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2016-05-26T11:08:07+02:00 (8 years ago)
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kingr
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    r6617 r6625  
    599599 
    600600   !!====================================================================== 
    601 END MODULE p2zbio 
     601END MODULE  p2zbio 
  • branches/UKMO/dev_r5518_v3.4_asm_nemovar_community/NEMOGCM/NEMO/TOP_SRC/PISCES/P2Z/p2zsms.F90

    r6617 r6625  
    8484 
    8585   !!====================================================================== 
    86 END MODULE p2zsms 
     86END MODULE  p2zsms 
  • branches/UKMO/dev_r5518_v3.4_asm_nemovar_community/NEMOGCM/NEMO/TOP_SRC/PISCES/P4Z/p4zbio.F90

    r6617 r6625  
    109109 
    110110   !!====================================================================== 
    111 END MODULE p4zbio 
     111END MODULE  p4zbio 
     112 
  • branches/UKMO/dev_r5518_v3.4_asm_nemovar_community/NEMOGCM/NEMO/TOP_SRC/PISCES/P4Z/p4zche.F90

    r6617 r6625  
    3131   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:) ::   sio3eq   ! chemistry of Si 
    3232   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:) ::   fekeq    ! chemistry of Fe 
    33    REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,: ::   chemc    ! Solubilities of O2 and CO2 
    34    REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:) ::   chemo2   ! Solubilities of O2 and CO2 
     33   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:) ::   chemc    ! Solubilities of O2 and CO2 
     34   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:) ::   chemo2    ! Solubilities of O2 and CO2 
    3535 
    3636   REAL(wp), PUBLIC ::   atcox  = 0.20946         ! units atm 
     
    7676   REAL(wp) ::   st1    =      0.14     ! constants for calculate concentrations for sulfate 
    7777   REAL(wp) ::   st2    =  1./96.062    !  (Morris & Riley 1966) 
     78   REAL(wp) ::   ks0    =    141.328  
     79   REAL(wp) ::   ks1    =  -4276.1   
     80   REAL(wp) ::   ks2    =    -23.093 
     81   REAL(wp) ::   ks3    = -13856.   
     82   REAL(wp) ::   ks4    =   324.57  
     83   REAL(wp) ::   ks5    =   -47.986 
     84   REAL(wp) ::   ks6    =  35474.  
     85   REAL(wp) ::   ks7    =   -771.54 
     86   REAL(wp) ::   ks8    =    114.723 
     87   REAL(wp) ::   ks9    =  -2698.   
     88   REAL(wp) ::   ks10   =   1776.  
     89   REAL(wp) ::   ks11   =      1. 
     90   REAL(wp) ::   ks12   =     -0.001005  
    7891 
    7992   REAL(wp) ::   ft1    =    0.000067   ! constants for calculate concentrations for fluorides 
    8093   REAL(wp) ::   ft2    = 1./18.9984    ! (Dickson & Riley 1979 ) 
     94   REAL(wp) ::   kf0    =  -12.641     
     95   REAL(wp) ::   kf1    = 1590.2     
     96   REAL(wp) ::   kf2    =    1.525     
     97   REAL(wp) ::   kf3    =    1.0      
     98   REAL(wp) ::   kf4    =   -0.001005 
     99 
     100   REAL(wp) ::   cb0    = -8966.90      ! Coeff. for 1. dissoc. of boric acid  
     101   REAL(wp) ::   cb1    = -2890.53      ! (Dickson and Goyet, 1994) 
     102   REAL(wp) ::   cb2    =   -77.942 
     103   REAL(wp) ::   cb3    =     1.728 
     104   REAL(wp) ::   cb4    =    -0.0996 
     105   REAL(wp) ::   cb5    =   148.0248 
     106   REAL(wp) ::   cb6    =   137.1942 
     107   REAL(wp) ::   cb7    =     1.62142 
     108   REAL(wp) ::   cb8    =   -24.4344 
     109   REAL(wp) ::   cb9    =   -25.085 
     110   REAL(wp) ::   cb10   =    -0.2474  
     111   REAL(wp) ::   cb11   =     0.053105 
     112 
     113   REAL(wp) ::   cw0    = -13847.26     ! Coeff. for dissoc. of water (Dickson and Riley, 1979 ) 
     114   REAL(wp) ::   cw1    =    148.9652   
     115   REAL(wp) ::   cw2    =    -23.6521 
     116   REAL(wp) ::   cw3    =    118.67  
     117   REAL(wp) ::   cw4    =     -5.977  
     118   REAL(wp) ::   cw5    =      1.0495   
     119   REAL(wp) ::   cw6    =     -0.01615 
    81120 
    82121   !                                    ! volumetric solubility constants for o2 in ml/L   
     
    161200         DO ji = 1, jpi 
    162201            !                             ! SET ABSOLUTE TEMPERATURE 
    163             ztkel = tsn(ji,jj,1,jp_tem) + 273.15 
     202            ztkel = tsn(ji,jj,1,jp_tem) + 273.16 
    164203            zt    = ztkel * 0.01 
    165204            zt2   = zt * zt 
     
    170209            !                             !     AND FOR THE ATMOSPHERE FOR NON IDEAL GAS 
    171210            zcek1 = ca0 + ca1 / zt + ca2 * zlogt + ca3 * zt2 + zsal * ( ca4 + ca5 * zt + ca6 * zt2 ) 
     211            !                             ! LN(K0) OF SOLUBILITY OF O2 and N2 in ml/L (EQ. 8, GARCIA AND GORDON, 1992) 
     212            ztgg  = LOG( ( 298.15 - tsn(ji,jj,1,jp_tem) ) / ztkel )  ! Set the GORDON & GARCIA scaled temperature 
     213            ztgg2 = ztgg  * ztgg 
     214            ztgg3 = ztgg2 * ztgg 
     215            ztgg4 = ztgg3 * ztgg 
     216            ztgg5 = ztgg4 * ztgg 
     217            zoxy  = ox0 + ox1 * ztgg + ox2 * ztgg2 + ox3 * ztgg3 + ox4 * ztgg4 + ox5 * ztgg5   & 
     218                   + zsal * ( ox6 + ox7 * ztgg + ox8 * ztgg2 + ox9 * ztgg3 ) +  ox10 * zsal2 
     219 
    172220            !                             ! SET SOLUBILITIES OF O2 AND CO2  
    173             chemc(ji,jj) = EXP( zcek1 ) * 1.e-6 * rhop(ji,jj,1) / 1000.  ! mol/(L uatm) 
     221            chemc(ji,jj,1) = EXP( zcek1 ) * 1.e-6 * rhop(ji,jj,1) / 1000.  ! mol/(L uatm) 
     222            chemc(ji,jj,2) = ( EXP( zoxy  ) * o2atm ) * oxyco              ! mol/(L atm) 
    174223            ! 
    175224         END DO 
     
    184233!CDIR NOVERRCHK 
    185234            DO ji = 1, jpi 
    186               ztkel = tsn(ji,jj,jk,jp_tem) + 273.15 
     235              ztkel = tsn(ji,jj,jk,jp_tem) + 273.16 
    187236              zsal  = tsn(ji,jj,jk,jp_sal) + ( 1.- tmask(ji,jj,jk) ) * 35. 
    188237              zsal2 = zsal * zsal 
     
    214263 
    215264               ! SET ABSOLUTE TEMPERATURE 
    216                ztkel   = tsn(ji,jj,jk,jp_tem) + 273.15 
     265               ztkel   = tsn(ji,jj,jk,jp_tem) + 273.16 
    217266               zsal    = tsn(ji,jj,jk,jp_sal) + ( 1.-tmask(ji,jj,jk) ) * 35. 
    218267               zsqrt  = SQRT( zsal ) 
     
    235284 
    236285               ! DISSOCIATION CONSTANT FOR SULFATES on free H scale (Dickson 1990) 
    237                zcks    = EXP(-4276.1 * ztr + 141.328 - 23.093 * zlogt         & 
    238                &         + (-13856. * ztr + 324.57 - 47.986 * zlogt) * zisqrt & 
    239                &         + (35474. * ztr - 771.54 + 114.723 * zlogt) * zis    & 
    240                &         - 2698. * ztr * zis**1.5 + 1776.* ztr * zis2         & 
    241                &         + LOG(1.0 - 0.001005 * zsal)) 
    242                ! 
    243                aphscale(ji,jj,jk) = ( 1. + zst / zcks ) 
     286               zcks    = EXP(  ks1 * ztr + ks0 + ks2 * zlogt                           & 
     287                  &                     + ( ks3 * ztr + ks4 + ks5 * zlogt ) * zisqrt   & 
     288                  &                     + ( ks6 * ztr + ks7 + ks8 * zlogt ) * zis      & 
     289                  &                     + ks9 * ztr * zis * zisqrt + ks10 * ztr *zis2 + LOG( ks11 + ks12 *zsal )  ) 
    244290 
    245291               ! DISSOCIATION CONSTANT FOR FLUORIDES on free H scale (Dickson and Riley 79) 
    246                zckf    = EXP( 1590.2*ztr - 12.641 + 1.525*zisqrt   & 
    247                &         + LOG(1.0d0 - 0.001005d0*zsal)            & 
    248                &         + LOG(1.0d0 + zst/zcks)) 
     292               zckf    = EXP(  kf1 * ztr + kf0 + kf2 * zisqrt + LOG( kf3 + kf4 * zsal )  ) 
    249293 
    250294               ! DISSOCIATION CONSTANT FOR CARBONATE AND BORATE 
    251                zckb=  (-8966.90 - 2890.53*zsqrt - 77.942*zsal        & 
    252                &      + 1.728*zsal15 - 0.0996*zsal*zsal)*ztr         & 
    253                &      + (148.0248 + 137.1942*zsqrt + 1.62142*zsal)   & 
    254                &      + (-24.4344 - 25.085*zsqrt - 0.2474*zsal)      &  
    255                &      * zlogt + 0.053105*zsqrt*ztkel 
    256  
     295               zckb    = ( cb0 + cb1 * zsqrt + cb2  * zsal + cb3 * zsal15 + cb4 * zsal * zsal ) * ztr   & 
     296                  &    + ( cb5 + cb6 * zsqrt + cb7  * zsal )                                            & 
     297                  &    + ( cb8 + cb9 * zsqrt + cb10 * zsal ) * zlogt + cb11 * zsqrt * ztkel             & 
     298                  &    + LOG(  ( 1.+ zst / zcks + zft / zckf ) / ( 1.+ zst / zcks )  ) 
    257299 
    258300               zck1    = c10 * ztr + c11 + c12 * zlogt + c13 * zsal + c14 * zsal * zsal 
     
