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Changeset 4148 for branches/2013/dev_LOCEAN_2013/NEMOGCM/CONFIG – NEMO

Ignore:
Timestamp:
2013-11-04T13:54:28+01:00 (10 years ago)
Author:
cetlod
Message:

merge in trunk changes between r3853 and r3940 and commit the changes, see ticket #1169

Location:
branches/2013/dev_LOCEAN_2013/NEMOGCM/CONFIG
Files:
17 edited

Legend:

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Removed

  • branches/2013/dev_LOCEAN_2013/NEMOGCM/CONFIG/AMM12/EXP00/iodef.xml

    r4147 r4148  
    2121    --> 
    2222     
    23     <file_definition type="multiple_file" sync_freq="1d" min_digits="4"> 
     23    <file_definition type="multiple_file" name="@expname@_@freq@_@startdate@_@enddate@" sync_freq="10d" min_digits="4"> 
    2424     
     25      <file_group id="1ts" output_freq="1ts"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1 time step files --> 
     26 
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  • branches/2013/dev_LOCEAN_2013/NEMOGCM/CONFIG/GYRE/EXP00/iodef.xml

    r4147 r4148  
    2121    --> 
    2222     
    23     <file_definition type="multiple_file" sync_freq="1d" min_digits="4"> 
     23    <file_definition type="multiple_file" name="@expname@_@freq@_@startdate@_@enddate@" sync_freq="1d" min_digits="4"> 
    2424     
     25      <file_group id="1ts" output_freq="1ts"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1 time step files --> 
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    2627      <file_group id="2h" output_freq="2h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 2h files --> 
    … …  
    3334      <file_group id="5d" output_freq="5d"  output_level="10" enabled=".TRUE.">  <!-- 5d files -->   
    3435  
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     36   <file id="file1" name_suffix="_grid_T" description="ocean T grid variables" > 
    3637     <field field_ref="toce"         name="votemper"  /> 
    3738     <field field_ref="soce"         name="vosaline"  /> 
    … …  
    4748        </file> 
    4849    
    49         <file id="5d_grid_U" name="auto" description="ocean U grid variables" > 
     50   <file id="file2" name_suffix="_grid_U" description="ocean U grid variables" > 
    5051          <field field_ref="uoce"         name="vozocrtx"  /> 
    5152          <field field_ref="utau"         name="sozotaux"  /> 
    5253        </file> 
    5354    
    54         <file id="5d_grid_V" name="auto" description="ocean V grid variables" > 
     55   <file id="file3" name_suffix="_grid_V" description="ocean V grid variables" > 
    5556          <field field_ref="voce"         name="vomecrty"  />  
    5657          <field field_ref="vtau"         name="sometauy"  />  
    5758        </file> 
    5859    
    59         <file id="5d_grid_W" name="auto" description="ocean W grid variables" > 
     60   <file id="file4" name_suffix="_grid_W" description="ocean W grid variables" > 
    6061          <field field_ref="woce"         name="vovecrtz" /> 
    6162          <field field_ref="avt"          name="votkeavt" /> 

  • branches/2013/dev_LOCEAN_2013/NEMOGCM/CONFIG/GYRE_BFM/EXP00/iodef.xml

    r3771 r4148  
    2121    --> 
    2222     
    23     <file_definition type="multiple_file" sync_freq="1d" min_digits="4"> 
     23    <file_definition type="multiple_file" name="@expname@_@freq@_@startdate@_@enddate@" sync_freq="10d" min_digits="4"> 
    2424     
     25      <file_group id="1ts" output_freq="1ts"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1 time step files --> 
     26 
    2527      <file_group id="1h" output_freq="1h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1h files --> 
    2628      <file_group id="2h" output_freq="2h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 2h files --> 

  • branches/2013/dev_LOCEAN_2013/NEMOGCM/CONFIG/GYRE_PISCES/EXP00/iodef.xml

    r3771 r4148  
    2121    --> 
    2222     
    23     <file_definition type="multiple_file" sync_freq="1d" min_digits="4"> 
     23    <file_definition type="multiple_file" name="@expname@_@freq@_@startdate@_@enddate@" sync_freq="10d" min_digits="4"> 
    2424     
     25      <file_group id="1ts" output_freq="1ts"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1 time step files --> 
     26 
    2527      <file_group id="1h" output_freq="1h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1h files --> 
    2628      <file_group id="2h" output_freq="2h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 2h files --> 
    … …  
    3335      <file_group id="5d" output_freq="5d"  output_level="10" enabled=".TRUE.">  <!-- 5d files -->    
    3436  
    35         <file id="5d_grid_T" name="auto" description="ocean T grid variables" > 
     37        <file id="file1" name_suffix="_grid_T" description="ocean T grid variables" > 
    3638     <field field_ref="toce"         name="votemper"  /> 
    3739     <field field_ref="soce"         name="vosaline"  /> 
    … …  
    4749        </file> 
    4850    
    49         <file id="5d_grid_U" name="auto" description="ocean U grid variables" > 
     51        <file id="file2" name_suffix="_grid_U" description="ocean U grid variables" > 
    5052          <field field_ref="uoce"         name="vozocrtx"  /> 
    5153          <field field_ref="utau"         name="sozotaux"  /> 
    5254        </file> 
    5355    
    54         <file id="5d_grid_V" name="auto" description="ocean V grid variables" > 
     56        <file id="file3" name_suffix="_grid_V" description="ocean V grid variables" > 
    5557          <field field_ref="voce"         name="vomecrty"  />  
    5658          <field field_ref="vtau"         name="sometauy"  />  
    5759        </file> 
    5860    
    59         <file id="5d_grid_W" name="auto" description="ocean W grid variables" > 
     61        <file id="file4" name_suffix="_grid_W" description="ocean W grid variables" > 
    6062          <field field_ref="woce"         name="vovecrtz" /> 
    6163          <field field_ref="avt"          name="votkeavt" /> 
    … …  
    6365        </file> 
    6466 
    65    <file id="5d_ptrc_T" name="auto" description="lobster sms variables" > 
     67   <file id="file5" name="_ptrc_T" description="lobster sms variables" > 
    6668          <field field_ref="DET"      /> 
    6769          <field field_ref="ZOO"      /> 
    … …  
    8284      <file_group id="1y"  output_freq="1y" output_level="10" enabled=".TRUE."> <!-- real yearly files --> 
    8385 
    84    <file id="1y_diad_T" name="auto" description="additional lobster diagnostics" >   
     86   <file id="file6" name_suffix="_diad_T" description="additional lobster diagnostics" >   
    8587          <field field_ref="FNO3PHY"   />  
    8688          <field field_ref="FNH4PHY"   />  

