New URL for NEMO forge!   http://forge.nemo-ocean.eu

Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
This present forge is now archived and remained online for history.
Changeset 12065 for NEMO/branches/2019/dev_r10742_ENHANCE-12_SimonM-Tides/cfgs/SHARED – NEMO

Ignore:
Timestamp:
2019-12-05T12:06:36+01:00 (4 years ago)
Author:
smueller
Message:

Synchronizing with /NEMO/trunk@12055 (ticket #2194)

Location:
NEMO/branches/2019/dev_r10742_ENHANCE-12_SimonM-Tides/cfgs/SHARED
Files:
10 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed

  • NEMO/branches/2019/dev_r10742_ENHANCE-12_SimonM-Tides/cfgs/SHARED/README.rst

    r10598 r12065  
    33*********** 
    44 
     5.. todo:: 
     6 
     7 
     8 
    59.. contents:: 
    6            :local: 
     10   :local: 
    711 
    812Output of diagnostics in NEMO is usually done using XIOS. 
    9 This is an efficient way of writing diagnostics because the time averaging, file writing and even some simple arithmetic or regridding is carried out in parallel to the NEMO model run. 
     13This is an efficient way of writing diagnostics because 
     14the time averaging, file writing and even some simple arithmetic or regridding is carried out in 
     15parallel to the NEMO model run. 
    1016This page gives a basic introduction to using XIOS with NEMO. 
    11 Much more information is available from the XIOS homepage above and from the NEMO manual. 
     17Much more information is available from the :xios:`XIOS homepage<>` above and from the NEMO manual. 
    1218 
    13 Use of XIOS for diagnostics is activated using the pre-compiler key ``key_iomput``.  
     19Use of XIOS for diagnostics is activated using the pre-compiler key ``key_iomput``. 
    1420 
    1521Extracting and installing XIOS 
    16 ------------------------------ 
     22============================== 
    1723 
    18241. Install the NetCDF4 library. 
    19    If you want to use single file output you will need to compile the HDF & NetCDF libraries to allow parallel IO. 
    20 2. Download the version of XIOS that you wish to use. The recommended version is now XIOS 2.5: 
    21     
    22 .. code-block:: console 
     25   If you want to use single file output you will need to compile the HDF & NetCDF libraries to 
     26   allow parallel IO. 
     272. Download the version of XIOS that you wish to use. 
     28   The recommended version is now XIOS 2.5: 
    2329 
    24    $ svn co http://forge.ipsl.jussieu.fr/ioserver/svn/XIOS/branchs/xios-2.5 xios-2.5 
     30   .. code-block:: console 
    2531 
    26 and follow the instructions in `XIOS documentation <http://forge.ipsl.jussieu.fr/ioserver/wiki/documentation>`_ to compile it. 
    27    If you find problems at this stage, support can be found by subscribing to the `XIOS mailing list <http://forge.ipsl.jussieu.fr/mailman/listinfo.cgi/xios-users>`_ and sending a mail message to it.  
     32      $ svn co http://forge.ipsl.jussieu.fr/ioserver/svn/XIOS/branchs/xios-2.5 
     33 
     34and follow the instructions in :xios:`XIOS documentation <wiki/documentation>` to compile it. 
     35If you find problems at this stage, support can be found by subscribing to 
     36the :xios:`XIOS mailing list <../mailman/listinfo.cgi/xios-users>` and sending a mail message to it. 
    2837 
    2938XIOS Configuration files 
    3039------------------------ 
    3140 
    32 XIOS is controlled using xml input files that should be copied to your model run directory before running the model. 
    33 Examples of these files can be found in the reference configurations (``cfgs``). The XIOS executable expects to find a file called ``iodef.xml`` in the model run directory. 
    34 In NEMO we have made the decision to use include statements in the ``iodef.xml`` file to include ``field_def_nemo-oce.xml`` (for physics), ``field_def_nemo-ice.xml`` (for ice), ``field_def_nemo-pisces.xml`` (for biogeochemistry) and ``domain_def.xml`` from the /cfgs/SHARED directory. 
    35 Most users will not need to modify ``domain_def.xml`` or ``field_def_nemo-???.xml`` unless they want to add new diagnostics to the NEMO code. 
    36 The definition of the output files is organized into separate ``file_definition.xml`` files which are included in the ``iodef.xml`` file. 
     41XIOS is controlled using XML input files that should be copied to 
     42your model run directory before running the model. 
     43Examples of these files can be found in the reference configurations (:file:`./cfgs`). 
     44The XIOS executable expects to find a file called :file:`iodef.xml` in the model run directory. 
     45In NEMO we have made the decision to use include statements in the :file:`iodef.xml` file to include: 
     46 
     47- :file:`field_def_nemo-oce.xml` (for physics), 
     48- :file:`field_def_nemo-ice.xml` (for ice), 
     49- :file:`field_def_nemo-pisces.xml` (for biogeochemistry) and 
     50- :file:`domain_def.xml` from the :file:`./cfgs/SHARED` directory. 
     51 
     52Most users will not need to modify :file:`domain_def.xml` or :file:`field_def_nemo-???.xml` unless 
     53they want to add new diagnostics to the NEMO code. 
     54The definition of the output files is organized into separate :file:`file_definition.xml` files which 
     55are included in the :file:`iodef.xml` file. 
    3756 
    3857Modes 
    39 ----- 
     58===== 
    4059 
    4160Detached Mode 
    … …  
    4463In detached mode the XIOS executable is executed on separate cores from the NEMO model. 
    4564This is the recommended method for using XIOS for realistic model runs. 
    46 To use this mode set ``using_server`` to ``true`` at the bottom of the ``iodef.xml`` file: 
     65To use this mode set ``using_server`` to ``true`` at the bottom of the :file:`iodef.xml` file: 
    4766 
    4867.. code-block:: xml 
    4968 
    50    <variable id="using_server" type="boolean">true</variable> 
     69   <variable id="using_server" type="boolean">true</variable> 
    5170 
    52 Make sure there is a copy (or link to) your XIOS executable in the working directory and in your job submission script allocate processors to XIOS. 
     71Make sure there is a copy (or link to) your XIOS executable in the working directory and 
     72in your job submission script allocate processors to XIOS. 
    5373 
    5474Attached Mode 
    … …  
    5676 
    5777In attached mode XIOS runs on each of the cores used by NEMO. 
    58 This method is less efficient than the detached mode but can be more convenient for testing or with small configurations. 
    59 To activate this mode simply set ``using_server`` to false in the ``iodef.xml`` file 
     78This method is less efficient than the detached mode but can be more convenient for testing or 
     79with small configurations. 
     80To activate this mode simply set ``using_server`` to false in the :file:`iodef.xml` file 
    6081 
    6182.. code-block:: xml 
    6283 
    63    <variable id="using_server" type="boolean">false</variable> 
     84   <variable id="using_server" type="boolean">false</variable> 
    6485 
    6586and don't allocate any cores to XIOS. 
    66 Note that due to the different domain decompositions between XIOS and NEMO if the total number of cores is larger than the number of grid points in the j direction then the model run will fail. 
     87 
     88.. note:: 
     89 
     90   Due to the different domain decompositions between XIOS and NEMO, 
     91   if the total number of cores is larger than the number of grid points in the ``j`` direction then 
     92   the model run will fail. 
    6793 
    6894Adding new diagnostics 
    69 ---------------------- 
     95====================== 
    7096 
    7197If you want to add a NEMO diagnostic to the NEMO code you will need to do the following: 
    7298 
    73991. Add any necessary code to calculate you new diagnostic in NEMO 
    74 2. Send the field to XIOS using ``CALL iom_put( 'field_id', variable )`` where ``field_id`` is a unique id for your new diagnostics and variable is the fortran variable containing the data. 
    75    This should be called at every model timestep regardless of how often you want to output the field. No time averaging should be done in the model code.  
    76 3. If it is computationally expensive to calculate your new diagnostic you should also use "iom_use" to determine if it is requested in the current model run. For example, 
    77     
    78 .. code-block:: fortran 
     1002. Send the field to XIOS using ``CALL iom_put( 'field_id', variable )`` where 
     101   ``field_id`` is a unique id for your new diagnostics and 
     102   variable is the fortran variable containing the data. 
     103   This should be called at every model timestep regardless of how often you want to output the field. 
     104   No time averaging should be done in the model code. 
     1053. If it is computationally expensive to calculate your new diagnostic 
     106   you should also use "iom_use" to determine if it is requested in the current model run. 
     107   For example, 
    79108 
    80       IF iom_use('field_id') THEN 
    81          !Some expensive computation 
    82          !... 
    83          !... 
    84          iom_put('field_id', variable) 
    85       ENDIF 
     109   .. code-block:: fortran 
    86110 
    87 4. Add a variable definition to the ``field_def_nemo-???.xml`` file. 
    88 5. Add the variable to the ``iodef.xml`` or ``file_definition.xml`` file. 
     111      IF iom_use('field_id') THEN 
     112         !Some expensive computation 
     113         !... 
     114         !... 
     115    iom_put('field_id', variable) 
     116      ENDIF 
     117 
     1184. Add a variable definition to the :file:`field_def_nemo-???.xml` file. 
     1195. Add the variable to the :file:`iodef.xml` or :file:`file_definition.xml` file. 

  • NEMO/branches/2019/dev_r10742_ENHANCE-12_SimonM-Tides/cfgs/SHARED/domain_def_nemo.xml

    r9930 r12065  
    1010     </domain> 
    1111 
    12      <domain id="1point" domain_ref="grid_T" > 
    13        <zoom_domain ibegin="1" jbegin="1" ni="1" nj="1"/> 
    14      </domain> 
    1512     <!--   Eq section --> 
    1613     <domain id="EqT" domain_ref="grid_T" > <zoom_domain id="EqT"/> </domain> 

  • NEMO/branches/2019/dev_r10742_ENHANCE-12_SimonM-Tides/cfgs/SHARED/field_def_nemo-ice.xml

