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clem
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    5454=== '''AGRIF''' === 
    5555==== ''' '''AGRIF-1 / Met Office - Increased vertical resolution with AGRIF ==== 
    56   '''                                    Motivation:'''              Vertical grid refinement in NEMO would be a useful tool in simulating some aspects of the ocean (e.g. overflows)        [[BR]]                                '''                                    Status: '''              Started in 2015 but much more work to do                      [[BR]]                                '''                                   Main Tasks: '''                                    [[BR]]                                '''                                    Science Reviewer:'''                                                                            [[BR]]                                                                            '''                                    System Reviewer:'''                                                                            [[BR]]                                                                            '''                                    Deadline:'''                                    [[BR]]                                                                            '''                                    Priority:'''               Medium                     [[BR]]       '''       Depends on:'''                                                                            [[BR]]                                                                            '''                                    Principal Investigator : '''       Tim Graham 
     56  '''                                     Motivation:'''               Vertical grid refinement in NEMO would be a useful tool in simulating some aspects of the ocean (e.g. overflows)        [[BR]]                                 '''                                     Status: '''               Started in 2015 but much more work to do                      [[BR]]                                 '''                                    Main Tasks: '''                                     [[BR]]                                 '''                                     Science Reviewer:'''                                                                             [[BR]]                                                                             '''                                     System Reviewer:'''                                                                             [[BR]]                                                                             '''                                     Deadline:'''                                     [[BR]]                                                                             '''                                     Priority:'''                Medium                     [[BR]]        '''        Depends on:'''                                                                             [[BR]]                                                                             '''                                     Principal Investigator : '''        Tim Graham 
    5757 
    5858====  ==== 
     
    6060====  ==== 
    6161==== AGRIF-2 / CNRS - Assessment of LIM3 with AGRIF ==== 
    62   '''                                    Motivation:'''    Assess the grid refinement with LIM3, since LIM3 is consolidated in NEMO and should remain the only sea-ice model in the system[[BR]]                                '''                                    Status: '''   Not yet tarted in 2015 [[BR]]                                '''                                   Main Tasks: '''                                    [[BR]]                                '''                                    Science Reviewer:'''                                                                            [[BR]]                                                                            '''                                    System Reviewer:'''                                                                            [[BR]]                                                                            '''                                    Deadline:'''                                    [[BR]]                                                                            '''                                    Priority:'''             High                     [[BR]]            '''            Depends on:'''                                                                            [[BR]]                                                                            '''                                    Principal Investigator :'''    Clément Rousset 
     62  '''                                     Motivation:''' enable the use of AGRIF with LIM3 since LIM3 is the reference sea ice model in NEMO and LIM2 will soon be removed[[BR]]                                 '''                                     Status: '''    Not yet started in 2015 [[BR]]                                 '''                                    Main Tasks: '''AGRIF already works with LIM2, so the strategy here will be to adapt what is done in LIM2 to LIM3.                                     [[BR]]                                 '''                                     Science Reviewer:'''                                                                             [[BR]]                                                                             '''                                     System Reviewer:'''                                                                             [[BR]]                                                                             '''                                     Deadline: '''end of 2016                                     [[BR]]                                                                             '''                                     Priority:'''              High                     [[BR]]             '''             Depends on:'''                                                                             [[BR]]                                                                             '''                                     Principal Investigator :'''     Clément Rousset 
    6363 
    6464===  === 
    6565==== AGRIF-3 / Mercator Océan - Agrif + vvl (two way nesting) ==== 
    66   '''    Motivation:'''     Enable the use of agrif with temporally varying vertical grid (e.g. with zstar or ztilde coordinates) [[BR]]    '''    Status: '''    Started in 2015. One way nesting is ok, two way nesting needs to be finalized. [[BR]]    '''    Main Tasks: '''    [[BR]]    '''    Science Reviewer:'''     [[BR]]    '''    System Reviewer:'''     [[BR]]    '''    Deadline:'''     [[BR]]    '''    Priority:'''     High [[BR]]    '''    Depends on:'''     [[BR]]    '''    Principal Investigator :'''     Jérôme Chanut 
