New URL for NEMO forge!   http://forge.nemo-ocean.eu

Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
This present forge is now archived and remained online for history.
Changeset 12191 for NEMO/branches/2019/dev_r12072_MERGE_OPTION2_2019/src/NST/agrif_oce_sponge.F90 – NEMO

Ignore:
Timestamp:
2019-12-11T16:56:06+01:00 (4 years ago)
Author:
jchanut
Message:

Add dev_AGRIF-01-05_merged branch, e.g. 2019 AGRIF dev

File:
1 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • NEMO/branches/2019/dev_r12072_MERGE_OPTION2_2019/src/NST/agrif_oce_sponge.F90

    r10425 r12191  
    2222   USE agrif_oce 
    2323   USE lbclnk          ! ocean lateral boundary conditions (or mpp link) 
     24   USE iom 
     25   USE vremap 
    2426 
    2527   IMPLICIT NONE 
     
    5860#endif 
    5961      ! 
     62      CALL iom_put( 'agrif_spu', fspu(:,:)) 
     63      CALL iom_put( 'agrif_spv', fspv(:,:)) 
     64      ! 
    6065   END SUBROUTINE Agrif_Sponge_Tra 
    6166 
     
    8590#endif 
    8691      ! 
     92      CALL iom_put( 'agrif_spt', fspt(:,:)) 
     93      CALL iom_put( 'agrif_spf', fspf(:,:)) 
     94      ! 
    8795   END SUBROUTINE Agrif_Sponge_dyn 
    8896 
     
