New URL for NEMO forge!   http://forge.nemo-ocean.eu

Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
This present forge is now archived and remained online for history.
Changeset 6225 for branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG – NEMO

Ignore:
Timestamp:
2016-01-08T10:35:19+01:00 (9 years ago)
Author:
jamesharle
Message:

Update MPP_BDY_UPDATE branch to be consistent with head of trunk

Location:
branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG
Files:
5 deleted
73 edited
5 copied

Legend:

Unmodified
Added
Removed

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/AMM12/EXP00/iodef.xml

    r4695 r6225  
    2525      <file_group id="1ts" output_freq="1ts"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1 time step files --> 
    2626 
    27       <file_group id="1h" output_freq="1h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1h files --> 
     27<!--old      <file_group id="1h" output_freq="1h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> old --> <!-- 1h files -->  
     28   <!-- TMB files --> 
     29      <file_group id="1h" output_freq="1h"  output_level="10" enabled=".TRUE."  >                       
     30 
     31   <file id="file9" name_suffix="_shelftmb_grid_T" description="ocean T grid variables" enabled=".TRUE." > 
     32     <field field_ref="top_temp"           name="votemper_top"   operation="instant" enabled=".TRUE." /> 
     33     <field field_ref="mid_temp"           name="votemper_mid"   operation="instant" enabled=".TRUE." /> 
     34     <field field_ref="bot_temp"           name="votemper_bot"   operation="instant" enabled=".TRUE." /> 
     35     <field field_ref="sshnmasked"         name="sossheig"       operation="instant" enabled=".TRUE." />  
     36     <field field_ref="top_sal"            name="vosaline_top"   operation="instant" enabled=".TRUE." /> 
     37     <field field_ref="mid_sal"            name="vosaline_mid"   operation="instant" enabled=".TRUE." /> 
     38     <field field_ref="bot_sal"            name="vosaline_bot"   operation="instant" enabled=".TRUE." /> 
     39   </file> 
     40 
     41   <file id="file10" name_suffix="_shelftmb_grid_U" description="TMB ocean U grid variables" enabled=".TRUE." > 
     42     <field field_ref="top_u"         name="vozocrtx_top"   operation="instant" /> 
     43     <field field_ref="mid_u"         name="vozocrtx_mid"   operation="instant" /> 
     44     <field field_ref="bot_u"         name="vozocrtx_bot"   operation="instant" /> 
     45     <field field_ref="baro_u"        name="vobtcrtx"       operation="instant" /> 
     46   </file> 
     47 
     48   <file id="file11" name_suffix="_shelftmb_grid_V" description="TMB ocean V grid variables" enabled=".TRUE." > 
     49     <field field_ref="top_v"         name="vomecrty_top"   operation="instant" /> 
     50     <field field_ref="mid_v"         name="vomecrty_mid"   operation="instant" /> 
     51     <field field_ref="bot_v"         name="vomecrty_bot"   operation="instant" /> 
     52     <field field_ref="baro_v"        name="vobtcrty"       operation="instant" /> 
     53   </file> 
     54 
     55      </file_group> 
     56 
    2857      <file_group id="2h" output_freq="2h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 2h files --> 
    2958      <file_group id="3h" output_freq="3h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 3h files -->      
    3059      <file_group id="4h" output_freq="4h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 4h files --> 
    3160      <file_group id="6h" output_freq="6h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 6h files --> 
     61 
     62      <file_group id="25h_mean" output_freq="1d" output_level="10" enabled=".TRUE."> 
     63 
     64 
     65     <file id="file12" name_suffix="_25hourm_grid_T" description="ocean T grid variables, 25h meaned" enabled=".TRUE." > 
     66     <field field_ref="temper25h"   name="votemper"  operation="instant" enabled=".TRUE."/> 
     67     <field field_ref="tempis25h"   name="votempis"  operation="instant" enabled=".TRUE."/> 
     68     <field field_ref="salin25h"    name="vosaline"  operation="instant" enabled=".TRUE."/> 
     69     <field field_ref="ssh25h"      name="sossheig"  operation="instant" enabled=".TRUE."/> 
     70    </file> 
     71 
     72     <file id="file13" name_suffix="_25hourm_grid_U" description="ocean U grid variables, 25h meaned" enabled=".TRUE." > 
     73     <field field_ref="vozocrtx25h" name="vozocrtx"  operation="instant" enabled=".TRUE."/> 
     74    </file> 
     75 
     76     <file id="file14" name_suffix="_25hourm_grid_V" description="ocean V grid variables, 25h meaned" enabled=".TRUE." > 
     77     <field field_ref="vomecrty25h" name="vomecrty"  operation="instant" enabled=".TRUE."/> 
     78    </file> 
     79 
     80     <file id="file15" name_suffix="_25hourm_grid_W" description="ocean W grid variables, 25h meaned" enabled=".TRUE." > 
     81     <field field_ref="vomecrtz25h"          name="vomerctz"  operation="instant" enabled=".TRUE."/> 
     82     <field field_ref="woce"                 name="vovecrtz"  operation="instant" enabled=".TRUE."/> 
     83     <field field_ref="avt25h"               name="votkeavt"  operation="instant" enabled=".TRUE."/> 
     84     <field field_ref="avm25h"               name="votkeavm"  operation="instant" enabled=".TRUE."/> 
     85     <field field_ref="tke25h"               name="votke"  operation="instant" enabled=".TRUE."/> 
     86     <field field_ref="mxln25h"              name="mxln"   operation="instant" enabled=".TRUE."/> 
     87    </file> 
     88      </file_group> 
    3289      
    3390      <file_group id="1d" output_freq="1d"  output_level="10" enabled=".TRUE."> <!-- 1d files --> 
    3491 
    3592   <file id="file1" name_suffix="_grid_T" description="ocean T grid variables" > 
    36      <field field_ref="sst"          name="tos"      long_name="sea_surface_temperature"                       /> 
    37      <field field_ref="sss"          name="sos"      long_name="sea_surface_salinity"                          /> 
    38      <field field_ref="ssh"          name="zos"      long_name="sea_surface_height_above_geoid"                /> 
     93     <field field_ref="sst"          name="tos" /> 
     94     <field field_ref="sss"          name="sos" /> 
     95     <field field_ref="ssh"          name="zos" /> 
    3996   </file> 
    4097 
    4198   <file id="file2" name_suffix="_grid_U" description="ocean U grid variables" > 
    42      <field field_ref="suoce"        name="uos"     long_name="sea_surface_x_velocity"    /> 
     99     <field field_ref="ssu"          name="uos" /> 
    43100   </file> 
    44101    
    45102   <file id="file3" name_suffix="_grid_V" description="ocean V grid variables" > 
    46      <field field_ref="svoce"        name="vos"     long_name="sea_surface_y_velocity"    /> 
    47    </file> 
    48     
    49       </file_group> 
     103     <field field_ref="ssv"          name="vos" /> 
     104   </file> 
     105    
     106      </file_group> 
     107 
    50108      <file_group id="3d" output_freq="3d"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 3d files -->     
    51109 
    … …  
    53111 
    54112   <file id="file4" name_suffix="_grid_T" description="ocean T grid variables" > 
    55      <field field_ref="toce"         name="thetao"   long_name="sea_water_potential_temperature"               /> 
    56      <field field_ref="soce"         name="so"       long_name="sea_water_salinity"                            /> 
    57      <field field_ref="sst"          name="tos"      long_name="sea_surface_temperature"                       /> 
    58      <field field_ref="sst2"         name="tossq"    long_name="square_of_sea_surface_temperature"             /> 
    59      <field field_ref="sss"          name="sos"      long_name="sea_surface_salinity"                          /> 
    60      <field field_ref="ssh"          name="zos"      long_name="sea_surface_height_above_geoid"                /> 
    61      <field field_ref="ssh2"         name="zossq"    long_name="square_of_sea_surface_height_above_geoid"      /> 
    62      <field field_ref="empmr"        name="wfo"      long_name="water_flux_into_sea_water"                     /> 
    63      <field field_ref="qsr"          name="rsntds"   long_name="surface_net_downward_shortwave_flux"           /> 
    64      <field field_ref="qt"           name="tohfls"   long_name="surface_net_downward_total_heat_flux"          /> 
    65      <field field_ref="taum"         /> 
    66      <field field_ref="mldkz5"       /> 
    67      <field field_ref="mldr10_1"     /> 
     113     <field field_ref="toce"         name="thetao" /> 
     114     <field field_ref="soce"         name="so"     /> 
     115     <field field_ref="sst"          name="tos"    /> 
     116     <field field_ref="sst2"         name="tossq"  /> 
     117     <field field_ref="sss"          name="sos"    /> 
     118     <field field_ref="ssh"          name="zos"    /> 
     119     <field field_ref="ssh2"         name="zossq"  /> 
     120     <field field_ref="empmr"        name="wfo"    /> 
     121     <field field_ref="qsr"          name="rsntds" /> 
     122     <field field_ref="qt"           name="tohfls" /> 
     123     <field field_ref="taum"     /> 
     124     <field field_ref="mldkz5"   /> 
     125     <field field_ref="mldr10_1" /> 
    68126   </file> 
    69127    
    70128   <file id="file5" name_suffix="_grid_U" description="ocean U grid variables" > 
    71      <field field_ref="uoce"         name="uo"      long_name="sea_water_x_velocity"      /> 
    72      <field field_ref="suoce"        name="uos"     long_name="sea_surface_x_velocity"    /> 
    73      <field field_ref="utau"         name="tauuo"   long_name="surface_downward_x_stress" /> 
     129     <field field_ref="uoce"         name="uo"    /> 
     130     <field field_ref="ssu"          name="uos"   /> 
     131     <field field_ref="utau"         name="tauuo" /> 
    74132   </file> 
    75133    
    76134   <file id="file6" name_suffix="_grid_V" description="ocean V grid variables" > 
    77      <field field_ref="voce"         name="vo"      long_name="sea_water_y_velocity"      /> 
    78      <field field_ref="svoce"        name="vos"     long_name="sea_surface_y_velocity"    /> 
    79      <field field_ref="vtau"         name="tauvo"   long_name="surface_downward_y_stress" /> 
     135     <field field_ref="voce"         name="vo"    /> 
     136     <field field_ref="ssv"          name="vos"   /> 
     137     <field field_ref="vtau"         name="tauvo" /> 
    80138   </file> 
    81139    
    82140   <file id="file7" name_suffix="_grid_W" description="ocean W grid variables" > 
    83      <field field_ref="woce"         name="wo"      long_name="ocean vertical velocity"         /> 
    84      <field field_ref="avt"          name="difvho"  long_name="ocean_vertical_heat_diffusivity" /> 
     141     <field field_ref="woce"         name="wo"     /> 
     142     <field field_ref="avt"          name="difvho" /> 
    85143   </file> 
    86144    
    … …  
    98156      <file_group id="10y" output_freq="10y" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 10y files --> 
    99157 
     158 
    100159   </file_definition> 
    101160     
    … …  
    107166     
    108167   <axis_definition>   
    109       <axis id="deptht" long_name="Vertical T levels" unit="m" positive="down" /> 
    110       <axis id="depthu" long_name="Vertical U levels" unit="m" positive="down" /> 
    111       <axis id="depthv" long_name="Vertical V levels" unit="m" positive="down" /> 
    112       <axis id="depthw" long_name="Vertical W levels" unit="m" positive="down" /> 
    113       <axis id="nfloat" long_name="Float number"      unit="-"  /> 
    114       <axis id="icbcla" long_name="Iceberg class"     unit="-"  /> 
     168      <axis id="deptht"  long_name="Vertical T levels"  unit="m" positive="down" /> 
     169      <axis id="depthu"  long_name="Vertical U levels"  unit="m" positive="down" /> 
     170      <axis id="depthv"  long_name="Vertical V levels"  unit="m" positive="down" /> 
     171      <axis id="depthw"  long_name="Vertical W levels"  unit="m" positive="down" /> 
     172      <axis id="nfloat"  long_name="Float number"       unit="1"                 /> 
     173      <axis id="icbcla"  long_name="Iceberg class"      unit="1"                 /> 
     174      <axis id="ncatice" long_name="Ice category"       unit="1"                 /> 
     175      <axis id="iax_20C" long_name="20 degC isotherm"   unit="degC"              /> 
     176      <axis id="iax_28C" long_name="28 degC isotherm"   unit="degC"              /> 
    115177   </axis_definition>  
    116178     
    … …  
    126188     <grid id="grid_W_2D" domain_ref="grid_W"/> 
    127189     <grid id="grid_W_3D" domain_ref="grid_W" axis_ref="depthw"/> 
     190     <grid id="gznl_T_2D" domain_ref="gznl"/> 
     191     <grid id="gznl_T_3D" domain_ref="gznl" axis_ref="deptht"/> 
     192     <grid id="gznl_W_3D" domain_ref="gznl" axis_ref="depthw"/> 
    128193    </grid_definition>    
    129194  </context> 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/AMM12/EXP00/namelist_cfg

    r4493 r6225  
    1414   cn_ocerst_in   = "amm12_restart_oce"   !  suffix of ocean restart name (input) 
    1515   cn_ocerst_out  = "restart_oce_out"   !  suffix of ocean restart name (input) 
    16    nn_istate   =       1   !  output the initial state (1) or not (0) 
    1716   nn_stock    =    1296   !  frequency of creation of a restart file (modulo referenced to 1) 
    1817   nn_write    =     144   !  frequency of write in the output file   (modulo referenced to nit000)  
    … …  
    3534&namzgr        !   vertical coordinate 
    3635!----------------------------------------------------------------------- 
    37    ln_zps      = .false.   !  z-coordinate - partial steps   (T/F) 
    38    ln_sco      = .true.    !  s- or hybrid z-s-coordinate    (T/F) 
     36   ln_sco      = .true.    !  s- or hybrid z-s-coordinate 
    3937/ 
    4038!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    5149!----------------------------------------------------------------------- 
    5250   rn_rdt      =   600.    !  time step for the dynamics (and tracer if nn_acc=0) 
    53    rn_rdtmin   =   600.          !  minimum time step on tracers (used if nn_acc=1) 
    54    rn_rdtmax   =   600.          !  maximum time step on tracers (used if nn_acc=1) 
    55    rn_rdth     =   600.          !  depth variation of tracer time step  (used if nn_acc=1) 
    5651   ppglam0     =  999999.0             !  longitude of first raw and column T-point (jphgr_msh = 1) 
    5752   ppgphi0     =  999999.0             ! latitude  of first raw and column T-point (jphgr_msh = 1) 
    … …  
    7368/ 
    7469!----------------------------------------------------------------------- 
    75 &namsplit      !   time splitting parameters                            ("key_dynspg_ts") 
    76 !----------------------------------------------------------------------- 
    77    ln_bt_nn_auto =    .FALSE.          !  Set nn_baro automatically to be just below 
    78                                        !  a user defined maximum courant number (rn_bt_cmax) 
    79    nn_baro       =    30               !  Number of iterations of barotropic mode 
    80 / 
    81 !----------------------------------------------------------------------- 
    8270&namcrs        !   Grid coarsening for dynamics output and/or 
    8371               !   passive tracer coarsened online simulations 
    … …  
    10088   ln_ssr      = .false.   !  Sea Surface Restoring on T and/or S       (T => fill namsbc_ssr) 
    10189   nn_fwb      = 0         !  FreshWater Budget: =0 unchecked 
     90   ln_apr_dyn  = .false.    !  Patm gradient added in ocean & ice Eqs.   (T => fill namsbc_apr ) 
     91   ln_traqsr   = .false.   !  Light penetration (T) or not (F) 
     92 
    10293/ 
    10394!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    130121/ 
    131122!----------------------------------------------------------------------- 
    132 &namsbc_cpl    !   coupled ocean/atmosphere model                       ("key_coupled") 
     123&namsbc_cpl    !   coupled ocean/atmosphere model                       ("key_oasis3") 
    133124!----------------------------------------------------------------------- 
    134125/ 
    … …  
    136127&namtra_qsr    !   penetrative solar radiation 
    137128!----------------------------------------------------------------------- 
    138    ln_traqsr   = .false.   !  Light penetration (T) or not (F) 
    139129   nn_chldta   =      0    !  RGB : Chl data (=1) or cst value (=0) 
    140130/ 
    … …  
    159149!          !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
    160150!          !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
    161    sn_apr      = 'patm'    ,         -1        ,'somslpre',    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,  ''      ,   '' , '' 
     151   sn_apr     = 'amm12_mslp'     ,          1        ,  'p_msl'      , .false.      , .false. , 'daily'   ,  ''      ,  '' , '' 
    162152 
    163    cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the bulk files 
    164    rn_pref     = 101000._wp !  reference atmospheric pressure   [N/m2]/ 
     153   cn_dir      = './fluxes/' !  root directory for the location of the bulk files 
     154   rn_pref     = 101000.    !  reference atmospheric pressure   [N/m2]/ 
    165155   ln_ref_apr  = .false.    !  ref. pressure: global mean Patm (T) or a constant (F) 
    166    ln_apr_obc  = .false.    !  inverse barometer added to OBC ssh data 
     156   ln_apr_obc  = .true.    !  inverse barometer added to OBC ssh data 
    167157/ 
    168158!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    193183   rn_shlat    =     0     !  shlat = 0  !  0 < shlat < 2  !  shlat = 2  !  2 < shlat 
    194184                           !  free slip  !   partial slip  !   no slip   ! strong slip 
    195 / 
    196 !----------------------------------------------------------------------- 
    197 &namcla        !   cross land advection 
    198 !----------------------------------------------------------------------- 
    199 / 
    200 !----------------------------------------------------------------------- 
    201 &namobc        !   open boundaries parameters                           ("key_obc") 
    202 !----------------------------------------------------------------------- 
    203185/ 
    204186!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    264246/ 
    265247!----------------------------------------------------------------------- 
    266 &nambbc        !   bottom temperature boundary condition 
    267 !----------------------------------------------------------------------- 
    268    ln_trabbc   = .false.   !  Apply a geothermal heating at the ocean bottom 
     248&nambbc        !   bottom temperature boundary condition                (default: NO) 
     249!----------------------------------------------------------------------- 
    269250/ 
    270251!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    280261&namtra_adv    !   advection scheme for tracer 
    281262!----------------------------------------------------------------------- 
     263   ln_traadv_fct =  .true.   !  FCT scheme 
     264      nn_fct_h   =  2               !  =2/4, horizontal 2nd / 4th order  
     265      nn_fct_v   =  2               !  =2/4, vertical   2nd / COMPACT 4th order  
     266      nn_fct_zts =  0               !  >=1,  2nd order FCT scheme with vertical sub-timestepping 
     267      !                             !        (number of sub-timestep = nn_fct_zts) 
    282268/ 
    283269!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    288274&namtra_ldf    !   lateral diffusion scheme for tracers 
    289275!---------------------------------------------------------------------------------- 
    290    ln_traldf_hor    =  .true.   !  horizontal (geopotential)   (needs "key_ldfslp" when ln_sco=T) 
    291    ln_traldf_iso    =  .false.  !  iso-neutral                 (needs "key_ldfslp") 
    292    rn_aeiv_0        =     0.    !  eddy induced velocity coefficient [m2/s] 
    293    rn_aht_0         =    50.    !  horizontal eddy diffusivity for tracers [m2/s] 
     276   !                       !  Operator type: 
     277   ln_traldf_lap   =  .true.   !    laplacian operator 
     278   ln_traldf_blp   =  .false.  !  bilaplacian operator 
     279   !                       !  Direction of action: 
     280   ln_traldf_lev   =  .false.  !  iso-level 
     281   ln_traldf_hor   =  .true.   !  horizontal (geopotential) 
     282   ln_traldf_iso   =  .false.  !  iso-neutral 
     283   ln_traldf_triad =  .false.  !  iso-neutral using Griffies triads 
     284   ! 
     285   !                       !  iso-neutral options:         
     286   ln_traldf_msc   =  .true.   !  Method of Stabilizing Correction (both operators) 
     287   rn_slpmax       =   0.01    !  slope limit                      (both operators) 
     288   ln_triad_iso    =  .false.  !  pure horizontal mixing in ML     (triad only) 
     289   rn_sw_triad     =  1        !  =1 switching triad ; =0 all 4 triads used (triad only) 
     290   ln_botmix_triad =  .false.  !  lateral mixing on bottom         (triad only) 
     291   ! 
     292   !                       !  Coefficients: 
     293   nn_aht_ijk_t    = 0         !  space/time variation of eddy coef 
     294   !                                !   =-20 (=-30)    read in eddy_diffusivity_2D.nc (..._3D.nc) file 
     295   !                                !   =  0           constant  
     296   !                                !   = 10 F(k)      =ldf_c1d  
     297   !                                !   = 20 F(i,j)    =ldf_c2d  
     298   !                                !   = 21 F(i,j,t)  =Treguier et al. JPO 1997 formulation 
     299   !                                !   = 30 F(i,j,k)  =ldf_c2d + ldf_c1d 
     300   !                                !   = 31 F(i,j,k,t)=F(local velocity) 
     301   rn_aht_0        =   50.     !  lateral eddy diffusivity   (lap. operator) [m2/s] 
     302   rn_bht_0        = 1.e+12    !  lateral eddy diffusivity (bilap. operator) [m4/s] 
     303/ 
     304!---------------------------------------------------------------------------------- 
     305&namtra_ldfeiv !   eddy induced velocity param. 
     306!---------------------------------------------------------------------------------- 
     307   ln_ldfeiv     =.false.   ! use eddy induced velocity parameterization 
    294308/ 
    295309!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    305319&namdyn_vor    !   option of physics/algorithm (not control by CPP keys) 
    306320!----------------------------------------------------------------------- 
     321   ln_dynvor_ene = .false. !  enstrophy conserving scheme 
     322   ln_dynvor_ens = .false. !  energy conserving scheme 
     323   ln_dynvor_mix = .false. !  mixed scheme 
     324   ln_dynvor_een = .true.  !  energy & enstrophy scheme 
     325      nn_een_e3f = 1             !  e3f = masked averaging of e3t divided by 4 (=0) or by the sum of mask (=1) 
    307326/ 
    308327!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    313332/ 
    314333!----------------------------------------------------------------------- 
    315 !namdyn_spg    !   surface pressure gradient   (CPP key only) 
    316 !----------------------------------------------------------------------- 
    317 !                          !  explicit free surface                     ("key_dynspg_exp") 
    318 !                          !  filtered free surface                     ("key_dynspg_flt") 
    319 !                          !  split-explicit free surface               ("key_dynspg_ts") 
    320  
     334&namdyn_spg    !   surface pressure gradient  
     335!----------------------------------------------------------------------- 
     336   ln_dynspg_ts = .true.    ! split-explicit free surface 
     337      ln_bt_auto    = .false.  ! Number of sub-step defined from: 
     338         nn_baro       = 30       ! =F : the number of sub-step in rn_rdt seconds 
     339/ 
    321340!----------------------------------------------------------------------- 
    322341&namdyn_ldf    !   lateral diffusion on momentum 
    323342!----------------------------------------------------------------------- 
    324343   !                       !  Type of the operator : 
    325    ln_dynldf_bilap  =  .true.   !  bilaplacian operator 
    326    ln_dynldf_lap    =  .false.  !  bilaplacian operator 
     344   !                           !  no diffusion: set ln_dynldf_lap=..._blp=F  
     345   ln_dynldf_lap =  .false.    !    laplacian operator 
     346   ln_dynldf_blp =  .true.     !  bilaplacian operator 
    327347   !                       !  Direction of action  : 
    328    ln_dynldf_level  =  .true.   !  iso-level 
    329    ln_dynldf_hor    =  .false.  !  horizontal (geopotential)            (require "key_ldfslp" in s-coord.) 
    330                            !  Coefficient 
    331    rn_ahm_0_lap     = 60.0      !  horizontal laplacian eddy viscosity   [m2/s] 
    332    rn_ahm_0_blp     = -1.0e+10  !  horizontal bilaplacian eddy viscosity [m4/s] 
     348   ln_dynldf_lev =  .true.     !  iso-level 
     349   ln_dynldf_hor =  .false.    !  horizontal (geopotential) 
     350   ln_dynldf_iso =  .false.    !  iso-neutral 
     351   !                       !  Coefficient 
     352   nn_ahm_ijk_t  = 0           !  space/time variation of eddy coef 
     353   !                                !  =-30  read in eddy_viscosity_3D.nc file 
     354   !                                !  =-20  read in eddy_viscosity_2D.nc file 
     355   !                                !  =  0  constant  
     356   !                                !  = 10  F(k)=c1d 
     357   !                                !  = 20  F(i,j)=F(grid spacing)=c2d 
     358   !                                !  = 30  F(i,j,k)=c2d*c1d 
     359   !                                !  = 31  F(i,j,k)=F(grid spacing and local velocity) 
     360   rn_ahm_0      =     60.     !  horizontal laplacian eddy viscosity   [m2/s] 
     361   rn_ahm_b      =      0.     !  background eddy viscosity for ldf_iso [m2/s] 
     362   rn_bhm_0      = 1.0e+10     !  horizontal bilaplacian eddy viscosity [m4/s] 
     363   ! 
     364   ! Caution in 20 and 30 cases the coefficient have to be given for a 1 degree grid (~111km) 
    333365/ 
    334366!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    348380!----------------------------------------------------------------------- 
    349381/ 
    350 !------------------------------------------------------------------------ 
    351 &namzdf_kpp    !   K-Profile Parameterization dependent vertical mixing  ("key_zdfkpp", and optionally: 
    352 !------------------------------------------------------------------------ "key_kppcustom" or "key_kpplktb") 
    353 / 
    354382!----------------------------------------------------------------------- 
    355383&namzdf_gls                !   GLS vertical diffusion                   ("key_zdfgls") 
    356384!----------------------------------------------------------------------- 
    357385   rn_charn =  100000.     !  Charnock constant for wb induced roughness length 
     386   nn_z0_met = 1           !  Method for surface roughness computation (0/1/2) 
    358387/ 
    359388!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    365394!----------------------------------------------------------------------- 
    366395   ln_tmx_itf  = .FALSE.   !  ITF specific parameterisation 
    367 / 
    368 !----------------------------------------------------------------------- 
    369 &namsol        !   elliptic solver / island / free surface 
    370 !----------------------------------------------------------------------- 
    371396/ 
    372397!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    394419&namptr       !   Poleward Transport Diagnostic 
    395420!----------------------------------------------------------------------- 
    396    ln_diaznl  = .false.    !  Add zonal means and meridional stream functions 
    397    ln_subbas  = .false.    !  Atlantic/Pacific/Indian basins computation (T) or not 
    398                            !  (orca configuration only, need input basins mask file named "subbasins.nc" 
    399    ln_ptrcomp = .false.    !  Add decomposition : overturning 
    400 / 
    401 !----------------------------------------------------------------------- 
     421/ 
    402422&namhsb       !  Heat and salt budgets 
    403423!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    424444/ 
    425445!----------------------------------------------------------------------- 
    426 &namdyn_nept  !   Neptune effect (simplified: lateral and vertical diffusions removed) 
    427 !----------------------------------------------------------------------- 
    428 / 
     446&nam_diatmb  !  Top Middle Bottom Output 
     447!----------------------------------------------------------------------- 
     448   ln_diatmb  = .true.    !  Choose Top Middle and Bottom output or not 
     449/ 
     450!----------------------------------------------------------------------- 
     451&nam_dia25h  !  25h Mean Output 
     452!----------------------------------------------------------------------- 
     453   ln_dia25h  = .true.    ! Choose 25h mean output or not 
     454/ 
     455 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/AMM12/cpp_AMM12.fcm

    r4245 r6225  
    1  bld::tool::fppkeys  key_bdy key_tide key_dynspg_ts key_ldfslp  key_zdfgls  key_vvl key_diainstant key_mpp_mpi key_iomput 
     1 bld::tool::fppkeys  key_bdy key_tide key_zdfgls key_diainstant key_mpp_mpi key_iomput 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/C1D_PAPA/EXP00/iodef.xml

    r4667 r6225  
    3434     <field field_ref="empmr"        name="sowaflup"  /> 
    3535     <field field_ref="qsr"          name="soshfldo"  /> 
    36           <field field_ref="saltflx"      name="sosfldow"  /> 
     36      <field field_ref="saltflx"      name="sosfldow"  /> 
    3737     <field field_ref="qt"           name="sohefldo"  /> 
    3838     <field field_ref="mldr10_1"     name="somxl010"  /> 
    3939     <field field_ref="mldkz5"       name="somixhgt"  /> 
    40         </file> 
     40    </file> 
    4141    
    4242   <file id="file2" name_suffix="_grid_U" description="ocean U grid variables" > 
    4343          <field field_ref="uoce"         name="vozocrtx"  /> 
    4444          <field field_ref="utau"         name="sozotaux"  /> 
    45         </file> 
     45    </file> 
    4646    
    4747   <file id="file3" name_suffix="_grid_V" description="ocean V grid variables" > 
    4848          <field field_ref="voce"         name="vomecrty"  />  
    4949          <field field_ref="vtau"         name="sometauy"  />  
    50         </file> 
     50    </file> 
    5151    
    5252   <file id="file4" name_suffix="_grid_W" description="ocean W grid variables" > 
    … …  
    5454          <field field_ref="avt"          name="votkeavt" /> 
    5555          <field field_ref="aht2d"        name="soleahtw" /> 
    56         </file> 
     56    </file> 
    5757      </file_group> 
    5858 
    … …  
    7272     <field field_ref="empmr"        name="sowaflup"  /> 
    7373     <field field_ref="qsr"          name="soshfldo"  /> 
    74           <field field_ref="saltflx"      name="sosfldow"  /> 
     74      <field field_ref="saltflx"      name="sosfldow"  /> 
    7575     <field field_ref="qt"           name="sohefldo"  /> 
    7676     <field field_ref="mldr10_1"     name="somxl010"  /> 
    7777     <field field_ref="mldkz5"       name="somixhgt"  /> 
    78         </file> 
     78    </file> 
    7979    
    8080   <file id="file6" name_suffix="_grid_U" description="ocean U grid variables" > 
    8181          <field field_ref="uoce"         name="vozocrtx"  /> 
    8282          <field field_ref="utau"         name="sozotaux"  /> 
    83         </file> 
     83    </file> 
    8484    
    8585   <file id="file7" name_suffix="_grid_V" description="ocean V grid variables" > 
    8686          <field field_ref="voce"         name="vomecrty"  />  
    8787          <field field_ref="vtau"         name="sometauy"  />  
    88         </file> 
     88    </file> 
    8989    
    9090   <file id="file8" name_suffix="_grid_W" description="ocean W grid variables" > 
    … …  
    9292          <field field_ref="avt"          name="votkeavt" /> 
    9393          <field field_ref="aht2d"        name="soleahtw" /> 
    94         </file> 
     94    </file> 
    9595      </file_group> 
    9696 
    … …  
    9898      <file_group id="3d" output_freq="3d"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 3d files -->     
    9999      <file_group id="5d" output_freq="5d"  output_level="10" enabled=".TRUE."/>  <!-- 5d files -->    
     100 
    100101      <file_group id="1m" output_freq="1mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real monthly files --> 
    101102      <file_group id="2m" output_freq="2mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 2m files --> 
    … …  
    118119     
    119120   <axis_definition>   
    120       <axis id="deptht" long_name="Vertical T levels" unit="m" positive="down" /> 
    121       <axis id="depthu" long_name="Vertical U levels" unit="m" positive="down" /> 
    122       <axis id="depthv" long_name="Vertical V levels" unit="m" positive="down" /> 
    123       <axis id="depthw" long_name="Vertical W levels" unit="m" positive="down" /> 
    124       <axis id="nfloat" long_name="Float number"      unit="-"  /> 
    125       <axis id="icbcla" long_name="Iceberg class"     unit="-"  /> 
     121      <axis id="deptht"  long_name="Vertical T levels"  unit="m" positive="down" /> 
     122      <axis id="depthu"  long_name="Vertical U levels"  unit="m" positive="down" /> 
     123      <axis id="depthv"  long_name="Vertical V levels"  unit="m" positive="down" /> 
     124      <axis id="depthw"  long_name="Vertical W levels"  unit="m" positive="down" /> 
     125      <axis id="nfloat"  long_name="Float number"       unit="1"                 /> 
     126      <axis id="icbcla"  long_name="Iceberg class"      unit="1"                 /> 
     127      <axis id="ncatice" long_name="Ice category"       unit="1"                 /> 
     128      <axis id="iax_20C" long_name="20 degC isotherm"   unit="degC"              /> 
     129      <axis id="iax_28C" long_name="28 degC isotherm"   unit="degC"              /> 
    126130   </axis_definition>  
    127131     

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/C1D_PAPA/EXP00/namelist_cfg

    r4667 r6225  
    3030&namzgr        !   vertical coordinate 
    3131!----------------------------------------------------------------------- 
     32   ln_zps      = .true.    !  z-coordinate - partial steps 
    3233/ 
    3334!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    4142   rn_bathy    = 4198.     !  value of the bathymetry. if (=0) bottom flat at jpkm1 
    4243   nn_msh      =    0      !  create (=1) a mesh file or not (=0) 
    43    rn_rdt      =  360.     !  time step for the dynamics (and tracer if nn_acc=0) 
    44    rn_rdtmin   =  360.           !  minimum time step on tracers (used if nn_acc=1) 
    45    rn_rdtmax   =  360.           !  maximum time step on tracers (used if nn_acc=1) 
     44   rn_rdt      =  360.     !  time step for the dynamics  
    4645   jphgr_msh   =       1                 !  type of horizontal mesh 
    4746   ppglam0     =    -150.0               !  longitude of first raw and column T-point (jphgr_msh = 1) 
    … …  
    6463/ 
    6564!----------------------------------------------------------------------- 
    66 &namsplit      !   time splitting parameters                            ("key_dynspg_ts") 
    67 !----------------------------------------------------------------------- 
    68 / 
    69 !----------------------------------------------------------------------- 
    7065&namcrs        !   Grid coarsening for dynamics output and/or 
    7166               !   passive tracer coarsened online simulations 
    … …  
    10297&namsbc_ana    !   analytical surface boundary condition 
    10398!----------------------------------------------------------------------- 
    104    nn_tau000   =   100     !  gently increase the stress over the first ntau_rst time-steps 
    105    rn_utau0    =   0.1e0   !  uniform value for the i-stress 
    10699/ 
    107100!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    126119   sn_prec     = 'forcing_PAPASTATION_1h' ,         1         , 'prec'    ,   .false.    , .false. , 'yearly' , '' , '', '' 
    127120   sn_snow     = 'forcing_PAPASTATION_1h' ,         1         , 'snow'    ,   .false.    , .false. , 'yearly' , '' , '', '' 
    128    ln_2m         = .true.    !  air temperature and humidity referenced at 2m (T) instead 10m (F) 
     121   rn_zqt      =  2.    !  air temperature and humidity referenced at 2m (T) instead 10m (F) 
    129122/ 
    130123!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    133126/ 
    134127!----------------------------------------------------------------------- 
    135 &namsbc_cpl    !   coupled ocean/atmosphere model                       ("key_coupled") 
     128&namsbc_cpl    !   coupled ocean/atmosphere model                       ("key_oasis3") 
    136129!----------------------------------------------------------------------- 
    137130/ 
    … …  
    143136&namtra_qsr    !   penetrative solar radiation 
    144137!----------------------------------------------------------------------- 
     138!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
     139!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
     140   sn_chl      ='chlorophyll_PAPASTATION', -1    , 'CHLA'    ,   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , '' 
    145141/ 
    146142!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    174170/ 
    175171!----------------------------------------------------------------------- 
    176 &namcla        !   cross land advection 
    177 !----------------------------------------------------------------------- 
    178 / 
    179 !----------------------------------------------------------------------- 
    180 &namobc        !   open boundaries parameters                           ("key_obc") 
    181 !----------------------------------------------------------------------- 
    182 / 
    183 !----------------------------------------------------------------------- 
    184172&namagrif      !  AGRIF zoom                                            ("key_agrif") 
    185173!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    207195/ 
    208196!----------------------------------------------------------------------- 
    209 &nambbc        !   bottom temperature boundary condition 
    210 !----------------------------------------------------------------------- 
    211    ln_trabbc   = .false.   !  Apply a geothermal heating at the ocean bottom 
    212    nn_geoflx   =    0      !  geothermal heat flux: = 0 no flux 
     197&nambbc        !   bottom temperature boundary condition                (default: NO) 
     198!----------------------------------------------------------------------- 
    213199/ 
    214200!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    219205&nameos        !   ocean physical parameters 
    220206!----------------------------------------------------------------------- 
     207   nn_eos      =  0      !  type of equation of state and Brunt-Vaisala frequency 
     208                                 !  =-1, TEOS-10 
     209                                 !  = 0, EOS-80 
     210                                 !  = 1, S-EOS   (simplified eos) 
     211   ln_useCT    = .false. ! use of Conservative Temp. ==> surface CT converted in Pot. Temp. in sbcssm 
    221212/ 
    222213!----------------------------------------------------------------------- 
    223214&namtra_adv    !   advection scheme for tracer 
    224215!----------------------------------------------------------------------- 
     216! C1D : no advection scheme  
    225217/ 
    226218!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    228220!----------------------------------------------------------------------- 
    229221/ 
    230 !---------------------------------------------------------------------------------- 
     222!----------------------------------------------------------------------- 
    231223&namtra_ldf    !   lateral diffusion scheme for tracers 
    232 !---------------------------------------------------------------------------------- 
    233 !---------------------------------------------------------------------------------- 
    234    ln_traldf_hor    =  .true.   !  horizontal (geopotential)   (needs "key_ldfslp" when ln_sco=T) 
    235    ln_traldf_iso    =  .false.  !  iso-neutral                 (needs "key_ldfslp") 
    236    rn_aeiv_0        =     0.    !  eddy induced velocity coefficient [m2/s] 
    237    rn_aht_0         =     0.    !  horizontal eddy diffusivity for tracers [m2/s] 
     224!----------------------------------------------------------------------- 
     225! C1D : no lateral diffusion   
     226/ 
     227!----------------------------------------------------------------------- 
     228&namtra_ldfeiv !   eddy induced velocity param. 
     229!----------------------------------------------------------------------- 
     230! C1D : no eiv   
    238231/ 
    239232!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    241234!----------------------------------------------------------------------- 
    242235   ln_tradmp   =  .false.  !  add a damping termn (T) or not (F) 
    243    nn_zdmp     =   -1      !  vertical   shape =0    damping throughout the water column 
    244    nn_file     =    1      !  create a damping.coeff NetCDF file (=1) or not (=0) 
    245236/ 
    246237!----------------------------------------------------------------------- 
    247238&namdyn_adv    !   formulation of the momentum advection 
    248239!----------------------------------------------------------------------- 
     240! C1D : no advection scheme  
    249241/ 
    250242!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    257249/ 
    258250!----------------------------------------------------------------------- 
     251&namc1d_dyndmp !   U & V newtonian damping                              ("key_c1d") 
     252!----------------------------------------------------------------------- 
     253/ 
     254!----------------------------------------------------------------------- 
    259255&namdyn_hpg    !   Hydrostatic pressure gradient option 
    260256!----------------------------------------------------------------------- 
    261257/ 
    262258!----------------------------------------------------------------------- 
    263 !namdyn_spg    !   surface pressure gradient   (CPP key only) 
    264 !----------------------------------------------------------------------- 
     259&namdyn_spg    !   surface pressure gradient                            (default: NO spg) 
     260!----------------------------------------------------------------------- 
     261/ 
    265262!----------------------------------------------------------------------- 
    266263&namdyn_ldf    !   lateral diffusion on momentum 
    … …  
    271268&namzdf        !   vertical physics 
    272269!----------------------------------------------------------------------- 
    273 !   rn_avm0     =   5.0e-6  !rbb 1.2e-4  !  vertical eddy viscosity   [m2/s]          (background Kz if not "key_zdfcst") 
    274 !   rn_avt0     =   5.0e-6  !rbb 1.2e-5  !  vertical eddy diffusivity [m2/s]          (background Kz if not "key_zdfcst") 
    275    ln_zdfevd   = .false. !rbb .true.    !  enhanced vertical diffusion (evd) (T) or not (F) 
     270   ln_zdfevd   = .false.        !  enhanced vertical diffusion (evd) (T) or not (F) 
    276271/ 
    277272!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    283278!----------------------------------------------------------------------- 
    284279/ 
    285 !------------------------------------------------------------------------ 
    286 &namzdf_kpp    !   K-Profile Parameterization dependent vertical mixing  ("key_zdfkpp", and optionally: 
    287 !------------------------------------------------------------------------ "key_kppcustom" or "key_kpplktb") 
    288 / 
    289280!----------------------------------------------------------------------- 
    290281&namzdf_gls                !   GLS vertical diffusion                   ("key_zdfgls") 
    291282!----------------------------------------------------------------------- 
    292    rn_clim_galp  = 0.267   !  galperin limit 
    293283/ 
    294284!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    300290!----------------------------------------------------------------------- 
    301291   ln_tmx_itf  = .false.   !  ITF specific parameterisation 
    302 / 
    303 !----------------------------------------------------------------------- 
    304 &namsol        !   elliptic solver / island / free surface 
    305 !----------------------------------------------------------------------- 
    306    nn_solv     =      2    !  elliptic solver: =1 preconditioned conjugate gradient (pcg) 
    307    nn_nmin     =    210    !  minimum of iterations for the SOR solver 
    308    rn_sor      =  1.96     !  optimal coefficient for SOR solver (to be adjusted with the domain) 
    309292/ 
    310293!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    356339!----------------------------------------------------------------------- 
    357340/ 
    358 !----------------------------------------------------------------------- 
    359 &namdyn_nept  !   Neptune effect (simplified: lateral and vertical diffusions removed) 
    360 !----------------------------------------------------------------------- 
    361    ln_neptramp       = .false.  ! ramp down Neptune velocity in shallow water 
    362 / 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/GYRE/EXP00/iodef.xml

    r4245 r6225  
    4242     <field field_ref="empmr"        name="sowaflup"  /> 
    4343     <field field_ref="qsr"          name="soshfldo"  /> 
    44           <field field_ref="saltflx"      name="sosfldow"  /> 
     44      <field field_ref="saltflx"      name="sosfldow"  /> 
    4545     <field field_ref="qt"           name="sohefldo"  /> 
    4646     <field field_ref="mldr10_1"     name="somxl010"  /> 
    4747     <field field_ref="mldkz5"       name="somixhgt"  /> 
    48            <!-- variables available with MLE 
    49           <field field_ref="Lf_NHpf"    name="Lf_NHpf"  long_name="MLE:_Lf=NH/f"     /> 
    50       --> 
    51        </file> 
     48    </file> 
    5249    
    5350   <file id="file2" name_suffix="_grid_U" description="ocean U grid variables" > 
    5451          <field field_ref="uoce"         name="vozocrtx"  /> 
    5552          <field field_ref="utau"         name="sozotaux"  /> 
    56           <!-- variables available with MLE 
    57           <field field_ref="psiu_mle"     name="psiu_mle"  long_name="MLE_streamfunction_along_i-axis" /> 
    58      --> 
    59         </file> 
     53    </file> 
    6054    
    6155   <file id="file3" name_suffix="_grid_V" description="ocean V grid variables" > 
    6256          <field field_ref="voce"         name="vomecrty"  />  
    6357          <field field_ref="vtau"         name="sometauy"  />  
    64           <!-- variables available with MLE 
    65           <field field_ref="psiv_mle"     name="psiv_mle"  long_name="MLE_streamfunction_along_j-axis" /> 
    66      --> 
    67         </file> 
     58    </file> 
    6859    
    6960   <file id="file4" name_suffix="_grid_W" description="ocean W grid variables" > 
    … …  
    7162          <field field_ref="avt"          name="votkeavt" /> 
    7263          <field field_ref="aht2d"        name="soleahtw" /> 
    73         </file> 
     64    </file> 
    7465 
    7566      </file_group> 
    … …  
    9586     
    9687   <axis_definition>   
    97       <axis id="deptht" long_name="Vertical T levels" unit="m" positive="down" /> 
    98       <axis id="depthu" long_name="Vertical U levels" unit="m" positive="down" /> 
    99       <axis id="depthv" long_name="Vertical V levels" unit="m" positive="down" /> 
    100       <axis id="depthw" long_name="Vertical W levels" unit="m" positive="down" /> 
    101       <axis id="nfloat" long_name="Float number"      unit="-"  /> 
    102       <axis id="icbcla" long_name="Iceberg class"     unit="-"  /> 
     88      <axis id="deptht"  long_name="Vertical T levels"  unit="m" positive="down" /> 
     89      <axis id="depthu"  long_name="Vertical U levels"  unit="m" positive="down" /> 
     90      <axis id="depthv"  long_name="Vertical V levels"  unit="m" positive="down" /> 
     91      <axis id="depthw"  long_name="Vertical W levels"  unit="m" positive="down" /> 
     92      <axis id="nfloat"  long_name="Float number"       unit="1"                 /> 
     93      <axis id="icbcla"  long_name="Iceberg class"      unit="1"                 /> 
     94      <axis id="ncatice" long_name="Ice category"       unit="1"                 /> 
     95      <axis id="iax_20C" long_name="20 degC isotherm"   unit="degC"              /> 
     96      <axis id="iax_28C" long_name="28 degC isotherm"   unit="degC"              /> 
    10397   </axis_definition>  
    10498     

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/GYRE/EXP00/namelist_cfg

    r4370 r6225  
    1111   nn_stock    =    4320   !  frequency of creation of a restart file (modulo referenced to 1) 
    1212   nn_write    =      60   !  frequency of write in the output file   (modulo referenced to nn_it000) 
     13 
     14   ln_clobber  = .true.    !  clobber (overwrite) an existing file 
     15 
    1316/ 
    1417!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    2932&namzgr        !   vertical coordinate 
    3033!----------------------------------------------------------------------- 
    31    ln_zco      = .true.    !  z-coordinate - full    steps   (T/F)      ("key_zco" may also be defined) 
    32    ln_zps      = .false.   !  z-coordinate - partial steps   (T/F) 
     34   ln_zco      = .true.    !  z-coordinate - full    steps 
     35   ln_linssh   = .true.    !  linear free surface 
    3336/ 
    3437!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    4043!----------------------------------------------------------------------- 
    4144   nn_bathy    =    0      !  compute (=0) or read (=1) the bathymetry file 
    42    rn_rdt      = 7200.     !  time step for the dynamics (and tracer if nn_acc=0) 
    43    rn_rdtmin   = 7200.           !  minimum time step on tracers (used if nn_acc=1) 
    44    rn_rdtmax   = 7200.           !  maximum time step on tracers (used if nn_acc=1) 
     45   rn_rdt      = 7200.     !  time step for the dynamics  
    4546   jphgr_msh   =       5                 !  type of horizontal mesh 
    4647   ppglam0     =       0.0               !  longitude of first raw and column T-point (jphgr_msh = 1) 
    … …  
    6364/ 
    6465!----------------------------------------------------------------------- 
    65 &namsplit      !   time splitting parameters                            ("key_dynspg_ts") 
    66 !----------------------------------------------------------------------- 
    67 / 
    68 !----------------------------------------------------------------------- 
    6966&namcrs        !   Grid coarsening for dynamics output and/or 
    7067               !   passive tracer coarsened online simulations 
    … …  
    8279!----------------------------------------------------------------------- 
    8380   nn_fsbc     = 1         !  frequency of surface boundary condition computation 
    84                            !     (also = the frequency of sea-ice model call) 
     81   !                       !     (also = the frequency of sea-ice model call) 
    8582   ln_ana      = .true.    !  analytical formulation                    (T => fill namsbc_ana ) 
    8683   ln_blk_core = .false.   !  CORE bulk formulation                     (T => fill namsbc_core) 
    … …  
    113110/ 
    114111!----------------------------------------------------------------------- 
    115 &namsbc_cpl    !   coupled ocean/atmosphere model                       ("key_coupled") 
     112&namsbc_cpl    !   coupled ocean/atmosphere model                       ("key_oasis3") 
    116113!----------------------------------------------------------------------- 
    117114/ 
    … …  
    153150/ 
    154151!----------------------------------------------------------------------- 
    155 &namcla        !   cross land advection 
    156 !----------------------------------------------------------------------- 
    157 / 
    158 !----------------------------------------------------------------------- 
    159 &namobc        !   open boundaries parameters                           ("key_obc") 
    160 !----------------------------------------------------------------------- 
    161 / 
    162 !----------------------------------------------------------------------- 
    163152&namagrif      !  AGRIF zoom                                            ("key_agrif") 
    164153!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    198187&nameos        !   ocean physical parameters 
    199188!----------------------------------------------------------------------- 
    200    nn_eos      =   2       !  type of equation of state and Brunt-Vaisala frequency 
     189   nn_eos      =  0       !  type of equation of state and Brunt-Vaisala frequency 
     190                                 !  =-1, TEOS-10  
     191                                 !  = 0, EOS-80  
     192                                 !  = 1, S-EOS   (simplified eos) 
     193   ln_useCT    = .false.  ! use of Conservative Temp. ==> surface CT converted in Pot. Temp. in sbcssm 
     194   !                             ! 
     195   !                      ! S-EOS coefficients : 
     196   !                             !  rd(T,S,Z)*rau0 = -a0*(1+.5*lambda*dT+mu*Z+nu*dS)*dT+b0*dS 
     197   rn_a0       =  1.6550e-1      !  thermal expension coefficient (nn_eos= 1) 
     198   rn_b0       =  7.6554e-1      !  saline  expension coefficient (nn_eos= 1) 
     199   rn_lambda1  =  5.9520e-2      !  cabbeling coeff in T^2  (=0 for linear eos) 
     200   rn_lambda2  =  7.4914e-4      !  cabbeling coeff in S^2  (=0 for linear eos) 
     201   rn_mu1      =  1.4970e-4      !  thermobaric coeff. in T (=0 for linear eos) 
     202   rn_mu2      =  1.1090e-5      !  thermobaric coeff. in S (=0 for linear eos) 
     203   rn_nu       =  2.4341e-3      !  cabbeling coeff in T*S  (=0 for linear eos) 
     204!!org GYRE   rn_alpha    =   2.0e-4  !  thermal expension coefficient (nn_eos= 1 or 2) 
     205!!org GYRE   rn_beta     =   7.7e-4  !  saline  expension coefficient (nn_eos= 2) 
     206!!org  caution  now a0 = alpha / rau0   with rau0 = 1026 
    201207/ 
    202208!----------------------------------------------------------------------- 
    203209&namtra_adv    !   advection scheme for tracer 
    204210!----------------------------------------------------------------------- 
    205    ln_traadv_msc_ups=  .false.  !  use upstream scheme within muscl  
     211   ln_traadv_fct =  .true.   !  FCT scheme 
     212      nn_fct_h   =  2               !  =2/4, horizontal 2nd / 4th order  
     213      nn_fct_v   =  2               !  =2/4, vertical   2nd / COMPACT 4th order  
     214      nn_fct_zts =  0               !  >=1,  2nd order FCT scheme with vertical sub-timestepping 
     215      !                             !        (number of sub-timestep = nn_fct_zts) 
    206216/ 
    207217!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    212222&namtra_ldf    !   lateral diffusion scheme for tracers 
    213223!---------------------------------------------------------------------------------- 
    214    rn_aeiv_0        =     0.    !  eddy induced velocity coefficient [m2/s] 
    215    rn_aht_0         =  1000.    !  horizontal eddy diffusivity for tracers [m2/s] 
     224   !                       !  Operator type: 
     225   ln_traldf_lap   =  .true.   !    laplacian operator 
     226   ln_traldf_blp   =  .false.  !  bilaplacian operator 
     227   !                       !  Direction of action: 
     228   ln_traldf_lev   =  .false.  !  iso-level 
     229   ln_traldf_hor   =  .false.  !  horizontal (geopotential) 
     230   ln_traldf_iso   =  .true.   !  iso-neutral 
     231   ln_traldf_triad =  .false.  !  iso-neutral using Griffies triads 
     232   ! 
     233   !                       !  iso-neutral options:         
     234   ln_traldf_msc   =  .false.  !  Method of Stabilizing Correction (both operators) 
     235   rn_slpmax       =   0.01    !  slope limit                      (both operators) 
     236   ln_triad_iso    =  .false.  !  pure horizontal mixing in ML     (triad only) 
     237   rn_sw_triad     =  1        !  =1 switching triad ; =0 all 4 triads used (triad only) 
     238   ln_botmix_triad =  .false.  !  lateral mixing on bottom         (triad only) 
     239   ! 
     240   !                       !  Coefficients: 
     241   nn_aht_ijk_t    = 0         !  space/time variation of eddy coef 
     242   !                                !   =-20 (=-30)    read in eddy_induced_velocity_2D.nc (..._3D.nc) file 
     243   !                                !   =  0           constant  
     244   !                                !   = 10 F(k)      =ldf_c1d  
     245   !                                !   = 20 F(i,j)    =ldf_c2d  
     246   !                                !   = 21 F(i,j,t)  =Treguier et al. JPO 1997 formulation 
     247   !                                !   = 30 F(i,j,k)  =ldf_c2d + ldf_c1d 
     248   !                                !   = 31 F(i,j,k,t)=F(local velocity) 
     249   rn_aht_0        = 1000.     !  lateral eddy diffusivity   (lap. operator) [m2/s] 
     250   rn_bht_0        = 1.e+12    !  lateral eddy diffusivity (bilap. operator) [m4/s] 
     251/ 
     252!---------------------------------------------------------------------------------- 
     253&namtra_ldfeiv !   eddy induced velocity param. 
     254!---------------------------------------------------------------------------------- 
     255   ln_ldfeiv     =.false.   ! use eddy induced velocity parameterization 
    216256/ 
    217257!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    219259!----------------------------------------------------------------------- 
    220260   ln_tradmp   =  .false.  !  add a damping termn (T) or not (F) 
    221    nn_zdmp     =    1      !  vertical   shape =0    damping throughout the water column 
    222    nn_file     =    1      !  create a damping.coeff NetCDF file (=1) or not (=0) 
    223261/ 
    224262!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    229267&namdyn_vor    !   option of physics/algorithm (not control by CPP keys) 
    230268!----------------------------------------------------------------------- 
    231    ln_dynvor_ene = .true.  !  energy    conserving scheme   
    232    ln_dynvor_ens = .false. !  enstrophy conserving scheme     
     269   ln_dynvor_ene = .true.  !  enstrophy conserving scheme 
     270   ln_dynvor_ens = .false. !  energy conserving scheme 
     271   ln_dynvor_mix = .false. !  mixed scheme 
    233272   ln_dynvor_een = .false. !  energy & enstrophy scheme 
     273      nn_een_e3f = 1             !  e3f = masked averaging of e3t divided by 4 (=0) or by the sum of mask (=1) 
    234274/ 
    235275!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    240280/ 
    241281!----------------------------------------------------------------------- 
    242 !namdyn_spg    !   surface pressure gradient   (CPP key only) 
    243 !----------------------------------------------------------------------- 
     282&namdyn_spg    !   surface pressure gradient  
     283!----------------------------------------------------------------------- 
     284   ln_dynspg_ts  = .true.  !  split-explicit free surface 
     285/ 
    244286!----------------------------------------------------------------------- 
    245287&namdyn_ldf    !   lateral diffusion on momentum 
    246288!----------------------------------------------------------------------- 
    247    rn_ahm_0_lap     = 100000.   !  horizontal laplacian eddy viscosity   [m2/s] 
     289   !                       !  Type of the operator : 
     290   !                           !  no diffusion: set ln_dynldf_lap=..._blp=F  
     291   ln_dynldf_lap =  .true.     !    laplacian operator 
     292   ln_dynldf_blp =  .false.    !  bilaplacian operator 
     293   !                       !  Direction of action  : 
     294   ln_dynldf_lev =  .true.     !  iso-level 
     295   ln_dynldf_hor =  .false.    !  horizontal (geopotential) 
     296   ln_dynldf_iso =  .false.    !  iso-neutral 
     297   !                       !  Coefficient 
     298   nn_ahm_ijk_t  = 0           !  space/time variation of eddy coef 
     299   !                                !  =-30  read in eddy_viscosity_3D.nc file 
     300   !                                !  =-20  read in eddy_viscosity_2D.nc file 
     301   !                                !  =  0  constant  
     302   !                                !  = 10  F(k)=c1d 
     303   !                                !  = 20  F(i,j)=F(grid spacing)=c2d 
     304   !                                !  = 30  F(i,j,k)=c2d*c1d 
     305   !                                !  = 31  F(i,j,k)=F(grid spacing and local velocity) 
     306   rn_ahm_0      = 100000.     !  horizontal laplacian eddy viscosity   [m2/s] 
     307   rn_ahm_b      =      0.     !  background eddy viscosity for ldf_iso [m2/s] 
     308   rn_bhm_0      =      0.     !  horizontal bilaplacian eddy viscosity [m4/s] 
    248309/ 
    249310!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    261322   nn_etau     =   0       !  penetration of tke below the mixed layer (ML) due to internal & intertial waves 
    262323/ 
    263 !------------------------------------------------------------------------ 
    264 &namzdf_kpp    !   K-Profile Parameterization dependent vertical mixing  ("key_zdfkpp", and optionally: 
    265 !------------------------------------------------------------------------ "key_kppcustom" or "key_kpplktb") 
    266 / 
    267324!----------------------------------------------------------------------- 
    268325&namzdf_gls                !   GLS vertical diffusion                   ("key_zdfgls") 
    … …  
    277334!----------------------------------------------------------------------- 
    278335   ln_tmx_itf  = .false.   !  ITF specific parameterisation 
    279 / 
    280 !----------------------------------------------------------------------- 
    281 &namsol        !   elliptic solver / island / free surface 
    282 !----------------------------------------------------------------------- 
    283    nn_solv     =      2    !  elliptic solver: =1 preconditioned conjugate gradient (pcg) 
    284    nn_nmin     =    210    !  minimum of iterations for the SOR solver 
    285    rn_sor      =  1.96     !  optimal coefficient for SOR solver (to be adjusted with the domain) 
    286336/ 
    287337!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    301351!              !       or mixed-layer trends or barotropic vorticity    ("key_trdmld" or     "key_trdvor") 
    302352!----------------------------------------------------------------------- 
    303 / 
     353   ln_glo_trd  = .false.   ! (T) global domain averaged diag for T, T^2, KE, and PE 
     354   ln_dyn_trd  = .false.   ! (T) 3D momentum trend output 
     355   ln_dyn_mxl  = .FALSE.   ! (T) 2D momentum trends averaged over the mixed layer (not coded yet) 
     356   ln_vor_trd  = .FALSE.   ! (T) 2D barotropic vorticity trends (not coded yet) 
     357   ln_KE_trd   = .false.   ! (T) 3D Kinetic   Energy     trends 
     358   ln_PE_trd   = .false.   ! (T) 3D Potential Energy     trends 
     359   ln_tra_trd  = .false.    ! (T) 3D tracer trend output 
     360   ln_tra_mxl  = .false.   ! (T) 2D tracer trends averaged over the mixed layer (not coded yet) 
     361   nn_trd      = 365       !  print frequency (ln_glo_trd=T) (unit=time step) 
     362/ 
     363!!gm   nn_ctls     =   0       !  control surface type in mixed-layer trends (0,1 or n<jpk) 
     364!!gm   rn_ucf      =   1.      !  unit conversion factor (=1 -> /seconds ; =86400. -> /day) 
     365!!gm   cn_trdrst_in      = "restart_mld"   ! suffix of ocean restart name (input) 
     366!!gm   cn_trdrst_out     = "restart_mld"   ! suffix of ocean restart name (output) 
     367!!gm   ln_trdmld_restart = .false.         !  restart for ML diagnostics 
     368!!gm   ln_trdmld_instant = .false.         !  flag to diagnose trends of instantantaneous or mean ML T/S 
     369!!gm 
    304370!----------------------------------------------------------------------- 
    305371&namflo       !   float parameters                                      ("key_float") 
    … …  
    333399!----------------------------------------------------------------------- 
    334400/ 
    335 !----------------------------------------------------------------------- 
    336 &namdyn_nept  !   Neptune effect (simplified: lateral and vertical diffusions removed) 
    337 !----------------------------------------------------------------------- 
    338    ln_neptramp       = .false.  ! ramp down Neptune velocity in shallow water 
    339 / 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/GYRE/cpp_GYRE.fcm

    r4230 r6225  
    1  bld::tool::fppkeys key_dynspg_flt key_ldfslp key_zdftke key_iomput key_mpp_mpi 
     1 bld::tool::fppkeys key_zdftke key_iomput key_mpp_mpi 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/GYRE_BFM/EXP00/iodef.xml

    r4153 r6225  
    3131      <file_group id="6h" output_freq="6h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 6h files --> 
    3232      
    33       <file_group id="1d" output_freq="1d"  output_level="10" enabled=".TRUE."> <!-- 1d files --> 
    34       </file_group> 
     33      <file_group id="1d" output_freq="1d"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1d files --> 
    3534      <file_group id="3d" output_freq="3d"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 3d files -->     
    36       <file_group id="5d" output_freq="5d"  output_level="10" enabled=".TRUE.">  <!-- 5d files -->    
    37       </file_group> 
     35      <file_group id="5d" output_freq="5d"  output_level="10" enabled=".TRUE."/>  <!-- 5d files -->    
    3836 
    3937      <file_group id="1m" output_freq="1mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real monthly files --> 
    … …  
    5755     
    5856   <axis_definition>   
    59       <axis id="deptht" long_name="Vertical T levels" unit="m" positive="down" /> 
    60       <axis id="depthu" long_name="Vertical U levels" unit="m" positive="down" /> 
    61       <axis id="depthv" long_name="Vertical V levels" unit="m" positive="down" /> 
    62       <axis id="depthw" long_name="Vertical W levels" unit="m" positive="down" /> 
    63       <axis id="nfloat" long_name="Float number"      unit="-"  /> 
    64       <axis id="icbcla" long_name="Iceberg class"     unit="-"  /> 
     57      <axis id="deptht"  long_name="Vertical T levels"  unit="m" positive="down" /> 
     58      <axis id="depthu"  long_name="Vertical U levels"  unit="m" positive="down" /> 
     59      <axis id="depthv"  long_name="Vertical V levels"  unit="m" positive="down" /> 
     60      <axis id="depthw"  long_name="Vertical W levels"  unit="m" positive="down" /> 
     61      <axis id="nfloat"  long_name="Float number"       unit="1"                 /> 
     62      <axis id="icbcla"  long_name="Iceberg class"      unit="1"                 /> 
     63      <axis id="ncatice" long_name="Ice category"       unit="1"                 /> 
     64      <axis id="iax_20C" long_name="20 degC isotherm"   unit="degC"              /> 
     65      <axis id="iax_28C" long_name="28 degC isotherm"   unit="degC"              /> 
    6566   </axis_definition>  
    6667     

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/GYRE_BFM/EXP00/namelist_cfg

    r4370 r6225  
    3535&namzgr        !   vertical coordinate 
    3636!----------------------------------------------------------------------- 
    37    ln_zco      = .true.    !  z-coordinate - full    steps   (T/F)      ("key_zco" may also be defined) 
    38    ln_zps      = .false.   !  z-coordinate - partial steps   (T/F) 
     37   ln_zco      = .true.    !  z-coordinate - full    steps 
     38   ln_linssh   = .true.   !  linear free surface 
    3939/ 
    4040!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    4646!----------------------------------------------------------------------- 
    4747   nn_bathy    =    0      !  compute (=0) or read (=1) the bathymetry file 
    48    rn_rdt      = 7200.     !  time step for the dynamics (and tracer if nn_acc=0) 
    49    rn_rdtmin   = 7200.           !  minimum time step on tracers (used if nn_acc=1) 
    50    rn_rdtmax   = 7200.           !  maximum time step on tracers (used if nn_acc=1) 
     48   rn_rdt      = 7200.     !  time step for the dynamics  
    5149   jphgr_msh   =       5                 !  type of horizontal mesh 
    5250   ppglam0     =       0.0               !  longitude of first raw and column T-point (jphgr_msh = 1) 
    … …  
    6967/ 
    7068!----------------------------------------------------------------------- 
    71 &namsplit      !   time splitting parameters                            ("key_dynspg_ts") 
    72 !----------------------------------------------------------------------- 
    73 / 
    74 !----------------------------------------------------------------------- 
    7569&namcrs        !   Grid coarsening for dynamics output and/or 
    7670               !   passive tracer coarsened online simulations 
    … …  
    121115/ 
    122116!----------------------------------------------------------------------- 
    123 &namsbc_cpl    !   coupled ocean/atmosphere model                       ("key_coupled") 
     117&namsbc_cpl    !   coupled ocean/atmosphere model                       ("key_oasis3") 
    124118!----------------------------------------------------------------------- 
    125119/ 
    … …  
    161155/ 
    162156!----------------------------------------------------------------------- 
    163 &namcla        !   cross land advection 
    164 !----------------------------------------------------------------------- 
    165 / 
    166 !----------------------------------------------------------------------- 
    167 &namobc        !   open boundaries parameters                           ("key_obc") 
    168 !----------------------------------------------------------------------- 
    169 / 
    170 !----------------------------------------------------------------------- 
    171157&namagrif      !  AGRIF zoom                                            ("key_agrif") 
    172158!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    194180/ 
    195181!----------------------------------------------------------------------- 
    196 &nambbc        !   bottom temperature boundary condition 
    197 !----------------------------------------------------------------------- 
    198    ln_trabbc   = .false.   !  Apply a geothermal heating at the ocean bottom 
    199    nn_geoflx   =    0      !  geothermal heat flux: = 0 no flux 
     182&nambbc        !   bottom temperature boundary condition                (default: NO) 
     183!----------------------------------------------------------------------- 
    200184/ 
    201185!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    206190&nameos        !   ocean physical parameters 
    207191!----------------------------------------------------------------------- 
    208    nn_eos      =   2       !  type of equation of state and Brunt-Vaisala frequency 
     192   nn_eos      =  0       !  type of equation of state and Brunt-Vaisala frequency 
     193                                 !  =-1, TEOS-10 
     194                                 !  = 0, EOS-80 
     195                                 !  = 1, S-EOS   (simplified eos) 
     196   ln_useCT    = .false.  ! use of Conservative Temp. ==> surface CT converted in Pot. Temp. in sbcssm 
     197   !                             ! 
     198   !                      ! S-EOS coefficients : 
     199   !                             !  rd(T,S,Z)*rau0 = -a0*(1+.5*lambda*dT+mu*Z+nu*dS)*dT+b0*dS 
     200   rn_a0       =  1.6550e-1      !  thermal expension coefficient (nn_eos= 1) 
     201   rn_b0       =  7.6554e-1      !  saline  expension coefficient (nn_eos= 1) 
     202   rn_lambda1  =  5.9520e-2      !  cabbeling coeff in T^2  (=0 for linear eos) 
     203   rn_lambda2  =  7.4914e-4      !  cabbeling coeff in S^2  (=0 for linear eos) 
     204   rn_mu1      =  1.4970e-4      !  thermobaric coeff. in T (=0 for linear eos) 
     205   rn_mu2      =  1.1090e-5      !  thermobaric coeff. in S (=0 for linear eos) 
     206   rn_nu       =  2.4341e-3      !  cabbeling coeff in T*S  (=0 for linear eos) 
     207!!org GYRE   rn_alpha    =   2.0e-4  !  thermal expension coefficient (nn_eos= 1 or 2) 
     208!!org GYRE   rn_beta     =   7.7e-4  !  saline  expension coefficient (nn_eos= 2) 
     209!!org  caution  now a0 = alpha / rau0   with rau0 = 1026 
    209210/ 
    210211!----------------------------------------------------------------------- 
    211212&namtra_adv    !   advection scheme for tracer 
    212213!----------------------------------------------------------------------- 
    213    ln_traadv_msc_ups=  .false.  !  use upstream scheme within muscl  
     214   ln_traadv_fct =  .true.   !  FCT scheme 
     215      nn_fct_h   =  2               !  =2/4, horizontal 2nd / 4th order  
     216      nn_fct_v   =  2               !  =2/4, vertical   2nd / COMPACT 4th order  
     217      nn_fct_zts =  0               !  >=1,  2nd order FCT scheme with vertical sub-timestepping 
     218      !                             !        (number of sub-timestep = nn_fct_zts) 
    214219/ 
    215220!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    220225&namtra_ldf    !   lateral diffusion scheme for tracers 
    221226!---------------------------------------------------------------------------------- 
    222    rn_aeiv_0        =     0.    !  eddy induced velocity coefficient [m2/s] 
    223    rn_aht_0         =  1000.    !  horizontal eddy diffusivity for tracers [m2/s] 
     227   !                       !  Operator type: 
     228   ln_traldf_lap   =  .true.   !    laplacian operator 
     229   ln_traldf_blp   =  .false.  !  bilaplacian operator 
     230   !                       !  Direction of action: 
     231   ln_traldf_lev   =  .false.  !  iso-level 
     232   ln_traldf_hor   =  .false.  !  horizontal (geopotential) 
     233   ln_traldf_iso   =  .true.   !  iso-neutral (standard operator) 
     234   ln_traldf_triad =  .false.  !  iso-neutral (triad    operator) 
     235   ! 
     236   !                       !  iso-neutral options:         
     237   ln_traldf_msc   =  .true.   !  Method of Stabilizing Correction (both operators) 
     238   rn_slpmax       =   0.01    !  slope limit                      (both operators) 
     239   ln_triad_iso    =  .false.  !  pure horizontal mixing in ML              (triad only) 
     240   rn_sw_triad     =  1        !  =1 switching triad ; =0 all 4 triads used (triad only) 
     241   ln_botmix_triad =  .false.  !  lateral mixing on bottom                  (triad only) 
     242   ! 
     243   !                       !  Coefficients: 
     244   nn_aht_ijk_t    = 0         !  space/time variation of eddy coef 
     245   !                                !   =-20 (=-30)    read in eddy_diffusivity_2D.nc (..._3D.nc) file 
     246   !                                !   =  0           constant  
     247   !                                !   = 10 F(k)      =ldf_c1d  
     248   !                                !   = 20 F(i,j)    =ldf_c2d  
     249   !                                !   = 21 F(i,j,t)  =Treguier et al. JPO 1997 formulation 
     250   !                                !   = 30 F(i,j,k)  =ldf_c2d + ldf_c1d 
     251   !                                !   = 31 F(i,j,k,t)=F(local velocity) 
     252   rn_aht_0        = 1000.     !  lateral eddy diffusivity   (lap. operator) [m2/s] 
     253   rn_bht_0        = 1.e+12    !  lateral eddy diffusivity (bilap. operator) [m4/s] 
     254/ 
     255!---------------------------------------------------------------------------------- 
     256&namtra_ldfeiv !   eddy induced velocity param. 
     257!---------------------------------------------------------------------------------- 
     258   ln_ldfeiv     =.false.   ! use eddy induced velocity parameterization 
    224259/ 
    225260!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    227262!----------------------------------------------------------------------- 
    228263   ln_tradmp   =  .false.  !  add a damping termn (T) or not (F) 
    229    nn_zdmp     =    1      !  vertical   shape =0    damping throughout the water column 
    230    nn_file     =    1      !  create a damping.coeff NetCDF file (=1) or not (=0) 
    231264/ 
    232265!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    237270&namdyn_vor    !   option of physics/algorithm (not control by CPP keys) 
    238271!----------------------------------------------------------------------- 
    239    ln_dynvor_ene = .true.  !  energy    conserving scheme   
    240    ln_dynvor_ens = .false. !  enstrophy conserving scheme     
    241    ln_dynvor_een = .false. !  energy & enstrophy scheme 
     272   ln_dynvor_ene = .true.  !  enstrophy conserving scheme 
    242273/ 
    243274!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    248279/ 
    249280!----------------------------------------------------------------------- 
    250 !namdyn_spg    !   surface pressure gradient   (CPP key only) 
    251 !----------------------------------------------------------------------- 
     281&namdyn_spg    !   surface pressure gradient 
     282!----------------------------------------------------------------------- 
     283   ln_dynspg_ts  = .true.  !  split-explicit free surface 
     284/ 
    252285!----------------------------------------------------------------------- 
    253286&namdyn_ldf    !   lateral diffusion on momentum 
    254287!----------------------------------------------------------------------- 
     288   !                       !  Type of the operator : 
     289   !                           !  no diffusion: set ln_dynldf_lap=..._blp=F  
     290   ln_dynldf_lap =  .true.     !    laplacian operator 
     291   ln_dynldf_blp =  .false.    !  bilaplacian operator 
     292   !                       !  Direction of action  : 
     293   ln_dynldf_lev =  .true.     !  iso-level 
     294   ln_dynldf_hor =  .false.    !  horizontal (geopotential) 
     295   ln_dynldf_iso =  .false.    !  iso-neutral 
     296   !                       !  Coefficient 
     297   nn_ahm_ijk_t  = 0           !  space/time variation of eddy coef 
     298   !                                !  =-30  read in eddy_viscosity_3D.nc file 
     299   !                                !  =-20  read in eddy_viscosity_2D.nc file 
     300   !                                !  =  0  constant  
     301   !                                !  = 10  F(k)=c1d 
     302   !                                !  = 20  F(i,j)=F(grid spacing)=c2d 
     303   !                                !  = 30  F(i,j,k)=c2d*c1d 
     304   !                                !  = 31  F(i,j,k)=F(grid spacing and local velocity) 
     305   rn_ahm_0      = 100000.     !  horizontal laplacian eddy viscosity   [m2/s] 
     306   rn_ahm_b      =      0.     !  background eddy viscosity for ldf_iso [m2/s] 
     307   rn_bhm_0      =      0.     !  horizontal bilaplacian eddy viscosity [m4/s] 
     308   ! 
     309   ! Caution in 20 and 30 cases the coefficient have to be given for a 1 degree grid (~111km) 
     310/ 
    255311   rn_ahm_0_lap     = 100000.   !  horizontal laplacian eddy viscosity   [m2/s] 
    256312/ 
    … …  
    269325   nn_etau     =   0       !  penetration of tke below the mixed layer (ML) due to internal & intertial waves 
    270326/ 
    271 !------------------------------------------------------------------------ 
    272 &namzdf_kpp    !   K-Profile Parameterization dependent vertical mixing  ("key_zdfkpp", and optionally: 
    273 !------------------------------------------------------------------------ "key_kppcustom" or "key_kpplktb") 
    274 / 
    275327!----------------------------------------------------------------------- 
    276328&namzdf_gls                !   GLS vertical diffusion                   ("key_zdfgls") 
    … …  
    285337!----------------------------------------------------------------------- 
    286338   ln_tmx_itf  = .false.   !  ITF specific parameterisation 
    287 / 
    288 !----------------------------------------------------------------------- 
    289 &namsol        !   elliptic solver / island / free surface 
    290 !----------------------------------------------------------------------- 
    291    nn_solv     =      2    !  elliptic solver: =1 preconditioned conjugate gradient (pcg) 
    292    nn_nmin     =    210    !  minimum of iterations for the SOR solver 
    293    rn_sor      =  1.96     !  optimal coefficient for SOR solver (to be adjusted with the domain) 
    294339/ 
    295340!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    341386!----------------------------------------------------------------------- 
    342387/ 
    343 !----------------------------------------------------------------------- 
    344 &namdyn_nept  !   Neptune effect (simplified: lateral and vertical diffusions removed) 
    345 !----------------------------------------------------------------------- 
    346    ln_neptramp       = .false.  ! ramp down Neptune velocity in shallow water 
    347 / 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/GYRE_BFM/EXP00/namelist_top_cfg

    r4152 r6225  
    2323!----------------------------------------------------------------------- 
    2424&namtrc_adv    !   advection scheme for passive tracer  
    25 !-----------------------------------------------------------------------   
    26    ln_trcadv_tvd     =  .true.   !  TVD scheme 
    27    ln_trcadv_muscl   =  .false.  !  MUSCL scheme 
     25!----------------------------------------------------------------------- 
     26   ln_trcadv_fct =  .true.   !  FCT scheme 
     27      nn_fct_h   =  2               !  =2/4, horizontal 2nd / 4th order  
     28      nn_fct_v   =  2               !  =2/4, vertical   2nd / COMPACT 4th order  
     29      nn_fct_zts =  0               !  >=1,  2nd order FCT scheme with vertical sub-timestepping 
     30      !                             !        (number of sub-timestep = nn_fct_zts) 
    2831/ 
    2932!----------------------------------------------------------------------- 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/GYRE_BFM/cpp_GYRE_BFM.fcm

    r4230 r6225  
    1 bld::tool::fppkeys key_dynspg_flt key_ldfslp key_zdftke key_vectopt_loop key_top key_my_trc key_mpp_mpi key_iomput 
     1bld::tool::fppkeys key_zdftke key_top key_my_trc key_mpp_mpi key_iomput 
    22inc $BFMDIR/src/nemo/bfm.fcm 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/GYRE_PISCES/EXP00/iodef.xml

    r4609 r6225  
    4343     <field field_ref="empmr"        name="sowaflup"  /> 
    4444     <field field_ref="qsr"          name="soshfldo"  /> 
    45           <field field_ref="saltflx"      name="sosfldow"  /> 
     45      <field field_ref="saltflx"      name="sosfldow"  /> 
    4646     <field field_ref="qt"           name="sohefldo"  /> 
    4747     <field field_ref="mldr10_1"     name="somxl010"  /> 
    4848     <field field_ref="mldkz5"       name="somixhgt"  /> 
    49            <!-- variables available with MLE 
    50           <field field_ref="Lf_NHpf"    name="Lf_NHpf"  long_name="MLE:_Lf=NH/f"     /> 
    51       --> 
    5249        </file> 
    5350    
    … …  
    5552          <field field_ref="uoce"         name="vozocrtx"  /> 
    5653          <field field_ref="utau"         name="sozotaux"  /> 
    57           <!-- variables available with MLE 
    58           <field field_ref="psiu_mle"     name="psiu_mle"  long_name="MLE_streamfunction_along_i-axis" /> 
    59      --> 
    6054        </file> 
    6155    
    … …  
    6357          <field field_ref="voce"         name="vomecrty"  />  
    6458          <field field_ref="vtau"         name="sometauy"  />  
    65           <!-- variables available with MLE 
    66           <field field_ref="psiv_mle"     name="psiv_mle"  long_name="MLE_streamfunction_along_j-axis" /> 
    67      --> 
    6859        </file> 
    6960    
    … …  
    132123     
    133124   <axis_definition>   
    134       <axis id="deptht" long_name="Vertical T levels" unit="m" positive="down" /> 
    135       <axis id="depthu" long_name="Vertical U levels" unit="m" positive="down" /> 
    136       <axis id="depthv" long_name="Vertical V levels" unit="m" positive="down" /> 
    137       <axis id="depthw" long_name="Vertical W levels" unit="m" positive="down" /> 
    138       <axis id="nfloat" long_name="Float number"      unit="-"  /> 
    139       <axis id="icbcla" long_name="Iceberg class"     unit="-"  /> 
     125      <axis id="deptht"  long_name="Vertical T levels"  unit="m" positive="down" /> 
     126      <axis id="depthu"  long_name="Vertical U levels"  unit="m" positive="down" /> 
     127      <axis id="depthv"  long_name="Vertical V levels"  unit="m" positive="down" /> 
     128      <axis id="depthw"  long_name="Vertical W levels"  unit="m" positive="down" /> 
     129      <axis id="nfloat"  long_name="Float number"       unit="1"                 /> 
     130      <axis id="icbcla"  long_name="Iceberg class"      unit="1"                 /> 
     131      <axis id="ncatice" long_name="Ice category"       unit="1"                 /> 
     132      <axis id="iax_20C" long_name="20 degC isotherm"   unit="degC"              /> 
     133      <axis id="iax_28C" long_name="28 degC isotherm"   unit="degC"              /> 
    140134   </axis_definition>  
    141135     

