New URL for NEMO forge!   http://forge.nemo-ocean.eu

Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
This present forge is now archived and remained online for history.
Changeset 13571 for NEMO/branches/2020/dev_r13296_HPC-07_mocavero_mpi3/src/SAS – NEMO

Ignore:
Timestamp:
2020-10-06T18:17:44+02:00 (4 years ago)
Author:
mocavero
Message:

Align branch with trunk

Location:
NEMO/branches/2020/dev_r13296_HPC-07_mocavero_mpi3/src/SAS
Files:
2 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • NEMO/branches/2020/dev_r13296_HPC-07_mocavero_mpi3/src/SAS/nemogcm.F90

    r13286 r13571  
    22   !!====================================================================== 
    33   !!                       ***  MODULE nemogcm   *** 
    4    !! StandAlone Surface module : surface fluxes + sea-ice + iceberg floats 
     4   !! StandAlone Surface module : surface fluxes + sea-ice + iceberg floats + ABL 
    55   !!====================================================================== 
    66   !! History :  3.6  ! 2011-11  (S. Alderson, G. Madec) original code 
     
    5858 
    5959#if defined key_mpp_mpi 
     60   ! need MPI_Wtime 
    6061   INCLUDE 'mpif.h' 
    6162#endif 
     
    8384      !!---------------------------------------------------------------------- 
    8485      INTEGER ::   istp   ! time step index 
     86      REAL(wp)::   zstptiming   ! elapsed time for 1 time step 
    8587      !!---------------------------------------------------------------------- 
    8688      ! 
     
    9395#if defined key_agrif 
    9496      Kbb_a = Nbb; Kmm_a = Nnn; Krhs_a = Nrhs   ! agrif_oce module copies of time level indices 
    95       CALL Agrif_Declare_Var       !  "      "   "   "      "  DYN/TRA  
     97      CALL Agrif_Declare_Var       !  "      "   "   "      "  DYN/TRA 
    9698# if defined key_top 
    9799      CALL Agrif_Declare_Var_top   !  "      "   "   "      "  TOP 
     
    107109      !                            !==   time stepping   ==! 
    108110      !                            !-----------------------! 
     111      ! 
     112      !                                               !== set the model time-step  ==! 
     113      ! 
    109114      istp = nit000 
    110115      ! 
     
    124129      END DO 
    125130      ! 
    126 #else 
     131# else 
    127132      ! 
    128133      IF( .NOT.ln_diurnal_only ) THEN                 !==  Standard time-stepping  ==! 
    129134         ! 
    130135         DO WHILE( istp <= nitend .AND. nstop == 0 ) 
    131 #if defined key_mpp_mpi 
     136 
    132137            ncom_stp = istp 
    133             IF ( istp == ( nit000 + 1 ) ) elapsed_time = MPI_Wtime() 
    134             IF ( istp ==         nitend ) elapsed_time = MPI_Wtime() - elapsed_time 
    135 #endif 
     138            IF( ln_timing ) THEN 
     139               zstptiming = MPI_Wtime() 
     140               IF ( istp == ( nit000 + 1 ) ) elapsed_time = zstptiming 
     141               IF ( istp ==         nitend ) elapsed_time = zstptiming - elapsed_time 
     142            ENDIF 
     143             
    136144            CALL stp        ( istp )  
    137145            istp = istp + 1 
     146 
     147            IF( lwp .AND. ln_timing )   WRITE(numtime,*) 'timing step ', istp-1, ' : ', MPI_Wtime() - zstptiming 
     148 
    138149         END DO 
    139150         ! 
     
    305316         WRITE(numout,*) "       )  )       \) |`\ \)  '.   \      (   (   " 
    306317         WRITE(numout,*) "      (  (           \_/       '-._\      )   )  " 
    307          WRITE(numout,*) "       )  ) jgs                    `     (   (   " 
     318         WRITE(numout,*) "       )  ) jgs                     `    (   (   " 
    308319         WRITE(numout,*) "     ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ " 
    309320         WRITE(numout,*) 
     
    355366      ! 
    356367      !                                      ! General initialization 
    357       IF( ln_timing    )   CALL timing_init     ! timing 
     368      IF( ln_timing    )   CALL timing_init ( 'timing_sas.output' ) 
    358369      IF( ln_timing    )   CALL timing_start( 'nemo_init') 
    359370 
     
