New URL for NEMO forge!   http://forge.nemo-ocean.eu

Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
This present forge is now archived and remained online for history.
Changeset 5260 for branches/2014/dev_r4650_UKMO10_Tidally_Meaned_Diagnostics/NEMOGCM/CONFIG/SHARED – NEMO

Ignore:
Timestamp:
2015-05-12T12:37:15+02:00 (9 years ago)
Author:
deazer
Message:

Merged branch with Trunk at revision 5253.
Checked with SETTE, passes modified iodef.xml for AMM12 experiment

Location:
branches/2014/dev_r4650_UKMO10_Tidally_Meaned_Diagnostics/NEMOGCM/CONFIG/SHARED
Files:
8 edited
1 copied

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • branches/2014/dev_r4650_UKMO10_Tidally_Meaned_Diagnostics/NEMOGCM/CONFIG/SHARED/README_configs_namcfg_namdom

    r4147 r5260  
    331331!----------------------------------------------------------------------- 
    332332   cp_cfg      =  "orca"               !  name of the configuration 
    333    jp_cfg      =    1442               !  resolution of the configuration 
    334    jpidta      =    1021               !  1st lateral dimension ( >= jpi ) 
    335    jpjdta      =     511               !  2nd    "         "    ( >= jpj ) 
     333   jp_cfg      =     025               !  resolution of the configuration 
     334   jpidta      =    1442               !  1st lateral dimension ( >= jpi ) 
     335   jpjdta      =    1021               !  2nd    "         "    ( >= jpj ) 
    336336   jpkdta      =      75               !  number of levels      ( >= jpk ) 
    337337   jpiglo      =    1442               !  1st dimension of global domain --> i =jpidta 
  • branches/2014/dev_r4650_UKMO10_Tidally_Meaned_Diagnostics/NEMOGCM/CONFIG/SHARED/domain_def.xml

    r3771 r5260  
    55    <!--   My zoom: example of hand defined zoom   --> 
    66         <domain id="myzoom" zoom_ibegin="10" zoom_jbegin="10" zoom_ni="5" zoom_nj="5" /> 
    7     <!--   Eq section   --> 
     7         <domain id="1point" zoom_ibegin="10" zoom_jbegin="10" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
     8         <domain id="ptr" zoom_ibegin="0000"  zoom_jbegin="1" zoom_ni="1" zoom_nj="0000" /> 
     9         <!--   Eq section   --> 
    810         <domain id="EqT" zoom_ibegin="1" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="0000" zoom_nj="1" /> 
    911         <!--   TAO   --> 
     
    170172      <domain_group id="scalarpoint"> 
    171173         <domain id="scalarpoint" long_name="scalar"/> 
     174         <!-- 
    172175         <domain id="1point" zoom_ibegin="1" zoom_jbegin="1" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
     176         --> 
    173177      </domain_group> 
    174178 
  • branches/2014/dev_r4650_UKMO10_Tidally_Meaned_Diagnostics/NEMOGCM/CONFIG/SHARED/field_def.xml

    r4756 r5260  
    1616       
    1717     <field_group id="grid_T" grid_ref="grid_T_2D" > 
    18          <field id="toce"         long_name="temperature"                               unit="degC" grid_ref="grid_T_3D"/> 
    19          <field id="soce"         long_name="salinity"                                  unit="psu"  grid_ref="grid_T_3D"/> 
     18         <field id="e3t"          long_name="T-cell thickness"                          unit="m"      grid_ref="grid_T_3D"/> 
     19 
     20         <field id="toce"         long_name="temperature"                               unit="degC"   grid_ref="grid_T_3D"/> 
     21         <field id="toce_e3t"     long_name="temperature * e3t"                         unit="degC*m" grid_ref="grid_T_3D" > toce * e3t </field > 
     22         <field id="soce"         long_name="salinity"                                  unit="psu"    grid_ref="grid_T_3D"/> 
     23         <field id="soce_e3t"     long_name="salinity * e3t"                            unit="psu*m"  grid_ref="grid_T_3D" > soce * e3t </field > 
     24 
    2025         <field id="sst"          long_name="sea surface temperature"                   unit="degC"                     /> 
    21          <field id="sst2"         long_name="square of sea surface temperature"         unit="degC2"                    /> 
     26         <field id="sst2"         long_name="square of sea surface temperature"         unit="degC2"                     >  sst * sst </field > 
     27         <field id="sstmax"       long_name="max of sea surface temperature"       field_ref="sst"  operation="maximum" /> 
     28         <field id="sstmin"       long_name="min of sea surface temperature"       field_ref="sst"  operation="minimum" /> 
    2229         <field id="sstgrad"      long_name="module of sst gradient"                    unit="degC/m"                   /> 
    2330         <field id="sstgrad2"     long_name="square of module of sst gradient"          unit="degC2/m2"                 /> 
     31         <field id="sbt"          long_name="sea bottom temperature"                    unit="degC"                     /> 
     32     
    2433         <field id="sss"          long_name="sea surface salinity"                      unit="psu"                      /> 
    25          <field id="sss2"         long_name="square of sea surface salinity"            unit="psu2"                     /> 
     34         <field id="sss2"         long_name="square of sea surface salinity"            unit="psu2"                      >  sss * sss </field > 
     35         <field id="sssmax"       long_name="max of sea surface salinity"          field_ref="sss"  operation="maximum" /> 
     36         <field id="sssmin"       long_name="min of sea surface salinity"          field_ref="sss"  operation="minimum" /> 
     37         <field id="sbs"          long_name="sea bottom salinity"                       unit="psu"                      /> 
     38 
    2639         <field id="ssh"          long_name="sea surface height"                        unit="m"                        /> 
    27          <field id="ssh2"         long_name="square of sea surface height"              unit="m2"                       /> 
     40         <field id="ssh2"         long_name="square of sea surface height"              unit="m2"                        >  ssh * ssh </field > 
     41         <field id="sshmax"       long_name="max of sea surface height"            field_ref="ssh"  operation="maximum" /> 
     42 
    2843         <field id="mldkz5"       long_name="mixing layer depth (Turbocline)"           unit="m"                        /> 
    2944         <field id="mldr10_1"     long_name="Mixed Layer Depth 0.01 ref.10m"            unit="m"                        /> 
    30          <field id="rhop"         long_name="potential density (sigma0)"                unit="kg/m3" grid_ref="grid_T_3D"/> 
    31     <field id="eken"         long_name="kinetic energy"                            unit="m2/s2" grid_ref="grid_T_3D"/> 
    32     <field id="hdiv"         long_name="horizontal divergence"                     unit="s-1"   grid_ref="grid_T_3D"/> 
     45         <field id="mldr10_1max"  long_name="max of Mixed Layer Depth 0.01 ref.10m" field_ref="mldr10_1"  operation="maximum" /> 
     46         <field id="mldr10_1min"  long_name="min of Mixed Layer Depth 0.01 ref.10m" field_ref="mldr10_1"  operation="minimum" /> 
     47         <field id="heatc"        long_name="Heat content vertically integrated"        unit="J/m2"                     /> 
     48         <field id="saltc"        long_name="Salt content vertically integrated"        unit="PSU*kg/m2"                /> 
     49         <!-- EOS --> 
     50         <field id="alpha"        long_name="thermal expansion"                         unit="1/degC" grid_ref="grid_T_3D"/> 
     51         <field id="beta"         long_name="haline contraction"                        unit="1/psu"  grid_ref="grid_T_3D"/> 
     52         <field id="bn2"          long_name="squared Brunt-Vaisala frequency"           unit="1/s"    grid_ref="grid_T_3D"/> 
     53         <field id="rhop"         long_name="potential density (sigma0)"                unit="kg/m3"  grid_ref="grid_T_3D"/> 
     54         <!-- Energy - horizontal divergence --> 
     55         <field id="eken"         long_name="kinetic energy"                            unit="m2/s2"  grid_ref="grid_T_3D"/> 
     56         <field id="hdiv"         long_name="horizontal divergence"                     unit="s-1"    grid_ref="grid_T_3D"/> 
    3357         <!-- variables available with MLE --> 
    3458         <field id="Lf_NHpf"      long_name="MLE: Lf = N H / f"                         unit="m"                        /> 
     
    5074         <field id="botpres"      long_name="Pressure at sea floor"                     unit="dbar"                     /> 
    5175         <!-- variables available with key_diaar5/key_vvl --> 
    52          <field id="cellthc"      long_name="Cell thickness"                            unit="m"    grid_ref="grid_T_3D"/> 
    5376         <!-- variables available with key_vvl --> 
    5477         <field id="tpt_dep"      long_name="T-point depth"                             unit="m"    grid_ref="grid_T_3D"/> 
     
    138161 
    139162         <field id="empmr"        long_name="Net Upward Water Flux"                                        unit="kg/m2/s"  /> 
    140          <field id="saltflx"      long_name="Downward salt flux"                                           unit="PSU/m2/s"  /> 
     163         <field id="saltflx"      long_name="Downward salt flux"                                           unit="PSU/m2/s" /> 
    141164         <field id="fmmflx"       long_name="Water flux due to freezing/melting"                           unit="kg/m2/s"  /> 
    142165         <field id="snowpre"      long_name="Snow precipitation"                                           unit="kg/m2/s"  /> 
    143166         <field id="runoffs"      long_name="River Runoffs"                                                unit="Kg/m2/s"  /> 
    144          <field id="precip"       long_name="Total precipitation"                                           unit="kg/m2/s"  /> 
     167         <field id="precip"       long_name="Total precipitation"                                          unit="kg/m2/s"  /> 
    145168 
    146169 
     
    156179    <!-- * variable relative to atmospheric pressure forcing : available with ln_apr_dyn --> 
    157180    <field id="ssh_ib"       long_name="Inverse barometer sea surface height"                         unit="m"        /> 
    158     
     181 
     182         <!-- * variable related to ice shelf forcing * --> 
     183         <field id="fwfisf"       long_name="Ice shelf melting"                                            unit="Kg/m2/s"  /> 
     184         <field id="qisf"         long_name="Ice Shelf Heat Flux"                                          unit="W/m2"     /> 
     185         <field id="isfgammat"    long_name="transfert coefficient for isf (temperature) "                 unit="m/s"      /> 
     186         <field id="isfgammas"    long_name="transfert coefficient for isf (salinity)    "                 unit="m/s"      /> 
     187        <field id="stbl"         long_name="salinity in the Losh tbl                    "                 unit="PSU"      /> 
     188        <field id="ttbl"         long_name="temperature in the Losh tbl                 "                 unit="C"        /> 
     189 
    159190         <!-- *_oce variables available with ln_blk_clio or ln_blk_core --> 
    160          <field id="qns_oce"      long_name="Non solar Downward Heat Flux over open ocean"                 unit="W/m2"     /> 
    161191         <field id="qlw_oce"      long_name="Longwave Downward Heat Flux over open ocean"                  unit="W/m2"     /> 
    162192         <field id="qsb_oce"      long_name="Sensible Downward Heat Flux over open ocean"                  unit="W/m2"     /> 
     
    188218         <field id="snowmel_cea"   long_name="Snow Melt Rate (cell average)"                               unit="kg/m2/s"  /> 
    189219         <field id="sntoice_cea"   long_name="Snow-Ice Formation Rate (cell average)"                      unit="kg/m2/s"  /> 
    190          <field id="ticemel_cea"      long_name="Rate of Melt at Upper Surface of Sea Ice (cell average)"     unit="kg/m2/s"  /> 
     220         <field id="ticemel_cea"   long_name="Rate of Melt at Upper Surface of Sea Ice (cell average)"     unit="kg/m2/s"  /> 
    191221 
    192222    <!-- ice fields --> 
     
    194224         <field id="ice_cover"    long_name="Ice fraction"                                                 unit="1"        /> 
    195225 
    196          <field id="ioceflxb"     long_name="Oceanic flux at the ice base"                                 unit="W/m2"     /> 
    197226         <field id="qsr_ai_cea"   long_name="Air-Ice downward solar heat flux (cell average)"              unit="W/m2"     /> 
    198227         <field id="qns_ai_cea"   long_name="Air-Ice downward non-solar heat flux (cell average)"          unit="W/m2"     /> 
     
    205234         <field id="icethic_cea"  long_name="Ice thickness (cell average)"                                 unit="m"        /> 
    206235         <field id="iceprod_cea"  long_name="Ice production (cell average)"                                unit="m/s"      /> 
     236         <field id="iiceconc"     long_name="Ice concentration"                                            unit=""         /> 
    207237          
    208238         <field id="ice_pres"     long_name="Ice presence"                                                 unit="-"        /> 
     
    219249         <field id="emp_x_sst"    long_name="Concentration/Dilution term on SST"                           unit="kgC/m2/s" /> 
    220250         <field id="emp_x_sss"    long_name="Concentration/Dilution term on SSS"                         unit="kgPSU/m2/s" />         
    221           
    222           
     251        
    223252         <field id="iceconc"      long_name="ice concentration"                                            unit="%"        /> 
    224          <field id="icebopr"      long_name="daily bottom thermo ice prod."                                unit="km3/day"   /> 
    225          <field id="icedypr"      long_name="daily  dynamic ice prod."                                     unit="km3/day"   /> 
    226     <field id="ioceflxb"     long_name="Oceanic flux at the ice base"                                 unit="W/m2"     /> 
    227253         <field id="uice_ipa"     long_name="Ice velocity along i-axis at I-point (ice presence average)"  unit="m/s"      /> 
    228254         <field id="vice_ipa"     long_name="Ice velocity along j-axis at I-point (ice presence average)"  unit="m/s"      /> 
     
