New URL for NEMO forge!   http://forge.nemo-ocean.eu

Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
This present forge is now archived and remained online for history.
Changeset 5338 for branches/2014/dev_r4650_UKMO11_restart_functionality/NEMOGCM/CONFIG – NEMO

Ignore:
Timestamp:
2015-06-03T14:36:20+02:00 (9 years ago)
Author:
davestorkey
Message:

Update branch to head of trunk (and correct a change to nn_date0
in namelist_ref that crept in on Monday).

Location:
branches/2014/dev_r4650_UKMO11_restart_functionality/NEMOGCM/CONFIG
Files:
3 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed

  • branches/2014/dev_r4650_UKMO11_restart_functionality/NEMOGCM/CONFIG/SHARED/namelist_ref

    r5317 r5338  
    1010!!              7 - dynamics         (namdyn_adv, namdyn_vor, namdyn_hpg, namdyn_spg, namdyn_ldf) 
    1111!!              8 - Verical physics  (namzdf, namzdf_ric, namzdf_tke, namzdf_kpp, namzdf_ddm, namzdf_tmx) 
    12 !!              9 - diagnostics      (namnc4, namtrd, namspr, namflo, namhsb) 
     12!!              9 - diagnostics      (namnc4, namtrd, namspr, namflo, namhsb, namsto) 
    1313!!             10 - miscellaneous    (namsol, nammpp, namctl) 
    1414!!             11 - Obs & Assim      (namobs, nam_asminc) 
    … …  
    5454!!                      ***  Domain namelists  *** 
    5555!!====================================================================== 
    56 !!   namcfg       parameters of the configuration       
     56!!   namcfg       parameters of the configuration 
    5757!!   namzgr       vertical coordinate 
    5858!!   namzgr_sco   s-coordinate or hybrid z-s-coordinate 
    … …  
    6262! 
    6363!----------------------------------------------------------------------- 
    64 &namcfg     !   parameters of the configuration       
     64&namcfg     !   parameters of the configuration 
    6565!----------------------------------------------------------------------- 
    6666   cp_cfg      =  "default"            !  name of the configuration 
    … …  
    7676   jperio      =       0               !  lateral cond. type (between 0 and 6) 
    7777                                       !  = 0 closed                 ;   = 1 cyclic East-West 
    78                                        !  = 2 equatorial symmetric   ;   = 3 North fold T-point pivot  
     78                                       !  = 2 equatorial symmetric   ;   = 3 North fold T-point pivot 
    7979                                       !  = 4 cyclic East-West AND North fold T-point pivot 
    8080                                       !  = 5 North fold F-point pivot 
    8181                                       !  = 6 cyclic East-West AND North fold F-point pivot 
    82    ln_use_jattr = .false.              !  use (T) the file attribute: open_ocean_jstart, if present  
     82   ln_use_jattr = .false.              !  use (T) the file attribute: open_ocean_jstart, if present 
    8383                                       !  in netcdf input files, as the start j-row for reading 
    8484/ 
    … …  
    105105                        !!!!!!!  SH94 stretching coefficients  (ln_s_sh94 = .true.) 
    106106   rn_theta    =    6.0    !  surface control parameter (0<=theta<=20) 
    107    rn_bb       =    0.8    !  stretching with SH94 s-sigma    
     107   rn_bb       =    0.8    !  stretching with SH94 s-sigma 
    108108                        !!!!!!!  SF12 stretching coefficient  (ln_s_sf12 = .true.) 
    109109   rn_alpha    =    4.4    !  stretching with SF12 s-sigma 
    … …  
    114114   rn_zb_b     =   -0.2    !  offset for calculating Zb 
    115115                        !!!!!!!! Other stretching (not SH94 or SF12) [also uses rn_theta above] 
    116    rn_thetb    =    1.0    !  bottom control parameter  (0<=thetb<= 1)  
     116   rn_thetb    =    1.0    !  bottom control parameter  (0<=thetb<= 1) 
    117117/ 
    118118!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    122122   rn_bathy    =    0.     !  value of the bathymetry. if (=0) bottom flat at jpkm1 
    123123   nn_closea   =    0      !  remove (=0) or keep (=1) closed seas and lakes (ORCA) 
    124    nn_msh      =    0      !  create (=1) a mesh file or not (=0) 
     124   nn_msh      =    1      !  create (=1) a mesh file or not (=0) 
    125125   rn_hmin     =   -3.     !  min depth of the ocean (>0) or min number of ocean level (<0) 
    126126   rn_e3zps_min=   20.     !  partial step thickness is set larger than the minimum of 
    … …  
    168168   nn_baro       =    30               !  Number of iterations of barotropic mode 