    93101      !!---------------------------------------------------------------------- 
    94102      INTEGER  ::   ji, jj, ind1, ind2 
    95       INTEGER  ::   ispongearea 
    96       REAL(wp) ::   z1_spongearea 
     103      INTEGER  ::   ispongearea, jspongearea 
     104      REAL(wp) ::   z1_ispongearea, z1_jspongearea 
    97105      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj) :: ztabramp 
    98       !!---------------------------------------------------------------------- 
    99       ! 
     106      REAL(wp), DIMENSION(jpjmax)  :: zmskwest,  zmskeast 
     107      REAL(wp), DIMENSION(jpimax)  :: zmsknorth, zmsksouth 
     108      !!---------------------------------------------------------------------- 
     109      ! 
     110      ! Sponge 1d example with: 
     111      !      iraf = 3 ; nbghost = 3 ; nn_sponge_len = 2 
     112      !                         
     113      !coarse :     U     T     U     T     U     T     U 
     114      !|            |           |           |           | 
     115      !fine :     t u t u t u t u t u t u t u t u t u t u t 
     116      !sponge val:0   0   0   1  5/6 4/6 3/6 2/6 1/6  0   0 
     117      !           |   ghost     | <-- sponge area  -- > | 
     118      !           |   points    |                       | 
     119      !                         |--> dynamical interface 
     120 
    100121#if defined SPONGE || defined SPONGE_TOP 
    101122      IF (( .NOT. spongedoneT ).OR.( .NOT. spongedoneU )) THEN 
     123         ! 
     124         ! Retrieve masks at open boundaries: 
     125 
     126         ! --- West --- ! 
     127         ztabramp(:,:) = 0._wp 
     128         ind1 = 1+nbghostcells 
     129         DO ji = mi0(ind1), mi1(ind1)                 
     130            ztabramp(ji,:) = ssumask(ji,:) 
     131         END DO 
     132         ! 
     133         zmskwest(:) = 0._wp 
     134         zmskwest(1:jpj) = MAXVAL(ztabramp(:,:), dim=1) 
     135 
     136         ! --- East --- ! 
     137         ztabramp(:,:) = 0._wp 
     138         ind1 = jpiglo - nbghostcells - 1 
     139         DO ji = mi0(ind1), mi1(ind1)                  
     140            ztabramp(ji,:) = ssumask(ji,:) 
     141         END DO 
     142         ! 
     143         zmskeast(:) = 0._wp 
     144         zmskeast(1:jpj) = MAXVAL(ztabramp(:,:), dim=1) 
     145 
     146         ! --- South --- ! 
     147         ztabramp(:,:) = 0._wp 
     148         ind1 = 1+nbghostcells 
     149         DO jj = mj0(ind1), mj1(ind1)                  
     150            ztabramp(:,jj) = ssvmask(:,jj) 
     151         END DO 
     152         ! 
     153         zmsksouth(:) = 0._wp 
     154         zmsksouth(1:jpi) = MAXVAL(ztabramp(:,:), dim=2) 
     155 
     156         ! --- North --- ! 
     157         ztabramp(:,:) = 0._wp 
     158         ind1 = jpjglo - nbghostcells - 1 
     159         DO jj = mj0(ind1), mj1(ind1)                  
     160            ztabramp(:,jj) = ssvmask(:,jj) 
     161         END DO 
     162         ! 
     163         zmsknorth(:) = 0._wp 
     164         zmsknorth(1:jpi) = MAXVAL(ztabramp(:,:), dim=2) 
     165         ! JC: SPONGE MASKING TO BE SORTED OUT: 
     166         zmskwest(:)  = 1._wp 
     167         zmskeast(:)  = 1._wp 
     168         zmsknorth(:) = 1._wp 
     169         zmsksouth(:) = 1._wp 
     170#if defined key_mpp_mpi 
     171!         CALL mpp_max( 'AGRIF_sponge', zmskwest(:) , jpjmax ) 
     172!         CALL mpp_max( 'AGRIF_Sponge', zmskeast(:) , jpjmax ) 
     173!         CALL mpp_max( 'AGRIF_Sponge', zmsksouth(:), jpimax ) 
     174!         CALL mpp_max( 'AGRIF_Sponge', zmsknorth(:), jpimax ) 
     175#endif 
     176 
    102177         ! Define ramp from boundaries towards domain interior at T-points 
    103178         ! Store it in ztabramp 
    104179 
    105          ispongearea  = 1 + nn_sponge_len * Agrif_irhox() 
    106          z1_spongearea = 1._wp / REAL( ispongearea ) 
     180         ispongearea  = nn_sponge_len * Agrif_irhox() 
     181         z1_ispongearea = 1._wp / REAL( ispongearea ) 
     182         jspongearea  = nn_sponge_len * Agrif_irhoy() 
     183         z1_jspongearea = 1._wp / REAL( jspongearea ) 
    107184          
    108185         ztabramp(:,:) = 0._wp 
    109186 
     187         ! Trick to remove sponge in 2DV domains: 
     188         IF ( nbcellsx <= 3 ) ispongearea = -1 
     189         IF ( nbcellsy <= 3 ) jspongearea = -1 
     190 
    110191         ! --- West --- ! 
    111          IF( (nbondi == -1) .OR. (nbondi == 2) ) THEN 
    112             ind1 = 1+nbghostcells 
    113             ind2 = 1+nbghostcells + ispongearea  
     192         ind1 = 1+nbghostcells 
     193         ind2 = 1+nbghostcells + ispongearea  
     194         DO ji = mi0(ind1), mi1(ind2)    
     195            DO jj = 1, jpj                
     196               ztabramp(ji,jj) = REAL( ind2 - mig(ji) ) * z1_ispongearea * zmskwest(jj) 
     197            END DO 
     198         END DO 
     199 
     200         ! ghost cells: 
     201         ind1 = 1 
     202         ind2 = nbghostcells + 1 
     203         DO ji = mi0(ind1), mi1(ind2)    
     204            DO jj = 1, jpj                
     205               ztabramp(ji,jj) = zmskwest(jj) 
     206            END DO 
     207         END DO 
     208 
     209         ! --- East --- ! 
     210         ind1 = jpiglo - nbghostcells - ispongearea 
     211         ind2 = jpiglo - nbghostcells 
     212         DO ji = mi0(ind1), mi1(ind2) 
    114213            DO jj = 1, jpj 
    115                DO ji = ind1, ind2                 
    116                   ztabramp(ji,jj) = REAL( ind2 - ji ) * z1_spongearea * umask(ind1,jj,1) 
    117                END DO 
     214               ztabramp(ji,jj) = MAX( ztabramp(ji,jj), REAL( mig(ji) - ind1 ) * z1_ispongearea) * zmskeast(jj) 
    118215            ENDDO 
    119          ENDIF 
    120  
    121          ! --- East --- ! 
    122          IF( (nbondi == 1) .OR. (nbondi == 2) ) THEN 
    123             ind1 = nlci - nbghostcells - ispongearea 
    124             ind2 = nlci - nbghostcells 
     216         END DO 
     217 
     218         ! ghost cells: 
     219         ind1 = jpiglo - nbghostcells 
     220         ind2 = jpiglo 
     221         DO ji = mi0(ind1), mi1(ind2) 
    125222            DO jj = 1, jpj 
    126                DO ji = ind1, ind2 
    127                   ztabramp(ji,jj) = MAX( ztabramp(ji,jj), REAL( ji - ind1 ) * z1_spongearea * umask(ind2-1,jj,1) ) 
    128                ENDDO 
     223               ztabramp(ji,jj) = zmskeast(jj) 
    129224            ENDDO 
    130          ENDIF 
     225         END DO 
    131226 
    132227         ! --- South --- ! 
    133          IF( (nbondj == -1) .OR. (nbondj == 2) ) THEN 
    134             ind1 = 1+nbghostcells 
    135             ind2 = 1+nbghostcells + ispongearea 
    136             DO jj = ind1, ind2  
    137                DO ji = 1, jpi 
    138                   ztabramp(ji,jj) = MAX( ztabramp(ji,jj), REAL( ind2 - jj ) * z1_spongearea * vmask(ji,ind1,1) ) 
    139                END DO 
    140             ENDDO 
    141          ENDIF 
     228         ind1 = 1+nbghostcells 
     229         ind2 = 1+nbghostcells + jspongearea 
     230         DO jj = mj0(ind1), mj1(ind2)  
     231            DO ji = 1, jpi 
     232               ztabramp(ji,jj) = MAX( ztabramp(ji,jj), REAL( ind2 - mjg(jj) ) * z1_jspongearea) * zmsksouth(ji) 
     233            END DO 
     234         END DO 
     235 
     236         ! ghost cells: 
     237         ind1 = 1 
     238         ind2 = nbghostcells + 1 
     239         DO jj = mj0(ind1), mj1(ind2)  
     240            DO ji = 1, jpi 
     241               ztabramp(ji,jj) = zmsksouth(ji) 
     242            END DO 
     243         END DO 
    142244 
    143245         ! --- North --- ! 
    144          IF( (nbondj == 1) .OR. (nbondj == 2) ) THEN 
    145             ind1 = nlcj - nbghostcells - ispongearea 
    146             ind2 = nlcj - nbghostcells 
    147             DO jj = ind1, ind2 
    148                DO ji = 1, jpi 
    149                   ztabramp(ji,jj) = MAX( ztabramp(ji,jj), REAL( jj - ind1 ) * z1_spongearea * vmask(ji,ind2-1,1) ) 
    150                END DO 
    151             ENDDO 
    152          ENDIF 
     246         ind1 = jpjglo - nbghostcells - jspongearea 
     247         ind2 = jpjglo - nbghostcells 
     248         DO jj = mj0(ind1), mj1(ind2) 
     249            DO ji = 1, jpi 
     250               ztabramp(ji,jj) = MAX( ztabramp(ji,jj), REAL( mjg(jj) - ind1 ) * z1_jspongearea) * zmsknorth(ji) 
     251            END DO 
     252         END DO 
     253 
     254         ! ghost cells: 
     255         ind1 = jpjglo - nbghostcells 
     256         ind2 = jpjglo 
     257         DO jj = mj0(ind1), mj1(ind2) 
     258            DO ji = 1, jpi 
     259               ztabramp(ji,jj) = zmsknorth(ji) 
     260            END DO 
     261         END DO 
    153262 
    154263      ENDIF 
     