     66  '''     Motivation:'''      Enable the use of agrif with temporally varying vertical grid (e.g. with zstar or ztilde coordinates) [[BR]]     '''     Status: '''     Started in 2015. One way nesting is ok, two way nesting needs to be finalized. [[BR]]     '''     Main Tasks: '''     [[BR]]     '''     Science Reviewer:'''      [[BR]]     '''     System Reviewer:'''      [[BR]]     '''     Deadline:'''      [[BR]]     '''     Priority:'''      High [[BR]]     '''     Depends on:'''      [[BR]]     '''     Principal Investigator :'''      Jérôme Chanut 
    6767 
    6868===  === 
     
    7474'''                Motivation:''' Grouping communications (lbc_lnk) together is more efficient than several separate lbc_lnk calls. [[BR]] 
    7575 
    76   '''                               Status: '''              lbc_lnk_multi in 3.6                 [[BR]]                           '''                              Main Tasks: '''              Extend functionality of lbc_lnk_multi to 3D (or 4D variables). Find calls to lbc_lnk that can be replaced with lbc_lnk_multi.                 [[BR]]                           '''                               Science Reviewer:'''                                                                       [[BR]]                                                                       '''                               System Reviewer:'''                                                                       [[BR]]                                                                       '''                               Deadline:'''                               [[BR]]                                                                       '''                               Priority:'''                               [[BR]]                                                                       '''                               Depends on:'''                                                                       [[BR]]                                                                       '''                               Principal Investigator : '''              Miguel Castrillo 
     76  '''                                Status: '''               lbc_lnk_multi in 3.6                 [[BR]]                            '''                               Main Tasks: '''               Extend functionality of lbc_lnk_multi to 3D (or 4D variables). Find calls to lbc_lnk that can be replaced with lbc_lnk_multi.                 [[BR]]                            '''                                Science Reviewer:'''                                                                        [[BR]]                                                                        '''                                System Reviewer:'''                                                                        [[BR]]                                                                        '''                                Deadline:'''                                [[BR]]                                                                        '''                                Priority:'''                                [[BR]]                                                                        '''                                Depends on:'''                                                                        [[BR]]                                                                        '''                                Principal Investigator : '''               Miguel Castrillo 
    7777 
    7878==== ''' '''HPC-3 / Barcelona - Suppress useless communications ==== 
    7979'''                Motivation:''' Suppress unnecessary calls to lbc_lnk. 
    8080 
    81   [[BR]]                           '''                               Status: '''                           [[BR]]                           '''                              Main Tasks: '''              Use a script to search for and test impact of removing lbc_lnk calls from the model code. Determine whether communications used for diagnostic purposes can be suppressed.               [[BR]]                           '''                               Science Reviewer:'''                                                                       [[BR]]                                                                       '''                               System Reviewer:'''                                                                       [[BR]]                                                                       '''                               Deadline:'''                               [[BR]]                                                                       '''                               Priority:'''                               [[BR]]                                                                       '''                               Depends on:'''                                                                       [[BR]]                                                                       '''                               Principal Investigator : '''              Tim Graham 
     81  [[BR]]                            '''                                Status: '''                            [[BR]]                            '''                               Main Tasks: '''               Use a script to search for and test impact of removing lbc_lnk calls from the model code. Determine whether communications used for diagnostic purposes can be suppressed.               [[BR]]                            '''                                Science Reviewer:'''                                                                        [[BR]]                                                                        '''                                System Reviewer:'''                                                                        [[BR]]                                                                        '''                                Deadline:'''                                [[BR]]                                                                        '''                                Priority:'''                                [[BR]]                                                                        '''                                Depends on:'''                                                                        [[BR]]                                                                        '''                                Principal Investigator : '''               Tim Graham 
    8282 
    8383==== ''' '''HPC-4 / CMCC - Scalability with MPI-OPENMP ==== 
    8484'''                Motivation:''' Improving NEMO scalability. 