    r10578 r12065  
    3232  
    3333     <!-- general fields --> 
    34           <field id="icemass"      long_name="Sea-ice mass per area"                                   standard_name="sea_ice_amount"                            unit="kg/m2"/> 
     34          <field id="icemass"      long_name="Sea-ice mass per gridcell area"                          standard_name="sea_ice_amount"                            unit="kg/m2"/> 
    3535          <field id="snwmass"      long_name="Snow mass per area"                                      standard_name="liquid_water_content_of_surface_snow"      unit="kg/m2"/> 
    36           <field id="iceconc"      long_name="Sea-ice area fraction"                                   standard_name="sea_ice_area_fraction"                     unit=""    /> 
    37           <field id="icevolu"      long_name="Sea-ice volume per area"                                 standard_name="sea_ice_thickness"                         unit="m"   /> 
    38           <field id="icethic"      long_name="Sea-ice thickness per area"                              standard_name="sea_ice_thickness"                         unit="m"   /> 
    39           <field id="snwthic"      long_name="Snow thickness per area"                                 standard_name="snow_thickness"                            unit="m"   /> 
    40           <field id="icebrv"       long_name="brine volume"                                                                                                      unit="%"   /> 
    41           <field id="iceage"       long_name="ice age"                                                                                                           unit="days"/> 
    42           <field id="icehnew"      long_name="frazil ice collection thickness"                                                                                   unit="m"   /> 
    43           <field id="snwvolu"      long_name="snow volume"                                                                                                       unit="m"   /> 
    44           <field id="icefrb"       long_name="Sea-ice freeboard"                                       standard_name="sea_ice_freeboard"                         unit="m"   /> 
    45           <field id="icealb"       long_name="Sea-ice or snow albedo"                                  standard_name="sea_ice_albedo"                            unit=""    /> 
    46           <field id="tau_icebfr"   long_name="ice friction on ocean bottom for landfast ice"                                                                     unit="N/2" /> 
     36          <field id="iceconc"      long_name="Sea-ice area fraction"                                   standard_name="sea_ice_area_fraction"                     unit=""     /> 
     37          <field id="icevolu"      long_name="Sea-ice volume per area"                                 standard_name="sea_ice_thickness"                         unit="m"    /> 
     38          <field id="icethic"      long_name="Sea-ice thickness"                                       standard_name="sea_ice_thickness"                         unit="m"    /> 
     39          <field id="snwthic"      long_name="Snow thickness"                                          standard_name="snow_thickness"                            unit="m"    /> 
     40          <field id="icebrv"       long_name="brine volume"                                                                                                      unit="%"    /> 
     41          <field id="iceage"       long_name="ice age"                                                                                                           unit="days" detect_missing_value="true"/> 
     42          <field id="icehnew"      long_name="frazil ice collection thickness"                                                                                   unit="m"    /> 
     43          <field id="snwvolu"      long_name="snow volume"                                                                                                       unit="m"    /> 
     44          <field id="icefrb"       long_name="Sea-ice freeboard"                                       standard_name="sea_ice_freeboard"                         unit="m"    /> 
     45          <field id="icealb"       long_name="Sea-ice or snow albedo"                                  standard_name="sea_ice_albedo"                            unit=""    detect_missing_value="true" /> 
    4746      
    4847     <!-- melt ponds --> 
    49      <field id="iceapnd"      long_name="melt pond fraction"                                      standard_name="sea_ice_meltpond_fraction"                 unit="%" />  
     48     <field id="iceapnd"      long_name="melt pond concentration"                                 standard_name="sea_ice_meltpond_concentration"            unit=""  />  
     49          <field id="icehpnd"      long_name="melt pond depth"                                         standard_name="sea_ice_meltpond_depth"                    unit="m" />  
    5050          <field id="icevpnd"      long_name="melt pond volume"                                        standard_name="sea_ice_meltpond_volume"                   unit="m" />  
    5151      
    5252     <!-- heat --> 
    53           <field id="icetemp"      long_name="Mean ice temperature"                                                                                              unit="degC" /> 
    54           <field id="snwtemp"      long_name="Mean snow temperature"                                                                                             unit="degC" /> 
    55           <field id="icettop"      long_name="temperature at the ice surface"                                                                                    unit="degC" /> 
    56           <field id="icetbot"      long_name="temperature at the ice bottom"                                                                                     unit="degC" /> 
    57           <field id="icetsni"      long_name="temperature at the snow-ice interface"                                                                             unit="degC" /> 
     53          <field id="icetemp"      long_name="Mean ice temperature"                                                                                              unit="degC" detect_missing_value="true" /> 
     54          <field id="snwtemp"      long_name="Mean snow temperature"                                                                                             unit="degC" detect_missing_value="true" /> 
     55          <field id="icettop"      long_name="temperature at the ice surface"                                                                                    unit="degC" detect_missing_value="true" /> 
     56          <field id="icetbot"      long_name="temperature at the ice bottom"                                                                                     unit="degC" detect_missing_value="true" /> 
     57          <field id="icetsni"      long_name="temperature at the snow-ice interface"                                                                             unit="degC" detect_missing_value="true" /> 
    5858          <field id="icehc"        long_name="ice heat content"                                                                                                  unit="J/m2" />  
    5959          <field id="snwhc"        long_name="snow heat content"                                                                                                 unit="J/m2" /> 
    6060      
    6161     <!-- salt --> 
    62           <field id="icesalt"      long_name="Sea ice salinity"                                                                                                  unit="g/kg"  /> 
     62          <field id="icesalt"      long_name="Sea ice salinity"                                                                                                  unit="g/kg"  detect_missing_value="true" /> 
    6363          <field id="icesalm"      long_name="Mass of salt in sea ice per area"                        standard_name="sea_ice_salt_mass"                         unit="kg/m2" /> 
    6464      
    … …  
    7171          <field id="utau_oi"      long_name="X-component of ocean stress on sea ice"                  standard_name="sea_ice_base_upward_x_stress"              unit="N/m2" /> 
    7272          <field id="vtau_oi"      long_name="Y-component of ocean stress on sea ice"                  standard_name="sea_ice_base_upward_y_stress"              unit="N/m2" /> 
     73          <field id="utau_bi"      long_name="X-component of ocean bottom stress on sea ice -landfast" standard_name="ocean_bottom_upward_x_stress"              unit="N/m2" /> 
     74          <field id="vtau_bi"      long_name="Y-component of ocean bottom stress on sea ice -landfast" standard_name="ocean_bottom_upward_y_stress"              unit="N/m2" /> 
    7375          <field id="isig1"        long_name="1st principal stress component for EVP rhg"                                                                        unit=""     /> 
    7476          <field id="isig2"        long_name="2nd principal stress component for EVP rhg"                                                                        unit=""     /> 
    … …  
    9294      
    9395     <!-- trends --> 
    94           <field id="afxthd"       long_name="sea-ice area fraction change from thermodynamics"  standard_name="tendency_of_sea_ice_area_fraction_due_to_dynamics" unit="s-1" /> 
    95           <field id="afxdyn"       long_name="sea-ice area fraction change from dynamics"        standard_name="tendency_of_sea_ice_area_fraction_due_to_dynamics" unit="s-1" /> 
    96      <field id="afxtot"       long_name="area tendency (total)"                                                                                               unit="s-1" /> 
     96          <field id="afxthd"       long_name="sea-ice area fraction change from thermodynamics" standard_name="tendency_of_sea_ice_area_fraction_due_to_dynamics" unit="s-1" /> 
     97          <field id="afxdyn"       long_name="sea-ice area fraction change from dynamics"       standard_name="tendency_of_sea_ice_area_fraction_due_to_dynamics" unit="s-1" /> 
     98     <field id="afxtot"       long_name="area tendency (total)"                                                                                              unit="s-1" /> 
    9799      
    98100     <!-- momentum (advection) --> 
    … …  
    160162          <field id="hfxdhc"       long_name="Heat content variation in snow and ice (neg = ice cooling)"   unit="W/m2" /> 
    161163 
    162      <!-- diagnostics of the negative values resulting from the advection scheme --> 
    163      <field id="iceneg_pres"  long_name="Fraction of time steps with negative sea ice volume"                    unit=""     /> 
    164      <field id="iceneg_volu"  long_name="Negative sea ice volume per area arising from advection"                unit="m"    /> 
    165           <field id="iceneg_hfx"   long_name="Negative sea ice heat content (eq. heat flux) arising from advection"   unit="W/m2" /> 
    166  
    167164     <!-- sbcssm variables --> 
    168165          <field id="sst_m"    unit="degC" /> 
    … …  
    173170          <field id="e3t_m"    unit="m"    /> 
    174171          <field id="frq_m"    unit="-"    /> 
    175  
    176      <!-- categories --> 
    177      <field id="iceconc_cat"  long_name="Sea-ice concentration per category"                unit=""       grid_ref="grid_T_3D_ncatice" /> 
    178           <field id="icethic_cat"  long_name="Sea-ice thickness per category"                    unit="m"      grid_ref="grid_T_3D_ncatice" /> 
    179           <field id="snwthic_cat"  long_name="Snow thickness per category"                       unit="m"      grid_ref="grid_T_3D_ncatice" /> 
    180           <field id="icesalt_cat"  long_name="Sea-Ice Bulk salinity per category"                unit="g/kg"   grid_ref="grid_T_3D_ncatice" /> 
    181           <field id="icetemp_cat"  long_name="Ice temperature per category"                      unit="degC"   grid_ref="grid_T_3D_ncatice" /> 
    182           <field id="snwtemp_cat"  long_name="Snow temperature per category"                     unit="degC"   grid_ref="grid_T_3D_ncatice" /> 
    183           <field id="icettop_cat"  long_name="Ice/snow surface temperature per category"         unit="degC"   grid_ref="grid_T_3D_ncatice" /> 
    184           <field id="iceapnd_cat"  long_name="Ice melt pond concentration per category"          unit="%"      grid_ref="grid_T_3D_ncatice" />  
    185           <field id="icehpnd_cat"  long_name="Ice melt pond thickness per category"              unit="m"      grid_ref="grid_T_3D_ncatice" />  
    186           <field id="iceafpnd_cat" long_name="Ice melt pond fraction per category"               unit="m"      grid_ref="grid_T_3D_ncatice" />  
    187           <field id="icemask_cat"  long_name="Fraction of time step with sea ice (per category)" unit=""       grid_ref="grid_T_3D_ncatice" /> 
    188           <field id="iceage_cat"   long_name="Ice age per category"                              unit="days"   grid_ref="grid_T_3D_ncatice" /> 
    189           <field id="icebrv_cat"   long_name="Brine volume per category"                         unit="%"      grid_ref="grid_T_3D_ncatice" /> 
    190172 
    191173     <!-- ================= --> 
    … …  
    254236          <field id="xmtrptot"     long_name="X-component of sea-ice mass transport"                   standard_name="sea_ice_x_transport"                   unit="kg/s" > xmtrpice + xmtrpsnw </field> 
    255237          <field id="ymtrptot"     long_name="Y-component of sea-ice mass transport"                   standard_name="sea_ice_y_transport"                   unit="kg/s" > ymtrpice + ymtrpsnw </field> 
    256  
    257      <!-- categories --> 
    258           <field id="iceconc_cat_cmip"     long_name="Sea-ice area fractions in thickness categories"  standard_name="sea_ice_area_fraction_over_categories" detect_missing_value="true" unit=""  grid_ref="grid_T_3D_ncatice" > iceconc_cat      * icemask_cat + $missval * (1.-icemask_cat) </field> 
    259           <field id="icethic_cat_cmip"     long_name="Sea-ice thickness in thickness categories"       standard_name="sea_ice_thickness_over_categories"     detect_missing_value="true" unit="m" grid_ref="grid_T_3D_ncatice" > icethic_cat      * icemask_cat + $missval * (1.-icemask_cat) </field> 
    260           <field id="snwthic_cat_cmip"     long_name="Snow thickness in thickness categories"          standard_name="snow_thickness_over_categories"        detect_missing_value="true" unit="m" grid_ref="grid_T_3D_ncatice" > snwthic_cat      * icemask_cat + $missval * (1.-icemask_cat) </field> 
    261           <field id="iceconc_cat_pct_cmip" long_name="Sea-ice area fractions in thickness categories"  standard_name="sea_ice_area_fraction_over_categories" detect_missing_value="true" unit="%" grid_ref="grid_T_3D_ncatice" > iceconc_cat*100. * icemask_cat + $missval * (1.-icemask_cat) </field> 
    262238     
    263239   </field_group> <!-- SBC_2D --> 
    264240 
     241   <!-- categories --> 
     242        <field_group id="SBC_3D" grid_ref="grid_T_ncatice" > 
     243 
     244          <!-- standard ice fields -->   
