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Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
This present forge is now archived and remained online for history.
Changeset 7646 for trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM – NEMO

Ignore:
Timestamp:
2017-02-06T10:25:03+01:00 (7 years ago)
Author:
timgraham
Message:

Merge of dev_merge_2016 into trunk. UPDATE TO ARCHFILES NEEDED for XIOS2.
LIM_SRC_s/limrhg.F90 to follow in next commit due to change of kind (I'm unable to do it in this commit).
Merged using the following steps:

1) svn merge --reintegrate ​svn+ssh://forge.ipsl.jussieu.fr/ipsl/forge/projets/nemo/svn/trunk .
2) Resolve minor conflicts in sette.sh and namelist_cfg for ORCA2LIM3 (due to a change in trunk after branch was created)
3) svn commit
4) svn switch ​svn+ssh://forge.ipsl.jussieu.fr/ipsl/forge/projets/nemo/svn/trunk
5) svn merge ​svn+ssh://forge.ipsl.jussieu.fr/ipsl/forge/projets/nemo/svn/branches/2016/dev_merge_2016 .
6) At this stage I checked out a clean copy of the branch to compare against what is about to be committed to the trunk.
6) svn commit #Commit code to the trunk

In this commit I have also reverted a change to Fcheck_archfile.sh which was causing problems on the Paris machine.

Location:
trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/EXP00
Files:
2 deleted
7 edited
5 copied

Legend:

Unmodified
Added
Removed

  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/EXP00/1_namelist_cfg

    r6489 r7646  
    44!----------------------------------------------------------------------- 
    55&namrun        !   parameters of the run 
    6  nn_it000=1 
    76!----------------------------------------------------------------------- 
    87   cn_exp      = "Agulhas" !  experience name  
    9    nn_itend    =   10950 
     8   nn_it000    =       1   !  first time step 
     9   nn_itend    =   10950   !  last  time step 
    1010   nn_stock    =   10950   !  frequency of creation of a restart file (modulo referenced to 1) 
    1111   nn_write    =   10950   !  frequency of write in the output file   (modulo referenced to nn_it000) 
    12    ln_clobber  =  .true. 
     12   ln_clobber  = .true.    !  clobber (overwrite) an existing file 
    1313/ 
    1414!----------------------------------------------------------------------- 
    1515&namcfg        !   parameters of the configuration 
    1616!----------------------------------------------------------------------- 
    17    cp_cfg      =  "default"             !  name of the configuration 
    18    jp_cfg      =      -1               !  resolution of the configuration 
    19    jpidta      =     182               !  1st lateral dimension ( >= jpi ) 
    20    jpjdta      =     149               !  2nd    "         "    ( >= jpj ) 
    21    jpkdta      =      31               !  number of levels      ( >= jpk ) 
    22    jpiglo      =     182               !  1st dimension of global domain --> i =jpidta 
    23    jpjglo      =     149               !  2nd    -                  -    --> j  =jpjdta 
    24    jpizoom     =       1               !  left bottom (i,j) indices of the zoom 
    25    jpjzoom     =       1               !  in data domain indices 
    26    jperio      =       0               !  lateral cond. type (between 0 and 6) 
     17   ln_read_cfg = .true.    !  (=T) read the domain configuration file 
     18      !                    !  (=F) user defined configuration  ==>>>  see usrdef(_...) modules 
     19      cn_domcfg = "AGRIF_AGULHAS_domain_cfg"    ! domain configuration filename 
    2720/ 
    2821!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    3023!----------------------------------------------------------------------- 
    3124   ln_zps      = .true.    !  z-coordinate - partial steps 
    32    ln_linssh   = .true.    !  linear free surface 
    3325/ 
    3426!----------------------------------------------------------------------- 
    3527&namdom        !   space and time domain (bathymetry, mesh, timestep) 
    3628!-----------------------------------------------------------------------   
    37    jphgr_msh   =       0               !  type of horizontal mesh 
    38    ppglam0     =  999999.0             !  longitude of first raw and column T-point (jphgr_msh = 1) 
    39    ppgphi0     =  999999.0             ! latitude  of first raw and column T-point (jphgr_msh = 1) 
    40    ppe1_deg    =  999999.0             !  zonal      grid-spacing (degrees) 
    41    ppe2_deg    =  999999.0             !  meridional grid-spacing (degrees) 
    42    ppe1_m      =  999999.0             !  zonal      grid-spacing (degrees) 
    43    ppe2_m      =  999999.0             !  meridional grid-spacing (degrees) 
    44    ppsur       =   -4762.96143546300   !  ORCA r4, r2 and r05 coefficients 
    45    ppa0        =     255.58049070440   ! (default coefficients) 
    46    ppa1        =     245.58132232490   ! 
    47    ppkth       =      21.43336197938   ! 
    48    ppacr       =       3.0             ! 
    49    ppdzmin     =  999999.              !  Minimum vertical spacing 
    50    pphmax      =  999999.              !  Maximum depth 
    51    ldbletanh   =  .FALSE.              !  Use/do not use double tanf function for vertical coordinates 
    52    ppa2        =  999999.              !  Double tanh function parameters 
    53    ppkth2      =  999999.              ! 
    54    ppacr2      =  999999.              ! 
     29   ln_linssh   = .true.   !  =T  linear free surface  ==>>  model level are fixed in time 
     30   nn_closea   =    0      !  remove (=0) or keep (=1) closed seas and lakes (ORCA) 
     31   ! 
    5532   rn_rdt      = 2880.     !  time step for the dynamics (and tracer if nn_acc=0) 
    5633/ 
    … …  
    6744&namsbc        !   Surface Boundary Condition (surface module) 
    6845!----------------------------------------------------------------------- 
     46   ln_blk      = .true.    !  CORE bulk formulation                     (T => fill namsbc_core) 
    6947   nn_ice      = 0         !  =0 no ice boundary condition   , 
    7048                           !  =1 use observed ice-cover      , 
    … …  
    7856/ 
    7957!----------------------------------------------------------------------- 
    80 &namsbc_core   !   namsbc_core  CORE bulk formulae 
    81 !----------------------------------------------------------------------- 
    82 !              !  file name                    ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights                               ! rotation ! land/sea mask ! 
    83 !              !                               !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename                              ! pairing  ! filename      ! 
