source: NEMO/trunk/src/OCE/IOM/iom_nf90.F90 @ 10521

Last change on this file since 10521 was 10521, checked in by smasson, 19 months ago

trunk: bugfix for compilation with (at least) gcc, see #2201

  • Property svn:keywords set to Id
File size: 44.8 KB
Line 
1MODULE iom_nf90
2   !!======================================================================
3   !!                    ***  MODULE  iom_nf90 ***
4   !! Input/Output manager :  Library to read input files with NF90 (only fliocom module)
5   !!======================================================================
6   !! History :  9.0  ! 05 12  (J. Belier) Original code
7   !!            9.0  ! 06 02  (S. Masson) Adaptation to NEMO
8   !!             "   ! 07 07  (D. Storkey) Changes to iom_nf90_gettime
9   !!            3.6  ! 2015-15  (J. Harle) Added procedure to read REAL attributes
10   !!            4.0  ! 2017-11 (M. Andrejczuk) Extend IOM interface to write any 3D fields
11   !!----------------------------------------------------------------------
12
13   !!----------------------------------------------------------------------
14   !!   iom_open       : open a file read only
15   !!   iom_close      : close a file or all files opened by iom
16   !!   iom_get        : read a field (interfaced to several routines)
17   !!   iom_gettime    : read the time axis kvid in the file
18   !!   iom_varid      : get the id of a variable in a file
19   !!   iom_rstput     : write a field in a restart file (interfaced to several routines)
20   !!----------------------------------------------------------------------
21   USE dom_oce         ! ocean space and time domain
22   USE lbclnk          ! lateal boundary condition / mpp exchanges
23   USE iom_def         ! iom variables definitions
24   USE netcdf          ! NetCDF library
25   USE in_out_manager  ! I/O manager
26   USE lib_mpp         ! MPP library
27
28   IMPLICIT NONE
29   PRIVATE
30
31   PUBLIC iom_nf90_open  , iom_nf90_close, iom_nf90_varid, iom_nf90_get, iom_nf90_gettime, iom_nf90_rstput
32   PUBLIC iom_nf90_chkatt, iom_nf90_getatt, iom_nf90_putatt
33
34   INTERFACE iom_nf90_get
35      MODULE PROCEDURE iom_nf90_g0d, iom_nf90_g123d
36   END INTERFACE
37   INTERFACE iom_nf90_rstput
38      MODULE PROCEDURE iom_nf90_rp0123d
39   END INTERFACE
40
41   !!----------------------------------------------------------------------
42   !! NEMO/OCE 4.0 , NEMO Consortium (2018)
43   !! $Id$
44   !! Software governed by the CeCILL license (see ./LICENSE)
45   !!----------------------------------------------------------------------
46CONTAINS
47
48   SUBROUTINE iom_nf90_open( cdname, kiomid, ldwrt, ldok, kdompar, kdlev )
49      !!---------------------------------------------------------------------
50      !!                   ***  SUBROUTINE  iom_open  ***
51      !!
52      !! ** Purpose : open an input file with NF90
53      !!---------------------------------------------------------------------
54      CHARACTER(len=*)       , INTENT(inout)           ::   cdname      ! File name
55      INTEGER                , INTENT(  out)           ::   kiomid      ! nf90 identifier of the opened file
56      LOGICAL                , INTENT(in   )           ::   ldwrt       ! read or write the file?
57      LOGICAL                , INTENT(in   )           ::   ldok        ! check the existence
58      INTEGER, DIMENSION(2,5), INTENT(in   ), OPTIONAL ::   kdompar     ! domain parameters:
59      INTEGER                , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   kdlev       ! size of the third dimension
60
61      CHARACTER(LEN=256) ::   clinfo           ! info character
62      CHARACTER(LEN=256) ::   cltmp            ! temporary character
63      INTEGER            ::   iln              ! lengths of character
64      INTEGER            ::   istop            ! temporary storage of nstop
65      INTEGER            ::   if90id           ! nf90 identifier of the opened file
66      INTEGER            ::   idmy             ! dummy variable
67      INTEGER            ::   jl               ! loop variable
68      INTEGER            ::   ichunk           ! temporary storage of nn_chunksz
69      INTEGER            ::   imode            ! creation mode flag: NF90_CLOBBER or NF90_NOCLOBBER or NF90_HDF5
70      INTEGER            ::   ihdf5            ! local variable for retrieval of value for NF90_HDF5
71      LOGICAL            ::   llclobber        ! local definition of ln_clobber
72      INTEGER            ::   ilevels           ! vertical levels
73      !---------------------------------------------------------------------
74      !
75      clinfo = '                    iom_nf90_open ~~~  '
76      istop = nstop     ! store the actual value of nstop
77      !
78      !                 !number of vertical levels
79      IF( PRESENT(kdlev) ) THEN   ;   ilevels = kdlev    ! use input value (useful for sea-ice)
80      ELSE                        ;   ilevels = jpk      ! by default jpk
81      ENDIF
82      !
83      IF( nn_chunksz > 0 ) THEN   ;   ichunk = nn_chunksz
84      ELSE                        ;   ichunk = NF90_SIZEHINT_DEFAULT
85      ENDIF
86      !
87      llclobber = ldwrt .AND. ln_clobber
88      IF( ldok .AND. .NOT. llclobber ) THEN      !==  Open existing file ==!
89         !                                       !=========================!
90         IF( ldwrt ) THEN  ! ... in write mode
91            IF(lwp) WRITE(numout,*) TRIM(clinfo)//' open existing file: '//TRIM(cdname)//' in WRITE mode'
92            IF( snc4set%luse ) THEN
93               CALL iom_nf90_check(NF90_OPEN( TRIM(cdname), NF90_WRITE  , if90id ), clinfo)
94            ELSE
95               CALL iom_nf90_check(NF90_OPEN( TRIM(cdname), NF90_WRITE  , if90id, chunksize = ichunk ), clinfo)
96            ENDIF
97            CALL iom_nf90_check(NF90_SET_FILL( if90id, NF90_NOFILL, idmy                          ), clinfo)
98         ELSE              ! ... in read mode
99            IF(lwp) WRITE(numout,*) TRIM(clinfo)//' open existing file: '//TRIM(cdname)//' in READ mode'
100            CALL iom_nf90_check(NF90_OPEN( TRIM(cdname), NF90_NOWRITE, if90id, chunksize = ichunk ), clinfo)
101         ENDIF
102      ELSE                                       !== the file doesn't exist ==!   (or we overwrite it)
103         !                                       !============================!
