New URL for NEMO forge!   http://forge.nemo-ocean.eu

Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
This present forge is now archived and remained online for history.
Changeset 5989 for branches/2014/dev_r4650_UKMO10_Tidally_Meaned_Diagnostics/NEMOGCM/CONFIG/GYRE_XIOS – NEMO

Ignore:
Timestamp:
2015-12-03T09:10:32+01:00 (9 years ago)
Author:
deazer
Message:

Merging TMB and 25h diagnostics to head of trunk
added brief documentation

Location:
branches/2014/dev_r4650_UKMO10_Tidally_Meaned_Diagnostics/NEMOGCM/CONFIG/GYRE_XIOS
Files:
3 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed

  • branches/2014/dev_r4650_UKMO10_Tidally_Meaned_Diagnostics/NEMOGCM/CONFIG/GYRE_XIOS/EXP00/iodef.xml

    r4373 r5989  
    4242     <field field_ref="empmr"        name="sowaflup"  /> 
    4343     <field field_ref="qsr"          name="soshfldo"  /> 
    44           <field field_ref="saltflx"      name="sosfldow"  /> 
     44      <field field_ref="saltflx"      name="sosfldow"  /> 
    4545     <field field_ref="qt"           name="sohefldo"  /> 
    4646     <field field_ref="mldr10_1"     name="somxl010"  /> 
    4747     <field field_ref="mldkz5"       name="somixhgt"  /> 
    48            <!-- variables available with MLE 
    49           <field field_ref="Lf_NHpf"    name="Lf_NHpf"  long_name="MLE:_Lf=NH/f"     /> 
    50       --> 
    51        </file> 
     48    </file> 
    5249    
    5350   <file id="file2" name_suffix="_grid_U" description="ocean U grid variables" > 
    5451          <field field_ref="uoce"         name="vozocrtx"  /> 
    5552          <field field_ref="utau"         name="sozotaux"  /> 
    56           <!-- variables available with MLE 
    57           <field field_ref="psiu_mle"     name="psiu_mle"  long_name="MLE_streamfunction_along_i-axis" /> 
    58      --> 
    59         </file> 
     53    </file> 
    6054    
    6155   <file id="file3" name_suffix="_grid_V" description="ocean V grid variables" > 
    6256          <field field_ref="voce"         name="vomecrty"  />  
    6357          <field field_ref="vtau"         name="sometauy"  />  
    64           <!-- variables available with MLE 
    65           <field field_ref="psiv_mle"     name="psiv_mle"  long_name="MLE_streamfunction_along_j-axis" /> 
    66      --> 
    67         </file> 
     58    </file> 
    6859    
    6960   <file id="file4" name_suffix="_grid_W" description="ocean W grid variables" > 
    … …  
    7162          <field field_ref="avt"          name="votkeavt" /> 
    7263          <field field_ref="aht2d"        name="soleahtw" /> 
    73         </file> 
     64    </file> 
    7465 
    7566      </file_group> 
    … …  
    9586     
    9687   <axis_definition>   
    97       <axis id="deptht" long_name="Vertical T levels" unit="m" positive="down" /> 
    98       <axis id="depthu" long_name="Vertical U levels" unit="m" positive="down" /> 
    99       <axis id="depthv" long_name="Vertical V levels" unit="m" positive="down" /> 
    100       <axis id="depthw" long_name="Vertical W levels" unit="m" positive="down" /> 
    101       <axis id="nfloat" long_name="Float number"      unit="-"  /> 
    102       <axis id="icbcla" long_name="Iceberg class"     unit="-"  /> 
     88      <axis id="deptht"  long_name="Vertical T levels"  unit="m" positive="down" /> 
     89      <axis id="depthu"  long_name="Vertical U levels"  unit="m" positive="down" /> 
     90      <axis id="depthv"  long_name="Vertical V levels"  unit="m" positive="down" /> 
     91      <axis id="depthw"  long_name="Vertical W levels"  unit="m" positive="down" /> 
     92      <axis id="nfloat"  long_name="Float number"       unit="1"                 /> 
     93      <axis id="icbcla"  long_name="Iceberg class"      unit="1"                 /> 
     94      <axis id="ncatice" long_name="Ice category"       unit="1"                 /> 
     95      <axis id="iax_20C" long_name="20 degC isotherm"   unit="degC"              /> 
     96      <axis id="iax_28C" long_name="28 degC isotherm"   unit="degC"              /> 
    10397   </axis_definition>  
    10498     

  • branches/2014/dev_r4650_UKMO10_Tidally_Meaned_Diagnostics/NEMOGCM/CONFIG/GYRE_XIOS/EXP00/namelist_cfg

