New URL for NEMO forge!   http://forge.nemo-ocean.eu

Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
This present forge is now archived and remained online for history.
Changeset 5890 for branches/2015/nemo_v3_6_STABLE/DOC/TexFiles – NEMO

Ignore:
Timestamp:
2015-11-16T13:54:03+01:00 (8 years ago)
Author:
gm
Message:

#1629 - v3.6 stable DOC : update DOC/Namelist + addition of a script (see wiki page)

Location:
branches/2015/nemo_v3_6_STABLE/DOC/TexFiles
Files:
12 added
8 deleted
31 edited
1 moved

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • branches/2015/nemo_v3_6_STABLE/DOC/TexFiles/Biblio/Biblio.bib

    r5120 r5890  
    276276  author = {A. Beckmann and H. Goosse}, 
    277277  title = {A parameterization of ice shelf-ocean interaction for climate models}, 
    278   journal = OM 
    279   year = {2003} 
    280   volume = {5} 
     278  journal = OM, 
     279  year = {2003}, 
     280  volume = {5}, 
    281281  pages = {157--170} 
    282282} 
  • branches/2015/nemo_v3_6_STABLE/DOC/TexFiles/Chapters/Chap_TRA.tex

    r5102 r5890  
    859859\label{TRA_bbc} 
    860860%--------------------------------------------nambbc-------------------------------------------------------- 
    861 \namdisplay{namtra_bbc} 
     861\namdisplay{nambbc} 
    862862%-------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 
    863863%>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
  • branches/2015/nemo_v3_6_STABLE/DOC/TexFiles/Namelist/nam_tide

    r4147 r5890  
    33!----------------------------------------------------------------------- 
    44   ln_tide_pot   = .true.   !  use tidal potential forcing 
    5    clname(1)     =   'M2'   !  name of constituent 
    6    clname(2)     =   'S2' 
    7    clname(3)     =   'N2' 
    8    clname(4)     =   'K1' 
    9    clname(5)     =   'O1' 
    10    clname(6)     =   'Q1' 
    11    clname(7)     =   'M4' 
    12    clname(8)     =   'K2' 
    13    clname(9)     =   'P1' 
    14    clname(10)    =   'Mf' 
    15    clname(11)    =   'Mm' 
     5   ln_tide_ramp  = .false.  ! 
     6   rdttideramp   =    0.    ! 
     7   clname(1)     = 'DUMMY'  !  name of constituent - all tidal components must be set in namelist_cfg 
    168/ 
  • branches/2015/nemo_v3_6_STABLE/DOC/TexFiles/Namelist/nambdy

    r4147 r5890  
    22&nambdy        !  unstructured open boundaries                          ("key_bdy") 
    33!----------------------------------------------------------------------- 
    4     nb_bdy = 1                            !  number of open boundary sets 
     4    nb_bdy         = 0                    !  number of open boundary sets 
    55    ln_coords_file = .true.               !  =T : read bdy coordinates from file 
    66    cn_coords_file = 'coordinates.bdy.nc' !  bdy coordinates files 
    7     ln_mask_file = .false.                !  =T : read mask from file 
    8     cn_mask_file = ''                     !  name of mask file (if ln_mask_file=.TRUE.) 
    9     nn_dyn2d      =  2                    !  boundary conditions for barotropic fields 
    10     nn_dyn2d_dta  =  3                    !  = 0, bdy data are equal to the initial state 
     7    ln_mask_file   = .false.              !  =T : read mask from file 
     8    cn_mask_file   = ''                   !  name of mask file (if ln_mask_file=.TRUE.) 
     9    cn_dyn2d       = 'none'               ! 
     10    nn_dyn2d_dta   =  0                   !  = 0, bdy data are equal to the initial state 
    1111                                          !  = 1, bdy data are read in 'bdydata   .nc' files 
    1212                                          !  = 2, use tidal harmonic forcing data from files 
    1313                                          !  = 3, use external data AND tidal harmonic forcing 
    14     nn_dyn3d      =  0                    !  boundary conditions for baroclinic velocities 
     14    cn_dyn3d      =  'none'               ! 
    1515    nn_dyn3d_dta  =  0                    !  = 0, bdy data are equal to the initial state 
    16                            !  = 1, bdy data are read in 'bdydata   .nc' files 
    17     nn_tra        =  1                    !  boundary conditions for T and S 
    18     nn_tra_dta    =  1                    !  = 0, bdy data are equal to the initial state 
    19                            !  = 1, bdy data are read in 'bdydata   .nc' files 
    20     nn_rimwidth  = 10                      !  width of the relaxation zone 
    21     ln_vol     = .false.                  !  total volume correction (see nn_volctl parameter) 
    22     nn_volctl  = 1                        !  = 0, the total water flux across open boundaries is zero 
     16                                          !  = 1, bdy data are read in 'bdydata   .nc' files 
     17    cn_tra        =  'none'               ! 
     18    nn_tra_dta    =  0                    !  = 0, bdy data are equal to the initial state 
     19                                          !  = 1, bdy data are read in 'bdydata   .nc' files 
     20    cn_ice_lim      =  'none'             ! 
     21    nn_ice_lim_dta  =  0                  !  = 0, bdy data are equal to the initial state 
     22                                          !  = 1, bdy data are read in 'bdydata   .nc' files 
     23    rn_ice_tem      = 270.                !  lim3 only: arbitrary temperature of incoming sea ice 
     24    rn_ice_sal      = 10.                 !  lim3 only:      --   salinity           -- 
     25    rn_ice_age      = 30.                 !  lim3 only:      --   age                -- 
     26 
     27    ln_tra_dmp    =.false.                !  open boudaries conditions for tracers 
     28    ln_dyn3d_dmp  =.false.                !  open boundary condition for baroclinic velocities 
     29    rn_time_dmp   =  1.                   ! Damping time scale in days 
     30    rn_time_dmp_out =  1.                 ! Outflow damping time scale 
     31    nn_rimwidth   = 10                    !  width of the relaxation zone 
     32    ln_vol        = .false.               !  total volume correction (see nn_volctl parameter) 
     33    nn_volctl     = 1                     !  = 0, the total water flux across open boundaries is zero 
    2334/ 
  • branches/2015/nemo_v3_6_STABLE/DOC/TexFiles/Namelist/nambdy_dta

    r4230 r5890  
    22&nambdy_dta      !  open boundaries - external data           ("key_bdy") 
    33!----------------------------------------------------------------------- 
    4 !              !   file name    ! frequency (hours) !  variable  ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
    5 !              !                !  (if <0  months)  !    name    !    (logical)   !  (T/F)  ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
    6    bn_ssh =     'amm12_bdyT_u2d' ,         24        , 'sossheig' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''    , '' 
    7    bn_u2d =     'amm12_bdyU_u2d' ,         24        , 'vobtcrtx' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''    , '' 
    8    bn_v2d =     'amm12_bdyV_u2d' ,         24        , 'vobtcrty' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''    , '' 
    9    bn_u3d  =    'amm12_bdyU_u3d' ,         24        , 'vozocrtx' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''    , '' 
    10    bn_v3d  =    'amm12_bdyV_u3d' ,         24        , 'vomecrty' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''    , '' 
    11    bn_tem  =    'amm12_bdyT_tra' ,         24        , 'votemper' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''    , '' 
    12    bn_sal  =    'amm12_bdyT_tra' ,         24        , 'vosaline' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''    , '' 
     4!              !  file name      ! frequency (hours) ! variable   ! time interp.   !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
     5!              !                 !  (if <0  months)  !   name     !   (logical)    !  (T/F ) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
     6   bn_ssh =     'amm12_bdyT_u2d' ,         24        , 'sossheig' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
     7   bn_u2d =     'amm12_bdyU_u2d' ,         24        , 'vobtcrtx' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
     8   bn_v2d =     'amm12_bdyV_u2d' ,         24        , 'vobtcrty' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
     9   bn_u3d  =    'amm12_bdyU_u3d' ,         24        , 'vozocrtx' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
     10   bn_v3d  =    'amm12_bdyV_u3d' ,         24        , 'vomecrty' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
     11   bn_tem  =    'amm12_bdyT_tra' ,         24        , 'votemper' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
     12   bn_sal  =    'amm12_bdyT_tra' ,         24        , 'vosaline' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
     13! for lim2 
     14!   bn_frld  =    'amm12_bdyT_ice' ,         24        , 'ileadfra' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
     15!   bn_hicif =    'amm12_bdyT_ice' ,         24        , 'iicethic' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
     16!   bn_hsnif =    'amm12_bdyT_ice' ,         24        , 'isnowthi' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
     17! for lim3 
     18!   bn_a_i  =    'amm12_bdyT_ice' ,         24        , 'ileadfra' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
     19!   bn_ht_i =    'amm12_bdyT_ice' ,         24        , 'iicethic' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
     20!   bn_ht_s =    'amm12_bdyT_ice' ,         24        , 'isnowthi' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
    1321   cn_dir  =    'bdydta/' 
    1422   ln_full_vel = .false. 
  • branches/2015/nemo_v3_6_STABLE/DOC/TexFiles/Namelist/namberg