104         iln = INDEX( cdname, '.nc' )
105         IF( ldwrt ) THEN              !* the file should be open in write mode so we create it...
106            IF( jpnij > 1 ) THEN
107               WRITE(cltmp,'(a,a,i4.4,a)') cdname(1:iln-1), '_', narea-1, '.nc'
108               cdname = TRIM(cltmp)
109            ENDIF
110            IF(lwp) WRITE(numout,*) TRIM(clinfo)//' create new file: '//TRIM(cdname)//' in WRITE mode'
111
112            IF( llclobber ) THEN   ;   imode = IOR( NF90_64BIT_OFFSET, NF90_CLOBBER   )
113            ELSE                   ;   imode = IOR( NF90_64BIT_OFFSET, NF90_NOCLOBBER ) 
114            ENDIF
115            IF( snc4set%luse ) THEN
116               IF(lwp) WRITE(numout,*) TRIM(clinfo)//' creating file: '//TRIM(cdname)//' in hdf5 (netcdf4) mode'
117               CALL GET_NF90_SYMBOL("NF90_HDF5", ihdf5)
118               IF( llclobber ) THEN   ;   imode = IOR(ihdf5, NF90_CLOBBER)
119               ELSE                   ;   imode = IOR(ihdf5, NF90_NOCLOBBER)
120               ENDIF
121               CALL iom_nf90_check(NF90_CREATE( TRIM(cdname), imode, if90id ), clinfo)
122            ELSE
123               CALL iom_nf90_check(NF90_CREATE( TRIM(cdname), imode, if90id, chunksize = ichunk ), clinfo)
124            ENDIF
125            CALL iom_nf90_check(NF90_SET_FILL( if90id, NF90_NOFILL,                   idmy ), clinfo)
126            ! define dimensions
127            CALL iom_nf90_check(NF90_DEF_DIM( if90id,            'x',   kdompar(1,1), idmy ), clinfo)
128            CALL iom_nf90_check(NF90_DEF_DIM( if90id,            'y',   kdompar(2,1), idmy ), clinfo)
129            CALL iom_nf90_check(NF90_DEF_DIM( if90id,      'nav_lev',            jpk, idmy ), clinfo)
130            CALL iom_nf90_check(NF90_DEF_DIM( if90id, 'time_counter', NF90_UNLIMITED, idmy ), clinfo)
131            IF( PRESENT(kdlev) )   &
132               CALL iom_nf90_check(NF90_DEF_DIM( if90id,    'numcat',          kdlev, idmy ), clinfo)
133            ! global attributes
134            CALL iom_nf90_check(NF90_PUT_ATT( if90id, NF90_GLOBAL, 'DOMAIN_number_total'   , jpnij              ), clinfo)
135            CALL iom_nf90_check(NF90_PUT_ATT( if90id, NF90_GLOBAL, 'DOMAIN_number'         , narea-1            ), clinfo)
136            CALL iom_nf90_check(NF90_PUT_ATT( if90id, NF90_GLOBAL, 'DOMAIN_dimensions_ids' , (/1     , 2     /) ), clinfo)
137            CALL iom_nf90_check(NF90_PUT_ATT( if90id, NF90_GLOBAL, 'DOMAIN_size_global'    , (/jpiglo, jpjglo/) ), clinfo)
138            CALL iom_nf90_check(NF90_PUT_ATT( if90id, NF90_GLOBAL, 'DOMAIN_size_local'     , kdompar(:,1)       ), clinfo)
139            CALL iom_nf90_check(NF90_PUT_ATT( if90id, NF90_GLOBAL, 'DOMAIN_position_first' , kdompar(:,2)       ), clinfo)
140            CALL iom_nf90_check(NF90_PUT_ATT( if90id, NF90_GLOBAL, 'DOMAIN_position_last'  , kdompar(:,3)       ), clinfo)
141            CALL iom_nf90_check(NF90_PUT_ATT( if90id, NF90_GLOBAL, 'DOMAIN_halo_size_start', kdompar(:,4)       ), clinfo)
142            CALL iom_nf90_check(NF90_PUT_ATT( if90id, NF90_GLOBAL, 'DOMAIN_halo_size_end'  , kdompar(:,5)       ), clinfo)
143            CALL iom_nf90_check(NF90_PUT_ATT( if90id, NF90_GLOBAL, 'DOMAIN_type'           , 'BOX'              ), clinfo)
144         ELSE                          !* the file should be open for read mode so it must exist...
145            CALL ctl_stop( TRIM(clinfo), ' should be impossible case...' )
146         ENDIF
147      ENDIF
148      !
149      ! start to fill file informations
150      ! =============
151      IF( istop == nstop ) THEN   ! no error within this routine
152!does not work with some compilers         kiomid = MINLOC(iom_file(:)%nfid, dim = 1)
153         kiomid = 0
154         DO jl = jpmax_files, 1, -1
155            IF( iom_file(jl)%nfid == 0 )   kiomid = jl
156         ENDDO
157         iom_file(kiomid)%name   = TRIM(cdname)
158         iom_file(kiomid)%nfid   = if90id
159         iom_file(kiomid)%nvars  = 0
160         iom_file(kiomid)%irec   = -1   ! useless for NetCDF files, used to know if the file is in define mode
161         iom_file(kiomid)%nlev   = ilevels
162         CALL iom_nf90_check(NF90_Inquire(if90id, unlimitedDimId = iom_file(kiomid)%iduld), clinfo)
163         IF( iom_file(kiomid)%iduld .GE. 0 ) THEN
164            CALL iom_nf90_check(NF90_Inquire_Dimension(if90id, iom_file(kiomid)%iduld,    & 
165               &                                       name = iom_file(kiomid)%uldname,   &
166               &                                       len  = iom_file(kiomid)%lenuld ), clinfo )
167         ENDIF
168         IF(lwp) WRITE(numout,*) '                   ---> '//TRIM(cdname)//' OK'
169      ELSE
170         kiomid = 0               ! return error flag
171      ENDIF
172      !
173   END SUBROUTINE iom_nf90_open
174
175
176   SUBROUTINE iom_nf90_close( kiomid )
177      !!--------------------------------------------------------------------
178      !!                   ***  SUBROUTINE  iom_nf90_close  ***
179      !!
180      !! ** Purpose : close an input file with NF90
181      !!--------------------------------------------------------------------
182      INTEGER, INTENT(in) ::   kiomid   ! iom identifier of the file to be closed
183      CHARACTER(LEN=100)  ::   clinfo   ! info character
184      !---------------------------------------------------------------------
185      clinfo = '      iom_nf90_close    , file: '//TRIM(iom_file(kiomid)%name)
186      CALL iom_nf90_check(NF90_CLOSE(iom_file(kiomid)%nfid), clinfo)
187   END SUBROUTINE iom_nf90_close
188
189
190   FUNCTION iom_nf90_varid ( kiomid, cdvar, kiv, kdimsz, kndims ) 
191      !!-----------------------------------------------------------------------
192      !!                  ***  FUNCTION  iom_varid  ***
193      !!
