Changeset 12660


Ignore:
Timestamp:
2020-04-03T13:09:33+02:00 (7 months ago)
Author:
cguiavarch
Message:

UKMO/NEMO_4.0.2_GO8_package: copy over changes from NEMO_4.0.1_GO8_package branch.

Location:
NEMO/branches/UKMO/NEMO_4.0.2_GO8_package
Files:
20 edited
2 copied

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • NEMO/branches/UKMO/NEMO_4.0.2_GO8_package/cfgs/SHARED/domain_def_nemo.xml

    r12276 r12660  
    181181     <domain id="EqW" domain_ref="grid_W" > <zoom_domain id="EqW"/> </domain> 
    182182 
    183               <!--   zonal mean grid   --> 
    184      <domain_group id="gznl"> 
    185         <domain id="gznl" long_name="gznl"/> 
    186         <domain id="ptr" domain_ref="gznl" >  
    187             <zoom_domain id="ptr" ibegin="0000" jbegin="0" ni="1" nj="0000" />  
    188         </domain> 
    189       </domain_group> 
     183      
     184     <!--   zonal mean grid   --> 
     185     <domain id="gznl" long_name="gznl"/> 
     186     <domain id="ptr" domain_ref="gznl" > 
     187    <zoom_domain id="ptr" ibegin="0000" jbegin="0" ni="1" nj="0000" /> 
     188     </domain>   
     189     <domain id="znl_T" domain_ref="gznl" > <zoom_domain id="znl_T"/> </domain> 
     190     <domain id="znl_W" domain_ref="gznl" > <zoom_domain id="znl_W"/> </domain> 
    190191 
    191192      
  • NEMO/branches/UKMO/NEMO_4.0.2_GO8_package/cfgs/SHARED/field_def_nemo-ice.xml

    r12337 r12660  
    163163 
    164164     <!-- sbcssm variables --> 
    165           <field id="sst_m"    unit="degC" /> 
    166           <field id="sss_m"    unit="psu"  /> 
     165          <field id="sst_m_pot"    unit="degC" /> 
     166     <!-- EOS-80 --> 
     167          <field id="sss_m_pra"    unit="psu"  /> 
     168          <!-- TEOS-10 --> 
     169          <field id="sss_m_abs"    unit="psu"  /> 
     170 
    167171          <field id="ssu_m"    unit="m/s"  /> 
    168172          <field id="ssv_m"    unit="m/s"  /> 
     
    360364     <field field_ref="icevpnd"          name="sivpnd" /> 
    361365          <field field_ref="iceage"           name="siage"  /> 
    362      <field field_ref="sst_m"            name="sst_m"  /> 
    363      <field field_ref="sss_m"            name="sss_m"  /> 
     366     <field id="sst_m_pot"    unit="degC" /> 
     367     <!-- EOS-80 --> 
     368     <field id="sss_m_pra"    unit="psu"  /> 
     369     <!-- TEOS-10 --> 
     370          <field id="sss_m_abs"    unit="psu"  /> 
    364371      
    365372     <!-- heat --> 
  • NEMO/branches/UKMO/NEMO_4.0.2_GO8_package/cfgs/SHARED/field_def_nemo-oce.xml

    r12288 r12660  
    1919       
    2020      <field_group id="grid_T" grid_ref="grid_T_2D" > 
    21         <field id="e3t"          long_name="T-cell thickness"                    standard_name="cell_thickness"        unit="m"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
    22         <field id="e3ts"         long_name="T-cell thickness"   field_ref="e3t"  standard_name="cell_thickness"        unit="m"   grid_ref="grid_T_SFC"/> 
    23         <field id="e3t_0"        long_name="Initial T-cell thickness"            standard_name="ref_cell_thickness"    unit="m"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
    24         <field id="e3tb"         long_name="bottom T-cell thickness"             standard_name="bottom_cell_thickness" unit="m"   grid_ref="grid_T_2D"/>  
    25         <field id="e3t_300"      field_ref="e3t"                grid_ref="grid_T_zoom_300"       detect_missing_value="true" /> 
    26         <field id="e3t_vsum300"  field_ref="e3t_300"            grid_ref="grid_T_vsum"   detect_missing_value="true" /> 
    27    <field id="masscello"    long_name="Sea Water Mass per unit area"   standard_name="sea_water_mass_per_unit_area"   unit="kg/m2"   grid_ref="grid_T_3D"/> 
    28         <field id="volcello"     long_name="Ocean Volume"                   standard_name="ocean_volume"   unit="m3"       grid_ref="grid_T_3D"/>  
    29         <field id="toce"         long_name="temperature"                         standard_name="sea_water_potential_temperature"   unit="degC"     grid_ref="grid_T_3D"/> 
    30         <field id="toce_e3t"     long_name="temperature (thickness weighted)"                                                      unit="degC"     grid_ref="grid_T_3D" > toce * e3t </field > 
    31         <field id="soce"         long_name="salinity"                            standard_name="sea_water_practical_salinity"      unit="1e-3"     grid_ref="grid_T_3D"/> 
    32         <field id="soce_e3t"     long_name="salinity    (thickness weighted)"                                                      unit="1e-3"     grid_ref="grid_T_3D" > soce * e3t </field > 
     21        <field id="e3t"          long_name="T-cell thickness"                    standard_name="cell_thickness"     unit="m"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
     22        <field id="e3t_surf"     long_name="T-cell thickness"   field_ref="e3t"  standard_name="cell_thickness"     unit="m"   grid_ref="grid_T_surface_extract"/> 
     23        <field id="e3t_0"        long_name="Initial T-cell thickness"            standard_name="ref_cell_thickness" unit="m"   grid_ref="grid_T_3D" /> 
     24         
     25        <!-- EOS80 --> 
     26        <field id="toce_pot"         long_name="potential temperature"           standard_name="sea_water_potential_temperature"      unit="degC"     grid_ref="grid_T_3D"/> 
     27        <field id="toce_pot_e3t"     long_name="potential temperature (thickness weighted)"                                           unit="degC"     grid_ref="grid_T_3D" > toce_pot * e3t </field > 
     28        <field id="soce_pra"         long_name="practical salinity"              standard_name="sea_water_practical_salinity"      unit="1e-3"     grid_ref="grid_T_3D"/> 
     29        <field id="soce_pra_e3t"     long_name="practical salinity    (thickness weighted)"                                        unit="1e-3"     grid_ref="grid_T_3D" > soce_pra * e3t </field > 
     30        <!-- TEOS10 --> 
     31        <field id="toce_con"         long_name="conservative temperature"        standard_name="sea_water_conservative_temperature"   unit="degC"     grid_ref="grid_T_3D"/> 
     32        <field id="toce_con_e3t"     long_name="conservative temperature (thickness weighted)"                                        unit="degC"     grid_ref="grid_T_3D" > toce_con * e3t </field >   
     33        <field id="soce_abs"         long_name="absolute salinity"               standard_name="sea_water_absolute_salinity"       unit="1e-3"     grid_ref="grid_T_3D"/> 
     34        <field id="soce_abs_e3t"     long_name="absolute salinity    (thickness weighted)"                                         unit="1e-3"     grid_ref="grid_T_3D" > soce_abs * e3t </field > 
    3335 
    3436        <field id="toce_e3t_300"      field_ref="toce_e3t"          unit="degree_C"     grid_ref="grid_T_zoom_300"      detect_missing_value="true" /> 
     
