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2012-11-28T17:06:02+01:00 (8 years ago)
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acc
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Branch dev_MERGE_2012. Tidying of iodef files and tools for SETTE.

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branches/2012/dev_MERGE_2012/NEMOGCM
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    r3707 r3715  
    2121    --> 
    2222     
    23     <file_definition type="multi_file" sync_freq="1d" min_digits="4"> 
     23    <file_definition type="multiple_file" sync_freq="1d" min_digits="4"> 
    2424     
    2525      <file_group id="1h" output_freq="1h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1h files --> 
     
    109109     <variable id="buffer_server_factor_size" type="integer">2</variable> 
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    111      <variable id="using_server"              type="boolean">true</variable> 
     111     <variable id="using_server"              type="boolean">false</variable> 
    112112     <variable id="using_oasis"               type="boolean">false</variable> 
    113113     <variable id="oasis_codes_id"            type="string" >oceanx</variable> 
  • branches/2012/dev_MERGE_2012/NEMOGCM/CONFIG/GYRE_PISCES/EXP00/iodef.xml

    r3707 r3715  
    2121    --> 
    2222     
    23     <file_definition type="multi_file" sync_freq="1d" min_digits="4"> 
     23    <file_definition type="multiple_file" sync_freq="1d" min_digits="4"> 
    2424     
    2525      <file_group id="1h" output_freq="1h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1h files --> 
     
    146146     <variable id="buffer_server_factor_size" type="integer">2</variable> 
    147147     <variable id="info_level"                type="integer">0</variable> 
    148      <variable id="using_server"              type="boolean">true</variable> 
     148     <variable id="using_server"              type="boolean">false</variable> 
    149149     <variable id="using_oasis"               type="boolean">false</variable> 
    150150     <variable id="oasis_codes_id"            type="string" >oceanx</variable> 
  • branches/2012/dev_MERGE_2012/NEMOGCM/SETTE/iodef_sette.xml

    r3651 r3715  
    11<?xml version="1.0"?> 
    22<simulation>  
    3    
    4   <context id="nemo"> 
     3 
     4 <context id="nemo" time_origin="1900-01-01 00:00:00" > 
    55     
    66    <!-- $id$ --> 
    7  
     7     
    88    <!--  
    99============================================================================================================ 
     