    260302 
    261303               ! PKW (H2O) (DICKSON AND RILEY, 1979) 
    262                zckw = -13847.26*ztr + 148.9652 - 23.6521 * zlogt    &  
    263                &     + (118.67*ztr - 5.977 + 1.0495 * zlogt)        & 
    264                &     * zsqrt - 0.01615 * zsal 
     304               zckw    = cw0 * ztr + cw1 + cw2 * zlogt + ( cw3 * ztr + cw4 + cw5 * zlogt ) * zsqrt + cw6 * zsal 
     305 
    265306 
    266307               ! APPARENT SOLUBILITY PRODUCT K'SP OF CALCITE IN SEAWATER 
     
    337378      !!                     ***  ROUTINE p4z_che_alloc  *** 
    338379      !!---------------------------------------------------------------------- 
    339       ALLOCATE( sio3eq(jpi,jpj,jpk), fekeq(jpi,jpj,jpk), chemc(jpi,jpj), chemo2(jpi,jpj,jpk),   & 
    340       &         STAT=p4z_che_alloc ) 
     380      ALLOCATE( sio3eq(jpi,jpj,jpk), fekeq(jpi,jpj,jpk), chemc(jpi,jpj,2), chemo2(jpi,jpj,jpk), STAT=p4z_che_alloc ) 
    341381      ! 
    342382      IF( p4z_che_alloc /= 0 )   CALL ctl_warn('p4z_che_alloc : failed to allocate arrays.') 
     
    356396 
    357397   !!====================================================================== 
    358 END MODULE p4zche 
     398END MODULE  p4zche 
  • branches/UKMO/dev_r5518_v3.4_asm_nemovar_community/NEMOGCM/NEMO/TOP_SRC/PISCES/P4Z/p4zflx.F90

    r6617 r6625  
    8484      ! 
    8585      INTEGER  ::   ji, jj, jm, iind, iindm1 
    86       REAL(wp) ::   ztc, ztc2, ztc3, ztc4, zws, zkgwan 
     86      REAL(wp) ::   ztc, ztc2, ztc3, zws, zkgwan 
    8787      REAL(wp) ::   zfld, zflu, zfld16, zflu16, zfact 
    8888      REAL(wp) ::   zph, zah2, zbot, zdic, zalk, zsch_o2, zalka, zsch_co2 
     
    135135 
    136136               ! CALCULATE [ALK]([CO3--], [HCO3-]) 
    137                zalk  = zalka - (  akw3(ji,jj,1) / zph - zph / aphscale(ji,jj,1)    & 
    138                &       + zbot / ( 1.+ zph / akb3(ji,jj,1) )  ) 
     137               zalk  = zalka - (  akw3(ji,jj,1) / zph - zph + zbot / ( 1.+ zph / akb3(ji,jj,1) )  ) 
    139138 
    140139               ! CALCULATE [H+] AND [H2CO3] 
     
    163162            ztc2 = ztc * ztc 
    164163            ztc3 = ztc * ztc2  
    165             ztc4 = ztc2 * ztc2  
    166164            ! Compute the schmidt Number both O2 and CO2 
    167             zsch_co2 = 2116.8 - 136.25 * ztc + 4.7353 * ztc2 - 0.092307 * ztc3 + 0.0007555 * ztc4 
    168             zsch_o2  = 1920.4 - 135.6  * ztc + 5.2122 * ztc2 - 0.109390 * ztc3 + 0.0009377 * ztc4 
     165            zsch_co2 = 2073.1 - 125.62 * ztc + 3.6276 * ztc2 - 0.043126 * ztc3 
     166            zsch_o2  = 1953.4 - 128.0  * ztc + 3.9918 * ztc2 - 0.050091 * ztc3 
    169167            !  wind speed  
    170168            zws  = wndm(ji,jj) * wndm(ji,jj) 
    171169            ! Compute the piston velocity for O2 and CO2 
    172             zkgwan = 0.251 * zws 
     170            zkgwan = 0.3 * zws  + 2.5 * ( 0.5246 + 0.016256 * ztc + 0.00049946  * ztc2 ) 
    173171            zkgwan = zkgwan * xconv * ( 1.- fr_i(ji,jj) ) * tmask(ji,jj,1) 
    174172# if defined key_degrad 
     
    184182         DO ji = 1, jpi 
    185183            ! Compute CO2 flux for the sea and air 
    186             zfld = satmco2(ji,jj) * patm(ji,jj) * tmask(ji,jj,1) * chemc(ji,jj) * zkgco2(ji,jj)   ! (mol/L) * (m/s) 
     184            zfld = satmco2(ji,jj) * patm(ji,jj) * tmask(ji,jj,1) * chemc(ji,jj,1) * zkgco2(ji,jj)   ! (mol/L) * (m/s) 
    187185            zflu = zh2co3(ji,jj) * tmask(ji,jj,1) * zkgco2(ji,jj)                                   ! (mol/L) (m/s) ? 
    188186            oce_co2(ji,jj) = ( zfld - zflu ) * rfact2 * e1e2t(ji,jj) * tmask(ji,jj,1) * 1000. 
     
    191189 
    192190            ! Compute O2 flux  
    193             zfld16 = patm(ji,jj) * chemo2(ji,jj,1) * tmask(ji,jj,1) * zkgo2(ji,jj)          ! (mol/L) * (m/s) 
     191            zfld16 = atcox * patm(ji,jj) * chemc(ji,jj,2) * tmask(ji,jj,1) * zkgo2(ji,jj)          ! (mol/L) * (m/s) 
    194192            zflu16 = trb(ji,jj,1,jpoxy) * tmask(ji,jj,1) * zkgo2(ji,jj) 
    195193            zoflx(ji,jj) = zfld16 - zflu16 
     
    224222         ENDIF 
    225223         IF( iom_use( "Dpco2" ) ) THEN 
    226            zw2d(:,:) = ( satmco2(:,:) * patm(:,:) - zh2co3(:,:) / ( chemc(:,:) + rtrn ) ) * tmask(:,:,1) 
     224           zw2d(:,:) = ( satmco2(:,:) * patm(:,:) - zh2co3(:,:) / ( chemc(:,:,1) + rtrn ) ) * tmask(:,:,1) 
    227225           CALL iom_put( "Dpco2" ,  zw2d ) 
    228226         ENDIF 
    229227         IF( iom_use( "Dpo2" ) )  THEN 
    230            zw2d(:,:) = ( atcox * patm(:,:) - atcox * trn(:,:,1,jpoxy) / ( chemo2(:,:,1) + rtrn ) ) * tmask(:,:,1) 
     228           zw2d(:,:) = ( atcox * patm(:,:) - trb(:,:,1,jpoxy) / ( chemc(:,:,2) + rtrn ) ) * tmask(:,:,1) 
    231229           CALL iom_put( "Dpo2"  , zw2d ) 
    232230         ENDIF 
     
    240238            trc2d(:,:,jp_pcs0_2d + 1) = zoflx(:,:) * 1000 * tmask(:,:,1)  
    241239            trc2d(:,:,jp_pcs0_2d + 2) = zkgco2(:,:) * tmask(:,:,1)  
    242             trc2d(:,:,jp_pcs0_2d + 3) = ( satmco2(:,:) * patm(:,:) - zh2co3(:,:) / ( chemc(:,:) + rtrn ) ) * tmask(:,:,1)  
     240            trc2d(:,:,jp_pcs0_2d + 3) = ( satmco2(:,:) * patm(:,:) - zh2co3(:,:) / ( chemc(:,:,1) + rtrn ) ) * tmask(:,:,1)  
    243241         ENDIF 
    244242      ENDIF 
     
    402400 
    403401   !!====================================================================== 
    404 END MODULE p4zflx 
     402END MODULE  p4zflx 
  • branches/UKMO/dev_r5518_v3.4_asm_nemovar_community/NEMOGCM/NEMO/TOP_SRC/PISCES/P4Z/p4zint.F90

    r6617 r6625  
    8181 
    8282   !!====================================================================== 
    83 END MODULE p4zint 
     83END MODULE  p4zint 
  • branches/UKMO/dev_r5518_v3.4_asm_nemovar_community/NEMOGCM/NEMO/TOP_SRC/PISCES/P4Z/p4zlim.F90

    r6617 r6625  
    265265 
    266266   !!====================================================================== 
    267 END MODULE p4zlim 
     267END MODULE  p4zlim 
  • branches/UKMO/dev_r5518_v3.4_asm_nemovar_community/NEMOGCM/NEMO/TOP_SRC/PISCES/P4Z/p4zlys.F90

    r6617 r6625  
    9191                  zalka = trb(ji,jj,jk,jptal) / zfact 
    9292                  ! CALCULATE [ALK]([CO3--], [HCO3-]) 
    93                   zalk  = zalka - ( akw3(ji,jj,jk) / zph - zph / ( aphscale(ji,jj,jk) + rtrn )  & 
    94                   &       + borat(ji,jj,jk) / ( 1. + zph / akb3(ji,jj,jk) ) ) 
     93                  zalk  = zalka - ( akw3(ji,jj,jk) / zph - zph + borat(ji,jj,jk) / ( 1. + zph / akb3(ji,jj,jk) ) ) 
    9594                  ! CALCULATE [H+] and [CO3--] 
    9695                  zaldi = zdic - zalk 
     
    153152         IF( iom_use( "DCAL"   ) ) CALL iom_put( "DCAL"  , zcaldiss(:,:,:) * 1.e+3 * rfact2r   * tmask(:,:,:) ) 
    154153      ELSE 
    155          IF( ln_diatrc ) THEN 
    156             trc3d(:,:,:,jp_pcs0_3d    ) = -1. * LOG10( hi(:,:,:) ) * tmask(:,:,:) 
    157             trc3d(:,:,:,jp_pcs0_3d + 1) = zco3(:,:,:)              * tmask(:,:,:) 
    158             trc3d(:,:,:,jp_pcs0_3d + 2) = aksp(:,:,:) / calcon     * tmask(:,:,:) 
    159          ENDIF 
     154         trc3d(:,:,:,jp_pcs0_3d    ) = -1. * LOG10( hi(:,:,:) ) * tmask(:,:,:) 
     155         trc3d(:,:,:,jp_pcs0_3d + 1) = zco3(:,:,:)              * tmask(:,:,:) 
     156         trc3d(:,:,:,jp_pcs0_3d + 2) = aksp(:,:,:) / calcon     * tmask(:,:,:) 
    160157      ENDIF 
    161158      ! 
     
