Changeset 634 for trunk/docs

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03/16/14 21:16:36 (10 years ago)

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pinsard

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fix thanks to coding rules; utf8

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trunk/docs/docs_dev/source

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trunk/docs/docs_dev/source/guides/bibliography.rst

@@ -77 +77 @@
 .. [envunix] Ara Arakelian, Christophe Boitel, Marine Bonazzola, Pacome Delva, Jacques Lefrere, Jean-Francois Rysman, Philippe Sindzingre, Fabien Souris, Aymeric Spiga, Sofian Teber, *L'environnement Unix*, http://wwwens.aero.jussieu.fr/lefrere/master/mni/mni/unix/poly-unix.pdf
 
-.. [octave] http://enacit1.epfl.ch/cours_matlab/ `Introduction à MATLAB et GNU Octave` Jean-Daniel BONJOUR
+.. [octave] http://enacit1.epfl.ch/cours_matlab/ `Introduction à MATLAB et GNU Octave` Jean-Daniel BONJOUR
 
 .. [Gentle:GIS:Introduction] http://download.osgeo.org/qgis/doc/manual/qgis-1.0.0_a-gentle-gis-introduction_en.pdf
@@ -87 +87 @@
 .. [netcdf:climatology] http://jisao.washington.edu/data/nco/climatology.html *Using NetCDF Operators (NCOs) to calculate climatologies*
 
-.. [Dalaise:CNRSimage:2007] Marcel Dalaise, *La calebasse et le pluviomètre*, http://www.universcience-vod.fr/media/821/la-calebasse-et-le-pluviometre.html?page=1&tag_id=810
+.. [Dalaise:CNRSimage:2007] Marcel Dalaise, *La calebasse et le pluviomÚtre*, http://www.universcience-vod.fr/media/821/la-calebasse-et-le-pluviometre.html?page=1&tag_id=810
 
-.. [EymardKarbouEtAl:JoGR:2010] Laurence Eymard and Fatima Karbou and Serge Janicot and Nadine Chouaib and Françoise Pinsard, *On the use AMSU-A and -B measurements for studying the Monsoon variability over West Africa*, Journal of Geophysical Research-Atmospheres,2010, http://dx.doi.org/10.1029/2009JD012935
+.. [EymardKarbouEtAl:JoGR:2010] Laurence Eymard and Fatima Karbou and Serge Janicot and Nadine Chouaib and Françoise Pinsard, *On the use AMSU-A and -B measurements for studying the Monsoon variability over West Africa*, Journal of Geophysical Research-Atmospheres,2010, http://dx.doi.org/10.1029/2009JD012935
 
-.. [Fiolleau:thesis:2010] Thomas Fiolleau, *Cycle de vie des systèmes convectifs de mousson dans les régions tropicales: préparation à la mission Megha-Tropiques*, 2010, http://www.lmd.jussieu.fr/~tfilmd/#these_thomas
+.. [Fiolleau:thesis:2010] Thomas Fiolleau, *Cycle de vie des systÚmes convectifs de mousson dans les régions tropicales: préparation à la mission Megha-Tropiques*, 2010, http://www.lmd.jussieu.fr/~tfilmd/#these_thomas
 
-.. [Gratton:IAG:2002] Yves Gratton, * le krigeage : la méthode optimale d'interpolation spatiale*, 2002, Institut d'analyse géographique, http://www.iag.asso.fr/pdf/krigeage_juillet2002.pdf
+.. [Gratton:IAG:2002] Yves Gratton, * le krigeage : la méthode optimale d'interpolation spatiale*, 2002, Institut d'analyse géographique, http://www.iag.asso.fr/pdf/krigeage_juillet2002.pdf
 
 .. [Bennartz:JAOT:2000] RALF BENNARTZ, *Optimal Convolution of AMSU-B to AMSU-A*, 2000, 1215-1225

trunk/docs/docs_dev/source/guides/builddoc.rst

@@ -42 +42 @@
 Documentation |project|
 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
-La documentation est construite à partir des fichiers ReStructuredText_
+La documentation est construite à partir des fichiers ReStructuredText_
 dans :file:`${PROJECT}/adm/` et des commentaires dans les sources
 sous :file:`${PROJECT}/src/`.
@@ -48 +48 @@
 .. _ReStructuredText: http://docutils.sourceforge.net/rst.html
 
-Sphinx_ est utilisé pour produire la documentation sous forme HTML et PDF:
+Sphinx_ est utilisé pour produire la documentation sous forme HTML et PDF:
 
 .. _Sphinx: http://sphinx.pocoo.org/
@@ -59 +59 @@
    make html_dev
 
-et regarder le résultat dans :file:`../doc/html/sphinx/index.html`.
+et regarder le résultat dans :file:`../doc/html/sphinx/index.html`.
 