    232258         <field id="qsr_oce"      long_name="solar heat flux at ocean surface"                             unit="W/m2"     /> 
    233259         <field id="qns_oce"      long_name="non-solar heat flux at ocean surface"                         unit="W/m2"     /> 
    234          <field id="hfbri"        long_name="heat flux due to brine release"                               unit="W/m2"     /> 
     260         <field id="qt_ice"       long_name="total flux at ice surface"                                    unit="W/m2"     /> 
     261         <field id="qsr_ice"      long_name="solar heat flux at ice surface"                               unit="W/m2"     /> 
     262         <field id="qns_ice"      long_name="non-solar heat flux at ice surface"                           unit="W/m2"     /> 
     263         <field id="qtr_ice"      long_name="solar heat flux transmitted thru the ice"                     unit="W/m2"     /> 
    235264         <field id="utau_ice"     long_name="Wind stress along i-axis over the ice at i-point"             unit="N/m2"     /> 
    236265         <field id="vtau_ice"     long_name="Wind stress along j-axis over the ice at i-point"             unit="N/m2"     /> 
    237     <field id="qsr_io"       long_name="Ice-Oce downward solar heat flux"                             unit="W/m2"     /> 
    238     <field id="qns_io"       long_name="Ice-Oce downward non-solar heat flux"                         unit="W/m2"     /> 
    239266         <field id="micesalt"     long_name="Mean ice salinity"                                            unit="psu"      /> 
    240267         <field id="miceage"      long_name="Mean ice age"                                                 unit="years"    /> 
    241          <field id="icelapr"      long_name="daily lateral thermo ice prod."                               unit="km3/day"   /> 
    242          <field id="icesipr"      long_name="daily snowice ice prod."                                      unit="km3/day"   /> 
     268 
     269         <field id="iceage_cat"   long_name="Ice age for categories"                                       unit="days"   axis_ref="ncatice" /> 
     270         <field id="iceconc_cat"  long_name="Ice concentration for categories"                             unit="%"      axis_ref="ncatice" /> 
     271         <field id="icethic_cat"  long_name="Ice thickness for categories"                                 unit="m"      axis_ref="ncatice" /> 
     272         <field id="snowthic_cat" long_name="Snow thicknessi for categories"                               unit="m"      axis_ref="ncatice" /> 
     273         <field id="salinity_cat" long_name="Sea-Ice Bulk salinity for categories"                         unit="ppt"    axis_ref="ncatice" /> 
     274         <field id="brinevol_cat" long_name="Brine volume for categories"                                  unit="%"      axis_ref="ncatice" /> 
     275 
    243276         <field id="micet"        long_name="Mean ice temperature"                                         unit="degC"     /> 
    244          <field id="icehc"        long_name="ice total heat content"                                       unit="10^9 J"   />  
     277         <field id="icehc"        long_name="ice total heat content"                                       unit="10^9J"    />  
    245278         <field id="isnowhc"      long_name="snow total heat content"                                      unit="10^9J"    /> 
    246279         <field id="icest"        long_name="ice surface temperature"                                      unit="degC"     /> 
    247          <field id="sfxbri"       long_name="brine salt flux"                                              unit="psu*kg/m2/day" /> 
    248          <field id="sfxthd"       long_name="equivalent FW salt flux"                                      unit="psu*kg/m2/day" /> 
    249280         <field id="ibrinv"       long_name="brine volume"                                                 unit="%"        /> 
    250281         <field id="icecolf"      long_name="frazil ice collection thickness"                              unit="m"        /> 
    251282         <field id="icestr"       long_name="ice strength"                                                 unit="N/m"      /> 
    252283         <field id="icevel"       long_name="ice velocity"                                                 unit="m/s"      /> 
    253          <field id="isume"        long_name="surface melt"                                                 unit="km3/day"   /> 
    254          <field id="ibome"        long_name="bottom melt"                                                  unit="km3/day"   /> 
    255284         <field id="idive"        long_name="divergence"                                                   unit="10-8s-1"  /> 
    256285         <field id="ishear"       long_name="shear"                                                        unit="10-8s-1"  /> 
    257          <field id="icerepr"      long_name="daily resultant ice prod./melting from limupdate"             unit="km3/day"   /> 
    258          <field id="icevolu"      long_name="ice volume"                                                   unit="km3"      /> 
    259          <field id="snowvol"      long_name="snow volume"                                                  unit="km3"      /> 
    260          <field id="sfxmec"       long_name="salt flux from ridging rafting"                               unit="psu*kg/m2/day" /> 
     286         <field id="icevolu"      long_name="ice volume"                                                   unit="m"        /> 
     287         <field id="snowvol"      long_name="snow volume"                                                  unit="m"        /> 
     288 
     289         <field id="icetrp"       long_name="ice volume transport"                                         unit="m/day"   /> 
     290         <field id="snwtrp"       long_name="snw volume transport"                                         unit="m/day"   /> 
     291         <field id="saltrp"       long_name="salt content transport"                                       unit="psu*kg/m2/day" /> 
     292         <field id="deitrp"       long_name="advected ice enthalpy"                                         unit="W/m2"    /> 
     293         <field id="destrp"       long_name="advected snw enthalpy"                                         unit="W/m2"    /> 
     294 
     295         <field id="sfxbri"       long_name="brine salt flux"                                              unit="psu*kg/m2/day" /> 
     296         <field id="sfxdyn"       long_name="salt flux from ridging rafting"                               unit="psu*kg/m2/day" /> 
    261297         <field id="sfxres"       long_name="salt flux from lipupdate (resultant)"                         unit="psu*kg/m2/day" /> 
    262          <field id="icetrp"       long_name="ice volume transport"                                         unit="km3/day"   /> 
    263  
     298         <field id="sfxbog"       long_name="salt flux from bot growth"                                    unit="psu*kg/m2/day" /> 
     299         <field id="sfxbom"       long_name="salt flux from bot melt"                                      unit="psu*kg/m2/day" /> 
     300         <field id="sfxsum"       long_name="salt flux from surf melt"                                     unit="psu*kg/m2/day" /> 
     301         <field id="sfxsni"       long_name="salt flux from snow-ice formation"                            unit="psu*kg/m2/day" /> 
     302         <field id="sfxopw"       long_name="salt flux from open water ice formation"                      unit="psu*kg/m2/day" /> 
     303         <field id="sfx"          long_name="salt flux total"                                              unit="psu*kg/m2/day" /> 
     304 
     305         <field id="vfxbog"       long_name="daily bottom thermo ice prod."                                unit="m/day"   /> 
     306         <field id="vfxdyn"       long_name="daily  dynamic ice prod."                                     unit="m/day"   /> 
     307         <field id="vfxopw"       long_name="daily lateral thermo ice prod."                               unit="m/day"   /> 
     308         <field id="vfxsni"       long_name="daily snowice ice prod."                                      unit="m/day"   /> 
     309         <field id="vfxsum"       long_name="surface melt"                                                 unit="m/day"   /> 
     310         <field id="vfxbom"       long_name="bottom melt"                                                  unit="m/day"   /> 
     311         <field id="vfxres"       long_name="daily resultant ice prod./melting from limupdate"             unit="m/day"   /> 
     312         <field id="vfxice"       long_name="ice melt/growth"                                              unit="m/day"   /> 
     313         <field id="vfxsnw"       long_name="snw melt/growth"                                              unit="m/day"   /> 
     314         <field id="vfxsub"       long_name="snw sublimation"                                              unit="m/day"   /> 
     315         <field id="vfxspr"       long_name="snw precipitation on ice"                                     unit="m/day"   /> 
     316 
     317         <field id="afxtot"       long_name="area tendency (total)"                                        unit="day-1"   /> 
     318         <field id="afxdyn"       long_name="area tendency (dynamics)"                                     unit="day-1"   /> 
     319         <field id="afxthd"       long_name="area tendency (thermo)"                                       unit="day-1"   /> 
     320 
     321         <field id="hfxsum"   long_name="heat fluxes causing surface ice melt"            unit="W/m2"  /> 
     322         <field id="hfxbom"   long_name="heat fluxes causing bottom ice melt"             unit="W/m2"  /> 
     323         <field id="hfxbog"   long_name="heat fluxes causing bottom ice growth"           unit="W/m2"  /> 
     324         <field id="hfxdif"   long_name="heat fluxes causing ice temperature change"      unit="W/m2"  /> 
     325         <field id="hfxopw"   long_name="heat fluxes causing open water ice formation"    unit="W/m2"  /> 
     326         <field id="hfxsnw"   long_name="heat fluxes causing snow melt"                   unit="W/m2"  /> 
     327         <field id="hfxerr"   long_name="heat fluxes error after heat diffusion"          unit="W/m2"  /> 
     328         <field id="hfxerr_rem" long_name="heat fluxes error after remapping"             unit="W/m2"  /> 
     329         <field id="hfxout"   long_name="total heat fluxes received by the ocean"         unit="W/m2"  /> 
     330         <field id="hfxin"    long_name="total heat fluxes at the ice/ocean surface"      unit="W/m2"  /> 
     331 
     332    <!-- heat flux associated with mass exchange --> 
     333         <field id="hfxthd"   long_name="heat fluxes from ice-ocean mass exchange during thermo"              unit="W/m2"  /> 
     334         <field id="hfxdyn"   long_name="heat fluxes from ice-ocean mass exchange during dynamic"             unit="W/m2"  /> 
     335         <field id="hfxres"   long_name="heat fluxes from ice-ocean mass exchange during resultant"           unit="W/m2"  /> 
     336         <field id="hfxsub"   long_name="heat fluxes from ice-atm. mass exchange during sublimation"          unit="W/m2"  /> 
     337         <field id="hfxspr"   long_name="heat fluxes from ice-atm. mass exchange during snow precip"          unit="W/m2"  /> 
     338 
     339    <!-- diags --> 
     340         <field id="hfxdhc"    long_name="Heat content variation in snow and ice"   unit="W/m2" /> 
     341         <field id="hfxtur"    long_name="turbulent heat flux at the ice base"      unit="W/m2" /> 
    264342 
    265343      </field_group> 
     
    268346       
    269347      <field_group id="grid_U"   grid_ref="grid_U_2D"> 
    270          <field id="utau"         long_name="Wind Stress along i-axis"                    unit="N/m2" /> 
    271          <field id="suoce"        long_name="ocean surface current along i-axis"          unit="m/s"  /> 
    272          <field id="uoce"         long_name="ocean current along i-axis"                  unit="m/s"  grid_ref="grid_U_3D" /> 
    273          <field id="uocetr_eff"   long_name="Effective ocean transport along i-axis"      unit="m3/s" grid_ref="grid_U_3D" /> 
     348         <field id="e3u"          long_name="U-cell thickness"                               unit="m"        grid_ref="grid_U_3D" /> 
     349         <field id="utau"         long_name="Wind Stress along i-axis"                       unit="N/m2"                          /> 
     350         <field id="uoce"         long_name="ocean current along i-axis"                     unit="m/s"      grid_ref="grid_U_3D" /> 
     351         <field id="uoce_e3u"     long_name="ocean current along i-axis * e3u"               unit="m2/s"     grid_ref="grid_U_3D"  > uoce * e3u </field> 
     352         <field id="ssu"          long_name="ocean surface current along i-axis"             unit="m/s"                           /> 
     353         <field id="sbu"          long_name="ocean bottom current along i-axis"              unit="m/s"                           /> 
     354         <field id="uocetr_eff"   long_name="Effective ocean transport along i-axis"         unit="m3/s"     grid_ref="grid_U_3D" /> 
    274355         <field id="uocet"        long_name="ocean transport along i-axis times temperature" unit="degC.m/s" grid_ref="grid_U_3D" /> 
    275356         <field id="uoces"        long_name="ocean transport along i-axis times salinity"    unit="psu.m/s"  grid_ref="grid_U_3D" /> 
    276357         <!-- variables available with MLE --> 
    277          <field id="psiu_mle"     long_name="MLE streamfunction along i-axis"             unit="m3/s"  grid_ref="grid_U_3D" /> 
     358         <field id="psiu_mle"     long_name="MLE streamfunction along i-axis"                unit="m3/s"     grid_ref="grid_U_3D" /> 
    278359         <!-- uoce_eiv: available with key_traldf_eiv and key_diaeiv --> 
    279          <field id="uoce_eiv"     long_name="EIV ocean current along i-axis"              unit="m/s"  grid_ref="grid_U_3D" /> 
     360         <field id="uoce_eiv"     long_name="EIV ocean current along i-axis"                 unit="m/s"      grid_ref="grid_U_3D" /> 
    280361         <!-- uoce_eiv: available with key_trabbl --> 
    281          <field id="uoce_bbl"     long_name="BBL ocean current along i-axis"              unit="m/s"  grid_ref="grid_U_3D" /> 
    282     <field id="ahu_bbl"      long_name="BBL diffusive flux along i-axis"             unit="m3/s" /> 
     362         <field id="uoce_bbl"     long_name="BBL ocean current along i-axis"                 unit="m/s"      grid_ref="grid_U_3D" /> 
     363        <field id="ahu_bbl"      long_name="BBL diffusive flux along i-axis"                unit="m3/s"                          /> 
     364         <!-- variable for ice shelves --> 
     365    <field id="utbl"         long_name="zonal current in the Losh tbl"                  unit="m/s"                           /> 
    283366         <!-- variables available with key_diaar5 --> 
    284          <field id="u_masstr"     long_name="ocean eulerian mass transport along i-axis"  unit="kg/s" grid_ref="grid_U_3D" /> 
    285          <field id="u_heattr"     long_name="ocean eulerian heat transport along i-axis"  unit="W"    /> 
    286          <field id="ueiv_heattr"  long_name="ocean bolus heat transport along i-axis"     unit="W"    /> 
    287          <field id="udiff_heattr" long_name="ocean diffusion heat transport along i-axis" unit="W"    /> 
     367         <field id="u_masstr"     long_name="ocean eulerian mass transport along i-axis"     unit="kg/s"     grid_ref="grid_U_3D" /> 
     368         <field id="u_heattr"     long_name="ocean eulerian heat transport along i-axis"     unit="W"                             /> 
     369         <field id="u_salttr"     long_name="ocean eulerian salt transport along i-axis"     unit="PSU*kg/s"                      /> 
     370         <field id="ueiv_heattr"  long_name="ocean bolus heat transport along i-axis"        unit="W"                             /> 
     371         <field id="udiff_heattr" long_name="ocean diffusion heat transport along i-axis"    unit="W"                             /> 
    288372     </field_group> 
    289373       
     
    291375       
    292376      <field_group id="grid_V"   grid_ref="grid_V_2D"> 
    293          <field id="vtau"         long_name="Wind Stress along j-axis"                    unit="N/m2" /> 
    294          <field id="svoce"        long_name="ocean surface current along j-axis"          unit="m/s"  /> 
    295          <field id="voce"         long_name="ocean current along j-axis"                  unit="m/s"  grid_ref="grid_V_3D" /> 
    296          <field id="vocetr_eff"   long_name="Effective ocean transport along j-axis"      unit="m3/s" grid_ref="grid_V_3D" /> 
     377         <field id="e3v"          long_name="V-cell thickness"                               unit="m"        grid_ref="grid_V_3D" /> 
     378         <field id="vtau"         long_name="Wind Stress along j-axis"                       unit="N/m2"                          /> 
     379         <field id="voce"         long_name="ocean current along j-axis"                     unit="m/s"      grid_ref="grid_V_3D" /> 
     380         <field id="voce_e3v"     long_name="ocean current along j-axis * e3v"               unit="m2/s"     grid_ref="grid_V_3D"  > voce * e3v </field> 
     381         <field id="ssv"          long_name="ocean surface current along j-axis"             unit="m/s"                           /> 
     382         <field id="sbv"          long_name="ocean bottom current along j-axis"              unit="m/s"                           /> 
     383         <field id="vocetr_eff"   long_name="Effective ocean transport along j-axis"         unit="m3/s"     grid_ref="grid_V_3D" /> 
    297384         <field id="vocet"        long_name="ocean transport along j-axis times temperature" unit="degC.m/s" grid_ref="grid_V_3D" /> 
    298385         <field id="voces"        long_name="ocean transport along j-axis times salinity"    unit="psu.m/s"  grid_ref="grid_V_3D" /> 
    299386         <!-- variables available with MLE --> 
    300          <field id="psiv_mle"     long_name="MLE streamfunction along j-axis"             unit="m3/s"  grid_ref="grid_V_3D" /> 
     387         <field id="psiv_mle"     long_name="MLE streamfunction along j-axis"                unit="m3/s"     grid_ref="grid_V_3D" /> 
    301388         <!-- voce_eiv: available with key_traldf_eiv and key_diaeiv --> 
    302          <field id="voce_eiv"     long_name="EIV ocean current along j-axis"              unit="m/s"  grid_ref="grid_V_3D" /> 
     389         <field id="voce_eiv"     long_name="EIV ocean current along j-axis"                 unit="m/s"      grid_ref="grid_V_3D" /> 
    303390         <!-- voce_eiv: available with key_trabbl --> 
    304          <field id="voce_bbl"     long_name="BBL ocean current along j-axis"              unit="m/s"  grid_ref="grid_V_3D" /> 
    305     <field id="ahv_bbl"      long_name="BBL diffusive flux along j-axis"             unit="m3/s"                   /> 
     391         <field id="voce_bbl"     long_name="BBL ocean current along j-axis"                 unit="m/s"      grid_ref="grid_V_3D" /> 
     392        <field id="ahv_bbl"      long_name="BBL diffusive flux along j-axis"                unit="m3/s"                          /> 
     393         <!-- variable for ice shelves --> 
     394        <field id="vtbl"         long_name="meridional current in the Losh tbl"             unit="m/s"                           /> 
    306395         <!-- variables available with key_diaar5 --> 
    307          <field id="v_masstr"     long_name="ocean eulerian mass transport along j-axis"  unit="kg/s" grid_ref="grid_V_3D" /> 
    308          <field id="v_heattr"     long_name="ocean eulerian heat transport along j-axis"  unit="W"     /> 
    309          <field id="veiv_heattr"  long_name="ocean bolus heat transport along j-axis"     unit="W"     /> 
    310          <field id="vdiff_heattr" long_name="ocean diffusion heat transport along j-axis" unit="W"     /> 
     396         <field id="v_masstr"     long_name="ocean eulerian mass transport along j-axis"     unit="kg/s"     grid_ref="grid_V_3D" /> 
     397         <field id="v_heattr"     long_name="ocean eulerian heat transport along j-axis"     unit="W"                             /> 
     398         <field id="v_salttr"     long_name="ocean eulerian salt transport along i-axis"     unit="PSU*kg/s"                      /> 
     399         <field id="veiv_heattr"  long_name="ocean bolus heat transport along j-axis"        unit="W"                             /> 
     400         <field id="vdiff_heattr" long_name="ocean diffusion heat transport along j-axis"    unit="W"                             /> 
    311401      </field_group> 
    312402       
     
    314404       
    315405      <field_group id="grid_W" grid_ref="grid_W_3D"> 
     406        <field id="e3w"          long_name="W-cell thickness"                            unit="m"   /> 
    316407        <field id="woce"         long_name="ocean vertical velocity"                  unit="m/s"    /> 
     408        <field id="woce_e3w"     long_name="ocean vertical velocity * e3v"            unit="m2/s"    > woce * e3w </field> 
    317409        <field id="wocetr_eff"   long_name="effective ocean vertical transport"       unit="m3/s"   /> 
    318410        <!-- woce_eiv: available with key_traldf_eiv and key_diaeiv --> 
     