    226223#endif  
    227224   !!====================================================================== 
    228 END MODULE p4zlys 
     225END MODULE  p4zlys 
  • branches/UKMO/dev_r5518_v3.4_asm_nemovar_community/NEMOGCM/NEMO/TOP_SRC/PISCES/P4Z/p4zmeso.F90

    r6617 r6625  
    340340 
    341341   !!====================================================================== 
    342 END MODULE p4zmeso 
     342END MODULE  p4zmeso 
  • branches/UKMO/dev_r5518_v3.4_asm_nemovar_community/NEMOGCM/NEMO/TOP_SRC/PISCES/P4Z/p4zmicro.F90

    r6617 r6625  
    273273 
    274274   !!====================================================================== 
    275 END MODULE p4zmicro 
     275END MODULE  p4zmicro 
  • branches/UKMO/dev_r5518_v3.4_asm_nemovar_community/NEMOGCM/NEMO/TOP_SRC/PISCES/P4Z/p4zmort.F90

    r6617 r6625  
    277277 
    278278   !!====================================================================== 
    279 END MODULE p4zmort 
     279END MODULE  p4zmort 
  • branches/UKMO/dev_r5518_v3.4_asm_nemovar_community/NEMOGCM/NEMO/TOP_SRC/PISCES/P4Z/p4zopt.F90

    r6617 r6625  
    439439 
    440440   !!====================================================================== 
    441 END MODULE p4zopt 
     441END MODULE  p4zopt 
  • branches/UKMO/dev_r5518_v3.4_asm_nemovar_community/NEMOGCM/NEMO/TOP_SRC/PISCES/P4Z/p4zprod.F90

    r6617 r6625  
    629629 
    630630   !!====================================================================== 
    631 END MODULE p4zprod 
     631END MODULE  p4zprod 
  • branches/UKMO/dev_r5518_v3.4_asm_nemovar_community/NEMOGCM/NEMO/TOP_SRC/PISCES/P4Z/p4zsbc.F90

    r6617 r6625  
    519519 
    520520   !!====================================================================== 
    521 END MODULE p4zsbc 
     521END MODULE  p4zsbc 
  • branches/UKMO/dev_r5518_v3.4_asm_nemovar_community/NEMOGCM/NEMO/TOP_SRC/PISCES/P4Z/p4zsed.F90

    r6617 r6625  
    7272      CHARACTER (len=25) :: charout 
    7373      REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:  ) :: zpdep, zsidep, zwork1, zwork2, zwork3 
    74       REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:)   :: zsedcal, zsedsi, zsedc 
    7574      REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:  ) :: zdenit2d, zironice, zbureff 
    7675      REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:  ) :: zwsbio3, zwsbio4, zwscal 
     
    8483      ! Allocate temporary workspace 
    8584      CALL wrk_alloc( jpi, jpj, zdenit2d, zwork1, zwork2, zwork3, zbureff ) 
    86       CALL wrk_alloc( jpi, jpj, zsedcal,  zsedsi, zsedc ) 
    8785      CALL wrk_alloc( jpi, jpj, zwsbio3, zwsbio4, zwscal ) 
    8886      CALL wrk_alloc( jpi, jpj, jpk, zsoufer ) 
     
    9391      zwork2  (:,:) = 0.e0 
    9492      zwork3  (:,:) = 0.e0 
    95       zsedsi   (:,:) = 0.e0 
    96       zsedcal  (:,:) = 0.e0 
    97       zsedc    (:,:) = 0.e0 
    9893 
    9994      ! Iron input/uptake due to sea ice : Crude parameterization based on Lancelot et al. 
     
    303298            tra(ji,jj,ikt,jptal) =  tra(ji,jj,ikt,jptal) + zcaloss * zrivalk * 2.0 
    304299            tra(ji,jj,ikt,jpdic) =  tra(ji,jj,ikt,jpdic) + zcaloss * zrivalk 
    305             zsedcal(ji,jj) = (1.0 - zrivalk) * zcaloss / zdep 
    306             zsedsi (ji,jj) = (1.0 - zrivsil) * zsiloss / zdep 
    307300#endif 
    308301         END DO 
     
    343336            tra(ji,jj,ikt,jptal) = tra(ji,jj,ikt,jptal) + rno3 * (zolimit + (1.+rdenit) * (zpdenit + zdenitt) ) 
    344337            tra(ji,jj,ikt,jpdic) = tra(ji,jj,ikt,jpdic) + zpdenit + zolimit + zdenitt 
    345             sdenit(ji,jj) = rdenit * zpdenit / zdep 
    346             zsedc(ji,jj)   = (1. - zrivno3) * zwstpoc / zdep 
     338            sdenit(ji,jj) = rdenit * zpdenit * fse3t(ji,jj,ikt) 
    347339#endif 
    348340         END DO 
     
    400392               CALL iom_put( "INTNFIX" , zwork1 )  
    401393            ENDIF 
    402             IF( iom_use("SedCal" ) ) CALL iom_put( "SedCal", zsedcal(:,:) * 1.e+3 ) 
    403             IF( iom_use("SedSi" ) )  CALL iom_put( "SedSi",  zsedsi (:,:) * 1.e+3 ) 
    404             IF( iom_use("SedC" ) )   CALL iom_put( "SedC",   zsedc  (:,:) * 1.e+3 ) 
    405             IF( iom_use("Sdenit" ) ) CALL iom_put( "Sdenit", sdenit (:,:) * 1.e+3 * rno3 ) 
    406394         ENDIF 
    407395      ELSE 
     
    417405      ! 
    418406      CALL wrk_dealloc( jpi, jpj, zdenit2d, zwork1, zwork2, zwork3, zbureff ) 
    419       CALL wrk_dealloc( jpi, jpj, zsedcal , zsedsi, zsedc ) 
    420407      CALL wrk_dealloc( jpi, jpj, zwsbio3, zwsbio4, zwscal ) 
    421408      CALL wrk_dealloc( jpi, jpj, jpk, zsoufer ) 
     
    449436 
    450437   !!====================================================================== 
    451 END MODULE p4zsed 
     438END MODULE  p4zsed 
  • branches/UKMO/dev_r5518_v3.4_asm_nemovar_community/NEMOGCM/NEMO/TOP_SRC/PISCES/P4Z/p4zsink.F90

    r6617 r6625  
    913913 
    914914   !!====================================================================== 
    915 END MODULE p4zsink 
     915END MODULE  p4zsink 
  • branches/UKMO/dev_r5518_v3.4_asm_nemovar_community/NEMOGCM/NEMO/TOP_SRC/PISCES/P4Z/p4zsms.F90

    r6617 r6625  
    3838 
    3939   REAL(wp) :: alkbudget, no3budget, silbudget, ferbudget, po4budget 
    40    REAL(wp) :: xfact1, xfact2, xfact3 
     40   REAL(wp) :: xfact1, xfact2 
    4141   INTEGER ::  numco2, numnut, numnit  !: logical unit for co2 budget 
    4242 
     
    133133         ! 
    134134         CALL p4z_bio( kt, jnt )   ! Biology 
     135         CALL p4z_sed( kt, jnt )   ! Sedimentation 
    135136         CALL p4z_lys( kt, jnt )   ! Compute CaCO3 saturation 
    136          CALL p4z_sed( kt, jnt )   ! Surface and Bottom boundary conditions 
    137137         CALL p4z_flx( kt, jnt )   ! Compute surface fluxes 
    138138         ! 
     
    474474      !!--------------------------------------------------------------------- 
    475475      ! 
    476       INTEGER, INTENT( in ) ::   kt      ! ocean time-step index       
    477       REAL(wp)             ::  zrdenittot, zsdenittot, znitrpottot 
     476      INTEGER , INTENT( in ) ::   kt      ! ocean time-step index       
     477      REAL(wp)               ::  zfact        
     478      REAL(wp) ::  zrdenittot, zsdenittot, znitrpottot 
    478479      CHARACTER(LEN=100)   ::   cltxt 
    479480      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk) :: zvol 
     
    491492            xfact1 = rfact2r * 12. / 1.e15 * ryyss    ! conversion molC/kt --> PgC/yr 
    492493            xfact2 = 1.e+3 * rno3 * 14. / 1.e12 * ryyss   ! conversion molC/l/s ----> TgN/m3/yr 
    493             xfact3 = 1.e+3 * rfact2r * rno3   ! conversion molC/l/kt ----> molN/m3/s 
    494494            cltxt='time-step   Alkalinity        Nitrate        Phosphorus         Silicate           Iron' 
    495495            IF( lwp ) WRITE(numnut,*)  TRIM(cltxt) 
     
    574574      IF( iom_use( "Sdenit" ) .OR.  ( ln_check_mass .AND. kt == nitend )  ) THEN 
    575575         zsdenittot   = glob_sum ( sdenit(:,:) * e1e2t(:,:) ) 
    576          CALL iom_put( "Sdenit", sdenit(:,:) * xfact3 * tmask(:,:,1) )  ! Nitrate reduction in the sediments 
     576         CALL iom_put( "Sdenit", sdenit(:,:) * zfact * tmask(:,:,1) )  ! Nitrate reduction in the sediments 
    577577      ENDIF 
    578578 
  • branches/UKMO/dev_r5518_v3.4_asm_nemovar_community/NEMOGCM/NEMO/TOP_SRC/PISCES/sms_pisces.F90

    r6617 r6625  
    101101   REAL(wp), ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:) ::   hi         !: ??? 
    102102   REAL(wp), ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:) ::   excess     !: ??? 
    103    REAL(wp), ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:) ::   aphscale   !:  
    104  
    105103 
    106104   !!* Temperature dependancy of SMS terms 
     