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/GYRE_PISCES/EXP00/namelist_cfg

    r4370 r6225  
    2929&namzgr        !   vertical coordinate 
    3030!----------------------------------------------------------------------- 
    31    ln_zco      = .true.    !  z-coordinate - full    steps   (T/F)      ("key_zco" may also be defined) 
    32    ln_zps      = .false.   !  z-coordinate - partial steps   (T/F) 
     31   ln_zco      = .true.    !  z-coordinate - full    steps 
     32   ln_linssh   = .true.    !  linear free surface 
    3333/ 
    3434!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    3636!----------------------------------------------------------------------- 
    3737   nn_bathy    =    0      !  compute (=0) or read (=1) the bathymetry file 
    38    rn_rdt      = 7200.     !  time step for the dynamics (and tracer if nn_acc=0) 
    39    rn_rdtmin   = 7200.           !  minimum time step on tracers (used if nn_acc=1) 
    40    rn_rdtmax   = 7200.           !  maximum time step on tracers (used if nn_acc=1) 
     38   rn_rdt      = 7200.     !  time step for the dynamics  
    4139   jphgr_msh   =       5                 !  type of horizontal mesh 
    4240   ppglam0     =       0.0               !  longitude of first raw and column T-point (jphgr_msh = 1) 
    … …  
    5957/ 
    6058!----------------------------------------------------------------------- 
    61 &namsplit      !   time splitting parameters                            ("key_dynspg_ts") 
    62 !----------------------------------------------------------------------- 
    63 / 
    64 !----------------------------------------------------------------------- 
    6559&namcrs        !   Grid coarsening for dynamics output and/or 
    6660               !   passive tracer coarsened online simulations 
    … …  
    10498/ 
    10599!----------------------------------------------------------------------- 
    106 &namcla        !   cross land advection 
    107 !----------------------------------------------------------------------- 
    108 / 
    109 !----------------------------------------------------------------------- 
    110100&nambfr        !   bottom friction 
    111101!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    113103/ 
    114104!----------------------------------------------------------------------- 
    115 &nambbc        !   bottom temperature boundary condition 
    116 !----------------------------------------------------------------------- 
    117    ln_trabbc   = .false.   !  Apply a geothermal heating at the ocean bottom 
    118    nn_geoflx   =    0      !  geothermal heat flux: = 0 no flux 
     105&nambbc        !   bottom temperature boundary condition                (default: NO) 
     106!----------------------------------------------------------------------- 
    119107/ 
    120108!----------------------------------------------------------------------- 
    121109&nameos        !   ocean physical parameters 
    122110!----------------------------------------------------------------------- 
    123    nn_eos      =   2       !  type of equation of state and Brunt-Vaisala frequency 
     111   nn_eos      =  0       !  type of equation of state and Brunt-Vaisala frequency 
     112                                 !  =-1, TEOS-10 
     113                                 !  = 0, EOS-80 
     114                                 !  = 1, S-EOS   (simplified eos) 
     115   ln_useCT    = .false.  ! use of Conservative Temp. ==> surface CT converted in Pot. Temp. in sbcssm 
     116   !                             ! 
     117   !                      ! S-EOS coefficients : 
     118   !                             !  rd(T,S,Z)*rau0 = -a0*(1+.5*lambda*dT+mu*Z+nu*dS)*dT+b0*dS 
     119   rn_a0       =  1.6550e-1      !  thermal expension coefficient (nn_eos= 1) 
     120   rn_b0       =  7.6554e-1      !  saline  expension coefficient (nn_eos= 1) 
     121   rn_lambda1  =  5.9520e-2      !  cabbeling coeff in T^2  (=0 for linear eos) 
     122   rn_lambda2  =  7.4914e-4      !  cabbeling coeff in S^2  (=0 for linear eos) 
     123   rn_mu1      =  1.4970e-4      !  thermobaric coeff. in T (=0 for linear eos) 
     124   rn_mu2      =  1.1090e-5      !  thermobaric coeff. in S (=0 for linear eos) 
     125   rn_nu       =  2.4341e-3      !  cabbeling coeff in T*S  (=0 for linear eos) 
     126!!org GYRE   rn_alpha    =   2.0e-4  !  thermal expension coefficient (nn_eos= 1 or 2) 
     127!!org GYRE   rn_beta     =   7.7e-4  !  saline  expension coefficient (nn_eos= 2) 
     128!!org  caution  now a0 = alpha / rau0   with rau0 = 1026 
    124129/ 
    125130!----------------------------------------------------------------------- 
    126131&namtra_adv    !   advection scheme for tracer 
    127132!----------------------------------------------------------------------- 
    128    ln_traadv_msc_ups=  .false.  !  use upstream scheme within muscl  
     133   ln_traadv_fct =  .true.   !  FCT scheme 
     134      nn_fct_h   =  2               !  =2/4, horizontal 2nd / 4th order  
     135      nn_fct_v   =  2               !  =2/4, vertical   2nd / COMPACT 4th order  
     136      nn_fct_zts =  0               !  >=1,  2nd order FCT scheme with vertical sub-timestepping 
     137      !                             !        (number of sub-timestep = nn_fct_zts) 
    129138/ 
    130139!---------------------------------------------------------------------------------- 
    131140&namtra_ldf    !   lateral diffusion scheme for tracers 
    132141!---------------------------------------------------------------------------------- 
    133    rn_aeiv_0        =     0.    !  eddy induced velocity coefficient [m2/s] 
    134    rn_aht_0         =  1000.    !  horizontal eddy diffusivity for tracers [m2/s] 
     142   !                       !  Operator type: 
     143   ln_traldf_lap   =  .true.   !    laplacian operator 
     144   ln_traldf_blp   =  .false.  !  bilaplacian operator 
     145   !                       !  Direction of action: 
     146   ln_traldf_lev   =  .false.  !  iso-level 
     147   ln_traldf_hor   =  .false.  !  horizontal (geopotential) 
     148   ln_traldf_iso   =  .true.   !  iso-neutral (standard operator) 
     149   ln_traldf_triad =  .false.  !  iso-neutral (triad    operator) 
     150   ! 
     151   !                       !  iso-neutral options:         
     152   ln_traldf_msc   =  .true.   !  Method of Stabilizing Correction (both operators) 
     153   rn_slpmax       =   0.01    !  slope limit                      (both operators) 
     154   ln_triad_iso    =  .false.  !  pure horizontal mixing in ML              (triad only) 
     155   rn_sw_triad     =  1        !  =1 switching triad ; =0 all 4 triads used (triad only) 
     156   ln_botmix_triad =  .false.  !  lateral mixing on bottom                  (triad only) 
     157   ! 
     158   !                       !  Coefficients: 
     159   nn_aht_ijk_t    = 0         !  space/time variation of eddy coef 
     160   !                                !   =-20 (=-30)    read in eddy_diffusivity_2D.nc (..._3D.nc) file 
     161   !                                !   =  0           constant  
     162   !                                !   = 10 F(k)      =ldf_c1d  
     163   !                                !   = 20 F(i,j)    =ldf_c2d  
     164   !                                !   = 21 F(i,j,t)  =Treguier et al. JPO 1997 formulation 
     165   !                                !   = 30 F(i,j,k)  =ldf_c2d + ldf_c1d 
     166   !                                !   = 31 F(i,j,k,t)=F(local velocity) 
     167   rn_aht_0        = 1000.     !  lateral eddy diffusivity   (lap. operator) [m2/s] 
     168   rn_bht_0        = 1.e+12    !  lateral eddy diffusivity (bilap. operator) [m4/s] 
     169/ 
     170!---------------------------------------------------------------------------------- 
     171&namtra_ldfeiv !   eddy induced velocity param. 
     172!---------------------------------------------------------------------------------- 
     173   ln_ldfeiv     =.false.   ! use eddy induced velocity parameterization 
    135174/ 
    136175!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    138177!----------------------------------------------------------------------- 
    139178   ln_tradmp   =  .false.  !  add a damping termn (T) or not (F) 
    140    nn_zdmp     =    1      !  vertical   shape =0    damping throughout the water column 
    141    nn_file     =    1      !  create a damping.coeff NetCDF file (=1) or not (=0) 
    142179/ 
    143180!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    148185&namdyn_vor    !   option of physics/algorithm (not control by CPP keys) 
    149186!----------------------------------------------------------------------- 
    150    ln_dynvor_ene = .true.  !  energy    conserving scheme   
    151    ln_dynvor_ens = .false. !  enstrophy conserving scheme     
     187   ln_dynvor_ene = .true.  !  enstrophy conserving scheme 
     188   ln_dynvor_ens = .false. !  energy conserving scheme 
     189   ln_dynvor_mix = .false. !  mixed scheme 
    152190   ln_dynvor_een = .false. !  energy & enstrophy scheme 
     191      nn_een_e3f = 1             !  e3f = masked averaging of e3t divided by 4 (=0) or by the sum of mask (=1) 
    153192/ 
    154193!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    159198/ 
    160199!----------------------------------------------------------------------- 
     200&namdyn_spg    !   surface pressure gradient 
     201!----------------------------------------------------------------------- 
     202   ln_dynspg_ts  = .true.  !  split-explicit free surface 
     203/ 
     204!----------------------------------------------------------------------- 
    161205&namdyn_ldf    !   lateral diffusion on momentum 
    162206!----------------------------------------------------------------------- 
     207   !                       !  Type of the operator : 
     208   !                           !  no diffusion: set ln_dynldf_lap=..._blp=F  
     209   ln_dynldf_lap =  .true.    !    laplacian operator 
     210   ln_dynldf_blp =  .false.    !  bilaplacian operator 
     211   !                       !  Direction of action  : 
     212   ln_dynldf_lev =  .true.    !  iso-level 
     213   ln_dynldf_hor =  .false.    !  horizontal (geopotential) 
     214   ln_dynldf_iso =  .false.    !  iso-neutral 
     215   !                       !  Coefficient 
     216   nn_ahm_ijk_t  = 0           !  space/time variation of eddy coef 
     217   !                                !  =-30  read in eddy_viscosity_3D.nc file 
     218   !                                !  =-20  read in eddy_viscosity_2D.nc file 
     219   !                                !  =  0  constant  
     220   !                                !  = 10  F(k)=c1d 
     221   !                                !  = 20  F(i,j)=F(grid spacing)=c2d 
     222   !                                !  = 30  F(i,j,k)=c2d*c1d 
     223   !                                !  = 31  F(i,j,k)=F(grid spacing and local velocity) 
     224   rn_ahm_0      = 100000.     !  horizontal laplacian eddy viscosity   [m2/s] 
     225   rn_ahm_b      =      0.     !  background eddy viscosity for ldf_iso [m2/s] 
     226   rn_bhm_0      =      0.      !  horizontal bilaplacian eddy viscosity [m4/s] 
     227   ! 
     228   ! Caution in 20 and 30 cases the coefficient have to be given for a 1 degree grid (~111km) 
     229/ 
    163230   rn_ahm_0_lap     = 100000.   !  horizontal laplacian eddy viscosity   [m2/s] 
    164231/ 
    … …  
    174241/ 
    175242!----------------------------------------------------------------------- 
    176 &namsol        !   elliptic solver / island / free surface 
    177 !----------------------------------------------------------------------- 
    178    nn_solv     =      2    !  elliptic solver: =1 preconditioned conjugate gradient (pcg) 
    179    nn_nmin     =    210    !  minimum of iterations for the SOR solver 
    180    rn_sor      =  1.96     !  optimal coefficient for SOR solver (to be adjusted with the domain) 
    181 / 
    182 !----------------------------------------------------------------------- 
    183243&nammpp        !   Massively Parallel Processing                        ("key_mpp_mpi) 
    184244!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    196256!----------------------------------------------------------------------- 
    197257/ 
    198 !----------------------------------------------------------------------- 
    199 &namdyn_nept  !   Neptune effect (simplified: lateral and vertical diffusions removed) 
    200 !----------------------------------------------------------------------- 
    201    ln_neptramp       = .false.  ! ramp down Neptune velocity in shallow water 
    202 / 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/GYRE_PISCES/EXP00/namelist_top_cfg

    r4340 r6225  
    2424&namtrc_adv    !   advection scheme for passive tracer  
    2525!-----------------------------------------------------------------------    
    26    ln_trcadv_tvd     =  .true.   !  TVD scheme 
    27    ln_trcadv_muscl   =  .false.  !  MUSCL scheme 
     26   ln_trcadv_fct =  .true.   !  FCT scheme 
     27      nn_fct_h   =  2               !  =2/4, horizontal 2nd / 4th order  
     28      nn_fct_v   =  2               !  =2/4, vertical   2nd / COMPACT 4th order  
     29      nn_fct_zts =  0               !  >=1,  2nd order FCT scheme with vertical sub-timestepping 
     30      !                             !        (number of sub-timestep = nn_fct_zts) 
    2831/ 
    2932!----------------------------------------------------------------------- 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/GYRE_PISCES/cpp_GYRE_PISCES.fcm

    r4230 r6225  
    1 bld::tool::fppkeys  key_dynspg_flt key_ldfslp key_zdftke key_top key_pisces_reduced key_iomput key_mpp_mpi  
     1bld::tool::fppkeys key_zdftke key_top key_pisces_reduced key_mpp_mpi 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/GYRE_XIOS/EXP00/iodef.xml

    r4373 r6225  
    4242     <field field_ref="empmr"        name="sowaflup"  /> 
    4343     <field field_ref="qsr"          name="soshfldo"  /> 
    44           <field field_ref="saltflx"      name="sosfldow"  /> 
     44      <field field_ref="saltflx"      name="sosfldow"  /> 
    4545     <field field_ref="qt"           name="sohefldo"  /> 
    4646     <field field_ref="mldr10_1"     name="somxl010"  /> 
    4747     <field field_ref="mldkz5"       name="somixhgt"  /> 
    48            <!-- variables available with MLE 
    49           <field field_ref="Lf_NHpf"    name="Lf_NHpf"  long_name="MLE:_Lf=NH/f"     /> 
    50       --> 
    51        </file> 
     48    </file> 
    5249    
    5350   <file id="file2" name_suffix="_grid_U" description="ocean U grid variables" > 
    5451          <field field_ref="uoce"         name="vozocrtx"  /> 
    5552          <field field_ref="utau"         name="sozotaux"  /> 
    56           <!-- variables available with MLE 
    57           <field field_ref="psiu_mle"     name="psiu_mle"  long_name="MLE_streamfunction_along_i-axis" /> 
    58      --> 
    59         </file> 
     53    </file> 
    6054    
    6155   <file id="file3" name_suffix="_grid_V" description="ocean V grid variables" > 
    6256          <field field_ref="voce"         name="vomecrty"  />  
    6357          <field field_ref="vtau"         name="sometauy"  />  
    64           <!-- variables available with MLE 
    65           <field field_ref="psiv_mle"     name="psiv_mle"  long_name="MLE_streamfunction_along_j-axis" /> 
    66      --> 
    67         </file> 
     58    </file> 
    6859    
    6960   <file id="file4" name_suffix="_grid_W" description="ocean W grid variables" > 
    … …  
    7162          <field field_ref="avt"          name="votkeavt" /> 
    7263          <field field_ref="aht2d"        name="soleahtw" /> 
    73         </file> 
     64    </file> 
    7465 
    7566      </file_group> 
    … …  
    9586     
    9687   <axis_definition>   
    97       <axis id="deptht" long_name="Vertical T levels" unit="m" positive="down" /> 
    98       <axis id="depthu" long_name="Vertical U levels" unit="m" positive="down" /> 
    99       <axis id="depthv" long_name="Vertical V levels" unit="m" positive="down" /> 
    100       <axis id="depthw" long_name="Vertical W levels" unit="m" positive="down" /> 
    101       <axis id="nfloat" long_name="Float number"      unit="-"  /> 
    102       <axis id="icbcla" long_name="Iceberg class"     unit="-"  /> 
     88      <axis id="deptht"  long_name="Vertical T levels"  unit="m" positive="down" /> 
     89      <axis id="depthu"  long_name="Vertical U levels"  unit="m" positive="down" /> 
     90      <axis id="depthv"  long_name="Vertical V levels"  unit="m" positive="down" /> 
     91      <axis id="depthw"  long_name="Vertical W levels"  unit="m" positive="down" /> 
     92      <axis id="nfloat"  long_name="Float number"       unit="1"                 /> 
     93      <axis id="icbcla"  long_name="Iceberg class"      unit="1"                 /> 
     94      <axis id="ncatice" long_name="Ice category"       unit="1"                 /> 
     95      <axis id="iax_20C" long_name="20 degC isotherm"   unit="degC"              /> 
     96      <axis id="iax_28C" long_name="28 degC isotherm"   unit="degC"              /> 
    10397   </axis_definition>  
    10498     

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/GYRE_XIOS/EXP00/namelist_cfg

    r4373 r6225  
    2929&namzgr        !   vertical coordinate 
    3030!----------------------------------------------------------------------- 
    31    ln_zco      = .true.    !  z-coordinate - full    steps   (T/F)      ("key_zco" may also be defined) 
    32    ln_zps      = .false.   !  z-coordinate - partial steps   (T/F) 
     31   ln_zco      = .true.    !  z-coordinate - full    steps 
     32   ln_linssh   = .true.    !  linear free surface 
    3333/ 
    3434!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    4040!----------------------------------------------------------------------- 
    4141   nn_bathy    =    0      !  compute (=0) or read (=1) the bathymetry file 
    42    rn_rdt      = 7200.     !  time step for the dynamics (and tracer if nn_acc=0) 
     42   rn_rdt      = 7200.     !  time step for the dynamics  
    4343!   nn_baro     =   60      !  number of barotropic time step            ("key_dynspg_ts") 
    44    rn_rdtmin   = 7200.           !  minimum time step on tracers (used if nn_acc=1) 
    45    rn_rdtmax   = 7200.           !  maximum time step on tracers (used if nn_acc=1) 
    4644   jphgr_msh   =       5                 !  type of horizontal mesh 
    4745   ppglam0     =       0.0               !  longitude of first raw and column T-point (jphgr_msh = 1) 
    … …  
    110108/ 
    111109!----------------------------------------------------------------------- 
    112 &namsbc_cpl    !   coupled ocean/atmosphere model                       ("key_coupled") 
     110&namsbc_cpl    !   coupled ocean/atmosphere model                       ("key_oasis3") 
    113111!----------------------------------------------------------------------- 
    114112/ 
    … …  
    150148/ 
    151149!----------------------------------------------------------------------- 
    152 &namcla        !   cross land advection 
    153 !----------------------------------------------------------------------- 
    154 / 
    155 !----------------------------------------------------------------------- 
    156 &namobc        !   open boundaries parameters                           ("key_obc") 
    157 !----------------------------------------------------------------------- 
    158 / 
    159 !----------------------------------------------------------------------- 
    160150&namagrif      !  AGRIF zoom                                            ("key_agrif") 
    161151!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    183173/ 
    184174!----------------------------------------------------------------------- 
    185 &nambbc        !   bottom temperature boundary condition 
    186 !----------------------------------------------------------------------- 
    187    ln_trabbc   = .false.   !  Apply a geothermal heating at the ocean bottom 
    188    nn_geoflx   =    0      !  geothermal heat flux: = 0 no flux 
     175&nambbc        !   bottom temperature boundary condition                (default: NO) 
     176!----------------------------------------------------------------------- 
    189177/ 
    190178!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    195183&nameos        !   ocean physical parameters 
    196184!----------------------------------------------------------------------- 
    197    nn_eos      =   2       !  type of equation of state and Brunt-Vaisala frequency 
     185   nn_eos      =   0       !  type of equation of state and Brunt-Vaisala frequency 
    198186/ 
    199187!----------------------------------------------------------------------- 
    200188&namtra_adv    !   advection scheme for tracer 
    201189!----------------------------------------------------------------------- 
    202    ln_traadv_msc_ups=  .false.  !  use upstream scheme within muscl  
     190   ln_traadv_fct =  .true.    !  FCT scheme 
     191      nn_fct_h   =  2               !  =2/4, horizontal 2nd / 4th order  
     192      nn_fct_v   =  2               !  =2/4, vertical   2nd / COMPACT 4th order  
     193      nn_fct_zts =  0               !  >=1,  2nd order FCT scheme with vertical sub-timestepping 
     194      !                             !        (number of sub-timestep = nn_fct_zts) 
    203195/ 
    204196!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    209201&namtra_ldf    !   lateral diffusion scheme for tracers 
    210202!---------------------------------------------------------------------------------- 
    211    rn_aeiv_0        =     0.    !  eddy induced velocity coefficient [m2/s] 
    212    rn_aht_0         =  1000.    !  horizontal eddy diffusivity for tracers [m2/s] 
     203   !                       !  Operator type: 
     204   ln_traldf_lap   =  .true.   !    laplacian operator 
     205   ln_traldf_blp   =  .false.  !  bilaplacian operator 
     206   !                       !  Direction of action: 
     207   ln_traldf_lev   =  .false.  !  iso-level 
     208   ln_traldf_hor   =  .false.  !  horizontal (geopotential) 
     209   ln_traldf_iso   =  .true.   !  iso-neutral (standard operator) 
     210   ln_traldf_triad =  .false.  !  iso-neutral (triad    operator) 
     211   ! 
     212   !                       !  iso-neutral options:         
     213   ln_traldf_msc   =  .true.   !  Method of Stabilizing Correction (both operators) 
     214   rn_slpmax       =   0.01    !  slope limit                      (both operators) 
     215   ln_triad_iso    =  .false.  !  pure horizontal mixing in ML              (triad only) 
     216   rn_sw_triad     =  1        !  =1 switching triad ; =0 all 4 triads used (triad only) 
     217   ln_botmix_triad =  .false.  !  lateral mixing on bottom                  (triad only) 
     218   ! 
     219   !                       !  Coefficients: 
     220   nn_aht_ijk_t    = 0         !  space/time variation of eddy coef 
     221   !                                !   =-20 (=-30)    read in eddy_induced_velocity_2D.nc (..._3D.nc) file 
     222   !                                !   =  0           constant  
     223   !                                !   = 10 F(k)      =ldf_c1d  
     224   !                                !   = 20 F(i,j)    =ldf_c2d  
     225   !                                !   = 21 F(i,j,t)  =Treguier et al. JPO 1997 formulation 
     226   !                                !   = 30 F(i,j,k)  =ldf_c2d + ldf_c1d 
     227   !                                !   = 31 F(i,j,k,t)=F(local velocity) 
     228   rn_aht_0        = 1000.     !  lateral eddy diffusivity   (lap. operator) [m2/s] 
     229   rn_bht_0        = 1.e+12    !  lateral eddy diffusivity (bilap. operator) [m4/s] 
     230/ 
     231!---------------------------------------------------------------------------------- 
     232&namtra_ldfeiv !   eddy induced velocity param. 
     233!---------------------------------------------------------------------------------- 
     234   ln_ldfeiv     =.false.   ! use eddy induced velocity parameterization 
    213235/ 
    214236!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    216238!----------------------------------------------------------------------- 
    217239   ln_tradmp   =  .false.  !  add a damping termn (T) or not (F) 
    218    nn_zdmp     =    1      !  vertical   shape =0    damping throughout the water column 
    219    nn_file     =    1      !  create a damping.coeff NetCDF file (=1) or not (=0) 
    220240/ 
    221241!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    237257/ 
    238258!----------------------------------------------------------------------- 
    239 !namdyn_spg    !   surface pressure gradient   (CPP key only) 
    240 !----------------------------------------------------------------------- 
     259&namdyn_spg    !   surface pressure gradient 
     260!----------------------------------------------------------------------- 
     261   ln_dynspg_ts  = .true.  !  split-explicit free surface 
     262/ 
    241263!----------------------------------------------------------------------- 
    242264&namdyn_ldf    !   lateral diffusion on momentum 
    … …  
    276298/ 
    277299!----------------------------------------------------------------------- 
    278 &namsol        !   elliptic solver / island / free surface 
    279 !----------------------------------------------------------------------- 
    280    nn_solv     =      2    !  elliptic solver: =1 preconditioned conjugate gradient (pcg) 
    281    nn_nmin     =    210    !  minimum of iterations for the SOR solver 
    282    rn_sor      =  1.96     !  optimal coefficient for SOR solver (to be adjusted with the domain) 
    283 / 
    284 !----------------------------------------------------------------------- 
    285300&nammpp        !   Massively Parallel Processing                        ("key_mpp_mpi) 
    286301!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    330345!----------------------------------------------------------------------- 
    331346/ 
    332 !----------------------------------------------------------------------- 
    333 &namdyn_nept  !   Neptune effect (simplified: lateral and vertical diffusions removed) 
    334 !----------------------------------------------------------------------- 
    335    ln_neptramp       = .false.  ! ramp down Neptune velocity in shallow water 
    336 / 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/GYRE_XIOS/cpp_GYRE_XIOS.fcm

    r4373 r6225  
    1  bld::tool::fppkeys key_dynspg_flt key_ldfslp key_zdftke key_iomput key_mpp_mpi 
     1 bld::tool::fppkeys key_zdftke key_iomput key_mpp_mpi 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/EXP00/1_namelist_cfg

    r4329 r6225  
    44!----------------------------------------------------------------------- 
    55&namrun        !   parameters of the run 
     6 nn_it000=1 
    67!----------------------------------------------------------------------- 
    78   cn_exp      = "Agulhas" !  experience name  
    8    nn_itend    =     480   !  last  time step 
     9   nn_itend    =   10950 
    910   nn_stock    =   10950   !  frequency of creation of a restart file (modulo referenced to 1) 
    1011   nn_write    =   10950   !  frequency of write in the output file   (modulo referenced to nn_it000) 
    11    ln_clobber  = .true.    !  clobber (overwrite) an existing file 
     12   ln_clobber  =  .true. 
    1213/ 
    1314!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    2829&namzgr        !   vertical coordinate 
    2930!----------------------------------------------------------------------- 
     31   ln_zps      = .true.    !  z-coordinate - partial steps 
     32   ln_linssh   = .true.    !  linear free surface 
    3033/ 
    3134!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    5154   ppacr2      =  999999.              ! 
    5255   rn_rdt      = 2880.     !  time step for the dynamics (and tracer if nn_acc=0) 
    53    rn_rdtmin   = 14400.          !  minimum time step on tracers (used if nn_acc=1) 
    54    rn_rdtmax   = 14400.          !  maximum time step on tracers (used if nn_acc=1) 
     56/ 
     57!----------------------------------------------------------------------- 
     58&namcrs        !   Grid coarsening for dynamics output and/or 
     59               !   passive tracer coarsened online simulations 
     60!----------------------------------------------------------------------- 
    5561/ 
    5662!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    7278/ 
    7379!----------------------------------------------------------------------- 
    74 &namsbc_core   !   namsbc_core  CORE bulk formulea 
    75 !----------------------------------------------------------------------- 
     80&namsbc_core   !   namsbc_core  CORE bulk formulae 
     81!----------------------------------------------------------------------- 
     82!              !  file name                    ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights                               ! rotation ! land/sea mask ! 
     83!              !                               !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename                              ! pairing  ! filename      ! 
     84   sn_wndi     = 'u_10.15JUNE2009_fill'        ,         6         , 'U_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core2_agrif_bicubic.nc'      , 'Uwnd'   , '' 
     85   sn_wndj     = 'v_10.15JUNE2009_fill'        ,         6         , 'V_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core2_agrif_bicubic.nc'      , 'Vwnd'   , '' 
     86   sn_qsr      = 'ncar_rad.15JUNE2009_fill'    ,        24         , 'SWDN_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core2_agrif_bilinear.nc'     , ''       , '' 
     87   sn_qlw      = 'ncar_rad.15JUNE2009_fill'    ,        24         , 'LWDN_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core2_agrif_bilinear.nc'     , ''       , '' 
     88   sn_tair     = 't_10.15JUNE2009_fill'        ,         6         , 'T_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core2_agrif_bilinear.nc'     , ''       , '' 
     89   sn_humi     = 'q_10.15JUNE2009_fill'        ,         6         , 'Q_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core2_agrif_bilinear.nc'     , ''       , '' 
     90   sn_prec     = 'ncar_precip.15JUNE2009_fill' ,        -1         , 'PRC_MOD1',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core2_agrif_bilinear.nc'     , ''       , '' 
     91   sn_snow     = 'ncar_precip.15JUNE2009_fill' ,        -1         , 'SNOW'    ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core2_agrif_bilinear.nc'     , ''       , '' 
     92   sn_tdif     = 'taudif_core'                 ,        24         , 'taudif'  ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core2_agrif_bilinear.nc'     , ''       , '' 
     93 
     94   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the bulk files 
     95   ln_taudif   = .false.   !  HF tau contribution: use "mean of stress module - module of the mean stress" data 
     96   rn_zqt      = 10.        !  Air temperature and humidity reference height (m) 
     97   rn_zu       = 10.        !  Wind vector reference height (m) 
     98   rn_pfac     = 1.        !  multiplicative factor for precipitation (total & snow) 
     99   rn_efac     = 1.        !  multiplicative factor for evaporation (0. or 1.) 
     100   rn_vfac     = 0.        !  multiplicative factor for ocean/ice velocity 
     101                           !  in the calculation of the wind stress (0.=absolute winds or 1.=relative winds) 
    76102/ 
    77103!----------------------------------------------------------------------- 
    78104&namtra_qsr    !   penetrative solar radiation 
    79105!----------------------------------------------------------------------- 
     106!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     107!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     108   sn_chl      ='chlorophyll',        -1         , 'CHLA'    ,   .true.     , .true. , 'yearly'  , 'weights_bilin.nc'       , '' 
    80109/ 
    81110!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    84113/ 
    85114!----------------------------------------------------------------------- 
    86 &namcla        !   cross land advection 
    87 !----------------------------------------------------------------------- 
    88 / 
    89 !----------------------------------------------------------------------- 
    90115&namagrif      !  AGRIF zoom                                            ("key_agrif") 
    91116!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    96121/ 
    97122!----------------------------------------------------------------------- 
    98 &nambbc        !   bottom temperature boundary condition 
    99 !----------------------------------------------------------------------- 
     123&nambbc        !   bottom temperature boundary condition                (default: NO) 
     124!----------------------------------------------------------------------- 
     125   ln_trabbc   = .true.    !  Apply a geothermal heating at the ocean bottom 
    100126/ 
    101127!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    108134/ 
    109135!----------------------------------------------------------------------- 
    110 &namtra_adv    !   advection scheme for tracer  
    111 !----------------------------------------------------------------------- 
    112 / 
    113 !----------------------------------------------------------------------- 
    114 &namtra_ldf    !   lateral diffusion scheme for tracers  
    115 !----------------------------------------------------------------------- 
    116  
    117    rn_aht_0         =  1000.    !  horizontal eddy diffusivity for tracers [m2/s] 
    118    rn_aeiv_0        =     0.    !  eddy induced velocity coefficient [m2/s]    (require "key_traldf_eiv") 
     136&namtra_dmp    !   tracer: T & S newtonian damping 
     137!----------------------------------------------------------------------- 
     138   ln_tradmp   =  .false.   !  add a damping termn (T) or not (F) 
     139/ 
     140!----------------------------------------------------------------------- 
     141&namtra_adv    !   advection scheme for tracer 
     142!----------------------------------------------------------------------- 
     143   ln_traadv_fct =  .true.    !  FCT scheme 
     144      nn_fct_h   =  2               !  =2/4, horizontal 2nd / 4th order 
     145      nn_fct_v   =  2               !  =2/4, vertical   2nd / COMPACT 4th order 
     146      nn_fct_zts =  0               !  >=1,  2nd order FCT scheme with vertical sub-timestepping 
     147      !                             !        (number of sub-timestep = nn_fct_zts) 
     148/ 
     149!----------------------------------------------------------------------- 
     150&namtra_ldf    !   lateral diffusion scheme for tracers 
     151!----------------------------------------------------------------------- 
     152   !                       !  Operator type: 
     153   ln_traldf_lap   =  .true.   !    laplacian operator 
     154   ln_traldf_blp   =  .false.  !  bilaplacian operator 
     155   !                       !  Direction of action: 
     156   ln_traldf_lev   =  .false.  !  iso-level 
     157   ln_traldf_hor   =  .false.  !  horizontal (geopotential) 
     158   ln_traldf_iso   =  .true.   !  iso-neutral (standard operator) 
     159   ln_traldf_triad =  .false.  !  iso-neutral (triad    operator) 
     160   ! 
     161   !                       !  iso-neutral options:         
     162   ln_traldf_msc   =  .true.   !  Method of Stabilizing Correction (both operators) 
     163   rn_slpmax       =   0.01    !  slope limit                      (both operators) 
     164   ln_triad_iso    =  .false.  !  pure horizontal mixing in ML              (triad only) 
     165   rn_sw_triad     =  1        !  =1 switching triad ; =0 all 4 triads used (triad only) 
     166   ln_botmix_triad =  .false.  !  lateral mixing on bottom                  (triad only) 
     167   ! 
     168   !                       !  Coefficients: 
     169   nn_aht_ijk_t    = 20        !  space/time variation of eddy coef 
     170   !                                !   =-20 (=-30)    read in eddy_diffusivity_2D.nc (..._3D.nc) file 
     171   !                                !   =  0           constant 
     172   !                                !   = 10 F(k)      =ldf_c1d 
     173   !                                !   = 20 F(i,j)    =ldf_c2d 
     174   !                                !   = 21 F(i,j,t)  =Treguier et al. JPO 1997 formulation 
     175   !                                !   = 30 F(i,j,k)  =ldf_c2d + ldf_c1d 
     176   !                                !   = 31 F(i,j,k,t)=F(local velocity) 
     177   rn_aht_0        = 1000.     !  lateral eddy diffusivity   (lap. operator) [m2/s] 
     178   rn_bht_0        = 1.e+12    !  lateral eddy diffusivity (bilap. operator) [m4/s] 
     179/ 
     180!---------------------------------------------------------------------------------- 
     181&namtra_ldfeiv !   eddy induced velocity param. 
     182!---------------------------------------------------------------------------------- 
     183   ln_ldfeiv     =.false.   ! use eddy induced velocity parameterization 
    119184/ 
    120185!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    125190&namdyn_vor    !   option of physics/algorithm (not control by CPP keys) 
    126191!----------------------------------------------------------------------- 
     192   ln_dynvor_ene = .false. !  enstrophy conserving scheme 
     193   ln_dynvor_ens = .false. !  energy conserving scheme 
     194   ln_dynvor_mix = .false. !  mixed scheme 
     195   ln_dynvor_een = .true.  !  energy & enstrophy scheme 
     196      nn_een_e3f = 1             !  e3f = masked averaging of e3t divided by 4 (=0) or by the sum of mask (=1) 
    127197/ 
    128198!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    131201/ 
    132202!----------------------------------------------------------------------- 
     203&namdyn_spg    !   Surface pressure gradient 
     204!----------------------------------------------------------------------- 
     205   ln_dynspg_ts = .true.   !  Split-explicit free surface 
     206/ 
     207!----------------------------------------------------------------------- 
    133208&namdyn_ldf    !   lateral diffusion on momentum 
    134209!----------------------------------------------------------------------- 
    135    !                       !  Type of the operator :  
    136    ln_dynldf_lap    =  .false.  !  laplacian operator          
    137    ln_dynldf_bilap  =  .true.   !  bilaplacian operator     
    138    rn_ahm_0_blp     = -8.5e+11  !  horizontal bilaplacian eddy viscosity [m4/s]  
     210   !                       !  Type of the operator : 
     211   !                           !  no diffusion: set ln_dynldf_lap=..._blp=F 
     212   ln_dynldf_lap =  .false.    !    laplacian operator 
     213   ln_dynldf_blp =  .true.     !  bilaplacian operator 
     214   !                       !  Direction of action  : 
     215   ln_dynldf_lev =  .true.     !  iso-level 
     216   ln_dynldf_hor =  .false.    !  horizontal (geopotential) 
     217   ln_dynldf_iso =  .false.    !  iso-neutral 
     218   !                       !  Coefficient 
     219   nn_ahm_ijk_t  =   0         !  space/time variation of eddy coef 
     220   !                                !  =-30  read in eddy_viscosity_3D.nc file 
     221   !                                !  =-20  read in eddy_viscosity_2D.nc file 
     222   !                                !  =  0  constant 
     223   !                                !  = 10  F(k)=c1d 
     224   !                                !  = 20  F(i,j)=F(grid spacing)=c2d 
     225   !                                !  = 30  F(i,j,k)=c2d*c1d 
     226   !                                !  = 31  F(i,j,k)=F(grid spacing and local velocity) 
     227   rn_ahm_0      =  40000.     !  horizontal laplacian eddy viscosity   [m2/s] 
     228   rn_ahm_b      =      0.     !  background eddy viscosity for ldf_iso [m2/s] 
     229   rn_bhm_0      = 8.5e+11      !  horizontal bilaplacian eddy viscosity [m4/s] 
    139230/ 
    140231!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    156247/ 
    157248!----------------------------------------------------------------------- 
    158 &namsol        !   elliptic solver / island / free surface  
    159 !----------------------------------------------------------------------- 
    160 / 
    161 !----------------------------------------------------------------------- 
    162249&nammpp        !   Massively Parallel Processing                        ("key_mpp_mpi) 
    163250!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    180267/ 
    181268!----------------------------------------------------------------------- 
    182 &namdyn_nept  !   Neptune effect (simplified: lateral and vertical diffusions removed) 
    183 !----------------------------------------------------------------------- 
    184 / 
     269&namobs       !  observation usage                                      ('key_diaobs') 
     270!----------------------------------------------------------------------- 
     271/ 
     272!----------------------------------------------------------------------- 
     273&nam_asminc   !   assimilation increments                               ('key_asminc') 
     274!----------------------------------------------------------------------- 
     275/ 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/EXP00/iodef.xml

    r4696 r6225  
    33 
    44 <context id="nemo" time_origin="1950-01-01 00:00:00" > 
     5     
     6    <!-- $id$ --> 
     7     
     8    <!--  
     9============================================================================================================ 
     10=                                  definition of all existing variables                                    = 
     11=                                            DO NOT CHANGE                                                 = 
     12============================================================================================================ 
     13    --> 
     14    <field_definition src="./field_def.xml"/> 
     15    <!--  
     16============================================================================================================ 
     17=                                           output files definition                                        = 
     18=                                            Define your own files                                         = 
     19=                                         put the variables you want...                                    = 
     20============================================================================================================ 
     21    --> 
     22     
     23    <file_definition type="multiple_file" name="@expname@_@freq@_@startdate@_@enddate@" sync_freq="10d" min_digits="4"> 
     24     
     25      <file_group id="1ts" output_freq="1ts"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1 time step files --> 
     26      <file_group id="1h" output_freq="1h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1h files --> 
     27      <file_group id="2h" output_freq="2h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 2h files --> 
     28      <file_group id="3h" output_freq="3h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 3h files -->      
     29      <file_group id="4h" output_freq="4h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 4h files --> 
     30      <file_group id="6h" output_freq="6h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 6h files -->      
     31      <file_group id="1d" output_freq="1d"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1d files --> 
     32      <file_group id="3d" output_freq="3d"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 3d files -->     
     33 
     34      <file_group id="5d" output_freq="5d"  output_level="10" enabled=".TRUE." >  <!-- 5d files -->   
     35  
     36   <file id="file1" name_suffix="_grid_T" description="ocean T grid variables" > 
     37     <field field_ref="e3t"                          /> 
     38     <field field_ref="toce"         name="thetao"                                                                      operation="instant" freq_op="5d" > @toce_e3t / @e3t </field> 
     39     <field field_ref="soce"         name="so"                                                                          operation="instant" freq_op="5d" > @soce_e3t / @e3t </field> 
     40     <field field_ref="sst"          name="tos"      /> 
     41     <field field_ref="sss"          name="sos"      /> 
     42     <field field_ref="ssh"          name="zos"      /> 
     43     <field field_ref="sst"          name="tosstd"       long_name="sea surface temperature standard deviation"         operation="instant" freq_op="5d" > sqrt( @sst2 - @sst * @sst ) </field> 
     44     <field field_ref="ssh"          name="zosstd"       long_name="sea surface height above geoid standard deviation"  operation="instant" freq_op="5d" > sqrt( @ssh2 - @ssh * @ssh ) </field> 
     45     <field field_ref="sst"          name="sstdcy"       long_name="amplitude of sst diurnal cycle"                     operation="average" freq_op="1d" > @sstmax - @sstmin </field> 
     46     <field field_ref="mldkz5"                       /> 
     47     <field field_ref="mldr10_1"                     /> 
     48     <field field_ref="mldr10_1"     name="mldr10_1dcy"  long_name="amplitude of mldr10_1 diurnal cycle"                operation="average" freq_op="1d" > @mldr10_1max - @mldr10_1min </field> 
     49     <field field_ref="empmr"        name="wfo"      /> 
     50     <field field_ref="qsr"          name="rsntds"   /> 
     51     <field field_ref="qt"           name="tohfls"   /> 
     52     <field field_ref="saltflx"      name="sosflxdo" /> 
     53     <field field_ref="taum"                         /> 
     54     <field field_ref="wspd"         name="sowindsp" /> 
     55      <field field_ref="precip"       name="soprecip" /> 
     56     <field field_ref="sbt"                          /> 
     57   </file> 
     58 
     59   <file id="file3" name_suffix="_grid_U" description="ocean U grid variables" > 
     60     <field field_ref="e3u"                       /> 
     61     <field field_ref="ssu"          name="uos"   /> 
     62     <field field_ref="uoce"         name="uo"      operation="instant" freq_op="5d" > @uoce_e3u / @e3u </field> 
     63     <field field_ref="utau"         name="tauuo" /> 
     64   </file> 
     65    
     66   <file id="file4" name_suffix="_grid_V" description="ocean V grid variables" > 
     67     <field field_ref="e3v"                       /> 
     68     <field field_ref="ssv"          name="vos"   /> 
     69     <field field_ref="voce"         name="vo"      operation="instant" freq_op="5d" > @voce_e3v / @e3v </field> 
     70     <field field_ref="vtau"         name="tauvo" /> 
     71   </file> 
     72    
     73   <file id="file5" name_suffix="_grid_W" description="ocean W grid variables" > 
     74     <field field_ref="e3w"                        /> 
     75     <field field_ref="woce"         name="wo"     /> 
     76     <field field_ref="avt"          name="difvho" /> 
     77   </file> 
     78 
     79   <file id="file6" name_suffix="_icemod" description="ice variables" > 
     80     <field field_ref="ice_pres"   /> 
     81     <field field_ref="snowthic_cea" name="snd" /> 
     82     <field field_ref="icethic_cea"  name="sit" /> 
     83     <field field_ref="iceprod_cea"  name="sip" /> 
     84     <field field_ref="ist_ipa"    /> 
     85     <field field_ref="uice_ipa"   /> 
     86     <field field_ref="vice_ipa"   /> 
     87     <field field_ref="utau_ice"   /> 
     88     <field field_ref="vtau_ice"   /> 
     89     <field field_ref="qsr_io_cea" /> 
     90     <field field_ref="qns_io_cea" /> 
     91     <field field_ref="snowpre"    /> 
     92   </file> 
     93 
     94   <!-- 
     95   <file id="file8" name_suffix="_Tides" description="tidal harmonics" > 
     96     <field field_ref="M2x"          name="M2x"      long_name="M2 Elevation harmonic real part"                       /> 
     97     <field field_ref="M2y"          name="M2y"      long_name="M2 Elevation harmonic imaginary part"                  /> 
     98     <field field_ref="M2x_u"        name="M2x_u"    long_name="M2 current barotrope along i-axis harmonic real part "       /> 
     99     <field field_ref="M2y_u"        name="M2y_u"    long_name="M2 current barotrope along i-axis harmonic imaginary part "  /> 
     100     <field field_ref="M2x_v"        name="M2x_v"    long_name="M2 current barotrope along j-axis harmonic real part "       /> 
     101     <field field_ref="M2y_v"        name="M2y_v"    long_name="M2 current barotrope along j-axis harmonic imaginary part "  /> 
     102   </file> 
     103   --> 
     104 
     105      </file_group> 
     106 
     107      <file_group id="1m" output_freq="1mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real monthly files --> 
     108      <file_group id="2m" output_freq="2mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 2m files --> 
     109      <file_group id="3m" output_freq="3mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 3m files --> 
     110      <file_group id="4m" output_freq="4mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 4m files --> 
     111      <file_group id="6m" output_freq="6mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 6m files --> 
     112 
     113      <file_group id="1y"  output_freq="1y" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real yearly files --> 
     114      <file_group id="2y"  output_freq="2y" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 2y files --> 
     115      <file_group id="5y"  output_freq="5y" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 5y files --> 
     116      <file_group id="10y" output_freq="10y" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 10y files --> 
     117 
     118   </file_definition> 
     119     
     120    <!--  
     121============================================================================================================ 
     122= grid definition = = DO NOT CHANGE = 
     123============================================================================================================ 
     124    --> 
     125     
     126   <axis_definition>   
     127      <axis id="deptht"  long_name="Vertical T levels"  unit="m" positive="down" /> 
     128      <axis id="depthu"  long_name="Vertical U levels"  unit="m" positive="down" /> 
     129      <axis id="depthv"  long_name="Vertical V levels"  unit="m" positive="down" /> 
     130      <axis id="depthw"  long_name="Vertical W levels"  unit="m" positive="down" /> 
     131      <axis id="nfloat"  long_name="Float number"       unit="1"                 /> 
     132      <axis id="icbcla"  long_name="Iceberg class"      unit="1"                 /> 
     133      <axis id="ncatice" long_name="Ice category"       unit="1"                 /> 
     134      <axis id="iax_20C" long_name="20 degC isotherm"   unit="degC"              /> 
     135      <axis id="iax_28C" long_name="28 degC isotherm"   unit="degC"              /> 
     136   </axis_definition>  
     137    
     138   <domain_definition src="./domain_def.xml"/> 
     139    
     140   <grid_definition>     
     141     <grid id="grid_T_2D" domain_ref="grid_T"/> 
     142     <grid id="grid_T_3D" domain_ref="grid_T" axis_ref="deptht"/> 
     143     <grid id="grid_U_2D" domain_ref="grid_U"/> 
     144     <grid id="grid_U_3D" domain_ref="grid_U" axis_ref="depthu"/> 
     145     <grid id="grid_V_2D" domain_ref="grid_V"/> 
     146     <grid id="grid_V_3D" domain_ref="grid_V" axis_ref="depthv"/> 
     147     <grid id="grid_W_2D" domain_ref="grid_W"/> 
     148     <grid id="grid_W_3D" domain_ref="grid_W" axis_ref="depthw"/> 
     149     <grid id="gznl_T_2D" domain_ref="gznl"/> 
     150     <grid id="gznl_T_3D" domain_ref="gznl" axis_ref="deptht"/> 
     151     <grid id="gznl_W_3D" domain_ref="gznl" axis_ref="depthw"/> 
     152    </grid_definition>    
     153  </context> 
     154   
     155 <context id="1_nemo" time_origin="1950-01-01 00:00:00" > 
    5156     
    6157    <!-- $id$ --> 
    … …  
    54205 
    55206   <file id="file3" name_suffix="_grid_U" description="ocean U grid variables" > 
    56      <field field_ref="suoce"        name="uos"     long_name="sea_surface_x_velocity"    /> 
     207     <field field_ref="ssu"          name="uos"     long_name="sea_surface_x_velocity"    /> 
    57208     <field field_ref="uoce"         name="uo"      long_name="sea_water_x_velocity"      /> 
    58209     <field field_ref="utau"         name="tauuo"   long_name="surface_downward_x_stress" /> 
    … …  
    63214    
    64215   <file id="file4" name_suffix="_grid_V" description="ocean V grid variables" > 
    65      <field field_ref="svoce"        name="vos"     long_name="sea_surface_y_velocity"    /> 
     216     <field field_ref="ssv"          name="vos"     long_name="sea_surface_y_velocity"    /> 
    66217     <field field_ref="voce"         name="vo"      long_name="sea_water_y_velocity"      /> 
    67218     <field field_ref="vtau"         name="tauvo"   long_name="surface_downward_y_stress" /> 
    … …  
    75226     <field field_ref="avt"          name="difvho"  long_name="ocean_vertical_heat_diffusivity" /> 
    76227   </file> 
    77  
     228<!-- 
    78229   <file id="file6" name_suffix="_icemod" description="ice variables" > 
    79230     <field field_ref="ice_pres"                     /> 
    … …  
    91242   </file> 
    92243 
    93    <!-- 
    94244   <file id="file8" name_suffix="_Tides" description="tidal harmonics" > 
    95245     <field field_ref="M2x"          name="M2x"      long_name="M2 Elevation harmonic real part"                       /> 
    … …  
    147297    </grid_definition>    
    148298  </context> 
    149    
    150299 
    151300  <context id="xios"> 
    … …  
    156305        We must have buffer_size > jpi*jpj*jpk*8 (with jpi and jpj the subdomain size) 
    157306--> 
    158      <variable id="buffer_size"               type="integer">5000000</variable> 
     307     <variable id="buffer_size"               type="integer">50000000</variable> 
    159308     <variable id="buffer_server_factor_size" type="integer">2</variable> 
    160309     <variable id="info_level"                type="integer">0</variable> 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/EXP00/iodef_ar5.xml

    r4153 r6225  
    3232      <file_group id="1d" output_freq="1d"  enabled=".TRUE.">                      <!-- 1d files --> 
    3333   <file id="file1" name_suffix="_grid_T_table2.2" >         <!-- grid T  --> 
    34      <field field_ref="sst"          name='tos'      long_name="sea_surface_temperature"                              level="2"                      /> 
    35      <field field_ref="sst2"         name='tossq'    long_name="square_of_sea_surface_temperature"                    level="2"                      /> 
    36      <field field_ref="mldkz5"       name='omldamax' long_name="ocean_mixed_layer_thickness_defined_by_mixing_scheme" level="2" operation="maximum" /> 
     34     <field field_ref="sst"          name='tos'      long_name="sea_surface_temperature"                              level="2" /> 
     35     <field field_ref="sst2"         name='tossq'    long_name="square_of_sea_surface_temperature"                    level="2" /> 
     36     <field field_ref="mldkz5"       name='omldamax' long_name="ocean_mixed_layer_thickness_defined_by_mixing_scheme" standard_name="ocean_mixed_layer_thickness_defined_by_mixing_scheme" level="2" operation="maximum" /> 
    3737   </file>    
    3838      </file_group> 
    … …  
    4040++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++   monthly   +++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++ 
    4141     --> 
    42       <file_group id="1m" output_freq="1mo"     enabled=".TRUE.">                      <!-- real monthly files --> 
     42      <file_group id="1m" output_freq="1mo" enabled=".TRUE.">                      <!-- real monthly files --> 
    4343   <!-- 
    4444..............................................    grid T   ................................................. 
    4545     -->    
    4646   <file id="file2" name_suffix="_grid_T_table2.2" > 
    47      <field field_ref="botpres"      name="pbo"      long_name="sea_water_pressure_at_sea_floor"                               /> 
     47     <field field_ref="botpres"      name="pbo"      long_name="sea_water_pressure_at_sea_floor" /> 
    4848     <!-- pso : sea_water_pressure_at_sea_water_surface = 0 --> 
    49      <field field_ref="ssh"          name="zos"      long_name="sea_surface_height_above_geoid"                                 /> 
    50      <field field_ref="ssh2"         name="zossq"    long_name="square_of_sea_surface_height_above_geoid"             level="2" /> 
    51      <!-- masscello : sea_water_mass_per_unit_area = cellthc*rau0                                          no time changes --> 
    52      <field field_ref="cellthc"      name="thkcello" long_name="cell_thickness"                                                 /> <!-- no time changes --> 
    53      <field field_ref="toce"         name="thetao"   long_name="sea_water_potential_temperature"                                /> 
    54      <field field_ref="sst"          name="tos"      long_name="sea_surface_temperature"                              level="1" /> 
    55      <field field_ref="sst2"         name="tossq"    long_name="square_of_sea_surface_temperature"                    level="2" /> 
    56      <field field_ref="soce"         name="so"       long_name="sea_water_salinity"                                             /> 
    57      <field field_ref="sss"          name="sos"      long_name="sea_surface_salinity"                                 level="1" /> 
    58      <field field_ref="rhop"         name="rhopoto"  long_name="sea_water_potential_density"                          level="2" /> 
     49     <field field_ref="ssh"          name="zos"      long_name="sea_surface_height_above_geoid"  /> 
     50     <field field_ref="ssh2"         name="zossq"    long_name="square_of_sea_surface_height_above_geoid"  level="2" /> 
     51     <!-- masscello : sea_water_mass_per_unit_area = e3t*rau0                                          no time changes --> 
     52     <field field_ref="e3t"          name="thkcello" long_name="cell_thickness"                  /> <!-- no time changes --> 
     53     <field field_ref="toce"         name="thetao"   long_name="sea_water_potential_temperature" /> 
     54     <field field_ref="sst"          name="tos"      long_name="sea_surface_temperature"                   level="1" /> 
     55     <field field_ref="sst2"         name="tossq"    long_name="square_of_sea_surface_temperature"         level="2" /> 
     56     <field field_ref="soce"         name="so"       long_name="sea_water_salinity"              /> 
     57     <field field_ref="sss"          name="sos"      long_name="sea_surface_salinity"                      level="1" /> 
     58     <field field_ref="rhop"         name="rhopoto"  long_name="sea_water_potential_density"               level="2" /> 
    5959     <!-- no agessc : sea_water_age_since_surface_contact --> 
    6060     <!-- no cfc11  : moles_per_unit_mass_of_cfc11_in_sea_water --> 
    … …  
    6262     <!-- mlotst    :           ocean_mixed_layer_thickness_defined_by_sigma_t : must be done offline --> 
    6363     <!-- mlotstsq  : square_of_ocean_mixed_layer_thickness_defined_by_sigma_t : must be done offline --> 
    64      <field field_ref="mldkz5"       name='omlmax'   long_name="ocean_mixed_layer_thickness_defined_by_mixing_scheme" level="2" operation="maximum" /> 
     64     <field field_ref="mldkz5"       name='omlmax'   long_name="ocean_mixed_layer_thickness_defined_by_mixing_scheme" standard_name="ocean_mixed_layer_thickness_defined_by_mixing_scheme" level="2" operation="maximum" /> 
    6565   </file>    
    6666    
    6767   <file id="file3" name_suffix="_grid_T_table2.5" > 
    68      <field field_ref="rain"         name="pr"       long_name="rainfall_flux"                                           level="1" /> 
    69      <field field_ref="snow_ao_cea"  name="prsn"     long_name="snowfall_flux"                                           level="1" /> 
    70      <field field_ref="evap_ao_cea"  name="evs"      long_name="water_evaporation_flux"                                  level="1" /> 
    71      <field field_ref="runoffs"      name="friver"   long_name="water_flux_into_sea_water_from_rivers"                   level="1" /> 
    72      <field field_ref="calving"      name="ficeberg" long_name="water_flux_into_sea_water_from_icebergs"                 level="1" /> 
    73      <field field_ref="isnwmlt_cea"  name="fsitherm" long_name="water_flux_into_sea_water_due_to_sea_ice_thermodynamics" level="1" /> 
    74      <field field_ref="empmr"        name="wfo"      long_name="water_flux_into_sea_water"                               level="1" /> 
     68     <field field_ref="rain"         name="pr"       long_name="rainfall_flux"                           level="1" /> 
     69     <field field_ref="snow_ao_cea"  name="prsn"     long_name="snowfall_flux"                           level="1" /> 
     70     <field field_ref="evap_ao_cea"  name="evs"      long_name="water_evaporation_flux"                  level="1" /> 
     71     <field field_ref="runoffs"      name="friver"   long_name="water_flux_into_sea_water_from_rivers"   level="1" /> 
     72     <field field_ref="calving_cea"  name="ficeberg" long_name="water_flux_into_sea_water_from_icebergs" level="1" /> 
     73      <!-- Referenced variable "isnwmlt_cea" is snow melt flux only? --> 
     74     <field field_ref="isnwmlt_cea"  name="fsitherm" long_name="water_flux_into_sea_water_due_to_sea_ice_thermodynamics" standard_name="water_flux_into_sea_water_due_to_sea_ice_thermodynamics" level="1" /> 
     75     <!-- Referenced variable "empmr" is positive upward, "wfo" is positive downward --> 
     76     <field field_ref="empmr"        name="wfo"      long_name="water_flux_into_sea_water"                               standard_name="water_flux_into_sea_water"                               level="1" /> 
    7577     <!-- wfonocorr : water_flux_into_sea_water_without_flux_correction : emp - erp -->   
    76      <field field_ref="erp"          name="wfcorr"   long_name="water_flux_correction"                                   level="1" /> <!-- usually = 0 --> 
     78      <!-- Referenced variable "erp" is newtonian damping term --> 
     79     <field field_ref="erp"          name="wfcorr"   long_name="water_flux_correction"                                   standard_name="water_flux_correction"                                   level="1" /> <!-- usually = 0 --> 
    7780   </file>    
    7881    
    … …  
    8487     <!-- vsf      : virtual_salt_flux_into_sea_water = fsal_virtual + fsal_real --> 
    8588     <!-- wfcorr   : virtual_salt_flux_correction                        = 0 -->  
    86      <field field_ref="fsal_virt_cea" name="sfdsi"  long_name="downward_sea_ice_basal_salt_flux"                               level="1" /> 
     89      <!-- Should be field_ref = "fsal_real_cea"? --> 
     90     <field field_ref="fsal_virt_cea" name="sfdsi"  long_name="downward_sea_ice_basal_salt_flux" standard_name="downward_sea_ice_basal_salt_flux" level="1" /> 
    8791     <!-- sfriver  : salt_flux_into_sea_water_from_rivers                = 0 -->  
    8892   </file>    
    … …  
    101105     <field field_ref="qns"           name="nshfls"      long_name="surface_net_downward_non_solar_flux"                                         level="1" /> 
    102106     <field field_ref="qsr"           name="rsntds"      long_name="surface_net_downward_shortwave_flux"                                         level="1" /> 
     107     <!-- Should be name="rsdo" --> 
    103108     <field field_ref="qsr3d"         name="rsds"        long_name="downwelling_shortwave_flux_in_sea_water"                                     level="1" /> 
    104      <field field_ref="qrp"           name="hfcorr"      long_name="heat_flux_correction"                                                        level="1" /> 
     109      <!-- Referenced variable "qrp" is newtonian damping term --> 
     110     <field field_ref="qrp"           name="hfcorr"      long_name="heat_flux_correction" standard_name="heat_flux_correction"                   level="1" /> 
    105111   </file>    
    106112   <!-- 
    … …  
    108114   --> 
    109115   <file id="file6" name_suffix="_grid_U_table2.3" > 
    110      <field field_ref="uoce"         name="uo"      long_name="sea_water_x_velocity"                                       /> 
    111      <field field_ref="u_masstr"     name="umo"     long_name="ocean_mass_x_transport"                           level="1" /> 
    112      <field field_ref="u_heattr"     name="hfx"     long_name="ocean_heat_x_transport"                           level="1" /> 
    113      <field field_ref="ueiv_heattr"  name="hfxba"   long_name="ocean_heat_x_transport_due_to_bolus_advection"    level="2" /> 
    114      <field field_ref="udiff_heattr" name="hfxdiff" long_name="ocean_heat_x_transport_due_to_diffusion"          level="2" /> 
     116     <field field_ref="uoce"         name="uo"      long_name="sea_water_x_velocity" /> 
     117     <field field_ref="u_masstr"     name="umo"     long_name="ocean_mass_x_transport"                        level="1" /> 
     118     <field field_ref="u_heattr"     name="hfx"     long_name="ocean_heat_x_transport"                        level="1" /> 
     119     <field field_ref="ueiv_heattr"  name="hfxba"   long_name="ocean_heat_x_transport_due_to_bolus_advection" level="2" /> 
     120     <field field_ref="udiff_heattr" name="hfxdiff" long_name="ocean_heat_x_transport_due_to_diffusion"       level="2" /> 
    115121   </file>    
    116122    
    117123   <file id="file7" name_suffix="_grid_U_table2.8" > 
    118      <field field_ref="utau"         name="tauuo" long_name="surface_downward_x_stress"                          level="1" /> 
     124     <field field_ref="utau"         name="tauuo"   long_name="surface_downward_x_stress"                     level="1" /> 
    119125     <!-- tauucorr : surface_downward_x_stress_correction = 0 --> 
    120126   </file>    
    … …  
    123129   --> 
    124130   <file id="file8" name_suffix="_grid_V_table2.3" > 
    125      <field field_ref="voce"         name="vo"      long_name="sea_water_y_velocity"                                       /> 
    126      <field field_ref="v_masstr"     name="vmo"     long_name="ocean_mass_y_transport"                           level="1" /> 
    127      <field field_ref="v_heattr"     name="hfy"     long_name="ocean_heat_y_transport"                           level="1" /> 
    128      <field field_ref="veiv_heattr"  name="hfyba"   long_name="ocean_heat_y_transport_due_to_bolus_advection"    level="2" /> 
    129      <field field_ref="vdiff_heattr" name="hfydiff" long_name="ocean_heat_y_transport_due_to_diffusion"          level="2" /> 
     131     <field field_ref="voce"         name="vo"      long_name="sea_water_y_velocity" /> 
     132     <field field_ref="v_masstr"     name="vmo"     long_name="ocean_mass_y_transport"                        level="1" /> 
     133     <field field_ref="v_heattr"     name="hfy"     long_name="ocean_heat_y_transport"                        level="1" /> 
     134     <field field_ref="veiv_heattr"  name="hfyba"   long_name="ocean_heat_y_transport_due_to_bolus_advection" level="2" /> 
     135     <field field_ref="vdiff_heattr" name="hfydiff" long_name="ocean_heat_y_transport_due_to_diffusion"       level="2" /> 
    130136   </file>    
    131137    
    132138   <file id="file9" name_suffix="_grid_V_table2.8" > 
    133      <field field_ref="vtau"         name="tauvo" long_name="surface_downward_y_stress"                          level="1" /> 
     139     <field field_ref="vtau"         name="tauvo"   long_name="surface_downward_y_stress"                     level="1" /> 
    134140     <!-- tauvcorr : surface_downward_y_stress_correction = 0 --> 
    135141   </file>    
    … …  
    138144   --> 
    139145   <file id="file10" name_suffix="_grid_W_table2.3" > 
    140      <field field_ref="w_masstr"   name="wmo"   long_name="upward_ocean_mass_transport"                                    /> 
    141      <field field_ref="w_masstr2"  name="wmosq" long_name="square_pf_upward_ocean_mass_transport"                          /> 
     146     <field field_ref="w_masstr"   name="wmo"   long_name="upward_ocean_mass_transport"           /> 
     147     <field field_ref="w_masstr2"  name="wmosq" long_name="square_pf_upward_ocean_mass_transport" /> 
    142148   </file>    
    143149    
    144150   <file id="file11" name_suffix="_grid_W_table2.9" > 
    145      <field field_ref="avt"     name="difvho"   long_name="ocean_vertical_heat_diffusivity"                  level="2" /> 
    146      <field field_ref="avs"     name="difvso"   long_name="ocean_vertical_salt_diffusivity"                  level="2" /> 
     151     <field field_ref="avt"     name="difvho"   long_name="ocean_vertical_heat_diffusivity"                level="2" /> 
     152     <field field_ref="avs"     name="difvso"   long_name="ocean_vertical_salt_diffusivity"                level="2" /> 
    147153     <!-- difvtrbo : ocean_vertical_tracer_diffusivity_due_to_background : cte with time, see namelist parameters nn_avb and  nn_havtb --> 
    148      <field field_ref="av_tide" name="difvtrto" long_name="ocean_vertical_tracer_diffusivity_due_to_tides"   level="2" /> 
     154     <field field_ref="av_tide" name="difvtrto" long_name="ocean_vertical_tracer_diffusivity_due_to_tides" level="2" /> 
    149155     <!-- tnpeo     : tendency_of_ocean_potential_energy_content                   : not available --> 
    150156     <!-- tnpeot    : tendency_of_ocean_potential_energy_content_due_to_tides      : not available --> 
    151157     <!-- tnpeotb   : tendency_of_ocean_potential_energy_content_due_to_background : not available --> 
    152      <field field_ref="avm"     name="difvmo"   long_name="ocean_vertical_momentum_diffusivity"              level="2" /> 
     158     <field field_ref="avm"     name="difvmo"   long_name="ocean_vertical_momentum_diffusivity"            level="2" /> 
    153159     <!-- difvmbo : ocean_vertical_momentum_diffusivity_due_to_background : cte with time, see namelist parameters nn_avb --> 
    154      <field field_ref="av_tide" name="difvmto"  long_name="ocean_vertical_momentum_diffusivity_due_to_tides" level="2" /> <!-- same as tracer --> 
     160     <field field_ref="av_tide" name="difvmto"  long_name="ocean_vertical_momentum_diffusivity_due_to_tides" standard_name="ocean_vertical_momentum_diffusivity_due_to_tides" level="2" /> <!-- same as tracer --> 
    155161     <!-- difvmfdo : ocean_vertical_momentum_diffusivity_due_to_form_drag : ??? --> 
    156162     <!-- dispkevfo : ocean_kinetic_energy_dissipation_per_unit_area_due_to_vertical_friction : not available --> 
    … …  
    159165   <file id="file12" name_suffix="_grid_W_table2.10" > 
    160166     <!-- if ln_traldf_lap    =  .true. --> 
    161      <field field_ref="aht2d_eiv" name="diftrblo" long_name="ocean_tracer_bolus_laplacian_diffusivity"                     level="2" /> 
     167     <field field_ref="aht2d_eiv" name="diftrblo" long_name="ocean_tracer_bolus_laplacian_diffusivity" level="2" /> 
    162168     <!-- diftrelo : ocean_tracer_epineutral_laplacian_diffusivity : cte with time, see ln_traldf_iso --> 
    163169     <!-- diftrxylo : ocean_tracer_xy_laplacian_diffusivity : cte with time --> 
    … …  
    175181   --> 
    176182   <file id="file13" name_suffix="_scalar_table2.2" >         <!-- scalar --> 
    177      <field field_ref="masstot"    name="masso"    long_name="sea_water_mass"                                /> 
    178      <field field_ref="voltot"     name="volo"     long_name="sea_water_volume"                              /> 
    179      <field field_ref="sshtot"     name="zosga"    long_name="global_average_sea_level_change"               /> 
    180      <field field_ref="sshsteric"  name="zossga"   long_name="global_average_steric_sea_level_change"        /> 
    181      <field field_ref="sshthster"  name="zostoga"  long_name="global_average_thermosteric_sea_level_change"  /> 
    182      <field field_ref="temptot"    name="thetaoga" long_name="sea_water_potential_temperature"               /> 
    183      <field field_ref="saltot"     name="soga"     long_name="sea_water_salinity"                            /> 
     183     <field field_ref="masstot"    name="masso"    long_name="sea_water_mass"                               /> 
     184     <field field_ref="voltot"     name="volo"     long_name="sea_water_volume"                             /> 
     185     <field field_ref="sshtot"     name="zosga"    long_name="global_average_sea_level_change"              /> 
     186     <field field_ref="sshsteric"  name="zossga"   long_name="global_average_steric_sea_level_change"       /> 
     187     <field field_ref="sshthster"  name="zostoga"  long_name="global_average_thermosteric_sea_level_change" /> 
     188     <field field_ref="temptot"    name="thetaoga" long_name="sea_water_potential_temperature"              /> 
     189     <field field_ref="saltot"     name="soga"     long_name="sea_water_salinity"                           /> 
    184190   </file>    
    185191   <!-- 
    … …  
    187193   --> 
    188194   <file id="file14" name_suffix="_icemod_table2.2" >         <!-- scalar --> 
    189      <field field_ref="ice_pres"                     /> 
    190      <field field_ref="ice_cover"    name="sic"        long_name="sea_ice_area_fraction"                            /> 
    191      <field field_ref="icethic_cea"  name="sit"        long_name="sea_ice_thickness"                                /> 
    192      <field field_ref="subl_ai_cea"  name="evap"       long_name="water_evaporation_flux"                           /> 
    193      <field field_ref="snowthic_cea" name="snd"        long_name="surface_snow_thickness"                           /> 
     195     <field field_ref="ice_pres" /> 
     196     <field field_ref="ice_cover"    name="sic"       long_name="sea_ice_area_fraction"                                           /> 
     197     <field field_ref="icethic_cea"  name="sit"       long_name="sea_ice_thickness"                                               /> 
     198     <field field_ref="subl_ai_cea"  name="evap"      long_name="water_evaporation_flux" standard_name="water_evaporation_flux"   /> 
     199     <field field_ref="snowthic_cea" name="snd"       long_name="surface_snow_thickness"                                          /> 
    194200     <!-- snc : surface_snow_area_fraction : same as sic --> 
    195      <field field_ref="icealb_cea"   name="ialb"       long_name="Bare Sea Ice Albedo"                              /> 
     201     <field field_ref="icealb_cea"   name="ialb"      long_name="Bare Sea Ice Albedo"                                             /> 
    196202     <!-- ssi : Sea Ice Salinity : cte = sice = 6, expect in baltic sea = 2 --> 
    197      <field field_ref="ist_cea"      name="tsice"      long_name="Surface Temperature of Sea Ice"                   /> 
     203     <field field_ref="ist_cea"      name="tsice"     long_name="Surface Temperature of Sea Ice"                                  /> 
    198204     <!-- tsnint : Temperature at Interface Between Sea Ice and Snow : not available --> 
    199205     <!-- pr : Surface Rainfall Rate into the Sea Ice Portion of the Grid Cell = 0 --> 
    200      <field field_ref="snow_ai_cea"  name="prsn"       long_name="Surface Snowfall Rate into the Sea Ice Portion of the Grid Cell" /> 
     206     <field field_ref="snow_ai_cea"  name="prsn"      long_name="Surface Snowfall Rate into the Sea Ice Portion of the Grid Cell" /> 
    201207     <!-- ageice   : Age of Sea Ice : not available ??? --> 
    202208     <!-- grFrazil : Frazil Sea Ice Growth (Leads) Rate ??? --> 
    203209     <!-- grCongel : Congelation Sea Ice Growth Rate ??? --> 
    204      <field field_ref="licepro_cea"  name="grLateral"  long_name="Lateral Sea Ice Growth Rate"                      /> 
    205      <field field_ref="sntoice_cea"  name="snoToIce"   long_name="Snow-Ice Formation Rate"                          /> 
    206      <field field_ref="snowmel_cea"  name="snomelt"    long_name="Snow Melt Rate"                                   /> 
    207      <field field_ref="ticemel_cea"  name="tmelt"      long_name="Rate of Melt at Upper Surface of Sea Ice"         /> 
    208      <field field_ref="bicemel_cea"  name="bmelt"      long_name="Rate of Melt at Sea Ice Base"                     /> 
     210     <field field_ref="licepro_cea"  name="grLateral" long_name="Lateral Sea Ice Growth Rate"                                     /> 
     211     <field field_ref="sntoice_cea"  name="snoToIce"  long_name="Snow-Ice Formation Rate"                                         /> 
     212     <field field_ref="snowmel_cea"  name="snomelt"   long_name="Snow Melt Rate"                                                  /> 
     213     <field field_ref="ticemel_cea"  name="tmelt"     long_name="Rate of Melt at Upper Surface of Sea Ice"                        /> 
     214     <field field_ref="bicemel_cea"  name="bmelt"     long_name="Rate of Melt at Sea Ice Base"                                    /> 
    209215     <!-- hcice  : Sea Ice Total Heat Content ??? --> 
    210      <field field_ref="qsr_ai_cea"   name="rsdssi"     long_name="surface_downwelling_shortwave_flux_in_air"        /> 
     216     <field field_ref="qsr_ai_cea"   name="rsdssi"    long_name="surface_downwelling_shortwave_flux_in_air"                       /> 
    211217     <!-- rsussi : surface_upwelling_shortwave_flux_in_air ??? --> 
    212218     <!-- rldssi : surface_downwelling_longwave_flux_in_air ??? --> 
    … …  
    214220     <!-- hfssi  : surface_upward_sensible_heat_flux ??? --> 
    215221     <!-- hflssi : surface_upward_latent_heat_flux ??? --> 
    216      <field field_ref="subl_ai_cea"  name="sblsi"      long_name="surface_snow_and_ice_sublimation_flux"             /> 
    217      <field field_ref="u_imasstr"    name="transix"    long_name="Eastward Sea Ice Transport"                        /> 
    218      <field field_ref="v_imasstr"    name="transiy"    long_name="Northward Sea Ice Transport"                       /> 
    219      <field field_ref="fram_trans"   name="transifs"   long_name="Sea Ice Mass Transport Through Fram Strait"        /> 
    220      <field field_ref="utau_ice"     name="strairx"    long_name="Eastward Atmospheric Stress On Sea Ice"            /> 
    221      <field field_ref="vtau_ice"     name="strairy"    long_name="Northward Atmospheric Stress On Sea Ice"           /> 
     222     <field field_ref="subl_ai_cea"  name="sblsi"     long_name="surface_snow_and_ice_sublimation_flux"                           /> 
     223     <field field_ref="u_imasstr"    name="transix"   long_name="Eastward Sea Ice Transport"                                      /> 
     224     <field field_ref="v_imasstr"    name="transiy"   long_name="Northward Sea Ice Transport"                                     /> 
     225     <field field_ref="fram_trans"   name="transifs"  long_name="Sea Ice Mass Transport Through Fram Strait"                      /> 
     226     <field field_ref="utau_ice"     name="strairx"   long_name="Eastward Atmospheric Stress On Sea Ice"                          /> 
     227     <field field_ref="vtau_ice"     name="strairy"   long_name="Northward Atmospheric Stress On Sea Ice"                         /> 
    222228     <!-- strocnx : Eastward Ocean Stress On Sea Ice ??? --> 
    223229     <!-- strocny : Northward Ocean Stress On Sea Ice ??? --> 
    … …  
    243249 
    244250   <axis_definition>   
    245       <axis id="deptht" long_name="Vertical T levels" unit="m" positive="down" /> 
    246       <axis id="depthu" long_name="Vertical U levels" unit="m" positive="down" /> 
    247       <axis id="depthv" long_name="Vertical V levels" unit="m" positive="down" /> 
    248       <axis id="depthw" long_name="Vertical W levels" unit="m" positive="down" /> 
    249       <axis id="nfloat" long_name="Float number"      unit="-"  /> 
    250       <axis id="icbcla" long_name="Iceberg class"     unit="-"  /> 
    251    </axis_definition>  
     251      <axis id="deptht"  long_name="Vertical T levels"  unit="m" positive="down" /> 
     252      <axis id="depthu"  long_name="Vertical U levels"  unit="m" positive="down" /> 
     253      <axis id="depthv"  long_name="Vertical V levels"  unit="m" positive="down" /> 
     254      <axis id="depthw"  long_name="Vertical W levels"  unit="m" positive="down" /> 
     255      <axis id="nfloat"  long_name="Float number"       unit="1"                 /> 
     256      <axis id="icbcla"  long_name="Iceberg class"      unit="1"                 /> 
     257      <axis id="ncatice" long_name="Ice category"       unit="1"                 /> 
     258      <axis id="iax_20C" long_name="20 degC isotherm"   unit="degC"              /> 
     259      <axis id="iax_28C" long_name="28 degC isotherm"   unit="degC"              /> 
     260   </axis_definition> 
    252261     
    253262   <domain_definition src="./domain_def.xml"/> 
    … …  
    262271     <grid id="grid_W_2D" domain_ref="grid_W"/> 
    263272     <grid id="grid_W_3D" domain_ref="grid_W" axis_ref="depthw"/> 
     273     <grid id="gznl_T_2D" domain_ref="gznl"/> 
     274     <grid id="gznl_T_3D" domain_ref="gznl" axis_ref="deptht"/> 
     275     <grid id="gznl_W_3D" domain_ref="gznl" axis_ref="depthw"/> 
    264276    </grid_definition>     
    265277 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/EXP00/iodef_crs.xml

    r4152 r6225  
    3434 
    3535   <file id="file1" name_suffix="_grid_T" description="ocean T grid variables" > 
    36      <field field_ref="sst"          name="tos"      long_name="sea_surface_temperature"                       /> 
    37      <field field_ref="sss"          name="sos"      long_name="sea_surface_salinity"                          /> 
    38      <field field_ref="ssh"          name="zos"      long_name="sea_surface_height_above_geoid"                /> 
     36     <field field_ref="sst"          name="tos" /> 
     37     <field field_ref="sss"          name="sos" /> 
     38     <field field_ref="ssh"          name="zos" /> 
    3939   </file> 
    4040 
    4141   <file id="file2" name_suffix="_grid_U" description="ocean U grid variables" > 
    42      <field field_ref="suoce"        name="uos"     long_name="sea_surface_x_velocity"    /> 
     42     <field field_ref="ssu"          name="uos" /> 
    4343   </file> 
    4444    
    4545   <file id="file3" name_suffix="_grid_V" description="ocean V grid variables" > 
    46      <field field_ref="svoce"        name="vos"     long_name="sea_surface_y_velocity"    /> 
     46     <field field_ref="ssv"          name="vos" /> 
    4747   </file> 
    4848    
    … …  
    5454 
    5555   <file id="file4" name_suffix="_grid_T" description="ocean T grid variables" > 
    56      <field field_ref="toce"         name="thetao"   long_name="sea_water_potential_temperature"               /> 
    57      <field field_ref="soce"         name="so"       long_name="sea_water_salinity"                            /> 
    58      <field field_ref="sst"          name="tos"      long_name="sea_surface_temperature"                       /> 
    59      <field field_ref="sst2"         name="tossq"    long_name="square_of_sea_surface_temperature"             /> 
    60      <field field_ref="sss"          name="sos"      long_name="sea_surface_salinity"                          /> 
    61      <field field_ref="ssh"          name="zos"      long_name="sea_surface_height_above_geoid"                /> 
    62      <field field_ref="ssh2"         name="zossq"    long_name="square_of_sea_surface_height_above_geoid"      /> 
    63      <field field_ref="empmr"        name="wfo"      long_name="water_flux_into_sea_water"                     /> 
    64      <field field_ref="qsr"          name="rsntds"   long_name="surface_net_downward_shortwave_flux"           /> 
    65      <field field_ref="qt"           name="tohfls"   long_name="surface_net_downward_total_heat_flux"          /> 
    66      <field field_ref="taum"         /> 
    67      <field field_ref="mldkz5"       /> 
    68      <field field_ref="mldr10_1"     /> 
     56     <field field_ref="toce"         name="thetao" /> 
     57     <field field_ref="soce"         name="so"     /> 
     58     <field field_ref="sst"          name="tos"    /> 
     59     <field field_ref="sst2"         name="tossq"  /> 
     60     <field field_ref="sss"          name="sos"    /> 
     61     <field field_ref="ssh"          name="zos"    /> 
     62     <field field_ref="ssh2"         name="zossq"  /> 
     63     <field field_ref="empmr"        name="wfo"    /> 
     64     <field field_ref="qsr"          name="rsntds" /> 
     65     <field field_ref="qt"           name="tohfls" /> 
     66     <field field_ref="taum"     /> 
     67     <field field_ref="mldkz5"   /> 
     68     <field field_ref="mldr10_1" /> 
    6969   </file> 
    7070    
    7171   <file id="file5" name_suffix="_grid_U" description="ocean U grid variables" > 
    72      <field field_ref="uoce"         name="uo"      long_name="sea_water_x_velocity"      /> 
    73      <field field_ref="suoce"        name="uos"     long_name="sea_surface_x_velocity"    /> 
    74      <field field_ref="utau"         name="tauuo"   long_name="surface_downward_x_stress" /> 
     72     <field field_ref="uoce"         name="uo"    /> 
     73     <field field_ref="ssu"          name="uos"   /> 
     74     <field field_ref="utau"         name="tauuo" /> 
    7575   </file> 
    7676    
    7777   <file id="file6" name_suffix="_grid_V" description="ocean V grid variables" > 
    78      <field field_ref="voce"         name="vo"      long_name="sea_water_y_velocity"      /> 
    79      <field field_ref="svoce"        name="vos"     long_name="sea_surface_y_velocity"    /> 
    80      <field field_ref="vtau"         name="tauvo"   long_name="surface_downward_y_stress" /> 
     78     <field field_ref="voce"         name="vo"    /> 
     79     <field field_ref="ssv"          name="vos"   /> 
     80     <field field_ref="vtau"         name="tauvo" /> 
    8181   </file> 
    8282    
    8383   <file id="file7" name_suffix="_grid_W" description="ocean W grid variables" > 
    84      <field field_ref="woce"         name="wo"      long_name="ocean vertical velocity"         /> 
    85      <field field_ref="avt"          name="difvho"  long_name="ocean_vertical_heat_diffusivity" /> 
     84     <field field_ref="woce"         name="wo"     /> 
     85     <field field_ref="avt"          name="difvho" /> 
    8686   </file> 
    8787    
    8888   <file id="file8" name_suffix="_icemod" description="ice variables" > 
    89      <field field_ref="ice_pres"                     /> 
    90      <field field_ref="snowthic_cea" name="snd"     long_name="surface_snow_thickness"   /> 
    91      <field field_ref="icethic_cea"  name="sit"     long_name="sea_ice_thickness"        /> 
    92      <field field_ref="iceprod_cea"  name="sip"     long_name="sea_ice_thickness"        /> 
    93      <field field_ref="ist_ipa"      /> 
    94      <field field_ref="ioceflxb"     /> 
    95      <field field_ref="uice_ipa"     /> 
    96      <field field_ref="vice_ipa"     /> 
    97      <field field_ref="utau_ice"     /> 
    98      <field field_ref="vtau_ice"     /> 
    99      <field field_ref="qsr_io_cea"   /> 
    100      <field field_ref="qns_io_cea"   /> 
    101      <field field_ref="snowpre"      /> 
     89     <field field_ref="ice_pres"   /> 
     90     <field field_ref="snowthic_cea" name="snd" /> 
     91     <field field_ref="icethic_cea"  name="sit" /> 
     92     <field field_ref="iceprod_cea"  name="sip" /> 
     93     <field field_ref="ist_ipa"    /> 
     94     <field field_ref="ioceflxb"   /> 
     95     <field field_ref="uice_ipa"   /> 
     96     <field field_ref="vice_ipa"   /> 
     97     <field field_ref="utau_ice"   /> 
     98     <field field_ref="vtau_ice"   /> 
     99     <field field_ref="qsr_io_cea" /> 
     100     <field field_ref="qns_io_cea" /> 
     101     <field field_ref="snowpre"    /> 
    102102   </file> 
    103103    
    … …  
    124124     
    125125   <axis_definition>   
    126       <axis id="deptht" long_name="Vertical T levels" unit="m" positive="down" /> 
    127       <axis id="depthu" long_name="Vertical U levels" unit="m" positive="down" /> 
    128       <axis id="depthv" long_name="Vertical V levels" unit="m" positive="down" /> 
    129       <axis id="depthw" long_name="Vertical W levels" unit="m" positive="down" /> 
    130       <axis id="nfloat" long_name="Float number"      unit="-"  /> 
     126      <axis id="deptht"  long_name="Vertical T levels" unit="m" positive="down" /> 
     127      <axis id="depthu"  long_name="Vertical U levels" unit="m" positive="down" /> 
     128      <axis id="depthv"  long_name="Vertical V levels" unit="m" positive="down" /> 
     129      <axis id="depthw"  long_name="Vertical W levels" unit="m" positive="down" /> 
     130      <axis id="nfloat"  long_name="Float number"      unit="1"                 /> 
     131      <axis id="icbcla"  long_name="Iceberg class"     unit="1"                 /> 
     132      <axis id="ncatice" long_name="Ice category"      unit="1"                 /> 
     133      <axis id="iax_20C" long_name="20 degC isotherm"  unit="degC"              /> 
     134      <axis id="iax_28C" long_name="28 degC isotherm"  unit="degC"              /> 
    131135   </axis_definition>  
    132136     
    … …  
    142146     <grid id="grid_W_2D" domain_ref="grid_W"/> 
    143147     <grid id="grid_W_3D" domain_ref="grid_W" axis_ref="depthw"/> 
     148     <grid id="gznl_T_2D" domain_ref="gznl"/> 
     149     <grid id="gznl_T_3D" domain_ref="gznl" axis_ref="deptht"/> 
     150     <grid id="gznl_W_3D" domain_ref="gznl" axis_ref="depthw"/> 
    144151    </grid_definition>    
    145152  </context> 
    … …  
    169176 
    170177   <file id="file1" name_suffix="_gcrs_T" description="ocean T grid variables" > 
    171      <field field_ref="sst"          name="tos"      long_name="sea_surface_temperature"                       /> 
    172      <field field_ref="sss"          name="sos"      long_name="sea_surface_salinity"                          /> 
    173      <field field_ref="ssh"          name="zos"      long_name="sea_surface_height_above_geoid"                /> 
     178     <field field_ref="sst"          name="tos" /> 
     179     <field field_ref="sss"          name="sos" /> 
     180     <field field_ref="ssh"          name="zos" /> 
    174181   </file> 
    175182 
    176183   <file id="file2" name_suffix="_gcrs_U" description="ocean U grid variables" > 
    177      <field field_ref="uoce"         name="uo"      long_name="sea_water_x_velocity"      /> 
     184     <field field_ref="uoce"         name="uo" /> 
    178185   </file> 
    179186    
    180187   <file id="file3" name_suffix="_gcrs_V" description="ocean V grid variables" > 
    181      <field field_ref="voce"         name="vo"      long_name="sea_water_y_velocity"      /> 
     188     <field field_ref="voce"         name="vo" /> 
    182189   </file> 
    183190    
    … …  
    187194 
    188195   <file id="file4" name_suffix="_gcrs_T" description="ocean T grid variables" > 
    189      <field field_ref="toce"         name="thetao"   long_name="sea_water_potential_temperature"               /> 
    190      <field field_ref="soce"         name="so"       long_name="sea_water_salinity"                            /> 
    191      <field field_ref="sst"          name="tos"      long_name="sea_surface_temperature"                       /> 
    192      <field field_ref="sss"          name="sos"      long_name="sea_surface_salinity"                          /> 
    193      <field field_ref="ssh"          name="zos"      long_name="sea_surface_height_above_geoid"                /> 
    194           <field field_ref="eken"         name="eke"      long_name="Kinetic energy"/> 
     196     <field field_ref="toce"         name="thetao" /> 
     197     <field field_ref="soce"         name="so"     /> 
     198     <field field_ref="sst"          name="tos"    /> 
     199     <field field_ref="sss"          name="sos"    /> 
     200     <field field_ref="ssh"          name="zos"    /> 
     201      <field field_ref="eken"         name="eke"    /> 
    195202   </file> 
    196203    
    197204   <file id="file5" name_suffix="_gcrs_U" description="ocean U grid variables" > 
    198      <field field_ref="uoce"         name="uo"      long_name="sea_water_x_velocity"      /> 
    199      <field field_ref="uocet"         /> 
    200      <field field_ref="uoces"         /> 
     205     <field field_ref="uoce"         name="uo" /> 
     206     <field field_ref="uocet" /> 
     207     <field field_ref="uoces" /> 
    201208   </file> 
    202209    
    203210   <file id="file6" name_suffix="_gcrs_V" description="ocean V grid variables" > 
    204      <field field_ref="voce"         name="vo"      long_name="sea_water_y_velocity"      /> 
    205      <field field_ref="vocet"         /> 
    206      <field field_ref="voces"         /> 
     211     <field field_ref="voce"         name="vo" /> 
     212     <field field_ref="vocet" /> 
     213     <field field_ref="voces" /> 
    207214   </file> 
    208215    
    209216   <file id="file7" name_suffix="_gcrs_W" description="ocean W grid variables" > 
    210      <field field_ref="woce"         name="wo"      long_name="ocean vertical velocity"         /> 
     217     <field field_ref="woce"         name="wo" /> 
    211218   </file> 
    212219 
    … …  
    233240     
    234241   <axis_definition>   
    235       <axis id="deptht" long_name="Vertical T levels" unit="m" positive="down" /> 
    236       <axis id="depthu" long_name="Vertical U levels" unit="m" positive="down" /> 
    237       <axis id="depthv" long_name="Vertical V levels" unit="m" positive="down" /> 
    238       <axis id="depthw" long_name="Vertical W levels" unit="m" positive="down" /> 
    239    </axis_definition>  
     242      <axis id="deptht"  long_name="Vertical T levels"  unit="m" positive="down" /> 
     243      <axis id="depthu"  long_name="Vertical U levels"  unit="m" positive="down" /> 
     244      <axis id="depthv"  long_name="Vertical V levels"  unit="m" positive="down" /> 
     245      <axis id="depthw"  long_name="Vertical W levels"  unit="m" positive="down" /> 
     246      <axis id="nfloat"  long_name="Float number"       unit="1"                 /> 
     247      <axis id="icbcla"  long_name="Iceberg class"      unit="1"                 /> 
     248      <axis id="ncatice" long_name="Ice category"       unit="1"                 /> 
     249      <axis id="iax_20C" long_name="20 degC isotherm"   unit="degC"              /> 
     250      <axis id="iax_28C" long_name="28 degC isotherm"   unit="degC"              /> 
     251   </axis_definition> 
    240252     
    241253   <domain_definition src="./domain_def.xml"/> 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/EXP00/iodef_demo.xml

    r4153 r6225  
    6464     <field field_ref="sst"    name="sst_1d_inst" operation="instant" />     <!-- instant value --> 
    6565     <field field_ref="sst"    name="sst_1d_max"  operation="maximum" />     <!-- max --> 
    66      <field field_ref="suoce"  />   <!-- include a U-grid variable in the list --> 
     66     <field field_ref="ssu"  />   <!-- include a U-grid variable in the list --> 
    6767   </file> 
    6868    
    … …  
    7878     
    7979   <axis_definition>   
    80      <axis_group id="deptht" long_name="Vertical T levels" unit="m" positive="down" > 
    81        <axis id="deptht" /> 
    82        <axis id="deptht_myzoom" zoom_begin="1" zoom_end="10" /> 
    83      </axis_group> 
    84       <axis id="depthu" long_name="Vertical U levels" unit="m" positive="down" /> 
    85       <axis id="depthv" long_name="Vertical V levels" unit="m" positive="down" /> 
    86       <axis id="depthw" long_name="Vertical W levels" unit="m" positive="down" /> 
    87       <axis id="nfloat" long_name="Float number"      unit="-"  /> 
    88       <axis id="icbcla" long_name="Iceberg class"     unit="-"  /> 
     80      <axis_group id="deptht" long_name="Vertical T levels" unit="m" positive="down" >  
     81         <axis id="deptht" />  
     82         <axis id="deptht_myzoom" zoom_begin="1" zoom_end="10" />  
     83      </axis_group> 
     84      <axis id="depthu"  long_name="Vertical U levels"  unit="m" positive="down" /> 
     85      <axis id="depthv"  long_name="Vertical V levels"  unit="m" positive="down" /> 
     86      <axis id="depthw"  long_name="Vertical W levels"  unit="m" positive="down" /> 
     87      <axis id="nfloat"  long_name="Float number"       unit="1"                 /> 
     88      <axis id="icbcla"  long_name="Iceberg class"      unit="1"                 /> 
     89      <axis id="ncatice" long_name="Ice category"       unit="1"                 /> 
     90      <axis id="iax_20C" long_name="20 degC isotherm"   unit="degC"              /> 
     91      <axis id="iax_28C" long_name="28 degC isotherm"   unit="degC"              /> 
    8992   </axis_definition>  
    9093     
    … …  
    100103     <grid id="grid_W_2D" domain_ref="grid_W"/> 
    101104     <grid id="grid_W_3D" domain_ref="grid_W" axis_ref="depthw"/> 
     105     <grid id="gznl_T_2D" domain_ref="gznl"/> 
     106     <grid id="gznl_T_3D" domain_ref="gznl" axis_ref="deptht"/> 
     107     <grid id="gznl_W_3D" domain_ref="gznl" axis_ref="depthw"/> 
    102108    </grid_definition>     
    103109 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/EXP00/iodef_oldstyle.xml

    r4153 r6225  
    111111     
    112112   <axis_definition>   
    113       <axis id="deptht" long_name="Vertical T levels" unit="m" positive="down" /> 
    114       <axis id="depthu" long_name="Vertical U levels" unit="m" positive="down" /> 
    115       <axis id="depthv" long_name="Vertical V levels" unit="m" positive="down" /> 
    116       <axis id="depthw" long_name="Vertical W levels" unit="m" positive="down" /> 
    117       <axis id="nfloat" long_name="Float number"      unit="-"  /> 
    118       <axis id="icbcla" long_name="Iceberg class"     unit="-"  /> 
    119    </axis_definition>  
     113      <axis id="deptht"  long_name="Vertical T levels"  unit="m" positive="down" /> 
     114      <axis id="depthu"  long_name="Vertical U levels"  unit="m" positive="down" /> 
     115      <axis id="depthv"  long_name="Vertical V levels"  unit="m" positive="down" /> 
     116      <axis id="depthw"  long_name="Vertical W levels"  unit="m" positive="down" /> 
     117      <axis id="nfloat"  long_name="Float number"       unit="1"                 /> 
     118      <axis id="icbcla"  long_name="Iceberg class"      unit="1"                 /> 
     119      <axis id="ncatice" long_name="Ice category"       unit="1"                 /> 
     120      <axis id="iax_20C" long_name="20 degC isotherm"   unit="degC"              /> 
     121      <axis id="iax_28C" long_name="28 degC isotherm"   unit="degC"              /> 
     122   </axis_definition> 
    120123     
    121124   <domain_definition src="./domain_def.xml"/> 
    … …  
    130133     <grid id="grid_W_2D" domain_ref="grid_W"/> 
    131134     <grid id="grid_W_3D" domain_ref="grid_W" axis_ref="depthw"/> 
     135     <grid id="gznl_T_2D" domain_ref="gznl"/> 
     136     <grid id="gznl_T_3D" domain_ref="gznl" axis_ref="deptht"/> 
     137     <grid id="gznl_W_3D" domain_ref="gznl" axis_ref="depthw"/> 
    132138    </grid_definition>    
    133139  </context> 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/EXP00/namelist_cfg