    350442 
    351443       <!-- available with ln_diahsb --> 
    352     <field id="bgtemper"     long_name="global mean temperature"                  unit="degC"   /> 
    353     <field id="bgsaline"     long_name="global mean salinity"                     unit="psu"    /> 
    354     <field id="bgheatco"     long_name="global mean heat content"                 unit="10^9J"  /> 
    355     <field id="bgsaltco"     long_name="global mean salt content"                 unit="psu*m3" /> 
    356     <field id="bgvolssh"     long_name="global mean ssh volume"                   unit="km3"     /> 
    357     <field id="bgvoltot"     long_name="global mean volume"                       unit="km3"     /> 
    358     <field id="bgsshtot"     long_name="global mean ssh"                          unit="m"      /> 
    359     <field id="bgfrcvol"     long_name="global mean volume from forcing"          unit="km3"     /> 
    360     <field id="bgfrctem"     long_name="global mean heat content from forcing"    unit="10^9J"  /> 
    361     <field id="bgfrcsal"     long_name="global mean salt content from forcing"    unit="psu*km3" /> 
    362     <field id="bgmistem"     long_name="global mean temperature error due to free surface" unit="degC" /> 
    363     <field id="bgmissal"     long_name="global mean salinity error due to free surface"    unit="psu"  /> 
     444       <field id="bgtemper"     long_name="global mean temperature"                  unit="degC"   /> 
     445       <field id="bgsaline"     long_name="global mean salinity"                     unit="psu"    /> 
     446       <field id="bgheatco"     long_name="global mean heat content"                 unit="10^9J"  /> 
     447       <field id="bgsaltco"     long_name="global mean salt content"                 unit="psu*m3" /> 
     448       <field id="bgvolssh"     long_name="global mean ssh volume"                   unit="km3"     /> 
     449        <field id="bgvole3t"     long_name="global mean volume variation (e3t)"           unit="km3"/> 
     450       <field id="bgvoltot"     long_name="global mean volume"                       unit="km3"     /> 
     451       <field id="bgsshtot"     long_name="global mean ssh"                          unit="m"      /> 
     452       <field id="bgfrcvol"     long_name="global mean volume from forcing"          unit="km3"     /> 
     453       <field id="bgfrctem"     long_name="global mean heat content from forcing"    unit="10^9J"  /> 
     454       <field id="bgfrcsal"     long_name="global mean salt content from forcing"    unit="psu*km3" /> 
     455       <field id="bgmistem"     long_name="global mean temperature error due to free surface" unit="degC" /> 
     456       <field id="bgmissal"     long_name="global mean salinity error due to free surface"    unit="psu"  /> 
    364457      </field_group> 
    365458 
    366459      <field_group id="SBC_scalar"  domain_ref="1point" > 
    367          <!-- available with ln_limdiahsb --> 
    368     <field id="ibgvoltot"    long_name="global mean ice volume"                   unit="km3"   /> 
    369     <field id="sbgvoltot"    long_name="global mean snow volume"                  unit="km3"   /> 
    370     <field id="ibgarea"      long_name="global mean ice area"                     unit="km2"   /> 
    371     <field id="ibgsaline"    long_name="global mean ice salinity"                 unit="psu"   /> 
    372     <field id="ibgtemper"    long_name="global mean ice temperature"              unit="degC"   /> 
    373     <field id="ibgheatco"    long_name="global mean ice heat content"             unit="10^9J"   /> 
    374     <field id="ibgsaltco"    long_name="global mean ice salt content"             unit="psu*km3"   /> 
    375     <field id="sbgheatco"    long_name="global mean snow heat content"            unit="10^9J"   /> 
    376     <field id="ibgfrcsfx"    long_name="global mean salt content from sfx"        unit="psu*km3"   /> 
    377     <field id="ibgfrcemp"    long_name="global mean volume from emp"              unit="km3"      /> 
    378     <field id="ibgsfx"       long_name="global mean emps"                         unit="psu*kg/m2/day"   /> 
    379     <field id="ibgemp"       long_name="global mean emp"                          unit="kg/m2/day"   /> 
    380     <field id="ibgsfxbri"    long_name="global mean ice sfx_bri"                  unit="psu*kg/m2/day"   /> 
    381     <field id="ibgsfxthd"    long_name="global mean ice sfx_thd"                  unit="psu*kg/m2/day"   /> 
    382     <field id="ibgsfxres"    long_name="global mean ice sfx_res"                  unit="psu*kg/m2/day"   /> 
    383     <field id="ibgsfxmec"    long_name="global mean ice fsalt_rpo"                unit="psu*kg/m2/day"   /> 
    384     <field id="ibggrpme"     long_name="global mean ice growth+melt volume"       unit="km3"      /> 
     460         <!-- available with ln_limdiaout --> 
     461    <field id="ibgvoltot"    long_name="global mean ice volume"                   unit="km3"      /> 
     462    <field id="sbgvoltot"    long_name="global mean snow volume"                  unit="km3"      /> 
     463    <field id="ibgarea"      long_name="global mean ice area"                     unit="km2"      /> 
     464    <field id="ibgsaline"    long_name="global mean ice salinity"                 unit="psu"      /> 
     465    <field id="ibgtemper"    long_name="global mean ice temperature"              unit="degC"     /> 
     466    <field id="ibgheatco"    long_name="global mean ice heat content"             unit="10^20J"   /> 
     467    <field id="sbgheatco"    long_name="global mean snow heat content"            unit="10^20J"   /> 
     468    <field id="ibgsaltco"    long_name="global mean ice salt content"             unit="psu*km3"  /> 
     469 
     470    <field id="ibgvfx"       long_name="global mean volume flux (emp)"               unit="m/day"   /> 
     471    <field id="ibgvfxbog"    long_name="global mean volume flux (bottom growth)"     unit="m/day"   /> 
     472    <field id="ibgvfxopw"    long_name="global mean volume flux (open water growth)" unit="m/day"   /> 
     473    <field id="ibgvfxsni"    long_name="global mean volume flux (snow-ice growth)"   unit="m/day"   /> 
     474    <field id="ibgvfxdyn"    long_name="global mean volume flux (dynamic growth)"    unit="m/day"   /> 
     475    <field id="ibgvfxbom"    long_name="global mean volume flux (bottom melt)"       unit="m/day"   /> 
     476    <field id="ibgvfxsum"    long_name="global mean volume flux (surface melt)"      unit="m/day"   /> 
     477    <field id="ibgvfxres"    long_name="global mean volume flux (resultant)"         unit="m/day"   /> 
     478    <field id="ibgvfxspr"    long_name="global mean volume flux (snow precip)"       unit="m/day"   /> 
     479    <field id="ibgvfxsnw"    long_name="global mean volume flux (snow melt)"         unit="m/day"   /> 
     480    <field id="ibgvfxsub"    long_name="global mean volume flux (snow sublimation)"  unit="m/day"   /> 
     481 
     482    <field id="ibgsfx"       long_name="global mean salt flux (total)"            unit="psu*m/day"   /> 
     483    <field id="ibgsfxbri"    long_name="global mean salt flux (brines)"           unit="psu*m/day"   /> 
     484    <field id="ibgsfxdyn"    long_name="global mean salt flux (dynamic)"          unit="psu*m/day"   /> 
     485    <field id="ibgsfxres"    long_name="global mean salt flux (resultant)"        unit="psu*m/day"   /> 
     486    <field id="ibgsfxbog"    long_name="global mean salt flux (thermo)"           unit="psu*m/day"   /> 
     487    <field id="ibgsfxopw"    long_name="global mean salt flux (thermo)"           unit="psu*m/day"   /> 
     488    <field id="ibgsfxsni"    long_name="global mean salt flux (thermo)"           unit="psu*m/day"   /> 
     489    <field id="ibgsfxbom"    long_name="global mean salt flux (thermo)"           unit="psu*m/day"   /> 
     490    <field id="ibgsfxsum"    long_name="global mean salt flux (thermo)"           unit="psu*m/day"   /> 
     491 
     492 
     493        <field id="ibghfxdhc"    long_name="Heat content variation in snow and ice"   unit="W" /> 
     494        <field id="ibghfxspr"    long_name="Heat content of snow precip"              unit="W" /> 
     495 
     496        <field id="ibghfxthd"   long_name="heat fluxes from ice-ocean exchange during thermo"              unit="W"  /> 
     497        <field id="ibghfxsum"   long_name="heat fluxes causing surface ice melt"                           unit="W"  /> 
     498        <field id="ibghfxbom"   long_name="heat fluxes causing bottom ice melt"                            unit="W"  /> 
     499        <field id="ibghfxbog"   long_name="heat fluxes causing bottom ice growth"                          unit="W"  /> 
     500        <field id="ibghfxdif"   long_name="heat fluxes causing ice temperature change"                     unit="W"  /> 
     501        <field id="ibghfxopw"   long_name="heat fluxes causing open water ice formation"                   unit="W"  /> 
     502        <field id="ibghfxdyn"   long_name="heat fluxes from ice-ocean exchange during dynamic"             unit="W"  /> 
     503        <field id="ibghfxres"   long_name="heat fluxes from ice-ocean exchange during resultant"           unit="W"  /> 
     504        <field id="ibghfxsub"   long_name="heat fluxes from sublimation"                                   unit="W"  /> 
     505        <field id="ibghfxsnw"   long_name="heat fluxes from snow-ocean exchange"                           unit="W"  /> 
     506        <field id="ibghfxout"   long_name="non solar heat fluxes received by the ocean"                    unit="W"  /> 
     507        <field id="ibghfxin"    long_name="total heat fluxes at the ice surface"                           unit="W"  /> 
     508 
     509    <field id="ibgfrcvol"    long_name="global mean forcing volume (emp)"         unit="km3"      /> 
     510    <field id="ibgfrcsfx"    long_name="global mean forcing salt   (sfx)"         unit="psu*km3"  /> 
     511    <field id="ibgvolgrm"    long_name="global mean ice growth+melt volume"       unit="km3"      /> 
    385512      </field_group> 
    386513   
     
    412539        <field id="berg_stored_ice"    long_name="icb accumulated ice mass by class"             unit="kg"       axis_ref="icbcla" /> 
    413540      </field_group> 
     541 
     542      <!-- Poleward transport : ptr -->      
     543      <field_group id="diaptr" domain_ref="ptr"  >  
     544        <field id="zomsfglo"          long_name="Meridional Stream-Function: Global"           unit="Sv"       grid_ref="grid_W_3D"  /> 
     545        <field id="zomsfatl"          long_name="Meridional Stream-Function: Atlantic"         unit="Sv"       grid_ref="grid_W_3D"  /> 
     546        <field id="zomsfpac"          long_name="Meridional Stream-Function: Pacific"          unit="Sv"       grid_ref="grid_W_3D"  /> 
     547        <field id="zomsfind"          long_name="Meridional Stream-Function: Indian"           unit="Sv"       grid_ref="grid_W_3D"  /> 
     548        <field id="zomsfipc"          long_name="Meridional Stream-Function: Pacific+Indian"   unit="Sv"       grid_ref="grid_W_3D"   /> 
     549        <field id="zotemglo"          long_name="Zonal Mean Temperature : Global"              unit="C"        grid_ref="grid_T_3D" /> 
     550        <field id="zotematl"          long_name="Zonal Mean Temperature : Atlantic"            unit="C"        grid_ref="grid_T_3D" /> 
     551        <field id="zotempac"          long_name="Zonal Mean Temperature : Pacific"             unit="C"        grid_ref="grid_T_3D" /> 
     552        <field id="zotemind"          long_name="Zonal Mean Temperature : Indian"              unit="C"        grid_ref="grid_T_3D" /> 
     553        <field id="zotemipc"          long_name="Zonal Mean Temperature : Pacific+Indian"      unit="C"        grid_ref="grid_T_3D" /> 
     554        <field id="zosalglo"          long_name="Zonal Mean Salinity : Global"                 unit="PSU"      grid_ref="grid_T_3D"   /> 
     555        <field id="zosalatl"          long_name="Zonal Mean Salinity : Atlantic"               unit="PSU"      grid_ref="grid_T_3D"   /> 
     556        <field id="zosalpac"          long_name="Zonal Mean Salinity : Pacific"                unit="PSU"      grid_ref="grid_T_3D"   /> 
     557        <field id="zosalind"          long_name="Zonal Mean Salinity : Indian"                 unit="PSU"      grid_ref="grid_T_3D"   /> 
     558        <field id="zosalipc"          long_name="Zonal Mean Salinity : Pacific+Indian"         unit="PSU"      grid_ref="grid_T_3D"   /> 
     559        <field id="zosrfglo"          long_name="Zonal Mean Surface"                           unit="m2"       grid_ref="grid_T_3D"  /> 
     560        <field id="zosrfatl"          long_name="Zonal Mean Surface : Atlantic"                unit="m2"       grid_ref="grid_T_3D"  /> 
     561        <field id="zosrfpac"          long_name="Zonal Mean Surface : Pacific"                 unit="m2"       grid_ref="grid_T_3D"  /> 
     562        <field id="zosrfind"          long_name="Zonal Mean Surface : Indian"                  unit="m2"       grid_ref="grid_T_3D"  /> 
     563        <field id="zosrfipc"          long_name="Zonal Mean Surface : Pacific+Indian"          unit="m2"       grid_ref="grid_T_3D"  /> 
     564        <field id="sophtadv"          long_name="Advective Heat Transport"                     unit="PW"       grid_ref="grid_T_2D" /> 
     565        <field id="sophtldf"          long_name="Diffusive Heat Transport"                     unit="PW"       grid_ref="grid_T_2D" /> 
     566        <field id="sopstadv"          long_name="Advective Salt Transport"                     unit="Giga g/s" grid_ref="grid_T_2D" /> 
     567        <field id="sopstldf"          long_name="Diffusive Salt Transport"                     unit="Giga g/s" grid_ref="grid_T_2D" /> 
     568      </field_group> 
     569 
    414570 
    415571      <!-- ptrc on T grid --> 
     
    501657       <field id="EPSI100"     long_name="Export of Silicate at 100 m"             unit="mol/m2/s"                     /> 
    502658       <field id="EPCAL100"    long_name="Export of Calcite at 100 m"              unit="mol/m2/s"                     /> 
     659       <field id="EXPC"        long_name="Export of carbon"                        unit="molC/m2/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
     660       <field id="EXPFE"       long_name="Export of biogenic iron"                 unit="molFe/m2/s" grid_ref="grid_T_3D" /> 
     661       <field id="EXPSI"       long_name="Export of Silicate"                      unit="molSi/m2/s" grid_ref="grid_T_3D" /> 
     662       <field id="EXPCAL"      long_name="Export of Calcite"                       unit="molC/m2/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
    503663       <field id="Cflx"        long_name="DIC flux"                                unit="mol/m2/s"                     /> 
    504664       <field id="Oflx"        long_name="Oxygen flux"                             unit="mol/m2/s"                     /> 
     
    510670       <field id="Ironsed"     long_name="Iron deposition from sediment"           unit="mol/m2/s"  grid_ref="grid_T_3D"/> 
    511671 
     672 
    512673       <!-- PISCES with Kriest parametisation : variables available with key_kriest --> 
    513        <field id="POCFlx"      long_name="Particulate organic C flux"              unit="mol/m2/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
    514        <field id="NumFlx"      long_name="Particle number flux"                    unit="nbr/m2/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
    515        <field id="SiFlx"       long_name="Biogenic Si flux"                        unit="mol/m2/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
    516        <field id="CaCO3Flx"    long_name="CaCO3 flux"                              unit="mol/m2/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
    517        <field id="xnum"        long_name="Number of particles in aggregats"        unit="-"          grid_ref="grid_T_3D" /> 
    518        <field id="W1"          long_name="sinking speed of mass flux"              unit="m2/s"       grid_ref="grid_T_3D" /> 
    519        <field id="W2"          long_name="sinking speed of number flux"            unit="m2/s"       grid_ref="grid_T_3D" /> 
     674       <field id="EPN100"      long_name="Particulate number flux at 100 m"        unit="mol/m2/s"                     /> 
     675       <field id="EXPN"        long_name="Particulate number flux"                 unit="mol/m2/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
     676       <field id="XNUM"        long_name="Number of particles in aggregats"        unit="-"          grid_ref="grid_T_3D" /> 
     677       <field id="WSC"         long_name="sinking speed of mass flux"              unit="m2/s"       grid_ref="grid_T_3D" /> 
     678       <field id="WSN"         long_name="sinking speed of number flux"            unit="m2/s"       grid_ref="grid_T_3D" /> 
     679 
     680      <!-- dbio_T on T grid : variables available with key_diaar5 --> 
     681       <field id="TPP"         long_name="Total Primary production of phyto"                   unit="molC/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
     682       <field id="TPNEW"       long_name="New Primary production of phyto"                     unit="molC/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
     683       <field id="TPBFE"       long_name="Total biogenic iron production"                      unit="molFe/m3/s" grid_ref="grid_T_3D" /> 
     684       <field id="INTDIC"      long_name="DIC content"                                         unit="kg/m2"   /> 
     685       <field id="O2MIN"       long_name="Oxygen minimum concentration"                        unit="molC/L" /> 
     686       <field id="ZO2MIN"      long_name="Depth of oxygen minimum concentration"               unit="m"       /> 
     687       <field id="INTNFIX"     long_name="Nitrogen fixation rate : vert. integrated"           unit="molN/m2/s"  /> 
     688       <field id="INTPPPHY"    long_name="Vertically integrated primary production by nanophy" unit="molC/m2/s"  /> 
     689       <field id="INTPPPHY2"   long_name="Vertically integrated primary production by diatom"  unit="molC/m2/s"  /> 
     690       <field id="INTPP"       long_name="Vertically integrated primary production by phyto"   unit="molC/m2/s"  /> 
     691       <field id="INTPNEW"     long_name="Vertically integrated new primary production"        unit="molC/m2/s"  /> 
     692       <field id="INTPBFE"     long_name="Vertically integrated of biogenic iron production"   unit="molFe/m2/s" /> 
     693       <field id="INTPBSI"     long_name="Vertically integrated of biogenic Si production"     unit="molSi/m2/s" /> 
     694       <field id="INTPCAL"     long_name="Vertically integrated of calcite production"         unit="molC/m2/s" /> 
    520695 
    521696       <!-- PISCES light : variables available with key_pisces_reduced --> 
     