194      !! ** Purpose : get the id of a variable in a file with NF90
195      !!-----------------------------------------------------------------------
196      INTEGER              , INTENT(in   )           ::   kiomid   ! file Identifier
197      CHARACTER(len=*)     , INTENT(in   )           ::   cdvar    ! name of the variable
198      INTEGER              , INTENT(in   )           ::   kiv   !
199      INTEGER, DIMENSION(:), INTENT(  out), OPTIONAL ::   kdimsz   ! size of the dimensions
200      INTEGER,               INTENT(  out), OPTIONAL ::   kndims   ! size of the dimensions
201      !
202      INTEGER                        ::   iom_nf90_varid   ! iom variable Id
203      INTEGER                        ::   if90id           ! nf90 file identifier
204      INTEGER                        ::   ji               ! dummy loop index
205      INTEGER                        ::   ivarid           ! NetCDF  variable Id
206      INTEGER                        ::   i_nvd            ! number of dimension of the variable
207      INTEGER, DIMENSION(jpmax_dims) ::   idimid           ! dimension ids of the variable
208      LOGICAL                        ::   llok             ! ok  test
209      CHARACTER(LEN=100)             ::   clinfo           ! info character
210      !!-----------------------------------------------------------------------
211      clinfo = '          iom_nf90_varid, file: '//TRIM(iom_file(kiomid)%name)//', var: '//TRIM(cdvar)
212      iom_nf90_varid = 0                    ! default definition
213      IF( PRESENT(kdimsz) ) kdimsz(:) = 0   ! default definition
214      if90id = iom_file(kiomid)%nfid        ! get back NetCDF file id
215      !
216      llok = NF90_INQ_VARID( if90id, TRIM(cdvar), ivarid ) == nf90_noerr   ! does the variable exist in the file
217      IF( llok ) THEN
218         iom_nf90_varid = kiv
219         iom_file(kiomid)%nvars       = kiv
220         iom_file(kiomid)%nvid(kiv)   = ivarid
221         iom_file(kiomid)%cn_var(kiv) = TRIM(cdvar)
222         CALL iom_nf90_check(NF90_Inquire_Variable(if90id, ivarid, ndims = i_nvd), clinfo)   ! number of dimensions
223         iom_file(kiomid)%ndims(kiv)  = i_nvd
224         CALL iom_nf90_check(NF90_Inquire_Variable(if90id, ivarid, dimids = idimid(1:i_nvd)), clinfo)   ! dimensions ids
225         iom_file(kiomid)%luld(kiv) = .FALSE.   ! default value
226         iom_file(kiomid)%dimsz(:,kiv) = 0      ! reset dimsz in case previously used
227         DO ji = 1, i_nvd                       ! dimensions size
228            CALL iom_nf90_check(NF90_Inquire_Dimension(if90id, idimid(ji), len = iom_file(kiomid)%dimsz(ji,kiv)), clinfo)   
229            IF( idimid(ji) == iom_file(kiomid)%iduld ) iom_file(kiomid)%luld(kiv) = .TRUE.   ! unlimited dimension?
230         END DO
231         !---------- Deal with scale_factor and add_offset
232         llok = NF90_Inquire_attribute(if90id, ivarid, 'scale_factor') == nf90_noerr
233         IF( llok) THEN
234            CALL iom_nf90_check(NF90_GET_ATT(if90id, ivarid, 'scale_factor', iom_file(kiomid)%scf(kiv)), clinfo)
235         ELSE
236            iom_file(kiomid)%scf(kiv) = 1.
237         END IF
238         llok = NF90_Inquire_attribute(if90id, ivarid, 'add_offset') == nf90_noerr
239         IF( llok ) THEN
240            CALL iom_nf90_check(NF90_GET_ATT(if90id, ivarid, 'add_offset', iom_file(kiomid)%ofs(kiv)), clinfo)
241         ELSE
242            iom_file(kiomid)%ofs(kiv) = 0.
243         END IF
244         ! return the simension size
245         IF( PRESENT(kdimsz) ) THEN
246            IF( i_nvd <= SIZE(kdimsz) ) THEN
247               kdimsz(1:i_nvd) = iom_file(kiomid)%dimsz(1:i_nvd,kiv)
248            ELSE
249               WRITE(ctmp1,*) i_nvd, SIZE(kdimsz)
250               CALL ctl_stop( TRIM(clinfo), 'error in kdimsz size'//TRIM(ctmp1) )
251            ENDIF
252         ENDIF
253         IF( PRESENT(kndims) )  kndims = iom_file(kiomid)%ndims(kiv)
254      ELSE 
255         iom_nf90_varid = -1   !   variable not found, return error code: -1
256      ENDIF
257      !
258   END FUNCTION iom_nf90_varid
259
260   !!----------------------------------------------------------------------
261   !!                   INTERFACE iom_nf90_get
262   !!----------------------------------------------------------------------
263
264   SUBROUTINE iom_nf90_g0d( kiomid, kvid, pvar, kstart )
265      !!-----------------------------------------------------------------------
266      !!                  ***  ROUTINE  iom_nf90_g0d  ***
267      !!
268      !! ** Purpose : read a scalar with NF90
269      !!-----------------------------------------------------------------------
270      INTEGER ,               INTENT(in   )            ::   kiomid   ! Identifier of the file
271      INTEGER ,               INTENT(in   )            ::   kvid     ! variable id
272      REAL(wp),               INTENT(  out)            ::   pvar     ! read field
273      INTEGER , DIMENSION(1), INTENT(in   ), OPTIONAL  ::   kstart   ! start position of the reading in each axis
274      !
275      CHARACTER(LEN=100)      ::   clinfo   ! info character
276      !---------------------------------------------------------------------
277      clinfo = 'iom_nf90_g0d , file: '//TRIM(iom_file(kiomid)%name)//', var: '//TRIM(iom_file(kiomid)%cn_var(kvid))
278      CALL iom_nf90_check(NF90_GET_VAR(iom_file(kiomid)%nfid, iom_file(kiomid)%nvid(kvid), pvar, start = kstart), clinfo )
279   END SUBROUTINE iom_nf90_g0d
280
281
282   SUBROUTINE iom_nf90_g123d( kiomid, kvid, knbdim, kstart, kcount, kx1, kx2, ky1, ky2,   &
283         &                    pv_r1d, pv_r2d, pv_r3d )
284      !!-----------------------------------------------------------------------
285      !!                  ***  ROUTINE  iom_nf90_g123d  ***
286      !!
287      !! ** Purpose : read a 1D/2D/3D variable with NF90
288      !!