    r4370 r6225  
    66&namrun        !   parameters of the run 
    77!----------------------------------------------------------------------- 
     8   nn_no       =       0   !  job number (no more used...) 
     9   cn_exp      =  "ORCA2"  !  experience name 
     10   nn_it000    =       1   !  first time step 
     11   nn_itend    =     300   !  last  time step (std 5475) 
    812/ 
    913!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    2428&namzgr        !   vertical coordinate 
    2529!----------------------------------------------------------------------- 
     30   ln_zps      = .true.    !  z-coordinate - partial steps 
     31   ln_linssh   = .true.    !  linear free surface 
    2632/ 
    2733!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    4854/ 
    4955!----------------------------------------------------------------------- 
    50 &namsplit      !   time splitting parameters                            ("key_dynspg_ts") 
    51 !----------------------------------------------------------------------- 
    52 / 
    53 !----------------------------------------------------------------------- 
    5456&namcrs        !   Grid coarsening for dynamics output and/or 
    5557               !   passive tracer coarsened online simulations 
    … …  
    9395/ 
    9496!----------------------------------------------------------------------- 
    95 &namcla        !   cross land advection 
    96 !----------------------------------------------------------------------- 
    97 / 
    98 !----------------------------------------------------------------------- 
    9997&nambfr        !   bottom friction 
    10098!----------------------------------------------------------------------- 
    10199/ 
    102100!----------------------------------------------------------------------- 
    103 &nambbc        !   bottom temperature boundary condition 
    104 !----------------------------------------------------------------------- 
     101&nambbc        !   bottom temperature boundary condition                (default: NO) 
     102!----------------------------------------------------------------------- 
     103   ln_trabbc   = .true.    !  Apply a geothermal heating at the ocean bottom 
    105104/ 
    106105!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    115114&namtra_adv    !   advection scheme for tracer 
    116115!----------------------------------------------------------------------- 
     116   ln_traadv_fct =  .true.    !  FCT scheme 
     117      nn_fct_h   =  2               !  =2/4, horizontal 2nd / 4th order  
     118      nn_fct_v   =  2               !  =2/4, vertical   2nd / COMPACT 4th order  
     119      nn_fct_zts =  0               !  > 1 , 2nd order FCT scheme with vertical sub-timestepping 
     120      !                             !        (number of sub-timestep = nn_fct_zts) 
    117121/ 
    118122!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    120124!----------------------------------------------------------------------- 
    121125/ 
    122 !----------------------------------------------------------------------- 
    123 &namtra_adv_mle !  mixed layer eddy parametrisation (Fox-Kemper param) 
    124 !----------------------------------------------------------------------- 
    125 / 
    126126!---------------------------------------------------------------------------------- 
    127127&namtra_ldf    !   lateral diffusion scheme for tracers 
    128128!---------------------------------------------------------------------------------- 
     129   !                       !  Operator type: 
     130   ln_traldf_lap   =  .true.   !    laplacian operator 
     131   ln_traldf_blp   =  .false.  !  bilaplacian operator 
     132   !                       !  Direction of action: 
     133   ln_traldf_lev   =  .false.  !  iso-level 
     134   ln_traldf_hor   =  .false.  !  horizontal (geopotential) 
     135   ln_traldf_iso   =  .true.   !  iso-neutral (standard operator) 
     136   ln_traldf_triad =  .false.  !  iso-neutral (triad    operator) 
     137   ! 
     138   !                       !  iso-neutral options:         
     139   ln_traldf_msc   =  .true.   !  Method of Stabilizing Correction (both operators) 
     140   rn_slpmax       =   0.01    !  slope limit                      (both operators) 
     141   ln_triad_iso    =  .false.  !  pure horizontal mixing in ML              (triad only) 
     142   rn_sw_triad     =  1        !  =1 switching triad ; =0 all 4 triads used (triad only) 
     143   ln_botmix_triad =  .false.  !  lateral mixing on bottom                  (triad only) 
     144   ! 
     145   !                       !  Coefficients: 
     146   nn_aht_ijk_t    = 20        !  space/time variation of eddy coef 
     147   !                                !   =-20 (=-30)    read in eddy_diffusivity_2D.nc (..._3D.nc) file 
     148   !                                !   =  0           constant 
     149   !                                !   = 10 F(k)      =ldf_c1d 
     150   !                                !   = 20 F(i,j)    =ldf_c2d 
     151   !                                !   = 21 F(i,j,t)  =Treguier et al. JPO 1997 formulation 
     152   !                                !   = 30 F(i,j,k)  =ldf_c2d + ldf_c1d 
     153   !                                !   = 31 F(i,j,k,t)=F(local velocity) 
     154   rn_aht_0        = 2000.     !  lateral eddy diffusivity   (lap. operator) [m2/s] 
     155   rn_bht_0        = 1.e+12    !  lateral eddy diffusivity (bilap. operator) [m4/s] 
     156/ 
     157!---------------------------------------------------------------------------------- 
     158&namtra_ldfeiv !   eddy induced velocity param. 
     159!---------------------------------------------------------------------------------- 
     160   ln_ldfeiv     =.true.   ! use eddy induced velocity parameterization 
     161   ln_ldfeiv_dia =.true.   ! diagnose eiv stream function and velocities 
     162   rn_aeiv_0     = 2000.   ! eddy induced velocity coefficient   [m2/s] 
     163   nn_aei_ijk_t  = 21      ! space/time variation of the eiv coeficient 
     164   !                                !   =-20 (=-30)    read in eddy_induced_velocity_2D.nc (..._3D.nc) file 
     165   !                                !   =  0           constant 
     166   !                                !   = 10 F(k)      =ldf_c1d 
     167   !                                !   = 20 F(i,j)    =ldf_c2d 
     168   !                                !   = 21 F(i,j,t)  =Treguier et al. JPO 1997 formulation 
     169   !                                !   = 30 F(i,j,k)  =ldf_c2d + ldf_c1d 
    129170/ 
    130171!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    139180&namdyn_vor    !   option of physics/algorithm (not control by CPP keys) 
    140181!----------------------------------------------------------------------- 
     182   ln_dynvor_ene = .false. !  enstrophy conserving scheme 
     183   ln_dynvor_ens = .false. !  energy conserving scheme 
     184   ln_dynvor_mix = .false. !  mixed scheme 
     185   ln_dynvor_een = .true.  !  energy & enstrophy scheme 
     186      nn_een_e3f = 0             !  e3f = masked averaging of e3t divided by 4 (=0) or by the sum of mask (=1) 
    141187/ 
    142188!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    145191/ 
    146192!----------------------------------------------------------------------- 
     193&namdyn_spg    !   Surface pressure gradient 
     194!----------------------------------------------------------------------- 
     195   ln_dynspg_ts = .true.   !  Split-explicit free surface 
     196/ 
     197!----------------------------------------------------------------------- 
    147198&namdyn_ldf    !   lateral diffusion on momentum 
    148199!----------------------------------------------------------------------- 
     200   !                       !  Type of the operator : 
     201   !                           !  no diffusion: set ln_dynldf_lap=..._blp=F  
     202   ln_dynldf_lap =  .true.     !    laplacian operator 
     203   ln_dynldf_blp =  .false.    !  bilaplacian operator 
     204   !                       !  Direction of action  : 
     205   ln_dynldf_lev =  .true.     !  iso-level 
     206   ln_dynldf_hor =  .false.    !  horizontal (geopotential) 
     207   ln_dynldf_iso =  .false.    !  iso-neutral 
     208   !                       !  Coefficient 
     209   nn_ahm_ijk_t  = -30         !  space/time variation of eddy coef 
     210   !                                !  =-30  read in eddy_viscosity_3D.nc file 
     211   !                                !  =-20  read in eddy_viscosity_2D.nc file 
     212   !                                !  =  0  constant  
     213   !                                !  = 10  F(k)=c1d 
     214   !                                !  = 20  F(i,j)=F(grid spacing)=c2d 
     215   !                                !  = 30  F(i,j,k)=c2d*c1d 
     216   !                                !  = 31  F(i,j,k)=F(grid spacing and local velocity) 
     217   rn_ahm_0      =  40000.     !  horizontal laplacian eddy viscosity   [m2/s] 
     218   rn_ahm_b      =      0.     !  background eddy viscosity for ldf_iso [m2/s] 
     219   rn_bhm_0      = 1.e+12      !  horizontal bilaplacian eddy viscosity [m4/s] 
    149220/ 
    150221!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    165236/ 
    166237!----------------------------------------------------------------------- 
    167 &namsol        !   elliptic solver / island / free surface 
    168 !----------------------------------------------------------------------- 
    169 / 
    170 !----------------------------------------------------------------------- 
    171238&nammpp        !   Massively Parallel Processing                        ("key_mpp_mpi) 
    172239!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    185252/ 
    186253!----------------------------------------------------------------------- 
    187 &namdyn_nept  !   Neptune effect (simplified: lateral and vertical diffusions removed) 
    188 !----------------------------------------------------------------------- 
    189 / 
     254&namobs       !  observation usage 
     255!----------------------------------------------------------------------- 
     256/ 
     257!----------------------------------------------------------------------- 
     258&nam_asminc   !   assimilation increments                               ('key_asminc') 
     259!----------------------------------------------------------------------- 
     260/ 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IDL_scripts/README

    r4394 r6225  
    22# prerequired 
    33#---------------------------------------------------------------------- 
    4 To use these idl tools, you need to download some climatogies and mask files; 
     4First, you need either : 
     5- IDL (version 6.4 or above), see : http://www.exelisvis.com/ProductsServices/IDL.aspx 
     6  In this case, you also need to download SAXO which is a free package of IDL scripts: 
     7  define $PATH_SAXO, the path where you will download SAXO and get it through svn with the following command. 
     8  > PATH_SAXO=... 
     9  > svn checkout http://forge.ipsl.jussieu.fr/saxo/svn/trunk/SRC $PATH_SAXO/SAXO_DIR/SRC 
     10 
     11- or the IDL Virtual Machine which is free to use and does not require a license to run , see : 
     12  http://www.exelisvis.com/Support/HelpArticlesDetail/TabId/219/ArtMID/900/ArticleID/12395/The-IDL-Virtual-Machine.aspx 
     13  the virtual machine requites std_main.sav that is distributed with this README. 
     14 
     15Next, to use these idl tools, you need to download some climatogies and mask files; 
    516that you can find here: http://dodsp.idris.fr/reee512/NEMO_OUT/ORCA2_LIM/ 
    617 
    … …  
    1324# define your std_plot_vardef.sh or std_ts_vardef.sh file 
    1425#---------------------------------------------------------------------- 
    15 Use the examples provided in : 
     26These files are needed to define your PATHs, the experiments and variables names you used in your experiment. 
     27 - std_plot_vardef.sh is used to do all plots based on temporal mean (maps, vertical profiles...). 
     28 - std_ts_vardef.sh is used to do all time-series type of plot. 
     29 
     30To build you own std_plot_vardef.sh or std_ts_vardef.sh file; use the examples provided such as: 
    1631 - std_ts_vardef.sh_example1 or std_ts_vardef.sh_example2 
    1732 - std_plot_vardef.sh_example1 or std_plot_vardef.sh_example2 
    18 to build your own std_plot_vardef.sh or std_ts_vardef.sh file. 
    1933 
    20 This file is needed to define you PATH, the experiments and variables names 
     34Note that if you use the IDL Virtual Machine, the variable SAXO_DIR defined in std_plot_vardef.sh or std_ts_vardef.sh is not used. Any definition will be ok. 
    2135 
    22 you can copy std_ts_vardef.sh_example1 con std_ts_vardef.sh 
    23 and std_plot_vardef.sh_example1 std_plot_vardef.sh 
     36#---------------------------------------------------------------------- 
     37# HOW TO USE  
     38#---------------------------------------------------------------------- 
     39./std_main.sh -plot -pdf 
     40or 
     41./std_main.sh -ts -pdf 
    2442 
    2543 
    2644 
    2745 
    28  
    29  
    30 #---------------------------------------------------------------------- 
    31 # short note on: How to build IDL virtual Machine: 
     46########################################################################################################## 
     47# short note for developers of this package on: 
     48#                   How to build the tarball required for IDL virtual Machine: 
     49########################################################################################################## 
     50# 
     51# we need to recreate std_main.sav as soon as we change IDL programmes files as 
     52# std_main.sav contains all ".pro" files aready compiled to be used with the virtual machine 
    3253# 
    3354. ./std_plot_vardef.sh # or . ./std_ts_vardef.sh  

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IDL_scripts/std_plot_IceFrac.pro

    r4559 r6225  
    2121   
    2222  IF keyword_set(arc) THEN BEGIN  
    23     domdef, 20, 380, 50, 90 
     23    domdef, 20, 380, 40, 90 
    2424    map = [90, 0, 0] 
    2525  ENDIF 
    2626  IF keyword_set(ant) THEN BEGIN  
    27     domdef, 20, 380, -90, -50 
     27    domdef, 20, 380, -90, -40 
    2828    map = [-90, 0, 0] 
    2929  ENDIF 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IDL_scripts/std_plot_all.pro

    r4559 r6225  
    172172  Ithi_april_1 = {arr:1./float(cnt) * total(reform(Ithi_1.arr[*, *, temporary(april)],nxt,nyt,cnt), 3), unit:Ithi_1.unit} 
    173173  jan = where(mm EQ 1, cnt) 
     174  Ithi_jan_1 = {arr:1./float(cnt) * total(reform(Ithi_1.arr[*, *, temporary(jan)],nxt,nyt,cnt), 3), unit:Ithi_1.unit}  
    174175  sept = where(mm EQ 9, cnt) 
    175   Ithi_jan_1 = {arr:1./float(cnt) * total(reform(Ithi_1.arr[*, *, temporary(jan)],nxt,nyt,cnt), 3), unit:Ithi_1.unit}  
    176176  Ithi_sept_1 = {arr:1./float(cnt) * total(reform(Ithi_1.arr[*, *, temporary(sept)],nxt,nyt,cnt), 3), unit:Ithi_1.unit}  
    177177  undefine, Ithi_1 
    … …  
    288288     Isal_sept_2 = {arr:-1} 
    289289   ENDELSE 
    290 ; 
     290 
    291291  IvelU_1 = read_ncdf(getenv('VAR1_IvelU'), allrecords = allrec, filename = std_file1_I )  
    292292  IvelV_1 = read_ncdf(getenv('VAR1_IvelV'), allrecords = allrec, filename = std_file1_I )  
    … …  
    335335    Ivelo_sept_2 = {arr:-1} 
    336336  ENDELSE 
    337 ; 
     337 
    338338  Iage_1 = read_ncdf(getenv('VAR1_Iage'), allrecords = allrec, filename = std_file1_I )  
    339339  caldat, time, mm 
    … …  
    396396  cnt = cnt+1   &   blabla = 'Erp salinity damping term' 
    397397  IF doplot EQ cnt OR doplot EQ 0 THEN std_plot_erp, ERP1, ERP2, _extra = ex 
    398 ; 
     398;; 
    399399  cnt = cnt+1   &   blabla = 'Evaporation - Precipitation - Runoff term' 
    400400  IF doplot EQ cnt OR doplot EQ 0 THEN std_plot_emp, EMP1, EMP2, _extra = ex 
    … …  
    439439  IF doplot EQ cnt OR doplot EQ 0 THEN std_plot_mld, MLD1, MLD2, MLD, _extra = ex 
    440440; 
     441  cnt = cnt+1   &   blabla = 'Mixed layer depth ortho plan ARCTIC' 
     442  IF doplot EQ cnt OR doplot EQ 0 THEN std_plot_MLD_ortho, MLD1, MLD2, /ARC, _extra = ex 
     443;sf 
     444  cnt = cnt+1   &   blabla = 'Mixed layer depth ortho plan ANTARTIC' 
     445  IF doplot EQ cnt OR doplot EQ 0 THEN std_plot_MLD_ortho, MLD1, MLD2, /ANT, _extra = ex 
     446;sf 
    441447  cnt = cnt+1   &   blabla = 'Zonal mean Mixed layer depth' 
    442448  IF doplot EQ cnt OR doplot EQ 0 THEN std_plot_ZonMld, MLD1, MLD2, MLD, _extra = ex 
    … …  
    564570  cnt = cnt+1   &   blabla = 'Antartic Ice Velocity: SEPT' 
    565571  IF doplot EQ cnt OR doplot EQ 0 THEN std_plot_IceVel, IvelU_sept_1, IvelU_sept_2, IvelV_sept_1, IvelV_sept_2, Ivelo_sept_1, Ivelo_sept_2, /ANT,  /SEPT, _extra = ex 
    566 ; 
     572 
    567573  cnt = cnt+1   &   blabla = 'Arctic Ice Age: MARCH' 
    568574  IF doplot EQ cnt OR doplot EQ 0 THEN std_plot_IceAge, Iage_march_1, Iage_march_2, Ifra_march_1, Ifra_march_2, /ARC, /MARCH, _extra = ex 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IDL_scripts/std_plot_vardef.sh

    r4562 r6225  
    2121#idl_command=idl71 
    2222# 
    23 PS_DIR=$( pwd )/OR2LPv36_ps_plot 
    24 PDF_DIR=$( pwd )/OR2LPv36_pdf_plot 
     23PS_DIR=$( pwd )/p4H25a50-testht_ps_plot 
     24PDF_DIR=$( pwd )/p4H25a50-testht_pdf_plot 
    2525HTML_DIR=$( pwd )/html_plot 
    2626SAXO_DIR=/Users/sflod/SAXO_DIR 
    2727# 
    28 DIR_DATA=/Users/sflod/idl_PLOTS/DATA_STORE/RUN_CLIMATO/500y_pisces     # path of data in NetCDF format 
     28DIR_DATA=/Users/sflod/idl_PLOTS/DATA_STORE/RUN_CLIMATO/lim3_ada     # path of data in NetCDF format 
    2929DIR_CLIMATO=/Users/sflod/idl_PLOTS/CLIMATOLOGIES    # path of climatological data 
    3030DIR_MASK=/Users/sflod/idl_PLOTS/MASK  # path of mask files (ex: subbasins) 
    … …  
    5454# 
    5555#===================== EXP1 ===================== 
    56 # 23610101_23701231 
    57 FILE1_T=OR2LPv36_23610101_23701231_1Y_grid_T.nc   # exp1 grid T input file 
    58 FILE1_U=OR2LPv36_23610101_23701231_1Y_grid_U.nc   # exp1 grid U input file 
    59 FILE1_V=OR2LPv36_23610101_23701231_1Y_grid_V.nc   # exp1 grid V input file 
    60 FILE1_I=OR2LPv36_23610101_23701231_1M_icemod.nc   # exp1 ice    input file 
     56# 
     57FILE1_T=p4H25a50_20410101_20501231_1Y_grid_T.nc   # exp1 grid T input file 
     58FILE1_U=p4H25a50_20410101_20501231_1Y_grid_U.nc   # exp1 grid U input file 
     59FILE1_V=p4H25a50_20410101_20501231_1Y_grid_V.nc   # exp1 grid V input file 
     60FILE1_I=p4H25a50_20410101_20501231_1M_icemod.nc   # exp1 ice    input file 
    6161VAR1_T=thetao 
    6262VAR1_S=so         
    63 VAR1_QNET=tohfls 
    64 VAR1_ERP=sowafldp       
     63VAR1_QNET=qt 
     64VAR1_ERP=wfcorr 
    6565VAR1_EMP=wfo 
    6666VAR1_MLD=mldr10_1 
    6767VAR1_U=uocetr_eff 
    6868VAR1_V=vocetr_eff 
    69 VAR1_Ithick=iicethic 
    70 VAR1_Ifrac=soicecov 
    71 VAR1_Isnow=isnowthi 
    72 #VAR1_Isal=sisali 
    73 #VAR1_Iage=siages 
    74 VAR1_IvelU=iicevelu 
    75 VAR1_IvelV=iicevelv 
    76 #VAR1_Ivelo=sivelo 
     69VAR1_Ithick=sithic 
     70VAR1_Ifrac=siconc 
     71VAR1_Isnow=snvolu 
     72VAR1_Isal=sisali 
     73VAR1_Iage=siages 
     74VAR1_IvelU=sivelu 
     75VAR1_IvelV=sivelv 
     76VAR1_Ivelo=sivelo 
    7777# 
    7878#===================== EXP2 ===================== 
    7979# 
    80 FILE2_T=OR2LPv36_23610101_23701231_1Y_grid_T.nc   # exp1 grid T input file 
    81 FILE2_U=OR2LPv36_23610101_23701231_1Y_grid_U.nc   # exp1 grid U input file 
    82 FILE2_V=OR2LPv36_23610101_23701231_1Y_grid_V.nc   # exp1 grid V input file 
    83 FILE2_I=OR2LPv36_23610101_23701231_1M_icemod.nc   # exp1 ice    input file 
     80FILE2_T=testht_20410101_20501231_1Y_grid_T.nc   # exp1 grid T input file 
     81FILE2_U=testht_20410101_20501231_1Y_grid_U.nc   # exp1 grid U input file 
     82FILE2_V=testht_20410101_20501231_1Y_grid_V.nc   # exp1 grid V input file 
     83FILE2_I=testht_20410101_20501231_1M_icemod.nc   # exp1 ice    input file 
    8484VAR2_T=thetao 
    8585VAR2_S=so 
    86 VAR2_QNET=tohfls 
    87 VAR2_ERP=sowafldp 
     86VAR2_QNET=qt 
     87VAR2_ERP=wfcorr 
    8888VAR2_EMP=wfo 
    8989VAR2_MLD=mldr10_1 
    9090VAR2_U=uocetr_eff 
    9191VAR2_V=vocetr_eff 
    92 VAR2_Ithick=iicethic 
    93 VAR2_Ifrac=soicecov 
    94 VAR2_Isnow=isnowthi 
    95 #VAR2_Isal=sisali 
    96 #VAR2_Iage=siages 
    97 VAR2_IvelU=iicevelu 
    98 VAR2_IvelV=iicevelv 
    99 #VAR2_Ivelo=sivelo 
     92VAR2_Ithick=sithic 
     93VAR2_Ifrac=siconc 
     94VAR2_Isnow=snvolu 
     95VAR2_Isal=sisali 
     96VAR2_Iage=siages 
     97VAR2_IvelU=sivelu 
     98VAR2_IvelV=sivelv 
     99VAR2_Ivelo=sivelo 
    100100# 
    101101######################### Export Variables ############################### 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IDL_scripts/std_plot_vardef.sh.old_names

    r4559 r6225  
    7474VAR1_IvelU=iicevelu 
    7575VAR1_IvelV=iicevelv 
    76 VAR1_Ivelo=iicevelo 
     76#VAR1_Ivelo=iicevelo 
    7777# 
    7878#===================== EXP2 ===================== 
    … …  
    9999VAR2_IvelU=iicevelu 
    100100VAR2_IvelV=iicevelv 
    101 VAR2_Ivelo=iicevelo 
     101#VAR2_Ivelo=iicevelo 
    102102# 
    103103######################### Export Variables ############################### 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IDL_scripts/std_ts_ICE.pro

    r4497 r6225  
    8888  ICE_S_15 = {arr:ICE_S_15 * 1.e-12, unit : '10^12 m^2'} 
    8989  ; 
    90   title = 'Northern Hemisphere'+'!C'+prefix+' (BLACK) '+d1_d2+'!C'+'OBSERVATION (light blue) '+'!C'+' Global Annual Mean Ice Area (CONTINUOUS) '+'!C'+ 'and Extend minus 15% (DASHED)' 
     90  ;;title = 'Northern Hemisphere'+'!C'+prefix+' (BLACK) '+d1_d2+'!C'+'OBSERVATION (light blue) '+'!C'+' Global Annual Mean Ice Area (CONTINUOUS) '+'!C'+ 'and Extend minus 15% (DASHED)' 
     91  title = 'Northern Hemisphere'+'!C'+prefix+' (BLACK) '+d1_d2+'!C'+'OBSERVATION (light blue) '+'!C'+' Global Annual Mean Ice Area (DASHED) '+'!C'+ 'and Extend minus 15% (CONTINUOUS)' 
    9192  jpt=12 
    9293  time=julday(1,15,1900)+30*lindgen(12) 
    93   pltt, ICE_N, 't', MIN = 4., MAX = 16., /REMPLI, /PORTRAIT, XGRIDSTYLE = 1, DATE_FORMAT = '%M' $ 
     94  pltt, ICE_N, 't', MIN = 4., MAX = 16., /REMPLI, /PORTRAIT, LINESTYLE=2, XGRIDSTYLE = 1, DATE_FORMAT = '%M' $ 
    9495       , COLOR = 000 , small = [1, 2, 1], YTITLE = '10^12 m^2 ', TITLE = title, _extra = ex 
    95   pltt, ICE_N_15, 't', /REMPLI, /PORTRAIT, LINESTYLE=2 $       ;;; dashed lines is LINESTYLE=2  $ 
     96  pltt, ICE_N_15, 't', /REMPLI, /PORTRAIT $       ;;; dashed lines is LINESTYLE=2  $ 
    9697        , /ov1d, COLOR = 000, small = [1, 2, 1], YTITLE = '10^12 m^2 ', TITLE = title, _extra = ex  
    97   pltt, vICE_area_NH, 't',  /REMPLI, /PORTRAIT  $  
     98  pltt, vICE_area_NH, 't',  /REMPLI, /PORTRAIT, LINESTYLE=2  $  
    9899        , /ov1d, COLOR = 100, small = [1, 2, 1], YTITLE = '10^12 m^2 ', TITLE = title, _extra = ex 
    99   pltt, vICE_ext_NH, 't', /REMPLI, /PORTRAIT, LINESTYLE=2 $   ;;; dashed lines is LINESTYLE=2  $ 
     100  pltt, vICE_ext_NH, 't', /REMPLI, /PORTRAIT $   ;;; dashed lines is LINESTYLE=2  $ 
    100101        , /ov1d, COLOR = 100, small = [1, 2, 1], YTITLE = '10^12 m^2 ', TITLE = title, _extra = ex 
    101102; 
    102   title = 'Southern Hemisphere'+'!C'+prefix+' (BLACK) '+d1_d2+'!C'+'OBSERVATION (light blue) '+'!C'+' Global Annual Mean Ice Area (CONTINUOUS) '+'!C'+ 'and Extend minus 15% (DASHED)' 
    103   pltt, ICE_S, 't', MIN = 0., MAX = 20., /REMPLI, /NOERASE , XGRIDSTYLE = 1 , DATE_FORMAT = '%M' $ 
     103  title = 'Southern Hemisphere'+'!C'+prefix+' (BLACK) '+d1_d2+'!C'+'OBSERVATION (light blue) '+'!C'+' Global Annual Mean Ice Area (DASHED) '+'!C'+ 'and Extend minus 15% (CONTINUOUS)' 
     104  pltt, ICE_S, 't', MIN = 0., MAX = 20., /REMPLI, LINESTYLE=2, /NOERASE , XGRIDSTYLE = 1 , DATE_FORMAT = '%M' $ 
    104105        ,COLOR = 000, small = [1, 2, 2], YTITLE = '10^12 m^2 ', TITLE = title, _extra = ex 
    105   pltt, ICE_S_15, 't', /REMPLI, /PORTRAIT, LINESTYLE=2 $  
     106  pltt, ICE_S_15, 't', /REMPLI, /PORTRAIT $  
    106107        , /ov1d, COLOR = 000, small = [1, 2, 1], YTITLE = '10^12 m^2 ', TITLE = title, _extra = ex  
    107   pltt,  vICE_area_SH, 't', /REMPLI, /PORTRAIT  $  
     108  pltt,  vICE_area_SH, 't', /REMPLI, /PORTRAIT, LINESTYLE=2  $  
    108109         , /ov1d, COLOR = 100, small = [1, 2, 1], YTITLE = '10^12 m^2 ', TITLE = title, _extra = ex 
    109   pltt,  vICE_ext_SH, 't', /REMPLI, /PORTRAIT, LINESTYLE=2 $  
     110  pltt,  vICE_ext_SH, 't', /REMPLI, /PORTRAIT $  
    110111        , /ov1d, COLOR = 100, small = [1, 2, 1], YTITLE = '10^12 m^2 ', TITLE = title, _extra = ex 
    111112; 
    … …  
    159160 
    160161 
    161   title = 'Northern Hemisphere'+'!C'+prefix+' (BLACK) - '+prefix2+' (RED) '+d1_d2_2+'!C'+'OBSERVATION (light blue) '+'!C'+' Global Annual Mean Ice Area (CONTINUOUS) '+'!C'+ 'and Extend minus 15% (DASHED)' 
     162  ;;title = 'Northern Hemisphere'+'!C'+prefix+' (BLACK) - '+prefix2+' (RED) '+d1_d2_2+'!C'+'OBSERVATION (light blue) '+'!C'+' Global Annual Mean Ice Area (CONTINUOUS) '+'!C'+ 'and Extend minus 15% (DASHED)' 
     163  title = 'Northern Hemisphere'+'!C'+prefix+' (BLACK) - '+prefix2+' (RED) '+d1_d2_2+'!C'+'OBSERVATION (light blue) '+'!C'+' Global Annual Mean Ice Area (DASHED) '+'!C'+ 'and Extend minus 15% (CONTINUOUS)' 
    162164  jpt=12 
    163165  time=julday(1,15,1900)+30*lindgen(12) 
    164   pltt, ICE_N, 't', MIN = 4, MAX = 16,  /REMPLI, /PORTRAIT, XGRIDSTYLE = 1, window = 2, DATE_FORMAT = '%M' $ 
     166  pltt, ICE_N, 't', MIN = 4, MAX = 16,  /REMPLI, /PORTRAIT, LINESTYLE=2, XGRIDSTYLE = 1, window = 2, DATE_FORMAT = '%M' $ 
    165167        , COLOR = 000, small = [1, 2, 1], YTITLE = '10^12 m^2 ', TITLE = title, _extra = ex ; BLACK 
    166   pltt, ICE_N2, 't', /REMPLI, /PORTRAIT $ 
     168  pltt, ICE_N2, 't', /REMPLI, /PORTRAIT , LINESTYLE=2 $ 
    167169        , /ov1d, COLOR = 250, small = [1, 2, 1], YTITLE = '10^12 m^2 ', TITLE = title, _extra = ex  ; RED 
    168   pltt, ICE_N_15, 't', /REMPLI, /PORTRAIT, LINESTYLE=2 $ ; linee tratteggiate LINESTYLE=2  $ 
     170  pltt, ICE_N_15, 't', /REMPLI, /PORTRAIT $ ; linee tratteggiate LINESTYLE=2  $ 
    169171        , /ov1d, COLOR = 000, small = [1, 2, 1], YTITLE = '10^12 m^2 ', TITLE = title, _extra = ex  
    170   pltt, ICE_N2_15, 't', /REMPLI, /PORTRAIT, LINESTYLE=2 $ ; linee tratteggiate LINESTYLE=2  $ 
     172  pltt, ICE_N2_15, 't', /REMPLI, /PORTRAIT $ ; linee tratteggiate LINESTYLE=2  $ 
    171173        , /ov1d, COLOR = 250, small = [1, 2, 1], YTITLE = '10^12 m^2 ', TITLE = title, _extra = ex 
    172   pltt, vICE_area_NH, 't', /REMPLI, /PORTRAIT  $  
     174  pltt, vICE_area_NH, 't', /REMPLI, /PORTRAIT, LINESTYLE=2  $  
    173175        , /ov1d, COLOR = 100, small = [1, 2, 1], YTITLE = '10^12 m^2 ', TITLE = title, _extra = ex  ; light blue 
    174   pltt, vICE_ext_NH, 't', /REMPLI, /PORTRAIT, LINESTYLE=2 $  
     176  pltt, vICE_ext_NH, 't', /REMPLI, /PORTRAIT $  
    175177        , /ov1d, COLOR = 100, small = [1, 2, 1], YTITLE = '10^12 m^2 ', TITLE = title, _extra = ex  ; blu scuro 
    176178; 
    177   title ='Southern Hemisphere'+'!C'+prefix+' (BLACK) - '+prefix2+' (RED) '+d1_d2_2+'!C'+'OBSERVATION (light blue) '+'!C'+'Global Annual Mean Ice Area (CONTINUS)'+'!C'+ 'and Extend minus 15% (DASHED)' 
     179  title ='Southern Hemisphere'+'!C'+prefix+' (BLACK) - '+prefix2+' (RED) '+d1_d2_2+'!C'+'OBSERVATION (light blue) '+'!C'+'Global Annual Mean Ice Area (DASHED)'+'!C'+ 'and Extend minus 15% (CONTINUOUS)' 
    178180;  title ='Southern Hemisphere'+'!C' 
    179   pltt, ICE_S, 't', MIN = 0., MAX = 20.,  /REMPLI, /NOERASE, XGRIDSTYLE = 1, DATE_FORMAT = '%M' $ 
     181  pltt, ICE_S, 't', MIN = 0., MAX = 20., /REMPLI, LINESTYLE=2, /NOERASE, XGRIDSTYLE = 1, DATE_FORMAT = '%M' $ 
    180182         , COLOR = 000, small = [1, 2, 2], YTITLE = '10^12 m^2 ', TITLE = title, _extra = ex 
    181   pltt, ICE_S2, 't', /REMPLI, /NOERASE $ 
     183  pltt, ICE_S2, 't', /REMPLI, /NOERASE, LINESTYLE=2 $ 
    182184        , /ov1d, COLOR = 250, small = [1, 2, 2], YTITLE = '10^12 m^2 ', TITLE = title, _extra = ex 
    183   pltt, ICE_S_15 , 't', /REMPLI, /PORTRAIT, LINESTYLE=2 $ ; linee tratteggiate LINESTYLE=2  $ 
     185  pltt, ICE_S_15 , 't', /REMPLI, /PORTRAIT $ ; linee tratteggiate LINESTYLE=2  $ 
    184186        , /ov1d, COLOR = 000, small = [1, 2, 2], YTITLE = '10^12 m^2 ', TITLE = title, _extra = ex 
    185   pltt, ICE_S2_15, 't', /REMPLI, /PORTRAIT, LINESTYLE=2 $ ; linee tratteggiate LINESTYLE=2  $ 
     187  pltt, ICE_S2_15, 't', /REMPLI, /PORTRAIT $ ; linee tratteggiate LINESTYLE=2  $ 
    186188        , /ov1d, COLOR = 250, small = [1, 2, 2], YTITLE = '10^12 m^2 ', TITLE = title, _extra = ex 
    187   pltt,  vICE_area_SH, 't', /REMPLI, /PORTRAIT $  
     189  pltt,  vICE_area_SH, 't', /REMPLI, /PORTRAIT, LINESTYLE=2 $  
    188190          , /ov1d, COLOR = 100, small = [1, 2, 2], YTITLE = '10^12 m^2 ', TITLE = title, _extra = ex 
    189   pltt,  vICE_ext_SH, 't', /REMPLI, /PORTRAIT, LINESTYLE=2 $  
     191  pltt,  vICE_ext_SH, 't', /REMPLI, /PORTRAIT $  
    190192        , /ov1d, COLOR = 100, small = [1, 2, 2], YTITLE = '10^12 m^2 ', TITLE = title, _extra = ex 
    191193; 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IDL_scripts/std_ts_ICE_FRAM.pro

    r4514 r6225  
    55arr2d = arr2d[t1:t2] 
    66arr2d = reform(arr2d,12,nyear) ; put in 2D array 
    7 arr2d = total(arr2d,2)/nyear ; total over 2th dimension (i.e.years) 
     7;arr2d = total(arr2d,2)/nyear ; total over 2th dimension (i.e.years) 
     8arr2d = arr2d[*, nyear-1] ;  select last year 
    89 
    910return, arr2d 
    … …  
    3435; 
    3536  d1_d2 = '('+strtrim(date1, 1)+' - '+strtrim(date2, 1)+')' 
     37  d2 = '('+strtrim(date2, 1)+')' 
    3638; 
    3739  iodir = std_iodir_data 
    … …  
    7476  ;; AREA 
    7577  ICE_area_export = reform(ICE_area_export, 12, nyr) 
    76   ICE_area_export = total(ICE_area_export,2)/nyr 
     78  ;ICE_area_export = total(ICE_area_export,2)/nyr  ; old version monthly mean average  over all years 
     79  ICE_area_export = ICE_area_export[*,nyr-1]  ; dim= 12, index 0-11; last year choosen 
    7780  ; ICE_area_export = {arr:ICE_area_export * 1.e-12 * 86400 * 365 , unit : '10^6 Km^2/year'}  ; annual mean 
    7881  ICE_area_export = {arr:ICE_area_export * 1.e-12 * 86400 * 30 , unit : '10^6 Km^2/month'}    ; monthly mean 
    … …  
    8083  ; 
    8184  ICE_vol_export = reform(ICE_vol_export, 12, nyr) 
    82   ICE_vol_export = total(ICE_vol_export,2)/nyr 
     85  ;ICE_vol_export = total(ICE_vol_export,2)/nyr 
     86  ICE_vol_export = ICE_vol_export[*,nyr-1] 
    8387  ; ICE_vol_export = {arr:ICE_vol_export * 1.e-9 * 86400 * 365 , unit : '10^3 Km^3/year'}      ; annual mean 
    8488  ICE_vol_export = {arr:ICE_vol_export * 1.e-9 * 86400 * 30 , unit : '10^3 Km^3/month'}      ; monthly mean 
    8589 
    8690  ; 
    87   title = 'Fram Strait Areal Export'+'!C'+prefix+' '+d1_d2 
     91  ;title = 'Fram Strait Areal Export: LAST YEAR'+'!C'+prefix+' '+d1_d2 
     92  title = 'Fram Strait Areal Export: LAST YEAR'+'!C'+prefix+' '+d2 
    8893  jpt=12 
    8994  time=julday(1,15,1900)+30*lindgen(12) 
    … …  
    99104  xyouts, julday(7,15,1900), 0.41, 'Data from Kwok et al.(2004), 1979-2002 ', ALIGN = 0, CHARTHICK = 2, CHARSIZE=0.8, COLOR=2 
    100105  ; 
    101   title = 'Fram Strait Volume Export'+'!C'+prefix+' '+d1_d2 
     106  ;title = 'Fram Strait Volume Export LAST YEAR'+'!C'+prefix+' '+d1_d2 
     107  title = 'Fram Strait Volume Export LAST YEAR'+'!C'+prefix+' '+d2 
    102108  pltt, ICE_vol_export, 't',  /REMPLI, MIN = 60., MAX = 500. , /NOERASE, XGRIDSTYLE = 1 $ 
    103109       , small = [1, 2, 2], YTITLE = '10^3 Km^3/month', TITLE = title, DATE_FORMAT = '%M', _extra = ex 
    … …  
    118124 
    119125    d1_d2_2 = '('+strtrim(date1_2, 1)+' - '+strtrim(date2_2, 1)+')' 
     126    d2_2 = '('+strtrim(date2_2, 1)+')' 
    120127    tsave = time 
    121128    domdef, indx1, indx2, indy1, indy2, /xindex, /yindex,/memeindices 
    … …  
    140147    ;; AREA 
    141148    ICE_area_export_2 = reform(ICE_area_export_2, 12, nyr) 
    142     ICE_area_export_2 = total(ICE_area_export_2,2)/nyr 
     149    ;ICE_area_export_2 = total(ICE_area_export_2,2)/nyr 
     150    ICE_area_export_2 = ICE_area_export_2[*,nyr-1] 
    143151    ; ICE_area_export_2 = {arr:ICE_area_export_2 * 1.e-12 * 86400 * 365 , unit : '10^6 Km^2/year'}   ; annual mean 
    144152    ICE_area_export_2 = {arr:ICE_area_export_2 * 1.e-12 * 86400 * 30 , unit : '10^6 Km^2/month'}     ; monthly mean 
    145153    ; 
    146154    ICE_vol_export_2 = reform(ICE_vol_export_2, 12, nyr) 
    147     ICE_vol_export_2 = total(ICE_vol_export_2,2)/nyr 
     155    ;ICE_vol_export_2 = total(ICE_vol_export_2,2)/nyr 
     156    ICE_vol_export_2 = ICE_vol_export_2[*,nyr-1] 
    148157    ; ICE_vol_export_2 = {arr:ICE_vol_export_2 * 1.e-12 * 86400 * 365 , unit : '10^3 Km^3/year'}     ; annual mean 
    149158    ICE_vol_export_2 = {arr:ICE_vol_export_2 * 1.e-9 * 86400 * 30 , unit : '10^3 Km^3/month'}       ; monthly mean 
    … …  
    152161    if KEYWORD_SET(postscript) then openps, filename+'_2.ps', portrait = 1 
    153162 
    154     title = 'Fram Strait Areal Export'+'!C'+prefix+' (BLACK) - '+prefix2+' (RED) '+d1_d2_2 
     163    ;title = 'Fram Strait Areal Export'+'!C'+prefix+' (BLACK) - '+prefix2+' (RED) '+d1_d2_2 
     164    title = 'Fram Strait Areal Export LAST YEAR'+'!C'+prefix+' (BLACK) - '+prefix2+' (RED) '+d2_2 
    155165    jpt=12 
    156166    time=julday(1,15,1900)+30*lindgen(12) 
    … …  
    170180    xyouts, julday(7,15,1900), 0.41, 'Data from Kwok et al.(2004), 1979-2002 ', ALIGN = 0, CHARTHICK = 2, CHARSIZE=0.8, COLOR=2 
    171181    ; 
    172     title = 'Fram Strait Volume Export'+'!C'+prefix+' (BLACK) - '+prefix2+' (RED) '+d1_d2_2 
     182    ;title = 'Fram Strait Volume Export'+'!C'+prefix+' (BLACK) - '+prefix2+' (RED) '+d1_d2_2 
     183    title = 'Fram Strait Volume Export LAST YEAR'+'!C'+prefix+' (BLACK) - '+prefix2+' (RED) '+d2_2 
    173184    pltt, ICE_vol_export, 't', /REMPLI,  MIN = 60., MAX = 500., /NOERASE, XGRIDSTYLE = 1 $ 
    174185        , small = [1, 2, 2], YTITLE = '10^3 Km^3/month', TITLE = title, DATE_FORMAT = '%M', _extra = ex 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IDL_scripts/std_ts_ICE_Vol.pro

    r4504 r6225  
    7070; 
    7171  title ='Southern Hemisphere' +'!C'+prefix+' '+d1_d2+' - '+'!C'+'Global Annual Mean Ice Volume (BLACK)' 
    72   pltt, ICE_vol_S, 't', MIN = 0., MAX = 11000., /REMPLI, /NOERASE, XGRIDSTYLE = 1 , DATE_FORMAT = '%M' $ 
     72  pltt, ICE_vol_S, 't', MIN = 0., MAX = 12000., /REMPLI, /NOERASE, XGRIDSTYLE = 1 , DATE_FORMAT = '%M' $ 
    7373        , small = [1, 2, 2], YTITLE = '10^9 Km^3 ', TITLE = title, _extra = ex 
    7474; 
    … …  
    119119    ; 
    120120    title = 'Southern Hemisphere'+'!C'+prefix+' (BLACK) - '+prefix2+' (RED) '+d1_d2_2+'!C'+'Global Annual Mean Ice Volume' 
    121     pltt, ICE_vol_S, 't', MIN = 0., MAX = 11000., /REMPLI, /NOERASE, XGRIDSTYLE = 1, DATE_FORMAT = '%M' $ 
     121    pltt, ICE_vol_S, 't', MIN = 0., MAX = 12000., /REMPLI, /NOERASE, XGRIDSTYLE = 1, DATE_FORMAT = '%M' $ 
    122122          , small = [1, 2, 2], YTITLE = '10^9 Km^3 ', TITLE = title, _extra = ex    
    123123    pltt, ICE_vol_S2, 't',  /REMPLI, /NOERASE $ 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IDL_scripts/std_ts_all.pro

    r4559 r6225  
    6060  IF doplot EQ cnt OR doplot EQ 0 THEN std_ts_SSH, masknp, POSTSCRIPT = postscript, _extra = ex 
    6161; 
    62   cnt = cnt+1   &   blabla = 'Global Mean Q net' 
    63   IF doplot EQ cnt OR doplot EQ 0 THEN std_ts_Q, masknp, POSTSCRIPT = postscript, _extra = ex 
     62;;;;  cnt = cnt+1   &   blabla = 'Global Mean Q net' 
     63;;;;  IF doplot EQ cnt OR doplot EQ 0 THEN std_ts_Q, masknp, POSTSCRIPT = postscript, _extra = ex 
    6464; 
    6565  cnt = cnt+1   &   blabla = 'Global Mean EMP' 
    … …  
    7777  cnt = cnt+1   &   blabla = 'Sea-Ice Volume' 
    7878  IF doplot EQ cnt OR doplot EQ 0 THEN std_ts_ICE_Vol, masknp, POSTSCRIPT = postscript, _extra = ex 
    79 ; 
    80   cnt = cnt+1   &   blabla = 'ICE Velocity ' 
    81   IF doplot EQ cnt OR doplot EQ 0 THEN std_ts_ICE_Vel, masknp, POSTSCRIPT = postscript, _extra = ex 
    82 ; 
     79;SF; and probably useless 
     80;SF  cnt = cnt+1   &   blabla = 'ICE Velocity ' 
     81;SF  IF doplot EQ cnt OR doplot EQ 0 THEN std_ts_ICE_Vel, masknp, POSTSCRIPT = postscript, _extra = ex 
     82;SF; 
    8383  cnt = cnt+1   &   blabla = 'Sea-Ice Volume Export at Fram Strait' 
    8484  IF doplot EQ cnt OR doplot EQ 0 THEN std_ts_ICE_FRAM, masknp, POSTSCRIPT = postscript, _extra = ex 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IDL_scripts/std_ts_vardef.sh

    r4559 r6225  
    1818idl_command=/Applications/itt/idl64/bin/idl 
    1919# 
    20 PS_DIR=$( pwd )/ts_heatbug_ps 
    21 PDF_DIR=$( pwd )/ts_heatbug_pdf 
     20PS_DIR=$( pwd )/ts_p4H25a50-testht_ps 
     21PDF_DIR=$( pwd )/ts_p4H25a50-testht_pdf 
    2222HTML_DIR=$( pwd )/html 
    2323SAXO_DIR=/Users/sflod/SAXO_DIR 
    2424# 
    25 DIR_DATA=/Users/sflod/idl_PLOTS/DATA_STORE/RUN_CLIMATO/lim3_ada      # path of data in NetCDF format 
     25DIR_DATA=/Users/sflod/idl_PLOTS/DATA_STORE/RUN_CLIMATO/lim3_ada     # path of data in NetCDF format 
    2626DIR_CLIMATO=/Users/sflod/idl_PLOTS/CLIMATOLOGIES    # path of climatological data 
    2727DIR_MASK=/Users/sflod/idl_PLOTS/MASK  # path of mask files (ex: subbasins) 
    … …  
    5252READ_ONLY_FIRST_RECORD=0   # if 0 then read all records in files else read only the first reacord in each file 
    5353# 
    54 #DATE1=20010101   ;   DATE2=25001231 
    55 DATE1=20310101   ;   DATE2=20401231 
    56 #DATE1=00010101      ;   DATE2=00101231 
     54DATE1=20010101         ;   DATE2=20501231 
    5755# 
    58 VAR1_T=thetao        ;   V1T_PREF=heatbug       ;   V1T_SUFF=_1Y_grid_T.nc 
    59 VAR1_S=so            ;   V1S_PREF=heatbug      ;   V1S_SUFF=_1Y_grid_T.nc 
    60 VAR1_SSH=zos         ;   V1SSH_PREF=heatbug    ;   V1SSH_SUFF=_1Y_grid_T.nc 
    61 VAR1_Q=tohfls        ;   V1Q_PREF=heatbug      ;   V1Q_SUFF=_1Y_grid_T.nc 
    62 VAR1_EMP=wfo         ;   V1EMP_PREF=heatbug    ;   V1EMP_SUFF=_1Y_grid_T.nc 
    63 VAR1_U=uocetr_eff    ;   V1U_PREF=heatbug      ;   V1U_SUFF=_1Y_grid_U.nc 
    64 VAR1_V=vocetr_eff    ;   V1V_PREF=heatbug      ;   V1V_SUFF=_1Y_grid_V.nc 
    65 VAR1_ICE=siconc      ;   V1ICE_PREF=heatbug    ;   V1ICE_SUFF=_1M_icemod.nc 
    66 VAR1_Ithick=sithic   ;   V1It_PREF=heatbug     ;   V1It_SUFF=_1M_icemod.nc 
    67 VAR1_SNOW=sndept     ;   V1SNOW_PREF=heatbug   ;   V1SNOW_SUFF=_1M_icemod.nc 
    68 VAR1_IvelV=sivelv    ;   V1IvV_PREF=heatbug    ;   V1IvV_SUFF=_1M_icemod.nc 
    69 VAR1_Ivel=sivelo     ;   V1Iv_PREF=heatbug     ;   V1Iv_SUFF=_1M_icemod.nc 
     56VAR1_T=thetao          ;   V1T_PREF=p4H25a50      ;   V1T_SUFF=_1Y_grid_T.nc 
     57VAR1_S=so              ;   V1S_PREF=p4H25a50      ;   V1S_SUFF=_1Y_grid_T.nc 
     58VAR1_SSH=zos         ;   V1SSH_PREF=p4H25a50    ;   V1SSH_SUFF=_1Y_grid_T.nc 
     59##VAR1_Q=qt              ;   V1Q_PREF=p4H25a50      ;   V1Q_SUFF=_1Y_grid_T.nc 
     60VAR1_EMP=wfo         ;   V1EMP_PREF=p4H25a50    ;   V1EMP_SUFF=_1Y_grid_T.nc 
     61VAR1_U=uocetr_eff      ;   V1U_PREF=p4H25a50      ;   V1U_SUFF=_1Y_grid_U.nc 
     62VAR1_V=vocetr_eff      ;   V1V_PREF=p4H25a50      ;   V1V_SUFF=_1Y_grid_V.nc 
     63VAR1_ICE=siconc      ;   V1ICE_PREF=p4H25a50    ;   V1ICE_SUFF=_1M_icemod.nc 
     64VAR1_Ithick=sithic    ;   V1It_PREF=p4H25a50     ;   V1It_SUFF=_1M_icemod.nc 
     65VAR1_SNOW=snthic    ;   V1SNOW_PREF=p4H25a50   ;   V1SNOW_SUFF=_1M_icemod.nc 
     66VAR1_IvelV=sivelv    ;   V1IvV_PREF=p4H25a50    ;   V1IvV_SUFF=_1M_icemod.nc  
     67VAR1_Ivel=sivelo      ;   V1Iv_PREF=p4H25a50     ;   V1Iv_SUFF=_1M_icemod.nc 
    7068# 
    7169#===================== EXP2 ===================== 
    7270# 
    73 #DATE1_2=20010101   ;   DATE2_2=20101231 
    74 DATE1_2=20310101   ;   DATE2_2=20401231 
    75 #DATE1_2=20010101   ;   DATE2_2=25001231 
     71DATE1_2=20010101       ;   DATE2_2=20501231 
    7672# 
    77 VAR2_T=thetao      ;   V2T_PREF=heatbug      ;   V2T_SUFF=_1Y_grid_T.nc 
    78 VAR2_S=so          ;   V2S_PREF=heatbug      ;   V2S_SUFF=_1Y_grid_T.nc 
    79 VAR2_SSH=zos       ;   V2SSH_PREF=heatbug    ;   V2SSH_SUFF=_1Y_grid_T.nc 
    80 VAR2_Q=tohfls      ;   V2Q_PREF=heatbug      ;   V2Q_SUFF=_1Y_grid_T.nc 
    81 VAR2_EMP=wfo       ;   V2EMP_PREF=heatbug    ;   V2EMP_SUFF=_1Y_grid_T.nc 
    82 VAR2_U=uocetr_eff  ;   V2U_PREF=heatbug      ;   V2U_SUFF=_1Y_grid_U.nc 
    83 VAR2_V=vocetr_eff  ;   V2V_PREF=heatbug      ;   V2V_SUFF=_1Y_grid_V.nc 
    84 VAR2_ICE=siconc    ;   V2ICE_PREF=heatbug    ;   V2ICE_SUFF=_1M_icemod.nc 
    85 VAR2_Ithick=sithic ;   V2It_PREF=heatbug     ;   V2It_SUFF=_1M_icemod.nc 
    86 VAR2_SNOW=sndept   ;   V2SNOW_PREF=heatbug   ;   V2SNOW_SUFF=_1M_icemod.nc 
    87 VAR2_IvelV=sivelv  ;   V2IvV_PREF=heatbug    ;   V2IvV_SUFF=_1M_icemod.nc 
    88 VAR2_Ivel=sivelo   ;   V2Iv_PREF=heatbug     ;   V2Iv_SUFF=_1M_icemod.nc 
     73VAR2_T=thetao          ;   V2T_PREF=testht     ;   V2T_SUFF=_1Y_grid_T.nc 
     74VAR2_S=so           ;   V2S_PREF=testht     ;   V2S_SUFF=_1Y_grid_T.nc 
     75VAR2_SSH=zos         ;   V2SSH_PREF=testht   ;   V2SSH_SUFF=_1Y_grid_T.nc 
     76##VAR2_Q=qt            ;   V2Q_PREF=testht     ;   V2Q_SUFF=_1Y_grid_T.nc 
     77VAR2_EMP=wfo            ;   V2EMP_PREF=testht   ;   V2EMP_SUFF=_1Y_grid_T.nc 
     78VAR2_U=uocetr_eff      ;   V2U_PREF=testht     ;   V2U_SUFF=_1Y_grid_U.nc 
     79VAR2_V=vocetr_eff      ;   V2V_PREF=testht     ;   V2V_SUFF=_1Y_grid_V.nc 
     80VAR2_ICE=siconc         ;   V2ICE_PREF=testht   ;   V2ICE_SUFF=_1M_icemod.nc 
     81VAR2_Ithick=sithic       ;   V2It_PREF=testht    ;   V2It_SUFF=_1M_icemod.nc 
     82VAR2_SNOW=snthic       ;   V2SNOW_PREF=testht  ;   V2SNOW_SUFF=_1M_icemod.nc 
     83VAR2_IvelV=sivelv       ;   V2IvV_PREF=testht   ;   V2IvV_SUFF=_1M_icemod.nc  
     84VAR2_Ivel=sivelo        ;   V2IvV_PREF=testht   ;   V2IvV_SUFF=_1M_icemod.nc  
    8985# 
    9086######################### Export Variables ############################### 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IDL_scripts/std_ts_vardef.sh.500yfwb0

    r4394 r6225  
    114114export VAR1_Ithick  V1It_PREF    V1It_SUFF 
    115115export VAR1_SNOW    V1SNOW_PREF  V1SNOW_SUFF 
    116 export VAR1_IvelV   V1IvV_PREF   V1IvV_PREF 
     116export VAR1_IvelV   V1IvV_PREF   V1IvV_SUFF 
    117117#===================== EXP2 ===================== 
    118118export DATE1_2      DATE2_2 
    … …  
    127127export VAR2_Ithick  V2It_PREF    V2It_SUFF 
    128128export VAR2_SNOW    V2SNOW_PREF  V2SNOW_SUFF 
    129 export VAR2_IvelV   V2IvV_PREF   V2IvV_PREF 
     129export VAR2_IvelV   V2IvV_PREF   V2IvV_SUFF 
    130130# 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IDL_scripts/std_ts_vardef.sh.500yfwb2

    r4394 r6225  
    114114export VAR1_Ithick  V1It_PREF    V1It_SUFF 
    115115export VAR1_SNOW    V1SNOW_PREF  V1SNOW_SUFF 
    116 export VAR1_IvelV   V1IvV_PREF   V1IvV_PREF 
     116export VAR1_IvelV   V1IvV_PREF   V1IvV_SUFF 
    117117#===================== EXP2 ===================== 
    118118export DATE1_2      DATE2_2 
    … …  
    127127export VAR2_Ithick  V2It_PREF    V2It_SUFF 
    128128export VAR2_SNOW    V2SNOW_PREF  V2SNOW_SUFF 
    129 export VAR2_IvelV   V2IvV_PREF   V2IvV_PREF 
     129export VAR2_IvelV   V2IvV_PREF   V2IvV_SUFF 
    130130# 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IDL_scripts/std_ts_vardef.sh_example1

    r4394 r6225  
    112112export VAR1_Ithick  V1It_PREF    V1It_SUFF 
    113113export VAR1_SNOW    V1SNOW_PREF  V1SNOW_SUFF 
    114 export VAR1_IvelV   V1IvV_PREF   V1IvV_PREF 
     114export VAR1_IvelV   V1IvV_PREF   V1IvV_SUFF 
    115115#===================== EXP2 ===================== 
    116116export DATE1_2      DATE2_2 
    … …  
    125125export VAR2_Ithick  V2It_PREF   V2It_SUFF 
    126126export VAR2_SNOW    V2SNOW_PREF V2SNOW_SUFF 
    127 export VAR2_IvelV   V2IvV_PREF   V2IvV_PREF 
     127export VAR2_IvelV   V2IvV_PREF   V2IvV_SUFF 
    128128# 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IDL_scripts/std_ts_vardef.sh_example2

    r4394 r6225  
    112112export VAR1_Ithick  V1It_PREF    V1It_SUFF 
    113113export VAR1_SNOW    V1SNOW_PREF  V1SNOW_SUFF 
    114 export VAR1_IvelV   V1IvV_PREF   V1IvV_PREF 
     114export VAR1_IvelV   V1IvV_PREF   V1IvV_SUFF 
    115115#===================== EXP2 ===================== 
    116116export DATE1_2      DATE2_2 
    … …  
    125125export VAR2_Ithick  V2It_PREF   V2It_SUFF 
    126126export VAR2_SNOW    V2SNOW_PREF V2SNOW_SUFF 
    127 export VAR2_IvelV   V2IvV_PREF   V2IvV_PREF 
     127export VAR2_IvelV   V2IvV_PREF   V2IvV_SUFF 
    128128# 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/cpp_ORCA2_LIM.fcm

    r4523 r6225  
    1  bld::tool::fppkeys key_trabbl key_lim2 key_dynspg_flt key_diaeiv key_ldfslp key_traldf_c2d key_traldf_eiv key_dynldf_c3d key_zdftke key_zdfddm key_zdftmx key_iomput key_mpp_mpi 
     1bld::tool::fppkeys key_trabbl key_lim2 key_zdftke key_zdfddm key_zdftmx  key_mpp_mpi key_iomput key_nosignedzero 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM3/EXP00/1_namelist_cfg

    r4161 r6225  
    2828&namzgr        !   vertical coordinate 
    2929!----------------------------------------------------------------------- 
     30   ln_zps      = .true.    !  z-coordinate - partial steps 
    3031/ 
    3132!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    5152   ppacr2      =  999999.              ! 
    5253   rn_rdt      = 2880.     !  time step for the dynamics (and tracer if nn_acc=0) 
    53    rn_rdtmin   = 14400.          !  minimum time step on tracers (used if nn_acc=1) 
    54    rn_rdtmax   = 14400.          !  maximum time step on tracers (used if nn_acc=1) 
     54/ 
     55!----------------------------------------------------------------------- 
     56&namcrs        !   Grid coarsening for dynamics output and/or 
     57               !   passive tracer coarsened online simulations 
     58!----------------------------------------------------------------------- 
    5559/ 
    5660!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    7276/ 
    7377!----------------------------------------------------------------------- 
    74 &namsbc_core   !   namsbc_core  CORE bulk formulea 
    75 !----------------------------------------------------------------------- 
    76 !              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    77 !              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    78    sn_wndi = 'u_10.15JUNE2009_orca2'       ,  6  , 'U_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_bicub.nc'       , '' 
    79    sn_wndj = 'v_10.15JUNE2009_orca2'       ,  6  , 'V_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_bicub.nc'       , '' 
    80    sn_qsr  = 'ncar_rad.15JUNE2009_orca2'   , 24  , 'SWDN_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_bilin.nc'       , '' 
    81    sn_qlw  = 'ncar_rad.15JUNE2009_orca2'   , 24  , 'LWDN_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_bilin.nc'       , '' 
    82    sn_tair = 't_10.15JUNE2009_orca2'       ,  6  , 'T_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_bilin.nc'       , '' 
    83    sn_humi = 'q_10.15JUNE2009_orca2'       ,  6  , 'Q_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_bilin.nc'       , '' 
    84    sn_prec = 'ncar_precip.15JUNE2009_orca2', -1  , 'PRC_MOD1',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_bilin.nc'       , '' 
    85    sn_snow = 'ncar_precip.15JUNE2009_orca2', -1  , 'SNOW'    ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_bilin.nc'       , '' 
    86    sn_tdif = 'taudif_core'                 , 24  , 'taudif'  ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_bilin.nc'       , '' 
     78&namsbc_core   !   namsbc_core  CORE bulk formulae 
     79!----------------------------------------------------------------------- 
     80!              !  file name                    ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights                               ! rotation ! land/sea mask ! 
     81!              !                               !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename                              ! pairing  ! filename      ! 
     82   sn_wndi     = 'u_10.15JUNE2009_fill'        ,         6         , 'U_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core2_agrif_bicubic.nc'      , 'Uwnd'   , '' 
     83   sn_wndj     = 'v_10.15JUNE2009_fill'        ,         6         , 'V_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core2_agrif_bicubic.nc'      , 'Vwnd'   , '' 
     84   sn_qsr      = 'ncar_rad.15JUNE2009_fill'    ,        24         , 'SWDN_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core2_agrif_bilinear.nc'     , ''       , '' 
     85   sn_qlw      = 'ncar_rad.15JUNE2009_fill'    ,        24         , 'LWDN_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core2_agrif_bilinear.nc'     , ''       , '' 
     86   sn_tair     = 't_10.15JUNE2009_fill'        ,         6         , 'T_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core2_agrif_bilinear.nc'     , ''       , '' 
     87   sn_humi     = 'q_10.15JUNE2009_fill'        ,         6         , 'Q_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core2_agrif_bilinear.nc'     , ''       , '' 
     88   sn_prec     = 'ncar_precip.15JUNE2009_fill' ,        -1         , 'PRC_MOD1',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core2_agrif_bilinear.nc'     , ''       , '' 
     89   sn_snow     = 'ncar_precip.15JUNE2009_fill' ,        -1         , 'SNOW'    ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core2_agrif_bilinear.nc'     , ''       , '' 
     90   sn_tdif     = 'taudif_core'                 ,        24         , 'taudif'  ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core2_agrif_bilinear.nc'     , ''       , '' 
     91 
     92   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the bulk files 
     93   ln_taudif   = .false.   !  HF tau contribution: use "mean of stress module - module of the mean stress" data 
     94   rn_zqt      = 10.        !  Air temperature and humidity reference height (m) 
     95   rn_zu       = 10.        !  Wind vector reference height (m) 
     96   rn_pfac     = 1.        !  multiplicative factor for precipitation (total & snow) 
     97   rn_efac     = 1.        !  multiplicative factor for evaporation (0. or 1.) 
     98   rn_vfac     = 0.        !  multiplicative factor for ocean/ice velocity 
     99                           !  in the calculation of the wind stress (0.=absolute winds or 1.=relative winds) 
    87100/ 
    88101!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    98111/ 
    99112!----------------------------------------------------------------------- 
    100 &namcla        !   cross land advection 
    101 !----------------------------------------------------------------------- 
    102 / 
    103 !----------------------------------------------------------------------- 
    104113&namagrif      !  AGRIF zoom                                            ("key_agrif") 
    105114!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    112121&nambbc        !   bottom temperature boundary condition 
    113122!----------------------------------------------------------------------- 
     123   ln_trabbc   = .true.    !  Apply a geothermal heating at the ocean bottom 
    114124/ 
    115125!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    122132/ 
    123133!----------------------------------------------------------------------- 
    124 &namtra_adv    !   advection scheme for tracer  
    125 !----------------------------------------------------------------------- 
    126 / 
    127 !----------------------------------------------------------------------- 
    128 &namtra_ldf    !   lateral diffusion scheme for tracers  
    129 !----------------------------------------------------------------------- 
    130  
    131    rn_aht_0         =  1000.    !  horizontal eddy diffusivity for tracers [m2/s] 
    132    rn_aeiv_0        =     0.    !  eddy induced velocity coefficient [m2/s]    (require "key_traldf_eiv") 
     134&namtra_dmp    !   tracer: T & S newtonian damping 
     135!----------------------------------------------------------------------- 
     136   ln_tradmp   =  .false.   !  add a damping termn (T) or not (F) 
     137/ 
     138!----------------------------------------------------------------------- 
     139&namtra_adv    !   advection scheme for tracer 
     140!----------------------------------------------------------------------- 
     141   ln_traadv_fct =  .true.    !  FCT scheme 
     142      nn_fct_h   =  2               !  =2/4, horizontal 2nd / 4th order  
     143      nn_fct_v   =  2               !  =2/4, vertical   2nd / COMPACT 4th order  
     144      nn_fct_zts =  0               !  >=1,  2nd order FCT scheme with vertical sub-timestepping 
     145      !                             !        (number of sub-timestep = nn_fct_zts) 
     146/ 
     147!----------------------------------------------------------------------- 
     148&namtra_ldf    !   lateral diffusion scheme for tracers 
     149!---------------------------------------------------------------------------------- 
     150   !                       !  Operator type: 
     151   ln_traldf_lap   =  .true.   !    laplacian operator 
     152   ln_traldf_blp   =  .false.  !  bilaplacian operator 
     153   !                       !  Direction of action: 
     154   ln_traldf_lev   =  .false.  !  iso-level 
     155   ln_traldf_hor   =  .false.  !  horizontal (geopotential) 
     156   ln_traldf_iso   =  .true.   !  iso-neutral (Standard operator) 
     157   ln_traldf_triad =  .false.  !  iso-neutral (Triads   operator) 
     158   ! 
     159   !                       !  iso-neutral options:         
     160   ln_traldf_msc   =  .true.   !  Method of Stabilizing Correction (both operators) 
     161   rn_slpmax       =   0.01    !  slope limit                      (both operators) 
     162   ln_triad_iso    =  .false.  !  pure horizontal mixing in ML              (triad only) 
     163   rn_sw_triad     =  1        !  =1 switching triad ; =0 all 4 triads used (triad only) 
     164   ln_botmix_triad =  .false.  !  lateral mixing on bottom                  (triad only) 
     165   ! 
     166   !                       !  Coefficients: 
     167   nn_aht_ijk_t    = 20        !  space/time variation of eddy coef 
     168   !                                !   =-20 (=-30)    read in eddy_diffusivity_2D.nc (..._3D.nc) file 
     169   !                                !   =  0           constant  
     170   !                                !   = 10 F(k)      =ldf_c1d  
     171   !                                !   = 20 F(i,j)    =ldf_c2d  
     172   !                                !   = 21 F(i,j,t)  =Treguier et al. JPO 1997 formulation 
     173   !                                !   = 30 F(i,j,k)  =ldf_c2d + ldf_c1d 
     174   !                                !   = 31 F(i,j,k,t)=F(local velocity) 
     175   rn_aht_0        = 1000.     !  lateral eddy diffusivity   (lap. operator) [m2/s] 
     176   rn_bht_0        = 1.e+12    !  lateral eddy diffusivity (bilap. operator) [m4/s] 
     177/ 
     178!---------------------------------------------------------------------------------- 
     179&namtra_ldfeiv !   eddy induced velocity param. 
     180!---------------------------------------------------------------------------------- 
     181   ln_ldfeiv     =.false.   ! use eddy induced velocity parameterization 
    133182/ 
    134183!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    139188&namdyn_vor    !   option of physics/algorithm (not control by CPP keys) 
    140189!----------------------------------------------------------------------- 
     190   ln_dynvor_ene = .false. !  enstrophy conserving scheme 
     191   ln_dynvor_ens = .false. !  energy conserving scheme 
     192   ln_dynvor_mix = .false. !  mixed scheme 
     193   ln_dynvor_een = .true.  !  energy & enstrophy scheme 
     194      nn_een_e3f = 0             !  e3f = masked averaging of e3t divided by 4 (=0) or by the sum of mask (=1) 
     195   ln_dynvor_msk = .false. !  vorticity multiplied by fmask (=T) or not (=F) (all vorticity schemes) 
    141196/ 
    142197!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    145200/ 
    146201!----------------------------------------------------------------------- 
     202&namdyn_spg    !   surface pressure gradient 
     203!----------------------------------------------------------------------- 
     204   ln_dynspg_ts  = .true.  !  split-explicit free surface 
     205/ 
     206!----------------------------------------------------------------------- 
    147207&namdyn_ldf    !   lateral diffusion on momentum 
    148208!----------------------------------------------------------------------- 
    149    !                       !  Type of the operator :  
    150    ln_dynldf_lap    =  .false.  !  laplacian operator          
    151    ln_dynldf_bilap  =  .true.   !  bilaplacian operator     
    152    rn_ahm_0_blp     = -8.5e+11  !  horizontal bilaplacian eddy viscosity [m4/s]  
     209   !                       !  Type of the operator : 
     210   !                           !  no diffusion: set ln_dynldf_lap=..._blp=F  
     211   ln_dynldf_lap =  .false.    !    laplacian operator 
     212   ln_dynldf_blp =  .true.     !  bilaplacian operator 
     213   !                       !  Direction of action  : 
     214   ln_dynldf_lev =  .true.     !  iso-level 
     215   ln_dynldf_hor =  .false.    !  horizontal (geopotential) 
     216   ln_dynldf_iso =  .false.    !  iso-neutral 
     217   !                       !  Coefficient 
     218   nn_ahm_ijk_t  = 20          !  space/time variation of eddy coef 
     219   !                                !  =-30  read in eddy_viscosity_3D.nc file 
     220   !                                !  =-20  read in eddy_viscosity_2D.nc file 
     221   !                                !  =  0  constant  
     222   !                                !  = 10  F(k)=c1d 
     223   !                                !  = 20  F(i,j)=F(grid spacing)=c2d 
     224   !                                !  = 30  F(i,j,k)=c2d*c1d 
     225   !                                !  = 31  F(i,j,k)=F(grid spacing and local velocity) 
     226   rn_ahm_0      =  40000.     !  horizontal laplacian eddy viscosity   [m2/s] 
     227   rn_ahm_b      =      0.     !  background eddy viscosity for ldf_iso [m2/s] 
     228   rn_bhm_0      = 8.5e+11     !  horizontal bilaplacian eddy viscosity [m4/s] 
    153229/ 
    154230!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    170246/ 
    171247!----------------------------------------------------------------------- 
    172 &namsol        !   elliptic solver / island / free surface  
    173 !----------------------------------------------------------------------- 
    174 / 
    175 !----------------------------------------------------------------------- 
    176248&nammpp        !   Massively Parallel Processing                        ("key_mpp_mpi) 
    177249!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    194266/ 
    195267!----------------------------------------------------------------------- 
    196 &namdyn_nept  !   Neptune effect (simplified: lateral and vertical diffusions removed) 
    197 !----------------------------------------------------------------------- 
    198 / 
     268&namobs       !  observation usage                                      ('key_diaobs') 
     269!----------------------------------------------------------------------- 
     270/ 
     271!----------------------------------------------------------------------- 
     272&nam_asminc   !   assimilation increments                               ('key_asminc') 
     273!----------------------------------------------------------------------- 
     274/ 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM3/EXP00/iodef.xml

