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Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
This present forge is now archived and remained online for history.
Changeset 6225 for branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_OFF_PISCES – NEMO

Ignore:
Timestamp:
2016-01-08T10:35:19+01:00 (8 years ago)
Author:
jamesharle
Message:

Update MPP_BDY_UPDATE branch to be consistent with head of trunk

Location:
branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_OFF_PISCES
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  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_OFF_PISCES/EXP00/iodef.xml

    r4153 r6225  
    3030      <file_group id="6h" output_freq="6h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 6h files --> 
    3131      
    32       <file_group id="1d" output_freq="1d"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1d files --> 
     32      <file_group id="1d" output_freq="1d"  output_level="10" enabled=".TRUE."> <!-- 1d files --> 
     33        <file id="file1" name_suffix="_bioscalar" description="pisces sms variables" > 
     34           <field field_ref="tdenit"   name="tdenit"   unit="TgN/yr" operation="instant" > tdenit * 14. * 86400. * 365. / 1e12 </field> 
     35           <field field_ref="tnfix"    name="tnfix"    unit="TgN/yr" operation="instant" > tnfix * 14. * 86400. * 365. / 1e12 </field> 
     36           <field field_ref="tcflx"    name="tcflx"    unit="PgC/yr" operation="instant" > tcflx * -1. * 12. * 86400. * 365. / 1e15 </field> 
     37           <field field_ref="tcflxcum" name="tcflxcum" unit="PgC"    operation="instant" > tcflxcum * -1. * 12. / 1e15 </field> 
     38           <field field_ref="tcexp"    name="tcexp"    unit="PgC/yr" operation="instant" > tcexp * 12. * 86400. * 365. / 1e15 </field> 
     39           <field field_ref="tintpp"   name="tintpp"   unit="PgC/yr" operation="instant" > tintpp * 12. * 86400. * 365. / 1e15 </field> 
     40           <field field_ref="pno3tot"  name="pno3tot"  unit="umolN"  > pno3tot * 16. / 122. * 1e6 </field> 
     41           <field field_ref="ppo4tot"  name="ppo4tot"  unit="umolP"  > ppo4tot * 1. / 122. * 1e6 </field> 
     42           <field field_ref="psiltot"  name="psiltot"  unit="umolC"  > psiltot * 1e6  </field> 
     43           <field field_ref="palktot"  name="palktot"  unit="umolC"  > palktot * 1e6  </field> 
     44           <field field_ref="pfertot"  name="pfertot"  unit="nmolFe" > pfertot * 1e9  </field> 
     45        </file> 
     46      </file_group> 
     47 
    3348      <file_group id="3d" output_freq="3d"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 3d files -->     
    3449      <file_group id="5d" output_freq="5d"  output_level="10" enabled=".TRUE."/>  <!-- 5d files -->    
    … …  
    3651      <file_group id="1m" output_freq="1mo" output_level="10" enabled=".TRUE."> <!-- real monthly files --> 
    3752 
    38    <file id="file1" name_suffix="_ptrc_T" description="pisces sms variables" > 
     53   <file id="file2" name_suffix="_ptrc_T" description="pisces sms variables" > 
    3954          <field field_ref="DIC"      /> 
    4055          <field field_ref="Alkalini" /> 
    … …  
    4863   </file> 
    4964    
    50    <file id="file2" name_suffix="_diad_T" description="additional pisces diagnostics" > 
     65   <file id="file3" name_suffix="_diad_T" description="additional pisces diagnostics" > 
    5166          <field field_ref="Cflx"     /> 
    5267          <field field_ref="Dpco2"    /> 
    … …  
    6176      <file_group id="1y"  output_freq="1y" output_level="10" enabled=".TRUE."> <!-- real yearly files --> 
    6277 
    63    <file id="file3" name_suffix="_ptrc_T" description="pisces sms variables" > 
     78   <file id="file4" name_suffix="_ptrc_T" description="pisces sms variables" > 
    6479          <field field_ref="DIC"      /> 
    6580          <field field_ref="Alkalini" /> 
    … …  
    88103   </file> 
    89104 
    90    <file id="file4" name_suffix="_diad_T" description="additional pisces diagnostics" > 
     105   <file id="file5" name_suffix="_diad_T" description="additional pisces diagnostics" > 
    91106          <field field_ref="PH"       /> 
    92107          <field field_ref="CO3"      /> 
    … …  
    153168     
    154169   <axis_definition>   
    155       <axis id="deptht" long_name="Vertical T levels" unit="m" positive="down" /> 
    156       <axis id="depthu" long_name="Vertical U levels" unit="m" positive="down" /> 
    157       <axis id="depthv" long_name="Vertical V levels" unit="m" positive="down" /> 
    158       <axis id="depthw" long_name="Vertical W levels" unit="m" positive="down" /> 
    159       <axis id="nfloat" long_name="Float number"      unit="-"  /> 
    160       <axis id="icbcla" long_name="Iceberg class"     unit="-"  /> 
     170      <axis id="deptht"  long_name="Vertical T levels"  unit="m" positive="down" /> 
     171      <axis id="depthu"  long_name="Vertical U levels"  unit="m" positive="down" /> 
     172      <axis id="depthv"  long_name="Vertical V levels"  unit="m" positive="down" /> 
     173      <axis id="depthw"  long_name="Vertical W levels"  unit="m" positive="down" /> 
     174      <axis id="nfloat"  long_name="Float number"       unit="1"                 /> 
     175      <axis id="icbcla"  long_name="Iceberg class"      unit="1"                 /> 
     176      <axis id="ncatice" long_name="Ice category"       unit="1"                 /> 
     177      <axis id="iax_20C" long_name="20 degC isotherm"   unit="degC"              /> 
     178      <axis id="iax_28C" long_name="28 degC isotherm"   unit="degC"              /> 
    161179   </axis_definition>  
    162180     