    4143   <field id="ahmt_3d"      long_name=" 3D      t-eddy viscosity coefficient"   unit="m2/s or m4/s"  grid_ref="grid_T_3D"/> 
    4244 
    43         <field id="sst"          long_name="sea surface temperature"                            standard_name="sea_surface_temperature"             unit="degC"     /> 
    44         <field id="sst2"         long_name="square of sea surface temperature"                  standard_name="square_of_sea_surface_temperature"   unit="degC2"     > sst * sst </field > 
    45         <field id="sstmax"       long_name="max of sea surface temperature"   field_ref="sst"   operation="maximum"                                                 /> 
    46         <field id="sstmin"       long_name="min of sea surface temperature"   field_ref="sst"   operation="minimum"                                                 /> 
    47         <field id="sstgrad"      long_name="module of sst gradient"                                                                                 unit="degC/m"   /> 
    48         <field id="sstgrad2"     long_name="square of module of sst gradient"                                                                       unit="degC2/m2" /> 
    49         <field id="sbt"          long_name="sea bottom temperature"                                                                                 unit="degC"     /> 
    50         <field id="tosmint"      long_name="vertical integral of temperature times density"     standard_name="integral_wrt_depth_of_product_of_density_and_potential_temperature"  unit="(kg m2) degree_C" /> 
    51         <field id="sst_wl"       long_name="Delta SST of warm layer"                                                                                unit="degC"     /> 
    52         <field id="sst_cs"       long_name="Delta SST of cool skin"                                                                                 unit="degC"     /> 
    53    <field id="temp_3m"      long_name="temperature at 3m"                                                                                      unit="degC"     /> 
    54          
    55         <field id="sss"          long_name="sea surface salinity"                               standard_name="sea_surface_salinity"                unit="1e-3"     /> 
    56         <field id="sss2"         long_name="square of sea surface salinity"                                                                         unit="1e-6"      > sss * sss </field > 
    57         <field id="sssmax"       long_name="max of sea surface salinity"      field_ref="sss"   operation="maximum"                                                 /> 
    58         <field id="sssmin"       long_name="min of sea surface salinity"      field_ref="sss"   operation="minimum"                                                 /> 
    59         <field id="sbs"          long_name="sea bottom salinity"                                                                                    unit="0.001"    /> 
    60         <field id="somint"       long_name="vertical integral of salinity times density"        standard_name="integral_wrt_depth_of_product_of_density_and_salinity"  unit="(kg m2) x (1e-3)" />  
     45        <!-- EOS80 --> 
     46        <field id="sst_pot"          long_name="sea surface potential temperature"                            standard_name="sea_surface_temperature"             unit="degC"     /> 
     47        <field id="sst2_pot"         long_name="square of sea surface potential temperature"                  standard_name="square_of_sea_surface_temperature"   unit="degC2"     > sst_pot * sst_pot </field > 
     48        <field id="sstmax_pot"       long_name="max of sea surface potential temperature"   field_ref="sst_pot"   operation="maximum"                                                 /> 
     49        <field id="sstmin_pot"       long_name="min of sea surface potential temperature"   field_ref="sst_pot"   operation="minimum"                                                 /> 
     50        <field id="sstgrad_pot"      long_name="module of potential sst gradient"                                                                                 unit="degC/m"   /> 
     51        <field id="sstgrad2_pot"     long_name="square of module of potential sst gradient"                                                                       unit="degC2/m2" /> 
     52        <field id="sbt_pot"          long_name="sea bottom potential temperature"                                                                                 unit="degC"     /> 
     53        <field id="tosmint_pot"      long_name="vertical integral of potential temperature times density"     standard_name="integral_wrt_depth_of_product_of_density_and_potential_temperature"  unit="(kg m2) degree_C" /> 
     54        <field id="sst_wl_pot"       long_name="Delta potential SST of warm layer"                                                                                unit="degC"     /> 
     55        <field id="sst_cs_pot"       long_name="Delta potential SST of cool skin"                                                                                 unit="degC"     /> 
     56   <field id="temp_3m_pot"      long_name="potential temperature at 3m"                                                                                      unit="degC"     /> 
     57 
     58        <field id="sss_pra"          long_name="sea surface practical salinity"                               standard_name="sea_surface_practical_salinity"                unit="1e-3"     /> 
     59        <field id="sss2_pra"         long_name="square of sea surface practical salinity"                                                                         unit="1e-6"      > sss_pra * sss_pra </field > 
     60        <field id="sssmax_pra"       long_name="max of sea surface practical salinity"      field_ref="sss_pra"   operation="maximum"                                                 /> 
     61        <field id="sssmin_pra"       long_name="min of sea surface practical salinity"      field_ref="sss_pra"   operation="minimum"                                                 /> 
     62        <field id="sbs_pra"          long_name="sea bottom practical salinity"                                                                                    unit="0.001"    /> 
     63        <field id="somint_pra"       long_name="vertical integral of practical salinity times density"        standard_name="integral_wrt_depth_of_product_of_density_and_practical_salinity"  unit="(kg m2) x (1e-3)" />  
     64        <!-- TEOS10 --> 
     65        <field id="sst_con"          long_name="sea surface conservative temperature"                            standard_name="sea_surface_conservative_temperature"             unit="degC"     /> 
     66        <field id="sst2_con"         long_name="square of sea surface conservative temperature"                  standard_name="square_of_sea_surface_temperature"   unit="degC2"     > sst_con * sst_con </field > 
     67        <field id="sstmax_con"       long_name="max of sea surface conservative temperature"   field_ref="sst_con"   operation="maximum"                                                 /> 
     68        <field id="sstmin_con"       long_name="min of sea surface conservative temperature"   field_ref="sst_con"   operation="minimum"                                                 /> 
     69        <field id="sstgrad_con"      long_name="module of conservative sst gradient"                                                                                 unit="degC/m"   /> 
     70        <field id="sstgrad2_con"     long_name="square of module of conservative sst gradient"                                                                       unit="degC2/m2" /> 
     71        <field id="sbt_con"          long_name="sea bottom conservative temperature"                                                                                 unit="degC"     /> 
     72        <field id="tosmint_con"      long_name="vertical integral of conservative temperature times density"     standard_name="integral_wrt_depth_of_product_of_density_and_conservative_temperature"  unit="(kg m2) degree_C" /> 
     73        <field id="sst_wl_con"       long_name="Delta conservative SST of warm layer"                                                                                unit="degC"     /> 
     74        <field id="sst_cs_con"       long_name="Delta conservative SST of cool skin"                                                                                 unit="degC"     /> 
     75   <field id="temp_3m_con"      long_name="conservative temperature at 3m"                                                                                      unit="degC"     /> 
     76 
     77        <field id="sss_abs"          long_name="sea surface absolute salinity"                               standard_name="sea_surface_absolute_salinity"                unit="1e-3"     /> 
     78        <field id="sss2_abs"         long_name="square of sea surface absolute salinity"                                                                         unit="1e-6"      > sss_abs * sss_abs </field > 
     79        <field id="sssmax_abs"       long_name="max of sea surface absolute salinity"      field_ref="sss_abs"   operation="maximum"                                                 /> 
     80        <field id="sssmin_abs"       long_name="min of sea surface absolute salinity"      field_ref="sss_abs"   operation="minimum"                                                 /> 
     81        <field id="sbs_abs"          long_name="sea bottom absolute salinity"                                                                                    unit="0.001"    /> 
     82        <field id="somint_abs"       long_name="vertical integral of absolute salinity times density"        standard_name="integral_wrt_depth_of_product_of_density_and_absolute_salinity"  unit="(kg m2) x (1e-3)" /> 
    6183 
    6284        <field id="taubot"       long_name="bottom stress module"                                                                                   unit="N/m2"     />  
     
