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2020-03-19T15:52:52+01:00 (8 months ago)
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cguiavarch
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Add Equation of State tag to salinity and temperature outputs and cell_methods attribute for mean_nemo (mean_nemo_wrapper not needed anymore)

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    2222        <field id="e3t_surf"     long_name="T-cell thickness"   field_ref="e3t"  standard_name="cell_thickness"     unit="m"   grid_ref="grid_T_surface_extract"/> 
    2323        <field id="e3t_0"        long_name="Initial T-cell thickness"            standard_name="ref_cell_thickness" unit="m"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
    24  
    25         <field id="toce"         long_name="temperature"                         standard_name="sea_water_potential_temperature"   unit="degC"     grid_ref="grid_T_3D"/> 
    26         <field id="toce_e3t"     long_name="temperature (thickness weighted)"                                                      unit="degC"     grid_ref="grid_T_3D" > toce * e3t </field > 
    27         <field id="soce"         long_name="salinity"                            standard_name="sea_water_practical_salinity"      unit="1e-3"     grid_ref="grid_T_3D"/> 
    28         <field id="soce_e3t"     long_name="salinity    (thickness weighted)"                                                      unit="1e-3"     grid_ref="grid_T_3D" > soce * e3t </field > 
     24         
     25        <!-- EOS80 --> 
     26        <field id="toce_pot"         long_name="potential temperature"           standard_name="sea_water_potential_temperature"      unit="degC"     grid_ref="grid_T_3D"/> 
     27        <field id="toce_pot_e3t"     long_name="potential temperature (thickness weighted)"                                           unit="degC"     grid_ref="grid_T_3D" > toce_pot * e3t </field > 
     28        <field id="soce_pra"         long_name="practical salinity"              standard_name="sea_water_practical_salinity"      unit="1e-3"     grid_ref="grid_T_3D"/> 
     29        <field id="soce_pra_e3t"     long_name="practical salinity    (thickness weighted)"                                        unit="1e-3"     grid_ref="grid_T_3D" > soce_pra * e3t </field > 
     30        <!-- TEOS10 --> 
     31        <field id="toce_con"         long_name="conservative temperature"        standard_name="sea_water_conservative_temperature"   unit="degC"     grid_ref="grid_T_3D"/> 
     32        <field id="toce_con_e3t"     long_name="conservative temperature (thickness weighted)"                                        unit="degC"     grid_ref="grid_T_3D" > toce_con * e3t </field >   
     33        <field id="soce_abs"         long_name="absolute salinity"               standard_name="sea_water_absolute_salinity"       unit="1e-3"     grid_ref="grid_T_3D"/> 
     34        <field id="soce_abs_e3t"     long_name="absolute salinity    (thickness weighted)"                                         unit="1e-3"     grid_ref="grid_T_3D" > soce_abs * e3t </field > 
    2935 
    3036        <!-- t-eddy viscosity coefficients (ldfdyn) --> 
     
    3238   <field id="ahmt_3d"      long_name=" 3D      t-eddy viscosity coefficient"   unit="m2/s or m4/s"  grid_ref="grid_T_3D"/> 
    3339 
    34         <field id="sst"          long_name="sea surface temperature"                            standard_name="sea_surface_temperature"             unit="degC"     /> 
    35         <field id="sst2"         long_name="square of sea surface temperature"                  standard_name="square_of_sea_surface_temperature"   unit="degC2"     > sst * sst </field > 
    36         <field id="sstmax"       long_name="max of sea surface temperature"   field_ref="sst"   operation="maximum"                                                 /> 
    37         <field id="sstmin"       long_name="min of sea surface temperature"   field_ref="sst"   operation="minimum"                                                 /> 
    38         <field id="sstgrad"      long_name="module of sst gradient"                                                                                 unit="degC/m"   /> 
    39         <field id="sstgrad2"     long_name="square of module of sst gradient"                                                                       unit="degC2/m2" /> 
    40         <field id="sbt"          long_name="sea bottom temperature"                                                                                 unit="degC"     /> 
