New URL for NEMO forge!   http://forge.nemo-ocean.eu

Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
This present forge is now archived and remained online for history.
Changeset 12928 for NEMO/branches/2019/dev_r11078_OSMOSIS_IMMERSE_Nurser/cfgs/ORCA2_OFF_PISCES/EXPREF – NEMO

Ignore:
Timestamp:
2020-05-14T21:46:00+02:00 (4 years ago)
Author:
smueller
Message:

Synchronizing with /NEMO/trunk@12925 (ticket #2170)

Location:
NEMO/branches/2019/dev_r11078_OSMOSIS_IMMERSE_Nurser
Files:
1 deleted
5 edited
2 copied

Legend:

Unmodified
Added
Removed

  • NEMO/branches/2019/dev_r11078_OSMOSIS_IMMERSE_Nurser

    • Property svn:externals

      •  

        old new  
        66^/vendors/FCM@HEAD            ext/FCM 
        77^/vendors/IOIPSL@HEAD         ext/IOIPSL 
         8 
         9# SETTE 
         10^/utils/CI/sette@HEAD         sette 

  • NEMO/branches/2019/dev_r11078_OSMOSIS_IMMERSE_Nurser/cfgs/ORCA2_OFF_PISCES/EXPREF/context_nemo.xml

    r12178 r12928  
    55--> 
    66<context id="nemo"> 
    7 <!-- $id$ --> 
     7    <!-- $id$ --> 
    88    <variable_definition> 
    9     <!-- Year of time origin for NetCDF files; defaults to 1800 --> 
    10        <variable id="ref_year" type="int"   > 1800 </variable> 
    11        <variable id="rau0"     type="float" > 1026.0 </variable> 
    12        <variable id="cpocean"  type="float" > 3991.86795711963 </variable> 
    13        <variable id="convSpsu" type="float" > 0.99530670233846  </variable> 
    14        <variable id="rhoic"    type="float" > 917.0 </variable> 
    15        <variable id="rhosn"    type="float" > 330.0 </variable> 
    16        <variable id="missval"  type="float" > 1.e20 </variable> 
     9       <!-- Year/Month/Day of time origin for NetCDF files; defaults to 1800-01-01 --> 
     10       <variable id="ref_year"  type="int"> 1900 </variable> 
     11       <variable id="ref_month" type="int"> 01 </variable> 
     12       <variable id="ref_day"   type="int"> 01 </variable> 
     13       <variable id="rau0"      type="float" > 1026.0 </variable> 
     14       <variable id="cpocean"   type="float" > 3991.86795711963 </variable> 
     15       <variable id="convSpsu"  type="float" > 0.99530670233846  </variable> 
     16       <variable id="rhoic"     type="float" > 917.0 </variable> 
     17       <variable id="rhosn"     type="float" > 330.0 </variable> 
     18       <variable id="missval"   type="float" > 1.e20 </variable> 
    1719    </variable_definition> 
     20 
    1821<!-- Fields definition --> 
    19     <field_definition src="./field_def_nemo-oce.xml"/>   <!--  Ocean biology                     --> 
    20     <field_definition src="./field_def_nemo-pisces.xml"/>   <!--  Ocean biology                     --> 
     22    <field_definition src="./field_def_nemo-oce.xml"/>    <!--  NEMO ocean dynamics     --> 
     23    <field_definition src="./field_def_nemo-pisces.xml"/> <!--  NEMO ocean biology      --> 
    2124 
    2225<!-- Files definition --> 
    23     <file_definition src="./file_def_nemo.xml"/>     <!--  NEMO ocean dynamics                     --> 
    24     <!--  
    25 ============================================================================================================ 
    26 = grid definition = = DO NOT CHANGE = 
    27 ============================================================================================================ 
    28     --> 
    29      
    30     <axis_definition> 
    31       <axis id="deptht"  long_name="Vertical T levels" unit="m" positive="down" /> 
    32       <axis id="depthu"  long_name="Vertical U levels" unit="m" positive="down" /> 
    33       <axis id="depthv"  long_name="Vertical V levels" unit="m" positive="down" /> 
    34       <axis id="depthw"  long_name="Vertical W levels" unit="m" positive="down" /> 
    35       <axis id="profsed" long_name="Vertical S levels" unit="cm" positive="down"/> 
    36       <axis id="nfloat"  long_name="Float number"      unit="-"                 /> 
    37       <axis id="icbcla"  long_name="Iceberg class"     unit="1"                 /> 
    38       <axis id="ncatice" long_name="Ice category"      unit="1"                 /> 
    39       <axis id="iax_20C" long_name="20 degC isotherm"  unit="degC"              /> 
    40       <axis id="iax_28C" long_name="28 degC isotherm"  unit="degC"              /> 
    41     </axis_definition> 
     26    <file_definition src="./file_def_nemo-pisces.xml"/>  <!--  NEMO ocean biology       --> 
     27 
     28 
     29<!-- Axis definition --> 
     30    <axis_definition src="./axis_def_nemo.xml"/> 
    4231  
     32<!-- Domain definition --> 
    4333    <domain_definition src="./domain_def_nemo.xml"/> 
     34 
     35<!-- Grids definition --> 
     36    <grid_definition   src="./grid_def_nemo.xml"/> 
    4437   
    45     <grid_definition src="./grid_def_nemo.xml"/> 
    46      
     38 
    4739</context> 