    549724       <field id="qintC14b"    long_name="Cumulative air-sea flux of Bomb C14"      unit="mol/m2"     /> 
    550725       <field id="fdecay"      long_name="Radiactive decay of Bomb C14"             unit="mol/m3"  grid_ref="grid_T_3D"  /> 
     726     </field_group> 
     727 
     728    <field_group id="PISCES_scalar"  domain_ref="1point" > 
     729       <field id="pno3tot"         long_name="global mean nitrate concentration"                  unit="mol/l"   /> 
     730       <field id="psiltot"         long_name="global mean silicate concentration"                 unit="mol/l"   /> 
     731       <field id="palktot"         long_name="global mean alkalinity concentration"               unit="mol/l"   /> 
     732       <field id="pfertot"         long_name="global mean iron concentration"                     unit="mol/l"   /> 
     733       <field id="tcflx"           long_name="total Flux of Carbon out of the ocean"              unit="molC/s" /> 
     734       <field id="tcflxcum"        long_name="cumulative total Flux of Carbon out of the ocean"   unit="molC/s" /> 
     735       <field id="tcexp"           long_name="total Carbon export at 100m"                        unit="molC/s" /> 
     736       <field id="tintpp"          long_name="global total integrated primary production"         unit="molC/s" /> 
     737       <field id="tnfix"           long_name="global total nitrogen fixation"                     unit="molN/s" /> 
     738       <field id="tdenit"          long_name="Total denitrification"                              unit="molN/s" /> 
    551739     </field_group> 
    552740 
     
    615803    <field_group id="groupU" > 
    616804      <field field_ref="uoce"         name="uo"      long_name="sea_water_x_velocity"      /> 
    617       <field field_ref="suoce"        name="uos"     long_name="sea_surface_x_velocity"    /> 
     805      <field field_ref="ssu"          name="uos"     long_name="sea_surface_x_velocity"    /> 
    618806      <field field_ref="utau"         name="tauuo"   long_name="surface_downward_x_stress" /> 
    619807    </field_group> 
     
    621809    <field_group id="groupV" > 
    622810      <field field_ref="voce"         name="vo"      long_name="sea_water_y_velocity"      /> 
    623       <field field_ref="svoce"        name="vos"     long_name="sea_surface_y_velocity"    /> 
     811      <field field_ref="ssv"          name="vos"     long_name="sea_surface_y_velocity"    /> 
    624812      <field field_ref="vtau"         name="tauvo"   long_name="surface_downward_y_stress" /> 
    625813    </field_group> 
     
    676864 
    677865 
     866    <!--  
     867============================================================================================================ 
     868                     Trend diagnostics : temperature, KE, PE, momentum 
     869============================================================================================================ 
     870    --> 
     871 
     872    <field_group id="trendT" grid_ref="grid_T_3D"> 
     873      <!-- variables available with ln_tra_trd --> 
     874      <field id="ttrd_xad"      long_name="temperature-trend: i-advection"                 unit="degC/s" /> 
     875      <field id="strd_xad"      long_name="salinity   -trend: i-advection"                 unit="psu/s"  /> 
     876      <field id="ttrd_yad"      long_name="temperature-trend: j-advection"                 unit="degC/s" /> 
     877      <field id="strd_yad"      long_name="salinity   -trend: j-advection"                 unit="psu/s"  /> 
     878      <field id="ttrd_zad"      long_name="temperature-trend: k-advection"                 unit="degC/s" /> 
     879      <field id="strd_zad"      long_name="salinity   -trend: k-advection"                 unit="psu/s"  /> 
     880      <field id="ttrd_sad"      long_name="temperature-trend: surface adv. (no-vvl)"       unit="degC/s" grid_ref="grid_T_2D" /> 
     881      <field id="strd_sad"      long_name="salinity   -trend: surface adv. (no-vvl)"       unit="psu/s"  grid_ref="grid_T_2D" /> 
     882      <field id="ttrd_ldf"      long_name="temperature-trend: lateral  diffusion"          unit="degC/s" /> 
     883      <field id="strd_ldf"      long_name="salinity   -trend: lateral  diffusion"          unit="psu/s"  /> 
     884      <field id="ttrd_zdf"      long_name="temperature-trend: vertical diffusion"          unit="degC/s" /> 
     885      <field id="strd_zdf"      long_name="salinity   -trend: vertical diffusion"          unit="psu/s"  /> 
     886      <!-- ln_traldf_iso=T only (iso-neutral diffusion) --> 
     887      <field id="ttrd_zdfp"     long_name="temperature-trend: pure vert. diffusion"        unit="degC/s" /> 
     888      <field id="strd_zdfp"     long_name="salinity   -trend: pure vert. diffusion"        unit="psu/s"  /> 
     889      <!-- --> 
     890      <field id="ttrd_dmp"      long_name="temperature-trend: interior restoring"          unit="degC/s" /> 
     891      <field id="strd_dmp"      long_name="salinity   -trend: interior restoring"          unit="psu/s"  /> 
     892      <field id="ttrd_bbl"      long_name="temperature-trend: bottom boundary layer"       unit="degC/s" /> 
     893      <field id="strd_bbl"      long_name="salinity   -trend: bottom boundary layer"       unit="psu/s"  /> 
     894      <field id="ttrd_npc"      long_name="temperature-trend: non-penetrative conv."       unit="degC/s" /> 
     895      <field id="strd_npc"      long_name="salinity   -trend: non-penetrative conv."       unit="psu/s"  /> 
     896      <field id="ttrd_qns"      long_name="temperature-trend: non-solar flux + runoff"     unit="degC/s" /> 
     897      <field id="strd_cdt"      long_name="salinity   -trend: C/D term       + runoff"     unit="degC/s" /> 
     898      <field id="ttrd_qsr"      long_name="temperature-trend: solar penetr. heating"       unit="degC/s" /> 
     899      <field id="ttrd_bbc"      long_name="temperature-trend: geothermal heating"          unit="degC/s" /> 
     900      <field id="ttrd_atf"      long_name="temperature-trend: asselin time filter"         unit="degC/s" /> 
     901      <field id="strd_atf"      long_name="salinity   -trend: asselin time filter"         unit="psu/s"  /> 
     902      <!-- variables available with ln_KE_trd --> 
     903      <field id="ketrd_hpg"     long_name="ke-trend: hydrostatic pressure gradient"        unit="W/s^3"  /> 
     904      <field id="ketrd_spg"     long_name="ke-trend: surface     pressure gradient"        unit="W/s^3"  /> 
     905      <field id="ketrd_spgexp"  long_name="ke-trend: surface pressure gradient (explicit)" unit="W/s^3"  /> 
     906      <field id="ketrd_spgflt"  long_name="ke-trend: surface pressure gradient (filter)"   unit="W/s^3"  /> 
     907      <field id="ssh_flt"       long_name="filtered contribution to ssh (dynspg_flt)"      unit="m"     grid_ref="grid_T_2D"   /> 
     908      <field id="w0"            long_name="surface vertical velocity"                      unit="m/s"   grid_ref="grid_T_2D"   /> 
     909      <field id="pw0_exp"       long_name="surface pressure flux due to ssh"               unit="W/s^2" grid_ref="grid_T_2D"   /> 
     910      <field id="pw0_flt"       long_name="surface pressure flux due to filtered ssh"      unit="W/s^2" grid_ref="grid_T_2D"   /> 
     911      <field id="ketrd_keg"     long_name="ke-trend: KE gradient         or hor. adv."     unit="W/s^3"  /> 
     912      <field id="ketrd_rvo"     long_name="ke-trend: relative  vorticity or metric term"   unit="W/s^3"  /> 
     913      <field id="ketrd_pvo"     long_name="ke-trend: planetary vorticity"                  unit="W/s^3"  /> 
     914      <field id="ketrd_zad"     long_name="ke-trend: vertical  advection"                  unit="W/s^3"  /> 
     915      <field id="ketrd_udx"     long_name="ke-trend: U.dx[U]"                              unit="W/s^3"  /> 
     916      <field id="ketrd_ldf"     long_name="ke-trend: lateral   diffusion"                  unit="W/s^3"  /> 
     917      <field id="ketrd_zdf"     long_name="ke-trend: vertical  diffusion"                  unit="W/s^3"  /> 
     918      <field id="ketrd_tau"     long_name="ke-trend: wind stress "                         unit="W/s^3" grid_ref="grid_T_2D"   /> 
     919      <field id="ketrd_bfr"     long_name="ke-trend: bottom friction (explicit)"           unit="W/s^3"  />    
     920      <field id="ketrd_bfri"    long_name="ke-trend: bottom friction (implicit)"           unit="W/s^3"  />    
     921      <field id="ketrd_atf"     long_name="ke-trend: asselin time filter trend"            unit="W/s^3"  />   
     922      <field id="ketrd_convP2K" long_name="ke-trend: conversion (potential to kinetic)"    unit="W/s^3"  /> 
     923      <field id="KE"            long_name="kinetic energy: u(n)*u(n+1)/2"                  unit="W/s^2"  />    
     924      <!-- variables available with ln_PE_trd --> 
     925      <field id="petrd_xad"     long_name="pe-trend: i-advection"                          unit="W/m^3"  /> 
     926      <field id="petrd_yad"     long_name="pe-trend: j-advection"                          unit="W/m^3"  /> 
     927      <field id="petrd_zad"     long_name="pe-trend: k-advection"                          unit="W/m^3"  /> 
     928      <field id="petrd_sad"     long_name="pe-trend: surface adv. (no-vvl)"                unit="W/m^3"  grid_ref="grid_T_2D" /> 
     929      <field id="petrd_ldf"     long_name="pe-trend: lateral  diffusion"                   unit="W/m^3"  /> 
     930      <field id="petrd_zdf"     long_name="pe-trend: vertical diffusion"                   unit="W/m^3"  /> 
     931      <field id="petrd_zdfp"    long_name="pe-trend: pure vert. diffusion"                 unit="W/m^3"  /> 
     932      <field id="petrd_dmp"     long_name="pe-trend: interior restoring"                   unit="W/m^3"  /> 
     933      <field id="petrd_bbl"     long_name="pe-trend: bottom boundary layer"                unit="W/m^3"  /> 
     934      <field id="petrd_npc"     long_name="pe-trend: non-penetrative conv."                unit="W/m^3"  /> 
     935      <field id="petrd_nsr"     long_name="pe-trend: surface forcing + runoff"             unit="W/m^3"  /> 
     936      <field id="petrd_qsr"     long_name="pe-trend: solar penetr. heating"                unit="W/m^3"  /> 
     937      <field id="petrd_bbc"     long_name="pe-trend: geothermal heating"                   unit="W/m^3"  /> 
     938      <field id="petrd_atf"     long_name="pe-trend: asselin time filter"                  unit="W/m^3"  /> 
     939      <field id="PEanom"        long_name="potential energy anomaly"                       unit="SI"     />    
     940      <field id="alphaPE"       long_name="- partial deriv. of PEanom wrt T"               unit="/degC"  />    
     941      <field id="betaPE"        long_name="partial deriv. of PEanom wrt S"                 unit="/psu"   />    
     942    </field_group> 
     943 
     944    <field_group id="trendU" grid_ref="grid_U_3D"> 
     945     <!-- variables available with ln_dyn_trd --> 
     946     <field id="utrd_hpg"       long_name="i-trend: hydrostatic pressure gradient"         unit="m/s^2"                      /> 
     947     <field id="utrd_spg"       long_name="i-trend: surface     pressure gradient"         unit="m/s^2"                      /> 
     948     <field id="utrd_spgexp"    long_name="i-trend: surface pressure gradient (explicit)"  unit="m/s^2"                      /> 
     949     <field id="utrd_spgflt"    long_name="i-trend: surface pressure gradient (filtered)"  unit="m/s^2"                      /> 
     950     <field id="utrd_keg"       long_name="i-trend: KE gradient         or hor. adv."      unit="m/s^2"                      /> 
     951     <field id="utrd_rvo"       long_name="i-trend: relative  vorticity or metric term"    unit="m/s^2"                      /> 
     952     <field id="utrd_pvo"       long_name="i-trend: planetary vorticity"                   unit="m/s^2"                      /> 
     953     <field id="utrd_zad"       long_name="i-trend: vertical  advection"                   unit="m/s^2"                      /> 
     954     <field id="utrd_udx"       long_name="i-trend: U.dx[U]"                               unit="m/s^2"                      /> 
     955     <field id="utrd_ldf"       long_name="i-trend: lateral   diffusion"                   unit="m/s^2"                      /> 
     956     <field id="utrd_zdf"       long_name="i-trend: vertical  diffusion"                   unit="m/s^2"                      /> 
     957     <field id="utrd_tau"       long_name="i-trend: wind stress "                          unit="m/s^2" grid_ref="grid_U_2D" /> 
     958     <field id="utrd_bfr"       long_name="i-trend: bottom friction (explicit)"            unit="m/s^2"                      />    
     959     <field id="utrd_bfri"      long_name="i-trend: bottom friction (implicit)"            unit="m/s^2"                      />    
     960     <field id="utrd_tot"       long_name="i-trend: total momentum trend before atf"       unit="m/s^2"                      />    
     961     <field id="utrd_atf"       long_name="i-trend: asselin time filter trend"             unit="m/s^2"                      />    
     962    </field_group> 
     963 
     964    <field_group id="trendV" grid_ref="grid_V_3D"> 
     965     <!-- variables available with ln_dyn_trd --> 
     966     <field id="vtrd_hpg"       long_name="j-trend: hydrostatic pressure gradient"         unit="m/s^2"                      /> 
     967     <field id="vtrd_spg"       long_name="j-trend: surface     pressure gradient"         unit="m/s^2"                      /> 
     968     <field id="vtrd_spgexp"    long_name="j-trend: surface pressure gradient (explicit)"  unit="m/s^2"                      /> 
     969     <field id="vtrd_spgflt"    long_name="j-trend: surface pressure gradient (filtered)"  unit="m/s^2"                      /> 
     970     <field id="vtrd_keg"       long_name="j-trend: KE gradient         or hor. adv."      unit="m/s^2"                      /> 
     971     <field id="vtrd_rvo"       long_name="j-trend: relative  vorticity or metric term"    unit="m/s^2"                      /> 
     972     <field id="vtrd_pvo"       long_name="j-trend: planetary vorticity"                   unit="m/s^2"                      /> 
     973     <field id="vtrd_zad"       long_name="j-trend: vertical  advection"                   unit="m/s^2"                      /> 
     974     <field id="vtrd_vdy"       long_name="i-trend: V.dx[V]"                               unit="m/s^2"                      /> 
     975     <field id="vtrd_ldf"       long_name="j-trend: lateral   diffusion"                   unit="m/s^2"                      /> 
     976     <field id="vtrd_zdf"       long_name="j-trend: vertical  diffusion"                   unit="m/s^2"                      /> 
     977     <field id="vtrd_tau"       long_name="j-trend: wind stress "                          unit="m/s^2" grid_ref="grid_V_2D" /> 
     978     <field id="vtrd_bfr"       long_name="j-trend: bottom friction (explicit)"            unit="m/s^2"                      />    
     979     <field id="vtrd_bfri"      long_name="j-trend: bottom friction (implicit)"            unit="m/s^2"                      />    
     980     <field id="vtrd_tot"       long_name="j-trend: total momentum trend before atf"       unit="m/s^2"                      />    
     981     <field id="vtrd_atf"       long_name="j-trend: asselin time filter trend"            unit="m/s^2"                       />    
     982    </field_group> 
     983 
    678984    </field_definition> 
  • branches/2014/dev_r4650_UKMO10_Tidally_Meaned_Diagnostics/NEMOGCM/CONFIG/SHARED/namelist_ice_lim2_ref

    r4329 r5260  
    4848   c_rhg       =  20.0     !  2nd bulk-rhelogy parameter 
    4949   etamn       =   0.0e+07 !  minimun value for viscosity 
    50    creepl      =   1.0e-08 !  creep limit 
    51    ecc         =   2.0     !  eccentricity of the elliptical yield curve 
     50   rn_creepl   =   1.0e-08 !  creep limit 
     51   rn_ecc      =   2.0     !  eccentricity of the elliptical yield curve 
    5252   ahi0        = 350.e0    !  horizontal eddy diffusivity coefficient for sea-ice [m2/s] 
    53    nevp        =   120     !  number of EVP subcycling iterations 
     53   nn_nevp     =   120     !  number of EVP subcycling iterations 
    5454   telast      =   9600    !  timescale for EVP elastic waves 
    5555   alphaevp    =   1.0     !  coefficient for the solution of EVP int. stresses 
    56    hminrhg     =   0.05     !  ice thickness (m) below which ice velocity equal ocean velocity 
    5756/ 
    5857!----------------------------------------------------------------------- 
  • branches/2014/dev_r4650_UKMO10_Tidally_Meaned_Diagnostics/NEMOGCM/CONFIG/SHARED/namelist_ice_lim3_ref