289      !! ** Method : read ONE record at each CALL
290      !!-----------------------------------------------------------------------
291      INTEGER                    , INTENT(in   )           ::   kiomid    ! iom identifier of the file
292      INTEGER                    , INTENT(in   )           ::   kvid      ! Name of the variable
293      INTEGER                    , INTENT(in   )           ::   knbdim    ! number of dimensions of the variable
294      INTEGER , DIMENSION(:)     , INTENT(in   )           ::   kstart    ! start position of the reading in each axis
295      INTEGER , DIMENSION(:)     , INTENT(in   )           ::   kcount    ! number of points to be read in each axis
296      INTEGER ,                    INTENT(in   )           ::   kx1, kx2, ky1, ky2   ! subdomain indexes
297      REAL(wp), DIMENSION(:)     , INTENT(  out), OPTIONAL ::   pv_r1d    ! read field (1D case)
298      REAL(wp), DIMENSION(:,:)   , INTENT(  out), OPTIONAL ::   pv_r2d    ! read field (2D case)
299      REAL(wp), DIMENSION(:,:,:) , INTENT(  out), OPTIONAL ::   pv_r3d    ! read field (3D case)
300      !
301      CHARACTER(LEN=100) ::   clinfo               ! info character
302      INTEGER            ::   if90id               ! nf90 identifier of the opened file
303      INTEGER            ::   ivid                 ! nf90 variable id
304      !---------------------------------------------------------------------
305      clinfo = 'iom_nf90_g123d , file: '//TRIM(iom_file(kiomid)%name)//', var: '//TRIM(iom_file(kiomid)%cn_var(kvid))
306      if90id = iom_file(kiomid)%nfid         ! get back NetCDF file id
307      ivid   = iom_file(kiomid)%nvid(kvid)   ! get back NetCDF var id
308      !
309      IF(     PRESENT(pv_r1d) ) THEN
310         CALL iom_nf90_check( NF90_GET_VAR(if90id, ivid, pv_r1d(:                ), start = kstart(1:knbdim),   &
311            &                                                                       count = kcount(1:knbdim)), clinfo )
312      ELSEIF( PRESENT(pv_r2d) ) THEN
313         CALL iom_nf90_check( NF90_GET_VAR(if90id, ivid, pv_r2d(kx1:kx2,ky1:ky2  ), start = kstart(1:knbdim),   &
314            &                                                                       count = kcount(1:knbdim)), clinfo )
315      ELSEIF( PRESENT(pv_r3d) ) THEN
316         CALL iom_nf90_check( NF90_GET_VAR(if90id, ivid, pv_r3d(kx1:kx2,ky1:ky2,:), start = kstart(1:knbdim),   &
317            &                                                                       count = kcount(1:knbdim)), clinfo )
318      ENDIF
319      !
320   END SUBROUTINE iom_nf90_g123d
321
322
323   SUBROUTINE iom_nf90_chkatt( kiomid, cdatt, llok, ksize, cdvar )
324      !!-----------------------------------------------------------------------
325      !!                  ***  ROUTINE  iom_nf90_chkatt  ***
326      !!
327      !! ** Purpose : check existence of attribute with NF90
328      !!              (either a global attribute (default) or a variable
329      !!               attribute if optional variable name is supplied (cdvar))
330      !!-----------------------------------------------------------------------
331      INTEGER         , INTENT(in   ) ::   kiomid   ! Identifier of the file
332      CHARACTER(len=*), INTENT(in   ) ::   cdatt    ! attribute name
333      LOGICAL         , INTENT(  out) ::   llok     ! error code
334      INTEGER         , INTENT(  out), OPTIONAL     &
335                      &               ::   ksize    ! attribute size
336      CHARACTER(len=*), INTENT(in   ), OPTIONAL     &
337                      &               ::   cdvar    ! name of the variable
338      !
339      INTEGER                         ::   if90id   ! temporary integer
340      INTEGER                         ::   isize    ! temporary integer
341      INTEGER                         ::   ivarid   ! NetCDF variable Id
342      !---------------------------------------------------------------------
343      !
344      if90id = iom_file(kiomid)%nfid
345      IF( PRESENT(cdvar) ) THEN
346         ! check the variable exists in the file
347         llok = NF90_INQ_VARID( if90id, TRIM(cdvar), ivarid ) == nf90_noerr
348         IF( llok ) &
349            ! check the variable has the attribute required
350            llok = NF90_Inquire_attribute(if90id, ivarid, cdatt, len=isize ) == nf90_noerr
351      ELSE
352         llok = NF90_Inquire_attribute(if90id, NF90_GLOBAL, cdatt, len=isize ) == nf90_noerr
353      ENDIF
354      !
355      IF( PRESENT(ksize) ) ksize = isize
356      !
357      IF( .not. llok) &
358         CALL ctl_warn('iom_nf90_chkatt: no attribute '//cdatt//' found')
359      !
360   END SUBROUTINE iom_nf90_chkatt
361
362
363   !!----------------------------------------------------------------------
364   !!                   INTERFACE iom_nf90_getatt
365   !!----------------------------------------------------------------------
366
367   SUBROUTINE iom_nf90_getatt( kiomid, cdatt, katt0d, katt1d, patt0d, patt1d, cdatt0d, cdvar)
368      !!-----------------------------------------------------------------------
369      !!                  ***  ROUTINE  iom_nf90_getatt  ***
370      !!
371      !! ** Purpose : read an attribute with NF90
372      !!              (either a global attribute (default) or a variable
373      !!               attribute if optional variable name is supplied (cdvar))
374      !!-----------------------------------------------------------------------
375      INTEGER               , INTENT(in   )           ::   kiomid   ! Identifier of the file
376      CHARACTER(len=*)      , INTENT(in   )           ::   cdatt    ! attribute name
377      INTEGER               , INTENT(  out), OPTIONAL ::   katt0d   ! read scalar integer
378      INTEGER, DIMENSION(:) , INTENT(  out), OPTIONAL ::   katt1d   ! read 1d array integer
379      REAL(wp)              , INTENT(  out), OPTIONAL ::   patt0d   ! read scalar  real
380      REAL(wp), DIMENSION(:), INTENT(  out), OPTIONAL ::   patt1d   ! read 1d array real
381      CHARACTER(len=*)      , INTENT(  out), OPTIONAL ::   cdatt0d  ! read character
382      CHARACTER(len=*)      , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   cdvar    ! name of the variable
383      !
384      INTEGER                         ::   if90id   ! temporary integer
385      INTEGER                         ::   ivarid   ! NetCDF variable Id
386      LOGICAL                         ::   llok     ! temporary logical
387      CHARACTER(LEN=100)              ::   clinfo   ! info character
388      !---------------------------------------------------------------------
389      !