    1212============================================================================================================ 
    1313    --> 
    14      
    15     <field_definition level="1" prec="4" operation="ave(X)" enabled=".TRUE."> <!-- time step automaticaly defined --> 
    16  
    17       <!-- T grid --> 
    18        
    19       <group id="grid_T" axis_ref="none" grid_ref="grid_T"> 
    20    <field id="toce"         description="temperature"                               unit="degC" axis_ref="deptht"   /> 
    21          <field id="soce"         description="salinity"                                  unit="psu"  axis_ref="deptht"   /> 
    22    <field id="sst"          description="sea surface temperature"                   unit="degC"                     /> 
    23    <field id="sst2"         description="square of sea surface temperature"         unit="degC2"                    /> 
    24    <field id="sstgrad"      description="module of sst gradient"                    unit="degC/m"                   /> 
    25    <field id="sstgrad2"     description="square of module of sst gradient"          unit="degC2/m2"                 /> 
    26    <field id="sss"          description="sea surface salinity"                      unit="psu"                      /> 
    27    <field id="sss2"         description="square of sea surface salinity"            unit="psu2"                     /> 
    28    <field id="ssh"          description="sea surface height"                        unit="m"                        /> 
    29    <field id="ssh2"         description="square of sea surface height"              unit="m2"                       /> 
    30    <field id="mldkz5"       description="mixing layer depth (Turbocline)"           unit="m"                        /> 
    31    <field id="mldr10_1"     description="Mixed Layer Depth 0.01 ref.10m"            unit="m"                        /> 
    32          <field id="rhop"         description="potential density (sigma0)"                unit="kg/m3" axis_ref="deptht"  /> 
    33    <!-- next variables available with key_diahth --> 
    34    <field id="mlddzt"       description="Thermocline Depth (max dT/dz)"             unit="m"                        /> 
    35    <field id="mldr10_3"     description="Mixed Layer Depth dr=0.03 (ref.10m)"       unit="m"                        /> 
    36    <field id="mldr0_1"      description="Mixed Layer Depth dr=0.01 (ref.surf)"      unit="m"                        /> 
    37    <field id="mldr0_3"      description="Mixed Layer Depth dr=0.03 (ref.surf)"      unit="m"                        /> 
    38    <field id="mld_dt02"     description="Mixed Layer Depth |dt|=0.2 (ref.10m)"      unit="m"                        /> 
    39    <field id="topthdep"     description="Top of the thermocline dt=-0.2 (ref.10m)"  unit="m"                        /> 
    40    <field id="pycndep"      description="Pycnocline depth dr~dt=-0.2 (ref.10m)"     unit="m"                        /> 
    41    <field id="BLT"          description="Barrier Layer Thickness"                   unit="m"                        /> 
    42    <field id="tinv"         description="Max of vertical invertion of temperature"  unit="degC"                     /> 
    43    <field id="depti"        description="Depth of max. vert. inv. of temperature"   unit="m"                        /> 
    44         <field id="20d"          description="Depth of 20C isotherm"                     unit="m"                        /> 
    45    <field id="28d"          description="Depth of 28C isotherm"                     unit="m"                        /> 
    46    <field id="hc300"        description="Heat content 300 m"                        unit="W"                        /> 
    47    <!-- variables available with key_diaar5 --> 
    48    <field id="botpres"      description="Pressure at sea floor"                     unit="dbar"                     /> 
    49    <field id="cellthc"      description="Cell thickness"                            unit="m"     axis_ref="deptht"  /> 
    50      </group> 
    51  
    52       <!-- SBC --> 
    53        
    54       <group id="SBC" axis_ref="none" grid_ref="grid_T" > <!-- time step automaticaly defined based on nn_fsbc --> 
    55  
    56    <field id="empmr"        description="Net Upward Water Flux"                                        unit="kg/m2/s"  /> 
    57    <field id="saltflx"      description="Downward water flux"                                          unit="PSU/m2/s"  /> 
    58    <field id="snowpre"      description="Snow precipitation"                                           unit="kg/m2/s"  /> 
    59    <field id="runoffs"      description="River Runoffs"                                                unit="Kg/m2/s"  /> 
    60  
    61    <field id="qt"           description="Net Downward Heat Flux"                                       unit="W/m2"     /> 
    62    <field id="qns"          description="non solar Downward Heat Flux"                                 unit="W/m2"     /> 
    63    <field id="qsr"          description="Shortwave Radiation"                                          unit="W/m2"     /> 
    64    <field id="qsr3d"        description="Shortwave Radiation 3D distribution"        axis_ref="deptht" unit="W/m2"     /> 
    65    <field id="qrp"          description="Surface Heat Flux: Damping"                                   unit="W/m2"     /> 
    66    <field id="erp"          description="Surface Water Flux: Damping"                                  unit="Kg/m2/s"  /> 
    67    <field id="taum"         description="wind stress module"                                           unit="N/m2"     /> 
    68    <field id="wspd"         description="Wind speed module at 10 m"                                    unit="m/s"      /> 
    69  
    70         <!-- * variable relative to atmospheric pressure forcing : available with ln_apr_dyn --> 
    71         <field id="ssh_ib"       description="Inverse barometer sea surface height"                         unit="m"        /> 
    72     
    73    <!-- *_oce variables available with ln_blk_clio or ln_blk_core --> 
    74    <field id="qns_oce"      description="Non solar Downward Heat Flux over open ocean"                 unit="W/m2"     /> 
    75    <field id="qlw_oce"      description="Longwave Downward Heat Flux over open ocean"                  unit="W/m2"     /> 
    76    <field id="qsb_oce"      description="Sensible Downward Heat Flux over open ocean"                  unit="W/m2"     /> 
    77    <field id="qla_oce"      description="Latent Downward Heat Flux over open ocean"                    unit="W/m2"     /> 
    78         <field id="qhc_oce"      description="Downward Heat Content of E-P over open ocean"                 unit="W/m2"     /> 
    79    <field id="taum_oce"     description="wind stress module over open ocean"                           unit="N/m2"     /> 
    80  
    81    <field id="ice_cover"    description="Ice fraction"                                                 unit="1"        /> 
    82  
    83    <field id="ioceflxb"     description="Oceanic flux at the ice base"                                 unit="W/m2"     /> 
    84    <field id="qsr_ai_cea"   description="Air-Ice downward solar heat flux (cell average)"              unit="W/m2"     /> 
    85    <field id="qns_ai_cea"   description="Air-Ice downward non-solar heat flux (cell average)"          unit="W/m2"     /> 
    86    <field id="qla_ai_cea"   description="Air-Ice downward Latent heat flux (cell average)"             unit="W/m2"     /> 
    87     
    88    <field id="qsr_io_cea"   description="Ice-Oce downward solar heat flux (cell average)"              unit="W/m2"     /> 
    89    <field id="qns_io_cea"   description="Ice-Oce downward non-solar heat flux (cell average)"          unit="W/m2"     /> 
    90     
    91    <field id="snowthic_cea" description="Snow thickness (cell average)"                                unit="m"        /> 
    92    <field id="icethic_cea"  description="Ice thickness (cell average)"                                 unit="m"        /> 
    93    <field id="iceprod_cea"  description="Ice production (cell average)"                                unit="m/s"      /> 
    94     
    95    <field id="ice_pres"     description="Ice presence"                                                 unit="-"        /> 
    96    <field id="ist_cea"      description="Ice surface temperature (cell average)"                       unit="degC"     /> 
    97    <field id="ist_ipa"      description="Ice surface temperature (ice presence average)"               unit="degC"     />       
    98    <field id="uice_ipa"     description="Ice velocity along i-axis at I-point (ice presence average)"  unit="m/s"      />       
    99    <field id="vice_ipa"     description="Ice velocity along j-axis at I-point (ice presence average)"  unit="m/s"      />       
    100     
    101    <field id="utau_ice"     description="Wind stress along i-axis over the ice at i-point"             unit="N/m2"     /> 
    102    <field id="vtau_ice"     description="Wind stress along j-axis over the ice at i-point"             unit="N/m2"     /> 
    103     
    104    <field id="u_imasstr"    description="Sea-ice mass transport along i-axis"                          unit="kg/s"     /> 
    105    <field id="v_imasstr"    description="Sea-ice mass transport along j-axis"                          unit="kg/s"     /> 
    106  
    107    <!-- available if not defined key_vvl --> 
    108         <field id="emp_x_sst"      description="Concentration/Dilution term on SST"                         unit="kgC/m2/s" /> 
    109         <field id="emp_x_sss"      description="Concentration/Dilution term on SSS"                       unit="kgPSU/m2/s" /> 
    110    <!-- available key_coupled --> 
    111    <field id="snow_ao_cea"  description="Snow over ice-free ocean (cell average)"                      unit="kg/m2/s"  /> 
    112    <field id="snow_ai_cea"  description="Snow over sea-ice (cell average)"                             unit="kg/m2/s"  /> 
    113    <field id="subl_ai_cea"  description="Sublimation over sea-ice (cell average)"                      unit="kg/m2/s"  /> 
    114    <field id="icealb_cea"   description="Ice albedo (cell average)"                                    unit="1"        /> 
    115    <field id="calving"      description="Calving"                                                      unit="kg/m2/s"  /> 
    116    <!-- available if key_coupled + conservative method --> 
    117    <field id="rain"         description="Liquid precipitation"                                         unit="Kg/m2/s"  /> 
    118    <field id="evap_ao_cea"  description="Evaporation over ice-free ocean (cell average)"               unit="kg/m2/s"  /> 
    119    <!-- variables available with key_diaar5 --> 
    120    <field id="isnwmlt_cea"   description="Snow over Ice melting (cell average)"                        unit="kg/m2/s"  /> 
    121    <field id="fsal_virt_cea" description="Virtual salt flux due to ice formation (cell average)"       unit="kg/m2/s"  /> 
    122    <field id="fsal_real_cea" description="Real salt flux due to ice formation (cell average)"          unit="kg/m2/s"  /> 
    123    <field id="hflx_rain_cea" description="heat flux due to rainfall"                                   unit="W/m2"     /> 
    124    <field id="hflx_evap_cea" description="heat flux due to evaporation"                                unit="W/m2"     /> 
    125    <field id="hflx_snow_cea" description="heat flux due to snow falling over ice-free ocean"           unit="W/m2"     /> 
    126    <field id="hflx_ice_cea"  description="heat flux due to ice thermodynamics"                         unit="W/m2"     /> 
    127    <field id="hflx_rnf_cea"  description="heat flux due to runoffs"                                    unit="W/m2"     /> 
    128    <field id="hflx_cal_cea"  description="heat flux due to calving"                                    unit="W/m2"     /> 
    129    <field id="bicemel_cea"  description="Rate of Melt at Sea Ice Base (cell average)"                  unit="kg/m2/s"  /> 
    130    <field id="licepro_cea"  description="Lateral Sea Ice Growth Rate (cell average)"                   unit="kg/m2/s"  /> 
    131    <field id="snowmel_cea"  description="Snow Melt Rate (cell average)"                                unit="kg/m2/s"  /> 
    132    <field id="sntoice_cea"  description="Snow-Ice Formation Rate (cell average)"                       unit="kg/m2/s"  /> 
    133    <field id="ticemel_cea"  description="Rate of Melt at Upper Surface of Sea Ice (cell average)"      unit="kg/m2/s"  /> 
    134  
    135       </group> 
    136  
    137       <!-- U grid --> 
    138        
    139       <group id="grid_U"  axis_ref="depthu" grid_ref="grid_U"> 
    140    <field id="utau"         description="Wind Stress along i-axis"                    unit="N/m2" axis_ref="none" /> 
    141    <field id="uoce"         description="ocean current along i-axis"                  unit="m/s"                  /> 
    142    <field id="uocetr_eff"     description="Effective ocean transport along i-axis"    unit="m3/s"                 /> 
    143    <!-- uoce_eiv: available with key_traldf_eiv and key_diaeiv --> 
    144    <field id="uoce_eiv"     description="EIV ocean current along i-axis"              unit="m/s"                  /> 
    145    <!-- uoce_eiv: available with key_trabbl --> 
    146    <field id="uoce_bbl"     description="BBL ocean current along i-axis"              unit="m/s"  axis_ref="none" /> 
    147    <field id="ahu_bbl"      description="BBL diffusive flux along i-axis"             unit="m3/s" axis_ref="none" /> 
    148    <!-- variables available with key_diaar5 --> 
    149    <field id="u_masstr"     description="ocean eulerian mass transport along i-axis"  unit="kg/s"                 /> 
    150    <field id="u_heattr"     description="ocean eulerian heat transport along i-axis"  unit="W"    axis_ref="none" /> 
    151    <field id="ueiv_heattr"  description="ocean bolus heat transport along i-axis"     unit="W"    axis_ref="none" /> 
    152    <field id="udiff_heattr" description="ocean diffusion heat transport along i-axis" unit="W"    axis_ref="none" /> 
    153      </group> 
    154        
    155       <!-- V grid --> 
    156        
    157       <group id="grid_V"  axis_ref="depthv" grid_ref="grid_V"> 
    158    <field id="vtau"         description="Wind Stress along j-axis"                    unit="N/m2" axis_ref="none" /> 
    159    <field id="voce"         description="ocean current along j-axis"                  unit="m/s"                  /> 
    160    <field id="vocetr_eff"     description="Effective ocean tra,sport along j-axis"    unit="m3/s"                 /> 
    161    <!-- voce_eiv: available with key_traldf_eiv and key_diaeiv --> 
    162    <field id="voce_eiv"     description="EIV ocean current along j-axis"              unit="m/s"                  /> 
    163    <!-- voce_eiv: available with key_trabbl --> 
    164    <field id="voce_bbl"     description="BBL ocean current along j-axis"              unit="m/s" axis_ref="none"  /> 
    165    <field id="ahv_bbl"      description="BBL diffusive flux along j-axis"             unit="m3/s" axis_ref="none" /> 
    166    <!-- variables available with key_diaar5 --> 
    167    <field id="v_masstr"     description="ocean eulerian mass transport along j-axis"  unit="kg/s"                 /> 
    168    <field id="v_heattr"     description="ocean eulerian heat transport along j-axis"  unit="W"    axis_ref="none" /> 
    169    <field id="veiv_heattr"  description="ocean bolus heat transport along j-axis"     unit="W"    axis_ref="none" /> 
    170    <field id="vdiff_heattr" description="ocean diffusion heat transport along j-axis" unit="W"    axis_ref="none" /> 
    171       </group> 
    172        
    173       <!-- W grid --> 
    174        
    175       <group id="grid_W"  axis_ref="depthw" grid_ref="grid_W"> 
    176    <field id="woce"         description="ocean vertical velocity"                     unit="m/s"                  /> 
    177    <field id="wocetr_eff"     description="effective ocean vertical transport"          unit="m3/s"                 /> 
    178    <!-- woce_eiv: available with key_traldf_eiv and key_diaeiv --> 
    179    <field id="woce_eiv"     description="EIV ocean vertical velocity"                 unit="m/s"                  /> 
    180    <!-- woce_eiv: available with key_trabbl_adv --> 
    181    <field id="avt"          description="vertical eddy diffusivity"                   unit="m2/s"                 /> 
    182    <field id="avm"          description="vertical eddy viscosity"                     unit="m2/s"                 /> 
    183    <!-- avs: available with key_zdfddm --> 
    184    <field id="avs"          description="salt vertical eddy diffusivity"              unit="m2/s"                 /> 
    185    <!-- avt_evd and avm_evd: available with ln_zdfevd --> 
    186    <field id="avt_evd"      description="enhanced vertical diffusivity"               unit="m2/s"                 /> 
    187    <field id="avm_evd"      description="enhanced vertical viscosity"                 unit="m2/s"                 /> 
    188    <!-- aht2d and  aht2d_eiv: available with key_traldf_eiv and key_traldf_c2d --> 
    189    <field id="aht2d"        description="lateral eddy diffusivity"                    unit="m2/s" axis_ref="none" /> 
    190    <field id="aht2d_eiv"    description="EIV lateral eddy diffusivity"                unit="m2/s" axis_ref="none" /> 
    191    <!-- avt_tide: available with key_zdftmx --> 
    192    <field id="av_tide"      description="tidal vertical diffusivity"                  unit="m2/s"                 /> 
    193    <!-- variables available with key_diaar5 -->    
    194    <field id="w_masstr"     description="vertical mass trasport"                      unit="kg/s"                 /> 
    195    <field id="w_masstr2"    description="square of vertical mass trasport"            unit="kg2/s2"               /> 
    196       </group> 
    197            
    198       <!-- scalar --> 
    199        
    200       <!-- variables available with key_diaar5 --> 
    201       <group id="scalar" axis_ref="none" grid_ref="scalarpoint" zoom_ref="1point" > 
    202    <field id="voltot"     description="global mean volume"                         unit="m3"   /> 
    203    <field id="sshtot"     description="global mean ssh"                            unit="m"    /> 
    204    <field id="sshsteric"  description="global mean ssh steric"                     unit="m"    /> 
    205    <field id="sshthster"  description="global mean ssh thermosteric"               unit="m"    /> 
    206    <field id="masstot"    description="global mean mass"                           unit="kg"   /> 
    207    <field id="temptot"    description="global mean temperature"                    unit="degC" /> 
    208    <field id="saltot"     description="global mean salinity"                       unit="psu"  /> 
    209    <field id="fram_trans" description="Sea Ice Mass Transport Through Fram Strait" unit="kg/s" /> 
    210       </group> 
    211  
    212       <!-- variables available with key_float --> 
    213       <group id="floatvar" axis_ref="nfloat" grid_ref="scalarpoint" zoom_ref="1point"> 
    214         <field id="traj_lon"   description="floats longitude"   unit="deg"  operation="inst(X)" /> 
    215         <field id="traj_lat"   description="floats latitude"    unit="deg"   /> 
    216         <field id="traj_dep"   description="floats depth"       unit="m"     /> 
    217         <field id="traj_temp"  description="floats temperature" unit="degC"  /> 
    218         <field id="traj_salt"  description="floats salinity"    unit="psu"   /> 
    219         <field id="traj_dens"  description="floats density"     unit="kg/m3" /> 
    220         <field id="traj_group" description="floats group"       unit="none"  /> 
    221       </group> 
    222       
    223       <!-- ptrc on T grid --> 
    224  
    225      <group id="ptrc_T" axis_ref="deptht" grid_ref="grid_T"> 
    226        <field id="DIC"      description="Dissolved inorganic Concentration"        unit="mmol/m3" /> 
    227        <field id="Alkalini" description="Total Alkalinity Concentration"           unit="mmol/m3"    /> 
    228        <field id="O2"       description="Oxygen Concentration"                     unit="mmol/m3" /> 
    229        <field id="CaCO3"    description="Calcite Concentration"                    unit="mmol/m3" /> 
    230        <field id="PO4"      description="Phosphate Concentration"                  unit="mmol/m3" /> 
    231        <field id="POC"      description="Small organic carbon Concentration"       unit="mmol/m3" /> 
    232        <field id="Si"       description="Silicate Concentration"                   unit="mmol/m3" /> 
    233        <field id="PHY"      description="Nanophytoplankton Concentration"          unit="mmol/m3" /> 
    234        <field id="ZOO"      description="Microzooplankton Concentration"           unit="mmol/m3" /> 
    235        <field id="DOC"      description="Dissolved organic Concentration"          unit="mmol/m3" /> 
    236        <field id="PHY2"     description="Diatoms Concentration"                    unit="mmol/m3" /> 
    237        <field id="ZOO2"     description="Mesozooplankton Concentration"            unit="mmol/m3" /> 
    238        <field id="DSi"      description="Diatoms Silicate Concentration"           unit="mmol/m3" /> 
    239        <field id="Fer"      description="Dissolved Iron Concentration"             unit="mmol/m3" /> 
    240        <field id="BFe"      description="Big iron particles Concentration"         unit="mmol/m3" /> 
    241        <field id="GOC"      description="Big organic carbon Concentration"         unit="mmol/m3" /> 
    242        <field id="SFe"      description="Small iron particles Concentration"       unit="mmol/m3" /> 
    243        <field id="DFe"      description="Diatoms iron  Concentration"              unit="mmol/m3" /> 
    244        <field id="GSi"      description="Sinking biogenic Silicate Concentration"  unit="mmol/m3" /> 
    245        <field id="NFe"      description="Nano iron Concentration"                  unit="mmol/m3" /> 
    246        <field id="NCHL"     description="Nano chlorophyl Concentration"            unit="mg/m3" /> 
    247        <field id="DCHL"     description="Diatoms chlorophyl Concentration"         unit="mg/m3" /> 
    248        <field id="NO3"      description="Nitrates Concentration"                   unit="mmol/m3" /> 
    249        <field id="NH4"      description="Ammonium Concentration"                   unit="mmol/m3" /> 
    250        <field id="DET"      description="Detritus"                                      unit="mmole-N/m3" /> 
    251        <field id="ZOO"      description="Zooplankton Concentration"                     unit="mmole-N/m3" /> 
    252        <field id="PHY"      description="Phytoplankton Concentration"                   unit="mmole-N/m3" /> 
    253        <field id="NO3"      description="Nitrate Concentration"                         unit="mmole-N/m3" /> 
    254        <field id="NH4"      description="Ammonium Concentration"                        unit="mmole-N/m3" /> 
    255        <field id="DOM"      description="Dissolved Organic Matter"                      unit="mmole-N/m3" /> 
    256      </group> 
    257  
    258       <!-- diad on T grid : variables available with key_diatrc --> 
    259  
    260      <group id="diad_T" axis_ref="none" grid_ref="grid_T"> 
    261        <field id="PH"          description="PH"                                       unit="-"          axis_ref="deptht" /> 
    262        <field id="CO3"         description="Bicarbonates"                             unit="mol/m3"     axis_ref="deptht" /> 
    263        <field id="CO3sat"      description="CO3 saturation"                           unit="mol/m3"     axis_ref="deptht" /> 
    264        <field id="PAR"         description="Photosynthetically Available Radiation"   unit="W/m2"       axis_ref="deptht" /> 
    265        <field id="PPPHY"       description="Primary production of nanophyto"          unit="mol/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    266        <field id="PPPHY2"      description="Primary production of diatoms"            unit="mol/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    267        <field id="PPNEWN"      description="New Primary production of nanophyto"      unit="mol/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    268        <field id="PPNEWD"      description="New Primary production of diatoms"        unit="mol/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    269        <field id="PBSi"        description="Primary production of Si diatoms"         unit="mol/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    270        <field id="PFeN"        description="Primary production of nano iron"          unit="mol/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    271        <field id="PFeD"        description="Primary production of diatoms iron"       unit="mol/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    272        <field id="PCAL"        description="Calcite production"                       unit="mol/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    273        <field id="DCAL"        description="Calcite dissolution"                      unit="mol/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    274        <field id="GRAZ"        description="Grazing by zooplankton"                   unit="mol/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    275        <field id="Mumax"       description="Maximum growth rate"                      unit="s-1"        axis_ref="deptht" /> 
    276        <field id="MuN"         description="Realized growth rate for nanophyto"       unit="s-1"        axis_ref="deptht" /> 
    277        <field id="MuD"         description="Realized growth rate for diatomes"        unit="s-1"        axis_ref="deptht" /> 
    278        <field id="MuNlight"    description="Light limited growth rate for nanophyto"  unit="s-1"        axis_ref="deptht" /> 
    279        <field id="MuDlight"    description="Light limited growth rate for diatomes"   unit="s-1"        axis_ref="deptht" /> 
    280        <field id="LNnut"       description="Nutrient limitation term in Nanophyto"    unit="-"          axis_ref="deptht" /> 
    281        <field id="LDnut"       description="Nutrient limitation term in Diatoms"      unit="-"          axis_ref="deptht" /> 
    282        <field id="LNFe"        description="Iron limitation term in Nanophyto"        unit="-"          axis_ref="deptht" /> 
    283        <field id="LDFe"        description="Iron limitation term in Diatoms"          unit="-"          axis_ref="deptht" /> 
    284        <field id="LNlight"     description="Light limitation term in Nanophyto"       unit="-"          axis_ref="deptht" /> 
    285        <field id="LDlight"     description="Light limitation term in Diatoms"         unit="-"          axis_ref="deptht" /> 
    286        <field id="Nfix"        description="Nitrogen fixation at surface"             unit="mol/m2/s"                     /> 
    287        <field id="EPC100"      description="Export of carbon particles at 100 m"      unit="mol/m2/s"                     /> 
    288        <field id="EPFE100"     description="Export of biogenic iron at 100 m"         unit="mol/m2/s"                     /> 
    289        <field id="EPSI100"     description="Export of Silicate at 100 m"              unit="mol/m2/s"                     /> 
    290        <field id="EPCAL100"    description="Export of Calcite at 100 m"               unit="mol/m2/s"                     /> 
    291        <field id="Cflx"        description="DIC flux"                                 unit="mol/m2/s"                     /> 
    292        <field id="Oflx"        description="Oxygen flux"                              unit="mol/m2/s"                     /> 