  • branches/2013/dev_LOCEAN_2013/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/EXP00/iodef_ar5.xml

    r3771 r4148  
    2626    --> 
    2727     
    28     <file_definition type="multiple_file" output_level="10" sync_freq="1d" min_digits="4"> 
     28    <file_definition type="multiple_file" name="@expname@_@freq@_@startdate@_@enddate@" output_level="10" sync_freq="2mo" min_digits="4"> 
    2929      <!-- 
    3030+++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++   daily   ++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++ 
    3131        --> 
    3232      <file_group id="1d" output_freq="1d"  enabled=".TRUE.">                      <!-- 1d files --> 
    33    <file id="1d_grid_T" name="auto" name_suffix="_table2.2" >         <!-- grid T  --> 
     33   <file id="file1" name_suffix="_grid_T_table2.2" >         <!-- grid T  --> 
    3434     <field field_ref="sst"          name='tos'      long_name="sea_surface_temperature"                              level="2"                      /> 
    3535     <field field_ref="sst2"         name='tossq'    long_name="square_of_sea_surface_temperature"                    level="2"                      /> 
    … …  
    4343   <!-- 
    4444..............................................    grid T   ................................................. 
    45      --> 
    46    <file_group id="1m_grid_T" name="auto" >                                                        <!-- grid T --> 
    47       
    48      <file id="1m grid_T table 2.2" name_suffix="_table2.2" > 
    49        <field field_ref="botpres"      name="pbo"      long_name="sea_water_pressure_at_sea_floor"                               /> 
    50        <!-- pso : sea_water_pressure_at_sea_water_surface = 0 --> 
    51        <field field_ref="ssh"          name="zos"      long_name="sea_surface_height_above_geoid"                                 /> 
    52        <field field_ref="ssh2"         name="zossq"    long_name="square_of_sea_surface_height_above_geoid"             level="2" /> 
    53        <!-- masscello : sea_water_mass_per_unit_area = cellthc*rau0                                          no time changes --> 
    54        <field field_ref="cellthc"      name="thkcello" long_name="cell_thickness"                                                 /> <!-- no time changes --> 
    55        <field field_ref="toce"         name="thetao"   long_name="sea_water_potential_temperature"                                /> 
    56        <field field_ref="sst"          name="tos"      long_name="sea_surface_temperature"                              level="1" /> 
    57        <field field_ref="sst2"         name="tossq"    long_name="square_of_sea_surface_temperature"                    level="2" /> 
    58        <field field_ref="soce"         name="so"       long_name="sea_water_salinity"                                             /> 
    59        <field field_ref="sss"          name="sos"      long_name="sea_surface_salinity"                                 level="1" /> 
    60        <field field_ref="rhop"         name="rhopoto"  long_name="sea_water_potential_density"                          level="2" /> 
    61        <!-- no agessc : sea_water_age_since_surface_contact --> 
    62        <!-- no cfc11  : moles_per_unit_mass_of_cfc11_in_sea_water --> 
    63        <!-- msftbarot : ocean_barotropic_mass_streamfunction : offline --> 
    64        <!-- mlotst    :           ocean_mixed_layer_thickness_defined_by_sigma_t : must be done offline --> 
    65        <!-- mlotstsq  : square_of_ocean_mixed_layer_thickness_defined_by_sigma_t : must be done offline --> 
    66        <field field_ref="mldkz5"       name='omlmax'   long_name="ocean_mixed_layer_thickness_defined_by_mixing_scheme" level="2" operation="maximum" /> 
    67      </file>    
    68       
    69      <file id="1m grid_T table 2.5" name_suffix="_table2.5" > 
    70        <field field_ref="rain"         name="pr"       long_name="rainfall_flux"                                           level="1" /> 
    71        <field field_ref="snow_ao_cea"  name="prsn"     long_name="snowfall_flux"                                           level="1" /> 
    72        <field field_ref="evap_ao_cea"  name="evs"      long_name="water_evaporation_flux"                                  level="1" /> 
    73        <field field_ref="runoffs"      name="friver"   long_name="water_flux_into_sea_water_from_rivers"                   level="1" /> 
    74        <field field_ref="calving"      name="ficeberg" long_name="water_flux_into_sea_water_from_icebergs"                 level="1" /> 
    75        <field field_ref="isnwmlt_cea"  name="fsitherm" long_name="water_flux_into_sea_water_due_to_sea_ice_thermodynamics" level="1" /> 
    76        <field field_ref="empmr"        name="wfo"      long_name="water_flux_into_sea_water"                               level="1" /> 
    77        <!-- wfonocorr : water_flux_into_sea_water_without_flux_correction : emp - erp -->   
    78        <field field_ref="erp"          name="wfcorr"   long_name="water_flux_correction"                                   level="1" /> <!-- usually = 0 --> 
    79      </file>    
    80       
    81      <file id="1m grid_T table 2.6" name_suffix="_table2.6" > 
    82        <!-- vsfpr    : virtual_salt_flux_into_sea_water_due_to_rainfall    = 0 -->  
    83        <!-- vsfevap  : virtual_salt_flux_into_sea_water_due_to_evaporation = 0 -->  
    84        <!-- vsfriver : virtual_salt_flux_into_sea_water_from_rivers        = 0 -->     
    85        <field field_ref="fsal_virt_cea" name="vsfsit" long_name="virtual_salt_flux_into_sea_water_due_to_sea_ice_thermodynamics" level="1" /> 
    86        <!-- vsf      : virtual_salt_flux_into_sea_water = fsal_virtual + fsal_real --> 
    87        <!-- wfcorr   : virtual_salt_flux_correction                        = 0 -->  
    88        <field field_ref="fsal_virt_cea" name="sfdsi"  long_name="downward_sea_ice_basal_salt_flux"                               level="1" /> 
    89        <!-- sfriver  : salt_flux_into_sea_water_from_rivers                = 0 -->  
    90      </file>    
    91       
    92      <file id="1m grid_T table 2.7" name_suffix="_table2.7" > 
    93        <!-- hfgeou : upward_geothermal_heat_flux_at_sea_floor : cte, see nambbc and trabbc.F90 --> 
    94        <field field_ref="hflx_rain_cea" name="hfrainds"    long_name="temperature_flux_due_to_rainfall_expressed_as_heat_flux_into_sea_water"      level="1" /> 
    95        <field field_ref="hflx_evap_cea" name="hfevapds"    long_name="temperature_flux_due_to_evaporation_expressed_as_heat_flux_out_of_sea_water" level="1" /> 
    96        <field field_ref="hflx_rnf_cea"  name="hfrunoffds"  long_name="temperature_flux_due_to_runoff_expressed_as_heat_flux_into_sea_water"        level="1" /> 
    97        <field field_ref="hflx_snow_cea" name="hfsnthermds" long_name="heat_flux_into_sea_water_due_to_snow_thermodynamics"                         level="1" /> 
    98        <field field_ref="hflx_ice_cea"  name="hfsithermds" long_name="heat_flux_into_sea_water_due_to_sea_ice_thermodynamics"                      level="1" /> 
    99        <field field_ref="hflx_cal_cea"  name="hfibthermds" long_name="heat_flux_into_sea_water_due_to_iceberg_thermodynamics"                      level="1" /> 
    100        <!-- rlds   : surface_net_downward_longwave_flux : not available --> 
    101        <!-- hfls   : surface_downward_latent_heat_flux  : not available --> 
    102        <!-- hfss   : surface_downward_sensible_heat_flux: not available --> 
    103        <field field_ref="qns"           name="nshfls"      long_name="surface_net_downward_non_solar_flux"                                         level="1" /> 
    104        <field field_ref="qsr"           name="rsntds"      long_name="surface_net_downward_shortwave_flux"                                         level="1" /> 
    105        <field field_ref="qsr3d"         name="rsds"        long_name="downwelling_shortwave_flux_in_sea_water"                                     level="1" /> 
    106        <field field_ref="qrp"           name="hfcorr"      long_name="heat_flux_correction"                                                        level="1" /> 
    107      </file>    
    108    </file_group> 
     45     -->    
     46   <file id="file2" name_suffix="_grid_T_table2.2" > 
     47     <field field_ref="botpres"      name="pbo"      long_name="sea_water_pressure_at_sea_floor"                               /> 
     48     <!-- pso : sea_water_pressure_at_sea_water_surface = 0 --> 
     49     <field field_ref="ssh"          name="zos"      long_name="sea_surface_height_above_geoid"                                 /> 
     50     <field field_ref="ssh2"         name="zossq"    long_name="square_of_sea_surface_height_above_geoid"             level="2" /> 
     51     <!-- masscello : sea_water_mass_per_unit_area = cellthc*rau0                                          no time changes --> 
     52     <field field_ref="cellthc"      name="thkcello" long_name="cell_thickness"                                                 /> <!-- no time changes --> 
     53     <field field_ref="toce"         name="thetao"   long_name="sea_water_potential_temperature"                                /> 
     54     <field field_ref="sst"          name="tos"      long_name="sea_surface_temperature"                              level="1" /> 