    7799        <field id="mldr10_1max"  long_name="Max of Mixed Layer Depth (dsigma = 0.01 wrt 10m)"   field_ref="mldr10_1"   operation="maximum"                                                                          /> 
    78100        <field id="mldr10_1min"  long_name="Min of Mixed Layer Depth (dsigma = 0.01 wrt 10m)"   field_ref="mldr10_1"   operation="minimum"                                                                          /> 
     101         <field id="mldzint_1"    long_name="Mixed Layer Depth interpolated"                     standard_name="ocean_mixed_layer_thickness"                                                       unit="m"          /> 
     102         <field id="mldzint_2"    long_name="Mixed Layer Depth interpolated"                     standard_name="ocean_mixed_layer_thickness"                                                       unit="m"          /> 
     103         <field id="mldzint_3"    long_name="Mixed Layer Depth interpolated"                     standard_name="ocean_mixed_layer_thickness"                                                       unit="m"          /> 
     104         <field id="mldzint_4"    long_name="Mixed Layer Depth interpolated"                     standard_name="ocean_mixed_layer_thickness"                                                       unit="m"          /> 
     105         <field id="mldzint_5"    long_name="Mixed Layer Depth interpolated"                     standard_name="ocean_mixed_layer_thickness"                                                       unit="m"          /> 
     106         <field id="mldhtc_1"     long_name="Mixed Layer Depth integrated heat content"          standard_name="integral_of_sea_water_potential_temperature_wrt_depth_expressed_as_heat_content"   unit="J/m2"       /> 
     107         <field id="mldhtc_2"     long_name="Mixed Layer Depth integrated heat content"          standard_name="integral_of_sea_water_potential_temperature_wrt_depth_expressed_as_heat_content"   unit="J/m2"       /> 
     108         <field id="mldhtc_3"     long_name="Mixed Layer Depth integrated heat content"          standard_name="integral_of_sea_water_potential_temperature_wrt_depth_expressed_as_heat_content"   unit="J/m2"       /> 
     109         <field id="mldhtc_4"     long_name="Mixed Layer Depth integrated heat content"          standard_name="integral_of_sea_water_potential_temperature_wrt_depth_expressed_as_heat_content"   unit="J/m2"       /> 
     110         <field id="mldhtc_5"     long_name="Mixed Layer Depth integrated heat content"          standard_name="integral_of_sea_water_potential_temperature_wrt_depth_expressed_as_heat_content"   unit="J/m2"       /> 
    79111        <field id="heatc"        long_name="Heat content vertically integrated"                 standard_name="integral_of_sea_water_potential_temperature_wrt_depth_expressed_as_heat_content"   unit="J/m2"       /> 
    80112        <field id="saltc"        long_name="Salt content vertically integrated"                                                                                                                   unit="1e-3*kg/m2" /> 
     