     245     <field id="iceconc_cat"  long_name="Sea-ice concentration per category"                unit=""        /> 
     246          <field id="icethic_cat"  long_name="Sea-ice thickness per category"                    unit="m"       detect_missing_value="true" /> 
     247          <field id="snwthic_cat"  long_name="Snow thickness per category"                       unit="m"       detect_missing_value="true" /> 
     248          <field id="icesalt_cat"  long_name="Sea-Ice Bulk salinity per category"                unit="g/kg"    detect_missing_value="true" /> 
     249          <field id="icetemp_cat"  long_name="Ice temperature per category"                      unit="degC"    detect_missing_value="true" /> 
     250          <field id="snwtemp_cat"  long_name="Snow temperature per category"                     unit="degC"    detect_missing_value="true" /> 
     251          <field id="icettop_cat"  long_name="Ice/snow surface temperature per category"         unit="degC"    detect_missing_value="true" /> 
     252          <field id="iceapnd_cat"  long_name="Ice melt pond concentration per category"          unit=""        />  
     253          <field id="icehpnd_cat"  long_name="Ice melt pond thickness per category"              unit="m"       detect_missing_value="true" />  
     254          <field id="iceafpnd_cat" long_name="Ice melt pond fraction per category"               unit=""        />  
     255          <field id="icemask_cat"  long_name="Fraction of time step with sea ice (per category)" unit=""        /> 
     256          <field id="iceage_cat"   long_name="Ice age per category"                              unit="days"    detect_missing_value="true" /> 
     257          <field id="icebrv_cat"   long_name="Brine volume per category"                         unit="%"       detect_missing_value="true" /> 
     258          <field id="icealb_cat"   long_name="Sea-ice or snow albedo"                            unit=""        detect_missing_value="true" /> 
     259 
     260          <!-- Add-ons for SIMIP --> 
     261          <field id="iceconc_cat_cmip"     long_name="Sea-ice area fractions in thickness categories"  standard_name="sea_ice_area_fraction_over_categories" detect_missing_value="true" unit=""   > iceconc_cat      * icemask_cat + $missval * (1.-icemask_cat) </field> 
     262          <field id="icethic_cat_cmip"     long_name="Sea-ice thickness in thickness categories"       standard_name="sea_ice_thickness_over_categories"     detect_missing_value="true" unit="m"  > icethic_cat      * icemask_cat + $missval * (1.-icemask_cat) </field> 
     263          <field id="snwthic_cat_cmip"     long_name="Snow thickness in thickness categories"          standard_name="snow_thickness_over_categories"        detect_missing_value="true" unit="m"  > snwthic_cat      * icemask_cat + $missval * (1.-icemask_cat) </field> 
     264          <field id="iceconc_cat_pct_cmip" long_name="Sea-ice area fractions in thickness categories"  standard_name="sea_ice_area_fraction_over_categories" detect_missing_value="true" unit="%"  > iceconc_cat*100. * icemask_cat + $missval * (1.-icemask_cat) </field> 
     265 
     266   </field_group> <!-- SBC_3D --> 
     267    
    265268   <!-- scalar variables --> 
    266    <field_group id="SBC_0D"  grid_ref="grid_1point" > 
     269   <field_group id="SBC_scalar"  grid_ref="grid_scalar" > 
     270          <field id="NH_iceextt"      long_name="Sea ice extent North"                   standard_name="sea_ice_extent_n"                   unit="1e6_km2"  /> 
     271          <field id="SH_iceextt"      long_name="Sea ice extent South"                   standard_name="sea_ice_extent_s"                   unit="1e6_km2"  /> 
     272          <field id="NH_icevolu"      long_name="Sea ice volume North"                   standard_name="sea_ice_volume_n"                   unit="1e3_km3"  /> 
     273          <field id="SH_icevolu"      long_name="Sea ice volume South"                   standard_name="sea_ice_volume_s"                   unit="1e3_km3"  /> 
     274          <field id="NH_icearea"      long_name="Sea ice area North"                     standard_name="sea_ice_area_n"                     unit="1e6_km2"  /> 
     275          <field id="SH_icearea"      long_name="Sea ice area South"                     standard_name="sea_ice_area_s"                     unit="1e6_km2"  /> 
     276 
    267277          <!-- available with ln_icediaout --> 
    268278          <field id="ibgfrcvoltop"    long_name="global mean ice/snow forcing at interface ice/snow-atm (volume equivalent ocean volume)"   unit="km3"      /> 
    … …  
    286296          <field id="sbgheat_tot"     long_name="global mean snow heat content"                                                             unit="1e20J"    /> 
    287297 
    288           <field id="NH_iceextt"      long_name="Sea ice extent North"                   standard_name="sea_ice_extent_n"                   unit="1e6_km2"  /> 
    289           <field id="SH_iceextt"      long_name="Sea ice extent South"                   standard_name="sea_ice_extent_s"                   unit="1e6_km2"  /> 
    290           <field id="NH_icevolu"      long_name="Sea ice volume North"                   standard_name="sea_ice_volume_n"                   unit="1e3_km3"  /> 
    291           <field id="SH_icevolu"      long_name="Sea ice volume South"                   standard_name="sea_ice_volume_s"                   unit="1e3_km3"  /> 
    292           <field id="NH_icearea"      long_name="Sea ice area North"                     standard_name="sea_ice_area_n"                     unit="1e6_km2"  /> 
    293           <field id="SH_icearea"      long_name="Sea ice area South"                     standard_name="sea_ice_area_s"                     unit="1e6_km2"  /> 
    294  
     298     <!-- available later --> 
     299     <!-- 
    295300          <field id="strait_mifl"     long_name="Sea ice mass flux through straits"      standard_name="sea_ice_mass_transport_across_line" unit="kg/s"  grid_ref="grid_4strait" /> 
    296301          <field id="strait_arfl"     long_name="Sea ice area flux through straits"      standard_name="sea_ice_area_transport_across_line" unit="m2/s"  grid_ref="grid_4strait" />   
    297302          <field id="strait_msfl"     long_name="Sea ice snow flux through straits"      standard_name="snow_mass_transport_across_line"    unit="kg/s"  grid_ref="grid_4strait" /> 
    298    </field_group> <!-- SBC_0D --> 
     303          --> 
     304   </field_group> 
    299305   
    300306   <!--  
    … …  
    304310       
    305311   <field_group id="myvarICE"        grid_ref="grid_T_2D" > 
    306           <field field_ref="icethic"          name="sithic"  /> 
    307           <field field_ref="icevolu"          name="sivolu"  /> 
    308           <field field_ref="iceconc"          name="siconc"  /> 
     312     <!-- ice mask --> 
     313     <field field_ref="icemask"          name="simsk"   /> 
     314     <field field_ref="icemask05"        name="simsk05" /> 
     315     <field field_ref="icemask15"        name="simsk15" /> 
     316      
     317     <!-- general --> 
     318     <field field_ref="snwvolu"          name="snvolu" /> 
     319     <field field_ref="snwthic"          name="snthic" /> 
     320     <field field_ref="icethic"          name="sithic" /> 
     321<!-- 
     322     <field field_ref="icethic"          name="sithic_max" operation="maximum" /> 
     323     <field field_ref="icethic"          name="sithic_min" operation="minimum" /> 
     324--> 
     325     <field field_ref="fasticepres"      name="fasticepres" /> 
     326     <field field_ref="icevolu"          name="sivolu" /> 
     327     <field field_ref="iceconc"          name="siconc" /> 
     328     <field field_ref="icesalt"          name="sisali" /> 
     329     <field field_ref="iceapnd"          name="siapnd" /> 
     330     <field field_ref="icehpnd"          name="sihpnd" /> 
     331     <field field_ref="icevpnd"          name="sivpnd" /> 
     332          <field field_ref="iceage"           name="siage"  /> 
     333     <field field_ref="sst_m"            name="sst_m"  /> 
     334     <field field_ref="sss_m"            name="sss_m"  /> 
     335      
     336     <!-- heat --> 
     337     <field field_ref="icetemp"          name="sitemp" /> 
     338     <field field_ref="snwtemp"          name="sntemp" /> 
     339     <field field_ref="icettop"          name="sittop" /> 
     340     <field field_ref="icetbot"          name="sitbot" /> 
     341     <field field_ref="icetsni"          name="sitsni" /> 
     342      
     343     <!-- momentum --> 
     344     <field field_ref="uice"             name="sivelu"  /> 
     345     <field field_ref="vice"             name="sivelv"  /> 
     346     <field field_ref="icevel"           name="sivelo"  /> 
     347     <field field_ref="utau_ai"          name="utau_ai" /> 
     348     <field field_ref="vtau_ai"          name="vtau_ai" /> 
     349     <field field_ref="utau_oi"          name="utau_oi" /> 
     350     <field field_ref="vtau_oi"          name="vtau_oi" /> 
     351      
     352     <!-- rheology --> 
     353     <field field_ref="icediv"           name="sidive"  /> 
     354     <field field_ref="iceshe"           name="sishea"  /> 
     355     <field field_ref="icestr"           name="sistre"  /> 
     356     <field field_ref="normstr"          name="normstr" /> 
     357     <field field_ref="sheastr"          name="sheastr" /> 
     358     <field field_ref="isig1"            name="isig1"   /> 
     359     <field field_ref="isig2"            name="isig2"   /> 
     360     <field field_ref="isig3"            name="isig3"   /> 
     361      
     362     <!-- heat fluxes --> 
     363     <field field_ref="qt_oce_ai"        name="qt_oce_ai"  /> 
     364     <field field_ref="qt_atm_oi"        name="qt_atm_oi"  /> 
     365     <field field_ref="qtr_ice_top"      name="qtr_ice_top"/> 
     366     <field field_ref="qtr_ice_bot"      name="qtr_ice_bot"/> 
     367     <field field_ref="qt_ice"           name="qt_ice"     /> 
     368     <field field_ref="qsr_ice"          name="qsr_ice"    /> 
     369     <field field_ref="qns_ice"          name="qns_ice"    /> 
     370     <field field_ref="qemp_ice"         name="qemp_ice"   /> 
     371     <field field_ref="albedo"           name="albedo"     /> 
     372          <field field_ref="icealb"           name="icealb"     /> 
     373      
     374     <field field_ref="hfxcndtop"        name="hfxcndtop"  /> 
     375     <field field_ref="hfxcndbot"        name="hfxcndbot"  /> 
     376     <field field_ref="hfxsensib"        name="hfxsensib"  /> 
     377 
     378     <field field_ref="icehc"         name="icehc"  /> 
     379     <field field_ref="snwhc"         name="snwhc"  /> 
     380     <field field_ref="hfxbog"        name="hfxbog"  /> 
     381     <field field_ref="hfxbom"        name="hfxbom"  /> 
     382     <field field_ref="hfxsum"        name="hfxsum"  /> 
     383     <field field_ref="hfxopw"        name="hfxopw"  /> 
     384     <field field_ref="hfxdif"        name="hfxdif"  /> 
     385     <field field_ref="hfxsnw"        name="hfxsnw"  /> 
     386     <field field_ref="hfxerr"        name="hfxerr"  /> 
     387     <field field_ref="hfxthd"        name="hfxthd"  /> 
     388     <field field_ref="hfxdyn"        name="hfxdyn"  /> 
     389     <field field_ref="hfxres"        name="hfxres"  /> 
     390     <field field_ref="hfxsub"        name="hfxsub"  /> 
     391     <field field_ref="hfxspr"        name="hfxspr"  /> 
     392 
     393<!-- 
     394     <field field_ref="hfxdhc"        name="hfxbudget"  operation="average" freq_op="1d" > @qt_atm_oi - @qt_oce_ai -@hfxdhc </field> 
     395--> 
     396      
     397     <!-- salt fluxes --> 
     398     <field field_ref="sfxice"           name="sfxice" /> 
     399      
     400     <!-- mass fluxes --> 
     401     <field field_ref="vfxice"           name="vfxice" /> 
     402     <field field_ref="vfxsnw"           name="vfxsnw" /> 
     403 
     404     <field field_ref="vfxbom"           name="vfxbom" /> 
     405     <field field_ref="vfxbog"           name="vfxbog" /> 
     406     <field field_ref="vfxsum"           name="vfxsum" /> 
     407     <field field_ref="vfxopw"           name="vfxopw" /> 
     408     <field field_ref="vfxlam"           name="vfxlam" /> 
     409     <field field_ref="vfxsni"           name="vfxsni" /> 
     410     <field field_ref="vfxdyn"           name="vfxdyn" /> 
     411     <field field_ref="vfxres"           name="vfxres" /> 
     412     <field field_ref="vfxpnd"           name="vfxpnd" /> 
     413     <field field_ref="vfxsub"           name="vfxsub" /> 
     414     <field field_ref="vfxsub_err"       name="vfxsub_err" /> 
     415          <field field_ref="vfxthin"          name="vfxthin" /> 
     416    
     417     <!-- diag error for negative ice volume after advection --> 
     418     <field field_ref="iceneg_pres"      name="sineg_pres" /> 
     419     <field field_ref="iceneg_volu"      name="sineg_volu" /> 
     420     <field field_ref="iceneg_hfx"       name="sineg_hfx"  /> 
     421        </field_group> 
     422 
     423 
     424        <field_group id="myvarICE_cat"        grid_ref="grid_T_ncatice" > 
     425 
     426     <!-- categories --> 
     427     <field field_ref="icemask_cat"      name="simskcat"/> 
     428     <field field_ref="snwthic_cat"      name="snthicat"/> 
     429     <field field_ref="iceconc_cat"      name="siconcat"/> 
     430     <field field_ref="icethic_cat"      name="sithicat"/> 
     431     <field field_ref="icesalt_cat"      name="sisalcat"/> 
     432     <field field_ref="icetemp_cat"      name="sitemcat"/> 
     433     <field field_ref="snwtemp_cat"      name="sntemcat"/> 
     434     <field field_ref="icettop_cat"      name="sitopcat"/> 
     435 
    309436   </field_group>     
    310437 
    311    <field_group id="ICE_globalbudget"  grid_ref="grid_1point" > 
     438   <field_group id="ICE_globalbudget"  grid_ref="grid_scalar" > 
     439     <!-- global contents --> 
    312440        <field field_ref="ibgvol_tot"       name="ibgvol_tot"   /> 
    313441     <field field_ref="sbgvol_tot"       name="sbgvol_tot"   /> 
    … …  
    317445        <field field_ref="sbgheat_tot"      name="sbgheat_tot"  /> 
    318446 
    319         <field field_ref="ibgvolume"        name="ibgvolume"    /> 
     447     <!-- global drifts (conservation checks) --> 
     448     <field field_ref="ibgvolume"        name="ibgvolume"    /> 
    320449        <field field_ref="ibgsaltco"        name="ibgsaltco"    /> 
    321450        <field field_ref="ibgheatco"        name="ibgheatco"    /> 
    322451          <field field_ref="ibgheatfx"        name="ibgheatfx"    /> 
    323452 
     453     <!-- global forcings  --> 
    324454        <field field_ref="ibgfrcvoltop"     name="ibgfrcvoltop" /> 
    325455        <field field_ref="ibgfrcvolbot"     name="ibgfrcvolbot" /> 
    … …  
    338468 
    339469   <!-- SIMIP monthly scalar variables --> 
    340    <field_group id="SImon_scalars"   grid_ref="grid_1point" > 
     470   <field_group id="SImon_scalars"   grid_ref="grid_scalar" > 
    341471          <!-- Integrated quantities --> 
    342472          <field field_ref="NH_iceextt"       name="siextentn"    /> 