    156154         &      ak23(jpi,jpj,jpk)    , aksp  (jpi,jpj,jpk) ,       & 
    157155         &      akw3(jpi,jpj,jpk)    , borat (jpi,jpj,jpk) ,       & 
    158          &      hi  (jpi,jpj,jpk)    , excess(jpi,jpj,jpk) ,       & 
    159          &      aphscale(jpi,jpj,jpk),                           STAT=ierr(4) ) 
     156         &      hi  (jpi,jpj,jpk)    , excess(jpi,jpj,jpk) ,     STAT=ierr(4) ) 
    160157         ! 
    161158      !* Temperature dependancy of SMS terms 
  • branches/UKMO/dev_r5518_v3.4_asm_nemovar_community/NEMOGCM/NEMO/TOP_SRC/PISCES/trcice_pisces.F90

    r6617 r6625  
    2929CONTAINS 
    3030 
    31  
    3231   SUBROUTINE trc_ice_ini_pisces 
    3332      !!---------------------------------------------------------------------- 
    34       !!                   ***  ROUTINE trc_ini_pisces *** 
    35       !! 
    36       !! ** Purpose :   Initialisation of the PISCES biochemical model 
    37       !!---------------------------------------------------------------------- 
    38  
    39       IF( lk_p4z ) THEN  ;   CALL p4z_ice_ini   !  PISCES 
    40       ELSE               ;   CALL p2z_ice_ini   !  LOBSTER 
    41       ENDIF 
    42  
    43    END SUBROUTINE trc_ice_ini_pisces 
    44  
    45  
    46    SUBROUTINE p4z_ice_ini 
    47  
    48 #if defined key_pisces  
    49       !!---------------------------------------------------------------------- 
    50       !!                   ***  ROUTINE p4z_ice_ini *** 
     33      !!                   ***  ROUTINE trc_ice_ini_pisces *** 
    5134      !! 
    5235      !! ** Purpose :   PISCES fake sea ice model setting 
     
    7558 
    7659                                        !--- Dummy variables 
    77       REAL(wp), DIMENSION(jp_pisces,2)  :: zratio  ! effective ice-ocean tracer cc ratio 
    78       REAL(wp), DIMENSION(jp_pisces,4)  :: zpisc   ! prescribes concentration  
    79       !                                            !  1:global, 2:Arctic, 3:Antarctic, 4:Baltic 
    80  
     60      REAL(wp), DIMENSION(jptra,2) & 
     61               ::  zratio            ! effective ice-ocean tracer cc ratio 
    8162      REAL(wp), DIMENSION(2) :: zrs  ! ice-ocean salinity ratio, 1 - global, 2- Baltic 
    8263      REAL(wp) :: zsice_bal          ! prescribed ice salinity in the Baltic 
     