-Si le résultat est convainquant, on peut produire les autres formats de
+Si le résultat est convainquant, on peut produire les autres formats de
 documentations (HTML single, PDF et troff):
 
@@ -71 +71 @@
 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
 
-La mise à disposition des documentations produites ci-dessus sur l'URL
+La mise à disposition des documentations produites ci-dessus sur l'URL
 http://www.locean-ipsl.upmc.fr/~fplod/varamma/varamma_ws/doc/html/sphinx/index.html
-est réservée à Françoise Pinsard pour des raisons de protections de fichiers et
+est réservée à Françoise Pinsard pour des raisons de protections de fichiers et
 de politique de login.
 

trunk/docs/docs_dev/source/guides/contact.rst

@@ -25 +25 @@
 Laurence Eymard pour la science
 
-Françoise Pinsard pour la gestion du projet sous trac et svn
+Françoise Pinsard pour la gestion du projet sous trac et svn

trunk/docs/docs_dev/source/guides/contents.rst

@@ -15 +15 @@
 .. _contents:
 
-===============
- Documentation
-===============
+=============
+Documentation
+=============
 
 For users

trunk/docs/docs_dev/source/guides/contributing.rst

@@ -21 +21 @@
 .. _contributing:
 
-==============
- Contributing
-==============
+============
+Contributing
+============
 
 Development is tracked with svn_.
@@ -35 +35 @@
 and add/answer tickets.
 
-See :ref:`Contact <contact>` to ask for login or any trouble on your forge.ipsl.jussieu.fr account.
+See :ref:`Contact <contact>` to ask for login or any trouble on your 
+forge.ipsl.jussieu.fr account.
 
 You will find in

trunk/docs/docs_dev/source/guides/data_content.rst

@@ -134 +134 @@
 ====
 
-contenu terminologie granulométrie organisation etc.
+contenu terminologie granulométrie organisation etc.
 
 .. _data_lai:
@@ -141 +141 @@
 ---------------------
 
-résolution temporelle
+résolution temporelle
    hebdomadaire
 
@@ -147 +147 @@
    200002118 (doy=49) 20081226 (doy=361)
 
-résolution spatiale
+résolution spatiale
    1 km
 
 couverture spatiale
-   Sénégal (de 13,5 à 17N, 13 à 17,5W)
+   Sénégal (de 13,5 à 17N, 13 à 17,5W)
 