    r4690 r6225  
    3535      <file_group id="6h" output_freq="6h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 6h files -->      
    3636 
    37       <file_group id="1d" output_freq="1d"  output_level="10" enabled=".TRUE." > <!-- 1d files --> 
    38  
     37      <file_group id="1d" output_freq="1d"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1d files --> 
     38       
     39      <file_group id="3d" output_freq="3d"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 3d files --> 
     40       
     41      <file_group id="5d" output_freq="5d"  output_level="10" enabled=".TRUE.">  <!-- 5d files -->    
     42    
    3943   <file id="file1" name_suffix="_grid_T" description="ocean T grid variables" > 
    40      <field field_ref="sst"          name="tos"      long_name="sea_surface_temperature"                       /> 
    41      <field field_ref="sss"          name="sos"      long_name="sea_surface_salinity"                          /> 
    42      <field field_ref="ssh"          name="zos"      long_name="sea_surface_height_above_geoid"                /> 
    43      <field field_ref="toce"         name="thetao"   long_name="sea_water_potential_temperature"               /> 
    44      <field field_ref="soce"         name="so"       long_name="sea_water_salinity"                            /> 
    45      <field field_ref="sst2"         name="tossq"    long_name="square_of_sea_surface_temperature"             /> 
    46      <field field_ref="ssh2"         name="zossq"    long_name="square_of_sea_surface_height_above_geoid"      /> 
    47      <field field_ref="mldkz5"       /> 
    48      <field field_ref="mldr10_1"     /> 
    49       <field field_ref="heatc"        name="heatc"    long_name="Heat content vertically integrated"            /> 
    50       <field field_ref="saltc"        name="saltc"    long_name="Salt content vertically integrated"            /> 
     44     <field field_ref="e3t"      /> 
     45     <field field_ref="toce"         name="thetao"                                                                      operation="instant" freq_op="5d" > @toce_e3t / @e3t </field> 
     46     <field field_ref="soce"         name="so"                                                                          operation="instant" freq_op="5d" > @soce_e3t / @e3t </field> 
     47     <field field_ref="sst"          name="tos"   /> 
     48     <field field_ref="sss"          name="sos"   /> 
     49     <field field_ref="ssh"          name="zos"   /> 
     50     <field field_ref="sst"          name="tosstd"       long_name="sea surface temperature standard deviation"         operation="instant" freq_op="5d" > sqrt( @sst2 - @sst * @sst ) </field> 
     51     <field field_ref="ssh"          name="zosstd"       long_name="sea surface height above geoid standard deviation"  operation="instant" freq_op="5d" > sqrt( @ssh2 - @ssh * @ssh ) </field> 
     52     <field field_ref="sst"          name="sstdcy"       long_name="amplitude of sst diurnal cycle"                     operation="average" freq_op="1d" > @sstmax - @sstmin </field> 
     53     <field field_ref="mldkz5"   /> 
     54     <field field_ref="mldr10_1" /> 
     55     <field field_ref="mldr10_1"     name="mldr10_1dcy"  long_name="amplitude of mldr10_1 diurnal cycle"                operation="average" freq_op="1d" > @mldr10_1max - @mldr10_1min </field> 
     56     <field field_ref="sbt"      /> 
     57     <field field_ref="heatc"        name="heatc" /> 
     58     <field field_ref="saltc"        name="saltc" /> 
    5159   </file> 
    5260 
    5361   <file id="file2" name_suffix="_SBC" description="surface fluxes variables" > <!-- time step automaticaly defined based on nn_fsbc --> 
    54      <field field_ref="empmr"        name="wfo"      long_name="water_flux_into_sea_water"                     /> 
    55      <field field_ref="qsr_oce"      name="qsr_oce"  long_name="downward shortwave flux at ocean surface"           /> 
    56      <field field_ref="qns_oce"      name="qns_oce"  long_name="downward non solar flux at ocean surface"           /> 
    57      <field field_ref="qt_oce"       name="qt_oce"   long_name="downward total flux at ocean surface"           /> 
    58      <field field_ref="qsr_ice"      name="qsr_ice"  long_name="downward shortwave flux at ice surface"           /> 
    59      <field field_ref="qns_ice"      name="qns_ice"  long_name="downward non solar flux at ice surface"           /> 
    60      <field field_ref="qtr_ice"      name="qtr_ice"  long_name="shortwave flux transmitted thru the ice"           /> 
    61      <field field_ref="qt_ice"       name="qt_ice"   long_name="downward total flux at ice surface"           /> 
    62      <field field_ref="saltflx"      name="sfx"  /> 
    63      <field field_ref="taum"         name="taum" /> 
    64      <field field_ref="wspd"         name="windsp"  /> 
    65       <field field_ref="precip"       name="precip" /> 
     62     <field field_ref="empmr"        name="wfo"      /> 
     63     <field field_ref="qsr_oce"      name="qsr_oce"  /> 
     64     <field field_ref="qns_oce"      name="qns_oce"  /> 
     65     <field field_ref="qt_oce"       name="qt_oce"   /> 
     66     <field field_ref="qsr_ice"      name="qsr_ice"  /> 
     67     <field field_ref="qns_ice"      name="qns_ice"  /> 
     68     <field field_ref="qtr_ice"      name="qtr_ice"  /> 
     69     <field field_ref="qt_ice"       name="qt_ice"   /> 
     70     <field field_ref="saltflx"      name="sfx"      /> 
     71     <field field_ref="taum"         name="taum"     /> 
     72     <field field_ref="wspd"         name="windsp"   /> 
     73     <field field_ref="precip"       name="precip"  /> 
    6674     <!-- ice and snow --> 
    67      <field field_ref="snowpre"      /> 
    68       <field field_ref="utau_ice"         name="utau_ice" /> 
    69       <field field_ref="vtau_ice"         name="vtau_ice" /> 
    70  
     75     <field field_ref="snowpre" /> 
     76     <field field_ref="utau_ice"     name="utau_ice" /> 
     77     <field field_ref="vtau_ice"     name="vtau_ice" /> 
    7178   </file> 
    7279 
    7380   <file id="file3" name_suffix="_grid_U" description="ocean U grid variables" > 
    74      <field field_ref="suoce"        name="uos"     long_name="sea_surface_x_velocity"    /> 
    75      <field field_ref="uoce"         name="uo"      long_name="sea_water_x_velocity"      /> 
    76      <field field_ref="utau"         name="tauuo"   long_name="surface_downward_x_stress" /> 
     81     <field field_ref="e3u" /> 
     82     <field field_ref="ssu"          name="uos"      /> 
     83     <field field_ref="uoce"         name="uo"       operation="instant" freq_op="5d" > @uoce_e3u / @e3u </field> 
     84     <field field_ref="utau"         name="tauuo"    /> 
    7785          <!-- available with key_diaar5 --> 
    78      <field field_ref="u_masstr"     name="vozomatr"  /> 
    79      <field field_ref="u_heattr"     name="sozohetr"  /> 
    80       <field field_ref="u_salttr"     name="sozosatr"  /> 
     86     <field field_ref="u_masstr"     name="vozomatr" /> 
     87     <field field_ref="u_heattr"     name="sozohetr" /> 
     88      <field field_ref="u_salttr"     name="sozosatr" /> 
    8189   </file> 
    8290    
    8391   <file id="file4" name_suffix="_grid_V" description="ocean V grid variables" > 
    84      <field field_ref="svoce"        name="vos"     long_name="sea_surface_y_velocity"    /> 
    85      <field field_ref="voce"         name="vo"      long_name="sea_water_y_velocity"      /> 
    86      <field field_ref="vtau"         name="tauvo"   long_name="surface_downward_y_stress" /> 
     92     <field field_ref="e3v" /> 
     93     <field field_ref="ssv"          name="vos"      /> 
     94     <field field_ref="voce"         name="vo"       operation="instant" freq_op="5d" > @voce_e3v / @e3v </field> 
     95     <field field_ref="vtau"         name="tauvo"    /> 
    8796          <!-- available with key_diaar5 --> 
    88      <field field_ref="v_masstr"     name="vomematr"  /> 
    89      <field field_ref="v_heattr"     name="somehetr"  /> 
    90       <field field_ref="v_salttr"     name="somesatr"  /> 
     97     <field field_ref="v_masstr"     name="vomematr" /> 
     98     <field field_ref="v_heattr"     name="somehetr" /> 
     99      <field field_ref="v_salttr"     name="somesatr" /> 
    91100   </file> 
    92101    
    93102   <file id="file5" name_suffix="_grid_W" description="ocean W grid variables" > 
    94      <field field_ref="woce"         name="wo"      long_name="ocean vertical velocity"         /> 
    95      <field field_ref="avt"          name="difvho"  long_name="ocean_vertical_heat_diffusivity" /> 
    96      <field field_ref="w_masstr"     name="vovematr"  /> 
     103     <field field_ref="e3w" /> 
     104     <field field_ref="woce"         name="wo"       /> 
     105     <field field_ref="avt"          name="difvho"   /> 
     106     <field field_ref="w_masstr"     name="vovematr" /> 
    97107   </file> 
    98108 
    99109   <file id="file6" name_suffix="_icemod" description="ice variables" enabled=".true." > 
    100      <field field_ref="snowthic_cea"     name="snthic"     long_name="surface_snow_thickness"  /> 
    101      <field field_ref="icethic_cea"      name="sithic"     long_name="sea_ice_thickness"        /> 
    102           <field field_ref="icevolu"          name="sivolu" /> 
    103           <field field_ref="snowvol"          name="snvolu" /> 
    104           <field field_ref="iceconc"          name="siconc" /> 
     110          <field field_ref="snowthic_cea"    name="snthic" /> 
     111          <field field_ref="icethic_cea"     name="sithic" /> 
     112          <field field_ref="icevolu"         name="sivolu" /> 
     113          <field field_ref="snowvol"         name="snvolu" /> 
     114          <field field_ref="iceconc"         name="siconc" /> 
    105115 
    106116          <field field_ref="vfxbog"          name="vfxbog" /> 
    … …  
    118128          <field field_ref="icetrp"          name="sivtrp" /> 
    119129          <field field_ref="snwtrp"          name="snvtrp" /> 
     130          <field field_ref="saltrp"          name="saltrp" /> 
    120131          <field field_ref="deitrp"          name="deitrp" /> 
    121132          <field field_ref="destrp"          name="destrp" /> 
    122133 
    123           <field field_ref="sfxbri"           name="sfxbri" /> 
    124           <field field_ref="sfxdyn"           name="sfxdyn" /> 
    125           <field field_ref="sfxres"           name="sfxres" /> 
    126           <field field_ref="sfxbog"           name="sfxbog" /> 
    127           <field field_ref="sfxbom"           name="sfxbom" /> 
    128           <field field_ref="sfxsum"           name="sfxsum" /> 
    129           <field field_ref="sfxsni"           name="sfxsni" /> 
    130           <field field_ref="sfxopw"           name="sfxopw" /> 
    131           <field field_ref="sfx"              name="sfx" /> 
    132  
    133           <field field_ref="hfxsum"          name="hfxsum"    /> 
    134           <field field_ref="hfxbom"          name="hfxbom"    /> 
    135           <field field_ref="hfxbog"          name="hfxbog"    /> 
    136           <field field_ref="hfxdif"          name="hfxdif"    /> 
    137           <field field_ref="hfxopw"          name="hfxopw"    /> 
    138           <field field_ref="hfxout"          name="hfxout"    /> 
    139           <field field_ref="hfxin"           name="hfxin"    /> 
    140           <field field_ref="hfxsnw"          name="hfxsnw"    /> 
    141           <field field_ref="hfxerr"          name="hfxerr"    /> 
    142           <field field_ref="hfxerr_rem"      name="hfxerr_rem"    /> 
     134          <field field_ref="sfxbri"          name="sfxbri" /> 
     135          <field field_ref="sfxdyn"          name="sfxdyn" /> 
     136          <field field_ref="sfxres"          name="sfxres" /> 
     137          <field field_ref="sfxbog"          name="sfxbog" /> 
     138          <field field_ref="sfxbom"          name="sfxbom" /> 
     139          <field field_ref="sfxsum"          name="sfxsum" /> 
     140          <field field_ref="sfxsni"          name="sfxsni" /> 
     141          <field field_ref="sfxopw"          name="sfxopw" /> 
     142          <field field_ref="sfx"             name="sfx"    /> 
     143 
     144          <field field_ref="hfxsum"          name="hfxsum"     /> 
     145          <field field_ref="hfxbom"          name="hfxbom"     /> 
     146          <field field_ref="hfxbog"          name="hfxbog"     /> 
     147          <field field_ref="hfxdif"          name="hfxdif"     /> 
     148          <field field_ref="hfxopw"          name="hfxopw"     /> 
     149          <field field_ref="hfxout"          name="hfxout"     /> 
     150          <field field_ref="hfxin"           name="hfxin"      /> 
     151          <field field_ref="hfxsnw"          name="hfxsnw"     /> 
     152          <field field_ref="hfxerr"          name="hfxerr"     /> 
     153          <field field_ref="hfxerr_rem"      name="hfxerr_rem" /> 
    143154 
    144155     <!-- ice-ocean heat flux from mass exchange --> 
    145           <field field_ref="hfxdyn"          name="hfxdyn"    /> 
    146           <field field_ref="hfxres"          name="hfxres"    /> 
    147           <field field_ref="hfxthd"          name="hfxthd"    /> 
     156          <field field_ref="hfxdyn"          name="hfxdyn" /> 
     157          <field field_ref="hfxres"          name="hfxres" /> 
     158          <field field_ref="hfxthd"          name="hfxthd" /> 
    148159     <!-- ice-atm. heat flux from mass exchange --> 
    149           <field field_ref="hfxsub"          name="hfxsub"    /> 
    150           <field field_ref="hfxspr"          name="hfxspr"    /> 
     160          <field field_ref="hfxsub"          name="hfxsub" /> 
     161          <field field_ref="hfxspr"          name="hfxspr" /> 
    151162 
    152163     <!-- diags --> 
    153           <field field_ref="hfxdhc"          name="hfxdhc"    /> 
    154           <field field_ref="hfxtur"          name="hfxtur"    /> 
    155  
    156           <field field_ref="isst"             name="sst" /> 
    157           <field field_ref="isss"             name="sss" /> 
    158           <field field_ref="micesalt"         name="sisali" /> 
    159           <field field_ref="micet"            name="sitemp" /> 
    160           <field field_ref="icest"            name="sistem" /> 
    161           <field field_ref="icehc"            name="siheco" /> 
    162           <field field_ref="isnowhc"          name="snheco" /> 
    163           <field field_ref="miceage"          name="siages" /> 
    164  
    165           <field field_ref="uice_ipa"         name="sivelu" /> 
    166           <field field_ref="vice_ipa"         name="sivelv" /> 
    167           <field field_ref="icevel"           name="sivelo" /> 
    168           <field field_ref="idive"            name="sidive" /> 
    169           <field field_ref="ishear"           name="sishea" /> 
    170           <field field_ref="icestr"           name="sistre" /> 
    171  
    172           <field field_ref="ibrinv"           name="sibrin" /> 
    173           <field field_ref="icecolf"          name="sicolf" /> 
    174  
    175           <field field_ref="iceage_cat"       name="siagecat"/> 
    176           <field field_ref="iceconc_cat"      name="siconcat"/> 
    177           <field field_ref="icethic_cat"      name="sithicat"/> 
    178           <field field_ref="snowthic_cat"     name="snthicat"/> 
    179           <field field_ref="salinity_cat"     name="salincat"/> 
    180           <field field_ref="brinevol_cat"     name="sibricat"/> 
     164          <field field_ref="hfxdhc"          name="hfxdhc" /> 
     165          <field field_ref="hfxtur"          name="hfxtur" /> 
     166 
     167          <field field_ref="isst"            name="sst"    /> 
     168          <field field_ref="isss"            name="sss"    /> 
     169          <field field_ref="micesalt"        name="sisali" /> 
     170          <field field_ref="micet"           name="sitemp" /> 
     171          <field field_ref="icest"           name="sistem" /> 
     172          <field field_ref="icehc"           name="siheco" /> 
     173          <field field_ref="isnowhc"         name="snheco" /> 
     174          <field field_ref="miceage"         name="siages" /> 
     175 
     176          <field field_ref="uice_ipa"        name="sivelu" /> 
     177          <field field_ref="vice_ipa"        name="sivelv" /> 
     178          <field field_ref="icevel"          name="sivelo" /> 
     179          <field field_ref="idive"           name="sidive" /> 
     180          <field field_ref="ishear"          name="sishea" /> 
     181          <field field_ref="icestr"          name="sistre" /> 
     182 
     183          <field field_ref="ibrinv"          name="sibrin" /> 
     184          <field field_ref="icecolf"         name="sicolf" /> 
     185 
     186          <field field_ref="iceage_cat"      name="siagecat" /> 
     187          <field field_ref="iceconc_cat"     name="siconcat" /> 
     188          <field field_ref="icethic_cat"     name="sithicat" /> 
     189          <field field_ref="snowthic_cat"    name="snthicat" /> 
     190          <field field_ref="salinity_cat"    name="salincat" /> 
     191          <field field_ref="brinevol_cat"    name="sibricat" /> 
     192     <field field_ref="icetemp_cat"     name="sitemcat" /> 
     193     <field field_ref="snwtemp_cat"     name="sntemcat" /> 
    181194 
    182195   </file> 
    183196 
    184197        <file id="file7" name_suffix="_scalar" description="scalar variables" enabled=".true." > 
    185           <field field_ref="voltot"       name="scvoltot"  /> 
    186           <field field_ref="sshtot"       name="scsshtot"  /> 
    187           <field field_ref="sshsteric"    name="scsshste"  /> 
    188           <field field_ref="sshthster"    name="scsshtst"  /> 
    189           <field field_ref="masstot"      name="scmastot"  /> 
    190           <field field_ref="temptot"      name="sctemtot"  /> 
    191           <field field_ref="saltot"       name="scsaltot"  /> 
    192  
    193           <field field_ref="bgtemper"     name="bgtemper"    /> 
    194           <field field_ref="bgsaline"     name="bgsaline"    /> 
    195           <field field_ref="bgheatco"     name="bgheatco"    /> 
    196           <field field_ref="bgsaltco"     name="bgsaltco"    /> 
    197           <field field_ref="bgvolssh"     name="bgvolssh"    />  
    198           <field field_ref="bgvole3t"     name="bgvole3t"    /> 
    199           <field field_ref="bgfrcvol"     name="bgfrcvol"    /> 
    200           <field field_ref="bgfrctem"     name="bgfrctem"    /> 
    201           <field field_ref="bgfrcsal"     name="bgfrcsal"    /> 
    202  
    203           <field field_ref="ibgvoltot"    name="ibgvoltot"   /> 
    204           <field field_ref="sbgvoltot"    name="sbgvoltot"   /> 
    205           <field field_ref="ibgarea"      name="ibgarea"     /> 
    206           <field field_ref="ibgsaline"    name="ibgsaline"   /> 
    207           <field field_ref="ibgtemper"    name="ibgtemper"   /> 
    208           <field field_ref="ibgheatco"    name="ibgheatco"   /> 
    209           <field field_ref="sbgheatco"    name="sbgheatco"   /> 
    210           <field field_ref="ibgsaltco"    name="ibgsaltco"   /> 
    211  
    212           <field field_ref="ibgvfx"       name="ibgvfx"      /> 
    213           <field field_ref="ibgvfxbog"    name="ibgvfxbog"      /> 
    214           <field field_ref="ibgvfxopw"    name="ibgvfxopw"      /> 
    215           <field field_ref="ibgvfxsni"    name="ibgvfxsni"      /> 
    216           <field field_ref="ibgvfxdyn"    name="ibgvfxdyn"      /> 
    217           <field field_ref="ibgvfxbom"    name="ibgvfxbom"      /> 
    218           <field field_ref="ibgvfxsum"    name="ibgvfxsum"      /> 
    219           <field field_ref="ibgvfxres"    name="ibgvfxres"      /> 
    220           <field field_ref="ibgvfxspr"    name="ibgvfxspr"      /> 
    221           <field field_ref="ibgvfxsnw"    name="ibgvfxsnw"      /> 
    222           <field field_ref="ibgvfxsub"    name="ibgvfxsub"      /> 
     198          <field field_ref="voltot"       name="scvoltot"   /> 
     199          <field field_ref="sshtot"       name="scsshtot"   /> 
     200          <field field_ref="sshsteric"    name="scsshste"   /> 
     201          <field field_ref="sshthster"    name="scsshtst"   /> 
     202          <field field_ref="masstot"      name="scmastot"   /> 
     203          <field field_ref="temptot"      name="sctemtot"   /> 
     204          <field field_ref="saltot"       name="scsaltot"   /> 
     205 
     206          <field field_ref="bgtemper"     name="bgtemper"   /> 
     207          <field field_ref="bgsaline"     name="bgsaline"   /> 
     208          <field field_ref="bgheatco"     name="bgheatco"   /> 
     209          <field field_ref="bgsaltco"     name="bgsaltco"   /> 
     210          <field field_ref="bgvolssh"     name="bgvolssh"   />  
     211          <field field_ref="bgvole3t"     name="bgvole3t"   /> 
     212          <field field_ref="bgfrcvol"     name="bgfrcvol"   /> 
     213          <field field_ref="bgfrctem"     name="bgfrctem"   /> 
     214          <field field_ref="bgfrcsal"     name="bgfrcsal"   /> 
     215 
     216          <field field_ref="ibgvoltot"    name="ibgvoltot"  /> 
     217          <field field_ref="sbgvoltot"    name="sbgvoltot"  /> 
     218          <field field_ref="ibgarea"      name="ibgarea"    /> 
     219          <field field_ref="ibgsaline"    name="ibgsaline"  /> 
     220          <field field_ref="ibgtemper"    name="ibgtemper"  /> 
     221          <field field_ref="ibgheatco"    name="ibgheatco"  /> 
     222          <field field_ref="sbgheatco"    name="sbgheatco"  /> 
     223          <field field_ref="ibgsaltco"    name="ibgsaltco"  /> 
     224 
     225          <field field_ref="ibgvfx"       name="ibgvfx"     /> 
     226          <field field_ref="ibgvfxbog"    name="ibgvfxbog"  /> 
     227          <field field_ref="ibgvfxopw"    name="ibgvfxopw"  /> 
     228          <field field_ref="ibgvfxsni"    name="ibgvfxsni"  /> 
     229          <field field_ref="ibgvfxdyn"    name="ibgvfxdyn"  /> 
     230          <field field_ref="ibgvfxbom"    name="ibgvfxbom"  /> 
     231          <field field_ref="ibgvfxsum"    name="ibgvfxsum"  /> 
     232          <field field_ref="ibgvfxres"    name="ibgvfxres"  /> 
     233          <field field_ref="ibgvfxspr"    name="ibgvfxspr"  /> 
     234          <field field_ref="ibgvfxsnw"    name="ibgvfxsnw"  /> 
     235          <field field_ref="ibgvfxsub"    name="ibgvfxsub"  /> 
    223236 
    224237          <field field_ref="ibgsfx"       name="ibgsfx"     /> 
    225           <field field_ref="ibgsfxbri"    name="ibgsfxbri"    /> 
    226           <field field_ref="ibgsfxdyn"    name="ibgsfxdyn" /> 
    227           <field field_ref="ibgsfxres"    name="ibgsfxres" /> 
    228           <field field_ref="ibgsfxbog"    name="ibgsfxbog"      /> 
    229           <field field_ref="ibgsfxopw"    name="ibgsfxopw"      /> 
    230           <field field_ref="ibgsfxsni"    name="ibgsfxsni"      /> 
    231           <field field_ref="ibgsfxbom"    name="ibgsfxbom"      /> 
    232           <field field_ref="ibgsfxsum"    name="ibgsfxsum"      /> 
    233  
    234           <field field_ref="ibghfxdhc"    name="ibghfxdhc"    /> 
    235           <field field_ref="ibghfxspr"    name="ibghfxspr"    /> 
    236  
    237           <field field_ref="ibghfxres"    name="ibghfxres"    /> 
    238           <field field_ref="ibghfxsub"    name="ibghfxsub"    /> 
    239           <field field_ref="ibghfxdyn"    name="ibghfxdyn"    /> 
    240           <field field_ref="ibghfxthd"    name="ibghfxthd"    /> 
    241           <field field_ref="ibghfxsum"    name="ibghfxsum"    /> 
    242           <field field_ref="ibghfxbom"    name="ibghfxbom"    /> 
    243           <field field_ref="ibghfxbog"    name="ibghfxbog"    /> 
    244           <field field_ref="ibghfxdif"    name="ibghfxdif"    /> 
    245           <field field_ref="ibghfxopw"    name="ibghfxopw"    /> 
    246           <field field_ref="ibghfxout"    name="ibghfxout"    /> 
    247           <field field_ref="ibghfxin"    name="ibghfxin"    /> 
    248           <field field_ref="ibghfxsnw"    name="ibghfxsnw"    /> 
    249  
    250           <field field_ref="ibgfrcvol"    name="ibgfrcvol"   /> 
     238          <field field_ref="ibgsfxbri"    name="ibgsfxbri"  /> 
     239          <field field_ref="ibgsfxdyn"    name="ibgsfxdyn"  /> 
     240          <field field_ref="ibgsfxres"    name="ibgsfxres"  /> 
     241          <field field_ref="ibgsfxbog"    name="ibgsfxbog"  /> 
     242          <field field_ref="ibgsfxopw"    name="ibgsfxopw"  /> 
     243          <field field_ref="ibgsfxsni"    name="ibgsfxsni"  /> 
     244          <field field_ref="ibgsfxbom"    name="ibgsfxbom"  /> 
     245          <field field_ref="ibgsfxsum"    name="ibgsfxsum"  /> 
     246 
     247          <field field_ref="ibghfxdhc"    name="ibghfxdhc"  /> 
     248          <field field_ref="ibghfxspr"    name="ibghfxspr"  /> 
     249 
     250          <field field_ref="ibghfxres"    name="ibghfxres"  /> 
     251          <field field_ref="ibghfxsub"    name="ibghfxsub"  /> 
     252          <field field_ref="ibghfxdyn"    name="ibghfxdyn"  /> 
     253          <field field_ref="ibghfxthd"    name="ibghfxthd"  /> 
     254          <field field_ref="ibghfxsum"    name="ibghfxsum"  /> 
     255          <field field_ref="ibghfxbom"    name="ibghfxbom"  /> 
     256          <field field_ref="ibghfxbog"    name="ibghfxbog"  /> 
     257          <field field_ref="ibghfxdif"    name="ibghfxdif"  /> 
     258          <field field_ref="ibghfxopw"    name="ibghfxopw"  /> 
     259          <field field_ref="ibghfxout"    name="ibghfxout"  /> 
     260          <field field_ref="ibghfxin"     name="ibghfxin"   /> 
     261          <field field_ref="ibghfxsnw"    name="ibghfxsnw"  /> 
     262 
     263          <field field_ref="ibgfrcvol"    name="ibgfrcvol"  /> 
    251264          <field field_ref="ibgfrcsfx"    name="ibgfrcsfx"  /> 
    252           <field field_ref="ibgvolgrm"    name="ibgvolgrm"    /> 
     265          <field field_ref="ibgvolgrm"    name="ibgvolgrm"  /> 
    253266 
    254267        </file> 
    … …  
    267280      </file_group> 
    268281 
    269       <file_group id="3d" output_freq="3d"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 3d files -->     
    270       <file_group id="5d" output_freq="5d"  output_level="10" enabled=".TRUE."/>  <!-- 5d files -->    
    271  
    272282      <file_group id="1m" output_freq="1mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real monthly files --> 
    273  
    274  
    275283      <file_group id="2m" output_freq="2mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 2m files --> 
    276284      <file_group id="3m" output_freq="3mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 3m files --> 
    … …  
    292300     
    293301   <axis_definition>   
    294       <axis id="deptht" long_name="Vertical T levels" unit="m" positive="down" /> 
    295       <axis id="depthu" long_name="Vertical U levels" unit="m" positive="down" /> 
    296       <axis id="depthv" long_name="Vertical V levels" unit="m" positive="down" /> 
    297       <axis id="depthw" long_name="Vertical W levels" unit="m" positive="down" /> 
    298       <axis id="nfloat" long_name="Float number"      unit="-"  /> 
    299       <axis id="icbcla" long_name="Iceberg class"     unit="-"  /> 
    300       <axis id="ncatice" long_name="Ice categories"   unit="-"  /> 
     302      <axis id="deptht"  long_name="Vertical T levels"  unit="m" positive="down" /> 
     303      <axis id="depthu"  long_name="Vertical U levels"  unit="m" positive="down" /> 
     304      <axis id="depthv"  long_name="Vertical V levels"  unit="m" positive="down" /> 
     305      <axis id="depthw"  long_name="Vertical W levels"  unit="m" positive="down" /> 
     306      <axis id="nfloat"  long_name="Float number"       unit="1"                 /> 
     307      <axis id="icbcla"  long_name="Iceberg class"      unit="1"                 /> 
     308      <axis id="ncatice" long_name="Ice category"       unit="1"                 /> 
     309      <axis id="iax_20C" long_name="20 degC isotherm"   unit="degC"              /> 
     310      <axis id="iax_28C" long_name="28 degC isotherm"   unit="degC"              /> 
    301311   </axis_definition>  
    302312     
    … …  
    312322     <grid id="grid_W_2D" domain_ref="grid_W"/> 
    313323     <grid id="grid_W_3D" domain_ref="grid_W" axis_ref="depthw"/> 
     324     <grid id="gznl_T_2D" domain_ref="gznl"/> 
     325     <grid id="gznl_T_3D" domain_ref="gznl" axis_ref="deptht"/> 
     326     <grid id="gznl_W_3D" domain_ref="gznl" axis_ref="depthw"/> 
    314327    </grid_definition>    
    315328  </context> 
    … …  
    323336        We must have buffer_size > jpi*jpj*jpk*8 (with jpi and jpj the subdomain size) 
    324337--> 
    325      <variable id="buffer_size"               type="integer">5000000</variable> 
     338     <variable id="buffer_size"               type="integer">50000000</variable> 
    326339     <variable id="buffer_server_factor_size" type="integer">2</variable> 
    327340     <variable id="info_level"                type="integer">0</variable> 
    328      <variable id="using_server"              type="boolean">true</variable> 
     341     <variable id="using_server"              type="boolean">false</variable> 
    329342     <variable id="using_oasis"               type="boolean">false</variable> 
    330343     <variable id="oasis_codes_id"            type="string" >oceanx</variable> 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM3/EXP00/namelist_cfg

    r4370 r6225  
    66&namrun        !   parameters of the run 
    77!----------------------------------------------------------------------- 
     8   nn_no       =       0   !  job number (no more used...) 
     9   cn_exp      =  "ORCA2"  !  experience name 
     10   nn_it000    =       1   !  first time step 
     11   nn_itend    =     300   !  last  time step (std 5475) 
    812/ 
    913!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    2428&namzgr        !   vertical coordinate 
    2529!----------------------------------------------------------------------- 
     30   ln_zps      = .true.    !  z-coordinate - partial steps 
    2631/ 
    2732!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    4853/ 
    4954!----------------------------------------------------------------------- 
    50 &namsplit      !   time splitting parameters                            ("key_dynspg_ts") 
    51 !----------------------------------------------------------------------- 
    52 / 
    53 !----------------------------------------------------------------------- 
    5455&namcrs        !   Grid coarsening for dynamics output and/or 
    5556               !   passive tracer coarsened online simulations 
    … …  
    9394/ 
    9495!----------------------------------------------------------------------- 
    95 &namcla        !   cross land advection 
    96 !----------------------------------------------------------------------- 
    97 / 
    98 !----------------------------------------------------------------------- 
    9996&nambfr        !   bottom friction 
    10097!----------------------------------------------------------------------- 
    10198/ 
    10299!----------------------------------------------------------------------- 
    103 &nambbc        !   bottom temperature boundary condition 
    104 !----------------------------------------------------------------------- 
     100&nambbc        !   bottom temperature boundary condition                (default: NO) 
     101!----------------------------------------------------------------------- 
     102   ln_trabbc   = .true.    !  Apply a geothermal heating at the ocean bottom 
    105103/ 
    106104!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    115113&namtra_adv    !   advection scheme for tracer 
    116114!----------------------------------------------------------------------- 
     115   ln_traadv_fct =  .true.    !  FCT scheme 
     116      nn_fct_h   =  2               !  =2/4, horizontal 2nd / 4th order  
     117      nn_fct_v   =  2               !  =2/4, vertical   2nd / COMPACT 4th order  
     118      nn_fct_zts =  0               !  > 1 , 2nd order FCT scheme with vertical sub-timestepping 
     119      !                             !        (number of sub-timestep = nn_fct_zts) 
    117120/ 
    118121!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    123126&namtra_ldf    !   lateral diffusion scheme for tracers 
    124127!---------------------------------------------------------------------------------- 
     128   !                       !  Operator type: 
     129   ln_traldf_lap   =  .true.   !    laplacian operator 
     130   ln_traldf_blp   =  .false.  !  bilaplacian operator 
     131   !                       !  Direction of action: 
     132   ln_traldf_lev   =  .false.  !  iso-level 
     133   ln_traldf_hor   =  .false.  !  horizontal (geopotential) 
     134   ln_traldf_iso   =  .true.   !  iso-neutral (Standard operator) 
     135   ln_traldf_triad =  .false.  !  iso-neutral (Triads   operator) 
     136   ! 
     137   !                       !  iso-neutral options:         
     138   ln_traldf_msc   =  .true.   !  Method of Stabilizing Correction (both operators) 
     139   rn_slpmax       =   0.01    !  slope limit                      (both operators) 
     140   ln_triad_iso    =  .false.  !  pure horizontal mixing in ML              (triad only) 
     141   rn_sw_triad     =  1        !  =1 switching triad ; =0 all 4 triads used (triad only) 
     142   ln_botmix_triad =  .false.  !  lateral mixing on bottom                  (triad only) 
     143   ! 
     144   !                       !  Coefficients: 
     145   nn_aht_ijk_t    = 20        !  space/time variation of eddy coef 
     146   !                                !   =-20 (=-30)    read in eddy_diffusivity_2D.nc (..._3D.nc) file 
     147   !                                !   =  0           constant  
     148   !                                !   = 10 F(k)      =ldf_c1d  
     149   !                                !   = 20 F(i,j)    =ldf_c2d  
     150   !                                !   = 21 F(i,j,t)  =Treguier et al. JPO 1997 formulation 
     151   !                                !   = 30 F(i,j,k)  =ldf_c2d + ldf_c1d 
     152   !                                !   = 31 F(i,j,k,t)=F(local velocity) 
     153   rn_aht_0        = 2000.     !  lateral eddy diffusivity   (lap. operator) [m2/s] 
     154   rn_bht_0        = 1.e+12    !  lateral eddy diffusivity (bilap. operator) [m4/s] 
     155/ 
     156!---------------------------------------------------------------------------------- 
     157&namtra_ldfeiv !   eddy induced velocity param. 
     158!---------------------------------------------------------------------------------- 
     159   ln_ldfeiv     =.true.   ! use eddy induced velocity parameterization 
     160   ln_ldfeiv_dia =.true.   ! diagnose eiv stream function and velocities 
     161   rn_aeiv_0     = 2000.   ! eddy induced velocity coefficient   [m2/s] 
     162   nn_aei_ijk_t  = 21      ! space/time variation of the eiv coeficient 
     163   !                                !   =-20 (=-30)    read in eddy_induced_velocity_2D.nc (..._3D.nc) file 
     164   !                                !   =  0           constant  
     165   !                                !   = 10 F(k)      =ldf_c1d  
     166   !                                !   = 20 F(i,j)    =ldf_c2d  
     167   !                                !   = 21 F(i,j,t)  =Treguier et al. JPO 1997 formulation 
     168   !                                !   = 30 F(i,j,k)  =ldf_c2d + ldf_c1d 
    125169/ 
    126170!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    135179&namdyn_vor    !   option of physics/algorithm (not control by CPP keys) 
    136180!----------------------------------------------------------------------- 
     181   ln_dynvor_ene = .false. !  enstrophy conserving scheme 
     182   ln_dynvor_ens = .false. !  energy conserving scheme 
     183   ln_dynvor_mix = .false. !  mixed scheme 
     184   ln_dynvor_een = .true.  !  energy & enstrophy scheme 
     185      nn_een_e3f = 0             !  e3f = masked averaging of e3t divided by 4 (=0) or by the sum of mask (=1) 
    137186/ 
    138187!----------------------------------------------------------------------- 
    139188&namdyn_hpg    !   Hydrostatic pressure gradient option 
    140189!----------------------------------------------------------------------- 
     190   ln_hpg_sco  = .true.    !  s-coordinate (standard jacobian formulation) 
     191   ln_hpg_zps  = .false.   !  z-coordinate - partial steps (interpolation) 
     192/ 
     193!----------------------------------------------------------------------- 
     194&namdyn_spg    !   surface pressure gradient 
     195!----------------------------------------------------------------------- 
     196   ln_dynspg_ts  = .true.  !  split-explicit free surface 
    141197/ 
    142198!----------------------------------------------------------------------- 
    143199&namdyn_ldf    !   lateral diffusion on momentum 
    144200!----------------------------------------------------------------------- 
     201   !                       !  Type of the operator : 
     202   !                           !  no diffusion: set ln_dynldf_lap=..._blp=F  
     203   ln_dynldf_lap =  .true.     !    laplacian operator 
     204   ln_dynldf_blp =  .false.    !  bilaplacian operator 
     205   !                       !  Direction of action  : 
     206   ln_dynldf_lev =  .true.     !  iso-level 
     207   ln_dynldf_hor =  .false.    !  horizontal (geopotential) 
     208   ln_dynldf_iso =  .false.    !  iso-neutral 
     209   !                       !  Coefficient 
     210   nn_ahm_ijk_t  = -30         !  space/time variation of eddy coef 
     211   !                                !  =-30  read in eddy_viscosity_3D.nc file 
     212   !                                !  =-20  read in eddy_viscosity_2D.nc file 
     213   !                                !  =  0  constant  
     214   !                                !  = 10  F(k)=c1d 
     215   !                                !  = 20  F(i,j)=F(grid spacing)=c2d 
     216   !                                !  = 30  F(i,j,k)=c2d*c1d 
     217   !                                !  = 31  F(i,j,k)=F(grid spacing and local velocity) 
     218   rn_ahm_0      =  40000.     !  horizontal laplacian eddy viscosity   [m2/s] 
     219   rn_ahm_b      =      0.     !  background eddy viscosity for ldf_iso [m2/s] 
     220   rn_bhm_0      = 1.e+12      !  horizontal bilaplacian eddy viscosity [m4/s] 
     221   ! 
     222   ! Caution in 20 and 30 cases the coefficient have to be given for a 1 degree grid (~111km) 
    145223/ 
    146224!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    161239/ 
    162240!----------------------------------------------------------------------- 
    163 &namsol        !   elliptic solver / island / free surface 
    164 !----------------------------------------------------------------------- 
    165 / 
    166 !----------------------------------------------------------------------- 
    167241&nammpp        !   Massively Parallel Processing                        ("key_mpp_mpi) 
    168242!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    177251/ 
    178252!----------------------------------------------------------------------- 
    179 &namhsb       !  Heat and salt budgets 
    180 !----------------------------------------------------------------------- 
    181 / 
    182 !----------------------------------------------------------------------- 
    183 &namdyn_nept  !   Neptune effect (simplified: lateral and vertical diffusions removed) 
    184 !----------------------------------------------------------------------- 
    185 / 
     253&namhsb       !  Heat and salt budgets                                  (default F) 
     254!----------------------------------------------------------------------- 
     255   ln_diahsb  = .true.    !  check the heat and salt budgets (T) or not (F) 
     256/ 
     257!----------------------------------------------------------------------- 
     258&namobs       !  observation usage                                      ('key_diaobs') 
     259!----------------------------------------------------------------------- 
     260/ 
     261!----------------------------------------------------------------------- 
     262&nam_asminc   !   assimilation increments                               ('key_asminc') 
     263!----------------------------------------------------------------------- 
     264/ 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM3/cpp_ORCA2_LIM3.fcm

    r4161 r6225  
    1  bld::tool::fppkeys key_trabbl key_lim3 key_dynspg_flt key_diaeiv key_ldfslp key_traldf_c2d key_traldf_eiv key_dynldf_c3d key_zdftke key_zdfddm key_zdftmx key_iomput key_mpp_mpi 
     1bld::tool::fppkeys key_trabbl key_lim3 key_zdftke key_zdfddm key_zdftmx key_iomput key_mpp_mpi key_asminc key_nosignedzero 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM_CFC_C14b/EXP00/1_namelist_cfg

    r4147 r6225  
    55!!                                    namsbc_cpl, namtra_qsr, namsbc_rnf,  
    66!!                                    namsbc_apr, namsbc_ssr, namsbc_alb) 
    7 !!              4 - lateral boundary (namlbc, namcla, namobc, namagrif, nambdy, nambdy_tide) 
     7!!              4 - lateral boundary (namlbc, namagrif, nambdy, nambdy_tide) 
    88!!              5 - bottom  boundary (nambfr, nambbc, nambbl) 
    99!!              6 - Tracer           (nameos, namtra_adv, namtra_ldf, namtra_dmp) 
    … …  
    5959&namzgr        !   vertical coordinate 
    6060!----------------------------------------------------------------------- 
    61    ln_zco      = .false.   !  z-coordinate - full    steps   (T/F)      ("key_zco" may also be defined) 
    6261   ln_zps      = .true.    !  z-coordinate - partial steps   (T/F) 
    63    ln_sco      = .false.   !  s- or hybrid z-s-coordinate    (T/F) 
     62   ln_linssh   = .true.    !  linear free surface 
    6463/ 
    6564!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    8685                           ! 
    8786   rn_rdt      = 2880.     !  time step for the dynamics (and tracer if nn_acc=0) 
    88    nn_baro     =   64      !  number of barotropic time step            ("key_dynspg_ts") 
    8987   rn_atfp     =    0.1    !  asselin time filter parameter 
    90    nn_acc      =    0      !  acceleration of convergence : =1      used, rdt < rdttra(k) 
    91                                  !                          =0, not used, rdt = rdttra 
    92    rn_rdtmin   = 14400.          !  minimum time step on tracers (used if nn_acc=1) 
    93    rn_rdtmax   = 14400.          !  maximum time step on tracers (used if nn_acc=1) 
    94    rn_rdth     =  800.           !  depth variation of tracer time step  (used if nn_acc=1) 
    9588/ 
    9689!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    110103!!   namsbc_clio     CLIO bulk formulea formulation 
    111104!!   namsbc_core     CORE bulk formulea formulation 
    112 !!   namsbc_cpl      CouPLed            formulation                     ("key_coupled") 
     105!!   namsbc_cpl      CouPLed            formulation                     ("key_oasis3") 
    113106!!   namtra_qsr      penetrative solar radiation 
    114107!!   namsbc_rnf      river runoffs 
    … …  
    199192/ 
    200193!----------------------------------------------------------------------- 
    201 &namsbc_cpl    !   coupled ocean/atmosphere model                       ("key_coupled") 
     194&namsbc_cpl    !   coupled ocean/atmosphere model                       ("key_oasis3") 
    202195!----------------------------------------------------------------------- 
    203196!                    !     description       !  multiple  !    vector   !      vector          ! vector ! 
    … …  
    297290   rn_alphdi   =    0.72   !  (Pyane, 1972) 
    298291/ 
     292!----------------------------------------------------------------------- 
     293&namsbc_wave   ! External fields from wave model 
     294!----------------------------------------------------------------------- 
     295!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     296!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     297   sn_cdg      =  'cdg_wave' ,        1          , 'drag_coeff' , .true.   , .false. , 'daily'  ,''         , '' 
     298! 
     299   cn_dir_cdg  = './'  !  root directory for the location of drag coefficient files 
     300/ 
    299301 
    300302!!====================================================================== 
    … …  
    302304!!====================================================================== 
    303305!!   namlbc        lateral momentum boundary condition 
    304 !!   namcla        cross land advection 
    305 !!   namobc        open boundaries parameters                           ("key_obc") 
    306306!!   namagrif      agrif nested grid ( read by child model only )       ("key_agrif")  
    307307!!   nambdy        Unstructured open boundaries                         ("key_bdy") 
    … …  
    314314   rn_shlat    =    2.     !  shlat = 0  !  0 < shlat < 2  !  shlat = 2  !  2 < shlat 
    315315                           !  free slip  !   partial slip  !   no slip   ! strong slip 
    316 / 
    317 !----------------------------------------------------------------------- 
    318 &namcla        !   cross land advection 
    319 !----------------------------------------------------------------------- 
    320    nn_cla      =    0      !  advection between 2 ocean pts separates by land 
    321 / 
    322 !----------------------------------------------------------------------- 
    323 &namobc        !   open boundaries parameters                           ("key_obc") 
    324 !----------------------------------------------------------------------- 
    325    ln_obc_clim = .false.   !  climatological obc data files (T) or not (F) 
    326    ln_vol_cst  = .true.    !  impose the total volume conservation (T) or not (F) 
    327    ln_obc_fla  = .false.   !  Flather open boundary condition  
    328    nn_obcdta   =    1      !  = 0 the obc data are equal to the initial state 
    329                            !  = 1 the obc data are read in 'obc.dta' files 
    330    cn_obcdta   = 'annual'  !  set to annual if obc datafile hold 1 year of data 
    331                            !  set to monthly if obc datafile hold 1 month of data 
    332    rn_dpein    =    1.     !  damping time scale for inflow at east  open boundary 
    333    rn_dpwin    =    1.     !     -           -         -       west    -      - 
    334    rn_dpnin    =    1.     !     -           -         -       north   -      - 
    335    rn_dpsin    =    1.     !     -           -         -       south   -      - 
    336    rn_dpeob    = 3000.     !  time relaxation (days) for the east  open boundary 
    337    rn_dpwob    =   15.     !     -           -         -     west    -      - 
    338    rn_dpnob    = 3000.     !     -           -         -     north   -      - 
    339    rn_dpsob    =   15.     !     -           -         -     south   -      - 
    340    rn_volemp   =    1.     !  = 0 the total volume change with the surface flux (E-P-R) 
    341                            !  = 1 the total volume remains constant 
    342316/ 
    343317!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    394368&nambdy_tide     ! tidal forcing at open boundaries               
    395369!----------------------------------------------------------------------- 
    396    filtide      = 'bdydta/amm12_bdytide_'         !  file name root of tidal forcing files 
     370    filtide       = 'bdydta/amm12_bdytide_'         !  file name root of tidal forcing files 
    397371    tide_cpt(1)   ='Q1'  !  names of tidal components used 
    398372    tide_cpt(2)   ='O1'  !  names of tidal components used 
    … …  
    485459/ 
    486460!----------------------------------------------------------------------- 
    487 &namtra_adv    !   advection scheme for tracer  
    488 !----------------------------------------------------------------------- 
    489    ln_traadv_cen2   =  .false.  !  2nd order centered scheme    
    490    ln_traadv_tvd    =  .true.   !  TVD scheme                 
    491    ln_traadv_muscl  =  .false.  !  MUSCL scheme              
    492    ln_traadv_muscl2 =  .false.  !  MUSCL2 scheme + cen2 at boundaries   
    493    ln_traadv_ubs    =  .false.  !  UBS scheme                  
    494    ln_traadv_qck    =  .false.  !  QUCIKEST scheme                  
     461&namtra_adv    !   advection scheme for tracer 
     462!----------------------------------------------------------------------- 
     463   ln_traadv_fct =  .true.    !  FCT scheme 
     464      nn_fct_h   =  2               !  =2/4, horizontal 2nd / 4th order  
     465      nn_fct_v   =  2               !  =2/4, vertical   2nd / COMPACT 4th order  
     466      nn_fct_zts =  0               !  >=1,  2nd order FCT scheme with vertical sub-timestepping 
     467      !                             !        (number of sub-timestep = nn_fct_zts) 
    495468/ 
    496469!----------------------------------------------------------------------- 
    497470&namtra_ldf    !   lateral diffusion scheme for tracer  
    498471!----------------------------------------------------------------------- 
    499    !                       !  Type of the operator :  
    500    ln_traldf_lap    =  .true.   !  laplacian operator        
    501    ln_traldf_bilap  =  .false.  !  bilaplacian operator      
    502    !                       !  Direction of action  : 
    503    ln_traldf_level  =  .false.  !  iso-level                 
    504    ln_traldf_hor    =  .false.  !  horizontal (geopotential)            (require "key_ldfslp" when ln_sco=T) 
    505    ln_traldf_iso    =  .true.   !  iso-neutral                          (require "key_ldfslp") 
    506    ln_traldf_grif   =  .false.  !  griffies skew flux formulation       (require "key_ldfslp")  ! UNDER TEST, DO NOT USE 
    507    ln_traldf_gdia   =  .false.  !  griffies operator strfn diagnostics  (require "key_ldfslp")  ! UNDER TEST, DO NOT USE 
    508    !                       !  Coefficient 
    509    rn_aht_0         =  1000.    !  horizontal eddy diffusivity for tracers [m2/s] 
    510    rn_ahtb_0        =     0.    !  background eddy diffusivity for ldf_iso [m2/s] 
    511    rn_aeiv_0        =     0.    !  eddy induced velocity coefficient [m2/s]    (require "key_traldf_eiv") 
     472   !                       !  Operator type: 
     473   !                           !  no diffusion: set ln_traldf_lap=..._blp=F  
     474   ln_traldf_lap   =  .true.   !    laplacian operator 
     475   ln_traldf_blp   =  .false.  !  bilaplacian operator 
     476   !                       !  Direction of action: 
     477   ln_traldf_lev   =  .false.  !  iso-level 
     478   ln_traldf_hor   =  .false.  !  horizontal (geopotential) 
     479   ln_traldf_iso   =  .true.   !  iso-neutral (standard operator) 
     480   ln_traldf_triad =  .false.  !  iso-neutral (triad    operator) 
     481   ! 
     482   !                       !  iso-neutral options:         
     483   ln_traldf_msc   =  .true.   !  Method of Stabilizing Correction (both operators) 
     484   rn_slpmax       =   0.01    !  slope limit                      (both operators) 
     485   ln_triad_iso    =  .false.  !  pure horizontal mixing in ML              (triad only) 
     486   rn_sw_triad     =  1        !  =1 switching triad ; =0 all 4 triads used (triad only) 
     487   ln_botmix_triad =  .false.  !  lateral mixing on bottom                  (triad only) 
     488   ! 
     489   !                       !  Coefficients: 
     490   nn_aht_ijk_t    = 0         !  space/time variation of eddy coef 
     491   !                                !   =-20 (=-30)    read in eddy_diffusivity_2D.nc (..._3D.nc) file 
     492   !                                !   =  0           constant  
     493   !                                !   = 10 F(k)      =ldf_c1d  
     494   !                                !   = 20 F(i,j)    =ldf_c2d  
     495   !                                !   = 21 F(i,j,t)  =Treguier et al. JPO 1997 formulation 
     496   !                                !   = 30 F(i,j,k)  =ldf_c2d * ldf_c1d 
     497   !                                !   = 31 F(i,j,k,t)=F(local velocity and grid-spacing) 
     498   rn_aht_0        = 1000.     !  lateral eddy diffusivity   (lap. operator) [m2/s] 
     499   rn_bht_0        = 1.e+12    !  lateral eddy diffusivity (bilap. operator) [m4/s] 
     500/ 
     501!---------------------------------------------------------------------------------- 
     502&namtra_ldfeiv !   eddy induced velocity param. 
     503!---------------------------------------------------------------------------------- 
     504   ln_ldfeiv     =.false.   ! use eddy induced velocity parameterization 
    512505/ 
    513506!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    546539&namdyn_vor    !   option of physics/algorithm (not control by CPP keys) 
    547540!----------------------------------------------------------------------- 
    548    ln_dynvor_ene = .false. !  enstrophy conserving scheme   
    549    ln_dynvor_ens = .false. !  energy conserving scheme     
    550    ln_dynvor_mix = .false. !  mixed scheme                
    551    ln_dynvor_een = .true.  !  energy & enstrophy scheme   
     541   ln_dynvor_ene = .false. !  enstrophy conserving scheme 
     542   ln_dynvor_ens = .false. !  energy conserving scheme 
     543   ln_dynvor_mix = .false. !  mixed scheme 
     544   ln_dynvor_een = .true.  !  energy & enstrophy scheme 
     545      nn_een_e3f = 1             !  e3f = masked averaging of e3t divided by 4 (=0) or by the sum of mask (=1) 
     546   ln_dynvor_msk = .true.  !  vorticity multiplied by fmask (=T) or not (=F) (all vorticity schemes) 
    552547/ 
    553548!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    559554   ln_hpg_djc  = .false.   !  s-coordinate (Density Jacobian with Cubic polynomial) 
    560555   ln_hpg_prj  = .false.   !  s-coordinate (Pressure Jacobian scheme) 
    561    ln_dynhpg_imp = .false. !  time stepping: semi-implicit time scheme  (T) 
    562                                  !           centered      time scheme  (F) 
    563 / 
    564 !----------------------------------------------------------------------- 
    565 !namdyn_spg    !   surface pressure gradient   (CPP key only) 
    566 !----------------------------------------------------------------------- 
    567 !                          !  explicit free surface                     ("key_dynspg_exp") 
    568 !                          !  filtered free surface                     ("key_dynspg_flt") 
    569 !                          !  split-explicit free surface               ("key_dynspg_ts") 
    570  
     556/ 
     557!----------------------------------------------------------------------- 
     558&namdyn_spg    !   surface pressure gradient 
     559!----------------------------------------------------------------------- 
     560   ln_dynspg_ts  = .true.  !  split-explicit free surface 
     561/ 
    571562!----------------------------------------------------------------------- 
    572563&namdyn_ldf    !   lateral diffusion on momentum 
    573564!----------------------------------------------------------------------- 
    574    !                       !  Type of the operator :  
    575    ln_dynldf_lap    =  .false.  !  laplacian operator          
    576    ln_dynldf_bilap  =  .true.   !  bilaplacian operator     
    577    !                       !  Direction of action  :  
    578    ln_dynldf_level  =  .false.  !  iso-level                
    579    ln_dynldf_hor    =  .true.   !  horizontal (geopotential)            (require "key_ldfslp" in s-coord.) 
    580    ln_dynldf_iso    =  .false.  !  iso-neutral                          (require "key_ldfslp") 
     565   !                       !  Type of the operator : 
     566   !                           !  no diffusion: set ln_dynldf_lap=..._blp=F  
     567   ln_dynldf_lap =  .false.    !    laplacian operator 
     568   ln_dynldf_blp =  .true.     !  bilaplacian operator 
     569   !                       !  Direction of action  : 
     570   ln_dynldf_lev =  .true.     !  iso-level 
     571   ln_dynldf_hor =  .false.    !  horizontal (geopotential) 
     572   ln_dynldf_iso =  .false.    !  iso-neutral 
    581573   !                       !  Coefficient 
    582    rn_ahm_0_lap     = 40000.    !  horizontal laplacian eddy viscosity   [m2/s] 
    583    rn_ahmb_0        =     0.    !  background eddy viscosity for ldf_iso [m2/s] 
    584    rn_ahm_0_blp     = -8.5e+11  !  horizontal bilaplacian eddy viscosity [m4/s]  
     574   nn_ahm_ijk_t  = 0           !  space/time variation of eddy coef 
     575   !                                !  =-30  read in eddy_viscosity_3D.nc file 
     576   !                                !  =-20  read in eddy_viscosity_2D.nc file 
     577   !                                !  =  0  constant  
     578   !                                !  = 10  F(k)=c1d 
     579   !                                !  = 20  F(i,j)=F(grid spacing)=c2d 
     580   !                                !  = 30  F(i,j,k)=c2d*c1d 
     581   !                                !  = 31  F(i,j,k)=F(grid spacing and local velocity) 
     582   rn_ahm_0      =  40000.     !  horizontal laplacian eddy viscosity   [m2/s] 
     583   rn_ahm_b      =      0.     !  background eddy viscosity for ldf_iso [m2/s] 
     584   rn_bhm_0      = 8.5e+11     !  horizontal bilaplacian eddy viscosity [m4/s] 
    585585/ 
    586586 
    … …  
    640640                           !        = 1 add a tke source below the ML 
    641641                           !        = 2 add a tke source just at the base of the ML 
    642                            !        = 3 as = 1 applied on HF part of the stress    ("key_coupled") 
     642                           !        = 3 as = 1 applied on HF part of the stress    ("key_oasis3") 
    643643   rn_efr      =   0.05    !  fraction of surface tke value which penetrates below the ML (nn_etau=1 or 2) 
    644644   nn_htau     =   1       !  type of exponential decrease of tke penetration below the ML 
    … …  
    700700!!   nammpp_dyndist    Massively Parallel domain decomposition          ("key_agrif" && "key_mpp_dyndist") 
    701701!!   namctl            Control prints & Benchmark 
    702 !!   namsol            elliptic solver / island / free surface  
    703 !!====================================================================== 
    704 ! 
    705 !----------------------------------------------------------------------- 
    706 &namsol        !   elliptic solver / island / free surface  
    707 !----------------------------------------------------------------------- 
    708    nn_solv     =      1    !  elliptic solver: =1 preconditioned conjugate gradient (pcg) 
    709                            !                   =2 successive-over-relaxation (sor) 
    710    nn_sol_arp  =      0    !  absolute/relative (0/1) precision convergence test 
    711    rn_eps      =  1.e-6    !  absolute precision of the solver 
    712    nn_nmin     =    300    !  minimum of iterations for the SOR solver 
    713    nn_nmax     =    800    !  maximum of iterations for the SOR solver 
    714    nn_nmod     =     10    !  frequency of test for the SOR solver 
    715    rn_resmax   =  1.e-10   !  absolute precision for the SOR solver 
    716    rn_sor      =  1.92     !  optimal coefficient for SOR solver (to be adjusted with the domain) 
    717 / 
     702!!====================================================================== 
     703! 
    718704!----------------------------------------------------------------------- 
    719705&nammpp        !   Massively Parallel Processing                        ("key_mpp_mpi) 
    … …  
    877863   ln_ignmis  = .true.     ! Logical switch for ignoring missing files    
    878864                           !     endailyavtypes   ENACT daily average types                     
    879    ln_grid_global = .true. 
    880865   ln_grid_search_lookup = .false. 
    881866/  
    … …  
    897882    salfixmin = -9999      !  Minimum salinity after applying the increments 
    898883/ 
    899 !----------------------------------------------------------------------- 
    900 &namsbc_wave   ! External fields from wave model 
    901 !----------------------------------------------------------------------- 
    902 !              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    903 !              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    904    sn_cdg      =  'cdg_wave' ,        1          , 'drag_coeff' , .true.   , .false. , 'daily'  ,''         , '' 
    905 ! 
    906    cn_dir_cdg  = './'  !  root directory for the location of drag coefficient files 
    907 / 
    908 !----------------------------------------------------------------------- 
    909 &namdyn_nept  !   Neptune effect (simplified: lateral and vertical diffusions removed) 
    910 !----------------------------------------------------------------------- 
    911    ! Suggested lengthscale values are those of Eby & Holloway (1994) for a coarse model 
    912    ln_neptsimp       = .false.  ! yes/no use simplified neptune 
    913  
    914    ln_smooth_neptvel = .false.  ! yes/no smooth zunep, zvnep 
    915    rn_tslse          =  1.2e4   ! value of lengthscale L at the equator 
    916    rn_tslsp          =  3.0e3   ! value of lengthscale L at the pole 
    917    ! Specify whether to ramp down the Neptune velocity in shallow 
    918    ! water, and if so the depth range controlling such ramping down 
    919    ln_neptramp       = .true.   ! ramp down Neptune velocity in shallow water 
    920    rn_htrmin         =  100.0   ! min. depth of transition range 
    921    rn_htrmax         =  200.0   ! max. depth of transition range 
    922 / 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM_CFC_C14b/EXP00/1_namelist_top_cfg

    r4147 r6225  
    3939&namtrc_adv    !   advection scheme for passive tracer  
    4040!----------------------------------------------------------------------- 
    41    ln_trcadv_cen2   =  .false.  !  2nd order centered scheme    
    42    ln_trcadv_tvd    =  .true.  !  TVD scheme 
    43    ln_trcadv_muscl  =  .false.   !  MUSCL scheme 
    44    ln_trcadv_muscl2 =  .false.  !  MUSCL2 scheme + cen2 at boundaries 
    45    ln_trcadv_ubs    =  .false.  !  UBS scheme 
    46    ln_trcadv_qck    =  .false.  !  QUICKEST scheme 
     41   ln_trcadv_fct =  .true.   !  FCT scheme 
     42      nn_fct_h   =  2               !  =2/4, horizontal 2nd / 4th order  
     43      nn_fct_v   =  2               !  =2/4, vertical   2nd / COMPACT 4th order  
     44      nn_fct_zts =  0               !  >=1,  2nd order FCT scheme with vertical sub-timestepping 
     45      !                             !        (number of sub-timestep = nn_fct_zts) 
    4746/ 
    4847!----------------------------------------------------------------------- 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM_CFC_C14b/EXP00/iodef.xml

    r4153 r6225  
    3636 
    3737   <file id="file1" name_suffix="_grid_T" description="ocean T grid variables" > 
    38      <field field_ref="toce"         name="thetao"   long_name="sea_water_potential_temperature"               /> 
    39      <field field_ref="soce"         name="so"       long_name="sea_water_salinity"                            /> 
    40      <field field_ref="sst"          name="tos"      long_name="sea_surface_temperature"                       /> 
    41      <field field_ref="sst2"         name="tossq"    long_name="square_of_sea_surface_temperature"             /> 
    42      <field field_ref="sss"          name="sos"      long_name="sea_surface_salinity"                          /> 
    43      <field field_ref="ssh"          name="zos"      long_name="sea_surface_height_above_geoid"                /> 
    44      <field field_ref="ssh2"         name="zossq"    long_name="square_of_sea_surface_height_above_geoid"      /> 
    45      <field field_ref="empmr"        name="wfo"      long_name="water_flux_into_sea_water"                     /> 
    46      <field field_ref="qsr"          name="rsntds"   long_name="surface_net_downward_shortwave_flux"           /> 
    47      <field field_ref="qt"           name="tohfls"   long_name="surface_net_downward_total_heat_flux"          /> 
    48      <field field_ref="taum"         /> 
    49      <field field_ref="mldkz5"       /> 
    50      <field field_ref="mldr10_1"     /> 
     38     <field field_ref="toce"         name="thetao" /> 
     39     <field field_ref="soce"         name="so"     /> 
     40     <field field_ref="sst"          name="tos"    /> 
     41     <field field_ref="sst2"         name="tossq"  /> 
     42     <field field_ref="sss"          name="sos"    /> 
     43     <field field_ref="ssh"          name="zos"    /> 
     44     <field field_ref="ssh2"         name="zossq"  /> 
     45     <field field_ref="empmr"        name="wfo"    /> 
     46     <field field_ref="qsr"          name="rsntds" /> 
     47     <field field_ref="qt"           name="tohfls" /> 
     48     <field field_ref="taum"     /> 
     49     <field field_ref="mldkz5"   /> 
     50     <field field_ref="mldr10_1" /> 
    5151   </file> 
    5252    
    5353   <file id="file2" name_suffix="_grid_U" description="ocean U grid variables" > 
    54      <field field_ref="uoce"         name="uo"      long_name="sea_water_x_velocity"      /> 
    55      <field field_ref="suoce"        name="uos"     long_name="sea_surface_x_velocity"    /> 
    56      <field field_ref="utau"         name="tauuo"   long_name="surface_downward_x_stress" /> 
     54     <field field_ref="uoce"         name="uo"    /> 
     55     <field field_ref="ssu"          name="uos"   /> 
     56     <field field_ref="utau"         name="tauuo" /> 
    5757   </file> 
    5858    
    5959   <file id="file3" name_suffix="_grid_V" description="ocean V grid variables" > 
    60      <field field_ref="voce"         name="vo"      long_name="sea_water_y_velocity"      /> 
    61      <field field_ref="svoce"        name="vos"     long_name="sea_surface_y_velocity"    /> 
    62      <field field_ref="vtau"         name="tauvo"   long_name="surface_downward_y_stress" /> 
     60     <field field_ref="voce"         name="vo"    /> 
     61     <field field_ref="ssv"          name="vos"   /> 
     62     <field field_ref="vtau"         name="tauvo" /> 
    6363   </file> 
    6464    
    6565   <file id="file4" name_suffix="_grid_W" description="ocean W grid variables" > 
    66      <field field_ref="woce"         name="wo"      long_name="ocean vertical velocity"         /> 
    67      <field field_ref="avt"          name="difvho"  long_name="ocean_vertical_heat_diffusivity" /> 
     66     <field field_ref="woce"         name="wo"     /> 
     67     <field field_ref="avt"          name="difvho" /> 
    6868   </file> 
    6969    
    7070   <file id="file5" name_suffix="_icemod" description="ice variables" > 
    71      <field field_ref="ice_pres"                     /> 
    72      <field field_ref="snowthic_cea" name="snd"     long_name="surface_snow_thickness"   /> 
    73      <field field_ref="icethic_cea"  name="sit"     long_name="sea_ice_thickness"        /> 
    74      <field field_ref="iceprod_cea"  name="sip"     long_name="sea_ice_thickness"        /> 
    75      <field field_ref="ist_ipa"      /> 
    76      <field field_ref="ioceflxb"     /> 
    77      <field field_ref="uice_ipa"     /> 
    78      <field field_ref="vice_ipa"     /> 
    79      <field field_ref="utau_ice"     /> 
    80      <field field_ref="vtau_ice"     /> 
    81      <field field_ref="qsr_io_cea"   /> 
    82      <field field_ref="qns_io_cea"   /> 
    83      <field field_ref="snowpre"      /> 
     71     <field field_ref="ice_pres"   /> 
     72     <field field_ref="snowthic_cea" name="snd" /> 
     73     <field field_ref="icethic_cea"  name="sit" /> 
     74     <field field_ref="iceprod_cea"  name="sip" /> 
     75     <field field_ref="ist_ipa"    /> 
     76     <field field_ref="ioceflxb"   /> 
     77     <field field_ref="uice_ipa"   /> 
     78     <field field_ref="vice_ipa"   /> 
     79     <field field_ref="utau_ice"   /> 
     80     <field field_ref="vtau_ice"   /> 
     81     <field field_ref="qsr_io_cea" /> 
     82     <field field_ref="qns_io_cea" /> 
     83     <field field_ref="snowpre"    /> 
    8484   </file> 
    8585 
    8686 
    8787   <file id="file6" name_suffix="_ptrc_T" description="sms variables" > 
    88           <field field_ref="CFC11"      /> 
    89           <field field_ref="C14B" /> 
     88          <field field_ref="CFC11" /> 
     89          <field field_ref="C14B"  /> 
    9090   </file> 
    9191    
    9292   <file id="file7" name_suffix="_diad_T" description="additional diagnostics" > 
    93           <field field_ref="qtrCFC11"     /> 
    94           <field field_ref="qintCFC11"     /> 
    95           <field field_ref="qtrC14b"     /> 
    96           <field field_ref="qintC14b"     /> 
    97           <field field_ref="fdecay"     /> 
     93          <field field_ref="qtrCFC11"  /> 
     94          <field field_ref="qintCFC11" /> 
     95          <field field_ref="qtrC14b"   /> 
     96          <field field_ref="qintC14b"  /> 
     97          <field field_ref="fdecay"    /> 
    9898   </file> 
    9999 
    … …  
    120120     
    121121   <axis_definition>   
    122       <axis id="deptht" long_name="Vertical T levels" unit="m" positive="down" /> 
    123       <axis id="depthu" long_name="Vertical U levels" unit="m" positive="down" /> 
    124       <axis id="depthv" long_name="Vertical V levels" unit="m" positive="down" /> 
    125       <axis id="depthw" long_name="Vertical W levels" unit="m" positive="down" /> 
    126       <axis id="nfloat" long_name="Float number"      unit="-"  /> 
    127       <axis id="icbcla" long_name="Iceberg class"     unit="-"  /> 
     122      <axis id="deptht"  long_name="Vertical T levels"  unit="m" positive="down" /> 
     123      <axis id="depthu"  long_name="Vertical U levels"  unit="m" positive="down" /> 
     124      <axis id="depthv"  long_name="Vertical V levels"  unit="m" positive="down" /> 
     125      <axis id="depthw"  long_name="Vertical W levels"  unit="m" positive="down" /> 
     126      <axis id="nfloat"  long_name="Float number"       unit="1"                 /> 
     127      <axis id="icbcla"  long_name="Iceberg class"      unit="1"                 /> 
     128      <axis id="ncatice" long_name="Ice category"       unit="1"                 /> 
     129      <axis id="iax_20C" long_name="20 degC isotherm"   unit="degC"              /> 
     130      <axis id="iax_28C" long_name="28 degC isotherm"   unit="degC"              /> 
    128131   </axis_definition>  
    129132     

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM_CFC_C14b/EXP00/iodef.xml_cfc

    r3567 r6225  
    11<?xml version="1.0"?> 
     2 
     3<!-- WARNING: THIS XML FILE IS FOR THE DEPRECATED XMLIO SERVER: IT WILL NOT WORK WITH XIOS! --> 
     4 
    25<simulation>  
    36   

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM_CFC_C14b/EXP00/namelist_cfg

    r4370 r6225  
    3131&namzgr        !   vertical coordinate 
    3232!----------------------------------------------------------------------- 
     33   ln_zps      = .true.    !  z-coordinate - partial steps 
     34   ln_linssh   = .true.    !  linear free surface 
    3335/ 
    3436!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    104106/ 
    105107!----------------------------------------------------------------------- 
    106 &namsbc_cpl    !   coupled ocean/atmosphere model                       ("key_coupled") 
     108&namsbc_cpl    !   coupled ocean/atmosphere model                       ("key_oasis3") 
    107109!----------------------------------------------------------------------- 
    108110/ 
    … …  
    132134/ 
    133135!----------------------------------------------------------------------- 
    134 &namcla        !   cross land advection 
    135 !----------------------------------------------------------------------- 
    136 / 
    137 !----------------------------------------------------------------------- 
    138 &namobc        !   open boundaries parameters                           ("key_obc") 
    139 !----------------------------------------------------------------------- 
    140 / 
    141 !----------------------------------------------------------------------- 
    142136&namagrif      !  AGRIF zoom                                            ("key_agrif") 
    143137!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    164158/ 
    165159!----------------------------------------------------------------------- 
    166 &nambbc        !   bottom temperature boundary condition 
     160&nambbc        !   bottom temperature boundary condition                (default: NO) 
    167161!-----------------------------------------------------------------------  
     162   ln_trabbc   = .true.    !  Apply a geothermal heating at the ocean bottom 
    168163/ 
    169164!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    176171/ 
    177172!----------------------------------------------------------------------- 
    178 &namtra_adv    !   advection scheme for tracer  
    179 !-----------------------------------------------------------------------      
     173&namtra_adv    !   advection scheme for tracer 
     174!----------------------------------------------------------------------- 
     175   ln_traadv_fct =  .true.    !  FCT scheme 
     176      nn_fct_h   =  2               !  =2/4, horizontal 2nd / 4th order  
     177      nn_fct_v   =  2               !  =2/4, vertical   2nd / COMPACT 4th order  
     178      nn_fct_zts =  0               !  >=1,  2nd order FCT scheme with vertical sub-timestepping 
     179      !                             !        (number of sub-timestep = nn_fct_zts) 
    180180/ 
    181181!---------------------------------------------------------------------------------- 
    182182&namtra_ldf    !   lateral diffusion scheme for tracers 
    183183!---------------------------------------------------------------------------------- 
     184   !                       !  Operator type: 
     185   !                           !  no diffusion: set ln_traldf_lap=..._blp=F  
     186   ln_traldf_lap   =  .true.   !    laplacian operator 
     187   ln_traldf_blp   =  .false.  !  bilaplacian operator 
     188   !                       !  Direction of action: 
     189   ln_traldf_lev   =  .false.  !  iso-level 
     190   ln_traldf_hor   =  .false.  !  horizontal (geopotential) 
     191   ln_traldf_iso   =  .true.   !  iso-neutral (standard operator) 
     192   ln_traldf_triad =  .false.  !  iso-neutral (triad    operator) 
     193   ! 
     194   !                       !  iso-neutral options:         
     195   ln_traldf_msc   =  .true.   !  Method of Stabilizing Correction (both operators) 
     196   rn_slpmax       =   0.01    !  slope limit                      (both operators) 
     197   ln_triad_iso    =  .false.  !  pure horizontal mixing in ML              (triad only) 
     198   rn_sw_triad     =  1        !  =1 switching triad ; =0 all 4 triads used (triad only) 
     199   ln_botmix_triad =  .false.  !  lateral mixing on bottom                  (triad only) 
     200   ! 
     201   !                       !  Coefficients: 
     202   nn_aht_ijk_t    = 20        !  space/time variation of eddy coef 
     203   !                                !   =-20 (=-30)    read in eddy_diffusivity_2D.nc (..._3D.nc) file 
     204   !                                !   =  0           constant  
     205   !                                !   = 10 F(k)      =ldf_c1d  
     206   !                                !   = 20 F(i,j)    =ldf_c2d  
     207   !                                !   = 21 F(i,j,t)  =Treguier et al. JPO 1997 formulation 
     208   !                                !   = 30 F(i,j,k)  =ldf_c2d * ldf_c1d 
     209   !                                !   = 31 F(i,j,k,t)=F(local velocity and grid-spacing) 
     210   rn_aht_0        = 2000.     !  lateral eddy diffusivity   (lap. operator) [m2/s] 
     211   rn_bht_0        = 1.e+12    !  lateral eddy diffusivity (bilap. operator) [m4/s] 
     212/ 
     213!---------------------------------------------------------------------------------- 
     214&namtra_ldfeiv !   eddy induced velocity param. 
     215!---------------------------------------------------------------------------------- 
     216   ln_ldfeiv     =.true.    ! use eddy induced velocity parameterization 
     217   ln_ldfeiv_dia =.false.   ! diagnose eiv stream function and velocities 
     218   rn_aeiv_0     = 2000.    ! eddy induced velocity coefficient   [m2/s] 
     219   nn_aei_ijk_t  = 21       ! space/time variation of the eiv coeficient 
     220   !                                !   =-20 (=-30)    read in eddy_induced_velocity_2D.nc (..._3D.nc) file 
     221   !                                !   =  0           constant  
     222   !                                !   = 10 F(k)      =ldf_c1d  
     223   !                                !   = 20 F(i,j)    =ldf_c2d  
     224   !                                !   = 21 F(i,j,t)  =Treguier et al. JPO 1997 formulation 
     225   !                                !   = 30 F(i,j,k)  =ldf_c2d + ldf_c1d 
    184226/ 
    185227!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    188230/ 
    189231!----------------------------------------------------------------------- 
     232&namtra_adv_mle !  mixed layer eddy parametrisation (Fox-Kemper param) 
     233!----------------------------------------------------------------------- 
     234/ 
     235!----------------------------------------------------------------------- 
    190236&namdyn_adv    !   formulation of the momentum advection 
    191237!----------------------------------------------------------------------- 
    192238/   
    193239!----------------------------------------------------------------------- 
    194 &namtra_adv_mle !  mixed layer eddy parametrisation (Fox-Kemper param) 
    195 !----------------------------------------------------------------------- 
    196 / 
    197 !----------------------------------------------------------------------- 
    198240&namdyn_vor    !   option of physics/algorithm (not control by CPP keys) 
    199241!----------------------------------------------------------------------- 
     242   ln_dynvor_ene = .false. !  enstrophy conserving scheme 
     243   ln_dynvor_ens = .false. !  energy conserving scheme 
     244   ln_dynvor_mix = .false. !  mixed scheme 
     245   ln_dynvor_een = .true.  !  energy & enstrophy scheme 
     246      nn_een_e3f = 1             !  e3f = masked averaging of e3t divided by 4 (=0) or by the sum of mask (=1) 
    200247/ 
    201248!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    209256&namdyn_ldf    !   lateral diffusion on momentum 
    210257!-----------------------------------------------------------------------       
     258   !                       !  Type of the operator : 
     259   !                           !  no diffusion: set ln_dynldf_lap=..._blp=F  
     260   ln_dynldf_lap =  .true.     !    laplacian operator 
     261   ln_dynldf_blp =  .false.    !  bilaplacian operator 
     262   !                       !  Direction of action  : 
     263   ln_dynldf_lev =  .true.     !  iso-level 
     264   ln_dynldf_hor =  .false.    !  horizontal (geopotential) 
     265   ln_dynldf_iso =  .false.    !  iso-neutral 
     266   !                       !  Coefficient 
     267   nn_ahm_ijk_t  = -30         !  space/time variation of eddy coef 
     268   !                                !  =-30  read in eddy_viscosity_3D.nc file 
     269   !                                !  =-20  read in eddy_viscosity_2D.nc file 
     270   !                                !  =  0  constant  
     271   !                                !  = 10  F(k)=c1d 
     272   !                                !  = 20  F(i,j)=F(grid spacing)=c2d 
     273   !                                !  = 30  F(i,j,k)=c2d*c1d 
     274   !                                !  = 31  F(i,j,k)=F(grid spacing and local velocity) 
     275   rn_ahm_0      =  40000.     !  horizontal laplacian eddy viscosity   [m2/s] 
     276   rn_ahm_b      =      0.     !  background eddy viscosity for ldf_iso [m2/s] 
     277   rn_bhm_0      = 1.e+12      !  horizontal bilaplacian eddy viscosity [m4/s] 
    211278/ 
    212279!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    221288&namzdf_tke    !   turbulent eddy kinetic dependent vertical diffusion  ("key_zdftke") 
    222289!----------------------------------------------------------------------- 
    223 / 
    224 !------------------------------------------------------------------------ 
    225 &namzdf_kpp    !   K-Profile Parameterization dependent vertical mixing  ("key_zdfkpp", and optionally: 
    226 !------------------------------------------------------------------------ "key_kppcustom" or "key_kpplktb") 
    227290/ 
    228291!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    291354!----------------------------------------------------------------------- 
    292355/ 
    293 !----------------------------------------------------------------------- 
    294 &namdyn_nept  !   Neptune effect (simplified: lateral and vertical diffusions removed) 
    295 !----------------------------------------------------------------------- 
    296 / 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM_CFC_C14b/EXP00/namelist_top_cfg

    r4340 r6225  
    2424&namtrc_adv    !   advection scheme for passive tracer  
    2525!-----------------------------------------------------------------------    
    26    ln_trcadv_tvd     =  .true.   !  TVD scheme 
    27    ln_trcadv_muscl   =  .false.  !  MUSCL scheme 
     26   ln_trcadv_fct =  .true.   !  FCT scheme 
     27      nn_fct_h   =  2               !  =2/4, horizontal 2nd / 4th order  
     28      nn_fct_v   =  2               !  =2/4, vertical   2nd / COMPACT 4th order  
     29      nn_fct_zts =  0               !  >=1,  2nd order FCT scheme with vertical sub-timestepping 
     30      !                             !        (number of sub-timestep = nn_fct_zts) 
    2831/ 
    2932!----------------------------------------------------------------------- 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM_CFC_C14b/cpp_ORCA2_LIM_CFC_C14b.fcm

    r4523 r6225  
    1 bld::tool::fppkeys key_trabbl key_lim2 key_dynspg_flt key_diaeiv key_ldfslp key_traldf_c2d key_traldf_eiv key_dynldf_c3d key_zdftke key_zdfddm key_zdftmx key_top key_cfc key_c14b key_iomput key_mpp_mpi 
     1bld::tool::fppkeys key_trabbl key_lim2 key_zdftke key_zdfddm key_zdftmx key_top key_cfc key_c14b key_iomput key_mpp_mpi 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM_PISCES/EXP00/iodef.xml

    r4696 r6225  
    3434 
    3535   <file id="file1" name_suffix="_grid_T" description="ocean T grid variables" > 
    36      <field field_ref="sst"          name="tos"      long_name="sea_surface_temperature"                       /> 
    37      <field field_ref="sss"          name="sos"      long_name="sea_surface_salinity"                          /> 
    38      <field field_ref="ssh"          name="zos"      long_name="sea_surface_height_above_geoid"                /> 
     36     <field field_ref="sst"          name="tos" /> 
     37     <field field_ref="sss"          name="sos" /> 
     38     <field field_ref="ssh"          name="zos" /> 
    3939   </file> 
    4040 
    4141   <file id="file2" name_suffix="_grid_U" description="ocean U grid variables" > 
    42      <field field_ref="suoce"        name="uos"     long_name="sea_surface_x_velocity"    /> 
     42     <field field_ref="ssu"          name="uos" /> 
    4343   </file> 
    4444    
    4545   <file id="file3" name_suffix="_grid_V" description="ocean V grid variables" > 
    46      <field field_ref="svoce"        name="vos"     long_name="sea_surface_y_velocity"    /> 
    47    </file> 
    48     
     46     <field field_ref="ssv"          name="vos" /> 
     47   </file> 
     48 
     49        <file id="file4" name_suffix="_bioscalar" description="pisces sms variables" > 
     50          <field field_ref="tdenit"   name="tdenit"   unit="TgN/yr" operation="instant" > tdenit * 14. * 86400. * 365. / 1e12 </field> 
     51          <field field_ref="tnfix"    name="tnfix"    unit="TgN/yr" operation="instant" > tnfix * 14. * 86400. * 365. / 1e12 </field> 
     52          <field field_ref="tcflx"    name="tcflx"    unit="PgC/yr" operation="instant" > tcflx * -1. * 12. * 86400. * 365. / 1e15 </field> 
     53          <field field_ref="tcflxcum" name="tcflxcum" unit="PgC"    operation="instant" > tcflxcum * -1. * 12. / 1e15 </field> 
     54          <field field_ref="tcexp"    name="tcexp"    unit="PgC/yr" operation="instant" > tcexp * 12. * 86400. * 365. / 1e15 </field> 
     55          <field field_ref="tintpp"   name="tintpp"   unit="PgC/yr" operation="instant" > tintpp * 12. * 86400. * 365. / 1e15 </field> 
     56          <field field_ref="pno3tot"  name="pno3tot"  unit="umolN"  > pno3tot * 16. / 122. * 1e6 </field> 
     57          <field field_ref="ppo4tot"  name="ppo4tot"  unit="umolP"  > ppo4tot * 1. / 122. * 1e6 </field> 
     58          <field field_ref="psiltot"  name="psiltot"  unit="umolC"  > psiltot * 1e6  </field> 
     59          <field field_ref="palktot"  name="palktot"  unit="umolC"  > palktot * 1e6  </field> 
     60        <field field_ref="pfertot"  name="pfertot"  unit="nmolFe" > pfertot * 1e9  </field> 
     61                                                                                                                             </file> 
    4962      </file_group> 
    5063 
    … …  
    5366      <file_group id="5d" output_freq="5d"  output_level="10" enabled=".TRUE.">  <!-- 5d files -->    
    5467 
    55    <file id="file4" name_suffix="_grid_T" description="ocean T grid variables" > 
    56      <field field_ref="toce"         name="thetao"   long_name="sea_water_potential_temperature"               /> 
    57      <field field_ref="soce"         name="so"       long_name="sea_water_salinity"                            /> 
    58      <field field_ref="sst"          name="tos"      long_name="sea_surface_temperature"                       /> 
    59      <field field_ref="sst2"         name="tossq"    long_name="square_of_sea_surface_temperature"             /> 
    60      <field field_ref="sss"          name="sos"      long_name="sea_surface_salinity"                          /> 
    61      <field field_ref="ssh"          name="zos"      long_name="sea_surface_height_above_geoid"                /> 
    62      <field field_ref="ssh2"         name="zossq"    long_name="square_of_sea_surface_height_above_geoid"      /> 
    63      <field field_ref="empmr"        name="wfo"      long_name="water_flux_into_sea_water"                     /> 
    64      <field field_ref="qsr"          name="rsntds"   long_name="surface_net_downward_shortwave_flux"           /> 
    65      <field field_ref="qt"           name="tohfls"   long_name="surface_net_downward_total_heat_flux"          /> 
    66      <field field_ref="taum"         /> 
    67      <field field_ref="mldkz5"       /> 
    68      <field field_ref="mldr10_1"     /> 
    69            <!-- variables available with MLE 
    70           <field field_ref="Lf_NHpf"    name="Lf_NHpf"  long_name="MLE:_Lf=NH/f"     /> 
    71       --> 
    72    </file> 
    73     
    74    <file id="file5" name_suffix="_grid_U" description="ocean U grid variables" > 
    75      <field field_ref="uoce"         name="uo"      long_name="sea_water_x_velocity"      /> 
    76      <field field_ref="suoce"        name="uos"     long_name="sea_surface_x_velocity"    /> 
    77      <field field_ref="utau"         name="tauuo"   long_name="surface_downward_x_stress" /> 
    78           <!-- variables available with MLE 
    79           <field field_ref="psiu_mle"     name="psiu_mle"  long_name="MLE_streamfunction_along_i-axis" /> 
    80      --> 
    81    </file> 
    82     
    83    <file id="file6" name_suffix="_grid_V" description="ocean V grid variables" > 
    84      <field field_ref="voce"         name="vo"      long_name="sea_water_y_velocity"      /> 
    85      <field field_ref="svoce"        name="vos"     long_name="sea_surface_y_velocity"    /> 
    86      <field field_ref="vtau"         name="tauvo"   long_name="surface_downward_y_stress" /> 
    87           <!-- variables available with MLE 
    88           <field field_ref="psiv_mle"     name="psiv_mle"  long_name="MLE_streamfunction_along_j-axis" /> 
    89      --> 
    90    </file> 
    91     
    92    <file id="file7" name_suffix="_grid_W" description="ocean W grid variables" > 
    93      <field field_ref="woce"         name="wo"      long_name="ocean vertical velocity"         /> 
    94      <field field_ref="avt"          name="difvho"  long_name="ocean_vertical_heat_diffusivity" /> 
    95    </file> 
    96     
    97    <file id="file8" name_suffix="_icemod" description="ice variables" > 
    98      <field field_ref="ice_pres"                     /> 
    99      <field field_ref="snowthic_cea" name="snd"     long_name="surface_snow_thickness"   /> 
    100      <field field_ref="icethic_cea"  name="sit"     long_name="sea_ice_thickness"        /> 
    101      <field field_ref="iceprod_cea"  name="sip"     long_name="sea_ice_thickness"        /> 
    102      <field field_ref="ist_ipa"      /> 
    103      <field field_ref="uice_ipa"     /> 
    104      <field field_ref="vice_ipa"     /> 
    105      <field field_ref="utau_ice"     /> 
    106      <field field_ref="vtau_ice"     /> 
    107      <field field_ref="qsr_io_cea"   /> 
    108      <field field_ref="qns_io_cea"   /> 
    109      <field field_ref="snowpre"      /> 
     68   <file id="file5" name_suffix="_grid_T" description="ocean T grid variables" > 
     69     <field field_ref="toce"         name="thetao" /> 
     70     <field field_ref="soce"         name="so"     /> 
     71     <field field_ref="sst"          name="tos"    /> 
     72     <field field_ref="sst2"         name="tossq"  /> 
     73     <field field_ref="sss"          name="sos"    /> 
     74     <field field_ref="ssh"          name="zos"    /> 
     75     <field field_ref="ssh2"         name="zossq"  /> 
     76     <field field_ref="empmr"        name="wfo"    /> 
     77     <field field_ref="qsr"          name="rsntds" /> 
     78     <field field_ref="qt"           name="tohfls" /> 
     79     <field field_ref="taum"     /> 
     80     <field field_ref="mldkz5"   /> 
     81     <field field_ref="mldr10_1" /> 
     82   </file> 
     83    
     84   <file id="file6" name_suffix="_grid_U" description="ocean U grid variables" > 
     85     <field field_ref="uoce"         name="uo"     /> 
     86     <field field_ref="ssu"          name="uos"    /> 
     87     <field field_ref="utau"         name="tauuo"  /> 
     88   </file> 
     89    
     90   <file id="file7" name_suffix="_grid_V" description="ocean V grid variables" > 
     91     <field field_ref="voce"         name="vo"     /> 
     92     <field field_ref="ssv"          name="vos"    /> 
     93     <field field_ref="vtau"         name="tauvo"  /> 
     94   </file> 
     95    
     96   <file id="file8" name_suffix="_grid_W" description="ocean W grid variables" > 
     97     <field field_ref="woce"         name="wo"     /> 
     98     <field field_ref="avt"          name="difvho" /> 
     99   </file> 
     100    
     101   <file id="file9" name_suffix="_icemod" description="ice variables" > 
     102     <field field_ref="ice_pres"   /> 
     103     <field field_ref="snowthic_cea" name="snd"    /> 
     104     <field field_ref="icethic_cea"  name="sit"    /> 
     105     <field field_ref="iceprod_cea"  name="sip"    /> 
     106     <field field_ref="ist_ipa"    /> 
     107     <field field_ref="uice_ipa"   /> 
     108     <field field_ref="vice_ipa"   /> 
     109     <field field_ref="utau_ice"   /> 
     110     <field field_ref="vtau_ice"   /> 
     111     <field field_ref="qsr_io_cea" /> 
     112     <field field_ref="qns_io_cea" /> 
     113     <field field_ref="snowpre"    /> 
    110114   </file> 
    111115    
    … …  
    114118      <file_group id="1m" output_freq="1mo" output_level="10" enabled=".TRUE."> <!-- real monthly files --> 
    115119 
    116    <file id="file9" name_suffix="_ptrc_T" description="pisces sms variables" > 
     120   <file id="file10" name_suffix="_ptrc_T" description="pisces sms variables" > 
    117121          <field field_ref="DIC"      /> 
    118122          <field field_ref="Alkalini" /> 
    … …  
    126130   </file> 
    127131    
    128    <file id="file10" name_suffix="_diad_T" description="additional pisces diagnostics" > 
     132   <file id="file11" name_suffix="_diad_T" description="additional pisces diagnostics" > 
    129133          <field field_ref="Cflx"     /> 
    130134          <field field_ref="Dpco2"    /> 
    … …  
    140144      <file_group id="1y"  output_freq="1y" output_level="10" enabled=".TRUE."> <!-- real yearly files --> 
    141145 
    142    <file id="file11" name_suffix="_ptrc_T" description="pisces sms variables" > 
     146   <file id="file12" name_suffix="_ptrc_T" description="pisces sms variables" > 
    143147          <field field_ref="DIC"      /> 
    144148          <field field_ref="Alkalini" /> 
    … …  
    167171   </file> 
    168172 
    169    <file id="file12" name_suffix="_diad_T" description="additional pisces diagnostics" > 
     173   <file id="file13" name_suffix="_diad_T" description="additional pisces diagnostics" > 
    170174          <field field_ref="PH"       /> 
    171175          <field field_ref="CO3"      /> 
    … …  
    233237     
    234238   <axis_definition>   
    235       <axis id="deptht" long_name="Vertical T levels" unit="m" positive="down" /> 
    236       <axis id="depthu" long_name="Vertical U levels" unit="m" positive="down" /> 
    237       <axis id="depthv" long_name="Vertical V levels" unit="m" positive="down" /> 
    238       <axis id="depthw" long_name="Vertical W levels" unit="m" positive="down" /> 
    239       <axis id="nfloat" long_name="Float number"      unit="-"  /> 
    240       <axis id="icbcla" long_name="Iceberg class"     unit="-"  /> 
     239      <axis id="deptht"  long_name="Vertical T levels"  unit="m" positive="down" /> 
     240      <axis id="depthu"  long_name="Vertical U levels"  unit="m" positive="down" /> 
     241      <axis id="depthv"  long_name="Vertical V levels"  unit="m" positive="down" /> 
     242      <axis id="depthw"  long_name="Vertical W levels"  unit="m" positive="down" /> 
     243      <axis id="nfloat"  long_name="Float number"       unit="1"                 /> 
     244      <axis id="icbcla"  long_name="Iceberg class"      unit="1"                 /> 
     245      <axis id="ncatice" long_name="Ice category"       unit="1"                 /> 
     246      <axis id="iax_20C" long_name="20 degC isotherm"   unit="degC"              /> 
     247      <axis id="iax_28C" long_name="28 degC isotherm"   unit="degC"              /> 
    241248   </axis_definition>  
    242249     

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM_PISCES/EXP00/namelist_cfg

    r4370 r6225  
    2424&namzgr        !   vertical coordinate 
    2525!----------------------------------------------------------------------- 
     26   ln_zps      = .true.    !  z-coordinate - partial steps 
     27   ln_linssh   = .true.    !  linear free surface 
    2628/ 
    2729!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    4850/ 
    4951!----------------------------------------------------------------------- 
    50 &namsplit      !   time splitting parameters                            ("key_dynspg_ts") 
    51 !----------------------------------------------------------------------- 
    52 / 
    53 !----------------------------------------------------------------------- 
    5452&namcrs        !   Grid coarsening for dynamics output and/or 
    5553               !   passive tracer coarsened online simulations 
    … …  
    9391/ 
    9492!----------------------------------------------------------------------- 
    95 &namcla        !   cross land advection 
    96 !----------------------------------------------------------------------- 
    97 / 
    98 !----------------------------------------------------------------------- 
    9993&nambfr        !   bottom friction 
    10094!----------------------------------------------------------------------- 
    10195/ 
    10296!----------------------------------------------------------------------- 
    103 &nambbc        !   bottom temperature boundary condition 
    104 !----------------------------------------------------------------------- 
     97&nambbc        !   bottom temperature boundary condition                (default: NO) 
     98!----------------------------------------------------------------------- 
     99   ln_trabbc   = .true.    !  Apply a geothermal heating at the ocean bottom 
    105100/ 
    106101!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    115110&namtra_adv    !   advection scheme for tracer 
    116111!----------------------------------------------------------------------- 
     112   ln_traadv_fct =  .true.    !  FCT scheme 
     113      nn_fct_h   =  2               !  =2/4, horizontal 2nd / 4th order  
     114      nn_fct_v   =  2               !  =2/4, vertical   2nd / COMPACT 4th order  
     115      nn_fct_zts =  0               !  > 1 , 2nd order FCT scheme with vertical sub-timestepping 
     116      !                             !        (number of sub-timestep = nn_fct_zts) 
    117117/ 
    118118!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    120120!----------------------------------------------------------------------- 
    121121/ 
    122 !----------------------------------------------------------------------- 
    123 &namtra_adv_mle !  mixed layer eddy parametrisation (Fox-Kemper param) 
    124 !----------------------------------------------------------------------- 
    125 / 
    126122!---------------------------------------------------------------------------------- 
    127123&namtra_ldf    !   lateral diffusion scheme for tracers 
    128124!---------------------------------------------------------------------------------- 
     125   !                       !  Operator type: 
     126   ln_traldf_lap   =  .true.   !    laplacian operator 
     127   ln_traldf_blp   =  .false.  !  bilaplacian operator 
     128   !                       !  Direction of action: 
     129   ln_traldf_lev   =  .false.  !  iso-level 
     130   ln_traldf_hor   =  .false.  !  horizontal (geopotential) 
     131   ln_traldf_iso   =  .true.   !  iso-neutral (standard operator) 
     132   ln_traldf_triad =  .false.  !  iso-neutral (triad    operator) 
     133   ! 
     134   !                       !  iso-neutral options:         
     135   ln_traldf_msc   =  .true.   !  Method of Stabilizing Correction (both operators) 
     136   rn_slpmax       =   0.01    !  slope limit                      (both operators) 
     137   ln_triad_iso    =  .false.  !  pure horizontal mixing in ML              (triad only) 
     138   rn_sw_triad     =  1        !  =1 switching triad ; =0 all 4 triads used (triad only) 
     139   ln_botmix_triad =  .false.  !  lateral mixing on bottom                  (triad only) 
     140   ! 
     141   !                       !  Coefficients: 
     142   nn_aht_ijk_t    = 20        !  space/time variation of eddy coef 
     143   !                                !   =-20 (=-30)    read in eddy_diffusivity_2D.nc (..._3D.nc) file 
     144   !                                !   =  0           constant 
     145   !                                !   = 10 F(k)      =ldf_c1d 
     146   !                                !   = 20 F(i,j)    =ldf_c2d 
     147   !                                !   = 21 F(i,j,t)  =Treguier et al. JPO 1997 formulation 
     148   !                                !   = 30 F(i,j,k)  =ldf_c2d + ldf_c1d 
     149   !                                !   = 31 F(i,j,k,t)=F(local velocity) 
     150   rn_aht_0        = 2000.     !  lateral eddy diffusivity   (lap. operator) [m2/s] 
     151   rn_bht_0        = 1.e+12    !  lateral eddy diffusivity (bilap. operator) [m4/s] 
     152/ 
     153!---------------------------------------------------------------------------------- 
     154&namtra_ldfeiv !   eddy induced velocity param. 
     155!---------------------------------------------------------------------------------- 
     156   ln_ldfeiv     =.true.   ! use eddy induced velocity parameterization 
     157   ln_ldfeiv_dia =.true.   ! diagnose eiv stream function and velocities 
     158   rn_aeiv_0     = 2000.   ! eddy induced velocity coefficient   [m2/s] 
     159   nn_aei_ijk_t  = 21      ! space/time variation of the eiv coeficient 
     160   !                                !   =-20 (=-30)    read in eddy_induced_velocity_2D.nc (..._3D.nc) file 
     161   !                                !   =  0           constant 
     162   !                                !   = 10 F(k)      =ldf_c1d 
     163   !                                !   = 20 F(i,j)    =ldf_c2d 
     164   !                                !   = 21 F(i,j,t)  =Treguier et al. JPO 1997 formulation 
     165   !                                !   = 30 F(i,j,k)  =ldf_c2d + ldf_c1d 
    129166/ 
    130167!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    139176&namdyn_vor    !   option of physics/algorithm (not control by CPP keys) 
    140177!----------------------------------------------------------------------- 
     178   ln_dynvor_ene = .false. !  enstrophy conserving scheme 
     179   ln_dynvor_ens = .false. !  energy conserving scheme 
     180   ln_dynvor_mix = .false. !  mixed scheme 
     181   ln_dynvor_een = .true.  !  energy & enstrophy scheme 
     182      nn_een_e3f = 0             !  e3f = masked averaging of e3t divided by 4 (=0) or by the sum of mask (=1) 
    141183/ 
    142184!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    145187/ 
    146188!----------------------------------------------------------------------- 
     189&namdyn_spg    !   surface pressure gradient 
     190!----------------------------------------------------------------------- 
     191   ln_dynspg_ts  = .true.  !  split-explicit free surface 
     192/ 
     193!----------------------------------------------------------------------- 
    147194&namdyn_ldf    !   lateral diffusion on momentum 
    148195!----------------------------------------------------------------------- 
     196   !                       !  Type of the operator : 
     197   !                           !  no diffusion: set ln_dynldf_lap=..._blp=F  
     198   ln_dynldf_lap =  .true.     !    laplacian operator 
     199   ln_dynldf_blp =  .false.    !  bilaplacian operator 
     200   !                       !  Direction of action  : 
     201   ln_dynldf_lev =  .true.     !  iso-level 
     202   ln_dynldf_hor =  .false.    !  horizontal (geopotential) 
     203   ln_dynldf_iso =  .false.    !  iso-neutral 
     204   !                       !  Coefficient 
     205   nn_ahm_ijk_t  = -30         !  space/time variation of eddy coef 
     206   !                                !  =-30  read in eddy_viscosity_3D.nc file 
     207   !                                !  =-20  read in eddy_viscosity_2D.nc file 
     208   !                                !  =  0  constant  
     209   !                                !  = 10  F(k)=c1d 
     210   !                                !  = 20  F(i,j)=F(grid spacing)=c2d 
     211   !                                !  = 30  F(i,j,k)=c2d*c1d 
     212   !                                !  = 31  F(i,j,k)=F(grid spacing and local velocity) 
     213   rn_ahm_0      =  40000.     !  horizontal laplacian eddy viscosity   [m2/s] 
     214   rn_ahm_b      =      0.     !  background eddy viscosity for ldf_iso [m2/s] 
     215   rn_bhm_0      = 1.e+12      !  horizontal bilaplacian eddy viscosity [m4/s] 
    149216/ 
    150217!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    165232/ 
    166233!----------------------------------------------------------------------- 
    167 &namsol        !   elliptic solver / island / free surface 
    168 !----------------------------------------------------------------------- 
    169 / 
    170 !----------------------------------------------------------------------- 
    171234&nammpp        !   Massively Parallel Processing                        ("key_mpp_mpi) 
    172235!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    184247!----------------------------------------------------------------------- 
    185248/ 
    186 !----------------------------------------------------------------------- 
    187 &namdyn_nept  !   Neptune effect (simplified: lateral and vertical diffusions removed) 
    188 !----------------------------------------------------------------------- 
    189 / 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM_PISCES/EXP00/namelist_top_cfg

    r4340 r6225  
    55&namtrc_run     !   run information 
    66!----------------------------------------------------------------------- 
    7    ln_top_euler  = .true.    !  use Euler time-stepping for TOP 
    87/ 
    98!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    6362&namtrc_adv    !   advection scheme for passive tracer  
    6463!----------------------------------------------------------------------- 
    65    ln_trcadv_tvd     =  .false.  !  TVD scheme 
    66    ln_trcadv_muscl   =  .true.   !  MUSCL scheme 
     64   ln_trcadv_mus =  .true.  !  MUSCL scheme 
     65      ln_mus_ups =  .false.         !  use upstream scheme near river mouths 
    6766/ 
    6867!----------------------------------------------------------------------- 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM_PISCES/cpp_ORCA2_LIM_PISCES.fcm

    r4523 r6225  
    1 bld::tool::fppkeys key_trabbl key_lim2 key_dynspg_flt key_diaeiv key_ldfslp key_traldf_c2d key_traldf_eiv key_dynldf_c3d key_zdftke key_zdfddm key_zdftmx key_top key_pisces key_iomput key_mpp_mpi 
     1bld::tool::fppkeys key_trabbl key_lim2 key_zdftke key_zdfddm key_zdftmx key_top key_pisces key_mpp_mpi key_iomput 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_OFF_PISCES/EXP00/iodef.xml

    r4153 r6225  
    3030      <file_group id="6h" output_freq="6h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 6h files --> 
    3131      
    32       <file_group id="1d" output_freq="1d"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1d files --> 
     32      <file_group id="1d" output_freq="1d"  output_level="10" enabled=".TRUE."> <!-- 1d files --> 
     33        <file id="file1" name_suffix="_bioscalar" description="pisces sms variables" > 
     34           <field field_ref="tdenit"   name="tdenit"   unit="TgN/yr" operation="instant" > tdenit * 14. * 86400. * 365. / 1e12 </field> 
     35           <field field_ref="tnfix"    name="tnfix"    unit="TgN/yr" operation="instant" > tnfix * 14. * 86400. * 365. / 1e12 </field> 
     36           <field field_ref="tcflx"    name="tcflx"    unit="PgC/yr" operation="instant" > tcflx * -1. * 12. * 86400. * 365. / 1e15 </field> 
     37           <field field_ref="tcflxcum" name="tcflxcum" unit="PgC"    operation="instant" > tcflxcum * -1. * 12. / 1e15 </field> 
     38           <field field_ref="tcexp"    name="tcexp"    unit="PgC/yr" operation="instant" > tcexp * 12. * 86400. * 365. / 1e15 </field> 
     39           <field field_ref="tintpp"   name="tintpp"   unit="PgC/yr" operation="instant" > tintpp * 12. * 86400. * 365. / 1e15 </field> 
     40           <field field_ref="pno3tot"  name="pno3tot"  unit="umolN"  > pno3tot * 16. / 122. * 1e6 </field> 
     41           <field field_ref="ppo4tot"  name="ppo4tot"  unit="umolP"  > ppo4tot * 1. / 122. * 1e6 </field> 
     42           <field field_ref="psiltot"  name="psiltot"  unit="umolC"  > psiltot * 1e6  </field> 
     43           <field field_ref="palktot"  name="palktot"  unit="umolC"  > palktot * 1e6  </field> 
     44           <field field_ref="pfertot"  name="pfertot"  unit="nmolFe" > pfertot * 1e9  </field> 
     45        </file> 
     46      </file_group> 
     47 
    3348      <file_group id="3d" output_freq="3d"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 3d files -->     
    3449      <file_group id="5d" output_freq="5d"  output_level="10" enabled=".TRUE."/>  <!-- 5d files -->    
    … …  
    3651      <file_group id="1m" output_freq="1mo" output_level="10" enabled=".TRUE."> <!-- real monthly files --> 
    3752 
    38    <file id="file1" name_suffix="_ptrc_T" description="pisces sms variables" > 
     53   <file id="file2" name_suffix="_ptrc_T" description="pisces sms variables" > 
    3954          <field field_ref="DIC"      /> 
    4055          <field field_ref="Alkalini" /> 
    … …  
    4863   </file> 
    4964    
    50    <file id="file2" name_suffix="_diad_T" description="additional pisces diagnostics" > 
     65   <file id="file3" name_suffix="_diad_T" description="additional pisces diagnostics" > 
    5166          <field field_ref="Cflx"     /> 
    5267          <field field_ref="Dpco2"    /> 
    … …  
    6176      <file_group id="1y"  output_freq="1y" output_level="10" enabled=".TRUE."> <!-- real yearly files --> 
    6277 
    63    <file id="file3" name_suffix="_ptrc_T" description="pisces sms variables" > 
     78   <file id="file4" name_suffix="_ptrc_T" description="pisces sms variables" > 
    6479          <field field_ref="DIC"      /> 
    6580          <field field_ref="Alkalini" /> 
    … …  
    88103   </file> 
    89104 
    90    <file id="file4" name_suffix="_diad_T" description="additional pisces diagnostics" > 
     105   <file id="file5" name_suffix="_diad_T" description="additional pisces diagnostics" > 
    91106          <field field_ref="PH"       /> 
    92107          <field field_ref="CO3"      /> 
    … …  
    153168     
    154169   <axis_definition>   
    155       <axis id="deptht" long_name="Vertical T levels" unit="m" positive="down" /> 
    156       <axis id="depthu" long_name="Vertical U levels" unit="m" positive="down" /> 
    157       <axis id="depthv" long_name="Vertical V levels" unit="m" positive="down" /> 
    158       <axis id="depthw" long_name="Vertical W levels" unit="m" positive="down" /> 
    159       <axis id="nfloat" long_name="Float number"      unit="-"  /> 
    160       <axis id="icbcla" long_name="Iceberg class"     unit="-"  /> 
     170      <axis id="deptht"  long_name="Vertical T levels"  unit="m" positive="down" /> 
     171      <axis id="depthu"  long_name="Vertical U levels"  unit="m" positive="down" /> 
     172      <axis id="depthv"  long_name="Vertical V levels"  unit="m" positive="down" /> 
     173      <axis id="depthw"  long_name="Vertical W levels"  unit="m" positive="down" /> 
     174      <axis id="nfloat"  long_name="Float number"       unit="1"                 /> 
     175      <axis id="icbcla"  long_name="Iceberg class"      unit="1"                 /> 
     176      <axis id="ncatice" long_name="Ice category"       unit="1"                 /> 
     177      <axis id="iax_20C" long_name="20 degC isotherm"   unit="degC"              /> 
     178      <axis id="iax_28C" long_name="28 degC isotherm"   unit="degC"              /> 
    161179   </axis_definition>  
    162180     