    293        <field id="Kg"          description="Gas transfer"                             unit="mol/m2/s/uatm"                /> 
    294        <field id="Dpco2"       description="Delta CO2"                                unit="uatm"                         /> 
    295        <field id="Dpo2"        description="Delta O2"                                 unit="uatm"                         /> 
    296        <field id="Heup"        description="Euphotic layer depth"                     unit="m"                            /> 
    297        <field id="Irondep"     description="Iron deposition"                          unit="mol/m2/s"                     /> 
    298        <field id="FNO3PHY"     description="FNO3PHY"                                  unit="-"          axis_ref="deptht" /> 
    299        <field id="FNH4PHY"     description="FNH4PHY"                                  unit="-"          axis_ref="deptht" /> 
    300        <field id="FNH4NO3"     description="FNH4NO3"                                  unit="-"          axis_ref="deptht" /> 
    301        <field id="TNO3PHY"     description="TNO3PHY"                                  unit="-"  /> 
    302        <field id="TNH4PHY"     description="TNH4PHY"                                  unit="-"  /> 
    303        <field id="TPHYDOM"     description="TPHYDOM"                                  unit="-"  /> 
    304        <field id="TPHYNH4"     description="TPHYNH4"                                  unit="-"  /> 
    305        <field id="TPHYZOO"     description="TPHYZOO"                                  unit="-"  /> 
    306        <field id="TPHYDET"     description="TPHYDET"                                  unit="-"  /> 
    307        <field id="TDETZOO"     description="TDETZOO"                                  unit="-"  /> 
    308        <field id="TDETSED"     description="TDETSED"                                  unit="-"  /> 
    309        <field id="TZOODET"     description="TZOODET"                                  unit="-"  /> 
    310        <field id="TZOOBOD"     description="TZOOBOD"                                  unit="-"  /> 
    311        <field id="TZOONH4"     description="TZOONH4"                                  unit="-"  /> 
    312        <field id="TZOODOM"     description="TZOODOM"                                  unit="-"  /> 
    313        <field id="TNH4NO3"     description="TNH4NO3"                                  unit="-"  /> 
    314        <field id="TDOMNH4"     description="TDOMNH4"                                  unit="-"  /> 
    315        <field id="TDETNH4"     description="TDETNH4"                                  unit="-"  /> 
    316        <field id="TPHYTOT"     description="TPHYTOT"                                  unit="-"  /> 
    317        <field id="TZOOTOT"     description="TZOOTOT"                                  unit="-"  /> 
    318        <field id="TDETDOM"     description="TDETDOM"                                  unit="-"  /> 
    319        <field id="SEDPOC"      description="SEDPOC"                                   unit="-"  /> 
    320      </group> 
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    322     </field_definition> 
    323      
     14    <field_definition src="./field_def.xml"/> 
    32415    <!--  
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    385     </file_definition> 
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    389 =                                           grid definition                                                = 
    390 =                                            DO NOT CHANGE                                                 = 
     51= grid definition = = DO NOT CHANGE = 
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    39253    --> 
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     61   </axis_definition>  
    40262     
    403     <grid_definition> 
    404       <grid id="grid_T" description="grid T" > 
    405     <!--   Eq section   --> 
    406         <zoom id="EqT" ibegin="1" jbegin="0000" ni="0000" nj="1" /> 
    407     <!--   TAO   --> 
    408       <!--   137e   --> 
    409         <zoom id="2n137eT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    410         <zoom id="5n137eT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    411         <zoom id="8n137eT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    412       <!--   147e   --> 
    413         <zoom id="0n147eT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    414         <zoom id="2n147eT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    415         <zoom id="5n147eT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    416       <!--   156e   --> 
    417         <zoom id="5s156eT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    418         <zoom id="2s156eT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    419         <zoom id="0n156eT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    420         <zoom id="2n156eT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    421         <zoom id="5n156eT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    422         <zoom id="8n156eT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    423       <!--   165e   --> 
    424         <zoom id="8s165eT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    425         <zoom id="5s165eT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    426         <zoom id="2s165eT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    427         <zoom id="0n165eT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    428         <zoom id="2n165eT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    429         <zoom id="5n165eT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    430         <zoom id="8n165eT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    431       <!--   180w   --> 
    432         <zoom id="8s180wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    433         <zoom id="5s180wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    434         <zoom id="2s180wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    435         <zoom id="0n180wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    436         <zoom id="2n180wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    437         <zoom id="5n180wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    438         <zoom id="8n180wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    439       <!--   170w   --> 
    440         <zoom id="8s170wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    441         <zoom id="5s170wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    442         <zoom id="2s170wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    443         <zoom id="0n170wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    444         <zoom id="2n170wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
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    446         <zoom id="8n170wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    447       <!--   155w   --> 
    448         <zoom id="8s155wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
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    450         <zoom id="2s155wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
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    459         <zoom id="0n140wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    460         <zoom id="2n140wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    461         <zoom id="5n140wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    462         <zoom id="8n140wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    463       <!--   125w   --> 
    464         <zoom id="8s125wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    465         <zoom id="5s125wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    466         <zoom id="2s125wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
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    468         <zoom id="2n125wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    469         <zoom id="5n125wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    470         <zoom id="8n125wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
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    472         <zoom id="8s110wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
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    479       <!--   95w   --> 
    480         <zoom id="8s95wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    481         <zoom id="5s95wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    482         <zoom id="2s95wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    483         <zoom id="0n95wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    484         <zoom id="2n95wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    485         <zoom id="5n95wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    486         <zoom id="8n95wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    487     <!--   RAMA   --> 
    488       <!--   55e   --> 
    489         <zoom id="16s55eT"    ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    490         <zoom id="12s55eT"    ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    491         <zoom id="8s55eT"     ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    492         <zoom id="4s55eT"     ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    493         <zoom id="1.5s55eT"   ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    494         <zoom id="0n55eT"     ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    495         <zoom id="1.5n55eT"   ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    496         <zoom id="4n55eT"     ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    497       <!--   65e   --> 
    498         <zoom id="15n65eT"    ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    499       <!--   67e   --> 
    500         <zoom id="16s67eT"    ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    501         <zoom id="12s67eT"    ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    502         <zoom id="8s67eT"     ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    503         <zoom id="4s67eT"     ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    504         <zoom id="1.5s67eT"   ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    505         <zoom id="0n67eT"     ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    506         <zoom id="1.5n67eT"   ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    507         <zoom id="4n67eT"     ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    508         <zoom id="8n67eT"     ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    509       <!--   80.5e   --> 
    510         <zoom id="16s80.5eT"  ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    511         <zoom id="12s80.5eT"  ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    512         <zoom id="8s80.5eT"   ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    513         <zoom id="4s80.5eT"   ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    514         <zoom id="1.5s80.5eT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    515         <zoom id="0n80.5eT"   ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    516         <zoom id="1.5n80.5eT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    517         <zoom id="4n80.5eT"   ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    518       <!--   90e   --> 
    519         <zoom id="1.5s90eT"   ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    520         <zoom id="0n90eT"     ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
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    522         <zoom id="4n90eT"     ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
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    525         <zoom id="15n90eT"    ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    526       <!--   95e   --> 
    527         <zoom id="16s95eT"    ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    528         <zoom id="12s95eT"    ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    529         <zoom id="8s95eT"     ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    530         <zoom id="5s95eT"     ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    531     <!--   PIRATA   --> 
    532       <!--   38w-30w   --> 
    533         <zoom id="19s34wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    534         <zoom id="14s32wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    535         <zoom id="8s30wT"  ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    536         <zoom id="0n35wT"  ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    537         <zoom id="4n38wT"  ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    538         <zoom id="8n38wT"  ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    539         <zoom id="12n38wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    540         <zoom id="15n38wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    541         <zoom id="20n38wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    542       <!--   23w   --> 
    543         <zoom id="0n23wT"  ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    544         <zoom id="4n23wT"  ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    545         <zoom id="12n23wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    546         <zoom id="21n23wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    547       <!--   10w   --> 
    548         <zoom id="10s10wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    549         <zoom id="6s10wT"  ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    550         <zoom id="0n10wT"  ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    551       <!--   0e   --> 
    552         <zoom id="0n0eT"   ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    553       </grid> 
    554  
    555       <grid id="grid_U" description="grid U" > 
    556     <!--   Eq section   --> 
    557         <zoom id="EqU" ibegin="1" jbegin="0000" ni="0000" nj="1" /> 
    558       </grid> 
    559  
    560       <grid id="grid_V" description="grid V" > 
    561       </grid> 
    562  
    563       <grid id="grid_W" description="grid W" > 
    564     <!--   Eq section   --> 
    565         <zoom id="EqW" ibegin="1" jbegin="0000" ni="0000" nj="1" /> 
    566       </grid> 
    567  
    568       <grid id="scalarpoint" description="scalar" > 
    569         <zoom id="1point" ibegin="1" jbegin="1" ni="1" nj="1" /> 
    570       </grid> 
    571  
    572  
    573     </grid_definition>     
    574      
     63   <domain_definition src="./domain_def.xml"/> 
     64    
     65   <grid_definition />     
     66   
    57567  </context> 
    57668   
    577   <context id="1_nemo"> 
    578      
    579     <!-- $id$ --> 
    58069 
    581     <!--  
    582 ============================================================================================================ 
    583 =                                  definition of all existing variables                                    = 
    584 =                                            DO NOT CHANGE                                                 = 
    585 ============================================================================================================ 
    586     --> 
    587      
    588     <field_definition level="1" prec="4" operation="ave(X)" enabled=".TRUE."> <!-- time step automaticaly defined --> 
     70  <context id="xios"> 
    58971 
    590       <!-- T grid --> 
    591        
    592       <group id="grid_T" axis_ref="none" grid_ref="grid_T"> 
    593    <field id="toce"         description="temperature"                               unit="degC" axis_ref="deptht"   /> 
    594          <field id="soce"         description="salinity"                                  unit="psu"  axis_ref="deptht"   /> 
    595    <field id="sst"          description="sea surface temperature"                   unit="degC"                     /> 
    596    <field id="sst2"         description="square of sea surface temperature"         unit="degC2"                    /> 
    597    <field id="sstgrad"      description="module of sst gradient"                    unit="degC/m"                   /> 
    598    <field id="sstgrad2"     description="square of module of sst gradient"          unit="degC2/m2"                 /> 
    599    <field id="sss"          description="sea surface salinity"                      unit="psu"                      /> 
    600    <field id="sss2"         description="square of sea surface salinity"            unit="psu2"                     /> 
    601    <field id="ssh"          description="sea surface height"                        unit="m"                        /> 
    602    <field id="ssh2"         description="square of sea surface height"              unit="m2"                       /> 
    603    <field id="mldkz5"       description="mixing layer depth (Turbocline)"           unit="m"                        /> 
    604    <field id="mldr10_1"     description="Mixed Layer Depth 0.01 ref.10m"            unit="m"                        /> 
    605          <field id="rhop"         description="potential density (sigma0)"                unit="kg/m3" axis_ref="deptht"  /> 
    606    <!-- next variables available with key_diahth --> 
    607    <field id="mlddzt"       description="Thermocline Depth (max dT/dz)"             unit="m"                        /> 
    608    <field id="mldr10_3"     description="Mixed Layer Depth dr=0.03 (ref.10m)"       unit="m"                        /> 
    609    <field id="mldr0_1"      description="Mixed Layer Depth dr=0.01 (ref.surf)"      unit="m"                        /> 
    610    <field id="mldr0_3"      description="Mixed Layer Depth dr=0.03 (ref.surf)"      unit="m"                        /> 
    611    <field id="mld_dt02"     description="Mixed Layer Depth |dt|=0.2 (ref.10m)"      unit="m"                        /> 
    612    <field id="topthdep"     description="Top of the thermocline dt=-0.2 (ref.10m)"  unit="m"                        /> 
    613    <field id="pycndep"      description="Pycnocline depth dr~dt=-0.2 (ref.10m)"     unit="m"                        /> 
    614    <field id="BLT"          description="Barrier Layer Thickness"                   unit="m"                        /> 
    615    <field id="tinv"         description="Max of vertical invertion of temperature"  unit="degC"                     /> 
    616    <field id="depti"        description="Depth of max. vert. inv. of temperature"   unit="m"                        /> 
    617         <field id="20d"          description="Depth of 20C isotherm"                     unit="m"                        /> 
    618    <field id="28d"          description="Depth of 28C isotherm"                     unit="m"                        /> 
    619    <field id="hc300"        description="Heat content 300 m"                        unit="W"                        /> 
    620    <!-- variables available with key_diaar5 --> 
    621    <field id="botpres"      description="Pressure at sea floor"                     unit="dbar"                     /> 
    622    <field id="cellthc"      description="Cell thickness"                            unit="m"     axis_ref="deptht"  /> 
    623      </group> 
    624  
    625       <!-- SBC --> 
    626        
    627       <group id="SBC" axis_ref="none" grid_ref="grid_T" > <!-- time step automaticaly defined based on nn_fsbc --> 
    628  
    629    <field id="empmr"        description="Net Upward Water Flux"                                        unit="kg/m2/s"  /> 
    630         <field id="saltflx"      description="Downward salt flux"                                          unit="PSU/m2/s"  /> 
    631    <field id="snowpre"      description="Snow precipitation"                                           unit="kg/m2/s"  /> 
    632    <field id="runoffs"      description="River Runoffs"                                                unit="Kg/m2/s"  /> 
    633  
    634    <field id="qt"           description="Net Downward Heat Flux"                                       unit="W/m2"     /> 
    635    <field id="qns"          description="non solar Downward Heat Flux"                                 unit="W/m2"     /> 
    636    <field id="qsr"          description="Shortwave Radiation"                                          unit="W/m2"     /> 
    637    <field id="qsr3d"        description="Shortwave Radiation 3D distribution"        axis_ref="deptht" unit="W/m2"     /> 
    638    <field id="qrp"          description="Surface Heat Flux: Damping"                                   unit="W/m2"     /> 
    639    <field id="erp"          description="Surface Water Flux: Damping"                                  unit="Kg/m2/s"  /> 
    640    <field id="taum"         description="wind stress module"                                           unit="N/m2"     /> 
    641    <field id="wspd"         description="Wind speed module at 10 m"                                    unit="m/s"      /> 
    642  
    643         <!-- * variable relative to atmospheric pressure forcing : available with ln_apr_dyn --> 
    644         <field id="ssh_ib"       description="Inverse barometer sea surface height"                         unit="m"        /> 
     72      <variable_definition> 
    64573    
    646    <!-- *_oce variables available with ln_blk_clio or ln_blk_core --> 
    647    <field id="qns_oce"      description="Non solar Downward Heat Flux over open ocean"                 unit="W/m2"     /> 
    648    <field id="qlw_oce"      description="Longwave Downward Heat Flux over open ocean"                  unit="W/m2"     /> 
    649    <field id="qsb_oce"      description="Sensible Downward Heat Flux over open ocean"                  unit="W/m2"     /> 
    650    <field id="qla_oce"      description="Latent Downward Heat Flux over open ocean"                    unit="W/m2"     /> 
    651         <field id="qhc_oce"      description="Downward Heat Content of E-P over open ocean"                 unit="W/m2"     /> 
    652    <field id="taum_oce"     description="wind stress module over open ocean"                           unit="N/m2"     /> 
    653  
    654    <field id="ice_cover"    description="Ice fraction"                                                 unit="1"        /> 
    655  
    656    <field id="ioceflxb"     description="Oceanic flux at the ice base"                                 unit="W/m2"     /> 
    657    <field id="qsr_ai_cea"   description="Air-Ice downward solar heat flux (cell average)"              unit="W/m2"     /> 
    658    <field id="qns_ai_cea"   description="Air-Ice downward non-solar heat flux (cell average)"          unit="W/m2"     /> 
    659    <field id="qla_ai_cea"   description="Air-Ice downward Latent heat flux (cell average)"             unit="W/m2"     /> 
     74     <!--  
     75        We must have buffer_size > jpi*jpj*jpk*8 (with jpi and jpj the subdomain size) 
     76--> 
     77     <variable id="buffer_size"               type="integer">10000000</variable> 
     78     <variable id="buffer_server_factor_size" type="integer">2</variable> 
     79     <variable id="info_level"                type="integer">0</variable> 
     80     <variable id="using_server"              type="boolean">false</variable> 
     81     <variable id="using_oasis"               type="boolean">false</variable> 
     82     <variable id="oasis_codes_id"            type="string" >oceanx</variable> 
    66083    
    661    <field id="qsr_io_cea"   description="Ice-Oce downward solar heat flux (cell average)"              unit="W/m2"     /> 
    662    <field id="qns_io_cea"   description="Ice-Oce downward non-solar heat flux (cell average)"          unit="W/m2"     /> 
    663     
    664    <field id="snowthic_cea" description="Snow thickness (cell average)"                                unit="m"        /> 
    665    <field id="icethic_cea"  description="Ice thickness (cell average)"                                 unit="m"        /> 
    666    <field id="iceprod_cea"  description="Ice production (cell average)"                                unit="m/s"      /> 
    667     
    668    <field id="ice_pres"     description="Ice presence"                                                 unit="-"        /> 
    669    <field id="ist_cea"      description="Ice surface temperature (cell average)"                       unit="degC"     /> 
    670    <field id="ist_ipa"      description="Ice surface temperature (ice presence average)"               unit="degC"     />       
    671    <field id="uice_ipa"     description="Ice velocity along i-axis at I-point (ice presence average)"  unit="m/s"      />       
    672    <field id="vice_ipa"     description="Ice velocity along j-axis at I-point (ice presence average)"  unit="m/s"      />       
    673     
    674    <field id="utau_ice"     description="Wind stress along i-axis over the ice at i-point"             unit="N/m2"     /> 
    675    <field id="vtau_ice"     description="Wind stress along j-axis over the ice at i-point"             unit="N/m2"     /> 
    676     
    677    <field id="u_imasstr"    description="Sea-ice mass transport along i-axis"                          unit="kg/s"     /> 
    678    <field id="v_imasstr"    description="Sea-ice mass transport along j-axis"                          unit="kg/s"     /> 
    679  
    680         <!-- available if not defined key_vvl --> 
    681         <field id="emp_x_sst"      description="Concentration/Dilution term on SST"                         unit="kgC/m2/s" /> 
    682         <field id="emp_x_sss"      description="Concentration/Dilution term on SSS"                       unit="kgPSU/m2/s" /> 
    683    <!-- available key_coupled --> 
    684    <field id="snow_ao_cea"  description="Snow over ice-free ocean (cell average)"                      unit="kg/m2/s"  /> 
    685    <field id="snow_ai_cea"  description="Snow over sea-ice (cell average)"                             unit="kg/m2/s"  /> 
    686    <field id="subl_ai_cea"  description="Sublimation over sea-ice (cell average)"                      unit="kg/m2/s"  /> 
    687    <field id="icealb_cea"   description="Ice albedo (cell average)"                                    unit="1"        /> 
    688    <field id="calving"      description="Calving"                                                      unit="kg/m2/s"  /> 
    689    <!-- available if key_coupled + conservative method --> 
    690    <field id="rain"         description="Liquid precipitation"                                         unit="Kg/m2/s"  /> 
    691    <field id="evap_ao_cea"  description="Evaporation over ice-free ocean (cell average)"               unit="kg/m2/s"  /> 
    692    <!-- variables available with key_diaar5 --> 
    693    <field id="isnwmlt_cea"   description="Snow over Ice melting (cell average)"                        unit="kg/m2/s"  /> 
    694    <field id="fsal_virt_cea" description="Virtual salt flux due to ice formation (cell average)"       unit="kg/m2/s"  /> 
    695    <field id="fsal_real_cea" description="Real salt flux due to ice formation (cell average)"          unit="kg/m2/s"  /> 
    696    <field id="hflx_rain_cea" description="heat flux due to rainfall"                                   unit="W/m2"     /> 
    697    <field id="hflx_evap_cea" description="heat flux due to evaporation"                                unit="W/m2"     /> 
    698    <field id="hflx_snow_cea" description="heat flux due to snow falling over ice-free ocean"           unit="W/m2"     /> 
    699    <field id="hflx_ice_cea"  description="heat flux due to ice thermodynamics"                         unit="W/m2"     /> 
    700    <field id="hflx_rnf_cea"  description="heat flux due to runoffs"                                    unit="W/m2"     /> 