    353385      
    354386     <!-- sbcssm variables --> 
    355           <field id="sst_m"    unit="degC" /> 
    356           <field id="sss_m"    unit="psu"  /> 
     387          <field id="sst_m_pot"    unit="degC" /> 
     388     <!-- EOS-80 --> 
     389          <field id="sss_m_pra"    unit="psu"  /> 
     390          <!-- TEOS-10 --> 
     391          <field id="sss_m_abs"    unit="psu"  /> 
     392 
    357393          <field id="ssu_m"    unit="m/s"  /> 
    358394          <field id="ssv_m"    unit="m/s"  /> 
     
    386422 
    387423 
     424        <field id="uoce2_e3u"    long_name="ocean current along i-axis squared (thickness weighted)"                                            unit="m3/s2"      grid_ref="grid_U_3D"  > uoce * uoce * e3u </field> 
    388425        <field id="ssu"          long_name="ocean surface current along i-axis"                                                                 unit="m/s"                             /> 
    389426        <field id="sbu"          long_name="ocean bottom current along i-axis"                                                                  unit="m/s"                             /> 
     
    443480        <field id="voce"         long_name="ocean current along j-axis"                             standard_name="sea_water_y_velocity"        unit="m/s"        grid_ref="grid_V_3D" /> 
    444481        <field id="voce_e3v"     long_name="ocean current along j-axis  (thickness weighted)"                                                   unit="m/s"        grid_ref="grid_V_3D"  > voce * e3v </field> 
     482        <field id="voce2_e3v"    long_name="ocean current along j-axis squared (thickness weighted)"                                            unit="m3/s2"      grid_ref="grid_V_3D"  > voce * voce * e3v </field> 
    445483        <field id="ssv"          long_name="ocean surface current along j-axis"                                                                 unit="m/s"                             /> 
    446484        <field id="sbv"          long_name="ocean bottom current along j-axis"                                                                  unit="m/s"                             /> 
     
    541579      <field id="ahmf_2d"      long_name=" surface f-eddy viscosity coefficient"   unit="m2/s or m4/s" /> 
    542580      <field id="ahmf_3d"      long_name=" 3D      f-eddy viscosity coefficient"   unit="m2/s or m4/s"  grid_ref="grid_T_3D"/> 
     581 
     582      <!-- product fields --> 
     583      <field_group id="diaprod"> 
     584   <field id="ut"           long_name="product_of_sea_water_x_velocity_and_potential_temperature"      unit="degree_C m/s"      grid_ref="grid_U_3D"   /> 
     585        <field id="ut_e3u"       long_name="product_of_sea_water_x_velocity_and_potential_temperature * e3u"  unit="degree_C m2/s"   grid_ref="grid_U_3D" > ut * e3u </field > 
     586   <field id="us"           long_name="product_of_sea_water_x_velocity_and_salinity"                   unit="PSU m/s"       grid_ref="grid_U_3D"   /> 
     587        <field id="us_e3u"       long_name="product_of_sea_water_x_velocity_and_salinity * e3u"             unit="PSU m2/s"      grid_ref="grid_U_3D" > us * e3u </field > 
     588   <field id="urhop"        long_name="product_of_sea_water_x_velocity_and_potential_density"          unit="(kg/m3).(m/s)" grid_ref="grid_U_3D"   /> 
     589        <field id="urhop_e3u"    long_name="product_of_sea_water_x_velocity_and_potential_density * e3u"    unit="(kg/m3).(m2/s)"   grid_ref="grid_U_3D" > urhop * e3u </field > 
     590   <field id="vt"           long_name="product_of_sea_water_y_velocity_and_potential_temperature"      unit="degree_C m/s"      grid_ref="grid_V_3D"   /> 
     591        <field id="vt_e3v"       long_name="product_of_sea_water_y_velocity_and_potential_temperature * e3v"  unit="degree_C m2/s"   grid_ref="grid_V_3D" > vt * e3v </field > 
     592   <field id="vs"           long_name="product_of_sea_water_y_velocity_and_salinity"                   unit="PSU m/s"       grid_ref="grid_V_3D"   /> 
     593        <field id="vs_e3v"       long_name="product_of_sea_water_y_velocity_and_salinity * e3t"             unit="PSU m2/s"      grid_ref="grid_V_3D" > vs * e3v </field > 
     594   <field id="vrhop"        long_name="product_of_sea_water_y_velocity_and_potential_density"          unit="(kg/m3).(m/s)" grid_ref="grid_V_3D"   /> 
     595        <field id="vrhop_e3v"    long_name="product_of_sea_water_y_velocity_and_potential_density * e3t"    unit="(kg/m3).(m2/s)"  grid_ref="grid_V_3D" > vrhop * e3v </field > 
     596   <field id="wt"           long_name="product_of_upward_sea_water_velocity_and_potential_temperature" unit="degree_C m/s"      grid_ref="grid_W_3D"   /> 
     597   <field id="ws"           long_name="product_of_upward_sea_water_velocity_and_salinity"              unit="PSU m/s"       grid_ref="grid_W_3D"   /> 
     598   <field id="wrhop"        long_name="product_of_upward_sea_water_velocity_and_potential_density"     unit="(kg/m3).(m/s)" grid_ref="grid_W_3D"   /> 
     599   <field id="uv"           long_name="product_of_sea_water_x_velocity_and_sea_water_y_velocity"       unit="m2/s2   "      grid_ref="grid_T_3D"   /> 
     600   <field id="uw"           long_name="product_of_upward_sea_water_velocity_and_sea_water_x_velocity"  unit="m2/s2   "      grid_ref="grid_W_3D"   /> 
     601   <field id="vw"           long_name="product_of_upward_sea_water_velocity_and_sea_water_y_velocity"  unit="m2/s2"         grid_ref="grid_W_3D"   /> 
     602      </field_group> 
    543603 
    544604      <field_group id="scalar"  grid_ref="grid_scalar"  > 
     