    156265      ! Tracers 
    157266      IF( .NOT. spongedoneT ) THEN 
    158          fsaht_spu(:,:) = 0._wp 
    159          fsaht_spv(:,:) = 0._wp 
     267         fspu(:,:) = 0._wp 
     268         fspv(:,:) = 0._wp 
    160269         DO jj = 2, jpjm1 
    161270            DO ji = 2, jpim1   ! vector opt. 
    162                fsaht_spu(ji,jj) = 0.5_wp * visc_tra * ( ztabramp(ji,jj) + ztabramp(ji+1,jj  ) ) 
    163                fsaht_spv(ji,jj) = 0.5_wp * visc_tra * ( ztabramp(ji,jj) + ztabramp(ji  ,jj+1) ) 
    164             END DO 
    165          END DO 
    166          CALL lbc_lnk( 'agrif_oce_sponge', fsaht_spu, 'U', 1. )   ! Lateral boundary conditions 
    167          CALL lbc_lnk( 'agrif_oce_sponge', fsaht_spv, 'V', 1. ) 
    168           
     271               fspu(ji,jj) = 0.5_wp * ( ztabramp(ji,jj) + ztabramp(ji+1,jj  ) ) * ssumask(ji,jj) 
     272               fspv(ji,jj) = 0.5_wp * ( ztabramp(ji,jj) + ztabramp(ji  ,jj+1) ) * ssvmask(ji,jj) 
     273            END DO 
     274         END DO 
     275         CALL lbc_lnk( 'agrif_Sponge', fspu, 'U', 1. )   ! Lateral boundary conditions 
     276         CALL lbc_lnk( 'agrif_Sponge', fspv, 'V', 1. ) 
     277 
    169278         spongedoneT = .TRUE. 
    170279      ENDIF 
     
    172281      ! Dynamics 
    173282      IF( .NOT. spongedoneU ) THEN 
    174          fsahm_spt(:,:) = 0._wp 
    175          fsahm_spf(:,:) = 0._wp 
     283         fspt(:,:) = 0._wp 
     284         fspf(:,:) = 0._wp 
    176285         DO jj = 2, jpjm1 
    177286            DO ji = 2, jpim1   ! vector opt. 
    178                fsahm_spt(ji,jj) = visc_dyn * ztabramp(ji,jj) 
    179                fsahm_spf(ji,jj) = 0.25_wp * visc_dyn * ( ztabramp(ji  ,jj  ) + ztabramp(ji  ,jj+1) & 
    180                                                      &  +ztabramp(ji+1,jj+1) + ztabramp(ji+1,jj  ) ) 
    181             END DO 
    182          END DO 
    183          CALL lbc_lnk( 'agrif_oce_sponge', fsahm_spt, 'T', 1. )   ! Lateral boundary conditions 
    184          CALL lbc_lnk( 'agrif_oce_sponge', fsahm_spf, 'F', 1. ) 
     287               fspt(ji,jj) = ztabramp(ji,jj) * ssmask(ji,jj) 
     288               fspf(ji,jj) = 0.25_wp * ( ztabramp(ji  ,jj  ) + ztabramp(ji  ,jj+1)   & 
     289                                     &  +ztabramp(ji+1,jj+1) + ztabramp(ji+1,jj  ) ) & 
     290                                     &  * ssvmask(ji,jj) * ssvmask(ji,jj+1) 
     291            END DO 
     292         END DO 
     293         CALL lbc_lnk( 'agrif_Sponge', fspt, 'T', 1. )   ! Lateral boundary conditions 
     294         CALL lbc_lnk( 'agrif_Sponge', fspf, 'F', 1. ) 
    185295          
    186296         spongedoneU = .TRUE. 
    187297      ENDIF 
     298 
     299#if defined key_vertical 
     300      ! Remove vertical interpolation where not needed: 
     301      DO jj = 2, jpjm1 
     302         DO ji = 2, jpim1 
     303            IF ((fspu(ji-1,jj)==0._wp).AND.(fspu(ji,jj)==0._wp).AND. & 
     304            &   (fspv(ji,jj-1)==0._wp).AND.(fspv(ji,jj)==0._wp)) mbkt_parent(ji,jj) = 0 
     305! 
     306            IF ((fspt(ji+1,jj)==0._wp).AND.(fspt(ji,jj)==0._wp).AND. & 
     307            &   (fspf(ji,jj-1)==0._wp).AND.(fspf(ji,jj)==0._wp)) mbku_parent(ji,jj) = 0 
     308! 
     309            IF ((fspt(ji,jj+1)==0._wp).AND.(fspt(ji,jj)==0._wp).AND. & 
     310            &   (fspf(ji-1,jj)==0._wp).AND.(fspf(ji,jj)==0._wp)) mbkv_parent(ji,jj) = 0 
     311! 
     312            IF ( ssmask(ji,jj) == 0._wp) mbkt_parent(ji,jj) = 0 
     313            IF (ssumask(ji,jj) == 0._wp) mbku_parent(ji,jj) = 0 
     314            IF (ssvmask(ji,jj) == 0._wp) mbkv_parent(ji,jj) = 0 
     315         END DO 
     316      END DO 
     317      ! 
     318      ztabramp(:,:) = REAL( mbkt_parent(:,:), wp )   ;   CALL lbc_lnk( 'Agrif_Sponge', ztabramp, 'T', 1. ) 
     319      mbkt_parent(:,:) = NINT( ztabramp(:,:) ) 
     320      ztabramp(:,:) = REAL( mbku_parent(:,:), wp )   ;   CALL lbc_lnk( 'Agrif_Sponge', ztabramp, 'U', 1. ) 
     321      mbku_parent(:,:) = NINT( ztabramp(:,:) ) 
     322      ztabramp(:,:) = REAL( mbkv_parent(:,:), wp )   ;   CALL lbc_lnk( 'Agrif_Sponge', ztabramp, 'V', 1. ) 
     323      mbkv_parent(:,:) = NINT( ztabramp(:,:) ) 
     324#endif 
    188325      ! 
    189326#endif 
     