    9980      ! fluxes 
    10081 
    101       !--- Global values 
    102       zpisc(jpdic,1) =  1.99e-3_wp  
    103       zpisc(jpdoc,1) =  2.04e-5_wp  
    104       zpisc(jptal,1) =  2.31e-3_wp  
    105       zpisc(jpoxy,1) =  2.47e-4_wp 
    106       zpisc(jpcal,1) =  1.04e-8_wp 
    107       zpisc(jppo4,1) =  5.77e-7_wp / po4r  
    108       zpisc(jppoc,1) =  1.27e-6_wp   
    109 #  if ! defined key_kriest 
    110       zpisc(jpgoc,1) =  5.23e-8_wp   
    111       zpisc(jpbfe,1) =  9.84e-13_wp  
    112 #  else 
    113       zpisc(jpnum,1) = 0. ! could not get this value since did not use it 
    114 #  endif 
    115       zpisc(jpsil,1) =  7.36e-6_wp   
    116       zpisc(jpdsi,1) =  1.07e-7_wp  
    117       zpisc(jpgsi,1) =  1.53e-8_wp 
    118       zpisc(jpphy,1) =  9.57e-8_wp 
    119       zpisc(jpdia,1) =  4.24e-7_wp 
    120       zpisc(jpzoo,1) =  6.07e-7_wp 
    121       zpisc(jpmes,1) =  3.44e-7_wp 
    122       zpisc(jpfer,1) =  4.06e-10_wp 
    123       zpisc(jpsfe,1) =  2.51e-11_wp 
    124       zpisc(jpdfe,1) =  6.57e-12_wp 
    125       zpisc(jpnfe,1) =  1.76e-11_wp 
    126       zpisc(jpnch,1) =  1.67e-7_wp 
    127       zpisc(jpdch,1) =  1.02e-7_wp 
    128       zpisc(jpno3,1) =  5.79e-6_wp / rno3  
    129       zpisc(jpnh4,1) =  3.22e-7_wp / rno3 
     82      !--- Global case  
     83      IF ( cn_trc_o(jpdic) == 'GL ' ) trc_o(:,:,jpdic) =  1.99e-3_wp  
     84      IF ( cn_trc_o(jpdoc) == 'GL ' ) trc_o(:,:,jpdoc) =  2.04e-5_wp  
     85      IF ( cn_trc_o(jptal) == 'GL ' ) trc_o(:,:,jptal) =  2.31e-3_wp  
     86      IF ( cn_trc_o(jpoxy) == 'GL ' ) trc_o(:,:,jpoxy) =  2.47e-4_wp 
     87      IF ( cn_trc_o(jpcal) == 'GL ' ) trc_o(:,:,jpcal) =  1.04e-8_wp 
     88      IF ( cn_trc_o(jppo4) == 'GL ' ) trc_o(:,:,jppo4) =  5.77e-7_wp / po4r  
     89      IF ( cn_trc_o(jppoc) == 'GL ' ) trc_o(:,:,jppoc) =  1.27e-6_wp   
     90#  if ! defined key_kriest 
     91      IF ( cn_trc_o(jpgoc) == 'GL ' ) trc_o(:,:,jpgoc) =  5.23e-8_wp   
     92      IF ( cn_trc_o(jpbfe) == 'GL ' ) trc_o(:,:,jpbfe) =  9.84e-13_wp  
     93#  else 
     94      IF ( cn_trc_o(jpnum) == 'GL ' ) trc_o(:,:,jpnum) = 0. ! could not get this value since did not use it 
     95#  endif 
     96      IF ( cn_trc_o(jpsil) == 'GL ' ) trc_o(:,:,jpsil) =  7.36e-6_wp   
     97      IF ( cn_trc_o(jpdsi) == 'GL ' ) trc_o(:,:,jpdsi) =  1.07e-7_wp  
     98      IF ( cn_trc_o(jpgsi) == 'GL ' ) trc_o(:,:,jpgsi) =  1.53e-8_wp 
     99      IF ( cn_trc_o(jpphy) == 'GL ' ) trc_o(:,:,jpphy) =  9.57e-8_wp 
     100      IF ( cn_trc_o(jpdia) == 'GL ' ) trc_o(:,:,jpdia) =  4.24e-7_wp 
     101      IF ( cn_trc_o(jpzoo) == 'GL ' ) trc_o(:,:,jpzoo) =  6.07e-7_wp 
     102      IF ( cn_trc_o(jpmes) == 'GL ' ) trc_o(:,:,jpmes) =  3.44e-7_wp 
     103      IF ( cn_trc_o(jpfer) == 'GL ' ) trc_o(:,:,jpfer) =  4.06e-10_wp 
     104      IF ( cn_trc_o(jpsfe) == 'GL ' ) trc_o(:,:,jpsfe) =  2.51e-11_wp 
     105      IF ( cn_trc_o(jpdfe) == 'GL ' ) trc_o(:,:,jpdfe) =  6.57e-12_wp 
     106      IF ( cn_trc_o(jpnfe) == 'GL ' ) trc_o(:,:,jpnfe) =  1.76e-11_wp 
     107      IF ( cn_trc_o(jpnch) == 'GL ' ) trc_o(:,:,jpnch) =  1.67e-7_wp 
     108      IF ( cn_trc_o(jpdch) == 'GL ' ) trc_o(:,:,jpdch) =  1.02e-7_wp 
     109      IF ( cn_trc_o(jpno3) == 'GL ' ) trc_o(:,:,jpno3) =  5.79e-6_wp / rno3  
     110      IF ( cn_trc_o(jpnh4) == 'GL ' ) trc_o(:,:,jpnh4) =  3.22e-7_wp / rno3 
    130111 
    131112      !--- Arctic specificities (dissolved inorganic & DOM) 
    132       zpisc(jpdic,2) =  1.98e-3_wp  
    133       zpisc(jpdoc,2) =  6.00e-6_wp  
    134       zpisc(jptal,2) =  2.13e-3_wp  
    135       zpisc(jpoxy,2) =  3.65e-4_wp   
    136       zpisc(jpcal,2) =  1.50e-9_wp   
    137       zpisc(jppo4,2) =  4.09e-7_wp / po4r  
    138       zpisc(jppoc,2) =  4.05e-7_wp   
    139 #  if ! defined key_kriest 
    140       zpisc(jpgoc,2) =  2.84e-8_wp   
    141       zpisc(jpbfe,2) =  7.03e-13_wp  
    142 #  else 
    143       zpisc(jpnum,2) =  0.00e-00_wp  
    144 #  endif 
    145       zpisc(jpsil,2) =  6.87e-6_wp   
    146       zpisc(jpdsi,2) =  1.73e-7_wp  
    147       zpisc(jpgsi,2) =  7.93e-9_wp 
    148       zpisc(jpphy,2) =  5.25e-7_wp   
    149       zpisc(jpdia,2) =  7.75e-7_wp  
    150       zpisc(jpzoo,2) =  3.34e-7_wp 
    151       zpisc(jpmes,2) =  2.49e-7_wp   
    152       zpisc(jpfer,2) =  1.43e-9_wp  
    153       zpisc(jpsfe,2) =  2.21e-11_wp  
    154       zpisc(jpdfe,2) =  2.04e-11_wp  
    155       zpisc(jpnfe,2) =  1.75e-11_wp  
    156       zpisc(jpnch,2) =  1.46e-07_wp  
    157       zpisc(jpdch,2) =  2.36e-07_wp  
    158       zpisc(jpno3,2) =  3.51e-06_wp / rno3  
    159       zpisc(jpnh4,2) =  6.15e-08_wp / rno3  
     113      IF ( cn_trc_o(jpdic) == 'AA ' ) THEN ; WHERE( gphit(:,:) >= 00._wp ) ; trc_o(:,:,jpdic) =  1.98e-3_wp  ; END WHERE ; ENDIF 
     114      IF ( cn_trc_o(jpdoc) == 'AA ' ) THEN ; WHERE( gphit(:,:) >= 00._wp ) ; trc_o(:,:,jpdoc) =  6.00e-6_wp  ; END WHERE ; ENDIF 
     115      IF ( cn_trc_o(jptal) == 'AA ' ) THEN ; WHERE( gphit(:,:) >= 00._wp ) ; trc_o(:,:,jptal) =  2.13e-3_wp  ; END WHERE ; ENDIF 
     116      IF ( cn_trc_o(jpoxy) == 'AA ' ) THEN ; WHERE( gphit(:,:) >= 00._wp ) ; trc_o(:,:,jpoxy) =  3.65e-4_wp  ; END WHERE ; ENDIF 
     117      IF ( cn_trc_o(jpcal) == 'AA ' ) THEN ; WHERE( gphit(:,:) >= 00._wp ) ; trc_o(:,:,jpcal) =  1.50e-9_wp  ; END WHERE ; ENDIF 
     118      IF ( cn_trc_o(jppo4) == 'AA ' ) THEN ; WHERE( gphit(:,:) >= 00._wp ) ; trc_o(:,:,jppo4) =  4.09e-7_wp / po4r ; END WHERE ; ENDIF 
     119      IF ( cn_trc_o(jppoc) == 'AA ' ) THEN ; WHERE( gphit(:,:) >= 00._wp ) ; trc_o(:,:,jppoc) =  4.05e-7_wp  ; END WHERE ; ENDIF 
     120#  if ! defined key_kriest 
     121      IF ( cn_trc_o(jpgoc) == 'AA ' ) THEN ; WHERE( gphit(:,:) >= 00._wp ) ; trc_o(:,:,jpgoc) =  2.84e-8_wp  ; END WHERE ; ENDIF 
     122      IF ( cn_trc_o(jpbfe) == 'AA ' ) THEN ; WHERE( gphit(:,:) >= 00._wp ) ; trc_o(:,:,jpbfe) =  7.03e-13_wp ; END WHERE ; ENDIF 
     123#  else 
     124      IF ( cn_trc_o(jpnum) == 'AA ' ) THEN ; WHERE( gphit(:,:) >= 00._wp ) ; trc_o(:,:,jpnum) =  0.00e-00_wp ; END WHERE ; ENDIF 
     125#  endif 
     126      IF ( cn_trc_o(jpsil) == 'AA ' ) THEN ; WHERE( gphit(:,:) >= 00._wp ) ; trc_o(:,:,jpsil) =  6.87e-6_wp  ; END WHERE ; ENDIF 
     127      IF ( cn_trc_o(jpdsi) == 'AA ' ) THEN ; WHERE( gphit(:,:) >= 00._wp ) ; trc_o(:,:,jpdsi) =  1.73e-7_wp  ; END WHERE ; ENDIF 
     128      IF ( cn_trc_o(jpgsi) == 'AA ' ) THEN ; WHERE( gphit(:,:) >= 00._wp ) ; trc_o(:,:,jpgsi) =  7.93e-9_wp  ; END WHERE ; ENDIF 
     129      IF ( cn_trc_o(jpphy) == 'AA ' ) THEN ; WHERE( gphit(:,:) >= 00._wp ) ; trc_o(:,:,jpphy) =  5.25e-7_wp  ; END WHERE ; ENDIF 
     130      IF ( cn_trc_o(jpdia) == 'AA ' ) THEN ; WHERE( gphit(:,:) >= 00._wp ) ; trc_o(:,:,jpdia) =  7.75e-7_wp  ; END WHERE ; ENDIF 
     131      IF ( cn_trc_o(jpzoo) == 'AA ' ) THEN ; WHERE( gphit(:,:) >= 00._wp ) ; trc_o(:,:,jpzoo) =  3.34e-7_wp  ; END WHERE ; ENDIF 
     132      IF ( cn_trc_o(jpmes) == 'AA ' ) THEN ; WHERE( gphit(:,:) >= 00._wp ) ; trc_o(:,:,jpmes) =  2.49e-7_wp  ; END WHERE ; ENDIF 
     133      IF ( cn_trc_o(jpfer) == 'AA ' ) THEN ; WHERE( gphit(:,:) >= 00._wp ) ; trc_o(:,:,jpfer) =  1.43e-9_wp  ; END WHERE ; ENDIF 
     134      IF ( cn_trc_o(jpsfe) == 'AA ' ) THEN ; WHERE( gphit(:,:) >= 00._wp ) ; trc_o(:,:,jpsfe) =  2.21e-11_wp ; END WHERE ; ENDIF 
     135      IF ( cn_trc_o(jpdfe) == 'AA ' ) THEN ; WHERE( gphit(:,:) >= 00._wp ) ; trc_o(:,:,jpdfe) =  2.04e-11_wp ; END WHERE ; ENDIF 
     136      IF ( cn_trc_o(jpnfe) == 'AA ' ) THEN ; WHERE( gphit(:,:) >= 00._wp ) ; trc_o(:,:,jpnfe) =  1.75e-11_wp ; END WHERE ; ENDIF 
     137      IF ( cn_trc_o(jpnch) == 'AA ' ) THEN ; WHERE( gphit(:,:) >= 00._wp ) ; trc_o(:,:,jpnch) =  1.46e-07_wp ; END WHERE ; ENDIF 
     138      IF ( cn_trc_o(jpdch) == 'AA ' ) THEN ; WHERE( gphit(:,:) >= 00._wp ) ; trc_o(:,:,jpdch) =  2.36e-07_wp ; END WHERE ; ENDIF 
     139      IF ( cn_trc_o(jpno3) == 'AA ' ) THEN ; WHERE( gphit(:,:) >= 00._wp ) ; trc_o(:,:,jpno3) =  3.51e-06_wp / rno3 ; END WHERE ; ENDIF 
     140      IF ( cn_trc_o(jpnh4) == 'AA ' ) THEN ; WHERE( gphit(:,:) >= 00._wp ) ; trc_o(:,:,jpnh4) =  6.15e-08_wp / rno3 ; END WHERE ; ENDIF 
    160141 
    161142      !--- Antarctic specificities (dissolved inorganic & DOM) 
    162       zpisc(jpdic,3) =  2.20e-3_wp   
    163       zpisc(jpdoc,3) =  7.02e-6_wp   