    701    <field id="hflx_cal_cea"  description="heat flux due to calving"                                    unit="W/m2"     /> 
    702    <field id="bicemel_cea"  description="Rate of Melt at Sea Ice Base (cell average)"                  unit="kg/m2/s"  /> 
    703    <field id="licepro_cea"  description="Lateral Sea Ice Growth Rate (cell average)"                   unit="kg/m2/s"  /> 
    704    <field id="snowmel_cea"  description="Snow Melt Rate (cell average)"                                unit="kg/m2/s"  /> 
    705    <field id="sntoice_cea"  description="Snow-Ice Formation Rate (cell average)"                       unit="kg/m2/s"  /> 
    706    <field id="ticemel_cea"  description="Rate of Melt at Upper Surface of Sea Ice (cell average)"      unit="kg/m2/s"  /> 
    707  
    708       </group> 
    709  
    710       <!-- U grid --> 
    711        
    712       <group id="grid_U"  axis_ref="depthu" grid_ref="grid_U"> 
    713    <field id="utau"         description="Wind Stress along i-axis"                    unit="N/m2" axis_ref="none" /> 
    714    <field id="uoce"         description="ocean current along i-axis"                  unit="m/s"                  /> 
    715    <field id="uocetr_eff"     description="Effective ocean transport along i-axis"    unit="m3/s"                 /> 
    716    <!-- uoce_eiv: available with key_traldf_eiv and key_diaeiv --> 
    717    <field id="uoce_eiv"     description="EIV ocean current along i-axis"              unit="m/s"                  /> 
    718    <!-- uoce_eiv: available with key_trabbl --> 
    719    <field id="uoce_bbl"     description="BBL ocean current along i-axis"              unit="m/s"  axis_ref="none" /> 
    720    <field id="ahu_bbl"      description="BBL diffusive flux along i-axis"             unit="m3/s" axis_ref="none" /> 
    721    <!-- variables available with key_diaar5 --> 
    722    <field id="u_masstr"     description="ocean eulerian mass transport along i-axis"  unit="kg/s"                 /> 
    723    <field id="u_heattr"     description="ocean eulerian heat transport along i-axis"  unit="W"    axis_ref="none" /> 
    724    <field id="ueiv_heattr"  description="ocean bolus heat transport along i-axis"     unit="W"    axis_ref="none" /> 
    725    <field id="udiff_heattr" description="ocean diffusion heat transport along i-axis" unit="W"    axis_ref="none" /> 
    726      </group> 
    727        
    728       <!-- V grid --> 
    729        
    730       <group id="grid_V"  axis_ref="depthv" grid_ref="grid_V"> 
    731    <field id="vtau"         description="Wind Stress along j-axis"                    unit="N/m2" axis_ref="none" /> 
    732    <field id="voce"         description="ocean current along j-axis"                  unit="m/s"                  /> 
    733    <field id="vocetr_eff"     description="Effective ocean tra,sport along j-axis"    unit="m3/s"                 /> 
    734    <!-- voce_eiv: available with key_traldf_eiv and key_diaeiv --> 
    735    <field id="voce_eiv"     description="EIV ocean current along j-axis"              unit="m/s"                  /> 
    736    <!-- voce_eiv: available with key_trabbl --> 
    737    <field id="voce_bbl"     description="BBL ocean current along j-axis"              unit="m/s" axis_ref="none"  /> 
    738    <field id="ahv_bbl"      description="BBL diffusive flux along j-axis"             unit="m3/s" axis_ref="none" /> 
    739    <!-- variables available with key_diaar5 --> 
    740    <field id="v_masstr"     description="ocean eulerian mass transport along j-axis"  unit="kg/s"                 /> 
    741    <field id="v_heattr"     description="ocean eulerian heat transport along j-axis"  unit="W"    axis_ref="none" /> 
    742    <field id="veiv_heattr"  description="ocean bolus heat transport along j-axis"     unit="W"    axis_ref="none" /> 
    743    <field id="vdiff_heattr" description="ocean diffusion heat transport along j-axis" unit="W"    axis_ref="none" /> 
    744       </group> 
    745        
    746       <!-- W grid --> 
    747        
    748       <group id="grid_W"  axis_ref="depthw" grid_ref="grid_W"> 
    749    <field id="woce"         description="ocean vertical velocity"                     unit="m/s"                  /> 
    750    <field id="wocetr_eff"     description="effective ocean vertical transport"          unit="m3/s"                 /> 
    751    <!-- woce_eiv: available with key_traldf_eiv and key_diaeiv --> 
    752    <field id="woce_eiv"     description="EIV ocean vertical velocity"                 unit="m/s"                  /> 
    753    <!-- woce_eiv: available with key_trabbl_adv --> 
    754    <field id="avt"          description="vertical eddy diffusivity"                   unit="m2/s"                 /> 
    755    <field id="avm"          description="vertical eddy viscosity"                     unit="m2/s"                 /> 
    756    <!-- avs: available with key_zdfddm --> 
    757    <field id="avs"          description="salt vertical eddy diffusivity"              unit="m2/s"                 /> 
    758    <!-- avt_evd and avm_evd: available with ln_zdfevd --> 
    759    <field id="avt_evd"      description="enhanced vertical diffusivity"               unit="m2/s"                 /> 
    760    <field id="avm_evd"      description="enhanced vertical viscosity"                 unit="m2/s"                 /> 
    761    <!-- aht2d and  aht2d_eiv: available with key_traldf_eiv and key_traldf_c2d --> 
    762    <field id="aht2d"        description="lateral eddy diffusivity"                    unit="m2/s" axis_ref="none" /> 
    763    <field id="aht2d_eiv"    description="EIV lateral eddy diffusivity"                unit="m2/s" axis_ref="none" /> 
    764    <!-- avt_tide: available with key_zdftmx --> 
    765    <field id="av_tide"      description="tidal vertical diffusivity"                  unit="m2/s"                 /> 
    766    <!-- variables available with key_diaar5 -->    
    767    <field id="w_masstr"     description="vertical mass trasport"                      unit="kg/s"                 /> 
    768    <field id="w_masstr2"    description="square of vertical mass trasport"            unit="kg2/s2"               /> 
    769       </group> 
    770            
    771       <!-- scalar --> 
    772        
    773       <!-- variables available with key_diaar5 --> 
    774       <group id="scalar" axis_ref="none" grid_ref="scalarpoint" zoom_ref="1point" > 
    775    <field id="voltot"     description="global mean volume"                         unit="m3"   /> 
    776    <field id="sshtot"     description="global mean ssh"                            unit="m"    /> 
    777    <field id="sshsteric"  description="global mean ssh steric"                     unit="m"    /> 
    778    <field id="sshthster"  description="global mean ssh thermosteric"               unit="m"    /> 
    779    <field id="masstot"    description="global mean mass"                           unit="kg"   /> 
    780    <field id="temptot"    description="global mean temperature"                    unit="degC" /> 
    781    <field id="saltot"     description="global mean salinity"                       unit="psu"  /> 
    782    <field id="fram_trans" description="Sea Ice Mass Transport Through Fram Strait" unit="kg/s" /> 
    783       </group> 
    784  
    785       <!-- variables available with key_float --> 
    786       <group id="floatvar" axis_ref="nfloat" grid_ref="scalarpoint" zoom_ref="1point"> 
    787         <field id="traj_lon"   description="floats longitude"   unit="deg"  operation="inst(X)" /> 
    788         <field id="traj_lat"   description="floats latitude"    unit="deg"   /> 
    789         <field id="traj_dep"   description="floats depth"       unit="m"     /> 
    790         <field id="traj_temp"  description="floats temperature" unit="degC"  /> 
    791         <field id="traj_salt"  description="floats salinity"    unit="psu"   /> 
    792         <field id="traj_dens"  description="floats density"     unit="kg/m3" /> 
    793         <field id="traj_group" description="floats group"       unit="none"  /> 
    794       </group> 
    795       
    796       <!-- ptrc on T grid --> 
    797  
    798      <group id="ptrc_T" axis_ref="deptht" grid_ref="grid_T"> 
    799        <field id="DIC"      description="Dissolved inorganic Concentration"        unit="mmol/m3" /> 
    800        <field id="Alkalini" description="Total Alkalinity Concentration"           unit="mmol/m3"    /> 
    801        <field id="O2"       description="Oxygen Concentration"                     unit="mmol/m3" /> 
    802        <field id="CaCO3"    description="Calcite Concentration"                    unit="mmol/m3" /> 
    803        <field id="PO4"      description="Phosphate Concentration"                  unit="mmol/m3" /> 
    804        <field id="POC"      description="Small organic carbon Concentration"       unit="mmol/m3" /> 
    805        <field id="Si"       description="Silicate Concentration"                   unit="mmol/m3" /> 
    806        <field id="PHY"      description="Nanophytoplankton Concentration"          unit="mmol/m3" /> 
    807        <field id="ZOO"      description="Microzooplankton Concentration"           unit="mmol/m3" /> 
    808        <field id="DOC"      description="Dissolved organic Concentration"          unit="mmol/m3" /> 
    809        <field id="PHY2"     description="Diatoms Concentration"                    unit="mmol/m3" /> 
    810        <field id="ZOO2"     description="Mesozooplankton Concentration"            unit="mmol/m3" /> 
    811        <field id="DSi"      description="Diatoms Silicate Concentration"           unit="mmol/m3" /> 
    812        <field id="Fer"      description="Dissolved Iron Concentration"             unit="mmol/m3" /> 
    813        <field id="BFe"      description="Big iron particles Concentration"         unit="mmol/m3" /> 
    814        <field id="GOC"      description="Big organic carbon Concentration"         unit="mmol/m3" /> 
    815        <field id="SFe"      description="Small iron particles Concentration"       unit="mmol/m3" /> 
    816        <field id="DFe"      description="Diatoms iron  Concentration"              unit="mmol/m3" /> 
    817        <field id="GSi"      description="Sinking biogenic Silicate Concentration"  unit="mmol/m3" /> 
    818        <field id="NFe"      description="Nano iron Concentration"                  unit="mmol/m3" /> 
    819        <field id="NCHL"     description="Nano chlorophyl Concentration"            unit="mg/m3" /> 
    820        <field id="DCHL"     description="Diatoms chlorophyl Concentration"         unit="mg/m3" /> 
    821        <field id="NO3"      description="Nitrates Concentration"                   unit="mmol/m3" /> 
    822        <field id="NH4"      description="Ammonium Concentration"                   unit="mmol/m3" /> 
    823        <field id="DET"      description="Detritus"                                      unit="mmole-N/m3" /> 
    824        <field id="ZOO"      description="Zooplankton Concentration"                     unit="mmole-N/m3" /> 
    825        <field id="PHY"      description="Phytoplankton Concentration"                   unit="mmole-N/m3" /> 
    826        <field id="NO3"      description="Nitrate Concentration"                         unit="mmole-N/m3" /> 
    827        <field id="NH4"      description="Ammonium Concentration"                        unit="mmole-N/m3" /> 
    828        <field id="DOM"      description="Dissolved Organic Matter"                      unit="mmole-N/m3" /> 
    829      </group> 
    830  
    831       <!-- diad on T grid : variables available with key_diatrc --> 
    832  
    833      <group id="diad_T" axis_ref="none" grid_ref="grid_T"> 
    834        <field id="PH"          description="PH"                                       unit="-"          axis_ref="deptht" /> 
    835        <field id="CO3"         description="Bicarbonates"                             unit="mol/m3"     axis_ref="deptht" /> 
    836        <field id="CO3sat"      description="CO3 saturation"                           unit="mol/m3"     axis_ref="deptht" /> 
    837        <field id="PAR"         description="Photosynthetically Available Radiation"   unit="W/m2"       axis_ref="deptht" /> 
    838        <field id="PPPHY"       description="Primary production of nanophyto"          unit="mol/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    839        <field id="PPPHY2"      description="Primary production of diatoms"            unit="mol/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    840        <field id="PPNEWN"      description="New Primary production of nanophyto"      unit="mol/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    841        <field id="PPNEWD"      description="New Primary production of diatoms"        unit="mol/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    842        <field id="PBSi"        description="Primary production of Si diatoms"         unit="mol/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    843        <field id="PFeN"        description="Primary production of nano iron"          unit="mol/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    844        <field id="PFeD"        description="Primary production of diatoms iron"       unit="mol/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    845        <field id="PCAL"        description="Calcite production"                       unit="mol/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    846        <field id="DCAL"        description="Calcite dissolution"                      unit="mol/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    847        <field id="GRAZ"        description="Grazing by zooplankton"                   unit="mol/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    848        <field id="Mumax"       description="Maximum growth rate"                      unit="s-1"        axis_ref="deptht" /> 
    849        <field id="MuN"         description="Realized growth rate for nanophyto"       unit="s-1"        axis_ref="deptht" /> 
    850        <field id="MuD"         description="Realized growth rate for diatomes"        unit="s-1"        axis_ref="deptht" /> 
    851        <field id="MuNlight"    description="Light limited growth rate for nanophyto"  unit="s-1"        axis_ref="deptht" /> 
    852        <field id="MuDlight"    description="Light limited growth rate for diatomes"   unit="s-1"        axis_ref="deptht" /> 
    853        <field id="LNnut"       description="Nutrient limitation term in Nanophyto"    unit="-"          axis_ref="deptht" /> 
    854        <field id="LDnut"       description="Nutrient limitation term in Diatoms"      unit="-"          axis_ref="deptht" /> 
    855        <field id="LNFe"        description="Iron limitation term in Nanophyto"        unit="-"          axis_ref="deptht" /> 
    856        <field id="LDFe"        description="Iron limitation term in Diatoms"          unit="-"          axis_ref="deptht" /> 
    857        <field id="LNlight"     description="Light limitation term in Nanophyto"       unit="-"          axis_ref="deptht" /> 
    858        <field id="LDlight"     description="Light limitation term in Diatoms"         unit="-"          axis_ref="deptht" /> 
    859        <field id="Nfix"        description="Nitrogen fixation at surface"             unit="mol/m2/s"                     /> 
    860        <field id="EPC100"      description="Export of carbon particles at 100 m"      unit="mol/m2/s"                     /> 
    861        <field id="EPFE100"     description="Export of biogenic iron at 100 m"         unit="mol/m2/s"                     /> 
    862        <field id="EPSI100"     description="Export of Silicate at 100 m"              unit="mol/m2/s"                     /> 
    863        <field id="EPCAL100"    description="Export of Calcite at 100 m"               unit="mol/m2/s"                     /> 
    864        <field id="Cflx"        description="DIC flux"                                 unit="mol/m2/s"                     /> 
    865        <field id="Oflx"        description="Oxygen flux"                              unit="mol/m2/s"                     /> 
    866        <field id="Kg"          description="Gas transfer"                             unit="mol/m2/s/uatm"                /> 
    867        <field id="Dpco2"       description="Delta CO2"                                unit="uatm"                         /> 
    868        <field id="Dpo2"        description="Delta O2"                                 unit="uatm"                         /> 
    869        <field id="Heup"        description="Euphotic layer depth"                     unit="m"                            /> 
    870        <field id="Irondep"     description="Iron deposition"                          unit="mol/m2/s"                     /> 
    871        <field id="FNO3PHY"     description="FNO3PHY"                                  unit="-"          axis_ref="deptht" /> 
    872        <field id="FNH4PHY"     description="FNH4PHY"                                  unit="-"          axis_ref="deptht" /> 
    873        <field id="FNH4NO3"     description="FNH4NO3"                                  unit="-"          axis_ref="deptht" /> 
    874        <field id="TNO3PHY"     description="TNO3PHY"                                  unit="-"  /> 
    875        <field id="TNH4PHY"     description="TNH4PHY"                                  unit="-"  /> 
    876        <field id="TPHYDOM"     description="TPHYDOM"                                  unit="-"  /> 
    877        <field id="TPHYNH4"     description="TPHYNH4"                                  unit="-"  /> 
    878        <field id="TPHYZOO"     description="TPHYZOO"                                  unit="-"  /> 
    879        <field id="TPHYDET"     description="TPHYDET"                                  unit="-"  /> 
    880        <field id="TDETZOO"     description="TDETZOO"                                  unit="-"  /> 
    881        <field id="TDETSED"     description="TDETSED"                                  unit="-"  /> 
    882        <field id="TZOODET"     description="TZOODET"                                  unit="-"  /> 
    883        <field id="TZOOBOD"     description="TZOOBOD"                                  unit="-"  /> 
    884        <field id="TZOONH4"     description="TZOONH4"                                  unit="-"  /> 
    885        <field id="TZOODOM"     description="TZOODOM"                                  unit="-"  /> 
    886        <field id="TNH4NO3"     description="TNH4NO3"                                  unit="-"  /> 
    887        <field id="TDOMNH4"     description="TDOMNH4"                                  unit="-"  /> 
    888        <field id="TDETNH4"     description="TDETNH4"                                  unit="-"  /> 
    889        <field id="TPHYTOT"     description="TPHYTOT"                                  unit="-"  /> 
    890        <field id="TZOOTOT"     description="TZOOTOT"                                  unit="-"  /> 
    891        <field id="TDETDOM"     description="TDETDOM"                                  unit="-"  /> 
    892        <field id="SEDPOC"      description="SEDPOC"                                   unit="-"  /> 
    893      </group> 
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    895     </field_definition> 
    896      
    897     <!--  
    898 ============================================================================================================ 
    899 =                                           output files definition                                        = 
    900 =                                            Define your own files                                         = 
    901 =                                         put the variables you want...                                    = 
    902 ============================================================================================================ 
    903     --> 
    904      
    905     <file_definition > 
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    961 ============================================================================================================ 
    962 =                                           grid definition                                                = 
    963 =                                            DO NOT CHANGE                                                 = 
    964 ============================================================================================================ 
    965     --> 
    966      
    967     <axis_definition>   
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    978     <!--   Eq section   --> 
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    980     <!--   TAO   --> 
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    987         <zoom id="2n147eT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
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    998         <zoom id="5s165eT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
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    1030         <zoom id="5s140wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
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    1044       <!--   110w   --> 
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    1046         <zoom id="5s110wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    1047         <zoom id="2s110wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    1048         <zoom id="0n110wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    1049         <zoom id="2n110wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    1050         <zoom id="5n110wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    1051         <zoom id="8n110wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    1052       <!--   95w   --> 
    1053         <zoom id="8s95wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    1054         <zoom id="5s95wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    1055         <zoom id="2s95wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    1056         <zoom id="0n95wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    1057         <zoom id="2n95wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
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    1060     <!--   RAMA   --> 
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    1062         <zoom id="16s55eT"    ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    1063         <zoom id="12s55eT"    ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    1064         <zoom id="8s55eT"     ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    1065         <zoom id="4s55eT"     ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
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    1067         <zoom id="0n55eT"     ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
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    1069         <zoom id="4n55eT"     ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    1070       <!--   65e   --> 
    1071         <zoom id="15n65eT"    ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    1072       <!--   67e   --> 
    1073         <zoom id="16s67eT"    ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    1074         <zoom id="12s67eT"    ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    1075         <zoom id="8s67eT"     ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
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    1078         <zoom id="0n67eT"     ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    1079         <zoom id="1.5n67eT"   ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    1080         <zoom id="4n67eT"     ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    1081         <zoom id="8n67eT"     ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    1082       <!--   80.5e   --> 
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    1085         <zoom id="8s80.5eT"   ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
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    1089         <zoom id="1.5n80.5eT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    1090         <zoom id="4n80.5eT"   ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    1091       <!--   90e   --> 
    1092         <zoom id="1.5s90eT"   ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    1093         <zoom id="0n90eT"     ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    1094         <zoom id="1.5n90eT"   ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    1095         <zoom id="4n90eT"     ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    1096         <zoom id="8n90eT"     ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    1097         <zoom id="12n90eT"    ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    1098         <zoom id="15n90eT"    ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    1099       <!--   95e   --> 
    1100         <zoom id="16s95eT"    ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    1101         <zoom id="12s95eT"    ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    1102         <zoom id="8s95eT"     ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    1103         <zoom id="5s95eT"     ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    1104     <!--   PIRATA   --> 
    1105       <!--   38w-30w   --> 
    1106         <zoom id="19s34wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    1107         <zoom id="14s32wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    1108         <zoom id="8s30wT"  ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    1109         <zoom id="0n35wT"  ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    1110         <zoom id="4n38wT"  ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    1111         <zoom id="8n38wT"  ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    1112         <zoom id="12n38wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    1113         <zoom id="15n38wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    1114         <zoom id="20n38wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    1115       <!--   23w   --> 
    1116         <zoom id="0n23wT"  ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    1117         <zoom id="4n23wT"  ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    1118         <zoom id="12n23wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    1119         <zoom id="21n23wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    1120       <!--   10w   --> 
    1121         <zoom id="10s10wT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    1122         <zoom id="6s10wT"  ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    1123         <zoom id="0n10wT"  ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    1124       <!--   0e   --> 
    1125         <zoom id="0n0eT"   ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" /> 
    1126       </grid> 
    1127  
    1128       <grid id="grid_U" description="grid U" > 
    1129     <!--   Eq section   --> 
    1130         <zoom id="EqU" ibegin="1" jbegin="0000" ni="0000" nj="1" /> 
    1131       </grid> 
    1132  
    1133       <grid id="grid_V" description="grid V" > 
    1134       </grid> 
    1135  
    1136       <grid id="grid_W" description="grid W" > 
    1137     <!--   Eq section   --> 
    1138         <zoom id="EqW" ibegin="1" jbegin="0000" ni="0000" nj="1" /> 
    1139       </grid> 
    1140  
    1141       <grid id="scalarpoint" description="scalar" > 
    1142         <zoom id="1point" ibegin="1" jbegin="1" ni="1" nj="1" /> 
    1143       </grid> 
    1144  
    1145  
    1146     </grid_definition>     
     84      </variable_definition> 
     85                
    114786  </context> 
    1148      
     87   
    114988</simulation> 
  • branches/2012/dev_MERGE_2012/NEMOGCM/SETTE/sette_rpt

