   = 'O2      ' , 'Dissolved Oxygen Concentration         ',  'mol-C/L' ,  .true. 
    27    sn_tracer(4)   = 'CaCO3   ' , 'Calcite Concentration                  ',  'mol-C/L' ,  .false. 
    28    sn_tracer(5)   = 'PO4     ' , 'Phosphate Concentration                ',  'mol-C/L' ,  .true. 
    29    sn_tracer(6)   = 'POC     ' , 'Small organic carbon Concentration     ',  'mol-C/L' ,  .false. 
    30    sn_tracer(7)   = 'Si      ' , 'Silicate Concentration                 ',  'mol-C/L' ,  .true. 
    31    sn_tracer(8)   = 'PHY     ' , 'Nanophytoplankton Concentration        ',  'mol-C/L' ,  .false. 
    32    sn_tracer(9)   = 'ZOO     ' , 'Microzooplankton Concentration         ',  'mol-C/L' ,  .false. 
    33    sn_tracer(10)  = 'DOC     ' , 'Dissolved organic Concentration        ',  'mol-C/L' ,  .true. 
    34    sn_tracer(11)  = 'PHY2    ' , 'Diatoms Concentration                  ',  'mol-C/L' ,  .false. 
    35    sn_tracer(12)  = 'ZOO2    ' , 'Mesozooplankton Concentration          ',  'mol-C/L' ,  .false. 
    36    sn_tracer(13)  = 'DSi     ' , 'Diatoms Silicate Concentration         ',  'mol-C/L' ,  .false. 
    37    sn_tracer(14)  = 'Fer     ' , 'Dissolved Iron Concentration           ',  'mol-C/L' ,  .true. 
    38    sn_tracer(15)  = 'BFe     ' , 'Big iron particles Concentration       ',  'mol-C/L' ,  .false. 
    39    sn_tracer(16)  = 'GOC     ' , 'Big organic carbon Concentration       ',  'mol-C/L' ,  .false. 
    40    sn_tracer(17)  = 'SFe     ' , 'Small iron particles Concentration     ',  'mol-C/L' ,  .false. 
    41    sn_tracer(18)  = 'DFe     ' , 'Diatoms iron  Concentration            ',  'mol-C/L' ,  .false. 
    42    sn_tracer(19)  = 'GSi     ' , 'Sinking biogenic Silicate Concentration',  'mol-C/L' ,  .false. 
    43    sn_tracer(20)  = 'NFe     ' , 'Nano iron Concentration                ',  'mol-C/L' ,  .false. 
    44    sn_tracer(21)  = 'NCHL    ' , 'Nano chlorophyl Concentration          ',  'mol-C/L' ,  .false. 
    45    sn_tracer(22)  = 'DCHL    ' , 'Diatoms chlorophyl Concentration       ',  'mol-C/L' ,  .false. 
    46    sn_tracer(23)  = 'NO3     ' , 'Nitrates Concentration                 ',  'mol-C/L' ,  .true. 
    47    sn_tracer(24)  = 'NH4     ' , 'Ammonium Concentration                 ',  'mol-C/L' ,  .false. 
    48 / 
     22!                !           !                                           !             !         ! 
     23!                !    name   !           title of the field              !   units     ! init    ! sbc    ! cbc    !  obc !  
     24   sn_tracer(1)   = 'DIC     ' , 'Dissolved inorganic Concentration      ',  'mol-C/L' , .true.  , .false., .true., .false.  
     25   sn_tracer(2)   = 'Alkalini' , 'Total Alkalinity Concentration         ',  'eq/L '   , .true.  , .false. , .true., .false. 