     55     <field field_ref="sst2"         name="tossq"    long_name="square_of_sea_surface_temperature"                    level="2" /> 
     56     <field field_ref="soce"         name="so"       long_name="sea_water_salinity"                                             /> 
     57     <field field_ref="sss"          name="sos"      long_name="sea_surface_salinity"                                 level="1" /> 
     58     <field field_ref="rhop"         name="rhopoto"  long_name="sea_water_potential_density"                          level="2" /> 
     59     <!-- no agessc : sea_water_age_since_surface_contact --> 
     60     <!-- no cfc11  : moles_per_unit_mass_of_cfc11_in_sea_water --> 
     61     <!-- msftbarot : ocean_barotropic_mass_streamfunction : offline --> 
     62     <!-- mlotst    :           ocean_mixed_layer_thickness_defined_by_sigma_t : must be done offline --> 
     63     <!-- mlotstsq  : square_of_ocean_mixed_layer_thickness_defined_by_sigma_t : must be done offline --> 
     64     <field field_ref="mldkz5"       name='omlmax'   long_name="ocean_mixed_layer_thickness_defined_by_mixing_scheme" level="2" operation="maximum" /> 
     65   </file>    
     66    
     67   <file id="file3" name_suffix="_grid_T_table2.5" > 
     68     <field field_ref="rain"         name="pr"       long_name="rainfall_flux"                                           level="1" /> 
     69     <field field_ref="snow_ao_cea"  name="prsn"     long_name="snowfall_flux"                                           level="1" /> 
     70     <field field_ref="evap_ao_cea"  name="evs"      long_name="water_evaporation_flux"                                  level="1" /> 
     71     <field field_ref="runoffs"      name="friver"   long_name="water_flux_into_sea_water_from_rivers"                   level="1" /> 
     72     <field field_ref="calving"      name="ficeberg" long_name="water_flux_into_sea_water_from_icebergs"                 level="1" /> 
     73     <field field_ref="isnwmlt_cea"  name="fsitherm" long_name="water_flux_into_sea_water_due_to_sea_ice_thermodynamics" level="1" /> 
     74     <field field_ref="empmr"        name="wfo"      long_name="water_flux_into_sea_water"                               level="1" /> 
     75     <!-- wfonocorr : water_flux_into_sea_water_without_flux_correction : emp - erp -->   
     76     <field field_ref="erp"          name="wfcorr"   long_name="water_flux_correction"                                   level="1" /> <!-- usually = 0 --> 
     77   </file>    
     78    
     79   <file id="file4" name_suffix="_grid_T_table2.6" > 
     80     <!-- vsfpr    : virtual_salt_flux_into_sea_water_due_to_rainfall    = 0 -->  
     81     <!-- vsfevap  : virtual_salt_flux_into_sea_water_due_to_evaporation = 0 -->  
     82     <!-- vsfriver : virtual_salt_flux_into_sea_water_from_rivers        = 0 -->       
     83     <field field_ref="fsal_virt_cea" name="vsfsit" long_name="virtual_salt_flux_into_sea_water_due_to_sea_ice_thermodynamics" level="1" /> 
     84     <!-- vsf      : virtual_salt_flux_into_sea_water = fsal_virtual + fsal_real --> 
     85     <!-- wfcorr   : virtual_salt_flux_correction                        = 0 -->  
     86     <field field_ref="fsal_virt_cea" name="sfdsi"  long_name="downward_sea_ice_basal_salt_flux"                               level="1" /> 
     87     <!-- sfriver  : salt_flux_into_sea_water_from_rivers                = 0 -->  
     88   </file>    
     89    
     90   <file id="file5" name_suffix="_grid_T_table2.7" > 
     91     <!-- hfgeou : upward_geothermal_heat_flux_at_sea_floor : cte, see nambbc and trabbc.F90 --> 
     92     <field field_ref="hflx_rain_cea" name="hfrainds"    long_name="temperature_flux_due_to_rainfall_expressed_as_heat_flux_into_sea_water"      level="1" /> 
     93     <field field_ref="hflx_evap_cea" name="hfevapds"    long_name="temperature_flux_due_to_evaporation_expressed_as_heat_flux_out_of_sea_water" level="1" /> 
     94     <field field_ref="hflx_rnf_cea"  name="hfrunoffds"  long_name="temperature_flux_due_to_runoff_expressed_as_heat_flux_into_sea_water"        level="1" /> 
     95     <field field_ref="hflx_snow_cea" name="hfsnthermds" long_name="heat_flux_into_sea_water_due_to_snow_thermodynamics"                         level="1" /> 
     96     <field field_ref="hflx_ice_cea"  name="hfsithermds" long_name="heat_flux_into_sea_water_due_to_sea_ice_thermodynamics"                      level="1" /> 
     97     <field field_ref="hflx_cal_cea"  name="hfibthermds" long_name="heat_flux_into_sea_water_due_to_iceberg_thermodynamics"                      level="1" /> 
     98     <!-- rlds   : surface_net_downward_longwave_flux : not available --> 
     99     <!-- hfls   : surface_downward_latent_heat_flux  : not available --> 
     100     <!-- hfss   : surface_downward_sensible_heat_flux: not available --> 
     101     <field field_ref="qns"           name="nshfls"      long_name="surface_net_downward_non_solar_flux"                                         level="1" /> 
     102     <field field_ref="qsr"           name="rsntds"      long_name="surface_net_downward_shortwave_flux"                                         level="1" /> 
     103     <field field_ref="qsr3d"         name="rsds"        long_name="downwelling_shortwave_flux_in_sea_water"                                     level="1" /> 
     104     <field field_ref="qrp"           name="hfcorr"      long_name="heat_flux_correction"                                                        level="1" /> 
     105   </file>    
    109106   <!-- 
    110107..............................................    grid U   ................................................. 
    111      --> 
    112    <file_group id="1m_grid_U" name="auto" >                                                        <!-- grid U --> 
    113  
    114      <file id="1m grid_U table 2.3" name_suffix="_table2.3" > 
    115        <field field_ref="uoce"         name="uo"      long_name="sea_water_x_velocity"                                       /> 
    116        <field field_ref="u_masstr"     name="umo"     long_name="ocean_mass_x_transport"                           level="1" /> 
    117        <field field_ref="u_heattr"     name="hfx"     long_name="ocean_heat_x_transport"                           level="1" /> 
    118        <field field_ref="ueiv_heattr"  name="hfxba"   long_name="ocean_heat_x_transport_due_to_bolus_advection"    level="2" /> 
    119        <field field_ref="udiff_heattr" name="hfxdiff" long_name="ocean_heat_x_transport_due_to_diffusion"          level="2" /> 
    120      </file>    
    121  
    122      <file id="1m grid_U table 2.8" name_suffix="_table2.8" > 
    123        <field field_ref="utau"         name="tauuo" long_name="surface_downward_x_stress"                          level="1" /> 
    124        <!-- tauucorr : surface_downward_x_stress_correction = 0 --> 
    125      </file>    
    126  
    127    </file_group> 
     108   --> 
     109   <file id="file6" name_suffix="_grid_U_table2.3" > 
     110     <field field_ref="uoce"         name="uo"      long_name="sea_water_x_velocity"                                       /> 
     111     <field field_ref="u_masstr"     name="umo"     long_name="ocean_mass_x_transport"                           level="1" /> 
     112     <field field_ref="u_heattr"     name="hfx"     long_name="ocean_heat_x_transport"                           level="1" /> 
     113     <field field_ref="ueiv_heattr"  name="hfxba"   long_name="ocean_heat_x_transport_due_to_bolus_advection"    level="2" /> 
     114     <field field_ref="udiff_heattr" name="hfxdiff" long_name="ocean_heat_x_transport_due_to_diffusion"          level="2" /> 
     115   </file>    
     116    
     117   <file id="file7" name_suffix="_grid_U_table2.8" > 
     118     <field field_ref="utau"         name="tauuo" long_name="surface_downward_x_stress"                          level="1" /> 
     119     <!-- tauucorr : surface_downward_x_stress_correction = 0 --> 
     120   </file>    
    128121   <!-- 
    129122..............................................    grid V   ................................................. 
    130      --> 
    131    <file_group id="1m_grid_V" name="auto" >                                                        <!-- grid V --> 
    132  
    133      <file id="1m grid_V table 2.3" name_suffix="_table2.3" > 
    134        <field field_ref="voce"         name="vo"      long_name="sea_water_y_velocity"                                       /> 
    135        <field field_ref="v_masstr"     name="vmo"     long_name="ocean_mass_y_transport"                           level="1" /> 
    136        <field field_ref="v_heattr"     name="hfy"     long_name="ocean_heat_y_transport"                           level="1" /> 
    137        <field field_ref="veiv_heattr"  name="hfyba"   long_name="ocean_heat_y_transport_due_to_bolus_advection"    level="2" /> 
    138        <field field_ref="vdiff_heattr" name="hfydiff" long_name="ocean_heat_y_transport_due_to_diffusion"          level="2" /> 
    139      </file>    
    140  
    141      <file id="1m grid_V table 2.8" name_suffix="_table2.8" > 
    142        <field field_ref="vtau"         name="tauvo" long_name="surface_downward_y_stress"                          level="1" /> 