390      if90id = iom_file(kiomid)%nfid
391      IF( PRESENT(cdvar) ) THEN
392         ! check the variable exists in the file
393         llok = NF90_INQ_VARID( if90id, TRIM(cdvar), ivarid ) == nf90_noerr
394         IF( llok ) THEN
395            ! check the variable has the attribute required
396            llok = NF90_Inquire_attribute(if90id, ivarid, cdatt) == nf90_noerr
397         ELSE
398            CALL ctl_warn('iom_nf90_getatt: no variable '//TRIM(cdvar)//' found')
399         ENDIF
400      ELSE
401         llok = NF90_Inquire_attribute(if90id, NF90_GLOBAL, cdatt) == nf90_noerr
402         ivarid = NF90_GLOBAL
403      ENDIF
404      !
405      IF( llok) THEN
406         clinfo = 'iom_nf90_getatt, file: '//TRIM(iom_file(kiomid)%name)//', att: '//TRIM(cdatt)
407         IF(PRESENT( katt0d))   CALL iom_nf90_check(NF90_GET_ATT(if90id, ivarid, cdatt, values =  katt0d), clinfo)
408         IF(PRESENT( katt1d))   CALL iom_nf90_check(NF90_GET_ATT(if90id, ivarid, cdatt, values =  katt1d), clinfo)
409         IF(PRESENT( patt0d))   CALL iom_nf90_check(NF90_GET_ATT(if90id, ivarid, cdatt, values =  patt0d), clinfo)
410         IF(PRESENT( patt1d))   CALL iom_nf90_check(NF90_GET_ATT(if90id, ivarid, cdatt, values =  patt1d), clinfo)
411         IF(PRESENT(cdatt0d))   CALL iom_nf90_check(NF90_GET_ATT(if90id, ivarid, cdatt, values = cdatt0d), clinfo)
412      ELSE
413         CALL ctl_warn('iom_nf90_getatt: no attribute '//TRIM(cdatt)//' found')
414         IF(PRESENT( katt0d))    katt0d    = -999
415         IF(PRESENT( katt1d))    katt1d(:) = -999
416         IF(PRESENT( patt0d))    patt0d    = -999._wp
417         IF(PRESENT( patt1d))    patt1d(:) = -999._wp
418         IF(PRESENT(cdatt0d))   cdatt0d    = '!'
419      ENDIF
420      !
421   END SUBROUTINE iom_nf90_getatt
422
423
424   SUBROUTINE iom_nf90_putatt( kiomid, cdatt, katt0d, katt1d, patt0d, patt1d, cdatt0d, cdvar)
425      !!-----------------------------------------------------------------------
426      !!                  ***  ROUTINE  iom_nf90_putatt  ***
427      !!
428      !! ** Purpose : write an attribute with NF90
429      !!              (either a global attribute (default) or a variable
430      !!               attribute if optional variable name is supplied (cdvar))
431      !!-----------------------------------------------------------------------
432      INTEGER               , INTENT(in   )           ::   kiomid   ! Identifier of the file
433      CHARACTER(len=*)      , INTENT(in   )           ::   cdatt    ! attribute name
434      INTEGER               , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   katt0d   ! read scalar integer
435      INTEGER, DIMENSION(:) , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   katt1d   ! read 1d array integer
436      REAL(wp)              , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   patt0d   ! read scalar  real
437      REAL(wp), DIMENSION(:), INTENT(in   ), OPTIONAL ::   patt1d   ! read 1d array real
438      CHARACTER(len=*)      , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   cdatt0d  ! read character
439      CHARACTER(len=*)      , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   cdvar    ! name of the variable
440      !
441      INTEGER                         ::   if90id   ! temporary integer
442      INTEGER                         ::   ivarid   ! NetCDF variable Id
443      INTEGER                         ::   isize    ! Attribute size
444      INTEGER                         ::   itype    ! Attribute type
445      LOGICAL                         ::   llok     ! temporary logical
446      LOGICAL                         ::   llatt     ! temporary logical
447      LOGICAL                         ::   lldata   ! temporary logical
448      CHARACTER(LEN=100)              ::   clinfo   ! info character
449      !---------------------------------------------------------------------
450      !
451      if90id = iom_file(kiomid)%nfid
452      IF( PRESENT(cdvar) ) THEN
453         llok = NF90_INQ_VARID( if90id, TRIM(cdvar), ivarid ) == nf90_noerr   ! is the variable in the file?
454         IF( .NOT. llok ) THEN
455            CALL ctl_warn('iom_nf90_putatt: no variable '//TRIM(cdvar)//' found'   &
456               &        , '                 no attribute '//cdatt//' written' )
457            RETURN
458         ENDIF
459      ELSE
460         ivarid = NF90_GLOBAL
461      ENDIF
462      llatt = NF90_Inquire_attribute(if90id, ivarid, cdatt, len = isize, xtype = itype ) == nf90_noerr
463      !
464      ! trick: irec used to know if the file is in define mode or not
465      lldata = iom_file(kiomid)%irec /= -1   ! default: go back in define mode if in data mode
466      IF( lldata .AND. llatt ) THEN          ! attribute already there. Do we really need to go back in define mode?
467         ! do we have the appropriate type?
468         IF(PRESENT( katt0d) .OR. PRESENT( katt1d))   llok = itype == NF90_INT
469         IF(PRESENT( patt0d) .OR. PRESENT( patt1d))   llok = itype == NF90_DOUBLE
470         IF(PRESENT(cdatt0d)                      )   llok = itype == NF90_CHAR
471         ! and do we have the appropriate size?
472         IF(PRESENT( katt0d))   llok = llok .AND. isize == 1
473         IF(PRESENT( katt1d))   llok = llok .AND. isize == SIZE(katt1d)
474         IF(PRESENT( patt0d))   llok = llok .AND. isize == 1
475         IF(PRESENT( patt1d))   llok = llok .AND. isize == SIZE(patt1d)
476         IF(PRESENT(cdatt0d))   llok = llok .AND. isize == LEN_TRIM(cdatt0d)
477         !
478         lldata = .NOT. llok
479      ENDIF
480      !
481      clinfo = 'iom_nf90_putatt, file: '//TRIM(iom_file(kiomid)%name)//', att: '//TRIM(cdatt)
482      IF(lldata)   CALL iom_nf90_check(NF90_REDEF( if90id ), clinfo)   ! leave data mode to define mode
483      !
484      IF(PRESENT( katt0d))   CALL iom_nf90_check(NF90_PUT_ATT(if90id, ivarid, cdatt, values =       katt0d) , clinfo)
485      IF(PRESENT( katt1d))   CALL iom_nf90_check(NF90_PUT_ATT(if90id, ivarid, cdatt, values =       katt1d) , clinfo)
486      IF(PRESENT( patt0d))   CALL iom_nf90_check(NF90_PUT_ATT(if90id, ivarid, cdatt, values =       patt0d) , clinfo)
487      IF(PRESENT( patt1d))   CALL iom_nf90_check(NF90_PUT_ATT(if90id, ivarid, cdatt, values =       patt1d) , clinfo)
488      IF(PRESENT(cdatt0d))   CALL iom_nf90_check(NF90_PUT_ATT(if90id, ivarid, cdatt, values = trim(cdatt0d)), clinfo)
489      !