     26   sn_tracer(3)   = 'O2      ' , 'Dissolved Oxygen Concentration         ',  'mol-C/L' , .true.  , .false., .false., .false  
     27   sn_tracer(4)   = 'CaCO3   ' , 'Calcite Concentration                  ',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false 
     28   sn_tracer(5)   = 'PO4     ' , 'Phosphate Concentration                ',  'mol-C/L' , .true.  , .true., .true., .false 
     29   sn_tracer(6)   = 'POC     ' , 'Small organic carbon Concentration     ',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false 
     30   sn_tracer(7)   = 'Si      ' , 'Silicate Concentration                 ',  'mol-C/L' , .true.  , .true., .true., .false 
     31   sn_tracer(8)   = 'PHY     ' , 'Nanophytoplankton Concentration        ',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false 
     32   sn_tracer(9)   = 'ZOO     ' , 'Microzooplankton Concentration         ',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false 
     33   sn_tracer(10)  = 'DOC     ' , 'Dissolved organic Concentration        ',  'mol-C/L' , .true.  , .false., .true., .false 
     34   sn_tracer(11)  = 'PHY2    ' , 'Diatoms Concentration                  ',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false 
     35   sn_tracer(12)  = 'ZOO2    ' , 'Mesozooplankton Concentration          ',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false 
     36   sn_tracer(13)  = 'DSi     ' , 'Diatoms Silicate Concentration         ',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false 
     37   sn_tracer(14)  = 'Fer     ' , 'Dissolved Iron Concentration           ',  'mol-C/L' , .true.  , .true., .true., .false 
     38   sn_tracer(15)  = 'BFe     ' , 'Big iron particles Concentration       ',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false 
     39   sn_tracer(16)  = 'GOC     ' , 'Big organic carbon Concentration       ',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false 
     40   sn_tracer(17)  = 'SFe     ' , 'Small iron particles Concentration     ',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false 
     41   sn_tracer(18)  = 'DFe     ' , 'Diatoms iron  Concentration            ',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false 
     42   sn_tracer(19)  = 'GSi     ' , 'Sinking biogenic Silicate Concentration',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false 
     43   sn_tracer(20)  = 'NFe     ' , 'Nano iron Concentration                ',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false 
     44   sn_tracer(21)  = 'NCHL    ' , 'Nano chlorophyl Concentration          ',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false 
     45   sn_tracer(22)  = 'DCHL    ' , 'Diatoms chlorophyl Concentration       ',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false 
     46   sn_tracer(23)  = 'NO3     ' , 'Nitrates Concentration                 ',  'mol-C/L' , .true.  , .true., .true., .false 
     47   sn_tracer(24)  = 'NH4     ' , 'Ammonium Concentration                 ',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false 
     48 
    4949!----------------------------------------------------------------------- 
    5050&namage          !   AGE  
     
    107107&namtrc_bc       !   data for boundary conditions 
    108108!----------------------------------------------------------------------- 
     109!                !  file name        ! frequency (hours) ! variable      ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
     110!                !                   !  (if <0  months)  !   name        !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
     111   sn_trcsbc(5)  = 'dust.orca.new'   ,       -1          , 'dustpo4'     ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     112   sn_trcsbc(7)  = 'dust.orca.new'   ,       -1          , 'dustsi'      ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     113   sn_trcsbc(14) = 'dust.orca.new'   ,       -1          , 'dustfer'     ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     114   sn_trcsbc(23) = 'ndeposition.orca',      -12          , 'ndep'        ,  .false.     , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     115   rn_trsfac(5)  = 8.264e-02   !  (  0.021 / 31. * 122 ) 
     116   rn_trsfac(7)  = 3.313e-01     !  ( 8.8   / 28.1 ) 
     117   rn_trsfac(14) = 6.266e-04   !  (  0.035 / 55.85 ) 
     118   rn_trsfac(23) =  5.4464e-01  !  ( From kgN m-2 s-1 to molC l-1 ====> zfact = 7.625/14 ) 
     119   rn_sbc_time   =  1.          !  Time scaling factor for SBC and CBC data (seconds in a day) 
     120   ! 
     121   sn_trccbc(1)  = 'river.orca'      ,    120            , 'riverdic'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     122   sn_trccbc(2)  = 'river.orca'      ,    120            , 'riverdic'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     123   sn_trccbc(5)  = 'river.orca'      ,    120            , 'riverdip'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     124   sn_trccbc(7)  = 'river.orca'      ,    120            , 'riverdsi'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     125   sn_trccbc(10) = 'river.orca'      ,    120            , 'riverdoc'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     126   sn_trccbc(14) = 'river.orca'      ,    120            , 'riverdic'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     127   sn_trccbc(23) = 'river.orca'      ,    120            , 'riverdin'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     128   rn_trcfac(1)  = 8.333e+01   !  ( data in Mg/m2/yr : 1e3/12/ryyss) 