    887947     
    888948    <field_group id="mooring" > 
    889       <field field_ref="toce"         name="thetao"   long_name="sea_water_potential_temperature"      /> 
    890       <field field_ref="soce"         name="so"       long_name="sea_water_salinity"                   /> 
     949      <!-- EOS80 --> 
     950      <field field_ref="toce_pot"         name="thetao_pot"   long_name="sea_water_potential_temperature"      /> 
     951      <field field_ref="soce_pra"         name="so_pra"       long_name="sea_water_practical_salinity"                   /> 
     952      <!-- TEOS10 --> 
     953      <field field_ref="toce_con"         name="thetao_con"   long_name="sea_water_conservative_temperature"      /> 
     954      <field field_ref="soce_abs"         name="so_con"       long_name="sea_water_absolute_salinity"                   /> 
     955 
    891956      <field field_ref="uoce"         name="uo"       long_name="sea_water_x_velocity"                 /> 
    892957      <field field_ref="voce"         name="vo"       long_name="sea_water_y_velocity"                 /> 
     
    894959      <field field_ref="avt"          name="difvho"   long_name="ocean_vertical_heat_diffusivity"      /> 
    895960      <field field_ref="avm"          name="difvmo"   long_name="ocean_vertical_momentum_diffusivity"  /> 
    896        
    897       <field field_ref="sst"          name="tos"      long_name="sea_surface_temperature"                       /> 
    898       <field field_ref="sst2"         name="tossq"    long_name="square_of_sea_surface_temperature"             /> 
    899       <field field_ref="sstgrad"      name="tosgrad"  long_name="module_of_sea_surface_temperature_gradient"    /> 
    900       <field field_ref="sss"          name="sos"      long_name="sea_surface_salinity"                          /> 
     961 
     962      <!-- EOS80 --> 
     963      <field field_ref="sst_pot"          name="tos_pot"      long_name="sea_surface_potential_temperature"                       /> 
     964      <field field_ref="sst2_pot"         name="tossq_pot"    long_name="square_of_sea_surface_potential_temperature"             /> 
     965      <field field_ref="sstgrad_pot"      name="tosgrad_pot"  long_name="module_of_sea_surface_potential_temperature_gradient"    /> 
     966      <field field_ref="sss_pra"          name="sos_pra"      long_name="sea_surface_absolute_salinity"                          /> 
     967      <!-- TEOS10 --> 
     968      <field field_ref="sst_con"          name="tos_con"      long_name="sea_surface_conservative_temperature"                       /> 
     969      <field field_ref="sst2_con"         name="tossq_con"    long_name="square_of_sea_surface_conservative_temperature"             /> 
     970      <field field_ref="sstgrad_con"      name="tosgrad_con"  long_name="module_of_sea_surface_conservative_temperature_gradient"    /> 
     971      <field field_ref="sss_abs"          name="sos"      long_name="sea_surface_absolute_salinity"                          /> 
     972 
    901973      <field field_ref="ssh"          name="zos"      long_name="sea_surface_height_above_geoid"                /> 
    902974      <field field_ref="empmr"        name="wfo"      long_name="water_flux_into_sea_water"                     /> 
     
    921993 
    922994    <field_group id="groupT" > 
    923       <field field_ref="toce"         name="thetao"   long_name="sea_water_potential_temperature"               /> 
    924       <field field_ref="soce"         name="so"       long_name="sea_water_salinity"                            /> 
    925       <field field_ref="sst"          name="tos"      long_name="sea_surface_temperature"                       /> 
    926       <field field_ref="sst2"         name="tossq"    long_name="square_of_sea_surface_temperature"             /> 
    927       <field field_ref="sss"          name="sos"      long_name="sea_surface_salinity"                          /> 
     995      <!-- EOS80 --> 
     996      <field field_ref="toce_pot"         name="thetao_pot"   long_name="sea_water_potential_temperature"               /> 
     997      <field field_ref="soce_pra"         name="so_pra"       long_name="sea_water_practical_salinity"                            /> 
     998      <field field_ref="sst_pot"          name="tos_pot"      long_name="sea_surface_potential_temperature"                       /> 
     999      <field field_ref="sst2_pot"         name="tossq_pot"    long_name="square_of_sea_surface_potential_temperature"             /> 
     1000      <field field_ref="sss_pra"          name="sos_pra"      long_name="sea_surface_practical_salinity"                          /> 
     1001      <!-- TEOS10 --> 
     1002      <field field_ref="toce_con"         name="thetao_con"   long_name="sea_water_conservative_temperature"               /> 
     1003      <field field_ref="soce_abs"         name="so_abs"       long_name="sea_water_absolute_salinity"                            /> 
     1004      <field field_ref="sst_con"          name="tos_con"      long_name="sea_surface_conservative_temperature"                       /> 
     1005      <field field_ref="sst2_con"         name="tossq_con"    long_name="square_of_sea_surface_conservative_temperature"             /> 
     1006      <field field_ref="sss_abs"          name="sos_abs"      long_name="sea_surface_absolute_salinity"                          /> 
     1007 
    9281008      <field field_ref="ssh"          name="zos"      long_name="sea_surface_height_above_geoid"                /> 
    9291009      <field field_ref="empmr"        name="wfo"      long_name="water_flux_into_sea_water"                     /> 
     
