Changes between Initial Version and Version 1 of Ajeterici/Branches/Orchidee-Stics

Timestamp:

2011-10-10T10:40:27+02:00 (13 years ago)

Author:

nvuilsce

Comment:

--

Ajeterici/Branches/Orchidee-Stics

@@ +1 @@
+= How to install ORCHIDEE-STICS model ? =
+== Download modipsl framework ==
+{{{
+my_prompt>> svn co http://forge.ipsl.jussieu.fr/igcmg/svn/modipsl/trunk ORCHIDEE_STICS
+}}}
+
+== Add ORCHIDEE-STICS model into mod.def file ==
+Under "util" directory, modify the mod.def fiel by adding the following lines:
+{{{
+#-
+#-H- ORCHIDEE_STICS  Modele ORCHIDEE-STICS
+#-H- ORCHIDEE_STICS  ORCHIDEE-STICS trunk
+#-H- ORCHIDEE_STICS  IOIPSL with tag 2.2.1
+#-H- ORCHIDEE_STICS  libIGCM tag libIGCM_v1_10
+#-H- ORCHIDEE_STICS  FCM svn version PATCHED/FCM_V1.2
+#-M- ORCHIDEE_STICS  nicolas.vuichard@lsce.ipsl.fr
+#-C- ORCHIDEE_STICS  IOIPSL/tags/v2_2_1/src HEAD   8 IOIPSL/src      modeles
+#-C- ORCHIDEE_STICS  tags/libIGCM_v1_10     HEAD  10 libIGCM         .
+#-C- ORCHIDEE_STICS  PATCHED/FCM_V1.2       HEAD  13 tools/FCM/V1.2  .
+#-C- ORCHIDEE_STICS  branches/ORCHIDEE-STICS/ORCHIDEE                 ?       14 .
+#-C- ORCHIDEE_STICS  branches/ORCHIDEE-STICS/ORCHIDEE_OL              ?       14 .
+#-C- ORCHIDEE_STICS  branches/ORCHIDEE-STICS/ORCHIDEE_OL/OOL_SEC_STO  ?       14 config/ORCHIDEE_OL/OOL_SEC_STO .
+#-C- ORCHIDEE_STICS  branches/ORCHIDEE-STICS/ORCHIDEE_OL/OOL_SEC      ?       14 . config/ORCHIDEE_OL
+#-C- ORCHIDEE_STICS  branches/ORCHIDEE-STICS/ORCHIDEE_OL/FORCESOIL    ?       14 . config/ORCHIDEE_OL
+#-C- ORCHIDEE_STICS  branches/ORCHIDEE-STICS/ORCHIDEE_OL/TESTSTOMATE  ?       14 . config/ORCHIDEE_OL
+#-C- ORCHIDEE_STICS  branches/ORCHIDEE-STICS/ORCHIDEE_OL/SPINUP       ?       14 . config/ORCHIDEE_OL
+#-C- ORCHIDEE_STICS  branches/ORCHIDEE-STICS/ORCHIDEE_OL/FLUXNET      ?       14 . config/ORCHIDEE_OL
+#-C- ORCHIDEE_STICS  branches/ORCHIDEE-STICS/STICS                    ?       14 .
+#-C- ORCHIDEE_STICS  branches/ORCHIDEE-STICS\ -N                      ?       14 AA_make util/
+# -
+}}}
+
+== Install ORCHIDEE-STICS model under util dir. ==
+{{{
+my_prompt>> ./model ORCHIDEE_STICS
+}}}
+
+== Compilation of ORCHIDEE-STICS model ==
+First, update the AA_make.gdef file under directory by typing the 2 command lines :
+{{{
+my_prompt>> cp AA_make/AA_make.gdef .
+my_prompt>> \rm -rf AA_make
+my_prompt>> ./ins_make
+}}}
+Under "modeles/ORCHIDEE_OL" dir
+{{{
+my_prompt>> gmake
+}}}
+
+== Launching a job under OOL_SEC_STO config ==
+Under "util" dir, type :
+{{{
+my_prompt>> ./ins_job
+}}}
+Under "modeles/ORCHIDEE_OL/OOL_SEC_STO" dir, add the following lines into the Job_* script before the Execution section:
+{{{
+export OMP_NUM_THREADS=3
+export OMP_WAIT_POLYCY=passive
+export OMP_NESTED=TRUE
+}}}
+You can then submit the Job.
+
+
+= Evolution du code ORCHIDEE-STICS =
+
+----
+== 01/12/2009 ==
+'''Compte-rendu de la mise à jour d'O-S effectuée par D. Leclère et N. Vuichard'''[[BR]]
+On a utilisé trois codes-source pour cette mise à jour[[BR]]
+1- code O-S (sous /home/users/dleclere/Orch-Stics/STICS/stics_orchidee_maj)[[BR]]
+2- code d'ORCHIDEE utilisé lors du couplage O-S par Smith/Meurdesoif/Viovy (sous /home/users/dleclere/Orch-Stics/STICS/SOURCES_NICOLAS_VIOVY/commit)[[BR]]
+3- version 1.9.4 du code ORCHIDEE (/home/users/dleclere/Orch-Stics/modipsl/modeles)[[BR]]
+Les appels à STICS ont été identifiés par diff entre 1 et 2 et injectés dans 3.[[BR]]
+Un journal a été réalisé mentionnant les fichiers sur lesquels nous sommes intervenus et les points - plutôt scientifiques - qui restent à travailler.[[BR]]
+Journal stocké sous /home/users/dleclere/Orch-Stics/JOURNAL_MERGE.txt et en pièce jointe. 
+
+'''Compilation et exécution d'un cas test'''[[BR]]
