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2014WP/Met_Office (diff) – NEMO

Changes between Version 6 and Version 7 of 2014WP/Met_Office


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Timestamp:
2013-11-20T17:42:14+01:00 (10 years ago)
Author:
rfurner
Comment:

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  • 2014WP/Met_Office

    v6 v7  
    2424|| Met_Office-6 || || Allow specification of an hour start time || || || || || || || || || 
    2525|| Met_Office-7 || || Inclusion of surface wave effects in NEMO || || || || || || || || || 
    26 || Met_Office-8 || || Salinity dependent freezing temperature || || || || || || || || || 
    27 || Met_Office-9 || || Further 1D configuration changes || || || || || || || || || 
    28 || Met_Office-10 || || Tidally meaned diagnostics || || || || || || || || || 
    29 || Met_Office-11 || || Outputting restarts at specified times instead of specified frequency || || || || || || || || || 
    30 || Met_Office-12 || || CFL diagnostic || || || || || || || || || 
    31 || Met_Office-13 || || Updates to CICE interface for CICE 5 || || || || || || || || || 
    32 || Met_Office-14 || || Updates and improvements to OBS and ASM || || || || || || || || || 
     26|| Met_Office-8 || || Further 1D configuration changes || || || || || || || || || 
     27|| Met_Office-9 || || Tidally meaned diagnostics || || || || || || || || || 
     28|| Met_Office-10 || || Outputting restarts at specified times instead of specified frequency || || || || || || || || || 
     29|| Met_Office-11 || || CFL diagnostic || || || || || || || || || 
     30|| Met_Office-12 || || Updates to CICE interface for CICE 5 || || || || || || || || || 
     31|| Met_Office-13 || || Updates and improvements to OBS and ASM || || || || || || || || || 
    3332 
    3433---- 
     
    6160'''                       Motivation: '''Modifying NEMO SBC to include wave-induced mixing and Langmuir  circulation with data obtained from a surface wave model and modifying  the equation of motion to include Stokes-Coriolis forcing[[BR]]                       '''                       Status :''' Not started[[BR]]                       '''                       Main tasks :''' NEMO-side code modifications to read/couple wave fields and modifications in the TKE scheme and dynamics module[[BR]]                       '''                       Science Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       System Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       Deadline:''' October 2014[[BR]]                       '''                       Priority:'''                         Medium [[BR]]                       '''                       Depends on: '''N/A                        [[BR]]                       '''                       Principal Investigator : '''Francois-Xavier Bocquet (francois.bocquet@metoffice.gov.uk) 
    6261 
    63 === '''Met_Office-8  - Salinity dependent freezing temperature''' === 
     62=== '''Met_Office-8  - Further 1D configuration changes''' === 
     63'''                       Motivation: '''Add further functionality that there wasn't time for in the 2013 development[[BR]]                       '''                       Status :''' Plan exists[[BR]]                       '''                       Main tasks :''' Add namelist domain control, case studies, maybe remove CPP key dependence.[[BR]]                       '''                       Science Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       System Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       Deadline:''' October 2014[[BR]]                       '''                       Priority:'''                         Medium [[BR]]                       '''                       Depends on: '''N/A                        [[BR]]                       '''                       Principal Investigator :  '''Daley Calvert (daley.calvert@metoffice.gov.uk) 
     64 
     65=== '''Met_Office-9 - Tidally meaned diagnostics''' === 
     66'''                       Motivation: '''Implementing 25 hour means (an average of 25 instantaneous hourly values, midnight to midnight, so each midnight is included for both the day preceding it, and the day following it) provides a simple way of detiding model runs as it  largely averages out the main M2 tidal signal. These outputs give a rough idea of the residual flows, mean ssh etc. on a particular day  [[BR]] '''Status :''' The code exits in a local branch at vn3.4[[BR]]                       '''                       Main tasks :''' Check the existing code and implement in the appropriate NEMO version, test and document[[BR]]                       '''                       Science Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       System Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       Deadline:''' October 2014[[BR]]                       '''                       Priority:'''                         Medium [[BR]]                       '''                       Depends on: '''N/A                        [[BR]]                       '''                       Principal Investigator : '''Enda O'Dea (enda.odea@metoffice.gov.uk) 
     67 
     68=== '''Met_Office-10  - Outputting restarts at specified times instead of specified frequency''' === 
     69'''                       Motivation: '''Operationally we require the flexibility to output restarts at specified  times rather than at a specified frequency.  This used to be an option  in the NEMO trunk but disappeared at v3.0 and we have been maintaining  the required code since then.  The code uses the nstocklist  functionality.[[BR]]                       '''                       Status :''' The code exits in a local branch at vn3.4[[BR]]                       '''                       Main tasks :''' Check the existing code and implement in the appropriate NEMO version, test and document[[BR]]                       '''                       Science Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       System Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       Deadline:''' October 2014[[BR]]                       '''                       Priority:'''                         Medium [[BR]]                       '''                       Depends on: '''N/A                        [[BR]]                       '''                       Principal Investigator : '''Ed Blockley (ed.blockley@metoffice.gov.uk) 