  • NEMO/branches/2019/dev_r10742_ENHANCE-12_SimonM-Tides/cfgs/SHARED/field_def_nemo-oce.xml

    r11764 r12065  
    108108        <field id="tpt_dep"      long_name="T-point depth"                  standard_name="depth_below_geoid"   unit="m"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
    109109        <field id="e3tdef"       long_name="T-cell thickness deformation"                                       unit="%"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
     110 
     111        <!-- variables available with ln_diacfl=.true. --> 
     112        <field id="cfl_cu"       long_name="u-courant number"   unit="#" /> 
     113        <field id="cfl_cv"       long_name="v-courant number"   unit="#" /> 
     114        <field id="cfl_cw"       long_name="w-courant number"   unit="#" /> 
     115 
    110116      </field_group> <!-- grid_T --> 
    111117 
    … …  
    358364   </field_group> 
    359365    
    360    <!-- scalar variables --> 
    361    <field_group id="SBC_0D"  grid_ref="grid_1point" > 
    362    </field_group> 
    363366 
    364367      </field_group> <!-- SBC --> 
    … …  
    515518      <field id="ahmf_3d"      long_name=" 3D      f-eddy viscosity coefficient"   unit="m2/s or m4/s"  grid_ref="grid_T_3D"/> 
    516519 
    517       <field_group id="scalar"  grid_ref="grid_T_2D"  > 
     520      <field_group id="scalar"  grid_ref="grid_scalar"  > 
    518521         <!-- Need to have a salinity reference climatological file : sali_ref_clim_monthly --> 
    519522        <field id="voltot"     long_name="global total volume"                          standard_name="sea_water_volume"                               unit="m3"   /> 
    … …  
    542545      </field_group> 
    543546       
    544       <!-- variables available with key_float --> 
     547      <!-- variables available with ln_floats --> 
    545548 
    546549      <field_group id="floatvar" grid_ref="grid_T_nfloat"  operation="instant" > 