    r4230 r5890  
    99                                                      ! Initial mass required for an iceberg of each class 
    1010      rn_initial_mass          = 8.8e7, 4.1e8, 3.3e9, 1.8e10, 3.8e10, 7.5e10, 1.2e11, 2.2e11, 3.9e11, 7.4e11 
    11                                                       ! Proportion of calving mass to apportion to each class   
     11                                                      ! Proportion of calving mass to apportion to each class 
    1212      rn_distribution          = 0.24, 0.12, 0.15, 0.18, 0.12, 0.07, 0.03, 0.03, 0.03, 0.02 
    1313                                                      ! Ratio between effective and real iceberg mass (non-dim) 
    14                                                       ! i.e. number of icebergs represented at a point          
     14                                                      ! i.e. number of icebergs represented at a point 
    1515      rn_mass_scaling          = 2000, 200, 50, 20, 10, 5, 2, 1, 1, 1 
    1616                                                      ! thickness of newly calved bergs (m) 
     
    2121      rn_bits_erosion_fraction = 0.                   ! Fraction of erosion melt flux to divert to bergy bits 
    2222      rn_sicn_shift            = 0.                   ! Shift of sea-ice concn in erosion flux (0<sicn_shift<1) 
    23       ln_passive_mode          = .false.              ! iceberg - ocean decoupling    
     23      ln_passive_mode          = .false.              ! iceberg - ocean decoupling 
    2424      nn_test_icebergs         =  10                  ! Create test icebergs of this class (-1 = no) 
    2525                                                      ! Put a test iceberg at each gridpoint in box (lon1,lon2,lat1,lat2) 
    2626      rn_test_box              = 108.0,  116.0, -66.0, -58.0 
    27       rn_speed_limit           = 0.                   ! CFL speed limit for a berg    
     27      rn_speed_limit           = 0.                   ! CFL speed limit for a berg 
    2828 
    29                ! filename ! freq (hours) ! variable ! time interp. ! clim  !'yearly' or ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
    30                !          ! (<0  months) !   name   !  (logical)   ! (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
    31       sn_icb =  'calving' ,     -1       , 'calvingmask',  .true.      , .true., 'yearly'   , ' '      , ' '  , '' 
    32     
    33       cn_dir = './'  
     29!              ! file name ! frequency (hours) !   variable   ! time interp.   !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
     30!              !           !  (if <0  months)  !     name     !   (logical)    !  (T/F ) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
     31      sn_icb =  'calving' ,       -1           , 'calvingmask',  .true.        , .true.  , 'yearly'  , ''       , ''       , '' 
     32 
     33      cn_dir = './' 
    3434/ 
  • branches/2015/nemo_v3_6_STABLE/DOC/TexFiles/Namelist/namdom

    r4560 r5890  
    33!----------------------------------------------------------------------- 
    44   nn_bathy    =    1      !  compute (=0) or read (=1) the bathymetry file 
    5    nn_closea    =   0      !  remove (=0) or keep (=1) closed seas and lakes (ORCA) 
    6    nn_msh      =    0      !  create (=1) a mesh file or not (=0) 
     5   rn_bathy    =    0.     !  value of the bathymetry. if (=0) bottom flat at jpkm1 
     6   nn_closea   =    0      !  remove (=0) or keep (=1) closed seas and lakes (ORCA) 
     7   nn_msh      =    1      !  create (=1) a mesh file or not (=0) 
    78   rn_hmin     =   -3.     !  min depth of the ocean (>0) or min number of ocean level (<0) 
    89   rn_e3zps_min=   20.     !  partial step thickness is set larger than the minimum of 
     
    1617   rn_rdtmax   = 28800.          !  maximum time step on tracers (used if nn_acc=1) 
    1718   rn_rdth     =  800.           !  depth variation of tracer time step  (used if nn_acc=1) 
     19   ln_crs      = .false.      !  Logical switch for coarsening module 
    1820   jphgr_msh   =       0               !  type of horizontal mesh 
    1921                                       !  = 0 curvilinear coordinate on the sphere read in coordinate.nc 
  • branches/2015/nemo_v3_6_STABLE/DOC/TexFiles/Namelist/namdyn_adv

    r3294 r5890  
    22&namdyn_adv    !   formulation of the momentum advection 
    33!----------------------------------------------------------------------- 
    4    ln_dynadv_vec = .true.  !  vector form (T) or flux form (F)   
     4   ln_dynadv_vec = .true.  !  vector form (T) or flux form (F) 
     5   nn_dynkeg     = 0       ! scheme for grad(KE): =0   C2  ;  =1   Hollingsworth correction 
    56   ln_dynadv_cen2= .false. !  flux form - 2nd order centered scheme 
    6    ln_dynadv_ubs = .false. !  flux form - 3rd order UBS      scheme  
    7  
     7   ln_dynadv_ubs = .false. !  flux form - 3rd order UBS      scheme 
     8   ln_dynzad_zts = .false. !  Use (T) sub timestepping for vertical momentum advection 
     9/ 
  • branches/2015/nemo_v3_6_STABLE/DOC/TexFiles/Namelist/namdyn_hpg

    r5120 r5890  
    55   ln_hpg_zps  = .true.    !  z-coordinate - partial steps (interpolation) 
    66   ln_hpg_sco  = .false.   !  s-coordinate (standard jacobian formulation) 
    7    ln_hpg_isf  = .false.   !  s-coordinate (sco ) adapted to ice shelf cavity 
     7   ln_hpg_isf  = .false.   !  s-coordinate (sco ) adapted to isf 
    88   ln_hpg_djc  = .false.   !  s-coordinate (Density Jacobian with Cubic polynomial) 
    99   ln_hpg_prj  = .false.   !  s-coordinate (Pressure Jacobian scheme) 
  • branches/2015/nemo_v3_6_STABLE/DOC/TexFiles/Namelist/namdyn_vor

    r4147 r5890  
    66   ln_dynvor_mix = .false. !  mixed scheme 
    77   ln_dynvor_een = .true.  !  energy & enstrophy scheme 
     8   ln_dynvor_een_old = .false.  !  energy & enstrophy scheme - original formulation 
    89/ 
  • branches/2015/nemo_v3_6_STABLE/DOC/TexFiles/Namelist/nameos