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_OFF_PISCES/EXP00/namelist_cfg

    r4370 r6225  
    2727&namzgr        !   vertical coordinate 
    2828!----------------------------------------------------------------------- 
     29   ln_zps      = .true.    !  z-coordinate - partial steps 
     30   ln_linssh   = .true.    !  linear free surface 
    2931/ 
    3032!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    3234!----------------------------------------------------------------------- 
    3335   nn_msh      =    1      !  create (=1) a mesh file or not (=0) 
    34    rn_rdt      = 21600.    !  time step for the dynamics (and tracer if nn_acc=0) 
    35    rn_rdtmin   = 21600.          !  minimum time step on tracers (used if nn_acc=1) 
    36    rn_rdtmax   = 21600.          !  maximum time step on tracers (used if nn_acc=1) 
     36   rn_rdt      = 21600.    !  time step for the dynamics  
    3737   jphgr_msh   =       0               !  type of horizontal mesh 
    3838   ppglam0     =  999999.0             !  longitude of first raw and column T-point (jphgr_msh = 1) 
    … …  
    6767!----------------------------------------------------------------------- 
    6868   nn_fsbc     = 1         !  frequency of surface boundary condition computation  
     69   ln_rnf      = .false.   !  runoffs 
     70   ln_traqsr   = .false.   !  Light penetration (T) or not (F) 
    6971/   
    7072!----------------------------------------------------------------------- 
    7173&namtra_qsr    !   penetrative solar radiation 
    7274!----------------------------------------------------------------------- 
    73    ln_traqsr   = .false.   !  Light penetration (T) or not (F) 
    7475/ 
    7576!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    7778!----------------------------------------------------------------------- 
    7879/       
    79  
    80 !----------------------------------------------------------------------- 
    81 &namcla        !   cross land advection 
    82 !----------------------------------------------------------------------- 
    83 / 
    8480!----------------------------------------------------------------------- 
    8581&nambbl        !   bottom boundary layer scheme 
    … …  
    9086!----------------------------------------------------------------------- 
    9187/ 
    92 !----------------------------------------------------------------------- 
    93 &namtra_ldf    !   lateral diffusion scheme for tracer  
    94 !----------------------------------------------------------------------- 
    95    ln_triad_iso     =  .true.  !  griffies operator calculates triads twice => pure lateral mixing in ML (require "key_ldfslp") 
     88!---------------------------------------------------------------------------------- 
     89&namtra_ldf    !   lateral diffusion scheme for tracers 
     90!---------------------------------------------------------------------------------- 
     91   !                       !  Operator type: 
     92   ln_traldf_lap   =  .true.   !    laplacian operator 
     93   ln_traldf_blp   =  .false.  !  bilaplacian operator 
     94   !                       !  Direction of action: 
     95   ln_traldf_lev   =  .false.  !  iso-level 
     96   ln_traldf_hor   =  .false.  !  horizontal (geopotential) 
     97   ln_traldf_iso   =  .true.   !  iso-neutral 
     98   ln_traldf_triad =  .false.  !  iso-neutral using Griffies triads 
     99   ! 
     100   !                       !  iso-neutral options:         
     101   ln_traldf_msc   =  .true.   !  Method of Stabilizing Correction (both operators) 
     102   rn_slpmax       =   0.01    !  slope limit                      (both operators) 
     103   ln_triad_iso    =  .false.  !  pure horizontal mixing in ML     (triad only) 
     104   rn_sw_triad     =  1        !  =1 switching triad ; =0 all 4 triads used (triad only) 
     105   ln_botmix_triad =  .false.  !  lateral mixing on bottom         (triad only) 
     106   ! 
     107   !                       !  Coefficients: 
     108   nn_aht_ijk_t    = 0        !  space/time variation of eddy coef 
     109   !                                !   =-20 (=-30)    read in eddy_diffusivity_2D.nc (..._3D.nc) file 
     110   !                                !   =  0           constant  
     111   !                                !   = 10 F(k)      =ldf_c1d  
     112   !                                !   = 20 F(i,j)    =ldf_c2d  