    9571037    </field_group> 
    9581038 
     1039    <!-- TMB diagnostic output --> 
     1040    <field_group  id="1h_grid_T_tmb" grid_ref="grid_T_2D" operation="instant"> 
     1041      <!-- EOS80 --> 
     1042      <field id="top_temp_pot"           name="votemper_top_pot"  unit="degC"  /> 
     1043      <field id="mid_temp_pot"           name="votemper_mid_pot"  unit="degC"  /> 
     1044      <field id="bot_temp_pot"           name="votemper_bot_pot"  unit="degC"  /> 
     1045      <field id="top_sal_pra"            name="vosaline_top_pra"  unit="psu"   /> 
     1046      <field id="mid_sal_pra"            name="vosaline_mid_pra"  unit="psu"   /> 
     1047      <field id="bot_sal_pra"            name="vosaline_bot_pra"  unit="psu"   /> 
     1048      <!-- TEOS10 --> 
     1049      <field id="top_temp_con"           name="votemper_top_con"  unit="degC"  /> 
     1050      <field id="mid_temp_con"           name="votemper_mid_con"  unit="degC"  /> 
     1051      <field id="bot_temp_con"           name="votemper_bot_con"  unit="degC"  /> 
     1052      <field id="top_sal_abs"            name="vosaline_top_abs"  unit="psu"   /> 
     1053      <field id="mid_sal_abs"            name="vosaline_mid_abs"  unit="psu"   /> 
     1054      <field id="bot_sal_abs"            name="vosaline_bot_abs"  unit="psu"   /> 
     1055 
     1056      <field id="sshnmasked"         name="sossheig"      unit="m"     />  
     1057    </field_group> 
     1058 
    9591059    <field_group  id="1h_grid_U_tmb" grid_ref="grid_U_2D" operation="instant"> 
    9601060      <field id="top_u"           name="vozocrtx_top"  unit="m/s"  /> 
     
    9731073    <!-- 25h diagnostic output --> 
    9741074    <field_group id="25h_grid_T" grid_ref="grid_T_3D" operation="instant"> 
    975       <field id="temper25h"         name="potential temperature 25h mean"    unit="degC" /> 
     1075      <!-- EOS80 --> 
     1076      <field id="temper25h_pot"         name="potential temperature 25h mean"    unit="degC" /> 
    9761077      <field id="tempis25h"         name="insitu temperature 25h mean"    unit="degC" /> 
    977       <field id="salin25h"          name="salinity 25h mean"                 unit="psu"  /> 
     1078      <field id="salin25h_pra"          name="practical salinity 25h mean"                 unit="psu"  /> 
     1079      <!-- TEOS10 --> 
     1080      <field id="temper25h_con"         name="conservative temperature 25h mean"    unit="degC" /> 
     1081      <field id="tempis25h"         name="insitu temperature 25h mean"    unit="degC" /> 
     1082      <field id="salin25h_abs"          name="absolute salinity 25h mean"                 unit="psu"  /> 
     1083 
    9781084      <field id="ssh25h"            name="sea surface height 25h mean"  grid_ref="grid_T_2D"      unit="m"    /> 
    9791085    </field_group> 
  • NEMO/branches/UKMO/NEMO_4.0.2_GO8_package/cfgs/SHARED/grid_def_nemo.xml

    r12331 r12660  
    264264        <scalar/> 
    265265      </grid> 
    266   
    267     </grid_definition>    
    268   
     266        <!--  --> 
     267       <grid id="grid_EqT" > 
     268         <domain id="EqT" /> 
     269       </grid> 
     270        <!--  --> 
     271       <grid id="gznl_T_2D"> 
     272         <domain id="ptr" /> 
     273       </grid> 
     274        <!--  --> 
     275       <grid id="gznl_T_3D"> 
     276         <domain id="ptr" /> 
     277         <axis axis_ref="deptht" /> 
     278       </grid> 
     279        <!--  --> 
     280       <grid id="gznl_W_2D"> 
     281         <domain id="ptr" /> 
     282       </grid> 
     283        <!--  --> 
     284       <grid id="gznl_W_3D"> 
     285         <domain id="ptr" /> 
     286         <axis axis_ref="depthw" /> 
     287       </grid> 
     288       <grid id="vert_sum"> 
     289         <domain id="grid_T"/> 
     290         <scalar> 
     291            <reduce_axis operation="sum" /> 
     292         </scalar> 
     293       </grid> 
     294       <grid id="zoom_300"> 
     295         <domain id="grid_T" /> 
     296         <axis axis_ref="deptht300"/> 
     297       </grid> 
     298       <grid id="zoom_300_sum"> 
     299         <domain id="grid_T" /> 
     300         <scalar> 
     301            <reduce_axis operation="sum" /> 
     302         </scalar> 
     303       </grid> 
     304       <grid id="grid_T_surface_extract"> 
     305         <domain id="grid_T" /> 
     306         <axis   axis_ref="deptht_surface" /> 
     307       </grid> 
     308 
     309    </grid_definition> 
     310     
  • NEMO/branches/UKMO/NEMO_4.0.2_GO8_package/cfgs/SHARED/namelist_ref

