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2016WP/2016SharedActions (diff) – NEMO

Changes between Version 60 and Version 61 of 2016WP/2016SharedActions


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2016-01-05T12:55:04+01:00 (8 years ago)
Author:
mocavero
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    v60 v61  
    6565=== '''AGRIF''' === 
    6666==== ''' '''AGRIF-1 / Met Office - Increased vertical resolution with AGRIF ==== 
    67   '''                                              Motivation:'''                        Vertical grid refinement in NEMO would be a useful tool in simulating some aspects of the ocean (e.g. overflows)        [[BR]]                                          '''                                              Status: '''                        Started in 2015 but much more work to do                      [[BR]]                                          '''                                             Main Tasks: '''                                              [[BR]]                                          '''                                              Science Reviewer:'''                                                                                      [[BR]]                                                                                      '''                                              System Reviewer:'''                                                                                      [[BR]]                                                                                      '''                                              Deadline:'''                                              [[BR]]                                                                                      '''                                              Priority:'''                         Medium                     [[BR]]                 '''                 Depends on:'''                                                                                      [[BR]]                                                                                      '''                                              Principal Investigator : '''                 Tim Graham 
     67  '''                                               Motivation:'''                         Vertical grid refinement in NEMO would be a useful tool in simulating some aspects of the ocean (e.g. overflows)        [[BR]]                                           '''                                               Status: '''                         Started in 2015 but much more work to do                      [[BR]]                                           '''                                              Main Tasks: '''                                               [[BR]]                                           '''                                               Science Reviewer:'''                                                                                       [[BR]]                                                                                       '''                                               System Reviewer:'''                                                                                       [[BR]]                                                                                       '''                                               Deadline:'''                                               [[BR]]                                                                                       '''                                               Priority:'''                          Medium                     [[BR]]                  '''                  Depends on:'''                                                                                       [[BR]]                                                                                       '''                                               Principal Investigator : '''                  Tim Graham 
    6868 
    6969====  ==== 
     
    7171====  ==== 
    7272==== AGRIF-2 / CNRS - Assessment of LIM3 with AGRIF ==== 
    73   '''                                              Motivation:'''          enable the use of AGRIF with LIM3 since LIM3 is the reference sea ice model in NEMO and LIM2 will soon be removed[[BR]]                                          '''                                              Status: '''             Not yet started in 2015 [[BR]]                                          '''                                             Main Tasks: '''         AGRIF already works with LIM2, so the strategy here will be to adapt what is done in LIM2 to LIM3.                                     [[BR]]                                          '''                                              Science Reviewer:'''                                                                                      [[BR]]                                                                                      '''                                              System Reviewer:'''                                                                                      [[BR]]                                                                                      '''                                              Deadline: '''         end of 2016                                     [[BR]]                                                                                      '''                                              Priority:'''                       High                     [[BR]]                      '''                      Depends on:'''                                                                                      [[BR]]                                                                                      '''                                              Principal Investigator :'''              Clément Rousset 
     73  '''                                               Motivation:'''           enable the use of AGRIF with LIM3 since LIM3 is the reference sea ice model in NEMO and LIM2 will soon be removed[[BR]]                                           '''                                               Status: '''              Not yet started in 2015 [[BR]]                                           '''                                              Main Tasks: '''          AGRIF already works with LIM2, so the strategy here will be to adapt what is done in LIM2 to LIM3.                                     [[BR]]                                           '''                                               Science Reviewer:'''                                                                                       [[BR]]                                                                                       '''                                               System Reviewer:'''                                                                                       [[BR]]                                                                                       '''                                               Deadline: '''          end of 2016                                     [[BR]]                                                                                       '''                                               Priority:'''                        High                     [[BR]]                       '''                       Depends on:'''                                                                                       [[BR]]                                                                                       '''                                               Principal Investigator :'''               Clément Rousset 
    7474 
    7575===  === 
    7676==== AGRIF-3 / Mercator Océan - Agrif + vvl (two way nesting) ==== 
    77   '''              Motivation:'''               Enable the use of agrif with temporally varying vertical grid (e.g. with zstar or ztilde coordinates) [[BR]]              '''              Status: '''              Started in 2015. One way nesting is ok, two way nesting needs to be finalized. [[BR]]              '''              Main Tasks: '''              [[BR]]              '''              Science Reviewer:'''               [[BR]]              '''              System Reviewer:'''               [[BR]]              '''              Deadline:'''               [[BR]]              '''              Priority:'''               High [[BR]]              '''              Depends on:'''               [[BR]]              '''              Principal Investigator :'''               Jérôme Chanut 
     77  '''               Motivation:'''                Enable the use of agrif with temporally varying vertical grid (e.g. with zstar or ztilde coordinates) [[BR]]               '''               Status: '''               Started in 2015. One way nesting is ok, two way nesting needs to be finalized. [[BR]]               '''               Main Tasks: '''               [[BR]]               '''               Science Reviewer:'''                [[BR]]               '''               System Reviewer:'''                [[BR]]               '''               Deadline:'''                [[BR]]               '''               Priority:'''                High [[BR]]               '''               Depends on:'''                [[BR]]               '''               Principal Investigator :'''                Jérôme Chanut 
    7878 
    7979===  === 
     