    201338      INTEGER  ::   ji, jj, jk, jn   ! dummy loop indices 
    202339      INTEGER  ::   iku, ikv 
    203       REAL(wp) :: ztsa, zabe1, zabe2, zbtr 
     340      REAL(wp) :: ztsa, zabe1, zabe2, zbtr, zhtot, ztrelax 
    204341      REAL(wp), DIMENSION(i1:i2,j1:j2,jpk) :: ztu, ztv 
    205342      REAL(wp), DIMENSION(i1:i2,j1:j2,jpk,n1:n2) ::tsbdiff 
     
    210347      REAL(wp), DIMENSION(1:jpk) :: h_out 
    211348      INTEGER :: N_in, N_out 
    212       REAL(wp) :: h_diff 
    213349      !!---------------------------------------------------------------------- 
    214350      ! 
     
    225361 
    226362# if defined key_vertical 
    227          DO jk=k1,k2 
    228             DO jj=j1,j2 
    229                DO ji=i1,i2 
    230                   tabres(ji,jj,jk,jpts+1) = tmask(ji,jj,jk) * e3t_n(ji,jj,jk)  
    231                END DO 
    232             END DO 
    233          END DO 
     363        ! Interpolate thicknesses 
     364        ! Warning: these are masked, hence extrapolated prior interpolation. 
     365        DO jk=k1,k2 
     366           DO jj=j1,j2 
     367              DO ji=i1,i2 
     368                  tabres(ji,jj,jk,jpts+1) = tmask(ji,jj,jk) * e3t_b(ji,jj,jk) 
     369              END DO 
     370           END DO 
     371        END DO 
     372 
     373        ! Extrapolate thicknesses in partial bottom cells: 
     374        ! Set them to Agrif_SpecialValue (0.). Correct bottom thicknesses are retrieved later on 
     375        IF (ln_zps) THEN 
     376           DO jj=j1,j2 
     377              DO ji=i1,i2 
     378                  jk = mbkt(ji,jj) 
     379                  tabres(ji,jj,jk,jpts+1) = 0._wp 
     380              END DO 
     381           END DO            
     382        END IF 
     383      
     384        ! Save ssh at last level: 
     385        IF (.NOT.ln_linssh) THEN 
     386           tabres(i1:i2,j1:j2,k2,jpts+1) = sshb(i1:i2,j1:j2)*tmask(i1:i2,j1:j2,1)  
     387        ELSE 
     388           tabres(i1:i2,j1:j2,k2,jpts+1) = 0._wp 
     389        END IF       
    234390# endif 
    235391 
     
    237393         ! 
    238394# if defined key_vertical 
    239          tabres_child(:,:,:,:) = 0. 
     395 
     396         IF (ln_linssh) tabres(i1:i2,j1:j2,k2,n2) = 0._wp 
     397 
    240398         DO jj=j1,j2 
    241399            DO ji=i1,i2 
    242                N_in = 0 
    243                DO jk=k1,k2 !k2 = jpk of parent grid 
    244                   IF (tabres(ji,jj,jk,n2) == 0) EXIT 
    245                   N_in = N_in + 1 
     400               tabres_child(ji,jj,:,:) = 0._wp  
     401               N_in = mbkt_parent(ji,jj) 
     402               zhtot = 0._wp 
     403               DO jk=1,N_in !k2 = jpk of parent grid 
     404                  IF (jk==N_in) THEN 
     405                     h_in(jk) = ht0_parent(ji,jj) + tabres(ji,jj,k2,n2) - zhtot 
     406                  ELSE 
     407                     h_in(jk) = tabres(ji,jj,jk,n2) 
     408                  ENDIF 
     409                  zhtot = zhtot + h_in(jk) 
    246410                  tabin(jk,:) = tabres(ji,jj,jk,n1:n2-1) 
    247                   h_in(N_in) = tabres(ji,jj,jk,n2) 
    248411               END DO 
    249412               N_out = 0 
     
    251414                  IF (tmask(ji,jj,jk) == 0) EXIT  
    252415                  N_out = N_out + 1 
    253                   h_out(jk) = e3t_n(ji,jj,jk) !Child grid scale factors. Could multiply by e1e2t here instead of division above 
     416                  h_out(jk) = e3t_b(ji,jj,jk) !Child grid scale factors. Could multiply by e1e2t here instead of division above 
    254417               ENDDO 
    255                IF (N_in > 0) THEN 
    256                   h_diff = sum(h_out(1:N_out))-sum(h_in(1:N_in)) 
    257                   tabres(ji,jj,k2,:) = tabres(ji,jj,k2-1,:) !what is this line for????? 
    258                   DO jn=1,jpts 
    259                      call reconstructandremap(tabin(1:N_in,jn),h_in,tabres_child(ji,jj,1:N_out,jn),h_out,N_in,N_out) 
    260                   ENDDO 
     418 
     419               ! Account for small differences in free-surface 
     420               IF ( sum(h_out(1:N_out)) > sum(h_in(1:N_in) )) THEN 
     421                  h_out(1) = h_out(1) - ( sum(h_out(1:N_out))-sum(h_in(1:N_in)) ) 
     422               ELSE 
     423                  h_in(1)   = h_in(1)   - (sum(h_in(1:N_in))-sum(h_out(1:N_out)) ) 
     424               ENDIF 
     425               IF (N_in*N_out > 0) THEN 
     426                  CALL reconstructandremap(tabin(1:N_in,1:jpts),h_in(1:N_in),tabres_child(ji,jj,1:N_out,1:jpts),h_out(1:N_out),N_in,N_out,jpts) 
    261427               ENDIF 
    262428            ENDDO 
     