    84    sn_wndi     = 'u_10.15JUNE2009_fill'        ,         6         , 'U_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core2_agrif_bicubic.nc'      , 'Uwnd'   , '' 
    85    sn_wndj     = 'v_10.15JUNE2009_fill'        ,         6         , 'V_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core2_agrif_bicubic.nc'      , 'Vwnd'   , '' 
    86    sn_qsr      = 'ncar_rad.15JUNE2009_fill'    ,        24         , 'SWDN_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core2_agrif_bilinear.nc'     , ''       , '' 
    87    sn_qlw      = 'ncar_rad.15JUNE2009_fill'    ,        24         , 'LWDN_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core2_agrif_bilinear.nc'     , ''       , '' 
    88    sn_tair     = 't_10.15JUNE2009_fill'        ,         6         , 'T_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core2_agrif_bilinear.nc'     , ''       , '' 
    89    sn_humi     = 'q_10.15JUNE2009_fill'        ,         6         , 'Q_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core2_agrif_bilinear.nc'     , ''       , '' 
    90    sn_prec     = 'ncar_precip.15JUNE2009_fill' ,        -1         , 'PRC_MOD1',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core2_agrif_bilinear.nc'     , ''       , '' 
    91    sn_snow     = 'ncar_precip.15JUNE2009_fill' ,        -1         , 'SNOW'    ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core2_agrif_bilinear.nc'     , ''       , '' 
    92    sn_tdif     = 'taudif_core'                 ,        24         , 'taudif'  ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core2_agrif_bilinear.nc'     , ''       , '' 
    93  
    94    cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the bulk files 
    95    ln_taudif   = .false.   !  HF tau contribution: use "mean of stress module - module of the mean stress" data 
    96    rn_zqt      = 10.        !  Air temperature and humidity reference height (m) 
    97    rn_zu       = 10.        !  Wind vector reference height (m) 
    98    rn_pfac     = 1.        !  multiplicative factor for precipitation (total & snow) 
    99    rn_efac     = 1.        !  multiplicative factor for evaporation (0. or 1.) 
    100    rn_vfac     = 0.        !  multiplicative factor for ocean/ice velocity 
    101                            !  in the calculation of the wind stress (0.=absolute winds or 1.=relative winds) 
     58&namsbc_blk   !   namsbc_blk  generic Bulk formula                      (ln_blk = T) 
     59!----------------------------------------------------------------------- 
     60!              !  file name                   ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights                              ! rotation ! land/sea mask ! 
     61!              !                              !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename                             ! pairing  ! filename      ! 
     62   sn_wndi     = 'u_10.15JUNE2009_fill'       ,         6         , 'U_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core2_agrif_bicubic.nc'     , 'Uwnd'   , '' 
     63   sn_wndj     = 'v_10.15JUNE2009_fill'       ,         6         , 'V_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core2_agrif_bicubic.nc'     , 'Vwnd'   , '' 
     64   sn_qsr      = 'ncar_rad.15JUNE2009_fill'   ,        24         , 'SWDN_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core2_agrif_bilinear.nc'    , ''       , '' 
     65   sn_qlw      = 'ncar_rad.15JUNE2009_fill'   ,        24         , 'LWDN_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core2_agrif_bilinear.nc'    , ''       , '' 
     66   sn_tair     = 't_10.15JUNE2009_fill'       ,         6         , 'T_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core2_agrif_bilinear.nc'    , ''       , '' 
     67   sn_humi     = 'q_10.15JUNE2009_fill'       ,         6         , 'Q_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core2_agrif_bilinear.nc'    , ''       , '' 
     68   sn_prec     = 'ncar_precip.15JUNE2009_fill',        -1         , 'PRC_MOD1',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core2_agrif_bilinear.nc'    , ''       , '' 
     69   sn_snow     = 'ncar_precip.15JUNE2009_fill',        -1         , 'SNOW'    ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core2_agrif_bilinear.nc'    , ''       , '' 
     70   sn_slp      = 'slp.15JUNE2009_fill'        ,         6         , 'SLP'     ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core2_agrif_bilinear.nc'    , ''       , '' 
     71   sn_tdif     = 'taudif_core'                ,        24         , 'taudif'  ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core2_agrif_bilinear.nc'    , ''       , '' 
     72   ! 
     73   ln_NCAR     = .true.   ! "NCAR"      algorithm   (Large and Yeager 2008) 
     74   ! 
    10275/ 
    10376!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    195168   ln_dynvor_mix = .false. !  mixed scheme 
    196169   ln_dynvor_een = .true.  !  energy & enstrophy scheme 
    197       nn_een_e3f = 1             !  e3f = masked averaging of e3t divided by 4 (=0) or by the sum of mask (=1) 
     170      nn_een_e3f = 0             !  e3f = masked averaging of e3t divided by 4 (=0) or by the sum of mask (=1) 
    198171/ 
    199172!----------------------------------------------------------------------- 