  • NEMO/branches/2019/dev_r11078_OSMOSIS_IMMERSE_Nurser/cfgs/ORCA2_OFF_PISCES/EXPREF/namelist_cfg

    r12178 r12928  
    3434   ln_linssh   = .true.   !  =T  linear free surface  ==>>  model level are fixed in time 
    3535   ! 
    36    rn_rdt      = 21600.     !  time step for the dynamics and tracer 
     36   rn_Dt      = 21600.     !  time step for the dynamics and tracer 
    3737/ 
    3838!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    377377!!   namdiu       Cool skin and warm layer models                       (default: OFF) 
    378378!!   namflo       float parameters                                      (default: OFF) 
    379 !!   nam_diaharm  Harmonic analysis of tidal constituents               (default: OFF) 
    380379!!   nam_diadct   transports through some sections                      (default: OFF) 
    381 !!   nam_diatmb   Top Middle Bottom Output                              (default: OFF) 
    382380!!   nam_dia25h   25h Mean Output                                       (default: OFF) 
    383381!!   namnc4       netcdf4 chunking and compression settings             ("key_netcdf4") 
    … …  
    405403/ 
    406404!----------------------------------------------------------------------- 
    407 &nam_diaharm   !   Harmonic analysis of tidal constituents              (default: OFF) 
    408 !----------------------------------------------------------------------- 
    409 / 
    410 !----------------------------------------------------------------------- 
    411405&nam_diadct    !   transports through some sections                     (default: OFF) 
    412 !----------------------------------------------------------------------- 
    413 / 
    414 !----------------------------------------------------------------------- 
    415 &nam_diatmb    !  Top Middle Bottom Output                              (default: OFF) 
    416406!----------------------------------------------------------------------- 
    417407/ 

  • NEMO/branches/2019/dev_r11078_OSMOSIS_IMMERSE_Nurser/cfgs/ORCA2_OFF_PISCES/EXPREF/namelist_pisces_cfg

    r10227 r12928  
    8181/ 
    8282!----------------------------------------------------------------------- 
    83 &nampissbc     !   parameters for inputs deposition 
     83&nampisbc      !   parameters for inputs deposition 
     84!----------------------------------------------------------------------- 
     85   sn_dust     = 'dust.orca.new'       ,     -1            , 'dust'        ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     86   ln_ironsed  =  .true.   ! boolean for Fe input from sediments 
     87   ln_ironice  =  .true.   ! boolean for Fe input from sea ice 
     88   ln_hydrofe  =  .true.   ! boolean for from hydrothermal vents 
     89/ 
     90!----------------------------------------------------------------------- 
     91&nampissed     !   parameters for sediments mobilization 
    8492!----------------------------------------------------------------------- 
    8593/ 

  • NEMO/branches/2019/dev_r11078_OSMOSIS_IMMERSE_Nurser/cfgs/ORCA2_OFF_PISCES/EXPREF/namelist_top_cfg