    9191'''                Motivation:''' Grouping communications (lbc_lnk) together is more efficient than several separate lbc_lnk calls. [[BR]] 
    9292 
    93   '''                                         Status: '''                        lbc_lnk_multi in 3.6                 [[BR]]                                     '''                                        Main Tasks: '''                        Extend functionality of lbc_lnk_multi to 3D (or 4D variables). Find calls to lbc_lnk that can be replaced with lbc_lnk_multi.                 [[BR]]                                     '''                                         Science Reviewer:'''                                                                                 [[BR]]                                                                                 '''                                         System Reviewer:'''                                                                                 [[BR]]                                                                                 '''                                         Deadline:'''                                         [[BR]]                                                                                 '''                                         Priority:'''                                         [[BR]]                                                                                 '''                                         Depends on:'''                                                                                 [[BR]]                                                                                 '''                                         Principal Investigator : '''                        Miguel Castrillo 
     93  '''                                          Status: '''                         lbc_lnk_multi in 3.6                 [[BR]]                                      '''                                         Main Tasks: '''                         Extend functionality of lbc_lnk_multi to 3D (or 4D variables). Find calls to lbc_lnk that can be replaced with lbc_lnk_multi.                 [[BR]]                                      '''                                          Science Reviewer:'''                                                                                  [[BR]]                                                                                  '''                                          System Reviewer:'''                                                                                  [[BR]]                                                                                  '''                                          Deadline:'''                                          [[BR]]                                                                                  '''                                          Priority:'''                                          [[BR]]                                                                                  '''                                          Depends on:'''                                                                                  [[BR]]                                                                                  '''                                          Principal Investigator : '''                         Miguel Castrillo 
    9494 
    9595==== ''' '''HPC-3 / Barcelona - Suppress useless communications ==== 
    9696'''                Motivation:''' Suppress unnecessary calls to lbc_lnk. 
    9797 
    98   [[BR]]                                     '''                                         Status: '''                                     [[BR]]                                     '''                                        Main Tasks: '''                        Use a script to search for and test impact of removing lbc_lnk calls from the model code. Determine whether communications used for diagnostic purposes can be suppressed.               [[BR]]                                     '''                                         Science Reviewer:'''                                                                                 [[BR]]                                                                                 '''                                         System Reviewer:'''                                                                                 [[BR]]                                                                                 '''                                         Deadline:'''                                         [[BR]]                                                                                 '''                                         Priority:'''                                         [[BR]]                                                                                 '''                                         Depends on:'''                                                                                 [[BR]]                                                                                 '''                                         Principal Investigator : '''                        Tim Graham 
     98  [[BR]]                                      '''                                          Status: '''                                      [[BR]]                                      '''                                         Main Tasks: '''                         Use a script to search for and test impact of removing lbc_lnk calls from the model code. Determine whether communications used for diagnostic purposes can be suppressed.               [[BR]]                                      '''                                          Science Reviewer:'''                                                                                  [[BR]]                                                                                  '''                                          System Reviewer:'''                                                                                  [[BR]]                                                                                  '''                                          Deadline:'''                                          [[BR]]                                                                                  '''                                          Priority:'''                                          [[BR]]                                                                                  '''                                          Depends on:'''                                                                                  [[BR]]                                                                                  '''                                          Principal Investigator : '''                         Tim Graham 
    9999 
    100100==== ''' '''HPC-4 / CMCC - Scalability with MPI-OPENMP ==== 
    101101'''                Motivation:''' Improving NEMO scalability. 
    102102 
    103 '''Status: '''                          continuation of 2015 dev CMCC-1 [[BR]]'''Main Tasks:''' 
     103'''Status: '''                          continuation of 2015 dev CMCC-1 [[BR]]'''Main Tasks:''' 
     104 
    104105 * the activity started at the end of 2013 with the analysis of three OpenMP approaches (implemented using “mini-apps”) on several multicore architectures; the second step was the implementation of the hybrid version of the GYRE configuration using the best OpenMP approach. Some improvements to the implementation have been performed by Intel to match Intel architectures. During 2016, the extension of the hybrid implementation to the entire code is planned 
    105106 * analysis of scalability improvement using MPI3 new communications (e.g. collective neighbours communications), instead of point to point communications 
    106107 
    107 '''        Science Reviewer:''' Prof. Giovanni Aloisio (University of Salento & CMCC)[[BR]]'''        System Reviewer:''' [[BR]]'''        Deadline:''' December 2016[[BR]]'''        Priority:''' HIGH [[BR]]'''        Depends on:''' results of the same action in 2015[[BR]]'''        Principal Investigator : '''Silvia Mocavero 
     108'''        Science Reviewer:''' Prof. G. Aloisio (University of Salento & CMCC)[[BR]]'''        System Reviewer:''' [[BR]]'''        Deadline:''' December 2016[[BR]]'''        Priority:''' HIGH [[BR]]'''        Depends on:''' results of the same action in 2015[[BR]]'''        Principal Investigator : '''Silvia Mocavero 
    108109 
    109110==== ''' '''HPC-5 / NERC - Implement larger haloes ==== 
    110111'''                Motivation:''' Improving NEMO scalability. 
    111112 
    112   [[BR]]                                     '''                                         Status: '''                          New implementation - old idea           [[BR]]                                     '''                                        Main Tasks: '''                            Investigate the benefits of using larger halo to reduce the communication frequency and hence improve performance and scalability. This is likely to be most influential in the barotropic time-splitting where it should be possible to emulate earlier solutions for the iterative solvers. Extension to the rest of the code will be considered subject to an impact assessment.         [[BR]]                                     '''                                         Science Reviewer:'''                                                                                 [[BR]]                                                                                 '''                                         System Reviewer:'''                                                                                 [[BR]]                                                                                 '''                                         Deadline:'''                                         [[BR]]                                                                                 '''                                         Priority:'''                          HIGH               [[BR]]                                                                                 '''                                         Depends on:'''                                    [[BR]]                                                                                 '''                                         Principal Investigator : '''                        Andrew Coward 
     113  [[BR]]                                      '''                                          Status: '''                           New implementation - old idea           [[BR]]                                      '''                                         Main Tasks: '''                             Investigate the benefits of using larger halo to reduce the communication frequency and hence improve performance and scalability. This is likely to be most influential in the barotropic time-splitting where it should be possible to emulate earlier solutions for the iterative solvers. Extension to the rest of the code will be considered subject to an impact assessment.         [[BR]]                                      '''                                          Science Reviewer:'''                                                                                  [[BR]]                                                                                  '''                                          System Reviewer:'''                                                                                  [[BR]]                                                                                  '''                                          Deadline:'''                                          [[BR]]                                                                                  '''                                          Priority:'''                           HIGH               [[BR]]                                                                                  '''                                          Depends on:'''                                     [[BR]]                                                                                  '''                                          Principal Investigator : '''                         Andrew Coward 
    113114 
    114115===  === 
     
