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2016WP/2016SharedActions (diff) – NEMO

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gm
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    v104 v105  
    138138 
    139139==== SIMPLIF-4 / CMCC - Remove key_mpp_rep ==== 
    140   '''                       Motivation:'''                             Set the use of MPI safe computation as a default [[BR]]                                                     '''                        Status :'''                                     [[BR]]                                    '''                        Main tasks :'''                             remove the use of the macro key_mpp_rep and use as a default condition the MPI safe communications  [[BR]]                                    '''                        Science '''                      Pre-viewer'''                      :'''                              Gurvan Madec              [[BR]]                                                            '''                       System '''                      Pre-viewer'''                      :'''                             Gurvan Madec                                  [[BR]]                                                            '''                       Deadline:'''                                    [[BR]]                                   '''                       Priority:'''                                                              [[BR]]                                                            '''                       Depends on:'''                                                       [[BR]]                                                            '''                       Principal Investigator : '''                            Dorotea Iovino 
    141  
    142 ===  === 
     140  '''                       Motivation:'''                             Set the use of MPI safe computation as a default [[BR]]                                                     '''                        Status :'''                                     [[BR]]                                    '''                        Main tasks :'''                             remove the use of the macro key_mpp_rep and use as a default condition the MPI safe communications  [[BR]]                                    '''                        Science '''                      Pre-viewer'''                      :'''                              Gurvan Madec              [[BR]]                                                            '''                       System '''                      Pre-viewer'''                      :'''                             Gurvan Madec                                  [[BR]]                                                            '''                       Deadline:'''                                    [[BR]]                                   '''                       Priority:'''                                                              [[BR]]                                                            '''                       Depends on:'''                                                       [[BR]]                                                            '''                       Principal Investigator : '''                            Dorotea Iovino [[BR]] 
     141 
     142 
    143143==== '''SIMPLI-5 / NOC - '''Reimplement Smagorinsky ==== 
    144144 '''Motivation: '''The rationalisation of the LDF operators offers the possibility of[https://forge.ipsl.jussieu.fr/#6322077 cleanly] reintroducing the Smagorinsky parameterisation by adding an appropriate subroutine to set the three-dimensional coefficient array that already exists. This should represent an additional improvement over the previous implementation in that it will work with both harmonic and biharmonic operators.  [[BR]]'''Status :'''  [[BR]]'''Main tasks :'''  [[BR]]'''Science Reviewer:[[BR]]System Reviewer:[[BR]]Deadline:'''  [[BR]]'''Priority: '''[[BR]]'''Depends on:[[BR]]Principal Investigator : '''[[BR]]  
     145 
     146 
     147==== '''SIMPLI-6 / CNRS - '''suppression of LIM-2 ==== 
     148 '''Motivation: '''LIM-3 used with one category gives results similar to LIM-2. Therefore LIM-2 is useless.  [[BR]]'''Status :'''  [[BR]]'''Main tasks :''' remove LIM_SRC_2 directory together with changes in SBC and namelists  [[BR]]'''Science Reviewer:[[BR]]System Reviewer:[[BR]]Deadline:'''  [[BR]]'''Priority: '''[[BR]]'''Depends on:[[BR]]Principal Investigator : Clément Rousset'''[[BR]]  
    145149 
    146150 
     
    200204 
    201205==== ''' '''ROBUSTNESS-2 / Met Office - Improvements to EEN scheme with partial steps ==== 
    202   '''                 Motivation: ''' Following investigative work by Nicolas Ducousso it became clear that the EEN scheme in NEMO did not perform as expected in idealised test cases. Although a fix was implemented that improved the performance in idealised test cases the performance in realistic simulations (e.g. ORCA025) is worse. It is not clear that the new or old formulation is correct for the case of sloping bathymetry and partial steps. 