    143        <!-- tauvcorr : surface_downward_y_stress_correction = 0 --> 
    144      </file>    
    145  
    146    </file_group> 
     123   --> 
     124   <file id="file8" name_suffix="_grid_V_table2.3" > 
     125     <field field_ref="voce"         name="vo"      long_name="sea_water_y_velocity"                                       /> 
     126     <field field_ref="v_masstr"     name="vmo"     long_name="ocean_mass_y_transport"                           level="1" /> 
     127     <field field_ref="v_heattr"     name="hfy"     long_name="ocean_heat_y_transport"                           level="1" /> 
     128     <field field_ref="veiv_heattr"  name="hfyba"   long_name="ocean_heat_y_transport_due_to_bolus_advection"    level="2" /> 
     129     <field field_ref="vdiff_heattr" name="hfydiff" long_name="ocean_heat_y_transport_due_to_diffusion"          level="2" /> 
     130   </file>    
     131    
     132   <file id="file9" name_suffix="_grid_V_table2.8" > 
     133     <field field_ref="vtau"         name="tauvo" long_name="surface_downward_y_stress"                          level="1" /> 
     134     <!-- tauvcorr : surface_downward_y_stress_correction = 0 --> 
     135   </file>    
    147136   <!-- 
    148137..............................................    grid W   ................................................. 
    149      --> 
    150    <file_group id="1m_grid_W" name="auto" >                                                        <!-- grid W --> 
    151       
    152      <file id="1m grid_W table 2.3" name_suffix="_table2.3" > 
    153        <field field_ref="w_masstr"   name="wmo"   long_name="upward_ocean_mass_transport"                                    /> 
    154        <field field_ref="w_masstr2"  name="wmosq" long_name="square_pf_upward_ocean_mass_transport"                          /> 
    155      </file>    
    156       
    157      <file id="1m grid_W table 2.9" name_suffix="_table2.9" > 
    158        <field field_ref="avt"     name="difvho"   long_name="ocean_vertical_heat_diffusivity"                  level="2" /> 
    159        <field field_ref="avs"     name="difvso"   long_name="ocean_vertical_salt_diffusivity"                  level="2" /> 
    160        <!-- difvtrbo : ocean_vertical_tracer_diffusivity_due_to_background : cte with time, see namelist parameters nn_avb and  nn_havtb --> 
    161        <field field_ref="av_tide" name="difvtrto" long_name="ocean_vertical_tracer_diffusivity_due_to_tides"   level="2" /> 
    162        <!-- tnpeo     : tendency_of_ocean_potential_energy_content                   : not available --> 
    163        <!-- tnpeot    : tendency_of_ocean_potential_energy_content_due_to_tides      : not available --> 
    164        <!-- tnpeotb   : tendency_of_ocean_potential_energy_content_due_to_background : not available --> 
    165        <field field_ref="avm"     name="difvmo"   long_name="ocean_vertical_momentum_diffusivity"              level="2" /> 
    166        <!-- difvmbo : ocean_vertical_momentum_diffusivity_due_to_background : cte with time, see namelist parameters nn_avb --> 
    167        <field field_ref="av_tide" name="difvmto"  long_name="ocean_vertical_momentum_diffusivity_due_to_tides" level="2" /> <!-- same as tracer --> 
    168        <!-- difvmfdo : ocean_vertical_momentum_diffusivity_due_to_form_drag : ??? --> 
    169        <!-- dispkevfo : ocean_kinetic_energy_dissipation_per_unit_area_due_to_vertical_friction : not available --> 
    170      </file> 
    171  
    172      <file id="1m grid_W table 2.10" name_suffix="_table2.10" > 
    173        <!-- if ln_traldf_lap    =  .true. --> 
    174        <field field_ref="aht2d_eiv" name="diftrblo" long_name="ocean_tracer_bolus_laplacian_diffusivity"                     level="2" /> 
    175        <!-- diftrelo : ocean_tracer_epineutral_laplacian_diffusivity : cte with time, see ln_traldf_iso --> 
    176        <!-- diftrxylo : ocean_tracer_xy_laplacian_diffusivity : cte with time --> 
    177        <!-- if ln_traldf_bilap  =  .true. --> 
    178        <!-- field field_ref="diftrbbo" name="aht2d_eiv" long_name="ocean_tracer_bolus_biharmonic_diffusivity"                    level="2" /--> 
    179        <!-- diftrebo : ocean_tracer_epineutral_biharmonic_diffusivity : cte with time, see ln_traldf_iso --> 
    180        <!-- diftrxybo : ocean_tracer_xy_biharmonic_diffusivity : cte with time --> 
    181        <!-- tnkebto : tendency_of_ocean_eddy_kinetic_energy_content_due_to_bolus_transport : not available --> 
    182        <!-- difmxylo : ocean_momentum_xy_laplacian_diffusivity : cte with time, see ln_dynldf_lap --> 
    183        <!-- difmxybo : ocean_momentum_xy_biharmonic_diffusivity : cte with time, see ln_dynldf_bilap --> 
    184        <!-- dispkexyfo : ocean_kinetic_energy_dissipation_per_unit_area_due_to_xy_friction : not available --> 
    185      </file>    
    186  
    187    </file_group> 
     138   --> 
     139   <file id="file10" name_suffix="_grid_W_table2.3" > 
     140     <field field_ref="w_masstr"   name="wmo"   long_name="upward_ocean_mass_transport"                                    /> 
     141     <field field_ref="w_masstr2"  name="wmosq" long_name="square_pf_upward_ocean_mass_transport"                          /> 
     142   </file>    
     143    
     144   <file id="file11" name_suffix="_grid_W_table2.9" > 
     145     <field field_ref="avt"     name="difvho"   long_name="ocean_vertical_heat_diffusivity"                  level="2" /> 
     146     <field field_ref="avs"     name="difvso"   long_name="ocean_vertical_salt_diffusivity"                  level="2" /> 
     147     <!-- difvtrbo : ocean_vertical_tracer_diffusivity_due_to_background : cte with time, see namelist parameters nn_avb and  nn_havtb --> 
     148     <field field_ref="av_tide" name="difvtrto" long_name="ocean_vertical_tracer_diffusivity_due_to_tides"   level="2" /> 
     149     <!-- tnpeo     : tendency_of_ocean_potential_energy_content                   : not available --> 
     150     <!-- tnpeot    : tendency_of_ocean_potential_energy_content_due_to_tides      : not available --> 
     151     <!-- tnpeotb   : tendency_of_ocean_potential_energy_content_due_to_background : not available --> 
     152     <field field_ref="avm"     name="difvmo"   long_name="ocean_vertical_momentum_diffusivity"              level="2" /> 
     153     <!-- difvmbo : ocean_vertical_momentum_diffusivity_due_to_background : cte with time, see namelist parameters nn_avb --> 
     154     <field field_ref="av_tide" name="difvmto"  long_name="ocean_vertical_momentum_diffusivity_due_to_tides" level="2" /> <!-- same as tracer --> 
     155     <!-- difvmfdo : ocean_vertical_momentum_diffusivity_due_to_form_drag : ??? --> 
     156     <!-- dispkevfo : ocean_kinetic_energy_dissipation_per_unit_area_due_to_vertical_friction : not available --> 
     157   </file> 
     158    
     159   <file id="file12" name_suffix="_grid_W_table2.10" > 
     160     <!-- if ln_traldf_lap    =  .true. --> 
     161     <field field_ref="aht2d_eiv" name="diftrblo" long_name="ocean_tracer_bolus_laplacian_diffusivity"                     level="2" /> 
     162     <!-- diftrelo : ocean_tracer_epineutral_laplacian_diffusivity : cte with time, see ln_traldf_iso --> 
     163     <!-- diftrxylo : ocean_tracer_xy_laplacian_diffusivity : cte with time --> 
     164     <!-- if ln_traldf_bilap  =  .true. --> 
     165     <!-- field field_ref="diftrbbo" name="aht2d_eiv" long_name="ocean_tracer_bolus_biharmonic_diffusivity"                    level="2" /--> 
     166     <!-- diftrebo : ocean_tracer_epineutral_biharmonic_diffusivity : cte with time, see ln_traldf_iso --> 
     167     <!-- diftrxybo : ocean_tracer_xy_biharmonic_diffusivity : cte with time --> 
     168     <!-- tnkebto : tendency_of_ocean_eddy_kinetic_energy_content_due_to_bolus_transport : not available --> 
     169     <!-- difmxylo : ocean_momentum_xy_laplacian_diffusivity : cte with time, see ln_dynldf_lap --> 
     170     <!-- difmxybo : ocean_momentum_xy_biharmonic_diffusivity : cte with time, see ln_dynldf_bilap --> 
     171     <!-- dispkexyfo : ocean_kinetic_energy_dissipation_per_unit_area_due_to_xy_friction : not available --> 
     172   </file>    
    188173   <!-- 
    189174..............................................    scalar   ................................................. 
    190      --> 
    191    <file id="1m_scalar" name="auto" name_suffix="_table2.2" >         <!-- scalar --> 
     175   --> 
     176   <file id="file13" name_suffix="_scalar_table2.2" >         <!-- scalar --> 
    192177     <field field_ref="masstot"    name="masso"    long_name="sea_water_mass"                                /> 
    193178     <field field_ref="voltot"     name="volo"     long_name="sea_water_volume"                              /> 
    … …  
    200185   <!-- 
    201186..............................................    icemod   ................................................. 
    202      --> 
    203    <file id="1m_icemod" name="auto" name_suffix="_table2.2" >         <!-- scalar --> 
     187   --> 
     188   <file id="file14" name_suffix="_icemod_table2.2" >         <!-- scalar --> 
    204189     <field field_ref="ice_pres"                     /> 
    205190     <field field_ref="ice_cover"    name="sic"        long_name="sea_ice_area_fraction"                            /> 

