New URL for NEMO forge!   http://forge.nemo-ocean.eu

Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
This present forge is now archived and remained online for history.
Changeset 7646 for trunk/NEMOGCM/CONFIG/GYRE_BFM – NEMO

Ignore:
Timestamp:
2017-02-06T10:25:03+01:00 (7 years ago)
Author:
timgraham
Message:

Merge of dev_merge_2016 into trunk. UPDATE TO ARCHFILES NEEDED for XIOS2.
LIM_SRC_s/limrhg.F90 to follow in next commit due to change of kind (I'm unable to do it in this commit).
Merged using the following steps:

1) svn merge --reintegrate ​svn+ssh://forge.ipsl.jussieu.fr/ipsl/forge/projets/nemo/svn/trunk .
2) Resolve minor conflicts in sette.sh and namelist_cfg for ORCA2LIM3 (due to a change in trunk after branch was created)
3) svn commit
4) svn switch ​svn+ssh://forge.ipsl.jussieu.fr/ipsl/forge/projets/nemo/svn/trunk
5) svn merge ​svn+ssh://forge.ipsl.jussieu.fr/ipsl/forge/projets/nemo/svn/branches/2016/dev_merge_2016 .
6) At this stage I checked out a clean copy of the branch to compare against what is about to be committed to the trunk.
6) svn commit #Commit code to the trunk

In this commit I have also reverted a change to Fcheck_archfile.sh which was causing problems on the Paris machine.

Location:
trunk/NEMOGCM/CONFIG/GYRE_BFM/EXP00
Files:
2 deleted
2 edited
5 copied

Legend:

Unmodified
Added
Removed

  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/GYRE_BFM/EXP00/iodef.xml

    r5363 r7646  
    22<simulation>  
    33 
    4  <context id="nemo" time_origin="1900-01-01 00:00:00" > 
    5      
    6     <!-- $id$ --> 
    7      
    8     <!--  
    9 ============================================================================================================ 
    10 =                                  definition of all existing variables                                    = 
    11 =                                            DO NOT CHANGE                                                 = 
    12 ============================================================================================================ 
    13     --> 
    14     <field_definition src="./field_def.xml"/> 
    15     <!--  
    16 ============================================================================================================ 
    17 =                                           output files definition                                        = 
    18 =                                            Define your own files                                         = 
    19 =                                         put the variables you want...                                    = 
    20 ============================================================================================================ 
    21     --> 
    22      
    23     <file_definition type="multiple_file" name="@expname@_@freq@_@startdate@_@enddate@" sync_freq="10d" min_digits="4"> 
    24      
    25       <file_group id="1ts" output_freq="1ts"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1 time step files --> 
    26  
    27       <file_group id="1h" output_freq="1h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1h files --> 
    28       <file_group id="2h" output_freq="2h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 2h files --> 
    29       <file_group id="3h" output_freq="3h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 3h files -->      
    30       <file_group id="4h" output_freq="4h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 4h files --> 
    31       <file_group id="6h" output_freq="6h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 6h files --> 
    32       
    33       <file_group id="1d" output_freq="1d"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1d files --> 
    34       <file_group id="3d" output_freq="3d"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 3d files -->     
    35       <file_group id="5d" output_freq="5d"  output_level="10" enabled=".TRUE."/>  <!-- 5d files -->    
    36  
    37       <file_group id="1m" output_freq="1mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real monthly files --> 
    38       <file_group id="2m" output_freq="2mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 2m files --> 
    39       <file_group id="3m" output_freq="3mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 3m files --> 
    40       <file_group id="4m" output_freq="4mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 4m files --> 
    41       <file_group id="6m" output_freq="6mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 6m files --> 
    42  
    43       <file_group id="1y"  output_freq="1y" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real yearly files --> 
    44       <file_group id="2y"  output_freq="2y" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 2y files --> 
    45       <file_group id="5y"  output_freq="5y" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 5y files --> 
    46       <file_group id="10y" output_freq="10y" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 10y files --> 
    47  
    48    </file_definition> 
    49      
    50     <!--  
    51 ============================================================================================================ 
    52 = grid definition = = DO NOT CHANGE = 
    53 ============================================================================================================ 
    54     --> 
    55      
    56    <axis_definition>   
    57       <axis id="deptht"  long_name="Vertical T levels"  unit="m" positive="down" /> 
    58       <axis id="depthu"  long_name="Vertical U levels"  unit="m" positive="down" /> 
    59       <axis id="depthv"  long_name="Vertical V levels"  unit="m" positive="down" /> 
    60       <axis id="depthw"  long_name="Vertical W levels"  unit="m" positive="down" /> 
    61       <axis id="nfloat"  long_name="Float number"       unit="1"                 /> 
    62       <axis id="icbcla"  long_name="Iceberg class"      unit="1"                 /> 
    63       <axis id="ncatice" long_name="Ice category"       unit="1"                 /> 
    64       <axis id="iax_20C" long_name="20 degC isotherm"   unit="degC"              /> 
    65       <axis id="iax_28C" long_name="28 degC isotherm"   unit="degC"              /> 
    66    </axis_definition>  
    67      
    68    <domain_definition src="./domain_def.xml"/> 
    69     
    70    <grid_definition>     
    71      <grid id="grid_T_2D" domain_ref="grid_T"/> 
    72      <grid id="grid_T_3D" domain_ref="grid_T" axis_ref="deptht"/> 
    73      <grid id="grid_U_2D" domain_ref="grid_U"/> 
    74      <grid id="grid_U_3D" domain_ref="grid_U" axis_ref="depthu"/> 
    75      <grid id="grid_V_2D" domain_ref="grid_V"/> 
    76      <grid id="grid_V_3D" domain_ref="grid_V" axis_ref="depthv"/> 
    77      <grid id="grid_W_2D" domain_ref="grid_W"/> 
    78      <grid id="grid_W_3D" domain_ref="grid_W" axis_ref="depthw"/> 
    79     </grid_definition>     
    80    
    81   </context> 
    82    
     4<!-- ============================================================================================ --> 
     5<!-- XIOS context                                                                                 --> 
     6<!-- ============================================================================================ --> 
    837 
    848  <context id="xios"> 
    … …  
    8610      <variable_definition> 
    8711    
    88      <!--  
    89         We must have buffer_size > jpi*jpj*jpk*8 (with jpi and jpj the subdomain size) 
    90 --> 
    91      <variable id="buffer_size"               type="integer">10000000</variable> 
    92      <variable id="buffer_server_factor_size" type="integer">2</variable> 
    93      <variable id="info_level"                type="integer">0</variable> 
    94      <variable id="using_server"              type="boolean">false</variable> 
    95      <variable id="using_oasis"               type="boolean">false</variable> 
     12     <variable id="info_level"                type="int">0</variable> 
     13     <variable id="using_server"              type="bool">false</variable> 
     14     <variable id="using_oasis"               type="bool">false</variable> 
    9615     <variable id="oasis_codes_id"            type="string" >oceanx</variable> 
    9716    
    … …  
    9918                
    10019  </context> 
     20 
     21<!-- ============================================================================================ --> 
     22<!-- NEMO  CONTEXT add and suppress the components you need                                       --> 
     23<!-- ============================================================================================ --> 
     24 
     25  <context id="nemo" src="./context_nemo.xml"/>       <!--  NEMO       --> 
    10126   
    10227</simulation> 

  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/GYRE_BFM/EXP00/namelist_cfg