  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/EXP00/iodef.xml

    r5656 r7646  
    11<?xml version="1.0"?> 
    2 <simulation>  
     2<simulation> 
    33 
    4  <context id="nemo" time_origin="1950-01-01 00:00:00" > 
    5      
    6     <!-- $id$ --> 
    7      
    8     <!--  
    9 ============================================================================================================ 
    10 =                                  definition of all existing variables                                    = 
    11 =                                            DO NOT CHANGE                                                 = 
    12 ============================================================================================================ 
    13     --> 
    14     <field_definition src="./field_def.xml"/> 
    15     <!--  
    16 ============================================================================================================ 
    17 =                                           output files definition                                        = 
    18 =                                            Define your own files                                         = 
    19 =                                         put the variables you want...                                    = 
    20 ============================================================================================================ 
    21     --> 
    22      
    23     <file_definition type="multiple_file" name="@expname@_@freq@_@startdate@_@enddate@" sync_freq="10d" min_digits="4"> 
    24      
    25       <file_group id="1ts" output_freq="1ts"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1 time step files --> 
    26       <file_group id="1h" output_freq="1h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1h files --> 
    27       <file_group id="2h" output_freq="2h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 2h files --> 
    28       <file_group id="3h" output_freq="3h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 3h files -->      
    29       <file_group id="4h" output_freq="4h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 4h files --> 
    30       <file_group id="6h" output_freq="6h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 6h files -->      
    31       <file_group id="1d" output_freq="1d"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1d files --> 
    32       <file_group id="3d" output_freq="3d"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 3d files -->     
     4<!-- ============================================================================================ --> 
     5<!-- XIOS context                                                                                 --> 
     6<!-- ============================================================================================ --> 
    337 
    34       <file_group id="5d" output_freq="5d"  output_level="10" enabled=".TRUE." >  <!-- 5d files -->   
    35   
    36    <file id="file1" name_suffix="_grid_T" description="ocean T grid variables" > 
    37      <field field_ref="e3t"                          /> 
    38      <field field_ref="toce"         name="thetao"                                                                      operation="instant" freq_op="5d" > @toce_e3t / @e3t </field> 
    39      <field field_ref="soce"         name="so"                                                                          operation="instant" freq_op="5d" > @soce_e3t / @e3t </field> 
    40      <field field_ref="sst"          name="tos"      /> 
    41      <field field_ref="sss"          name="sos"      /> 
    42      <field field_ref="ssh"          name="zos"      /> 
    43      <field field_ref="sst"          name="tosstd"       long_name="sea surface temperature standard deviation"         operation="instant" freq_op="5d" > sqrt( @sst2 - @sst * @sst ) </field> 
    44      <field field_ref="ssh"          name="zosstd"       long_name="sea surface height above geoid standard deviation"  operation="instant" freq_op="5d" > sqrt( @ssh2 - @ssh * @ssh ) </field> 
    45      <field field_ref="sst"          name="sstdcy"       long_name="amplitude of sst diurnal cycle"                     operation="average" freq_op="1d" > @sstmax - @sstmin </field> 
    46      <field field_ref="mldkz5"                       /> 
    47      <field field_ref="mldr10_1"                     /> 
    48      <field field_ref="mldr10_1"     name="mldr10_1dcy"  long_name="amplitude of mldr10_1 diurnal cycle"                operation="average" freq_op="1d" > @mldr10_1max - @mldr10_1min </field> 
    49      <field field_ref="empmr"        name="wfo"      /> 
    50      <field field_ref="qsr"          name="rsntds"   /> 
    51      <field field_ref="qt"           name="tohfls"   /> 
    52      <field field_ref="saltflx"      name="sosflxdo" /> 
    53      <field field_ref="taum"                         /> 
    54      <field field_ref="wspd"         name="sowindsp" /> 
    55       <field field_ref="precip"       name="soprecip" /> 
    56      <field field_ref="sbt"                          /> 
    57    </file> 
     8  <context id="xios" > 
    589 
    59    <file id="file3" name_suffix="_grid_U" description="ocean U grid variables" > 
    60      <field field_ref="e3u"                       /> 
    61      <field field_ref="ssu"          name="uos"   /> 
    62      <field field_ref="uoce"         name="uo"      operation="instant" freq_op="5d" > @uoce_e3u / @e3u </field> 
    63      <field field_ref="utau"         name="tauuo" /> 
    64    </file> 
    65     
    66    <file id="file4" name_suffix="_grid_V" description="ocean V grid variables" > 
    67      <field field_ref="e3v"                       /> 
    68      <field field_ref="ssv"          name="vos"   /> 