    169169                                       !  during rn_rdt seconds. Only used if ln_bt_nn_auto=F 
    170    rn_bt_cmax    =    0.8              !  Maximum courant number allowed if ln_bt_nn_auto=T  
     170   rn_bt_cmax    =    0.8              !  Maximum courant number allowed if ln_bt_nn_auto=T 
    171171   nn_bt_flt     =    1                !  Time filter choice 
    172172                                       !  = 0 None 
    173173                                       !  = 1 Boxcar over   nn_baro barotropic steps 
    174                                        !  = 2 Boxcar over 2*nn_baro     "        "   
     174                                       !  = 2 Boxcar over 2*nn_baro     "        " 
    175175/ 
    176176!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    249249   ln_rnf      = .true.    !  runoffs                                   (T   => fill namsbc_rnf) 
    250250   nn_isf      = 0         !  ice shelf melting/freezing                (/=0 => fill namsbc_isf) 
    251                            !  0 =no isf                  1 = presence of ISF  
    252                            !  2 = bg03 parametrisation   3 = rnf file for isf    
     251                           !  0 =no isf                  1 = presence of ISF 
     252                           !  2 = bg03 parametrisation   3 = rnf file for isf 
    253253                           !  4 = ISF fwf specified 
    254254                           !  option 1 and 4 need ln_isfcav = .true. (domzgr) 
    … …  
    281281&namsbc_flx    !   surface boundary condition : flux formulation 
    282282!----------------------------------------------------------------------- 
    283 !              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask !  
     283!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
    284284!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
    285285   sn_utau     = 'utau'      ,        24         , 'utau'    , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , ''       , '' 
    … …  
    324324   ln_taudif   = .false.   !  HF tau contribution: use "mean of stress module - module of the mean stress" data 
    325325   rn_zqt      = 10.        !  Air temperature and humidity reference height (m) 
    326    rn_zu       = 10.        !  Wind vector reference height (m)                  
     326   rn_zu       = 10.        !  Wind vector reference height (m) 
    327327   rn_pfac     = 1.        !  multiplicative factor for precipitation (total & snow) 
    328328   rn_efac     = 1.        !  multiplicative factor for evaporation (0. or 1.) 
    329    rn_vfac     = 0.        !  multiplicative factor for ocean/ice velocity  
     329   rn_vfac     = 0.        !  multiplicative factor for ocean/ice velocity 
    330330                           !  in the calculation of the wind stress (0.=absolute winds or 1.=relative winds) 
    331331/ 
    … …  
    377377!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
    378378!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
    379    sn_usp      = 'sas_grid_U' ,    120           , 'vozocrtx' ,  .true.    , .true. ,   'yearly'  , ''       , ''             , ''       
     379   sn_usp      = 'sas_grid_U' ,    120           , 'vozocrtx' ,  .true.    , .true. ,   'yearly'  , ''       , ''             , '' 
    380380   sn_vsp      = 'sas_grid_V' ,    120           , 'vomecrty' ,  .true.    , .true. ,   'yearly'  , ''       , ''             , '' 
    381381   sn_tem      = 'sas_grid_T' ,    120           , 'sosstsst' ,  .true.    , .true. ,   'yearly'  , ''       , ''             , '' 
    … …  
    426426/ 
    427427!----------------------------------------------------------------------- 
    428 &namsbc_isf    !  Top boundary layer (ISF)  
     428&namsbc_isf    !  Top boundary layer (ISF) 
    429429!----------------------------------------------------------------------- 
    430430!              ! file name ! frequency (hours) ! variable ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    … …  
    503503                                                      ! Initial mass required for an iceberg of each class 
    504504      rn_initial_mass          = 8.8e7, 4.1e8, 3.3e9, 1.8e10, 3.8e10, 7.5e10, 1.2e11, 2.2e11, 3.9e11, 7.4e11 
    505                                                       ! Proportion of calving mass to apportion to each class   
     505                                                      ! Proportion of calving mass to apportion to each class 
    506506      rn_distribution          = 0.24, 0.12, 0.15, 0.18, 0.12, 0.07, 0.03, 0.03, 0.03, 0.02 
    507507                                                      ! Ratio between effective and real iceberg mass (non-dim) 