    164       zpisc(jptal,3) =  2.37e-3_wp   
    165       zpisc(jpoxy,3) =  3.42e-4_wp   
    166       zpisc(jpcal,3) =  3.17e-9_wp   
    167       zpisc(jppo4,3) =  1.88e-6_wp / po4r   
    168       zpisc(jppoc,3) =  1.13e-6_wp   
    169 #  if ! defined key_kriest 
    170       zpisc(jpgoc,3) =  2.89e-8_wp   
    171       zpisc(jpbfe,3) =  5.63e-13_wp  
    172 #  else 
    173       zpisc(jpnum,3) =  0.00e-00_wp  
    174 #  endif 
    175       zpisc(jpsil,3) =  4.96e-5_wp   
    176       zpisc(jpdsi,3) =  5.63e-7_wp  
    177       zpisc(jpgsi,3) =  5.35e-8_wp 
    178       zpisc(jpphy,3) =  8.10e-7_wp   
    179       zpisc(jpdia,3) =  5.77e-7_wp  
    180       zpisc(jpzoo,3) =  6.68e-7_wp 
    181       zpisc(jpmes,3) =  3.55e-7_wp   
    182       zpisc(jpfer,3) =  1.62e-10_wp 
    183       zpisc(jpsfe,3) =  2.29e-11_wp  
    184       zpisc(jpdfe,3) =  8.75e-12_wp 
    185       zpisc(jpnfe,3) =  1.48e-11_wp  
    186       zpisc(jpnch,3) =  2.02e-7_wp   
    187       zpisc(jpdch,3) =  1.60e-7_wp   
    188       zpisc(jpno3,3) =  2.64e-5_wp / rno3   
    189       zpisc(jpnh4,3) =  3.39e-7_wp / rno3   
     143      IF ( cn_trc_o(jpdic) == 'AA ' ) THEN ; WHERE( gphit(:,:) <  00._wp ) ; trc_o(:,:,jpdic) =  2.20e-3_wp  ; END WHERE ; ENDIF 
     144      IF ( cn_trc_o(jpdoc) == 'AA ' ) THEN ; WHERE( gphit(:,:) <  00._wp ) ; trc_o(:,:,jpdoc) =  7.02e-6_wp  ; END WHERE ; ENDIF 
     145      IF ( cn_trc_o(jptal) == 'AA ' ) THEN ; WHERE( gphit(:,:) <  00._wp ) ; trc_o(:,:,jptal) =  2.37e-3_wp  ; END WHERE ; ENDIF 
     146      IF ( cn_trc_o(jpoxy) == 'AA ' ) THEN ; WHERE( gphit(:,:) <  00._wp ) ; trc_o(:,:,jpoxy) =  3.42e-4_wp  ; END WHERE ; ENDIF 
     147      IF ( cn_trc_o(jpcal) == 'AA ' ) THEN ; WHERE( gphit(:,:) <  00._wp ) ; trc_o(:,:,jpcal) =  3.17e-9_wp  ; END WHERE ; ENDIF 
     148      IF ( cn_trc_o(jppo4) == 'AA ' ) THEN ; WHERE( gphit(:,:) <  00._wp ) ; trc_o(:,:,jppo4) =  1.88e-6_wp / po4r  ; END WHERE ; ENDIF 
     149      IF ( cn_trc_o(jppoc) == 'AA ' ) THEN ; WHERE( gphit(:,:) <  00._wp ) ; trc_o(:,:,jppoc) =  1.13e-6_wp  ; END WHERE ; ENDIF 
     150#  if ! defined key_kriest 
     151      IF ( cn_trc_o(jpgoc) == 'AA ' ) THEN ; WHERE( gphit(:,:) <  00._wp ) ; trc_o(:,:,jpgoc) =  2.89e-8_wp  ; END WHERE ; ENDIF 
     152      IF ( cn_trc_o(jpbfe) == 'AA ' ) THEN ; WHERE( gphit(:,:) <  00._wp ) ; trc_o(:,:,jpbfe) =  5.63e-13_wp ; END WHERE ; ENDIF 
     153#  else 
     154      IF ( cn_trc_o(jpnum) == 'AA ' ) THEN ; WHERE( gphit(:,:) <  00._wp ) ; trc_o(:,:,jpnum) =  0.00e-00_wp ; END WHERE ; ENDIF 
     155#  endif 
     156      IF ( cn_trc_o(jpsil) == 'AA ' ) THEN ; WHERE( gphit(:,:) <  00._wp ) ; trc_o(:,:,jpsil) =  4.96e-5_wp  ; END WHERE ; ENDIF 
     157      IF ( cn_trc_o(jpdsi) == 'AA ' ) THEN ; WHERE( gphit(:,:) <  00._wp ) ; trc_o(:,:,jpdsi) =  5.63e-7_wp  ; END WHERE ; ENDIF 
     158      IF ( cn_trc_o(jpgsi) == 'AA ' ) THEN ; WHERE( gphit(:,:) <  00._wp ) ; trc_o(:,:,jpgsi) =  5.35e-8_wp  ; END WHERE ; ENDIF 
     159      IF ( cn_trc_o(jpphy) == 'AA ' ) THEN ; WHERE( gphit(:,:) <  00._wp ) ; trc_o(:,:,jpphy) =  8.10e-7_wp  ; END WHERE ; ENDIF 
     160      IF ( cn_trc_o(jpdia) == 'AA ' ) THEN ; WHERE( gphit(:,:) <  00._wp ) ; trc_o(:,:,jpdia) =  5.77e-7_wp  ; END WHERE ; ENDIF 
     161      IF ( cn_trc_o(jpzoo) == 'AA ' ) THEN ; WHERE( gphit(:,:) <  00._wp ) ; trc_o(:,:,jpzoo) =  6.68e-7_wp  ; END WHERE ; ENDIF 
     162      IF ( cn_trc_o(jpmes) == 'AA ' ) THEN ; WHERE( gphit(:,:) <  00._wp ) ; trc_o(:,:,jpmes) =  3.55e-7_wp  ; END WHERE ; ENDIF 
     163      IF ( cn_trc_o(jpfer) == 'AA ' ) THEN ; WHERE( gphit(:,:) <  00._wp ) ; trc_o(:,:,jpfer) =  1.62e-10_wp ; END WHERE ; ENDIF 
     164      IF ( cn_trc_o(jpsfe) == 'AA ' ) THEN ; WHERE( gphit(:,:) <  00._wp ) ; trc_o(:,:,jpsfe) =  2.29e-11_wp ; END WHERE ; ENDIF 
     165      IF ( cn_trc_o(jpdfe) == 'AA ' ) THEN ; WHERE( gphit(:,:) <  00._wp ) ; trc_o(:,:,jpdfe) =  8.75e-12_wp ; END WHERE ; ENDIF 
     166      IF ( cn_trc_o(jpnfe) == 'AA ' ) THEN ; WHERE( gphit(:,:) <  00._wp ) ; trc_o(:,:,jpnfe) =  1.48e-11_wp ; END WHERE ; ENDIF 
     167      IF ( cn_trc_o(jpnch) == 'AA ' ) THEN ; WHERE( gphit(:,:) <  00._wp ) ; trc_o(:,:,jpnch) =  2.02e-7_wp  ; END WHERE ; ENDIF 
     168      IF ( cn_trc_o(jpdch) == 'AA ' ) THEN ; WHERE( gphit(:,:) <  00._wp ) ; trc_o(:,:,jpdch) =  1.60e-7_wp  ; END WHERE ; ENDIF 
     169      IF ( cn_trc_o(jpno3) == 'AA ' ) THEN ; WHERE( gphit(:,:) <  00._wp ) ; trc_o(:,:,jpno3) =  2.64e-5_wp / rno3  ; END WHERE ; ENDIF 
     170      IF ( cn_trc_o(jpnh4) == 'AA ' ) THEN ; WHERE( gphit(:,:) <  00._wp ) ; trc_o(:,:,jpnh4) =  3.39e-7_wp / rno3  ; END WHERE ; ENDIF 
    190171 
    191172      !--- Baltic Sea particular case for ORCA configurations 
    192       zpisc(jpdic,4) = 1.14e-3_wp 
    193       zpisc(jpdoc,4) = 1.06e-5_wp 
    194       zpisc(jptal,4) = 1.16e-3_wp 
    195       zpisc(jpoxy,4) = 3.71e-4_wp 
    196       zpisc(jpcal,4) = 1.51e-9_wp 
    197       zpisc(jppo4,4) = 2.85e-9_wp / po4r 
    198       zpisc(jppoc,4) = 4.84e-7_wp 
    199 #  if ! defined key_kriest 
    200       zpisc(jpgoc,4) = 1.05e-8_wp 
    201       zpisc(jpbfe,4) = 4.97e-13_wp 
    202 #  else 
    203       zpisc(jpnum,4) = 0. ! could not get this value 
    204 #  endif 
    205       zpisc(jpsil,4) = 4.91e-5_wp 
    206       zpisc(jpdsi,4) = 3.25e-7_wp 
    207       zpisc(jpgsi,4) = 1.93e-8_wp 
    208       zpisc(jpphy,4) = 6.64e-7_wp 
    209       zpisc(jpdia,4) = 3.41e-7_wp 
    210       zpisc(jpzoo,4) = 3.83e-7_wp 
    211       zpisc(jpmes,4) = 0.225e-6_wp 
    212       zpisc(jpfer,4) = 2.45e-9_wp 
    213       zpisc(jpsfe,4) = 3.89e-11_wp 
    214       zpisc(jpdfe,4) = 1.33e-11_wp 
    215       zpisc(jpnfe,4) = 2.62e-11_wp 
    216       zpisc(jpnch,4) = 1.17e-7_wp 
    217       zpisc(jpdch,4) = 9.69e-8_wp 
    218       zpisc(jpno3,4) = 5.36e-5_wp / rno3 
    219       zpisc(jpnh4,4) = 7.18e-7_wp / rno3 
    220   
    221       DO jn = jp_pcs0, jp_pcs1 
    222          IF( cn_trc_o(jn) == 'GL ' ) trc_o(:,:,jn) = zpisc(jn,1)  ! Global case 
    223          IF( cn_trc_o(jn) == 'AA ' ) THEN  
    224             WHERE( gphit(:,:) >= 0._wp ) ; trc_o(:,:,jn) = zpisc(jn,2) ; END WHERE ! Arctic  
    225             WHERE( gphit(:,:) <  0._wp ) ; trc_o(:,:,jn) = zpisc(jn,3) ; END WHERE ! Antarctic  
    226          ENDIF 
    227          IF( cp_cfg == "orca" ) THEN     !  Baltic Sea particular case for ORCA configurations 
    228              WHERE( 14._wp <= glamt(:,:) .AND. glamt(:,:) <= 32._wp .AND.    & 
    229                     54._wp <= gphit(:,:) .AND. gphit(:,:) <= 66._wp ) 
    230                     trc_o(:,:,jn) = zpisc(jn,4) 
    231             END WHERE 
    232          ENDIF  
    233       ENDDO 
    234  
    235  
     173      IF( cp_cfg == "orca" ) THEN            ! Baltic mask 
     174         WHERE( 14._wp <= glamt(:,:) .AND. glamt(:,:) <= 32._wp .AND.    & 
     175                54._wp <= gphit(:,:) .AND. gphit(:,:) <= 66._wp ) 
     176         trc_o(:,:,jpdic) = 1.14e-3_wp 
     177         trc_o(:,:,jpdoc) = 1.06e-5_wp 
     178         trc_o(:,:,jptal) = 1.16e-3_wp 
     179         trc_o(:,:,jpoxy) = 3.71e-4_wp 
     180         trc_o(:,:,jpcal) = 1.51e-9_wp 
     181         trc_o(:,:,jppo4) = 2.85e-9_wp / po4r 
     182         trc_o(:,:,jppoc) = 4.84e-7_wp 
     183#  if ! defined key_kriest 
     184         trc_o(:,:,jpgoc) = 1.05e-8_wp 
     185         trc_o(:,:,jpbfe) = 4.97e-13_wp 
     186#  else 
     187         trc_o(:,:,jpnum) = 0. ! could not get this value 
     188#  endif 
     189         trc_o(:,:,jpsil) = 4.91e-5_wp 
     190         trc_o(:,:,jpdsi) = 3.25e-7_wp 
     191         trc_o(:,:,jpgsi) = 1.93e-8_wp 
     192         trc_o(:,:,jpphy) = 6.64e-7_wp 
     193         trc_o(:,:,jpdia) = 3.41e-7_wp 
     194         trc_o(:,:,jpzoo) = 3.83e-7_wp 
     195         trc_o(:,:,jpmes) = 0.225e-6_wp 
     196         trc_o(:,:,jpfer) = 2.45e-9_wp 
     197         trc_o(:,:,jpsfe) = 3.89e-11_wp 
     198         trc_o(:,:,jpdfe) = 1.33e-11_wp 
     199         trc_o(:,:,jpnfe) = 2.62e-11_wp 
     200         trc_o(:,:,jpnch) = 1.17e-7_wp 
     201         trc_o(:,:,jpdch) = 9.69e-8_wp 
     202         trc_o(:,:,jpno3) = 5.36e-5_wp / rno3 
     203         trc_o(:,:,jpnh4) = 7.18e-7_wp / rno3 
     204         END WHERE 
     205      ENDIF ! cfg 
    236206 
    237207      !----------------------------- 
     
