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2016WP/2016SharedActions (diff) – NEMO

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2016-02-08T05:02:43+01:00 (8 years ago)
Author:
flavoni
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    v77 v78  
    6767=== '''AGRIF''' === 
    6868==== ''' '''AGRIF-1 / Met Office - Increased vertical resolution with AGRIF ==== 
    69   '''                                                              Motivation:'''                                        Vertical grid refinement in NEMO would be a useful tool in simulating some aspects of the ocean (e.g. overflows)        [[BR]]                                                          '''                                                              Status: '''                                        Started in 2015 but much more work to do                      [[BR]]                                                          '''                                                             Main Tasks: '''                                                              [[BR]]                                                          '''                                                              Science Pre-viewer:'''                                                                                                      [[BR]]                                                                                                      '''                                                              System '''    Pre-viewer'''    :'''                                                                                                      [[BR]]                                                                                                      '''                                                              Deadline:'''                                                              [[BR]]                                                                                                      '''                                                              Priority:'''                                         Medium                     [[BR]]                                 '''                                 Depends on:'''                                                                                                      [[BR]]                                                                                                      '''                                                              Principal Investigator : '''                                 Tim Graham 
     69  '''                                                               Motivation:'''                                         Vertical grid refinement in NEMO would be a useful tool in simulating some aspects of the ocean (e.g. overflows)        [[BR]]                                                           '''                                                               Status: '''                                         Started in 2015 but much more work to do                      [[BR]]                                                           '''                                                              Main Tasks: '''                                                               [[BR]]                                                           '''                                                               Science Pre-viewer:'''                                                                                                       [[BR]]                                                                                                       '''                                                               System '''     Pre-viewer'''     :'''                                                                                                       [[BR]]                                                                                                       '''                                                               Deadline:'''                                                               [[BR]]                                                                                                       '''                                                               Priority:'''                                          Medium                     [[BR]]                                  '''                                  Depends on:'''                                                                                                       [[BR]]                                                                                                       '''                                                               Principal Investigator : '''                                  Tim Graham 
    7070 
    7171====  ==== 
     
    7373====  ==== 
    7474==== AGRIF-2 / CNRS - Assessment of LIM3 with AGRIF ==== 
    75   '''                                                              Motivation:'''                          enable the use of AGRIF with LIM3 since LIM3 is the reference sea ice model in NEMO and LIM2 will soon be removed[[BR]]                                                          '''                                                              Status: '''                             Not yet started in 2015 [[BR]]                                                          '''                                                             Main Tasks: '''                         AGRIF already works with LIM2, so the strategy here will be to adapt what is done in LIM2 to LIM3.                                     [[BR]]                                                          '''                                                              Science '''    Pre-viewer'''    :'''                                                                                                      [[BR]]                                                                                                      '''                                                              System '''    Pre-viewer'''    :'''                                                                                                      [[BR]]                                                                                                      '''                                                              Deadline: '''                         end of 2016                                     [[BR]]                                                                                                      '''                                                              Priority:'''                                       High                     [[BR]]                                      '''                                      Depends on:'''                                                                                                      [[BR]]                                                                                                      '''                                                              Principal Investigator :'''                              Clément Rousset 
     75  '''                                                               Motivation:'''                           enable the use of AGRIF with LIM3 since LIM3 is the reference sea ice model in NEMO and LIM2 will soon be removed[[BR]]                                                           '''                                                               Status: '''                              Not yet started in 2015 [[BR]]                                                           '''                                                              Main Tasks: '''                          AGRIF already works with LIM2, so the strategy here will be to adapt what is done in LIM2 to LIM3.                                     [[BR]]                                                           '''                                                               Science '''     Pre-viewer'''     :'''                                                                                                       [[BR]]                                                                                                       '''                                                               System '''     Pre-viewer'''     :'''                                                                                                       [[BR]]                                                                                                       '''                                                               Deadline: '''                          end of 2016                                     [[BR]]                                                                                                       '''                                                               Priority:'''                                        High                     [[BR]]                                       '''                                       Depends on:'''                                                                                                       [[BR]]                                                                                                       '''                                                               Principal Investigator :'''                               Clément Rousset 
    7676 
    7777===  === 
    7878==== AGRIF-3 / Mercator Océan - Agrif + vvl (two way nesting) ==== 
    79   '''                              Motivation:'''                               Enable the use of agrif with temporally varying vertical grid (e.g. with zstar or ztilde coordinates) [[BR]]                              '''                              Status: '''                              Started in 2015. One way nesting is ok, two way nesting needs to be finalized. [[BR]]                              '''                              Main Tasks: '''                              [[BR]]                              '''                              Science '''    Pre-viewer'''    :'''                               [[BR]]                              '''                              System '''    Pre-viewer'''    :'''                               [[BR]]                              '''                              Deadline:'''                               [[BR]]                              '''                              Priority:'''                               High [[BR]]                              '''                              Depends on:'''                               [[BR]]                              '''                              Principal Investigator :'''                               Jérôme Chanut 
     79  '''                               Motivation:'''                                Enable the use of agrif with temporally varying vertical grid (e.g. with zstar or ztilde coordinates) [[BR]]                               '''                               Status: '''                               Started in 2015. One way nesting is ok, two way nesting needs to be finalized. [[BR]]                               '''                               Main Tasks: '''                               [[BR]]                               '''                               Science '''     Pre-viewer'''     :'''                                [[BR]]                               '''                               System '''     Pre-viewer'''     :'''                                [[BR]]                               '''                               Deadline:'''                                [[BR]]                               '''                               Priority:'''                                High [[BR]]                               '''                               Depends on:'''                                [[BR]]                               '''                               Principal Investigator :'''                                Jérôme Chanut 
    8080 
    8181===  === 
     