 Reference files
 ~~~~~~~~~~~~~~~
 
-MODIS Terra-Aqua format HDF4 fournis par Catherine Ottlé +todo+ URL
-déposés dans par Laurence Eymard in :file:`/net/zeus/usr/zeus/incas/mousson/LAI/LAI_{yyyy}/`
+MODIS Terra-Aqua format HDF4 fournis par Catherine Ottlé +todo+ URL
+déposés dans par Laurence Eymard in :file:`/net/zeus/usr/zeus/incas/mousson/LAI/LAI_{yyyy}/`
 
 exemple de terminologie :
@@ -167 +167 @@
 
 format texte produits en utilisant :ref:`LectureLAIHDF.pro`
-déposés dans par Laurence Eymard in :file:`/net/zeus/usr/zeus/incas/mousson/LAI/`
+déposés dans par Laurence Eymard in 
+:file:`/net/zeus/usr/zeus/incas/mousson/LAI/`
 
 terminologie : :file:`laisen{yyyy}_float.txt`
@@ -209 +210 @@
 We have been informed by Jean-Claude Berges (Jean-Claude.Berges@univ-paris1.fr) that micro-wave precipitation data every 3 hours are provided by GSFC in a collection of binary files.
 
-References of documentations and available softwares (C, Fortran, IDL) can be read in
+References of documentations and available softwares (C, Fortran, IDL) can 
+be read in
 ftp://trmmopen.gsfc.nasa.gov/pub/merged/3B4XRT_index.
 
 see ftp://meso.gsfc.nasa.gov/pub/trmmdocs/rt/3B4XRT_README.pdf
 
-résolution temporelle
+résolution temporelle
   3 hours
 
@@ -220 +222 @@
   2005++++ -
 
-résolution spatiale
-  0.25°x0.25°
+résolution spatiale
+  0.25°x0.25°
 
 couverture spatiale
@@ -278 +280 @@
 Outil primaire de simulation :
 
-Outils de récupération : :ref:`get_trmm.sh`
-
-Outils de mise en forme : :ref:`traite_trmm.sh` (:ref:`geolocation_to_string_sh.sh`)
+Outils de récupération : :ref:`get_trmm.sh`
+
+Outils de mise en forme : :ref:`traite_trmm.sh` 
+(:ref:`geolocation_to_string_sh.sh`)
 
 Outil de lecture : :func:`TRMMread`
@@ -294 +297 @@
 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
 
-Precipitation data have been provided to Soukèye Cisse in a zip file
-:file:`Données climatiques_Soukèye.zip` stored in :file:`/net/zeus/usr/zeus/incas/mousson/Donnees_climatiques_Soukeye.zip`.
+Precipitation data have been provided to SoukÚye Cisse in a zip file
+:file:`Données climatiques_SoukÚye.zip` stored in 
+:file:`/net/zeus/usr/zeus/incas/mousson/Donnees_climatiques_Soukeye.zip`.
 
 This file contains Excel files :
 
  - Barkedji_pluviom_SP-2008.xls
- - Barkédji_Morel.xls
- - Barkédji_RR_1961-2000.xls
+ - Barkédji_Morel.xls
+ - Barkédji_RR_1961-2000.xls
  - CORUS_Ferlo.xls
- - Coordionénes STATIONS_AGRY_Synop.XLS
- - Données_Almamy_vallée-SEN.xls
- - Ferlo_Pluvio-journalière_1961-2000.xls
- - Ferlo_Pluvio-journalière_2001-2009.xls
- - LYON_Adama-Sarr(Données).xls
- - Ranérou.xls
+ - Coordionénes STATIONS_AGRY_Synop.XLS
+ - Données_Almamy_vallée-SEN.xls
+ - Ferlo_Pluvio-journaliÚre_1961-2000.xls
+ - Ferlo_Pluvio-journaliÚre_2001-2009.xls
+ - LYON_Adama-Sarr(Données).xls
+ - Ranérou.xls
  - barkedji_pluviom_2003.xls
  - barkedji_pluviom_2004.xls
@@ -315 +319 @@
  - bar?kdji pluvio2009.xls
  - ferlo_pluvio_journaliere_1933_2000.xls
- - petite côte.xls
+ - petite cÃŽte.xls
 
 .. note::
 
-   Reading Excel file under matlab is possible with xslread but the same function in octave 3.0.2 only accept CSV files.
+   Reading Excel file under matlab is possible with xslread but the 
+   same function in octave 3.0.2 only accept CSV files.
 
 .. note::
@@ -328 +333 @@
  - Barkedji_pluviom_SP-2008.xls
 
-   les cumuls ne sont pas utiles dans les programmes du projets car recalculables
-   pas de valeurs manquantes sur des cases ne correspondant pas à une date (ex : 20080931)
-
+   les cumuls ne sont pas utiles dans les programmes du projets car 
+   recalculables
+
+   pas de valeurs manquantes sur des cases ne correspondant pas à une date (ex : 20080931)
 
  - ferlo_pluvio_journaliere_1933_2000.xls
-    xls2calc ne permet pas de récupérer le nom des feuilles
+    xls2calc ne permet pas de récupérer le nom des feuilles
 
     on les voit avec strings
@@ -346 +352 @@
     Arbeitsbl
 
-   les années ne sont pas tjs sur la même colonne
+   les années ne sont pas tjs sur la même colonne
 
    il y a des valeurs manquantes -999 mais aussi des valeurs bizarres -555
 