    69      <field field_ref="voce"         name="vo"      operation="instant" freq_op="5d" > @voce_e3v / @e3v </field> 
    70      <field field_ref="vtau"         name="tauvo" /> 
    71    </file> 
    72     
    73    <file id="file5" name_suffix="_grid_W" description="ocean W grid variables" > 
    74      <field field_ref="e3w"                        /> 
    75      <field field_ref="woce"         name="wo"     /> 
    76      <field field_ref="avt"          name="difvho" /> 
    77    </file> 
     10      <variable_definition> 
    7811 
    79    <file id="file6" name_suffix="_icemod" description="ice variables" > 
    80      <field field_ref="ice_pres"   /> 
    81      <field field_ref="snowthic_cea" name="snd" /> 
    82      <field field_ref="icethic_cea"  name="sit" /> 
    83      <field field_ref="iceprod_cea"  name="sip" /> 
    84      <field field_ref="ist_ipa"    /> 
    85      <field field_ref="uice_ipa"   /> 
    86      <field field_ref="vice_ipa"   /> 
    87      <field field_ref="utau_ice"   /> 
    88      <field field_ref="vtau_ice"   /> 
    89      <field field_ref="qsr_io_cea" /> 
    90      <field field_ref="qns_io_cea" /> 
    91      <field field_ref="snowpre"    /> 
    92    </file> 
     12          <variable id="info_level"                type="int">10</variable> 
     13          <variable id="using_server"              type="bool">true</variable> 
     14          <variable id="using_oasis"               type="bool">false</variable> 
     15          <variable id="oasis_codes_id"            type="string" >oceanx</variable> 
    9316 
    94    <!-- 
    95    <file id="file8" name_suffix="_Tides" description="tidal harmonics" > 
    96      <field field_ref="M2x"          name="M2x"      long_name="M2 Elevation harmonic real part"                       /> 
    97      <field field_ref="M2y"          name="M2y"      long_name="M2 Elevation harmonic imaginary part"                  /> 
    98      <field field_ref="M2x_u"        name="M2x_u"    long_name="M2 current barotrope along i-axis harmonic real part "       /> 
    99      <field field_ref="M2y_u"        name="M2y_u"    long_name="M2 current barotrope along i-axis harmonic imaginary part "  /> 
    100      <field field_ref="M2x_v"        name="M2x_v"    long_name="M2 current barotrope along j-axis harmonic real part "       /> 
    101      <field field_ref="M2y_v"        name="M2y_v"    long_name="M2 current barotrope along j-axis harmonic imaginary part "  /> 
    102    </file> 
    103    --> 
    104  
    105       </file_group> 
    106  
    107       <file_group id="1m" output_freq="1mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real monthly files --> 
    108       <file_group id="2m" output_freq="2mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 2m files --> 
    109       <file_group id="3m" output_freq="3mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 3m files --> 
    110       <file_group id="4m" output_freq="4mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 4m files --> 
    111       <file_group id="6m" output_freq="6mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 6m files --> 
    112  
    113       <file_group id="1y"  output_freq="1y" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real yearly files --> 
    114       <file_group id="2y"  output_freq="2y" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 2y files --> 
    115       <file_group id="5y"  output_freq="5y" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 5y files --> 
    116       <file_group id="10y" output_freq="10y" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 10y files --> 
    117  
    118    </file_definition> 
    119      
    120     <!--  
    121 ============================================================================================================ 
    122 = grid definition = = DO NOT CHANGE = 
    123 ============================================================================================================ 
    124     --> 
    125      
    126    <axis_definition>   
    127       <axis id="deptht"  long_name="Vertical T levels"  unit="m" positive="down" /> 
    128       <axis id="depthu"  long_name="Vertical U levels"  unit="m" positive="down" /> 
    129       <axis id="depthv"  long_name="Vertical V levels"  unit="m" positive="down" /> 
    130       <axis id="depthw"  long_name="Vertical W levels"  unit="m" positive="down" /> 
    131       <axis id="nfloat"  long_name="Float number"       unit="1"                 /> 
    132       <axis id="icbcla"  long_name="Iceberg class"      unit="1"                 /> 
    133       <axis id="ncatice" long_name="Ice category"       unit="1"                 /> 
    134       <axis id="iax_20C" long_name="20 degC isotherm"   unit="degC"              /> 
    135       <axis id="iax_28C" long_name="28 degC isotherm"   unit="degC"              /> 
    136    </axis_definition>  
    137     
    138    <domain_definition src="./domain_def.xml"/> 
    139     
    140    <grid_definition>     
    141      <grid id="grid_T_2D" domain_ref="grid_T"/> 
    142      <grid id="grid_T_3D" domain_ref="grid_T" axis_ref="deptht"/> 
    143      <grid id="grid_U_2D" domain_ref="grid_U"/> 
    144      <grid id="grid_U_3D" domain_ref="grid_U" axis_ref="depthu"/> 
    145      <grid id="grid_V_2D" domain_ref="grid_V"/> 
    146      <grid id="grid_V_3D" domain_ref="grid_V" axis_ref="depthv"/> 
    147      <grid id="grid_W_2D" domain_ref="grid_W"/> 
    148      <grid id="grid_W_3D" domain_ref="grid_W" axis_ref="depthw"/> 
    149      <grid id="gznl_T_2D" domain_ref="gznl"/> 
    150      <grid id="gznl_T_3D" domain_ref="gznl" axis_ref="deptht"/> 
    151      <grid id="gznl_W_3D" domain_ref="gznl" axis_ref="depthw"/> 
    152     </grid_definition>    
    153   </context> 
    154    