    r6489 r7646  
    2222&namcfg     !   parameters of the configuration    
    2323!----------------------------------------------------------------------- 
    24    cp_cfg      =  "gyre"                 !  name of the configuration 
    25    jp_cfg      =       1                 !  resolution of the configuration 
    26    jpidta      =      32                 !  1st lateral dimension ( >= jpi ) = 30*jp_cfg+2 
    27    jpjdta      =      22                 !  2nd    "         "    ( >= jpj ) = 20*jp_cfg+2  
    28    jpkdta      =      31                 !  number of levels      ( >= jpk ) 
    29    jpiglo      =      32                 !  1st dimension of global domain --> i  = jpidta 
    30    jpjglo      =      22                 !  2nd    -                  -    --> j  = jpjdta 
    31    jpizoom     =       1                 !  left bottom (i,j) indices of the zoom 
    32    jpjzoom     =       1                 !  in data domain indices 
    33    jperio      =       0                 !  lateral cond. type (between 0 and 6) 
    34 / 
    35 &namzgr        !   vertical coordinate 
    36 !----------------------------------------------------------------------- 
    37    ln_zco      = .true.    !  z-coordinate - full    steps 
    38    ln_linssh   = .true.   !  linear free surface 
    39 / 
    40 !----------------------------------------------------------------------- 
    41 &namzgr_sco    !   s-coordinate or hybrid z-s-coordinate 
    42 !----------------------------------------------------------------------- 
     24   ln_read_cfg = .false.   !  (=T) read the domain configuration file 
     25      !                    !  (=F) user defined configuration  ==>>>  see usrdef(_...) modules 
     26   ln_write_cfg= .false.   !  (=T) create the domain configuration file 
    4327/ 
    4428!----------------------------------------------------------------------- 
    4529&namdom        !   space and time domain (bathymetry, mesh, timestep) 
    4630!----------------------------------------------------------------------- 
    47    nn_bathy    =    0      !  compute (=0) or read (=1) the bathymetry file 
    48    rn_rdt      = 7200.     !  time step for the dynamics  
    49    jphgr_msh   =       5                 !  type of horizontal mesh 
    50    ppglam0     =       0.0               !  longitude of first raw and column T-point (jphgr_msh = 1) 
    51    ppgphi0     =      29.0               ! latitude  of first raw and column T-point (jphgr_msh = 1) 
    52    ppe1_deg    =  999999.0               !  zonal      grid-spacing (degrees) 
    53    ppe2_deg    =  999999.0               !  meridional grid-spacing (degrees) 
    54    ppe1_m      =  999999.0               !  zonal      grid-spacing (degrees) 
    55    ppe2_m      =  999999.0               !  meridional grid-spacing (degrees) 
    56    ppsur       =   -2033.194295283385    !  ORCA r4, r2 and r05 coefficients 
    57    ppa0        =     155.8325369664153   ! (default coefficients) 
    58    ppa1        =     146.3615918601890   ! 
    59    ppkth       =      17.28520372419791  ! 
    60    ppacr       =       5.0               ! 
    61    ppdzmin     =  999999.0               !  Minimum vertical spacing 
    62    pphmax      =  999999.0               !  Maximum depth 
    63    ldbletanh   =  .FALSE.                !  Use/do not use double tanf function for vertical coordinates 
    64    ppa2        =  999999.0               !  Double tanh function parameters 
    65    ppkth2      =  999999.0               ! 
    66    ppacr2      =  999999.0               ! 
     31   ln_linssh   = .true.    !  =T  linear free surface  ==>>  model level are fixed in time 
     32   ! 
     33   nn_msh      =    0      !  create (>0) a mesh file or not (=0) 
     34   ! 
     35   rn_rdt      = 7200.     !  time step for the dynamics (and tracer if nn_acc=0) 
    6736/ 
    6837!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    8554   nn_fsbc     = 1         !  frequency of surface boundary condition computation 
    8655                           !     (also = the frequency of sea-ice model call) 
    87    ln_ana      = .true.    !  analytical formulation                    (T => fill namsbc_ana ) 
    88    ln_blk_core = .false.   !  CORE bulk formulation                     (T => fill namsbc_core) 
     56   ln_usr      = .true.    !  user defined formulation                  (T => check usrdef_sbc) 
     57   ln_blk      = .false.   !  Bulk formulation                          (T => fill namsbc_blk ) 
    8958   nn_ice      = 0         !  =0 no ice boundary condition   , 
