New URL for NEMO forge!   http://forge.nemo-ocean.eu

Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
This present forge is now archived and remained online for history.
Changeset 7403 for branches/2016/dev_merge_2016/NEMOGCM/CONFIG/GYRE_PISCES/EXP00 – NEMO

Ignore:
Timestamp:
2016-11-30T17:56:53+01:00 (7 years ago)
Author:
timgraham
Message:

Merge dev_INGV_METO_merge_2016 into branch

Location:
branches/2016/dev_merge_2016/NEMOGCM/CONFIG/GYRE_PISCES/EXP00
Files:
2 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed

  • branches/2016/dev_merge_2016/NEMOGCM/CONFIG/GYRE_PISCES/EXP00/namelist_pisces_cfg

    r4147 r7403  
    11!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
    2 !! GYRE_PISCES: Configuration namelist used to overwrite SHARED/namelist_pisces_ref 
     2!! PISCES  (key_pisces) reference namelist (see below for key_pisces_reduced) 
     3!!              1  - air-sea exchange                         (nampisext) 
     4!!              2  - biological parameters                    (nampisbio) 
     5!!              3  - parameters for nutrient limitations      (nampislim)     
     6!!              4  - parameters for phytoplankton             (nampisprod,nampismort) 
     7!!              5  - parameters for zooplankton               (nampismes,nampiszoo) 
     8!!              6  - parameters for remineralization          (nampisrem) 
     9!!              7  - parameters for calcite chemistry         (nampiscal) 
     10!!              8  - parameters for inputs deposition         (nampissed) 
     11!!              11 - Damping                                  (nampisdmp) 
     12!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
     13!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
     14&nampismod     !  Model used  
     15!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
     16    ln_p4z = .false. 
     17    ln_p2z = .true. 
     18/ 
     19!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
     20&nampisext     !   air-sea exchange 
     21!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
     22/ 
     23!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
     24&nampisatm     !  Atmospheric prrssure  
     25!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
     26/ 
     27!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
     28&nampisbio     !   biological parameters 
     29!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
     30/ 
     31!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
     32&nampislim     !   parameters for nutrient limitations 
     33!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
     34/ 
     35!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
     36&nampisopt     !   parameters for optics 
     37!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
     38/  
     39!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
     40&nampisprod     !   parameters for phytoplankton growth 
     41!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
     42/ 
     43!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
     44&nampismort     !   parameters for phytoplankton sinks 
     45!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
     46/ 
     47!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
     48&nampismes     !   parameters for mesozooplankton 
     49!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
     50/ 
     51!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
     52&nampiszoo     !   parameters for microzooplankton 
     53!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
     54/ 
     55!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
     56&nampisfer     !   parameters for iron chemistry 
     57!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
     58/   
     59!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
     60&nampisrem     !   parameters for remineralization 
     61!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
     62/ 
     63!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
     64&nampiscal     !   parameters for Calcite chemistry 
     65!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
     66/ 
     67!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
     68&nampissbc     !   parameters for inputs deposition 
     69!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
     70/ 
     71!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
     72&nampisice      !  Prescribed sea ice tracers 
     73!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
     74/ 
     75!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
     76&nampisdmp     !  Damping  
     77!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
     78/ 
     79!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
     80&nampismass     !  Mass conservation 
     81!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
     82/ 
     83!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
     84!! PISCES reduced (key_pisces_reduced, ex LOBSTER) : namelists 
     85!!              1  - biological parameters for phytoplankton    (namlobphy) 
     86!!              2  - biological parameters for nutrients        (namlobnut) 
     87!!              3  - biological parameters for zooplankton      (namlobzoo)     
     88!!              4  - biological parameters for detritus         (namlobdet) 
     89!!              5  - biological parameters for DOM              (namlobdom) 
     90!!              6  - parameters from aphotic layers to sediment (namlobsed) 
     91!!              7  - general coefficients                       (namlobrat) 
     92!!              8  - optical parameters                         (namlobopt) 
     93!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
    394!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
    495&namlobphy     !   biological parameters for phytoplankton 
    … …  
    15106!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
    16107&namlobdet     !   biological parameters for detritus 
    17 !,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,        
     108!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
    18109/ 
    19110!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 