    247217 
    248218      DO jn = jp_pcs0, jp_pcs1 
    249          IF( trc_ice_ratio(jn) >= 0._wp )  zratio(jn,:) = trc_ice_ratio(jn) 
    250          IF( trc_ice_ratio(jn) == -1._wp ) zratio(jn,:) = zrs(:) 
    251          IF( trc_ice_ratio(jn) == -2._wp ) zratio(jn,:) = -9999.99_wp 
     219         IF ( trc_ice_ratio(jn) >= 0._wp )  zratio(jn,:) = trc_ice_ratio(jn) 
     220         IF ( trc_ice_ratio(jn) == -1._wp ) zratio(jn,:) = zrs(:) 
     221         IF ( trc_ice_ratio(jn) == -2._wp ) zratio(jn,:) = -9999.99_wp 
    252222      END DO 
    253223 
     
    257227      DO jn = jp_pcs0, jp_pcs1 
    258228         !-- Everywhere but in the Baltic 
    259          IF ( trc_ice_ratio(jn) >= -1._wp ) THEN ! no prescribed conc. ; typically everything but iron)  
     229         IF ( trc_ice_ratio(jn) >= -1._wp ) THEN !! no prescribed concentration 
     230                                              !! (typically everything but iron)  
    260231            trc_i(:,:,jn) = zratio(jn,1) * trc_o(:,:,jn)  
    261          ELSE                                    ! prescribed concentration 
     232         ELSE                                 !! prescribed concentration 
    262233            trc_i(:,:,jn) = trc_ice_prescr(jn) 
    263234         ENDIF 
    264235        
    265236         !-- Baltic 
    266          IF( cp_cfg == "orca" ) THEN  ! Baltic treated seperately for ORCA configs 
    267             IF ( trc_ice_ratio(jn) >= - 1._wp ) THEN ! no prescribed conc. ; typically everything but iron)  
     237         IF( cp_cfg == "orca" ) THEN !! Baltic treated seperately for ORCA configs 
     238            IF ( trc_ice_ratio(jn) >= - 1._wp ) THEN !! no prescribed concentration 
     239                                                 !! (typically everything but iron)  
    268240               WHERE( 14._wp <= glamt(:,:) .AND. glamt(:,:) <= 32._wp .AND.    & 
    269241                      54._wp <= gphit(:,:) .AND. gphit(:,:) <= 66._wp ) 
    270242                     trc_i(:,:,jn) = zratio(jn,2) * trc_o(:,:,jn)  
    271243               END WHERE 
    272             ELSE                                 ! prescribed tracer concentration in ice 
     244            ELSE                                 !! prescribed tracer concentration in ice 
    273245               WHERE( 14._wp <= glamt(:,:) .AND. glamt(:,:) <= 32._wp .AND.    & 
    274246                   54._wp <= gphit(:,:) .AND. gphit(:,:) <= 66._wp ) 
     
    279251      ! 
    280252      END DO ! jn 
    281 #endif 
    282  
    283    END SUBROUTINE p4z_ice_ini 
    284  
    285    SUBROUTINE p2z_ice_ini 
    286 #if defined key_pisces_reduced  
    287       !!---------------------------------------------------------------------- 
    288       !!                   ***  ROUTINE p2z_ice_ini *** 
    289       !! 
    290       !! ** Purpose :   Initialisation of the LOBSTER biochemical model 
    291       !!---------------------------------------------------------------------- 
    292 #endif 
    293    END SUBROUTINE p2z_ice_ini 
    294  
     253 
     254   END SUBROUTINE trc_ice_ini_pisces 
    295255 
    296256#else 
  • branches/UKMO/dev_r5518_v3.4_asm_nemovar_community/NEMOGCM/NEMO/TOP_SRC/PISCES/trcini_pisces.F90

    r6617 r6625  
    115115      po4r    =   1._wp / 122._wp 
    116116      o2nit   =  32._wp / 122._wp 
     117      rdenit  = 105._wp /  16._wp 
     118      rdenita =   3._wp /  5._wp 
    117119      o2ut    = 133._wp / 122._wp 
    118       rdenit  =  ( ( o2ut + o2nit ) * 0.80 - rno3 - rno3 * 0.60 ) / rno3 
    119       rdenita =   3._wp /  5._wp 
    120  
    121120 
    122121      ! Initialization of tracer concentration in case of  no restart  
  • branches/UKMO/dev_r5518_v3.4_asm_nemovar_community/NEMOGCM/NEMO/TOP_SRC/TRP/trcdmp.F90

    r6617 r6625  
    107107                
    108108               jl = n_trc_index(jn)  
    109                CALL trc_dta( kt, sf_trcdta(jl) )   ! read tracer data at nit000 
    110                ztrcdta(:,:,:) = sf_trcdta(jl)%fnow(:,:,:) * tmask(:,:,:) * rf_trfac(jl) 
     109               CALL trc_dta( kt, sf_trcdta(jl),rf_trfac(jl) )   ! read tracer data at nit000 
     110               ztrcdta(:,:,:) = sf_trcdta(jl)%fnow(:,:,:) 
    111111 
    112112               SELECT CASE ( nn_zdmp_tr ) 
     
    187187      INTEGER :: ji , jj, jk, jn, jl, jc                     ! dummy loop indicesa 
    188188      INTEGER :: isrow                                      ! local index 
     189      REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:,:) ::  ztrcdta       ! 3D  workspace 
    189190 
    190191      !!---------------------------------------------------------------------- 
     
    277278         IF(lwp)  WRITE(numout,*) 
    278279         ! 
     280         CALL wrk_alloc( jpi, jpj, jpk, ztrcdta )   ! Memory allocation 
     281         ! 
    279282         DO jn = 1, jptra 
    280283            IF( ln_trc_ini(jn) ) THEN      ! update passive tracers arrays with input data read from file 
    281284                jl = n_trc_index(jn) 
    282                 CALL trc_dta( kt, sf_trcdta(jl) )   ! read tracer data at nit000 
     285                CALL trc_dta( kt, sf_trcdta(jl),rf_trfac(jl) )   ! read tracer data at nit000 
     286                ztrcdta(:,:,:) = sf_trcdta(jl)%fnow(:,:,:) 
    283287                DO jc = 1, npncts 
    284288                   DO jk = 1, jpkm1 
    285289                      DO jj = nctsj1(jc), nctsj2(jc) 
    286290                         DO ji = nctsi1(jc), nctsi2(jc) 
    287                             trn(ji,jj,jk,jn) = sf_trcdta(jl)%fnow(ji,jj,jk) * tmask(ji,jj,jk) * rf_trfac(jl) 
     291                            trn(ji,jj,jk,jn) = ztrcdta(ji,jj,jk) * tmask(ji,jj,jk) 
    288292                            trb(ji,jj,jk,jn) = trn(ji,jj,jk,jn) 
    289293                         ENDDO 
     
    293297             ENDIF 
    294298          ENDDO 
    295           ! 
     299          CALL wrk_dealloc( jpi, jpj, jpk, ztrcdta ) 
    296300      ENDIF 
    297301      ! 
  • branches/UKMO/dev_r5518_v3.4_asm_nemovar_community/NEMOGCM/NEMO/TOP_SRC/TRP/trcldf.F90

    r6617 r6625  
    5656      INTEGER, INTENT( in ) ::   kt   ! ocean time-step index 
    5757      !! 
    58       INTEGER            :: ji, jj, jk, jn 
    59       REAL(wp)           :: zdep 
     58      INTEGER            :: jn 
    6059      CHARACTER (len=22) :: charout 
    6160      REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:,:,:) ::   ztrtrd 
     
    6766 
    6867      rldf = rldf_rat 
    69       ! 
    70       r_fact_lap(:,:,:) = 1. 
    71       DO jk= 1, jpk 
    72          DO jj = 1, jpj 
    73             DO ji = 1, jpi 
    74                IF( fsdept(ji,jj,jk) > 200. .AND. gphit(ji,jj) < 5. .AND. gphit(ji,jj) > -5. ) THEN 
    75                   zdep = MAX( fsdept(ji,jj,jk) - 1000., 0. ) / 1000. 
    76                   r_fact_lap(ji,jj,jk) = MAX( 1., rn_fact_lap * EXP( -zdep ) ) 
    77                ENDIF 
    78             END DO 
    79          END DO 
    80       END DO 
    81       ! 
     68 
    8269      IF( l_trdtrc )  THEN 
    8370         CALL wrk_alloc( jpi, jpj, jpk, jptra, ztrtrd ) 
  • branches/UKMO/dev_r5518_v3.4_asm_nemovar_community/NEMOGCM/NEMO/TOP_SRC/TRP/trcnam_trp.F90

    r6617 r6625  
    4040   REAL(wp), PUBLIC ::   rn_ahtrc_0          !: diffusivity coefficient for passive tracer (m2/s) 
    4141   REAL(wp), PUBLIC ::   rn_ahtrb_0          !: background diffusivity coefficient for passive tracer (m2/s) 
    42    REAL(wp), PUBLIC ::   rn_fact_lap         !: Enhanced zonal diffusivity coefficent in the equatorial domain 
    4342 
    4443   !                                        !!: ** Treatment of Negative concentrations ( nam_trcrad ) 
     
    7574      NAMELIST/namtrc_ldf/ ln_trcldf_lap  ,     & 
    7675         &                 ln_trcldf_bilap, ln_trcldf_level,     & 
    77          &                 ln_trcldf_hor  , ln_trcldf_iso  , rn_ahtrc_0, rn_ahtrb_0,   & 
    78          &                 rn_fact_lap 
    79  
     76         &                 ln_trcldf_hor  , ln_trcldf_iso  , rn_ahtrc_0, rn_ahtrb_0 
    8077      NAMELIST/namtrc_zdf/ ln_trczdf_exp  , nn_trczdf_exp 
    8178      NAMELIST/namtrc_rad/ ln_trcrad 
     
    130127         WRITE(numout,*) '      diffusivity coefficient                                 rn_ahtrc_0 = ', rn_ahtrc_0 
    131128         WRITE(numout,*) '      background hor. diffusivity                             rn_ahtrb_0 = ', rn_ahtrb_0 
    132          WRITE(numout,*) '      enhanced zonal diffusivity                             rn_fact_lap = ', rn_fact_lap 
    133129      ENDIF 
    134130 
  • branches/UKMO/dev_r5518_v3.4_asm_nemovar_community/NEMOGCM/NEMO/TOP_SRC/TRP/trcnxt.F90

    r6617 r6625  
    102102      ENDIF 
    103103 
    104 #if defined key_agrif 
    105       CALL Agrif_trc                   ! AGRIF zoom boundaries 
    106 #endif 
    107104      ! Update after tracer on domain lateral boundaries 
    108105      DO jn = 1, jptra 
     
    113110#if defined key_bdy 
    114111!!      CALL bdy_trc( kt )               ! BDY open boundaries 
     112#endif 
     113#if defined key_agrif 
     114      CALL Agrif_trc                   ! AGRIF zoom boundaries 
    115115#endif 
    116116 
  • branches/UKMO/dev_r5518_v3.4_asm_nemovar_community/NEMOGCM/NEMO/TOP_SRC/TRP/trcsbc.F90

    r6617 r6625  
    170170            END DO 
    171171         ENDIF 
    172          ! 
    173          CALL lbc_lnk( sbc_trc(:,:,jn), 'T', 1. ) 
    174172         !                                       Concentration dilution effect on tracers due to evaporation & precipitation  
    175173         DO jj = 2, jpj 
  • branches/UKMO/dev_r5518_v3.4_asm_nemovar_community/NEMOGCM/NEMO/TOP_SRC/TRP/trctrp.F90

    r6617 r6625  
    6767         IF( lk_trabbl )        CALL trc_bbl( kstp )            ! advective (and/or diffusive) bottom boundary layer scheme 
    6868         IF( ln_trcdmp )        CALL trc_dmp( kstp )            ! internal damping trends 
     69         IF( ln_trcdmp_clo )    CALL trc_dmp_clo( kstp )        ! internal damping trends on closed seas only 
    6970                                CALL trc_adv( kstp )            ! horizontal & vertical advection  
    7071                                CALL trc_ldf( kstp )            ! lateral mixing 
     