    9059   ln_rnf      = .false.   !  runoffs                                   (T => fill namsbc_rnf) 
    … …  
    9362/ 
    9463!----------------------------------------------------------------------- 
    95 &namsbc_ana    !   analytical surface boundary condition 
    96 !----------------------------------------------------------------------- 
    97    nn_tau000   =   100     !  gently increase the stress over the first ntau_rst time-steps 
    98    rn_utau0    =   0.1e0   !  uniform value for the i-stress 
    99 / 
    100 !----------------------------------------------------------------------- 
    101 &namsbc_flx    !   surface boundary condition : flux formulation 
    102 !----------------------------------------------------------------------- 
    103 / 
    104 !----------------------------------------------------------------------- 
    105 &namsbc_clio   !   namsbc_clio  CLIO bulk formulae 
    106 !----------------------------------------------------------------------- 
    107 / 
    108 !----------------------------------------------------------------------- 
    109 &namsbc_core   !   namsbc_core  CORE bulk formulae 
    110 !----------------------------------------------------------------------- 
    111 / 
    112 !----------------------------------------------------------------------- 
    113 &namsbc_mfs   !   namsbc_mfs  MFS bulk formulae 
    114 !----------------------------------------------------------------------- 
    115 / 
    116 !----------------------------------------------------------------------- 
    117 &namsbc_cpl    !   coupled ocean/atmosphere model                       ("key_oasis3") 
    118 !----------------------------------------------------------------------- 
    119 / 
    120 !----------------------------------------------------------------------- 
    12164&namtra_qsr    !   penetrative solar radiation 
    12265!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    159102/ 
    160103!----------------------------------------------------------------------- 
    161 &nam_tide      !    tide parameters (#ifdef key_tide) 
    162 !----------------------------------------------------------------------- 
    163 / 
    164 !----------------------------------------------------------------------- 
    165 &nambdy        !  unstructured open boundaries                          ("key_bdy") 
    166 !----------------------------------------------------------------------- 
    167 / 
    168 !----------------------------------------------------------------------- 
    169 &nambdy_dta      !  open boundaries - external data           ("key_bdy") 
     104&nam_tide      !    tide parameters 
     105!----------------------------------------------------------------------- 
     106/ 
     107!----------------------------------------------------------------------- 
     108&nambdy        !  unstructured open boundaries                           
     109!----------------------------------------------------------------------- 
     110/ 
     111!----------------------------------------------------------------------- 
     112&nambdy_dta      !  open boundaries - external data            
    170113!----------------------------------------------------------------------- 
    171114/ 
    … …  
    191134!----------------------------------------------------------------------- 
    192135   ln_eos80    = .true.         !  = Use EOS80 equation of state 
    193    !                             ! 
    194    !                      ! S-EOS coefficients : 
    195    !                             !  rd(T,S,Z)*rau0 = -a0*(1+.5*lambda*dT+mu*Z+nu*dS)*dT+b0*dS 
    196    rn_a0       =  1.6550e-1      !  thermal expension coefficient (nn_eos= 1) 
    197    rn_b0       =  7.6554e-1      !  saline  expension coefficient (nn_eos= 1) 
    198    rn_lambda1  =  5.9520e-2      !  cabbeling coeff in T^2  (=0 for linear eos) 
    199    rn_lambda2  =  7.4914e-4      !  cabbeling coeff in S^2  (=0 for linear eos) 
    200    rn_mu1      =  1.4970e-4      !  thermobaric coeff. in T (=0 for linear eos) 
    201    rn_mu2      =  1.1090e-5      !  thermobaric coeff. in S (=0 for linear eos) 
    202    rn_nu       =  2.4341e-3      !  cabbeling coeff in T*S  (=0 for linear eos) 
    203 !!org GYRE   rn_alpha    =   2.0e-4  !  thermal expension coefficient (nn_eos= 1 or 2) 
    204 !!org GYRE   rn_beta     =   7.7e-4  !  saline  expension coefficient (nn_eos= 2) 
    205 !!org  caution  now a0 = alpha / rau0   with rau0 = 1026 
    206136/ 
    207137!----------------------------------------------------------------------- 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.