    9393'''                Motivation:''' Grouping communications (lbc_lnk) together is more efficient than several separate lbc_lnk calls. [[BR]] 
    9494 
    95   '''                                                         Status: '''                                        lbc_lnk_multi in 3.6                 [[BR]]                                                     '''                                                        Main Tasks: '''                                        Extend functionality of lbc_lnk_multi to 3D (or 4D variables). Find calls to lbc_lnk that can be replaced with lbc_lnk_multi.                 [[BR]]                                                     '''                                                         Science '''    Pre-viewer'''    :'''                                                                                                 [[BR]]                                                                                                 '''                                                         System '''    Pre-viewer'''    :'''                                                                                                 [[BR]]                                                                                                 '''                                                         Deadline:'''                                                         [[BR]]                                                                                                 '''                                                         Priority:'''                                                         [[BR]]                                                                                                 '''                                                         Depends on:'''                                                                                                 [[BR]]                                                                                                 '''                                                         Principal Investigator : '''                                        Miguel Castrillo 
     95  '''                                                          Status: '''                                         lbc_lnk_multi in 3.6                 [[BR]]                                                      '''                                                         Main Tasks: '''                                         Extend functionality of lbc_lnk_multi to 3D (or 4D variables). Find calls to lbc_lnk that can be replaced with lbc_lnk_multi.                 [[BR]]                                                      '''                                                          Science '''     Pre-viewer'''     :'''                                                                                                  [[BR]]                                                                                                  '''                                                          System '''     Pre-viewer'''     :'''                                                                                                  [[BR]]                                                                                                  '''                                                          Deadline:'''                                                          [[BR]]                                                                                                  '''                                                          Priority:'''                                                          [[BR]]                                                                                                  '''                                                          Depends on:'''                                                                                                  [[BR]]                                                                                                  '''                                                          Principal Investigator : '''                                         Miguel Castrillo 
    9696 
    9797==== ''' '''HPC-3 / Met Office - Suppress useless communications ==== 
    9898'''                Motivation:''' Suppress unnecessary halo updates (calls to lbc_lnk) as these are expensive and are a barrier to increased parallelisation of NEMO. 
    9999 
    100   [[BR]]                                                     '''                                                         Status: '''                                                     [[BR]]                                                     '''                                                        Main Tasks: ''' 
     100  [[BR]]                                                      '''                                                          Status: '''                                                      [[BR]]                                                      '''                                                         Main Tasks: ''' 
    101101 
    102102 * Use a script to search for lbc_lnk calls in the model code. 
     