    268434               DO jk=1,jpkm1 
    269435# if defined key_vertical 
    270                   tsbdiff(ji,jj,jk,1:jpts) = tsb(ji,jj,jk,1:jpts) - tabres_child(ji,jj,jk,1:jpts) 
     436                  tsbdiff(ji,jj,jk,1:jpts) = (tsb(ji,jj,jk,1:jpts) - tabres_child(ji,jj,jk,1:jpts)) * tmask(ji,jj,jk) 
    271437# else 
    272                   tsbdiff(ji,jj,jk,1:jpts) = tsb(ji,jj,jk,1:jpts) - tabres(ji,jj,jk,1:jpts) 
     438                  tsbdiff(ji,jj,jk,1:jpts) = (tsb(ji,jj,jk,1:jpts) - tabres(ji,jj,jk,1:jpts))*tmask(ji,jj,jk) 
    273439# endif 
    274440               ENDDO 
    275441            ENDDO 
    276442         ENDDO 
     443 
     444         !* set relaxation time scale 
     445         IF( neuler == 0 .AND. lk_agrif_fstep ) THEN   ;   ztrelax =   rn_trelax_tra  / (        rdt ) 
     446         ELSE                                          ;   ztrelax =   rn_trelax_tra  / (2._wp * rdt ) 
     447         ENDIF 
    277448 
    278449         DO jn = 1, jpts             
     
    281452               DO jj = j1,j2 
    282453                  DO ji = i1,i2-1 
    283                      zabe1 = fsaht_spu(ji,jj) * umask(ji,jj,jk) * e2_e1u(ji,jj) * e3u_n(ji,jj,jk) 
     454                     zabe1 = rn_sponge_tra * fspu(ji,jj) * umask(ji,jj,jk) * e2_e1u(ji,jj) * e3u_n(ji,jj,jk) 
    284455                     ztu(ji,jj,jk) = zabe1 * ( tsbdiff(ji+1,jj  ,jk,jn) - tsbdiff(ji,jj,jk,jn) )  
    285456                  END DO 
     
    288459               DO ji = i1,i2 
    289460                  DO jj = j1,j2-1 
    290                      zabe2 = fsaht_spv(ji,jj) * vmask(ji,jj,jk) * e1_e2v(ji,jj) * e3v_n(ji,jj,jk) 
     461                     zabe2 = rn_sponge_tra * fspv(ji,jj) * vmask(ji,jj,jk) * e1_e2v(ji,jj) * e3v_n(ji,jj,jk) 
    291462                     ztv(ji,jj,jk) = zabe2 * ( tsbdiff(ji  ,jj+1,jk,jn) - tsbdiff(ji,jj,jk,jn) ) 
    292463                  END DO 
     
    312483                        zbtr = r1_e1e2t(ji,jj) / e3t_n(ji,jj,jk) 
    313484                        ! horizontal diffusive trends 
    314                         ztsa = zbtr * (  ztu(ji,jj,jk) - ztu(ji-1,jj,jk) + ztv(ji,jj,jk) - ztv(ji,jj-1,jk)  ) 
     485                        ztsa = zbtr * (  ztu(ji,jj,jk) - ztu(ji-1,jj,jk) + ztv(ji,jj,jk) - ztv(ji,jj-1,jk)  ) & 
     486                             &  - ztrelax * fspt(ji,jj) * tsbdiff(ji,jj,jk,jn)  
    315487                        ! add it to the general tracer trends 
    316488                        tsa(ji,jj,jk,jn) = tsa(ji,jj,jk,jn) + ztsa 
     
    339511 
    340512      ! sponge parameters  
    341       REAL(wp) :: ze2u, ze1v, zua, zva, zbtr, h_diff 
     513      REAL(wp) :: ze2u, ze1v, zua, zva, zbtr, zhtot, ztrelax 
    342514      REAL(wp), DIMENSION(i1:i2,j1:j2,1:jpk) :: ubdiff 
    343515      REAL(wp), DIMENSION(i1:i2,j1:j2,1:jpk) :: rotdiff, hdivdiff 
     
    346518      REAL(wp), DIMENSION(k1:k2) :: tabin, h_in 
    347519      REAL(wp), DIMENSION(1:jpk) :: h_out 
    348       INTEGER ::N_in,N_out 
     520      INTEGER ::N_in, N_out 
    349521      !!---------------------------------------------     
    350522      ! 
    351523      IF( before ) THEN 
    352          DO jk=1,jpkm1 
     524         DO jk=k1,k2 
    353525            DO jj=j1,j2 
    354526               DO ji=i1,i2 
    355527                  tabres(ji,jj,jk,m1) = ub(ji,jj,jk) 
    356528# if defined key_vertical 
    357                   tabres(ji,jj,jk,m2) = e3u_n(ji,jj,jk)*umask(ji,jj,jk) 
     529                  tabres(ji,jj,jk,m2) = e3u_b(ji,jj,jk)*umask(ji,jj,jk) 
    358530# endif 
    359531               END DO 
     