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_OFF_PISCES/EXP00/namelist_cfg

    r4370 r6225  
    2727&namzgr        !   vertical coordinate 
    2828!----------------------------------------------------------------------- 
     29   ln_zps      = .true.    !  z-coordinate - partial steps 
     30   ln_linssh   = .true.    !  linear free surface 
    2931/ 
    3032!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    3234!----------------------------------------------------------------------- 
    3335   nn_msh      =    1      !  create (=1) a mesh file or not (=0) 
    34    rn_rdt      = 21600.    !  time step for the dynamics (and tracer if nn_acc=0) 
    35    rn_rdtmin   = 21600.          !  minimum time step on tracers (used if nn_acc=1) 
    36    rn_rdtmax   = 21600.          !  maximum time step on tracers (used if nn_acc=1) 
     36   rn_rdt      = 21600.    !  time step for the dynamics  
    3737   jphgr_msh   =       0               !  type of horizontal mesh 
    3838   ppglam0     =  999999.0             !  longitude of first raw and column T-point (jphgr_msh = 1) 
    … …  
    6767!----------------------------------------------------------------------- 
    6868   nn_fsbc     = 1         !  frequency of surface boundary condition computation  
     69   ln_rnf      = .false.   !  runoffs 
     70   ln_traqsr   = .false.   !  Light penetration (T) or not (F) 
    6971/   
    7072!----------------------------------------------------------------------- 
    7173&namtra_qsr    !   penetrative solar radiation 
    7274!----------------------------------------------------------------------- 
    73    ln_traqsr   = .false.   !  Light penetration (T) or not (F) 
    7475/ 
    7576!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    7778!----------------------------------------------------------------------- 
    7879/       
    79  
    80 !----------------------------------------------------------------------- 
    81 &namcla        !   cross land advection 
    82 !----------------------------------------------------------------------- 
    83 / 
    8480!----------------------------------------------------------------------- 
    8581&nambbl        !   bottom boundary layer scheme 
    … …  
    9086!----------------------------------------------------------------------- 
    9187/ 
    92 !----------------------------------------------------------------------- 
    93 &namtra_ldf    !   lateral diffusion scheme for tracer  
    94 !----------------------------------------------------------------------- 
    95    ln_triad_iso     =  .true.  !  griffies operator calculates triads twice => pure lateral mixing in ML (require "key_ldfslp") 
     88!---------------------------------------------------------------------------------- 
     89&namtra_ldf    !   lateral diffusion scheme for tracers 
     90!---------------------------------------------------------------------------------- 
     91   !                       !  Operator type: 
     92   ln_traldf_lap   =  .true.   !    laplacian operator 
     93   ln_traldf_blp   =  .false.  !  bilaplacian operator 
     94   !                       !  Direction of action: 
     95   ln_traldf_lev   =  .false.  !  iso-level 
     96   ln_traldf_hor   =  .false.  !  horizontal (geopotential) 
     97   ln_traldf_iso   =  .true.   !  iso-neutral 
     98   ln_traldf_triad =  .false.  !  iso-neutral using Griffies triads 
     99   ! 
     100   !                       !  iso-neutral options:         
     101   ln_traldf_msc   =  .true.   !  Method of Stabilizing Correction (both operators) 
     102   rn_slpmax       =   0.01    !  slope limit                      (both operators) 
     103   ln_triad_iso    =  .false.  !  pure horizontal mixing in ML     (triad only) 
     104   rn_sw_triad     =  1        !  =1 switching triad ; =0 all 4 triads used (triad only) 
     105   ln_botmix_triad =  .false.  !  lateral mixing on bottom         (triad only) 
     106   ! 
     107   !                       !  Coefficients: 
     108   nn_aht_ijk_t    = 0        !  space/time variation of eddy coef 
     109   !                                !   =-20 (=-30)    read in eddy_diffusivity_2D.nc (..._3D.nc) file 
     110   !                                !   =  0           constant  
     111   !                                !   = 10 F(k)      =ldf_c1d  
     112   !                                !   = 20 F(i,j)    =ldf_c2d  
     113   !                                !   = 21 F(i,j,t)  =Treguier et al. JPO 1997 formulation 
     114   !                                !   = 30 F(i,j,k)  =ldf_c2d + ldf_c1d 
     115   !                                !   = 31 F(i,j,k,t)=F(local velocity) 
     116   rn_aht_0        = 2000.     !  lateral eddy diffusivity   (lap. operator) [m2/s] 
     117   rn_bht_0        = 1.e+12    !  lateral eddy diffusivity (bilap. operator) [m4/s] 
     118/ 
     119!---------------------------------------------------------------------------------- 
     120&namtra_ldfeiv !   eddy induced velocity param. 
     121!---------------------------------------------------------------------------------- 
     122   ln_ldfeiv     =.true.   ! use eddy induced velocity parameterization 
     123   ln_ldfeiv_dia =.false.   ! diagnose eiv stream function and velocities 
     124   rn_aeiv_0     = 2000.   ! eddy induced velocity coefficient   [m2/s] 
     125   nn_aei_ijk_t  = 0      ! space/time variation of the eiv coeficient 
     126   !                                !   =-20 (=-30)    read in eddy_induced_velocity_2D.nc (..._3D.nc) file 
     127   !                                !   =  0           constant 
     128   !                                !   = 10 F(k)      =ldf_c1d 
     129   !                                !   = 20 F(i,j)    =ldf_c2d 
     130   !                                !   = 21 F(i,j,t)  =Treguier et al. JPO 1997 formulation 
     131   !                                !   = 30 F(i,j,k)  =ldf_c2d + ldf_c1d 
    96132/ 
    97133!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    114150   sn_ubl  = 'dyna_grid_U' ,    120            , 'sobblcox' ,  .true.    , .true. ,   'yearly'  , ''       , ''    , '' 
    115151   sn_vbl  = 'dyna_grid_V' ,    120            , 'sobblcoy' ,  .true.    , .true. ,   'yearly'  , ''       , ''    , '' 
    116    sn_ahu  = 'dyna_grid_U' ,    120            , 'vozoahtu' ,  .true.    , .true. ,   'yearly'  , ''       , ''    , '' 
    117    sn_ahv  = 'dyna_grid_V' ,    120            , 'vomeahtv' ,  .true.    , .true. ,   'yearly'  , ''       , ''    , '' 
    118    sn_ahw  = 'dyna_grid_W' ,    120            , 'voveahtz' ,  .true.    , .true. ,   'yearly'  , ''       , ''    , '' 
    119    sn_eiu  = 'dyna_grid_U' ,    120            , 'vozoaeiu' ,  .true.    , .true. ,   'yearly'  , ''       , ''    , '' 
    120    sn_eiv  = 'dyna_grid_V' ,    120            , 'vomeaeiv' ,  .true.    , .true. ,   'yearly'  , ''       , ''    , '' 
    121    sn_eiw  = 'dyna_grid_W' ,    120            , 'soleaeiw' ,  .true.    , .true. ,   'yearly'  , ''       , ''    , '' 
    122152! 
    123153   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the dynamical files 
    124    ln_degrad   =  .false.  !  flag for degradation -                requires ("key_degrad") 
    125154   ln_dynwzv   =  .true.   !  computation of vertical velocity instead of using the one read in file 
    126155   ln_dynbbl   =  .true.   !  bbl coef are in files, so read them - requires ("key_trabbl") 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_OFF_PISCES/EXP00/namelist_top_cfg

    r4340 r6225  
    66!----------------------------------------------------------------------- 
    77   nn_writetrc   =  1460     !  time step frequency for sn_tracer outputs 
    8    ln_top_euler  = .true.    !  use Euler time-stepping for TOP 
    98/ 
    109!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    6665&namtrc_adv    !   advection scheme for passive tracer  
    6766!----------------------------------------------------------------------- 
    68    ln_trcadv_tvd     =  .false.  !  TVD scheme 
    69    ln_trcadv_muscl   =  .true.   !  MUSCL scheme 
     67   ln_trcadv_mus =  .true.  !  MUSCL scheme 
     68      ln_mus_ups =  .false.         !  use upstream scheme near river mouths 
    7069/ 
    7170!----------------------------------------------------------------------- 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_OFF_PISCES/cpp_ORCA2_OFF_PISCES.fcm

    r4523 r6225  
    1 bld::tool::fppkeys key_trabbl key_ldfslp key_traldf_c2d key_traldf_eiv key_top key_offline key_pisces key_iomput key_mpp_mpi 
     1bld::tool::fppkeys key_trabbl key_top key_offline key_pisces key_iomput key_mpp_mpi 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_SAS_LIM/EXP00/iodef.xml

    r4696 r6225  
    3131      <file_group id="1d" output_freq="1d"  output_level="10" enabled=".TRUE."> <!-- 1d files --> 
    3232 
    33  
    3433   <file id="file1" name_suffix="_grid_T" description="ocean T grid variables" > 
    35      <field field_ref="sst"          name="sosstsst"      long_name="sea_surface_temperature"                       /> 
    36      <field field_ref="sss"          name="sosaline"      long_name="sea_surface_salinity"                          /> 
    37      <field field_ref="ssh"          name="sossheig"      long_name="sea_surface_height_above_geoid"                /> 
    38      <field field_ref="empmr"        name="wfo"      long_name="water_flux_into_sea_water"                     /> 
    39      <field field_ref="qsr"          name="rsntds"   long_name="surface_net_downward_shortwave_flux"           /> 
    40      <field field_ref="qt"           name="tohfls"   long_name="surface_net_downward_total_heat_flux"          /> 
    41      <field field_ref="mldr10_1"     /> 
     34     <field field_ref="sst"          name="sosstsst" /> 
     35     <field field_ref="sss"          name="sosaline" /> 
     36     <field field_ref="ssh"          name="sossheig" /> 
     37     <field field_ref="empmr"        name="wfo"      /> 
     38     <field field_ref="qsr"          name="rsntds"   /> 
     39     <field field_ref="qt"           name="tohfls"   /> 
     40     <field field_ref="mldr10_1" /> 
    4241   </file> 
    4342 
    4443   <file id="file2" name_suffix="_grid_U" description="ocean U grid variables" > 
    45      <field field_ref="suoce"        name="suoce"     long_name="sea_surface_x_velocity"    /> 
     44     <field field_ref="ssu"          name="suoce" /> 
    4645   </file> 
    4746    
    4847   <file id="file3" name_suffix="_grid_V" description="ocean V grid variables" > 
    49      <field field_ref="svoce"        name="svoce"     long_name="sea_surface_y_velocity"    /> 
     48     <field field_ref="ssv"          name="svoce" /> 
    5049   </file> 
    5150 
    5251      </file_group> 
     52 
    5353      <file_group id="3d" output_freq="3d"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 3d files -->     
    5454      <file_group id="5d" output_freq="5d"  output_level="10" enabled=".TRUE.">  <!-- 5d files --> 
    5555 
    5656   <file id="file4" name_suffix="_grid_T" description="ocean T grid variables" > 
    57      <field field_ref="sst"          name="sosstsst"      long_name="sea_surface_temperature"                       /> 
    58      <field field_ref="sst2"         name="tossq"    long_name="square_of_sea_surface_temperature"             /> 
    59      <field field_ref="sss"          name="sosaline"      long_name="sea_surface_salinity"                          /> 
    60      <field field_ref="ssh"          name="sossheig"      long_name="sea_surface_height_above_geoid"                /> 
    61      <field field_ref="ssh2"         name="zossq"    long_name="square_of_sea_surface_height_above_geoid"      /> 
    62      <field field_ref="empmr"        name="wfo"      long_name="water_flux_into_sea_water"                     /> 
    63      <field field_ref="qsr"          name="rsntds"   long_name="surface_net_downward_shortwave_flux"           /> 
    64      <field field_ref="qt"           name="tohfls"   long_name="surface_net_downward_total_heat_flux"          /> 
    65      <field field_ref="taum"         /> 
    66      <field field_ref="mldkz5"       /> 
    67      <field field_ref="mldr10_1"     /> 
     57     <field field_ref="sst"          name="sosstsst" /> 
     58     <field field_ref="sst2"         name="tossq"    /> 
     59     <field field_ref="sss"          name="sosaline" /> 
     60     <field field_ref="ssh"          name="sossheig" /> 
     61     <field field_ref="ssh2"         name="zossq"    /> 
     62     <field field_ref="empmr"        name="wfo"      /> 
     63     <field field_ref="qsr"          name="rsntds"   /> 
     64     <field field_ref="qt"           name="tohfls"   /> 
     65     <field field_ref="taum"     /> 
     66     <field field_ref="mldkz5"   /> 
     67     <field field_ref="mldr10_1" /> 
    6868   </file> 
    6969    
    7070   <file id="file5" name_suffix="_grid_U" description="ocean U grid variables" > 
    71      <field field_ref="suoce"        name="uos"     long_name="sea_surface_x_velocity"    /> 
    72      <field field_ref="utau"         name="tauuo"   long_name="surface_downward_x_stress" /> 
     71     <field field_ref="ssu"          name="uos"   /> 
     72     <field field_ref="utau"         name="tauuo" /> 
    7373   </file> 
    7474    
    7575   <file id="file6" name_suffix="_grid_V" description="ocean V grid variables" > 
    76      <field field_ref="svoce"        name="vos"     long_name="sea_surface_y_velocity"    /> 
    77      <field field_ref="vtau"         name="tauvo"   long_name="surface_downward_y_stress" /> 
     76     <field field_ref="ssv"          name="vos"   /> 
     77     <field field_ref="vtau"         name="tauvo" /> 
    7878   </file> 
    7979    
    8080   <file id="file7" name_suffix="_icemod" description="ice variables" > 
    81      <field field_ref="ice_pres"                     /> 
    82      <field field_ref="snowthic_cea" name="snd"     long_name="surface_snow_thickness"   /> 
    83      <field field_ref="icethic_cea"  name="sit"     long_name="sea_ice_thickness"        /> 
    84      <field field_ref="iceprod_cea"  name="sip"     long_name="sea_ice_thickness"        /> 
    85      <field field_ref="ist_ipa"      /> 
    86      <field field_ref="uice_ipa"     /> 
    87      <field field_ref="vice_ipa"     /> 
    88      <field field_ref="utau_ice"     /> 
    89      <field field_ref="vtau_ice"     /> 
    90      <field field_ref="qsr_io_cea"   /> 
    91      <field field_ref="qns_io_cea"   /> 
    92      <field field_ref="snowpre"      /> 
     81     <field field_ref="ice_pres"   /> 
     82     <field field_ref="snowthic_cea" name="snd" /> 
     83     <field field_ref="icethic_cea"  name="sit" /> 
     84     <field field_ref="iceprod_cea"  name="sip" /> 
     85     <field field_ref="ist_ipa"    /> 
     86     <field field_ref="uice_ipa"   /> 
     87     <field field_ref="vice_ipa"   /> 
     88     <field field_ref="utau_ice"   /> 
     89     <field field_ref="vtau_ice"   /> 
     90     <field field_ref="qsr_io_cea" /> 
     91     <field field_ref="qns_io_cea" /> 
     92     <field field_ref="snowpre"    /> 
    9393   </file> 
    9494    
    … …  
    115115     
    116116   <axis_definition>   
    117       <axis id="deptht" long_name="Vertical T levels" unit="m" positive="down" /> 
    118       <axis id="depthu" long_name="Vertical U levels" unit="m" positive="down" /> 
    119       <axis id="depthv" long_name="Vertical V levels" unit="m" positive="down" /> 
    120       <axis id="depthw" long_name="Vertical W levels" unit="m" positive="down" /> 
    121       <axis id="nfloat" long_name="Float number"      unit="-"  /> 
    122       <axis id="icbcla" long_name="Iceberg class"     unit="-"  /> 
    123    </axis_definition>  
     117      <axis id="deptht"  long_name="Vertical T levels"  unit="m" positive="down" /> 
     118      <axis id="depthu"  long_name="Vertical U levels"  unit="m" positive="down" /> 
     119      <axis id="depthv"  long_name="Vertical V levels"  unit="m" positive="down" /> 
     120      <axis id="depthw"  long_name="Vertical W levels"  unit="m" positive="down" /> 
     121      <axis id="nfloat"  long_name="Float number"       unit="1"                 /> 
     122      <axis id="icbcla"  long_name="Iceberg class"      unit="1"                 /> 
     123      <axis id="ncatice" long_name="Ice category class" unit="1"                 /> 
     124      <axis id="iax_20C" long_name="20 degC isotherm"   unit="degC"              /> 
     125      <axis id="iax_28C" long_name="28 degC isotherm"   unit="degC"              /> 
     126   </axis_definition> 
    124127     
    125128   <domain_definition src="./domain_def.xml"/> 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_SAS_LIM/EXP00/namelist_cfg

    r4370 r6225  
    2626&namzgr        !   vertical coordinate 
    2727!----------------------------------------------------------------------- 
     28   ln_zco      = .true.    !  z-coordinate - full    steps 
     29   ln_linssh   = .true.    !  linear free surface 
    2830/ 
    2931!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    4850   ppkth2      =  999999.              ! 
    4951   ppacr2      =  999999.              ! 
    50 / 
    51 !----------------------------------------------------------------------- 
    52 &namsplit      !   time splitting parameters                            ("key_dynspg_ts") 
    53 !----------------------------------------------------------------------- 
    5452/ 
    5553!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    8785/ 
    8886!----------------------------------------------------------------------- 
    89 &namcla        !   cross land advection 
    90 !----------------------------------------------------------------------- 
    91 / 
    92 !----------------------------------------------------------------------- 
    9387&nameos        !   ocean physical parameters 
    9488!----------------------------------------------------------------------- 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_SAS_LIM/cpp_ORCA2_SAS_LIM.fcm

    r4523 r6225  
    1  bld::tool::fppkeys key_trabbl key_lim2 key_dynspg_flt key_diaeiv key_ldfslp key_traldf_c2d key_traldf_eiv key_dynldf_c3d key_zdftke key_zdfddm key_zdftmx key_iomput key_mpp_mpi 
     1 bld::tool::fppkeys key_trabbl key_lim2 key_zdftke key_zdfddm key_zdftmx key_iomput key_mpp_mpi 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/SHARED/README_configs_namcfg_namdom

    r4147 r6225  
    331331!----------------------------------------------------------------------- 
    332332   cp_cfg      =  "orca"               !  name of the configuration 
    333    jp_cfg      =    1442               !  resolution of the configuration 
    334    jpidta      =    1021               !  1st lateral dimension ( >= jpi ) 
    335    jpjdta      =     511               !  2nd    "         "    ( >= jpj ) 
     333   jp_cfg      =     025               !  resolution of the configuration 
     334   jpidta      =    1442               !  1st lateral dimension ( >= jpi ) 
     335   jpjdta      =    1021               !  2nd    "         "    ( >= jpj ) 
    336336   jpkdta      =      75               !  number of levels      ( >= jpk ) 
    337337   jpiglo      =    1442               !  1st dimension of global domain --> i =jpidta 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/SHARED/domain_def.xml

    r4690 r6225  
    163163 
    164164      <domain id="grid_V" long_name="grid V"/> 
     165       
    165166      <domain_group id="grid_W"> 
    166167         <domain id="grid_W" long_name="grid W"/> 
    … …  
    169170      </domain_group> 
    170171 
    171       <domain_group id="scalarpoint"> 
    172          <domain id="scalarpoint" long_name="scalar"/> 
    173          <!-- 
    174          <domain id="1point" zoom_ibegin="1" zoom_jbegin="1" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    175          --> 
     172      <domain id="grid_F" long_name="grid F"/> 
     173 
     174      <domain_group id="scalarpoint">  
     175         <domain id="scalarpoint" long_name="scalar"/>  
     176         <!--  
     177         <domain id="1point" zoom_ibegin="1" zoom_jbegin="1" zoom_ni="1" zoom_nj="1" />  
     178         -->  
    176179      </domain_group> 
     180 
     181      <domain_group id="gznl"> 
     182         <domain id="ptr" long_name="zonal mean grid" zoom_ibegin="0000"  zoom_jbegin="1" zoom_ni="1" zoom_nj="0000" /> 
     183      </domain_group> 
     184 
    177185 
    178186   </domain_definition>     