+sous platine (/work/cont003/p529vui/MERGE_ORCHIDEE_STICS)[[BR]]
+en utilisant comme forçages météo ERA interim (/dmnfs12/cont003/p529maig/ANNUELS_IERA/DRIVER_FORTRAN)
+
+'''A FAIRE'''[[BR]]
+* Comparaison sur le cas test entre nouvelle version d'O-S et ancienne => N. Vuichard[[BR]]
+* Basculement de la technologie CORBA vers la techno MULTI-THREAD[[BR]]
+* Réfléchir à la possibilité de faire un restart de STICS en fin d'année[[BR]]
+* Résoudre les questions scientifiques levées lors de la mise à jour du couplage O-S (cf JOURNAL_MERGE.txt)
+
+----
+
+== 08/09/2009 ==
+'''Réunion pour préparer le changement de version d'ORCHIDEE''' (vers la 1.9.4) dans le modèle couplé ORCHIDEE-STICS[[BR]]
+Compte-rendu orchidee_stics_08_09_2009.doc en pièce jointe
+
+
+----
+
+== 10/07/2009 ==
+'''Avancées sur le code ORCHIDEE-STICS à mettre à jour'''
+
+On avait besoin : 
+
+ 1. du dernier code (ORCHIDEE - DRIVER en c) de Nicolas Viovy correspondant à la version MERGE
+   orchidee_MERGE_1_8_2
+ 2. de la version d'ORCHIDEE utilisée par Pascalle Smith en 2005 pour faire la "seconde" 
+   version (après Gervois) du couplage ORCHIDEE-STICS.
+
+On a donc chercher dans le home et le scratch platine de Nicolas Viovy (login viovy mercure) pour identifier ces versions.[[BR]]
+Nous y avons trouver et récupérer les répertoires suivant :
+
+||Nom répertoire Viovy || Répertoire ORCHIDEE || Date dernier source modifié ||
+||orc_test             || ORCHIDEE_OL         || 10-07-09                    ||
+||orc_test             || ORCHIDEE            || 10-07-09                    ||
+||orc_0608             || ORCHIDEE_OL         || 17-04-09                    ||
+||orc_0608             || ORCHIDEE            || 08-06-09                    ||
+||orc_0609             || ORCHIDEE_OL         || 08-06-09                    ||
+||orc_0609             || ORCHIDEE            || 08-06-09                    ||
+||orc_merge            || ORCHIDEE_OL         || 10-07-09                    ||
+||orc_merge            || ORCHIDEE            || 24-07-08                    ||
+
+Ancienne version :
+||commit               || ORCHIDEE_OL         || 24-10-05                    ||
+||commit               || ORCHIDEE            || 07-07-05                    ||
+
+Nous avons vérifier que la version 'commit' est bien proche de la version de départ de Pascalle S.[[BR]]
+=> diff_stics_orchidee_maj-commit.diff 
+
+A FAIRE :
+
+ 0. Martial (fait): page forge ORCHIDEE -> STICS => inscription Nicolas Vuichard
+ 1. Vuichard : historique, mettre les rapports réunions STICS 
+ 2. Martial (fait): identifier la version récente de Nicolas Viovy la plus proche de la orchidee_MERGE_1_8_2 [[BR]] 
+    (=> compatibilités des modifications du DRIVER c de Nicolas).
+ 3. Nicolas Vuichard / David Leclerc : reprendre cette version identifiée pour MAJ ORCHIDEE-STICS
+   avec nouveau driver Viovy / nouvelle version ORCHIDEE.
+ 4. Martial : création d'une banche ORCHIDEE-STICS partant du TAG orchidee_MERGE_1_8_2
+ 5. Martial : Mise à jour de la orchidee_MERGE_1_8_2 => TAG orchidee_MERGE_1_8_3
+ 6. Nathalie De Noblet : récupération Rapport Pascalle Smith CR_SMITH_18-08-08
+
+
+Passer à Nicolas :
+
+ 1. stics_orchidee_maj = commit  + 14 PFTs[[BR]]
+  -rw-rw-r--  1 mancip mancip   165159 2009-08-04 18:52 diff_stics_orchidee_maj-commit.diff
+ 2. version Nicolas : avant la ORCHIDEE_1_8_1 ! (très vieux par rapport à la branche ORCHIDEE_1_8_merge ...)[[BR]]
+  -rw-rw-r--  1 mancip mancip   337894 2009-08-04 18:42 diff_ORCHIDEE_1_8_1_orc_0609.diff [[BR]]
+  -rw-rw-r--  1 mancip mancip   266849 2009-08-04 18:42 diff_ORCHIDEE_1_8_1_orc_merge.diff [[BR]]
+  -rw-rw-r--  1 mancip mancip   269744 2009-08-04 18:42 diff_ORCHIDEE_1_8_1_orc_test.diff [[BR]]