     70 
     71=== '''Met_Office-11  - CFL diagnostic''' === 
     72'''                       Motivation: '''To calculate and output the maximum CFL parameter during a run, to inform users of stability constraints.[[BR]]'''Status :''' The code exits in a local branch at vn3.4[[BR]]                       '''                       Main tasks :''' Check the existing code and implement in the appropriate NEMO version, test and document[[BR]]                       '''                       Science Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       System Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       Deadline:''' October 2014[[BR]]                       '''                       Priority:'''                         Medium [[BR]]                       '''                       Depends on: '''N/A                        [[BR]]                       '''                       Principal Investigator : '''Rachel Furner (rachel.furner@metoffice.gov.uk) 
     73 
     74=== '''Met_Office-12  - Updates to CICE interface ''' === 
     75'''Met_Office-12.1  - Updates to CICE interface for CICE 5''' 
     76'''                       Motivation: '''The coupling to CICE directly uses CICE array names and unfortunately some of these have changed between CICE4 and CICE5.   Future NEMO versions should certainly support CICE5 and ideally also  CICE4 although we could decide to deprecate that later.  If we want to allow  both options they could potentially be switched through some kind of cpp  key control.[[BR]]                       '''                       Status :''' Not yet started[[BR]]                       '''                       Main tasks :''' Amend existing CICE interface to use CICE5 names depending in cpp keys used[[BR]]                       '''                       Science Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       System Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       Deadline:''' October 2014[[BR]]                       '''                       Priority:'''                         Medium [[BR]]                       '''                       Depends on: '''N/A                        [[BR]]                       '''                       Principal Investigator : '''TBD 
     77'''Met_Office-12.2  - Salinity dependent freezing temperature''' 
    6478'''                       Motivation: '''Implementation of salinity dependent freezing temperature in NEMO which can be passed to sea ice and atmosphere models[[BR]]                       '''                       Status :''' The code exits in a local branch at vn3.4[[BR]]                       '''                       Main tasks :''' Check the existing code and implement in the appropriate NEMO version, test and document[[BR]]                       '''                       Science Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       System Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       Deadline:''' October 2014[[BR]]                       '''                       Priority:'''                         Medium [[BR]]                       '''                       Depends on: '''N/A                        [[BR]]                       '''                       Principal Investigator : '''Dave Storkey (dave.storkey@metoffice.gov.uk) 
    6579 
    66 === '''Met_Office-9  - Further 1D configuration changes''' === 
    67 '''                       Motivation: '''Add further functionality that there wasn't time for in the 2013 development[[BR]]                       '''                       Status :''' Plan exists[[BR]]                       '''                       Main tasks :''' Add namelist domain control, case studies, maybe remove CPP key dependence.[[BR]]                       '''                       Science Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       System Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       Deadline:''' October 2014[[BR]]                       '''                       Priority:'''                         Medium [[BR]]                       '''                       Depends on: '''N/A                        [[BR]]                       '''                       Principal Investigator :  '''Daley Calvert (daley.calvert@metoffice.gov.uk) 
    68  
    69 === '''Met_Office-10 - Tidally meaned diagnostics''' === 
    70 '''                       Motivation: '''Implementing 25 hour means (an average of 25 instantaneous hourly values, midnight to midnight, so each midnight is included for both the day preceding it, and the day following it) provides a simple way of detiding model runs as it  largely averages out the main M2 tidal signal. These outputs give a rough idea of the residual flows, mean ssh etc. on a particular day  [[BR]] '''Status :''' The code exits in a local branch at vn3.4[[BR]]                       '''                       Main tasks :''' Check the existing code and implement in the appropriate NEMO version, test and document[[BR]]                       '''                       Science Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       System Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       Deadline:''' October 2014[[BR]]                       '''                       Priority:'''                         Medium [[BR]]                       '''                       Depends on: '''N/A                        [[BR]]                       '''                       Principal Investigator : '''Enda O'Dea (enda.odea@metoffice.gov.uk) 