    203  
    204   [[BR]]                                                         '''                                                             Status: '''                                                             [[BR]]                                                         '''                                                            Main Tasks: '''                                                             [[BR]]                                                         '''                                                             Science '''                      Pre-viewer'''                      :'''                                                                                                     [[BR]]                                                                                                     '''                                                             System '''                      Pre-viewer'''                      :'''                                                                                                     [[BR]]                                                                                                     '''                                                             Deadline:'''                                                             [[BR]]                                                                                                     '''                                                             Priority:'''                                                             [[BR]]                                                                                                     '''                                                             Depends on:'''                                                                                                     [[BR]] 
     206  '''                 Motivation: ''' Following investigative work by Nicolas Ducousso it became clear that the EEN scheme in NEMO did not perform as expected in idealised test cases. Although a fix was implemented that improved the performance in idealised test cases the performance in realistic simulations (e.g. ORCA025) is worse. It is not clear that the new or old formulation is correct for the case of sloping bathymetry and partial steps.[[BR]]                                                         '''                                                             Status: '''                                                             [[BR]]                                                         '''                                                            Main Tasks: '''                                                             [[BR]]                                                         '''                                                             Science '''                      Pre-viewer'''                      :'''                                                                                                     [[BR]]                                                                                                     '''                                                             System '''                      Pre-viewer'''                      :'''                                                                                                     [[BR]]                                                                                                     '''                                                             Deadline:'''                                                             [[BR]]                                                                                                     '''                                                             Priority:'''                                                             [[BR]]                                                                                                     '''                                                             Depends on:'''                                                                                                     [[BR]] 
     207  '''Principal Investigator :''' Mike Bell[[BR]]  
    205208 
    206209==== ROBUSTNESS-3 / CNRS - Academic test cases in the system ==== 
    207   '''Motivation: '''Implementation of standard test-cases for NEMO (e.g. for pedagogical purpose and/or for demonstrating the benefit of new features and/or for illustrating the effect of a numerical scheme)[[BR]]'''Status: '''started in 2015[[BR]]'''Main Tasks: '''after the structure of user_defined module is created in the code (see SIMPLIF-2 CNRS), a list of test cases will be implemented ('''suggestion''' one test case related to the main development of the year for each institution). [[BR]]The working group on Test cases and robustness will decide the structure fo the implementation in NEMO of test cases (work already started, with a template of equatorial box in 2015 branch).[[BR]]  