    508                                                       ! i.e. number of icebergs represented at a point          
     508                                                      ! i.e. number of icebergs represented at a point 
    509509      rn_mass_scaling          = 2000, 200, 50, 20, 10, 5, 2, 1, 1, 1 
    510510                                                      ! thickness of newly calved bergs (m) 
    … …  
    515515      rn_bits_erosion_fraction = 0.                   ! Fraction of erosion melt flux to divert to bergy bits 
    516516      rn_sicn_shift            = 0.                   ! Shift of sea-ice concn in erosion flux (0<sicn_shift<1) 
    517       ln_passive_mode          = .false.              ! iceberg - ocean decoupling    
     517      ln_passive_mode          = .false.              ! iceberg - ocean decoupling 
    518518      nn_test_icebergs         =  10                  ! Create test icebergs of this class (-1 = no) 
    519519                                                      ! Put a test iceberg at each gridpoint in box (lon1,lon2,lat1,lat2) 
    520520      rn_test_box              = 108.0,  116.0, -66.0, -58.0 
    521       rn_speed_limit           = 0.                   ! CFL speed limit for a berg    
     521      rn_speed_limit           = 0.                   ! CFL speed limit for a berg 
    522522 
    523523!              ! file name ! frequency (hours) !   variable   ! time interp.   !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
    524524!              !           !  (if <0  months)  !     name     !   (logical)    !  (T/F ) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
    525525      sn_icb =  'calving' ,       -1           , 'calvingmask',  .true.        , .true.  , 'yearly'  , ''       , ''       , '' 
    526     
    527       cn_dir = './'  
     526 
     527      cn_dir = './' 
    528528/ 
    529529 
    … …  
    601601                                          !  = 2, use tidal harmonic forcing data from files 
    602602                                          !  = 3, use external data AND tidal harmonic forcing 
    603     cn_dyn3d      =  'none'               !   
     603    cn_dyn3d      =  'none'               ! 
    604604    nn_dyn3d_dta  =  0                    !  = 0, bdy data are equal to the initial state 
    605605                                          !  = 1, bdy data are read in 'bdydata   .nc' files 
    606     cn_tra        =  'none'               !  
     606    cn_tra        =  'none'               ! 
    607607    nn_tra_dta    =  0                    !  = 0, bdy data are equal to the initial state 
    608608                                          !  = 1, bdy data are read in 'bdydata   .nc' files 
    609     cn_ice_lim      =  'none'             !   
     609    cn_ice_lim      =  'none'             ! 
    610610    nn_ice_lim_dta  =  0                  !  = 0, bdy data are equal to the initial state 
    611611                                          !  = 1, bdy data are read in 'bdydata   .nc' files 
    … …  
    616616    ln_tra_dmp    =.false.                !  open boudaries conditions for tracers 
    617617    ln_dyn3d_dmp  =.false.                !  open boundary condition for baroclinic velocities 
    618     rn_time_dmp   =  1.                   ! Damping time scale in days  
     618    rn_time_dmp   =  1.                   ! Damping time scale in days 
    619619    rn_time_dmp_out =  1.                 ! Outflow damping time scale 
    620620    nn_rimwidth   = 10                    !  width of the relaxation zone 
    … …  
    669669   rn_bfri2_max =   1.e-1  !  max. bottom drag coefficient (non linear case and ln_loglayer=T) 
    670670   rn_bfeb2    =    2.5e-3 !  bottom turbulent kinetic energy background  (m2/s2) 
    671    rn_bfrz0    =    3.e-3  !  bottom roughness [m] if ln_loglayer=T  
     671   rn_bfrz0    =    3.e-3  !  bottom roughness [m] if ln_loglayer=T 
    672672   ln_bfr2d    = .false.   !  horizontal variation of the bottom friction coef (read a 2D mask file ) 
    673673   rn_bfrien   =    50.    !  local multiplying factor of bfr (ln_bfr2d=T) 
    … …  
    715715!----------------------------------------------------------------------- 
    716716   nn_eos      =  -1     !  type of equation of state and Brunt-Vaisala frequency 
    717                                  !  =-1, TEOS-10  
    718                                  !  = 0, EOS-80  
     717                                 !  =-1, TEOS-10 
     718                                 !  = 0, EOS-80 