  • NEMO/branches/2019/dev_r10742_ENHANCE-12_SimonM-Tides/cfgs/SHARED/field_def_nemo-pisces.xml

    r10416 r12065  
    290290     </field_group> 
    291291 
    292      <field_group id="tracer_scalar"  grid_ref="grid_T_2D"  > 
     292     <field_group id="tracer_scalar"  grid_ref="grid_scalar"  > 
    293293     <!-- PISCES scalar  --> 
    294294       <field id="pno3tot"         long_name="Global mean nitrate concentration"                  unit="mol/m3"   /> 

  • NEMO/branches/2019/dev_r10742_ENHANCE-12_SimonM-Tides/cfgs/SHARED/grid_def_nemo.xml

    r10226 r12065  
    77       </grid> 
    88        <!--  --> 
    9        <grid id="grid_T_3D_ncatice" > 
     9       <grid id="grid_T_ncatice" > 
    1010         <domain id="grid_T" /> 
    1111         <axis id="ncatice" /> 
    … …  
    4949       </grid> 
    5050        <!--  --> 
    51        <grid id="grid_1point" > 
    52          <domain domain_ref="1point"/> 
    53        </grid> 
    54         <!--  --> 
    5551       <grid id="grid_T_nfloat" > 
    5652         <domain id="grid_T" /> 
    5753         <axis id="nfloat" /> 
    5854       </grid> 
     55      <!-- scalars --> 
     56      <grid id="grid_scalar" > 
     57        <scalar/> 
     58      </grid> 
    5959 
    6060    </grid_definition> 

  • NEMO/branches/2019/dev_r10742_ENHANCE-12_SimonM-Tides/cfgs/SHARED/namelist_ice_ref

    r10611 r12065  
    5656   rn_ishlat        =   2.            !  lbc : free slip (0) ; partial slip (0-2) ; no slip (2) ; strong slip (>2) 
    5757   ln_landfast_L16  = .false.         !  landfast: parameterization from Lemieux 2016 
    58    ln_landfast_home = .false.         !  landfast: parameterization from "home made" 
    5958      rn_depfra     =   0.125         !        fraction of ocean depth that ice must reach to initiate landfast 
    60                                       !          recommended range: [0.1 ; 0.25] - L16=0.125 - home=0.15 
    61       rn_icebfr     =  15.            !        ln_landfast_L16:  maximum bottom stress per unit volume [N/m3] 
    62                                       !        ln_landfast_home: maximum bottom stress per unit area of contact [N/m2] 
    63                                       !          recommended range: ?? L16=15 - home=10 
     59                                      !          recommended range: [0.1 ; 0.25] 
     60      rn_icebfr     =  15.            !        maximum bottom stress per unit volume [N/m3] 
    6461      rn_lfrelax    =   1.e-5         !        relaxation time scale to reach static friction [s-1] 
    65       rn_tensile    =   0.2           !        ln_landfast_L16: isotropic tensile strength 
     62      rn_tensile    =   0.2           !        isotropic tensile strength [0-0.5??] 
    6663/ 
    6764!------------------------------------------------------------------------------ 
    … …  
    104101&namdyn_adv     !   Ice advection 
    105102!------------------------------------------------------------------------------ 
    106    ln_adv_Pra       = .false.         !  Advection scheme (Prather) 
    107    ln_adv_UMx       = .true.          !  Advection scheme (Ultimate-Macho) 
     103   ln_adv_Pra       = .true.         !  Advection scheme (Prather) 
     104   ln_adv_UMx       = .false.          !  Advection scheme (Ultimate-Macho) 
    108105      nn_UMx        =   5             !     order of the scheme for UMx (1-5 ; 20=centered 2nd order) 
    109106/ 
    … …  
    154151&namthd_do      !   Ice growth in open water 
    155152!------------------------------------------------------------------------------ 
    156    rn_hinew         =   0.1           !  thickness for new ice formation in open water (m), must be larger than rn_hnewice 
     153   rn_hinew         =   0.1           !  thickness for new ice formation in open water (m), must be larger than rn_himin 
    157154   ln_frazil        = .false.         !  Frazil ice parameterization (ice collection as a function of wind) 
    158155      rn_maxfraz    =   1.0           !     maximum fraction of frazil ice collecting at the ice base 
    … …  
    178175&namthd_pnd     !   Melt ponds 
    179176!------------------------------------------------------------------------------ 
    180    ln_pnd_H12       = .false.         !  activate evolutive melt ponds (from Holland et al 2012) 
    181    ln_pnd_CST       = .false.         !  activate constant  melt ponds 
    182       rn_apnd       =   0.2           !     prescribed pond fraction, at Tsu=0 degC 
    183       rn_hpnd       =   0.05          !     prescribed pond depth,    at Tsu=0 degC 
    184    ln_pnd_alb       = .false.         !  melt ponds affect albedo or not 
     177   ln_pnd           = .false.         !  activate melt ponds or not 
     178     ln_pnd_H12     = .false.         !  activate evolutive melt ponds (from Holland et al 2012) 
     179     ln_pnd_CST     = .false.         !  activate constant  melt ponds 
     180       rn_apnd      =   0.2           !     prescribed pond fraction, at Tsu=0 degC 
     181       rn_hpnd      =   0.05          !     prescribed pond depth,    at Tsu=0 degC 
     182     ln_pnd_alb     = .false.         !  melt ponds affect albedo or not 
    185183/ 
    186184!------------------------------------------------------------------------------ 
    … …  
    189187   ln_iceini        = .true.          !  activate ice initialization (T) or not (F) 
    190188   ln_iceini_file   = .false.         !  netcdf file provided for initialization (T) or not (F) 
    191    rn_thres_sst     =   2.0           !  max delta temp. above Tfreeze with initial ice = (sst - tfreeze) 
    192    rn_hts_ini_n     =   0.3           !  initial real snow thickness (m), North 
     189   rn_thres_sst     =   2.0           !  max temp. above Tfreeze with initial ice = (sst - tfreeze) 
     190   rn_hti_ini_n     =   3.0           !  initial ice thickness       (m), North 
     191   rn_hti_ini_s     =   1.0           !        "            "             South 
     192   rn_hts_ini_n     =   0.3           !  initial snow thickness      (m), North 
    193193   rn_hts_ini_s     =   0.3           !        "            "             South 
    194    rn_hti_ini_n     =   3.0           !  initial real ice thickness  (m), North 
    195    rn_hti_ini_s     =   1.0           !        "            "             South 
    196194   rn_ati_ini_n     =   0.9           !  initial ice concentration   (-), North 
    197195   rn_ati_ini_s     =   0.9           !        "            "             South 
    198196   rn_smi_ini_n     =   6.3           !  initial ice salinity     (g/kg), North 
    199197   rn_smi_ini_s     =   6.3           !        "            "             South 
    200    rn_tmi_ini_n     = 270.            !  initial ice/snw temperature (K), North 
     198   rn_tmi_ini_n     = 270.            !  initial ice temperature    (K), North 
    201199   rn_tmi_ini_s     = 270.            !        "            "             South 
    202  
     200   rn_tsu_ini_n     = 270.            !  initial surface temperature (K), North 
     201   rn_tsu_ini_s     = 270.            !        "            "             South 
     202   rn_tms_ini_n     = 270.            !  initial snw temperature     (K), North 
     203   rn_tms_ini_s     = 270.            !        "            "             South 
     204   rn_apd_ini_n     =   0.2           !  initial pond fraction       (-), North 
     205   rn_apd_ini_s     =   0.2           !        "            "             South 
     206   rn_hpd_ini_n     =   0.05          !  initial pond depth          (m), North 
     207   rn_hpd_ini_s     =   0.05          !        "            "             South 
     208   ! -- for ln_iceini_file = T 
    203209   sn_hti = 'Ice_initialization'    , -12 ,'hti'   ,  .false.  , .true., 'yearly'  , '' , '', '' 
    204210   sn_hts = 'Ice_initialization'    , -12 ,'hts'   ,  .false.  , .true., 'yearly'  , '' , '', '' 
    205211   sn_ati = 'Ice_initialization'    , -12 ,'ati'   ,  .false.  , .true., 'yearly'  , '' , '', '' 
     212   sn_smi = 'Ice_initialization'    , -12 ,'smi'   ,  .false.  , .true., 'yearly'  , '' , '', '' 
     213   sn_tmi = 'Ice_initialization'    , -12 ,'tmi'   ,  .false.  , .true., 'yearly'  , '' , '', '' 
    206214   sn_tsu = 'Ice_initialization'    , -12 ,'tsu'   ,  .false.  , .true., 'yearly'  , '' , '', '' 
    207    sn_tmi = 'Ice_initialization'    , -12 ,'tmi'   ,  .false.  , .true., 'yearly'  , '' , '', '' 
    208    sn_smi = 'Ice_initialization'    , -12 ,'smi'   ,  .false.  , .true., 'yearly'  , '' , '', '' 
     215   sn_tms = 'NOT USED'              , -12 ,'tms'   ,  .false.  , .true., 'yearly'  , '' , '', '' 
     216   !      melt ponds (be careful, sn_apd is the pond concentration (not fraction), so it differs from rn_apd) 
     217   sn_apd = 'NOT USED'              , -12 ,'apd'   ,  .false.  , .true., 'yearly'  , '' , '', '' 
     218   sn_hpd = 'NOT USED'              , -12 ,'hpd'   ,  .false.  , .true., 'yearly'  , '' , '', '' 
    209219   cn_dir='./' 
    210220/ 
    … …  
    222232&namdia         !   Diagnostics 
    223233!------------------------------------------------------------------------------ 
    224    ln_icediachk     = .false.         !  check online the heat, mass & salt budgets (T) or not (F) 
     234   ln_icediachk     = .false.         !  check online heat, mass & salt budgets 
     235      !                               !   rate of ice spuriously gained/lost at each time step => rn_icechk=1 <=> 1.e-6 m/hour 
     236      rn_icechk_cel =  100.           !     check at each gridcell          (1.e-4m/h)=> stops the code if violated (and writes a file) 
     237      rn_icechk_glo =  1.             !     check over the entire ice cover (1.e-6m/h)=> only prints warnings 
    225238   ln_icediahsb     = .false.         !  output the heat, mass & salt budgets (T) or not (F) 
    226239   ln_icectl        = .false.         !  ice points output for debug (T or F) 

  • NEMO/branches/2019/dev_r10742_ENHANCE-12_SimonM-Tides/cfgs/SHARED/namelist_pisces_ref

    r10721 r12065  
    3434!              !  file name   ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
    3535!              !              !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
    36    sn_patm     = 'presatm'    ,     -1            , 'patm'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , '' 
    37    sn_atmco2   = 'presatmco2' ,     -1            , 'xco2'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , '' 
     36   sn_patm     = 'presatm'    ,     -1.           , 'patm'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , '' 
     37   sn_atmco2   = 'presatmco2' ,     -1.           , 'xco2'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , '' 
    3838   cn_dir      = './'     !  root directory for the location of the dynamical files 
    3939! 
    … …  
    141141!              !  file name       ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
    142142!              !                  !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
    143    sn_par      = 'par.orca'       ,     24            , 'fr_par'  ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , '' 
     143   sn_par      = 'par.orca'       ,     24.           , 'fr_par'  ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , '' 
    144144   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the dynamical files 
    145145   ln_varpar   =  .true.   ! boolean for PAR variable 
    … …  
    347347!              !  file name        ! frequency (hours) ! variable      ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
    348348!              !                   !  (if <0  months)  !   name        !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
    349    sn_dust     = 'dust.orca'       ,     -1            , 'dust'        ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
    350    sn_solub    = 'solubility.orca' ,    -12            , 'solubility1' ,  .false.     , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
    351    sn_riverdic = 'river.orca'      ,    120            , 'riverdic'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
    352    sn_riverdoc = 'river.orca'      ,    120            , 'riverdoc'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
    353    sn_riverdin = 'river.orca'      ,    120            , 'riverdin'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
    354    sn_riverdon = 'river.orca'      ,    120            , 'riverdon'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
    355    sn_riverdip = 'river.orca'      ,    120            , 'riverdip'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
    356    sn_riverdop = 'river.orca'      ,    120            , 'riverdop'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
    357    sn_riverdsi = 'river.orca'      ,    120            , 'riverdsi'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
    358    sn_ndepo    = 'ndeposition.orca',    -12            , 'ndep'        ,  .false.     , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
    359    sn_ironsed  = 'bathy.orca'      ,    -12            , 'bathy'       ,  .false.     , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
    360    sn_hydrofe  = 'hydrofe.orca'    ,    -12            , 'epsdb'       ,  .false.     , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     349   sn_dust     = 'dust.orca'       ,     -1.           , 'dust'        ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     350   sn_solub    = 'solubility.orca' ,    -12.           , 'solubility1' ,  .false.     , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     351   sn_riverdic = 'river.orca'      ,    120.           , 'riverdic'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     352   sn_riverdoc = 'river.orca'      ,    120.           , 'riverdoc'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     353   sn_riverdin = 'river.orca'      ,    120.           , 'riverdin'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     354   sn_riverdon = 'river.orca'      ,    120.           , 'riverdon'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     355   sn_riverdip = 'river.orca'      ,    120.           , 'riverdip'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     356   sn_riverdop = 'river.orca'      ,    120.           , 'riverdop'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     357   sn_riverdsi = 'river.orca'      ,    120.           , 'riverdsi'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     358   sn_ndepo    = 'ndeposition.orca',    -12.           , 'ndep'        ,  .false.     , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     359   sn_ironsed  = 'bathy.orca'      ,    -12.           , 'bathy'       ,  .false.     , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
     360   sn_hydrofe  = 'hydrofe.orca'    ,    -12.           , 'epsdb'       ,  .false.     , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , '' 
    361361! 
    362362   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the dynamical files 