    361533         END DO 
    362534 
     535# if defined key_vertical 
     536         ! Extrapolate thicknesses in partial bottom cells: 
     537         ! Set them to Agrif_SpecialValue (0.). Correct bottom thicknesses are retrieved later on 
     538         IF (ln_zps) THEN 
     539            DO jj=j1,j2 
     540               DO ji=i1,i2 
     541                  jk = mbku(ji,jj) 
     542                  tabres(ji,jj,jk,m2) = 0._wp 
     543               END DO 
     544            END DO            
     545         END IF 
     546        ! Save ssh at last level: 
     547        tabres(i1:i2,j1:j2,k2,m2) = 0._wp 
     548        IF (.NOT.ln_linssh) THEN 
     549           ! This vertical sum below should be replaced by the sea-level at U-points (optimization): 
     550           DO jk=1,jpk 
     551              tabres(i1:i2,j1:j2,k2,m2) = tabres(i1:i2,j1:j2,k2,m2) + e3u_b(i1:i2,j1:j2,jk) * umask(i1:i2,j1:j2,jk) 
     552           END DO 
     553           tabres(i1:i2,j1:j2,k2,m2) = tabres(i1:i2,j1:j2,k2,m2) - hu_0(i1:i2,j1:j2) 
     554        END IF  
     555# endif 
     556 
    363557      ELSE 
    364558 
    365559# if defined key_vertical 
    366          tabres_child(:,:,:) = 0._wp 
     560         IF (ln_linssh) tabres(i1:i2,j1:j2,k2,m2) = 0._wp 
     561 
    367562         DO jj=j1,j2 
    368563            DO ji=i1,i2 
    369                N_in = 0 
    370                DO jk=k1,k2 
    371                   IF (tabres(ji,jj,jk,m2) == 0) EXIT 
    372                   N_in = N_in + 1 
     564               tabres_child(ji,jj,:) = 0._wp 
     565               N_in = mbku_parent(ji,jj) 
     566               zhtot = 0._wp 
     567               DO jk=1,N_in 
     568                  IF (jk==N_in) THEN 
     569                     h_in(jk) = hu0_parent(ji,jj) + tabres(ji,jj,k2,m2) - zhtot 
     570                  ELSE 
     571                     h_in(jk) = tabres(ji,jj,jk,m2) 
     572                  ENDIF 
     573                  zhtot = zhtot + h_in(jk) 
    373574                  tabin(jk) = tabres(ji,jj,jk,m1) 
    374                   h_in(N_in) = tabres(ji,jj,jk,m2) 
    375               ENDDO 
    376               ! 
    377               IF (N_in == 0) THEN 
    378                  tabres_child(ji,jj,:) = 0. 
    379                  CYCLE 
    380               ENDIF 
    381           
    382               N_out = 0 
    383               DO jk=1,jpk 
    384                  if (umask(ji,jj,jk) == 0) EXIT 
    385                  N_out = N_out + 1 
    386                  h_out(N_out) = e3u_n(ji,jj,jk) 
    387               ENDDO 
    388           
    389               IF (N_out == 0) THEN 
    390                  tabres_child(ji,jj,:) = 0. 
    391                  CYCLE 
    392               ENDIF 
    393           
    394               IF (N_in * N_out > 0) THEN 
    395                  h_diff = sum(h_out(1:N_out))-sum(h_in(1:N_in)) 
    396                  if (h_diff < -1.e4) then 
    397                     print *,'CHECK YOUR BATHY ...', h_diff, sum(h_out(1:N_out)), sum(h_in(1:N_in)) 
    398                  endif 
    399               ENDIF 
    400               call reconstructandremap(tabin(1:N_in),h_in(1:N_in),tabres_child(ji,jj,1:N_out),h_out(1:N_out),N_in,N_out) 
    401           
     575               ENDDO 
     576               !          
     577               N_out = 0 
     578               DO jk=1,jpk 
     579                  IF (umask(ji,jj,jk) == 0) EXIT 
     580                  N_out = N_out + 1 
     581                  h_out(N_out) = e3u_b(ji,jj,jk) 
     582               ENDDO 
     583 
     584               ! Account for small differences in free-surface 
     585               IF ( sum(h_out(1:N_out)) > sum(h_in(1:N_in) )) THEN 
     586                  h_out(1) = h_out(1) - ( sum(h_out(1:N_out))-sum(h_in(1:N_in)) ) 
     587               ELSE 
     588                  h_in(1)   = h_in(1)   - (sum(h_in(1:N_in))-sum(h_out(1:N_out)) ) 
     589               ENDIF 
     590                   
     591               IF (N_in * N_out > 0) THEN 
     592                  CALL reconstructandremap(tabin(1:N_in),h_in(1:N_in),tabres_child(ji,jj,1:N_out),h_out(1:N_out),N_in,N_out,1) 
     593               ENDIF  
    402594            ENDDO 
    403595         ENDDO 
     
    407599         ubdiff(i1:i2,j1:j2,:) = (ub(i1:i2,j1:j2,:) - tabres(i1:i2,j1:j2,:,1))*umask(i1:i2,j1:j2,:) 
    408600#endif 
     601         !* set relaxation time scale 
     602         IF( neuler == 0 .AND. lk_agrif_fstep ) THEN   ;   ztrelax =   rn_trelax_dyn  / (        rdt ) 
     603         ELSE                                          ;   ztrelax =   rn_trelax_dyn  / (2._wp * rdt ) 
     604         ENDIF 
    409605         ! 
    410606         DO jk = 1, jpkm1                                 ! Horizontal slab 
     