-   les années ne sont pas typées "date" mais integer.
-
-
-Une carte du réseau des pluviomètres du Sénégal est mis à diposition par
-l'agence nationale de la météorologie du Sénégal sout forme PNG : http://www.meteo-senegal.net/images/png/pluvio.png.
+   les années ne sont pas typées "date" mais integer.
+
+
+Une carte du réseau des pluviomÚtres du Sénégal est mis à diposition par
+l'agence nationale de la météorologie du Sénégal sout forme PNG : 
+http://www.meteo-senegal.net/images/png/pluvio.png.
 
 Reference files set 2
 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
 
-Set 2 of Precipitation in situ data have been provided by Soukèye Cisse in january 2011.
+Set 2 of Precipitation in situ data have been provided by SoukÚye Cisse in 
+January 2011.
 
 They are csv files:
 
- - :file:` BarkÇdji_RR_1961-2000.csv`
+ - :file:` BarkÇdji_RR_1961-2000.csv`
  - :file:`barkedji pluvio2009.csv`
  - :file:`barkedji_pluie_2003.csv`
@@ -383 +391 @@
     - :file:`ferlo_pluvio_journaliere_thiel.csv`
 
-They have to be cleaned and completed to be usable with octave and Qgis because
-of following problems:
-
- - heterogeonous terminology (ex: barkedji_pluvio_2005.csv vs barkedji_pluie_2006.csv)
+They have to be cleaned and completed to be usable with octave and Qgis 
+because of following problems:
+
+ - heterogenous terminology (ex: barkedji_pluvio_2005.csv vs 
+   barkedji_pluie_2006.csv)
  - comma as digital separator
- - different formalism for missing values : `xx`, `-999`, `-555`, `-`, empty field
+ - different formalism for missing values : `xx`, `-999`, `-555`, `-`, empty 
+   field
  - no geolocation
- - heterogenus headers (ex : `"Jours","Juin","Juillet","Août","Septembre","Octobre","Novembre","cumul"` vs `"jours","JUIN","JUILLET","AOUT","SEPT","OCT","cumuls","Décads"`
+ - heterogenous headers (ex : 
+`"Jours","Juin","Juillet","Août","Septembre","Octobre","Novembre","cumul"` 
+vs `"jours","JUIN","JUILLET","AOUT","SEPT","OCT","cumuls","Décads"`
  - multiple years in one file
 
-Eventually following files are available in :file:`/net/zeus/usr/zeus/incas/mousson/PRECIP/` :
+Eventually following files are available in 
+:file:`/net/zeus/usr/zeus/incas/mousson/PRECIP/` :
 
  - :file:`barkedji_pluie_2003.csv`
@@ -435 +448 @@
 ------------------------
 
-Station pluviometer data have been provided by Soukèye Cisse in a Excel file
-stored in :file:`/net/zeus/usr/zeus/incas/mousson/Coordion%E9nes STATIONS_AGRY_Synop.XLS`.
+Station pluviometer data have been provided by SoukÚye Cisse in a Excel file
+stored in 
+:file:`/net/zeus/usr/zeus/incas/mousson/Coordion%E9nes STATIONS_AGRY_Synop.XLS`.
 
 It has been partially cleaned to be usable with octave and Qgis because
@@ -444 +458 @@
  - nom avec diacritiques
  - deux feuilles
- - sur la deuxième feuille 2 colonnes
- - des stations sont présentes plusieurs fois (ex: ranerou)
+ - sur la deuxiÚme feuille 2 colonnes
+ - des stations sont présentes plusieurs fois (ex: ranerou)
  - lat lon et alt sont des chaines
- - séparateur de décimale **,**
- - jaune et vert uniquement pour être humain
+ - séparateur de décimale **,**
+ - jaune et vert uniquement pour être humain
 
 Eventually :file:`/net/zeus/usr/zeus/incas/mousson/PRECIP/stations.csv`
 is available.
 
-:caution: duplicate station, BILIKOUATE longitude > 0, missing values in lat and lon
+:caution: duplicate station, BILIKOUATE longitude > 0, missing values in 
+lat and lon
 
 Annexes
@@ -464 +479 @@
 Outil de dessin : :func:`plot_station`
 
-Outil de sélection/information : :func:`get_station_geolocation`
+Outil de sélection/information : :func:`get_station_geolocation`
 
 Associated datasets
@@ -478 +493 @@
 15 orbites par jour
 
-seuil de validité des données : 100-300
+seuil de validité des données : 100-300
 
 ++ pour chaque type de fichier, info sur production, taille
@@ -493 +508 @@
 
    x
-     numéro du canal (pour `a` parmi [1,2,3,4,5,6,7,8,9,15], pour `b` parmi [1,2,3,4,5])
+     numéro du canal (pour `a` parmi [1,2,3,4,5,6,7,8,9,15], pour `b` 
+     parmi [1,2,3,4,5])
 
    yyyy
-     pour année.
+     pour année.
 