490      IF(lldata)   CALL iom_nf90_check(NF90_ENDDEF( if90id ), clinfo)   ! leave define mode to data mode
491      !
492   END SUBROUTINE iom_nf90_putatt
493
494
495   SUBROUTINE iom_nf90_gettime( kiomid, kvid, ptime, cdunits, cdcalendar )
496      !!--------------------------------------------------------------------
497      !!                   ***  SUBROUTINE iom_gettime  ***
498      !!
499      !! ** Purpose : read the time axis kvid in the file with NF90
500      !!--------------------------------------------------------------------
501      INTEGER                   , INTENT(in   ) ::   kiomid     ! file Identifier
502      INTEGER                   , INTENT(in   ) ::   kvid       ! variable id
503      REAL(wp), DIMENSION(:)    , INTENT(  out) ::   ptime      ! the time axis
504      CHARACTER(len=*), OPTIONAL, INTENT(  out) ::   cdunits    ! units attribute
505      CHARACTER(len=*), OPTIONAL, INTENT(  out) ::   cdcalendar ! calendar attribute
506      !
507      CHARACTER(LEN=100) ::   clinfo     ! info character
508      !---------------------------------------------------------------------
509      clinfo = 'iom_nf90_gettime, file: '//TRIM(iom_file(kiomid)%name)//', var: '//TRIM(iom_file(kiomid)%cn_var(kvid))
510      CALL iom_nf90_check(NF90_GET_VAR(iom_file(kiomid)%nfid, iom_file(kiomid)%nvid(kvid), ptime(:),   &
511            &                           start=(/ 1 /), count=(/ iom_file(kiomid)%dimsz(1, kvid) /)), clinfo)
512      IF ( PRESENT(cdunits) ) THEN
513         CALL iom_nf90_check(NF90_GET_ATT(iom_file(kiomid)%nfid, iom_file(kiomid)%nvid(kvid), "units", &
514            &                           values=cdunits), clinfo)
515      ENDIF
516      IF ( PRESENT(cdcalendar) ) THEN
517         CALL iom_nf90_check(NF90_GET_ATT(iom_file(kiomid)%nfid, iom_file(kiomid)%nvid(kvid), "calendar", &
518            &                           values=cdcalendar), clinfo)
519      ENDIF
520      !
521   END SUBROUTINE iom_nf90_gettime
522
523
524   SUBROUTINE iom_nf90_rp0123d( kt, kwrite, kiomid, cdvar , kvid  , ktype,   &
525         &                                  pv_r0d, pv_r1d, pv_r2d, pv_r3d )
526      !!--------------------------------------------------------------------
527      !!                   ***  SUBROUTINE  iom_nf90_rstput  ***
528      !!
529      !! ** Purpose : read the time axis cdvar in the file
530      !!--------------------------------------------------------------------
531      INTEGER                     , INTENT(in)           ::   kt       ! ocean time-step
532      INTEGER                     , INTENT(in)           ::   kwrite   ! writing time-step
533      INTEGER                     , INTENT(in)           ::   kiomid   ! Identifier of the file
534      CHARACTER(len=*)            , INTENT(in)           ::   cdvar    ! variable name
535      INTEGER                     , INTENT(in)           ::   kvid     ! variable id
536      INTEGER                     , INTENT(in), OPTIONAL ::   ktype    ! variable type (default R8)
537      REAL(wp)                    , INTENT(in), OPTIONAL ::   pv_r0d   ! written Od field
538      REAL(wp), DIMENSION(      :), INTENT(in), OPTIONAL ::   pv_r1d   ! written 1d field
539      REAL(wp), DIMENSION(:, :   ), INTENT(in), OPTIONAL ::   pv_r2d   ! written 2d field
540      REAL(wp), DIMENSION(:, :, :), INTENT(in), OPTIONAL ::   pv_r3d   ! written 3d field
541      !
542      INTEGER               :: idims                ! number of dimension
543      INTEGER               :: idvar                ! variable id
544      INTEGER               :: jd                   ! dimension loop counter   
545      INTEGER               :: ix1, ix2, iy1, iy2   ! subdomain indexes   
546      INTEGER, DIMENSION(4) :: idimsz               ! dimensions size 
547      INTEGER, DIMENSION(4) :: idimid               ! dimensions id
548      CHARACTER(LEN=256)    :: clinfo               ! info character
549      CHARACTER(LEN= 12), DIMENSION(5) :: cltmp     ! temporary character
550      INTEGER               :: if90id               ! nf90 file identifier
551      INTEGER               :: idmy                 ! dummy variable
552      INTEGER               :: itype                ! variable type
553      INTEGER, DIMENSION(4) :: ichunksz             ! NetCDF4 chunk sizes. Will be computed using
554      !                                             ! nn_nchunks_[i,j,k,t] namelist parameters
555      INTEGER               :: ichunkalg, ishuffle, ideflate, ideflate_level
556      !                                             ! NetCDF4 internally fixed parameters
557      LOGICAL               :: lchunk               ! logical switch to activate chunking and compression
558      !                                             ! when appropriate (currently chunking is applied to 4d fields only)
559      INTEGER               :: idlv                 ! local variable
560      INTEGER               :: idim3                ! id of the third dimension
561      !---------------------------------------------------------------------
562      !
563      clinfo = '          iom_nf90_rp0123d, file: '//TRIM(iom_file(kiomid)%name)//', var: '//TRIM(cdvar)
564      if90id = iom_file(kiomid)%nfid
565      !
566      ! define dimension variables if it is not already done
567      ! ==========================
568      IF( iom_file(kiomid)%nvars == 0 ) THEN
569         ! are we in define mode?
570         IF( iom_file(kiomid)%irec /= -1 ) THEN   ! trick: irec used to know if the file is in define mode or not
571            CALL iom_nf90_check(NF90_REDEF( if90id ), clinfo)   ;   iom_file(kiomid)%irec = -1
572         ENDIF
573         ! define the dimension variables if it is not already done
574         ! Warning: we must use the same character length in an array constructor (at least for gcc compiler)
575         cltmp = (/ 'nav_lon     ', 'nav_lat     ', 'nav_lev     ', 'time_counter', 'numcat      ' /)   
576         CALL iom_nf90_check(NF90_DEF_VAR( if90id, TRIM(cltmp(1)), NF90_FLOAT , (/ 1, 2 /), iom_file(kiomid)%nvid(1) ), clinfo)
577         CALL iom_nf90_check(NF90_DEF_VAR( if90id, TRIM(cltmp(2)), NF90_FLOAT , (/ 1, 2 /), iom_file(kiomid)%nvid(2) ), clinfo)
578         CALL iom_nf90_check(NF90_DEF_VAR( if90id, TRIM(cltmp(3)), NF90_FLOAT , (/ 3    /), iom_file(kiomid)%nvid(3) ), clinfo)
579         CALL iom_nf90_check(NF90_DEF_VAR( if90id, TRIM(cltmp(4)), NF90_DOUBLE, (/ 4    /), iom_file(kiomid)%nvid(4) ), clinfo)
580         ! update informations structure related the dimension variable we just added...