  • NEMO/branches/2019/dev_r10742_ENHANCE-12_SimonM-Tides/cfgs/SHARED/namelist_ref

    r12037 r12065  
    3737   cn_exp      =  "ORCA2"  !  experience name 
    3838   nn_it000    =       1   !  first time step 
    39    nn_itend    =    5475   !  last  time step (std 5475) 
     39   nn_itend    =    5840   !  last  time step (std 5840) 
    4040   nn_date0    =  010101   !  date at nit_0000 (format yyyymmdd) used if ln_rstart=F or (ln_rstart=T and nn_rstctl=0 or 1) 
    4141   nn_time0    =       0   !  initial time of day in hhmm 
    … …  
    5050      cn_ocerst_indir = "."         !  directory from which to read input ocean restarts 
    5151      cn_ocerst_out   = "restart"   !  suffix of ocean restart name (output) 
    52       cn_ocerst_outdir = "."         !  directory in which to write output ocean restarts 
     52      cn_ocerst_outdir = "."        !  directory in which to write output ocean restarts 
    5353   ln_iscpl    = .false.   !  cavity evolution forcing or coupling to ice sheet model 
    5454   nn_istate   =       0   !  output the initial state (1) or not (0) 
    5555   ln_rst_list = .false.   !  output restarts at list of times using nn_stocklist (T) or at set frequency with nn_stock (F) 
    56    nn_stock    =    5475   !  frequency of creation of a restart file (modulo referenced to 1) 
     56   nn_stock    =       0   !  used only if ln_rst_list = F: output restart freqeuncy (modulo referenced to 1) 
     57      !                          !    =  0 force to write restart files only at the end of the run 
     58      !                          !    = -1 do not do any restart 
    5759   nn_stocklist = 0,0,0,0,0,0,0,0,0,0 ! List of timesteps when a restart file is to be written 
    58    nn_write    =    5475   !  frequency of write in the output file   (modulo referenced to nn_it000) 
    59    ln_mskland  = .false.   !  mask land points in NetCDF outputs (costly: + ~15%) 
     60   nn_write    =       0   !  used only if key_iomput is not defined: output frequency (modulo referenced to nn_it000) 
     61      !                          !    =  0 force to write output files only at the end of the run 
     62      !                          !    = -1 do not do any output file 
     63   ln_mskland  = .false.   !  mask land points in NetCDF outputs 
    6064   ln_cfmeta   = .false.   !  output additional data to netCDF files required for compliance with the CF metadata standard 
    6165   ln_clobber  = .true.    !  clobber (overwrite) an existing file 
    … …  
    7074   rn_isfhmin  =    1.00   !  treshold [m] to discriminate grounding ice from floating ice 
    7175   ! 
    72    rn_rdt      = 5760.     !  time step for the dynamics and tracer 
     76   rn_rdt      = 5400.     !  time step for the dynamics and tracer 
    7377   rn_atfp     =    0.1    !  asselin time filter parameter 
    7478   ! 
    … …  
    107111   !           !  file name              ! frequency (hours) ! variable  ! time interp.!  clim  ! 'yearly'/ ! weights filename ! rotation ! land/sea mask ! 
    108112   !           !                         !  (if <0  months)  !   name    !   (logical) !  (T/F) ! 'monthly' !                  ! pairing  !    filename   ! 
    109    sn_tem = 'data_1m_potential_temperature_nomask',  -1      , 'votemper',   .true.    , .true. , 'yearly'  ,    ''            ,    ''    ,    '' 
    110    sn_sal = 'data_1m_salinity_nomask'             ,  -1      , 'vosaline',   .true.    , .true. , 'yearly'  ,    ''            ,    ''    ,    '' 
     113   sn_tem = 'data_1m_potential_temperature_nomask',  -1.     , 'votemper',   .true.    , .true. , 'yearly'  ,    ''            ,    ''    ,    '' 
     114   sn_sal = 'data_1m_salinity_nomask'             ,  -1.     , 'vosaline',   .true.    , .true. , 'yearly'  ,    ''            ,    ''    ,    '' 
    111115/ 
    112116!----------------------------------------------------------------------- 
    113117&namwad        !   Wetting and Drying (WaD)                             (default: OFF) 
    114118!----------------------------------------------------------------------- 
    115    ln_wd_il    = .false    !  T/F activation of iterative   limiter 
     119   ln_wd_il    = .false.   !  T/F activation of iterative   limiter 
    116120   ln_wd_dl    = .false.   !  T/F activation of directional limiter 
    117121   ln_wd_dl_bc = .false.   !  T/F Directional limiteer Baroclinic option 
    … …  
    163167   !           !  file name              ! frequency (hours) ! variable  ! time interp.!  clim  ! 'yearly'/ ! weights filename ! rotation ! land/sea mask ! 
    164168   !           !                         !  (if <0  months)  !   name    !   (logical) !  (T/F) ! 'monthly' !                  ! pairing  !    filename   ! 
    165    sn_ucur     = 'ucurrent'              ,         -1        ,'u_current',   .false.   , .true. , 'monthly' ,  ''              ,  'Ume'   , '' 
    166    sn_vcur     = 'vcurrent'              ,         -1        ,'v_current',   .false.   , .true. , 'monthly' ,  ''              ,  'Vme'   , '' 
     169   sn_ucur     = 'ucurrent'              ,         -1.       ,'u_current',   .false.   , .true. , 'monthly' ,  ''              ,  'Ume'   , '' 
     170   sn_vcur     = 'vcurrent'              ,         -1.       ,'v_current',   .false.   , .true. , 'monthly' ,  ''              ,  'Vme'   , '' 
    167171/ 
    168172 
    … …  
    189193&namsbc        !   Surface Boundary Condition manager                   (default: NO selection) 
    190194!----------------------------------------------------------------------- 
    191    nn_fsbc     = 5         !  frequency of SBC module call 
     195   nn_fsbc     = 2         !  frequency of SBC module call 
    192196      !                    !  (control sea-ice & iceberg model call) 
    193197                     ! Type of air-sea fluxes  
    … …  
    239243   !           !  file name              ! frequency (hours) ! variable  ! time interp.!  clim  ! 'yearly'/ ! weights filename ! rotation ! land/sea mask ! 
    240244   !           !                         !  (if <0  months)  !   name    !   (logical) !  (T/F) ! 'monthly' !                  ! pairing  !    filename   ! 
    241    sn_utau     = 'utau'                  ,        24         , 'utau'    , .false.     , .false., 'yearly'  , ''               , ''       , '' 
    242    sn_vtau     = 'vtau'                  ,        24         , 'vtau'    , .false.     , .false., 'yearly'  , ''               , ''       , '' 
    243    sn_qtot     = 'qtot'                  ,        24         , 'qtot'    , .false.     , .false., 'yearly'  , ''               , ''       , '' 
    244    sn_qsr      = 'qsr'                   ,        24         , 'qsr'     , .false.     , .false., 'yearly'  , ''               , ''       , '' 
    245    sn_emp      = 'emp'                   ,        24         , 'emp'     , .false.     , .false., 'yearly'  , ''               , ''       , '' 
     245   sn_utau     = 'utau'                  ,        24.        , 'utau'    , .false.     , .false., 'yearly'  , ''               , ''       , '' 
     246   sn_vtau     = 'vtau'                  ,        24.        , 'vtau'    , .false.     , .false., 'yearly'  , ''               , ''       , '' 
     247   sn_qtot     = 'qtot'                  ,        24.        , 'qtot'    , .false.     , .false., 'yearly'  , ''               , ''       , '' 
     248   sn_qsr      = 'qsr'                   ,        24.        , 'qsr'     , .false.     , .false., 'yearly'  , ''               , ''       , '' 
     249   sn_emp      = 'emp'                   ,        24.        , 'emp'     , .false.     , .false., 'yearly'  , ''               , ''       , '' 
    246250/ 
    247251!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    268272   !           !  file name              ! frequency (hours) ! variable  ! time interp.!  clim  ! 'yearly'/ !       weights filename               ! rotation ! land/sea mask ! 
    269273   !           !                         !  (if <0  months)  !   name    !   (logical) !  (T/F) ! 'monthly' !                                      ! pairing  !    filename   ! 
    270    sn_wndi     = 'u_10.15JUNE2009_fill'       ,    6         , 'U_10_MOD',   .false.   , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bicubic_noc.nc'  , 'Uwnd'   , '' 
    271    sn_wndj     = 'v_10.15JUNE2009_fill'       ,    6         , 'V_10_MOD',   .false.   , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bicubic_noc.nc'  , 'Vwnd'   , '' 
    272    sn_qsr      = 'ncar_rad.15JUNE2009_fill'   ,   24         , 'SWDN_MOD',   .false.   , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc' , ''       , '' 
    273    sn_qlw      = 'ncar_rad.15JUNE2009_fill'   ,   24         , 'LWDN_MOD',   .false.   , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc' , ''       , '' 
    274    sn_tair     = 't_10.15JUNE2009_fill'       ,    6         , 'T_10_MOD',   .false.   , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc' , ''       , '' 
    275    sn_humi     = 'q_10.15JUNE2009_fill'       ,    6         , 'Q_10_MOD',   .false.   , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc' , ''       , '' 
    276    sn_prec     = 'ncar_precip.15JUNE2009_fill',   -1         , 'PRC_MOD1',   .false.   , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc' , ''       , '' 
    277    sn_snow     = 'ncar_precip.15JUNE2009_fill',   -1         , 'SNOW'    ,   .false.   , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc' , ''       , '' 
    278    sn_slp      = 'slp.15JUNE2009_fill'        ,    6         , 'SLP'     ,   .false.   , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc' , ''       , '' 
     274   sn_wndi     = 'u_10.15JUNE2009_fill'       ,    6.        , 'U_10_MOD',   .false.   , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bicubic_noc.nc'  , 'Uwnd'   , '' 
     275   sn_wndj     = 'v_10.15JUNE2009_fill'       ,    6.        , 'V_10_MOD',   .false.   , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bicubic_noc.nc'  , 'Vwnd'   , '' 
     276   sn_qsr      = 'ncar_rad.15JUNE2009_fill'   ,   24.        , 'SWDN_MOD',   .false.   , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc' , ''       , '' 
     277   sn_qlw      = 'ncar_rad.15JUNE2009_fill'   ,   24.        , 'LWDN_MOD',   .false.   , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc' , ''       , '' 
     278   sn_tair     = 't_10.15JUNE2009_fill'       ,    6.        , 'T_10_MOD',   .false.   , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc' , ''       , '' 
     279   sn_humi     = 'q_10.15JUNE2009_fill'       ,    6.        , 'Q_10_MOD',   .false.   , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc' , ''       , '' 
     280   sn_prec     = 'ncar_precip.15JUNE2009_fill',   -1.        , 'PRC_MOD1',   .false.   , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc' , ''       , '' 
     281   sn_snow     = 'ncar_precip.15JUNE2009_fill',   -1.        , 'SNOW'    ,   .false.   , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc' , ''       , '' 
     282   sn_slp      = 'slp.15JUNE2009_fill'        ,    6.        , 'SLP'     ,   .false.   , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc' , ''       , '' 
    279283   sn_tdif     = 'taudif_core'                ,   24         , 'taudif'  ,   .false.   , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc' , ''       , '' 
    280284/ 
    … …  
    286290   !                       !   -> file cplmask.nc with the float variable called cplmask (jpi,jpj,nn_cplmodel) 
    287291   nn_cats_cpl   =     5   !  Number of sea ice categories over which coupling is to be carried out (if not 1) 
    288  
    289292   !_____________!__________________________!____________!_____________!______________________!________! 
    290293   !             !        description       !  multiple  !    vector   !       vector         ! vector ! 
    … …  
    323326   sn_rcv_wper   =   'none'                 ,    'no'    ,     ''      ,         ''           ,   '' 
    324327   sn_rcv_wnum   =   'none'                 ,    'no'    ,     ''      ,         ''           ,   '' 
    325    sn_rcv_wstrf  =   'none'                 ,    'no'    ,     ''      ,         ''           ,   '' 
     328   sn_rcv_wfreq  =   'none'                 ,    'no'    ,     ''      ,         ''           ,   '' 
    326329   sn_rcv_wdrag  =   'none'                 ,    'no'    ,     ''      ,         ''           ,   '' 
    327330   sn_rcv_ts_ice =   'none'                 ,    'no'    ,     ''      ,         ''           ,   '' 
    … …  
    343346   !           !  file name              ! frequency (hours) ! variable  ! time interp.!  clim  ! 'yearly'/ ! weights filename ! rotation ! land/sea mask ! 
    344347   !           !                         !  (if <0  months)  !   name    !   (logical) !  (T/F) ! 'monthly' !                  ! pairing  !    filename   ! 
    345    sn_usp      = 'sas_grid_U'            ,       120         , 'uos'     ,   .true.    , .true. , 'yearly'  ,    ''            ,    ''    ,    '' 
    346    sn_vsp      = 'sas_grid_V'            ,       120         , 'vos'     ,   .true.    , .true. , 'yearly'  ,    ''            ,    ''    ,    '' 
    347    sn_tem      = 'sas_grid_T'            ,       120         , 'sosstsst',   .true.    , .true. , 'yearly'  ,    ''            ,    ''    ,    '' 
    348    sn_sal      = 'sas_grid_T'            ,       120         , 'sosaline',   .true.    , .true. , 'yearly'  ,    ''            ,    ''    ,    '' 
    349    sn_ssh      = 'sas_grid_T'            ,       120         , 'sossheig',   .true.    , .true. , 'yearly'  ,    ''            ,    ''    ,    '' 
    350    sn_e3t      = 'sas_grid_T'            ,       120         , 'e3t_m'   ,   .true.    , .true. , 'yearly'  ,    ''            ,    ''    ,    '' 
    351    sn_frq      = 'sas_grid_T'            ,       120         , 'frq_m'   ,   .true.    , .true. , 'yearly'  ,    ''            ,    ''    ,    '' 
     348   sn_usp      = 'sas_grid_U'            ,       120.        , 'uos'     ,   .true.    , .true. , 'yearly'  ,    ''            ,    ''    ,    '' 
     349   sn_vsp      = 'sas_grid_V'            ,       120.        , 'vos'     ,   .true.    , .true. , 'yearly'  ,    ''            ,    ''    ,    '' 
     350   sn_tem      = 'sas_grid_T'            ,       120.        , 'sosstsst',   .true.    , .true. , 'yearly'  ,    ''            ,    ''    ,    '' 
     351   sn_sal      = 'sas_grid_T'            ,       120.        , 'sosaline',   .true.    , .true. , 'yearly'  ,    ''            ,    ''    ,    '' 
     352   sn_ssh      = 'sas_grid_T'            ,       120.        , 'sossheig',   .true.    , .true. , 'yearly'  ,    ''            ,    ''    ,    '' 
     353   sn_e3t      = 'sas_grid_T'            ,       120.        , 'e3t_m'   ,   .true.    , .true. , 'yearly'  ,    ''            ,    ''    ,    '' 
     354   sn_frq      = 'sas_grid_T'            ,       120.        , 'frq_m'   ,   .true.    , .true. , 'yearly'  ,    ''            ,    ''    ,    '' 
    352355/ 
    353356!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    377380   !           !  file name              ! frequency (hours) ! variable  ! time interp.!  clim  ! 'yearly'/ ! weights filename ! rotation ! land/sea mask ! 
    378381   !           !                         !  (if <0  months)  !   name    !   (logical) !  (T/F) ! 'monthly' !                  ! pairing  !    filename   ! 
    379    sn_chl      ='chlorophyll'            ,        -1         , 'CHLA'    ,   .true.    , .true. , 'yearly'  , ''               , ''       , '' 
     382   sn_chl      ='chlorophyll'            ,        -1.        , 'CHLA'    ,   .true.    , .true. , 'yearly'  , ''               , ''       , '' 
    380383/ 
    381384!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    394397   !           !  file name              ! frequency (hours) ! variable  ! time interp.!  clim  ! 'yearly'/ ! weights filename ! rotation ! land/sea mask ! 
    395398   !           !                         !  (if <0  months)  !   name    !   (logical) !  (T/F) ! 'monthly' !                  ! pairing  !    filename   ! 
    396    sn_sst      = 'sst_data'              ,        24         ,  'sst'    ,    .false.  , .false., 'yearly'  ,    ''            ,    ''    ,     '' 
    397    sn_sss      = 'sss_data'              ,        -1         ,  'sss'    ,    .true.   , .true. , 'yearly'  ,    ''            ,    ''    ,     '' 
     399   sn_sst      = 'sst_data'              ,        24.        ,  'sst'    ,    .false.  , .false., 'yearly'  ,    ''            ,    ''    ,     '' 
     400   sn_sss      = 'sss_data'              ,        -1.        ,  'sss'    ,    .true.   , .true. , 'yearly'  ,    ''            ,    ''    ,     '' 
    398401/ 
    399402!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    416419   !           !  file name              ! frequency (hours) ! variable  ! time interp.!  clim  ! 'yearly'/ ! weights filename ! rotation ! land/sea mask ! 