  - :file:`{c}{x}.{yyyy}{mm}.afratl.nc`
@@ -506 +522 @@
 
    x
-     numéro du canal (pour `a` parmi [1,2,3,4,5,6,7,8,9,15], pour `b` parmi [1,2,3,4,5])
+     numéro du canal (pour `a` parmi [1,2,3,4,5,6,7,8,9,15], pour `b` 
+     parmi [1,2,3,4,5])
 
    yyyy
-     année
+     année
 
    mm
@@ -522 +539 @@
 
    x
-     numéro du canal (pour a parmi [2,3,4,4,7,8], pour b parmi [3,4,5])
+     numéro du canal (pour a parmi [2,3,4,4,7,8], pour b parmi [3,4,5])
 
  - fichiers de correction au nadir
@@ -537 +554 @@
    aussi dans :file:`/net/zeus/usr/zeus/incas/mousson/AMSU/`
 
-   +todo+ comment ont-ils été crées ?
+   +todo+ comment ont-ils été crées ?
 
    used in :ref:`correct_nadir_amsu.pro` and :ref:`interpol_correc.pro`
@@ -549 +566 @@
     - :file:`b3.2000_2006.nc`
 
-L'année de mise au point des programmes est 2006.
-
-Manifestement peu/pas de convention appliquée sur tous ces types de fichier.++ intox CF
+L'année de mise au point des programmes est 2006.
+
+Manifestement peu/pas de convention appliquée sur tous ces types de fichier.
+++ intox CF
 
 Annexes
@@ -558 +576 @@
 Outil primaire de simulation :
 
-Outils de récupération : :ref:`get_amsu.sh`
-
-Outils de mise en forme : :ref:`traite_amsuab.sh`, :ref:`correct_nadir_amsu.pro`, :ref:`amsu2ncdf.pro`, :ref:`extract_zone_nc.sh`, :func:`cresamsu`, :func:`idl_amsu_netcdf`
+Outils de récupération : 
+:ref:`get_amsu.sh`
+
+Outils de mise en forme : 
+:ref:`traite_amsuab.sh`, 
+:ref:`correct_nadir_amsu.pro`, 
+:ref:`amsu2ncdf.pro`, 
+:ref:`extract_zone_nc.sh`, 
+:func:`cresamsu`, 
+:func:`idl_amsu_netcdf`
 
 Outil de gestion de fichiers :func:`search_amsufiles`
@@ -568 +593 @@
 Outil de dessin :
 
-Outil de sélection AMSU/MSG : :func:`selectionimages`, :func:`scatterplot`
+Outil de sélection AMSU/MSG : :func:`selectionimages`, :func:`scatterplot`
 
 .. _data_msg:
@@ -581 +606 @@
    SEVIRI
 
-résolution temporelle
+résolution temporelle
    15 mn
 
 couverture temporelle
-   yyyyymmjj yyyymmdd +todo+ (pour l'instant de 2006-07-01 à 2006-09-30)
-
-   +todo+ où est le reste des MSG ?!
-
-résolution spatiale
+   yyyyymmjj yyyymmdd +todo+ (pour l'instant de 2006-07-01 Ã  2006-09-30)
+
+   +todo+ où est le reste des MSG ?!
+
+résolution spatiale
    3 km
 
@@ -614 +639 @@
    59Mo/jour
 
- :caution: tous les quarts d'heure ne sont pas forcément présents.
+ :caution: tous les quarts d'heure ne sont pas forcément présents.
 
 Derived files
@@ -649 +674 @@
     :file:`${PROJECT_ID}/MSG/{yyyy}/{mm}/msg-{product}_{yyyy}-{mm}-{dd}_15min.nc`
 
-Déposés par Françoise Pinsard via Laurence Eymard dans
-directory :file:`zeus:/net/zeus/usr/zeus/incas/mousson/MSG/extracted/{yyyy}/{mm}` ++ d'où viennent-ils ? sortie de
+Déposés par Françoise Pinsard via Laurence Eymard dans
+directory :file:`zeus:/net/zeus/usr/zeus/incas/mousson/MSG/extracted/{yyyy}/{mm}` ++ d'où viennent-ils ? sortie de
 :ref:`traite_msg-prod.sh`
 
@@ -663 +688 @@
 Outil primaire de simulation : :func:`simul_msg`
 
-Outils de récupération : :ref:`get_msg.sh`
+Outils de récupération : :ref:`get_msg.sh`
 
 Outils de mise en forme : :ref:`traite_msg-prod.sh` (:ref:`create_gif.sh` :ref:`create_nc.sh`) , :ref:`concat-files.sh`, :ref:`extract_zone_nc.sh`
@@ -671 +696 @@
 Outil de dessin : :func:`plotimageMSG`, :func:`evolution_msg`, :func:`hovmullerlat`, :func:`showgrid`, :func:`plot_intensityMSG`, :func:`visuMSG`
 
-Outil de sélection AMSU/MSG : :func:`selectionimages`, :func:`scatterplot`
-
-Outils de détection de nuages : :ref:`cloud_day.pro`, :ref:`cloud_month.pro`, :ref:`msgnuage.pro`, :ref:`nuage.pro`, :ref:`ssminuage.pro`
+Outil de sélection AMSU/MSG : :func:`selectionimages`, :func:`scatterplot`
+
+Outils de détection de nuages : :ref:`cloud_day.pro`, :ref:`cloud_month.pro`, :ref:`msgnuage.pro`, :ref:`nuage.pro`, :ref:`ssminuage.pro`
 :func:`histo_intensityMSG` :func:`intensityMSG_day`
 
@@ -687 +712 @@
 ----------
 
-résolution temporelle
+résolution temporelle
    30 mn
 
@@ -693 +718 @@
    [20060726,20060731]
 
-résolution spatiale
+résolution spatiale
    11 km
 
@@ -706 +731 @@
 ~~~~~~~~~~~~~~~
 