    117118'''Motivation:''' Introduce a vertical physics manager that allows to save MPP communications 
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    119   '''                  Status: '''                   Already started[[BR]]                  '''                  Main Tasks: '''                   [[BR]]                  '''                  Science Reviewer:'''                   [[BR]]                  '''                  System Reviewer:'''                   [[BR]]                  '''                  Deadline:'''                   [[BR]]                  '''                  Priority:'''                   High[[BR]]                  '''                  Depends on:'''                   [[BR]]                  '''                  Principal Investigator : '''                  Gurvan Madec 
     120  '''                   Status: '''                    Already started[[BR]]                   '''                   Main Tasks: '''                    [[BR]]                   '''                   Science Reviewer:'''                    [[BR]]                   '''                   System Reviewer:'''                    [[BR]]                   '''                   Deadline:'''                    [[BR]]                   '''                   Priority:'''                    High[[BR]]                   '''                   Depends on:'''                    [[BR]]                   '''                   Principal Investigator : '''                   Gurvan Madec 
    120121 
    121122==== SIMPLIF-2 / CNRS - Simplification of configurations, introduction of user-defined module ==== 
     
    180181'''                 Motivation: ''' Following investigative work by Nicolas Ducousso it became clear that the EEN scheme in NEMO did not perform as expected in idealised test cases. Although a fix was implemented that improved the performance in idealised test cases the performance in realistic simulations (e.g. ORCA025) is worse. It is not clear that the new or old formulation is correct for the case of sloping bathymetry and partial steps. 
    181182 
    182   [[BR]]                       '''                           Status: '''                           [[BR]]                       '''                          Main Tasks: '''                           [[BR]]                       '''                           Science Reviewer:'''                                                                   [[BR]]                                                                   '''                           System Reviewer:'''                                                                   [[BR]]                                                                   '''                           Deadline:'''                           [[BR]]                                                                   '''                           Priority:'''                           [[BR]]                                                                   '''                           Depends on:'''                                                                   [[BR]] 
     183  [[BR]]                        '''                            Status: '''                            [[BR]]                        '''                           Main Tasks: '''                            [[BR]]                        '''                            Science Reviewer:'''                                                                    [[BR]]                                                                    '''                            System Reviewer:'''                                                                    [[BR]]                                                                    '''                            Deadline:'''                            [[BR]]                                                                    '''                            Priority:'''                            [[BR]]                                                                    '''                            Depends on:'''                                                                    [[BR]] 
    183184 
    184185'''ROBUSTNESS-3 / CNRS - Academic test cases in the system'''