    117117'''                Motivation:''' Improving NEMO scalability. 
    118118 
    119   [[BR]]                                                     '''                                                         Status: '''                                          New implementation - old idea           [[BR]]                                                     '''                                                        Main Tasks: '''                                            Investigate the benefits of using larger halo to reduce the communication frequency and hence improve performance and scalability. This is likely to be most influential in the barotropic time-splitting where it should be possible to emulate earlier solutions for the iterative solvers. Extension to the rest of the code will be considered subject to an impact assessment.         [[BR]]                                                     '''                                                         Science '''    Pre-viewer'''    :'''                                                                                                 [[BR]]                                                                                                 '''                                                         System '''    Pre-viewer'''    :'''                                                                                                 [[BR]]                                                                                                 '''                                                         Deadline:'''                                                         [[BR]]                                                                                                 '''                                                         Priority:'''                                          HIGH               [[BR]]                                                                                                 '''                                                         Depends on:'''                                                    [[BR]]                                                                                                 '''                                                         Principal Investigator : '''                                        Andrew Coward 
     119  [[BR]]                                                      '''                                                          Status: '''                                           New implementation - old idea           [[BR]]                                                      '''                                                         Main Tasks: '''                                             Investigate the benefits of using larger halo to reduce the communication frequency and hence improve performance and scalability. This is likely to be most influential in the barotropic time-splitting where it should be possible to emulate earlier solutions for the iterative solvers. Extension to the rest of the code will be considered subject to an impact assessment.         [[BR]]                                                      '''                                                          Science '''     Pre-viewer'''     :'''                                                                                                  [[BR]]                                                                                                  '''                                                          System '''     Pre-viewer'''     :'''                                                                                                  [[BR]]                                                                                                  '''                                                          Deadline:'''                                                          [[BR]]                                                                                                  '''                                                          Priority:'''                                           HIGH               [[BR]]                                                                                                  '''                                                          Depends on:'''                                                     [[BR]]                                                                                                  '''                                                          Principal Investigator : '''                                         Andrew Coward 
    120120 
    121121===  === 
     
    124124'''Motivation:''' Introduce a vertical physics manager that allows to save MPP communications 
    125125 
    126   '''                                  Status: '''                                   Already started[[BR]]                                  '''                                  Main Tasks: '''                                   [[BR]]                                  '''                                  Science '''    Pre-viewer'''    :'''                                   [[BR]]                                  '''                                  System '''    Pre-viewer'''    :'''                                   [[BR]]                                  '''                                  Deadline:'''                                   [[BR]]                                  '''                                  Priority:'''                                   High[[BR]]                                  '''                                  Depends on:'''                                   [[BR]]                                  '''                                  Principal Investigator : '''                                  Gurvan Madec 
     126  '''                                   Status: '''                                    Already started[[BR]]                                   '''                                   Main Tasks: '''                                    [[BR]]                                   '''                                   Science '''     Pre-viewer'''     :'''                                    [[BR]]                                   '''                                   System '''     Pre-viewer'''     :'''                                    [[BR]]                                   '''                                   Deadline:'''                                    [[BR]]                                   '''                                   Priority:'''                                    High[[BR]]                                   '''                                   Depends on:'''                                    [[BR]]                                   '''                                   Principal Investigator : '''                                   Gurvan Madec 
    127127 
    128128==== SIMPLIF-2 / CNRS - Simplification of configurations, introduction of user-defined module ==== 
     