    r4205 r5260  
    11!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
    2 !! NEMO/LIM3 :  1 - dynamics/advection/thermo          (namicerun) 
    3 !! namelists    2 - ice intialisation                  (namiceini) 
    4 !!              3 - ice dynamic                        (namicedyn) 
    5 !!              4 - ice advection                      (namicetrp) 
    6 !!              5 - thermodynamic                      (namicethd) 
    7 !!              6 - ice salinity                       (namicesal) 
    8 !!              7 - mechanical redistribution of ice   (namiceitdme) 
    9 !!              8 - ice diagnostics                    (namicedia) 
    10 !!              9 - ice outputs                        (namiceout) 
     2!! LIM3 namelist :   
     3!!              1 - Generic parameters                 (namicerun) 
     4!!              2 - Ice initialization                 (namiceini) 
     5!!              3 - Ice discretization                 (namiceitd) 
     6!!              4 - Ice dynamics and transport         (namicedyn) 
     7!!              5 - Ice thermodynamics                 (namicethd) 
     8!!              6 - Ice salinity                       (namicesal) 
     9!!              7 - Ice mechanical redistribution      (namiceitdme) 
    1110!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
    12  
    13 !----------------------------------------------------------------------- 
    14 &namicerun     !   Share parameters for dynamics/advection/thermo 
    15 !----------------------------------------------------------------------- 
     11! 
     12!------------------------------------------------------------------------------ 
     13&namicerun     !   Generic parameters 
     14!------------------------------------------------------------------------------ 
     15   jpl            =    5           !  number of ice  categories 
     16   nlay_i         =    2           !  number of ice  layers 
     17   nlay_s         =    1           !  number of snow layers (only 1 is working) 
    1618   cn_icerst_in  = "restart_ice"   !  suffix of ice restart name (input) 
    17    cn_icerst_out = "restart_ice"      !  suffix of ice restart name (output) 
    18    ln_limdyn   = .true.    !  ice dynamics (T) or thermodynamics only (F) 
    19    amax        = 0.999      !  maximum ice concentration 
    20    cai         =  1.40e-3  !  atmospheric drag over sea ice 
    21    cao         =  1.00e-3  !  atmospheric drag over ocean 
    22    ln_nicep    = .false.   !  Ice points output for debug (yes or no) 
    23    ln_limdiahsb  = .false.    !  check the heat and salt budgets (T) or not (F) 
    24    ln_limdiaout  = .false.    !  output the heat and salt budgets (T) or not (F) 
     19   cn_icerst_out = "restart_ice"   !  suffix of ice restart name (output) 
     20   ln_limdyn     = .true.          !  ice dynamics (T) or thermodynamics only (F) 
     21   rn_amax       = 0.999           !  maximum tolerated ice concentration  
     22   ln_limdiahsb  = .false.         !  check the heat and salt budgets (T) or not (F) 
     23   ln_limdiaout  = .true.          !  output the heat and salt budgets (T) or not (F) 
     24   ln_icectl     = .false.         !  ice points output for debug (T or F) 
     25   iiceprt       = 10              !  i-index for debug 
     26   jiceprt       = 10              !  j-index for debug 
    2527/ 
    26 !----------------------------------------------------------------------- 
    27 &namiceini     !   ice initialisation 
    28 !----------------------------------------------------------------------- 
    29    ttest       =  2.0      !  threshold water temperature for initial sea ice 
    30    hninn       =  0.3      !  initial snow thickness in the north 
    31    hnins       =  0.1      !        "            "          south 
    32    hginn       =  3.50     !  initial undeformed ice thickness in the north 
    33    hgins       =  1.0      !        "            "              "     south 
    34    aginn       =  0.95     !  initial undeformed ice concentration in the north 
    35    agins       =  0.9      !        "            "              "         south 
    36    sinn        =  6.301    !  initial salinity in the north 
    37    sins        =  6.301    !        "            "    south 
     28!------------------------------------------------------------------------------ 
     29&namiceini     !   Ice initialization 
     30!------------------------------------------------------------------------------ 
     31   ln_iceini      = .true.         !  activate ice initialization (T) or not (F) 
     32   rn_thres_sst   =  2.0           !  maximum water temperature with initial ice (degC) 
     33   rn_hts_ini_n   =  0.3           !  initial real snow thickness (m), North 
     34   rn_hts_ini_s   =  0.3           !        "            "             South 
     35   rn_hti_ini_n   =  3.0           !  initial real ice thickness  (m), North 
     36   rn_hti_ini_s   =  1.0           !        "            "             South 
     37   rn_ati_ini_n   =  0.9           !  initial ice concentration   (-), North 
     38   rn_ati_ini_s   =  0.9           !        "            "             South 
     39   rn_smi_ini_n   =  6.3           !  initial ice salinity     (g/kg), North 
     40   rn_smi_ini_s   =  6.3           !        "            "             South 
     41   rn_tmi_ini_n   =  270.          !  initial ice/snw temperature (K), North 
     42   rn_tmi_ini_s   =  270.          !        "            "             South 
    3843/ 
    39 !----------------------------------------------------------------------- 
    40 &namicedyn     !   ice dynamic 
    41 !----------------------------------------------------------------------- 
    42    epsd        =   1.0e-20 !  tolerance parameter 
    43    alpha       =   0.5     !  coefficient for semi-implicit coriolis 
    44    dm          =   0.6e+03 !  diffusion constant for dynamics 
    45    nbiter      =   1       !  number of sub-time steps for relaxation 
    46    nbitdr      = 500       !  maximum number of iterations for relaxation 
    47    om          =   0.5     !  relaxation constant  
    48    resl        =   5.0e-05 !  maximum value for the residual of relaxation 
    49    cw          =   5.0e-03 !  drag coefficient for oceanic stress 
    50    angvg       =   0.0     !  turning angle for oceanic stress 
    51    pstar       =   2.0e+04 !  1st bulk-rheology parameter 
    52    c_rhg       =  20.0     !  2nd bulk-rhelogy parameter 
    53    etamn       =   0.0e+07 !  minimun value for viscosity 
    54    creepl      =   1.0e-12 !  creep limit 
    55    ecc         =   2.0     !  eccentricity of the elliptical yield curve 
    56    ahi0        = 350.e0    !  horizontal eddy diffusivity coefficient for sea-ice [m2/s] 
    57    nevp        = 300       !  number of iterations for subcycling in EVP, SB, 400 
    58    telast      =9600.0     !  timescale for elastic waves, SB, 720.0 
    59    alphaevp    =   1.0     !  coefficient for the solution of internal ice stresses 
    60    hminrhg     =   0.001   !  ice volume (a*h in m) below which ice velocity equal ocean velocity 
     44!------------------------------------------------------------------------------ 
     45&namiceitd     !   Ice discretization 
     46!------------------------------------------------------------------------------ 
     47   nn_catbnd      =    2           !  computation of ice category boundaries based on 
     48                                   !      1: tanh function 
     49                                   !      2: h^(-alpha), function of rn_himean 
     50   rn_himean      =    2.0         !  expected domain-average ice thickness (m), nn_catbnd = 2 only 
    6151/ 
    62 !----------------------------------------------------------------------- 
    63 &namicetrp     !   ice transport 
    64 !----------------------------------------------------------------------- 
    65    bound       =   0.      !  boundary conditions (=0.0 no-slip, =1.0 free-slip) 
     52!------------------------------------------------------------------------------ 
     53&namicedyn     !   Ice dynamics and transport 
     54!------------------------------------------------------------------------------ 
     55   nn_icestr      =    0           !  ice strength parameteriztaion                       
     56                                   !     0: Hibler_79     P = pstar*<h>*exp(-c_rhg*A) 
     57                                   !     1: Rothrock_75   P = Cf*coeff*integral(wr.h^2)     
     58   ln_icestr_bvf  =    .false.     !  ice strength function brine volume (T) or not (F)      
     59   rn_pe_rdg      =   17.0         !  ridging work divided by pot. energy change in ridging, if nn_icestr = 1 
     60   rn_pstar       =    2.0e+04     !  ice strength thickness parameter (N/m2), nn_icestr = 0  
     61   rn_crhg        =   20.0         !  ice strength conc. parameter (-), nn_icestr = 0        
     62   rn_cio         =    5.0e-03     !  ice-ocean drag coefficient           (-)              
     63   rn_creepl      =    1.0e-12     !  creep limit (s-1)                                    
     64   rn_ecc         =    2.0         !  eccentricity of the elliptical yield curve           
     65   nn_nevp        =  120           !  number of EVP subcycles                              
     66   rn_relast      =    0.333       !  ratio of elastic timescale to ice time step: Telast = dt_ice * rn_relast  
     67                                   !     advised value: 1/3 (rn_nevp=120) or 1/9 (rn_nevp=300) 
     68   nn_ahi0        =    2           !  horizontal diffusivity computation 
     69                                   !     0: use rn_ahi0_ref 
     70                                   !     1: use rn_ahi0_ref x mean grid cell length / ( 2deg mean grid cell length ) 
     71                                   !     2: use rn_ahi0_ref x grid cell length      / ( 2deg mean grid cell length ) 
     72   rn_ahi0_ref    = 350.0          !  horizontal sea ice diffusivity (m2/s)  
     73                                   !     if nn_ahi0 > 0, rn_ahi0_ref is the reference value at a nominal 2 deg resolution 
    6674/ 
    67 !----------------------------------------------------------------------- 
    68 &namicethd     !   ice thermodynamic 
    69 !----------------------------------------------------------------------- 
    70    hmelt       = -0.15     !  maximum melting at the bottom 
    71    hiccrit     = 0.1 , 0.1 !  ice thickness for lateral accretion in the Northern (Southern) Hemisphere 
    72                            !         caution 1.0, 1.0 best value to be used!!! (gilles G.)  ???? 
    73    fraz_swi    = 0.0       !  use of frazil ice collection thickness in function of wind (1.0) or not (0.0) 
    74    maxfrazb    = 0.0       !  maximum portion of frazil ice collecting at the ice bottom 
    75    vfrazb      = 0.4166667 !  thresold drift speed for frazil ice collecting at the ice bottom 
    76    Cfrazb      = 5.0       !  squeezing coefficient for frazil ice collecting at the ice bottom 
    77    hicmin      = 0.2       !  ice thickness corr. to max. energy stored in brine pocket 
    78    hiclim      = 0.10      !  minimum ice thickness 
    79    sbeta       = 1.        !  numerical caracteritic of the scheme for diffusion in ice 
    80                            !        Cranck-Nicholson (=0.5), implicit (=1), explicit (=0) 
    81    parlat      = 0.0       !  percentage of energy used for lateral ablation 
    82    hakspl      = 0.25      !  slope of distr. for Hakkinen-Mellor's lateral melting 
    83    hibspl      = 0.5       !  slope of distribution for Hibler's lateral melting 
    84    exld        = 2.0       !  exponent for leads-closure rate 
    85    hakdif      = 1.0       !  coefficient for diffusions of ice and snow 
    86    thth        = 0.2       !  threshold thickness for comp. of eq. thermal conductivity 
    87    hnzst       = 0.1       !  thickness of the surf. layer in temp. computation 
    88    parsub      = 1.0       !  switch for snow sublimation or not 
    89    alphs       = 1.0       !  coefficient for snow density when snow ice formation 
    90    betas       = 0.6       !  exponent in lead-ice fractionation of snow precipitation 0.66 
    91                            !        betas = 1 -> equipartition, betas < 1 -> more on leads 
    92    kappa_i     = 1.0       !  extinction radiation parameter in sea ice (1.0) 
    93    nconv_i_thd = 50        !  maximal number of iterations for heat diffusion computation 
    94    maxer_i_thd = 0.0001    !  maximal error in temperature for heat diffusion computation 
    95    thcon_i_swi = 1         !  switch for computation of thermal conductivity in the ice 
    96                            !        (0) Untersteiner (1964), (1) Pringle et al. (2007) 
     75!------------------------------------------------------------------------------ 
     76&namicethd     !   Ice thermodynamics 
     77!------------------------------------------------------------------------------ 
     78   rn_hnewice  = 0.1               !  thickness for new ice formation in open water (m) 
     79   ln_frazil   = .false.           !  use frazil ice collection thickness as a function of wind (T) or not (F) 
     80   rn_maxfrazb = 0.0               !  maximum fraction of frazil ice collecting at the ice base 
     81   rn_vfrazb   = 0.417             !  thresold drift speed for frazil ice collecting at the ice bottom (m/s) 
     82   rn_Cfrazb   = 5.0               !  squeezing coefficient for frazil ice collecting at the ice bottom 
     83   rn_himin    = 0.10              !  minimum ice thickness (m) used in remapping, must be smaller than rn_hnewice 
     84   rn_betas    = 0.66              !  exponent in lead-ice repratition of snow precipitation 
     85                                   !     betas = 1 -> equipartition, betas < 1 -> more on leads 
     86   rn_kappa_i  = 1.0               !  radiation attenuation coefficient in sea ice (m-1) 
     87   nn_conv_dif = 50                !  maximal number of iterations for heat diffusion computation 
     88   rn_terr_dif = 0.0001            !  maximum temperature after heat diffusion (degC) 
     89   nn_ice_thcon= 1                 !  sea ice thermal conductivity 
     90                                   !     0: k = k0 + beta.S/T (Untersteiner, 1964) 
     91                                   !     1: k = k0 + beta1.S/T - beta2.T (Pringle et al., 2007) 
     92   nn_monocat  = 0                 !  virtual ITD mono-category parameterizations (1, jpl = 1 only) or not (0) 
     93                                   !     2: simple piling instead of ridging --- temporary option 
     94                                   !     3: activate G(he) only              --- temporary option 
     95                                   !     4: activate lateral melting only    --- temporary option 
     96  ln_it_qnsice = .true.            !  iterate the surface non-solar flux with surface temperature (T) or not (F) 
    9797/ 
    98 !----------------------------------------------------------------------- 
    99 &namicesal     !   ice salinity 
    100 !----------------------------------------------------------------------- 
    101    num_sal     =  2        !  salinity option: 1 -> S = bulk_sal 
    102                            !                   2 -> S = S(z,t) with a simple parameterization 
    103                            !                   3 -> S = S(z) profile of Scwharzacher [1959] 
    104                            !                   4 -> S = S(h) Cox and Weeks [1974] 
    105    bulk_sal    =  4.0      !  if 1 is used, it represents the ice salinity 
    106    sal_G       =  5.00     !  restoring salinity for GD 
    107    time_G      =  1.728e+6 !  restoring time for GD 
    108    sal_F       =  2.00     !  restoring salinity for flushing 
    109    time_F      =  8.640e+5 !  restoring time for flushing 
    110    s_i_max     = 20.0      !  Maximum salinity  
    111    s_i_min     =  0.1      !  Minimum tolerated ice salinity 
    112    s_i_0       =  3.5      !  1st salinity for salinity profile 
    113    s_i_1       =  4.5      !  2nd salinity for salinity profile 
     98!------------------------------------------------------------------------------ 
     99&namicesal     !   Ice salinity 
     100!------------------------------------------------------------------------------ 
     101   nn_icesal   =  2                !  ice salinity option 
     102                                   !     1: constant ice salinity (S=rn_icesal) 
     103                                   !     2: varying salinity parameterization S(z,t) 
     104                                   !     3: prescribed salinity profile S(z), Schwarzacher, 1959 
     105   rn_icesal   =  4.               !  ice salinity (g/kg, nn_icesal = 1 only) 
     106   rn_sal_gd   =  5.               !  restoring ice salinity, gravity drainage (g/kg) 
     107   rn_time_gd  =  1.73e+6          !  restoring time scale, gravity drainage  (s) 
     108   rn_sal_fl   =  2.               !  restoring ice salinity, flushing (g/kg) 
     109   rn_time_fl  =  8.64e+5          !  restoring time scale, flushing (s) 
     110   rn_simax    = 20.               !  maximum tolerated ice salinity (g/kg) 
     111   rn_simin    =  0.1              !  minimum tolerated ice salinity (g/kg) 
    114112/ 
    115 !----------------------------------------------------------------------- 
    116 &namiceitdme   !   parameters for mechanical redistribution of ice  
    117 !----------------------------------------------------------------------- 
    118    ridge_scheme_swi = 0      !  which ridging scheme using (1=Rothrock,else=Hibler79) 
    119    Cs               =   0.50 !  shearing energy contribution to ridging 
    120    Cf               =  17.0  !  ratio of ridging work to PE change in ridging 
    121    fsnowrdg         =   0.5  !  snow fraction that survives in ridging 
    122    fsnowrft         =   0.5  !  snow fraction that survives in rafting 
    123    Gstar            =   0.15 !  fractional area of thin ice being ridged 
    124    astar            =   0.05 !  equivalent of gstar (0.05 for TH75 and 0.03 for weaker ice) 
    125    Hstar            = 100.0  !  parameter determining the maximum thickness of ridged ice 
    126    raftswi          =   1    !  rafting or not 
    127    hparmeter        =   0.75 !  threshold thickness for rafting or not 
    128    Craft            =   5.0  !  coefficient used in the rafting function 
    129    ridge_por        =   0.3  !  initial porosity of the ridged ice (typically 0.30) 
    130    sal_max_ridge    =  15.0  !  maximum ridged ice salinity 
    131    partfun_swi      =   1    !  participation function linear, TH75 (0) or exponential Letal07 (1) 
    132    transfun_swi     =   0    !  transfer function uniform of H80 (0) or exponential Letal07 (1) 
    133    brinstren_swi    =   0    !  (1) use brine volume to diminish ice strength 
     113!------------------------------------------------------------------------------ 
     114&namiceitdme   !   Ice mechanical redistribution (ridging and rafting) 
     115!------------------------------------------------------------------------------ 
     116   rn_Cs       =   0.5             !  fraction of shearing energy contributing to ridging 
     117   rn_fsnowrdg =   0.5             !  snow volume fraction that survives in ridging 
     118   rn_fsnowrft =   0.5             !  snow volume fraction that survives in rafting 
     119   nn_partfun  =   1               !  type of ridging participation function 
     120                                   !     0: linear (Thorndike et al, 1975) 
     121                                   !     1: exponential (Lipscomb, 2007 
     122   rn_gstar    =   0.15            !  fractional area of thin ice being ridged (nn_partfun = 0) 
     123   rn_astar    =   0.05            !  exponential measure of ridging ice fraction (nn_partfun = 1) 
     124   rn_hstar    = 100.0             !  determines the maximum thickness of ridged ice (m) (Hibler, 1980) 
     125   ln_rafting  =   .true.          !  rafting activated (T) or not (F) 
     126   rn_hraft    =   0.75            !  threshold thickness for rafting (m) 
     127   rn_craft    =   5.0             !  squeezing coefficient used in the rafting function 
     128   rn_por_rdg  =   0.3             !  porosity of newly ridged ice (Lepparanta et al., 1995) 
    134129/ 
    135 !----------------------------------------------------------------------- 
    136 &namicedia     !   ice diagnostics 
    137 !----------------------------------------------------------------------- 
    138    fmtinf      ='1PE13.5 ' !  format of the output values 
    139    nfrinf      = 4         !  number of variables written in one line 
    140    ntmoy       = 1         !  instantaneous values of ice evolution or averaging 
    141    ninfo       = 1         !  frequency of ouputs on file ice_evolu in case of averaging 
    142 / 
    143 !!----------------------------------------------------------------------- 
    144 !&namicehsb       !  Heat and salt budgets  
    145 !!----------------------------------------------------------------------- 
    146 ! 
    147 !/ 
    148 !----------------------------------------------------------------------- 
    149 &namiceout     !   parameters for outputs 
    150 !----------------------------------------------------------------------- 
    151    noumef      =   43      !  number of fields 
    152    add_diag_swi=    1      !  1 -> diagnose distribution in thickness space 
    153                            !  0 -> only simple diagnostics 
    154 ! 
    155 !           !         title of the field           !  name     !   units   !  save  ! multipl. ! additive ! 
    156 !           !                                      !           !           ! or not !  factor  !  factor  ! 
    157    field_1  = 'Ice concentration                  ', 'iiceconc', '%       ',    1   ,  1.0     ,    0.0 
    158    field_2  = 'Ice thickness                      ', 'iicethic', 'm       ',    1   ,  1.0     ,    0.0 
    159    field_3  = 'Snow thickness                     ', 'isnowthi', 'm       ',    1   ,  1.0     ,    0.0 
    160    field_4  = 'Daily bottom thermo ice production ', 'iicebopr', 'km3/day ',    1   , 1.0e-9   ,    0.0 
    161    field_5  = 'Daily dynamic ice production       ', 'iicedypr', 'km3/day ',    1   , 1.0e-9   ,    0.0 
    162    field_6  = 'Oceanic flux at the ice base       ', 'ioceflxb', 'w/m2    ',    1   ,  1.0     ,    0.0 
    163    field_7  = 'Ice velocity u                     ', 'iicevelu', 'm/s     ',    1   ,  1.0     ,    0.0 
    164    field_8  = 'Ice velocity v                     ', 'iicevelv', 'm/s     ',    1   ,  1.0     ,    0.0 
    165    field_9  = 'Sea surface temperature            ', 'isstempe', 'C       ',    1   ,  1.0     , -273.15 
    166    field_10 = 'Sea surface salinity               ', 'isssalin', 'PSU     ',    1   ,  1.0     ,    0.0 
    167    field_11 = 'Total flux at ocean surface        ', 'iocetflx', 'w/m2    ',    1   ,  1.0     ,    0.0 
    168    field_12 = 'Solar flux at ocean surface        ', 'iocesflx', 'w/m2    ',    1   ,  1.0     ,    0.0 
    169    field_13 = 'Non-solar flux at ocean surface    ', 'iocwnsfl', 'w/m2    ',    1   ,  1.0     ,    0.0 
    170    field_14 = 'Heat flux due to brine release     ', 'iocehebr', 'w/m2    ',    1   ,  1.0     ,    0.0 
    171    field_15 = 'Wind stress u                      ', 'iocestru', 'Pa      ',    1   ,  1.0     ,    0.0 
    172    field_16 = 'Wind stress v                      ', 'iocestrv', 'Pa      ',    1   ,  1.0     ,    0.0  
    173    field_17 = 'Solar flux at ice/ocean surface    ', 'iicesflx', 'w/m2    ',    1   ,  1.0     ,    0.0 
    174    field_18 = 'Non-solar flux at ice/ocean surface', 'iicenflx', 'w/m2    ',    1   ,  1.0     ,    0.0 
    175    field_19 = 'Snow precipitation                 ', 'isnowpre', 'kg/m2/d ',    1   ,  1.0     ,    0.0 
    176    field_20 = 'Mean ice salinity                  ', 'iicesali', 'psu     ',    1   ,  1.0     ,    0.0 
    177    field_21 = 'Mean ice age                       ', 'iiceages', 'years   ',    1   ,  0.002739,    0.0 
    178    field_22 = 'Daily lateral thermo ice prod.     ', 'iicelapr', 'km3/day ',    1   ,1.0e-9    ,    0.0 
    179    field_23 = 'Daily snowice ice production       ', 'iicesipr', 'km3/day ',    1   ,1.0e-9    ,    0.0 
    180    field_24 = 'Mean ice temperature               ', 'iicetemp', 'C       ',    1   ,  1.0     , -273.15 
    181    field_25 = 'Ice total heat content             ', 'iiceheco', '10^9 J  ',    1   ,  1.0     ,    0.0 
    182    field_26 = 'Ice surface temperature            ', 'iicesurt', 'C       ',    1   ,  1.0     , -273.15 
    183    field_27 = 'Snow temperature                   ', 'isnotem2', 'C       ',    1   ,  1.0     , -273.15 
    184    field_28 = 'Fsbri - brine salt flux            ', 'iicefsbr', 'kg/m2/d ',    1   ,  1.0     ,    0.0 
    185    field_29 = 'Fseqv - equivalent FW salt flux    ', 'iicefseq', 'kg/m2/d ',    1   ,  1.0     ,    0.0 
    186    field_30 = 'Brine volume                       ', 'ibrinvol', '%       ',    1   ,  100.0   ,    0.0 
    187    field_31 = 'Frazil ice collection thickness    ', 'iicecolf', 'm       ',    1   ,  1.0     ,    0.0 
    188    field_32 = 'Ice strength                       ', 'iicestre', 'N/m     ',    1   ,  0.001   ,    0.0 
    189    field_33 = 'Ice velocity                       ', 'iicevelo', 'm/s     ',    1   ,  1.0     ,    0.0 
    190    field_34 = 'Surface melt                       ', 'iicesume', 'km3/day ',    1   ,1.0e-9    ,    0.0 
    191    field_35 = 'Bottom melt                        ', 'iicebome', 'km3/day ',    1   ,1.0e-9    ,    0.0 
    192    field_36 = 'Divergence                         ', 'iicedive', '10-8s-1 ',    1   ,  1.0e8   ,    0.0 
    193    field_37 = 'Shear                              ', 'iiceshea', '10-8s-1 ',    1   ,  1.0e8   ,    0.0 
    194    field_38 = 'Daily resultant ice prod/melt      ', 'iicerepr', 'km3/day ',    1   ,  1.0e-9  ,    0.0 
    195    field_39 = 'Ice volume                         ', 'iicevolu', 'km3     ',    1   ,  1.0e-9  ,    0.0 
    196    field_40 = 'Snow volume                        ', 'isnowvol', 'km3     ',    1   ,  1.0e-9  ,    0.0 
    197    field_41 = 'Fsrpo - salt flux from ridg/raft   ', 'iicefsrp', 'kg/m2/d ',    1   ,  1.0     ,    0.0 
    198    field_42 = 'Fsres - salt flux from limupdate   ', 'iicefsre', 'kg/m2/d ',    1   ,  1.0     ,    0.0 
    199    field_43 = 'Ice volume transport               ', 'iicevtrp', 'km3/day ',    1   ,1.0e-9    ,    0.0 
    200 /  
    201  
  • branches/2014/dev_r4650_UKMO10_Tidally_Meaned_Diagnostics/NEMOGCM/CONFIG/SHARED/namelist_pisces_ref