581         iom_file(kiomid)%nvars       = 4
582         iom_file(kiomid)%luld(1:4)   = (/ .FALSE., .FALSE., .FALSE., .TRUE. /)
583         iom_file(kiomid)%cn_var(1:4) = cltmp(1:4)
584         iom_file(kiomid)%ndims(1:4)  = (/ 2, 2, 1, 1 /)
585         IF( NF90_INQ_DIMID( if90id, 'numcat', idmy ) == nf90_noerr ) THEN   ! add a 5th variable corresponding to the 5th dimension
586            CALL iom_nf90_check(NF90_DEF_VAR( if90id, TRIM(cltmp(5)), NF90_FLOAT , (/ 5 /), iom_file(kiomid)%nvid(5) ), clinfo)
587            iom_file(kiomid)%nvars     = 5
588            iom_file(kiomid)%luld(5)   = .FALSE.
589            iom_file(kiomid)%cn_var(5) = cltmp(5)
590            iom_file(kiomid)%ndims(5)  = 1
591         ENDIF
592         ! trick: defined to 0 to say that dimension variables are defined but not yet written
593         iom_file(kiomid)%dimsz(1, 1)  = 0   
594         IF(lwp) WRITE(numout,*) TRIM(clinfo)//' define dimension variables done'
595      ENDIF
596      ! define the data if it is not already done
597      ! ===============
598      IF( kvid <= 0 ) THEN
599         !
600         ! NetCDF4 chunking and compression fixed settings
601         ichunkalg = 0
602         ishuffle = 1
603         ideflate = 1
604         ideflate_level = 1
605         !
606         idvar = iom_file(kiomid)%nvars + 1
607         ! are we in define mode?
608         IF( iom_file(kiomid)%irec /= -1 ) THEN   ! trick: irec used to know if the file is in define mode or not
609            CALL iom_nf90_check(NF90_REDEF( if90id ), clinfo)   ;   iom_file(kiomid)%irec = -1
610         ENDIF
611         ! variable definition
612         IF(     PRESENT(pv_r0d) ) THEN   ;   idims = 0
613         ELSEIF( PRESENT(pv_r1d) ) THEN
614            IF( SIZE(pv_r1d,1) == jpk ) THEN   ;   idim3 = 3
615            ELSE                               ;   idim3 = 5
616            ENDIF
617                                              idims = 2   ;   idimid(1:idims) = (/idim3,4/)
618         ELSEIF( PRESENT(pv_r2d) ) THEN   ;   idims = 3   ;   idimid(1:idims) = (/1,2  ,4/)
619         ELSEIF( PRESENT(pv_r3d) ) THEN
620            IF( SIZE(pv_r3d,3) == jpk ) THEN   ;   idim3 = 3
621            ELSE                               ;   idim3 = 5
622            ENDIF
623                                              idims = 4   ;   idimid(1:idims) = (/1,2,idim3,4/)
624         ENDIF
625         IF( PRESENT(ktype) ) THEN   ! variable external type
626            SELECT CASE (ktype)
627            CASE (jp_r8)   ;   itype = NF90_DOUBLE
628            CASE (jp_r4)   ;   itype = NF90_FLOAT
629            CASE (jp_i4)   ;   itype = NF90_INT
630            CASE (jp_i2)   ;   itype = NF90_SHORT
631            CASE (jp_i1)   ;   itype = NF90_BYTE
632            CASE DEFAULT   ;   CALL ctl_stop( TRIM(clinfo)//' unknown variable type' )
633            END SELECT
634         ELSE
635            itype = NF90_DOUBLE
636         ENDIF
637         IF( PRESENT(pv_r0d) ) THEN
638            CALL iom_nf90_check(NF90_DEF_VAR( if90id, TRIM(cdvar), itype,                    &
639               &                              iom_file(kiomid)%nvid(idvar) ), clinfo )
640         ELSE
641            CALL iom_nf90_check(NF90_DEF_VAR( if90id, TRIM(cdvar), itype, idimid(1:idims),   &
642               &                              iom_file(kiomid)%nvid(idvar) ), clinfo )
643         ENDIF
644         lchunk = .false.
645         IF( snc4set%luse .AND. idims == 4 )   lchunk = .true.
646         ! update informations structure related the new variable we want to add...
647         iom_file(kiomid)%nvars         = idvar
648         iom_file(kiomid)%cn_var(idvar) = TRIM(cdvar)
649         iom_file(kiomid)%scf(idvar)    = 1.
650         iom_file(kiomid)%ofs(idvar)    = 0.
651         iom_file(kiomid)%ndims(idvar)  = idims
652         IF( .NOT. PRESENT(pv_r0d) ) THEN   ;   iom_file(kiomid)%luld(idvar) = .TRUE.
653         ELSE                               ;   iom_file(kiomid)%luld(idvar) = .FALSE.
654         ENDIF
655         DO jd = 1, idims
656            CALL iom_nf90_check(NF90_INQUIRE_DIMENSION( if90id, idimid(jd), len = iom_file(kiomid)%dimsz(jd,idvar) ), clinfo)
657            IF ( lchunk ) ichunksz(jd) = iom_file(kiomid)%dimsz(jd,idvar)
658         END DO
659         IF ( lchunk ) THEN
660            ! Calculate chunk sizes by partitioning each dimension as requested in namnc4 namelist
661            ! Disallow very small chunk sizes and prevent chunk sizes larger than each individual dimension
662            ichunksz(1) = MIN( ichunksz(1),MAX( (ichunksz(1)-1)/snc4set%ni + 1 ,16 ) ) ! Suggested default nc4set%ni=4
663            ichunksz(2) = MIN( ichunksz(2),MAX( (ichunksz(2)-1)/snc4set%nj + 1 ,16 ) ) ! Suggested default nc4set%nj=2
664            ichunksz(3) = MIN( ichunksz(3),MAX( (ichunksz(3)-1)/snc4set%nk + 1 , 1 ) ) ! Suggested default nc4set%nk=6
665            ichunksz(4) = 1                                                            ! Do not allow chunks to span the
666            !                                                                          ! unlimited dimension
667            CALL iom_nf90_check(SET_NF90_DEF_VAR_CHUNKING(if90id, idvar, ichunkalg, ichunksz), clinfo)
668            CALL iom_nf90_check(SET_NF90_DEF_VAR_DEFLATE(if90id, idvar, ishuffle, ideflate, ideflate_level), clinfo)
669            IF(lwp) WRITE(numout,*) TRIM(clinfo)//' chunked ok. Chunks sizes: ', ichunksz
670         ENDIF
671         IF(lwp) WRITE(numout,*) TRIM(clinfo)//' defined ok'
672      ELSE
673         idvar = kvid
674      ENDIF
675      !