    142142 
    143143==== SIMPLIF-4 / CMCC - Remove key_mpp_rep ==== 
    144   '''     Motivation:'''           Set the use of MPI safe computation as a default [[BR]]                                   '''      Status :'''                   [[BR]]                  '''      Main tasks :'''           remove the use of the macro key_mpp_rep and use as a default condition the MPI safe communications  [[BR]]                  '''      Science '''    Pre-viewer'''    :'''            Gurvan Madec              [[BR]]                                          '''     System '''    Pre-viewer'''    :'''           Gurvan Madec                                  [[BR]]                                          '''     Deadline:'''                  [[BR]]                 '''     Priority:'''                                            [[BR]]                                          '''     Depends on:'''                                     [[BR]]                                          '''     Principal Investigator : '''          Dorotea Iovino 
     144  '''      Motivation:'''            Set the use of MPI safe computation as a default [[BR]]                                    '''       Status :'''                    [[BR]]                   '''       Main tasks :'''            remove the use of the macro key_mpp_rep and use as a default condition the MPI safe communications  [[BR]]                   '''       Science '''     Pre-viewer'''     :'''             Gurvan Madec              [[BR]]                                           '''      System '''     Pre-viewer'''     :'''            Gurvan Madec                                  [[BR]]                                           '''      Deadline:'''                   [[BR]]                  '''      Priority:'''                                             [[BR]]                                           '''      Depends on:'''                                      [[BR]]                                           '''      Principal Investigator : '''           Dorotea Iovino 
    145145 
    146146===  === 
     
    186186This work is included in the /2015/dev_r5936_INGV1_WAVE development branch  [[BR]]  ''' Main tasks :'''  [[BR]] •        Finalize the review and testing phase of /2015/dev_r5936_INGV1_WAVE  by January 2016  [[BR]] •        Merge the development branch into the trunk by January 2016  [[BR]] •        Continue tests on the wave-current processes implemented  [[BR]] •        Continue implementation of already defined wave-current processes:  [[BR]] 
    187187 
    188   o        Vertical mixing enhancement due to wave-current interaction;  [[BR]]   o        Contribute to the discussion on development of Langmuir circulation;  [[BR]]   o        others if agreed by the WAVE-WG.  [[BR]] 
     188  o        Vertical mixing enhancement due to wave-current interaction;  [[BR]]    o        Contribute to the discussion on development of Langmuir circulation;  [[BR]]    o        others if agreed by the WAVE-WG.  [[BR]] 
    189189 
    190190•        Meeting organization with the WAVE-WG to discuss further issues to be investigated and implemented [[BR]]    '''Science '''Pre-viewer''': ''' Nadia Pianrdi [[BR]]  ''' System '''Pre-viewer''': '''Rachid Benshila [[BR]] '''Deadline: ''' [[BR]]   '''Priority: ''' high [[BR]] '''Depends on: '''  [[BR]] '''Principal Investigator: ''' Emanuela Clementi (emanuela.clementi@ingv.it) 
     