     113   !                                !   = 21 F(i,j,t)  =Treguier et al. JPO 1997 formulation 
     114   !                                !   = 30 F(i,j,k)  =ldf_c2d + ldf_c1d 
     115   !                                !   = 31 F(i,j,k,t)=F(local velocity) 
     116   rn_aht_0        = 2000.     !  lateral eddy diffusivity   (lap. operator) [m2/s] 
     117   rn_bht_0        = 1.e+12    !  lateral eddy diffusivity (bilap. operator) [m4/s] 
     118/ 
     119!---------------------------------------------------------------------------------- 
     120&namtra_ldfeiv !   eddy induced velocity param. 
     121!---------------------------------------------------------------------------------- 
     122   ln_ldfeiv     =.true.   ! use eddy induced velocity parameterization 
     123   ln_ldfeiv_dia =.false.   ! diagnose eiv stream function and velocities 
     124   rn_aeiv_0     = 2000.   ! eddy induced velocity coefficient   [m2/s] 
     125   nn_aei_ijk_t  = 0      ! space/time variation of the eiv coeficient 
     126   !                                !   =-20 (=-30)    read in eddy_induced_velocity_2D.nc (..._3D.nc) file 
     127   !                                !   =  0           constant 
     128   !                                !   = 10 F(k)      =ldf_c1d 
     129   !                                !   = 20 F(i,j)    =ldf_c2d 
     130   !                                !   = 21 F(i,j,t)  =Treguier et al. JPO 1997 formulation 
     131   !                                !   = 30 F(i,j,k)  =ldf_c2d + ldf_c1d 
    96132/ 
    97133!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    114150   sn_ubl  = 'dyna_grid_U' ,    120            , 'sobblcox' ,  .true.    , .true. ,   'yearly'  , ''       , ''    , '' 
    115151   sn_vbl  = 'dyna_grid_V' ,    120            , 'sobblcoy' ,  .true.    , .true. ,   'yearly'  , ''       , ''    , '' 
    116    sn_ahu  = 'dyna_grid_U' ,    120            , 'vozoahtu' ,  .true.    , .true. ,   'yearly'  , ''       , ''    , '' 
    117    sn_ahv  = 'dyna_grid_V' ,    120            , 'vomeahtv' ,  .true.    , .true. ,   'yearly'  , ''       , ''    , '' 
    118    sn_ahw  = 'dyna_grid_W' ,    120            , 'voveahtz' ,  .true.    , .true. ,   'yearly'  , ''       , ''    , '' 
    119    sn_eiu  = 'dyna_grid_U' ,    120            , 'vozoaeiu' ,  .true.    , .true. ,   'yearly'  , ''       , ''    , '' 
    120    sn_eiv  = 'dyna_grid_V' ,    120            , 'vomeaeiv' ,  .true.    , .true. ,   'yearly'  , ''       , ''    , '' 
    121    sn_eiw  = 'dyna_grid_W' ,    120            , 'soleaeiw' ,  .true.    , .true. ,   'yearly'  , ''       , ''    , '' 
    122152! 
    123153   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the dynamical files 
    124    ln_degrad   =  .false.  !  flag for degradation -                requires ("key_degrad") 
    125154   ln_dynwzv   =  .true.   !  computation of vertical velocity instead of using the one read in file 
    126155   ln_dynbbl   =  .true.   !  bbl coef are in files, so read them - requires ("key_trabbl") 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_OFF_PISCES/EXP00/namelist_top_cfg

    r4340 r6225  
    66!----------------------------------------------------------------------- 
    77   nn_writetrc   =  1460     !  time step frequency for sn_tracer outputs 
    8    ln_top_euler  = .true.    !  use Euler time-stepping for TOP 
    98/ 
    109!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    6665&namtrc_adv    !   advection scheme for passive tracer  
    6766!----------------------------------------------------------------------- 
    68    ln_trcadv_tvd     =  .false.  !  TVD scheme 
    69    ln_trcadv_muscl   =  .true.   !  MUSCL scheme 
     67   ln_trcadv_mus =  .true.  !  MUSCL scheme 
     68      ln_mus_ups =  .false.         !  use upstream scheme near river mouths 
    7069/ 
    7170!----------------------------------------------------------------------- 

  • branches/2014/dev_r4704_NOC5_MPP_BDY_UPDATE/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_OFF_PISCES/cpp_ORCA2_OFF_PISCES.fcm

    r4523 r6225  
    1 bld::tool::fppkeys key_trabbl key_ldfslp key_traldf_c2d key_traldf_eiv key_top key_offline key_pisces key_iomput key_mpp_mpi 
     1bld::tool::fppkeys key_trabbl key_top key_offline key_pisces key_iomput key_mpp_mpi 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.