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/SHARED/field_def.xml

    r4690 r6225  
    1313   <field_definition level="1" prec="4" operation="average" enabled=".TRUE." default_value="1.e20" > <!-- time step automaticaly defined --> 
    1414 
     15    <!--  
     16============================================================================================================ 
     17                                  Physical ocean and ice model variables 
     18============================================================================================================ 
     19    --> 
     20 
    1521      <!-- T grid --> 
    1622       
    17      <field_group id="grid_T" grid_ref="grid_T_2D" > 
    18          <field id="toce"         long_name="temperature"                               unit="degC" grid_ref="grid_T_3D"/> 
    19          <field id="soce"         long_name="salinity"                                  unit="psu"  grid_ref="grid_T_3D"/> 
    20          <field id="sst"          long_name="sea surface temperature"                   unit="degC"                     /> 
    21          <field id="sst2"         long_name="square of sea surface temperature"         unit="degC2"                    /> 
    22          <field id="sstgrad"      long_name="module of sst gradient"                    unit="degC/m"                   /> 
    23          <field id="sstgrad2"     long_name="square of module of sst gradient"          unit="degC2/m2"                 /> 
    24          <field id="sss"          long_name="sea surface salinity"                      unit="psu"                      /> 
    25          <field id="sss2"         long_name="square of sea surface salinity"            unit="psu2"                     /> 
    26          <field id="ssh"          long_name="sea surface height"                        unit="m"                        /> 
    27          <field id="ssh2"         long_name="square of sea surface height"              unit="m2"                       /> 
    28          <field id="mldkz5"       long_name="mixing layer depth (Turbocline)"           unit="m"                        /> 
    29          <field id="mldr10_1"     long_name="Mixed Layer Depth 0.01 ref.10m"            unit="m"                        /> 
    30          <field id="rhop"         long_name="potential density (sigma0)"                unit="kg/m3" grid_ref="grid_T_3D"/> 
    31          <field id="heatc"        long_name="Heat content vertically integrated"        unit="J/m2"                      /> 
    32          <field id="saltc"        long_name="Salt content vertically integrated"        unit="PSU*kg/m2"                /> 
    33     <field id="eken"         long_name="kinetic energy"                            unit="m2/s2" grid_ref="grid_T_3D"/> 
    34     <field id="hdiv"         long_name="horizontal divergence"                     unit="s-1"   grid_ref="grid_T_3D"/> 
     23      <field_group id="grid_T" grid_ref="grid_T_2D" > 
     24         <field id="e3t"          long_name="T-cell thickness"   standard_name="cell_thickness"   unit="m"   grid_ref="grid_T_3D"/> 
     25 
     26         <field id="toce"         long_name="temperature"         standard_name="sea_water_potential_temperature"   unit="degC"     grid_ref="grid_T_3D"/> 
     27         <field id="toce_e3t"     long_name="temperature (thickness weighted)"                                      unit="degC"     grid_ref="grid_T_3D" > toce * e3t </field > 
     28         <field id="soce"         long_name="salinity"            standard_name="sea_water_practical_salinity"      unit="1e-3"     grid_ref="grid_T_3D"/> 
     29         <field id="soce_e3t"     long_name="salinity    (thickness weighted)"                                      unit="1e-3"     grid_ref="grid_T_3D" > soce * e3t </field > 
     30 
     31         <!-- t-eddy viscosity coefficients (ldfdyn) --> 
     32         <field id="ahmt_2d"      long_name=" surface t-eddy viscosity coefficient"   unit="m2/s or m4/s" /> 
     33         <field id="ahmt_3d"      long_name=" 3D      t-eddy viscosity coefficient"   unit="m2/s or m4/s"                           grid_ref="grid_T_3D"/> 
     34 
     35         <field id="sst"          long_name="sea surface temperature"             standard_name="sea_surface_temperature"             unit="degC"     /> 
     36         <field id="sst2"         long_name="square of sea surface temperature"   standard_name="square_of_sea_surface_temperature"   unit="degC2"     > sst * sst </field > 
     37         <field id="sstmax"       long_name="max of sea surface temperature"   field_ref="sst"   operation="maximum"                                  /> 
     38         <field id="sstmin"       long_name="min of sea surface temperature"   field_ref="sst"   operation="minimum"                                  /> 
     39         <field id="sstgrad"      long_name="module of sst gradient"                                                                  unit="degC/m"   /> 
     40         <field id="sstgrad2"     long_name="square of module of sst gradient"                                                        unit="degC2/m2" /> 
     41         <field id="sbt"          long_name="sea bottom temperature"                                                                  unit="degC"     /> 
     42         <field id="sst_wl"       long_name="Delta SST of warm layer"                                                                 unit="degC"     /> 
     43         <field id="sst_cs"       long_name="Delta SST of cool skin"                                                                  unit="degC"     /> 
     44    <field id="temp_3m"      long_name="temperature at 3m"                                                                       unit="degC"     /> 
     45          
     46         <field id="sss"          long_name="sea surface salinity"             standard_name="sea_surface_salinity"   unit="1e-3" /> 
     47         <field id="sss2"         long_name="square of sea surface salinity"                                          unit="1e-6"  > sss * sss </field > 
     48         <field id="sssmax"       long_name="max of sea surface salinity"   field_ref="sss"   operation="maximum"                 /> 
     49         <field id="sssmin"       long_name="min of sea surface salinity"   field_ref="sss"   operation="minimum"                 /> 
     50         <field id="sbs"          long_name="sea bottom salinity"                                                     unit="1e-3" /> 
     51 
     52         <field id="taubot"       long_name="bottom stress module"                                                    unit="N/m2" />  
     53 
     54         <field id="ssh"          long_name="sea surface height"             standard_name="sea_surface_height_above_geoid"             unit="m" /> 
     55         <field id="ssh2"         long_name="square of sea surface height"   standard_name="square_of_sea_surface_height_above_geoid"   unit="m2" > ssh * ssh </field > 
     56         <field id="sshmax"       long_name="max of sea surface height"   field_ref="ssh"   operation="maximum"                                  /> 
     57 
     58         <field id="mldkz5"       long_name="Turbocline depth (Kz = 5e-4)"                       standard_name="ocean_mixed_layer_thickness_defined_by_vertical_tracer_diffusivity"                unit="m"          /> 
     59         <field id="mldr10_1"     long_name="Mixed Layer Depth (dsigma = 0.01 wrt 10m)"          standard_name="ocean_mixed_layer_thickness_defined_by_sigma_theta"                                unit="m"          /> 
     60         <field id="mldr10_1max"  long_name="Max of Mixed Layer Depth (dsigma = 0.01 wrt 10m)"   field_ref="mldr10_1"   operation="maximum"                                                                          /> 
     61         <field id="mldr10_1min"  long_name="Min of Mixed Layer Depth (dsigma = 0.01 wrt 10m)"   field_ref="mldr10_1"   operation="minimum"                                                                          /> 
     62         <field id="heatc"        long_name="Heat content vertically integrated"                 standard_name="integral_of_sea_water_potential_temperature_wrt_depth_expressed_as_heat_content"   unit="J/m2"       /> 
     63         <field id="saltc"        long_name="Salt content vertically integrated"                                                                                                                   unit="1e-3*kg/m2" /> 
     64 
     65         <!-- EOS --> 
     66         <field id="alpha"        long_name="thermal expansion"                                                         unit="degC-1" grid_ref="grid_T_3D" /> 
     67         <field id="beta"         long_name="haline contraction"                                                        unit="1e3"    grid_ref="grid_T_3D" /> 
     68         <field id="bn2"          long_name="squared Brunt-Vaisala frequency"                                           unit="s-1"    grid_ref="grid_T_3D" /> 
     69         <field id="rhop"         long_name="potential density (sigma0)"        standard_name="sea_water_sigma_theta"   unit="kg/m3"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
     70 
     71         <!-- Energy - horizontal divergence --> 
     72         <field id="eken"         long_name="kinetic energy"          standard_name="specific_kinetic_energy_of_sea_water"   unit="m2/s2"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
     73         <field id="hdiv"         long_name="horizontal divergence"                                                          unit="s-1"    grid_ref="grid_T_3D" /> 
     74 
    3575         <!-- variables available with MLE --> 
    36          <field id="Lf_NHpf"      long_name="MLE: Lf = N H / f"                         unit="m"                        /> 
     76         <field id="Lf_NHpf"      long_name="MLE: Lf = N H / f"   unit="m" /> 
     77 
    3778         <!-- next variables available with key_diahth --> 
    38          <field id="mlddzt"       long_name="Thermocline Depth (max dT/dz)"             unit="m"                        /> 
    39          <field id="mldr10_3"     long_name="Mixed Layer Depth dr=0.03 (ref.10m)"       unit="m"                        /> 
    40          <field id="mldr0_1"      long_name="Mixed Layer Depth dr=0.01 (ref.surf)"      unit="m"                        /> 
    41          <field id="mldr0_3"      long_name="Mixed Layer Depth dr=0.03 (ref.surf)"      unit="m"                        /> 
    42          <field id="mld_dt02"     long_name="Mixed Layer Depth |dt|=0.2 (ref.10m)"      unit="m"                        /> 
    43          <field id="topthdep"     long_name="Top of the thermocline dt=-0.2 (ref.10m)"  unit="m"                        /> 
    44          <field id="pycndep"      long_name="Pycnocline depth dr~dt=-0.2 (ref.10m)"     unit="m"                        /> 
    45          <field id="BLT"          long_name="Barrier Layer Thickness"                   unit="m"                        /> 
    46          <field id="tinv"         long_name="Max of vertical invertion of temperature"  unit="degC"                     /> 
    47          <field id="depti"        long_name="Depth of max. vert. inv. of temperature"   unit="m"                        /> 
    48          <field id="20d"          long_name="Depth of 20C isotherm"                     unit="m"                        /> 
    49          <field id="28d"          long_name="Depth of 28C isotherm"                     unit="m"                        /> 
    50          <field id="hc300"        long_name="Heat content 300 m"                        unit="W"                        /> 
     79         <field id="mlddzt"       long_name="Thermocline Depth (depth of max dT/dz)"         standard_name="depth_at_maximum_upward_derivative_of_sea_water_potential_temperature"             unit="m"                         /> 
     80         <field id="mldr10_3"     long_name="Mixed Layer Depth (dsigma = 0.03 wrt 10m)"      standard_name="ocean_mixed_layer_thickness_defined_by_sigma_theta"                                unit="m"                         /> 
     81         <field id="mldr0_1"      long_name="Mixed Layer Depth (dsigma = 0.01 wrt sfc)"      standard_name="ocean_mixed_layer_thickness_defined_by_sigma_theta"                                unit="m"                         /> 
     82         <field id="mldr0_3"      long_name="Mixed Layer Depth (dsigma = 0.03 wrt sfc)"      standard_name="ocean_mixed_layer_thickness_defined_by_sigma_theta"                                unit="m"                         /> 
     83         <field id="mld_dt02"     long_name="Mixed Layer Depth (|dT| = 0.2 wrt 10m)"         standard_name="ocean_mixed_layer_thickness_defined_by_temperature"                                unit="m"                         /> 
     84         <field id="topthdep"     long_name="Top of Thermocline Depth (dT = -0.2 wrt 10m)"   standard_name="ocean_mixed_layer_thickness_defined_by_temperature"                                unit="m"                         /> 
     85         <field id="pycndep"      long_name="Pycnocline Depth (dsigma[dT=-0.2] wrt 10m)"     standard_name="ocean_mixed_layer_thickness_defined_by_sigma_theta"                                unit="m"                         /> 
     86         <field id="BLT"          long_name="Barrier Layer Thickness"                                                                                                                          unit="m"                          > topthdep - pycndep </field> 
     87         <field id="tinv"         long_name="Max of vertical invertion of temperature"                                                                                                         unit="degC"                      /> 
     88         <field id="depti"        long_name="Depth of max. vert. inv. of temperature"                                                                                                          unit="m"                         /> 
     89         <field id="20d"          long_name="Depth of 20C isotherm"                          standard_name="depth_of_isosurface_of_sea_water_potential_temperature"                            unit="m"      axis_ref="iax_20C" /> 
     90         <field id="28d"          long_name="Depth of 28C isotherm"                          standard_name="depth_of_isosurface_of_sea_water_potential_temperature"                            unit="m"      axis_ref="iax_28C" /> 
     91         <field id="hc300"        long_name="Heat content 0-300m"                            standard_name="integral_of_sea_water_potential_temperature_wrt_depth_expressed_as_heat_content"   unit="J/m2"                      /> 
     92 
    5193         <!-- variables available with key_diaar5 --> 
    52          <field id="botpres"      long_name="Pressure at sea floor"                     unit="dbar"                     /> 
    53          <!-- variables available with key_diaar5/key_vvl --> 
    54          <field id="cellthc"      long_name="Cell thickness"                            unit="m"    grid_ref="grid_T_3D"/> 
     94         <field id="botpres"      long_name="Pressure at sea floor"   standard_name="sea_water_pressure_at_sea_floor"   unit="dbar" /> 
     95 
    5596         <!-- variables available with key_vvl --> 
    56          <field id="tpt_dep"      long_name="T-point depth"                             unit="m"    grid_ref="grid_T_3D"/> 
    57          <field id="e3tdef"       long_name="T-cell thickness deformation"              unit="%"    grid_ref="grid_T_3D"/> 
    58      </field_group> 
    59  
    60      <field_group id="Tides_T" grid_ref="grid_T_2D" operation="once" > 
    61     <!-- tidal composante --> 
    62     <field id="M2x"          long_name="M2 Elevation harmonic real part "                             unit="m"        /> 
    63     <field id="M2y"          long_name="M2 Elevation harmonic imaginary part"                         unit="m"        /> 
    64     <field id="S2x"          long_name="S2 Elevation harmonic real part "                             unit="m"        /> 
    65     <field id="S2y"          long_name="S2 Elevation harmonic imaginary part"                         unit="m"        /> 
    66     <field id="N2x"          long_name="N2 Elevation harmonic real part "                             unit="m"        /> 
    67     <field id="N2y"          long_name="N2 Elevation harmonic imaginary part"                         unit="m"        /> 
    68     <field id="K1x"          long_name="K1 Elevation harmonic real part "                             unit="m"        /> 
    69     <field id="K1y"          long_name="K1 Elevation harmonic imaginary part"                         unit="m"        /> 
    70     <field id="O1x"          long_name="O1 Elevation harmonic real part "                             unit="m"        /> 
    71     <field id="O1y"          long_name="O1 Elevation harmonic imaginary part"                         unit="m"        /> 
    72     <field id="Q1x"          long_name="Q1 Elevation harmonic real part "                             unit="m"        /> 
    73     <field id="Q1y"          long_name="Q1 Elevation harmonic imaginary part"                         unit="m"        /> 
    74     <field id="M4x"          long_name="M4 Elevation harmonic real part "                             unit="m"        /> 
    75     <field id="M4y"          long_name="M4 Elevation harmonic imaginary part"                         unit="m"        /> 
    76     <field id="K2x"          long_name="K2 Elevation harmonic real part "                             unit="m"        /> 
    77     <field id="K2y"          long_name="K2 Elevation harmonic imaginary part"                         unit="m"        /> 
    78     <field id="P1x"          long_name="P1 Elevation harmonic real part "                             unit="m"        /> 
    79     <field id="P1y"          long_name="P1 Elevation harmonic imaginary part"                         unit="m"        /> 
    80     <field id="Mfx"          long_name="Mf Elevation harmonic real part "                             unit="m"        /> 
    81     <field id="Mfy"          long_name="Mf Elevation harmonic imaginary part"                         unit="m"        /> 
    82     <field id="Mmx"          long_name="Mm Elevation harmonic real part "                             unit="m"        /> 
    83     <field id="Mmy"          long_name="Mm Elevation harmonic imaginary part"                         unit="m"        /> 
    84      </field_group> 
     97         <field id="tpt_dep"      long_name="T-point depth"                  standard_name="depth_below_geoid"   unit="m"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
     98         <field id="e3tdef"       long_name="T-cell thickness deformation"                                       unit="%"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
     99      </field_group> 
     100 
     101      <!-- Tides --> 
     102 
     103      <field_group id="Tides_T" grid_ref="grid_T_2D" operation="once" > 
     104         <!-- tidal composante --> 
     105         <field id="M2x"          long_name="M2 Elevation harmonic real part "                             unit="m"        /> 
     106         <field id="M2y"          long_name="M2 Elevation harmonic imaginary part"                         unit="m"        /> 
     107         <field id="S2x"          long_name="S2 Elevation harmonic real part "                             unit="m"        /> 
     108         <field id="S2y"          long_name="S2 Elevation harmonic imaginary part"                         unit="m"        /> 
     109         <field id="N2x"          long_name="N2 Elevation harmonic real part "                             unit="m"        /> 
     110         <field id="N2y"          long_name="N2 Elevation harmonic imaginary part"                         unit="m"        /> 
     111         <field id="K1x"          long_name="K1 Elevation harmonic real part "                             unit="m"        /> 
     112         <field id="K1y"          long_name="K1 Elevation harmonic imaginary part"                         unit="m"        /> 
     113         <field id="O1x"          long_name="O1 Elevation harmonic real part "                             unit="m"        /> 
     114         <field id="O1y"          long_name="O1 Elevation harmonic imaginary part"                         unit="m"        /> 
     115         <field id="Q1x"          long_name="Q1 Elevation harmonic real part "                             unit="m"        /> 
     116         <field id="Q1y"          long_name="Q1 Elevation harmonic imaginary part"                         unit="m"        /> 
     117         <field id="M4x"          long_name="M4 Elevation harmonic real part "                             unit="m"        /> 
     118         <field id="M4y"          long_name="M4 Elevation harmonic imaginary part"                         unit="m"        /> 
     119         <field id="K2x"          long_name="K2 Elevation harmonic real part "                             unit="m"        /> 
     120         <field id="K2y"          long_name="K2 Elevation harmonic imaginary part"                         unit="m"        /> 
     121         <field id="P1x"          long_name="P1 Elevation harmonic real part "                             unit="m"        /> 
     122         <field id="P1y"          long_name="P1 Elevation harmonic imaginary part"                         unit="m"        /> 
     123         <field id="Mfx"          long_name="Mf Elevation harmonic real part "                             unit="m"        /> 
     124         <field id="Mfy"          long_name="Mf Elevation harmonic imaginary part"                         unit="m"        /> 
     125         <field id="Mmx"          long_name="Mm Elevation harmonic real part "                             unit="m"        /> 
     126         <field id="Mmy"          long_name="Mm Elevation harmonic imaginary part"                         unit="m"        /> 
     127      </field_group> 
    85128     
    86      <field_group id="Tides_U" grid_ref="grid_U_2D" operation="once" > 
    87     <field id="M2x_u"          long_name="M2 current barotrope along i-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
    88     <field id="M2y_u"          long_name="M2 current barotrope along i-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
    89     <field id="S2x_u"          long_name="S2 current barotrope along i-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
    90     <field id="S2y_u"          long_name="S2 current barotrope along i-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
    91     <field id="N2x_u"          long_name="N2 current barotrope along i-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
    92     <field id="N2y_u"          long_name="N2 current barotrope along i-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
    93     <field id="K1x_u"          long_name="K1 current barotrope along i-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
    94     <field id="K1y_u"          long_name="K1 current barotrope along i-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
    95     <field id="O1x_u"          long_name="O1 current barotrope along i-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
    96     <field id="O1y_u"          long_name="O1 current barotrope along i-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
    97     <field id="Q1x_u"          long_name="Q1 current barotrope along i-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
    98     <field id="Q1y_u"          long_name="Q1 current barotrope along i-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
    99     <field id="M4x_u"          long_name="M4 current barotrope along i-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
    100     <field id="M4y_u"          long_name="M4 current barotrope along i-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
    101     <field id="K2x_u"          long_name="K2 current barotrope along i-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
    102     <field id="K2y_u"          long_name="K2 current barotrope along i-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
    103     <field id="P1x_u"          long_name="P1 current barotrope along i-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
    104     <field id="P1y_u"          long_name="P1 current barotrope along i-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
    105     <field id="Mfx_u"          long_name="Mf current barotrope along i-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
    106     <field id="Mfy_u"          long_name="Mf current barotrope along i-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
    107     <field id="Mmx_u"          long_name="Mm current barotrope along i-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
    108     <field id="Mmy_u"          long_name="Mm current barotrope along i-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
    109      </field_group> 
     129      <field_group id="Tides_U" grid_ref="grid_U_2D" operation="once" > 
     130         <field id="M2x_u"        long_name="M2 current barotrope along i-axis harmonic real part "        unit="m/s"      /> 
     131         <field id="M2y_u"        long_name="M2 current barotrope along i-axis harmonic imaginary part "   unit="m/s"      /> 
     132         <field id="S2x_u"        long_name="S2 current barotrope along i-axis harmonic real part "        unit="m/s"      /> 
     133         <field id="S2y_u"        long_name="S2 current barotrope along i-axis harmonic imaginary part "   unit="m/s"      /> 
     134         <field id="N2x_u"        long_name="N2 current barotrope along i-axis harmonic real part "        unit="m/s"      /> 
     135         <field id="N2y_u"        long_name="N2 current barotrope along i-axis harmonic imaginary part "   unit="m/s"      /> 
     136         <field id="K1x_u"        long_name="K1 current barotrope along i-axis harmonic real part "        unit="m/s"      /> 
     137         <field id="K1y_u"        long_name="K1 current barotrope along i-axis harmonic imaginary part "   unit="m/s"      /> 
     138         <field id="O1x_u"        long_name="O1 current barotrope along i-axis harmonic real part "        unit="m/s"      /> 
     139         <field id="O1y_u"        long_name="O1 current barotrope along i-axis harmonic imaginary part "   unit="m/s"      /> 
     140         <field id="Q1x_u"        long_name="Q1 current barotrope along i-axis harmonic real part "        unit="m/s"      /> 
     141         <field id="Q1y_u"        long_name="Q1 current barotrope along i-axis harmonic imaginary part "   unit="m/s"      /> 
     142         <field id="M4x_u"        long_name="M4 current barotrope along i-axis harmonic real part "        unit="m/s"      /> 
     143         <field id="M4y_u"        long_name="M4 current barotrope along i-axis harmonic imaginary part "   unit="m/s"      /> 
     144         <field id="K2x_u"        long_name="K2 current barotrope along i-axis harmonic real part "        unit="m/s"      /> 
     145         <field id="K2y_u"        long_name="K2 current barotrope along i-axis harmonic imaginary part "   unit="m/s"      /> 
     146         <field id="P1x_u"        long_name="P1 current barotrope along i-axis harmonic real part "        unit="m/s"      /> 
     147         <field id="P1y_u"        long_name="P1 current barotrope along i-axis harmonic imaginary part "   unit="m/s"      /> 
     148         <field id="Mfx_u"        long_name="Mf current barotrope along i-axis harmonic real part "        unit="m/s"      /> 
     149         <field id="Mfy_u"        long_name="Mf current barotrope along i-axis harmonic imaginary part "   unit="m/s"      /> 
     150         <field id="Mmx_u"        long_name="Mm current barotrope along i-axis harmonic real part "        unit="m/s"      /> 
     151         <field id="Mmy_u"        long_name="Mm current barotrope along i-axis harmonic imaginary part "   unit="m/s"      /> 
     152      </field_group> 
    110153     
    111      <field_group id="Tides_V" grid_ref="grid_V_2D" operation="once" > 
    112     <field id="M2x_v"          long_name="M2 current barotrope along j-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
    113     <field id="M2y_v"          long_name="M2 current barotrope along j-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
    114     <field id="S2x_v"          long_name="S2 current barotrope along j-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
    115     <field id="S2y_v"          long_name="S2 current barotrope along j-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
    116     <field id="N2x_v"          long_name="N2 current barotrope along j-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
    117     <field id="N2y_v"          long_name="N2 current barotrope along j-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
    118     <field id="K1x_v"          long_name="K1 current barotrope along j-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
    119     <field id="K1y_v"          long_name="K1 current barotrope along j-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
    120     <field id="O1x_v"          long_name="O1 current barotrope along j-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
    121     <field id="O1y_v"          long_name="O1 current barotrope along j-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
    122     <field id="Q1x_v"          long_name="Q1 current barotrope along j-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
    123     <field id="Q1y_v"          long_name="Q1 current barotrope along j-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
    124     <field id="M4x_v"          long_name="M4 current barotrope along j-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
    125     <field id="M4y_v"          long_name="M4 current barotrope along j-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
    126     <field id="K2x_v"          long_name="K2 current barotrope along j-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
    127     <field id="K2y_v"          long_name="K2 current barotrope along j-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
    128     <field id="P1x_v"          long_name="P1 current barotrope along j-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
    129     <field id="P1y_v"          long_name="P1 current barotrope along j-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
    130     <field id="Mfx_v"          long_name="Mf current barotrope along j-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
    131     <field id="Mfy_v"          long_name="Mf current barotrope along j-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
    132     <field id="Mmx_v"          long_name="Mm current barotrope along j-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
    133     <field id="Mmy_v"          long_name="Mm current barotrope along j-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        />   
    134      </field_group> 
    135  
     154      <field_group id="Tides_V" grid_ref="grid_V_2D" operation="once" > 
     155         <field id="M2x_v"        long_name="M2 current barotrope along j-axis harmonic real part "        unit="m/s"      /> 
     156         <field id="M2y_v"        long_name="M2 current barotrope along j-axis harmonic imaginary part "   unit="m/s"      /> 
     157         <field id="S2x_v"        long_name="S2 current barotrope along j-axis harmonic real part "        unit="m/s"      /> 
     158         <field id="S2y_v"        long_name="S2 current barotrope along j-axis harmonic imaginary part "   unit="m/s"      /> 
     159         <field id="N2x_v"        long_name="N2 current barotrope along j-axis harmonic real part "        unit="m/s"      /> 
     160         <field id="N2y_v"        long_name="N2 current barotrope along j-axis harmonic imaginary part "   unit="m/s"      /> 
     161         <field id="K1x_v"        long_name="K1 current barotrope along j-axis harmonic real part "        unit="m/s"      /> 
     162         <field id="K1y_v"        long_name="K1 current barotrope along j-axis harmonic imaginary part "   unit="m/s"      /> 
     163         <field id="O1x_v"        long_name="O1 current barotrope along j-axis harmonic real part "        unit="m/s"      /> 
     164         <field id="O1y_v"        long_name="O1 current barotrope along j-axis harmonic imaginary part "   unit="m/s"      /> 
     165         <field id="Q1x_v"        long_name="Q1 current barotrope along j-axis harmonic real part "        unit="m/s"      /> 
     166         <field id="Q1y_v"        long_name="Q1 current barotrope along j-axis harmonic imaginary part "   unit="m/s"      /> 
     167         <field id="M4x_v"        long_name="M4 current barotrope along j-axis harmonic real part "        unit="m/s"      /> 
     168         <field id="M4y_v"        long_name="M4 current barotrope along j-axis harmonic imaginary part "   unit="m/s"      /> 
     169         <field id="K2x_v"        long_name="K2 current barotrope along j-axis harmonic real part "        unit="m/s"      /> 
     170         <field id="K2y_v"        long_name="K2 current barotrope along j-axis harmonic imaginary part "   unit="m/s"      /> 
     171         <field id="P1x_v"        long_name="P1 current barotrope along j-axis harmonic real part "        unit="m/s"      /> 
     172         <field id="P1y_v"        long_name="P1 current barotrope along j-axis harmonic imaginary part "   unit="m/s"      /> 
     173         <field id="Mfx_v"        long_name="Mf current barotrope along j-axis harmonic real part "        unit="m/s"      /> 
     174         <field id="Mfy_v"        long_name="Mf current barotrope along j-axis harmonic imaginary part "   unit="m/s"      /> 
     175         <field id="Mmx_v"        long_name="Mm current barotrope along j-axis harmonic real part "        unit="m/s"      /> 
     176         <field id="Mmy_v"        long_name="Mm current barotrope along j-axis harmonic imaginary part "   unit="m/s"      />   
     177      </field_group> 
    136178 
    137179      <!-- SBC --> 
    138180       
    139181      <field_group id="SBC" grid_ref="grid_T_2D" > <!-- time step automaticaly defined based on nn_fsbc --> 
    140  
    141          <field id="empmr"        long_name="Net Upward Water Flux"                                        unit="kg/m2/s"  /> 
    142          <field id="saltflx"      long_name="Downward salt flux"                                           unit="PSU/m2/s"  /> 
    143          <field id="fmmflx"       long_name="Water flux due to freezing/melting"                           unit="kg/m2/s"  /> 
    144          <field id="snowpre"      long_name="Snow precipitation"                                           unit="kg/m2/s"  /> 
    145          <field id="runoffs"      long_name="River Runoffs"                                                unit="Kg/m2/s"  /> 
    146          <field id="precip"       long_name="Total precipitation"                                           unit="kg/m2/s"  /> 
    147  
    148  
    149          <field id="qt"           long_name="Net Downward Heat Flux"                                       unit="W/m2"     /> 
    150          <field id="qns"          long_name="non solar Downward Heat Flux"                                 unit="W/m2"     /> 
    151          <field id="qsr"          long_name="Shortwave Radiation"                                          unit="W/m2"     /> 
    152          <field id="qsr3d"        long_name="Shortwave Radiation 3D distribution"  grid_ref="grid_T_3D"    unit="W/m2"     /> 
    153          <field id="qrp"          long_name="Surface Heat Flux: Damping"                                   unit="W/m2"     /> 
    154          <field id="erp"          long_name="Surface Water Flux: Damping"                                  unit="Kg/m2/s"  /> 
    155          <field id="taum"         long_name="wind stress module"                                           unit="N/m2"     /> 
    156          <field id="wspd"         long_name="Wind speed module at 10 m"                                    unit="m/s"      /> 
     182         <field id="empmr"        long_name="Net Upward Water Flux"                standard_name="water_flux_out_of_sea_ice_and_sea_water"                              unit="kg/m2/s"   /> 
     183         <field id="saltflx"      long_name="Downward salt flux"                                                                                                        unit="1e-3/m2/s" /> 
     184         <field id="fmmflx"       long_name="Water flux due to freezing/melting"                                                                                        unit="kg/m2/s"   /> 
     185         <field id="snowpre"      long_name="Snow precipitation"                   standard_name="snowfall_flux"                                                        unit="kg/m2/s"   /> 
     186         <field id="runoffs"      long_name="River Runoffs"                        standard_name="water_flux_into_sea_water_from_rivers"                                unit="kg/m2/s"   /> 
     187         <field id="precip"       long_name="Total precipitation"                  standard_name="precipitation_flux"                                                   unit="kg/m2/s"   /> 
     188  
     189         <field id="qt"           long_name="Net Downward Heat Flux"                standard_name="surface_downward_heat_flux_in_sea_water"                              unit="W/m2"                           /> 
     190         <field id="qns"          long_name="non solar Downward Heat Flux"                                                                                               unit="W/m2"                           /> 
     191         <field id="qsr"          long_name="Shortwave Radiation"                   standard_name="net_downward_shortwave_flux_at_sea_water_surface"                     unit="W/m2"                           /> 
     192         <field id="qsr3d"        long_name="Shortwave Radiation 3D distribution"   standard_name="downwelling_shortwave_flux_in_sea_water"                              unit="W/m2"      grid_ref="grid_T_3D" /> 
     193         <field id="qrp"          long_name="Surface Heat Flux: Damping"            standard_name="heat_flux_into_sea_water_due_to_newtonian_relaxation"                 unit="W/m2"                           /> 
     194         <field id="erp"          long_name="Surface Water Flux: Damping"           standard_name="water_flux_out_of_sea_water_due_to_newtonian_relaxation"              unit="kg/m2/s"                        /> 
     195         <field id="taum"         long_name="wind stress module"                    standard_name="magnitude_of_surface_downward_stress"                                 unit="N/m2"                           /> 
     196         <field id="wspd"         long_name="wind speed module"                     standard_name="wind_speed"                                                           unit="m/s"                            /> 
    157197          
    158     <!-- * variable relative to atmospheric pressure forcing : available with ln_apr_dyn --> 
    159     <field id="ssh_ib"       long_name="Inverse barometer sea surface height"                         unit="m"        /> 
    160     
     198         <!-- * variable relative to atmospheric pressure forcing : available with ln_apr_dyn --> 
     199         <field id="ssh_ib"       long_name="Inverse barometer sea surface height"  standard_name="sea_surface_height_correction_due_to_air_pressure_at_low_frequency"   unit="m"        /> 
     200 
     201         <!-- * variable related to ice shelf forcing * --> 
     202         <field id="fwfisf"       long_name="Ice shelf melting"                                            unit="Kg/m2/s"  /> 
     203         <field id="qisf"         long_name="Ice Shelf Heat Flux"                                          unit="W/m2"     /> 
     204         <field id="isfgammat"    long_name="transfert coefficient for isf (temperature) "                 unit="m/s"      /> 
     205         <field id="isfgammas"    long_name="transfert coefficient for isf (salinity)    "                 unit="m/s"      /> 
     206    <field id="stbl"         long_name="salinity in the Losh tbl                    "                 unit="PSU"      /> 
     207    <field id="ttbl"         long_name="temperature in the Losh tbl                 "                 unit="C"        /> 
     208    <field id="utbl"         long_name="zonal current in the Losh tbl at T point    "                 unit="m/s"      /> 
     209    <field id="vtbl"         long_name="merid current in the Losh tbl at T point    "                 unit="m/s"      /> 
     210    <field id="thermald"     long_name="thermal driving of ice shelf melting        "                 unit="C"        /> 
     211    <field id="tfrz"         long_name="top freezing point (used to compute melt)   "                 unit="C"        /> 
     212    <field id="tinsitu"      long_name="top insitu temperature (used to cmpt melt)  "                 unit="C"        /> 
     213    <field id="ustar"        long_name="ustar at T point used in ice shelf melting  "                 unit="m/s"      /> 
     214 
    161215         <!-- *_oce variables available with ln_blk_clio or ln_blk_core --> 
    162          <field id="qlw_oce"      long_name="Longwave Downward Heat Flux over open ocean"                  unit="W/m2"     /> 
    163          <field id="qsb_oce"      long_name="Sensible Downward Heat Flux over open ocean"                  unit="W/m2"     /> 
    164          <field id="qla_oce"      long_name="Latent Downward Heat Flux over open ocean"                    unit="W/m2"     /> 
    165          <field id="qhc_oce"      long_name="Downward Heat Content of E-P over open ocean"                 unit="W/m2"     /> 
    166          <field id="taum_oce"     long_name="wind stress module over open ocean"                           unit="N/m2"     /> 
    167  
    168          <!-- available key_coupled --> 
    169          <field id="snow_ao_cea"   long_name="Snow over ice-free ocean (cell average)"                     unit="kg/m2/s"  /> 
    170          <field id="snow_ai_cea"   long_name="Snow over sea-ice (cell average)"                            unit="kg/m2/s"  /> 
    171          <field id="subl_ai_cea"   long_name="Sublimation over sea-ice (cell average)"                     unit="kg/m2/s"  /> 
    172          <field id="icealb_cea"    long_name="Ice albedo (cell average)"                                   unit="1"        /> 
    173          <field id="calving"       long_name="Calving"                                                     unit="kg/m2/s"  /> 
    174          <!-- available if key_coupled + conservative method --> 
    175          <field id="rain"          long_name="Liquid precipitation"                                        unit="Kg/m2/s"  /> 
    176          <field id="evap_ao_cea"   long_name="Evaporation over ice-free ocean (cell average)"              unit="kg/m2/s"  /> 
    177          <!-- variables available with key_diaar5 --> 
    178          <field id="isnwmlt_cea"   long_name="Snow over Ice melting (cell average)"                        unit="kg/m2/s"  /> 
    179          <field id="fsal_virt_cea" long_name="Virtual salt flux due to ice formation (cell average)"       unit="kg/m2/s"  /> 
    180          <field id="fsal_real_cea" long_name="Real salt flux due to ice formation (cell average)"          unit="kg/m2/s"  /> 
    181          <field id="hflx_rain_cea" long_name="heat flux due to rainfall"                                   unit="W/m2"     /> 
    182          <field id="hflx_evap_cea" long_name="heat flux due to evaporation"                                unit="W/m2"     /> 
    183          <field id="hflx_snow_cea" long_name="heat flux due to snow falling over ice-free ocean"           unit="W/m2"     /> 
    184          <field id="hflx_ice_cea"  long_name="heat flux due to ice thermodynamics"                         unit="W/m2"     /> 
    185          <field id="hflx_rnf_cea"  long_name="heat flux due to runoffs"                                    unit="W/m2"     /> 
    186          <field id="hflx_cal_cea"  long_name="heat flux due to calving"                                    unit="W/m2"     /> 
    187          <field id="bicemel_cea"   long_name="Rate of Melt at Sea Ice Base (cell average)"                 unit="kg/m2/s"  /> 
    188          <field id="licepro_cea"   long_name="Lateral Sea Ice Growth Rate (cell average)"                  unit="kg/m2/s"  /> 
    189          <field id="snowmel_cea"   long_name="Snow Melt Rate (cell average)"                               unit="kg/m2/s"  /> 
    190          <field id="sntoice_cea"   long_name="Snow-Ice Formation Rate (cell average)"                      unit="kg/m2/s"  /> 
    191          <field id="ticemel_cea"      long_name="Rate of Melt at Upper Surface of Sea Ice (cell average)"     unit="kg/m2/s"  /> 
    192  
    193     <!-- ice fields --> 
    194  
    195          <field id="ice_cover"    long_name="Ice fraction"                                                 unit="1"        /> 
    196  
    197          <field id="qsr_ai_cea"   long_name="Air-Ice downward solar heat flux (cell average)"              unit="W/m2"     /> 
    198          <field id="qns_ai_cea"   long_name="Air-Ice downward non-solar heat flux (cell average)"          unit="W/m2"     /> 
    199          <field id="qla_ai_cea"   long_name="Air-Ice downward Latent heat flux (cell average)"             unit="W/m2"     /> 
     216         <field id="qlw_oce"      long_name="Longwave Downward Heat Flux over open ocean"  standard_name="surface_net_downward_longwave_flux"   unit="W/m2"  /> 
     217         <field id="qsb_oce"      long_name="Sensible Downward Heat Flux over open ocean"  standard_name="surface_downward_sensible_heat_flux"  unit="W/m2"  /> 
     218         <field id="qla_oce"      long_name="Latent Downward Heat Flux over open ocean"    standard_name="surface_downward_latent_heat_flux"    unit="W/m2"  /> 
     219         <field id="qemp_oce"     long_name="Downward Heat Flux from E-P over open ocean"                                                       unit="W/m2"  /> 
     220         <field id="taum_oce"     long_name="wind stress module over open ocean"           standard_name="magnitude_of_surface_downward_stress" unit="N/m2"  /> 
     221 
     222         <!-- available key_oasis3 --> 
     223         <field id="snow_ao_cea"  long_name="Snow over ice-free ocean (cell average)"   standard_name="snowfall_flux"                             unit="kg/m2/s"  /> 
     224         <field id="snow_ai_cea"  long_name="Snow over sea-ice (cell average)"          standard_name="snowfall_flux"                             unit="kg/m2/s"  /> 
     225         <field id="subl_ai_cea"  long_name="Sublimation over sea-ice (cell average)"   standard_name="surface_snow_and_ice_sublimation_flux"     unit="kg/m2/s"  /> 
     226         <field id="icealb_cea"   long_name="Ice albedo (cell average)"                 standard_name="sea_ice_albedo"                            unit="1"        /> 
     227         <field id="calving_cea"  long_name="Calving"                                   standard_name="water_flux_into_sea_water_from_icebergs"   unit="kg/m2/s"  /> 
     228 
     229         <!-- available if key_oasis3 + conservative method --> 
     230         <field id="rain"          long_name="Liquid precipitation"                                     standard_name="rainfall_flux"                                                                 unit="kg/m2/s"  /> 
     231         <field id="evap_ao_cea"   long_name="Evaporation over ice-free ocean (cell average)"           standard_name="water_evaporation_flux"                                                        unit="kg/m2/s"  /> 
     232         <field id="isnwmlt_cea"   long_name="Snow over Ice melting (cell average)"                     standard_name="surface_snow_melt_flux"                                                        unit="kg/m2/s"  /> 
     233         <field id="fsal_virt_cea" long_name="Virtual salt flux due to ice formation (cell average)"    standard_name="virtual_salt_flux_into_sea_water_due_to_sea_ice_thermodynamics"                unit="kg/m2/s"  /> 
     234         <field id="fsal_real_cea" long_name="Real salt flux due to ice formation (cell average)"       standard_name="downward_sea_ice_basal_salt_flux"                                              unit="kg/m2/s"  /> 
     235         <field id="hflx_rain_cea" long_name="heat flux due to rainfall"                                standard_name="temperature_flux_due_to_rainfall_expressed_as_heat_flux_into_sea_water"        unit="W/m2"     /> 
     236         <field id="hflx_evap_cea" long_name="heat flux due to evaporation"                             standard_name="temperature_flux_due_to_evaporation_expressed_as_heat_flux_out_of_sea_water"   unit="W/m2"     /> 
     237         <field id="hflx_snow_cea" long_name="heat flux due to snow falling over ice-free ocean"        standard_name="heat_flux_into_sea_water_due_to_snow_thermodynamics"                           unit="W/m2"     /> 
     238         <field id="hflx_ice_cea"  long_name="heat flux due to ice thermodynamics"                      standard_name="heat_flux_into_sea_water_due_to_sea_ice_thermodynamics"                        unit="W/m2"     /> 
     239         <field id="hflx_rnf_cea"  long_name="heat flux due to runoffs"                                 standard_name="temperature_flux_due_to_runoff_expressed_as_heat_flux_into_sea_water"          unit="W/m2"     /> 
     240         <field id="hflx_cal_cea"  long_name="heat flux due to calving"                                 standard_name="heat_flux_into_sea_water_due_to_iceberg_thermodynamics"                        unit="W/m2"     /> 
     241         <field id="bicemel_cea"   long_name="Rate of Melt at Sea Ice Base (cell average)"              standard_name="tendency_of_sea_ice_amount_due_to_basal_melting"                               unit="kg/m2/s"  /> 
     242         <field id="licepro_cea"   long_name="Lateral Sea Ice Growth Rate (cell average)"               standard_name="tendency_of_sea_ice_amount_due_to_lateral_growth_of_ice_floes"                 unit="kg/m2/s"  /> 
     243         <field id="snowmel_cea"   long_name="Snow Melt Rate (cell average)"                            standard_name="surface_snow_melt_flux"                                                        unit="kg/m2/s"  /> 
     244         <field id="sntoice_cea"   long_name="Snow-Ice Formation Rate (cell average)"                   standard_name="tendency_of_sea_ice_amount_due_to_snow_conversion"                             unit="kg/m2/s"  /> 
     245         <field id="ticemel_cea"   long_name="Rate of Melt at Upper Surface of Sea Ice (cell average)"  standard_name="tendency_of_sea_ice_amount_due_to_surface_melting"                             unit="kg/m2/s"  /> 
     246 
     247         <!-- ice fields --> 
     248         <field id="ice_cover"    long_name="Ice fraction"                                                 standard_name="sea_ice_area_fraction"                              unit="1"            /> 
     249 
     250         <field id="qsr_ai_cea"   long_name="Air-Ice downward solar heat flux (cell average)"              standard_name="surface_downwelling_shortwave_flux_in_air"          unit="W/m2"         /> 
     251         <field id="qns_ai_cea"   long_name="Air-Ice downward non-solar heat flux (cell average)"                                                                             unit="W/m2"         /> 
     252         <field id="qla_ai_cea"   long_name="Air-Ice downward Latent heat flux (cell average)"             standard_name="surface_downward_latent_heat_flux"                  unit="W/m2"         /> 
    200253          
    201          <field id="qsr_io_cea"   long_name="Ice-Oce downward solar heat flux (cell average)"              unit="W/m2"     /> 
    202          <field id="qns_io_cea"   long_name="Ice-Oce downward non-solar heat flux (cell average)"          unit="W/m2"     /> 
     254         <field id="qsr_io_cea"   long_name="Ice-Oce downward solar heat flux (cell average)"              standard_name="net_downward_shortwave_flux_at_sea_water_surface"   unit="W/m2"         /> 
     255         <field id="qns_io_cea"   long_name="Ice-Oce downward non-solar heat flux (cell average)"                                                                             unit="W/m2"         /> 
    203256          
    204          <field id="snowthic_cea" long_name="Snow thickness (cell average)"                                unit="m"        /> 
    205          <field id="icethic_cea"  long_name="Ice thickness (cell average)"                                 unit="m"        /> 
    206          <field id="iceprod_cea"  long_name="Ice production (cell average)"                                unit="m/s"      /> 
     257         <field id="snowthic_cea" long_name="Snow thickness (cell average)"                                standard_name="surface_snow_thickness"                             unit="m"            /> 
     258         <field id="icethic_cea"  long_name="Ice thickness (cell average)"                                 standard_name="sea_ice_thickness"                                  unit="m"            /> 
     259         <field id="iceprod_cea"  long_name="Ice production (cell average)"                                                                                                   unit="m/s"          /> 
     260         <field id="iiceconc"     long_name="Ice concentration"                                            standard_name="sea_ice_area_fraction"                              unit="1"            /> 
    207261          
    208          <field id="ice_pres"     long_name="Ice presence"                                                 unit="-"        /> 
    209          <field id="ist_cea"      long_name="Ice surface temperature (cell average)"                       unit="degC"     /> 
    210          <field id="ist_ipa"      long_name="Ice surface temperature (ice presence average)"               unit="degC"     />       
    211          <field id="uice_ipa"     long_name="Ice velocity along i-axis at I-point (ice presence average)"  unit="m/s"      />       
    212          <field id="vice_ipa"     long_name="Ice velocity along j-axis at I-point (ice presence average)"  unit="m/s"      />       
     262         <field id="ice_pres"     long_name="Ice presence"                                                                                                                    unit=""             /> 
     263         <field id="ist_cea"      long_name="Ice surface temperature (cell average)"                       standard_name="surface_temperature"                                unit="degC"         /> 
     264         <field id="ist_ipa"      long_name="Ice surface temperature (ice presence average)"               standard_name="surface_temperature"                                unit="degC"         />       
     265         <field id="uice_ipa"     long_name="Ice velocity along i-axis at I-point (ice presence average)"  standard_name="sea_ice_x_velocity"                                 unit="m/s"          />       
     266         <field id="vice_ipa"     long_name="Ice velocity along j-axis at I-point (ice presence average)"  standard_name="sea_ice_y_velocity"                                 unit="m/s"          />       
    213267          
    214          <field id="utau_ice"     long_name="Wind stress along i-axis over the ice at i-point"             unit="N/m2"     /> 
    215          <field id="vtau_ice"     long_name="Wind stress along j-axis over the ice at i-point"             unit="N/m2"     /> 
     268         <field id="utau_ice"     long_name="Wind stress along i-axis over the ice at i-point"             standard_name="surface_downward_x_stress"                          unit="N/m2"         /> 
     269         <field id="vtau_ice"     long_name="Wind stress along j-axis over the ice at i-point"             standard_name="surface_downward_y_stress"                          unit="N/m2"         /> 
    216270          
    217          <field id="u_imasstr"    long_name="Sea-ice mass transport along i-axis"                          unit="kg/s"     /> 
    218          <field id="v_imasstr"    long_name="Sea-ice mass transport along j-axis"                          unit="kg/s"     /> 
    219          <field id="emp_x_sst"    long_name="Concentration/Dilution term on SST"                           unit="kgC/m2/s" /> 
    220          <field id="emp_x_sss"    long_name="Concentration/Dilution term on SSS"                         unit="kgPSU/m2/s" />         
    221           
    222           
    223          <field id="iceconc"      long_name="ice concentration"                                            unit="%"        /> 
    224          <field id="uice_ipa"     long_name="Ice velocity along i-axis at I-point (ice presence average)"  unit="m/s"      /> 
    225          <field id="vice_ipa"     long_name="Ice velocity along j-axis at I-point (ice presence average)"  unit="m/s"      /> 
    226           <field id="isst"         long_name="sea surface temperature"                                      unit="degC"     /> 
    227          <field id="isss"         long_name="sea surface salinity"                                         unit="psu"      />  
    228          <field id="qt_oce"       long_name="total flux at ocean surface"                                  unit="W/m2"     /> 
    229          <field id="qsr_oce"      long_name="solar heat flux at ocean surface"                             unit="W/m2"     /> 
    230          <field id="qns_oce"      long_name="non-solar heat flux at ocean surface"                         unit="W/m2"     /> 
    231          <field id="qt_ice"       long_name="total flux at ice surface"                                    unit="W/m2"     /> 
    232          <field id="qsr_ice"      long_name="solar heat flux at ice surface"                               unit="W/m2"     /> 
    233          <field id="qns_ice"      long_name="non-solar heat flux at ice surface"                           unit="W/m2"     /> 
    234          <field id="qtr_ice"      long_name="solar heat flux transmitted thru the ice"                     unit="W/m2"     /> 
    235          <field id="utau_ice"     long_name="Wind stress along i-axis over the ice at i-point"             unit="N/m2"     /> 
    236          <field id="vtau_ice"     long_name="Wind stress along j-axis over the ice at i-point"             unit="N/m2"     /> 
    237          <field id="micesalt"     long_name="Mean ice salinity"                                            unit="psu"      /> 
    238          <field id="miceage"      long_name="Mean ice age"                                                 unit="years"    /> 
     271         <field id="u_imasstr"    long_name="Sea-ice mass transport along i-axis"                          standard_name="sea_ice_x_transport"                                unit="kg/s"         /> 
     272         <field id="v_imasstr"    long_name="Sea-ice mass transport along j-axis"                          standard_name="sea_ice_y_transport"                                unit="kg/s"         /> 
     273         <field id="emp_x_sst"    long_name="Concentration/Dilution term on SST"                                                                                              unit="kg*degC/m2/s" /> 
     274         <field id="emp_x_sss"    long_name="Concentration/Dilution term on SSS"                                                                                              unit="kg*1e-3/m2/s" />         
     275        
     276         <field id="iceconc"      long_name="ice concentration"                                            standard_name="sea_ice_area_fraction"                              unit="%"            /> 
     277          <field id="isst"         long_name="sea surface temperature"                                      standard_name="sea_surface_temperature"                            unit="degC"         /> 
     278         <field id="isss"         long_name="sea surface salinity"                                         standard_name="sea_surface_salinity"                               unit="1e-3"         />  
     279         <field id="qt_oce"       long_name="total flux at ocean surface"                                  standard_name="surface_downward_heat_flux_in_sea_water"            unit="W/m2"         /> 
     280         <field id="qsr_oce"      long_name="solar heat flux at ocean surface"                             standard_name="net_downward_shortwave_flux_at_sea_water_surface"   unit="W/m2"         /> 
     281         <field id="qns_oce"      long_name="non-solar heat flux at ocean surface"                                                                                            unit="W/m2"         /> 
     282         <field id="qt_ice"       long_name="total heat flux at ice surface: sum over categories"          standard_name="surface_downward_heat_flux_in_air"                  unit="W/m2"         /> 
     283         <field id="qsr_ice"      long_name="solar heat flux at ice surface: sum over categories"          standard_name="surface_downwelling_shortwave_flux_in_air"          unit="W/m2"         /> 
     284         <field id="qns_ice"      long_name="non-solar heat flux at ice surface: sum over categories"                                                                         unit="W/m2"         /> 
     285         <field id="qtr_ice"      long_name="solar heat flux transmitted through ice: sum over categories"                                                                    unit="W/m2"         /> 
     286         <field id="qemp_ice"     long_name="Downward Heat Flux from E-P over ice"                                                                                            unit="W/m2"         /> 
     287         <field id="micesalt"     long_name="Mean ice salinity"                                                                                                               unit="1e-3"         /> 
     288         <field id="miceage"      long_name="Mean ice age"                                                                                                                    unit="years"        /> 
    239289 
    240290         <field id="iceage_cat"   long_name="Ice age for categories"                                       unit="days"   axis_ref="ncatice" /> 
    … …  
    242292         <field id="icethic_cat"  long_name="Ice thickness for categories"                                 unit="m"      axis_ref="ncatice" /> 
    243293         <field id="snowthic_cat" long_name="Snow thicknessi for categories"                               unit="m"      axis_ref="ncatice" /> 
    244          <field id="salinity_cat" long_name="Sea-Ice Bulk salinity for categories"                         unit="ppt"    axis_ref="ncatice" /> 
     294         <field id="salinity_cat" long_name="Sea-Ice Bulk salinity for categories"                         unit="g/kg"   axis_ref="ncatice" /> 
    245295         <field id="brinevol_cat" long_name="Brine volume for categories"                                  unit="%"      axis_ref="ncatice" /> 
     296         <field id="icetemp_cat"  long_name="Ice temperature for categories"                               unit="degC"   axis_ref="ncatice" /> 
     297         <field id="snwtemp_cat"  long_name="Snow temperature for categories"                              unit="degC"   axis_ref="ncatice" /> 
    246298 
    247299         <field id="micet"        long_name="Mean ice temperature"                                         unit="degC"     /> 
    248          <field id="icehc"        long_name="ice total heat content"                                       unit="10^9J"   />  
     300         <field id="icehc"        long_name="ice total heat content"                                       unit="10^9J"    />  
    249301         <field id="isnowhc"      long_name="snow total heat content"                                      unit="10^9J"    /> 
    250302         <field id="icest"        long_name="ice surface temperature"                                      unit="degC"     /> 
    … …  
    253305         <field id="icestr"       long_name="ice strength"                                                 unit="N/m"      /> 
    254306         <field id="icevel"       long_name="ice velocity"                                                 unit="m/s"      /> 
    255          <field id="idive"        long_name="divergence"                                                   unit="10-8s-1"  /> 
    256          <field id="ishear"       long_name="shear"                                                        unit="10-8s-1"  /> 
    257          <field id="icevolu"      long_name="ice volume"                                                   unit="m"      /> 
    258          <field id="snowvol"      long_name="snow volume"                                                  unit="m"      /> 
    259  
    260          <field id="icetrp"       long_name="ice volume transport"                                         unit="m/day"   /> 
    261          <field id="snwtrp"       long_name="snw volume transport"                                         unit="m/day"   /> 
    262          <field id="deitrp"       long_name="advected ice enhalpy"                                         unit="W/m2"   /> 
    263          <field id="destrp"       long_name="advected snw enhalpy"                                         unit="W/m2"   /> 
    264  
    265          <field id="sfxbri"       long_name="brine salt flux"                                              unit="psu*kg/m2/day" /> 
    266          <field id="sfxdyn"       long_name="salt flux from ridging rafting"                               unit="psu*kg/m2/day" /> 
    267          <field id="sfxres"       long_name="salt flux from lipupdate (resultant)"                         unit="psu*kg/m2/day" /> 
    268          <field id="sfxbog"       long_name="salt flux from bot growth"                                    unit="psu*kg/m2/day" /> 
    269          <field id="sfxbom"       long_name="salt flux from bot melt"                                      unit="psu*kg/m2/day" /> 
    270          <field id="sfxsum"       long_name="salt flux from surf melt"                                     unit="psu*kg/m2/day" /> 
    271          <field id="sfxsni"       long_name="salt flux from snow-ice formation"                            unit="psu*kg/m2/day" /> 
    272          <field id="sfxopw"       long_name="salt flux from open water ice formation"                      unit="psu*kg/m2/day" /> 
    273          <field id="sfx"          long_name="salt flux total"                                              unit="psu*kg/m2/day" /> 
     307         <field id="idive"        long_name="divergence"                                                   unit="1e-8s-1"  /> 
     308         <field id="ishear"       long_name="shear"                                                        unit="1e-8s-1"  /> 
     309         <field id="icevolu"      long_name="ice volume"                                                   unit="m"        /> 
     310         <field id="snowvol"      long_name="snow volume"                                                  unit="m"        /> 
     311 
     312         <field id="icetrp"       long_name="ice volume transport"                                         unit="m/day"          /> 
     313         <field id="snwtrp"       long_name="snw volume transport"                                         unit="m/day"          /> 
     314         <field id="saltrp"       long_name="salt content transport"                                       unit="1e-3*kg/m2/day" /> 
     315         <field id="deitrp"       long_name="advected ice enthalpy"                                        unit="W/m2"           /> 
     316         <field id="destrp"       long_name="advected snw enthalpy"                                        unit="W/m2"           /> 
     317 
     318         <field id="sfxbri"       long_name="brine salt flux"                                              unit="1e-3*kg/m2/day" /> 
     319         <field id="sfxdyn"       long_name="salt flux from ridging rafting"                               unit="1e-3*kg/m2/day" /> 
     320         <field id="sfxres"       long_name="salt flux from lipupdate (resultant)"                         unit="1e-3*kg/m2/day" /> 
     321         <field id="sfxbog"       long_name="salt flux from bot growth"                                    unit="1e-3*kg/m2/day" /> 
     322         <field id="sfxbom"       long_name="salt flux from bot melt"                                      unit="1e-3*kg/m2/day" /> 
     323         <field id="sfxsum"       long_name="salt flux from surf melt"                                     unit="1e-3*kg/m2/day" /> 
     324         <field id="sfxsni"       long_name="salt flux from snow-ice formation"                            unit="1e-3*kg/m2/day" /> 
     325         <field id="sfxopw"       long_name="salt flux from open water ice formation"                      unit="1e-3*kg/m2/day" /> 
     326         <field id="sfx"          long_name="salt flux total"                                              unit="1e-3*kg/m2/day" /> 
    274327 
    275328         <field id="vfxbog"       long_name="daily bottom thermo ice prod."                                unit="m/day"   /> 
    … …  
    285338         <field id="vfxspr"       long_name="snw precipitation on ice"                                     unit="m/day"   /> 
    286339 
    287          <field id="hfxsum"   long_name="heat fluxes causing surface ice melt"            unit="W/m2"  /> 
    288          <field id="hfxbom"   long_name="heat fluxes causing bottom ice melt"             unit="W/m2"  /> 
    289          <field id="hfxbog"   long_name="heat fluxes causing bottom ice growth"           unit="W/m2"  /> 
    290          <field id="hfxdif"   long_name="heat fluxes causing ice temperature change"      unit="W/m2"  /> 
    291          <field id="hfxopw"   long_name="heat fluxes causing open water ice formation"    unit="W/m2"  /> 
    292          <field id="hfxsnw"   long_name="heat fluxes causing snow melt"                   unit="W/m2"  /> 
    293          <field id="hfxerr"   long_name="heat fluxes error after heat diffusion"          unit="W/m2"  /> 
    294          <field id="hfxerr_rem" long_name="heat fluxes error after remapping"             unit="W/m2"  /> 
    295          <field id="hfxout"   long_name="non solar heat fluxes received by the ocean"     unit="W/m2"  /> 
    296          <field id="hfxin"    long_name="total     heat fluxes at the ice surface"        unit="W/m2"  /> 
    297  
    298     <!-- heat flux associated with mass exchange --> 
    299          <field id="hfxthd"   long_name="heat fluxes from ice-ocean mass exchange during thermo"              unit="W/m2"  /> 
    300          <field id="hfxdyn"   long_name="heat fluxes from ice-ocean mass exchange during dynamic"             unit="W/m2"  /> 
    301          <field id="hfxres"   long_name="heat fluxes from ice-ocean mass exchange during resultant"           unit="W/m2"  /> 
    302          <field id="hfxsub"   long_name="heat fluxes from ice-atm. mass exchange during sublimation"          unit="W/m2"  /> 
    303          <field id="hfxspr"   long_name="heat fluxes from ice-atm. mass exchange during snow precip"          unit="W/m2" /> 
    304  
    305     <!-- diags --> 
    306          <field id="hfxdhc"    long_name="Heat content variation in snow and ice"   unit="W/m2" /> 
    307          <field id="hfxtur"    long_name="turbulent heat flux at the ice base"      unit="W/m2"  /> 
     340         <field id="afxtot"       long_name="area tendency (total)"                                        unit="day-1"   /> 
     341         <field id="afxdyn"       long_name="area tendency (dynamics)"                                     unit="day-1"   /> 
     342         <field id="afxthd"       long_name="area tendency (thermo)"                                       unit="day-1"   /> 
     343 
     344         <field id="hfxsum"       long_name="heat fluxes causing surface ice melt"                         unit="W/m2"  /> 
     345         <field id="hfxbom"       long_name="heat fluxes causing bottom ice melt"                          unit="W/m2"  /> 
     346         <field id="hfxbog"       long_name="heat fluxes causing bottom ice growth"                        unit="W/m2"  /> 
     347         <field id="hfxdif"       long_name="heat fluxes causing ice temperature change"                   unit="W/m2"  /> 
     348         <field id="hfxopw"       long_name="heat fluxes causing open water ice formation"                 unit="W/m2"  /> 
     349         <field id="hfxsnw"       long_name="heat fluxes causing snow melt"                                unit="W/m2"  /> 
     350         <field id="hfxerr"       long_name="heat fluxes error after heat diffusion"                       unit="W/m2"  /> 
     351         <field id="hfxerr_rem"   long_name="heat fluxes error after remapping"                            unit="W/m2"  /> 
     352         <field id="hfxout"       long_name="total heat fluxes received by the ocean"                      unit="W/m2"  /> 
     353         <field id="hfxin"        long_name="total heat fluxes at the ice/ocean surface"                   unit="W/m2"  /> 
     354 
     355         <!-- heat flux associated with mass exchange --> 
     356         <field id="hfxthd"       long_name="heat fluxes from ice-ocean mass exchange during thermo"       unit="W/m2"  /> 
     357         <field id="hfxdyn"       long_name="heat fluxes from ice-ocean mass exchange during dynamic"      unit="W/m2"  /> 
     358         <field id="hfxres"       long_name="heat fluxes from ice-ocean mass exchange during resultant"    unit="W/m2"  /> 
     359         <field id="hfxsub"       long_name="heat fluxes from ice-atm. mass exchange during sublimation"   unit="W/m2"  /> 
     360         <field id="hfxspr"       long_name="heat fluxes from ice-atm. mass exchange during snow precip"   unit="W/m2"  /> 
     361 
     362         <!-- diags --> 
     363         <field id="hfxdhc"       long_name="Heat content variation in snow and ice"                       unit="W/m2" /> 
     364         <field id="hfxtur"       long_name="turbulent heat flux at the ice base"                          unit="W/m2" /> 
     365    <!-- sbcssm variables --> 
     366         <field id="sst_m"    unit="degC" /> 
     367         <field id="sss_m"    unit="psu"  /> 
     368         <field id="ssu_m"    unit="m/s"  /> 
     369         <field id="ssv_m"    unit="m/s"  /> 
     370         <field id="ssh_m"    unit="m"    /> 
     371         <field id="e3t_m"    unit="m"    /> 
     372         <field id="frq_m"    unit="-"    /> 
    308373 
    309374      </field_group> 
    … …  
    312377       
    313378      <field_group id="grid_U"   grid_ref="grid_U_2D"> 
    314          <field id="utau"         long_name="Wind Stress along i-axis"                    unit="N/m2" /> 
    315          <field id="suoce"        long_name="ocean surface current along i-axis"          unit="m/s"  /> 
    316          <field id="uoce"         long_name="ocean current along i-axis"                  unit="m/s"  grid_ref="grid_U_3D" /> 
    317          <field id="uocetr_eff"   long_name="Effective ocean transport along i-axis"      unit="m3/s" grid_ref="grid_U_3D" /> 
    318          <field id="uocet"        long_name="ocean transport along i-axis times temperature" unit="degC.m/s" grid_ref="grid_U_3D" /> 
    319          <field id="uoces"        long_name="ocean transport along i-axis times salinity"    unit="psu.m/s"  grid_ref="grid_U_3D" /> 
     379         <field id="e3u"          long_name="U-cell thickness"                                       standard_name="cell_thickness"              unit="m"          grid_ref="grid_U_3D" /> 
     380         <field id="utau"         long_name="Wind Stress along i-axis"                               standard_name="surface_downward_x_stress"   unit="N/m2"                            /> 
     381         <field id="uoce"         long_name="ocean current along i-axis"                             standard_name="sea_water_x_velocity"        unit="m/s"        grid_ref="grid_U_3D" /> 
     382         <field id="uoce_e3u"     long_name="ocean current along i-axis  (thickness weighted)"                                                   unit="m/s"        grid_ref="grid_U_3D"  > uoce * e3u </field> 
     383         <field id="ssu"          long_name="ocean surface current along i-axis"                                                                 unit="m/s"                             /> 
     384         <field id="sbu"          long_name="ocean bottom current along i-axis"                                                                  unit="m/s"                             /> 
     385         <field id="ubar"         long_name="ocean barotropic current along i-axis"                                                              unit="m/s"                             /> 
     386         <field id="uocetr_eff"   long_name="Effective ocean transport along i-axis"                 standard_name="ocean_volume_x_transport"    unit="m3/s"       grid_ref="grid_U_3D" /> 
     387         <field id="uocet"        long_name="ocean transport along i-axis times temperature (CRS)"                                               unit="degC*m/s"   grid_ref="grid_U_3D" /> 
     388         <field id="uoces"        long_name="ocean transport along i-axis times salinity (CRS)"                                                  unit="1e-3*m/s"   grid_ref="grid_U_3D" /> 
     389 
     390         <!-- u-eddy coefficients (ldftra) --> 
     391         <field id="ahtu_2d"      long_name=" surface u-eddy diffusivity coefficient"   unit="m2/s or m4/s" /> 
     392         <field id="ahtu_3d"      long_name=" 3D u-EIV coefficient"                     unit="m2/s or m4/s"      grid_ref="grid_U_3D"/> 
     393         <field id="aeiu_2d"      long_name=" surface u-EIV coefficient"                unit="m2/s" /> 
     394         <field id="aeiu_3d"      long_name=" 3D u-EIV coefficient"                     unit="m2/s"              grid_ref="grid_U_3D"/> 
     395 
    320396         <!-- variables available with MLE --> 
    321          <field id="psiu_mle"     long_name="MLE streamfunction along i-axis"             unit="m3/s"  grid_ref="grid_U_3D"  /> 
    322          <!-- uoce_eiv: available with key_traldf_eiv and key_diaeiv --> 
    323          <field id="uoce_eiv"     long_name="EIV ocean current along i-axis"              unit="m/s"  grid_ref="grid_U_3D" /> 
     397         <field id="psiu_mle"     long_name="MLE streamfunction along i-axis"   unit="m3/s"   grid_ref="grid_U_3D" /> 
     398 
     399         <!-- uoce_eiv: available EIV --> 
     400         <field id="uoce_eiv"     long_name="EIV ocean current along i-axis"   standard_name="bolus_sea_water_x_velocity"   unit="m/s"   grid_ref="grid_U_3D" /> 
     401 
    324402         <!-- uoce_eiv: available with key_trabbl --> 
    325          <field id="uoce_bbl"     long_name="BBL ocean current along i-axis"              unit="m/s"  grid_ref="grid_U_3D" /> 
    326     <field id="ahu_bbl"      long_name="BBL diffusive flux along i-axis"             unit="m3/s" /> 
     403         <field id="uoce_bbl"     long_name="BBL ocean current along i-axis"    unit="m/s"  /> 
     404         <field id="ahu_bbl"      long_name="BBL diffusive flux along i-axis"   unit="m3/s" /> 
     405 
     406         <!-- variable for ice shelves --> 
     407         <field id="utbl"         long_name="zonal current in the Losh tbl"     unit="m/s" /> 
     408 
    327409         <!-- variables available with key_diaar5 --> 
    328          <field id="u_masstr"     long_name="ocean eulerian mass transport along i-axis"  unit="kg/s" grid_ref="grid_U_3D" /> 
    329          <field id="u_heattr"     long_name="ocean eulerian heat transport along i-axis"  unit="W"    /> 
    330          <field id="u_salttr"     long_name="ocean eulerian salt transport along i-axis"  unit="PSU*kg/s"    /> 
    331          <field id="ueiv_heattr"  long_name="ocean bolus heat transport along i-axis"     unit="W"    /> 
    332          <field id="udiff_heattr" long_name="ocean diffusion heat transport along i-axis" unit="W"    /> 
    333      </field_group> 
     410         <field id="u_masstr"     long_name="ocean eulerian mass transport along i-axis"    standard_name="ocean_mass_x_transport"                          unit="kg/s"        grid_ref="grid_U_3D" /> 
     411         <field id="u_heattr"     long_name="ocean eulerian heat transport along i-axis"    standard_name="ocean_heat_x_transport"                          unit="W"                                /> 
     412         <field id="u_salttr"     long_name="ocean eulerian salt transport along i-axis"    standard_name="ocean_salt_x_transport"                          unit="1e-3*kg/s"                        /> 
     413         <field id="ueiv_heattr"  long_name="ocean bolus heat transport along i-axis"       standard_name="ocean_heat_x_transport_due_to_bolus_advection"   unit="W"                                /> 
     414         <field id="udiff_heattr" long_name="ocean diffusion heat transport along i-axis"   standard_name="ocean_heat_x_transport_due_to_diffusion"         unit="W"                                /> 
     415      </field_group> 
    334416       
    335417      <!-- V grid --> 
    336418       
    337419      <field_group id="grid_V"   grid_ref="grid_V_2D"> 
    338          <field id="vtau"         long_name="Wind Stress along j-axis"                    unit="N/m2" /> 
    339          <field id="svoce"        long_name="ocean surface current along j-axis"          unit="m/s"  /> 
    340          <field id="voce"         long_name="ocean current along j-axis"                  unit="m/s"  grid_ref="grid_V_3D" /> 
    341          <field id="vocetr_eff"   long_name="Effective ocean transport along j-axis"      unit="m3/s" grid_ref="grid_V_3D" /> 
    342          <field id="vocet"        long_name="ocean transport along j-axis times temperature" unit="degC.m/s" grid_ref="grid_V_3D" /> 
    343          <field id="voces"        long_name="ocean transport along j-axis times salinity"    unit="psu.m/s"  grid_ref="grid_V_3D" /> 
     420         <field id="e3v"          long_name="V-cell thickness"                                       standard_name="cell_thickness"              unit="m"          grid_ref="grid_V_3D" /> 
     421         <field id="vtau"         long_name="Wind Stress along j-axis"                               standard_name="surface_downward_y_stress"   unit="N/m2"                            /> 
     422         <field id="voce"         long_name="ocean current along j-axis"                             standard_name="sea_water_y_velocity"        unit="m/s"        grid_ref="grid_V_3D" /> 
     423         <field id="voce_e3v"     long_name="ocean current along j-axis  (thickness weighted)"                                                   unit="m/s"        grid_ref="grid_V_3D"  > voce * e3v </field> 
     424         <field id="ssv"          long_name="ocean surface current along j-axis"                                                                 unit="m/s"                             /> 
     425         <field id="sbv"          long_name="ocean bottom current along j-axis"                                                                  unit="m/s"                             /> 
     426         <field id="vbar"         long_name="ocean barotropic current along j-axis"                                                              unit="m/s"                             /> 
     427         <field id="vocetr_eff"   long_name="Effective ocean transport along j-axis"                 standard_name="ocean_volume_y_transport"    unit="m3/s"       grid_ref="grid_V_3D" /> 
     428         <field id="vocet"        long_name="ocean transport along j-axis times temperature (CRS)"                                               unit="degC*m/s"   grid_ref="grid_V_3D" /> 
     429         <field id="voces"        long_name="ocean transport along j-axis times salinity (CRS)"                                                  unit="1e-3*m/s"   grid_ref="grid_V_3D" /> 
     430 
     431         <!-- v-eddy coefficients (ldftra, ldfdyn) --> 
     432         <field id="ahtv_2d"      long_name=" surface v-eddy diffusivity coefficient"     unit="m2/s or (m4/s)^1/2" /> 
     433         <field id="ahtv_3d"      long_name=" 3D v-eddy diffusivity coefficient"          unit="m2/s or (m4/s)^1/2"           grid_ref="grid_V_3D"/> 
     434         <field id="aeiv_2d"      long_name=" surface v-EIV coefficient"                  unit="m2/s" /> 
     435         <field id="aeiv_3d"      long_name=" 3D v-EIV coefficient"                       unit="m2/s"                         grid_ref="grid_V_3D" /> 
     436 
    344437         <!-- variables available with MLE --> 
    345          <field id="psiv_mle"     long_name="MLE streamfunction along j-axis"             unit="m3/s"  grid_ref="grid_V_3D"  /> 
    346          <!-- voce_eiv: available with key_traldf_eiv and key_diaeiv --> 
    347          <field id="voce_eiv"     long_name="EIV ocean current along j-axis"              unit="m/s"  grid_ref="grid_V_3D" /> 
     438         <field id="psiv_mle"     long_name="MLE streamfunction along j-axis"   unit="m3/s"   grid_ref="grid_V_3D" /> 
     439 
     440         <!-- voce_eiv: available with EIV --> 
     441         <field id="voce_eiv"     long_name="EIV ocean current along j-axis"   standard_name="bolus_sea_water_y_velocity"   unit="m/s"   grid_ref="grid_V_3D" /> 
     442 
    348443         <!-- voce_eiv: available with key_trabbl --> 
    349          <field id="voce_bbl"     long_name="BBL ocean current along j-axis"              unit="m/s"  grid_ref="grid_V_3D" /> 
    350     <field id="ahv_bbl"      long_name="BBL diffusive flux along j-axis"             unit="m3/s"                   /> 
     444         <field id="voce_bbl"     long_name="BBL ocean current along j-axis"    unit="m/s"  /> 
     445         <field id="ahv_bbl"      long_name="BBL diffusive flux along j-axis"   unit="m3/s" /> 
     446 
     447         <!-- variable for ice shelves --> 
     448         <field id="vtbl"         long_name="meridional current in the Losh tbl"   unit="m/s" /> 
     449 
    351450         <!-- variables available with key_diaar5 --> 
    352          <field id="v_masstr"     long_name="ocean eulerian mass transport along j-axis"  unit="kg/s" grid_ref="grid_V_3D" /> 
    353          <field id="v_heattr"     long_name="ocean eulerian heat transport along j-axis"  unit="W"     /> 
    354          <field id="v_salttr"     long_name="ocean eulerian salt transport along i-axis"  unit="PSU*kg/s"    /> 
    355          <field id="veiv_heattr"  long_name="ocean bolus heat transport along j-axis"     unit="W"     /> 
    356          <field id="vdiff_heattr" long_name="ocean diffusion heat transport along j-axis" unit="W"     /> 
     451         <field id="v_masstr"     long_name="ocean eulerian mass transport along j-axis"    standard_name="ocean_mass_y_transport"                          unit="kg/s"        grid_ref="grid_V_3D" /> 
     452         <field id="v_heattr"     long_name="ocean eulerian heat transport along j-axis"    standard_name="ocean_heat_y_transport"                          unit="W"                                /> 
     453         <field id="v_salttr"     long_name="ocean eulerian salt transport along i-axis"    standard_name="ocean_salt_y_transport"                          unit="1e-3*kg/s"                        /> 
     454         <field id="veiv_heattr"  long_name="ocean bolus heat transport along j-axis"       standard_name="ocean_heat_y_transport_due_to_bolus_advection"   unit="W"                                /> 
     455         <field id="vdiff_heattr" long_name="ocean diffusion heat transport along j-axis"   standard_name="ocean_heat_y_transport_due_to_diffusion"         unit="W"                                /> 
    357456      </field_group> 
    358457       
    … …  
    360459       
    361460      <field_group id="grid_W" grid_ref="grid_W_3D"> 
    362         <field id="woce"         long_name="ocean vertical velocity"                  unit="m/s"    /> 
    363         <field id="wocetr_eff"   long_name="effective ocean vertical transport"       unit="m3/s"   /> 
    364         <!-- woce_eiv: available with key_traldf_eiv and key_diaeiv --> 
    365         <field id="woce_eiv"     long_name="EIV ocean vertical velocity"              unit="m/s"    /> 
     461        <field id="e3w"          long_name="W-cell thickness"                     standard_name="cell_thickness"              unit="m"    /> 
     462        <field id="woce"         long_name="ocean vertical velocity"              standard_name="upward_sea_water_velocity"   unit="m/s"  /> 
     463        <field id="wocetr_eff"   long_name="effective ocean vertical transport"                                               unit="m3/s" /> 
     464 
     465        <!-- woce_eiv: available with EIV --> 
     466        <field id="woce_eiv"     long_name="EIV ocean vertical velocity"   standard_name="bolus_upward_sea_water_velocity"   unit="m/s" /> 
     467 
    366468        <!-- woce_eiv: available with key_trabbl_adv --> 
    367         <field id="avt"          long_name="vertical eddy diffusivity"                unit="m2/s"   /> 
    368         <field id="avm"          long_name="vertical eddy viscosity"                  unit="m2/s"   /> 
     469        <field id="avt"          long_name="vertical eddy diffusivity"   standard_name="ocean_vertical_heat_diffusivity"       unit="m2/s" /> 
     470        <field id="avm"          long_name="vertical eddy viscosity"     standard_name="ocean_vertical_momentum_diffusivity"   unit="m2/s" /> 
     471 
    369472        <!-- avs: available with key_zdfddm --> 
    370         <field id="avs"          long_name="salt vertical eddy diffusivity"           unit="m2/s"   /> 
     473        <field id="avs"          long_name="salt vertical eddy diffusivity"   standard_name="ocean_vertical_salt_diffusivity"   unit="m2/s" /> 
     474 
    371475        <!-- avt_evd and avm_evd: available with ln_zdfevd --> 
    372         <field id="avt_evd"      long_name="enhanced vertical diffusivity"            unit="m2/s"   /> 
    373         <field id="avm_evd"      long_name="enhanced vertical viscosity"              unit="m2/s"   /> 
     476        <field id="avt_evd"      long_name="convective enhancement of vertical diffusivity"   standard_name="ocean_vertical_tracer_diffusivity_due_to_convection"     unit="m2/s" /> 
     477        <field id="avm_evd"      long_name="convective enhancement of vertical viscosity"     standard_name="ocean_vertical_momentum_diffusivity_due_to_convection"   unit="m2/s" /> 
     478 
    374479        <!-- avt_tide: available with key_zdftmx --> 
    375         <field id="av_tide"      long_name="tidal vertical diffusivity"               unit="m2/s"   /> 
     480        <field id="av_tide"      long_name="tidal vertical diffusivity"   standard_name="ocean_vertical_tracer_diffusivity_due_to_tides"   unit="m2/s" /> 
     481 
    376482        <!-- variables available with key_diaar5 -->    
    377         <field id="w_masstr"     long_name="vertical mass trasport"                   unit="kg/s"   /> 
    378         <field id="w_masstr2"    long_name="square of vertical mass trasport"         unit="kg2/s2" /> 
     483        <field id="w_masstr"     long_name="vertical mass transport"             standard_name="upward_ocean_mass_transport"             unit="kg/s"   /> 
     484        <field id="w_masstr2"    long_name="square of vertical mass transport"   standard_name="square_of_upward_ocean_mass_transport"   unit="kg2/s2" /> 
     485 
     486        <!-- aht2d and  aht2d_eiv --> 
     487        <field id="aht2d"        long_name="lateral eddy diffusivity"       standard_name="ocean_tracer_xy_laplacian_diffusivity"      unit="m2/s"   grid_ref="grid_W_2D" /> 
     488        <field id="aht2d_eiv"    long_name="EIV lateral eddy diffusivity"   standard_name="ocean_tracer_bolus_laplacian_diffusivity"   unit="m2/s"   grid_ref="grid_W_2D" /> 
     489      </field_group> 
    379490         
    380         <!-- aht2d and  aht2d_eiv: available with key_traldf_eiv and key_traldf_c2d --> 
    381         <field id="aht2d"        long_name="lateral eddy diffusivity"                    unit="m2/s"   grid_ref="grid_W_2D" /> 
    382         <field id="aht2d_eiv"    long_name="EIV lateral eddy diffusivity"                unit="m2/s"   grid_ref="grid_W_2D"/> 
    383       </field_group> 
    384            
     491      <!-- F grid --> 
     492         <!-- f-eddy viscosity coefficients (ldfdyn) --> 
     493         <field id="ahmf_2d"      long_name=" surface f-eddy viscosity coefficient"   unit="m2/s or m4/s" /> 
     494         <field id="ahmf_3d"      long_name=" 3D      f-eddy viscosity coefficient"   unit="m2/s or m4/s"                           grid_ref="grid_T_3D"/> 
     495 
    385496      <!-- scalar variables available with key_diaar5 --> 
    386497 
    387498      <field_group id="scalar"  domain_ref="1point" > 
    388      <field id="voltot"     long_name="global mean volume"                         unit="m3"   /> 
    389      <field id="sshtot"     long_name="global mean ssh"                            unit="m"    /> 
    390      <field id="sshsteric"  long_name="global mean ssh steric"                     unit="m"    /> 
    391      <field id="sshthster"  long_name="global mean ssh thermosteric"               unit="m"    /> 
    392      <field id="masstot"    long_name="global mean mass"                           unit="kg"   /> 
    393      <field id="temptot"    long_name="global mean temperature"                    unit="degC" /> 
    394      <field id="saltot"     long_name="global mean salinity"                       unit="psu"  /> 
    395      <field id="fram_trans" long_name="Sea Ice Mass Transport Through Fram Strait" unit="kg/s" /> 
    396        <!-- available with ln_diahsb --> 
    397     <field id="bgtemper" long_name="global mean temperature variation"            unit="degC"/> 
    398     <field id="bgsaline" long_name="global mean salinity variation"               unit="psu"/> 
    399     <field id="bgheatco" long_name="global mean heat content variation"           unit="10^20J"/> 
    400     <field id="bgsaltco" long_name="global mean salt content variation"           unit="psu*km3" /> 
    401     <field id="bgvolssh" long_name="global mean volume variation (ssh)"           unit="km3"/> 
    402     <field id="bgvole3t" long_name="global mean volume variation (e3t)"           unit="km3"/> 
    403     <field id="bgfrcvol" long_name="global mean volume variation from forcing"    unit="km3"/> 
    404     <field id="bgfrctem" long_name="global mean forcing from heat content variation"   unit="degC"/> 
    405     <field id="bgfrcsal" long_name="global mean forcing salt content variation"        unit="psu"/> 
    406     <field id="bgmistem" long_name="global mean temperature error due to free surface" unit="degC"/> 
    407     <field id="bgmissal" long_name="global mean salinity error due to free surface"    unit="psu"/> 
    408       </field_group> 
     499         <field id="voltot"     long_name="global total volume"                          standard_name="sea_water_volume"                               unit="m3"   /> 
     500         <field id="sshtot"     long_name="global mean ssh"                              standard_name="global_average_sea_level_change"                unit="m"    /> 
     501         <field id="sshsteric"  long_name="global mean ssh steric"                       standard_name="global_average_steric_sea_level_change"         unit="m"    /> 
     502         <field id="sshthster"  long_name="global mean ssh thermosteric"                 standard_name="global_average_thermosteric_sea_level_change"   unit="m"    /> 
     503         <field id="masstot"    long_name="global total mass"                            standard_name="sea_water_mass"                                 unit="kg"   /> 
     504         <field id="temptot"    long_name="global mean temperature"                      standard_name="sea_water_potential_temperature"                unit="degC" /> 
     505         <field id="saltot"     long_name="global mean salinity"                         standard_name="sea_water_salinity"                             unit="1e-3" /> 
     506         <field id="fram_trans" long_name="Sea Ice Mass Transport Through Fram Strait"   standard_name="sea_ice_transport_across_line"                  unit="kg/s" /> 
     507 
     508          <!-- available with ln_diahsb --> 
     509       <field id="bgtemper"     long_name="drift in global mean temperature wrt timestep 1"                 standard_name="change_over_time_in_sea_water_potential_temperature"   unit="degC"     /> 
     510       <field id="bgsaline"     long_name="drift in global mean salinity wrt timestep 1"                    standard_name="change_over_time_in_sea_water_practical_salinity"      unit="1e-3"     /> 
     511       <field id="bgheatco"     long_name="drift in global mean heat content wrt timestep 1"                                                                                      unit="10^9J"    /> 
     512       <field id="bgsaltco"     long_name="drift in global mean salt content wrt timestep 1"                                                                                      unit="1e-3*m3"  /> 
     513       <field id="bgvolssh"     long_name="drift in global mean ssh volume wrt timestep 1"                                                                                        unit="km3"      /> 
     514         <field id="bgvole3t"     long_name="drift in global mean volume variation (e3t) wrt timestep 1"                                                                            unit="km3"      /> 
     515       <field id="bgvoltot"     long_name="drift in global mean volume wrt timestep 1"                                                                                            unit="km3"      /> 
     516         <!-- NOTE: No matching iom_put call --> 
     517       <field id="bgsshtot"     long_name="drift in global mean ssh wrt timestep 1"                         standard_name="global_average_sea_level_change"                       unit="m"        /> 
     518       <field id="bgfrcvol"     long_name="drift in global mean volume from forcing wrt timestep 1"                                                                               unit="km3"      /> 
     519       <field id="bgfrctem"     long_name="drift in global mean heat content from forcing wrt timestep 1"                                                                         unit="10^9J"    /> 
     520       <field id="bgfrcsal"     long_name="drift in global mean salt content from forcing wrt timestep 1"                                                                         unit="1e-3*km3" /> 
     521       <field id="bgmistem"     long_name="global mean temperature error due to free surface"                                                                                     unit="degC"     /> 
     522       <field id="bgmissal"     long_name="global mean salinity error due to free surface"                                                                                        unit="1e-3"     /> 
     523      </field_group> 
     524 
     525      <!-- LIM3 scalar variables --> 
    409526 
    410527      <field_group id="SBC_scalar"  domain_ref="1point" > 
    411528         <!-- available with ln_limdiaout --> 
    412     <field id="ibgvoltot"    long_name="global mean ice volume"                   unit="km3"   /> 
    413     <field id="sbgvoltot"    long_name="global mean snow volume"                  unit="km3"   /> 
    414     <field id="ibgarea"      long_name="global mean ice area"                     unit="km2"   /> 
    415     <field id="ibgsaline"    long_name="global mean ice salinity"                 unit="psu"   /> 
    416     <field id="ibgtemper"    long_name="global mean ice temperature"              unit="degC"   /> 
    417     <field id="ibgheatco"    long_name="global mean ice heat content"             unit="10^20J"   /> 
    418     <field id="sbgheatco"    long_name="global mean snow heat content"            unit="10^20J"   /> 
    419     <field id="ibgsaltco"    long_name="global mean ice salt content"             unit="psu*km3"   /> 
    420  
    421     <field id="ibgvfx"       long_name="global mean volume flux (emp)"               unit="m/day"   /> 
    422     <field id="ibgvfxbog"    long_name="global mean volume flux (bottom growth)"     unit="m/day"   /> 
    423     <field id="ibgvfxopw"    long_name="global mean volume flux (open water growth)" unit="m/day"   /> 
    424     <field id="ibgvfxsni"    long_name="global mean volume flux (snow-ice growth)"   unit="m/day"   /> 
    425     <field id="ibgvfxdyn"    long_name="global mean volume flux (dynamic growth)"    unit="m/day"   /> 
    426     <field id="ibgvfxbom"    long_name="global mean volume flux (bottom melt)"       unit="m/day"   /> 
    427     <field id="ibgvfxsum"    long_name="global mean volume flux (surface melt)"      unit="m/day"   /> 
    428     <field id="ibgvfxres"    long_name="global mean volume flux (resultant)"         unit="m/day"   /> 
    429     <field id="ibgvfxspr"    long_name="global mean volume flux (snow precip)"       unit="m/day"   /> 
    430     <field id="ibgvfxsnw"    long_name="global mean volume flux (snow melt)"         unit="m/day"   /> 
    431     <field id="ibgvfxsub"    long_name="global mean volume flux (snow sublimation)"  unit="m/day"   /> 
    432  
    433     <field id="ibgsfx"       long_name="global mean salt flux (total)"            unit="psu*m/day"   /> 
    434     <field id="ibgsfxbri"    long_name="global mean salt flux (brines)"           unit="psu*m/day"   /> 
    435     <field id="ibgsfxdyn"    long_name="global mean salt flux (dynamic)"          unit="psu*m/day"   /> 
    436     <field id="ibgsfxres"    long_name="global mean salt flux (resultant)"        unit="psu*m/day"   /> 
    437     <field id="ibgsfxbog"    long_name="global mean salt flux (thermo)"           unit="psu*m/day"   /> 
    438     <field id="ibgsfxopw"    long_name="global mean salt flux (thermo)"           unit="psu*m/day"   /> 
    439     <field id="ibgsfxsni"    long_name="global mean salt flux (thermo)"           unit="psu*m/day"   /> 
    440     <field id="ibgsfxbom"    long_name="global mean salt flux (thermo)"           unit="psu*m/day"   /> 
    441     <field id="ibgsfxsum"    long_name="global mean salt flux (thermo)"           unit="psu*m/day"   /> 
    442  
    443  
    444         <field id="ibghfxdhc"    long_name="Heat content variation in snow and ice"   unit="W" /> 
    445         <field id="ibghfxspr"    long_name="Heat content of snow precip"              unit="W" /> 
    446  
    447         <field id="ibghfxthd"   long_name="heat fluxes from ice-ocean exchange during thermo"              unit="W"  /> 
    448         <field id="ibghfxsum"   long_name="heat fluxes causing surface ice melt"              unit="W"  /> 
    449         <field id="ibghfxbom"   long_name="heat fluxes causing bottom ice melt"              unit="W"  /> 
    450         <field id="ibghfxbog"   long_name="heat fluxes causing bottom ice growth"              unit="W"  /> 
    451         <field id="ibghfxdif"   long_name="heat fluxes causing ice temperature change"              unit="W"  /> 
    452         <field id="ibghfxopw"   long_name="heat fluxes causing open water ice formation"              unit="W"  /> 
    453         <field id="ibghfxdyn"   long_name="heat fluxes from ice-ocean exchange during dynamic"             unit="W"  /> 
    454         <field id="ibghfxres"   long_name="heat fluxes from ice-ocean exchange during resultant"           unit="W"  /> 
    455         <field id="ibghfxsub"   long_name="heat fluxes from sublimation"                                   unit="W"  /> 
    456         <field id="ibghfxsnw"   long_name="heat fluxes from snow-ocean exchange"                           unit="W"  /> 
    457         <field id="ibghfxout"   long_name="non solar heat fluxes received by the ocean"                    unit="W"  /> 
    458         <field id="ibghfxin"    long_name="total heat fluxes at the ice surface"                           unit="W"  /> 
    459  
    460     <field id="ibgfrcvol"    long_name="global mean forcing volume (emp)"         unit="km3"      /> 
    461     <field id="ibgfrcsfx"    long_name="global mean forcing salt   (sfx)"         unit="psu*km3"   /> 
    462     <field id="ibgvolgrm"    long_name="global mean ice growth+melt volume"       unit="km3"      /> 
     529         <field id="ibgvoltot"    long_name="global mean ice volume"                                 unit="km3"        /> 
     530         <field id="sbgvoltot"    long_name="global mean snow volume"                                unit="km3"        /> 
     531         <field id="ibgarea"      long_name="global mean ice area"                                   unit="km2"        /> 
     532         <field id="ibgsaline"    long_name="global mean ice salinity"                               unit="1e-3"       /> 
     533         <field id="ibgtemper"    long_name="global mean ice temperature"                            unit="degC"       /> 
     534         <field id="ibgheatco"    long_name="global mean ice heat content"                           unit="10^20J"     /> 
     535         <field id="sbgheatco"    long_name="global mean snow heat content"                          unit="10^20J"     /> 
     536         <field id="ibgsaltco"    long_name="global mean ice salt content"                           unit="1e-3*km3"   /> 
     537 
     538         <field id="ibgvfx"       long_name="global mean volume flux (emp)"                          unit="m/day"      /> 
     539         <field id="ibgvfxbog"    long_name="global mean volume flux (bottom growth)"                unit="m/day"      /> 
     540         <field id="ibgvfxopw"    long_name="global mean volume flux (open water growth)"            unit="m/day"      /> 
     541         <field id="ibgvfxsni"    long_name="global mean volume flux (snow-ice growth)"              unit="m/day"      /> 
     542         <field id="ibgvfxdyn"    long_name="global mean volume flux (dynamic growth)"               unit="m/day"      /> 
     543         <field id="ibgvfxbom"    long_name="global mean volume flux (bottom melt)"                  unit="m/day"      /> 
     544         <field id="ibgvfxsum"    long_name="global mean volume flux (surface melt)"                 unit="m/day"      /> 
     545         <field id="ibgvfxres"    long_name="global mean volume flux (resultant)"                    unit="m/day"      /> 
     546         <field id="ibgvfxspr"    long_name="global mean volume flux (snow precip)"                  unit="m/day"      /> 
     547         <field id="ibgvfxsnw"    long_name="global mean volume flux (snow melt)"                    unit="m/day"      /> 
     548         <field id="ibgvfxsub"    long_name="global mean volume flux (snow sublimation)"             unit="m/day"      /> 
     549 
     550         <field id="ibgsfx"       long_name="global mean salt flux (total)"                          unit="1e-3*m/day" /> 
     551         <field id="ibgsfxbri"    long_name="global mean salt flux (brines)"                         unit="1e-3*m/day" /> 
     552         <field id="ibgsfxdyn"    long_name="global mean salt flux (dynamic)"                        unit="1e-3*m/day" /> 
     553         <field id="ibgsfxres"    long_name="global mean salt flux (resultant)"                      unit="1e-3*m/day" /> 
     554         <field id="ibgsfxbog"    long_name="global mean salt flux (thermo)"                         unit="1e-3*m/day" /> 
     555         <field id="ibgsfxopw"    long_name="global mean salt flux (thermo)"                         unit="1e-3*m/day" /> 
     556         <field id="ibgsfxsni"    long_name="global mean salt flux (thermo)"                         unit="1e-3*m/day" /> 
     557         <field id="ibgsfxbom"    long_name="global mean salt flux (thermo)"                         unit="1e-3*m/day" /> 
     558         <field id="ibgsfxsum"    long_name="global mean salt flux (thermo)"                         unit="1e-3*m/day" /> 
     559 
     560         <field id="ibghfxdhc"    long_name="Heat content variation in snow and ice"                 unit="W"          /> 
     561         <field id="ibghfxspr"    long_name="Heat content of snow precip"                            unit="W"          /> 
     562 
     563         <field id="ibghfxthd"    long_name="heat fluxes from ice-ocean exchange during thermo"      unit="W"          /> 
     564         <field id="ibghfxsum"    long_name="heat fluxes causing surface ice melt"                   unit="W"          /> 
     565         <field id="ibghfxbom"    long_name="heat fluxes causing bottom ice melt"                    unit="W"          /> 
     566         <field id="ibghfxbog"    long_name="heat fluxes causing bottom ice growth"                  unit="W"          /> 
     567         <field id="ibghfxdif"    long_name="heat fluxes causing ice temperature change"             unit="W"          /> 
     568         <field id="ibghfxopw"    long_name="heat fluxes causing open water ice formation"           unit="W"          /> 
     569         <field id="ibghfxdyn"    long_name="heat fluxes from ice-ocean exchange during dynamic"     unit="W"          /> 
     570         <field id="ibghfxres"    long_name="heat fluxes from ice-ocean exchange during resultant"   unit="W"          /> 
     571         <field id="ibghfxsub"    long_name="heat fluxes from sublimation"                           unit="W"          /> 
     572         <field id="ibghfxsnw"    long_name="heat fluxes from snow-ocean exchange"                   unit="W"          /> 
     573         <field id="ibghfxout"    long_name="non solar heat fluxes received by the ocean"            unit="W"          /> 
     574         <field id="ibghfxin"     long_name="total heat fluxes at the ice surface"                   unit="W"          /> 
     575 
     576         <field id="ibgfrcvol"    long_name="global mean forcing volume (emp)"                       unit="km3"        /> 
     577         <field id="ibgfrcsfx"    long_name="global mean forcing salt   (sfx)"                       unit="1e-3*km3"   /> 
     578         <field id="ibgvolgrm"    long_name="global mean ice growth+melt volume"                     unit="km3"        /> 
    463579      </field_group> 
    464580   
    465581      <!-- variables available with key_float --> 
     582 
    466583      <field_group id="floatvar" domain_ref="1point" axis_ref="nfloat" operation="instant" > 
    467         <field id="traj_lon"   long_name="floats longitude"   unit="deg"   /> 
    468         <field id="traj_lat"   long_name="floats latitude"    unit="deg"  /> 
    469         <field id="traj_dep"   long_name="floats depth"       unit="m"     /> 
    470         <field id="traj_temp"  long_name="floats temperature" unit="degC"  /> 
    471         <field id="traj_salt"  long_name="floats salinity"    unit="psu"   /> 
    472         <field id="traj_dens"  long_name="floats density"     unit="kg/m3" /> 
    473         <field id="traj_group" long_name="floats group"       unit="none"  /> 
     584        <field id="traj_lon"      long_name="floats longitude"                                                           unit="degrees_east"  /> 
     585        <field id="traj_lat"      long_name="floats latitude"                                                            unit="degrees_north" /> 
     586        <field id="traj_dep"      long_name="floats depth"                                                               unit="m"             /> 
     587        <field id="traj_temp"     long_name="floats temperature"       standard_name="sea_water_potential_temperature"   unit="degC"          /> 
     588        <field id="traj_salt"     long_name="floats salinity"          standard_name="sea_water_practical_salinity"      unit="1e-3"          /> 
     589        <field id="traj_dens"     long_name="floats in-situ density"   standard_name="sea_water_density"                 unit="kg/m3"        /> 
     590        <field id="traj_group"    long_name="floats group"                                                               unit="1"             /> 
    474591      </field_group> 
    475592 
    476593      <!-- variables available with iceberg trajectories --> 
     594 
    477595      <field_group id="icbvar" domain_ref="grid_T"  >  
    478         <field id="berg_melt"          long_name="icb melt rate of icebergs"                     unit="kg/m2/s"   /> 
    479         <field id="berg_buoy_melt"     long_name="icb buoyancy component of iceberg melt rate"   unit="kg/m2/s"   /> 
    480         <field id="berg_eros_melt"     long_name="icb erosion component of iceberg melt rate"    unit="kg/m2/s"   /> 
    481         <field id="berg_conv_melt"     long_name="icb convective component of iceberg melt rate" unit="kg/m2/s"   /> 
    482         <field id="berg_virtual_area"  long_name="icb virtual coverage by icebergs"              unit="m2"        /> 
    483         <field id="bits_src"           long_name="icb mass source of bergy bits"                 unit="kg/m2/s"   /> 
    484         <field id="bits_melt"          long_name="icb melt rate of bergy bits"                   unit="kg/m2/s"   /> 
    485         <field id="bits_mass"          long_name="icb bergy bit density field"                   unit="kg/m2"     /> 
    486         <field id="berg_mass"          long_name="icb iceberg density field"                     unit="kg/m2"     /> 
    487         <field id="calving"            long_name="icb calving mass input"                        unit="kg/s"      /> 
    488         <field id="berg_floating_melt" long_name="icb melt rate of icebergs + bits"              unit="kg/m2/s"   /> 
    489         <field id="berg_real_calving"  long_name="icb calving into iceberg class"                unit="kg/s"     axis_ref="icbcla" /> 
    490         <field id="berg_stored_ice"    long_name="icb accumulated ice mass by class"             unit="kg"       axis_ref="icbcla" /> 
    491       </field_group> 
     596        <field id="berg_melt"          long_name="icb melt rate of icebergs"                       unit="kg/m2/s"                    /> 
     597        <field id="berg_buoy_melt"     long_name="icb buoyancy component of iceberg melt rate"     unit="kg/m2/s"                    /> 
     598        <field id="berg_eros_melt"     long_name="icb erosion component of iceberg melt rate"      unit="kg/m2/s"                    /> 
     599        <field id="berg_conv_melt"     long_name="icb convective component of iceberg melt rate"   unit="kg/m2/s"                    /> 
     600        <field id="berg_virtual_area"  long_name="icb virtual coverage by icebergs"                unit="m2"                         /> 
     601        <field id="bits_src"           long_name="icb mass source of bergy bits"                   unit="kg/m2/s"                    /> 
     602        <field id="bits_melt"          long_name="icb melt rate of bergy bits"                     unit="kg/m2/s"                    /> 
     603        <field id="bits_mass"          long_name="icb bergy bit density field"                     unit="kg/m2"                      /> 
     604        <field id="berg_mass"          long_name="icb iceberg density field"                       unit="kg/m2"                      /> 
     605        <field id="calving"            long_name="icb calving mass input"                          unit="kg/s"                       /> 
     606        <field id="berg_floating_melt" long_name="icb melt rate of icebergs + bits"                unit="kg/m2/s"                    /> 
     607        <field id="berg_real_calving"  long_name="icb calving into iceberg class"                  unit="kg/s"     axis_ref="icbcla" /> 
     608        <field id="berg_stored_ice"    long_name="icb accumulated ice mass by class"               unit="kg"       axis_ref="icbcla" /> 
     609      </field_group> 
     610 
     611      <!-- Poleward transport : ptr -->      
     612      <field_group id="diaptr" domain_ref="ptr" >  
     613        <field id="zomsfglo"          long_name="Meridional Stream-Function: Global"           unit="Sv"       grid_ref="gznl_W_3D" /> 
     614        <field id="zomsfatl"          long_name="Meridional Stream-Function: Atlantic"         unit="Sv"       grid_ref="gznl_W_3D" /> 
     615        <field id="zomsfpac"          long_name="Meridional Stream-Function: Pacific"          unit="Sv"       grid_ref="gznl_W_3D" /> 
     616        <field id="zomsfind"          long_name="Meridional Stream-Function: Indian"           unit="Sv"       grid_ref="gznl_W_3D" /> 
     617        <field id="zomsfipc"          long_name="Meridional Stream-Function: Pacific+Indian"   unit="Sv"       grid_ref="gznl_W_3D" /> 
     618        <field id="zotemglo"          long_name="Zonal Mean Temperature : Global"              unit="degC"     grid_ref="gznl_T_3D" /> 
     619        <field id="zotematl"          long_name="Zonal Mean Temperature : Atlantic"            unit="degC"     grid_ref="gznl_T_3D" /> 
     620        <field id="zotempac"          long_name="Zonal Mean Temperature : Pacific"             unit="degC"     grid_ref="gznl_T_3D" /> 
     621        <field id="zotemind"          long_name="Zonal Mean Temperature : Indian"              unit="degC"     grid_ref="gznl_T_3D" /> 
     622        <field id="zotemipc"          long_name="Zonal Mean Temperature : Pacific+Indian"      unit="degC"     grid_ref="gznl_T_3D" /> 
     623        <field id="zosalglo"          long_name="Zonal Mean Salinity : Global"                 unit="1e-3"     grid_ref="gznl_T_3D" /> 
     624        <field id="zosalatl"          long_name="Zonal Mean Salinity : Atlantic"               unit="1e-3"     grid_ref="gznl_T_3D" /> 
     625        <field id="zosalpac"          long_name="Zonal Mean Salinity : Pacific"                unit="1e-3"     grid_ref="gznl_T_3D" /> 
     626        <field id="zosalind"          long_name="Zonal Mean Salinity : Indian"                 unit="1e-3"     grid_ref="gznl_T_3D" /> 
     627        <field id="zosalipc"          long_name="Zonal Mean Salinity : Pacific+Indian"         unit="1e-3"     grid_ref="gznl_T_3D" /> 
     628        <field id="zosrfglo"          long_name="Zonal Mean Surface"                           unit="m2"       grid_ref="gznl_T_3D" /> 
     629        <field id="zosrfatl"          long_name="Zonal Mean Surface : Atlantic"                unit="m2"       grid_ref="gznl_T_3D" /> 
     630        <field id="zosrfpac"          long_name="Zonal Mean Surface : Pacific"                 unit="m2"       grid_ref="gznl_T_3D" /> 
     631        <field id="zosrfind"          long_name="Zonal Mean Surface : Indian"                  unit="m2"       grid_ref="gznl_T_3D" /> 
     632        <field id="zosrfipc"          long_name="Zonal Mean Surface : Pacific+Indian"          unit="m2"       grid_ref="gznl_T_3D" /> 
     633        <field id="sophtadv"          long_name="Advective Heat Transport"                     unit="PW"       grid_ref="gznl_T_2D" /> 
     634        <field id="sophtldf"          long_name="Diffusive Heat Transport"                     unit="PW"       grid_ref="gznl_T_2D" /> 
     635        <field id="sopstadv"          long_name="Advective Salt Transport"                     unit="Giga g/s" grid_ref="gznl_T_2D" /> 
     636        <field id="sopstldf"          long_name="Diffusive Salt Transport"                     unit="Giga g/s" grid_ref="gznl_T_2D" /> 
     637      </field_group> 
     638 
     639    <!--  
     640============================================================================================================ 
     641                  Physical ocean model trend diagnostics : temperature, KE, PE, momentum 
     642============================================================================================================ 
     643    --> 
     644 
     645    <field_group id="trendT" grid_ref="grid_T_3D"> 
     646      <!-- variables available with ln_tra_trd --> 
     647      <field id="ttrd_xad"      long_name="temperature-trend: i-advection"                                                                                          unit="degC/s"                        /> 
     648      <field id="strd_xad"      long_name="salinity   -trend: i-advection"                                                                                          unit="1e-3/s"                        /> 
     649      <field id="ttrd_yad"      long_name="temperature-trend: j-advection"                                                                                          unit="degC/s"                        /> 
     650      <field id="strd_yad"      long_name="salinity   -trend: j-advection"                                                                                          unit="1e-3/s"                        /> 
     651      <field id="ttrd_zad"      long_name="temperature-trend: k-advection"                                                                                          unit="degC/s"                        /> 
     652      <field id="strd_zad"      long_name="salinity   -trend: k-advection"                                                                                          unit="1e-3/s"                        /> 
     653      <field id="ttrd_ad"       long_name="temperature-trend: advection"               standard_name="tendency_of_sea_water_temperature_due_to_advection"           unit="degC/s"                         > sqrt( ttrd_xad^2 + ttrd_yad^2 + ttrd_zad^2 ) </field> 
     654      <field id="strd_ad"       long_name="salinity   -trend: advection"               standard_name="tendency_of_sea_water_salinity_due_to_advection"              unit="1e-3/s"                         > sqrt( strd_xad^2 + strd_yad^2 + strd_zad^2 ) </field> 
     655      <field id="ttrd_sad"      long_name="temperature-trend: surface adv. (no-vvl)"                                                                                unit="degC/s"   grid_ref="grid_T_2D" /> 
     656      <field id="strd_sad"      long_name="salinity   -trend: surface adv. (no-vvl)"                                                                                unit="1e-3/s"   grid_ref="grid_T_2D" /> 
     657      <field id="ttrd_ldf"      long_name="temperature-trend: lateral  diffusion"      standard_name="tendency_of_sea_water_temperature_due_to_horizontal_mixing"   unit="degC/s"                        /> 
     658      <field id="strd_ldf"      long_name="salinity   -trend: lateral  diffusion"      standard_name="tendency_of_sea_water_salinity_due_to_horizontal_mixing"      unit="1e-3/s"                        /> 
     659      <field id="ttrd_zdf"      long_name="temperature-trend: vertical diffusion"      standard_name="tendency_of_sea_water_temperature_due_to_vertical_mixing"     unit="degC/s"                        /> 
     660      <field id="strd_zdf"      long_name="salinity   -trend: vertical diffusion"      standard_name="tendency_of_sea_water_salinity_due_to_vertical_mixing"        unit="1e-3/s"                        /> 
     661 
     662      <!-- ln_traldf_iso=T only (iso-neutral diffusion) --> 
     663      <field id="ttrd_zdfp"     long_name="temperature-trend: pure vert. diffusion"   unit="degC/s" /> 
     664      <field id="strd_zdfp"     long_name="salinity   -trend: pure vert. diffusion"   unit="1e-3/s" /> 
     665 
     666      <!-- --> 
     667      <field id="ttrd_dmp"      long_name="temperature-trend: interior restoring"        unit="degC/s" /> 
     668      <field id="strd_dmp"      long_name="salinity   -trend: interior restoring"        unit="1e-3/s" /> 
     669      <field id="ttrd_bbl"      long_name="temperature-trend: bottom boundary layer"     unit="degC/s" /> 
     670      <field id="strd_bbl"      long_name="salinity   -trend: bottom boundary layer"     unit="1e-3/s" /> 
     671      <field id="ttrd_npc"      long_name="temperature-trend: non-penetrative conv."     unit="degC/s" /> 
     672      <field id="strd_npc"      long_name="salinity   -trend: non-penetrative conv."     unit="1e-3/s" /> 
     673      <field id="ttrd_qns"      long_name="temperature-trend: non-solar flux + runoff"   unit="degC/s" /> 
     674      <field id="strd_cdt"      long_name="salinity   -trend: C/D term       + runoff"   unit="degC/s" /> 
     675      <field id="ttrd_qsr"      long_name="temperature-trend: solar penetr. heating"     unit="degC/s" /> 
     676      <field id="ttrd_bbc"      long_name="temperature-trend: geothermal heating"        unit="degC/s" /> 
     677      <field id="ttrd_atf"      long_name="temperature-trend: asselin time filter"       unit="degC/s" /> 
     678      <field id="strd_atf"      long_name="salinity   -trend: asselin time filter"       unit="1e-3/s" /> 
     679 
     680      <!-- variables available with ln_KE_trd --> 
     681      <field id="ketrd_hpg"     long_name="ke-trend: hydrostatic pressure gradient"          unit="W/s^3"                        /> 
     682      <field id="ketrd_spg"     long_name="ke-trend: surface     pressure gradient"          unit="W/s^3"                        /> 
     683      <field id="ketrd_spgexp"  long_name="ke-trend: surface pressure gradient (explicit)"   unit="W/s^3"                        /> 
     684      <field id="ketrd_spgflt"  long_name="ke-trend: surface pressure gradient (filter)"     unit="W/s^3"                        /> 
     685      <field id="ssh_flt"       long_name="filtered contribution to ssh (dynspg_flt)"        unit="m"       grid_ref="grid_T_2D" /> 
     686      <field id="w0"            long_name="surface vertical velocity"                        unit="m/s"     grid_ref="grid_T_2D" /> 
     687      <field id="pw0_exp"       long_name="surface pressure flux due to ssh"                 unit="W/s^2"   grid_ref="grid_T_2D" /> 
     688      <field id="pw0_flt"       long_name="surface pressure flux due to filtered ssh"        unit="W/s^2"   grid_ref="grid_T_2D" /> 
     689      <field id="ketrd_keg"     long_name="ke-trend: KE gradient         or hor. adv."       unit="W/s^3"                        /> 
     690      <field id="ketrd_rvo"     long_name="ke-trend: relative  vorticity or metric term"     unit="W/s^3"                        /> 
     691      <field id="ketrd_pvo"     long_name="ke-trend: planetary vorticity"                    unit="W/s^3"                        /> 
     692      <field id="ketrd_zad"     long_name="ke-trend: vertical  advection"                    unit="W/s^3"                        /> 
     693      <field id="ketrd_udx"     long_name="ke-trend: U.dx[U]"                                unit="W/s^3"                        /> 
     694      <field id="ketrd_ldf"     long_name="ke-trend: lateral   diffusion"                    unit="W/s^3"                        /> 
     695      <field id="ketrd_zdf"     long_name="ke-trend: vertical  diffusion"                    unit="W/s^3"                        /> 
     696      <field id="ketrd_tau"     long_name="ke-trend: wind stress "                           unit="W/s^3"   grid_ref="grid_T_2D" /> 
     697      <field id="ketrd_bfr"     long_name="ke-trend: bottom friction (explicit)"             unit="W/s^3"                        />    
     698      <field id="ketrd_bfri"    long_name="ke-trend: bottom friction (implicit)"             unit="W/s^3"                        />    
     699      <field id="ketrd_atf"     long_name="ke-trend: asselin time filter trend"              unit="W/s^3"                        />   
     700      <field id="ketrd_convP2K" long_name="ke-trend: conversion (potential to kinetic)"      unit="W/s^3"                        /> 
     701      <field id="KE"            long_name="kinetic energy: u(n)*u(n+1)/2"                    unit="W/s^2"                        />    
     702 
     703      <!-- variables available with ln_PE_trd --> 
     704      <field id="petrd_xad"     long_name="pe-trend: i-advection"                unit="W/m^3"                        /> 
     705      <field id="petrd_yad"     long_name="pe-trend: j-advection"                unit="W/m^3"                        /> 
     706      <field id="petrd_zad"     long_name="pe-trend: k-advection"                unit="W/m^3"                        /> 
     707      <field id="petrd_sad"     long_name="pe-trend: surface adv. (no-vvl)"      unit="W/m^3"   grid_ref="grid_T_2D" /> 
     708      <field id="petrd_ldf"     long_name="pe-trend: lateral  diffusion"         unit="W/m^3"                        /> 
     709      <field id="petrd_zdf"     long_name="pe-trend: vertical diffusion"         unit="W/m^3"                        /> 
     710      <field id="petrd_zdfp"    long_name="pe-trend: pure vert. diffusion"       unit="W/m^3"                        /> 
     711      <field id="petrd_dmp"     long_name="pe-trend: interior restoring"         unit="W/m^3"                        /> 
     712      <field id="petrd_bbl"     long_name="pe-trend: bottom boundary layer"      unit="W/m^3"                        /> 
     713      <field id="petrd_npc"     long_name="pe-trend: non-penetrative conv."      unit="W/m^3"                        /> 
     714      <field id="petrd_nsr"     long_name="pe-trend: surface forcing + runoff"   unit="W/m^3"                        /> 
     715      <field id="petrd_qsr"     long_name="pe-trend: solar penetr. heating"      unit="W/m^3"                        /> 
     716      <field id="petrd_bbc"     long_name="pe-trend: geothermal heating"         unit="W/m^3"                        /> 
     717      <field id="petrd_atf"     long_name="pe-trend: asselin time filter"        unit="W/m^3"                        /> 
     718      <field id="PEanom"        long_name="potential energy anomaly"             unit="1"                            />    
     719      <field id="alphaPE"       long_name="partial deriv. of PEanom wrt T"       unit="degC-1"                       />    
     720      <field id="betaPE"        long_name="partial deriv. of PEanom wrt S"       unit="1e3"                          />    
     721    </field_group> 
     722 
     723    <field_group id="trendU" grid_ref="grid_U_3D"> 
     724     <!-- variables available with ln_dyn_trd --> 
     725     <field id="utrd_hpg"       long_name="i-trend: hydrostatic pressure gradient"          unit="m/s^2"                        /> 
     726     <field id="utrd_spg"       long_name="i-trend: surface     pressure gradient"          unit="m/s^2"                        /> 
     727     <field id="utrd_spgexp"    long_name="i-trend: surface pressure gradient (explicit)"   unit="m/s^2"                        /> 
     728     <field id="utrd_spgflt"    long_name="i-trend: surface pressure gradient (filtered)"   unit="m/s^2"                        /> 
     729     <field id="utrd_keg"       long_name="i-trend: KE gradient         or hor. adv."       unit="m/s^2"                        /> 
     730     <field id="utrd_rvo"       long_name="i-trend: relative  vorticity or metric term"     unit="m/s^2"                        /> 
     731     <field id="utrd_pvo"       long_name="i-trend: planetary vorticity"                    unit="m/s^2"                        /> 
     732     <field id="utrd_zad"       long_name="i-trend: vertical  advection"                    unit="m/s^2"                        /> 
     733     <field id="utrd_udx"       long_name="i-trend: U.dx[U]"                                unit="m/s^2"                        /> 
     734     <field id="utrd_ldf"       long_name="i-trend: lateral   diffusion"                    unit="m/s^2"                        /> 
     735     <field id="utrd_zdf"       long_name="i-trend: vertical  diffusion"                    unit="m/s^2"                        /> 
     736     <field id="utrd_tau"       long_name="i-trend: wind stress "                           unit="m/s^2"   grid_ref="grid_U_2D" /> 
     737     <field id="utrd_bfr"       long_name="i-trend: bottom friction (explicit)"             unit="m/s^2"                        />    
     738     <field id="utrd_bfri"      long_name="i-trend: bottom friction (implicit)"             unit="m/s^2"                        />    
     739     <field id="utrd_tot"       long_name="i-trend: total momentum trend before atf"        unit="m/s^2"                        />    
     740     <field id="utrd_atf"       long_name="i-trend: asselin time filter trend"              unit="m/s^2"                        />    
     741    </field_group> 
     742 
     743    <field_group id="trendV" grid_ref="grid_V_3D"> 
     744     <!-- variables available with ln_dyn_trd --> 
     745     <field id="vtrd_hpg"       long_name="j-trend: hydrostatic pressure gradient"          unit="m/s^2"                        /> 
     746     <field id="vtrd_spg"       long_name="j-trend: surface     pressure gradient"          unit="m/s^2"                        /> 
     747     <field id="vtrd_spgexp"    long_name="j-trend: surface pressure gradient (explicit)"   unit="m/s^2"                        /> 
     748     <field id="vtrd_spgflt"    long_name="j-trend: surface pressure gradient (filtered)"   unit="m/s^2"                        /> 
     749     <field id="vtrd_keg"       long_name="j-trend: KE gradient         or hor. adv."       unit="m/s^2"                        /> 
     750     <field id="vtrd_rvo"       long_name="j-trend: relative  vorticity or metric term"     unit="m/s^2"                        /> 
     751     <field id="vtrd_pvo"       long_name="j-trend: planetary vorticity"                    unit="m/s^2"                        /> 
     752     <field id="vtrd_zad"       long_name="j-trend: vertical  advection"                    unit="m/s^2"                        /> 
     753     <field id="vtrd_vdy"       long_name="i-trend: V.dx[V]"                                unit="m/s^2"                        /> 
     754     <field id="vtrd_ldf"       long_name="j-trend: lateral   diffusion"                    unit="m/s^2"                        /> 
     755     <field id="vtrd_zdf"       long_name="j-trend: vertical  diffusion"                    unit="m/s^2"                        /> 
     756     <field id="vtrd_tau"       long_name="j-trend: wind stress "                           unit="m/s^2"   grid_ref="grid_V_2D" /> 
     757     <field id="vtrd_bfr"       long_name="j-trend: bottom friction (explicit)"             unit="m/s^2"                        />    
     758     <field id="vtrd_bfri"      long_name="j-trend: bottom friction (implicit)"             unit="m/s^2"                        />    
     759     <field id="vtrd_tot"       long_name="j-trend: total momentum trend before atf"        unit="m/s^2"                        />    
     760     <field id="vtrd_atf"       long_name="j-trend: asselin time filter trend"              unit="m/s^2"                        />    
     761    </field_group> 
     762 
     763    <!--  
     764============================================================================================================ 
     765                                     Biogeochemistry model variables 
     766============================================================================================================ 
     767    --> 
    492768 
    493769      <!-- ptrc on T grid --> 
    494770 
    495       <field_group id="ptrc_T" grid_ref="grid_T_3D"> 
    496        <field id="DIC"      long_name="Dissolved inorganic Concentration"        unit="mmol/m3" /> 
    497        <field id="Alkalini" long_name="Total Alkalinity Concentration"           unit="mmol/m3" /> 
    498        <field id="O2"       long_name="Oxygen Concentration"                     unit="mmol/m3" /> 
    499        <field id="CaCO3"    long_name="Calcite Concentration"                    unit="mmol/m3" /> 
    500        <field id="PO4"      long_name="Phosphate Concentration"                  unit="mmol/m3" /> 
    501        <field id="POC"      long_name="Small organic carbon Concentration"       unit="mmol/m3" /> 
    502        <field id="Si"       long_name="Silicate Concentration"                   unit="mmol/m3" /> 
    503        <field id="PHY"      long_name="(Nano)Phytoplankton Concentration"        unit="mmol/m3" /> 
    504        <field id="ZOO"      long_name="(Micro)Zooplankton Concentration"         unit="mmol/m3" /> 
    505        <field id="DOC"      long_name="Dissolved organic Concentration"          unit="mmol/m3" /> 
    506        <field id="PHY2"     long_name="Diatoms Concentration"                    unit="mmol/m3" /> 
    507        <field id="ZOO2"     long_name="Mesozooplankton Concentration"            unit="mmol/m3" /> 
    508        <field id="DSi"      long_name="Diatoms Silicate Concentration"           unit="mmol/m3" /> 
    509        <field id="Fer"      long_name="Dissolved Iron Concentration"             unit="mmol/m3" /> 
    510        <field id="BFe"      long_name="Big iron particles Concentration"         unit="mmol/m3" /> 
    511        <field id="GOC"      long_name="Big organic carbon Concentration"         unit="mmol/m3" /> 
    512        <field id="SFe"      long_name="Small iron particles Concentration"       unit="mmol/m3" /> 
    513        <field id="DFe"      long_name="Diatoms iron  Concentration"              unit="mmol/m3" /> 
    514        <field id="GSi"      long_name="Sinking biogenic Silicate Concentration"  unit="mmol/m3" /> 
    515        <field id="NFe"      long_name="Nano iron Concentration"                  unit="mmol/m3" /> 
    516        <field id="NCHL"     long_name="Nano chlorophyl Concentration"            unit="mg/m3"   /> 
    517        <field id="DCHL"     long_name="Diatoms chlorophyl Concentration"         unit="mg/m3"   /> 
    518        <field id="NO3"      long_name="Nitrate Concentration"                    unit="mmol/m3" /> 
    519        <field id="NH4"      long_name="Ammonium Concentration"                   unit="mmol/m3" /> 
     771     <field_group id="ptrc_T" grid_ref="grid_T_3D"> 
     772       <field id="DIC"          long_name="Dissolved inorganic Concentration"        unit="mmol/m3" /> 
     773       <field id="DIC_E3T"      long_name="DIC * E3T"                                unit="mmol/m2" > DIC * e3t </field > 
     774       <field id="Alkalini"     long_name="Total Alkalinity Concentration"           unit="mmol/m3" /> 
     775       <field id="Alkalini_E3T" long_name="Alkalini * E3T"                           unit="mmol/m2"  > Alkalini * e3t </field > 
     776       <field id="O2"           long_name="Oxygen Concentration"                     unit="mmol/m3" /> 
     777       <field id="O2_E3T"       long_name="O2 * E3T"                                 unit="mmol/m2"  > O2 * e3t </field > 
     778       <field id="CaCO3"        long_name="Calcite Concentration"                    unit="mmol/m3" /> 
     779       <field id="CaCO3_E3T"    long_name="CaCO3 * E3T"                              unit="mmol/m2"  > CaCO3 * e3t </field > 
     780       <field id="PO4"          long_name="Phosphate Concentration"                  unit="mmol/m3" /> 
     781       <field id="PO4_E3T"      long_name="PO4 * E3T"                                unit="mmol/m2"  > PO4 * e3t </field > 
     782       <field id="POC"          long_name="Small organic carbon Concentration"       unit="mmol/m3" /> 
     783       <field id="POC_E3T"      long_name="POC * E3T"                                unit="mmol/m2"  > POC * e3t </field > 
     784       <field id="Si"           long_name="Silicate Concentration"                   unit="mmol/m3" /> 
     785       <field id="Si_E3T"       long_name="Si * E3T"                                 unit="mmol/m2"  > Si * e3t </field > 
     786       <field id="PHY"          long_name="(Nano)Phytoplankton Concentration"        unit="mmol/m3" /> 
     787       <field id="PHY_E3T"      long_name="PHY * E3T"                                unit="mmol/m2"  > PHY * e3t </field > 
     788       <field id="ZOO"          long_name="(Micro)Zooplankton Concentration"         unit="mmol/m3" /> 
     789       <field id="ZOO_E3T"      long_name="ZOO2 * E3T"                               unit="mmol/m2"  > ZOO * e3t </field > 
     790       <field id="DOC"          long_name="Dissolved organic Concentration"          unit="mmol/m3" /> 
     791       <field id="DOC_E3T"      long_name="DOC * E3T"                                unit="mmol/m2"  > DOC * e3t </field > 
     792       <field id="PHY2"         long_name="Diatoms Concentration"                    unit="mmol/m3" /> 
     793       <field id="PHY2_E3T"     long_name="PHY2 * E3T"                               unit="mmol/m2"  > PHY2 * e3t </field > 
     794       <field id="ZOO2"         long_name="Mesozooplankton Concentration"            unit="mmol/m3" /> 
     795       <field id="ZOO2_E3T"     long_name="ZOO2 * E3T"                               unit="mmol/m2"  > ZOO2 * e3t </field > 
     796       <field id="DSi"          long_name="Diatoms Silicate Concentration"           unit="mmol/m3" /> 
     797       <field id="DSi_E3T"      long_name="Dsi * E3T"                                unit="mmol/m2"  > DSi * e3t </field > 
     798       <field id="Fer"          long_name="Dissolved Iron Concentration"             unit="mmol/m3" /> 
     799       <field id="Fer_E3T"      long_name="Fer * E3T"                                unit="mmol/m2"  > Fer * e3t </field > 
     800       <field id="BFe"          long_name="Big iron particles Concentration"         unit="mmol/m3" /> 
     801       <field id="BFe_E3T"      long_name="BFe * E3T"                                unit="mmol/m2"  > BFe * e3t </field > 
     802       <field id="GOC"          long_name="Big organic carbon Concentration"         unit="mmol/m3" /> 
     803       <field id="GOC_E3T"      long_name="GOC * E3T"                                unit="mmol/m2"  > GOC * e3t </field > 
     804       <field id="SFe"          long_name="Small iron particles Concentration"       unit="mmol/m3" /> 
     805       <field id="SFe_E3T"      long_name="SFe * E3T"                                unit="mmol/m2"  > SFe * e3t </field > 
     806       <field id="DFe"          long_name="Diatoms iron  Concentration"              unit="mmol/m3" /> 
     807       <field id="DFe_E3T"      long_name="DFe * E3T"                                unit="mmol/m2"  > DFe * e3t </field > 
     808       <field id="GSi"          long_name="Sinking biogenic Silicate Concentration"  unit="mmol/m3" /> 
     809       <field id="GSi_E3T"      long_name="GSi * E3T"                                unit="mmol/m2"  > GSi * e3t </field > 
     810       <field id="NFe"          long_name="Nano iron Concentration"                  unit="mmol/m3" /> 
     811       <field id="NFe_E3T"      long_name="NFe * E3T"                                unit="mmol/m2"  > NFe * e3t </field > 
     812       <field id="NCHL"         long_name="Nano chlorophyl Concentration"            unit="mg/m3"   /> 
     813       <field id="NCHL_E3T"     long_name="NCHL * E3T"                               unit="mmol/m2"  > NCHL * e3t </field > 
     814       <field id="DCHL"         long_name="Diatoms chlorophyl Concentration"         unit="mg/m3"   /> 
     815       <field id="DCHL_E3T"     long_name="DCHL * E3T"                               unit="mmol/m2"  > DCHL * e3t </field > 
     816       <field id="NO3"          long_name="Nitrate Concentration"                    unit="mmol/m3" /> 
     817       <field id="NO3_E3T"      long_name="NO3 * E3T"                                unit="mmol/m2"  > NO3 * e3t </field > 
     818       <field id="NH4"          long_name="Ammonium Concentration"                   unit="mmol/m3" /> 
     819       <field id="NH4_E3T"      long_name="NH4 * E3T"                                unit="mmol/m2"  > NH4 * e3t </field > 
    520820 
    521821       <!-- PISCES with Kriest parametisation : variables available with key_kriest --> 
    522        <field id="Num"      long_name="Number of organic particles"              unit="nbr" /> 
     822       <field id="Num"         long_name="Number of organic particles"              unit="1" /> 
     823       <field id="Num_E3T"     long_name="Num * E3T"                                unit="m"  > Num * e3t </field > 
    523824 
    524825       <!-- PISCES light : variables available with key_pisces_reduced --> 
    525        <field id="DET"      long_name="Detritus"                                 unit="mmol-N/m3" /> 
    526        <field id="DOM"      long_name="Dissolved Organic Matter"                 unit="mmol-N/m3" /> 
     826       <field id="DET"         long_name="Detritus"                                 unit="mmol-N/m3" /> 
     827       <field id="DET_E3T"     long_name="DET * E3T"                                unit="mmol-N/m2"  > DET * e3t </field > 
     828       <field id="DOM"         long_name="Dissolved Organic Matter"                 unit="mmol-N/m3" /> 
     829       <field id="DOM_E3T"     long_name="DOM * E3T"                                unit="mmol-N/m2"  > DOM * e3t </field > 
    527830 
    528831       <!-- CFC11 : variables available with key_cfc --> 
    529        <field id="CFC11"    long_name="CFC-11 Concentration"                     unit="umol/L" /> 
     832       <field id="CFC11"       long_name="CFC-11 Concentration"                     unit="umol/m3" /> 
     833       <field id="CFC11_E3T"   long_name="CFC11 * E3T"                              unit="umol/m2"  > CFC11 * e3t </field > 
    530834       <!-- Bomb C14 : variables available with key_c14b --> 
    531        <field id="C14B"     long_name="Bomb C14 Concentration"                   unit="ration" /> 
     835       <field id="C14B"     long_name="Bomb C14 Concentration"                      unit="1"         /> 
     836       <field id="C14B_E3T"    long_name="C14B * E3T"                               unit="m"  > C14B * e3t </field > 
    532837     </field_group> 
    533838 
    534       <!-- PISCES additional diagnostics on T grid  --> 
     839     <!-- PISCES additional diagnostics on T grid  --> 
     840 
    535841     <field_group id="diad_T" grid_ref="grid_T_2D"> 
    536        <field id="PH"          long_name="PH"                                      unit="-"          grid_ref="grid_T_3D" /> 
     842       <field id="PH"          long_name="PH"                                      unit="1"          grid_ref="grid_T_3D" /> 
    537843       <field id="CO3"         long_name="Bicarbonates"                            unit="mol/m3"     grid_ref="grid_T_3D" /> 
    538844       <field id="CO3sat"      long_name="CO3 saturation"                          unit="mol/m3"     grid_ref="grid_T_3D" /> 
    539845       <field id="PAR"         long_name="Photosynthetically Available Radiation"  unit="W/m2"       grid_ref="grid_T_3D" /> 
    540        <field id="PPPHY"       long_name="Primary production of nanophyto"         unit="molC/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
    541        <field id="PPPHY2"      long_name="Primary production of diatoms"           unit="molC/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
    542        <field id="PPNEWN"      long_name="New Primary production of nanophyto"     unit="molC/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
    543        <field id="PPNEWD"      long_name="New Primary production of diatoms"       unit="molC/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
    544        <field id="PBSi"        long_name="Primary production of Si diatoms"        unit="molSi/m3/s" grid_ref="grid_T_3D" /> 
    545        <field id="PFeN"        long_name="Primary production of nano iron"         unit="molFe/m3/s" grid_ref="grid_T_3D" /> 
    546        <field id="PFeD"        long_name="Primary production of diatoms iron"      unit="molFe/m3/s" grid_ref="grid_T_3D" /> 
    547        <field id="xfracal"     long_name="Calcifying fraction"                     unit="-"          grid_ref="grid_T_3D" /> 
    548        <field id="PCAL"        long_name="Calcite production"                      unit="molC/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
    549        <field id="DCAL"        long_name="Calcite dissolution"                     unit="molC/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
    550        <field id="GRAZ1"       long_name="Grazing by microzooplankton"             unit="molC/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
    551        <field id="GRAZ2"       long_name="Grazing by mesozooplankton"              unit="molC/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
    552        <field id="REMIN"       long_name="Oxic remineralization of OM"             unit="molC/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
    553        <field id="DENIT"       long_name="Anoxic remineralization of OM"           unit="molC/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
    554        <field id="Nfix"        long_name="Nitrogen fixation"                       unit="molN/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
     846       <field id="PARDM"       long_name="Daily mean PAR"                          unit="W/m2"       grid_ref="grid_T_3D" /> 
     847       <field id="PPPHY"       long_name="Primary production of nanophyto"         unit="mol/m3/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
     848       <field id="PPPHY2"      long_name="Primary production of diatoms"           unit="mol/m3/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
     849       <field id="PPNEWN"      long_name="New Primary production of nanophyto"     unit="mol/m3/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
     850       <field id="PPNEWD"      long_name="New Primary production of diatoms"       unit="mol/m3/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
     851       <field id="PBSi"        long_name="Primary production of Si diatoms"        unit="mol/m3/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
     852       <field id="PFeN"        long_name="Primary production of nano iron"         unit="mol/m3/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
     853       <field id="PFeD"        long_name="Primary production of diatoms iron"      unit="mol/m3/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
     854       <field id="xfracal"     long_name="Calcifying fraction"                     unit="1"          grid_ref="grid_T_3D" /> 
     855       <field id="PCAL"        long_name="Calcite production"                      unit="mol/m3/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
     856       <field id="DCAL"        long_name="Calcite dissolution"                     unit="mol/m3/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
     857       <field id="GRAZ1"       long_name="Grazing by microzooplankton"             unit="mol/m3/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
     858       <field id="GRAZ2"       long_name="Grazing by mesozooplankton"              unit="mol/m3/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
     859       <field id="REMIN"       long_name="Oxic remineralization of OM"             unit="mol/m3/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
     860       <field id="DENIT"       long_name="Anoxic remineralization of OM"           unit="mol/m3/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
     861       <field id="Nfix"        long_name="Nitrogen fixation"                       unit="mol/m3/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
    555862       <field id="Mumax"       long_name="Maximum growth rate"                     unit="s-1"        grid_ref="grid_T_3D" /> 
    556863       <field id="MuN"         long_name="Realized growth rate for nanophyto"      unit="s-1"        grid_ref="grid_T_3D" /> 
    557864       <field id="MuD"         long_name="Realized growth rate for diatomes"       unit="s-1"        grid_ref="grid_T_3D" /> 
    558        <field id="LNnut"       long_name="Nutrient limitation term in Nanophyto"   unit="-"          grid_ref="grid_T_3D" /> 
    559        <field id="LDnut"       long_name="Nutrient limitation term in Diatoms"     unit="-"          grid_ref="grid_T_3D" /> 
    560        <field id="LNFe"        long_name="Iron limitation term in Nanophyto"       unit="-"          grid_ref="grid_T_3D" /> 
    561        <field id="LDFe"        long_name="Iron limitation term in Diatoms"         unit="-"          grid_ref="grid_T_3D" /> 
    562        <field id="LNlight"     long_name="Light limitation term in Nanophyto"      unit="-"          grid_ref="grid_T_3D" /> 
    563        <field id="LDlight"     long_name="Light limitation term in Diatoms"        unit="-"          grid_ref="grid_T_3D" /> 
    564        <field id="Fe2"         long_name="Iron II concentration"                   unit="nmol/L"     grid_ref="grid_T_3D" /> 
    565        <field id="Fe3"         long_name="Iron III concentration"                  unit="nmol/L"     grid_ref="grid_T_3D" /> 
    566        <field id="FeL1"        long_name="Complexed Iron concentration with L1"    unit="nmol/L"     grid_ref="grid_T_3D" /> 
    567        <field id="FeL2"        long_name="Complexed Iron concentration with L2"    unit="nmol/L"     grid_ref="grid_T_3D" /> 
    568        <field id="FeP"         long_name="Precipitated Iron III"                   unit="nmol/L"     grid_ref="grid_T_3D" /> 
    569        <field id="TL1"         long_name="Total L1 concentration"                  unit="nmol/L"     grid_ref="grid_T_3D" /> 
    570        <field id="TL2"         long_name="Total L2 concentration"                  unit="nmol/L"     grid_ref="grid_T_3D" /> 
    571        <field id="pdust"       long_name="dust concentration"                      unit="g/L"                          /> 
    572        <field id="Totlig"      long_name="Total ligand concentation"               unit="nmol/L"     grid_ref="grid_T_3D" /> 
    573        <field id="Biron"       long_name="Bioavailable iron"                       unit="nmol/L"     grid_ref="grid_T_3D" /> 
    574        <field id="Sdenit"      long_name="Nitrate reduction in the sediments"      unit="molN/m2/s"                    /> 
    575        <field id="Ironice"     long_name="Iron input/uptake due to sea ice"        unit="molFe/m2/s"                   /> 
    576        <field id="HYDR"        long_name="Iron input from hydrothemal vents"       unit="molFe/m2/s" grid_ref="grid_T_3D" /> 
    577        <field id="EPC100"      long_name="Export of carbon particles at 100 m"     unit="mol/m2/s"                     /> 
    578        <field id="EPFE100"     long_name="Export of biogenic iron at 100 m"        unit="mol/m2/s"                     /> 
    579        <field id="EPSI100"     long_name="Export of Silicate at 100 m"             unit="mol/m2/s"                     /> 
    580        <field id="EPCAL100"    long_name="Export of Calcite at 100 m"              unit="mol/m2/s"                     /> 
    581        <field id="Cflx"        long_name="DIC flux"                                unit="mol/m2/s"                     /> 
    582        <field id="Oflx"        long_name="Oxygen flux"                             unit="mol/m2/s"                     /> 
    583        <field id="Kg"          long_name="Gas transfer"                            unit="mol/m2/s/uatm"                /> 
    584        <field id="Dpco2"       long_name="Delta CO2"                               unit="uatm"                         /> 
    585        <field id="Dpo2"        long_name="Delta O2"                                unit="uatm"                         /> 
    586        <field id="Heup"        long_name="Euphotic layer depth"                    unit="m"                            /> 
    587        <field id="Irondep"     long_name="Iron deposition from dust"               unit="mol/m2/s"                     /> 
    588        <field id="Ironsed"     long_name="Iron deposition from sediment"           unit="mol/m2/s"  grid_ref="grid_T_3D"/> 
     865       <field id="LNnut"       long_name="Nutrient limitation term in Nanophyto"   unit=""           grid_ref="grid_T_3D" /> 
     866       <field id="LDnut"       long_name="Nutrient limitation term in Diatoms"     unit=""           grid_ref="grid_T_3D" /> 
     867       <field id="LNFe"        long_name="Iron limitation term in Nanophyto"       unit=""           grid_ref="grid_T_3D" /> 
     868       <field id="LDFe"        long_name="Iron limitation term in Diatoms"         unit=""           grid_ref="grid_T_3D" /> 
     869       <field id="LNlight"     long_name="Light limitation term in Nanophyto"      unit=""           grid_ref="grid_T_3D" /> 
     870       <field id="LDlight"     long_name="Light limitation term in Diatoms"        unit=""           grid_ref="grid_T_3D" /> 
     871       <field id="Fe2"         long_name="Iron II concentration"                   unit="nmol/m3"    grid_ref="grid_T_3D" /> 
     872       <field id="Fe3"         long_name="Iron III concentration"                  unit="nmol/m3"    grid_ref="grid_T_3D" /> 
     873       <field id="FeL1"        long_name="Complexed Iron concentration with L1"    unit="nmol/m3"    grid_ref="grid_T_3D" /> 
     874       <field id="FeL2"        long_name="Complexed Iron concentration with L2"    unit="nmol/m3"    grid_ref="grid_T_3D" /> 
     875       <field id="FeP"         long_name="Precipitated Iron III"                   unit="nmol/m3"    grid_ref="grid_T_3D" /> 
     876       <field id="TL1"         long_name="Total L1 concentration"                  unit="nmol/m3"    grid_ref="grid_T_3D" /> 
     877       <field id="TL2"         long_name="Total L2 concentration"                  unit="nmol/m3"    grid_ref="grid_T_3D" /> 
     878       <field id="pdust"       long_name="dust concentration"                      unit="g/m3"                            /> 
     879       <field id="Totlig"      long_name="Total ligand concentation"               unit="nmol/m3"    grid_ref="grid_T_3D" /> 
     880       <field id="Biron"       long_name="Bioavailable iron"                       unit="nmol/m3"    grid_ref="grid_T_3D" /> 
     881       <field id="Sdenit"      long_name="Nitrate reduction in the sediments"      unit="mol/m2/s"                        /> 
     882       <field id="Ironice"     long_name="Iron input/uptake due to sea ice"        unit="mol/m2/s"                        /> 
     883       <field id="HYDR"        long_name="Iron input from hydrothemal vents"       unit="mol/m2/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
     884       <field id="EPC100"      long_name="Export of carbon particles at 100 m"     unit="mol/m2/s"                        /> 
     885       <field id="EPFE100"     long_name="Export of biogenic iron at 100 m"        unit="mol/m2/s"                        /> 
     886       <field id="EPSI100"     long_name="Export of Silicate at 100 m"             unit="mol/m2/s"                        /> 
     887       <field id="EPCAL100"    long_name="Export of Calcite at 100 m"              unit="mol/m2/s"                        /> 
     888       <field id="EXPC"        long_name="Export of carbon"                        unit="mol/m2/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
     889       <field id="EXPFE"       long_name="Export of biogenic iron"                 unit="mol/m2/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
     890       <field id="EXPSI"       long_name="Export of Silicate"                      unit="mol/m2/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
     891       <field id="EXPCAL"      long_name="Export of Calcite"                       unit="mol/m2/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
     892       <field id="Cflx"        long_name="DIC flux"                                unit="mol/m2/s"                        /> 
     893       <field id="Oflx"        long_name="Oxygen flux"                             unit="mol/m2/s"                        /> 
     894       <field id="Kg"          long_name="Gas transfer"                            unit="mol/m2/s/uatm"                   /> 
     895       <field id="Dpco2"       long_name="Delta CO2"                               unit="uatm"                            /> 
     896       <field id="Dpo2"        long_name="Delta O2"                                unit="uatm"                            /> 
     897       <field id="Heup"        long_name="Euphotic layer depth"                    unit="m"                               /> 
     898       <field id="Irondep"     long_name="Iron deposition from dust"               unit="mol/m2/s"                        /> 
     899       <field id="Ironsed"     long_name="Iron deposition from sediment"           unit="mol/m2/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
     900 
    589901 
    590902       <!-- PISCES with Kriest parametisation : variables available with key_kriest --> 
    591        <field id="POCFlx"      long_name="Particulate organic C flux"              unit="mol/m2/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
    592        <field id="NumFlx"      long_name="Particle number flux"                    unit="nbr/m2/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
    593        <field id="SiFlx"       long_name="Biogenic Si flux"                        unit="mol/m2/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
    594        <field id="CaCO3Flx"    long_name="CaCO3 flux"                              unit="mol/m2/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
    595        <field id="xnum"        long_name="Number of particles in aggregats"        unit="-"          grid_ref="grid_T_3D" /> 
    596        <field id="W1"          long_name="sinking speed of mass flux"              unit="m2/s"       grid_ref="grid_T_3D" /> 
    597        <field id="W2"          long_name="sinking speed of number flux"            unit="m2/s"       grid_ref="grid_T_3D" /> 
     903       <field id="EPN100"      long_name="Particulate number flux at 100 m"        unit="mol/m2/s"                        /> 
     904       <field id="EXPN"        long_name="Particulate number flux"                 unit="mol/m2/s"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
     905       <field id="XNUM"        long_name="Number of particles in aggregats"        unit="1"          grid_ref="grid_T_3D" /> 
     906       <field id="WSC"         long_name="sinking speed of mass flux"              unit="m2/s"       grid_ref="grid_T_3D" /> 
     907       <field id="WSN"         long_name="sinking speed of number flux"            unit="m2/s"       grid_ref="grid_T_3D" /> 
     908 
     909       <!-- dbio_T on T grid : variables available with key_diaar5 --> 
     910       <field id="TPP"         long_name="Total Primary production of phyto"                   unit="mol/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
     911       <field id="TPNEW"       long_name="New Primary production of phyto"                     unit="mol/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
     912       <field id="TPBFE"       long_name="Total biogenic iron production"                      unit="mol/m3/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
     913       <field id="INTDIC"      long_name="DIC content"                                         unit="kg/m2"                          /> 
     914       <field id="O2MIN"       long_name="Oxygen minimum concentration"                        unit="mol/m3"                          /> 
     915       <field id="ZO2MIN"      long_name="Depth of oxygen minimum concentration"               unit="m"                              /> 
     916       <field id="INTNFIX"     long_name="Nitrogen fixation rate : vert. integrated"           unit="mol/m2/s"                       /> 
     917       <field id="INTPPPHY"    long_name="Vertically integrated primary production by nanophy" unit="mol/m2/s"                       /> 
     918       <field id="INTPPPHY2"   long_name="Vertically integrated primary production by diatom"  unit="mol/m2/s"                       /> 
     919       <field id="INTPP"       long_name="Vertically integrated primary production by phyto"   unit="mol/m2/s"                       /> 
     920       <field id="INTPNEW"     long_name="Vertically integrated new primary production"        unit="mol/m2/s"                       /> 
     921       <field id="INTPBFE"     long_name="Vertically integrated of biogenic iron production"   unit="mol/m2/s"                       /> 
     922       <field id="INTPBSI"     long_name="Vertically integrated of biogenic Si production"     unit="mol/m2/s"                       /> 
     923       <field id="INTPCAL"     long_name="Vertically integrated of calcite production"         unit="mol/m2/s"                       /> 
    598924 
    599925       <!-- PISCES light : variables available with key_pisces_reduced --> 
    600        <field id="FNO3PHY"     long_name="FNO3PHY"                                 unit="-"          grid_ref="grid_T_3D" />  
    601        <field id="FNH4PHY"     long_name="FNH4PHY"                                 unit="-"          grid_ref="grid_T_3D" />  
    602        <field id="FNH4NO3"     long_name="FNH4NO3"                                 unit="-"          grid_ref="grid_T_3D" />  
    603        <field id="TNO3PHY"     long_name="TNO3PHY"                                 unit="-"  />  
    604        <field id="TNH4PHY"     long_name="TNH4PHY"                                 unit="-"  />  
    605        <field id="TPHYDOM"     long_name="TPHYDOM"                                 unit="-"  />  
    606        <field id="TPHYNH4"     long_name="TPHYNH4"                                 unit="-"  />  
    607        <field id="TPHYZOO"     long_name="TPHYZOO"                                 unit="-"  />  
    608        <field id="TPHYDET"     long_name="TPHYDET"                                 unit="-"  />  
    609        <field id="TDETZOO"     long_name="TDETZOO"                                 unit="-"  />  
    610        <field id="TZOODET"     long_name="TZOODET"                                 unit="-"  />  
    611        <field id="TZOOBOD"     long_name="TZOOBOD"                                 unit="-"  />  
    612        <field id="TZOONH4"     long_name="TZOONH4"                                 unit="-"  />  
    613        <field id="TZOODOM"     long_name="TZOODOM"                                 unit="-"  />  
    614        <field id="TNH4NO3"     long_name="TNH4NO3"                                 unit="-"  />  
    615        <field id="TDOMNH4"     long_name="TDOMNH4"                                 unit="-"  />  
    616        <field id="TDETNH4"     long_name="TDETNH4"                                 unit="-"  />  
    617        <field id="TPHYTOT"     long_name="TPHYTOT"                                 unit="-"  />  
    618        <field id="TZOOTOT"     long_name="TZOOTOT"                                 unit="-"  />  
    619        <field id="SEDPOC"      long_name="SEDPOC"                                  unit="-"  />  
    620        <field id="TDETSED"     long_name="TDETSED"                                 unit="-"  />  
     926       <field id="FNO3PHY"     long_name="FNO3PHY"                                 unit=""          grid_ref="grid_T_3D" />  
     927       <field id="FNH4PHY"     long_name="FNH4PHY"                                 unit=""          grid_ref="grid_T_3D" />  
     928       <field id="FNH4NO3"     long_name="FNH4NO3"                                 unit=""          grid_ref="grid_T_3D" />  
     929       <field id="TNO3PHY"     long_name="TNO3PHY"                                 unit=""  />  
     930       <field id="TNH4PHY"     long_name="TNH4PHY"                                 unit=""  />  
     931       <field id="TPHYDOM"     long_name="TPHYDOM"                                 unit=""  />  
     932       <field id="TPHYNH4"     long_name="TPHYNH4"                                 unit=""  />  
     933       <field id="TPHYZOO"     long_name="TPHYZOO"                                 unit=""  />  
     934       <field id="TPHYDET"     long_name="TPHYDET"                                 unit=""  />  
     935       <field id="TDETZOO"     long_name="TDETZOO"                                 unit=""  />  
     936       <field id="TZOODET"     long_name="TZOODET"                                 unit=""  />  
     937       <field id="TZOOBOD"     long_name="TZOOBOD"                                 unit=""  />  
     938       <field id="TZOONH4"     long_name="TZOONH4"                                 unit=""  />  
     939       <field id="TZOODOM"     long_name="TZOODOM"                                 unit=""  />  
     940       <field id="TNH4NO3"     long_name="TNH4NO3"                                 unit=""  />  
     941       <field id="TDOMNH4"     long_name="TDOMNH4"                                 unit=""  />  
     942       <field id="TDETNH4"     long_name="TDETNH4"                                 unit=""  />  
     943       <field id="TPHYTOT"     long_name="TPHYTOT"                                 unit=""  />  
     944       <field id="TZOOTOT"     long_name="TZOOTOT"                                 unit=""  />  
     945       <field id="SEDPOC"      long_name="SEDPOC"                                  unit=""  />  
     946       <field id="TDETSED"     long_name="TDETSED"                                 unit=""  />  
    621947 
    622948       <!-- CFC11 : variables available with key_cfc --> 
    623        <field id="qtrCFC11"    long_name="Air-sea flux of CFC-11"                   unit="mol/m2/s"   /> 
    624        <field id="qintCFC11"   long_name="Cumulative air-sea flux of CFC-11"        unit="mol/m2"     /> 
     949       <field id="qtrCFC11"    long_name="Air-sea flux of CFC-11"                  unit="mol/m2/s"   /> 
     950       <field id="qintCFC11"   long_name="Cumulative air-sea flux of CFC-11"       unit="mol/m2"     /> 
     951 
    625952       <!-- Bomb C14 : variables available with key_c14b --> 
    626        <field id="qtrC14b"     long_name="Air-sea flux of Bomb C14"                 unit="mol/m2/s"   /> 
    627        <field id="qintC14b"    long_name="Cumulative air-sea flux of Bomb C14"      unit="mol/m2"     /> 
    628        <field id="fdecay"      long_name="Radiactive decay of Bomb C14"             unit="mol/m3"  grid_ref="grid_T_3D"  /> 
     953       <field id="qtrC14b"     long_name="Air-sea flux of Bomb C14"                unit="mol/m2/s"   /> 
     954       <field id="qintC14b"    long_name="Cumulative air-sea flux of Bomb C14"     unit="mol/m2"     /> 
     955       <field id="fdecay"      long_name="Radiactive decay of Bomb C14"            unit="mol/m3"  grid_ref="grid_T_3D"  /> 
    629956     </field_group> 
    630957 
     958     <field_group id="PISCES_scalar"  domain_ref="1point" > 
     959       <field id="pno3tot"         long_name="global mean nitrate concentration"                  unit="mol/m3"   /> 
     960       <field id="ppo4tot"         long_name="global mean phosphorus concentration"               unit="mol/m3"   /> 
     961       <field id="psiltot"         long_name="global mean silicate concentration"                 unit="mol/m3"   /> 
     962       <field id="palktot"         long_name="global mean alkalinity concentration"               unit="mol/m3"   /> 
     963       <field id="pfertot"         long_name="global mean iron concentration"                     unit="mol/m3"   /> 
     964       <field id="tcflx"           long_name="total Flux of Carbon out of the ocean"              unit="mol/s"   /> 
     965       <field id="tcflxcum"        long_name="cumulative total Flux of Carbon out of the ocean"   unit="mol/s"   /> 
     966       <field id="tcexp"           long_name="total Carbon export at 100m"                        unit="mol/s"   /> 
     967       <field id="tintpp"          long_name="global total integrated primary production"         unit="mol/s"   /> 
     968       <field id="tnfix"           long_name="global total nitrogen fixation"                     unit="mol/s"   /> 
     969       <field id="tdenit"          long_name="Total denitrification"                              unit="mol/s"   /> 
     970     </field_group> 
     971 
    631972    <!--  
     973============================================================================================================ 
     974                                        Definitions for iodef_demo.xml 
    632975============================================================================================================ 
    633976    --> 
    … …  
    650993      <field field_ref="qsr"          name="rsntds"   long_name="surface_net_downward_shortwave_flux"           /> 
    651994      <field field_ref="qt"           name="tohfls"   long_name="surface_net_downward_total_heat_flux"          /> 
    652       <field field_ref="taum"          /> 
    653       <field field_ref="20d"           /> 
    654       <field field_ref="mldkz5"        /> 
    655       <field field_ref="mldr10_1"      /> 
    656       <field field_ref="mldr10_3"      /> 
    657       <field field_ref="mldr0_1"       /> 
    658       <field field_ref="mldr0_3"       /> 
    659       <field field_ref="mld_dt02"      /> 
    660       <field field_ref="topthdep"      /> 
    661       <field field_ref="pycndep"       /> 
    662       <field field_ref="tinv"          /> 
    663       <field field_ref="depti"         /> 
    664       <field field_ref="BLT"          name="blt"      long_name="barrier_layer_thickness"               /> 
    665       <field field_ref="utau"         name="tauuo"    long_name="surface_downward_x_stress"             /> 
    666       <field field_ref="vtau"         name="tauvo"    long_name="surface_downward_y_stress"             /> 
     995      <field field_ref="taum"                                                                                   /> 
     996      <field field_ref="20d"                                                                                    /> 
     997      <field field_ref="mldkz5"                                                                                 /> 
     998      <field field_ref="mldr10_1"                                                                               /> 
     999      <field field_ref="mldr10_3"                                                                               /> 
     1000      <field field_ref="mldr0_1"                                                                                /> 
     1001      <field field_ref="mldr0_3"                                                                                /> 
     1002      <field field_ref="mld_dt02"                                                                               /> 
     1003      <field field_ref="topthdep"                                                                               /> 
     1004      <field field_ref="pycndep"                                                                                /> 
     1005      <field field_ref="tinv"                                                                                   /> 
     1006      <field field_ref="depti"                                                                                  /> 
     1007      <field field_ref="BLT"          name="blt"      long_name="barrier_layer_thickness"                       /> 
     1008      <field field_ref="utau"         name="tauuo"    long_name="surface_downward_x_stress"                     /> 
     1009      <field field_ref="vtau"         name="tauvo"    long_name="surface_downward_y_stress"                     /> 
    6671010    </field_group> 
    6681011 
    669      
    6701012    <field_group id="groupT" > 
    6711013      <field field_ref="toce"         name="thetao"   long_name="sea_water_potential_temperature"               /> 
    … …  
    6781020      <field field_ref="qsr"          name="rsntds"   long_name="surface_net_downward_shortwave_flux"           /> 
    6791021      <field field_ref="qt"           name="tohfls"   long_name="surface_net_downward_total_heat_flux"          /> 
    680       <field field_ref="taum"         /> 
    681       <field field_ref="20d"          /> 
    682       <field field_ref="mldkz5"       /> 
    683       <field field_ref="mldr10_1"     /> 
    684       <field field_ref="mldr10_3"     /> 
    685       <field field_ref="mld_dt02"     /> 
    686       <field field_ref="topthdep"     /> 
    687       <field field_ref="pycndep"      /> 
    688       <field field_ref="tinv"         /> 
    689       <field field_ref="depti"        /> 
    690       <field field_ref="BLT"          name="blt"      long_name="Barrier Layer Thickness"  /> 
     1022      <field field_ref="taum"                                                                                   /> 
     1023      <field field_ref="20d"                                                                                    /> 
     1024      <field field_ref="mldkz5"                                                                                 /> 
     1025      <field field_ref="mldr10_1"                                                                               /> 
     1026      <field field_ref="mldr10_3"                                                                               /> 
     1027      <field field_ref="mld_dt02"                                                                               /> 
     1028      <field field_ref="topthdep"                                                                               /> 
     1029      <field field_ref="pycndep"                                                                                /> 
     1030      <field field_ref="tinv"                                                                                   /> 
     1031      <field field_ref="depti"                                                                                  /> 
     1032      <field field_ref="BLT"          name="blt"      long_name="Barrier Layer Thickness"                       /> 
    6911033    </field_group> 
    6921034     
    6931035    <field_group id="groupU" > 
    6941036      <field field_ref="uoce"         name="uo"      long_name="sea_water_x_velocity"      /> 
    695       <field field_ref="suoce"        name="uos"     long_name="sea_surface_x_velocity"    /> 
     1037      <field field_ref="ssu"          name="uos"     long_name="sea_surface_x_velocity"    /> 
    6961038      <field field_ref="utau"         name="tauuo"   long_name="surface_downward_x_stress" /> 
    6971039    </field_group> 
    … …  
    6991041    <field_group id="groupV" > 
    7001042      <field field_ref="voce"         name="vo"      long_name="sea_water_y_velocity"      /> 
    701       <field field_ref="svoce"        name="vos"     long_name="sea_surface_y_velocity"    /> 
     1043      <field field_ref="ssv"          name="vos"     long_name="sea_surface_y_velocity"    /> 
    7021044      <field field_ref="vtau"         name="tauvo"   long_name="surface_downward_y_stress" /> 
    7031045    </field_group> 
    … …  
    7061048      <field field_ref="woce"         name="wo"       long_name="ocean vertical velocity"  /> 
    7071049    </field_group> 
    708      
    709     </field_definition> 
     1050 
     1051       <!-- TMB diagnostic output --> 
     1052    <field_group  id="1h_grid_T_tmb" grid_ref="grid_T_2D" operation="instant"> 
     1053     <field id="top_temp"           name="votemper_top"  unit="degC"  /> 
     1054     <field id="mid_temp"           name="votemper_mid"  unit="degC"  /> 
     1055     <field id="bot_temp"           name="votemper_bot"  unit="degC"  /> 
     1056     <field id="top_sal"            name="vosaline_top"  unit="psu"   /> 
     1057     <field id="mid_sal"            name="vosaline_mid"  unit="psu"   /> 
     1058     <field id="bot_sal"            name="vosaline_bot"  unit="psu"   /> 
     1059     <field id="sshnmasked"         name="sossheig"      unit="m"     />  
     1060   </field_group> 
     1061    <field_group  id="1h_grid_U_tmb" grid_ref="grid_U_2D" operation="instant"> 
     1062     <field id="top_u"           name="vozocrtx_top"  unit="m/s"  /> 
     1063     <field id="mid_u"           name="vozocrtx_mid"  unit="m/s"  /> 
     1064     <field id="bot_u"           name="vozocrtx_bot"  unit="m/s"  /> 
     1065     <field id="baro_u"          name="vobtcrtx"      unit="m/s"  /> 
     1066   </field_group> 
     1067    <field_group  id="1h_grid_V_tmb" grid_ref="grid_V_2D" operation="instant"> 
     1068     <field id="top_v"           name="vomecrty_top"  unit="m/s"  /> 
     1069     <field id="mid_v"           name="vomecrty_mid"  unit="m/s"  /> 
     1070     <field id="bot_v"           name="vomecrty_bot"  unit="m/s"  /> 
     1071     <field id="baro_v"          name="vobtcrty"      unit="m/s"  /> 
     1072   </field_group> 
     1073       <!-- 25h diagnostic output --> 
     1074      <field_group id="25h_grid_T" grid_ref="grid_T_3D" operation="instant"> 
     1075   <field id="temper25h"         name="potential temperature 25h mean"    unit="degC" /> 
     1076   <field id="tempis25h"         name="insitu temperature 25h mean"    unit="degC" /> 
     1077   <field id="salin25h"          name="salinity 25h mean"                 unit="psu"  /> 
     1078   <field id="ssh25h"            name="sea surface height 25h mean"  grid_ref="grid_T_2D"      unit="m"    /> 
     1079      </field_group> 
     1080 
     1081      <field_group id="25h_grid_U" grid_ref="grid_U_3D" operation="instant" > 
     1082   <field id="vozocrtx25h"         name="i current 25h mean"    unit="m/s"   /> 
     1083      </field_group> 
     1084 
     1085      <field_group id="25h_grid_V" grid_ref="grid_V_3D" operation="instant"> 
     1086   <field id="vomecrty25h"         name="j current 25h mean"    unit="m/s"    /> 
     1087      </field_group> 
     1088 
     1089      <field_group id="25h_grid_W" grid_ref="grid_W_3D" operation="instant"> 
     1090   <field id="vomecrtz25h"         name="k current 25h mean"                 unit="m/s"      /> 
     1091   <field id="avt25h"             name="vertical diffusivity25h mean"       unit="m2/s" /> 
     1092   <field id="avm25h"              name="vertical viscosity 25h mean"        unit="m2/s" /> 
     1093   <field id="tke25h"              name="turbulent kinetic energy 25h mean" /> 
     1094   <field id="mxln25h"             name="mixing length 25h mean"             unit="m" /> 
     1095      </field_group> 
     1096 
     1097 
     1098 
     1099   </field_definition> 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/SHARED/namelist_ice_lim2_ref