  • branches/2013/dev_LOCEAN_2013/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/EXP00/iodef_default.xml

    r3771 r4148  
    2121    --> 
    2222     
    23     <file_definition type="multiple_file" sync_freq="1d" min_digits="4"> 
     23    <file_definition type="multiple_file" name="@expname@_@freq@_@startdate@_@enddate@" sync_freq="10d" min_digits="4"> 
    2424     
     25      <file_group id="1ts" output_freq="1ts"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1 time step files --> 
     26 
    2527      <file_group id="1h" output_freq="1h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1h files --> 
    2628      <file_group id="2h" output_freq="2h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 2h files --> 
    … …  
    3133      <file_group id="1d" output_freq="1d"  output_level="10" enabled=".TRUE."> <!-- 1d files --> 
    3234 
    33    <file id="1d_grid_T" name="auto" description="ocean T grid variables" > 
     35   <file id="file1" name_suffix="_grid_T" description="ocean T grid variables" > 
    3436     <field field_ref="sst"          name="tos"      long_name="sea_surface_temperature"                       /> 
    3537     <field field_ref="sss"          name="sos"      long_name="sea_surface_salinity"                          /> 
    … …  
    3739   </file> 
    3840 
    39    <file id="1d_grid_U" name="auto" description="ocean U grid variables" > 
     41   <file id="file2" name_suffix="_grid_U" description="ocean U grid variables" > 
    4042     <field field_ref="suoce"        name="uos"     long_name="sea_surface_x_velocity"    /> 
    4143   </file> 
    4244    
    43    <file id="1d_grid_V" name="auto" description="ocean V grid variables" > 
     45   <file id="file3" name_suffix="_grid_V" description="ocean V grid variables" > 
    4446     <field field_ref="svoce"        name="vos"     long_name="sea_surface_y_velocity"    /> 
    4547   </file> 
    4648    
    4749      </file_group> 
     50 
    4851      <file_group id="3d" output_freq="3d"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 3d files -->     
    4952 
    5053      <file_group id="5d" output_freq="5d"  output_level="10" enabled=".TRUE.">  <!-- 5d files -->    
    5154 
    52    <file id="5d_grid_T" name="auto" description="ocean T grid variables" > 
     55   <file id="file4" name_suffix="_grid_T" description="ocean T grid variables" > 
    5356     <field field_ref="toce"         name="thetao"   long_name="sea_water_potential_temperature"               /> 
    5457     <field field_ref="soce"         name="so"       long_name="sea_water_salinity"                            /> 
    … …  
    6669   </file> 
    6770    
    68    <file id="5d_grid_U" name="auto" description="ocean U grid variables" > 
     71   <file id="file5" name_suffix="_grid_U" description="ocean U grid variables" > 
    6972     <field field_ref="uoce"         name="uo"      long_name="sea_water_x_velocity"      /> 
    7073     <field field_ref="suoce"        name="uos"     long_name="sea_surface_x_velocity"    /> 
    … …  
    7275   </file> 
    7376    
    74    <file id="5d_grid_V" name="auto" description="ocean V grid variables" > 
     77   <file id="file6" name_suffix="_grid_V" description="ocean V grid variables" > 
    7578     <field field_ref="voce"         name="vo"      long_name="sea_water_y_velocity"      /> 
    7679     <field field_ref="svoce"        name="vos"     long_name="sea_surface_y_velocity"    /> 
    … …  
    7881   </file> 
    7982    
    80    <file id="5d_grid_W" name="auto" description="ocean W grid variables" > 
     83   <file id="file7" name_suffix="_grid_W" description="ocean W grid variables" > 
    8184     <field field_ref="woce"         name="wo"      long_name="ocean vertical velocity"         /> 
    8285     <field field_ref="avt"          name="difvho"  long_name="ocean_vertical_heat_diffusivity" /> 
    8386   </file> 
    8487    
    85    <file id="5d_icemod" name="auto" description="ice variables" > 
     88   <file id="file8" name_suffix="_icemod" description="ice variables" > 
    8689     <field field_ref="ice_pres"                     /> 
    8790     <field field_ref="snowthic_cea" name="snd"     long_name="surface_snow_thickness"   /> 