     129   rn_trcfac(2)  = 8.333e+01   !  ( 1e3 /12 ) 
     130   rn_trcfac(5)  = 3.935e+04   !  ( 1e3 / 31. * 122 ) 
     131   rn_trcfac(7)  = 3.588e+01   !  ( 1e3 / 28.1 ) 
     132   rn_trcfac(10) = 8.333e+01   !  ( 1e3 / 12 
     133   rn_trcfac(14) = 4.166e-03   !  ( 1e3 / 12 * 5e-5 ) 
     134   rn_trcfac(23) = 5.446e+02   !  (  1e3 / 14 * 7.625 ) 
     135   rn_cbc_time   = 3.1536e+7   !  Time scaling factor for CBC data (seconds in a year) 
    109136/ 
    110137!---------------------------------------------------------------------- 
  • NEMO/branches/2019/dev_r11219_TOP-01_cethe_PISCES_LBC/cfgs/SHARED/namelist_pisces_ref

    r10721 r11222  
    343343/ 
    344344!----------------------------------------------------------------------- 
    345 &nampissbc     !   parameters for inputs deposition 
     345&nampisbc     !   parameters for inputs deposition 
    346346!----------------------------------------------------------------------- 
    347347!              !  file name        ! frequency (hours) ! variable      ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
    348348!              !                   !  (if <0  months)  !   name        !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
    349349   sn_dust     = 'dust.orca'       ,     -1            , 'dust'        ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
    350    sn_solub    = 'solubility.orca' ,    -12            , 'solubility1' ,  .false.     , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
    351    sn_riverdic = 'river.orca'      ,    120            , 'riverdic'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
    352    sn_riverdoc = 'river.orca'      ,    120            , 'riverdoc'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
    353    sn_riverdin = 'river.orca'      ,    120            , 'riverdin'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
    354    sn_riverdon = 'river.orca'      ,    120            , 'riverdon'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
    355    sn_riverdip = 'river.orca'      ,    120            , 'riverdip'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
    356    sn_riverdop = 'river.orca'      ,    120            , 'riverdop'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
    357    sn_riverdsi = 'river.orca'      ,    120            , 'riverdsi'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
    358    sn_ndepo    = 'ndeposition.orca',    -12            , 'ndep'        ,  .false.     , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
    359350   sn_ironsed  = 'bathy.orca'      ,    -12            , 'bathy'       ,  .false.     , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
    360351   sn_hydrofe  = 'hydrofe.orca'    ,    -12            , 'epsdb'       ,  .false.     , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
    361352! 
    362353   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the dynamical files 
    363    ln_dust     =  .true.   ! boolean for dust input from the atmosphere 
    364    ln_solub    =  .true.   ! boolean for variable solubility of atm. Iron 
    365    ln_river    =  .true.   ! boolean for river input of nutrients 
    366    ln_ndepo    =  .true.   ! boolean for atmospheric deposition of N 
    367354   ln_ironsed  =  .true.   ! boolean for Fe input from sediments 
    368355   ln_ironice  =  .true.   ! boolean for Fe input from sea ice 
     
    370357   sedfeinput  =  2.e-9    ! Coastal release of Iron 
    371358   distcoast   =  5.e3     ! Distance off the coast for Iron from sediments 
    372    dustsolub   =  0.02     ! Solubility of the dusta 
    373359   mfrac       =  0.035    ! Fe mineral fraction of dust 
    374360   wdust       =  2.0      ! Dust sinking speed  
    375361   icefeinput  =  15.e-9   ! Iron concentration in sea ice 
     362   hratio      =  1.e+7    ! Fe to 3He ratio assumed for vent iron supply  
     363!                          ! ln_ligand 
     364   lgw_rath    =  0.5      ! Weak ligand ratio from sed hydro sources  
     365/ 
     366!----------------------------------------------------------------------- 
     367&nampissed     !   parameters for sediments mobilization 
     368!----------------------------------------------------------------------- 
    376369   nitrfix     =  1.e-7    ! Nitrogen fixation rate 
    377370   diazolight  =  50.      ! Diazotrophs sensitivity to light (W/m2) 
    378371   concfediaz  =  1.e-10   ! Diazotrophs half-saturation Cste for Iron 
    379    hratio      =  1.e+7    ! Fe to 3He ratio assumed for vent iron supply  
    380 !                          ! ln_ligand 
    381    lgw_rath    =  0.5      ! Weak ligand ratio from sed hydro sources  
    382372/ 
    383373!----------------------------------------------------------------------- 
  • NEMO/branches/2019/dev_r11219_TOP-01_cethe_PISCES_LBC/cfgs/SHARED/namelist_top_ref

    r10375 r11222  
    135135   cn_dir_obc    =  './'     !  root directory for the location of OPEN data files 
    136136   ln_rnf_ctl    = .false.   !  Remove runoff dilution on tracers with absent river load 
    137    rn_bc_time    =  86400.   !  Time scaling factor for SBC and CBC data (seconds in a day) 
     137   rn_sbc_time   =  86400.   !  Time scaling factor for SBC data (seconds in a day) 
     138   rn_cbc_time   =  86400.   !  Time scaling factor for CBC data (seconds in a day) 
    138139/ 
    139140!---------------------------------------------------------------------- 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.