    208 '''Science '''Pre-viewer''':''' Gurvan Madec[[BR]]'''System '''Pre-viewer''': '''Andrew Coward [[BR]]'''Deadline:''' [[BR]]'''Priority:''' High[[BR]]'''Depends on: '''SIMPLIF-2 (CNRS)[[BR]]'''Principal Investigator: '''Simona Flavoni[[BR]] 
     210  '''Motivation: '''Implementation of standard test-cases for NEMO (e.g. for pedagogical purpose and/or for demonstrating the benefit of new features and/or for illustrating the effect of a numerical scheme)[[BR]]'''Status: '''started in 2015[[BR]]'''Main Tasks: '''after the structure of user_defined module is created in the code (see SIMPLIF-2 CNRS), a list of test cases will be implemented ('''suggestion''' one test case related to the main development of the year for each institution). [[BR]]The working group on Test cases and robustness will decide the structure fo the implementation in NEMO of test cases (work already started, with a template of equatorial box in 2015 branch).[[BR]] '''Science '''Pre-viewer''':''' Gurvan Madec[[BR]]'''System '''Pre-viewer''': '''Andrew Coward [[BR]]'''Deadline:''' [[BR]]'''Priority:''' High[[BR]]'''Depends on: '''SIMPLIF-2 (CNRS)[[BR]]'''Principal Investigator: '''Simona Flavoni[[BR]] 
    209211 
    210212==== ROBUSTNESS-4 / CNRS - Passive tracers run offline with vvl ==== 
    211   '''Motivation: '''Add missing pieces of code to be able to run offline component with vvl [[BR]]'''Status: '''Started in 2015 ; to be improved[[BR]]'''Main Tasks:'''[[BR]]   
    212 (1) run a forced simulation ORCA2(1)-LIM2(3) and output variables needed for linear free surface, especially the changing vertical grid in time ( already done )[[BR]](2) Rewrite the Offline module to take into account the changing grid in time'''[[BR]]Science '''Pre-viewer''':''' Gurvan Madec[[BR]]'''System '''Pre-viewer''':''' [[BR]]'''Deadline:''' [[BR]]'''Priority:''' High[[BR]]'''Depends on:''' [[BR]]'''Principal Investigator: '''Christian Ethé[[BR]] 
     213  '''Motivation: '''Add missing pieces of code to be able to run offline component with vvl [[BR]]'''Status: '''Started in 2015 ; to be improved[[BR]]'''Main Tasks:'''[[BR]]  (1) run a forced simulation ORCA2(1)-LIM2(3) and output variables needed for linear free surface, especially the changing vertical grid in time ( already done )[[BR]](2) Rewrite the Offline module to take into account the changing grid in time'''[[BR]]Science '''Pre-viewer''':''' Gurvan Madec[[BR]]'''System '''Pre-viewer''':''' [[BR]]'''Deadline:''' [[BR]]'''Priority:''' High[[BR]]'''Depends on:''' [[BR]]'''Principal Investigator: '''Christian Ethé[[BR]] 
    213214 
    214215==== ROBUSTNESS-5 / CNRS/CMCC - Revisiting TOP interface ==== 
    215   '''Motivation: '''Some aspects of TOP interface need to be improved [[BR]]'''Status: '''[[BR]]'''Main Tasks: '''[[BR]]  
    216 (1) move the number of passive tracers from the code to the namelist[[BR]]  
    217 (2) Revisit the SMS models distributed in the model (  AGE tracer, Natural C14 vs Bomb C14, etc ...) [[BR]][[BR]] (3) generalisation of the work done at CMCC on boundary conditions to others models in the system ( PISCES, CFC, ... )'''[[BR]]Science '''Pre-viewer''':''' Olivier Aumont[[BR]]'''System '''Pre-viewer''':''' [[BR]]'''Deadline:''' [[BR]]'''Priority:''' Low[[BR]]'''Depends on:''' [[BR]]'''Principal Investigator: '''Christian Ethé, Tomas Lovato[[BR]] 
     216  '''Motivation: '''Some aspects of TOP interface need to be improved [[BR]]'''Status: '''[[BR]]'''Main Tasks: '''[[BR]]       (1) move the number of passive tracers from the code to the namelist[[BR]]       (2) Revisit the SMS models distributed in the model (  AGE tracer, Natural C14 vs Bomb C14, etc ...) [[BR]][[BR]]       (3) generalisation of the work done at CMCC on boundary conditions to others models in the system ( PISCES, CFC, ... )[[BR]]  '''Science '''Pre-viewer''':''' Olivier Aumont[[BR]]'''System '''Pre-viewer''':''' [[BR]]'''Deadline:''' [[BR]]'''Priority:''' Low[[BR]]'''Depends on:''' [[BR]]'''Principal Investigator: '''Christian Ethé, Tomas Lovato[[BR]] 
    218217 
    219218==== ROBUSTNESS-6 / CNRS - Continuous integration tool ('Trusting') ==== 
    220   '''Motivation: '''Carry on the use, the support and the spreading of this new tool for the validation of development works[[BR]]'''Status: '''[[BR]]'''Main Tasks:''' 
    221  * Follow-up the status of the trusting for supported configurations & HPC centers 
    222  * Finalize documentation (help content, wiki page, ...) 