-Disponibles de 2004 à 2006 (summer months) sur :file:`climserv:/bdd/AMMASAT/CDF/priv/west_africa/surf-rr/epsat-sg/{yyyy}/{mm}/`
+Disponibles de 2004 Ã  2006 (summer months) sur :file:`climserv:/bdd/AMMASAT/CDF/priv/west_africa/surf-rr/epsat-sg/{yyyy}/{mm}/`
 
 .. warning::
@@ -712 +737 @@
    need to belong to ``amma_eu`` group on climserv.
 
-Déposés par Laurence Eymard dans
+Déposés par Laurence Eymard dans
 directory :file:`zeus:/net/zeus/usr/zeus/incas/mousson/EPSAT/{yyyy}/{mm}`
 
@@ -721 +746 @@
    12Mo/jour
 
-Déposés par Françoise Pinsard via Laurence Eymard dans
-directory :file:`zeus:/net/zeus/usr/zeus/incas/mousson/EPSAT/extracted/{yyyy}/{mm}` ++ d'où viennent-ils ? AMMA bdd?
+Déposés par Françoise Pinsard via Laurence Eymard dans
+directory :file:`zeus:/net/zeus/usr/zeus/incas/mousson/EPSAT/extracted/{yyyy}/{mm}` ++ d'où viennent-ils ? AMMA bdd?
 
  terminologie
@@ -735 +760 @@
 Outil primaire de simulation : :func:`simul_epsat`
 
-Outils de récupération : :ref:`get_epsat.sh`
+Outils de récupération : :ref:`get_epsat.sh`
 
 Outils de mise en forme : :ref:`extract_zone_nc.sh`
@@ -760 +785 @@
 et `ERA 40 <http://climserv.ipsl.polytechnique.fr/fr/les-donnees/era40-6.html>`
 
-On peut utiliser le jeu de données OPERA (comme "opérational") de 2001 à 2008 ou ERA40 (sauf que ERA40 de 1967 à 200208 seulement).
-
-Les fichiers ECMWF opérationnels sont dans :file:`/bdd/OPERA/NETCDF/GLOBAL_1125/4xdaily/AN_PL/`.
-
-Les fichier ECMWF de réanalyse sont dans :file:`/bdd/ERA40/NETCDF/4xdaily/AN_PL`.
+On peut utiliser le jeu de données OPERA (comme "opérational") de 2001 à 2008 ou ERA40 (sauf que ERA40 de 1967 à 200208 seulement).
+
+Les fichiers ECMWF opérationnels sont dans :file:`/bdd/OPERA/NETCDF/GLOBAL_1125/4xdaily/AN_PL/`.
+
+Les fichier ECMWF de réanalyse sont dans :file:`/bdd/ERA40/NETCDF/4xdaily/AN_PL`.
 
 Les fichiers ECMWF INTERIM sont aussi disponibles +todo+.
@@ -775 +800 @@
 
    yyyy
-      année
-
-contient les "mean sea level" toutes les 6 heures sur le globe pour un mois donné.
+      année
+
+contient les "mean sea level" toutes les 6 heures sur le globe pour un mois donné.
 