    r12178 r12928  
    1919   ln_c14        =  .false. 
    2020! 
    21    ln_trcdta     =  .true.  !  Initialisation from data input file (T) or not (F) 
    22 !                !           !                                         !            !                               ! 
    23 !                !    name   !           title of the field            !   units    ! initial data from file or not !  
    24    sn_tracer(1)   = 'DIC     ' , 'Dissolved inorganic Concentration      ',  'mol-C/L' ,  .true. 
    25    sn_tracer(2)   = 'Alkalini' , 'Total Alkalinity Concentration         ',  'eq/L '   ,  .true. 
    26    sn_tracer(3)   = 'O2      ' , 'Dissolved Oxygen Concentration         ',  'mol-C/L' ,  .true. 
    27    sn_tracer(4)   = 'CaCO3   ' , 'Calcite Concentration                  ',  'mol-C/L' ,  .false. 
    28    sn_tracer(5)   = 'PO4     ' , 'Phosphate Concentration                ',  'mol-C/L' ,  .true. 
    29    sn_tracer(6)   = 'POC     ' , 'Small organic carbon Concentration     ',  'mol-C/L' ,  .false. 
    30    sn_tracer(7)   = 'Si      ' , 'Silicate Concentration                 ',  'mol-C/L' ,  .true. 
    31    sn_tracer(8)   = 'PHY     ' , 'Nanophytoplankton Concentration        ',  'mol-C/L' ,  .false. 
    32    sn_tracer(9)   = 'ZOO     ' , 'Microzooplankton Concentration         ',  'mol-C/L' ,  .false. 
    33    sn_tracer(10)  = 'DOC     ' , 'Dissolved organic Concentration        ',  'mol-C/L' ,  .true. 
    34    sn_tracer(11)  = 'PHY2    ' , 'Diatoms Concentration                  ',  'mol-C/L' ,  .false. 
    35    sn_tracer(12)  = 'ZOO2    ' , 'Mesozooplankton Concentration          ',  'mol-C/L' ,  .false. 
    36    sn_tracer(13)  = 'DSi     ' , 'Diatoms Silicate Concentration         ',  'mol-C/L' ,  .false. 
    37    sn_tracer(14)  = 'Fer     ' , 'Dissolved Iron Concentration           ',  'mol-C/L' ,  .true. 
    38    sn_tracer(15)  = 'BFe     ' , 'Big iron particles Concentration       ',  'mol-C/L' ,  .false. 
    39    sn_tracer(16)  = 'GOC     ' , 'Big organic carbon Concentration       ',  'mol-C/L' ,  .false. 
    40    sn_tracer(17)  = 'SFe     ' , 'Small iron particles Concentration     ',  'mol-C/L' ,  .false. 
    41    sn_tracer(18)  = 'DFe     ' , 'Diatoms iron  Concentration            ',  'mol-C/L' ,  .false. 
    42    sn_tracer(19)  = 'GSi     ' , 'Sinking biogenic Silicate Concentration',  'mol-C/L' ,  .false. 
    43    sn_tracer(20)  = 'NFe     ' , 'Nano iron Concentration                ',  'mol-C/L' ,  .false. 
    44    sn_tracer(21)  = 'NCHL    ' , 'Nano chlorophyl Concentration          ',  'mol-C/L' ,  .false. 
    45    sn_tracer(22)  = 'DCHL    ' , 'Diatoms chlorophyl Concentration       ',  'mol-C/L' ,  .false. 
    46    sn_tracer(23)  = 'NO3     ' , 'Nitrates Concentration                 ',  'mol-C/L' ,  .true. 
    47    sn_tracer(24)  = 'NH4     ' , 'Ammonium Concentration                 ',  'mol-C/L' ,  .false. 
     21   ln_trcdta     =  .true.   !  Initialisation from data input file (T) or not (F) 
     22   ln_trcbc      =  .false.  !  Enables Boundary conditions 
     23!                !           !                                           !             !         ! 
     24!                !    name   !           title of the field              !   units     ! init    ! sbc    ! cbc    !  obc  !  
     25   sn_tracer(1)   = 'DIC     ' , 'Dissolved inorganic Concentration      ',  'mol-C/L' , .true.  , .false., .true. , .false.  
     26   sn_tracer(2)   = 'Alkalini' , 'Total Alkalinity Concentration         ',  'eq/L '   , .true.  , .false., .true. , .false. 
     27   sn_tracer(3)   = 'O2      ' , 'Dissolved Oxygen Concentration         ',  'mol-C/L' , .true.  , .false., .false., .false.  
     28   sn_tracer(4)   = 'CaCO3   ' , 'Calcite Concentration                  ',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false. 
     29   sn_tracer(5)   = 'PO4     ' , 'Phosphate Concentration                ',  'mol-C/L' , .true.  , .true. , .true. , .false. 
     30   sn_tracer(6)   = 'POC     ' , 'Small organic carbon Concentration     ',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false. 
     31   sn_tracer(7)   = 'Si      ' , 'Silicate Concentration                 ',  'mol-C/L' , .true.  , .true. , .true. , .false. 
     32   sn_tracer(8)   = 'PHY     ' , 'Nanophytoplankton Concentration        ',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false. 
     33   sn_tracer(9)   = 'ZOO     ' , 'Microzooplankton Concentration         ',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false. 
     34   sn_tracer(10)  = 'DOC     ' , 'Dissolved organic Concentration        ',  'mol-C/L' , .true.  , .false., .true. , .false. 
     35   sn_tracer(11)  = 'PHY2    ' , 'Diatoms Concentration                  ',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false. 