    417420   !           !                         !  (if <0  months)  !   name    !   (logical) !  (T/F) ! 'monthly' !                  ! pairing  !    filename   ! 
    418    sn_rnf      = 'runoff_core_monthly'   ,        -1         , 'sorunoff',   .true.    , .true. , 'yearly'  , ''               , ''       , '' 
    419    sn_cnf      = 'runoff_core_monthly'   ,         0         , 'socoefr0',   .false.   , .true. , 'yearly'  , ''               , ''       , '' 
    420    sn_s_rnf    = 'runoffs'               ,        24         , 'rosaline',   .true.    , .true. , 'yearly'  , ''               , ''       , '' 
    421    sn_t_rnf    = 'runoffs'               ,        24         , 'rotemper',   .true.    , .true. , 'yearly'  , ''               , ''       , '' 
    422    sn_dep_rnf  = 'runoffs'               ,         0         , 'rodepth' ,   .false.   , .true. , 'yearly'  , ''               , ''       , '' 
     421   sn_rnf      = 'runoff_core_monthly'   ,        -1.        , 'sorunoff',   .true.    , .true. , 'yearly'  , ''               , ''       , '' 
     422   sn_cnf      = 'runoff_core_monthly'   ,         0.        , 'socoefr0',   .false.   , .true. , 'yearly'  , ''               , ''       , '' 
     423   sn_s_rnf    = 'runoffs'               ,        24.        , 'rosaline',   .true.    , .true. , 'yearly'  , ''               , ''       , '' 
     424   sn_t_rnf    = 'runoffs'               ,        24.        , 'rotemper',   .true.    , .true. , 'yearly'  , ''               , ''       , '' 
     425   sn_dep_rnf  = 'runoffs'               ,         0.        , 'rodepth' ,   .false.   , .true. , 'yearly'  , ''               , ''       , '' 
    423426/ 
    424427!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    433436   !           !  file name              ! frequency (hours) ! variable  ! time interp.!  clim  ! 'yearly'/ ! weights filename ! rotation ! land/sea mask ! 
    434437   !           !                         !  (if <0  months)  !   name    !   (logical) !  (T/F) ! 'monthly' !                  ! pairing  !    filename   ! 
    435    sn_apr      = 'patm'                  ,         -1        ,'somslpre' ,   .true.    , .true. , 'yearly'  ,    ''            ,    ''    ,      '' 
     438   sn_apr      = 'patm'                  ,         -1.       ,'somslpre' ,   .true.    , .true. , 'yearly'  ,    ''            ,    ''    ,      '' 
    436439/ 
    437440!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    460463   !           !             !  (if <0  months)  !   name    !  (logical)  !  (T/F)  ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
    461464!* nn_isf = 4 case 
    462    sn_fwfisf   = 'rnfisf'    ,         -12       ,'sowflisf' ,  .false.    , .true.  , 'yearly'  ,    ''    ,   ''     ,    '' 
     465   sn_fwfisf   = 'rnfisf'    ,         -12.      ,'sowflisf' ,  .false.    , .true.  , 'yearly'  ,    ''    ,   ''     ,    '' 
    463466!* nn_isf = 3 case 
    464    sn_rnfisf   = 'rnfisf'    ,         -12       ,'sofwfisf' ,  .false.    , .true.  , 'yearly'  ,    ''    ,   ''     ,    '' 
     467   sn_rnfisf   = 'rnfisf'    ,         -12.      ,'sofwfisf' ,  .false.    , .true.  , 'yearly'  ,    ''    ,   ''     ,    '' 
    465468!* nn_isf = 2 and 3 cases  
    466    sn_depmax_isf ='rnfisf'    ,         -12       ,'sozisfmax',  .false.    , .true.  , 'yearly'  ,    ''    ,   ''     ,    '' 
    467    sn_depmin_isf ='rnfisf'    ,         -12       ,'sozisfmin',  .false.    , .true.  , 'yearly'  ,    ''    ,   ''     ,    '' 
     469   sn_depmax_isf ='rnfisf'   ,         -12.      ,'sozisfmax',  .false.    , .true.  , 'yearly'  ,    ''    ,   ''     ,    '' 
     470   sn_depmin_isf ='rnfisf'   ,         -12.      ,'sozisfmin',  .false.    , .true.  , 'yearly'  ,    ''    ,   ''     ,    '' 
    468471!* nn_isf = 2 case 
    469    sn_Leff_isf = 'rnfisf'    ,         -12       ,'Leff'     ,  .false.    , .true.  , 'yearly'  ,    ''    ,   ''     ,    '' 
     472   sn_Leff_isf = 'rnfisf'    ,         -12.      ,'Leff'     ,  .false.    , .true.  , 'yearly'  ,    ''    ,   ''     ,    '' 
    470473/ 
    471474!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    483486   !           !  file name              ! frequency (hours) ! variable  ! time interp.!  clim  ! 'yearly'/ ! weights filename ! rotation ! land/sea mask ! 
    484487   !           !                         !  (if <0  months)  !   name    !   (logical) !  (T/F) ! 'monthly' !                  ! pairing  !    filename   ! 
    485    sn_cdg      =  'sdw_ecwaves_orca2'    ,        6          , 'drag_coeff' ,  .true.  , .true. , 'yearly'  ,  ''              , ''       , '' 
    486    sn_usd      =  'sdw_ecwaves_orca2'    ,        6          , 'u_sd2d'     ,  .true.  , .true. , 'yearly'  ,  ''              , ''       , '' 
    487    sn_vsd      =  'sdw_ecwaves_orca2'    ,        6          , 'v_sd2d'     ,  .true.  , .true. , 'yearly'  ,  ''              , ''       , '' 
    488    sn_hsw      =  'sdw_ecwaves_orca2'    ,        6          , 'hs'         ,  .true.  , .true. , 'yearly'  ,  ''              , ''       , '' 
    489    sn_wmp      =  'sdw_ecwaves_orca2'    ,        6          , 'wmp'        ,  .true.  , .true. , 'yearly'  ,  ''              , ''       , '' 
    490    sn_wfr      =  'sdw_ecwaves_orca2'    ,        6          , 'wfr'        ,  .true.  , .true. , 'yearly'  ,  ''              , ''       , '' 
    491    sn_wnum     =  'sdw_ecwaves_orca2'    ,        6          , 'wave_num'   ,  .true.  , .true. , 'yearly'  ,  ''              , ''       , '' 
    492    sn_tauwoc   =  'sdw_ecwaves_orca2'    ,        6          , 'wave_stress',  .true.  , .true. , 'yearly'  ,  ''              , ''       , '' 
    493    sn_tauwx    =  'sdw_ecwaves_orca2'    ,        6          , 'wave_stress',  .true.  , .true. , 'yearly'  ,  ''              , ''       , '' 
    494    sn_tauwy    =  'sdw_ecwaves_orca2'    ,        6          , 'wave_stress',  .true.  , .true. , 'yearly'  ,  ''              , ''       , '' 
     488   sn_cdg      =  'sdw_ecwaves_orca2'    ,        6.         , 'drag_coeff' ,  .true.  , .true. , 'yearly'  ,  ''              , ''       , '' 
     489   sn_usd      =  'sdw_ecwaves_orca2'    ,        6.         , 'u_sd2d'     ,  .true.  , .true. , 'yearly'  ,  ''              , ''       , '' 
     490   sn_vsd      =  'sdw_ecwaves_orca2'    ,        6.         , 'v_sd2d'     ,  .true.  , .true. , 'yearly'  ,  ''              , ''       , '' 
     491   sn_hsw      =  'sdw_ecwaves_orca2'    ,        6.         , 'hs'         ,  .true.  , .true. , 'yearly'  ,  ''              , ''       , '' 
     492   sn_wmp      =  'sdw_ecwaves_orca2'    ,        6.         , 'wmp'        ,  .true.  , .true. , 'yearly'  ,  ''              , ''       , '' 
     493   sn_wfr      =  'sdw_ecwaves_orca2'    ,        6.         , 'wfr'        ,  .true.  , .true. , 'yearly'  ,  ''              , ''       , '' 
     494   sn_wnum     =  'sdw_ecwaves_orca2'    ,        6.         , 'wave_num'   ,  .true.  , .true. , 'yearly'  ,  ''              , ''       , '' 
     495   sn_tauwoc   =  'sdw_ecwaves_orca2'    ,        6.         , 'wave_stress',  .true.  , .true. , 'yearly'  ,  ''              , ''       , '' 
     496   sn_tauwx    =  'sdw_ecwaves_orca2'    ,        6.         , 'wave_stress',  .true.  , .true. , 'yearly'  ,  ''              , ''       , '' 
     497   sn_tauwy    =  'sdw_ecwaves_orca2'    ,        6.         , 'wave_stress',  .true.  , .true. , 'yearly'  ,  ''              , ''       , '' 
    495498/ 
    496499!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    500503   ! 
    501504   !                          ! diagnostics: 
    502    ln_bergdia        = .true.       ! Calculate budgets 
    503    nn_verbose_level  = 0            ! Turn on more verbose output if level > 0 
    504    nn_verbose_write  = 15           ! Timesteps between verbose messages 
    505    nn_sample_rate    = 1            ! Timesteps between sampling for trajectory storage 
     505   ln_bergdia        = .true.        ! Calculate budgets 
     506   nn_verbose_level  = 0             ! Turn on more verbose output if level > 0 
     507   nn_verbose_write  = 15            ! Timesteps between verbose messages 
     508   nn_sample_rate    = 1             ! Timesteps between sampling for trajectory storage 
    506509   ! 
    507510   !                          ! iceberg setting: 
    508    !                                ! Initial mass required for an iceberg of each class 
     511   !                                 ! Initial mass required for an iceberg of each class 
    509512   rn_initial_mass   = 8.8e7, 4.1e8, 3.3e9, 1.8e10, 3.8e10, 7.5e10, 1.2e11, 2.2e11, 3.9e11, 7.4e11 
    510    !                                ! Proportion of calving mass to apportion to each class 
     513   !                                 ! Proportion of calving mass to apportion to each class 
    511514   rn_distribution   = 0.24, 0.12, 0.15, 0.18, 0.12, 0.07, 0.03, 0.03, 0.03, 0.02 
    512    !                                ! Ratio between effective and real iceberg mass (non-dim) 
    513    !                                ! i.e. number of icebergs represented at a point 
    514    rn_mass_scaling   = 2000, 200, 50, 20, 10, 5, 2, 1, 1, 1 
    515                                     ! thickness of newly calved bergs (m) 
     515   !                                 ! Ratio between effective and real iceberg mass (non-dim) 
     516   !                                 ! i.e. number of icebergs represented at a point 
     517   rn_mass_scaling   = 2000., 200., 50., 20., 10., 5., 2., 1., 1., 1. 
     518                                     ! thickness of newly calved bergs (m) 
    516519   rn_initial_thickness     = 40., 67., 133., 175., 250., 250., 250., 250., 250., 250. 
    517520   ! 
    518    rn_rho_bergs            = 850.   ! Density of icebergs 
    519    rn_LoW_ratio            = 1.5    ! Initial ratio L/W for newly calved icebergs 
    520    ln_operator_splitting   = .true. ! Use first order operator splitting for thermodynamics 
    521    rn_bits_erosion_fraction = 0.    ! Fraction of erosion melt flux to divert to bergy bits 
    522    rn_sicn_shift           = 0.     ! Shift of sea-ice concn in erosion flux (0<sicn_shift<1) 
    523    ln_passive_mode         = .false.! iceberg - ocean decoupling 
    524    nn_test_icebergs        =  10    ! Create test icebergs of this class (-1 = no) 
    525    !                                ! Put a test iceberg at each gridpoint in box (lon1,lon2,lat1,lat2) 
     521   rn_rho_bergs            = 850.    ! Density of icebergs 
     522   rn_LoW_ratio            = 1.5     ! Initial ratio L/W for newly calved icebergs 
     523   ln_operator_splitting   = .true.  ! Use first order operator splitting for thermodynamics 
     524   rn_bits_erosion_fraction = 0.     ! Fraction of erosion melt flux to divert to bergy bits 
     525   rn_sicn_shift           = 0.      ! Shift of sea-ice concn in erosion flux (0<sicn_shift<1) 
     526   ln_passive_mode         = .false. ! iceberg - ocean decoupling 
     527   nn_test_icebergs        =  10     ! Create test icebergs of this class (-1 = no) 
     528   !                                 ! Put a test iceberg at each gridpoint in box (lon1,lon2,lat1,lat2) 
    526529   rn_test_box             = 108.0,  116.0, -66.0, -58.0 
    527    ln_use_calving          = .false.! Use calving data even when nn_test_icebergs > 0 
    528    rn_speed_limit          = 0.     ! CFL speed limit for a berg 
     530   ln_use_calving          = .false. ! Use calving data even when nn_test_icebergs > 0 
     531   rn_speed_limit          = 0.      ! CFL speed limit for a berg 
    529532 
    530533   cn_dir      = './'      !  root directory for the calving data location 
    … …  
    532535   !           !  file name              ! frequency (hours) ! variable  ! time interp.!  clim  ! 'yearly'/ ! weights filename ! rotation ! land/sea mask ! 
    533536   !           !                         !  (if <0  months)  !   name    !   (logical) !  (T/F) ! 'monthly' !                  ! pairing  !    filename   ! 
    534    sn_icb     =  'calving'              ,         -1         ,'calvingmask',  .true.   , .true. , 'yearly'  , ''               , ''       , '' 
     537   sn_icb     =  'calving'              ,         -1.        ,'calvingmask',  .true.   , .true. , 'yearly'  , ''               , ''       , '' 
    535538/ 
    536539 
    … …  
    602605   nn_ice_dta    =  0         !  = 0, bdy data are equal to the initial state 
    603606   !                          !  = 1, bdy data are read in 'bdydata   .nc' files 
    604    rn_ice_tem    = 270.       !  si3 only: arbitrary temperature of incoming sea ice 
    605    rn_ice_sal    = 10.        !  si3 only:      --   salinity           -- 
    606    rn_ice_age    = 30.        !  si3 only:      --   age                -- 
    607607   ! 
    608608   ln_tra_dmp    =.false.     !  open boudaries conditions for tracers 
    609609   ln_dyn3d_dmp  =.false.     !  open boundary condition for baroclinic velocities 
    610610   rn_time_dmp   =  1.        !  Damping time scale in days 
    611    rn_time_dmp_out = 1.        !  Outflow damping time scale 
     611   rn_time_dmp_out = 1.       !  Outflow damping time scale 
    612612   nn_rimwidth   = 10         !  width of the relaxation zone 
    613613   ln_vol        = .false.    !  total volume correction (see nn_volctl parameter) 
    614614   nn_volctl     =  1         !  = 0, the total water flux across open boundaries is zero 
    615    nb_jpk_bdy    = -1         ! number of levels in the bdy data (set < 0 if consistent with planned run) 
    616615/ 
    617616!----------------------------------------------------------------------- 
    618617&nambdy_dta    !  open boundaries - external data                       (see nam_bdy) 
    619618!----------------------------------------------------------------------- 
    620    ln_full_vel = .false.      !  ??? 
    621  
     619   ln_zinterp  = .false.      !  T if a vertical interpolation is required. Variables gdep[tuv] and e3[tuv] must exist in the file 
     620   !                          !  automatically defined to T if the number of vertical levels in bdy dta /= jpk 
     621   ln_full_vel = .false.      !  T if [uv]3d are "full" velocities and not only its baroclinic components 
     622   !                          !  in this case, baroclinic and barotropic velocities will be recomputed -> [uv]2d not needed 
     623   ! 
    622624   cn_dir      = 'bdydta/'    !  root directory for the BDY data location 
    623625   !___________!_________________________!___________________!___________!_____________!________!___________!__________________!__________!_______________! 
    624626   !           !  file name              ! frequency (hours) ! variable  ! time interp.!  clim  ! 'yearly'/ ! weights filename ! rotation ! land/sea mask ! 
    625627   !           !                         !  (if <0  months)  !   name    !   (logical) !  (T/F) ! 'monthly' !                  ! pairing  !    filename   ! 
    626    bn_ssh      = 'amm12_bdyT_u2d'        ,         24        , 'sossheig',    .true.   , .false.,  'daily'  ,    ''            ,   ''     ,     '' 
    627    bn_u2d      = 'amm12_bdyU_u2d'        ,         24        , 'vobtcrtx',    .true.   , .false.,  'daily'  ,    ''            ,   ''     ,     '' 
    628    bn_v2d      = 'amm12_bdyV_u2d'        ,         24        , 'vobtcrty',    .true.   , .false.,  'daily'  ,    ''            ,   ''     ,     '' 
    629    bn_u3d      = 'amm12_bdyU_u3d'        ,         24        , 'vozocrtx',    .true.   , .false.,  'daily'  ,    ''            ,   ''     ,     '' 
    630    bn_v3d      = 'amm12_bdyV_u3d'        ,         24        , 'vomecrty',    .true.   , .false.,  'daily'  ,    ''            ,   ''     ,     '' 
    631    bn_tem      = 'amm12_bdyT_tra'        ,         24        , 'votemper',    .true.   , .false.,  'daily'  ,    ''            ,   ''     ,     '' 
    632    bn_sal      = 'amm12_bdyT_tra'        ,         24        , 'vosaline',    .true.   , .false.,  'daily'  ,    ''            ,   ''     ,     '' 
     628   bn_ssh      = 'amm12_bdyT_u2d'        ,         24.       , 'sossheig',    .true.   , .false.,  'daily'  ,    ''            ,   ''     ,     '' 
     629   bn_u2d      = 'amm12_bdyU_u2d'        ,         24.       , 'vobtcrtx',    .true.   , .false.,  'daily'  ,    ''            ,   ''     ,     '' 
     630   bn_v2d      = 'amm12_bdyV_u2d'        ,         24.       , 'vobtcrty',    .true.   , .false.,  'daily'  ,    ''            ,   ''     ,     '' 
     631   bn_u3d      = 'amm12_bdyU_u3d'        ,         24.       , 'vozocrtx',    .true.   , .false.,  'daily'  ,    ''            ,   ''     ,     '' 
     632   bn_v3d      = 'amm12_bdyV_u3d'        ,         24.       , 'vomecrty',    .true.   , .false.,  'daily'  ,    ''            ,   ''     ,     '' 
     633   bn_tem      = 'amm12_bdyT_tra'        ,         24.       , 'votemper',    .true.   , .false.,  'daily'  ,    ''            ,   ''     ,     '' 