    719719                                 !  = 1, S-EOS   (simplified eos) 
    720720   ln_useCT    = .true.  ! use of Conservative Temp. ==> surface CT converted in Pot. Temp. in sbcssm 
    … …  
    807807!----------------------------------------------------------------------- 
    808808   ln_dynadv_vec = .true.  !  vector form (T) or flux form (F) 
     809   nn_dynkeg     = 0       ! scheme for grad(KE): =0   C2  ;  =1   Hollingsworth correction 
    809810   ln_dynadv_cen2= .false. !  flux form - 2nd order centered scheme 
    810811   ln_dynadv_ubs = .false. !  flux form - 3rd order UBS      scheme 
    … …  
    814815&nam_vvl    !   vertical coordinate options 
    815816!----------------------------------------------------------------------- 
    816    ln_vvl_zstar  = .true.           !  zstar vertical coordinate                    
     817   ln_vvl_zstar  = .true.           !  zstar vertical coordinate 
    817818   ln_vvl_ztilde = .false.          !  ztilde vertical coordinate: only high frequency variations 
    818819   ln_vvl_layer  = .false.          !  full layer vertical coordinate 
    … …  
    9991000!!   namc1d_uvd        data: U & V currents                             ("key_c1d") 
    10001001!!   namc1d_dyndmp     U & V newtonian damping                          ("key_c1d") 
     1002!!   namsto            Stochastic parametrization of EOS 
    10011003!!====================================================================== 
    10021004! 
    … …  
    10571059   ln_dyndmp   =  .false.  !  add a damping term (T) or not (F) 
    10581060/ 
     1061!----------------------------------------------------------------------- 
     1062&namsto       ! Stochastic parametrization of EOS 
     1063!----------------------------------------------------------------------- 
     1064   ln_rststo = .false.           ! start from mean parameter (F) or from restart file (T) 
     1065   ln_rstseed = .true.           ! read seed of RNG from restart file 
     1066   cn_storst_in  = "restart_sto" !  suffix of stochastic parameter restart file (input) 
     1067   cn_storst_out = "restart_sto" !  suffix of stochastic parameter restart file (output) 
     1068 
     1069   ln_sto_eos = .false.          ! stochastic equation of state 
     1070   nn_sto_eos = 1                ! number of independent random walks 
     1071   rn_eos_stdxy = 1.4            ! random walk horz. standard deviation (in grid points) 
     1072   rn_eos_stdz  = 0.7            ! random walk vert. standard deviation (in grid points) 
     1073   rn_eos_tcor  = 1440.0         ! random walk time correlation (in timesteps) 
     1074   nn_eos_ord  = 1               ! order of autoregressive processes 
     1075   nn_eos_flt  = 0               ! passes of Laplacian filter 
     1076   rn_eos_lim  = 2.0             ! limitation factor (default = 3.0) 
     1077/ 
    10591078 
    10601079!!====================================================================== 
    … …  
    11681187   ln_sst     = .false.     ! Logical switch for SST observations 
    11691188   ln_reysst  = .false.     !     ln_reysst               Logical switch for Reynolds observations 
    1170    ln_ghrsst  = .false.    !     ln_ghrsst               Logical switch for GHRSST observations       
     1189   ln_ghrsst  = .false.    !     ln_ghrsst               Logical switch for GHRSST observations 
    11711190 
    11721191   ln_sstfb   = .false.    ! Logical switch for feedback SST data 
    … …  
    11951214   sstfbfiles = 'sst_01.nc' 
    11961215                           !     seaicefiles             Sea Ice input observation file names 
    1197    seaicefiles = 'seaice_01.nc'   
     1216   seaicefiles = 'seaice_01.nc' 
    11981217                           !     velavcurfiles           Vel. cur. daily av. input file name 
    11991218                           !     velhvcurfiles           Vel. cur. high freq. input file name 

  • branches/2014/dev_r4650_UKMO11_restart_functionality/NEMOGCM/CONFIG/cfg.txt

    r5313 r5338  
    88ORCA2_LIM_PISCES OPA_SRC LIM_SRC_2 NST_SRC TOP_SRC 
    99ORCA2_OFF_PISCES OPA_SRC OFF_SRC TOP_SRC 
    10 ISOMIP OPA_SRC 
    1110GYRE OPA_SRC 
    1211ORCA2_LIM3 OPA_SRC LIM_SRC_3 NST_SRC 

  • branches/2014/dev_r4650_UKMO11_restart_functionality/NEMOGCM/CONFIG/uspcfg.txt

    r5312 r5338  
    11ORCA1_CICE # ORCA2_LIM # OPA_SRC TOP_SRC  # http://gws-access.ceda.ac.uk/public/nemo/uspconfigs/ORCA1_CICE/v3.6.0/ORCA1_CICE_ctl.txt 
     2ISOMIP     # GYRE      # OPA_SRC          # http://gws-access.ceda.ac.uk/public/nemo/uspconfigs/ISOMIP/v3.6.0/ISOMIP_ctl.txt 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.