    r5260 r5989  
    4141   nn_bathy    =    0      !  compute (=0) or read (=1) the bathymetry file 
    4242   rn_rdt      = 7200.     !  time step for the dynamics (and tracer if nn_acc=0) 
    43 !   nn_baro     =   60      !  number of barotropic time step            ("key_dynspg_ts") 
    4443   rn_rdtmin   = 7200.           !  minimum time step on tracers (used if nn_acc=1) 
    4544   rn_rdtmax   = 7200.           !  maximum time step on tracers (used if nn_acc=1) 
    … …  
    110109/ 
    111110!----------------------------------------------------------------------- 
    112 &namsbc_cpl    !   coupled ocean/atmosphere model                       ("key_coupled") 
     111&namsbc_cpl    !   coupled ocean/atmosphere model                       ("key_oasis3") 
    113112!----------------------------------------------------------------------- 
    114113/ 
    … …  
    150149/ 
    151150!----------------------------------------------------------------------- 
    152 &namcla        !   cross land advection 
    153 !----------------------------------------------------------------------- 
    154 / 
    155 !----------------------------------------------------------------------- 
    156 &namobc        !   open boundaries parameters                           ("key_obc") 
    157 !----------------------------------------------------------------------- 
    158 / 
    159 !----------------------------------------------------------------------- 
    160151&namagrif      !  AGRIF zoom                                            ("key_agrif") 
    161152!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    195186&nameos        !   ocean physical parameters 
    196187!----------------------------------------------------------------------- 
    197    nn_eos      =   2       !  type of equation of state and Brunt-Vaisala frequency 
     188   nn_eos      =   0       !  type of equation of state and Brunt-Vaisala frequency 
    198189/ 
    199190!----------------------------------------------------------------------- 
    200191&namtra_adv    !   advection scheme for tracer 
    201192!----------------------------------------------------------------------- 
    202    ln_traadv_msc_ups=  .false.  !  use upstream scheme within muscl  
     193   ln_traadv_fct =  .true.    !  FCT scheme 
     194      nn_fct_h   =  2               !  =2/4, horizontal 2nd / 4th order  
     195      nn_fct_v   =  2               !  =2/4, vertical   2nd / COMPACT 4th order  
     196      nn_fct_zts =  0               !  >=1,  2nd order FCT scheme with vertical sub-timestepping 
     197      !                             !        (number of sub-timestep = nn_fct_zts) 
    203198/ 
    204199!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    209204&namtra_ldf    !   lateral diffusion scheme for tracers 
    210205!---------------------------------------------------------------------------------- 
    211    rn_aeiv_0        =     0.    !  eddy induced velocity coefficient [m2/s] 
    212    rn_aht_0         =  1000.    !  horizontal eddy diffusivity for tracers [m2/s] 
     206   !                       !  Operator type: 
     207   ln_traldf_lap   =  .true.   !    laplacian operator 
     208   ln_traldf_blp   =  .false.  !  bilaplacian operator 
     209   !                       !  Direction of action: 
     210   ln_traldf_lev   =  .false.  !  iso-level 
     211   ln_traldf_hor   =  .false.  !  horizontal (geopotential) 
     212   ln_traldf_iso   =  .true.   !  iso-neutral (standard operator) 
     213   ln_traldf_triad =  .false.  !  iso-neutral (triad    operator) 
     214   ! 
     215   !                       !  iso-neutral options:         
     216   ln_traldf_msc   =  .true.   !  Method of Stabilizing Correction (both operators) 
     217   rn_slpmax       =   0.01    !  slope limit                      (both operators) 
     218   ln_triad_iso    =  .false.  !  pure horizontal mixing in ML              (triad only) 
     219   rn_sw_triad     =  1        !  =1 switching triad ; =0 all 4 triads used (triad only) 
     220   ln_botmix_triad =  .false.  !  lateral mixing on bottom                  (triad only) 
     221   ! 
     222   !                       !  Coefficients: 
     223   nn_aht_ijk_t    = 0         !  space/time variation of eddy coef 
     224   !                                !   =-20 (=-30)    read in eddy_induced_velocity_2D.nc (..._3D.nc) file 
     225   !                                !   =  0           constant  
     226   !                                !   = 10 F(k)      =ldf_c1d  
     227   !                                !   = 20 F(i,j)    =ldf_c2d  
     228   !                                !   = 21 F(i,j,t)  =Treguier et al. JPO 1997 formulation 
     229   !                                !   = 30 F(i,j,k)  =ldf_c2d + ldf_c1d 
     230   !                                !   = 31 F(i,j,k,t)=F(local velocity) 
     231   rn_aht_0        = 1000.     !  lateral eddy diffusivity   (lap. operator) [m2/s] 
     232   rn_bht_0        = 1.e+12    !  lateral eddy diffusivity (bilap. operator) [m4/s] 
     233/ 
     234!---------------------------------------------------------------------------------- 
     235&namtra_ldfeiv !   eddy induced velocity param. 
     236!---------------------------------------------------------------------------------- 
     237   ln_ldfeiv     =.false.   ! use eddy induced velocity parameterization 
    213238/ 
    214239!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    235260/ 
    236261!----------------------------------------------------------------------- 
    237 !namdyn_spg    !   surface pressure gradient   (CPP key only) 
    238 !----------------------------------------------------------------------- 
     262&namdyn_spg    !   surface pressure gradient 
     263!----------------------------------------------------------------------- 
     264   ln_dynspg_ts  = .true.  !  split-explicit free surface 
     265/ 
    239266!----------------------------------------------------------------------- 
    240267&namdyn_ldf    !   lateral diffusion on momentum 
    … …  
    274301/ 
    275302!----------------------------------------------------------------------- 
    276 &namsol        !   elliptic solver / island / free surface 
    277 !----------------------------------------------------------------------- 
    278    nn_solv     =      2    !  elliptic solver: =1 preconditioned conjugate gradient (pcg) 
    279    nn_nmin     =    210    !  minimum of iterations for the SOR solver 
    280    rn_sor      =  1.96     !  optimal coefficient for SOR solver (to be adjusted with the domain) 
    281 / 
    282 !----------------------------------------------------------------------- 
    283303&nammpp        !   Massively Parallel Processing                        ("key_mpp_mpi) 
    284304!----------------------------------------------------------------------- 

  • branches/2014/dev_r4650_UKMO10_Tidally_Meaned_Diagnostics/NEMOGCM/CONFIG/GYRE_XIOS/cpp_GYRE_XIOS.fcm

    r4373 r5989  
    1  bld::tool::fppkeys key_dynspg_flt key_ldfslp key_zdftke key_iomput key_mpp_mpi 
     1 bld::tool::fppkeys key_zdftke key_iomput key_mpp_mpi 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.