    r3294 r5890  
    22&nameos        !   ocean physical parameters 
    33!----------------------------------------------------------------------- 
    4    nn_eos      =   0       !  type of equation of state and Brunt-Vaisala frequency 
    5                            !     = 0, UNESCO (formulation of Jackett and McDougall (1994) and of McDougall (1987) ) 
    6                            !     = 1, linear: rho(T)   = rau0 * ( 1.028 - ralpha * T ) 
    7                            !     = 2, linear: rho(T,S) = rau0 * ( rbeta * S - ralpha * T ) 
    8    rn_alpha    =   2.0e-4  !  thermal expension coefficient (nn_eos= 1 or 2) 
    9    rn_beta     =   7.7e-4  !  saline  expension coefficient (nn_eos= 2) 
     4   nn_eos      =  -1     !  type of equation of state and Brunt-Vaisala frequency 
     5                                 !  =-1, TEOS-10 
     6                                 !  = 0, EOS-80 
     7                                 !  = 1, S-EOS   (simplified eos) 
     8   ln_useCT    = .true.  ! use of Conservative Temp. ==> surface CT converted in Pot. Temp. in sbcssm 
     9   !                             ! 
     10   !                     ! S-EOS coefficients : 
     11   !                             !  rd(T,S,Z)*rau0 = -a0*(1+.5*lambda*dT+mu*Z+nu*dS)*dT+b0*dS 
     12   rn_a0       =  1.6550e-1      !  thermal expension coefficient (nn_eos= 1) 
     13   rn_b0       =  7.6554e-1      !  saline  expension coefficient (nn_eos= 1) 
     14   rn_lambda1  =  5.9520e-2      !  cabbeling coeff in T^2  (=0 for linear eos) 
     15   rn_lambda2  =  7.4914e-4      !  cabbeling coeff in S^2  (=0 for linear eos) 
     16   rn_mu1      =  1.4970e-4      !  thermobaric coeff. in T (=0 for linear eos) 
     17   rn_mu2      =  1.1090e-5      !  thermobaric coeff. in S (=0 for linear eos) 
     18   rn_nu       =  2.4341e-3      !  cabbeling coeff in T*S  (=0 for linear eos) 
    1019/ 
  • branches/2015/nemo_v3_6_STABLE/DOC/TexFiles/Namelist/namhsb

    r2540 r5890  
    11!----------------------------------------------------------------------- 
    2 &namhsb       !  Heat and salt budgets  
     2&namhsb       !  Heat and salt budgets 
    33!----------------------------------------------------------------------- 
    44   ln_diahsb  = .false.    !  check the heat and salt budgets (T) or not (F) 
  • branches/2015/nemo_v3_6_STABLE/DOC/TexFiles/Namelist/namobs

    r4147 r5890  
    55   ln_s3d     = .false.    ! Logical switch for S profile observations 
    66   ln_ena     = .false.    ! Logical switch for ENACT insitu data set 
    7    !                       !     ln_cor                  Logical switch for Coriolis insitu data set 
     7   ln_cor     = .false.    ! Logical switch for Coriolis insitu data set 
    88   ln_profb   = .false.    ! Logical switch for feedback insitu data set 
    99   ln_sla     = .false.    ! Logical switch for SLA observations 
    10  
    1110   ln_sladt   = .false.    ! Logical switch for AVISO SLA data 
    12  
    1311   ln_slafb   = .false.    ! Logical switch for feedback SLA data 
    14                            !     ln_ssh                  Logical switch for SSH observations 
    15  
    16    ln_sst     = .true.     ! Logical switch for SST observations 
    17    ln_reysst  = .true.     !     ln_reysst               Logical switch for Reynolds observations 
    18    ln_ghrsst  = .false.    !     ln_ghrsst               Logical switch for GHRSST observations       
    19  
     12   ln_ssh     = .false.    ! Logical switch for SSH observations 
     13   ln_sst     = .false.    ! Logical switch for SST observations 
     14   ln_reysst  = .false.    ! Logical switch for Reynolds observations 
     15   ln_ghrsst  = .false.    ! Logical switch for GHRSST observations 
    2016   ln_sstfb   = .false.    ! Logical switch for feedback SST data 
    21                            !     ln_sss                  Logical switch for SSS observations 
    22                            !     ln_seaice               Logical switch for Sea Ice observations 
    23                            !     ln_vel3d                Logical switch for velocity observations 
    24                            !     ln_velavcur             Logical switch for velocity daily av. cur. 
    25                            !     ln_velhrcur             Logical switch for velocity high freq. cur. 
    26                            !     ln_velavadcp            Logical switch for velocity daily av. ADCP 
    27                            !     ln_velhradcp            Logical switch for velocity high freq. ADCP 
    28                            !     ln_velfb                Logical switch for feedback velocity data 
    29                            !     ln_grid_global          Global distribtion of observations 
    30                            !     ln_grid_search_lookup   Logical switch for obs grid search w/lookup table 
    31                            !     grid_search_file        Grid search lookup file header 
    32                            !     enactfiles              ENACT input observation file names 
    33                            !     coriofiles              Coriolis input observation file name 
    34    !                       ! profbfiles: Profile feedback input observation file name 
    35    profbfiles = 'profiles_01.nc' 
    36                            !     ln_profb_enatim         Enact feedback input time setting switch 
    37                            !     slafilesact             Active SLA input observation file name 
    38                            !     slafilespas             Passive SLA input observation file name 
    39    !                       ! slafbfiles: Feedback SLA input observation file name 
    40    slafbfiles = 'sla_01.nc' 
    41                            !     sstfiles                GHRSST input observation file name 
    42    !                       ! sstfbfiles: Feedback SST input observation file name 
    43    sstfbfiles = 'sst_01.nc' 'sst_02.nc' 'sst_03.nc' 'sst_04.nc' 'sst_05.nc' 
    44                            !     seaicefiles             Sea Ice input observation file name 
    45                            !     velavcurfiles           Vel. cur. daily av. input file name 
    46                            !     velhvcurfiles           Vel. cur. high freq. input file name 
    47                            !     velavadcpfiles          Vel. ADCP daily av. input file name 
    48                            !     velhvadcpfiles          Vel. ADCP high freq. input file name 
    49                            !     velfbfiles              Vel. feedback input observation file name 
    50                            !     dobsini                 Initial date in window YYYYMMDD.HHMMSS 
    51                            !     dobsend                 Final date in window YYYYMMDD.HHMMSS 
    52                            !     n1dint                  Type of vertical interpolation method 
    53                            !     n2dint                  Type of horizontal interpolation method 
    54                            !     ln_nea                  Rejection of observations near land switch 
    55    nmsshc     = 0          ! MSSH correction scheme 
    56                            !     mdtcorr                 MDT  correction 
    57                            !     mdtcutoff               MDT cutoff for computed correction 
     17   ln_sss     = .false.    ! Logical switch for SSS observations 
     18   ln_seaice  = .false.    ! Logical switch for Sea Ice observations 
     19   ln_vel3d   = .false.    ! Logical switch for velocity observations 
     20   ln_velavcur= .false     ! Logical switch for velocity daily av. cur. 
     21   ln_velhrcur= .false     ! Logical switch for velocity high freq. cur. 
     22   ln_velavadcp = .false.  ! Logical switch for velocity daily av. ADCP 
     23   ln_velhradcp = .false.  ! Logical switch for velocity high freq. ADCP 
     24   ln_velfb   = .false.    ! Logical switch for feedback velocity data 
     25   ln_grid_global = .false. ! Global distribtion of observations 
     26   ln_grid_search_lookup = .false. !  Logical switch for obs grid search w/lookup table 
     27   grid_search_file = 'grid_search'  !  Grid search lookup file header 
     28! All of the *files* variables below are arrays. Use namelist_cfg to add more files 
     29   enactfiles = 'enact.nc' !  ENACT input observation file names (specify full array in namelist_cfg) 
     30   coriofiles = 'corio.nc' !  Coriolis input observation file name 
     31   profbfiles = 'profiles_01.nc' ! Profile feedback input observation file name 
     32   ln_profb_enatim = .false !        Enact feedback input time setting switch 
     33   slafilesact = 'sla_act.nc' !  Active SLA input observation file names 
     34   slafilespas = 'sla_pass.nc' ! Passive SLA input observation file names 
     35   slafbfiles = 'sla_01.nc' ! slafbfiles: Feedback SLA input observation file names 
     36   sstfiles = 'ghrsst.nc'   ! GHRSST input observation file names 
     37   sstfbfiles = 'sst_01.nc' ! Feedback SST input observation file names 
     38   seaicefiles = 'seaice_01.nc' ! Sea Ice input observation file names 
     39   velavcurfiles = 'velavcurfile.nc'  ! Vel. cur. daily av. input file name 
     40   velhrcurfiles = 'velhrcurfile.nc'  ! Vel. cur. high freq. input file name 
     41   velavadcpfiles = 'velavadcpfile.nc' ! Vel. ADCP daily av. input file name 
     42   velhradcpfiles = 'velhradcpfile.nc' ! Vel. ADCP high freq. input file name 
     43   velfbfiles = 'velfbfile.nc' ! Vel. feedback input observation file name 
     44   dobsini = 20000101.000000  !  Initial date in window YYYYMMDD.HHMMSS 
     45   dobsend = 20010101.000000  !  Final date in window YYYYMMDD.HHMMSS 
     46   n1dint = 0  !               Type of vertical interpolation method 
     47   n2dint = 0  !               Type of horizontal interpolation method 
     48   ln_nea = .false.   !        Rejection of observations near land switch 
     49   nmsshc     = 0     !        MSSH correction scheme 
     50   mdtcorr = 1.61     !        MDT  correction 
     51   mdtcutoff = 65.0   !        MDT cutoff for computed correction 
    5852   ln_altbias = .false.    ! Logical switch for alt bias 
    5953   ln_ignmis  = .true.     ! Logical switch for ignoring missing files 
    60                            !     endailyavtypes   ENACT daily average types 
     54   endailyavtypes = 820    ! ENACT daily average types - array (use namelist_cfg to set more values) 
    6155   ln_grid_global = .true. 
    6256   ln_grid_search_lookup = .false. 
  • branches/2015/nemo_v3_6_STABLE/DOC/TexFiles/Namelist/namptr