    r3667 r3715  
    2929 
    3030foreach pass (0 1 ) 
    31  
    32   if ( -d ./WGYRELOB_LONG ) then 
    33     set f1o = ./WGYRELOB_LONG/{$mach}/{$dorv}/LONG/ocean.output 
    34     set f1s = ./WGYRELOB_LONG/{$mach}/{$dorv}/LONG/solver.stat 
    35     set f2o = ./WGYRELOB_LONG/{$mach}/{$dorv}/SHORT/ocean.output 
    36     set f2s = ./WGYRELOB_LONG/{$mach}/{$dorv}/SHORT/solver.stat 
    37    
    38     set nl = `wc -l $f2s` 
    39     tail -$nl[1] $f1s > f1.tmp$$ 
    40     cmp -s f1.tmp$$ $f2s 
    41     if ( $status == 0 ) then 
    42       echo "GYRELOB     restartability  passed" 
    43     else 
    44       echo "GYRELOB     restartability  FAILED" 
    45       if ( $pass == 1 ) then 
    46         echo "<return> to view solver.stat differences" 
    47         set y = $< 
    48         sdiff -W f1.tmp$$ $f2s 
    49         echo "<return> to view ocean.output differences" 
    50         set y = $< 
    51         sdiff -W $f1o $f2o | grep "|" 
     31  if ( -d ./WGYRE_LONG ) then 
     32    set f1o = ./WGYRE_LONG/{$mach}/{$dorv}/LONG/ocean.output 
     33    set f1s = ./WGYRE_LONG/{$mach}/{$dorv}/LONG/solver.stat 
     34    set f2o = ./WGYRE_LONG/{$mach}/{$dorv}/SHORT/ocean.output 
     35    set f2s = ./WGYRE_LONG/{$mach}/{$dorv}/SHORT/solver.stat 
     36   
     37    set nl = `wc -l $f2s` 
     38    tail -$nl[1] $f1s > f1.tmp$$ 
     39    cmp -s f1.tmp$$ $f2s 
     40    if ( $status == 0 ) then 
     41      echo "GYRE     restartability  passed" 
     42    else 
     43      echo "GYRE     restartability  FAILED" 
     44      if ( $pass == 1 ) then 
     45        echo "<return> to view solver.stat differences" 
     46        set y = $< 
     47        sdiff f1.tmp$$ $f2s 
     48        echo "<return> to view ocean.output differences" 
     49        set y = $< 
     50        sdiff $f1o $f2o | grep "|" 
    5251        echo "<return> to continue" 
    5352        set y = $< 
     