    155  <context id="1_nemo" time_origin="1950-01-01 00:00:00" > 
    156      
    157     <!-- $id$ --> 
    158      
    159     <!--  
    160 ============================================================================================================ 
    161 =                                  definition of all existing variables                                    = 
    162 =                                            DO NOT CHANGE                                                 = 
    163 ============================================================================================================ 
    164     --> 
    165     <field_definition src="./field_def.xml"/> 
    166     <!--  
    167 ============================================================================================================ 
    168 =                                           output files definition                                        = 
    169 =                                            Define your own files                                         = 
    170 =                                         put the variables you want...                                    = 
    171 ============================================================================================================ 
    172     --> 
    173      
    174     <file_definition type="multiple_file" name="@expname@_@freq@_@startdate@_@enddate@" sync_freq="10d" min_digits="4"> 
    175      
    176       <file_group id="1ts" output_freq="1ts"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1 time step files --> 
    177       <file_group id="1h" output_freq="1h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1h files --> 
    178       <file_group id="2h" output_freq="2h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 2h files --> 
    179       <file_group id="3h" output_freq="3h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 3h files -->      
    180       <file_group id="4h" output_freq="4h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 4h files --> 
    181       <file_group id="6h" output_freq="6h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 6h files -->      
    182       <file_group id="1d" output_freq="1d"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1d files --> 
    183       <file_group id="3d" output_freq="3d"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 3d files -->     
    184  
    185       <file_group id="5d" output_freq="5d"  output_level="10" enabled=".TRUE." >  <!-- 5d files -->   
    186   
    187    <file id="file1" name_suffix="_grid_T" description="ocean T grid variables" > 
    188      <field field_ref="sst"          name="tos"      long_name="sea_surface_temperature"                       /> 
    189      <field field_ref="sss"          name="sos"      long_name="sea_surface_salinity"                          /> 
    190      <field field_ref="ssh"          name="zos"      long_name="sea_surface_height_above_geoid"                /> 
    191      <field field_ref="toce"         name="thetao"   long_name="sea_water_potential_temperature"               /> 
    192      <field field_ref="soce"         name="so"       long_name="sea_water_salinity"                            /> 
    193      <field field_ref="sst2"         name="tossq"    long_name="square_of_sea_surface_temperature"             /> 
    194      <field field_ref="ssh2"         name="zossq"    long_name="square_of_sea_surface_height_above_geoid"      /> 
    195      <field field_ref="mldkz5"       /> 
    196      <field field_ref="mldr10_1"     /> 
    197      <field field_ref="empmr"        name="wfo"      long_name="water_flux_into_sea_water"                     /> 
    198      <field field_ref="qsr"          name="rsntds"   long_name="surface_net_downward_shortwave_flux"           /> 
    199      <field field_ref="qt"           name="tohfls"   long_name="surface_net_downward_total_heat_flux"          /> 
    200      <field field_ref="saltflx"      name="sosflxdo"  /> 
    201      <field field_ref="taum"         name="taum" /> 
    202      <field field_ref="wspd"         name="sowindsp"  /> 
    203           <field field_ref="precip"       name="soprecip" /> 
    204    </file> 
    205  
    206    <file id="file3" name_suffix="_grid_U" description="ocean U grid variables" > 
    207      <field field_ref="ssu"          name="uos"     long_name="sea_surface_x_velocity"    /> 
    208      <field field_ref="uoce"         name="uo"      long_name="sea_water_x_velocity"      /> 
    209      <field field_ref="utau"         name="tauuo"   long_name="surface_downward_x_stress" /> 
    210           <!-- variables available with MLE 
    211           <field field_ref="psiu_mle"     name="psiu_mle"  long_name="MLE_streamfunction_along_i-axis" /> 
    212      --> 
    213    </file> 
    214     
    215    <file id="file4" name_suffix="_grid_V" description="ocean V grid variables" > 
    216      <field field_ref="ssv"          name="vos"     long_name="sea_surface_y_velocity"    /> 
    217      <field field_ref="voce"         name="vo"      long_name="sea_water_y_velocity"      /> 
    218      <field field_ref="vtau"         name="tauvo"   long_name="surface_downward_y_stress" /> 
    219           <!-- variables available with MLE 
    220           <field field_ref="psiv_mle"     name="psiv_mle"  long_name="MLE_streamfunction_along_j-axis" /> 
    221      --> 
    222    </file> 
    223     
    224    <file id="file5" name_suffix="_grid_W" description="ocean W grid variables" > 
    225      <field field_ref="woce"         name="wo"      long_name="ocean vertical velocity"         /> 
    226      <field field_ref="avt"          name="difvho"  long_name="ocean_vertical_heat_diffusivity" /> 
    227    </file> 
    228 <!-- 
    229    <file id="file6" name_suffix="_icemod" description="ice variables" > 