    367378         &                 CALL prt_ctl_init        ! Print control 
    368379       
     380      IF( ln_rstart )      CALL rst_read_open 
    369381                           CALL day_init        ! model calendar (using both namelist and restart infos) 
    370       IF( ln_rstart )      CALL rst_read_open 
    371  
     382 
     383#if defined key_agrif 
     384      uu(:,:,:,:) = 0.0_wp   ;   vv(:,:,:,:) = 0.0_wp   ;   ts(:,:,:,:,:) = 0.0_wp   ! needed for interp done at initialization phase 
     385#endif  
    372386      !                                      ! external forcing  
    373387                           CALL sbc_init( Nbb, Nnn, Naa )  ! Forcings : surface module  
     
    480494      ierr =        dia_wri_alloc() 
    481495      ierr = ierr + dom_oce_alloc()          ! ocean domain 
    482       ierr = ierr + oce_alloc    ()          ! (tsn...) needed for agrif and/or SI3 and bdy 
     496      ierr = ierr + oce_alloc    ()          ! (ts...) needed for agrif and/or SI3 and bdy 
    483497      ierr = ierr + bdy_oce_alloc()          ! bdy masks (incl. initialization) 
    484498      ! 
  • NEMO/branches/2020/dev_r13296_HPC-07_mocavero_mpi3/src/SAS/stpctl.F90

    r13136 r13571  
    2020   USE dom_oce         ! ocean space and time domain variables  
    2121   USE ice      , ONLY : vt_i, u_ice, tm_i 
     22   USE phycst   , ONLY : rt0 
     23   USE sbc_oce  , ONLY : lk_oasis 
    2224   ! 
    2325   USE diawri          ! Standard run outputs       (dia_wri_state routine) 
     
    4850      !! 
    4951      !! ** Method  : - Save the time step in numstp 
    50       !!              - Print it each 50 time steps 
    5152      !!              - Stop the run IF problem encountered by setting nstop > 0 
    5253      !!                Problems checked: ice thickness maximum > 100 m 
     
    8586         ENDIF 
    8687         !                                ! open time.step    ascii file, done only by 1st subdomain 
    87          IF( lwm )   CALL ctl_opn( numstp, 'time.step', 'REPLACE', 'FORMATTED', 'SEQUENTIAL', -1, numout, lwp, narea ) 
     88         IF( lk_oasis ) THEN   ;   clname = 'time_sas.step' 
     89         ELSE                  ;   clname = 'time.step' 
     90         ENDIF 
     91         IF( lwm )   CALL ctl_opn( numstp, clname, 'REPLACE', 'FORMATTED', 'SEQUENTIAL', -1, numout, lwp, narea ) 
    8892         ! 
    8993         IF( ll_wrtruns ) THEN 
     94            IF( lk_oasis ) THEN   ;   clname = 'run_sas.stat' 
     95            ELSE                  ;   clname = 'run.stat' 
     96            ENDIF 
    9097            !                             ! open run.stat     ascii file, done only by 1st subdomain 
    91             CALL ctl_opn( numrun, 'run.stat', 'REPLACE', 'FORMATTED', 'SEQUENTIAL', -1, numout, lwp, narea ) 
     98            CALL ctl_opn( numrun, clname, 'REPLACE', 'FORMATTED', 'SEQUENTIAL', -1, numout, lwp, narea ) 
    9299            !                             ! open run.stat.nc netcdf file, done only by 1st subdomain 
    93             clname = 'run.stat.nc' 
     100            clname = TRIM(clname)//'.nc' 
    94101            IF( .NOT. Agrif_Root() )   clname = TRIM(Agrif_CFixed())//"_"//TRIM(clname) 
    95102            istatus = NF90_CREATE( TRIM(clname), NF90_CLOBBER, nrunid ) 
     