    7372        echo "<return> to view solver.stat differences" 
    7473        set y = $< 
    75         sdiff -W f1.tmp$$ $f2s 
    76         echo "<return> to view ocean.output differences" 
    77         set y = $< 
    78         sdiff -W $f1o $f2o | grep "|" 
     74        sdiff f1.tmp$$ $f2s 
     75        echo "<return> to view ocean.output differences" 
     76        set y = $< 
     77        sdiff $f1o $f2o | grep "|" 
    7978        echo "<return> to continue" 
    8079        set y = $< 
     
    10099        echo "<return> to view tracer.stat differences" 
    101100        set y = $< 
    102         sdiff -W f1.tmp$$ $f2s 
    103         echo "<return> to view ocean.output differences" 
    104         set y = $< 
    105         sdiff -W $f1o $f2o | grep "|" 
     101        sdiff f1.tmp$$ $f2s 
     102        echo "<return> to view ocean.output differences" 
     103        set y = $< 
     104        sdiff $f1o $f2o | grep "|" 
    106105        echo "<return> to continue" 
    107106        set y = $< 
     
    127126        echo "<return> to view solver.stat differences" 
    128127        set y = $< 
    129         sdiff -W f1.tmp$$ $f2s 
    130         echo "<return> to view ocean.output differences" 
    131         set y = $< 
    132         sdiff -W $f1o $f2o | grep "|" 
     128        sdiff f1.tmp$$ $f2s 
     129        echo "<return> to view ocean.output differences" 
     130        set y = $< 
     131        sdiff $f1o $f2o | grep "|" 
    133132        echo "<return> to continue" 
    134133        set y = $< 
     
