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user/flavoni/libIGCM_v3.6/config.card_description (diff) – NEMO

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2015-11-02T12:50:09+01:00 (8 years ago)
Author:
flavoni
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  • user/flavoni/libIGCM_v3.6/config.card_description

    v20 v21  
    3535'''config.card file:''' 
    3636 
    37   # This is config.card file for restart with an NEW lib IGCM simulation tree.  [[BR]]                             # This is config.card file for NEMO ORCA1_LIM3_PISCES configuration   [[BR]]                             #      [[BR]]                               #========================================================================   [[BR]]                               #D-- Compatibility -   [[BR]]                               [Compatibility]     [[BR]]                               lib IGCM=1.0     [[BR]]                               #D-- !UserChoices                                -[[BR]]                              '''                    [!UserChoices                   ]'''                          [[BR]]                              #============================ [[BR]]                              #-- ('''                             <8 chars MAX'''                              for !JobName                               ) [[BR]]                              !JobName                               ='''                          eOR1L3P '''                          [[BR]]                              #----- Short Name of Experiment [[BR]]                              !ExperimentName                               =ORCA1clim [[BR]]                              #----- DEVT TEST PROD [[BR]]                              !SpaceName                               =DEVT [[BR]]                              !LongName                               ="ORCA1_LIM3_PISCES NEMO configuration" [[BR]]                              !TagName                               =ORCA1_LIM3_PISCES [[BR]]                              #D- Choice of experiment in EXPERIEMENTS directory [[BR]]                              !ExpType                               =ORCA1_LIM3_PISCES/clim [[BR]]                              #============================ [[BR]]                              #-- leap, noleap, 360d [[BR]]                              !CalendarType                               =noleap [[BR]]                              #-- Begin and end of Job [[BR]]                              #-- "YYYY-MM-DD" [[BR]]                              !DateBegin                               =0001-01-01 [[BR]]                              !DateEnd                               =0050-12-31 [[BR]]                              #============================ [[BR]]                              #-- 1Y, 1M, 5D, 1D 31 !PeriodLength                               =1Y [[BR]]                              #============================ [[BR]]                              #-- PBS Class (required on brodie mono/multi) [[BR]]                              #!JobClass                               =mono [[BR]]                              !JobClass                               =multi [[BR]]                              #============================ [[BR]]                              #-- Total Number of Processors [[BR]]                              !JobNumProcTot                               =225 [[BR]]                              #============================ [[BR]]                              #-- Run Options : [[BR]]                              !JobRunOptions                               =''                               [[BR]]                              #============================ [[BR]]                              # config.card configuration options :''                              [[BR]]                              #R_BC=$WORKDIR/../../gzi/rgzi002/IGCM/BC[[BR]]                              #R_INIT=$WORKDIR/../../gzi/rgzi002/IGCM/BC [[BR]]                              #======================================================================== [[BR]]                              #D-- !ListOfComponents                                - [[BR]]                              '''                          [!ListOfComponents                   ]        '''                              [[BR]]                              #D- For each component, Name of component, Tag of component [[BR]]                              OCE= (opa9, NEMO_v6) [[BR]]                              ICE= (lim3, LIM_3) [[BR]]                              MBG= (pisces, PISCES) [[BR]]                              IOS= (xios, XIOS) [[BR]]                              #======================================================================== [[BR]]                              #D-- Executable - [[BR]]                              '''                          [Executable]        '''                           [[BR]]                              Name=nemo [[BR]]                              #D- For each component, Real name of executable [[BR]]                              OCE= (nemo.exe, nemo, 221MPI) [[BR]]                              ICE= ("", "", "") [[BR]]                              MBG= ("", "", "") [[BR]]                              IOS= (xios_server.exe, xios.x, 4MPI) [[BR]]                              #======================================================================== [[BR]]                              #D-- Restarts - [[BR]]                              '''                          [Restarts] '''                          [[BR]]                              #D- by default: config.card describes no restart for all components [[BR]]                              #D-             ie start from Levitus or limit files [[BR]]                              #D- If you want to restart all components from the same simulation, [[BR]]                              #D-      put !OveRule                                flag to 'y' and set the next 3 parameters [[BR]]                              !OverRule                               =n [[BR]]                              #D- Last day of the experience used as restart [[BR]]                              !RestartDate                               =0094-12-31 [[BR]]                              #D- Define restart simulation name [[BR]]                              !RestartJobName                               =NO1-T17 [[BR]]                              #D- Path Server Group Login [[BR]]                              !RestartPath                               =${ARCHIVE}/IGCM_OUT/ORCA1_LIM3_PISCES/DEVT/ORCA1clim [[BR]]                               #======================================================================== [[BR]]                              #D-- OCE - [[BR]]                              '''                          [OCE] '''                          [[BR]]                              !WriteFrequency                              ="1D 5D 1M 1Y" [[BR]]                              #!WriteFrequency                               ="5D" [[BR]]                              Restart= n [[BR]]                              ##-- Last day of the experience used as restart [[BR]]                              !RestartDate                               =1999-12-31 [[BR]]                              # Define restart simulation name [[BR]]                              !RestartJobName                               =NL1 [[BR]]                              !RestartPath                               =${ARCHIVE}/IGCM_OUT/ORCA1_LIM3 [[BR]]                              # Old component name for restart (if empty, use new name) [[BR]]                              !OldName                               = [[BR]]                              #======================================================================== [[BR]]                              #D-- ICE - [[BR]]                              '''                          [ICE] '''                          [[BR]]                              !WriteFrequency                               ="1M" [[BR]]                              Restart= n [[BR]]                              ##-- Last day of the experience used as restart [[BR]]                           !RestartDate                               =1999-12-31[[BR]]                              # Define restart simulation name [[BR]]                              !RestartJobName                              =NL1 [[BR]]                              !RestartPath                              =${ARCHIVE}/IGCM_OUT/ORCA1_LIM3 [[BR]]                              # Old component name for restart (if empty, use new name) [[BR]]                              !OldName                              = [[BR]]                              #======================================================================== [[BR]]                              #D-- MBG - [[BR]]                              '''                          [MBG] '''                          [[BR]]                              !WriteFrequency                              ="1D 1M 1Y" [[BR]]                              Restart= n [[BR]]                              ##-- Last day of the experience used as restart [[BR]]                              !RestartDate                              =2000-12-31 [[BR]]                              # Define restart simulation name [[BR]]                              !RestartJobName                              =OR2LP1 [[BR]]                              !RestartPath                              =${ARCHIVE}/IGCM_OUT/ORCA1_LIM_PISCES [[BR]]                              # Old component name for restart (if empty, use new name) [[BR]]                              !OldName                              = [[BR]]                              #======================================================================== [[BR]]                              #D-- Post - [[BR]]                              '''                          [Post] '''                          [[BR]]                              #D- Do we rebuild parallel output, this flag determines [[BR]]                              #D- frequency of rebuild submission [[BR]]                              #-- 1Y [[BR]]                              !RebuildFrequency                              =NONE [[BR]]                              #D- Do we rebuild parallel output from archive [[BR]]                              !RebuildFromArchive                              =NONE [[BR]]                              #D- If you want to produce time series, this flag determines [[BR]]                              #D- frequency of post-processing submission [[BR]]                              !TimeSeriesFrequency                              =10Y [[BR]]                              #D- If you want to produce