    r4147 r5890  
    33!----------------------------------------------------------------------- 
    44   ln_diaptr  = .false.    !  Poleward heat and salt transport (T) or not (F) 
    5    ln_diaznl  = .true.     !  Add zonal means and meridional stream functions 
    6    ln_subbas  = .true.     !  Atlantic/Pacific/Indian basins computation (T) or not 
    7                            !  (orca configuration only, need input basins mask file named "subbasins.nc" 
    8    ln_ptrcomp = .true.     !  Add decomposition : overturning 
    9    nn_fptr    =  1         !  Frequency of ptr computation [time step] 
    10    nn_fwri    =  15        !  Frequency of ptr outputs [time step] 
     5   ln_subbas  = .false.     !  Atlantic/Pacific/Indian basins computation (T) or not 
    116/ 
  • branches/2015/nemo_v3_6_STABLE/DOC/TexFiles/Namelist/namrun

    r4147 r5890  
    99   nn_leapy    =       0   !  Leap year calendar (1) or not (0) 
    1010   ln_rstart   = .false.   !  start from rest (F) or from a restart file (T) 
    11    nn_rstctl   =       0   !  restart control => activated only if ln_rstart = T 
     11   nn_euler    =       1   !  = 0 : start with forward time step if ln_rstart=T 
     12   nn_rstctl   =       0   !  restart control ==> activated only if ln_rstart=T 
    1213                           !    = 0 nn_date0 read in namelist ; nn_it000 : read in namelist 
    1314                           !    = 1 nn_date0 read in namelist ; nn_it000 : check consistancy between namelist and restart 
    1415                           !    = 2 nn_date0 read in restart  ; nn_it000 : check consistancy between namelist and restart 
    1516   cn_ocerst_in  = "restart"   !  suffix of ocean restart name (input) 
     17   cn_ocerst_indir = "."       !  directory from which to read input ocean restarts 
    1618   cn_ocerst_out = "restart"   !  suffix of ocean restart name (output) 
     19   cn_ocerst_outdir = "."      !  directory in which to write output ocean restarts 
    1720   nn_istate   =       0   !  output the initial state (1) or not (0) 
     21   ln_rst_list = .false.   !  output restarts at list of times using nn_stocklist (T) or at set frequency with nn_stock (F) 
    1822   nn_stock    =    5475   !  frequency of creation of a restart file (modulo referenced to 1) 
     23   nn_stocklist = 0,0,0,0,0,0,0,0,0,0 ! List of timesteps when a restart file is to be written 
    1924   nn_write    =    5475   !  frequency of write in the output file   (modulo referenced to nn_it000) 
    2025   ln_dimgnnn  = .false.   !  DIMG file format: 1 file for all processors (F) or by processor (T) 
    2126   ln_mskland  = .false.   !  mask land points in NetCDF outputs (costly: + ~15%) 
     27   ln_cfmeta   = .false.   !  output additional data to netCDF files required for compliance with the CF metadata standard 
    2228   ln_clobber  = .false.   !  clobber (overwrite) an existing file 
    2329   nn_chunksz  =       0   !  chunksize (bytes) for NetCDF file (works only with iom_nf90 routines) 
  • branches/2015/nemo_v3_6_STABLE/DOC/TexFiles/Namelist/namsbc

    r5120 r5890  
    99   ln_blk_core = .true.    !  CORE bulk formulation                     (T => fill namsbc_core) 
    1010   ln_blk_mfs  = .false.   !  MFS bulk formulation                      (T => fill namsbc_mfs ) 
    11    ln_cpl      = .false.   !  Coupled formulation                       (T => fill namsbc_cpl ) 
     11   ln_cpl      = .false.   !  atmosphere coupled   formulation          ( requires key_oasis3 ) 
     12   ln_mixcpl   = .false.   !  forced-coupled mixed formulation          ( requires key_oasis3 ) 
     13   nn_components = 0       !  configuration of the opa-sas OASIS coupling 
     14                           !  =0 no opa-sas OASIS coupling: default single executable configuration 
     15                           !  =1 opa-sas OASIS coupling: multi executable configuration, OPA component 
     16                           !  =2 opa-sas OASIS coupling: multi executable configuration, SAS component  
    1217   ln_apr_dyn  = .false.   !  Patm gradient added in ocean & ice Eqs.   (T => fill namsbc_apr ) 
    1318   nn_ice      = 2         !  =0 no ice boundary condition   , 
    1419                           !  =1 use observed ice-cover      , 
    15                            !  =2 ice-model used                         ("key_lim3" or "key_lim2) 
    16    nn_ice_embd = 0         !  =0 levitating ice (no mass exchange, concentration/dilution effect) 
     20                           !  =2 ice-model used                         ("key_lim3" or "key_lim2") 
     21   nn_ice_embd = 1         !  =0 levitating ice (no mass exchange, concentration/dilution effect) 
    1722                           !  =1 levitating ice with mass and salt exchange but no presure effect 
    1823                           !  =2 embedded sea-ice (full salt and mass exchanges and pressure) 
    1924   ln_dm2dc    = .false.   !  daily mean to diurnal cycle on short wave 
    20    ln_rnf      = .true.    !  runoffs                                   (T => fill namsbc_rnf) 
     25   ln_rnf      = .true.    !  runoffs                                   (T   => fill namsbc_rnf) 
    2126   nn_isf      = 0         !  ice shelf melting/freezing                (/=0 => fill namsbc_isf) 
    2227                           !  0 =no isf                  1 = presence of ISF 
     