    223  * Complete the list of monitored configurations & add new features for improvement 
    224  * If needed,install the trusting on new HPCC for benchmarking the code over several centers 
    225 '''Science '''Pre-viewer''':'''[[BR]]'''System '''Pre-viewer''':'''  Miguel Castrillo[[BR]]'''Deadline:''' [[BR]]'''Priority:''' Medium[[BR]]'''Depends on:''' [[BR]]'''Principal Investigator: '''Nicolas Martin[[BR]] 
     219  '''Motivation: '''Carry on the use, the support and the spreading of this new tool for the validation of development works[[BR]]'''Status: '''[[BR]]'''Main Tasks:'''[[BR]]       - Follow-up the status of the trusting for supported configurations & HPC centers[[BR]] 
     220       - Finalize documentation (help content, wiki page, ...)[[BR]] 
     221       - Complete the list of monitored configurations & add new features for improvement[[BR]] 
     222       - If needed,install the trusting on new HPCC for benchmarking the code over several centers[[BR]]   
     223  '''Science '''Pre-viewer''':'''[[BR]]'''System '''Pre-viewer''':'''  Miguel Castrillo[[BR]]'''Deadline:''' [[BR]]'''Priority:''' Medium[[BR]]'''Depends on:''' [[BR]]'''Principal Investigator: '''Nicolas Martin[[BR]] 
     224 
     225 
     226==== ROBUSTNESS-7 / CMCC  -  BDY for nested limited area models ==== 
     227  '''                                     Motivation:'''       Improving nesting techniques for regional and sub-regional circulation models nested into coarser models  [[BR]]                               '''           Status :'''               [[BR]]              '''                                      Main tasks :'''       1. Implementation of the generalised Flather’s condition for the barotropic component (Oddo & Pinardi, 2008); 2. Interpolation Constraint applied to total velocity field for preserving the transport conservation across open boundaries  [[BR]]              '''              Science Reviewer:'''   Nadia Pinardi (University of Bologna & CMCC)              [[BR]]                                      '''                                      System Reviewer:'''   James Harle                                       [[BR]]                                      '''                                      Deadline:'''              [[BR]]             '''                                      Priority:'''                                        [[BR]]                                      '''                                      Depends on:'''                                 [[BR]]                                      '''                                      Principal Investigator : '''      Stefania Ciliberti (stefania.ciliberti@cmcc.it) [[BR]] 
     228 
     229 
     230 
    226231 
    227232==== ROBUSTNESS-8 / Mercator Océan - Improve split-explicit free surface ==== 
     
    231236 * Work on the stability of barotropic time stepping (based on INRIA's work) to possibly remove time filtering of barotropic variables. This would limit the temporal dissipation and greatly ease online coupling of nested domains at barotropic level (with AGRIF).[[BR]] 
    232237  '''                 Status: '''                 [[BR]]             '''                Main Tasks: '''                 [[BR]]             '''                 Science '''Pre-viewer''':'''                                                         [[BR]]                                                         '''                 System '''Pre-viewer''':'''                                                         [[BR]]                                                         '''                 Deadline:'''                 [[BR]]                                                         '''                 Priority:'''                 [[BR]]                                                         '''                 Depends on:'''                                                         [[BR]]                                                         '''                 Principal Investigator: '''Jérôme Chanut[[BR]] 
     238 
     239 
     240==== ROBUST-9 / MERCATOR -  tests NEMO3.6 with global configuration (1/4° & 1/12°) ==== 
     241 '''    Motivation: '''    Model configurations need to be validated before the release of the model. [[BR]]      '''    Status: ''' ORCA025_LIM2 with filtread free surface or time splitting is already running at Mercator [[BR]] '''    Main Tasks: Test and validation with ORCA025 of: ''' [[BR]] 