    r4329 r6225  
    1414!----------------------------------------------------------------------- 
    1515   cn_icerst_in  = "restart_ice_in"   !  suffix of ice restart name (input) 
     16   cn_icerst_indir = "."              !  directory from which to read input ice restarts 
    1617   cn_icerst_out = "restart_ice"      !  suffix of ice restart name (output) 
     18   cn_icerst_outdir = "."             !  directory in which to write output ice restarts 
    1719   ln_limdyn     = .true.             !  ice dynamics (T) or thermodynamics only (F) 
    1820   ln_limdmp     = .false.            !  restoring ice thickness and fraction leads   (T => fill  namice_dmp) 
    … …  
    4850   c_rhg       =  20.0     !  2nd bulk-rhelogy parameter 
    4951   etamn       =   0.0e+07 !  minimun value for viscosity 
    50    creepl      =   1.0e-08 !  creep limit 
    51    ecc         =   2.0     !  eccentricity of the elliptical yield curve 
     52   rn_creepl   =   1.0e-08 !  creep limit 
     53   rn_ecc      =   2.0     !  eccentricity of the elliptical yield curve 
    5254   ahi0        = 350.e0    !  horizontal eddy diffusivity coefficient for sea-ice [m2/s] 
    53    nevp        =   120     !  number of EVP subcycling iterations 
     55   nn_nevp     =   120     !  number of EVP subcycling iterations 
    5456   telast      =   9600    !  timescale for EVP elastic waves 
    5557   alphaevp    =   1.0     !  coefficient for the solution of EVP int. stresses 
    56    hminrhg     =   0.05     !  ice thickness (m) below which ice velocity equal ocean velocity 
    5758/ 
    5859!----------------------------------------------------------------------- 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/SHARED/namelist_ice_lim3_ref

    r4690 r6225  
    11!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
    2 !! NEMO/LIM3 :  1 - dynamics/advection/thermo          (namicerun) 
    3 !! namelists    2 - ice intialisation                  (namiceini) 
    4 !!              3 - ice dynamic                        (namicedyn) 
    5 !!              4 - ice advection                      (namicetrp) 
    6 !!              5 - thermodynamic                      (namicethd) 
    7 !!              6 - ice salinity                       (namicesal) 
    8 !!              7 - mechanical redistribution of ice   (namiceitdme) 
    9 !!              8 - ice diagnostics                    (namicedia) 
    10 !!              9 - ice outputs                        (namiceout) 
     2!! LIM3 namelist :   
     3!!              1 - Generic parameters                 (namicerun) 
     4!!              2 - Ice initialization                 (namiceini) 
     5!!              3 - Ice discretization                 (namiceitd) 
     6!!              4 - Ice dynamics and transport         (namicedyn) 
     7!!              5 - Ice thermodynamics                 (namicethd) 
     8!!              6 - Ice salinity                       (namicesal) 
     9!!              7 - Ice mechanical redistribution      (namiceitdme) 
    1110!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
    12  
    13 !----------------------------------------------------------------------- 
    14 &namicerun     !   Share parameters for dynamics/advection/thermo 
    15 !----------------------------------------------------------------------- 
     11! 
     12!------------------------------------------------------------------------------ 
     13&namicerun     !   Generic parameters 
     14!------------------------------------------------------------------------------ 
     15   jpl            =    5           !  number of ice  categories 
     16   nlay_i         =    2           !  number of ice  layers 
     17   nlay_s         =    1           !  number of snow layers (only 1 is working) 
    1618   cn_icerst_in  = "restart_ice"   !  suffix of ice restart name (input) 
     19   cn_icerst_indir = "."           !  directory from which to read input ice restarts 
    1720   cn_icerst_out = "restart_ice"   !  suffix of ice restart name (output) 
     21   cn_icerst_outdir = "."          !  directory in which to write output ice restarts 
    1822   ln_limdyn     = .true.          !  ice dynamics (T) or thermodynamics only (F) 
    19    amax          = 0.999           !  maximum ice concentration 
    20    cai           = 1.40e-3         !  atmospheric drag over sea ice (clio) 
    21    cao           = 1.00e-3         !  atmospheric drag over ocean   (clio) 
    22    ln_nicep      = .false.         !  Ice points output for debug (yes or no) 
    23    ln_limdiahsb  = .false.          !  check the heat and salt budgets (T) or not (F) 
     23   rn_amax       = 0.999           !  maximum tolerated ice concentration  
     24   ln_limdiahsb  = .false.         !  check the heat and salt budgets (T) or not (F) 
    2425   ln_limdiaout  = .true.          !  output the heat and salt budgets (T) or not (F) 
     26   ln_icectl     = .false.         !  ice points output for debug (T or F) 
     27   iiceprt       = 10              !  i-index for debug 
     28   jiceprt       = 10              !  j-index for debug 
    2529/ 
    26 !----------------------------------------------------------------------- 
    27 &namiceini     !   ice initialisation 
    28 !----------------------------------------------------------------------- 
    29    ln_limini   = .false.   !  activate ice initialization (T) or not (F) 
    30    thres_sst   =  0.0      !  threshold water temperature for initial sea ice 
    31    hts_ini_n   =  0.3      !  initial snow thickness in the north 
    32    hts_ini_s   =  0.3      !        "            "          south 
    33    hti_ini_n   =  1.0      !  initial ice thickness in the north 
    34    hti_ini_s   =  1.0      !        "            "         south 
    35    ati_ini_n   =  0.9      !  initial ice concentration in the north 
    36    ati_ini_s   =  0.9      !        "            "             south 
    37    smi_ini_n   =  6.301    !  initial ice salinity in the north 
    38    smi_ini_s   =  6.301    !        "            "    south 
    39    tmi_ini_n   =  270.     !  initial ice/snw temp in the north 
    40    tmi_ini_s   =  270.     !  initial ice/snw temp in the south 
     30!------------------------------------------------------------------------------ 
     31&namiceini     !   Ice initialization 
     32!------------------------------------------------------------------------------ 
     33   ln_iceini      = .true.         !  activate ice initialization (T) or not (F) 
     34   rn_thres_sst   =  2.0           !  maximum water temperature with initial ice (degC) 
     35   rn_hts_ini_n   =  0.3           !  initial real snow thickness (m), North 
     36   rn_hts_ini_s   =  0.3           !        "            "             South 
     37   rn_hti_ini_n   =  3.0           !  initial real ice thickness  (m), North 
     38   rn_hti_ini_s   =  1.0           !        "            "             South 
     39   rn_ati_ini_n   =  0.9           !  initial ice concentration   (-), North 
     40   rn_ati_ini_s   =  0.9           !        "            "             South 
     41   rn_smi_ini_n   =  6.3           !  initial ice salinity     (g/kg), North 
     42   rn_smi_ini_s   =  6.3           !        "            "             South 
     43   rn_tmi_ini_n   =  270.          !  initial ice/snw temperature (K), North 
     44   rn_tmi_ini_s   =  270.          !        "            "             South 
    4145/ 
    42 !----------------------------------------------------------------------- 
    43 &namicedyn     !   ice dynamic 
    44 !----------------------------------------------------------------------- 
    45    epsd        =   1.0e-20 !  tolerance parameter 
    46    om          =   0.5     !  relaxation constant  
    47    cw          =   5.0e-03 !  drag coefficient for oceanic stress 
    48    angvg       =   0.0     !  turning angle for oceanic stress 
    49    pstar       =   2.0e+04 !  1st bulk-rheology parameter 
    50    c_rhg       =  20.0     !  2nd bulk-rhelogy parameter 
    51    creepl      =   1.0e-12 !  creep limit 
    52    ecc         =   2.0     !  eccentricity of the elliptical yield curve 
    53    ahi0        = 350.e0    !  horizontal eddy diffusivity coefficient for sea-ice [m2/s] 
    54    nevp        = 300       !  number of iterations for subcycling in EVP, SB, 400 
    55    telast      =9600.0     !  timescale for elastic waves, SB, 720.0 
    56    alphaevp    =   1.0     !  coefficient for the solution of internal ice stresses 
    57    hminrhg     =   0.001   !  ice volume (a*h in m) below which ice velocity equal ocean velocity 
     46!------------------------------------------------------------------------------ 
     47&namiceitd     !   Ice discretization 
     48!------------------------------------------------------------------------------ 
     49   nn_catbnd      =    2           !  computation of ice category boundaries based on 
     50                                   !      1: tanh function 
     51                                   !      2: h^(-alpha), function of rn_himean 
     52   rn_himean      =    2.0         !  expected domain-average ice thickness (m), nn_catbnd = 2 only 
    5853/ 
    59 !----------------------------------------------------------------------- 
    60 &namicethd     !   ice thermodynamic 
    61 !----------------------------------------------------------------------- 
    62    hmelt       = -0.15     !  maximum melting at the bottom 
    63    hiccrit     = 0.1       !  ice thickness for lateral accretion  
    64                            !         caution 1.0, 1.0 best value to be used!!! (gilles G.)  ???? 
    65    fraz_swi    = 0         !  use of frazil ice collection thickness in function of wind (1.0) or not (0.0) 
    66    maxfrazb    = 0.0       !  maximum portion of frazil ice collecting at the ice bottom 
    67    vfrazb      = 0.4166667 !  thresold drift speed for frazil ice collecting at the ice bottom 
    68    Cfrazb      = 5.0       !  squeezing coefficient for frazil ice collecting at the ice bottom 
    69    hiclim      = 0.10      !  minimum ice thickness 
    70    hnzst       = 0.1       !  thickness of the surf. layer in temp. computation 
    71    parsub      = 1.0       !  switch for snow sublimation or not 
    72    betas       = 0.6       !  exponent in lead-ice fractionation of snow precipitation 0.66 
    73                            !        betas = 1 -> equipartition, betas < 1 -> more on leads 
    74    kappa_i     = 1.0       !  extinction radiation parameter in sea ice (1.0) 
    75    nconv_i_thd = 50        !  maximal number of iterations for heat diffusion computation 
    76    maxer_i_thd = 0.0001    !  maximal error in temperature for heat diffusion computation 
    77    thcon_i_swi = 1         !  switch for computation of thermal conductivity in the ice 
    78                            !        (0) Untersteiner (1964), (1) Pringle et al. (2007) 
     54!------------------------------------------------------------------------------ 
     55&namicedyn     !   Ice dynamics and transport 
     56!------------------------------------------------------------------------------ 
     57   nn_icestr      =    0           !  ice strength parameteriztaion                       
     58                                   !     0: Hibler_79     P = pstar*<h>*exp(-c_rhg*A) 
     59                                   !     1: Rothrock_75   P = Cf*coeff*integral(wr.h^2)     
     60   ln_icestr_bvf  =    .false.     !  ice strength function brine volume (T) or not (F)      
     61   rn_pe_rdg      =   17.0         !  ridging work divided by pot. energy change in ridging, if nn_icestr = 1 
     62   rn_pstar       =    2.0e+04     !  ice strength thickness parameter (N/m2), nn_icestr = 0  
     63   rn_crhg        =   20.0         !  ice strength conc. parameter (-), nn_icestr = 0        
     64   rn_cio         =    5.0e-03     !  ice-ocean drag coefficient           (-)              
     65   rn_creepl      =    1.0e-12     !  creep limit (s-1)                                    
     66   rn_ecc         =    2.0         !  eccentricity of the elliptical yield curve           
     67   nn_nevp        =  120           !  number of EVP subcycles                              
     68   rn_relast      =    0.333       !  ratio of elastic timescale to ice time step: Telast = dt_ice * rn_relast  
     69                                   !     advised value: 1/3 (rn_nevp=120) or 1/9 (rn_nevp=300) 
     70   nn_ahi0        =    2           !  horizontal diffusivity computation 
     71                                   !     0: use rn_ahi0_ref 
     72                                   !     1: use rn_ahi0_ref x mean grid cell length / ( 2deg mean grid cell length ) 
     73                                   !     2: use rn_ahi0_ref x grid cell length      / ( 2deg mean grid cell length ) 
     74   rn_ahi0_ref    = 350.0          !  horizontal sea ice diffusivity (m2/s)  
     75                                   !     if nn_ahi0 > 0, rn_ahi0_ref is the reference value at a nominal 2 deg resolution 
    7976/ 
    80 !----------------------------------------------------------------------- 
    81 &namicesal     !   ice salinity 
    82 !----------------------------------------------------------------------- 
    83    num_sal     =  2        !  salinity option: 1 -> S = bulk_sal 
    84                            !                   2 -> S = S(z,t) with a simple parameterization 
    85                            !                   3 -> S = S(z) profile of Scwharzacher [1959] 
    86                            !                   4 -> S = S(h) Cox and Weeks [1974] 
    87    bulk_sal    =  4.0      !  if 1 is used, it represents the ice salinity 
    88    sal_G       =  5.00     !  restoring salinity for GD 
    89    time_G      =  1.728e+6 !  restoring time for GD 
    90    sal_F       =  2.00     !  restoring salinity for flushing 
    91    time_F      =  8.640e+5 !  restoring time for flushing 
    92    s_i_max     = 20.0      !  Maximum salinity  
    93    s_i_min     =  0.1      !  Minimum tolerated ice salinity 
    94    s_i_0       =  3.5      !  1st salinity for salinity profile 
    95    s_i_1       =  4.5      !  2nd salinity for salinity profile 
     77!------------------------------------------------------------------------------ 
     78&namicehdf     !   Ice horizontal diffusion 
     79!------------------------------------------------------------------------------ 
     80   nn_convfrq     = 5              !  convergence check frequency of the Crant-Nicholson scheme (perf. optimization) 
    9681/ 
    97 !----------------------------------------------------------------------- 
    98 &namiceitdme   !   parameters for mechanical redistribution of ice  
    99 !----------------------------------------------------------------------- 
    100    ridge_scheme_swi = 0      !  which ridging scheme using (1=Rothrock,else=Hibler79) 
    101    Cs               =   0.50 !  shearing energy contribution to ridging 
    102    Cf               =  17.0  !  ratio of ridging work to PE change in ridging 
    103    fsnowrdg         =   0.5  !  snow fraction that survives in ridging 
    104    fsnowrft         =   0.5  !  snow fraction that survives in rafting 
    105    Gstar            =   0.15 !  fractional area of thin ice being ridged 
    106    astar            =   0.05 !  equivalent of gstar (0.05 for TH75 and 0.03 for weaker ice) 
    107    Hstar            = 100.0  !  parameter determining the maximum thickness of ridged ice 
    108    raft_swi         =   1    !  rafting or not 
    109    hparmeter        =   0.75 !  threshold thickness for rafting or not 
    110    Craft            =   5.0  !  coefficient used in the rafting function 
    111    ridge_por        =   0.3  !  initial porosity of the ridged ice (typically 0.30) 
    112    partfun_swi      =   1    !  participation function linear, TH75 (0) or exponential Letal07 (1) 
    113    brinstren_swi    =   0    !  (1) use brine volume to diminish ice strength 
     82!------------------------------------------------------------------------------ 
     83&namicethd     !   Ice thermodynamics 
     84!------------------------------------------------------------------------------ 
     85   rn_hnewice  = 0.1               !  thickness for new ice formation in open water (m) 
     86   ln_frazil   = .false.           !  use frazil ice collection thickness as a function of wind (T) or not (F) 
     87   rn_maxfrazb = 0.0               !  maximum fraction of frazil ice collecting at the ice base 
     88   rn_vfrazb   = 0.417             !  thresold drift speed for frazil ice collecting at the ice bottom (m/s) 
     89   rn_Cfrazb   = 5.0               !  squeezing coefficient for frazil ice collecting at the ice bottom 
     90   rn_himin    = 0.10              !  minimum ice thickness (m) used in remapping, must be smaller than rn_hnewice 
     91   rn_betas    = 0.66              !  exponent in lead-ice repratition of snow precipitation 
     92                                   !     betas = 1 -> equipartition, betas < 1 -> more on leads 
     93   rn_kappa_i  = 1.0               !  radiation attenuation coefficient in sea ice (m-1) 
     94   nn_conv_dif = 50                !  maximal number of iterations for heat diffusion computation 
     95   rn_terr_dif = 0.0001            !  maximum temperature after heat diffusion (degC) 
     96   nn_ice_thcon= 1                 !  sea ice thermal conductivity 
     97                                   !     0: k = k0 + beta.S/T (Untersteiner, 1964) 
     98                                   !     1: k = k0 + beta1.S/T - beta2.T (Pringle et al., 2007) 
     99   nn_monocat  = 0                 !  virtual ITD mono-category parameterizations (1, jpl = 1 only) or not (0) 
     100                                   !     2: simple piling instead of ridging --- temporary option 
     101                                   !     3: activate G(he) only              --- temporary option 
     102                                   !     4: activate lateral melting only    --- temporary option 
     103  ln_it_qnsice = .true.            !  iterate the surface non-solar flux with surface temperature (T) or not (F) 
    114104/ 
    115 !----------------------------------------------------------------------- 
    116 &namicedia     !   ice diagnostics 
    117 !----------------------------------------------------------------------- 
    118    fmtinf      ='1PE13.5 ' !  format of the output values 
    119    nfrinf      = 4         !  number of variables written in one line 
    120    ntmoy       = 1         !  instantaneous values of ice evolution or averaging 
    121    ninfo       = 1         !  frequency of ouputs on file ice_evolu in case of averaging 
     105!------------------------------------------------------------------------------ 
     106&namicesal     !   Ice salinity 
     107!------------------------------------------------------------------------------ 
     108   nn_icesal   =  2                !  ice salinity option 
     109                                   !     1: constant ice salinity (S=rn_icesal) 
     110                                   !     2: varying salinity parameterization S(z,t) 
     111                                   !     3: prescribed salinity profile S(z), Schwarzacher, 1959 
     112   rn_icesal   =  4.               !  ice salinity (g/kg, nn_icesal = 1 only) 
     113   rn_sal_gd   =  5.               !  restoring ice salinity, gravity drainage (g/kg) 
     114   rn_time_gd  =  1.73e+6          !  restoring time scale, gravity drainage  (s) 
     115   rn_sal_fl   =  2.               !  restoring ice salinity, flushing (g/kg) 
     116   rn_time_fl  =  8.64e+5          !  restoring time scale, flushing (s) 
     117   rn_simax    = 20.               !  maximum tolerated ice salinity (g/kg) 
     118   rn_simin    =  0.1              !  minimum tolerated ice salinity (g/kg) 
    122119/ 
    123 !!----------------------------------------------------------------------- 
    124 !&namicehsb       !  Heat and salt budgets  
    125 !!----------------------------------------------------------------------- 
    126 !/ 
    127  
     120!------------------------------------------------------------------------------ 
     121&namiceitdme   !   Ice mechanical redistribution (ridging and rafting) 
     122!------------------------------------------------------------------------------ 
     123   rn_Cs       =   0.5             !  fraction of shearing energy contributing to ridging 
     124   rn_fsnowrdg =   0.5             !  snow volume fraction that survives in ridging 
     125   rn_fsnowrft =   0.5             !  snow volume fraction that survives in rafting 
     126   nn_partfun  =   1               !  type of ridging participation function 
     127                                   !     0: linear (Thorndike et al, 1975) 
     128                                   !     1: exponential (Lipscomb, 2007 
     129   rn_gstar    =   0.15            !  fractional area of thin ice being ridged (nn_partfun = 0) 
     130   rn_astar    =   0.05            !  exponential measure of ridging ice fraction (nn_partfun = 1) 
     131   rn_hstar    = 100.0             !  determines the maximum thickness of ridged ice (m) (Hibler, 1980) 
     132   ln_rafting  =   .true.          !  rafting activated (T) or not (F) 
     133   rn_hraft    =   0.75            !  threshold thickness for rafting (m) 
     134   rn_craft    =   5.0             !  squeezing coefficient used in the rafting function 
     135   rn_por_rdg  =   0.3             !  porosity of newly ridged ice (Lepparanta et al., 1995) 
     136/ 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/SHARED/namelist_pisces_ref

    r4529 r6225  
    4848!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
    4949   concnno3   =  1.e-6    ! Nitrate half saturation of nanophytoplankton 
    50    concdno3   =  3.E-6    ! Phosphate half saturation for diatoms 
     50   concdno3   =  3.E-6    ! Nitrate half saturation for diatoms 
    5151   concnnh4   =  1.E-7    ! NH4 half saturation for phyto 
    5252   concdnh4   =  3.E-7    ! NH4 half saturation for diatoms 
    5353   concnfer   =  1.E-9    ! Iron half saturation for phyto 
    5454   concdfer   =  3.E-9    ! Iron half saturation for diatoms 
    55    concbfe    =  1.E-11   ! Half-saturation for Fe limitation of Bacteria 
    56    concbnh4   =  2.E-8    ! NH4 half saturation for phyto 
    57    concbno3   =  2.E-7    ! Phosphate half saturation for diatoms 
     55   concbfe    =  1.E-11   ! Iron half-saturation for DOC remin. 
     56   concbnh4   =  2.E-8    ! NH4 half saturation for DOC remin. 
     57   concbno3   =  2.E-7    ! Nitrate half saturation for DOC remin. 
    5858   xsizedia   =  1.E-6    ! Minimum size criteria for diatoms 
    5959   xsizephy   =  1.E-6    ! Minimum size criteria for phyto 
    … …  
    6161   xsizerd    =  3.0      ! Size ratio for diatoms 
    6262   xksi1      =  2.E-6    ! half saturation constant for Si uptake 
    63    xksi2      =  20E-6  ! half saturation constant for Si/C 
     63   xksi2      =  20E-6    ! half saturation constant for Si/C 
    6464   xkdoc      =  417.E-6  ! half-saturation constant of DOC remineralization 
    6565   qnfelim    =  7.E-6    ! Optimal quota of phyto 
    … …  
    8686   excret2    =  0.05     ! excretion ratio of diatoms 
    8787   ln_newprod =  .true.   ! Enable new parame. of production (T/F)  
    88    bresp      =  0.00333  ! Basal respiration rate 
    89    chlcnm     =  0.033    ! Minimum Chl/C in nanophytoplankton 
    90    chlcdm     =  0.05     ! Minimum Chl/C in diatoms 
    91    chlcmin    =  0.004    ! Maximum Chl/c in phytoplankton 
     88   bresp      =  0.033    ! Basal respiration rate 
     89   chlcnm     =  0.033    ! Maximum Chl/C in nanophytoplankton 
     90   chlcdm     =  0.05     ! Maximum Chl/C in diatoms 
     91   chlcmin    =  0.004    ! Minimum Chl/c in phytoplankton 
    9292   fecnm      =  40E-6    ! Maximum Fe/C in nanophytoplankton 
    93    fecdm      =  40E-6    ! Minimum Fe/C in diatoms 
     93   fecdm      =  40E-6    ! Maximum Fe/C in diatoms 
    9494   grosip     =  0.159    ! mean Si/C ratio 
    9595/ 
    … …  
    110110   resrat2    =  0.005    ! exsudation rate of mesozooplankton 
    111111   mzrat2     =  0.03     ! mesozooplankton mortality rate 
    112    xprefc     =  1.       ! zoo preference for phyto 
    113    xprefp     =  0.3      ! zoo preference for POC 
    114    xprefz     =  1.       ! zoo preference for zoo 
    115    xprefpoc   =  0.3      ! zoo preference for poc 
     112   xprefc     =  1.       ! mesozoo preference for diatoms 
     113   xprefp     =  0.3      ! mesozoo preference for nanophyto. 
     114   xprefz     =  1.       ! mesozoo preference for microzoo. 
     115   xprefpoc   =  0.3      ! mesozoo preference for poc 
    116116   xthresh2zoo = 1E-8     ! zoo feeding threshold for mesozooplankton  
    117117   xthresh2dia = 1E-8     ! diatoms feeding threshold for mesozooplankton  
    … …  
    119119   xthresh2poc = 1E-8     ! poc feeding threshold for mesozooplankton  
    120120   xthresh2   =  3E-7     ! Food threshold for grazing 
    121    xkgraz2    =  20.E-6   ! half sturation constant for meso grazing 
     121   xkgraz2    =  20.E-6   ! half saturation constant for meso grazing 
    122122   epsher2    =  0.35     ! Efficicency of Mesozoo growth 
    123123   sigma2     =  0.6      ! Fraction of mesozoo excretion as DOM 
    … …  
    156156&nampisrem     !   parameters for remineralization 
    157157!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
    158    xremik    =  0.35      ! remineralization rate of DOC 
     158   xremik    =  0.3       ! remineralization rate of DOC 
    159159   xremip    =  0.025     ! remineralisation rate of POC 
    160160   nitrif    =  0.05      ! NH4 nitrification rate 
    … …  
    207207/ 
    208208!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
     209&nampisice      !  Prescribed sea ice tracers 
     210!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
     211! constant ocean tracer concentrations are defined in trcice_pisces.F90 (Global, Arctic, Antarctic and Baltic) 
     212! trc_ice_ratio     * betw 0 and 1: prescribed ice/ocean tracer concentration ratio 
     213!                   * -1 => the ice-ocean tracer concentration ratio follows the  
     214!                           ice-ocean salinity ratio 
     215!                   * -2 => tracer concentration in sea ice is prescribed and  
     216!                           trc_ice_prescr is used 
     217! trc_ice_prescr    * prescribed tracer concentration. used only if  
     218!                     trc_ice_ratio = -2. equals -99 if not used. 
     219! cn_trc_o          * 'GL' use global ocean values making the Baltic distinction only 
     220!                     'AA' use specific Arctic/Antarctic/Baltic values 
     221!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
     222!    sn_tri_ ! trc_ice_ratio ! trc_ice_prescr !     cn_trc_o 
     223   sn_tri_dic =           -1.,           -99.,          'AA' 
     224   sn_tri_doc =            0.,           -99.,          'AA' 
     225   sn_tri_tal =           -1.,           -99.,          'AA' 
     226   sn_tri_oxy =           -1.,           -99.,          'AA' 
     227   sn_tri_cal =            0.,           -99.,          'AA' 
     228   sn_tri_po4 =           -1.,           -99.,          'AA' 
     229   sn_tri_poc =            0.,           -99.,          'AA' 
     230   sn_tri_goc =            0.,           -99.,          'AA' 
     231   sn_tri_bfe =            0.,           -99.,          'AA' 
     232   sn_tri_num =            0.,           -99.,          'AA' 
     233   sn_tri_sil =           -1.,           -99.,          'AA' 
     234   sn_tri_dsi =            0.,           -99.,          'AA' 
     235   sn_tri_gsi =            0.,           -99.,          'AA' 
     236   sn_tri_phy =            0.,           -99.,          'AA' 
     237   sn_tri_dia =            0.,           -99.,          'AA' 
     238   sn_tri_zoo =            0.,           -99.,          'AA' 
     239   sn_tri_mes =            0.,           -99.,          'AA' 
     240   sn_tri_fer =           -2.,          15E-9,          'AA' 
     241   sn_tri_sfe =            0.,           -99.,          'AA' 
     242   sn_tri_dfe =            0.,           -99.,          'AA' 
     243   sn_tri_nfe =            0.,           -99.,          'AA' 
     244   sn_tri_nch =            0.,           -99.,          'AA' 
     245   sn_tri_dch =            0.,           -99.,          'AA' 
     246   sn_tri_no3 =           -1.,           -99.,          'AA' 
     247   sn_tri_nh4 =            1.,           -99.,          'AA' 
     248/ 
     249!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
    209250&nampiskrp     !   Kriest parameterization : parameters     "key_kriest" 
    210251!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/SHARED/namelist_ref