    r12658 r12660  
    6767   ln_xios_read = .FALSE.  !  use XIOS to read restart file (only for a single file restart) 
    6868   nn_wxios = 0      !  use XIOS to write restart file 0 - no, 1 - single file output, 2 - multiple file output 
     69   ln_rst_eos = .TRUE.     ! check if the equation of state used to produce the restart is consistent with model 
    6970/ 
    7071!----------------------------------------------------------------------- 
  • NEMO/branches/UKMO/NEMO_4.0.2_GO8_package/src/ICE/icerst.F90

    r12658 r12660  
    2323   USE in_out_manager ! I/O manager 
    2424   USE iom            ! I/O manager library 
     25   USE ioipsl, ONLY : ju2ymds    ! for calendar 
    2526   USE lib_mpp        ! MPP library 
    2627   USE lib_fortran    ! fortran utilities (glob_sum + no signed zero) 
     
    4849      INTEGER, INTENT(in) ::   kt       ! number of iteration 
    4950      ! 
     51      INTEGER             ::   iyear, imonth, iday 
     52      REAL (wp)           ::   zsec 
     53      REAL (wp)           ::   zfjulday 
    5054      CHARACTER(len=20)   ::   clkt     ! ocean time-step define as a character 
    5155      CHARACTER(len=50)   ::   clname   ! ice output restart file name 
     
    6367         IF( nitrst <= nitend .AND. nitrst > 0 ) THEN 
    6468            ! beware of the format used to write kt (default is i8.8, that should be large enough...) 
    65             IF( nitrst > 99999999 ) THEN   ;   WRITE(clkt, *       ) nitrst 
    66             ELSE                           ;   WRITE(clkt, '(i8.8)') nitrst 
     69            IF ( ln_rstdate ) THEN 
     70               zfjulday = fjulday + (2*nn_fsbc+1)*rdt / rday 
     71               IF( ABS(zfjulday - REAL(NINT(zfjulday),wp)) < 0.1 / rday )   zfjulday = REAL(NINT(zfjulday),wp)   ! avoid truncation error 
     72               CALL ju2ymds( zfjulday, iyear, imonth, iday, zsec )            
     73               WRITE(clkt, '(i4.4,2i2.2)') iyear, imonth, iday 
     74            ELSE 
     75               IF( nitrst > 99999999 ) THEN   ;   WRITE(clkt, *       ) nitrst 
     76               ELSE                           ;   WRITE(clkt, '(i8.8)') nitrst 
     77               ENDIF 
    6778            ENDIF 
    6879            ! create the file 
  • NEMO/branches/UKMO/NEMO_4.0.2_GO8_package/src/ICE/icewri.F90

    r12658 r12660  
    104104      IF( iom_use('snwthic' ) )   CALL iom_put( 'snwthic', hm_s        * zmsk00 )                                           ! snw thickness 
    105105      IF( iom_use('icebrv'  ) )   CALL iom_put( 'icebrv' , bvm_i* 100. * zmsk00 )                                           ! brine volume 
    106       IF( iom_use('iceage'  ) )   CALL iom_put( 'iceage' , om_i / rday * zmsk15 + zmiss_val * ( 1._wp - zmsk15 ) )          ! ice age 
     106      IF( iom_use('iceage'  ) )   CALL iom_put( 'iceage' , om_i / rday * zmsk15 )                                           ! ice age 
    107107      IF( iom_use('icehnew' ) )   CALL iom_put( 'icehnew', ht_i_new             )                                           ! new ice thickness formed in the leads 
    108108      IF( iom_use('snwvolu' ) )   CALL iom_put( 'snwvolu', vt_s        * zmsksn )                                           ! snow volume 
     
    117117      IF( iom_use('icevpnd' ) )   CALL iom_put( 'icevpnd', vt_ip  * zmsk00      )                                           ! melt pond total volume per unit area 
    118118      ! salt 
    119       IF( iom_use('icesalt' ) )   CALL iom_put( 'icesalt', sm_i                 * zmsk00 + zmiss_val * ( 1._wp - zmsk00 ) ) ! mean ice salinity 
     119      IF( iom_use('icesalt' ) )   CALL iom_put( 'icesalt', sm_i                 * zmsk00 )                                  ! mean ice salinity 
    120120      IF( iom_use('icesalm' ) )   CALL iom_put( 'icesalm', st_i * rhoi * 1.0e-3 * zmsk00 )                                  ! Mass of salt in sea ice per cell area 
    121121      ! heat 
    122       IF( iom_use('icetemp' ) )   CALL iom_put( 'icetemp', ( tm_i  - rt0 ) * zmsk00 + zmiss_val * ( 1._wp - zmsk00 ) )      ! ice mean temperature 
    123       IF( iom_use('snwtemp' ) )   CALL iom_put( 'snwtemp', ( tm_s  - rt0 ) * zmsksn + zmiss_val * ( 1._wp - zmsksn ) )      ! snw mean temperature 
    124       IF( iom_use('icettop' ) )   CALL iom_put( 'icettop', ( tm_su - rt0 ) * zmsk00 + zmiss_val * ( 1._wp - zmsk00 ) )      ! temperature at the ice surface 
    125       IF( iom_use('icetbot' ) )   CALL iom_put( 'icetbot', ( t_bo  - rt0 ) * zmsk00 + zmiss_val * ( 1._wp - zmsk00 ) )      ! temperature at the ice bottom 
    126       IF( iom_use('icetsni' ) )   CALL iom_put( 'icetsni', ( tm_si - rt0 ) * zmsk00 + zmiss_val * ( 1._wp - zmsk00 ) )      ! temperature at the snow-ice interface 
     122      IF( iom_use('icetemp' ) )   CALL iom_put( 'icetemp', ( tm_i  - rt0 ) * zmsk00  )                                      ! ice mean temperature 
     123      IF( iom_use('snwtemp' ) )   CALL iom_put( 'snwtemp', ( tm_s  - rt0 ) * zmsksn  )                                      ! snw mean temperature 
     124      IF( iom_use('icettop' ) )   CALL iom_put( 'icettop', ( tm_su - rt0 ) * zmsk00  )                                      ! temperature at the ice surface 
     125      IF( iom_use('icetbot' ) )   CALL iom_put( 'icetbot', ( t_bo  - rt0 ) * zmsk00  )                                      ! temperature at the ice bottom 
     126      IF( iom_use('icetsni' ) )   CALL iom_put( 'icetsni', ( tm_si - rt0 ) * zmsk00  )                                      ! temperature at the snow-ice interface 
    127127      IF( iom_use('icehc'   ) )   CALL iom_put( 'icehc'  ,  -et_i          * zmsk00 )                                       ! ice heat content 
    128128      IF( iom_use('snwhc'   ) )   CALL iom_put( 'snwhc'  ,  -et_s          * zmsksn )                                       ! snow heat content 
     