     634   bn_sal      = 'amm12_bdyT_tra'        ,         24.       , 'vosaline',    .true.   , .false.,  'daily'  ,    ''            ,   ''     ,     '' 
    633635!* for si3 
    634 !   bn_a_i     = 'amm12_bdyT_ice'        ,         24        , 'ileadfra',    .true.   , .false.,  'daily'  ,    ''            ,   ''     ,     '' 
    635 !   bn_h_i     = 'amm12_bdyT_ice'        ,         24        , 'iicethic',    .true.   , .false.,  'daily'  ,    ''            ,   ''     ,     '' 
    636 !   bn_h_s     = 'amm12_bdyT_ice'        ,         24        , 'isnowthi',    .true.   , .false.,  'daily'  ,    ''            ,   ''     ,     '' 
     636   bn_a_i      = 'amm12_bdyT_ice'        ,         24.       , 'siconc'  ,    .true.   , .false.,  'daily'  ,    ''            ,   ''     ,     '' 
     637   bn_h_i      = 'amm12_bdyT_ice'        ,         24.       , 'sithic'  ,    .true.   , .false.,  'daily'  ,    ''            ,   ''     ,     '' 
     638   bn_h_s      = 'amm12_bdyT_ice'        ,         24.       , 'snthic'  ,    .true.   , .false.,  'daily'  ,    ''            ,   ''     ,     '' 
     639   bn_t_i      = 'NOT USED'              ,         24.       , 'sitemp'  ,    .true.   , .false.,  'daily'  ,    ''            ,   ''     ,     '' 
     640   bn_t_s      = 'NOT USED'              ,         24.       , 'sntemp'  ,    .true.   , .false.,  'daily'  ,    ''            ,   ''     ,     '' 
     641   bn_tsu      = 'NOT USED'              ,         24.       , 'sittop'  ,    .true.   , .false.,  'daily'  ,    ''            ,   ''     ,     '' 
     642   bn_s_i      = 'NOT USED'              ,         24.       , 'sisalt'  ,    .true.   , .false.,  'daily'  ,    ''            ,   ''     ,     '' 
     643   ! melt ponds (be careful, bn_aip is the pond concentration (not fraction), so it differs from rn_iceapnd) 
     644   bn_aip      = 'NOT USED'              ,         24.       , 'siapnd'  ,    .true.   , .false.,  'daily'  ,    ''            ,   ''     ,     '' 
     645   bn_hip      = 'NOT USED'              ,         24.       , 'sihpnd'  ,    .true.   , .false.,  'daily'  ,    ''            ,   ''     ,     '' 
     646   ! if bn_t_i etc are "not used", then define arbitrary temperatures and salinity and ponds 
     647   rn_ice_tem  = 270.         !  arbitrary temperature               of incoming sea ice 
     648   rn_ice_sal  = 10.          !       --   salinity                            -- 
     649   rn_ice_age  = 30.          !       --   age                                 -- 
     650   rn_ice_apnd = 0.2          !       --   pond fraction = a_ip/a_i            -- 
     651   rn_ice_hpnd = 0.05         !       --   pond depth                          -- 
    637652/ 
    638653!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    874889   ln_dynvor_eeT = .false. !  energy conserving scheme (een using e3t) 
    875890   ln_dynvor_een = .false. !  energy & enstrophy scheme 
    876       nn_een_e3f = 1          ! =0  e3f = mi(mj(e3t))/4  
     891      nn_een_e3f = 0          ! =0  e3f = mi(mj(e3t))/4  
    877892      !                       ! =1  e3f = mi(mj(e3t))/mi(mj( tmask)) 
    878893   ln_dynvor_msk = .false. !  vorticity multiplied by fmask (=T)        ==>>> PLEASE DO NOT ACTIVATE 
    … …  
    947962   !           !  file name              ! frequency (hours) ! variable  ! time interp.!  clim  ! 'yearly'/ ! weights filename ! rotation ! land/sea mask ! 
    948963   !           !                         !  (if <0  months)  !   name    !   (logical) !  (T/F) ! 'monthly' !                  ! pairing  !    filename   ! 
    949    sn_tem      = 'dyna_grid_T'           ,       120         , 'votemper'  ,  .true.   , .true. , 'yearly'  , ''               , ''       , '' 
    950    sn_sal      = 'dyna_grid_T'           ,       120         , 'vosaline'  ,  .true.   , .true. , 'yearly'  , ''               , ''       , '' 
    951    sn_mld      = 'dyna_grid_T'           ,       120         , 'somixhgt'  ,  .true.   , .true. , 'yearly'  , ''               , ''       , '' 
    952    sn_emp      = 'dyna_grid_T'           ,       120         , 'sowaflup'  ,  .true.   , .true. , 'yearly'  , ''               , ''       , '' 
    953    sn_fmf      = 'dyna_grid_T'           ,       120         , 'iowaflup'  ,  .true.   , .true. , 'yearly'  , ''               , ''       , '' 
    954    sn_ice      = 'dyna_grid_T'           ,       120         , 'soicecov'  ,  .true.   , .true. , 'yearly'  , ''               , ''       , '' 
    955    sn_qsr      = 'dyna_grid_T'           ,       120         , 'soshfldo'  ,  .true.   , .true. , 'yearly'  , ''               , ''       , '' 
    956    sn_wnd      = 'dyna_grid_T'           ,       120         , 'sowindsp'  ,  .true.   , .true. , 'yearly'  , ''               , ''       , '' 
    957    sn_uwd      = 'dyna_grid_U'           ,       120         , 'uocetr_eff',  .true.   , .true. , 'yearly'  , ''               , ''       , '' 
    958    sn_vwd      = 'dyna_grid_V'           ,       120         , 'vocetr_eff',  .true.   , .true. , 'yearly'  , ''               , ''       , '' 
    959    sn_wwd      = 'dyna_grid_W'           ,       120         , 'wocetr_eff',  .true.   , .true. , 'yearly'  , ''               , ''       , '' 
    960    sn_avt      = 'dyna_grid_W'           ,       120         , 'voddmavs'  ,  .true.   , .true. , 'yearly'  , ''               , ''       , '' 
    961    sn_ubl      = 'dyna_grid_U'           ,       120         , 'sobblcox'  ,  .true.   , .true. , 'yearly'  , ''               , ''       , '' 
    962    sn_vbl      = 'dyna_grid_V'           ,       120         , 'sobblcoy'  ,  .true.   , .true. , 'yearly'  , ''               , ''       , '' 
     964   sn_tem      = 'dyna_grid_T'           ,       120.        , 'votemper'  ,  .true.   , .true. , 'yearly'  , ''               , ''       , '' 
     965   sn_sal      = 'dyna_grid_T'           ,       120.        , 'vosaline'  ,  .true.   , .true. , 'yearly'  , ''               , ''       , '' 
     966   sn_mld      = 'dyna_grid_T'           ,       120.        , 'somixhgt'  ,  .true.   , .true. , 'yearly'  , ''               , ''       , '' 
     967   sn_emp      = 'dyna_grid_T'           ,       120.        , 'sowaflup'  ,  .true.   , .true. , 'yearly'  , ''               , ''       , '' 
     968   sn_fmf      = 'dyna_grid_T'           ,       120.        , 'iowaflup'  ,  .true.   , .true. , 'yearly'  , ''               , ''       , '' 
     969   sn_ice      = 'dyna_grid_T'           ,       120.        , 'soicecov'  ,  .true.   , .true. , 'yearly'  , ''               , ''       , '' 
     970   sn_qsr      = 'dyna_grid_T'           ,       120.        , 'soshfldo'  ,  .true.   , .true. , 'yearly'  , ''               , ''       , '' 
     971   sn_wnd      = 'dyna_grid_T'           ,       120.        , 'sowindsp'  ,  .true.   , .true. , 'yearly'  , ''               , ''       , '' 
     972   sn_uwd      = 'dyna_grid_U'           ,       120.        , 'uocetr_eff',  .true.   , .true. , 'yearly'  , ''               , ''       , '' 
     973   sn_vwd      = 'dyna_grid_V'           ,       120.        , 'vocetr_eff',  .true.   , .true. , 'yearly'  , ''               , ''       , '' 
     974   sn_wwd      = 'dyna_grid_W'           ,       120.        , 'wocetr_eff',  .true.   , .true. , 'yearly'  , ''               , ''       , '' 
     975   sn_avt      = 'dyna_grid_W'           ,       120.        , 'voddmavs'  ,  .true.   , .true. , 'yearly'  , ''               , ''       , '' 
     976   sn_ubl      = 'dyna_grid_U'           ,       120.        , 'sobblcox'  ,  .true.   , .true. , 'yearly'  , ''               , ''       , '' 
     977   sn_vbl      = 'dyna_grid_V'           ,       120.        , 'sobblcoy'  ,  .true.   , .true. , 'yearly'  , ''               , ''       , '' 
    963978/ 
    964979 
    … …  
    11051120!!   namdiu       Cool skin and warm layer models                       (default: OFF) 
    11061121!!   namdiu       Cool skin and warm layer models                       (default: OFF) 
    1107 !!   namflo       float parameters                                      ("key_float") 
    1108 !!   nam_diaharm  Harmonic analysis of tidal constituents               ("key_diaharm") 
    1109 !!   namdct       transports through some sections                      ("key_diadct") 
     1122!!   namflo       float parameters                                      (default: OFF) 
     1123!!   nam_diaharm  Harmonic analysis of tidal constituents               (default: OFF) 
     1124!!   nam_diadct   transports through some sections                      (default: OFF) 
    11101125!!   nam_diatmb   Top Middle Bottom Output                              (default: OFF) 
    11111126!!   nam_dia25h   25h Mean Output                                       (default: OFF) 
    … …  
    11421157&namhsb        !  Heat and salt budgets                                 (default: OFF) 
    11431158!----------------------------------------------------------------------- 
    1144    ln_diahsb   = .false.   !  check the heat and salt budgets (T) or not (F) 
     1159   ln_diahsb   = .false.   !  output the heat and salt budgets (T) or not (F) 
    11451160/ 
    11461161!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    11511166/ 
    11521167!----------------------------------------------------------------------- 
    1153 &namflo        !   float parameters                                     ("key_float") 
    1154 !----------------------------------------------------------------------- 
    1155    jpnfl       = 1         !  total number of floats during the run 
    1156    jpnnewflo   = 0         !  number of floats for the restart 
    1157    ln_rstflo   = .false.   !  float restart (T) or not (F) 
    1158    nn_writefl  =      75   !  frequency of writing in float output file 
    1159    nn_stockfl  =    5475   !  frequency of creation of the float restart file 
    1160    ln_argo     = .false.   !  Argo type floats (stay at the surface each 10 days) 
    1161    ln_flork4   = .false.   !  trajectories computed with a 4th order Runge-Kutta (T) 
    1162    !                       !  or computed with Blanke' scheme (F) 
    1163    ln_ariane   = .true.    !  Input with Ariane tool convention(T) 
    1164    ln_flo_ascii = .true.    !  Output with Ariane tool netcdf convention(F) or ascii file (T) 
    1165 / 
    1166 !----------------------------------------------------------------------- 
    1167 &nam_diaharm   !   Harmonic analysis of tidal constituents              ("key_diaharm") 
    1168 !----------------------------------------------------------------------- 
    1169     nit000_han = 1         ! First time step used for harmonic analysis 
    1170     nitend_han = 75        ! Last time step used for harmonic analysis 
    1171     nstep_han  = 15        ! Time step frequency for harmonic analysis 
    1172     tname(1)   = 'M2'      ! Name of tidal constituents 
    1173     tname(2)   = 'K1' 
    1174 / 
    1175 !----------------------------------------------------------------------- 
    1176 &namdct        ! transports through some sections                       ("key_diadct") 
    1177 !----------------------------------------------------------------------- 
    1178     nn_dct     = 15        !  time step frequency for transports computing 
    1179     nn_dctwri  = 15        !  time step frequency for transports writing 
    1180     nn_secdebug = 112       !      0 : no section to debug 
    1181     !                      !     -1 : debug all section 
    1182     !                      !  0 < n : debug section number n 
     1168&namflo        !   float parameters                                     (default: OFF) 
     1169!----------------------------------------------------------------------- 
     1170   ln_floats   = .false.      ! activate floats or not 
     1171      jpnfl       = 1         !    total number of floats during the run 
     1172      jpnnewflo   = 0         !    number of floats for the restart 
     1173      ln_rstflo   = .false.   !    float restart (T) or not (F) 
     1174      nn_writefl  =      75   !    frequency of writing in float output file 
     1175      nn_stockfl  =    5475   !    frequency of creation of the float restart file 
     1176      ln_argo     = .false.   !    Argo type floats (stay at the surface each 10 days) 
     1177      ln_flork4   = .false.   !    trajectories computed with a 4th order Runge-Kutta (T) 
     1178      !                       !    or computed with Blanke' scheme (F) 
     1179      ln_ariane   = .true.    !    Input with Ariane tool convention(T) 
     1180      ln_flo_ascii= .true.    !    Output with Ariane tool netcdf convention(F) or ascii file (T) 
     1181/ 
     1182!----------------------------------------------------------------------- 
     1183&nam_diaharm   !   Harmonic analysis of tidal constituents              (default: OFF) 
     1184!----------------------------------------------------------------------- 
     1185    ln_diaharm = .false.   ! Choose tidal harmonic output or not 
     1186       nit000_han = 1      !    First time step used for harmonic analysis 
     1187       nitend_han = 75     !    Last time step used for harmonic analysis 
     1188       nstep_han  = 15     !    Time step frequency for harmonic analysis 
     1189       tname(1)   = 'M2'   !    Name of tidal constituents 
     1190       tname(2)   = 'K1'   !              --- 
     1191/ 
     1192!----------------------------------------------------------------------- 
     1193&nam_diadct    !   transports through some sections                     (default: OFF) 
     1194!----------------------------------------------------------------------- 
     1195    ln_diadct  = .false.   ! Calculate transport thru sections or not 
     1196       nn_dct     = 15     !  time step frequency for transports computing 
     1197       nn_dctwri  = 15     !  time step frequency for transports writing 
     1198       nn_secdebug = 112   !      0 : no section to debug 
     1199       !                   !     -1 : debug all section 
     1200       !                   !  0 < n : debug section number n 
    11831201/ 
    11841202!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    12311249   ln_s_at_t   = .false.             ! Logical switch for computing model S at T obs if not there 
    12321250   ln_sstnight = .false.             ! Logical switch for calculating night-time average for SST obs 
     1251   ln_bound_reject  = .false.        ! Logical to remove obs near boundaries in LAMs. 
    12331252   ln_sla_fp_indegs = .true.         ! Logical for SLA: T=> averaging footprint is in degrees, F=> in metres 
    12341253   ln_sst_fp_indegs = .true.         ! Logical for SST: T=> averaging footprint is in degrees, F=> in metres 
    … …  
    12971316&nammpp        !   Massively Parallel Processing                        ("key_mpp_mpi") 
    12981317!----------------------------------------------------------------------- 
    1299    cn_mpi_send =  'I'      !  mpi send/recieve type   ='S', 'B', or 'I' for standard send, 
    1300    !                       !  buffer blocking send or immediate non-blocking sends, resp. 
    1301    nn_buffer   =   0       !  size in bytes of exported buffer ('B' case), 0 no exportation 
     1318   ln_listonly =  .false.  !  do nothing else than listing the best domain decompositions (with land domains suppression) 
     1319   !                       !  if T: the largest number of cores tested is defined by max(mppsize, jpni*jpnj) 
    13021320   ln_nnogather =  .true.  !  activate code to avoid mpi_allgather use at the northfold 
    1303    jpni        =   0       !  jpni   number of processors following i (set automatically if < 1) 
    1304    jpnj        =   0       !  jpnj   number of processors following j (set automatically if < 1) 
     1321   jpni        =   0       !  number of processors following i (set automatically if < 1), see also ln_listonly = T 
     1322   jpnj        =   0       !  number of processors following j (set automatically if < 1), see also ln_listonly = T 
    13051323/ 
    13061324!----------------------------------------------------------------------- 

  • NEMO/branches/2019/dev_r10742_ENHANCE-12_SimonM-Tides/cfgs/SHARED/namelist_top_ref

    r10375 r12065  
    5959!                !  file name        ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
    6060!                !                   !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
    61    sn_trcdta(1)  = 'data_TRC_nomask' ,        -12        ,  'TRC'    ,    .false.   , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , '' 
     61   sn_trcdta(1)  = 'data_TRC_nomask' ,        -12.       ,  'TRC'    ,    .false.   , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , '' 
    6262   ! 
    6363   cn_dir        =  './'     !  root directory for the location of the data files 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.