  • branches/2013/dev_LOCEAN_2013/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/EXP00/iodef_demo.xml

    r3771 r4148  
    2121    --> 
    2222     
    23     <file_definition type="multiple_file" sync_freq="1d" min_digits="4"> 
     23    <file_definition type="multiple_file" name="@expname@_@freq@_@startdate@_@enddate@" sync_freq="1d" min_digits="4"> 
    2424     
    2525      <file_group id="1h" output_freq="1h"  output_level="10" enabled=".TRUE."> <!-- 1h files --> 
    26    <file id="1h_grid_T" name="auto" description="ocean T grid variables" > 
     26   <file id="file1" name_suffix="_grid_T" description="ocean T grid variables" > 
    2727     <field field_ref="sst"  /> 
    2828     <field field_ref="qsr"  /> 
    … …  
    3232      
    3333      <file_group id="1d" output_freq="1d"  output_level="10" enabled=".TRUE."> <!-- 1d files --> 
    34  
    35    <file_group id="1d_grid_T" name="auto" description="ocean T grid variables" > 
    36  
    37      <!-- example of "hand made" zoom  --> 
    38      <file id="blabla_1" name_suffix="_myzoom" > 
    39        <!-- group of variables sharing the same zoom. see zoom definition in domain_def.xml --> 
    40        <field_group id="blabla" domain_ref="myzoom" >     
    41          <field field_ref="toce" /> 
    42          <field field_ref="soce" /> 
    43        </field_group> 
    44      </file> 
    45  
    46      <!-- mooring: automatic definition of the file name suffix based on id="0n180wT"  --> 
    47      <!-- include a group of variables. see field_def.xml for mooring variables definition  --> 
    48      <file id="0n180wT" name_suffix="auto" > 
    49          <field_group group_ref="mooring"/>   
    50      </file> 
    51  
    52      <!-- Equatorial section: automatic definition of the file name suffix based on id="EqT" --> 
    53      <!-- Zoom over vertical axis. def of axis_ref in the axis_definition bellow --> 
    54      <file id="EqT" name_suffix="auto" > 
    55        <field_group id="EqT" domain_ref="EqT" > 
    56          <field field_ref="toce" name="votemper" axis_ref="deptht_zoom"  /> 
    57        </field_group> 
    58      </file> 
    59  
    60      <!-- global file with different operations on data   --> 
    61      <file id="blabla_2" > 
    62        <field field_ref="toce"   default_value="-10" />    <!-- redefine the missing value --> 
    63        <field field_ref="sst"    name="sstmooring1" domain_ref="0n180wT"  />   <!-- include a mooring --> 
    64        <field field_ref="sst"    name="sst_1d_ave"  />                         <!-- mean --> 
    65        <field field_ref="sst"    name="sst_1d_inst" operation="instant" />     <!-- instant value --> 
    66        <field field_ref="sst"    name="sst_1d_max"  operation="maximum" />     <!-- max --> 
    67        <field field_ref="suoce"  />   <!-- include a U-grid variable in the list --> 
    68      </file> 
    69  
    70    </file_group> 
     34    
     35   <!-- example of "hand made" zoom  --> 
     36   <file id="file2" name_suffix="_grid_T_myzoom" > 
     37     <!-- group of variables sharing the same zoom. see zoom definition in domain_def.xml --> 
     38     <field_group id="blabla" domain_ref="myzoom" >     
     39       <field field_ref="toce" /> 
     40       <field field_ref="soce" /> 
     41     </field_group> 
     42   </file> 
     43    
     44   <!-- mooring: automatic definition of the file name suffix based on id="0n180wT"  --> 
     45   <!-- include a group of variables. see field_def.xml for mooring variables definition  --> 
     46   <file id="0n180wT" > 
     47     <field_group group_ref="mooring"/>   
     48   </file> 
     49    
     50   <!-- Equatorial section: automatic definition of the file name suffix based on id="EqT" --> 
     51   <!-- Zoom over vertical axis. def of axis_ref in the axis_definition bellow --> 
     52   <file id="EqT" > 
     53     <field_group id="EqT" domain_ref="EqT" > 
     54       <field field_ref="toce" name="votemper" axis_ref="deptht_myzoom"  /> 
     55     </field_group> 
     56   </file> 
     57    
     58   <!-- global file with different operations on data   --> 
     59   <file id="file3" > 
     60     <field field_ref="toce"   default_value="-10" />    <!-- redefine the missing value --> 
     61     <field field_ref="sst"    name="sstmooring1" domain_ref="0n180wT"  />   <!-- include a mooring --> 
     62     <field field_ref="sst"    name="sst_1d_ave"  />                         <!-- mean --> 
     63     <field field_ref="sst"    name="sst_1d_inst" operation="instant" />     <!-- instant value --> 
     64     <field field_ref="sst"    name="sst_1d_max"  operation="maximum" />     <!-- max --> 
     65     <field field_ref="suoce"  />   <!-- include a U-grid variable in the list --> 
     66   </file> 
     67    
    7168      </file_group> 
    72  
    73    </file_definition> 
     69       
     70    </file_definition> 
    7471     
    7572    <!--  
    … …  
    8279     <axis_group id="deptht" long_name="Vertical T levels" unit="m" positive="down" > 
    8380       <axis id="deptht" /> 
    84        <axis id="deptht_zoom" zoom_begin="1" zoom_end="10" /> 
     81       <axis id="deptht_myzoom" zoom_begin="1" zoom_end="10" /> 
    8582     </axis_group> 
    8683      <axis id="depthu" long_name="Vertical U levels" unit="m" positive="down" /> 