    r4529 r5260  
    4848!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
    4949   concnno3   =  1.e-6    ! Nitrate half saturation of nanophytoplankton 
    50    concdno3   =  3.E-6    ! Phosphate half saturation for diatoms 
     50   concdno3   =  3.E-6    ! Nitrate half saturation for diatoms 
    5151   concnnh4   =  1.E-7    ! NH4 half saturation for phyto 
    5252   concdnh4   =  3.E-7    ! NH4 half saturation for diatoms 
    5353   concnfer   =  1.E-9    ! Iron half saturation for phyto 
    5454   concdfer   =  3.E-9    ! Iron half saturation for diatoms 
    55    concbfe    =  1.E-11   ! Half-saturation for Fe limitation of Bacteria 
    56    concbnh4   =  2.E-8    ! NH4 half saturation for phyto 
    57    concbno3   =  2.E-7    ! Phosphate half saturation for diatoms 
     55   concbfe    =  1.E-11   ! Iron half-saturation for DOC remin. 
     56   concbnh4   =  2.E-8    ! NH4 half saturation for DOC remin. 
     57   concbno3   =  2.E-7    ! Nitrate half saturation for DOC remin. 
    5858   xsizedia   =  1.E-6    ! Minimum size criteria for diatoms 
    5959   xsizephy   =  1.E-6    ! Minimum size criteria for phyto 
     
    6161   xsizerd    =  3.0      ! Size ratio for diatoms 
    6262   xksi1      =  2.E-6    ! half saturation constant for Si uptake 
    63    xksi2      =  20E-6  ! half saturation constant for Si/C 
     63   xksi2      =  20E-6    ! half saturation constant for Si/C 
    6464   xkdoc      =  417.E-6  ! half-saturation constant of DOC remineralization 
    6565   qnfelim    =  7.E-6    ! Optimal quota of phyto 
     
    8686   excret2    =  0.05     ! excretion ratio of diatoms 
    8787   ln_newprod =  .true.   ! Enable new parame. of production (T/F)  
    88    bresp      =  0.00333  ! Basal respiration rate 
    89    chlcnm     =  0.033    ! Minimum Chl/C in nanophytoplankton 
    90    chlcdm     =  0.05     ! Minimum Chl/C in diatoms 
    91    chlcmin    =  0.004    ! Maximum Chl/c in phytoplankton 
     88   bresp      =  0.033    ! Basal respiration rate 
     89   chlcnm     =  0.033    ! Maximum Chl/C in nanophytoplankton 
     90   chlcdm     =  0.05     ! Maximum Chl/C in diatoms 
     91   chlcmin    =  0.004    ! Minimum Chl/c in phytoplankton 
    9292   fecnm      =  40E-6    ! Maximum Fe/C in nanophytoplankton 
    93    fecdm      =  40E-6    ! Minimum Fe/C in diatoms 
     93   fecdm      =  40E-6    ! Maximum Fe/C in diatoms 
    9494   grosip     =  0.159    ! mean Si/C ratio 
    9595/ 
     
    110110   resrat2    =  0.005    ! exsudation rate of mesozooplankton 
    111111   mzrat2     =  0.03     ! mesozooplankton mortality rate 
    112    xprefc     =  1.       ! zoo preference for phyto 
    113    xprefp     =  0.3      ! zoo preference for POC 
    114    xprefz     =  1.       ! zoo preference for zoo 
    115    xprefpoc   =  0.3      ! zoo preference for poc 
     112   xprefc     =  1.       ! mesozoo preference for diatoms 
     113   xprefp     =  0.3      ! mesozoo preference for nanophyto. 
     114   xprefz     =  1.       ! mesozoo preference for microzoo. 
     115   xprefpoc   =  0.3      ! mesozoo preference for poc 
    116116   xthresh2zoo = 1E-8     ! zoo feeding threshold for mesozooplankton  
    117117   xthresh2dia = 1E-8     ! diatoms feeding threshold for mesozooplankton  
     
    119119   xthresh2poc = 1E-8     ! poc feeding threshold for mesozooplankton  
    120120   xthresh2   =  3E-7     ! Food threshold for grazing 
    121    xkgraz2    =  20.E-6   ! half sturation constant for meso grazing 
     121   xkgraz2    =  20.E-6   ! half saturation constant for meso grazing 
    122122   epsher2    =  0.35     ! Efficicency of Mesozoo growth 
    123123   sigma2     =  0.6      ! Fraction of mesozoo excretion as DOM 
     
    156156&nampisrem     !   parameters for remineralization 
    157157!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
    158    xremik    =  0.35      ! remineralization rate of DOC 
     158   xremik    =  0.3       ! remineralization rate of DOC 
    159159   xremip    =  0.025     ! remineralisation rate of POC 
    160160   nitrif    =  0.05      ! NH4 nitrification rate 
  • branches/2014/dev_r4650_UKMO10_Tidally_Meaned_Diagnostics/NEMOGCM/CONFIG/SHARED/namelist_ref

    r4756 r5260  
    11!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
    2 !! NEMO/OPA  :  1 - run manager      (namrun, namcfg) 
    3 !! namelists    2 - Domain           (namzgr, namzgr_sco, namdom, namtsd) 
     2!! NEMO/OPA  :  1 - run manager      (namrun) 
     3!! namelists    2 - Domain           (namcfg, namzgr, namzgr_sco, namdom, namtsd) 
    44!!              3 - Surface boundary (namsbc, namsbc_ana, namsbc_flx, namsbc_clio, namsbc_core, namsbc_sas 
    55!!                                    namsbc_cpl, namtra_qsr, namsbc_rnf, 
     
    1010!!              7 - dynamics         (namdyn_adv, namdyn_vor, namdyn_hpg, namdyn_spg, namdyn_ldf) 
    1111!!              8 - Verical physics  (namzdf, namzdf_ric, namzdf_tke, namzdf_kpp, namzdf_ddm, namzdf_tmx) 
    12 !!              9 - diagnostics      (namnc4, namtrd, namspr, namflo, namptr, namhsb) 
     12!!              9 - diagnostics      (namnc4, namtrd, namspr, namflo, namhsb) 
    1313!!             10 - miscellaneous    (namsol, nammpp, namctl) 
    1414!!             11 - Obs & Assim      (namobs, nam_asminc) 
     
    1818!!                   ***  Run management namelists  *** 
    1919!!====================================================================== 
    20 !!   namrun        parameters of the run 
     20!!   namrun       parameters of the run 
    2121!!====================================================================== 
    2222! 
     