    230      <field field_ref="ice_pres"                     /> 
    231      <field field_ref="snowthic_cea" name="snd"     long_name="surface_snow_thickness"   /> 
    232      <field field_ref="icethic_cea"  name="sit"     long_name="sea_ice_thickness"        /> 
    233      <field field_ref="iceprod_cea"  name="sip"     long_name="sea_ice_thickness"        /> 
    234      <field field_ref="ist_ipa"      /> 
    235      <field field_ref="uice_ipa"     /> 
    236      <field field_ref="vice_ipa"     /> 
    237      <field field_ref="utau_ice"     /> 
    238      <field field_ref="vtau_ice"     /> 
    239      <field field_ref="qsr_io_cea"   /> 
    240      <field field_ref="qns_io_cea"   /> 
    241      <field field_ref="snowpre"      /> 
    242    </file> 
    243  
    244    <file id="file8" name_suffix="_Tides" description="tidal harmonics" > 
    245      <field field_ref="M2x"          name="M2x"      long_name="M2 Elevation harmonic real part"                       /> 
    246      <field field_ref="M2y"          name="M2y"      long_name="M2 Elevation harmonic imaginary part"                  /> 
    247      <field field_ref="M2x_u"        name="M2x_u"    long_name="M2 current barotrope along i-axis harmonic real part "       /> 
    248      <field field_ref="M2y_u"        name="M2y_u"    long_name="M2 current barotrope along i-axis harmonic imaginary part "  /> 
    249      <field field_ref="M2x_v"        name="M2x_v"    long_name="M2 current barotrope along j-axis harmonic real part "       /> 
    250      <field field_ref="M2y_v"        name="M2y_v"    long_name="M2 current barotrope along j-axis harmonic imaginary part "  /> 
    251    </file> 
    252    --> 
    253       </file_group> 
    254  
    255  
    256       <file_group id="1m" output_freq="1mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real monthly files --> 
    257  
    258  
    259       <file_group id="2m" output_freq="2mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 2m files --> 
    260       <file_group id="3m" output_freq="3mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 3m files --> 
    261       <file_group id="4m" output_freq="4mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 4m files --> 
    262       <file_group id="6m" output_freq="6mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 6m files --> 
    263  
    264       <file_group id="1y"  output_freq="1y" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real yearly files --> 
    265       <file_group id="2y"  output_freq="2y" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 2y files --> 
    266       <file_group id="5y"  output_freq="5y" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 5y files --> 
    267       <file_group id="10y" output_freq="10y" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 10y files --> 
    268  
    269    </file_definition> 
    270      
    271     <!--  
    272 ============================================================================================================ 
    273 = grid definition = = DO NOT CHANGE = 
    274 ============================================================================================================ 
    275     --> 
    276      
    277    <axis_definition>   
    278       <axis id="deptht" long_name="Vertical T levels" unit="m" positive="down" /> 
    279       <axis id="depthu" long_name="Vertical U levels" unit="m" positive="down" /> 
    280       <axis id="depthv" long_name="Vertical V levels" unit="m" positive="down" /> 
    281       <axis id="depthw" long_name="Vertical W levels" unit="m" positive="down" /> 
    282       <axis id="nfloat" long_name="Float number"      unit="-"  /> 
    283       <axis id="icbcla" long_name="Iceberg class"     unit="-"  /> 
    284    </axis_definition>  
    285      
    286    <domain_definition src="./domain_def.xml"/> 
    287     
    288    <grid_definition>     
    289      <grid id="grid_T_2D" domain_ref="grid_T"/> 
    290      <grid id="grid_T_3D" domain_ref="grid_T" axis_ref="deptht"/> 
    291      <grid id="grid_U_2D" domain_ref="grid_U"/> 
    292      <grid id="grid_U_3D" domain_ref="grid_U" axis_ref="depthu"/> 
    293      <grid id="grid_V_2D" domain_ref="grid_V"/> 
    294      <grid id="grid_V_3D" domain_ref="grid_V" axis_ref="depthv"/> 
    295      <grid id="grid_W_2D" domain_ref="grid_W"/> 
    296      <grid id="grid_W_3D" domain_ref="grid_W" axis_ref="depthw"/> 
    297     </grid_definition>    
     17      </variable_definition> 
    29818  </context> 
    29919 
    300   <context id="xios"> 
     20<!-- ============================================================================================ --> 
     21<!-- NEMO  CONTEXT add and suppress the components you need                                       --> 
     22<!-- ============================================================================================ --> 
    30123 
    302       <variable_definition> 
    303     
    304      <!--  
    305         We must have buffer_size > jpi*jpj*jpk*8 (with jpi and jpj the subdomain size) 
    306 --> 
    307      <variable id="buffer_size"               type="integer">50000000</variable> 
    308      <variable id="buffer_server_factor_size" type="integer">2</variable> 
    309      <variable id="info_level"                type="integer">0</variable> 
    310      <variable id="using_server"              type="boolean">false</variable> 
    311      <variable id="using_oasis"               type="boolean">false</variable> 
    312      <variable id="oasis_codes_id"            type="string" >oceanx</variable> 
    313     
    314       </variable_definition> 
    315                 
    316   </context> 
    317    
     24  <context id="nemo" src="./context_nemo.xml"/>       <!--  NEMO       --> 
     25 
    31826</simulation> 