    • Property svn:keywords set to Id
    r4699 r6225  
    11!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
    2 !! NEMO/OPA  :  1 - run manager      (namrun, namcfg) 
    3 !! namelists    2 - Domain           (namzgr, namzgr_sco, namdom, namtsd) 
     2!!                            namelist_ref 
     3!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
     4!! NEMO/OPA  :  1 - run manager      (namrun) 
     5!! namelists    2 - Domain           (namcfg, namzgr, namzgr_sco, namdom, namtsd) 
    46!!              3 - Surface boundary (namsbc, namsbc_ana, namsbc_flx, namsbc_clio, namsbc_core, namsbc_sas 
    57!!                                    namsbc_cpl, namtra_qsr, namsbc_rnf, 
    6 !!                                    namsbc_apr, namsbc_ssr, namsbc_alb) 
    7 !!              4 - lateral boundary (namlbc, namcla, namobc, namagrif, nambdy, nambdy_tide) 
     8!!                                    namsbc_apr, namsbc_ssr, namsbc_alb, namsbc_wave) 
     9!!              4 - lateral boundary (namlbc, namagrif, nambdy, nambdy_tide) 
    810!!              5 - bottom  boundary (nambfr, nambbc, nambbl) 
    9 !!              6 - Tracer           (nameos, namtra_adv, namtra_ldf, namtra_dmp) 
     11!!              6 - Tracer           (nameos, namtra_adv, namtra_ldf, namtra_ldfeiv, namtra_dmp) 
    1012!!              7 - dynamics         (namdyn_adv, namdyn_vor, namdyn_hpg, namdyn_spg, namdyn_ldf) 
    11 !!              8 - Verical physics  (namzdf, namzdf_ric, namzdf_tke, namzdf_kpp, namzdf_ddm, namzdf_tmx) 
    12 !!              9 - diagnostics      (namnc4, namtrd, namspr, namflo, namptr, namhsb) 
    13 !!             10 - miscellaneous    (namsol, nammpp, namctl) 
     13!!              8 - Verical physics  (namzdf, namzdf_ric, namzdf_tke, namzdf_ddm, namzdf_tmx) 
     14!!              9 - diagnostics      (namnc4, namtrd, namspr, namflo, namhsb, namsto) 
     15!!             10 - miscellaneous    (nammpp, namctl) 
    1416!!             11 - Obs & Assim      (namobs, nam_asminc) 
    1517!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
    … …  
    1820!!                   ***  Run management namelists  *** 
    1921!!====================================================================== 
    20 !!   namrun        parameters of the run 
     22!!   namrun       parameters of the run 
    2123!!====================================================================== 
    2224! 
    … …  
    2931   nn_itend    =    5475   !  last  time step (std 5475) 
    3032   nn_date0    =  010101   !  date at nit_0000 (format yyyymmdd) used if ln_rstart=F or (ln_rstart=T and nn_rstctl=0 or 1) 
     33   nn_time0    =       0   !  initial time of day in hhmm 
    3134   nn_leapy    =       0   !  Leap year calendar (1) or not (0) 
    3235   ln_rstart   = .false.   !  start from rest (F) or from a restart file (T) 
    33    nn_euler    =       1   !  = 0 : start with forward time step if ln_rstart=.true. 
    34    nn_rstctl   =       0   !  restart control => activated only if ln_rstart = T 
    35                            !    = 0 nn_date0 read in namelist ; nn_it000 : read in namelist 
    36                            !    = 1 nn_date0 read in namelist ; nn_it000 : check consistancy between namelist and restart 
    37                            !    = 2 nn_date0 read in restart  ; nn_it000 : check consistancy between namelist and restart 
    38    cn_ocerst_in  = "restart"   !  suffix of ocean restart name (input) 
    39    cn_ocerst_out = "restart"   !  suffix of ocean restart name (output) 
     36      nn_euler    =    1            !  = 0 : start with forward time step if ln_rstart=T 
     37      nn_rstctl   =    0            !  restart control ==> activated only if ln_rstart=T 
     38      !                             !    = 0 nn_date0 read in namelist ; nn_it000 : read in namelist 
     39      !                             !    = 1 nn_date0 read in namelist ; nn_it000 : check consistancy between namelist and restart 
     40      !                             !    = 2 nn_date0 read in restart  ; nn_it000 : check consistancy between namelist and restart 
     41      cn_ocerst_in    = "restart"   !  suffix of ocean restart name (input) 
     42      cn_ocerst_indir = "."         !  directory from which to read input ocean restarts 
     43      cn_ocerst_out   = "restart"   !  suffix of ocean restart name (output) 
     44      cn_ocerst_outdir= "."         !  directory in which to write output ocean restarts 
     45   ln_iscpl    = .false.   !  cavity evolution forcing or coupling to ice sheet model 
    4046   nn_istate   =       0   !  output the initial state (1) or not (0) 
     47   ln_rst_list = .false.   !  output restarts at list of times using nn_stocklist (T) or at set frequency with nn_stock (F) 
    4148   nn_stock    =    5475   !  frequency of creation of a restart file (modulo referenced to 1) 
     49   nn_stocklist = 0,0,0,0,0,0,0,0,0,0 ! List of timesteps when a restart file is to be written 
    4250   nn_write    =    5475   !  frequency of write in the output file   (modulo referenced to nn_it000) 
    43    ln_dimgnnn  = .false.   !  DIMG file format: 1 file for all processors (F) or by processor (T) 
    4451   ln_mskland  = .false.   !  mask land points in NetCDF outputs (costly: + ~15%) 
    45    ln_clobber  = .false.   !  clobber (overwrite) an existing file 
     52   ln_cfmeta   = .false.   !  output additional data to netCDF files required for compliance with the CF metadata standard 
     53   ln_clobber  = .true.    !  clobber (overwrite) an existing file 
    4654   nn_chunksz  =       0   !  chunksize (bytes) for NetCDF file (works only with iom_nf90 routines) 
    4755/ 
    4856! 
    49 !----------------------------------------------------------------------- 
    50 &namcfg     !   default parameters of the configuration       
    51 !----------------------------------------------------------------------- 
    52    cp_cfg      =  "default"            !  name of the configuration 
    53    cp_cfz      =         ''            !  name of the zoom of configuration 
    54    jp_cfg      =       0               !  resolution of the configuration 
    55    jpidta      =      10               !  1st lateral dimension ( >= jpi ) 
    56    jpjdta      =      12               !  2nd    "         "    ( >= jpj ) 
    57    jpkdta      =      31               !  number of levels      ( >= jpk ) 
    58    jpiglo      =      10               !  1st dimension of global domain --> i =jpidta 
    59    jpjglo      =      12               !  2nd    -                  -    --> j  =jpjdta 
    60    jpizoom     =       1               !  left bottom (i,j) indices of the zoom 
    61    jpjzoom     =       1               !  in data domain indices 
    62    jperio      =       0               !  lateral cond. type (between 0 and 6) 
    63                                        !  = 0 closed                 ;   = 1 cyclic East-West 
    64                                        !  = 2 equatorial symmetric   ;   = 3 North fold T-point pivot  
    65                                        !  = 4 cyclic East-West AND North fold T-point pivot 
    66                                        !  = 5 North fold F-point pivot 
    67                                        !  = 6 cyclic East-West AND North fold F-point pivot 
    68 / 
    6957!!====================================================================== 
    7058!!                      ***  Domain namelists  *** 
    7159!!====================================================================== 
     60!!   namcfg       parameters of the configuration 
    7261!!   namzgr       vertical coordinate 
    7362!!   namzgr_sco   s-coordinate or hybrid z-s-coordinate 
    7463!!   namdom       space and time domain (bathymetry, mesh, timestep) 
     64!!   namcrs       coarsened grid (for outputs and/or TOP)               ("key_crs") 
     65!!   namc1d       1D configuration options                              ("key_c1d") 
     66!!   namc1d_uvd   1D data (currents)                                    ("key_c1d") 
     67!!   namc1d_dyndmp 1D newtonian damping applied on currents             ("key_c1d") 
    7568!!   namtsd       data: temperature & salinity 
    7669!!====================================================================== 
    7770! 
    7871!----------------------------------------------------------------------- 
    79 &namzgr        !   vertical coordinate 
    80 !----------------------------------------------------------------------- 
    81    ln_zco      = .false.   !  z-coordinate - full    steps   (T/F)      ("key_zco" may also be defined) 
    82    ln_zps      = .true.    !  z-coordinate - partial steps   (T/F) 
    83    ln_sco      = .false.   !  s- or hybrid z-s-coordinate    (T/F) 
     72&namcfg        !   parameters of the configuration 
     73!----------------------------------------------------------------------- 
     74   cp_cfg      = "default" !  name of the configuration 
     75   cp_cfz      = "no zoom" !  name of the zoom of configuration 
     76   jp_cfg      =      0    !  resolution of the configuration 
     77   jpidta      =     10    !  1st lateral dimension ( >= jpi ) 
     78   jpjdta      =     12    !  2nd    "         "    ( >= jpj ) 
     79   jpkdta      =     31    !  number of levels      ( >= jpk ) 
     80   jpiglo      =     10    !  1st dimension of global domain --> i =jpidta 
     81   jpjglo      =     12    !  2nd    -                  -    --> j =jpjdta 
     82   jpizoom     =      1    !  left bottom (i,j) indices of the zoom 
     83   jpjzoom     =      1    !  in data domain indices 
     84   jperio      =      0    !  lateral cond. type (between 0 and 6) 
     85                                 !  = 0 closed                 ;   = 1 cyclic East-West 
     86                                 !  = 2 equatorial symmetric   ;   = 3 North fold T-point pivot 
     87                                 !  = 4 cyclic East-West AND North fold T-point pivot 
     88                                 !  = 5 North fold F-point pivot 
     89                                 !  = 6 cyclic East-West AND North fold F-point pivot 
     90   ln_use_jattr = .false.  !  use (T) the file attribute: open_ocean_jstart, if present 
     91                           !  in netcdf input files, as the start j-row for reading 
     92/ 
     93!----------------------------------------------------------------------- 
     94&namzgr        !   vertical coordinate                                  (default: NO selection) 
     95!----------------------------------------------------------------------- 
     96   ln_zco      = .false.   !  z-coordinate - full    steps 
     97   ln_zps      = .false.   !  z-coordinate - partial steps 
     98   ln_sco      = .false.   !  s- or hybrid z-s-coordinate 
     99   ln_isfcav   = .false.   !  ice shelf cavity 
     100   ln_linssh   = .false.   !  linear free surface 
    84101/ 
    85102!----------------------------------------------------------------------- 
    86103&namzgr_sco    !   s-coordinate or hybrid z-s-coordinate 
    87104!----------------------------------------------------------------------- 
    88    ln_s_sh94   = .true.    !  Song & Haidvogel 1994 hybrid S-sigma   (T)| 
     105   ln_s_sh94   = .false.    !  Song & Haidvogel 1994 hybrid S-sigma   (T)| 
    89106   ln_s_sf12   = .false.   !  Siddorn & Furner 2012 hybrid S-z-sigma (T)| if both are false the NEMO tanh stretching is applied 
    90107   ln_sigcrit  = .false.   !  use sigma coordinates below critical depth (T) or Z coordinates (F) for Siddorn & Furner stretch 
    … …  
    97114                        !!!!!!!  SH94 stretching coefficients  (ln_s_sh94 = .true.) 
    98115   rn_theta    =    6.0    !  surface control parameter (0<=theta<=20) 
    99    rn_bb       =    0.8    !  stretching with SH94 s-sigma    
     116   rn_bb       =    0.8    !  stretching with SH94 s-sigma 
    100117                        !!!!!!!  SF12 stretching coefficient  (ln_s_sf12 = .true.) 
    101118   rn_alpha    =    4.4    !  stretching with SF12 s-sigma 
    … …  
    106123   rn_zb_b     =   -0.2    !  offset for calculating Zb 
    107124                        !!!!!!!! Other stretching (not SH94 or SF12) [also uses rn_theta above] 
    108    rn_thetb    =    1.0    !  bottom control parameter  (0<=thetb<= 1)  
     125   rn_thetb    =    1.0    !  bottom control parameter  (0<=thetb<= 1) 
    109126/ 
    110127!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    114131   rn_bathy    =    0.     !  value of the bathymetry. if (=0) bottom flat at jpkm1 
    115132   nn_closea   =    0      !  remove (=0) or keep (=1) closed seas and lakes (ORCA) 
    116    nn_msh      =    0      !  create (=1) a mesh file or not (=0) 
     133   nn_msh      =    1      !  create (=1) a mesh file or not (=0) 
    117134   rn_hmin     =   -3.     !  min depth of the ocean (>0) or min number of ocean level (<0) 
     135   rn_isfhmin  =    1.00   !  treshold (m) to discriminate grounding ice to floating ice 
    118136   rn_e3zps_min=   20.     !  partial step thickness is set larger than the minimum of 
    119137   rn_e3zps_rat=    0.1    !  rn_e3zps_min and rn_e3zps_rat*e3t, with 0<rn_e3zps_rat<1 
    … …  
    121139   rn_rdt      = 5760.     !  time step for the dynamics (and tracer if nn_acc=0) 
    122140   rn_atfp     =    0.1    !  asselin time filter parameter 
    123    nn_acc      =    0      !  acceleration of convergence : =1      used, rdt < rdttra(k) 
    124                                  !                          =0, not used, rdt = rdttra 
    125    rn_rdtmin   = 28800.          !  minimum time step on tracers (used if nn_acc=1) 
    126    rn_rdtmax   = 28800.          !  maximum time step on tracers (used if nn_acc=1) 
    127    rn_rdth     =  800.           !  depth variation of tracer time step  (used if nn_acc=1) 
    128141   ln_crs      = .false.      !  Logical switch for coarsening module 
    129142   jphgr_msh   =       0               !  type of horizontal mesh 
    … …  
    152165/ 
    153166!----------------------------------------------------------------------- 
    154 &namsplit      !   time splitting parameters                            ("key_dynspg_ts") 
    155 !----------------------------------------------------------------------- 
    156    ln_bt_fw      =    .TRUE.           !  Forward integration of barotropic equations 
    157    ln_bt_av      =    .TRUE.           !  Time filtering of barotropic variables 
    158    ln_bt_nn_auto =    .TRUE.           !  Set nn_baro automatically to be just below 
    159                                        !  a user defined maximum courant number (rn_bt_cmax) 
    160    nn_baro       =    30               !  Number of iterations of barotropic mode 
    161                                        !  during rn_rdt seconds. Only used if ln_bt_nn_auto=F 
    162    rn_bt_cmax    =    0.8              !  Maximum courant number allowed if ln_bt_nn_auto=T  
    163    nn_bt_flt     =    1                !  Time filter choice 
    164                                        !  = 0 None 
    165                                        !  = 1 Boxcar over   nn_baro barotropic steps 
    166                                        !  = 2 Boxcar over 2*nn_baro     "        "   
    167 / 
    168 !----------------------------------------------------------------------- 
    169 &namcrs        !   Grid coarsening for dynamics output and/or 
    170                !   passive tracer coarsened online simulations 
     167&namcrs        !   coarsened grid (for outputs and/or TOP)              ("key_crs") 
    171168!----------------------------------------------------------------------- 
    172169   nn_factx    = 3         !  Reduction factor of x-direction 
    … …  
    190187/ 
    191188!----------------------------------------------------------------------- 
     189&namc1d_dyndmp !   U & V newtonian damping                              ("key_c1d") 
     190!----------------------------------------------------------------------- 
     191   ln_dyndmp   =  .false.  !  add a damping term (T) or not (F) 
     192/ 
     193!----------------------------------------------------------------------- 
     194&namc1d_uvd    !   data: U & V currents                                 ("key_c1d") 
     195!----------------------------------------------------------------------- 
     196!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
     197!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
     198   sn_ucur     = 'ucurrent'  ,         -1        ,'u_current',   .false.    , .true. , 'monthly' ,  ''      ,  'Ume'   , '' 
     199   sn_vcur     = 'vcurrent'  ,         -1        ,'v_current',   .false.    , .true. , 'monthly' ,  ''      ,  'Vme'   , '' 
     200! 
     201   cn_dir        = './'    !  root directory for the location of the files 
     202   ln_uvd_init   = .false. !  Initialisation of ocean U & V with U & V input data (T) or not (F) 
     203   ln_uvd_dyndmp = .false. !  damping of ocean U & V toward U & V input data (T) or not (F) 
     204/ 
     205!----------------------------------------------------------------------- 
    192206&namtsd    !   data : Temperature  & Salinity 
    193 !----------------------------------------------------------------------- 
    194207!----------------------------------------------------------------------- 
    195208!          !  file name                            ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
    … …  
    202215   ln_tsd_tradmp = .true.   !  damping of ocean T & S toward T &S input data (T) or not (F) 
    203216/ 
     217 
    204218!!====================================================================== 
    205219!!            ***  Surface Boundary Condition namelists  *** 
    206220!!====================================================================== 
    207221!!   namsbc          surface boundary condition 
    208 !!   namsbc_ana      analytical         formulation 
    209 !!   namsbc_flx      flux               formulation 
    210 !!   namsbc_clio     CLIO bulk formulae formulation 
    211 !!   namsbc_core     CORE bulk formulae formulation 
    212 !!   namsbc_mfs      MFS  bulk formulae formulation 
    213 !!   namsbc_cpl      CouPLed            formulation                     ("key_coupled") 
     222!!   namsbc_ana      analytical         formulation                     (ln_ana     =T) 
     223!!   namsbc_flx      flux               formulation                     (ln_flx     =T) 
     224!!   namsbc_clio     CLIO bulk formulae formulation                     (ln_blk_clio=T) 
     225!!   namsbc_core     CORE bulk formulae formulation                     (ln_blk_core=T) 
     226!!   namsbc_mfs      MFS  bulk formulae formulation                     (ln_blk_mfs =T) 
     227!!   namsbc_cpl      CouPLed            formulation                     ("key_oasis3" ) 
    214228!!   namsbc_sas      StAndalone Surface module 
    215 !!   namtra_qsr      penetrative solar radiation 
    216 !!   namsbc_rnf      river runoffs 
    217 !!   namsbc_apr      Atmospheric Pressure 
    218 !!   namsbc_ssr      sea surface restoring term (for T and/or S) 
     229!!   namtra_qsr      penetrative solar radiation                        (ln_traqsr  =T) 
     230!!   namsbc_rnf      river runoffs                                      (ln_rnf     =T) 
     231!!   namsbc_isf      ice shelf melting/freezing                         (nn_isf     >0) 
     232!!   namsbc_iscpl    coupling option between land ice model and ocean 
     233!!   namsbc_apr      Atmospheric Pressure                               (ln_apr_dyn =T) 
     234!!   namsbc_ssr      sea surface restoring term (for T and/or S)        (ln_ssr     =T) 
    219235!!   namsbc_alb      albedo parameters 
     236!!   namsbc_wave     external fields from wave model                    (ln_wave    =T) 
     237!!   namberg         iceberg floats                                     (ln_icebergs=T) 
    220238!!====================================================================== 
    221239! 
    … …  
    224242!----------------------------------------------------------------------- 
    225243   nn_fsbc     = 5         !  frequency of surface boundary condition computation 
    226                            !     (also = the frequency of sea-ice model call) 
     244                           !     (also = the frequency of sea-ice & iceberg model call) 
     245                     ! Type of air-sea fluxes  
    227246   ln_ana      = .false.   !  analytical formulation                    (T => fill namsbc_ana ) 
    228247   ln_flx      = .false.   !  flux formulation                          (T => fill namsbc_flx ) 
    … …  
    230249   ln_blk_core = .true.    !  CORE bulk formulation                     (T => fill namsbc_core) 
    231250   ln_blk_mfs  = .false.   !  MFS bulk formulation                      (T => fill namsbc_mfs ) 
    232    ln_cpl      = .false.   !  Coupled formulation                       (T => fill namsbc_cpl ) 
    233    ln_apr_dyn  = .false.   !  Patm gradient added in ocean & ice Eqs.   (T => fill namsbc_apr ) 
     251                     ! Type of coupling (Ocean/Ice/Atmosphere) : 
     252   ln_cpl      = .false.   !  atmosphere coupled   formulation          ( requires key_oasis3 ) 
     253   ln_mixcpl   = .false.   !  forced-coupled mixed formulation          ( requires key_oasis3 ) 
     254   nn_components = 0       !  configuration of the opa-sas OASIS coupling 
     255                           !  =0 no opa-sas OASIS coupling: default single executable configuration 
     256                           !  =1 opa-sas OASIS coupling: multi executable configuration, OPA component 
     257                           !  =2 opa-sas OASIS coupling: multi executable configuration, SAS component  
     258   nn_limflx = -1          !  LIM3 Multi-category heat flux formulation (use -1 if LIM3 is not used) 
     259                           !  =-1  Use per-category fluxes, bypass redistributor, forced mode only, not yet implemented coupled 
     260                           !  = 0  Average per-category fluxes (forced and coupled mode) 
     261                           !  = 1  Average and redistribute per-category fluxes, forced mode only, not yet implemented coupled 
     262                           !  = 2  Redistribute a single flux over categories (coupled mode only) 
     263                     ! Sea-ice : 
    234264   nn_ice      = 2         !  =0 no ice boundary condition   , 
    235265                           !  =1 use observed ice-cover      , 
    236                            !  =2 ice-model used                         ("key_lim3" or "key_lim2) 
     266                           !  =2 ice-model used                         ("key_lim3", "key_lim2", "key_cice") 
    237267   nn_ice_embd = 1         !  =0 levitating ice (no mass exchange, concentration/dilution effect) 
    238268                           !  =1 levitating ice with mass and salt exchange but no presure effect 
    239269                           !  =2 embedded sea-ice (full salt and mass exchanges and pressure) 
     270                     ! Misc. options of sbc :  
     271   ln_traqsr   = .true.    !  Light penetration in the ocean            (T => fill namtra_qsr ) 
    240272   ln_dm2dc    = .false.   !  daily mean to diurnal cycle on short wave 
    241273   ln_rnf      = .true.    !  runoffs                                   (T => fill namsbc_rnf) 
    … …  
    244276                           !     =1 global mean of e-p-r set to zero at each time step 
    245277                           !     =2 annual global mean of e-p-r set to zero 
    246                            !     =3 global emp set to zero and spread out over erp area 
    247    ln_wave = .false.       !  Activate coupling with wave (either Stokes Drift or Drag coefficient, or both)  (T => fill namsbc_wave) 
    248    ln_cdgw = .false.       !  Neutral drag coefficient read from wave model (T => fill namsbc_wave) 
    249    ln_sdw  = .false.       !  Computation of 3D stokes drift                (T => fill namsbc_wave) 
     278   ln_apr_dyn  = .false.   !  Patm gradient added in ocean & ice Eqs.   (T => fill namsbc_apr ) 
     279   ln_isf      = .false.   !  ice shelf                                 (T   => fill namsbc_isf) 
     280   ln_wave = .false.       !  coupling with surface wave                (T => fill namsbc_wave) 
    250281   nn_lsm  = 0             !  =0 land/sea mask for input fields is not applied (keep empty land/sea mask filename field) , 
    251282                           !  =1:n number of iterations of land/sea mask application for input fields (fill land/sea mask filename field) 
    252    cn_iceflx = 'linear'    !  redistribution of solar input into ice categories during coupling ice/atm. 
    253283/ 
    254284!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    265295&namsbc_flx    !   surface boundary condition : flux formulation 
    266296!----------------------------------------------------------------------- 
    267 !              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask !  
     297!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
    268298!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
    269299   sn_utau     = 'utau'      ,        24         , 'utau'    , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , ''       , '' 
    … …  
    293323&namsbc_core   !   namsbc_core  CORE bulk formulae 
    294324!----------------------------------------------------------------------- 
    295 !              !  file name                    ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights                               ! rotation ! land/sea mask ! 
    296 !              !                               !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename                              ! pairing  ! filename      ! 
    297    sn_wndi     = 'u_10.15JUNE2009_fill'        ,         6         , 'U_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bicubic_noc.nc'   , 'Uwnd'   , '' 
    298    sn_wndj     = 'v_10.15JUNE2009_fill'        ,         6         , 'V_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bicubic_noc.nc'   , 'Vwnd'   , '' 
    299    sn_qsr      = 'ncar_rad.15JUNE2009_fill'    ,        24         , 'SWDN_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc'  , ''       , '' 
    300    sn_qlw      = 'ncar_rad.15JUNE2009_fill'    ,        24         , 'LWDN_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc'  , ''       , '' 
    301    sn_tair     = 't_10.15JUNE2009_fill'        ,         6         , 'T_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc'  , ''       , '' 
    302    sn_humi     = 'q_10.15JUNE2009_fill'        ,         6         , 'Q_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc'  , ''       , '' 
    303    sn_prec     = 'ncar_precip.15JUNE2009_fill' ,        -1         , 'PRC_MOD1',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc'  , ''       , '' 
    304    sn_snow     = 'ncar_precip.15JUNE2009_fill' ,        -1         , 'SNOW'    ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc'  , ''       , '' 
    305    sn_tdif     = 'taudif_core'                 ,        24         , 'taudif'  ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc'  , ''       , '' 
     325!              !  file name                   ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights                               ! rotation ! land/sea mask ! 
     326!              !                              !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename                              ! pairing  ! filename      ! 
     327   sn_wndi     = 'u_10.15JUNE2009_fill'       ,         6         , 'U_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bicubic_noc.nc'   , 'Uwnd'   , '' 
     328   sn_wndj     = 'v_10.15JUNE2009_fill'       ,         6         , 'V_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bicubic_noc.nc'   , 'Vwnd'   , '' 
     329   sn_qsr      = 'ncar_rad.15JUNE2009_fill'   ,        24         , 'SWDN_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc'  , ''       , '' 
     330   sn_qlw      = 'ncar_rad.15JUNE2009_fill'   ,        24         , 'LWDN_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc'  , ''       , '' 
     331   sn_tair     = 't_10.15JUNE2009_fill'       ,         6         , 'T_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc'  , ''       , '' 
     332   sn_humi     = 'q_10.15JUNE2009_fill'       ,         6         , 'Q_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc'  , ''       , '' 
     333   sn_prec     = 'ncar_precip.15JUNE2009_fill',        -1         , 'PRC_MOD1',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc'  , ''       , '' 
     334   sn_snow     = 'ncar_precip.15JUNE2009_fill',        -1         , 'SNOW'    ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc'  , ''       , '' 
     335   sn_tdif     = 'taudif_core'                ,        24         , 'taudif'  ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc'  , ''       , '' 
    306336 
    307337   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the bulk files 
    308    ln_2m       = .false.   !  air temperature and humidity referenced at 2m (T) instead 10m (F) 
    309338   ln_taudif   = .false.   !  HF tau contribution: use "mean of stress module - module of the mean stress" data 
    310    ln_bulk2z   = .false.   !  Air temperature/humidity and wind vectors are referenced at heights rn_zqt and rn_zu 
    311    rn_zqt      = 3.        !  Air temperature and humidity reference height (m) (ln_bulk2z) 
    312    rn_zu       = 4.        !  Wind vector reference height (m)                  (ln_bulk2z) 
     339   rn_zqt      = 10.       !  Air temperature and humidity reference height (m) 
     340   rn_zu       = 10.       !  Wind vector reference height (m) 
    313341   rn_pfac     = 1.        !  multiplicative factor for precipitation (total & snow) 
    314342   rn_efac     = 1.        !  multiplicative factor for evaporation (0. or 1.) 
    315    rn_vfac     = 0.        !  multiplicative factor for ocean/ice velocity  
     343   rn_vfac     = 0.        !  multiplicative factor for ocean/ice velocity 
    316344                           !  in the calculation of the wind stress (0.=absolute winds or 1.=relative winds) 
    317345/ 
    … …  
    319347&namsbc_mfs   !   namsbc_mfs  MFS bulk formulae 
    320348!----------------------------------------------------------------------- 
    321 !              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights     ! rotation ! land/sea mask ! 
    322 !              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename    ! pairing  ! filename      ! 
    323    sn_wndi     =   'ecmwf'   ,        6          , 'u10'     ,    .true.    , .false. , 'daily'  ,'bicubic.nc' , ''       , '' 
    324    sn_wndj     =   'ecmwf'   ,        6          , 'v10'     ,    .true.    , .false. , 'daily'  ,'bicubic.nc' , ''       , '' 
    325    sn_clc      =   'ecmwf'   ,        6          , 'clc'     ,    .true.    , .false. , 'daily'  ,'bilinear.nc', ''       , '' 
    326    sn_msl      =   'ecmwf'   ,        6          , 'msl'     ,    .true.    , .false. , 'daily'  ,'bicubic.nc' , ''       , '' 
    327    sn_tair     =   'ecmwf'   ,        6          , 't2'      ,    .true.    , .false. , 'daily'  ,'bicubic.nc' , ''       , '' 
    328    sn_rhm      =   'ecmwf'   ,        6          , 'rh'      ,    .true.    , .false. , 'daily'  ,'bilinear.nc', ''       , '' 
    329    sn_prec     =   'ecmwf'   ,        6          , 'precip'  ,    .true.    , .true.  , 'daily'  ,'bicubic.nc' , ''       , '' 
     349!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights     ! rotation ! land/sea mask ! 
     350!              !             !  (if <0  months)  !   name   !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename    ! pairing  ! filename      ! 
     351   sn_wndi     =   'ecmwf'   ,        6          , 'u10'    ,    .true.    , .false., 'daily'   ,'bicubic.nc' ,   ''     ,  '' 
     352   sn_wndj     =   'ecmwf'   ,        6          , 'v10'    ,    .true.    , .false., 'daily'   ,'bicubic.nc' ,   ''     ,  '' 
     353   sn_clc      =   'ecmwf'   ,        6          , 'clc'    ,    .true.    , .false., 'daily'   ,'bilinear.nc',   ''     ,  '' 
     354   sn_msl      =   'ecmwf'   ,        6          , 'msl'    ,    .true.    , .false., 'daily'   ,'bicubic.nc' ,   ''     ,  '' 
     355   sn_tair     =   'ecmwf'   ,        6          , 't2'     ,    .true.    , .false., 'daily'   ,'bicubic.nc' ,   ''     ,  '' 
     356   sn_rhm      =   'ecmwf'   ,        6          , 'rh'     ,    .true.    , .false., 'daily'   ,'bilinear.nc',   ''     ,  '' 
     357   sn_prec     =   'ecmwf'   ,        6          , 'precip' ,    .true.    , .true. , 'daily'   ,'bicubic.nc' ,   ''     ,  '' 
    330358 
    331359   cn_dir      = './ECMWF/'      !  root directory for the location of the bulk files 
    332360/ 
    333361!----------------------------------------------------------------------- 
    334 &namsbc_cpl    !   coupled ocean/atmosphere model                       ("key_coupled") 
    335 !----------------------------------------------------------------------- 
    336 !                    !     description       !  multiple  !    vector   !      vector          ! vector ! 
    337 !                    !                       ! categories !  reference  !    orientation       ! grids  ! 
     362&namsbc_cpl    !   coupled ocean/atmosphere model                       ("key_oasis3") 
     363!----------------------------------------------------------------------- 
     364!                    !     description      !  multiple  !    vector   !      vector          ! vector ! 
     365!                    !                      ! categories !  reference  !    orientation       ! grids  ! 
    338366! send 
    339 sn_snd_temp   =       'weighted oce and ice' ,    'no'    ,     ''      ,         ''           ,   '' 
    340 sn_snd_alb    =       'weighted ice'         ,    'no'    ,     ''      ,         ''           ,   '' 
    341 sn_snd_thick  =       'none'                 ,    'no'   ,     ''      ,         ''           ,   '' 
    342 sn_snd_crt    =       'none'                 ,    'no'    , 'spherical' , 'eastward-northward' ,  'T' 
    343 sn_snd_co2    =       'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''           ,   '' 
     367   sn_snd_temp   =   'weighted oce and ice' ,    'no'    ,     ''      ,         ''           ,   '' 
     368   sn_snd_alb    =   'weighted ice'         ,    'no'    ,     ''      ,         ''           ,   '' 
     369   sn_snd_thick  =   'none'                 ,    'no'    ,     ''      ,         ''           ,   '' 
     370   sn_snd_crt    =   'none'                 ,    'no'    , 'spherical' , 'eastward-northward' ,  'T' 
     371   sn_snd_co2    =   'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''           ,   '' 
    344372! receive 
    345 sn_rcv_w10m   =       'none'                 ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
    346 sn_rcv_taumod =       'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
    347 sn_rcv_tau    =       'oce only'             ,    'no'    , 'cartesian' , 'eastward-northward',  'U,V' 
    348 sn_rcv_dqnsdt =       'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
    349 sn_rcv_qsr    =       'oce and ice'          ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
    350 sn_rcv_qns    =       'oce and ice'          ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
    351 sn_rcv_emp    =       'conservative'         ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
    352 sn_rcv_rnf    =       'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
    353 sn_rcv_cal    =       'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
    354 sn_rcv_co2    =       'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
     373   sn_rcv_w10m   =   'none'                 ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
     374   sn_rcv_taumod =   'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
     375   sn_rcv_tau    =   'oce only'             ,    'no'    , 'cartesian' , 'eastward-northward',  'U,V' 
     376   sn_rcv_dqnsdt =   'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
     377   sn_rcv_qsr    =   'oce and ice'          ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
     378   sn_rcv_qns    =   'oce and ice'          ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
     379   sn_rcv_emp    =   'conservative'         ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
     380   sn_rcv_rnf    =   'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
     381   sn_rcv_cal    =   'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
     382   sn_rcv_co2    =   'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
     383! 
     384   nn_cplmodel   =     1     !  Maximum number of models to/from which NEMO is potentialy sending/receiving data 
     385   ln_usecplmask = .false.   !  use a coupling mask file to merge data received from several models 
     386                             !   -> file cplmask.nc with the float variable called cplmask (jpi,jpj,nn_cplmodel) 
    355387/ 
    356388!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    359391!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
    360392!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
    361    sn_usp      = 'sas_grid_U' ,    120           , 'vozocrtx' ,  .true.    , .true. ,   'yearly'  , ''       , ''             , ''       
     393   sn_usp      = 'sas_grid_U' ,    120           , 'vozocrtx' ,  .true.    , .true. ,   'yearly'  , ''       , ''             , '' 
    362394   sn_vsp      = 'sas_grid_V' ,    120           , 'vomecrty' ,  .true.    , .true. ,   'yearly'  , ''       , ''             , '' 
    363395   sn_tem      = 'sas_grid_T' ,    120           , 'sosstsst' ,  .true.    , .true. ,   'yearly'  , ''       , ''             , '' 
    364396   sn_sal      = 'sas_grid_T' ,    120           , 'sosaline' ,  .true.    , .true. ,   'yearly'  , ''       , ''             , '' 
    365397   sn_ssh      = 'sas_grid_T' ,    120           , 'sossheig' ,  .true.    , .true. ,   'yearly'  , ''       , ''             , '' 
    366  
    367    ln_3d_uv    = .true.    !  specify whether we are supplying a 3D u,v field 
     398   sn_e3t      = 'sas_grid_T' ,    120           , 'e3t_m'    ,  .true.    , .true. ,   'yearly'  , ''       , ''             , '' 
     399   sn_frq      = 'sas_grid_T' ,    120           , 'frq_m'    ,  .true.    , .true. ,   'yearly'  , ''       , ''             , '' 
     400 
     401   ln_3d_uve   = .true.    !  specify whether we are supplying a 3D u,v and e3 field 
     402   ln_read_frq = .false.    !  specify whether we must read frq or not 
    368403   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the bulk files are 
    369404/ 
    370405!----------------------------------------------------------------------- 
    371 &namtra_qsr    !   penetrative solar radiation 
     406&namtra_qsr    !   penetrative solar radiation                          (ln_traqsr=T) 
    372407!----------------------------------------------------------------------- 
    373408!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
    … …  
    376411 
    377412   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
    378    ln_traqsr   = .true.    !  Light penetration (T) or not (F) 
    379413   ln_qsr_rgb  = .true.    !  RGB (Red-Green-Blue) light penetration 
    380414   ln_qsr_2bd  = .false.   !  2 bands              light penetration 
    … …  
    387421/ 
    388422!----------------------------------------------------------------------- 
    389 &namsbc_rnf    !   runoffs namelist surface boundary condition 
     423&namsbc_rnf    !   runoffs namelist surface boundary condition          (ln_rnf=T) 
    390424!----------------------------------------------------------------------- 
    391425!              !  file name           ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
    … …  
    398432 
    399433   cn_dir       = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
    400    ln_rnf_emp   = .false.   !  runoffs included into precipitation field (T) or into a file (F) 
    401434   ln_rnf_mouth = .true.    !  specific treatment at rivers mouths 
    402435   rn_hrnf      =  15.e0    !  depth over which enhanced vertical mixing is used 
    … …  
    406439   ln_rnf_tem   = .false.   !  read in temperature information for runoff 
    407440   ln_rnf_sal   = .false.   !  read in salinity information for runoff 
     441   ln_rnf_depth_ini = .false.  ! compute depth at initialisation from runoff file 
     442   rn_rnf_max   = 5.735e-4  !  max value of the runoff climatologie over global domain ( ln_rnf_depth_ini = .true ) 
     443   rn_dep_max   = 150.      !  depth over which runoffs is spread ( ln_rnf_depth_ini = .true ) 
     444   nn_rnf_depth_file = 0    !  create (=1) a runoff depth file or not (=0) 
     445/ 
     446!----------------------------------------------------------------------- 
     447&namsbc_isf    !  Top boundary layer (ISF)                              (nn_isf >0) 
     448!----------------------------------------------------------------------- 
     449!              ! file name ! frequency (hours) ! variable ! time interp. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
     450!              !           !  (if <0  months)  !   name   !  (logical)   !  (T/F)  ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
     451! nn_isf == 4 
     452   sn_fwfisf   = 'rnfisf'  ,         -12       ,'sowflisf',   .false.    , .true.  , 'yearly'  ,  ''      ,   ''     , '' 
     453! nn_isf == 3 
     454   sn_rnfisf   = 'rnfisf'  ,         -12       ,'sofwfisf',   .false.    , .true.  , 'yearly'  ,  ''      ,   ''     , '' 
     455! nn_isf == 2 and 3 
     456   sn_depmax_isf='rnfisf'  ,         -12       ,'sozisfmax',  .false.    , .true.  , 'yearly'  ,  ''      ,   ''     , '' 
     457   sn_depmin_isf='rnfisf'  ,         -12       ,'sozisfmin',  .false.    , .true.  , 'yearly'  ,  ''      ,   ''     , '' 
     458! nn_isf == 2 
     459   sn_Leff_isf = 'rnfisf'  ,         -12       ,'Leff'    ,   .false.    , .true.  , 'yearly'  ,  ''      ,   ''     , '' 
     460! 
     461! for all case 
     462   nn_isf      = 1         !  ice shelf melting/freezing 
     463                           !  1 = presence of ISF    2 = bg03 parametrisation  
     464                           !  3 = rnf file for isf   4 = ISF fwf specified 
     465                           !  option 1 and 4 need ln_isfcav = .true. (domzgr) 
     466! only for nn_isf = 1 or 2 
     467   rn_gammat0  = 1.e-4    ! gammat coefficient used in blk formula 
     468   rn_gammas0  = 1.e-4    ! gammas coefficient used in blk formula 
     469! only for nn_isf = 1 or 4 
     470   rn_hisf_tbl =  30.      ! thickness of the top boundary layer    (Losh et al. 2008) 
     471                          ! 0 => thickness of the tbl = thickness of the first wet cell 
     472! only for nn_isf = 1 
     473   nn_isfblk   = 1        ! 1 ISOMIP  like: 2 equations formulation (Hunter et al., 2006) 
     474                          ! 2 ISOMIP+ like: 3 equations formulation (Asay-Davis et al., 2015) 
     475   nn_gammablk = 1        ! 0 = cst Gammat (= gammat/s) 
     476                          ! 1 = velocity dependend Gamma (u* * gammat/s)  (Jenkins et al. 2010) 
     477                          ! 2 = velocity and stability dependent Gamma    (Holland et al. 1999) 
     478/ 
     479!----------------------------------------------------------------------- 
     480&namsbc_iscpl  !   land ice / ocean coupling option                      
     481!----------------------------------------------------------------------- 
     482   nn_drown  = 10       ! number of iteration of the extrapolation loop (fill the new wet cells) 
     483   ln_hsb    = .false.  ! activate conservation module (conservation exact after a time of rn_fiscpl) 
     484   nn_fiscpl = 43800    ! (number of time step) conservation period (maybe should be fix to the coupling frequencey of restart frequency) 
    408485/ 
    409486!----------------------------------------------------------------------- 
    410487&namsbc_apr    !   Atmospheric pressure used as ocean forcing or in bulk 
    411488!----------------------------------------------------------------------- 
    412 !              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
    413 !              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
    414    sn_apr      = 'patm'      ,         -1        ,'somslpre',    .true.     , .true. , 'yearly'  ,  ''      ,   ''     , '' 
     489!              !  file name ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
     490!              !            !  (if <0  months)  !   name    !  (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
     491   sn_apr      = 'patm'     ,         -1        ,'somslpre',    .true.     , .true. , 'yearly'  ,  ''      ,   ''     , '' 
    415492 
    416493   cn_dir      = './'       !  root directory for the location of the bulk files 
    417    rn_pref     = 101000._wp !  reference atmospheric pressure   [N/m2]/ 
     494   rn_pref     = 101000.    !  reference atmospheric pressure   [N/m2]/ 
    418495   ln_ref_apr  = .false.    !  ref. pressure: global mean Patm (T) or a constant (F) 
    419496   ln_apr_obc  = .false.    !  inverse barometer added to OBC ssh data 
    420497/ 
    421498!----------------------------------------------------------------------- 
    422 &namsbc_ssr    !   surface boundary condition : sea surface restoring 
     499&namsbc_ssr    !   surface boundary condition : sea surface restoring   (ln_ssr=T) 
    423500!----------------------------------------------------------------------- 
    424501!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
    … …  
    446523/ 
    447524!----------------------------------------------------------------------- 
    448 &namberg       !   iceberg parameters 
    449 !----------------------------------------------------------------------- 
    450       ln_icebergs              = .false. 
     525&namsbc_wave   ! External fields from wave model                        (ln_wave=T) 
     526!----------------------------------------------------------------------- 
     527!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable    ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
     528!              !             !  (if <0  months)  !   name      !  (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
     529   sn_cdg      =  'cdg_wave' ,        1          , 'drag_coeff',     .true.   , .false., 'daily'   ,  ''      , ''       , '' 
     530   sn_usd      =  'sdw_wave' ,        1          , 'u_sd2d'    ,     .true.   , .false., 'daily'   ,  ''      , ''       , '' 
     531   sn_vsd      =  'sdw_wave' ,        1          , 'v_sd2d'    ,     .true.   , .false., 'daily'   ,  ''      , ''       , '' 
     532   sn_wn       =  'sdw_wave' ,        1          , 'wave_num'  ,     .true.   , .false., 'daily'   ,  ''      , ''       , '' 
     533! 
     534   cn_dir_cdg  = './'      !  root directory for the location of drag coefficient files 
     535   ln_cdgw = .false.       !  Neutral drag coefficient read from wave model 
     536   ln_sdw  = .false.       !  Computation of 3D stokes drift                
     537/ 
     538!----------------------------------------------------------------------- 
     539&namberg       !   iceberg parameters                                   (default: No iceberg) 
     540!----------------------------------------------------------------------- 
     541      ln_icebergs              = .false.              ! iceberg floats or not 
    451542      ln_bergdia               = .true.               ! Calculate budgets 
    452543      nn_verbose_level         = 1                    ! Turn on more verbose output if level > 0 
    … …  
    455546                                                      ! Initial mass required for an iceberg of each class 
    456547      rn_initial_mass          = 8.8e7, 4.1e8, 3.3e9, 1.8e10, 3.8e10, 7.5e10, 1.2e11, 2.2e11, 3.9e11, 7.4e11 
    457                                                       ! Proportion of calving mass to apportion to each class   
     548                                                      ! Proportion of calving mass to apportion to each class 
    458549      rn_distribution          = 0.24, 0.12, 0.15, 0.18, 0.12, 0.07, 0.03, 0.03, 0.03, 0.02 
    459550                                                      ! Ratio between effective and real iceberg mass (non-dim) 
    460                                                       ! i.e. number of icebergs represented at a point          
     551                                                      ! i.e. number of icebergs represented at a point 
    461552      rn_mass_scaling          = 2000, 200, 50, 20, 10, 5, 2, 1, 1, 1 
    462553                                                      ! thickness of newly calved bergs (m) 
    … …  
    467558      rn_bits_erosion_fraction = 0.                   ! Fraction of erosion melt flux to divert to bergy bits 
    468559      rn_sicn_shift            = 0.                   ! Shift of sea-ice concn in erosion flux (0<sicn_shift<1) 
    469       ln_passive_mode          = .false.              ! iceberg - ocean decoupling    
     560      ln_passive_mode          = .false.              ! iceberg - ocean decoupling 
    470561      nn_test_icebergs         =  10                  ! Create test icebergs of this class (-1 = no) 
    471562                                                      ! Put a test iceberg at each gridpoint in box (lon1,lon2,lat1,lat2) 
    472563      rn_test_box              = 108.0,  116.0, -66.0, -58.0 
    473       rn_speed_limit           = 0.                   ! CFL speed limit for a berg    
    474  
    475 !              ! file name ! frequency (hours) !   variable   ! time interp.  !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
    476 !              !           !  (if <0  months)  !     name     !   (logical)    !  (T/F ) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
    477       sn_icb =  'calving' ,       -1           , 'calvingmask',  .true.        , .true.  , 'yearly'  , ''       , ''       , '' 
    478     
    479       cn_dir = './'  
     564      rn_speed_limit           = 0.                   ! CFL speed limit for a berg 
     565 
     566!            ! file name ! frequency (hours) !   variable   ! time interp. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
     567!            !           !  (if <0  months)  !     name     !   (logical)  !  (T/F ) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
     568      sn_icb =  'calving',       -1          , 'calvingmask',  .true.      , .true.  , 'yearly'  , ''       , ''       , '' 
     569 
     570      cn_dir = './' 
    480571/ 
    481572 
    … …  
    484575!!====================================================================== 
    485576!!   namlbc        lateral momentum boundary condition 
    486 !!   namcla        cross land advection 
    487577!!   namobc        open boundaries parameters                           ("key_obc") 
    488578!!   namagrif      agrif nested grid ( read by child model only )       ("key_agrif") 
    … …  
    494584&namlbc        !   lateral momentum boundary condition 
    495585!----------------------------------------------------------------------- 
     586   !                       !  free slip  !   partial slip  !   no slip   ! strong slip 
    496587   rn_shlat    =    2.     !  shlat = 0  !  0 < shlat < 2  !  shlat = 2  !  2 < shlat 
    497                            !  free slip  !   partial slip  !   no slip   ! strong slip 
    498    ln_vorlat   = .false.   !  consistency of vorticity boundary condition with analytical eqs. 
    499 / 
    500 !----------------------------------------------------------------------- 
    501 &namcla        !   cross land advection 
    502 !----------------------------------------------------------------------- 
    503    nn_cla      =    0      !  advection between 2 ocean pts separates by land 
    504 / 
    505 !----------------------------------------------------------------------- 
    506 &namobc        !   open boundaries parameters                           ("key_obc") 
    507 !----------------------------------------------------------------------- 
    508    ln_obc_clim = .false.   !  climatological obc data files (T) or not (F) 
    509    ln_vol_cst  = .true.    !  impose the total volume conservation (T) or not (F) 
    510    ln_obc_fla  = .false.   !  Flather open boundary condition 
    511    nn_obcdta   =    1      !  = 0 the obc data are equal to the initial state 
    512                            !  = 1 the obc data are read in 'obc.dta' files 
    513    cn_obcdta   = 'annual'  !  set to annual if obc datafile hold 1 year of data 
    514                            !  set to monthly if obc datafile hold 1 month of data 
    515    rn_dpein    =    1.     !  damping time scale for inflow at east  open boundary 
    516    rn_dpwin    =    1.     !     -           -         -       west    -      - 
    517    rn_dpnin    =    1.     !     -           -         -       north   -      - 
    518    rn_dpsin    =    1.     !     -           -         -       south   -      - 
    519    rn_dpeob    = 3000.     !  time relaxation (days) for the east  open boundary 
    520    rn_dpwob    =   15.     !     -           -         -     west    -      - 
    521    rn_dpnob    = 3000.     !     -           -         -     north   -      - 
    522    rn_dpsob    =   15.     !     -           -         -     south   -      - 
    523    rn_volemp   =    1.     !  = 0 the total volume change with the surface flux (E-P-R) 
    524                            !  = 1 the total volume remains constant 
     588   ln_vorlat   = .false.   !  consistency of vorticity boundary condition with analytical Eqs. 
    525589/ 
    526590!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    531595   rn_sponge_tra = 2880.   !  coefficient for tracer   sponge layer [m2/s] 
    532596   rn_sponge_dyn = 2880.   !  coefficient for dynamics sponge layer [m2/s] 
    533 / 
    534 !----------------------------------------------------------------------- 
    535 &nam_tide      !   tide parameters (#ifdef key_tide) 
     597   ln_chk_bathy  = .FALSE. ! 
     598/ 
     599!----------------------------------------------------------------------- 
     600&nam_tide      !   tide parameters                                      ("key_tide") 
    536601!----------------------------------------------------------------------- 
    537602   ln_tide_pot   = .true.   !  use tidal potential forcing 
    538603   ln_tide_ramp  = .false.  ! 
    539604   rdttideramp   =    0.    ! 
    540    clname(1)     =   'M2'   !  name of constituent 
    541    clname(2)     =   'S2' 
    542    clname(3)     =   'N2' 
    543    clname(4)     =   'K1' 
    544    clname(5)     =   'O1' 
    545    clname(6)     =   'Q1' 
    546    clname(7)     =   'M4' 
    547    clname(8)     =   'K2' 
    548    clname(9)     =   'P1' 
    549    clname(10)    =   'Mf' 
    550    clname(11)    =   'Mm' 
     605   clname(1)     = 'DUMMY'  !  name of constituent - all tidal components must be set in namelist_cfg 
    551606/ 
    552607!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    563618                                          !  = 2, use tidal harmonic forcing data from files 
    564619                                          !  = 3, use external data AND tidal harmonic forcing 
    565     cn_dyn3d      =  'none'               !   
     620    cn_dyn3d      =  'none'               ! 
    566621    nn_dyn3d_dta  =  0                    !  = 0, bdy data are equal to the initial state 
    567622                                          !  = 1, bdy data are read in 'bdydata   .nc' files 
    568     cn_tra        =  'none'               !  
     623    cn_tra        =  'none'               ! 
    569624    nn_tra_dta    =  0                    !  = 0, bdy data are equal to the initial state 
    570625                                          !  = 1, bdy data are read in 'bdydata   .nc' files 
    571     cn_ice_lim      =  'none'             !   
     626    cn_ice_lim      =  'none'             ! 
    572627    nn_ice_lim_dta  =  0                  !  = 0, bdy data are equal to the initial state 
    573628                                          !  = 1, bdy data are read in 'bdydata   .nc' files 
    … …  
    578633    ln_tra_dmp    =.false.                !  open boudaries conditions for tracers 
    579634    ln_dyn3d_dmp  =.false.                !  open boundary condition for baroclinic velocities 
    580     rn_time_dmp   =  1.                   ! Damping time scale in days  
     635    rn_time_dmp   =  1.                   ! Damping time scale in days 
    581636    rn_time_dmp_out =  1.                 ! Outflow damping time scale 
    582637    nn_rimwidth   = 10                    !  width of the relaxation zone 
    … …  
    585640/ 
    586641!----------------------------------------------------------------------- 
    587 &nambdy_dta      !  open boundaries - external data           ("key_bdy") 
    588 !----------------------------------------------------------------------- 
    589 !              !  file name      ! frequency (hours) ! variable   ! time interp.  !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
    590 !              !                 !  (if <0  months)  !   name     !   (logical)    !  (T/F ) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
    591    bn_ssh =     'amm12_bdyT_u2d' ,         24        , 'sossheig' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
    592    bn_u2d =     'amm12_bdyU_u2d' ,         24        , 'vobtcrtx' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
    593    bn_v2d =     'amm12_bdyV_u2d' ,         24        , 'vobtcrty' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
    594    bn_u3d  =    'amm12_bdyU_u3d' ,         24        , 'vozocrtx' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
    595    bn_v3d  =    'amm12_bdyV_u3d' ,         24        , 'vomecrty' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
    596    bn_tem  =    'amm12_bdyT_tra' ,         24        , 'votemper' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
    597    bn_sal  =    'amm12_bdyT_tra' ,         24        , 'vosaline' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
     642&nambdy_dta    !  open boundaries - external data                       ("key_bdy") 
     643!----------------------------------------------------------------------- 
     644!              !  file name      ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
     645!              !                 !  (if <0  months)  !   name    !  (logical)   !  (T/F ) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
     646   bn_ssh =     'amm12_bdyT_u2d' ,         24        , 'sossheig',     .true.   , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
     647   bn_u2d =     'amm12_bdyU_u2d' ,         24        , 'vobtcrtx',     .true.   , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
     648   bn_v2d =     'amm12_bdyV_u2d' ,         24        , 'vobtcrty',     .true.   , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
     649   bn_u3d  =    'amm12_bdyU_u3d' ,         24        , 'vozocrtx',     .true.   , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
     650   bn_v3d  =    'amm12_bdyV_u3d' ,         24        , 'vomecrty',     .true.   , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
     651   bn_tem  =    'amm12_bdyT_tra' ,         24        , 'votemper',     .true.   , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
     652   bn_sal  =    'amm12_bdyT_tra' ,         24        , 'vosaline',     .true.   , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
    598653! for lim2 
    599 !   bn_frld  =    'amm12_bdyT_ice' ,         24        , 'ileadfra' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
    600 !   bn_hicif =    'amm12_bdyT_ice' ,         24        , 'iicethic' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
    601 !   bn_hsnif =    'amm12_bdyT_ice' ,         24        , 'isnowthi' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
     654!   bn_frld  =   'amm12_bdyT_ice' ,         24        , 'ileadfra',     .true.   , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
     655!   bn_hicif =   'amm12_bdyT_ice' ,         24        , 'iicethic',     .true.   , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
     656!   bn_hsnif =   'amm12_bdyT_ice' ,         24        , 'isnowthi',     .true.   , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
    602657! for lim3 
    603 !   bn_a_i  =    'amm12_bdyT_ice' ,         24        , 'ileadfra' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
    604 !   bn_ht_i =    'amm12_bdyT_ice' ,         24        , 'iicethic' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
    605 !   bn_ht_s =    'amm12_bdyT_ice' ,         24        , 'isnowthi' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
    606    cn_dir  =    'bdydta/' 
    607    ln_full_vel = .false. 
     658!   bn_a_i  =    'amm12_bdyT_ice' ,         24        , 'ileadfra',     .true.   , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
     659!   bn_ht_i =    'amm12_bdyT_ice' ,         24        , 'iicethic',     .true.   , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
     660!   bn_ht_s =    'amm12_bdyT_ice' ,         24        , 'isnowthi',     .true.   , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
     661 
     662   cn_dir      =    'bdydta/'   !  root directory for the location of the bulk files 
     663   ln_full_vel = .false.        !   
    608664/ 
    609665!----------------------------------------------------------------------- 
    610666&nambdy_tide     ! tidal forcing at open boundaries 
    611667!----------------------------------------------------------------------- 
    612    filtide          = 'bdydta/amm12_bdytide_'         !  file name root of tidal forcing files 
    613    ln_bdytide_2ddta = .false. 
    614    ln_bdytide_conj  = .false. 
     668   filtide          = 'bdydta/amm12_bdytide_'   !  file name root of tidal forcing files 
     669   ln_bdytide_2ddta = .false.                   ! 
     670   ln_bdytide_conj  = .false.                   !  
    615671/ 
    616672!!====================================================================== 
    … …  
    623679! 
    624680!----------------------------------------------------------------------- 
    625 &nambfr        !   bottom friction 
     681&nambfr        !   bottom friction                                      (default: linear) 
    626682!----------------------------------------------------------------------- 
    627683   nn_bfr      =    1      !  type of bottom friction :   = 0 : free slip,  = 1 : linear friction 
    … …  
    631687   rn_bfri2_max =   1.e-1  !  max. bottom drag coefficient (non linear case and ln_loglayer=T) 
    632688   rn_bfeb2    =    2.5e-3 !  bottom turbulent kinetic energy background  (m2/s2) 
    633    rn_bfrz0    =    3.e-3  !  bottom roughness [m] if ln_loglayer=T  
    634    ln_loglayer = .false.   !  logarithmic formulation (non linear case) 
     689   rn_bfrz0    =    3.e-3  !  bottom roughness [m] if ln_loglayer=T 
    635690   ln_bfr2d    = .false.   !  horizontal variation of the bottom friction coef (read a 2D mask file ) 
    636691   rn_bfrien   =    50.    !  local multiplying factor of bfr (ln_bfr2d=T) 
     692   rn_tfri1    =    4.e-4  !  top drag coefficient (linear case) 
     693   rn_tfri2    =    2.5e-3 !  top drag coefficient (non linear case). Minimum coeft if ln_loglayer=T 
     694   rn_tfri2_max =   1.e-1  !  max. top drag coefficient (non linear case and ln_loglayer=T) 
     695   rn_tfeb2    =    0.0    !  top turbulent kinetic energy background  (m2/s2) 
     696   rn_tfrz0    =    3.e-3  !  top roughness [m] if ln_loglayer=T 
     697   ln_tfr2d    = .false.   !  horizontal variation of the top friction coef (read a 2D mask file ) 
     698   rn_tfrien   =    50.    !  local multiplying factor of tfr (ln_tfr2d=T) 
     699 
    637700   ln_bfrimp   = .true.    !  implicit bottom friction (requires ln_zdfexp = .false. if true) 
    638 / 
    639 !----------------------------------------------------------------------- 
    640 &nambbc        !   bottom temperature boundary condition 
    641 !----------------------------------------------------------------------- 
    642    ln_trabbc   = .true.    !  Apply a geothermal heating at the ocean bottom 
     701   ln_loglayer = .false.   !  logarithmic formulation (non linear case) 
     702/ 
     703!----------------------------------------------------------------------- 
     704&nambbc        !   bottom temperature boundary condition                (default: NO) 
     705!----------------------------------------------------------------------- 
     706!              !  file name      ! frequency (hours) ! variable  ! time interp.!  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
     707!              !                 !  (if <0  months)  !   name    !  (logical)  !  (T/F ) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
     708   sn_qgh      ='geothermal_heating.nc',  -12.       , 'heatflow',   .false.   , .true.  , 'yearly'  ,   ''     ,   ''     ,   '' 
     709   ! 
     710   ln_trabbc   = .false.   !  Apply a geothermal heating at the ocean bottom 
    643711   nn_geoflx   =    2      !  geothermal heat flux: = 0 no flux 
    644712                           !     = 1 constant flux 
    645713                           !     = 2 variable flux (read in geothermal_heating.nc in mW/m2) 
    646714   rn_geoflx_cst = 86.4e-3 !  Constant value of geothermal heat flux [W/m2] 
    647 / 
    648 !----------------------------------------------------------------------- 
    649 &nambbl        !   bottom boundary layer scheme 
     715   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the runoff files  
     716/ 
     717!----------------------------------------------------------------------- 
     718&nambbl        !   bottom boundary layer scheme                         ("key_trabbl") 
    650719!----------------------------------------------------------------------- 
    651720   nn_bbl_ldf  =  1      !  diffusive bbl (=1)   or not (=0) 
    … …  
    658727!!                        Tracer (T & S ) namelists 
    659728!!====================================================================== 
    660 !!   nameos        equation of state 
    661 !!   namtra_adv    advection scheme 
    662 !!   namtra_ldf    lateral diffusion scheme 
    663 !!   namtra_dmp    T & S newtonian damping 
     729!!   nameos           equation of state 
     730!!   namtra_adv       advection scheme 
     731!!   namtra_adv_mle   mixed layer eddy param. (Fox-Kemper param.) 
     732!!   namtra_ldf       lateral diffusion scheme 
     733!!   namtra_ldfeiv    eddy induced velocity param. 
     734!!   namtra_dmp       T & S newtonian damping 
    664735!!====================================================================== 
    665736! 
    … …  
    667738&nameos        !   ocean physical parameters 
    668739!----------------------------------------------------------------------- 
    669    nn_eos      =   0       !  type of equation of state and Brunt-Vaisala frequency 
    670                            !     = 0, UNESCO (formulation of Jackett and McDougall (1994) and of McDougall (1987) ) 
    671                            !     = 1, linear: rho(T)   = rau0 * ( 1.028 - ralpha * T ) 
    672                            !     = 2, linear: rho(T,S) = rau0 * ( rbeta * S - ralpha * T ) 
    673    rn_alpha    =   2.0e-4  !  thermal expension coefficient (nn_eos= 1 or 2) 
    674    rn_beta     =   7.7e-4  !  saline  expension coefficient (nn_eos= 2) 
    675 / 
    676 !----------------------------------------------------------------------- 
    677 &namtra_adv    !   advection scheme for tracer 
    678 !----------------------------------------------------------------------- 
    679    ln_traadv_cen2   =  .false.  !  2nd order centered scheme 
    680    ln_traadv_tvd    =  .true.   !  TVD scheme 
    681    ln_traadv_muscl  =  .false.  !  MUSCL scheme 
    682    ln_traadv_muscl2 =  .false.  !  MUSCL2 scheme + cen2 at boundaries 
    683    ln_traadv_ubs    =  .false.  !  UBS scheme 
    684    ln_traadv_qck    =  .false.  !  QUICKEST scheme 
    685    ln_traadv_msc_ups=  .false.  !  use upstream scheme within muscl 
    686 / 
    687 !----------------------------------------------------------------------- 
    688 &namtra_adv_mle !   mixed layer eddy parametrisation (Fox-Kemper param) 
    689 !----------------------------------------------------------------------- 
    690    ln_mle    = .true.      ! (T) use the Mixed Layer Eddy (MLE) parameterisation 
     740   nn_eos      =  -1     !  type of equation of state and Brunt-Vaisala frequency 
     741                                 !  =-1, TEOS-10 
     742                                 !  = 0, EOS-80 
     743                                 !  = 1, S-EOS   (simplified eos) 
     744   ln_useCT    = .true.  ! use of Conservative Temp. ==> surface CT converted in Pot. Temp. in sbcssm 
     745                                 ! 
     746   !                     ! S-EOS coefficients : 
     747                                 !  rd(T,S,Z)*rau0 = -a0*(1+.5*lambda*dT+mu*Z+nu*dS)*dT+b0*dS 
     748   rn_a0       =  1.6550e-1      !  thermal expension coefficient (nn_eos= 1) 
     749   rn_b0       =  7.6554e-1      !  saline  expension coefficient (nn_eos= 1) 
     750   rn_lambda1  =  5.9520e-2      !  cabbeling coeff in T^2  (=0 for linear eos) 
     751   rn_lambda2  =  7.4914e-4      !  cabbeling coeff in S^2  (=0 for linear eos) 
     752   rn_mu1      =  1.4970e-4      !  thermobaric coeff. in T (=0 for linear eos) 
     753   rn_mu2      =  1.1090e-5      !  thermobaric coeff. in S (=0 for linear eos) 
     754   rn_nu       =  2.4341e-3      !  cabbeling coeff in T*S  (=0 for linear eos) 
     755/ 
     756!----------------------------------------------------------------------- 
     757&namtra_adv    !   advection scheme for tracer                          (default: NO advection) 
     758!----------------------------------------------------------------------- 
     759   ln_traadv_cen =  .false.  !  2nd order centered scheme 
     760      nn_cen_h   =  4               !  =2/4, horizontal 2nd order CEN / 4th order CEN 
     761      nn_cen_v   =  4               !  =2/4, vertical   2nd order CEN / 4th order COMPACT 
     762   ln_traadv_fct =  .false.  !  FCT scheme 
     763      nn_fct_h   =  2               !  =2/4, horizontal 2nd / 4th order  
     764      nn_fct_v   =  2               !  =2/4, vertical   2nd / COMPACT 4th order  
     765      nn_fct_zts =  0               !  >=1,  2nd order FCT scheme with vertical sub-timestepping 
     766      !                             !        (number of sub-timestep = nn_fct_zts) 
     767   ln_traadv_mus =  .false.  !  MUSCL scheme 
     768      ln_mus_ups =  .false.         !  use upstream scheme near river mouths 
     769   ln_traadv_ubs =  .false.  !  UBS scheme 
     770      nn_ubs_v   =  2               !  =2  , vertical 2nd order FCT / COMPACT 4th order 
     771   ln_traadv_qck =  .false.  !  QUICKEST scheme 
     772/ 
     773!----------------------------------------------------------------------- 
     774&namtra_adv_mle !   mixed layer eddy parametrisation (Fox-Kemper param) (default: NO) 
     775!----------------------------------------------------------------------- 
     776   ln_mle    = .false.      ! (T) use the Mixed Layer Eddy (MLE) parameterisation 
    691777   rn_ce     = 0.06        ! magnitude of the MLE (typical value: 0.06 to 0.08) 
    692778   nn_mle    = 1           ! MLE type: =0 standard Fox-Kemper ; =1 new formulation 
    … …  
    698784   rn_rho_c_mle  = 0.01    ! delta rho criterion used to calculate MLD for FK 
    699785/ 
    700 !---------------------------------------------------------------------------------- 
    701 &namtra_ldf    !   lateral diffusion scheme for tracers 
    702 !---------------------------------------------------------------------------------- 
     786!----------------------------------------------------------------------- 
     787&namtra_ldf    !   lateral diffusion scheme for tracers                 (default: NO diffusion) 
     788!----------------------------------------------------------------------- 
    703789   !                       !  Operator type: 
    704    ln_traldf_lap    =  .true.   !  laplacian operator 
    705    ln_traldf_bilap  =  .false.  !  bilaplacian operator 
     790   !                           !  no diffusion: set ln_traldf_lap=..._blp=F  
     791   ln_traldf_lap   =  .false.  !    laplacian operator 
     792   ln_traldf_blp   =  .false.  !  bilaplacian operator 
    706793   !                       !  Direction of action: 
    707    ln_traldf_level  =  .false.  !  iso-level 
    708    ln_traldf_hor    =  .false.  !  horizontal (geopotential)   (needs "key_ldfslp" when ln_sco=T) 
    709    ln_traldf_iso    =  .true.   !  iso-neutral                 (needs "key_ldfslp") 
    710    !                 !  Griffies parameters              (all need "key_ldfslp") 
    711    ln_traldf_grif   =  .false.  !  use griffies triads 
    712    ln_traldf_gdia   =  .false.  !  output griffies eddy velocities 
    713    ln_triad_iso     =  .false.  !  pure lateral mixing in ML 
    714    ln_botmix_grif   =  .false.  !  lateral mixing on bottom 
    715    !                       !  Coefficients 
    716    ! Eddy-induced (GM) advection always used with Griffies; otherwise needs "key_traldf_eiv" 
    717    ! Value rn_aeiv_0 is ignored unless = 0 with Held-Larichev spatially varying aeiv 
    718    !                                  (key_traldf_c2d & key_traldf_eiv & key_orca_r2, _r1 or _r05) 
    719    rn_aeiv_0        =  2000.    !  eddy induced velocity coefficient [m2/s] 
    720    rn_aht_0         =  2000.    !  horizontal eddy diffusivity for tracers [m2/s] 
    721    rn_ahtb_0        =     0.    !  background eddy diffusivity for ldf_iso [m2/s] 
    722    !                                           (normally=0; not used with Griffies) 
    723    rn_slpmax        =     0.01  !  slope limit 
    724    rn_chsmag        =     1.    !  multiplicative factor in Smagorinsky diffusivity 
    725    rn_smsh          =     1.    !  Smagorinsky diffusivity: = 0 - use only sheer 
    726    rn_aht_m         =  2000.    !  upper limit or stability criteria for lateral eddy diffusivity (m2/s) 
    727 / 
    728 !----------------------------------------------------------------------- 
    729 &namtra_dmp    !   tracer: T & S newtonian damping 
     794   ln_traldf_lev   =  .false.  !  iso-level 
     795   ln_traldf_hor   =  .false.  !  horizontal (geopotential) 
     796   ln_traldf_iso   =  .false.  !  iso-neutral (standard operator) 
     797   ln_traldf_triad =  .false.  !  iso-neutral (triad    operator) 
     798   ! 
     799   !                       !  iso-neutral options:         
     800   ln_traldf_msc   =  .false.  !  Method of Stabilizing Correction (both operators) 
     801   rn_slpmax       =   0.01    !  slope limit                      (both operators) 
     802   ln_triad_iso    =  .false.  !  pure horizontal mixing in ML              (triad only) 
     803   rn_sw_triad     =  1        !  =1 switching triad ; =0 all 4 triads used (triad only) 
     804   ln_botmix_triad =  .false.  !  lateral mixing on bottom                  (triad only) 
     805   ! 
     806   !                       !  Coefficients: 
     807   nn_aht_ijk_t    = 0         !  space/time variation of eddy coef 
     808   !                                !   =-20 (=-30)    read in eddy_diffusivity_2D.nc (..._3D.nc) file 
     809   !                                !   =  0           constant  
     810   !                                !   = 10 F(k)      =ldf_c1d  
     811   !                                !   = 20 F(i,j)    =ldf_c2d  
     812   !                                !   = 21 F(i,j,t)  =Treguier et al. JPO 1997 formulation 
     813   !                                !   = 30 F(i,j,k)  =ldf_c2d * ldf_c1d 
     814   !                                !   = 31 F(i,j,k,t)=F(local velocity and grid-spacing) 
     815   rn_aht_0        = 2000.     !  lateral eddy diffusivity   (lap. operator) [m2/s] 
     816   rn_bht_0        = 1.e+12    !  lateral eddy diffusivity (bilap. operator) [m4/s] 
     817/ 
     818!----------------------------------------------------------------------- 
     819&namtra_ldfeiv !   eddy induced velocity param.                         (default: NO) 
     820!----------------------------------------------------------------------- 
     821   ln_ldfeiv     =.false.  ! use eddy induced velocity parameterization 
     822   ln_ldfeiv_dia =.false.  ! diagnose eiv stream function and velocities 
     823   rn_aeiv_0     = 2000.   ! eddy induced velocity coefficient   [m2/s] 
     824   nn_aei_ijk_t  = 21      ! space/time variation of the eiv coeficient 
     825   !                                !   =-20 (=-30)    read in eddy_induced_velocity_2D.nc (..._3D.nc) file 
     826   !                                !   =  0           constant  
     827   !                                !   = 10 F(k)      =ldf_c1d  
     828   !                                !   = 20 F(i,j)    =ldf_c2d  
     829   !                                !   = 21 F(i,j,t)  =Treguier et al. JPO 1997 formulation 
     830   !                                !   = 30 F(i,j,k)  =ldf_c2d + ldf_c1d 
     831/ 
     832!----------------------------------------------------------------------- 
     833&namtra_dmp    !   tracer: T & S newtonian damping                      (default: NO) 
    730834!----------------------------------------------------------------------- 
    731835   ln_tradmp   =  .true.   !  add a damping termn (T) or not (F) 
    732    nn_hdmp     =   -1      !  horizontal shape =-1, damping in Med and Red Seas only 
    733                            !                   =XX, damping poleward of XX degrees (XX>0) 
    734                            !                      + F(distance-to-coast) + Red and Med Seas 
    735836   nn_zdmp     =    0      !  vertical   shape =0    damping throughout the water column 
    736837                           !                   =1 no damping in the mixing layer (kz  criteria) 
    737838                           !                   =2 no damping in the mixed  layer (rho crieria) 
    738    rn_surf     =   50.     !  surface time scale of damping   [days] 
    739    rn_bot      =  360.     !  bottom  time scale of damping   [days] 
    740    rn_dep      =  800.     !  depth of transition between rn_surf and rn_bot [meters] 
    741    nn_file     =    0      !  create a damping.coeff NetCDF file (=1) or not (=0) 
     839   cn_resto    ='resto.nc' !  Name of file containing restoration coeff. field (use dmp_tools to create this) 
    742840/ 
    743841 
    … …  
    748846!!   namdyn_vor    advection scheme 
    749847!!   namdyn_hpg    hydrostatic pressure gradient 
    750 !!   namdyn_spg    surface pressure gradient                            (CPP key only) 
     848!!   namdyn_spg    surface pressure gradient 
    751849!!   namdyn_ldf    lateral diffusion scheme 
    752850!!====================================================================== 
    753851! 
    754852!----------------------------------------------------------------------- 
    755 &namdyn_adv    !   formulation of the momentum advection 
     853&namdyn_adv    !   formulation of the momentum advection                (default: vector form) 
    756854!----------------------------------------------------------------------- 
    757855   ln_dynadv_vec = .true.  !  vector form (T) or flux form (F) 
     856   nn_dynkeg     = 0       ! scheme for grad(KE): =0   C2  ;  =1   Hollingsworth correction 
    758857   ln_dynadv_cen2= .false. !  flux form - 2nd order centered scheme 
    759858   ln_dynadv_ubs = .false. !  flux form - 3rd order UBS      scheme 
    760 / 
    761 !----------------------------------------------------------------------- 
    762 &nam_vvl    !   vertical coordinate options 
    763 !----------------------------------------------------------------------- 
    764    ln_vvl_zstar  = .true.           !  zstar vertical coordinate                    
     859   ln_dynzad_zts = .false. !  Use (T) sub timestepping for vertical momentum advection 
     860/ 
     861!----------------------------------------------------------------------- 
     862&nam_vvl    !   vertical coordinate options                             (default: zstar) 
     863!----------------------------------------------------------------------- 
     864   ln_vvl_zstar  = .true.           !  zstar vertical coordinate 
    765865   ln_vvl_ztilde = .false.          !  ztilde vertical coordinate: only high frequency variations 
    766866   ln_vvl_layer  = .false.          !  full layer vertical coordinate 
    … …  
    774874/ 
    775875!----------------------------------------------------------------------- 
    776 &namdyn_vor    !   option of physics/algorithm (not control by CPP keys) 
     876&namdyn_vor    !   option of physics/algorithm                          (default: NO) 
    777877!----------------------------------------------------------------------- 
    778878   ln_dynvor_ene = .false. !  enstrophy conserving scheme 
    779879   ln_dynvor_ens = .false. !  energy conserving scheme 
    780880   ln_dynvor_mix = .false. !  mixed scheme 
    781    ln_dynvor_een = .true.  !  energy & enstrophy scheme 
    782 / 
    783 !----------------------------------------------------------------------- 
    784 &namdyn_hpg    !   Hydrostatic pressure gradient option 
     881   ln_dynvor_een = .false. !  energy & enstrophy scheme 
     882      nn_een_e3f = 1          ! e3f = masked averaging of e3t divided by 4 (=0) or by the sum of mask (=1) 
     883   ln_dynvor_msk = .false. !  vorticity multiplied by fmask (=T) or not (=F) (all vorticity schemes)  ! PLEASE DO NOT ACTIVATE 
     884/ 
     885!----------------------------------------------------------------------- 
     886&namdyn_hpg    !   Hydrostatic pressure gradient option                 (default: zps) 
    785887!----------------------------------------------------------------------- 
    786888   ln_hpg_zco  = .false.   !  z-coordinate - full steps 
    787889   ln_hpg_zps  = .true.    !  z-coordinate - partial steps (interpolation) 
    788890   ln_hpg_sco  = .false.   !  s-coordinate (standard jacobian formulation) 
     891   ln_hpg_isf  = .false.   !  s-coordinate (sco ) adapted to isf 
    789892   ln_hpg_djc  = .false.   !  s-coordinate (Density Jacobian with Cubic polynomial) 
    790893   ln_hpg_prj  = .false.   !  s-coordinate (Pressure Jacobian scheme) 
    791    ln_dynhpg_imp = .false. !  time stepping: semi-implicit time scheme  (T) 
    792                                  !           centered      time scheme  (F) 
    793 / 
    794 !----------------------------------------------------------------------- 
    795 !namdyn_spg    !   surface pressure gradient   (CPP key only) 
    796 !----------------------------------------------------------------------- 
    797 !                          !  explicit free surface                     ("key_dynspg_exp") 
    798 !                          !  filtered free surface                     ("key_dynspg_flt") 
    799 !                          !  split-explicit free surface               ("key_dynspg_ts") 
    800  
    801 !----------------------------------------------------------------------- 
    802 &namdyn_ldf    !   lateral diffusion on momentum 
     894/ 
     895!----------------------------------------------------------------------- 
     896&namdyn_spg    !   surface pressure gradient                            (default: NO) 
     897!----------------------------------------------------------------------- 
     898   ln_dynspg_exp  = .false.   ! explicit free surface 
     899   ln_dynspg_ts   = .false.   ! split-explicit free surface 
     900      ln_bt_fw      = .true.     ! Forward integration of barotropic Eqs. 
     901      ln_bt_av      = .true.     ! Time filtering of barotropic variables 
     902         nn_bt_flt     = 1          ! Time filter choice  = 0 None 
     903         !                          !                     = 1 Boxcar over   nn_baro sub-steps 
     904         !                          !                     = 2 Boxcar over 2*nn_baro  "    " 
     905      ln_bt_auto    = .true.     ! Number of sub-step defined from: 
     906         rn_bt_cmax   =  0.8        ! =T : the Maximum Courant Number allowed 
     907         nn_baro      = 30          ! =F : the number of sub-step in rn_rdt seconds 
     908/ 
     909!----------------------------------------------------------------------- 
     910&namdyn_ldf    !   lateral diffusion on momentum                        (default: NO) 
    803911!----------------------------------------------------------------------- 
    804912   !                       !  Type of the operator : 
    805    ln_dynldf_lap    =  .true.   !  laplacian operator 
    806    ln_dynldf_bilap  =  .false.  !  bilaplacian operator 
     913   !                           !  no diffusion: set ln_dynldf_lap=..._blp=F  
     914   ln_dynldf_lap =  .false.    !    laplacian operator 
     915   ln_dynldf_blp =  .false.    !  bilaplacian operator 
    807916   !                       !  Direction of action  : 
    808    ln_dynldf_level  =  .false.  !  iso-level 
    809    ln_dynldf_hor    =  .true.   !  horizontal (geopotential)            (require "key_ldfslp" in s-coord.) 
    810    ln_dynldf_iso    =  .false.  !  iso-neutral                          (require "key_ldfslp") 
     917   ln_dynldf_lev =  .false.    !  iso-level 
     918   ln_dynldf_hor =  .false.    !  horizontal (geopotential) 
     919   ln_dynldf_iso =  .false.    !  iso-neutral 
    811920   !                       !  Coefficient 
    812    rn_ahm_0_lap     = 40000.    !  horizontal laplacian eddy viscosity   [m2/s] 
    813    rn_ahmb_0        =     0.    !  background eddy viscosity for ldf_iso [m2/s] 
    814    rn_ahm_0_blp     =     0.    !  horizontal bilaplacian eddy viscosity [m4/s] 
    815    rn_cmsmag_1      =     3.    !  constant in laplacian Smagorinsky viscosity 
    816    rn_cmsmag_2      =     3     !  constant in bilaplacian Smagorinsky viscosity 
    817    rn_cmsh          =     1.    !  1 or 0 , if 0 -use only shear for Smagorinsky viscosity 
    818    rn_ahm_m_blp     =    -1.e12 !  upper limit for bilap  abs(ahm) < min( dx^4/128rdt, rn_ahm_m_blp) 
    819    rn_ahm_m_lap     = 40000.    !  upper limit for lap  ahm < min(dx^2/16rdt, rn_ahm_m_lap) 
     921   nn_ahm_ijk_t  = 0           !  space/time variation of eddy coef 
     922   !                                !  =-30  read in eddy_viscosity_3D.nc file 
     923   !                                !  =-20  read in eddy_viscosity_2D.nc file 
     924   !                                !  =  0  constant  
     925   !                                !  = 10  F(k)=c1d 
     926   !                                !  = 20  F(i,j)=F(grid spacing)=c2d 
     927   !                                !  = 30  F(i,j,k)=c2d*c1d 
     928   !                                !  = 31  F(i,j,k)=F(grid spacing and local velocity) 
     929   rn_ahm_0      =  40000.     !  horizontal laplacian eddy viscosity   [m2/s] 
     930   rn_ahm_b      =      0.     !  background eddy viscosity for ldf_iso [m2/s] 
     931   rn_bhm_0      = 1.e+12      !  horizontal bilaplacian eddy viscosity [m4/s] 
     932   ! 
     933   ! Caution in 20 and 30 cases the coefficient have to be given for a 1 degree grid (~111km) 
    820934/ 
    821935 
    … …  
    826940!!    namzdf_ric    richardson number dependent vertical mixing         ("key_zdfric") 
    827941!!    namzdf_tke    TKE dependent vertical mixing                       ("key_zdftke") 
    828 !!    namzdf_kpp    KPP dependent vertical mixing                       ("key_zdfkpp") 
     942!!    namzdf_gls    GLS vertical mixing                                 ("key_zdfgls") 
    829943!!    namzdf_ddm    double diffusive mixing parameterization            ("key_zdfddm") 
    830944!!    namzdf_tmx    tidal mixing parameterization                       ("key_zdftmx") 
    … …  
    858972   rn_wtmix    =  10.0     !  vertical eddy viscosity coeff [m2/s] in the mixed-layer 
    859973   rn_wvmix    =  10.0     !  vertical eddy diffusion coeff [m2/s] in the mixed-layer 
    860    ln_mldw     = .true.    !  Flag to use or not the mized layer depth param. 
     974   ln_mldw     = .true.    !  Flag to use or not the mixed layer depth param. 
    861975/ 
    862976!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    882996                           !        = 1 add a tke source below the ML 
    883997                           !        = 2 add a tke source just at the base of the ML 
    884                            !        = 3 as = 1 applied on HF part of the stress    ("key_coupled") 
     998                           !        = 3 as = 1 applied on HF part of the stress    ("key_oasis3") 
    885999   rn_efr      =   0.05    !  fraction of surface tke value which penetrates below the ML (nn_etau=1 or 2) 
    8861000   nn_htau     =   1       !  type of exponential decrease of tke penetration below the ML 
    … …  
    8881002                           !        = 1  0.5m at the equator to 30m poleward of 40 degrees 
    8891003/ 
    890 !------------------------------------------------------------------------ 
    891 &namzdf_kpp    !   K-Profile Parameterization dependent vertical mixing  ("key_zdfkpp", and optionally: 
    892 !------------------------------------------------------------------------ "key_kppcustom" or "key_kpplktb") 
    893    ln_kpprimix = .true.    !  shear instability mixing 
    894    rn_difmiw   =  1.0e-04  !  constant internal wave viscosity [m2/s] 
    895    rn_difsiw   =  0.1e-04  !  constant internal wave diffusivity [m2/s] 
    896    rn_riinfty  =  0.8      !  local Richardson Number limit for shear instability 
    897    rn_difri    =  0.0050   !  maximum shear mixing at Rig = 0    [m2/s] 
    898    rn_bvsqcon  = -0.01e-07 !  Brunt-Vaisala squared for maximum convection [1/s2] 
    899    rn_difcon   =  1.       !  maximum mixing in interior convection [m2/s] 
    900    nn_avb      =  0        !  horizontal averaged (=1) or not (=0) on avt and amv 
    901    nn_ave      =  1        !  constant (=0) or profile (=1) background on avt 
    902 / 
    9031004!----------------------------------------------------------------------- 
    9041005&namzdf_gls                !   GLS vertical diffusion                   ("key_zdfgls") 
    9051006!----------------------------------------------------------------------- 
    906    rn_emin       = 1.e-6   !  minimum value of e   [m2/s2] 
     1007   rn_emin       = 1.e-7   !  minimum value of e   [m2/s2] 
    9071008   rn_epsmin     = 1.e-12  !  minimum value of eps [m2/s3] 
    9081009   ln_length_lim = .true.  !  limit on the dissipation rate under stable stratification (Galperin et al., 1988) 
    909    rn_clim_galp  = 0.53    !  galperin limit 
    910    ln_crban      = .true.  !  Use Craig & Banner (1994) surface wave mixing parametrisation 
     1010   rn_clim_galp  = 0.267   !  galperin limit 
    9111011   ln_sigpsi     = .true.  !  Activate or not Burchard 2001 mods on psi schmidt number in the wb case 
    9121012   rn_crban      = 100.    !  Craig and Banner 1994 constant for wb tke flux 
    9131013   rn_charn      = 70000.  !  Charnock constant for wb induced roughness length 
    914    nn_tkebc_surf =   1     !  surface tke condition (0/1/2=Dir/Neum/Dir Mellor-Blumberg) 
    915    nn_tkebc_bot  =   1     !  bottom tke condition (0/1=Dir/Neum) 
    916    nn_psibc_surf =   1     !  surface psi condition (0/1/2=Dir/Neum/Dir Mellor-Blumberg) 
    917    nn_psibc_bot  =   1     !  bottom psi condition (0/1=Dir/Neum) 
    918    nn_stab_func  =   2     !  stability function (0=Galp, 1= KC94, 2=CanutoA, 3=CanutoB) 
    919    nn_clos       =   1     !  predefined closure type (0=MY82, 1=k-eps, 2=k-w, 3=Gen) 
     1014   rn_hsro       =  0.02   !  Minimum surface roughness 
     1015   rn_frac_hs    =   1.3   !  Fraction of wave height as roughness (if nn_z0_met=2) 
     1016   nn_z0_met     =     2   !  Method for surface roughness computation (0/1/2) 
     1017   nn_bc_surf    =     1   !  surface condition (0/1=Dir/Neum) 
     1018   nn_bc_bot     =     1   !  bottom condition (0/1=Dir/Neum) 
     1019   nn_stab_func  =     2   !  stability function (0=Galp, 1= KC94, 2=CanutoA, 3=CanutoB) 
     1020   nn_clos       =     1   !  predefined closure type (0=MY82, 1=k-eps, 2=k-w, 3=Gen) 
    9201021/ 
    9211022!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    9411042!!   nammpp            Massively Parallel Processing                    ("key_mpp_mpi) 
    9421043!!   namctl            Control prints & Benchmark 
    943 !!   namsol            elliptic solver / island / free surface 
    944 !!====================================================================== 
    945 ! 
    946 !----------------------------------------------------------------------- 
    947 &namsol        !   elliptic solver / island / free surface 
    948 !----------------------------------------------------------------------- 
    949    nn_solv     =      1    !  elliptic solver: =1 preconditioned conjugate gradient (pcg) 
    950                            !                   =2 successive-over-relaxation (sor) 
    951    nn_sol_arp  =      0    !  absolute/relative (0/1) precision convergence test 
    952    rn_eps      =  1.e-6    !  absolute precision of the solver 
    953    nn_nmin     =    300    !  minimum of iterations for the SOR solver 
    954    nn_nmax     =    800    !  maximum of iterations for the SOR solver 
    955    nn_nmod     =     10    !  frequency of test for the SOR solver 
    956    rn_resmax   =  1.e-10   !  absolute precision for the SOR solver 
    957    rn_sor      =  1.92     !  optimal coefficient for SOR solver (to be adjusted with the domain) 
    958 / 
     1044!!   namsto            Stochastic parametrization of EOS 
     1045!!====================================================================== 
     1046! 
    9591047!----------------------------------------------------------------------- 
    9601048&nammpp        !   Massively Parallel Processing                        ("key_mpp_mpi) 
    … …  
    9821070                           !     (no physical validity of the results) 
    9831071   nn_timing   =    0      !  timing by routine activated (=1) creates timing.output file, or not (=0) 
    984 / 
    985 !----------------------------------------------------------------------- 
    986 &namc1d_uvd    !   data: U & V currents                                 ("key_c1d") 
    987 !----------------------------------------------------------------------- 
    988 !              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
    989 !              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
    990    sn_ucur     = 'ucurrent'  ,         -1        ,'u_current',   .false.    , .true. , 'monthly' ,  ''      ,  'Ume'   , '' 
    991    sn_vcur     = 'vcurrent'  ,         -1        ,'v_current',   .false.    , .true. , 'monthly' ,  ''      ,  'Vme'   , '' 
    992 ! 
    993    cn_dir        = './'    !  root directory for the location of the files 
    994    ln_uvd_init   = .false. !  Initialisation of ocean U & V with U & V input data (T) or not (F) 
    995    ln_uvd_dyndmp = .false. !  damping of ocean U & V toward U & V input data (T) or not (F) 
    996 / 
    997 !----------------------------------------------------------------------- 
    998 &namc1d_dyndmp !   U & V newtonian damping                              ("key_c1d") 
    999 !----------------------------------------------------------------------- 
    1000    ln_dyndmp   =  .false.  !  add a damping term (T) or not (F) 
    1001 / 
     1072   nn_diacfl   =    0      !  Write out CFL diagnostics (=1) in cfl_diagnostics.ascii, or not (=0) 
     1073/ 
     1074!----------------------------------------------------------------------- 
     1075&namsto       ! Stochastic parametrization of EOS                       (default: NO) 
     1076!----------------------------------------------------------------------- 
     1077   ln_sto_eos   = .false.  ! stochastic equation of state 
     1078   nn_sto_eos   = 1        ! number of independent random walks 
     1079   rn_eos_stdxy = 1.4      ! random walk horz. standard deviation (in grid points) 
     1080   rn_eos_stdz  = 0.7      ! random walk vert. standard deviation (in grid points) 
     1081   rn_eos_tcor  = 1440.    ! random walk time correlation (in timesteps) 
     1082   nn_eos_ord   = 1        ! order of autoregressive processes 
     1083   nn_eos_flt   = 0        ! passes of Laplacian filter 
     1084   rn_eos_lim   = 2.0      ! limitation factor (default = 3.0) 
     1085   ln_rststo    = .false.  ! start from mean parameter (F) or from restart file (T) 
     1086   ln_rstseed = .true.           ! read seed of RNG from restart file 
     1087   cn_storst_in  = "restart_sto" !  suffix of stochastic parameter restart file (input) 
     1088   cn_storst_out = "restart_sto" !  suffix of stochastic parameter restart file (output) 
     1089/ 
     1090 
    10021091!!====================================================================== 
    10031092!!                  ***  Diagnostics namelists  *** 
    10041093!!====================================================================== 
    1005 !!   namnc4       netcdf4 chunking and compression settings             ("key_netcdf4") 
    1006 !!   namtrd       dynamics and/or tracer trends                         ("key_trddyn","key_trdtra","key_trdmld") 
    1007 !!   namflo       float parameters                                      ("key_float") 
     1094!!   namtrd       dynamics and/or tracer trends 
    10081095!!   namptr       Poleward Transport Diagnostics 
    10091096!!   namhsb       Heat and salt budgets 
    1010 !!====================================================================== 
    1011 ! 
    1012 !----------------------------------------------------------------------- 
    1013 &namnc4        !   netcdf4 chunking and compression settings            ("key_netcdf4") 
    1014 !----------------------------------------------------------------------- 
    1015    nn_nchunks_i=   4       !  number of chunks in i-dimension 
    1016    nn_nchunks_j=   4       !  number of chunks in j-dimension 
    1017    nn_nchunks_k=   31      !  number of chunks in k-dimension 
    1018                            !  setting nn_nchunks_k = jpk will give a chunk size of 1 in the vertical which 
    1019                            !  is optimal for postprocessing which works exclusively with horizontal slabs 
    1020    ln_nc4zip   = .true.    !  (T) use netcdf4 chunking and compression 
    1021                            !  (F) ignore chunking information and produce netcdf3-compatible files 
    1022 / 
    1023 !----------------------------------------------------------------------- 
    1024 &namtrd        !   diagnostics on dynamics and/or tracer trends         ("key_trddyn" and/or "key_trdtra") 
    1025 !              !       or mixed-layer trends or barotropic vorticity    ("key_trdmld" or     "key_trdvor") 
    1026 !----------------------------------------------------------------------- 
    1027    nn_trd      = 365       !  time step frequency dynamics and tracers trends 
    1028    nn_ctls     =   0       !  control surface type in mixed-layer trends (0,1 or n<jpk) 
    1029    rn_ucf      =   1.      !  unit conversion factor (=1 -> /seconds ; =86400. -> /day) 
    1030    cn_trdrst_in      = "restart_mld"   ! suffix of ocean restart name (input) 
    1031    cn_trdrst_out     = "restart_mld"   ! suffix of ocean restart name (output) 
    1032    ln_trdmld_restart = .false.         !  restart for ML diagnostics 
    1033    ln_trdmld_instant = .false.         !  flag to diagnose trends of instantantaneous or mean ML T/S 
     1097!!   namflo       float parameters                                      ("key_float") 
     1098!!   nam_diaharm  Harmonic analysis of tidal constituents               ('key_diaharm') 
     1099!!   namdct       transports through some sections 
     1100!!   namnc4       netcdf4 chunking and compression settings             ("key_netcdf4") 
     1101!!====================================================================== 
     1102! 
     1103!----------------------------------------------------------------------- 
     1104&namtrd        !   diagnostics on dynamics and/or tracer trends         (default F) 
     1105!              !   and/or mixed-layer trends and/or barotropic vorticity 
     1106!----------------------------------------------------------------------- 
     1107   ln_glo_trd  = .false.   ! (T) global domain averaged diag for T, T^2, KE, and PE 
     1108   ln_dyn_trd  = .false.   ! (T) 3D momentum trend output 
     1109   ln_dyn_mxl  = .false.   ! (T) 2D momentum trends averaged over the mixed layer (not coded yet) 
     1110   ln_vor_trd  = .false.   ! (T) 2D barotropic vorticity trends (not coded yet) 
     1111   ln_KE_trd   = .false.   ! (T) 3D Kinetic   Energy     trends 
     1112   ln_PE_trd   = .false.   ! (T) 3D Potential Energy     trends 
     1113   ln_tra_trd  = .false.   ! (T) 3D tracer trend output 
     1114   ln_tra_mxl  = .false.   ! (T) 2D tracer trends averaged over the mixed layer (not coded yet) 
     1115   nn_trd      = 365       !  print frequency (ln_glo_trd=T) (unit=time step) 
     1116/ 
     1117!!gm   nn_ctls     =   0       !  control surface type in mixed-layer trends (0,1 or n<jpk) 
     1118!!gm   rn_ucf      =   1.      !  unit conversion factor (=1 -> /seconds ; =86400. -> /day) 
     1119!!gm   cn_trdrst_in      = "restart_mld"   ! suffix of ocean restart name (input) 
     1120!!gm   cn_trdrst_out     = "restart_mld"   ! suffix of ocean restart name (output) 
     1121!!gm   ln_trdmld_restart = .false.         !  restart for ML diagnostics 
     1122!!gm   ln_trdmld_instant = .false.         !  flag to diagnose trends of instantantaneous or mean ML T/S 
     1123!!gm 
     1124!----------------------------------------------------------------------- 
     1125&namptr       !   Poleward Transport Diagnostic                         (default F) 
     1126!----------------------------------------------------------------------- 
     1127   ln_diaptr  = .false.    !  Poleward heat and salt transport (T) or not (F) 
     1128   ln_subbas  = .false.     !  Atlantic/Pacific/Indian basins computation (T) or not 
     1129/ 
     1130!----------------------------------------------------------------------- 
     1131&namhsb       !  Heat and salt budgets                                  (default F) 
     1132!----------------------------------------------------------------------- 
     1133   ln_diahsb  = .false.    !  check the heat and salt budgets (T) or not (F) 
    10341134/ 
    10351135!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    10481148/ 
    10491149!----------------------------------------------------------------------- 
    1050 &namptr       !   Poleward Transport Diagnostic 
    1051 !----------------------------------------------------------------------- 
    1052    ln_diaptr  = .false.    !  Poleward heat and salt transport (T) or not (F) 
    1053    ln_diaznl  = .true.     !  Add zonal means and meridional stream functions 
    1054    ln_subbas  = .true.     !  Atlantic/Pacific/Indian basins computation (T) or not 
    1055                            !  (orca configuration only, need input basins mask file named "subbasins.nc" 
    1056    ln_ptrcomp = .true.     !  Add decomposition : overturning 
    1057    nn_fptr    =  1         !  Frequency of ptr computation [time step] 
    1058    nn_fwri    =  15        !  Frequency of ptr outputs [time step] 
    1059 / 
    1060 !----------------------------------------------------------------------- 
    1061 &namhsb       !  Heat and salt budgets 
    1062 !----------------------------------------------------------------------- 
    1063    ln_diahsb  = .false.    !  check the heat and salt budgets (T) or not (F) 
    1064 / 
    1065 !----------------------------------------------------------------------- 
    1066 &nam_diaharm   !   Harmonic analysis of tidal constituents ('key_diaharm') 
     1150&nam_diaharm   !   Harmonic analysis of tidal constituents              ('key_diaharm') 
    10671151!----------------------------------------------------------------------- 
    10681152    nit000_han = 1         ! First time step used for harmonic analysis 
    … …  
    10731157/ 
    10741158!----------------------------------------------------------------------- 
    1075 &namdct        ! transports through sections 
     1159&namdct        ! transports through some sections 
    10761160!----------------------------------------------------------------------- 
    10771161    nn_dct      = 15       !  time step frequency for transports computing 
    … …  
    10811165                           !  0 < n : debug section number n 
    10821166/ 
    1083  
    1084 !!====================================================================== 
    1085 !!            ***  Observation & Assimilation namelists *** 
    1086 !!====================================================================== 
    1087 !!   namobs       observation and model comparison                      ('key_diaobs') 
     1167!----------------------------------------------------------------------- 
     1168&namnc4        !   netcdf4 chunking and compression settings            ("key_netcdf4") 
     1169!----------------------------------------------------------------------- 
     1170   nn_nchunks_i=   4       !  number of chunks in i-dimension 
     1171   nn_nchunks_j=   4       !  number of chunks in j-dimension 
     1172   nn_nchunks_k=   31      !  number of chunks in k-dimension 
     1173                           !  setting nn_nchunks_k = jpk will give a chunk size of 1 in the vertical which 
     1174                           !  is optimal for postprocessing which works exclusively with horizontal slabs 
     1175   ln_nc4zip   = .true.    !  (T) use netcdf4 chunking and compression 
     1176                           !  (F) ignore chunking information and produce netcdf3-compatible files 
     1177/ 
     1178 
     1179!!====================================================================== 
     1180!!               ***  Observation & Assimilation  *** 
     1181!!====================================================================== 
     1182!!   namobs       observation and model comparison 
    10881183!!   nam_asminc   assimilation increments                               ('key_asminc') 
    10891184!!====================================================================== 
    10901185! 
    10911186!----------------------------------------------------------------------- 
    1092 &namobs       !  observation usage switch                               ('key_diaobs') 
    1093 !----------------------------------------------------------------------- 
    1094    ln_t3d     = .false.    ! Logical switch for T profile observations 
    1095    ln_s3d     = .false.    ! Logical switch for S profile observations 
    1096    ln_ena     = .false.    ! Logical switch for ENACT insitu data set 
    1097    !                       !     ln_cor                  Logical switch for Coriolis insitu data set 
    1098    ln_profb   = .false.    ! Logical switch for feedback insitu data set 
    1099    ln_sla     = .false.    ! Logical switch for SLA observations 
    1100  
    1101    ln_sladt   = .false.    ! Logical switch for AVISO SLA data 
    1102  
    1103    ln_slafb   = .false.    ! Logical switch for feedback SLA data 
    1104                            !     ln_ssh                  Logical switch for SSH observations 
    1105  
    1106    ln_sst     = .true.     ! Logical switch for SST observations 
    1107    ln_reysst  = .true.     !     ln_reysst               Logical switch for Reynolds observations 
    1108    ln_ghrsst  = .false.    !     ln_ghrsst               Logical switch for GHRSST observations       
    1109  
    1110    ln_sstfb   = .false.    ! Logical switch for feedback SST data 
    1111                            !     ln_sss                  Logical switch for SSS observations 
    1112                            !     ln_seaice               Logical switch for Sea Ice observations 
    1113                            !     ln_vel3d                Logical switch for velocity observations 
    1114                            !     ln_velavcur             Logical switch for velocity daily av. cur. 
    1115                            !     ln_velhrcur             Logical switch for velocity high freq. cur. 
    1116                            !     ln_velavadcp            Logical switch for velocity daily av. ADCP 
    1117                            !     ln_velhradcp            Logical switch for velocity high freq. ADCP 
    1118                            !     ln_velfb                Logical switch for feedback velocity data 
    1119                            !     ln_grid_global          Global distribtion of observations 
    1120                            !     ln_grid_search_lookup   Logical switch for obs grid search w/lookup table 
    1121                            !     grid_search_file        Grid search lookup file header 
    1122                            !     enactfiles              ENACT input observation file names 
    1123                            !     coriofiles              Coriolis input observation file name 
    1124    !                       ! profbfiles: Profile feedback input observation file name 
    1125    profbfiles = 'profiles_01.nc' 
    1126                            !     ln_profb_enatim         Enact feedback input time setting switch 
    1127                            !     slafilesact             Active SLA input observation file name 
    1128                            !     slafilespas             Passive SLA input observation file name 
    1129    !                       ! slafbfiles: Feedback SLA input observation file name 
    1130    slafbfiles = 'sla_01.nc' 
    1131                            !     sstfiles                GHRSST input observation file name 
    1132    !                       ! sstfbfiles: Feedback SST input observation file name 
    1133    sstfbfiles = 'sst_01.nc' 'sst_02.nc' 'sst_03.nc' 'sst_04.nc' 'sst_05.nc' 
    1134                            !     seaicefiles             Sea Ice input observation file name 
    1135                            !     velavcurfiles           Vel. cur. daily av. input file name 
    1136                            !     velhvcurfiles           Vel. cur. high freq. input file name 
    1137                            !     velavadcpfiles          Vel. ADCP daily av. input file name 
    1138                            !     velhvadcpfiles          Vel. ADCP high freq. input file name 
    1139                            !     velfbfiles              Vel. feedback input observation file name 
    1140                            !     dobsini                 Initial date in window YYYYMMDD.HHMMSS 
    1141                            !     dobsend                 Final date in window YYYYMMDD.HHMMSS 
    1142                            !     n1dint                  Type of vertical interpolation method 
    1143                            !     n2dint                  Type of horizontal interpolation method 
    1144                            !     ln_nea                  Rejection of observations near land switch 
    1145    nmsshc     = 0          ! MSSH correction scheme 
    1146                            !     mdtcorr                 MDT  correction 
    1147                            !     mdtcutoff               MDT cutoff for computed correction 
    1148    ln_altbias = .false.    ! Logical switch for alt bias 
    1149    ln_ignmis  = .true.     ! Logical switch for ignoring missing files 
    1150                            !     endailyavtypes   ENACT daily average types 
    1151    ln_grid_global = .true. 
    1152    ln_grid_search_lookup = .false. 
     1187&namobs       !  observation usage switch 
     1188!----------------------------------------------------------------------- 
     1189   ln_diaobs  = .false.             ! Logical switch for the observation operator 
     1190   ln_t3d     = .false.             ! Logical switch for T profile observations 
     1191   ln_s3d     = .false.             ! Logical switch for S profile observations 
     1192   ln_sla     = .false.             ! Logical switch for SLA observations 
     1193   ln_sst     = .false.             ! Logical switch for SST observations 
     1194   ln_sic     = .false.             ! Logical switch for Sea Ice observations 
     1195   ln_vel3d   = .false.             ! Logical switch for velocity observations 
     1196   ln_altbias = .false.             ! Logical switch for altimeter bias correction 
     1197   ln_nea     = .false.             ! Logical switch for rejection of observations near land 
     1198   ln_grid_global = .true.          ! Logical switch for global distribution of observations 
     1199   ln_grid_search_lookup = .false.  ! Logical switch for obs grid search w/lookup table 
     1200   ln_ignmis  = .true.              ! Logical switch for ignoring missing files 
     1201   ln_s_at_t  = .false.             ! Logical switch for computing model S at T obs if not there 
     1202   ln_sstnight = .false.            ! Logical switch for calculating night-time average for SST obs 
     1203! All of the *files* variables below are arrays. Use namelist_cfg to add more files 
     1204   cn_profbfiles = 'profiles_01.nc'    ! Profile feedback input observation file names 
     1205   cn_slafbfiles = 'sla_01.nc'         ! SLA feedback input observation file names 
     1206   cn_sstfbfiles = 'sst_01.nc'         ! SST feedback input observation file names 
     1207   cn_sicfbfiles = 'sic_01.nc'         ! SIC feedback input observation file names 
     1208   cn_velfbfiles = 'vel_01.nc'         ! Velocity feedback input observation file names 
     1209   cn_altbiasfile = 'altbias.nc'       ! Altimeter bias input file name 
     1210   cn_gridsearchfile = 'gridsearch.nc' ! Grid search file name 
     1211   rn_gridsearchres = 0.5              ! Grid search resolution 
     1212   rn_dobsini = 00010101.000000        ! Initial date in window YYYYMMDD.HHMMSS 
     1213   rn_dobsend = 00010102.000000        ! Final date in window YYYYMMDD.HHMMSS 
     1214   nn_1dint = 0                        ! Type of vertical interpolation method 
     1215   nn_2dint = 0                        ! Type of horizontal interpolation method 
     1216   nn_msshc = 0                        ! MSSH correction scheme 
     1217   rn_mdtcorr = 1.61                   ! MDT  correction 
     1218   rn_mdtcutoff = 65.0                 ! MDT cutoff for computed correction 
     1219   nn_profdavtypes = -1                ! Profile daily average types - array 
     1220   ln_sstbias = .false.  
     1221   cn_sstbias_files = 'sstbias.nc' 
    11531222/ 
    11541223!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    11711240/ 
    11721241!----------------------------------------------------------------------- 
    1173 &namsbc_wave   ! External fields from wave model 
    1174 !----------------------------------------------------------------------- 
    1175 !              !  file name  ! frequency (hours) ! variable     ! time interp. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
    1176 !              !             !  (if <0  months)  !   name       !   (logical)  !  (T/F)  ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
    1177    sn_cdg      =  'cdg_wave' ,        1          , 'drag_coeff' ,     .true.   , .false. , 'daily'   ,  ''      , ''       , '' 
    1178    sn_usd      =  'sdw_wave' ,        1          , 'u_sd2d'     ,     .true.   , .false. , 'daily'   ,  ''      , ''       , '' 
    1179    sn_vsd      =  'sdw_wave' ,        1          , 'v_sd2d'     ,     .true.   , .false. , 'daily'   ,  ''      , ''       , '' 
    1180    sn_wn       =  'sdw_wave' ,        1          , 'wave_num'   ,     .true.   , .false. , 'daily'   ,  ''      , ''       , '' 
    1181 ! 
    1182    cn_dir_cdg  = './'  !  root directory for the location of drag coefficient files 
    1183 / 
    1184 !----------------------------------------------------------------------- 
    1185 &namdyn_nept  !   Neptune effect (simplified: lateral and vertical diffusions removed) 
    1186 !----------------------------------------------------------------------- 
    1187    ! Suggested lengthscale values are those of Eby & Holloway (1994) for a coarse model 
    1188    ln_neptsimp       = .false.  ! yes/no use simplified neptune 
    1189  
    1190    ln_smooth_neptvel = .false.  ! yes/no smooth zunep, zvnep 
    1191    rn_tslse          =  1.2e4   ! value of lengthscale L at the equator 
    1192    rn_tslsp          =  3.0e3   ! value of lengthscale L at the pole 
    1193    ! Specify whether to ramp down the Neptune velocity in shallow 
    1194    ! water, and if so the depth range controlling such ramping down 
    1195    ln_neptramp       = .true.   ! ramp down Neptune velocity in shallow water 
    1196    rn_htrmin         =  100.0   ! min. depth of transition range 
    1197    rn_htrmax         =  200.0   ! max. depth of transition range 
    1198 / 
     1242&namdiu !   Cool skin and warm layer models 
     1243!----------------------------------------------------------------------- 
     1244   ln_diurnal      = .false.   !  
     1245   ln_diurnal_only = .false.   ! 
     1246/ 
     1247!----------------------------------------------------------------------- 
     1248&nam_diatmb  !  Top Middle Bottom Output 
     1249!----------------------------------------------------------------------- 
     1250   ln_diatmb  = .false.    !  Choose Top Middle and Bottom output or not 
     1251/ 
     1252!----------------------------------------------------------------------- 
     1253&namwad  !   Wetting and drying 
     1254!----------------------------------------------------------------------- 
     1255   ln_wd             = .false.  ! T/F activation of wetting and drying 
     1256   rn_wdmin1         =  0.1     ! Minimum wet depth on dried cells 
     1257   rn_wdmin2         =  0.01    ! Tolerance of min wet depth on dried cells 
     1258   rn_wdld           =  20.0    ! Land elevation below which wetting/drying is allowed 
     1259   nn_wdit           =  10      ! Max iterations for W/D limiter 
     1260/ 
     1261!----------------------------------------------------------------------- 
     1262&nam_dia25h  !  25h Mean Output 
     1263!----------------------------------------------------------------------- 
     1264   ln_dia25h  = .false.    ! Choose 25h mean output or not 
     1265/ 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/SHARED/namelist_top_ref

    r4340 r6225  
    1111!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
    1212!----------------------------------------------------------------------- 
    13 &namtrc_run     !   run information 
     13&namtrc_run      !   run information 
    1414!----------------------------------------------------------------------- 
    1515   nn_dttrc      =  1        !  time step frequency for passive sn_tracers 
    1616   nn_writetrc   =  5475     !  time step frequency for sn_tracer outputs 
    17    ln_top_euler  = .false.    !  use Euler time-stepping for TOP 
     17   ln_top_euler  = .false.   !  use Euler time-stepping for TOP 
    1818   ln_rsttr      = .false.   !  start from a restart file (T) or not (F) 
    1919   nn_rsttr      =   0       !  restart control = 0 initial time step is not compared to the restart file value 
    20                            !                  = 1 do not use the value in the restart file 
    21                            !                  = 2 calendar parameters read in the restart file 
     20                             !                  = 1 do not use the value in the restart file 
     21                             !                  = 2 calendar parameters read in the restart file 
    2222   cn_trcrst_in  = "restart_trc"   !  suffix of pass. sn_tracer restart name (input) 
     23   cn_trcrst_indir = "."           !  directory from which to read input passive tracer restarts 
    2324   cn_trcrst_out = "restart_trc"   !  suffix of pass. sn_tracer restart name (output) 
     25   cn_trcrst_outdir = "."          !  directory to which to write output passive tracer restarts 
    2426/ 
    2527!----------------------------------------------------------------------- 
    26 &namtrc     !   tracers definition 
     28&namtrc          !   tracers definition 
    2729!----------------------------------------------------------------------- 
    2830   ln_trcdta     =   .true.  !  Initialisation from data input file (T) or not (F) 
    … …  
    3335&namtrc_dta      !    Initialisation from data input file 
    3436!----------------------------------------------------------------------- 
    35 ! 
    36    cn_dir        =  './'      !  root directory for the location of the data files 
     37   cn_dir        =  './'     !  root directory for the location of the data files 
    3738/ 
    3839!----------------------------------------------------------------------- 
    39 &namtrc_adv    !   advection scheme for passive tracer  
     40&namtrc_adv      !   advection scheme for passive tracer  
    4041!----------------------------------------------------------------------- 
    41    ln_trcadv_cen2    =  .false.  !  2nd order centered scheme    
    42    ln_trcadv_tvd     =  .true.  !  TVD scheme 
    43    ln_trcadv_muscl   =  .false.   !  MUSCL scheme 
    44    ln_trcadv_muscl2  =  .false.  !  MUSCL2 scheme + cen2 at boundaries 
    45    ln_trcadv_ubs     =  .false.  !  UBS scheme 
    46    ln_trcadv_qck     =  .false.  !  QUICKEST scheme 
    47    ln_trcadv_msc_ups =  .false.  !  use upstream scheme within muscl 
     42   ln_trcadv_cen =  .false.  !  2nd order centered scheme 
     43      nn_cen_h   =  4               !  =2/4, horizontal 2nd order CEN / 4th order CEN 
     44      nn_cen_v   =  4               !  =2/4, vertical   2nd order CEN / 4th order COMPACT 
     45   ln_trcadv_fct =  .false.  !  FCT scheme 
     46      nn_fct_h   =  2               !  =2/4, horizontal 2nd / 4th order  
     47      nn_fct_v   =  2               !  =2/4, vertical   2nd / COMPACT 4th order  
     48      nn_fct_zts =  0               !  >=1,  2nd order FCT scheme with vertical sub-timestepping 
     49      !                             !        (number of sub-timestep = nn_fct_zts) 
     50   ln_trcadv_mus =  .false.  !  MUSCL scheme 
     51      ln_mus_ups =  .false.         !  use upstream scheme near river mouths 
     52   ln_trcadv_ubs =  .false.  !  UBS scheme 
     53      nn_ubs_v   =  2               !  =2  , vertical 2nd order FCT 
     54   ln_trcadv_qck =  .false.  !  QUICKEST scheme 
    4855/ 
    4956!----------------------------------------------------------------------- 
    50 &namtrc_ldf    !   lateral diffusion scheme for passive tracer  
     57&namtrc_ldf      !   lateral diffusion scheme for passive tracer  
    5158!----------------------------------------------------------------------- 
    52    ln_trcldf_diff   =  .true.   !  performs lateral diffusion (T) or not (F) 
    53 !                               !  Type of the operator :  
    54    ln_trcldf_lap    =  .true.   !     laplacian operator        
    55    ln_trcldf_bilap  =  .false.  !     bilaplacian operator      
    56                                 !  Direction of action  : 
    57    ln_trcldf_level  =  .false.  !     iso-level                 
    58    ln_trcldf_hor    =  .false.  !     horizontal (geopotential)         (require "key_ldfslp" when ln_sco=T) 
    59    ln_trcldf_iso    =  .true.   !     iso-neutral                       (require "key_ldfslp") 
    60 !                               !  Coefficient 
    61    rn_ahtrc_0       =  2000.    !  horizontal eddy diffusivity for tracers [m2/s] 
    62    rn_ahtrb_0       =     0.    !     background eddy diffusivity for ldf_iso [m2/s] 
     59!                            !  Type of the operator:   
     60   ln_trcldf_lap   =  .true.     !    laplacian operator 
     61   ln_trcldf_blp   =  .false.    !  bilaplacian operator 
     62   !                         !  Direction of action: 
     63   ln_trcldf_lev   =  .false.    !  iso-level 
     64   ln_trcldf_hor   =  .false.    !  horizontal (geopotential) 
     65   ln_trcldf_iso   =  .true.     !  iso-neutral (standard operator) 
     66   ln_trcldf_triad =  .false.    !  iso-neutral (triad    operator) 
     67   !                         !  Coefficient  
     68   rn_ahtrc_0      = 2000.       !  lateral eddy diffusivity   (lap. operator) [m2/s] 
     69   rn_bhtrc_0      = 1.e+12      !  lateral eddy diffusivity (bilap. operator) [m4/s] 
    6370/ 
    6471!----------------------------------------------------------------------- 
    65 &namtrc_zdf        !   vertical physics 
     72&namtrc_zdf      !   vertical physics 
    6673!----------------------------------------------------------------------- 
    67    ln_trczdf_exp   =  .false.  !  split explicit (T) or implicit (F) time stepping 
    68    nn_trczdf_exp   =   3       !  number of sub-timestep for ln_trczdfexp=T 
     74   ln_trczdf_exp =  .false.  !  split explicit (T) or implicit (F) time stepping 
     75   nn_trczdf_exp =   3       !  number of sub-timestep for ln_trczdfexp=T 
    6976/ 
    7077!----------------------------------------------------------------------- 
    71 &namtrc_rad        !  treatment of negative concentrations  
     78&namtrc_rad      !  treatment of negative concentrations  
    7279!----------------------------------------------------------------------- 
    73    ln_trcrad   =  .true.  !  artificially correct negative concentrations (T) or not (F) 
     80   ln_trcrad     =  .true.   !  artificially correct negative concentrations (T) or not (F) 
    7481/ 
    7582!----------------------------------------------------------------------- 
    76 &namtrc_dmp    !   passive tracer newtonian damping    
     83&namtrc_dmp      !   passive tracer newtonian damping    
    7784!----------------------------------------------------------------------- 
    78    nn_hdmp_tr  =   -1      !  horizontal shape =-1, damping in Med and Red Seas only 
    79                            !                   =XX, damping poleward of XX degrees (XX>0) 
    80                            !                      + F(distance-to-coast) + Red and Med Seas 
    81    nn_zdmp_tr  =    1      !  vertical   shape =0    damping throughout the water column 
    82                            !                   =1 no damping in the mixing layer (kz  criteria) 
    83                            !                   =2 no damping in the mixed  layer (rho crieria) 
    84    rn_surf_tr  =   50.     !  surface time scale of damping   [days] 
    85    rn_bot_tr   =  360.     !  bottom  time scale of damping   [days] 
    86    rn_dep_tr   =  800.     !  depth of transition between rn_surf and rn_bot [meters] 
    87    nn_file_tr  =    0      !  create a damping.coeff NetCDF file (=1) or not (=0) 
     85   nn_zdmp_tr    =    1      !  vertical   shape =0    damping throughout the water column 
     86                             !                   =1 no damping in the mixing layer (kz  criteria) 
     87                             !                   =2 no damping in the mixed  layer (rho crieria) 
     88   cn_resto_tr   = 'resto_tr.nc'    !  create a damping.coeff NetCDF file (=1) or not (=0) 
    8889/ 
    8990!----------------------------------------------------------------------- 
    90 &namtrc_trd       !   diagnostics on tracer trends        ('key_trdtrc') 
    91 !                          or mixed-layer trends          ('key_trdmld_trc') 
    92 !---------------------------------------------------------------------- 
    93    nn_trd_trc  =  5475      !  time step frequency and tracers trends 
    94    nn_ctls_trc =   0        !  control surface type in mixed-layer trends (0,1 or n<jpk) 
    95    rn_ucf_trc  =   1        !  unit conversion factor (=1 -> /seconds ; =86400. -> /day) 
    96    ln_trdmld_trc_restart = .false.  !  restart for ML diagnostics 
    97    ln_trdmld_trc_instant = .true.  !  flag to diagnose trends of instantantaneous or mean ML T/S 
    98    ln_trdtrc(1)  =   .true. 
    99    ln_trdtrc(2)  =   .true. 
    100    ln_trdtrc(23) =   .true. 
     91&namtrc_ice      !    Representation of sea ice growth & melt effects 
     92!----------------------------------------------------------------------- 
     93   nn_ice_tr     =  -1       !  tracer concentration in sea ice  
     94                             !    =-1 (no vvl: identical cc in ice and ocean / vvl: cc_ice = 0) 
     95                             !    = 0 (no vvl: cc_ice = zero / vvl: cc_ice = ) 
     96                             !    = 1 prescribed to a namelist value (implemented in pisces only) 
    10197/ 
    10298!----------------------------------------------------------------------- 
    103 &namtrc_dia       !   parameters for passive tracer additional diagnostics 
     99&namtrc_trd      !   diagnostics on tracer trends                       ('key_trdtrc') 
     100!                          or mixed-layer trends                        ('key_trdmld_trc') 
     101!---------------------------------------------------------------------- 
     102   nn_trd_trc    =  5475     !  time step frequency and tracers trends 
     103   nn_ctls_trc   =   0       !  control surface type in mixed-layer trends (0,1 or n<jpk) 
     104   rn_ucf_trc    =   1       !  unit conversion factor (=1 -> /seconds ; =86400. -> /day) 
     105   ln_trdmld_trc_restart = .false. !  restart for ML diagnostics 
     106   ln_trdmld_trc_instant = .true.  !  flag to diagnose trends of instantantaneous or mean ML T/S 
     107   ln_trdtrc( 1) = .true. 
     108   ln_trdtrc( 2) = .true. 
     109   ln_trdtrc(23) = .true. 
     110/ 
     111!----------------------------------------------------------------------- 
     112&namtrc_dia      !   parameters for passive tracer additional diagnostics 
    104113!---------------------------------------------------------------------- 
    105114   ln_diatrc     =  .true.   !  save additional diag. (T) or not (F) 
    106115   ln_diabio     =  .true.   !  output biological trends 
    107116   nn_writedia   =  5475     !  time step frequency for diagnostics 
    108    nn_writebio   =    10     !: frequency of biological outputs 
     117   nn_writebio   =    10     !  frequency of biological outputs 
    109118/ 
    110119!---------------------------------------------------------------------- 
    111 ! namtrc_bc       !   data for boundary conditions 
     120&namtrc_bc       !   data for boundary conditions 
    112121!----------------------------------------------------------------------- 
    113 &namtrc_bc 
    114 ! 
    115    cn_dir        =  './'      !  root directory for the location of the data files 
     122   cn_dir_sbc    =  './'     !  root directory for the location of SURFACE data files 
     123   cn_dir_cbc    =  './'     !  root directory for the location of COASTAL data files 
     124   cn_dir_obc    =  './'     !  root directory for the location of OPEN data files 
    116125/ 
     126!---------------------------------------------------------------------- 
     127&namtrc_bdy      !   Setup of tracer boundary conditions 
     128!----------------------------------------------------------------------- 
     129   cn_trc_dflt   = 'neumann' !  OBC applied by default to all tracers 
     130   cn_trc        = 'none'    !  Boundary conditions used for tracers with data files (selected in namtrc) 
     131 
     132   nn_trcdmp_bdy = 0         !  Use damping timescales defined in nambdy of namelist 
     133                             !  = 0 NO damping of tracers at open boudaries 
     134                             !  = 1 Only for tracers forced with external data 
     135                             !  = 2 Damping applied to all tracers 
     136/ 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/cfg.txt

    r4690 r6225  
    11GYRE_PISCES OPA_SRC TOP_SRC 
    22ORCA2_LIM_CFC_C14b OPA_SRC LIM_SRC_2 NST_SRC TOP_SRC 
    3 GYRE OPA_SRC 
    43GYRE_XIOS OPA_SRC 
    5 ORCA2_OFF_PISCES OPA_SRC OFF_SRC TOP_SRC 
    64ORCA2_SAS_LIM OPA_SRC SAS_SRC LIM_SRC_2 NST_SRC 
    75C1D_PAPA OPA_SRC 
    8 ORCA2_LIM OPA_SRC LIM_SRC_2 NST_SRC 
     6GYRE_BFM OPA_SRC TOP_SRC 
    97AMM12 OPA_SRC 
    10 GYRE_BFM OPA_SRC TOP_SRC 
    118ORCA2_LIM_PISCES OPA_SRC LIM_SRC_2 NST_SRC TOP_SRC 
    129ORCA2_LIM3 OPA_SRC LIM_SRC_3 NST_SRC 
     10ORCA2_LIM OPA_SRC LIM_SRC_2 NST_SRC 
     11ORCA2_OFF_PISCES OPA_SRC OFF_SRC TOP_SRC 
     12GYRE OPA_SRC 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/makenemo

    r4148 r6225  
    3838# 
    3939# - NEW_CONF    : configuration to be created 
    40 # - REF_CONF    : reference configuration to build the new one 
     40# - REF_CONF    : reference configuration to build the new one from 
    4141# - CMP_NAM     : compiler name 
    4242# - NBR_PRC     : number of processes used to compile 
     43# - USP_CONF    : unsupported (external) configuration to build the new one from 
    4344# - NEM_SUBDIR  : NEMO subdirectory used (specified) 
    4445# 
    … …  
    5152# - TOOLS_DIR   :   "    "    " 
    5253# - NEMO_DIR    :   "    "    " 
     54# - REMOTE_CTL  : URL link to a remote resource list for an external configuration  
     55#                 which is not part of the reference suite 
     56# - LOCAL_REF   : Nearest reference configuration to an external configuration  
     57#                 which is not part of the reference suite 
     58#                 (used to populate work directories if remote access is not available) 
    5359# 
    5460# EXAMPLES 
    … …  
    8389x_n=""; 
    8490x_r=""; 
     91x_u=""; 
    8592x_m=""; 
    8693x_t=""; 
    … …  
    106113export AGRIFUSE=10 
    107114declare -a TAB 
     115declare -a REMOTE_CTL 
     116declare -a LOCAL_REF 
    108117list_key=0 
    109118chk_key=1 
    … …  
    114123#- 
    115124#- Choice of the options --- 
    116 while getopts :hd:n:r:m:j:e:s:v:t:k: V 
     125while getopts :hd:n:r:u:m:j:e:s:v:t:k: V 
    117126do 
    118127    case $V in 
    119128   (h) x_h=${OPTARG}; 
    120129        echo "Usage   : "${b_n} \ 
    121        " [-h] [-n name] [-m arch] [-d "dir1 dir2"] [-r conf] [-s Path] [-e Path] [-j No] [-v No] [-k 0/1]"; 
     130       " [-h] [-n name] [-m arch] [-d "dir1 dir2"] [-r conf] [-u conf] [-s Path] [-e Path] [-j No] [-v No] [-k 0/1]"; 
    122131   echo " -h           : help"; 
    123132   echo " -h institute : specific help for consortium members"; 
    … …  
    126135   echo " -d dir       : choose NEMO sub-directories"; 
    127136   echo " -r conf      : choose reference configuration"; 
     137   echo " -u conf      : choose an unsupported (external) configuration"; 
    128138        echo " -s Path      : choose alternative location for NEMO main directory"; 
    129139        echo " -e Path      : choose alternative location for MY_SRC directory"; 
    … …  
    139149   echo "Available configurations :"; cat ${CONFIG_DIR}/cfg.txt; 
    140150   echo ""; 
     151        echo "Available unsupported (external) configurations :"; cat ${CONFIG_DIR}/uspcfg.txt; 
     152   echo ""; 
    141153   echo "Example to remove bad configuration "; 
    142154   echo "./makenemo -n MY_CONFIG clean_config"; 
    … …  
    161173   (n)  x_n=${OPTARG};; 
    162174   (r)  x_r=${OPTARG};; 
     175   (u)  x_u=${OPTARG};; 
    163176   (m)  x_m=${OPTARG};; 
    164177   (j)  x_j=${OPTARG};; 
    … …  
    187200       ;; 
    188201   add_key) 
    189        list_add_key=$2 
    190        export ${list_add_key} 
     202            # Checking if argument has anything other than whitespace 
     203            [[ ! "$2" =~ ^\ +$ ]] && { list_add_key=$2; export ${list_add_key}; } 
    191204       shift 
    192205       ;; 
    193206   del_key) 
    194        list_del_key=$2 
    195        export ${list_del_key} 
     207            # Checking if argument has anything other than whitespace 
     208            [[ ! "$2" =~ ^\ +$ ]] && { list_del_key=$2; export ${list_del_key}; } 
    196209       shift 
    197210       ;; 
    … …  
    220233NEM_SUBDIR=${x_d} 
    221234REF_CONF=${x_r} 
     235USP_CONF=${x_u} 
    222236NEMO_TDIR=${x_t:-$NEMO_TDIR} 
    223237export NEMO_TDIR=${NEMO_TDIR:-$CONFIG_DIR} 
    … …  
    228242    echo "Available configurations :" 
    229243    cat ${CONFIG_DIR}/cfg.txt 
     244    echo 
     245    echo "Available unsupported (external) configurations :"  
     246    cat ${CONFIG_DIR}/uspcfg.txt 
    230247    exit 
    231248fi 
    … …  
    238255 
    239256if [ ${#NEW_CONF} -eq 0 ] ; then 
    240     if [ ${#NEM_SUBDIR} -eq 0 -a ${#REF_CONF} -eq 0 ]; then 
    241    echo "You are  installing a new configuration" 
     257    if [ ${#NEM_SUBDIR} -eq 0 ] && [ ${#REF_CONF} -eq 0 ] && [ ${#USP_CONF} -eq 0 ] ; then 
     258   echo "You are installing a new default (ORCA2_LIM) configuration" 
    242259   ind=0 
    243260   . ${COMPIL_DIR}/Fread_dir.sh OPA_SRC    YES 
    … …  
    248265   . ${COMPIL_DIR}/Fread_dir.sh OFF_SRC    NO 
    249266   REF_CONF=ORCA2_LIM 
    250     elif [ ${#NEM_SUBDIR} -gt 0 ] && [ ${#REF_CONF} -eq 0 ]; then 
    251    echo "You are  installing a new configuration" 
     267    elif [ ${#NEM_SUBDIR} -gt 0 ] && [ ${#REF_CONF} -eq 0 ] && [ ${#USP_CONF} -eq 0 ] ; then 
     268   echo "You are  installing a new configuration based on ORCA2_LIM" 
    252269   TAB=( ${NEM_SUBDIR} ) 
    253270   REF_CONF=ORCA2_LIM 
    … …  
    255272   echo "You are  installing a new configuration based on ${REF_CONF}" 
    256273   . ${COMPIL_DIR}/Fcopy_dir.sh ${REF_CONF} 
     274    elif [ ${#NEM_SUBDIR} -eq 0 ] && [ ${#USP_CONF} -gt 0 ]; then 
     275   echo "You are  installing a new configuration based on the unsupported (external) ${USP_CONF}" 
     276   . ${COMPIL_DIR}/Fcopy_extdir.sh ${USP_CONF}   
     277        #echo "TTT " ${TAB} 
     278        #echo "RRR " ${REMOTE_CTL} 
     279        #echo "LLL " ${LOCAL_REF} 
    257280    fi 
    258281    NEW_CONF=${x_n} 
    259     . ${COMPIL_DIR}/Fmake_config.sh ${NEW_CONF} ${REF_CONF} 
     282 
     283    if [ ${#USP_CONF} -gt 0 ]; then 
     284      . ${COMPIL_DIR}/Fmake_extconfig.sh ${NEW_CONF} ${LOCAL_REF} 
     285      . ${COMPIL_DIR}/Ffetch_extdir.sh ${NEW_CONF} ${REMOTE_CTL}   
     286    else 
     287      . ${COMPIL_DIR}/Fmake_config.sh ${NEW_CONF} ${REF_CONF} 
     288    fi 
    260289else 
    261290    sed -e "/${NEW_CONF} /d"  ${CONFIG_DIR}/cfg.txt >  ${COMPIL_DIR}/cfg.tmp 
    … …  
    287316fi 
    288317 
    289 #- At this stage new configuration has been added, 
    290 #- We add or remove keys 
    291 if [ ${#list_add_key} -ne 0 ] ; then 
    292     . ${COMPIL_DIR}/Fadd_keys.sh ${NEW_CONF} add_key ${list_add_key} 
    293 fi 
    294  
    295 if [ ${#list_del_key} -ne 0 ] ; then 
    296     . ${COMPIL_DIR}/Fdel_keys.sh ${NEW_CONF} del_key ${list_del_key} 
    297 fi 
     318#- At this stage new configuration has been added, we add or remove keys 
     319[ ! -z "${list_add_key}" ] && { . ${COMPIL_DIR}/Fadd_keys.sh ${NEW_CONF} add_key ${list_add_key}; } 
     320[ ! -z "${list_del_key}" ] && { . ${COMPIL_DIR}/Fdel_keys.sh ${NEW_CONF} del_key ${list_del_key}; } 
    298321 
    299322#- check that all keys are really existing... 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.