    2530                           !  option 1 and 4 need ln_isfcav = .true. (domzgr) 
    2631   ln_ssr      = .true.    !  Sea Surface Restoring on T and/or S       (T => fill namsbc_ssr) 
    27    nn_fwb      = 3         !  FreshWater Budget: =0 unchecked 
     32   nn_fwb      = 2         !  FreshWater Budget: =0 unchecked 
    2833                           !     =1 global mean of e-p-r set to zero at each time step 
    2934                           !     =2 annual global mean of e-p-r set to zero 
    30                            !     =3 global emp set to zero and spread out over erp area 
    3135   ln_wave = .false.       !  Activate coupling with wave (either Stokes Drift or Drag coefficient, or both)  (T => fill namsbc_wave) 
    3236   ln_cdgw = .false.       !  Neutral drag coefficient read from wave model (T => fill namsbc_wave) 
    3337   ln_sdw  = .false.       !  Computation of 3D stokes drift                (T => fill namsbc_wave) 
    34    nn_lsm  = 0             !  =0   land/sea mask for input fields is not applied (the field land/sea mask filename 
    35                            !       is left empty in namelist)  , 
    36                            !  =1:n number of iterations of land/sea mask application for input fields 
     38   nn_lsm  = 0             !  =0 land/sea mask for input fields is not applied (keep empty land/sea mask filename field) , 
     39                           !  =1:n number of iterations of land/sea mask application for input fields (fill land/sea mask filename field) 
     40   nn_limflx = -1          !  LIM3 Multi-category heat flux formulation (use -1 if LIM3 is not used) 
     41                           !  =-1  Use per-category fluxes, bypass redistributor, forced mode only, not yet implemented coupled 
     42                           !  = 0  Average per-category fluxes (forced and coupled mode) 
     43                           !  = 1  Average and redistribute per-category fluxes, forced mode only, not yet implemented coupled 
     44                           !  = 2  Redistribute a single flux over categories (coupled mode only) 
    3745/ 
  • branches/2015/nemo_v3_6_STABLE/DOC/TexFiles/Namelist/namsbc_apr

    r4230 r5890  
    22&namsbc_apr    !   Atmospheric pressure used as ocean forcing or in bulk 
    33!----------------------------------------------------------------------- 
    4 !              ! file name ! frequency (hours) ! variable ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
    5 !              !           !  (if <0  months)  !   name   !    (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
    6    sn_apr      = 'patm'    ,         -1        ,'somslpre',    .true.      , .true. , 'yearly'  ,  ''      ,   ''     , '' 
     4!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
     5!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
     6   sn_apr      = 'patm'      ,         -1        ,'somslpre',    .true.     , .true. , 'yearly'  ,  ''      ,   ''     , '' 
    77 
    88   cn_dir      = './'       !  root directory for the location of the bulk files 
    9    rn_pref     = 101000._wp !  reference atmospheric pressure   [N/m2]/ 
     9   rn_pref     = 101000.    !  reference atmospheric pressure   [N/m2]/ 
    1010   ln_ref_apr  = .false.    !  ref. pressure: global mean Patm (T) or a constant (F) 
    1111   ln_apr_obc  = .false.    !  inverse barometer added to OBC ssh data 
  • branches/2015/nemo_v3_6_STABLE/DOC/TexFiles/Namelist/namsbc_core

    r4230 r5890  
    22&namsbc_core   !   namsbc_core  CORE bulk formulae 
    33!----------------------------------------------------------------------- 
    4 !              !  file name                    ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
    5 !              !                               !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  !  filename     ! 
    6    sn_wndi     = 'u_10.15JUNE2009_orca2'       ,         6         , 'U_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , 'Uwnd'   , '' 
    7    sn_wndj     = 'v_10.15JUNE2009_orca2'       ,         6         , 'V_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , 'Vwnd'   , '' 
    8    sn_qsr      = 'ncar_rad.15JUNE2009_orca2'   ,        24         , 'SWDN_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , '' 
    9    sn_qlw      = 'ncar_rad.15JUNE2009_orca2'   ,        24         , 'LWDN_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , '' 
    10    sn_tair     = 't_10.15JUNE2009_orca2'       ,         6         , 'T_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , '' 
    11    sn_humi     = 'q_10.15JUNE2009_orca2'       ,         6         , 'Q_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , '' 
    12    sn_prec     = 'ncar_precip.15JUNE2009_orca2',        -1         , 'PRC_MOD1',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , '' 
    13    sn_snow     = 'ncar_precip.15JUNE2009_orca2',        -1         , 'SNOW'    ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , '' 
    14    sn_tdif     = 'taudif_core'                 ,        24         , 'taudif'  ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , '' 
    15 ! 
     4!              !  file name                    ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights                               ! rotation ! land/sea mask ! 
     5!              !                               !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename                              ! pairing  ! filename      ! 
     6   sn_wndi     = 'u_10.15JUNE2009_fill'        ,         6         , 'U_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bicubic_noc.nc'   , 'Uwnd'   , '' 
     7   sn_wndj     = 'v_10.15JUNE2009_fill'        ,         6         , 'V_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bicubic_noc.nc'   , 'Vwnd'   , '' 
     8   sn_qsr      = 'ncar_rad.15JUNE2009_fill'    ,        24         , 'SWDN_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc'  , ''       , '' 
     9   sn_qlw      = 'ncar_rad.15JUNE2009_fill'    ,        24         , 'LWDN_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc'  , ''       , '' 
     10   sn_tair     = 't_10.15JUNE2009_fill'        ,         6         , 'T_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc'  , ''       , '' 
     11   sn_humi     = 'q_10.15JUNE2009_fill'        ,         6         , 'Q_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc'  , ''       , '' 
     12   sn_prec     = 'ncar_precip.15JUNE2009_fill' ,        -1         , 'PRC_MOD1',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc'  , ''       , '' 
     13   sn_snow     = 'ncar_precip.15JUNE2009_fill' ,        -1         , 'SNOW'    ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc'  , ''       , '' 
     14   sn_tdif     = 'taudif_core'                 ,        24         , 'taudif'  ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc'  , ''       , '' 
     15 
    1616   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the bulk files 
    17    ln_2m       = .false.   !  air temperature and humidity referenced at 2m (T) instead 10m (F) 
    1817   ln_taudif   = .false.   !  HF tau contribution: use "mean of stress module - module of the mean stress" data 
     18   rn_zqt      = 10.        !  Air temperature and humidity reference height (m) 
     19   rn_zu       = 10.        !  Wind vector reference height (m) 
    1920   rn_pfac     = 1.        !  multiplicative factor for precipitation (total & snow) 
     21   rn_efac     = 1.        !  multiplicative factor for evaporation (0. or 1.) 
     22   rn_vfac     = 0.        !  multiplicative factor for ocean/ice velocity 
     23                           !  in the calculation of the wind stress (0.=absolute winds or 1.=relative winds) 
    2024/ 
  • branches/2015/nemo_v3_6_STABLE/DOC/TexFiles/Namelist/namsbc_cpl