    8585 
    86   [[BR]]                           '''                               Status: '''                continuation of 2015 dev CMCC-1            [[BR]]                           '''                              Main Tasks: '''              1. the activity started at the end of 2013 with the analysis of three OpenMP approaches (implemented using “mini-apps”) on several multicore architectures; the second step was the implementation of the hybrid version of the GYRE configuration using the best OpenMP approach. Results in terms of scalability were not so good. Thus, the porting and the analysis of the hybrid version (using “mini-apps”) on many core architectures (e.g. Xeon Phi) is needed, before extending the hybrid OpenMP/MPI approach to the entire code, in order to justify the effort of the development. This analysis is carrying out in 2015. The extension of the hybrid implementation on the entire code will depend on the results of this analysis. 2. analysis of scalability improvement using MPI3 new communications (e.g. collective neighbours communications), instead of point to point communications              [[BR]]                           '''                               Science Reviewer:'''                                                                       [[BR]]                                                                       '''                               System Reviewer:'''                                                                       [[BR]]                                                                       '''                               Deadline:'''                               [[BR]]                                                                       '''                               Priority:'''                HIGH               [[BR]]                                                                       '''                               Depends on:'''               results of the same action in 2015             [[BR]]                                                                       '''                               Principal Investigator : '''              Silvia Mocavero 
     86  [[BR]]                            '''                                Status: '''                 continuation of 2015 dev CMCC-1            [[BR]]                            '''                               Main Tasks: '''               1. the activity started at the end of 2013 with the analysis of three OpenMP approaches (implemented using “mini-apps”) on several multicore architectures; the second step was the implementation of the hybrid version of the GYRE configuration using the best OpenMP approach. Results in terms of scalability were not so good. Thus, the porting and the analysis of the hybrid version (using “mini-apps”) on many core architectures (e.g. Xeon Phi) is needed, before extending the hybrid OpenMP/MPI approach to the entire code, in order to justify the effort of the development. This analysis is carrying out in 2015. The extension of the hybrid implementation on the entire code will depend on the results of this analysis. 2. analysis of scalability improvement using MPI3 new communications (e.g. collective neighbours communications), instead of point to point communications              [[BR]]                            '''                                Science Reviewer:'''                                                                        [[BR]]                                                                        '''                                System Reviewer:'''                                                                        [[BR]]                                                                        '''                                Deadline:'''                                [[BR]]                                                                        '''                                Priority:'''                 HIGH               [[BR]]                                                                        '''                                Depends on:'''                results of the same action in 2015             [[BR]]                                                                        '''                                Principal Investigator : '''               Silvia Mocavero 
    8787 
    8888==== ''' '''HPC-5 / NERC - Implement larger haloes ==== 
    8989'''                Motivation:''' Improving NEMO scalability. 
    9090 
    91   [[BR]]                           '''                               Status: '''                New implementation - old idea           [[BR]]                           '''                              Main Tasks: '''                  Investigate the benefits of using larger halo to reduce the communication frequency and hence improve performance and scalability. This is likely to be most influential in the barotropic time-splitting where it should be possible to emulate earlier solutions for the iterative solvers. Extension to the rest of the code will be considered subject to an impact assessment.         [[BR]]                           '''                               Science Reviewer:'''                                                                       [[BR]]                                                                       '''                               System Reviewer:'''                                                                       [[BR]]                                                                       '''                               Deadline:'''                               [[BR]]                                                                       '''                               Priority:'''                HIGH               [[BR]]                                                                       '''                               Depends on:'''                          [[BR]]                                                                       '''                               Principal Investigator : '''              Andrew Coward 