    111118      !                                   !==            test of local extrema           ==! 
    112119      !                                   !==  done by all processes at every time step  ==! 
    113       llmsk(:,:) = tmask(:,:,1) == 1._wp 
     120      ! 
     121      llmsk(   1:Nis1,:) = .FALSE.                                              ! exclude halos from the checked region 
     122      llmsk(Nie1: jpi,:) = .FALSE. 
     123      llmsk(:,   1:Njs1) = .FALSE. 
     124      llmsk(:,Nje1: jpj) = .FALSE. 
     125      ! 
     126      llmsk(Nis0:Nie0,Njs0:Nje0) = tmask(Nis0:Nie0,Njs0:Nje0,1) == 1._wp   ! test only the inner domain 
    114127      IF( COUNT( llmsk(:,:) ) > 0 ) THEN   ! avoid huge values sent back for land processors... 
    115          zmax(1) = MAXVAL(      vt_i (:,:)            , mask = llmsk )   ! max ice thickness 
    116          zmax(2) = MAXVAL( ABS( u_ice(:,:) )          , mask = llmsk )   ! max ice velocity (zonal only) 
    117          zmax(3) = MAXVAL(     -tm_i (:,:) + 273.15_wp, mask = llmsk )   ! min ice temperature 
     128         zmax(1) = MAXVAL(      vt_i (:,:)      , mask = llmsk )   ! max ice thickness 
     129         zmax(2) = MAXVAL( ABS( u_ice(:,:) )    , mask = llmsk )   ! max ice velocity (zonal only) 
     130         zmax(3) = MAXVAL(     -tm_i (:,:) + rt0, mask = llmsk )   ! min ice temperature (in degC) 
    118131      ELSE 
    119132         IF( ll_colruns ) THEN    ! default value: must not be kept when calling mpp_max -> must be as small as possible 
     
    154167            IF( lwm .AND. kt /= nitend )   istatus = NF90_CLOSE(nrunid) 
    155168            ! get global loc on the min/max 
    156             CALL mpp_maxloc( 'stpctl',      vt_i(:,:)            , tmask(:,:,1), zzz, iloc(1:2,1) )   ! mpp_maxloc ok if mask = F  
    157             CALL mpp_maxloc( 'stpctl',ABS( u_ice(:,:) )          , tmask(:,:,1), zzz, iloc(1:2,2) ) 
    158             CALL mpp_minloc( 'stpctl',      tm_i(:,:) - 273.15_wp, tmask(:,:,1), zzz, iloc(1:2,3) ) 
     169            CALL mpp_maxloc( 'stpctl',      vt_i(:,:)      , llmsk, zzz, iloc(1:2,1) )   ! mpp_maxloc ok if mask = F  
     170            CALL mpp_maxloc( 'stpctl',ABS( u_ice(:,:) )    , llmsk, zzz, iloc(1:2,2) ) 
     171            CALL mpp_minloc( 'stpctl',      tm_i(:,:) - rt0, llmsk, zzz, iloc(1:2,3) ) 
    159172            ! find which subdomain has the max. 
    160173            iareamin(:) = jpnij+1   ;   iareamax(:) = 0   ;   iareasum(:) = 0 
     
    169182         ELSE                    ! find local min and max locations: 
    170183            ! if we are here, this means that the subdomain contains some oce points -> no need to test the mask used in maxloc 
    171             iloc(1:2,1) = MAXLOC(       vt_i(:,:)            , mask = llmsk ) + (/ nimpp - 1, njmpp - 1/) 
    172             iloc(1:2,2) = MAXLOC( ABS( u_ice(:,:) )          , mask = llmsk ) + (/ nimpp - 1, njmpp - 1/) 
    173             iloc(1:2,3) = MINLOC(       tm_i(:,:) - 273.15_wp, mask = llmsk ) + (/ nimpp - 1, njmpp - 1/) 
     184            iloc(1:2,1) = MAXLOC(       vt_i(:,:)      , mask = llmsk ) 
     185            iloc(1:2,2) = MAXLOC( ABS( u_ice(:,:) )    , mask = llmsk ) 
     186            iloc(1:2,3) = MINLOC(       tm_i(:,:) - rt0, mask = llmsk ) 
     187            DO ji = 1, 3   ! local domain indices ==> global domain indices, excluding halos 
     188               iloc(1:2,ji) = (/ mig0(iloc(1,ji)), mjg0(iloc(2,ji)) /) 
     189            END DO 
    174190            iareamin(:) = narea   ;   iareamax(:) = narea   ;   iareasum(:) = 1         ! this is local information 
    175191         ENDIF 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.