  - :file:`z.{yyyy}{mm}.aph.nc`
@@ -787 +812 @@
 
    yyyy
-    année
-
-contient les "++" (réanalyse) toutes les 6 heures sur le globe pour un mois donné.
+    année
+
+contient les "++" (réanalyse) toutes les 6 heures sur le globe pour un mois donné.
 
  - :file:`geopt.{yyyy}{mm}.aph.nc` :file:`geopt.{yyyy}{mm}.aph.GLOBAL_1125.nc`
@@ -799 +824 @@
 
    yyyy
-     année
-
-contient les "++" (operationel) toutes les 6 heures sur le globe pour un mois donné.
+     année
+
+contient les "++" (operationel) toutes les 6 heures sur le globe pour un mois donné.
 
 .. _data_olr:
@@ -809 +834 @@
 
 Pour l'instant je ne sais pas grand chose si ce n'est qu'il y a un fichier
-:file:`/usr/temp/lelod/olr_laurence.nc` et qu'il a posé des soucis d'axe de temps (à l'envers ?!) avec SAXO.  ++ à élucider.
+:file:`/usr/temp/lelod/olr_laurence.nc` et qu'il a posé des soucis d'axe de temps (à l'envers ?!) avec SAXO.  ++ à élucider.
 
 Doc sur climserv :
 ftp://ftp.climserv.ipsl.polytechnique.fr/noaa-olr/README
 
- - Moyenne quotidienne globale de 1974 à maintenant :
+ - Moyenne quotidienne globale de 1974 Ã  maintenant :
 
    ftp://ftp.climserv.ipsl.polytechnique.fr/noaa-olr/olr.day.mean.nc ++ que fait-on du champ info ?
 
- - Moyenne quotidienne globale par année :
+ - Moyenne quotidienne globale par année :
 
    :file:`olr.day.mean.{yyyy}.nc`
@@ -825 +850 @@
 
    yyyy
-     année
+     année
 
  - Moyenne quotidienne
 
-   [60° W, 50° E] [30° S, 45° N] par année : :file:`olr.day.mean.{yyyy}_ng.nc`
+   [60° W, 50° E] [30° S, 45° N] par année : :file:`olr.day.mean.{yyyy}_ng.nc`
 
    avec
 
    yyyy
-     année
+     année
 
 Other data sets
@@ -872 +897 @@
 via :file:`/net/zeus/usr/zeus/incas/mousson/maps/varamma_zi.csv`
 
-Figure "zones d'étude" fournie par le CSE via Soukèyé Cissé
+Figure "zones d'étude" fournie par le CSE via SoukÚyé Cissé
 :file:`/net/zeus/usr/zeus/incas/mousson/maps/zones_etudes.jpg`
 
@@ -884 +909 @@
 Outil de dessin : :func:`plot_zi`
 
-Outil de sélection/information : :func:`get_zi_geolocation`
+Outil de sélection/information : :func:`get_zi_geolocation`
 