    r4147 r5890  
    11!----------------------------------------------------------------------- 
    2 &namsbc_cpl    !   coupled ocean/atmosphere model                       ("key_coupled") 
     2&namsbc_cpl    !   coupled ocean/atmosphere model                       ("key_oasis3") 
    33!----------------------------------------------------------------------- 
    44!                    !     description       !  multiple  !    vector   !      vector          ! vector ! 
    55!                    !                       ! categories !  reference  !    orientation       ! grids  ! 
    66! send 
    7 sn_snd_temp   =       'weighted oce and ice' ,    'no'    ,     ''      ,         ''           ,   '' 
    8 sn_snd_alb    =       'weighted ice'         ,    'no'    ,     ''      ,         ''           ,   '' 
    9 sn_snd_thick  =       'none'                 ,    'no'   ,     ''      ,         ''           ,   '' 
    10 sn_snd_crt    =       'none'                 ,    'no'    , 'spherical' , 'eastward-northward' ,  'T' 
    11 sn_snd_co2    =       'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''           ,   '' 
     7   sn_snd_temp   =       'weighted oce and ice' ,    'no'    ,     ''      ,         ''           ,   '' 
     8   sn_snd_alb    =       'weighted ice'         ,    'no'    ,     ''      ,         ''           ,   '' 
     9   sn_snd_thick  =       'none'                 ,    'no'   ,     ''      ,         ''           ,   '' 
     10   sn_snd_crt    =       'none'                 ,    'no'    , 'spherical' , 'eastward-northward' ,  'T' 
     11   sn_snd_co2    =       'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''           ,   '' 
    1212! receive 
    13 sn_rcv_w10m   =       'none'                 ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
    14 sn_rcv_taumod =       'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
    15 sn_rcv_tau    =       'oce only'             ,    'no'    , 'cartesian' , 'eastward-northward',  'U,V' 
    16 sn_rcv_dqnsdt =       'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
    17 sn_rcv_qsr    =       'oce and ice'          ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
    18 sn_rcv_qns    =       'oce and ice'          ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
    19 sn_rcv_emp    =       'conservative'         ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
    20 sn_rcv_rnf    =       'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
    21 sn_rcv_cal    =       'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
    22 sn_rcv_co2    =       'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
     13   sn_rcv_w10m   =       'none'                 ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
     14   sn_rcv_taumod =       'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
     15   sn_rcv_tau    =       'oce only'             ,    'no'    , 'cartesian' , 'eastward-northward',  'U,V' 
     16   sn_rcv_dqnsdt =       'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
     17   sn_rcv_qsr    =       'oce and ice'          ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
     18   sn_rcv_qns    =       'oce and ice'          ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
     19   sn_rcv_emp    =       'conservative'         ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
     20   sn_rcv_rnf    =       'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
     21   sn_rcv_cal    =       'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
     22   sn_rcv_co2    =       'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
     23! 
     24   nn_cplmodel   =     1     !  Maximum number of models to/from which NEMO is potentialy sending/receiving data 
     25   ln_usecplmask = .false.   !  use a coupling mask file to merge data received from several models 
     26                             !   -> file cplmask.nc with the float variable called cplmask (jpi,jpj,nn_cplmodel) 
    2327/ 
  • branches/2015/nemo_v3_6_STABLE/DOC/TexFiles/Namelist/namsbc_mfs

    r4230 r5890  
    22&namsbc_mfs   !   namsbc_mfs  MFS bulk formulae 
    33!----------------------------------------------------------------------- 
    4 !              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
    5 !              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
    6    sn_wndi     =   'ecmwf'   ,        6          , 'u10'     ,    .true.    , .false. , 'daily'  ,'bicubic.nc' , ''    , '' 
    7    sn_wndj     =   'ecmwf'   ,        6          , 'v10'     ,    .true.    , .false. , 'daily'  ,'bicubic.nc' , ''    , '' 
    8    sn_clc      =   'ecmwf'   ,        6          , 'clc'     ,    .true.    , .false. , 'daily'  ,'bilinear.nc', ''    , '' 
    9    sn_msl      =   'ecmwf'   ,        6          , 'msl'     ,    .true.    , .false. , 'daily'  ,'bicubic.nc' , ''    , '' 
    10    sn_tair     =   'ecmwf'   ,        6          , 't2'      ,    .true.    , .false. , 'daily'  ,'bicubic.nc' , ''    , '' 
    11    sn_rhm      =   'ecmwf'   ,        6          , 'rh'      ,    .true.    , .false. , 'daily'  ,'bilinear.nc', ''    , '' 
    12    sn_prec     =   'precip'  ,        6          , 'precip'  ,    .true.    , .false. , 'daily'  ,'bicubic'    , ''    , '' 
    13    cn_dir      =   './'      !  root directory for the location of the bulk files 
     4!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights     ! rotation ! land/sea mask ! 
     5!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename    ! pairing  ! filename      ! 
     6   sn_wndi     =   'ecmwf'   ,        6          , 'u10'     ,    .true.    , .false. , 'daily'  ,'bicubic.nc' , ''       , '' 
     7   sn_wndj     =   'ecmwf'   ,        6          , 'v10'     ,    .true.    , .false. , 'daily'  ,'bicubic.nc' , ''       , '' 
     8   sn_clc      =   'ecmwf'   ,        6          , 'clc'     ,    .true.    , .false. , 'daily'  ,'bilinear.nc', ''       , '' 
     9   sn_msl      =   'ecmwf'   ,        6          , 'msl'     ,    .true.    , .false. , 'daily'  ,'bicubic.nc' , ''       , '' 
     10   sn_tair     =   'ecmwf'   ,        6          , 't2'      ,    .true.    , .false. , 'daily'  ,'bicubic.nc' , ''       , '' 
     11   sn_rhm      =   'ecmwf'   ,        6          , 'rh'      ,    .true.    , .false. , 'daily'  ,'bilinear.nc', ''       , '' 
     12   sn_prec     =   'ecmwf'   ,        6          , 'precip'  ,    .true.    , .true.  , 'daily'  ,'bicubic.nc' , ''       , '' 
     13 
     14   cn_dir      = './ECMWF/'      !  root directory for the location of the bulk files 
    1415/ 
  • branches/2015/nemo_v3_6_STABLE/DOC/TexFiles/Namelist/namsbc_rnf

    r4230 r5890  
    22&namsbc_rnf    !   runoffs namelist surface boundary condition 
    33!----------------------------------------------------------------------- 
    4 !              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
    5 !              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
    6    sn_rnf      = 'runoff_core_monthly',    -1    , 'sorunoff',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , '' 
    7    sn_cnf      = 'runoff_core_monthly',     0    , 'socoefr0',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , '' 
    8    sn_s_rnf    = 'runoffs'            ,    24    , 'rosaline',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , '' 
    9    sn_t_rnf    = 'runoffs'            ,    24    , 'rotemper',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , '' 
    10    sn_dep_rnf  = 'runoffs'            ,     0    , 'rodepth' ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , '' 
     4!              !  file name           ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
     5!              !                      !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
     6   sn_rnf      = 'runoff_core_monthly',        -1         , 'sorunoff',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , '' 
     7   sn_cnf      = 'runoff_core_monthly',         0         , 'socoefr0',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , '' 
     8   sn_s_rnf    = 'runoffs'            ,        24         , 'rosaline',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , '' 
     9   sn_t_rnf    = 'runoffs'            ,        24         , 'rotemper',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , '' 
     10   sn_dep_rnf  = 'runoffs'            ,         0         , 'rodepth' ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , '' 
    1111 
    1212   cn_dir       = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
    13    ln_rnf_emp   = .false.   !  runoffs included into precipitation field (T) or into a file (F) 
    1413   ln_rnf_mouth = .true.    !  specific treatment at rivers mouths 
    1514   rn_hrnf      =  15.e0    !  depth over which enhanced vertical mixing is used 
     