    140139echo 
    141140   
    142   if ( -d ./WGYRELOB_4 ) then 
    143     set f1o = ./WGYRELOB_4/{$mach}/{$dorv}/REPRO_1_4/ocean.output 
    144     set f1s = ./WGYRELOB_4/{$mach}/{$dorv}/REPRO_1_4/solver.stat 
    145     set f2o = ./WGYRELOB_4/{$mach}/{$dorv}/REPRO_2_2/ocean.output 
    146     set f2s = ./WGYRELOB_4/{$mach}/{$dorv}/REPRO_2_2/solver.stat 
    147    
    148     cmp -s $f1s $f2s 
    149     if ( $status == 0 ) then 
    150       echo "GYRELOB     reproducibility passed" 
    151     else 
    152       echo "GYRELOB     reproducibility FAILED" 
    153       if ( $pass == 1 ) then 
    154         echo "<return> to view solver.stat differences" 
    155         set y = $< 
    156         sdiff -W $f1s $f2s 
    157         echo "<return> to view ocean.output differences" 
    158         set y = $< 
    159         sdiff -W $f1o $f2o | grep "|" 
     141  if ( -d ./WGYRE_4 ) then 
     142    set f1o = ./WGYRE_4/{$mach}/{$dorv}/REPRO_1_4/ocean.output 
     143    set f1s = ./WGYRE_4/{$mach}/{$dorv}/REPRO_1_4/solver.stat 
     144    set f2o = ./WGYRE_4/{$mach}/{$dorv}/REPRO_2_2/ocean.output 
     145    set f2s = ./WGYRE_4/{$mach}/{$dorv}/REPRO_2_2/solver.stat 
     146   
     147    cmp -s $f1s $f2s 
     148    if ( $status == 0 ) then 
     149      echo "GYRE     reproducibility passed" 
     150    else 
     151      echo "GYRE     reproducibility FAILED" 
     152      if ( $pass == 1 ) then 
     153        echo "<return> to view solver.stat differences" 
     154        set y = $< 
     155        sdiff $f1s $f2s 
     156        echo "<return> to view ocean.output differences" 
     157        set y = $< 
     158        sdiff $f1o $f2o | grep "|" 
    160159        echo "<return> to continue" 
    161160        set y = $< 
     