    3131   nn_leapy    =       0   !  Leap year calendar (1) or not (0) 
    3232   ln_rstart   = .false.   !  start from rest (F) or from a restart file (T) 
    33    nn_euler    =       1   !  = 0 : start with forward time step if ln_rstart=.true. 
    34    nn_rstctl   =       0   !  restart control => activated only if ln_rstart = T 
     33   nn_euler    =       1   !  = 0 : start with forward time step if ln_rstart=T 
     34   nn_rstctl   =       0   !  restart control ==> activated only if ln_rstart=T 
    3535                           !    = 0 nn_date0 read in namelist ; nn_it000 : read in namelist 
    3636                           !    = 1 nn_date0 read in namelist ; nn_it000 : check consistancy between namelist and restart 
     
    4747/ 
    4848! 
    49 !----------------------------------------------------------------------- 
    50 &namcfg     !   default parameters of the configuration       
     49!!====================================================================== 
     50!!                      ***  Domain namelists  *** 
     51!!====================================================================== 
     52!!   namcfg       parameters of the configuration       
     53!!   namzgr       vertical coordinate 
     54!!   namzgr_sco   s-coordinate or hybrid z-s-coordinate 
     55!!   namdom       space and time domain (bathymetry, mesh, timestep) 
     56!!   namtsd       data: temperature & salinity 
     57!!====================================================================== 
     58! 
     59!----------------------------------------------------------------------- 
     60&namcfg     !   parameters of the configuration       
    5161!----------------------------------------------------------------------- 
    5262   cp_cfg      =  "default"            !  name of the configuration 
    53    cp_cfz      =         ''            !  name of the zoom of configuration 
     63   cp_cfz      =  "no zoom"            !  name of the zoom of configuration 
    5464   jp_cfg      =       0               !  resolution of the configuration 
    5565   jpidta      =      10               !  1st lateral dimension ( >= jpi ) 
     
    5767   jpkdta      =      31               !  number of levels      ( >= jpk ) 
    5868   jpiglo      =      10               !  1st dimension of global domain --> i =jpidta 
    59    jpjglo      =      12               !  2nd    -                  -    --> j  =jpjdta 
     69   jpjglo      =      12               !  2nd    -                  -    --> j =jpjdta 
    6070   jpizoom     =       1               !  left bottom (i,j) indices of the zoom 
    6171   jpjzoom     =       1               !  in data domain indices 
     
    6676                                       !  = 5 North fold F-point pivot 
    6777                                       !  = 6 cyclic East-West AND North fold F-point pivot 
    68 / 
    69 !!====================================================================== 
    70 !!                      ***  Domain namelists  *** 
    71 !!====================================================================== 
    72 !!   namzgr       vertical coordinate 
    73 !!   namzgr_sco   s-coordinate or hybrid z-s-coordinate 
    74 !!   namdom       space and time domain (bathymetry, mesh, timestep) 
    75 !!   namtsd       data: temperature & salinity 
    76 !!====================================================================== 
    77 ! 
     78   ln_use_jattr = .false.              !  use (T) the file attribute: open_ocean_jstart, if present  
     79                                       !  in netcdf input files, as the start j-row for reading 
     80/ 
    7881!----------------------------------------------------------------------- 
    7982&namzgr        !   vertical coordinate 
     
    8285   ln_zps      = .true.    !  z-coordinate - partial steps   (T/F) 
    8386   ln_sco      = .false.   !  s- or hybrid z-s-coordinate    (T/F) 
     87   ln_isfcav   = .false.   !  ice shelf cavity               (T/F) 
    8488/ 
    8589!----------------------------------------------------------------------- 
     
    183187/ 
    184188!----------------------------------------------------------------------- 
     189&namc1d        !   1D configuration options                             ("key_c1d") 
     190!----------------------------------------------------------------------- 
     191   rn_lat1d    =      50   !  Column latitude (default at PAPA station) 
     192   rn_lon1d    =    -145   !  Column longitude (default at PAPA station) 
     193   ln_c1d_locpt=  .true.   ! Localization of 1D config in a grid (T) or independant point (F) 
     194/ 
     195!----------------------------------------------------------------------- 
    185196&namtsd    !   data : Temperature  & Salinity 
    186197!----------------------------------------------------------------------- 
     
    208219!!   namtra_qsr      penetrative solar radiation 
    209220!!   namsbc_rnf      river runoffs 
     221!!   namsbc_isf      ice shelf melting/freezing 
    210222!!   namsbc_apr      Atmospheric Pressure 
    211223!!   namsbc_ssr      sea surface restoring term (for T and/or S) 
     
    223235   ln_blk_core = .true.    !  CORE bulk formulation                     (T => fill namsbc_core) 
    224236   ln_blk_mfs  = .false.   !  MFS bulk formulation                      (T => fill namsbc_mfs ) 
    225    ln_cpl      = .false.   !  Coupled formulation                       (T => fill namsbc_cpl ) 
    226237   ln_apr_dyn  = .false.   !  Patm gradient added in ocean & ice Eqs.   (T => fill namsbc_apr ) 
    227238   nn_ice      = 2         !  =0 no ice boundary condition   , 
    228239                           !  =1 use observed ice-cover      , 
    229                            !  =2 ice-model used                         ("key_lim3" or "key_lim2) 
     240                           !  =2 ice-model used                         ("key_lim3" or "key_lim2") 
    230241   nn_ice_embd = 1         !  =0 levitating ice (no mass exchange, concentration/dilution effect) 
    231242                           !  =1 levitating ice with mass and salt exchange but no presure effect 
    232243                           !  =2 embedded sea-ice (full salt and mass exchanges and pressure) 
    233244   ln_dm2dc    = .false.   !  daily mean to diurnal cycle on short wave 
    234    ln_rnf      = .true.    !  runoffs                                   (T => fill namsbc_rnf) 
     245   ln_rnf      = .true.    !  runoffs                                   (T   => fill namsbc_rnf) 
     246   nn_isf      = 0         !  ice shelf melting/freezing                (/=0 => fill namsbc_isf) 
     247                           !  0 =no isf                  1 = presence of ISF  
     248                           !  2 = bg03 parametrisation   3 = rnf file for isf    
     249                           !  4 = ISF fwf specified 
     250                           !  option 1 and 4 need ln_isfcav = .true. (domzgr) 
    235251   ln_ssr      = .true.    !  Sea Surface Restoring on T and/or S       (T => fill namsbc_ssr) 
    236252   nn_fwb      = 2         !  FreshWater Budget: =0 unchecked 
     
    240256   ln_cdgw = .false.       !  Neutral drag coefficient read from wave model (T => fill namsbc_wave) 
    241257   ln_sdw  = .false.       !  Computation of 3D stokes drift                (T => fill namsbc_wave) 
    242    cn_iceflx = 'linear'    !  redistribution of solar input into ice categories during coupling ice/atm. 
     258   nn_lsm  = 0             !  =0 land/sea mask for input fields is not applied (keep empty land/sea mask filename field) , 
     259                           !  =1:n number of iterations of land/sea mask application for input fields (fill land/sea mask filename field) 
     260   nn_limflx = -1          !  LIM3 Multi-category heat flux formulation (use -1 if LIM3 is not used) 
     261                           !  =-1  Use per-category fluxes, bypass redistributor, forced mode only, not yet implemented coupled 
     262                           !  = 0  Average per-category fluxes (forced and coupled mode) 
     263                           !  = 1  Average and redistribute per-category fluxes, forced mode only, not yet implemented coupled 
     264                           !  = 2  Redistribute a single flux over categories (coupled mode only) 
    243265/ 
    244266!----------------------------------------------------------------------- 
     
    296318 
    297319   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the bulk files 
    298    ln_2m       = .false.   !  air temperature and humidity referenced at 2m (T) instead 10m (F) 
    299320   ln_taudif   = .false.   !  HF tau contribution: use "mean of stress module - module of the mean stress" data 
    300    ln_bulk2z   = .false.   !  Air temperature/humidity and wind vectors are referenced at heights rn_zqt and rn_zu 
    301    rn_zqt      = 3.        !  Air temperature and humidity reference height (m) (ln_bulk2z) 
    302    rn_zu       = 4.        !  Wind vector reference height (m)                  (ln_bulk2z) 
     321   rn_zqt      = 10.        !  Air temperature and humidity reference height (m) 
     322   rn_zu       = 10.        !  Wind vector reference height (m)                  
    303323   rn_pfac     = 1.        !  multiplicative factor for precipitation (total & snow) 
    304324   rn_efac     = 1.        !  multiplicative factor for evaporation (0. or 1.) 
     
    327347!                    !                       ! categories !  reference  !    orientation       ! grids  ! 
    328348! send 
    329 sn_snd_temp   =       'weighted oce and ice' ,    'no'    ,     ''      ,         ''           ,   '' 
    330 sn_snd_alb    =       'weighted ice'         ,    'no'    ,     ''      ,         ''           ,   '' 
    331 sn_snd_thick  =       'none'                 ,    'no'   ,     ''      ,         ''           ,   '' 
    332 sn_snd_crt    =       'none'                 ,    'no'    , 'spherical' , 'eastward-northward' ,  'T' 
    333 sn_snd_co2    =       'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''           ,   '' 
     349   sn_snd_temp   =       'weighted oce and ice' ,    'no'    ,     ''      ,         ''           ,   '' 
     350   sn_snd_alb    =       'weighted ice'         ,    'no'    ,     ''      ,         ''           ,   '' 
     351   sn_snd_thick  =       'none'                 ,    'no'   ,     ''      ,         ''           ,   '' 
     352   sn_snd_crt    =       'none'                 ,    'no'    , 'spherical' , 'eastward-northward' ,  'T' 
     353   sn_snd_co2    =       'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''           ,   '' 
    334354! receive 
    335 sn_rcv_w10m   =       'none'                 ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
    336 sn_rcv_taumod =       'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
    337 sn_rcv_tau    =       'oce only'             ,    'no'    , 'cartesian' , 'eastward-northward',  'U,V' 
    338 sn_rcv_dqnsdt =       'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
    339 sn_rcv_qsr    =       'oce and ice'          ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
    340 sn_rcv_qns    =       'oce and ice'          ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
    341 sn_rcv_emp    =       'conservative'         ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
    342 sn_rcv_rnf    =       'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
    343 sn_rcv_cal    =       'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
    344 sn_rcv_co2    =       'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
     355   sn_rcv_w10m   =       'none'                 ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
     356   sn_rcv_taumod =       'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
     357   sn_rcv_tau    =       'oce only'             ,    'no'    , 'cartesian' , 'eastward-northward',  'U,V' 
     358   sn_rcv_dqnsdt =       'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
     359   sn_rcv_qsr    =       'oce and ice'          ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
     360   sn_rcv_qns    =       'oce and ice'          ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
     361   sn_rcv_emp    =       'conservative'         ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
     362   sn_rcv_rnf    =       'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
     363   sn_rcv_cal    =       'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
     364   sn_rcv_co2    =       'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
     365! 
     366   nn_cplmodel   =     1     !  Maximum number of models to/from which NEMO is potentialy sending/receiving data 
     367   ln_usecplmask = .false.   !  use a coupling mask file to merge data received from several models 
     368                             !   -> file cplmask.nc with the float variable called cplmask (jpi,jpj,nn_cplmodel) 
    345369/ 
    346370!----------------------------------------------------------------------- 
     
    396420   ln_rnf_tem   = .false.   !  read in temperature information for runoff 
    397421   ln_rnf_sal   = .false.   !  read in salinity information for runoff 
     422/ 
     423!----------------------------------------------------------------------- 
     424&namsbc_isf    !  Top boundary layer (ISF)  
     425!----------------------------------------------------------------------- 
     426!              ! file name ! frequency (hours) ! variable ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     427!              !           !  (if <0  months)  !   name   !    (logical)   !  (T/F)  ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     428! nn_isf == 4 
     429   sn_qisf      = 'rnfisf' ,         -12      ,'sohflisf',    .false.      , .true.  , 'yearly'  ,  ''      ,   '' 
     430   sn_fwfisf    = 'rnfisf' ,         -12      ,'sowflisf',    .false.      , .true.  , 'yearly'  ,  ''      ,   '' 
     431! nn_isf == 3 
     432   sn_rnfisf    = 'runoffs' ,         -12      ,'sofwfisf',    .false.      , .true.  , 'yearly'  ,  ''      ,   '' 
     433! nn_isf == 2 and 3 
     434   sn_depmax_isf = 'runoffs' ,       -12        ,'sozisfmax' ,   .false.  , .true.  , 'yearly'  ,  ''      ,   '' 
     435   sn_depmin_isf = 'runoffs' ,       -12        ,'sozisfmin' ,   .false.  , .true.  , 'yearly'  ,  ''      ,   '' 
     436! nn_isf == 2 
     437   sn_Leff_isf = 'rnfisf' ,       0          ,'Leff'         ,   .false.  , .true.  , 'yearly'  ,  ''      ,   '' 
     438! for all case 
     439   ln_divisf   = .true.  ! apply isf melting as a mass flux or in the salinity trend. (maybe I should remove this option as for runoff?) 
     440! only for nn_isf = 1 or 2 
     441   rn_gammat0  = 1.0e-4   ! gammat coefficient used in blk formula 
     442   rn_gammas0  = 1.0e-4   ! gammas coefficient used in blk formula 
     443! only for nn_isf = 1 
     444   nn_isfblk   =  1       ! 1 ISOMIP ; 2 conservative (3 equation formulation, Jenkins et al. 1991 ??) 
     445   rn_hisf_tbl =  30.      ! thickness of the top boundary layer           (Losh et al. 2008) 
     446                          ! 0 => thickness of the tbl = thickness of the first wet cell 
     447   ln_conserve = .true.   ! conservative case (take into account meltwater advection) 
     448   nn_gammablk = 1        ! 0 = cst Gammat (= gammat/s) 
     449                          ! 1 = velocity dependend Gamma (u* * gammat/s)  (Jenkins et al. 2010) 
     450                          !     if you want to keep the cd as in global config, adjust rn_gammat0 to compensate 
     451                          ! 2 = velocity and stability dependent Gamma    Holland et al. 1999 
    398452/ 
    399453!----------------------------------------------------------------------- 
     
    528582   ln_tide_ramp  = .false.  ! 
    529583   rdttideramp   =    0.    ! 
    530    clname(1)     =   'M2'   !  name of constituent 
    531    clname(2)     =   'S2' 
    532    clname(3)     =   'N2' 
    533    clname(4)     =   'K1' 
    534    clname(5)     =   'O1' 
    535    clname(6)     =   'Q1' 
    536    clname(7)     =   'M4' 
    537    clname(8)     =   'K2' 
    538    clname(9)     =   'P1' 
    539    clname(10)    =   'Mf' 
    540    clname(11)    =   'Mm' 
     584   clname(1)     = 'DUMMY'  !  name of constituent - all tidal components must be set in namelist_cfg 
    541585/ 
    542586!----------------------------------------------------------------------- 
     
    559603    nn_tra_dta    =  0                    !  = 0, bdy data are equal to the initial state 
    560604                                          !  = 1, bdy data are read in 'bdydata   .nc' files 
     605    cn_ice_lim      =  'none'             !   
     606    nn_ice_lim_dta  =  0                  !  = 0, bdy data are equal to the initial state 
     607                                          !  = 1, bdy data are read in 'bdydata   .nc' files 
     608    rn_ice_tem      = 270.                !  lim3 only: arbitrary temperature of incoming sea ice 
     609    rn_ice_sal      = 10.                 !  lim3 only:      --   salinity           -- 
     610    rn_ice_age      = 30.                 !  lim3 only:      --   age                -- 
     611 
    561612    ln_tra_dmp    =.false.                !  open boudaries conditions for tracers 
    562613    ln_dyn3d_dmp  =.false.                !  open boundary condition for baroclinic velocities 
     
    579630   bn_tem  =    'amm12_bdyT_tra' ,         24        , 'votemper' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
    580631   bn_sal  =    'amm12_bdyT_tra' ,         24        , 'vosaline' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
     632! for lim2 
     633!   bn_frld  =    'amm12_bdyT_ice' ,         24        , 'ileadfra' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
     634!   bn_hicif =    'amm12_bdyT_ice' ,         24        , 'iicethic' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
     635!   bn_hsnif =    'amm12_bdyT_ice' ,         24        , 'isnowthi' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
     636! for lim3 
     637!   bn_a_i  =    'amm12_bdyT_ice' ,         24        , 'ileadfra' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
     638!   bn_ht_i =    'amm12_bdyT_ice' ,         24        , 'iicethic' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
     639!   bn_ht_s =    'amm12_bdyT_ice' ,         24        , 'isnowthi' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
    581640   cn_dir  =    'bdydta/' 
    582641   ln_full_vel = .false. 
     