  • branches/2013/dev_LOCEAN_2013/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/EXP00/iodef_oldstyle.xml

    r3771 r4148  
    2121    --> 
    2222     
    23     <file_definition type="multiple_file" sync_freq="1d" min_digits="4"> 
     23    <file_definition type="multiple_file" name="@expname@_@freq@_@startdate@_@enddate@" sync_freq="1mo" min_digits="4"> 
    2424     
     25      <file_group id="1ts" output_freq="1ts"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1 time step files --> 
     26 
    2527      <file_group id="1h" output_freq="1h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1h files --> 
    2628      <file_group id="2h" output_freq="2h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 2h files --> 
    … …  
    3335      <file_group id="5d" output_freq="5d"  output_level="10" enabled=".TRUE.">  <!-- 5d files -->    
    3436 
    35    <file id="5d_grid_T" name="auto" description="ocean T grid variables" > 
     37   <file id="file1" name_suffix="_grid_T" description="ocean T grid variables" > 
    3638     <field field_ref="toce"         name="votemper"  /> 
    3739     <field field_ref="soce"         name="vosaline"  /> 
    … …  
    5254   </file> 
    5355    
    54    <file id="5d_grid_U" name="auto" description="ocean U grid variables" > 
     56   <file id="file2" name_suffix="_grid_U" description="ocean U grid variables" > 
    5557     <field field_ref="uoce"         name="vozocrtx"  /> 
    5658     <field field_ref="uoce_eiv"     name="vozoeivu"  /> 
    … …  
    5860   </file> 
    5961    
    60    <file id="5d_grid_V" name="auto" description="ocean V grid variables" > 
     62   <file id="file3" name_suffix="_grid_V" description="ocean V grid variables" > 
    6163     <field field_ref="voce"         name="vomecrty"  /> 
    6264     <field field_ref="voce_eiv"     name="vomeeivv"  /> 
    … …  
    6466   </file> 
    6567    
    66    <file id="5d_grid_W" name="auto" description="ocean W grid variables" > 
     68   <file id="file4" name_suffix="_grid_W" description="ocean V grid variables" > 
    6769     <field field_ref="woce"         name="vovecrtz" /> 
    6870     <field field_ref="avt"          name="votkeavt" /> 
    … …  
    7173   </file> 
    7274    
    73    <file id="5d_icemod" name="auto" description="ice variables" > 
     75   <file id="file5" name_suffix="_icemod" description="ocean V grid variables" > 
    7476     <field field_ref="ice_pres"                     /> 
    7577     <field field_ref="snowthic_cea" name="isnowthi" /> 

  • branches/2013/dev_LOCEAN_2013/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM_PISCES/EXP00/iodef.xml

    r3771 r4148  
    5858     <field field_ref="qsr"          name="soshfldo"  /> 
    5959          <field field_ref="saltflx"      name="sosfldow"  /> 
     60          <field field_ref="fmmflx"       name="sofmflup"  /> 
    6061     <field field_ref="qt"           name="sohefldo"  /> 
    6162     <field field_ref="mldr10_1"     name="somxl010"  /> 

  • branches/2013/dev_LOCEAN_2013/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM_PISCES/EXP00/namelist_top_cfg

    r4147 r4148  
    55&namtrc     !   tracers definition 
    66!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
     7   ln_top_euler  = .true.   !  use Euler time-stepping for TOP 
    78!                !    name   !           title of the field              ! initial data ! initial data ! save   ! 
    89!                !           !                                           !  units       ! from file    ! or not !  
    … …  
    5859&namtrc_adv    !   advection scheme for passive tracer  
    5960!----------------------------------------------------------------------- 
     61   ln_trcadv_tvd     =  .false.  !  TVD scheme 
     62   ln_trcadv_muscl   =  .true.   !  MUSCL scheme 
    6063/ 
    6164!----------------------------------------------------------------------- 

  • branches/2013/dev_LOCEAN_2013/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_OFF_PISCES/EXP00/namelist_cfg

    r4147 r4148  
    9797   sn_mld  = 'dyna_grid_T' ,    120            , 'somixhgt' ,  .true.    , .true. ,   'yearly'  , ''       , '' 
    9898   sn_emp  = 'dyna_grid_T' ,    120            , 'sowaflup' ,  .true.    , .true. ,   'yearly'  , ''       , '' 
    99    sn_sfx  = 'dyna_grid_T' ,    120            , 'sowaflcd' ,  .true.    , .true. ,   'yearly'  , ''       , '' 
     99   sn_fmf  = 'dyna_grid_T' ,    120            , 'iowaflup' ,  .true.    , .true. ,   'yearly'  , ''       , '' 
    100100   sn_ice  = 'dyna_grid_T' ,    120            , 'soicecov' ,  .true.    , .true. ,   'yearly'  , ''       , '' 
    101101   sn_qsr  = 'dyna_grid_T' ,    120            , 'soshfldo' ,  .true.    , .true. ,   'yearly'  , ''       , '' 

  • branches/2013/dev_LOCEAN_2013/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_OFF_PISCES/EXP00/namelist_top_cfg

    r4147 r4148  
    55&namtrc     !   tracers definition 
    66!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,        
     7   ln_top_euler  = .true.   !  use Euler time-stepping for TOP 
    78   nn_writetrc   =  1460     !  time step frequency for sn_tracer outputs 
    89! 
    … …  
    6162&namtrc_adv    !   advection scheme for passive tracer  
    6263!----------------------------------------------------------------------- 
     64   ln_trcadv_tvd     =  .false.  !  TVD scheme 
     65   ln_trcadv_muscl   =  .true.   !  MUSCL scheme 
    6366/ 
    6467!----------------------------------------------------------------------- 

  • branches/2013/dev_LOCEAN_2013/NEMOGCM/CONFIG/SHARED/field_def.xml

    r3824 r4148  
    5353 
    5454         <field id="empmr"        long_name="Net Upward Water Flux"                                        unit="kg/m2/s"  /> 
    55          <field id="saltflx"      long_name="Downward salt flux"                                          unit="PSU/m2/s"  /> 
     55         <field id="saltflx"      long_name="Downward salt flux"                                           unit="PSU/m2/s"  /> 
     56         <field id="fmmflx"       long_name="Water flux due to freezing/melting"                           unit="kg/m2/s"  /> 
    5657         <field id="snowpre"      long_name="Snow precipitation"                                           unit="kg/m2/s"  /> 
    5758         <field id="runoffs"      long_name="River Runoffs"                                                unit="Kg/m2/s"  /> 

  • branches/2013/dev_LOCEAN_2013/NEMOGCM/CONFIG/SHARED/namelist_ice_lim2_ref

    r4147 r4148  
    8989!              !              !  (if <0  months)  !   name   !  (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    9090   sn_hicif    = 'ice_damping',  -1.              , 'hicif'  ,   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    91    sn_cnf      = 'ice_damping',  -1.              , 'frld'   ,   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     91   sn_frld     = 'ice_damping',  -1.              , 'frld'   ,   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    9292! 
    9393   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the runoff files 

  • branches/2013/dev_LOCEAN_2013/NEMOGCM/CONFIG/SHARED/namelist_top_ref

    r4147 r4148  
    1414   nn_dttrc      =  1        !  time step frequency for passive sn_tracers       
    1515   nn_writetrc   =  5475     !  time step frequency for sn_tracer outputs 
     16   ln_top_euler  = .false.   !  use Euler time-stepping for TOP 
    1617   ln_rsttr      = .false.   !  start from a restart file (T) or not (F) 
    1718   nn_rsttr      =   0       !  restart control = 0 initial time step is not compared to the restart file value 
    … …  
    3334!----------------------------------------------------------------------- 
    3435   ln_trcadv_cen2    =  .false.  !  2nd order centered scheme    
    35    ln_trcadv_tvd     =  .false.  !  TVD scheme 
    36    ln_trcadv_muscl   =  .true.   !  MUSCL scheme 
     36   ln_trcadv_tvd     =  .true.  !  TVD scheme 
     37   ln_trcadv_muscl   =  .false.   !  MUSCL scheme 
    3738   ln_trcadv_muscl2  =  .false.  !  MUSCL2 scheme + cen2 at boundaries 
    3839   ln_trcadv_ubs     =  .false.  !  UBS scheme 