    416612            DO jj = j1,j2 
    417613               DO ji = i1+1,i2   ! vector opt. 
    418                   zbtr = r1_e1e2t(ji,jj) / e3t_n(ji,jj,jk) * fsahm_spt(ji,jj) 
    419                   hdivdiff(ji,jj,jk) = (  e2u(ji  ,jj)*e3u_n(ji  ,jj,jk) * ubdiff(ji  ,jj,jk) & 
    420                                      &   -e2u(ji-1,jj)*e3u_n(ji-1,jj,jk) * ubdiff(ji-1,jj,jk) ) * zbtr 
     614                  zbtr = r1_e1e2t(ji,jj) / e3t_b(ji,jj,jk) * rn_sponge_dyn * fspt(ji,jj) 
     615                  hdivdiff(ji,jj,jk) = (  e2u(ji  ,jj)*e3u_b(ji  ,jj,jk) * ubdiff(ji  ,jj,jk) & 
     616                                     &   -e2u(ji-1,jj)*e3u_b(ji-1,jj,jk) * ubdiff(ji-1,jj,jk) ) * zbtr 
    421617               END DO 
    422618            END DO 
     
    424620            DO jj = j1,j2-1 
    425621               DO ji = i1,i2   ! vector opt. 
    426                   zbtr = r1_e1e2f(ji,jj) * e3f_n(ji,jj,jk) * fsahm_spf(ji,jj) 
     622                  zbtr = r1_e1e2f(ji,jj) * e3f_n(ji,jj,jk) * rn_sponge_dyn * fspf(ji,jj) 
    427623                  rotdiff(ji,jj,jk) = ( -e1u(ji,jj+1) * ubdiff(ji,jj+1,jk)   & 
    428624                                    &   +e1u(ji,jj  ) * ubdiff(ji,jj  ,jk) ) * fmask(ji,jj,jk) * zbtr  
     
    440636                     ! horizontal diffusive trends 
    441637                     zua = - ( ze2u - rotdiff (ji,jj-1,jk) ) / ( e2u(ji,jj) * e3u_n(ji,jj,jk) )   & 
    442                            + ( hdivdiff(ji+1,jj,jk) - ze1v ) * r1_e1u(ji,jj) 
     638                         & + ( hdivdiff(ji+1,jj,jk) - ze1v ) * r1_e1u(ji,jj) &  
     639                         & - ztrelax  * fspu(ji,jj) * ubdiff(ji,jj,jk) 
    443640 
    444641                     ! add it to the general momentum trends 
    445                      ua(ji,jj,jk) = ua(ji,jj,jk) + zua 
    446  
     642                     ua(ji,jj,jk) = ua(ji,jj,jk) + zua                                  
    447643                  END DO 
    448644               ENDIF 
     
    492688      ! 
    493689      INTEGER  ::   ji, jj, jk, imax 
    494       REAL(wp) ::   ze2u, ze1v, zua, zva, zbtr, h_diff 
     690      REAL(wp) ::   ze2u, ze1v, zua, zva, zbtr, zhtot, ztrelax 
    495691      REAL(wp), DIMENSION(i1:i2,j1:j2,1:jpk) :: vbdiff 
    496692      REAL(wp), DIMENSION(i1:i2,j1:j2,1:jpk) :: rotdiff, hdivdiff 
     
    503699       
    504700      IF( before ) THEN  
    505          DO jk=1,jpkm1 
     701         DO jk=k1,k2 
    506702            DO jj=j1,j2 
    507703               DO ji=i1,i2 
    508704                  tabres(ji,jj,jk,m1) = vb(ji,jj,jk) 
    509705# if defined key_vertical 
    510                   tabres(ji,jj,jk,m2) = vmask(ji,jj,jk) * e3v_n(ji,jj,jk) 
     706                  tabres(ji,jj,jk,m2) = vmask(ji,jj,jk) * e3v_b(ji,jj,jk) 
    511707# endif 
    512708               END DO 
    513709            END DO 
    514710         END DO 
     711 
     712# if defined key_vertical 
     713         ! Extrapolate thicknesses in partial bottom cells: 
     714         ! Set them to Agrif_SpecialValue (0.). Correct bottom thicknesses are retrieved later on 
     715         IF (ln_zps) THEN 
     716            DO jj=j1,j2 
     717               DO ji=i1,i2 
     718                  jk = mbkv(ji,jj) 
     719                  tabres(ji,jj,jk,m2) = 0._wp 
     720               END DO 
     721            END DO            
     722         END IF 
     723        ! Save ssh at last level: 
     724        tabres(i1:i2,j1:j2,k2,m2) = 0._wp 
     725        IF (.NOT.ln_linssh) THEN 
     726           ! This vertical sum below should be replaced by the sea-level at V-points (optimization): 
     727           DO jk=1,jpk 
     728              tabres(i1:i2,j1:j2,k2,m2) = tabres(i1:i2,j1:j2,k2,m2) + e3v_b(i1:i2,j1:j2,jk) * vmask(i1:i2,j1:j2,jk) 
     729           END DO 
     730           tabres(i1:i2,j1:j2,k2,m2) = tabres(i1:i2,j1:j2,k2,m2) - hv_0(i1:i2,j1:j2) 
     731        END IF  
     732# endif 
     733 
    515734      ELSE 
    516735 
    517736# if defined key_vertical 
    518          tabres_child(:,:,:) = 0._wp 
     737         IF (ln_linssh) tabres(i1:i2,j1:j2,k2,m2) = 0._wp 
    519738         DO jj=j1,j2 
    520739            DO ji=i1,i2 
    521                N_in = 0 
    522                DO jk=k1,k2 
    523                   IF (tabres(ji,jj,jk,m2) == 0) EXIT 
    524                   N_in = N_in + 1 
     740               tabres_child(ji,jj,:) = 0._wp 
     741               N_in = mbkv_parent(ji,jj) 
     742               zhtot = 0._wp 
     743               DO jk=1,N_in 
     744                  IF (jk==N_in) THEN 
     745                     h_in(jk) = hv0_parent(ji,jj) + tabres(ji,jj,k2,m2) - zhtot 
     746                  ELSE 
     747                     h_in(jk) = tabres(ji,jj,jk,m2) 
     748                  ENDIF 
     749                  zhtot = zhtot + h_in(jk) 
    525750                  tabin(jk) = tabres(ji,jj,jk,m1) 
    526                   h_in(N_in) = tabres(ji,jj,jk,m2) 
    527               ENDDO 
     751               ENDDO 
     752               !           
     753               N_out = 0 
     754               DO jk=1,jpk 
     755                  IF (vmask(ji,jj,jk) == 0) EXIT 
     756                  N_out = N_out + 1 
     757                  h_out(N_out) = e3v_b(ji,jj,jk) 
     758               ENDDO 
     759 
     760               ! Account for small differences in free-surface 
     761               IF ( sum(h_out(1:N_out)) > sum(h_in(1:N_in) )) THEN 
     762                  h_out(1) = h_out(1) - ( sum(h_out(1:N_out))-sum(h_in(1:N_in)) ) 
     763               ELSE 
     764                  h_in(1)   = h_in(1) - (  sum(h_in(1:N_in))-sum(h_out(1:N_out)) ) 
     765               ENDIF 
    528766          
    529               IF (N_in == 0) THEN 
    530                  tabres_child(ji,jj,:) = 0. 
    531                  CYCLE 
    532               ENDIF 
    533           
    534               N_out = 0 
    535               DO jk=1,jpk 
    536                  if (vmask(ji,jj,jk) == 0) EXIT 
    537                  N_out = N_out + 1 
    538                  h_out(N_out) = e3v_n(ji,jj,jk) 
    539               ENDDO 
    540           
    541               IF (N_in * N_out > 0) THEN 
    542                  h_diff = sum(h_out(1:N_out))-sum(h_in(1:N_in)) 
    543                  if (h_diff < -1.e4) then 
    544                     print *,'CHECK YOUR BATHY ...', h_diff, sum(h_out(1:N_out)), sum(h_in(1:N_in)) 
    545                  endif 
    546               ENDIF 
    547               call reconstructandremap(tabin(1:N_in),h_in(1:N_in),tabres_child(ji,jj,1:N_out),h_out(1:N_out),N_in,N_out) 
     767               IF (N_in * N_out > 0) THEN 
     768                  CALL reconstructandremap(tabin(1:N_in),h_in(1:N_in),tabres_child(ji,jj,1:N_out),h_out(1:N_out),N_in,N_out,1) 
     769               ENDIF 
    548770            ENDDO 
    549771         ENDDO 
     