     36   sn_tracer(12)  = 'ZOO2    ' , 'Mesozooplankton Concentration          ',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false. 
     37   sn_tracer(13)  = 'DSi     ' , 'Diatoms Silicate Concentration         ',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false. 
     38   sn_tracer(14)  = 'Fer     ' , 'Dissolved Iron Concentration           ',  'mol-C/L' , .true.  , .true. , .true. , .false. 
     39   sn_tracer(15)  = 'BFe     ' , 'Big iron particles Concentration       ',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false. 
     40   sn_tracer(16)  = 'GOC     ' , 'Big organic carbon Concentration       ',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false. 
     41   sn_tracer(17)  = 'SFe     ' , 'Small iron particles Concentration     ',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false. 
     42   sn_tracer(18)  = 'DFe     ' , 'Diatoms iron  Concentration            ',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false. 
     43   sn_tracer(19)  = 'GSi     ' , 'Sinking biogenic Silicate Concentration',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false. 
     44   sn_tracer(20)  = 'NFe     ' , 'Nano iron Concentration                ',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false. 
     45   sn_tracer(21)  = 'NCHL    ' , 'Nano chlorophyl Concentration          ',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false. 
     46   sn_tracer(22)  = 'DCHL    ' , 'Diatoms chlorophyl Concentration       ',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false. 
     47   sn_tracer(23)  = 'NO3     ' , 'Nitrates Concentration                 ',  'mol-C/L' , .true.  , .true. , .true. , .false. 
     48   sn_tracer(24)  = 'NH4     ' , 'Ammonium Concentration                 ',  'mol-C/L' , .false. , .false., .false., .false. 
    4849/ 
    4950!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    107108&namtrc_bc       !   data for boundary conditions 
    108109!----------------------------------------------------------------------- 
     110!                !  file name        ! frequency (hours) ! variable      ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
     111!                !                   !  (if <0  months)  !   name        !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
     112   sn_trcsbc(5)  = 'dust.orca.new'   ,       -1          , 'dustpo4'     ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     113   sn_trcsbc(7)  = 'dust.orca.new'   ,       -1          , 'dustsi'      ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     114   sn_trcsbc(14) = 'dust.orca.new'   ,       -1          , 'dustfer'     ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     115   sn_trcsbc(23) = 'ndeposition.orca',      -12          , 'ndep'        ,  .false.     , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     116   rn_trsfac(5)  = 8.264e-02   !  (  0.021 / 31. * 122 ) 
     117   rn_trsfac(7)  = 3.313e-01     !  ( 8.8   / 28.1 ) 
     118   rn_trsfac(14) = 6.266e-04   !  (  0.035 / 55.85 ) 
     119   rn_trsfac(23) =  5.4464e-01  !  ( From kgN m-2 s-1 to molC l-1 ====> zfact = 7.625/14 ) 
     120   rn_sbc_time   =  1.          !  Time scaling factor for SBC and CBC data (seconds in a day) 
     121   ! 
     122   sn_trccbc(1)  = 'river.orca'      ,    120            , 'riverdic'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     123   sn_trccbc(2)  = 'river.orca'      ,    120            , 'riverdic'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     124   sn_trccbc(5)  = 'river.orca'      ,    120            , 'riverdip'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     125   sn_trccbc(7)  = 'river.orca'      ,    120            , 'riverdsi'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     126   sn_trccbc(10) = 'river.orca'      ,    120            , 'riverdoc'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     127   sn_trccbc(14) = 'river.orca'      ,    120            , 'riverdic'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     128   sn_trccbc(23) = 'river.orca'      ,    120            , 'riverdin'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     129   rn_trcfac(1)  = 8.333e+01   !  ( data in Mg/m2/yr : 1e3/12/ryyss) 
     130   rn_trcfac(2)  = 8.333e+01   !  ( 1e3 /12 ) 
     131   rn_trcfac(5)  = 3.935e+04   !  ( 1e3 / 31. * 122 ) 
     132   rn_trcfac(7)  = 3.588e+01   !  ( 1e3 / 28.1 ) 
     133   rn_trcfac(10) = 8.333e+01   !  ( 1e3 / 12 
     134   rn_trcfac(14) = 4.166e-03   !  ( 1e3 / 12 * 5e-5 ) 
     135   rn_trcfac(23) = 5.446e+02   !  (  1e3 / 14 * 7.625 ) 
     136   rn_cbc_time   = 3.1536e+7   !  Time scaling factor for CBC data (seconds in a year) 
    109137/ 
    110138!---------------------------------------------------------------------- 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.