    41         <field id="tosmint"      long_name="vertical integral of temperature times density"     standard_name="integral_wrt_depth_of_product_of_density_and_potential_temperature"  unit="(kg m2) degree_C" /> 
    42         <field id="sst_wl"       long_name="Delta SST of warm layer"                                                                                unit="degC"     /> 
    43         <field id="sst_cs"       long_name="Delta SST of cool skin"                                                                                 unit="degC"     /> 
    44    <field id="temp_3m"      long_name="temperature at 3m"                                                                                      unit="degC"     /> 
    45          
    46         <field id="sss"          long_name="sea surface salinity"                               standard_name="sea_surface_salinity"                unit="1e-3"     /> 
    47         <field id="sss2"         long_name="square of sea surface salinity"                                                                         unit="1e-6"      > sss * sss </field > 
    48         <field id="sssmax"       long_name="max of sea surface salinity"      field_ref="sss"   operation="maximum"                                                 /> 
    49         <field id="sssmin"       long_name="min of sea surface salinity"      field_ref="sss"   operation="minimum"                                                 /> 
    50         <field id="sbs"          long_name="sea bottom salinity"                                                                                    unit="0.001"    /> 
    51         <field id="somint"       long_name="vertical integral of salinity times density"        standard_name="integral_wrt_depth_of_product_of_density_and_salinity"  unit="(kg m2) x (1e-3)" />  
     40        <!-- EOS80 --> 
     41        <field id="sst_pot"          long_name="sea surface potential temperature"                            standard_name="sea_surface_temperature"             unit="degC"     /> 
     42        <field id="sst2_pot"         long_name="square of sea surface potential temperature"                  standard_name="square_of_sea_surface_temperature"   unit="degC2"     > sst_pot * sst_pot </field > 
     43        <field id="sstmax_pot"       long_name="max of sea surface potential temperature"   field_ref="sst_pot"   operation="maximum"                                                 /> 
     44        <field id="sstmin_pot"       long_name="min of sea surface potential temperature"   field_ref="sst_pot"   operation="minimum"                                                 /> 
     45        <field id="sstgrad_pot"      long_name="module of potential sst gradient"                                                                                 unit="degC/m"   /> 
     46        <field id="sstgrad2_pot"     long_name="square of module of potential sst gradient"                                                                       unit="degC2/m2" /> 
     47        <field id="sbt_pot"          long_name="sea bottom potential temperature"                                                                                 unit="degC"     /> 
     48        <field id="tosmint_pot"      long_name="vertical integral of potential temperature times density"     standard_name="integral_wrt_depth_of_product_of_density_and_potential_temperature"  unit="(kg m2) degree_C" /> 
     49        <field id="sst_wl_pot"       long_name="Delta potential SST of warm layer"                                                                                unit="degC"     /> 
     50        <field id="sst_cs_pot"       long_name="Delta potential SST of cool skin"                                                                                 unit="degC"     /> 
     51   <field id="temp_3m_pot"      long_name="potential temperature at 3m"                                                                                      unit="degC"     /> 
     52 
     53        <field id="sss_pra"          long_name="sea surface practical salinity"                               standard_name="sea_surface_practical_salinity"                unit="1e-3"     /> 
     54        <field id="sss2_pra"         long_name="square of sea surface practical salinity"                                                                         unit="1e-6"      > sss_pra * sss_pra </field > 
     55        <field id="sssmax_pra"       long_name="max of sea surface practical salinity"      field_ref="sss_pra"   operation="maximum"                                                 /> 