    71  
    72 === '''Met_Office-11  - Outputting restarts at specified times instead of specified frequency''' === 
    73 '''                       Motivation: '''Operationally we require the flexibility to output restarts at specified  times rather than at a specified frequency.  This used to be an option  in the NEMO trunk but disappeared at v3.0 and we have been maintaining  the required code since then.  The code uses the nstocklist  functionality.[[BR]]                       '''                       Status :''' The code exits in a local branch at vn3.4[[BR]]                       '''                       Main tasks :''' Check the existing code and implement in the appropriate NEMO version, test and document[[BR]]                       '''                       Science Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       System Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       Deadline:''' October 2014[[BR]]                       '''                       Priority:'''                         Medium [[BR]]                       '''                       Depends on: '''N/A                        [[BR]]                       '''                       Principal Investigator : '''Ed Blockley (ed.blockley@metoffice.gov.uk) 
    74  
    75 === '''Met_Office-12  - CFL diagnostic''' === 
    76 '''                       Motivation: '''To calculate and output the maximum CFL parameter during a run, to inform users of stability constraints.[[BR]]'''Status :''' The code exits in a local branch at vn3.4[[BR]]                       '''                       Main tasks :''' Check the existing code and implement in the appropriate NEMO version, test and document[[BR]]                       '''                       Science Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       System Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       Deadline:''' October 2014[[BR]]                       '''                       Priority:'''                         Medium [[BR]]                       '''                       Depends on: '''N/A                        [[BR]]                       '''                       Principal Investigator : '''Rachel Furner (rachel.furner@metoffice.gov.uk) 
    77  
    78 === '''Met_Office-13  - Updates to CICE interface for CICE 5''' === 
    79 '''                       Motivation: '''The coupling to CICE directly uses CICE array names and unfortunately some of these have changed between CICE4 and CICE5.   Future NEMO versions should certainly support CICE5 and ideally also  CICE4 although we could decide to deprecate that later.  If we want to allow  both options they could potentially be switched through some kind of cpp  key control.[[BR]]                       '''                       Status :''' Not yet started[[BR]]                       '''                       Main tasks :''' Amend existing CICE interface to use CICE5 names depending in cpp keys used[[BR]]                       '''                       Science Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       System Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       Deadline:''' October 2014[[BR]]                       '''                       Priority:'''                         Medium [[BR]]                       '''                       Depends on: '''N/A                        [[BR]]                       '''                       Principal Investigator : '''TBD 
    80  
    81 === '''Met_Office-14 - Updates and Improvements to OBS and ASM''' === 
    82 '''Met Office 14.1  - Equatorial Pressure correction'''[[BR]] 
     80=== '''Met_Office-13 - Updates and Improvements to OBS and ASM''' === 
     81'''Met Office 13.1  - Equatorial Pressure correction'''[[BR]] 
    8382'''                       Motivation: '''The pressure correction code exists to maintain balance in equatorial regions as data are assimilated[[BR]]                       '''                       Status :''' The code already exits, but still needs to be reviewed[[BR]]                       '''                       Main tasks :'''  Check the existing code and implement in the appropriate NEMO version[[BR]]                       '''                       Science Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       System Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       Deadline:''' October 2014 (likely sooner since there is little to do) [[BR]]                       '''                       Priority:'''                         Medium [[BR]]                       '''                       Depends on: '''N/A                        [[BR]]                       '''                       Principal Investigator : ''' Dan Lea (dan.lea@metoffice.gov.uk) 
    8483 
    85 '''Met_Office-14.2  - Seaice increments'''[[BR]] 
     84'''Met_Office-13.2  - Seaice increments'''[[BR]] 
    8685'''                       Motivation: '''Implement code used to apply seaice increments; this is used for data assimilation of ice variables.  It will also be necessary to make sure the code is compatible with cice[[BR]]                       '''                       Status : ''' The code exits in a local branch at vn3.4[[BR]]                       '''                       Main tasks :''' Check the existing code and implement in the appropriate NEMO version, test and document[[BR]]                       '''                       Science Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       System Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       Deadline:''' October 2014 (likely sooner since there is little to do) '''''[[BR]]                       '''                       '''''Priority:'''                         Medium [[BR]]                                              '''Depends on''': N/A                        [[BR]]                                              '''Principal Investigator :'''  Dan Lea (dan.lea@metoffice.gov.uk) 