    1918   ln_rnf_tem   = .false.   !  read in temperature information for runoff 
    2019   ln_rnf_sal   = .false.   !  read in salinity information for runoff 
     20   ln_rnf_depth_ini = .false.  ! compute depth at initialisation from runoff file 
     21   rn_rnf_max   = 5.735e-4  !  max value of the runoff climatologie over global domain ( ln_rnf_depth_ini = .true ) 
     22   rn_dep_max   = 150.      !  depth over which runoffs is spread ( ln_rnf_depth_ini = .true ) 
     23   nn_rnf_depth_file = 0    !  create (=1) a runoff depth file or not (=0) 
    2124/ 
  • branches/2015/nemo_v3_6_STABLE/DOC/TexFiles/Namelist/namsbc_sas

    r4230 r5890  
    44!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
    55!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
    6    sn_usp      = 'sas_grid_U' ,    120    , 'vozocrtx' ,  .true.    , .true. ,   'yearly'  , ''       , ''             , '' 
    7    sn_vsp      = 'sas_grid_V' ,    120    , 'vomecrty' ,  .true.    , .true. ,   'yearly'  , ''       , ''             , '' 
    8    sn_tem      = 'sas_grid_T' ,    120    , 'sosstsst' ,  .true.    , .true. ,   'yearly'  , ''       , ''             , '' 
    9    sn_sal      = 'sas_grid_T' ,    120    , 'sosaline' ,  .true.    , .true. ,   'yearly'  , ''       , ''             , '' 
    10    sn_ssh      = 'sas_grid_T' ,    120    , 'sossheig' ,  .true.    , .true. ,   'yearly'  , ''       , ''             , '' 
     6   sn_usp      = 'sas_grid_U' ,    120           , 'vozocrtx' ,  .true.    , .true. ,   'yearly'  , ''       , ''             , '' 
     7   sn_vsp      = 'sas_grid_V' ,    120           , 'vomecrty' ,  .true.    , .true. ,   'yearly'  , ''       , ''             , '' 
     8   sn_tem      = 'sas_grid_T' ,    120           , 'sosstsst' ,  .true.    , .true. ,   'yearly'  , ''       , ''             , '' 
     9   sn_sal      = 'sas_grid_T' ,    120           , 'sosaline' ,  .true.    , .true. ,   'yearly'  , ''       , ''             , '' 
     10   sn_ssh      = 'sas_grid_T' ,    120           , 'sossheig' ,  .true.    , .true. ,   'yearly'  , ''       , ''             , '' 
     11   sn_e3t      = 'sas_grid_T' ,    120           , 'e3t_m'    ,  .true.    , .true. ,   'yearly'  , ''       , ''             , '' 
     12   sn_frq      = 'sas_grid_T' ,    120           , 'frq_m'    ,  .true.    , .true. ,   'yearly'  , ''       , ''             , '' 
    1113 
    12    ln_3d_uv    = .true.    !  specify whether we are supplying a 3D u,v field 
     14   ln_3d_uve   = .true.    !  specify whether we are supplying a 3D u,v and e3 field 
     15   ln_read_frq = .false.    !  specify whether we must read frq or not 
    1316   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the bulk files are 
    1417/ 
  • branches/2015/nemo_v3_6_STABLE/DOC/TexFiles/Namelist/namsbc_wave

    r4230 r5890  
    22&namsbc_wave   ! External fields from wave model 
    33!----------------------------------------------------------------------- 
    4 !              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
    5 !              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
    6    sn_cdg      =  'cdg_wave' ,        1          , 'drag_coeff' , .true.    , .false. , 'daily'  , ''       , ''       , '' 
    7    sn_usd      =  'sdw_wave' ,        1          , 'u_sd2d'     , .true.   , .false. , 'daily'  ,''         , ''       , '' 
    8    sn_vsd      =  'sdw_wave' ,        1          , 'v_sd2d'     , .true.   , .false. , 'daily'  ,''         , ''       , '' 
    9    sn_wn       =  'sdw_wave' ,        1          , 'wave_num'   , .true.   , .false. , 'daily'  ,''         , ''       , '' 
     4!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable     ! time interp. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
     5!              !             !  (if <0  months)  !   name       !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
     6   sn_cdg      =  'cdg_wave' ,        1          , 'drag_coeff' ,     .true.   , .false. , 'daily'   ,  ''      , ''       , '' 
     7   sn_usd      =  'sdw_wave' ,        1          , 'u_sd2d'     ,     .true.   , .false. , 'daily'   ,  ''      , ''       , '' 
     8   sn_vsd      =  'sdw_wave' ,        1          , 'v_sd2d'     ,     .true.   , .false. , 'daily'   ,  ''      , ''       , '' 
     9   sn_wn       =  'sdw_wave' ,        1          , 'wave_num'   ,     .true.   , .false. , 'daily'   ,  ''      , ''       , '' 
    1010! 
    1111   cn_dir_cdg  = './'  !  root directory for the location of drag coefficient files 
  • branches/2015/nemo_v3_6_STABLE/DOC/TexFiles/Namelist/namtra_adv

    r4147 r5890  
    22&namtra_adv    !   advection scheme for tracer 
    33!----------------------------------------------------------------------- 
    4    ln_traadv_cen2   =  .false.  !  2nd order centered scheme 
    5    ln_traadv_tvd    =  .true.   !  TVD scheme 
    6    ln_traadv_muscl  =  .false.  !  MUSCL scheme 
    7    ln_traadv_muscl2 =  .false.  !  MUSCL2 scheme + cen2 at boundaries 
    8    ln_traadv_ubs    =  .false.  !  UBS scheme 
    9    ln_traadv_qck    =  .false.  !  QUICKEST scheme 
    10    ln_traadv_msc_ups=  .false.  !  use upstream scheme within muscl 
     4   ln_traadv_cen2   =  .false.   !  2nd order centered scheme 
     5   ln_traadv_tvd    =  .true.    !  TVD scheme 
     6   ln_traadv_muscl  =  .false.   !  MUSCL scheme 
     7   ln_traadv_muscl2 =  .false.   !  MUSCL2 scheme + cen2 at boundaries 
     8   ln_traadv_ubs    =  .false.   !  UBS scheme 
     9   ln_traadv_qck    =  .false.   !  QUICKEST scheme 
     10   ln_traadv_msc_ups=  .false.   !  use upstream scheme within muscl 
     11   ln_traadv_tvd_zts=  .false.  !  TVD scheme with sub-timestepping of vertical tracer advection 
    1112/ 
  • branches/2015/nemo_v3_6_STABLE/DOC/TexFiles/Namelist/namtra_dmp

    r5102 r5890  
    22&namtra_dmp    !   tracer: T & S newtonian damping 
    33!----------------------------------------------------------------------- 
    4    ln_tradmp   =  .true.     !  add a damping termn (T) or not (F) 
    5    nn_zdmp     =    0        !  vertical   shape =0    damping throughout the water column 
    6                              !                   =1 no damping in the mixing layer (kz  criteria) 
    7                              !                   =2 no damping in the mixed  layer (rho crieria) 
    8    cn_resto    = 'resto.nc'  ! Name of file containing restoration coefficient field (use dmp_tools to create this) 
    9  
     4   ln_tradmp   =  .true.   !  add a damping termn (T) or not (F) 
     5   nn_zdmp     =    0      !  vertical   shape =0    damping throughout the water column 
     6                           !                   =1 no damping in the mixing layer (kz  criteria) 
     7                           !                   =2 no damping in the mixed  layer (rho crieria) 
     8   cn_resto    = 'resto.nc' ! Name of file containing restoration coefficient field (use dmp_tools to create this) 
    109/ 
  • branches/2015/nemo_v3_6_STABLE/DOC/TexFiles/Namelist/namtra_qsr

    r4230 r5890  
    1515   rn_si0      =   0.35    !  RGB & 2 bands: shortess depth of extinction 
    1616   rn_si1      =   23.0    !  2 bands: longest depth of extinction 
     17   ln_qsr_ice  = .true.    !  light penetration for ice-model LIM3 
    1718/ 
  • branches/2015/nemo_v3_6_STABLE/DOC/TexFiles/Namelist/namtrd