     56        <field id="sssmin_pra"       long_name="min of sea surface practical salinity"      field_ref="sss_pra"   operation="minimum"                                                 /> 
     57        <field id="sbs_pra"          long_name="sea bottom practical salinity"                                                                                    unit="0.001"    /> 
     58        <field id="somint_pra"       long_name="vertical integral of practical salinity times density"        standard_name="integral_wrt_depth_of_product_of_density_and_practical_salinity"  unit="(kg m2) x (1e-3)" />  
     59        <!-- TEOS10 --> 
     60        <field id="sst_con"          long_name="sea surface conservative temperature"                            standard_name="sea_surface_conservative_temperature"             unit="degC"     /> 
     61        <field id="sst2_con"         long_name="square of sea surface conservative temperature"                  standard_name="square_of_sea_surface_temperature"   unit="degC2"     > sst_con * sst_con </field > 
     62        <field id="sstmax_con"       long_name="max of sea surface conservative temperature"   field_ref="sst_con"   operation="maximum"                                                 /> 
     63        <field id="sstmin_con"       long_name="min of sea surface conservative temperature"   field_ref="sst_con"   operation="minimum"                                                 /> 
     64        <field id="sstgrad_con"      long_name="module of conservative sst gradient"                                                                                 unit="degC/m"   /> 
     65        <field id="sstgrad2_con"     long_name="square of module of conservative sst gradient"                                                                       unit="degC2/m2" /> 
     66        <field id="sbt_con"          long_name="sea bottom conservative temperature"                                                                                 unit="degC"     /> 
     67        <field id="tosmint_con"      long_name="vertical integral of conservative temperature times density"     standard_name="integral_wrt_depth_of_product_of_density_and_conservative_temperature"  unit="(kg m2) degree_C" /> 
     68        <field id="sst_wl_con"       long_name="Delta conservative SST of warm layer"                                                                                unit="degC"     /> 
     69        <field id="sst_cs_con"       long_name="Delta conservative SST of cool skin"                                                                                 unit="degC"     /> 
     70   <field id="temp_3m_con"      long_name="conservative temperature at 3m"                                                                                      unit="degC"     /> 
     71 
     72        <field id="sss_abs"          long_name="sea surface absolute salinity"                               standard_name="sea_surface_absolute_salinity"                unit="1e-3"     /> 
     73        <field id="sss2_abs"         long_name="square of sea surface absolute salinity"                                                                         unit="1e-6"      > sss_abs * sss_abs </field > 
     74        <field id="sssmax_abs"       long_name="max of sea surface absolute salinity"      field_ref="sss_abs"   operation="maximum"                                                 /> 
     75        <field id="sssmin_abs"       long_name="min of sea surface absolute salinity"      field_ref="sss_abs"   operation="minimum"                                                 /> 
     76        <field id="sbs_abs"          long_name="sea bottom absolute salinity"                                                                                    unit="0.001"    /> 
     77        <field id="somint_abs"       long_name="vertical integral of absolute salinity times density"        standard_name="integral_wrt_depth_of_product_of_density_and_absolute_salinity"  unit="(kg m2) x (1e-3)" /> 
    5278 
    5379        <field id="taubot"       long_name="bottom stress module"                                                                                   unit="N/m2"     />  
     
    343369      
    344370     <!-- sbcssm variables --> 
    345           <field id="sst_m"    unit="degC" /> 
    346           <field id="sss_m"    unit="psu"  /> 
     371          <field id="sst_m_pot"    unit="degC" /> 
     372     <!-- EOS-80 --> 
     373          <field id="sss_m_pra"    unit="psu"  /> 