  • branches/2013/dev_LOCEAN_2013/NEMOGCM/CONFIG/cfg.txt

    r4147 r4148  
    11ORCA2_LIM3 OPA_SRC LIM_SRC_3 
    2 O2L3 OPA_SRC LIM_SRC_3 TOP_SRC 
    32GYRE_BFM OPA_SRC TOP_SRC 
    43GYRE OPA_SRC 
    … …  
    98GYRE_PISCES OPA_SRC TOP_SRC 
    109ORCA2_LIM_CFC_C14b OPA_SRC LIM_SRC_2 NST_SRC TOP_SRC 
    11 ORCA2_LIM OPA_SRC LIM_SRC_2 NST_SRC 
    12 AGRIF OPA_SRC LIM_SRC_2 NST_SRC 
    13 GYRE_LONG OPA_SRC 
    14 GYRE_4 OPA_SRC 
    15 ORCA2LIMPIS_LONG OPA_SRC LIM_SRC_2 NST_SRC TOP_SRC 
    16 ORCA2LIMPIS_16 OPA_SRC LIM_SRC_2 NST_SRC TOP_SRC 
    17 ORCA2OFFPIS_LONG OPA_SRC OFF_SRC TOP_SRC 
    18 ORCA2OFFPIS_16 OPA_SRC OFF_SRC TOP_SRC 
    19 AMM12_LONG OPA_SRC 
    20 AMM12_32 OPA_SRC 
    21 ORCA2AGUL_1_2 OPA_SRC LIM_SRC_2 NST_SRC 
    22 SAS_LONG OPA_SRC SAS_SRC LIM_SRC_2 NST_SRC 
    23 SAS_32 OPA_SRC SAS_SRC LIM_SRC_2 NST_SRC 

  • branches/2013/dev_LOCEAN_2013/NEMOGCM/CONFIG/makenemo

    r3764 r4148  
    106106export AGRIFUSE=10 
    107107declare -a TAB 
     108list_key=0 
     109chk_key=1 
    108110#- 
    109111#- FCM and functions location --- 
    … …  
    112114#- 
    113115#- Choice of the options --- 
    114 while getopts :hd:n:r:m:j:e:s:v:t: V 
     116while getopts :hd:n:r:m:j:e:s:v:t:k: V 
    115117do 
    116118    case $V in 
    117119   (h) x_h=${OPTARG}; 
    118120        echo "Usage   : "${b_n} \ 
    119        " [-h] [-n name] [-m arch] [-d "dir1 dir2"] [-r conf] [-s Path] [-e Path] [-j No] [-v No]"; 
     121       " [-h] [-n name] [-m arch] [-d "dir1 dir2"] [-r conf] [-s Path] [-e Path] [-j No] [-v No] [-k 0/1]"; 
    120122   echo " -h           : help"; 
    121123   echo " -h institute : specific help for consortium members"; 
    … …  
    128130        echo " -j No        : number of processes used to compile (0=nocompilation)"; 
    129131        echo " -v No        : set verbosity level for compilation [0-3]"; 
     132        echo " -k 0/1       : used cpp keys check (default = 1 -> check activated)"; 
    130133   echo " -t dir       : temporary directory for compilation" 
    131134   echo ""; 
    … …  
    141144   echo "Example to clean "; 
    142145   echo "./makenemo clean"; 
     146   echo ""; 
     147   echo "Example to list the available keys of a CONFIG "; 
     148   echo "./makenemo list_key"; 
    143149   echo ""; 
    144150   echo "Example to add and remove keys"; 
    … …  
    158164   (j)  x_j=${OPTARG};; 
    159165   (t)  x_t=${OPTARG};; 
    160     (e)  x_e=${OPTARG};; 
    161     (s)  x_s=${OPTARG};; 
    162     (v)  x_v=${OPTARG};; 
     166   (e)  x_e=${OPTARG};; 
     167   (s)  x_s=${OPTARG};; 
     168   (v)  x_v=${OPTARG};; 
     169   (k)  chk_key=${OPTARG};; 
    163170   (:)  echo ${b_n}" : -"${OPTARG}" option : missing value" 1>&2; 
    164171   exit 2;; 
    … …  
    188195       export ${list_del_key} 
    189196       shift 
     197       ;; 
     198   list_key) 
     199       list_key=1 
    190200       ;; 
    191201   *) 
    … …  
    222232[ "${CMP_NAM}" ==  help ] && . ${COMPIL_DIR}/Flist_archfile.sh all && exit 
    223233 
    224 #- When used for the first time, choose a compiler --- 
    225 . ${COMPIL_DIR}/Fcheck_archfile.sh arch_nemo.fcm ${CMP_NAM} || exit 
    226  
    227234#- 
    228235#- Choose a default configuration if needed --- 
    229236#- ORCA2_LIM or last one used --- 
    230237. ${COMPIL_DIR}/Fcheck_config.sh cfg.txt ${NEW_CONF} || exit 
    231  
    232238 
    233239if [ ${#NEW_CONF} -eq 0 ] ; then 
    … …  
    269275. ${COMPIL_DIR}/Fmake_bld.sh ${CONFIG_DIR} ${NEW_CONF}  ${NEMO_TDIR} || exit 
    270276 
     277# build the complete list of the cpp keys of this configuration 
     278if [ $chk_key -eq 1 ] ; then 
     279    for i in $( grep "^ *#.* key_" ${NEW_CONF}/WORK/* )  
     280    do 
     281   echo $i | grep key_ | sed -e "s/=.*//" 
     282    done | sort -d | uniq > ${COMPIL_DIR}/full_key_list.txt 
     283    if [ $list_key -eq 1 ]; then 
     284   cat ${COMPIL_DIR}/full_key_list.txt 
     285   exit 0 
     286    fi 
     287fi 
     288 
    271289#- At this stage new configuration has been added, 
    272290#- We add or remove keys 
    … …  
    278296    . ${COMPIL_DIR}/Fdel_keys.sh ${NEW_CONF} del_key ${list_del_key} 
    279297fi 
     298 
     299#- check that all keys are really existing... 
     300if [ $chk_key -eq 1 ] ; then 
     301    for kk in $( cat ${NEW_CONF}/cpp_${NEW_CONF}.fcm ) 
     302    do 
     303   if [ "$( echo $kk | cut -c 1-4 )" == "key_" ]; then 
     304       kk=${kk/=*/} 
     305       nb=$( grep -c $kk ${COMPIL_DIR}/full_key_list.txt ) 
     306       if [ $nb -eq 0 ]; then 
     307      echo 
     308      echo "E R R O R : key "$kk" is not found in ${NEW_CONF}/WORK routines..." 
     309      echo "we stop..." 
     310      echo 
     311      exit 1 
     312       fi 
     313   fi 
     314    done 
     315fi 
     316 
     317#- At this stage cpp keys have been updated. we can check the arch file 
     318#- When used for the first time, choose a compiler --- 
     319. ${COMPIL_DIR}/Fcheck_archfile.sh arch_nemo.fcm cpp.fcm ${CMP_NAM} || exit 
    280320 
    281321#- At this stage the configuration has beeen chosen 
    … …  
    317357        rm -rf ${NEMO_TDIR}/${NEW_CONF}/BLD 
    318358        rm -rf ${NEMO_TDIR}/${NEW_CONF}/EXP00/opa 
     359        rm -f ${COMPIL_DIR}/*history ${COMPIL_DIR}/*fcm ${COMPIL_DIR}/*txt 
    319360        echo "cleaning ${NEW_CONF} WORK, BLD" 
    320361    fi 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.