676      ! time step kwrite : write the variable
677      IF( kt == kwrite ) THEN
678         ! are we in write mode?
679         IF( iom_file(kiomid)%irec == -1 ) THEN   ! trick: irec used to know if the file is in define mode or not
680            CALL iom_nf90_check(NF90_ENDDEF( if90id ), clinfo)   ;   iom_file(kiomid)%irec = 0
681         ENDIF
682         ! on what kind of domain must the data be written?
683         IF( PRESENT(pv_r2d) .OR. PRESENT(pv_r3d) ) THEN
684            idimsz(1:2) = iom_file(kiomid)%dimsz(1:2,idvar)
685            IF(     idimsz(1) == (nlei - nldi + 1) .AND. idimsz(2) == (nlej - nldj + 1) ) THEN
686               ix1 = nldi   ;   ix2 = nlei   ;   iy1 = nldj   ;   iy2 = nlej
687            ELSEIF( idimsz(1) == nlci              .AND. idimsz(2) == nlcj              ) THEN
688               ix1 = 1      ;   ix2 = nlci   ;   iy1 = 1      ;   iy2 = nlcj
689            ELSEIF( idimsz(1) == jpi               .AND. idimsz(2) == jpj               ) THEN
690               ix1 = 1      ;   ix2 = jpi    ;   iy1 = 1      ;   iy2 = jpj
691            ELSE
692               CALL ctl_stop( 'iom_nf90_rp0123d: should have been an impossible case...' )
693            ENDIF
694
695            ! write dimension variables if it is not already done
696            ! =============
697            ! trick: is defined to 0 => dimension variable are defined but not yet written
698            IF( iom_file(kiomid)%dimsz(1, 1) == 0 ) THEN
699               CALL iom_nf90_check( NF90_INQ_VARID( if90id, 'nav_lon'     , idmy )         , clinfo )
700               CALL iom_nf90_check( NF90_PUT_VAR  ( if90id, idmy, glamt(ix1:ix2, iy1:iy2) ), clinfo )
701               CALL iom_nf90_check( NF90_INQ_VARID( if90id, 'nav_lat'     , idmy )         , clinfo )
702               CALL iom_nf90_check( NF90_PUT_VAR  ( if90id, idmy, gphit(ix1:ix2, iy1:iy2) ), clinfo )
703               CALL iom_nf90_check( NF90_INQ_VARID( if90id, 'nav_lev'     , idmy ), clinfo )
704               CALL iom_nf90_check( NF90_PUT_VAR  ( if90id, idmy, gdept_1d       ), clinfo )
705               IF( NF90_INQ_VARID( if90id, 'numcat', idmy ) == nf90_noerr ) THEN
706                  CALL iom_nf90_check( NF90_PUT_VAR  ( if90id, idmy, (/ (idlv, idlv = 1,iom_file(kiomid)%nlev) /)), clinfo )
707               ENDIF
708               ! +++ WRONG VALUE: to be improved but not really useful...
709               CALL iom_nf90_check( NF90_INQ_VARID( if90id, 'time_counter', idmy ), clinfo )
710               CALL iom_nf90_check( NF90_PUT_VAR( if90id, idmy, kt                      ), clinfo )   
711               ! update the values of the variables dimensions size
712               CALL iom_nf90_check( NF90_INQUIRE_DIMENSION( if90id, 1, len = iom_file(kiomid)%dimsz(1,1) ), clinfo )
713               CALL iom_nf90_check( NF90_INQUIRE_DIMENSION( if90id, 2, len = iom_file(kiomid)%dimsz(2,1) ), clinfo )
714               iom_file(kiomid)%dimsz(1:2, 2) = iom_file(kiomid)%dimsz(1:2, 1)
715               CALL iom_nf90_check( NF90_INQUIRE_DIMENSION( if90id, 3, len = iom_file(kiomid)%dimsz(1,3) ), clinfo )
716               iom_file(kiomid)%dimsz(1  , 4) = 1   ! unlimited dimension
717               IF(lwp) WRITE(numout,*) TRIM(clinfo)//' write dimension variables done'
718            ENDIF
719         ENDIF
720
721         ! write the data
722         ! =============
723         IF(     PRESENT(pv_r0d) ) THEN
724            CALL iom_nf90_check( NF90_PUT_VAR( if90id, idvar, pv_r0d                    ), clinfo )
725         ELSEIF( PRESENT(pv_r1d) ) THEN
726            CALL iom_nf90_check( NF90_PUT_VAR( if90id, idvar, pv_r1d(:)                 ), clinfo )
727         ELSEIF( PRESENT(pv_r2d) ) THEN
728            CALL iom_nf90_check( NF90_PUT_VAR( if90id, idvar, pv_r2d(ix1:ix2,iy1:iy2)   ), clinfo )
729         ELSEIF( PRESENT(pv_r3d) ) THEN
730            CALL iom_nf90_check( NF90_PUT_VAR( if90id, idvar, pv_r3d(ix1:ix2,iy1:iy2,:) ), clinfo )
731         ENDIF
732         ! add 1 to the size of the temporal dimension (not really useful...)
733         IF( iom_file(kiomid)%luld(idvar) )   iom_file(kiomid)%dimsz(iom_file(kiomid)%ndims(idvar), idvar)    &
734               &                            = iom_file(kiomid)%dimsz(iom_file(kiomid)%ndims(idvar), idvar) + 1
735         IF(lwp) WRITE(numout,*) TRIM(clinfo)//' written ok'
736      ENDIF
737      !     
738   END SUBROUTINE iom_nf90_rp0123d
739
740
741   SUBROUTINE iom_nf90_check( kstatus, cdinfo )
742      !!--------------------------------------------------------------------
743      !!                   ***  SUBROUTINE iom_nf90_check  ***
744      !!
745      !! ** Purpose :   check nf90 errors
746      !!--------------------------------------------------------------------
747      INTEGER,          INTENT(in) :: kstatus
748      CHARACTER(LEN=*), INTENT(in) :: cdinfo
749      !---------------------------------------------------------------------
750      IF(kstatus /= nf90_noerr)   CALL ctl_stop( 'iom_nf90_check : '//TRIM(nf90_strerror(kstatus)), TRIM(cdinfo) )
751   END SUBROUTINE iom_nf90_check
752
753   !!======================================================================
754END MODULE iom_nf90
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.