     374          <!-- TEOS-10 --> 
     375          <field id="sss_m_abs"    unit="psu"  /> 
     376 
    347377          <field id="ssu_m"    unit="m/s"  /> 
    348378          <field id="ssv_m"    unit="m/s"  /> 
     
    898928     
    899929    <field_group id="mooring" > 
    900       <field field_ref="toce"         name="thetao"   long_name="sea_water_potential_temperature"      /> 
    901       <field field_ref="soce"         name="so"       long_name="sea_water_salinity"                   /> 
     930      <!-- EOS80 --> 
     931      <field field_ref="toce_pot"         name="thetao_pot"   long_name="sea_water_potential_temperature"      /> 
     932      <field field_ref="soce_pra"         name="so_pra"       long_name="sea_water_practical_salinity"                   /> 
     933      <!-- TEOS10 --> 
     934      <field field_ref="toce_con"         name="thetao_con"   long_name="sea_water_conservative_temperature"      /> 
     935      <field field_ref="soce_abs"         name="so_con"       long_name="sea_water_absolute_salinity"                   /> 
     936 
    902937      <field field_ref="uoce"         name="uo"       long_name="sea_water_x_velocity"                 /> 
    903938      <field field_ref="voce"         name="vo"       long_name="sea_water_y_velocity"                 /> 
     
    905940      <field field_ref="avt"          name="difvho"   long_name="ocean_vertical_heat_diffusivity"      /> 
    906941      <field field_ref="avm"          name="difvmo"   long_name="ocean_vertical_momentum_diffusivity"  /> 
    907        
    908       <field field_ref="sst"          name="tos"      long_name="sea_surface_temperature"                       /> 
    909       <field field_ref="sst2"         name="tossq"    long_name="square_of_sea_surface_temperature"             /> 
    910       <field field_ref="sstgrad"      name="tosgrad"  long_name="module_of_sea_surface_temperature_gradient"    /> 
    911       <field field_ref="sss"          name="sos"      long_name="sea_surface_salinity"                          /> 
     942 
     943      <!-- EOS80 --> 
     944      <field field_ref="sst_pot"          name="tos_pot"      long_name="sea_surface_potential_temperature"                       /> 
     945      <field field_ref="sst2_pot"         name="tossq_pot"    long_name="square_of_sea_surface_potential_temperature"             /> 
     946      <field field_ref="sstgrad_pot"      name="tosgrad_pot"  long_name="module_of_sea_surface_potential_temperature_gradient"    /> 
     947      <field field_ref="sss_pra"          name="sos_pra"      long_name="sea_surface_absolute_salinity"                          /> 
     948      <!-- TEOS10 --> 
     949      <field field_ref="sst_con"          name="tos_con"      long_name="sea_surface_conservative_temperature"                       /> 
     950      <field field_ref="sst2_con"         name="tossq_con"    long_name="square_of_sea_surface_conservative_temperature"             /> 
     951      <field field_ref="sstgrad_con"      name="tosgrad_con"  long_name="module_of_sea_surface_conservative_temperature_gradient"    /> 
     952      <field field_ref="sss_abs"          name="sos"      long_name="sea_surface_absolute_salinity"                          /> 
     953 
    912954      <field field_ref="ssh"          name="zos"      long_name="sea_surface_height_above_geoid"                /> 
    913955      <field field_ref="empmr"        name="wfo"      long_name="water_flux_into_sea_water"                     /> 
     
    932974 
    933975    <field_group id="groupT" > 
    934       <field field_ref="toce"         name="thetao"   long_name="sea_water_potential_temperature"               /> 
    935       <field field_ref="soce"         name="so"       long_name="sea_water_salinity"                            /> 
    936       <field field_ref="sst"          name="tos"      long_name="sea_surface_temperature"                       /> 
    937       <field field_ref="sst2"         name="tossq"    long_name="square_of_sea_surface_temperature"             /> 
    938       <field field_ref="sss"          name="sos"      long_name="sea_surface_salinity"                          /> 
     976      <!-- EOS80 --> 
     977      <field field_ref="toce_pot"         name="thetao_pot"   long_name="sea_water_potential_temperature"               /> 
     978      <field field_ref="soce_pra"         name="so_pra"       long_name="sea_water_practical_salinity"                            /> 