    r3294 r5890  
    11!----------------------------------------------------------------------- 
    2 &namtrd        !   diagnostics on dynamics and/or tracer trends         ("key_trddyn" and/or "key_trdtra") 
    3 !              !       or mixed-layer trends or barotropic vorticity    ("key_trdmld" or     "key_trdvor") 
     2&namtrd        !   diagnostics on dynamics and/or tracer trends 
     3!              !       and/or mixed-layer trends and/or barotropic vorticity 
    44!----------------------------------------------------------------------- 
    5    nn_trd      = 365       !  time step frequency dynamics and tracers trends 
    6    nn_ctls     =   0       !  control surface type in mixed-layer trends (0,1 or n<jpk) 
    7    rn_ucf      =   1.      !  unit conversion factor (=1 -> /seconds ; =86400. -> /day) 
    8    cn_trdrst_in      = "restart_mld"   ! suffix of ocean restart name (input) 
    9    cn_trdrst_out     = "restart_mld"   ! suffix of ocean restart name (output) 
    10    ln_trdmld_restart = .false.         !  restart for ML diagnostics 
    11    ln_trdmld_instant = .false.         !  flag to diagnose trends of instantantaneous or mean ML T/S 
     5   ln_glo_trd  = .false.   ! (T) global domain averaged diag for T, T^2, KE, and PE 
     6   ln_dyn_trd  = .false.   ! (T) 3D momentum trend output 
     7   ln_dyn_mxl  = .FALSE.   ! (T) 2D momentum trends averaged over the mixed layer (not coded yet) 
     8   ln_vor_trd  = .FALSE.   ! (T) 2D barotropic vorticity trends (not coded yet) 
     9   ln_KE_trd   = .false.   ! (T) 3D Kinetic   Energy     trends 
     10   ln_PE_trd   = .false.   ! (T) 3D Potential Energy     trends 
     11   ln_tra_trd  = .FALSE.   ! (T) 3D tracer trend output 
     12   ln_tra_mxl  = .false.   ! (T) 2D tracer trends averaged over the mixed layer (not coded yet) 
     13   nn_trd      = 365       !  print frequency (ln_glo_trd=T) (unit=time step) 
    1214/ 
  • branches/2015/nemo_v3_6_STABLE/DOC/TexFiles/Namelist/namtsd

    r4230 r5890  
    22&namtsd    !   data : Temperature  & Salinity 
    33!----------------------------------------------------------------------- 
    4 !          ! file name ! frequency (hours)         ! variable     ! time interp. ! clim  !'yearly' or ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
    5 !          !           !  (if <0  months)          !   name       !  (logical)   ! (T/F) ! 'monthly'  ! filename ! pairing  ! filename      ! 
    6    sn_tem  = 'data_1m_potential_temperature_nomask', -1,'votemper',  .true.      , .true., 'yearly'   , ' '      , ' '      , '' 
    7    sn_sal  = 'data_1m_salinity_nomask'             , -1,'vosaline',  .true.      , .true., 'yearly'   , ''       , ' '      , '' 
     4!----------------------------------------------------------------------- 
     5!          !  file name                            ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
     6!          !                                       !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
     7   sn_tem  = 'data_1m_potential_temperature_nomask',         -1        ,'votemper' ,    .true.    , .true. , 'yearly'   , ''       ,   ''    ,    '' 
     8   sn_sal  = 'data_1m_salinity_nomask'             ,         -1        ,'vosaline' ,    .true.    , .true. , 'yearly'   , ''       ,   ''    ,    '' 
    89   ! 
    910   cn_dir        = './'     !  root directory for the location of the runoff files 
  • branches/2015/nemo_v3_6_STABLE/DOC/TexFiles/Namelist/namzdf_gls

    r3294 r5890  
    22&namzdf_gls                !   GLS vertical diffusion                   ("key_zdfgls") 
    33!----------------------------------------------------------------------- 
    4    rn_emin       = 1.e-6   !  minimum value of e   [m2/s2] 
     4   rn_emin       = 1.e-7   !  minimum value of e   [m2/s2] 
    55   rn_epsmin     = 1.e-12  !  minimum value of eps [m2/s3] 
    66   ln_length_lim = .true.  !  limit on the dissipation rate under stable stratification (Galperin et al., 1988) 
    7    rn_clim_galp  = 0.53    !  galperin limit 
    8    ln_crban      = .true.  !  Use Craig & Banner (1994) surface wave mixing parametrisation 
     7   rn_clim_galp  = 0.267   !  galperin limit 
    98   ln_sigpsi     = .true.  !  Activate or not Burchard 2001 mods on psi schmidt number in the wb case 
    109   rn_crban      = 100.    !  Craig and Banner 1994 constant for wb tke flux 
    1110   rn_charn      = 70000.  !  Charnock constant for wb induced roughness length 
    12    nn_tkebc_surf =   1     !  surface tke condition (0/1/2=Dir/Neum/Dir Mellor-Blumberg) 
    13    nn_tkebc_bot  =   1     !  bottom tke condition (0/1=Dir/Neum) 
    14    nn_psibc_surf =   1     !  surface psi condition (0/1/2=Dir/Neum/Dir Mellor-Blumberg) 
    15    nn_psibc_bot  =   1     !  bottom psi condition (0/1=Dir/Neum) 
    16    nn_stab_func  =   2     !  stability function (0=Galp, 1= KC94, 2=CanutoA, 3=CanutoB) 
    17    nn_clos       =   1     !  predefined closure type (0=MY82, 1=k-eps, 2=k-w, 3=Gen) 
     11   rn_hsro       =  0.02   !  Minimum surface roughness 
     12   rn_frac_hs    =   1.3   !  Fraction of wave height as roughness (if nn_z0_met=2) 
     13   nn_z0_met     =     2   !  Method for surface roughness computation (0/1/2) 
     14   nn_bc_surf    =     1   !  surface condition (0/1=Dir/Neum) 
     15   nn_bc_bot     =     1   !  bottom condition (0/1=Dir/Neum) 
     16   nn_stab_func  =     2   !  stability function (0=Galp, 1= KC94, 2=CanutoA, 3=CanutoB) 
     17   nn_clos       =     1   !  predefined closure type (0=MY82, 1=k-eps, 2=k-w, 3=Gen) 
    1818/ 
  • branches/2015/nemo_v3_6_STABLE/DOC/TexFiles/Namelist/namzdf_tke

    r4147 r5890  
    2121                           !        = 1 add a tke source below the ML 
    2222                           !        = 2 add a tke source just at the base of the ML 
    23                            !        = 3 as = 1 applied on HF part of the stress    ("key_coupled") 
     23                           !        = 3 as = 1 applied on HF part of the stress    ("key_oasis3") 
    2424   rn_efr      =   0.05    !  fraction of surface tke value which penetrates below the ML (nn_etau=1 or 2) 
    2525   nn_htau     =   1       !  type of exponential decrease of tke penetration below the ML 
  • branches/2015/nemo_v3_6_STABLE/DOC/TexFiles/Namelist/namzgr_sco

    r3680 r5890  
    1313                        !!!!!!!  SH94 stretching coefficients  (ln_s_sh94 = .true.) 
    1414   rn_theta    =    6.0    !  surface control parameter (0<=theta<=20) 
    15    rn_bb       =    0.8    !  stretching with SH94 s-sigma    
     15   rn_bb       =    0.8    !  stretching with SH94 s-sigma 
    1616                        !!!!!!!  SF12 stretching coefficient  (ln_s_sf12 = .true.) 
    1717   rn_alpha    =    4.4    !  stretching with SF12 s-sigma 
     
    2222   rn_zb_b     =   -0.2    !  offset for calculating Zb 
    2323                        !!!!!!!! Other stretching (not SH94 or SF12) [also uses rn_theta above] 
    24    rn_thetb    =    1.0    !  bottom control parameter  (0<=thetb<= 1)  
     24   rn_thetb    =    1.0    !  bottom control parameter  (0<=thetb<= 1) 
    2525/ 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.