    7778                                CALL trc_nxt( kstp )            ! tracer fields at next time step      
    7879         IF( ln_trcrad )        CALL trc_rad( kstp )            ! Correct artificial negative concentrations 
    79          IF( ln_trcdmp_clo )    CALL trc_dmp_clo( kstp )        ! internal damping trends on closed seas only 
    8080 
    8181#if defined key_agrif 
  • branches/UKMO/dev_r5518_v3.4_asm_nemovar_community/NEMOGCM/NEMO/TOP_SRC/oce_trc.F90

    r6617 r6625  
    116116   USE ldftra_oce , ONLY :  aeiw     =>   aeiw        !: eddy induced velocity coef. at w-points (m2/s)  
    117117   USE ldftra_oce , ONLY :  lk_traldf_eiv  =>  lk_traldf_eiv     !: eddy induced velocity flag 
    118    USE ldftra_oce , ONLY :  r_fact_lap     =>  r_fact_lap        !: enhanced zonal diffusivity coefficient 
    119118 
    120119   !* vertical diffusion * 
  • branches/UKMO/dev_r5518_v3.4_asm_nemovar_community/NEMOGCM/NEMO/TOP_SRC/trcdta.F90

    r6617 r6625  
    151151 
    152152 
    153    SUBROUTINE trc_dta( kt, sf_dta ) 
     153   SUBROUTINE trc_dta( kt, sf_dta, zrf_trfac ) 
    154154      !!---------------------------------------------------------------------- 
    155155      !!                   ***  ROUTINE trc_dta  *** 
     
    165165      INTEGER                     , INTENT(in   ) ::   kt     ! ocean time-step 
    166166      TYPE(FLD), DIMENSION(1)   , INTENT(inout) ::   sf_dta     ! array of information on the field to read 
     167      REAL(wp)                  , INTENT(in   ) ::   zrf_trfac  ! multiplication factor 
    167168      ! 
    168169      INTEGER ::   ji, jj, jk, jl, jkk, ik    ! dummy loop indices 
     
    233234         ENDIF 
    234235         ! 
     236         sf_dta(1)%fnow(:,:,:) = sf_dta(1)%fnow(:,:,:) * zrf_trfac   !  multiplicative factor 
     237         ! 
    235238         IF( lwp .AND. kt == nit000 ) THEN 
    236239               clndta = TRIM( sf_dta(1)%clvar )  
  • branches/UKMO/dev_r5518_v3.4_asm_nemovar_community/NEMOGCM/NEMO/TOP_SRC/trcini.F90

    r6617 r6625  
    6161      INTEGER ::   jk, jn, jl    ! dummy loop indices 
    6262      CHARACTER (len=25) :: charout 
     63      REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:,:) ::  ztrcdta   ! 4D  workspace 
    6364      !!--------------------------------------------------------------------- 
    6465      ! 
     
    120121        IF( ln_trcdta .AND. nb_trcdta > 0 ) THEN  ! Initialisation of tracer from a file that may also be used for damping 
    121122            ! 
     123            CALL wrk_alloc( jpi, jpj, jpk, ztrcdta )    ! Memory allocation 
     124            ! 
    122125            DO jn = 1, jptra 
    123126               IF( ln_trc_ini(jn) ) THEN      ! update passive tracers arrays with input data read from file 
    124127                  jl = n_trc_index(jn)  
    125                   CALL trc_dta( nit000, sf_trcdta(jl) )   ! read tracer data at nit000 
    126                   trn(:,:,:,jn) = sf_trcdta(jl)%fnow(:,:,:) * tmask(:,:,:) * rf_trfac(jl) 
    127                   ! 
     128                  CALL trc_dta( nit000, sf_trcdta(jl),rf_trfac(jl) )   ! read tracer data at nit000 
     129                  ztrcdta(:,:,:) = sf_trcdta(jl)%fnow(:,:,:) 
     130                  trn(:,:,:,jn) = ztrcdta(:,:,:) * tmask(:,:,:)   
    128131                  IF( .NOT.ln_trcdmp .AND. .NOT.ln_trcdmp_clo ) THEN      !== deallocate data structure   ==! 
    129132                     !                                                    (data used only for initialisation) 
     
    135138               ENDIF 
    136139            ENDDO 
    137             ! 
     140            CALL wrk_dealloc( jpi, jpj, jpk, ztrcdta ) 
    138141        ENDIF 
    139142        ! 
  • branches/UKMO/dev_r5518_v3.4_asm_nemovar_community/NEMOGCM/NEMO/TOP_SRC/trcnam.F90

    r6617 r6625  
    397397   !! Software governed by the CeCILL licence (NEMOGCM/NEMO_CeCILL.txt) 
    398398   !!====================================================================== 
    399 END MODULE trcnam 
     399END MODULE  trcnam 
  • branches/UKMO/dev_r5518_v3.4_asm_nemovar_community/NEMOGCM/NEMO/TOP_SRC/trcsms.F90

    r6617 r6625  
    7575 
    7676   !!====================================================================== 
    77 END MODULE trcsms 
     77END MODULE  trcsms 
  • branches/UKMO/dev_r5518_v3.4_asm_nemovar_community/NEMOGCM/NEMO/TOP_SRC/trcstp.F90

    r6617 r6625  
    3232   REAL(wp), DIMENSION(:,:,:), SAVE, ALLOCATABLE ::   qsr_arr ! save qsr during TOP time-step 
    3333   REAL(wp) :: rdt_sampl 
    34    INTEGER  :: nb_rec_per_day 
     34   INTEGER  :: nb_rec_per_days 
    3535   INTEGER  :: isecfst, iseclast 
    3636   LOGICAL  :: llnew 
     
    123123      !!               of diurnal cycle 
    124124      !! 
    125       !! ** Method  : store in TOP the qsr every hour ( or every time-step if the latter  
     125      !! ** Method  : store in TOP the qsr every hour ( or every time-step the latter  
    126126      !!              is greater than 1 hour ) and then, compute the  mean with  
    127127      !!              a moving average over 24 hours.  
     
    134134         IF( ln_cpl )  THEN   
    135135            rdt_sampl = 86400. / ncpl_qsr_freq 
    136             nb_rec_per_day = ncpl_qsr_freq 
     136            nb_rec_per_days = ncpl_qsr_freq 
    137137         ELSE   
    138138            rdt_sampl = MAX( 3600., rdt * nn_dttrc ) 
    139             nb_rec_per_day = INT( 86400 / rdt_sampl ) 
     139            nb_rec_per_days = INT( 86400 / rdt_sampl ) 
    140140         ENDIF 
    141141         ! 
    142142         IF( lwp ) THEN 
    143143            WRITE(numout,*)  
    144             WRITE(numout,*) ' Sampling frequency dt = ', rdt_sampl, 's','   Number of sampling per day  nrec = ', nb_rec_per_day 
     144            WRITE(numout,*) ' Sampling frequency dt = ', rdt_sampl, 's','   Number of sampling per day  nrec = ', nb_rec_per_days 
    145145            WRITE(numout,*)  
    146146         ENDIF 
    147147         ! 
    148          !                                            !* Restart: read in restart file 
    149          IF( ln_rsttr .AND. iom_varid( numrtr, 'qsr_mean', ldstop = .FALSE. ) > 0 ) THEN  
    150             IF(lwp) WRITE(numout,*) 'trc_qsr_mean:   qsr_mean read in the restart file' 
    151             CALL iom_get( numrtr, jpdom_autoglo, 'qsr_mean', qsr_mean )   !  A mean of qsr 
    152          ELSE                                         !* no restart: set from nit000 values 
    153             IF(lwp) WRITE(numout,*) 'trc_qsr_mean:   qsr_mean set to nit000 values' 
    154             qsr_mean(:,:) = qsr(:,:) 
    155          ENDIF 
    156          ! 
    157          ALLOCATE( qsr_arr(jpi,jpj,nb_rec_per_day ) ) 
    158          DO jn = 1, nb_rec_per_day 
    159              qsr_arr(:,:,jn) = qsr_mean(:,:) 
     148         ALLOCATE( qsr_arr(jpi,jpj,nb_rec_per_days ) ) 
     149         DO jn = 1, nb_rec_per_days 
     150            qsr_arr(:,:,jn) = qsr(:,:) 
    160151         ENDDO 
     152         qsr_mean(:,:) = qsr(:,:) 
    161153         ! 
    162154         isecfst  = nsec_year + nsec1jan000   !   number of seconds between Jan. 1st 00h of nit000 year and the middle of time step 
     
    171163             &                      ' time = ', (iseclast+rdt*nn_dttrc/2.)/3600.,'hours ' 
    172164          isecfst = iseclast 
    173           DO jn = 1, nb_rec_per_day - 1 
     165          DO jn = 1, nb_rec_per_days - 1 
    174166             qsr_arr(:,:,jn) = qsr_arr(:,:,jn+1) 
    175167          ENDDO 
    176           qsr_arr (:,:,nb_rec_per_day) = qsr(:,:) 
    177           qsr_mean(:,:                ) = SUM( qsr_arr(:,:,:), 3 ) / nb_rec_per_day 
     168          qsr_arr (:,:,nb_rec_per_days) = qsr(:,:) 
     169          qsr_mean(:,:                ) = SUM( qsr_arr(:,:,:), 3 ) / nb_rec_per_days 
    178170      ENDIF 
    179171      ! 
    180       IF( lrst_trc ) THEN    !* Write the mean of qsr in restart file  
    181          IF(lwp) WRITE(numout,*) 
    182          IF(lwp) WRITE(numout,*) 'trc_mean_qsr : write qsr_mean in restart file  kt =', kt 
    183          IF(lwp) WRITE(numout,*) '~~~~~~~' 
    184          CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrtw, 'qsr_mean', qsr_mean(:,:) ) 
    185       ENDIF 
    186      ! 
    187172   END SUBROUTINE trc_mean_qsr 
    188173 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.