     242  -no routines to be modified [[BR]] 
     243  -LIM2 vs LIM3 [[BR]]    -GLS vs TKE [[BR]]    -time-splitting vs filtred free surface [[BR]]    -vector form vs UBS for momentum advection [[BR]]    -run ORCA025 with Z* [[BR]]    -online coarsening [[BR]]    -run ORCA12 with time-splitting/LIM2/GLS/UBS?  [[BR]]    -online coarsening  [[BR]] 
     244  ''' Science Reviewer:''' Martin Vancoppenolle <martin.vancoppenolle@locean-ipsl.upmc.fr>,"Andrew C. Coward" <acc@noc.ac.uk>,Gurvan Madec <Gurvan.Madec@locean-ipsl.upmc.fr>                                   [[BR]]    ''' System Reviewer:'''  N/A                                      [[BR]]                                          ''' Deadline:''' [[BR]]                                          ''' Priority:''' medium                                        [[BR]]                                          ''' Depends on: '''implementation of online coarsening                                      [[BR]]                                         ''' Principal Investigator : ''' Clement Bricaud <cbricaud@mercator-ocean.fr>,Romain Bourdallé-Badie <rbourdal@mercator-ocean.fr>, Jerome Chanut <jchanut@mercator-ocean.fr>   [[BR]][[BR]] 
     245 
    233246 
    234247==== ROBUSTNESS-10 / CNRS - Evolution of the Collaborative Development Environment (CDE) ==== 
     
    246259 * New website or new full CDE if NEMO ST not satisfied with this new architecture 
    247260 
    248 '''Science '''Pre-viewer''':'''[[BR]]'''System '''Pre-viewer''':''' NEMO officers (Dorotea Iovino, Emanuela Clementi, Andrew Coward, Clément Bricaud, Tim Graham & Simona Flavoni)[[BR]]'''Deadline:'''  Q1 2016 for 1st phase, Q3 2016 for 2nd phase[[BR]]'''Priority:''' High[[BR]]'''Depends on:'''   the involvement of all ST members for contributing in one way or another (technical support, page content creation or updating, ...)[[BR]]'''Principal Investigator: '''Nicolas Martin[[BR]] 
     261  '''Science '''Pre-viewer''':'''[[BR]]'''System '''Pre-viewer''':''' NEMO officers (Dorotea Iovino, Emanuela Clementi, Andrew Coward, Clément Bricaud, Tim Graham & Simona Flavoni)[[BR]]'''Deadline:'''  Q1 2016 for 1st phase, Q3 2016 for 2nd phase[[BR]]'''Priority:''' High[[BR]]'''Depends on:'''   the involvement of all ST members for contributing in one way or another (technical support, page content creation or updating, ...)[[BR]]'''Principal Investigator: '''Nicolas Martin[[BR]] 
     262 
     263 
     264==== ROBUST-10/MERCATOR-6  -  TOP online coarsening ==== 
     265'''                                        Motivation: '''run online top/pisces with lower resolution than physics      [[BR]]                                         '''                                        Status : ''' developped on NEMO_3.6 / run with ORCA025                [[BR]]                                         '''                                        Main tasks :''' [[BR]] 
     266   -new crs routines will be added[[BR]] -change trctrp.F90,trcstp.F90, mppini. [[BR]]     -finish test of implementation with age tracer [[BR]]   -implementation in PISCES [[BR]]   -test with PISCES [[BR]] 
     267  '''                                        Science Reviewer:''' Gurvan Madec <gm@locean-ipsl.upmc.fr>                                       [[BR]]                                         '''                                        System Reviewer:''' Gurvan Madec <gm@locean-ipsl.upmc.fr>                                         [[BR]]                                         '''                                        Deadline:''' april 2015                                         [[BR]]                                         '''                                        Priority:'''  high                                        [[BR]]                                         '''                                        Depends on:'''                                         [[BR]]                                         '''                                        Principal Investigator : ''' Clement Bricaud <cbricaud@mercator-ocean.fr>,Christian Ethé <Christian.Ethe@ipsl.jussieu.fr>, Coralie Perruche <cperruche@mercator-ocean.fr> [[BR]][[BR]] 
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    250270=== '''ROBUST-12 / NOC '''- Reference manual update for v3.6 stable ===