  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/EXP00/iodef_ar5.xml

    r5385 r7646  
    11<?xml version="1.0"?> 
     2 
     3<!-- NOT YET UPDATED TO XIOS2 --> 
    24<simulation>  
    35   

  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/EXP00/iodef_crs.xml

    r5385 r7646  
    11<?xml version="1.0"?> 
     2 
     3<!-- NOT YET UPDATED TO XIOS2 --> 
    24<simulation>  
    35 

  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/EXP00/iodef_demo.xml

    r5468 r7646  
    11<?xml version="1.0"?> 
     2 
     3<!-- NOT YET UPDATED TO XIOS2 --> 
    24<simulation>  
    35 

  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/EXP00/iodef_oldstyle.xml

    r5385 r7646  
    11<?xml version="1.0"?> 
     2 
     3<!-- NOT YET UPDATED TO XIOS2 --> 
    24<simulation>  
    35 

  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/EXP00/namelist_cfg

    r6489 r7646  
    99   cn_exp      =  "ORCA2"  !  experience name 
    1010   nn_it000    =       1   !  first time step 
    11    nn_itend    =     300   !  last  time step (std 5475) 
    12 / 
    13 !----------------------------------------------------------------------- 
    14 &namcfg        !   parameters of the configuration 
    15 !----------------------------------------------------------------------- 
    16    cp_cfg      =  "orca"               !  name of the configuration 
    17    jp_cfg      =       2               !  resolution of the configuration 
    18    jpidta      =     182               !  1st lateral dimension ( >= jpi ) 
    19    jpjdta      =     149               !  2nd    "         "    ( >= jpj ) 
    20    jpkdta      =      31               !  number of levels      ( >= jpk ) 
    21    jpiglo      =     182               !  1st dimension of global domain --> i =jpidta 
    22    jpjglo      =     149               !  2nd    -                  -    --> j  =jpjdta 
    23    jpizoom     =       1               !  left bottom (i,j) indices of the zoom 
    24    jpjzoom     =       1               !  in data domain indices 
    25    jperio      =       4               !  lateral cond. type (between 0 and 6) 
     11   nn_itend    =    5475   !  last  time step (std 5475) 
     12/ 
     13!----------------------------------------------------------------------- 
     14&namcfg     !   parameters of the configuration 
     15!----------------------------------------------------------------------- 
     16   ln_read_cfg = .true.    !  (=T) read the domain configuration file 
     17      !                    !  (=F) user defined configuration  ==>>>  see usrdef(_...) modules 
     18      cn_domcfg = "ORCA_R2_zps_domcfg"    ! domain configuration filename 
    2619/ 
    2720!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    2922!----------------------------------------------------------------------- 
    3023   ln_zps      = .true.    !  z-coordinate - partial steps 
    31    ln_linssh   = .true.    !  linear free surface 
    3224/ 
    3325!----------------------------------------------------------------------- 
    3426&namdom        !   space and time domain (bathymetry, mesh, timestep) 
    3527!----------------------------------------------------------------------- 
    36    jphgr_msh   =       0               !  type of horizontal mesh 
    37    ppglam0     =  999999.0             !  longitude of first raw and column T-point (jphgr_msh = 1) 
    38    ppgphi0     =  999999.0             ! latitude  of first raw and column T-point (jphgr_msh = 1) 
    39    ppe1_deg    =  999999.0             !  zonal      grid-spacing (degrees) 
    40    ppe2_deg    =  999999.0             !  meridional grid-spacing (degrees) 
    41    ppe1_m      =  999999.0             !  zonal      grid-spacing (degrees) 
    42    ppe2_m      =  999999.0             !  meridional grid-spacing (degrees) 
    43    ppsur       =   -4762.96143546300   !  ORCA r4, r2 and r05 coefficients 
    44    ppa0        =     255.58049070440   ! (default coefficients) 
    45    ppa1        =     245.58132232490   ! 
    46    ppkth       =      21.43336197938   ! 
    47    ppacr       =       3.0             ! 
    48    ppdzmin     =  999999.              !  Minimum vertical spacing 
    49    pphmax      =  999999.              !  Maximum depth 
    50    ldbletanh   =  .FALSE.              !  Use/do not use double tanf function for vertical coordinates 
    51    ppa2        =  999999.              !  Double tanh function parameters 
    52    ppkth2      =  999999.              ! 
    53    ppacr2      =  999999.              ! 
     28   ln_linssh   = .false.   !  =T  linear free surface  ==>>  model level are fixed in time 
     29   ! 
     30   nn_msh      =    0      !  create (>0) a mesh file or not (=0) 
     31   ! 
    5432/ 
    5533!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    6543&namsbc        !   Surface Boundary Condition (surface module) 
    6644!----------------------------------------------------------------------- 
    67 / 
    68 !----------------------------------------------------------------------- 
    69 &namsbc_core   !   namsbc_core  CORE bulk formulae 
    70 !----------------------------------------------------------------------- 
     45   ln_blk      = .true.    !  Bulk formulation                          (T => fill namsbc_blk ) 
     46/ 
     47!----------------------------------------------------------------------- 
     48&namsbc_blk   !   namsbc_blk  generic Bulk formula                      (ln_blk = T) 
     49!----------------------------------------------------------------------- 
     50   ln_NCAR     = .true.   ! "NCAR"      algorithm   (Large and Yeager 2008) 
    7151/ 
    7252!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    134114   ln_traldf_lev   =  .false.  !  iso-level 
    135115   ln_traldf_hor   =  .false.  !  horizontal (geopotential) 
    136    ln_traldf_iso   =  .true.   !  iso-neutral (standard operator) 
    137    ln_traldf_triad =  .false.  !  iso-neutral (triad    operator) 
     116   ln_traldf_iso   =  .true.   !  iso-neutral (Standard operator) 
     117   ln_traldf_triad =  .false.  !  iso-neutral (Triads   operator) 
    138118   ! 
    139119   !                       !  iso-neutral options:         
    … …  
    147127   nn_aht_ijk_t    = 20        !  space/time variation of eddy coef 
    148128   !                                !   =-20 (=-30)    read in eddy_diffusivity_2D.nc (..._3D.nc) file 
    149    !                                !   =  0           constant 
    150    !                                !   = 10 F(k)      =ldf_c1d 
    151    !                                !   = 20 F(i,j)    =ldf_c2d 
     129   !                                !   =  0           constant  
     130   !                                !   = 10 F(k)      =ldf_c1d  
     131   !                                !   = 20 F(i,j)    =ldf_c2d  
    152132   !                                !   = 21 F(i,j,t)  =Treguier et al. JPO 1997 formulation 
    153133   !                                !   = 30 F(i,j,k)  =ldf_c2d + ldf_c1d 
    … …  
    164144   nn_aei_ijk_t  = 21      ! space/time variation of the eiv coeficient 
    165145   !                                !   =-20 (=-30)    read in eddy_induced_velocity_2D.nc (..._3D.nc) file 
    166    !                                !   =  0           constant 
    167    !                                !   = 10 F(k)      =ldf_c1d 
    168    !                                !   = 20 F(i,j)    =ldf_c2d 
     146   !                                !   =  0           constant  
     147   !                                !   = 10 F(k)      =ldf_c1d  
     148   !                                !   = 20 F(i,j)    =ldf_c2d  
    169149   !                                !   = 21 F(i,j,t)  =Treguier et al. JPO 1997 formulation 
    170150   !                                !   = 30 F(i,j,k)  =ldf_c2d + ldf_c1d 
    171151/ 
    172152!----------------------------------------------------------------------- 
    173 &namtra_dmp    !   tracer: T & S newtonian damping 
     153&namtra_dmp    !   tracer: T & S newtonian damping                      (default: NO) 
    174154!----------------------------------------------------------------------- 
    175155/ 
    … …  
    190170&namdyn_hpg    !   Hydrostatic pressure gradient option 
    191171!----------------------------------------------------------------------- 
    192 / 
    193 !----------------------------------------------------------------------- 
    194 &namdyn_spg    !   Surface pressure gradient 
    195 !----------------------------------------------------------------------- 
    196    ln_dynspg_ts = .true.   !  Split-explicit free surface 
     172   ln_hpg_sco  = .true.   !  s-coordinate (standard jacobian formulation) 
     173/ 
     174!----------------------------------------------------------------------- 
     175&namdyn_spg    !   surface pressure gradient 
     176!----------------------------------------------------------------------- 
     177   ln_dynspg_ts  = .true.  !  split-explicit free surface 
    197178/ 
    198179!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    219200   rn_ahm_b      =      0.     !  background eddy viscosity for ldf_iso [m2/s] 
    220201   rn_bhm_0      = 1.e+12      !  horizontal bilaplacian eddy viscosity [m4/s] 
     202   ! 
     203   ! Caution in 20 and 30 cases the coefficient have to be given for a 1 degree grid (~111km) 
    221204/ 
    222205!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    249232/ 
    250233!----------------------------------------------------------------------- 
    251 &namhsb       !  Heat and salt budgets 
    252 !----------------------------------------------------------------------- 
    253 / 
    254 !----------------------------------------------------------------------- 
    255 &namobs       !  observation usage 
     234&namhsb       !  Heat and salt budgets                                  (default F) 
     235!----------------------------------------------------------------------- 
     236/ 
     237!----------------------------------------------------------------------- 
     238&namobs       !  observation usage                                      ('key_diaobs') 
    256239!----------------------------------------------------------------------- 
    257240/ 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.