    178177        echo "<return> to view solver.stat differences" 
    179178        set y = $< 
    180         sdiff -W $f1s $f2s 
    181         echo "<return> to view ocean.output differences" 
    182         set y = $< 
    183         sdiff -W $f1o $f2o | grep "|" 
     179        sdiff $f1s $f2s 
     180        echo "<return> to view ocean.output differences" 
     181        set y = $< 
     182        sdiff $f1o $f2o | grep "|" 
    184183        echo "<return> to continue" 
    185184        set y = $< 
     
    202201        echo "<return> to view tracer.stat differences" 
    203202        set y = $< 
    204         sdiff -W $f1s $f2s 
    205         echo "<return> to view ocean.output differences" 
    206         set y = $< 
    207         sdiff -W $f1o $f2o | grep "|" 
     203        sdiff $f1s $f2s 
     204        echo "<return> to view ocean.output differences" 
     205        set y = $< 
     206        sdiff $f1o $f2o | grep "|" 
    208207        echo "<return> to continue" 
    209208        set y = $< 
     
    226225        echo "<return> to view solver.stat differences" 
    227226        set y = $< 
    228         sdiff -W $f1s $f2s 
    229         echo "<return> to view ocean.output differences" 
    230         set y = $< 
    231         sdiff -W $f1o $f2o | grep "|" 
    232         echo "<return> to continue" 
    233         set y = $< 
    234       endif 
     227        sdiff $f1s $f2s 
     228        echo "<return> to view ocean.output differences" 
     229        set y = $< 
     230        sdiff $f1o $f2o | grep "|" 
     231        echo "<return> to continue" 
     232        set y = $< 
     233      endif 
     234    endif 
     235  endif 
     236 
     237  if ( -d ./WORCA2AGUL_1_2 ) then 
     238    set f1o = ./WORCA2AGUL_1_2/{$mach}/{$dorv}/SHORT/ocean.output 
     239    set f1s = ./WORCA2AGUL_1_2/{$mach}/{$dorv}/SHORT/solver.stat 
     240 
     241    if ( -f $f1o && -f  $f1s ) then 
     242      echo "ORCA2_LIM_AGRIF runability passed" 
     243    else 
     244      echo "ORCA2_LIM_AGRIF runability FAILED" 
    235245    endif 
    236246  endif 
  • branches/2012/dev_MERGE_2012/NEMOGCM/TOOLS/COMPILE/Fmake_config.sh

    r3294 r3715  
    6464[ -f ${2}/EXP00/AGRIF_FixedGrids.in ] &&  \cp -R  ${2}/EXP00/AGRIF_FixedGrids.in ${1}/EXP00/. 
    6565[ -f ${2}/EXP00/iodef.xml ] &&  \cp -R  ${2}/EXP00/iodef.xml ${1}/EXP00/. 
     66[ -f ${2}/EXP00/field_def.xml ] &&  \cp -R  ${2}/EXP00/field_def.xml ${1}/EXP00/. 
     67[ -f ${2}/EXP00/domain_def.xml ] &&  \cp -R  ${2}/EXP00/domain_def.xml ${1}/EXP00/. 
    6668[ -f ${2}/EXP00/xmlio_server.def ] &&  \cp -R  ${2}/EXP00/xmlio_server.def ${1}/EXP00/. 
    6769[ -d    ${2}/MY_SRC ] && \cp  ${2}/MY_SRC/* ${1}/MY_SRC/. 2> /dev/null 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.