    198198=== '''ROBUSTNESS''' === 
    199199==== ''' '''ROBUSTNESS-1 / CNRS - Integration of the SEABASS configuration as a test case ==== 
    200 '''                 Motivation: '''SEABASS is the reference configuration for Data Assimilation, included  in the NEMO v3.4_STABLE version. Various data assimilation experiments  have been done with this configuration, with various data assimilation  systems (e.g. Cosme et al, 2011, Bouttier et al. 2014, Yin et al.,  2014). In this context, this configuration appears to be useful for data  assimilation users, to couple their own DA system on NEMO and compare  their results with thgose obtained on this configuration. SEABASS is  also easy to take in hand. Also, it allows to update the configuration  status to the future version of NEMO. For these reasons, this  configuration is a relevant test case for Data Assimilation. [[BR]]             '''                 Status: '''                 [[BR]]             '''                Main Tasks: '''                 [[BR]]             '''                 Science '''Pre-viewer''':'''                                                         [[BR]]                                                         '''                 System '''Pre-viewer''':'''                                                         [[BR]]                                                         '''                 Deadline:'''                 [[BR]]                                                         '''                 Priority:'''                 [[BR]]                                                         '''                 Depends on: '''SIMPLIF-2/CNRS                                                         [[BR]]                                                         '''                 Principal Investigator: '''Pierre-Antoine Bouttier 
     200'''                 Motivation: '''SEABASS is the reference configuration for Data Assimilation, included  in the NEMO v3.4_STABLE version. Various data assimilation experiments  have been done with this configuration, with various data assimilation  systems (e.g. Cosme et al, 2011, Bouttier et al. 2014, Yin et al.,  2014). In this context, this configuration appears to be useful for data  assimilation users, to couple their own DA system on NEMO and compare  their results with thgose obtained on this configuration. SEABASS is  also easy to take in hand. Also, it allows to update the configuration  status to the future version of NEMO. For these reasons, this  configuration is a relevant test case for Data Assimilation. [[BR]]             '''                 Status: '''                 [[BR]]             '''                Main Tasks: '''                 [[BR]]             '''                 Science '''Pre-viewer''':'''                                                         [[BR]]                                                         '''                 System '''Pre-viewer''': '''Simona Flavoni                                                         [[BR]]                                                         '''                 Deadline:'''                 [[BR]]                                                         '''                 Priority:'''                 [[BR]]                                                         '''                 Depends on: '''SIMPLIF-2/CNRS                                                         [[BR]]                                                         '''                 Principal Investigator: '''Pierre-Antoine Bouttier 
    201201 
    202202==== ''' '''ROBUSTNESS-2 / Met Office - Improvements to EEN scheme with partial steps ==== 
    203203'''                 Motivation: ''' Following investigative work by Nicolas Ducousso it became clear that the EEN scheme in NEMO did not perform as expected in idealised test cases. Although a fix was implemented that improved the performance in idealised test cases the performance in realistic simulations (e.g. ORCA025) is worse. It is not clear that the new or old formulation is correct for the case of sloping bathymetry and partial steps. 
    204204 
    205   [[BR]]                                       '''                                           Status: '''                                           [[BR]]                                       '''                                          Main Tasks: '''                                           [[BR]]                                       '''                                           Science '''    Pre-viewer'''    :'''                                                                                   [[BR]]                                                                                   '''                                           System '''    Pre-viewer'''    :'''                                                                                   [[BR]]                                                                                   '''                                           Deadline:'''                                           [[BR]]                                                                                   '''                                           Priority:'''                                           [[BR]]                                                                                   '''                                           Depends on:'''                                                                                   [[BR]] 
     205  [[BR]]                                        '''                                            Status: '''                                            [[BR]]                                        '''                                           Main Tasks: '''                                            [[BR]]                                        '''                                            Science '''     Pre-viewer'''     :'''                                                                                    [[BR]]                                                                                    '''                                            System '''     Pre-viewer'''     :'''                                                                                    [[BR]]                                                                                    '''                                            Deadline:'''                                            [[BR]]                                                                                    '''                                            Priority:'''                                            [[BR]]                                                                                    '''                                            Depends on:'''                                                                                    [[BR]] 
    206206 
    207207'''ROBUSTNESS-3 / CNRS - Academic test cases in the system''' 
     
    261261 * New website or new full CDE if NEMO ST not satisfied with this new architecture 
    262262 
    263 '''Science '''Pre-viewer''':'''[[BR]]'''System '''Pre-viewer''':''' [[BR]]'''Deadline:'''  Q1 2016 for 1st phase, Q3 2016 for 2nd phase[[BR]]'''Priority:''' High[[BR]]'''Depends on:'''   the involvement of all ST members for contributing in one way or another (technical support, page content creation or updating, ...)[[BR]]'''Principal Investigator: '''Nicolas Martin 
     263'''Science '''Pre-viewer''':'''[[BR]]'''System '''Pre-viewer''':''' [[BR]]'''Deadline:'''  Q1 2016 for 1st phase, Q3 2016 for 2nd phase[[BR]]'''Priority:''' High[[BR]]'''Depends on:'''   the involvement of all ST members for contributing in one way or another (technical support, page content creation or updating, ...)[[BR]]'''Principal Investigator: '''Nicolas Martin