  • branches/2016/dev_merge_2016/NEMOGCM/CONFIG/GYRE_PISCES/EXP00/namelist_top_cfg

    r5836 r7403  
    11!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
    2 !! NEMO-TOP Configuration namelist for GYRE_PISCES configuration used to overwrite SHARED/namelist_top_ref 
     2!! NEMO/TOP1 :  Configuration namelist : used to overwrite defaults values defined in SHARED/namelist_top_ref 
     3!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
    34!----------------------------------------------------------------------- 
    45&namtrc_run     !   run information 
    56!----------------------------------------------------------------------- 
    6    nn_writetrc   =  60     !  time step frequency for sn_tracer outputs 
    77/ 
    88!----------------------------------------------------------------------- 
    99&namtrc     !   tracers definition 
    1010!----------------------------------------------------------------------- 
    11    ln_trcdta     =   .false.    !  Initialisation from data input file (T) or not (F) 
     11   jp_bgc        =  6 
    1212! 
    13 !                ! name  !     title of the field          !   units       ! initial data ! save   ! 
    14 !                !       !                                 !               ! from file    ! or not ! 
    15 !                !       !                                 !               ! or not       !        ! 
    16    sn_tracer(1)   = 'DET'   , 'Detritus                   ',  'mmole-N/m3' ,  .false.     ,  .false. 
    17    sn_tracer(2)   = 'ZOO'   , 'Zooplankton concentration  ',  'mmole-N/m3' ,  .false.     ,  .false. 
    18    sn_tracer(3)   = 'PHY'   , 'Phytoplankton concentration',  'mmole-N/m3' ,  .false.     ,  .false. 
    19    sn_tracer(4)   = 'NO3'   , 'Nitrate concentration      ',  'mmole-N/m3' ,  .false.     ,  .true. 
    20    sn_tracer(5)   = 'NH4'   , 'Ammonium concentration     ',  'mmole-N/m3' ,  .false.     ,  .false. 
    21    sn_tracer(6)   = 'DOM'   , 'Dissolved organic matter   ',  'mmole-N/m3' ,  .false.     ,  .false. 
     13   ln_pisces     =  .true. 
     14   ln_age        =  .false. 
     15   ln_cfc11      =  .false. 
     16   ln_cfc12      =  .false. 
     17   ln_c14        =  .false. 
     18   ln_my_trc     =  .false. 
     19! 
     20!                 !           !                             !               ! 
     21!                 !    name   !   title of the field        !   units       ! initial data from file or not ! 
     22!                 !           !                                             !                               ! 
     23   sn_tracer(1)   = 'DET'     , 'Detritus                   ',  'mmole-N/m3' ,  .false.     
     24   sn_tracer(2)   = 'ZOO'     , 'Zooplankton concentration  ',  'mmole-N/m3' ,  .false.    
     25   sn_tracer(3)   = 'PHY'     , 'Phytoplankton concentration',  'mmole-N/m3' ,  .false.   
     26   sn_tracer(4)   = 'NO3'     , 'Nitrate concentration      ',  'mmole-N/m3' ,  .false.  
     27   sn_tracer(5)   = 'NH4'     , 'Ammonium concentration     ',  'mmole-N/m3' ,  .false.    
     28   sn_tracer(6)   = 'DOM'     , 'Dissolved organic matter   ',  'mmole-N/m3' ,  .false.   
    2229/ 
    2330!----------------------------------------------------------------------- 
    24 &namtrc_adv    !   advection scheme for passive tracer  
    25 !-----------------------------------------------------------------------    
     31&namtrc_dta      !    Initialisation from data input file 
     32!----------------------------------------------------------------------- 
     33/ 
    2634   ln_trcadv_fct =  .true.   !  FCT scheme 
    27       nn_fct_h   =  2               !  =2/4, horizontal 2nd / 4th order  
    28       nn_fct_v   =  2               !  =2/4, vertical   2nd / COMPACT 4th order  
     35      nn_fct_h   =  2               !  =2/4, horizontal 2nd / 4th order 
     36      nn_fct_v   =  2               !  =2/4, vertical   2nd / COMPACT 4th order 
    2937      nn_fct_zts =  0               !  >=1,  2nd order FCT scheme with vertical sub-timestepping 
    3038      !                             !        (number of sub-timestep = nn_fct_zts) 
    3139/ 
    3240!----------------------------------------------------------------------- 
    33 &namtrc_ldf    !   lateral diffusion scheme for passive tracer  
     41&namtrc_ldf    !   lateral diffusion scheme for passive tracer 
    3442!----------------------------------------------------------------------- 
    3543   rn_ahtrc_0       =  1000.    !  horizontal eddy diffusivity for tracers [m2/s] 
    … …  
    4048/ 
    4149!----------------------------------------------------------------------- 
    42 &namtrc_rad        !  treatment of negative concentrations  
     50&namtrc_rad        !  treatment of negative concentrations 
    4351!----------------------------------------------------------------------- 
    4452   ln_trcrad   =  .false.  !  artificially correct negative concentrations (T) or not (F) 
    4553/ 
    4654!----------------------------------------------------------------------- 
    47 &namtrc_dia       !   parameters for passive tracer additional diagnostics 
     55&namtrc_dmp      !   passive tracer newtonian damping 
     56!----------------------------------------------------------------------- 
     57/ 
     58!----------------------------------------------------------------------- 
     59&namtrc_ice      !    Representation of sea ice growth & melt effects 
     60!----------------------------------------------------------------------- 
     61/ 
     62!----------------------------------------------------------------------- 
     63&namtrc_trd      !   diagnostics on tracer trends                       ('key_trdtrc') 
     64!                          or mixed-layer trends                        ('key_trdmld_trc') 
    4865!---------------------------------------------------------------------- 
    49    nn_writedia   =  60     !  time step frequency for diagnostics 
    5066/ 
    5167!---------------------------------------------------------------------- 
    52 &namtrc_bc        !   data for boundary conditions 
     68&namtrc_bc       !   data for boundary conditions 
    5369!----------------------------------------------------------------------- 
    5470/ 
     71!---------------------------------------------------------------------- 
     72&namtrc_bdy      !   Setup of tracer boundary conditions 
     73!----------------------------------------------------------------------- 
     74/ 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.