    8786 
    88 '''Met_Office-14.3 - Temperature Criterion Mixed Layer''' [[BR]] 
     87'''Met_Office-13.3 - Temperature Criterion Mixed Layer''' [[BR]] 
    8988'''                       Motivation: ''' A new mixed layer definition based on a temperature criterion[[BR]]                       '''                       Status :''' The code exits in a local branch at vn3.4[[BR]]                       '''                       Main tasks :''' Check the existing code and implement in the appropriate NEMO version, test and document[[BR]]                       '''                       Science Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       System Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       Deadline:''' October 2014 (likely sooner since there is little to do) [[BR]]                       '''                       Priority:'''                         Medium [[BR]]                       '''                       Depends on: '''N/A                        [[BR]]                       '''                       Principal Investigator : '''James While (james.while@metoffice.gov.uk) 
    9089 
    91 '''Met_Office-14.4  - Observation operator for profiles for use with all vertical coordinates (i.e. generalised vertical interpolation) '''[[BR]] 
     90'''Met_Office-13.4  - Observation operator for profiles for use with all vertical coordinates (i.e. generalised vertical interpolation) '''[[BR]] 
    9291'''                       Motivation: '''This code is necessary to get profile minus model differences in any model not using vertical z-coordinates[[BR]]                       '''                       Status :''' The code exits in a local branch at vn3.4[[BR]]                       '''                       Main tasks :''' Check the existing code and implement in the appropriate NEMO version, test and document[[BR]]                       '''                       Science Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       System Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       Deadline:''' October 2014 (likely sooner since there is little to do) [[BR]]                       '''                       Priority:'''                         Medium [[BR]]                       '''                       Depends on: '''N/A                        [[BR]]                       '''                       Principal Investigator : ''' James While (james.while@metoffice.gov.uk) 
    9392 
    94 '''Met_Office-14.5  - SST bias correction''' [[BR]] 
     93'''Met_Office-13.5  - SST bias correction''' [[BR]] 
    9594'''                       Motivation: ''' This code reads in a bias field and uses it to correct SST observations  before they are passed to the obs operator.  It is necessary for  successful SST assimilation[[BR]]                       '''                       Status :''' The code exits in a local branch at vn3.4[[BR]]                       '''                       Main tasks :''' Check the existing code and implement in the appropriate NEMO version, test and document[[BR]]                       '''                       Science Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       System Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       Deadline:''' October 2014 (likely sooner since there is little to do) [[BR]]                       '''                       Priority:'''                         Medium [[BR]]                       '''                       Depends on: '''N/A                        [[BR]]                       '''                       Principal Investigator : ''' James While (james.while@metoffice.gov.uk) 
    9695 
    97 '''Met_Office-14.6  - ADCP data to be included in OBS routines''' [[BR]] 
     96'''Met_Office-13.6  - ADCP data to be included in OBS routines''' [[BR]] 
    9897'''                       Motivation: ''' Reads current data from ADCP files for comparison with model data[[BR]]                       '''                       Status :''' The code exits in a local branch at vn3.4[[BR]]                       '''                       Main tasks :''' Check the existing code and implement in the appropriate NEMO version, test and document[[BR]]                       '''                       Science Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       System Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       Deadline:''' October 2014[[BR]]                       '''                       Priority:'''                         Medium [[BR]]                       '''                       Depends on: '''N/A                        [[BR]]                       '''                       Principal Investigator : ''' James While (james.while@metoffice.gov.uk) 
    9998 
    100 '''Met_Office-14.7  - Read and process gridded seaice and sst data''' [[BR]] 
     99'''Met_Office-13.7  - Read and process gridded seaice and sst data''' [[BR]] 
    101100'''                       Motivation: '''  This code would allow us to process gridded SST and seaice data through the observation operator[[BR]]                       '''                       Status :''' The code exits in a local branch at vn3.4[[BR]]                       '''                       Main tasks :''' Check the existing code and implement in the appropriate NEMO version, test and document[[BR]]                       '''                       Science Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       System Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       Deadline:''' October 2014[[BR]]                       '''                       Priority:'''                         Medium [[BR]]                       '''                       Depends on: '''N/A                        [[BR]]                       '''                       Principal Investigator : ''' James While (james.while@metoffice.gov.uk) 