     91  [[BR]]                            '''                                Status: '''                 New implementation - old idea           [[BR]]                            '''                               Main Tasks: '''                   Investigate the benefits of using larger halo to reduce the communication frequency and hence improve performance and scalability. This is likely to be most influential in the barotropic time-splitting where it should be possible to emulate earlier solutions for the iterative solvers. Extension to the rest of the code will be considered subject to an impact assessment.         [[BR]]                            '''                                Science Reviewer:'''                                                                        [[BR]]                                                                        '''                                System Reviewer:'''                                                                        [[BR]]                                                                        '''                                Deadline:'''                                [[BR]]                                                                        '''                                Priority:'''                 HIGH               [[BR]]                                                                        '''                                Depends on:'''                           [[BR]]                                                                        '''                                Principal Investigator : '''               Andrew Coward 
    9292 
    9393===  === 
     
    9696'''Motivation:''' Introduce a vertical physics manager that allows to save MPP communications 
    9797 
    98   '''        Status: '''         Already started[[BR]]        '''        Main Tasks: '''         [[BR]]        '''        Science Reviewer:'''         [[BR]]        '''        System Reviewer:'''         [[BR]]        '''        Deadline:'''         [[BR]]        '''        Priority:'''         High[[BR]]        '''        Depends on:'''         [[BR]]        '''        Principal Investigator : '''        Gurvan Madec 
     98  '''         Status: '''          Already started[[BR]]         '''         Main Tasks: '''          [[BR]]         '''         Science Reviewer:'''          [[BR]]         '''         System Reviewer:'''          [[BR]]         '''         Deadline:'''          [[BR]]         '''         Priority:'''          High[[BR]]         '''         Depends on:'''          [[BR]]         '''         Principal Investigator : '''         Gurvan Madec 
    9999 
    100100=== '''Configuration Manager''' === 
     
    136136'''                 Motivation: '''SEABASS is the reference configuration for Data Assimilation, included  in the NEMO v3.4_STABLE version. Various data assimilation experiments  have been done with this configuration, with various data assimilation  systems (e.g. Cosme et al, 2011, Bouttier et al. 2014, Yin et al.,  2014). In this context, this configuration appears to be useful for data  assimilation users, to couple their own DA system on NEMO and compare  their results with thgose obtained on this configuration. SEABASS is  also easy to take in hand. Also, it allows to update the configuration  status to the future version of NEMO. For these reasons, this  configuration is a relevant test case for Data Assimilation. [[BR]]             '''                 Status: '''                 [[BR]]             '''                Main Tasks: '''                 [[BR]]             '''                 Science Reviewer:'''                                                         [[BR]]                                                         '''                 System Reviewer:'''                                                         [[BR]]                                                         '''                 Deadline:'''                 [[BR]]                                                         '''                 Priority:'''                 [[BR]]                                                         '''                 Depends on:'''                                                         [[BR]]                                                         '''                 Principal Investigator: '''Pierre-Antoine Bouttier 
    137137 
    138 ==== ''' '''ROBUSTNESS-2 / Met Office - Improvements to EEN scheme with partial steps  ==== 
     138==== ''' '''ROBUSTNESS-2 / Met Office - Improvements to EEN scheme with partial steps ==== 
    139139'''                 Motivation: ''' Following investigative work by Nicolas Ducousso it became clear that the EEN scheme in NEMO did not perform as expected in idealised test cases. Although a fix was implemented that improved the performance in idealised test cases the performance in realistic simulations (e.g. ORCA025) is worse. It is not clear that the new or old formulation is correct for the case of sloping bathymetry and partial steps. 
    140  [[BR]]             '''                 Status: '''                 [[BR]]             '''                Main Tasks: '''                 [[BR]]             '''                 Science Reviewer:'''                                                         [[BR]]                                                         '''                 System Reviewer:'''                                                         [[BR]]                                                         '''                 Deadline:'''                 [[BR]]                                                         '''                 Priority:'''                 [[BR]]                                                         '''                 Depends on:'''                                                         [[BR]]          
     140 
     141  [[BR]]              '''                  Status: '''                  [[BR]]              '''                 Main Tasks: '''                  [[BR]]              '''                  Science Reviewer:'''                                                          [[BR]]                                                          '''                  System Reviewer:'''                                                          [[BR]]                                                          '''                  Deadline:'''                  [[BR]]                                                          '''                  Priority:'''                  [[BR]]                                                          '''                  Depends on:'''                                                          [[BR]] 
    141142 
    142143'''ROBUSTNESS-3 / CNRS - Academic test cases in the system'''