     979      <field field_ref="sst_pot"          name="tos_pot"      long_name="sea_surface_potential_temperature"                       /> 
     980      <field field_ref="sst2_pot"         name="tossq_pot"    long_name="square_of_sea_surface_potential_temperature"             /> 
     981      <field field_ref="sss_pra"          name="sos_pra"      long_name="sea_surface_practical_salinity"                          /> 
     982      <!-- TEOS10 --> 
     983      <field field_ref="toce_con"         name="thetao_con"   long_name="sea_water_conservative_temperature"               /> 
     984      <field field_ref="soce_abs"         name="so_abs"       long_name="sea_water_absolute_salinity"                            /> 
     985      <field field_ref="sst_con"          name="tos_con"      long_name="sea_surface_conservative_temperature"                       /> 
     986      <field field_ref="sst2_con"         name="tossq_con"    long_name="square_of_sea_surface_conservative_temperature"             /> 
     987      <field field_ref="sss_abs"          name="sos_abs"      long_name="sea_surface_absolute_salinity"                          /> 
     988 
    939989      <field field_ref="ssh"          name="zos"      long_name="sea_surface_height_above_geoid"                /> 
    940990      <field field_ref="empmr"        name="wfo"      long_name="water_flux_into_sea_water"                     /> 
     
    9721022    <!-- TMB diagnostic output --> 
    9731023    <field_group  id="1h_grid_T_tmb" grid_ref="grid_T_2D" operation="instant"> 
    974       <field id="top_temp"           name="votemper_top"  unit="degC"  /> 
    975       <field id="mid_temp"           name="votemper_mid"  unit="degC"  /> 
    976       <field id="bot_temp"           name="votemper_bot"  unit="degC"  /> 
    977       <field id="top_sal"            name="vosaline_top"  unit="psu"   /> 
    978       <field id="mid_sal"            name="vosaline_mid"  unit="psu"   /> 
    979       <field id="bot_sal"            name="vosaline_bot"  unit="psu"   /> 
     1024      <!-- EOS80 --> 
     1025      <field id="top_temp_pot"           name="votemper_top_pot"  unit="degC"  /> 
     1026      <field id="mid_temp_pot"           name="votemper_mid_pot"  unit="degC"  /> 
     1027      <field id="bot_temp_pot"           name="votemper_bot_pot"  unit="degC"  /> 
     1028      <field id="top_sal_pra"            name="vosaline_top_pra"  unit="psu"   /> 
     1029      <field id="mid_sal_pra"            name="vosaline_mid_pra"  unit="psu"   /> 
     1030      <field id="bot_sal_pra"            name="vosaline_bot_pra"  unit="psu"   /> 
     1031      <!-- TEOS10 --> 
     1032      <field id="top_temp_con"           name="votemper_top_con"  unit="degC"  /> 
     1033      <field id="mid_temp_con"           name="votemper_mid_con"  unit="degC"  /> 
     1034      <field id="bot_temp_con"           name="votemper_bot_con"  unit="degC"  /> 
     1035      <field id="top_sal_abs"            name="vosaline_top_abs"  unit="psu"   /> 
     1036      <field id="mid_sal_abs"            name="vosaline_mid_abs"  unit="psu"   /> 
     1037      <field id="bot_sal_abs"            name="vosaline_bot_abs"  unit="psu"   /> 
     1038 
    9801039      <field id="sshnmasked"         name="sossheig"      unit="m"     />  
    9811040    </field_group> 
     
    9971056    <!-- 25h diagnostic output --> 
    9981057    <field_group id="25h_grid_T" grid_ref="grid_T_3D" operation="instant"> 
    999       <field id="temper25h"         name="potential temperature 25h mean"    unit="degC" /> 
     1058      <!-- EOS80 --> 
     1059      <field id="temper25h_pot"         name="potential temperature 25h mean"    unit="degC" /> 
    10001060      <field id="tempis25h"         name="insitu temperature 25h mean"    unit="degC" /> 
    1001       <field id="salin25h"          name="salinity 25h mean"                 unit="psu"  /> 
     1061      <field id="salin25h_pra"          name="practical salinity 25h mean"                 unit="psu"  /> 
     1062      <!-- TEOS10 --> 
     1063      <field id="temper25h_con"         name="conservative temperature 25h mean"    unit="degC" /> 
     1064      <field id="tempis25h"         name="insitu temperature 25h mean"    unit="degC" /> 
     1065      <field id="salin25h_abs"          name="absolute salinity 25h mean"                 unit="psu"  /> 
     1066 
    10021067      <field id="ssh25h"            name="sea surface height 25h mean"  grid_ref="grid_T_2D"      unit="m"    /> 
    10031068    </field_group> 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.