    102101 
    103 '''Met_Office-14.8  - Netcdf4 compression of feedback files''' [[BR]] 
     102'''Met_Office-13.8  - Netcdf4 compression of feedback files''' [[BR]] 
    104103'''                       Motivation: '''This code would allow us to more easily store feedback files at a higher compression[[BR]]                       '''                       Status :''' The code exits in a local branch at vn3.4[[BR]]                       '''                       Main tasks :''' Check the existing code and implement in the appropriate NEMO version, test and document[[BR]]                       '''                       Science Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       System Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       Deadline:''' October 2014[[BR]]                       '''                       Priority:'''                         Medium [[BR]]                       '''                       Depends on: '''N/A                        [[BR]]                       '''                       Principal Investigator : ''' James While (james.while@metoffice.gov.uk) 
    105104 
    106 '''Met_Office-14.9  - Add record information to SLA data''' [[BR]] 
     105'''Met_Office-13.9  - Add record information to SLA data''' [[BR]] 
    107106'''                       Motivation: '''Allows storage of record information for SLA data[[BR]]                       '''                       Status :''' The code exits in a local branch at vn3.4[[BR]]                       '''                       Main tasks :''' Check the existing code and implement in the appropriate NEMO version, test and document[[BR]]                       '''                       Science Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       System Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       Deadline:''' October 2014[[BR]]                       '''                       Priority:'''                         Medium [[BR]]                       '''                       Depends on: '''N/A                        [[BR]]                       '''                       Principal Investigator : ''' James While (james.while@metoffice.gov.uk) 
    108107 
    109 '''Met_Office-14.10  - Addition of Satellite Surface Salinity data and Microwave SST data to OBS routines''' [[BR]] 
     108'''Met_Office-13.10  - Addition of Satellite Surface Salinity data and Microwave SST data to OBS routines''' [[BR]] 
    110109'''                       Motivation: '''Allow comparison of satellite surface salinity and microwave SST data through the OBS routines.[[BR]]                       '''                       Status :''' The code exits in a local branch at vn3.4[[BR]]                       '''                       Main tasks :''' Check the existing code and implement in the appropriate NEMO version, test and document[[BR]]                       '''                       Science Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       System Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       Deadline:''' October 2014[[BR]]                       '''                       Priority:'''                         Medium [[BR]]                       '''                       Depends on: '''N/A                        [[BR]]                       '''                       Principal Investigator : ''' Dan Lea (dan.lea@metoffice.gov.uk) (work to be done with Niall [wiki:McConner McConnell and Jonah Roberts Jones)] 
    111110 
    112 '''Met_Office-14.11 - Implement assimilation interface SETTE test''' [[BR]] 
     111'''Met_Office-13.11 - Implement assimilation interface SETTE test''' [[BR]] 
    113112'''                       Motivation: '''Create a SETTE test configuration which includes observation operator  and increments tests, to ensure that  future NEMO developments do not break OBS and ASM.[[BR]]                       '''                       Status :''' Not started[[BR]]                       '''                       Main tasks :''' 
    114113 
     
    119118'''                       Science Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       System Reviewer:'''                        [[BR]]                       '''                       Deadline:''' October 2014 (likely sooner since there is little to do) [[BR]]                       '''                       Priority:'''                         Medium [[BR]]                       '''                       Depends on: '''N/A                        [[BR]]                       '''                       Principal Investigator : ''' Dan Lea (dan.lea@metoffice.gov.uk) 
    120119 
    121 '''Met_Office-14.12  - Improvements to offline OBS operator''' [[BR]] 
     120'''Met_Office-13.12  - Improvements to offline OBS operator''' [[BR]] 
    122121'''                       Motivation: '''Limit duplication of code, and move to using as much of the online code as possible.[[BR]]                       '''                       Status :'''To be done during alpha testing of 3.6 [[BR]]                       '''                       Main tasks :'''   [[BR]]                       '''                       Science Reviewer:'''Clement Bricaud                        [[BR]]                       '''                       System Reviewer:'''Clement Bricaud                        [[BR]]                       '''                       Deadline:''' Feb 2013[[BR]]                       '''                       Priority:'''                         Medium [[BR]]                       '''                       Depends on: '''N/A                        [[BR]]                       '''                       Principal Investigator : ''' Andy Ryan