    607666   rn_bfeb2    =    2.5e-3 !  bottom turbulent kinetic energy background  (m2/s2) 
    608667   rn_bfrz0    =    3.e-3  !  bottom roughness [m] if ln_loglayer=T  
    609    ln_loglayer = .false.   !  logarithmic formulation (non linear case) 
    610668   ln_bfr2d    = .false.   !  horizontal variation of the bottom friction coef (read a 2D mask file ) 
    611669   rn_bfrien   =    50.    !  local multiplying factor of bfr (ln_bfr2d=T) 
     670   rn_tfri1    =    4.e-4  !  top drag coefficient (linear case) 
     671   rn_tfri2    =    2.5e-3 !  top drag coefficient (non linear case). Minimum coeft if ln_loglayer=T 
     672   rn_tfri2_max =   1.e-1  !  max. top drag coefficient (non linear case and ln_loglayer=T) 
     673   rn_tfeb2    =    0.0    !  top turbulent kinetic energy background  (m2/s2) 
     674   rn_tfrz0    =    3.e-3  !  top roughness [m] if ln_loglayer=T 
     675   ln_tfr2d    = .false.   !  horizontal variation of the top friction coef (read a 2D mask file ) 
     676   rn_tfrien   =    50.    !  local multiplying factor of tfr (ln_tfr2d=T) 
     677 
    612678   ln_bfrimp   = .true.    !  implicit bottom friction (requires ln_zdfexp = .false. if true) 
     679   ln_loglayer = .false.   !  logarithmic formulation (non linear case) 
    613680/ 
    614681!----------------------------------------------------------------------- 
     
    635702!!   nameos        equation of state 
    636703!!   namtra_adv    advection scheme 
     704!!   namtra_adv_mle   mixed layer eddy param. (Fox-Kemper param.) 
    637705!!   namtra_ldf    lateral diffusion scheme 
    638706!!   namtra_dmp    T & S newtonian damping 
     
    642710&nameos        !   ocean physical parameters 
    643711!----------------------------------------------------------------------- 
    644    nn_eos      =   0       !  type of equation of state and Brunt-Vaisala frequency 
    645                            !     = 0, UNESCO (formulation of Jackett and McDougall (1994) and of McDougall (1987) ) 
    646                            !     = 1, linear: rho(T)   = rau0 * ( 1.028 - ralpha * T ) 
    647                            !     = 2, linear: rho(T,S) = rau0 * ( rbeta * S - ralpha * T ) 
    648    rn_alpha    =   2.0e-4  !  thermal expension coefficient (nn_eos= 1 or 2) 
    649    rn_beta     =   7.7e-4  !  saline  expension coefficient (nn_eos= 2) 
     712   nn_eos      =  -1     !  type of equation of state and Brunt-Vaisala frequency 
     713                                 !  =-1, TEOS-10  
     714                                 !  = 0, EOS-80  
     715                                 !  = 1, S-EOS   (simplified eos) 
     716   ln_useCT    = .true.  ! use of Conservative Temp. ==> surface CT converted in Pot. Temp. in sbcssm 
     717   !                             ! 
     718   !                     ! S-EOS coefficients : 
     719   !                             !  rd(T,S,Z)*rau0 = -a0*(1+.5*lambda*dT+mu*Z+nu*dS)*dT+b0*dS 
     720   rn_a0       =  1.6550e-1      !  thermal expension coefficient (nn_eos= 1) 
     721   rn_b0       =  7.6554e-1      !  saline  expension coefficient (nn_eos= 1) 
     722   rn_lambda1  =  5.9520e-2      !  cabbeling coeff in T^2  (=0 for linear eos) 
     723   rn_lambda2  =  7.4914e-4      !  cabbeling coeff in S^2  (=0 for linear eos) 
     724   rn_mu1      =  1.4970e-4      !  thermobaric coeff. in T (=0 for linear eos) 
     725   rn_mu2      =  1.1090e-5      !  thermobaric coeff. in S (=0 for linear eos) 
     726   rn_nu       =  2.4341e-3      !  cabbeling coeff in T*S  (=0 for linear eos) 
    650727/ 
    651728!----------------------------------------------------------------------- 
    652729&namtra_adv    !   advection scheme for tracer 
    653730!----------------------------------------------------------------------- 
    654    ln_traadv_cen2   =  .false.  !  2nd order centered scheme 
    655    ln_traadv_tvd    =  .true.   !  TVD scheme 
    656    ln_traadv_muscl  =  .false.  !  MUSCL scheme 
    657    ln_traadv_muscl2 =  .false.  !  MUSCL2 scheme + cen2 at boundaries 
    658    ln_traadv_ubs    =  .false.  !  UBS scheme 
    659    ln_traadv_qck    =  .false.  !  QUICKEST scheme 
    660    ln_traadv_msc_ups=  .false.  !  use upstream scheme within muscl 
     731   ln_traadv_cen2   =  .false.   !  2nd order centered scheme 
     732   ln_traadv_tvd    =  .true.    !  TVD scheme 
     733   ln_traadv_muscl  =  .false.   !  MUSCL scheme 
     734   ln_traadv_muscl2 =  .false.   !  MUSCL2 scheme + cen2 at boundaries 
     735   ln_traadv_ubs    =  .false.   !  UBS scheme 
     736   ln_traadv_qck    =  .false.   !  QUICKEST scheme 
     737   ln_traadv_msc_ups=  .false.   !  use upstream scheme within muscl 
     738   ln_traadv_tvd_zts=  .false.  !  TVD scheme with sub-timestepping of vertical tracer advection 
    661739/ 
    662740!----------------------------------------------------------------------- 
     
    705783!----------------------------------------------------------------------- 
    706784   ln_tradmp   =  .true.   !  add a damping termn (T) or not (F) 
    707    nn_hdmp     =   -1      !  horizontal shape =-1, damping in Med and Red Seas only 
    708                            !                   =XX, damping poleward of XX degrees (XX>0) 
    709                            !                      + F(distance-to-coast) + Red and Med Seas 
    710785   nn_zdmp     =    0      !  vertical   shape =0    damping throughout the water column 
    711786                           !                   =1 no damping in the mixing layer (kz  criteria) 
    712787                           !                   =2 no damping in the mixed  layer (rho crieria) 
    713    rn_surf     =   50.     !  surface time scale of damping   [days] 
    714    rn_bot      =  360.     !  bottom  time scale of damping   [days] 
    715    rn_dep      =  800.     !  depth of transition between rn_surf and rn_bot [meters] 
    716    nn_file     =    0      !  create a damping.coeff NetCDF file (=1) or not (=0) 
     788   cn_resto    = 'resto.nc' ! Name of file containing restoration coefficient field (use dmp_tools to create this) 
    717789/ 
    718790 
     
    733805   ln_dynadv_cen2= .false. !  flux form - 2nd order centered scheme 
    734806   ln_dynadv_ubs = .false. !  flux form - 3rd order UBS      scheme 
     807   ln_dynzad_zts = .false. !  Use (T) sub timestepping for vertical momentum advection 
    735808/ 
    736809!----------------------------------------------------------------------- 
     
    755828   ln_dynvor_mix = .false. !  mixed scheme 
    756829   ln_dynvor_een = .true.  !  energy & enstrophy scheme 
     830   ln_dynvor_een_old = .false.  !  energy & enstrophy scheme - original formulation 
    757831/ 
    758832!----------------------------------------------------------------------- 
     
    762836   ln_hpg_zps  = .true.    !  z-coordinate - partial steps (interpolation) 
    763837   ln_hpg_sco  = .false.   !  s-coordinate (standard jacobian formulation) 
     838   ln_hpg_isf  = .false.   !  s-coordinate (sco ) adapted to isf 
    764839   ln_hpg_djc  = .false.   !  s-coordinate (Density Jacobian with Cubic polynomial) 
    765840   ln_hpg_prj  = .false.   !  s-coordinate (Pressure Jacobian scheme) 
     
    879954&namzdf_gls                !   GLS vertical diffusion                   ("key_zdfgls") 
    880955!----------------------------------------------------------------------- 
    881    rn_emin       = 1.e-6   !  minimum value of e   [m2/s2] 
     956   rn_emin       = 1.e-7   !  minimum value of e   [m2/s2] 
    882957   rn_epsmin     = 1.e-12  !  minimum value of eps [m2/s3] 
    883958   ln_length_lim = .true.  !  limit on the dissipation rate under stable stratification (Galperin et al., 1988) 
    884    rn_clim_galp  = 0.53    !  galperin limit 
    885    ln_crban      = .true.  !  Use Craig & Banner (1994) surface wave mixing parametrisation 
     959   rn_clim_galp  = 0.267   !  galperin limit 
    886960   ln_sigpsi     = .true.  !  Activate or not Burchard 2001 mods on psi schmidt number in the wb case 
    887961   rn_crban      = 100.    !  Craig and Banner 1994 constant for wb tke flux 
    888962   rn_charn      = 70000.  !  Charnock constant for wb induced roughness length 
    889    nn_tkebc_surf =   1     !  surface tke condition (0/1/2=Dir/Neum/Dir Mellor-Blumberg) 
    890    nn_tkebc_bot  =   1     !  bottom tke condition (0/1=Dir/Neum) 
    891    nn_psibc_surf =   1     !  surface psi condition (0/1/2=Dir/Neum/Dir Mellor-Blumberg) 
    892    nn_psibc_bot  =   1     !  bottom psi condition (0/1=Dir/Neum) 
    893    nn_stab_func  =   2     !  stability function (0=Galp, 1= KC94, 2=CanutoA, 3=CanutoB) 
    894    nn_clos       =   1     !  predefined closure type (0=MY82, 1=k-eps, 2=k-w, 3=Gen) 
     963   rn_hsro       =  0.02   !  Minimum surface roughness 
     964   rn_frac_hs    =   1.3   !  Fraction of wave height as roughness (if nn_z0_met=2) 
     965   nn_z0_met     =     2   !  Method for surface roughness computation (0/1/2) 
     966   nn_bc_surf    =     1   !  surface condition (0/1=Dir/Neum) 
     967   nn_bc_bot     =     1   !  bottom condition (0/1=Dir/Neum) 
     968   nn_stab_func  =     2   !  stability function (0=Galp, 1= KC94, 2=CanutoA, 3=CanutoB) 
     969   nn_clos       =     1   !  predefined closure type (0=MY82, 1=k-eps, 2=k-w, 3=Gen) 
    895970/ 
    896971!----------------------------------------------------------------------- 
     
    914989!!                  ***  Miscellaneous namelists  *** 
    915990!!====================================================================== 
     991!!   namsol            elliptic solver / island / free surface 
    916992!!   nammpp            Massively Parallel Processing                    ("key_mpp_mpi) 
    917993!!   namctl            Control prints & Benchmark 
    918 !!   namsol            elliptic solver / island / free surface 
     994!!   namc1d            1D configuration options                         ("key_c1d") 
     995!!   namc1d_uvd        data: U & V currents                             ("key_c1d") 
     996!!   namc1d_dyndmp     U & V newtonian damping                          ("key_c1d") 
    919997!!====================================================================== 
    920998! 
     
    9591037/ 
    9601038!----------------------------------------------------------------------- 
    961 &namc1d        !   1D configuration options                             ("key_c1d") 
    962 !----------------------------------------------------------------------- 
    963    rn_lat      =    50     !  Column latitude 
    964    rn_lon      =    -145   !  Column longitude 
    965 / 
    966 !----------------------------------------------------------------------- 
    9671039&namc1d_uvd    !   data: U & V currents                                 ("key_c1d") 
    9681040!----------------------------------------------------------------------- 
     
    9811053   ln_dyndmp   =  .false.  !  add a damping term (T) or not (F) 
    9821054/ 
     1055 
    9831056!!====================================================================== 
    9841057!!                  ***  Diagnostics namelists  *** 
    9851058!!====================================================================== 
    9861059!!   namnc4       netcdf4 chunking and compression settings             ("key_netcdf4") 
    987 !!   namtrd       dynamics and/or tracer trends                         ("key_trddyn","key_trdtra","key_trdmld") 
     1060!!   namtrd       dynamics and/or tracer trends 
     1061!!   namptr       Poleward Transport Diagnostics 
    9881062!!   namflo       float parameters                                      ("key_float") 
    989 !!   namptr       Poleward Transport Diagnostics 
    9901063!!   namhsb       Heat and salt budgets 
    9911064!!====================================================================== 
     
    10031076/ 
    10041077!----------------------------------------------------------------------- 
    1005 &namtrd        !   diagnostics on dynamics and/or tracer trends         ("key_trddyn" and/or "key_trdtra") 
    1006 !              !       or mixed-layer trends or barotropic vorticity    ("key_trdmld" or     "key_trdvor") 
    1007 !----------------------------------------------------------------------- 
    1008    nn_trd      = 365       !  time step frequency dynamics and tracers trends 
    1009    nn_ctls     =   0       !  control surface type in mixed-layer trends (0,1 or n<jpk) 
    1010    rn_ucf      =   1.      !  unit conversion factor (=1 -> /seconds ; =86400. -> /day) 
    1011    cn_trdrst_in      = "restart_mld"   ! suffix of ocean restart name (input) 
    1012    cn_trdrst_out     = "restart_mld"   ! suffix of ocean restart name (output) 
    1013    ln_trdmld_restart = .false.         !  restart for ML diagnostics 
    1014    ln_trdmld_instant = .false.         !  flag to diagnose trends of instantantaneous or mean ML T/S 
    1015 / 
     1078&namtrd        !   diagnostics on dynamics and/or tracer trends 
     1079!              !       and/or mixed-layer trends and/or barotropic vorticity 
     1080!----------------------------------------------------------------------- 
     1081   ln_glo_trd  = .false.   ! (T) global domain averaged diag for T, T^2, KE, and PE 
     1082   ln_dyn_trd  = .false.   ! (T) 3D momentum trend output 
     1083   ln_dyn_mxl  = .FALSE.   ! (T) 2D momentum trends averaged over the mixed layer (not coded yet) 
     1084   ln_vor_trd  = .FALSE.   ! (T) 2D barotropic vorticity trends (not coded yet) 
     1085   ln_KE_trd   = .false.   ! (T) 3D Kinetic   Energy     trends 
     1086   ln_PE_trd   = .false.   ! (T) 3D Potential Energy     trends 
     1087   ln_tra_trd  = .FALSE.   ! (T) 3D tracer trend output 
     1088   ln_tra_mxl  = .false.   ! (T) 2D tracer trends averaged over the mixed layer (not coded yet) 
     1089   nn_trd      = 365       !  print frequency (ln_glo_trd=T) (unit=time step) 
     1090/ 
     1091!!gm   nn_ctls     =   0       !  control surface type in mixed-layer trends (0,1 or n<jpk) 
     1092!!gm   rn_ucf      =   1.      !  unit conversion factor (=1 -> /seconds ; =86400. -> /day) 
     1093!!gm   cn_trdrst_in      = "restart_mld"   ! suffix of ocean restart name (input) 
     1094!!gm   cn_trdrst_out     = "restart_mld"   ! suffix of ocean restart name (output) 
     1095!!gm   ln_trdmld_restart = .false.         !  restart for ML diagnostics 
     1096!!gm   ln_trdmld_instant = .false.         !  flag to diagnose trends of instantantaneous or mean ML T/S 
     1097!!gm 
    10161098!----------------------------------------------------------------------- 
    10171099&namflo       !   float parameters                                      ("key_float") 
     
    10321114!----------------------------------------------------------------------- 
    10331115   ln_diaptr  = .false.    !  Poleward heat and salt transport (T) or not (F) 
    1034    ln_diaznl  = .true.     !  Add zonal means and meridional stream functions 
    1035    ln_subbas  = .true.     !  Atlantic/Pacific/Indian basins computation (T) or not 
    1036                            !  (orca configuration only, need input basins mask file named "subbasins.nc" 
    1037    ln_ptrcomp = .true.     !  Add decomposition : overturning 
    1038    nn_fptr    =  1         !  Frequency of ptr computation [time step] 
    1039    nn_fwri    =  15        !  Frequency of ptr outputs [time step] 
     1116   ln_subbas  = .false.     !  Atlantic/Pacific/Indian basins computation (T) or not 
    10401117/ 
    10411118!----------------------------------------------------------------------- 
     
    10851162                           !     ln_ssh                  Logical switch for SSH observations 
    10861163 
    1087    ln_sst     = .true.     ! Logical switch for SST observations 
    1088    ln_reysst  = .true.     !     ln_reysst               Logical switch for Reynolds observations 
     1164   ln_sst     = .false.     ! Logical switch for SST observations 
     1165   ln_reysst  = .false.     !     ln_reysst               Logical switch for Reynolds observations 
    10891166   ln_ghrsst  = .false.    !     ln_ghrsst               Logical switch for GHRSST observations       
    10901167 
    10911168   ln_sstfb   = .false.    ! Logical switch for feedback SST data 
    10921169                           !     ln_sss                  Logical switch for SSS observations 
    1093                            !     ln_seaice              Logical switch for Sea Ice observations 
     1170   ln_seaice  = .false.    ! Logical switch for Sea Ice observations 
    10941171                           !     ln_vel3d                Logical switch for velocity observations 
    10951172                           !     ln_velavcur             Logical switch for velocity daily av. cur. 
     
    11121189                           !     sstfiles                GHRSST input observation file name 
    11131190   !                       ! sstfbfiles: Feedback SST input observation file name 
    1114    sstfbfiles = 'sst_01.nc' 'sst_02.nc' 'sst_03.nc' 'sst_04.nc' 'sst_05.nc' 
    1115                            !     seaicefiles             Sea Ice input observation file name 
     1191   sstfbfiles = 'sst_01.nc' 
     1192                           !     seaicefiles             Sea Ice input observation file names 
     1193   seaicefiles = 'seaice_01.nc'   
    11161194                           !     velavcurfiles           Vel. cur. daily av. input file name 
    11171195                           !     velhvcurfiles           Vel. cur. high freq. input file name 
  • branches/2014/dev_r4650_UKMO10_Tidally_Meaned_Diagnostics/NEMOGCM/CONFIG/SHARED/namelist_top_ref

    r4340 r5260  
    7676&namtrc_dmp    !   passive tracer newtonian damping    
    7777!----------------------------------------------------------------------- 
    78    nn_hdmp_tr  =   -1      !  horizontal shape =-1, damping in Med and Red Seas only 
    79                            !                   =XX, damping poleward of XX degrees (XX>0) 
    80                            !                      + F(distance-to-coast) + Red and Med Seas 
    8178   nn_zdmp_tr  =    1      !  vertical   shape =0    damping throughout the water column 
    8279                           !                   =1 no damping in the mixing layer (kz  criteria) 
    8380                           !                   =2 no damping in the mixed  layer (rho crieria) 
    84    rn_surf_tr  =   50.     !  surface time scale of damping   [days] 
    85    rn_bot_tr   =  360.     !  bottom  time scale of damping   [days] 
    86    rn_dep_tr   =  800.     !  depth of transition between rn_surf and rn_bot [meters] 
    87    nn_file_tr  =    0      !  create a damping.coeff NetCDF file (=1) or not (=0) 
     81   cn_resto_tr  = 'resto_tr.nc'    !  create a damping.coeff NetCDF file (=1) or not (=0) 
    8882/ 
    8983!----------------------------------------------------------------------- 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.