    553775         vbdiff(i1:i2,j1:j2,:) = (vb(i1:i2,j1:j2,:) - tabres(i1:i2,j1:j2,:,1))*vmask(i1:i2,j1:j2,:) 
    554776# endif 
     777         !* set relaxation time scale 
     778         IF( neuler == 0 .AND. lk_agrif_fstep ) THEN   ;   ztrelax =   rn_trelax_dyn  / (        rdt ) 
     779         ELSE                                          ;   ztrelax =   rn_trelax_dyn  / (2._wp * rdt ) 
     780         ENDIF 
    555781         ! 
    556782         DO jk = 1, jpkm1                                 ! Horizontal slab 
     
    562788            DO jj = j1+1,j2 
    563789               DO ji = i1,i2   ! vector opt. 
    564                   zbtr = r1_e1e2t(ji,jj) / e3t_n(ji,jj,jk) * fsahm_spt(ji,jj) 
    565                   hdivdiff(ji,jj,jk) = ( e1v(ji,jj  ) * e3v_n(ji,jj  ,jk) * vbdiff(ji,jj  ,jk)  & 
    566                                      &  -e1v(ji,jj-1) * e3v_n(ji,jj-1,jk) * vbdiff(ji,jj-1,jk)  ) * zbtr 
     790                  zbtr = r1_e1e2t(ji,jj) / e3t_b(ji,jj,jk) * rn_sponge_dyn * fspt(ji,jj) 
     791                  hdivdiff(ji,jj,jk) = ( e1v(ji,jj  ) * e3v_b(ji,jj  ,jk) * vbdiff(ji,jj  ,jk)  & 
     792                                     &  -e1v(ji,jj-1) * e3v_b(ji,jj-1,jk) * vbdiff(ji,jj-1,jk)  ) * zbtr 
    567793               END DO 
    568794            END DO 
    569795            DO jj = j1,j2 
    570796               DO ji = i1,i2-1   ! vector opt. 
    571                   zbtr = r1_e1e2f(ji,jj) * e3f_n(ji,jj,jk) * fsahm_spf(ji,jj) 
     797                  zbtr = r1_e1e2f(ji,jj) * e3f_n(ji,jj,jk) * rn_sponge_dyn * fspf(ji,jj) 
    572798                  rotdiff(ji,jj,jk) = ( e2v(ji+1,jj) * vbdiff(ji+1,jj,jk) &  
    573799                                    &  -e2v(ji  ,jj) * vbdiff(ji  ,jj,jk)  ) * fmask(ji,jj,jk) * zbtr 
     
    602828                     va(ji,jj,jk) = va(ji,jj,jk)                                                                  & 
    603829                        &  + ( rotdiff (ji,jj  ,jk) - rotdiff (ji-1,jj,jk) ) / ( e1v(ji,jj) * e3v_n(ji,jj,jk) )   & 
    604                         &  + ( hdivdiff(ji,jj+1,jk) - hdivdiff(ji  ,jj,jk) ) * r1_e2v(ji,jj) 
     830                        &  + ( hdivdiff(ji,jj+1,jk) - hdivdiff(ji  ,jj,jk) ) * r1_e2v(ji,jj)                      & 
     831                        &  - ztrelax * fspv(ji,jj) * vbdiff(ji,jj,jk) 
    605832                  END DO 
    606833               ENDIF 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.