 .. _data_bathymetry:
@@ -891 +916 @@
 ~~~~~~~~~~~~~~~
 
-Bathymetry used as land/sea information has been provided by Sébastien Masson
+Bathymetry used as land/sea information has been provided by Sébastien Masson
 to Laurence Eymard.
 

trunk/docs/docs_dev/source/guides/glossary.rst

@@ -49 +49 @@
 
    ESPAT
-      Estimation des précipitations par satellite
+      Estimation des précipitations par satellite
 
    LAI
@@ -61 +61 @@
 
    MSG
-      Météosat de sseconde génération
+      Météosat de sseconde génération
 
    PNAT
-      Programme national d'aménagement du territoire
+      Programme national d'aménagement du territoire
 
    GNCL
@@ -71 +71 @@
 
    CSE
-      Centre de suivi écologique
+      Centre de suivi écologique
 
    FAO

trunk/docs/docs_dev/source/guides/installing.rst

@@ -15 +15 @@
 .. _installing:
 
-============
- Installing
-============
+==========
+Installing
+==========
 
 Before installing VARAMMA, be sure to have all the

trunk/docs/docs_dev/source/guides/read_me.rst

@@ -4 +4 @@
 .. ====
 ..
-.. améliorer le plan et le look
+.. améliorer le plan et le look
 ..
 .. pb lien sur manuels
@@ -15 +15 @@
 .. - fplod 20100813T142121Z aedon.locean-ipsl.upmc.fr (Darwin)
 ..
-..   * conversion en ReST de cet aide mémoire de Laurence
+..   * conversion en ReST de cet aide mémoire de Laurence
 ..   * isolatin
 ..
@@ -30 +30 @@
 =========================================================
 
-choix de la zone et de la période
+choix de la zone et de la période
 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
 
@@ -44 +44 @@
    z_fin=[ 40 40 datenum(2007,12,1) 350];
 
-zone définie par les paramètres début et fin, pour le niveau, il fait la moyenne entre les deux niveaux définis
+zone définie par les paramÚtres début et fin, pour le niveau, il fait la moyenne entre les deux niveaux définis
 
 .. code-block:: matlab
@@ -53 +53 @@
    [EOF2D,PC]=affiche_EOF_PC_3D(mat_3D,date,lon,lat);
 
-options:choix des eof affichés: par défaut 1,2,3 sinon, ajouter [2 3 4] pour les trois suivants
+options:choix des eof affichés: par défaut 1,2,3 sinon, ajouter [2 3 4] pour les trois suivants
 
-pour changer d'autres paramètres (titre, par ex, regarder :ref:`affiche_eofpc_3Drev.m` pour identifier les variables à ajouter (le titre est le dixième ou à peu près)
+pour changer d'autres paramÚtres (titre, par ex, regarder :ref:`affiche_eofpc_3Drev.m` pour identifier les variables à ajouter (le titre est le dixiÚme ou à peu prÚs)
 
 Pour sauvegarder la figure en format png:
@@ -66 +66 @@
 ----
 
-Avec :ref:`readAMSU.m`, on lit le fichier 2000-2007 par défaut, sinon
-déclarer le chemin.
+Avec :ref:`readAMSU.m`, on lit le fichier 2000-2007 par défaut, sinon
+déclarer le chemin.
 
-on peut aussi définir z_deb et z_fin pour le choix de la zone et la période (en julien comme pour :ref:`readERA.m`):
+on peut aussi définir z_deb et z_fin pour le choix de la zone et la période (en julien comme pour :ref:`readERA.m`):
 
 .. code-block:: matlab
@@ -85 +85 @@
    [EOF2D,PC]=affiche_EOF_PC_3D(mat_3D,jours,longitude,latitude);
 
-Concernant b5, le problême vient du fait que dans ce canal, il y a des NaN
-persistants après bouchage des trous car le nombre de points manquants est
-important dans la région du golfe persique.
+Concernant b5, le problême vient du fait que dans ce canal, il y a des NaN
+persistants aprÚs bouchage des trous car le nombre de points manquants est
+important dans la région du golfe persique.
 
 Il faut donc refaire une interpolation pour boucher les trous restants :
@@ -101 +101 @@
    [EOF2D,PC]=affiche_EOF_PC_3D(mat_3D_b,jours,longitude,latitude);
 
-pour calculer des eofs sur une partie de l'année, chaque année, utiliser la fonction :ref:`choix_mois.m`:
+pour calculer des eofs sur une partie de l'année, chaque année, utiliser la fonction :ref:`choix_mois.m`:
 
 .. code-block:: matlab
@@ -107 +107 @@
    [mat_3D_s, jours_s]=choix_mois(mat_3D,jours,mois_deb,mois_fin );
 
-puis refaire tourner eof2d avec la bonne entrée.
+puis refaire tourner eof2d avec la bonne entrée.
 
-Pour un fichier mat3D(lat, lon, jours), on sélectionne tous les mois
+Pour un fichier mat3D(lat, lon, jours), on sélectionne tous les mois
 compris entre mois_deb et mois_fin inclus.
 
-ex: pour prendre d'avril à août, on choisit mois_deb=4,mois_fin=8 , de décembre a février: mois_deb=12,mois_fin=2, toute l'année (par défaut): mois_deb=1,mois_fin=12
+ex: pour prendre d'avril à août, on choisit mois_deb=4,mois_fin=8 , de décembre a février: mois_deb=12,mois_fin=2, toute l'année (par défaut): mois_deb=1,mois_fin=12
 
 Calcul des eof sans le cycle annuel : fonction:

trunk/docs/docs_dev/source/guides/sphinx/conf.py

@@ -173 +173 @@
 # (source start file, target name, title, author, documentclass [howto/manual]).
 latex_documents = [
-  ('index', 'varamma.tex', u'varamma Documentation',
-   u'fp', 'manual'),
+  ('index', 'varamma.tex', u'varamma Documentation', u'fp', 'manual'),
 ]
 

trunk/docs/docs_dev/source/index.rst

@@ -21 +21 @@
 ======================
 
-Variabilité AMMA
+Variabilité AMMA
 
 .. only:: html