seasonal average, this flag determines [[BR]]                              #D- the period of this average [[BR]]                              !SeasonalFrequency                              =NONE [[BR]]                              #D- Offset for seasonal average first start dates ; same unit as !SeasonalFrequency                               [[BR]]                              #D- Usefull if you do not want to consider the first X simulation's years [[BR]]                              #!SeasonalFrequencyOffset                              =0 [[BR]]                              !PackFrequency                              =1Y [[BR]]                              #======================================================================== [[BR]]                              #D-- IOS - [[BR]]                              '''                          [IOS] '''                          [[BR]]                              !WriteFrequency                              ="" [[BR]]                              # If config_Restarts_OverRule == 'n' next 4 params are read [[BR]]                              Restart= n [[BR]]                              ##-- Last day of the experience used as restart for this component if Restart=y [[BR]]                              !RestartDate                              =1899-12-31 [[BR]]                              # Define restart simulation name for this component [[BR]]                              !RestartJobName                              =EXP00 [[BR]]                              !RestartPath                              =${ARCHIVE}/IGCM_OUT/IPSLCM5A/DEVT/piControl [[BR]]                              # Old component name for restart (if empty, use new name) [[BR]]                              !OldName                              = [[BR]]                              #======================================================================== 
     37  # This is config.card file for restart with an NEW lib IGCM simulation tree.  [[BR]]                              # This is config.card file for NEMO ORCA1_LIM3_PISCES configuration   [[BR]]                              #      [[BR]]                                #========================================================================   [[BR]]                                #D-- Compatibility -   [[BR]]                                [Compatibility]     [[BR]]                                lib IGCM=1.0     [[BR]]                                #D-- !UserChoices                                 -[[BR]]                               '''                     [!UserChoices                    ]'''                           [[BR]]                               #============================ [[BR]]                               #-- ('''                              <8 chars MAX'''                               for !JobName                                ) [[BR]]                               !JobName                                ='''                           eOR1L3P '''                           [[BR]]                               #----- Short Name of Experiment [[BR]]                               !ExperimentName                                =ORCA1clim [[BR]]                               #----- DEVT TEST PROD [[BR]]                               !SpaceName                                =DEVT [[BR]]                               !LongName                                ="ORCA1_LIM3_PISCES NEMO configuration" [[BR]]                               !TagName                                =ORCA1_LIM3_PISCES [[BR]]                               #D- Choice of experiment in EXPERIEMENTS directory [[BR]]                               !ExpType                                =ORCA1_LIM3_PISCES/clim [[BR]]                               #============================ [[BR]]                               #-- leap, noleap, 360d [[BR]]                               !CalendarType                                =noleap [[BR]]                               #-- Begin and end of Job [[BR]]                               #-- "YYYY-MM-DD" [[BR]]                               !DateBegin                                =0001-01-01 [[BR]]                               !DateEnd                                =0050-12-31 [[BR]]                               #============================ [[BR]]                               #-- 1Y, 1M, 5D, 1D 31 !PeriodLength                                =1Y [[BR]]                               #============================ [[BR]]                               #-- PBS Class (required on brodie mono/multi) [[BR]]                               #!JobClass                                =mono [[BR]]                               !JobClass                                =multi [[BR]]                               #============================ [[BR]]                               #-- Total Number of Processors [[BR]]                               !JobNumProcTot                                =225 [[BR]]                               #============================ [[BR]]                               #-- Run Options : [[BR]]                               !JobRunOptions                                =''                                [[BR]]                               #============================ [[BR]]                               # config.card configuration options :''                               [[BR]]                               #R_BC=$WORKDIR/../../gzi/rgzi002/IGCM/BC[[BR]]                               #R_INIT=$WORKDIR/../../gzi/rgzi002/IGCM/BC [[BR]]                               #======================================================================== [[BR]]                               #D-- !ListOfComponents                                 - [[BR]]                               '''                           [!ListOfComponents                    ]        '''                               [[BR]]                               #D- For each component, Name of component, Tag of component [[BR]]                               OCE= (opa9, NEMO_v6) [[BR]]                               ICE= (lim3, LIM_3) [[BR]]                               MBG= (pisces, PISCES) [[BR]]                               IOS= (xios, XIOS) [[BR]]                               #======================================================================== [[BR]]                               #D-- Executable - [[BR]]                               '''                           [Executable]        '''                            [[BR]]                               Name=nemo [[BR]]                               #D- For each component, Real name of executable [[BR]]                               OCE= (nemo.exe, nemo, 221MPI) [[BR]]                               ICE= ("", "", "") [[BR]]                               MBG= ("", "", "") [[BR]]                               IOS= (xios_server.exe, xios.x, 4MPI) [[BR]]                               #======================================================================== [[BR]]                               #D-- Restarts - [[BR]]                               '''                           [Restarts] '''                           [[BR]]                               #D- by default: config.card describes no restart for all components [[BR]]                               #D-             ie start from Levitus or limit files [[BR]]                               #D- If you want to restart all components from the same simulation, [[BR]]                               #D-      put !OveRule                                 flag to 'y' and set the next 3 parameters [[BR]]                               !OverRule                                =n [[BR]]                               #D- Last day of the experience used as restart [[BR]]                               !RestartDate                                =0094-12-31 [[BR]]                               #D- Define restart simulation name [[BR]]                               !RestartJobName                                =NO1-T17 [[BR]]                               #D- Path Server Group Login [[BR]]                               !RestartPath                                =${ARCHIVE}/IGCM_OUT/ORCA1_LIM3_PISCES/DEVT/ORCA1clim [[BR]]                                #======================================================================== [[BR]]                               #D-- OCE - [[BR]]                               '''                           [OCE] '''                           [[BR]]                               !WriteFrequency                               ="1D 5D 1M 1Y" [[BR]]                               #!WriteFrequency                                ="5D" [[BR]]                               Restart= n [[BR]]                               ##-- Last day of the experience used as restart [[BR]]                               !RestartDate                                =1999-12-31 [[BR]]                               # Define restart simulation name [[BR]]                               !RestartJobName                                =NL1 [[BR]]                               !RestartPath                                =${ARCHIVE}/IGCM_OUT/ORCA1_LIM3 [[BR]]                               # Old component name for restart (if empty, use new name) [[BR]]                               !OldName                                = [[BR]]                               #======================================================================== [[BR]]                               #D-- ICE - [[BR]]                               '''                           [ICE] '''                           [[BR]]                               !WriteFrequency                                ="1M" [[BR]]                               Restart= n [[BR]]                               ##-- Last day of the experience used as restart [[BR]]                            !RestartDate                                =1999-12-31[[BR]]                               # Define restart simulation name [[BR]]                               !RestartJobName                               =NL1 [[BR]]                               !RestartPath                               =${ARCHIVE}/IGCM_OUT/ORCA1_LIM3 [[BR]]                               # Old component name for restart (if empty, use new name) [[BR]]                               !OldName                               = [[BR]]                               #======================================================================== [[BR]]                               #D-- MBG - [[BR]]                               '''                           [MBG] '''                           [[BR]]                               !WriteFrequency                               ="1D 1M 1Y" [[BR]]                               Restart= n [[BR]]                               ##-- Last day of the experience used as restart [[BR]]                               !RestartDate                               =2000-12-31 [[BR]]                               # Define restart simulation name [[BR]]                               !RestartJobName                               =OR2LP1 [[BR]]                               !RestartPath                               =${ARCHIVE}/IGCM_OUT/ORCA1_LIM_PISCES [[BR]]                               # Old component name for restart (if empty, use new name) [[BR]]                               !OldName                               = [[BR]]                               #======================================================================== [[BR]]                               #D-- Post - [[BR]]                               '''                           [Post] '''                           [[BR]]                               #D- Do we rebuild parallel output, this flag determines [[BR]]                               #D- frequency of rebuild submission [[BR]]                               #-- 1Y [[BR]]                               !RebuildFrequency                               =NONE [[BR]]                               #D- Do we rebuild parallel output from archive [[BR]]                               !RebuildFromArchive                               =NONE [[BR]]                               #D- If you want to produce time series, this flag determines [[BR]]                               #D- frequency of post-processing submission [[BR]]                               !TimeSeriesFrequency                               =10Y [[BR]]                               #D- If you want to produce seasonal average, this flag determines [[BR]]                               #D- the period of this average [[BR]]                               !SeasonalFrequency                               =NONE [[BR]]                               #D- Offset for seasonal average first start dates ; same unit as !SeasonalFrequency                                [[BR]]                               #D- Usefull if you do not want to consider the first X simulation's years [[BR]]                               #!SeasonalFrequencyOffset                               =0 [[BR]]                               !PackFrequency                               =1Y [[BR]]                               #======================================================================== [[BR]]                               #D-- IOS - [[BR]]                               '''                           [IOS] '''                           [[BR]]                               !WriteFrequency                               ="" [[BR]]                               # If config_Restarts_OverRule == 'n' next 4 params are read [[BR]]                               Restart= n [[BR]]                               ##-- Last day of the experience used as restart for this component if Restart=y [[BR]]                               !RestartDate                               =1899-12-31 [[BR]]                               # Define restart simulation name for this component [[BR]]                               !RestartJobName                               =EXP00 [[BR]]                               !RestartPath                               =${ARCHIVE}/IGCM_OUT/IPSLCM5A/DEVT/piControl [[BR]]                               # Old component name for restart (if empty, use new name) [[BR]]                               !OldName                               = [[BR]]                               #======================================================================== 
    3838 
    3939=== Important files === 
    … …  
    4444Forcing files: INTERANNUAL List_jobsbc=('''u_10_fill, v_10_fill, ncar_rad_fill, t_10_fill, q_10_fill, ncar_precip_fill''') 
    4545 
    46 Forcing files : CLIMATOLOGY List_jobsbc=('''(u_10.15JUNE2009_fill, v_10.15JUNE2009_fill, ncar_rad.15JUNE2009_fill, t_10.15JUNE2009_fill, q_10.15JUNE2009_fill, ncar_precip.15JUNE2009_fill, weights_WOA13d1_2_eorca1_bilinear, weights_3D_WOA13d1_2_eorca1_bilinear, weights_coreII_2_eorca1_bicubic, weights_coreII_2_eorca1_bilinear, weights_reg05_2_eorca1_bilinear, weights_Goutorbe1_2_eorca1_bilinear )''' 
     46Forcing files : CLIMATOLOGY List_jobsbc='''(u_10.15JUNE2009_fill, v_10.15JUNE2009_fill, ncar_rad.15JUNE2009_fill, t_10.15JUNE2009_fill, q_10.15JUNE2009_fill, ncar_precip.15JUNE2009_fill, weights_WOA13d1_2_eorca1_bilinear, weights_3D_WOA13d1_2_eorca1_bilinear, weights_coreII_2_eorca1_bicubic, weights_coreII_2_eorca1_bilinear, weights_reg05_2_eorca1_bilinear, weights_Goutorbe1_2_eorca1_bilinear )''' 
     47 
     48NOTA: if you want to change FORCING or INPUT files you can put you own PATH in R_BC variable in config.card 
     49 
     50but BE CAREFUL to be coherent in COMP/opa9.card in Section : 
     51 
     52 [!BoundaryFiles][[BR]]  List=   ()[[BR]]  !ListNonDel=  
     53 
     54  with variables:  (${R_BC}/OCE/${config_UserChoices_TagName}/${opa9_UserChoices_OPA_version}/ 
    4755 
    4856COMP/lim3.card 
    … …  
    5159 
    5260=== '''  DRIVER ''' === 
    53   :  shell script to use data of cards :'''        don't change''' 
     61  :  shell script to use data of cards :'''         don't change''' 
    5462 
    5563opa9.driver[[BR]]lim2.driver[[BR]]lim3.driver[[BR]]pisces.driver[[BR]]xios.driver