    151151      IF( iom_use('icemask_cat' ) )   CALL iom_put( 'icemask_cat' ,                  zmsk00l                                   ) ! ice mask 0% 
    152152      IF( iom_use('iceconc_cat' ) )   CALL iom_put( 'iceconc_cat' , a_i            * zmsk00l                                   ) ! area for categories 
    153       IF( iom_use('icethic_cat' ) )   CALL iom_put( 'icethic_cat' , h_i            * zmsk00l + zmiss_val * ( 1._wp - zmsk00l ) ) ! thickness for categories 
    154       IF( iom_use('snwthic_cat' ) )   CALL iom_put( 'snwthic_cat' , h_s            * zmsksnl + zmiss_val * ( 1._wp - zmsksnl ) ) ! snow depth for categories 
    155       IF( iom_use('icesalt_cat' ) )   CALL iom_put( 'icesalt_cat' , s_i            * zmsk00l + zmiss_val * ( 1._wp - zmsk00l ) ) ! salinity for categories 
    156       IF( iom_use('iceage_cat'  ) )   CALL iom_put( 'iceage_cat'  , o_i / rday     * zmsk00l + zmiss_val * ( 1._wp - zmsk00l ) ) ! ice age 
     153      IF( iom_use('icethic_cat' ) )   CALL iom_put( 'icethic_cat' , h_i            * zmsk00l                                   ) ! thickness for categories 
     154      IF( iom_use('snwthic_cat' ) )   CALL iom_put( 'snwthic_cat' , h_s            * zmsksnl                                   ) ! snow depth for categories 
     155      IF( iom_use('icesalt_cat' ) )   CALL iom_put( 'icesalt_cat' , s_i            * zmsk00l                                   ) ! salinity for categories 
     156      IF( iom_use('iceage_cat'  ) )   CALL iom_put( 'iceage_cat'  , o_i / rday     * zmsk00l                                   ) ! ice age 
    157157      IF( iom_use('icetemp_cat' ) )   CALL iom_put( 'icetemp_cat' , ( SUM( t_i, dim=3 ) * r1_nlay_i - rt0 ) & 
    158          &                                                                         * zmsk00l + zmiss_val * ( 1._wp - zmsk00l ) ) ! ice temperature 
     158         &                                                                         * zmsk00l                                   ) ! ice temperature 
    159159      IF( iom_use('snwtemp_cat' ) )   CALL iom_put( 'snwtemp_cat' , ( SUM( t_s, dim=3 ) * r1_nlay_s - rt0 ) & 
    160          &                                                                         * zmsksnl + zmiss_val * ( 1._wp - zmsksnl ) ) ! snow temperature 
    161       IF( iom_use('icettop_cat' ) )   CALL iom_put( 'icettop_cat' , ( t_su - rt0 ) * zmsk00l + zmiss_val * ( 1._wp - zmsk00l ) ) ! surface temperature 
    162       IF( iom_use('icebrv_cat'  ) )   CALL iom_put( 'icebrv_cat'  ,   bv_i * 100.  * zmsk00l + zmiss_val * ( 1._wp - zmsk00l ) ) ! brine volume 
     160         &                                                                         * zmsksnl                                   ) ! snow temperature 
     161      IF( iom_use('icettop_cat' ) )   CALL iom_put( 'icettop_cat' , ( t_su - rt0 ) * zmsk00l                                   ) ! surface temperature 
     162      IF( iom_use('icebrv_cat'  ) )   CALL iom_put( 'icebrv_cat'  ,   bv_i * 100.  * zmsk00l                                   ) ! brine volume 
    163163      IF( iom_use('iceapnd_cat' ) )   CALL iom_put( 'iceapnd_cat' ,   a_ip         * zmsk00l                                   ) ! melt pond frac for categories 
    164       IF( iom_use('icehpnd_cat' ) )   CALL iom_put( 'icehpnd_cat' ,   h_ip         * zmsk00l + zmiss_val * ( 1._wp - zmsk00l ) ) ! melt pond frac for categories 
     164      IF( iom_use('icehpnd_cat' ) )   CALL iom_put( 'icehpnd_cat' ,   h_ip         * zmsk00l                                   ) ! melt pond frac for categories 
    165165      IF( iom_use('iceafpnd_cat') )   CALL iom_put( 'iceafpnd_cat',   a_ip_frac    * zmsk00l                                   ) ! melt pond frac for categories 
    166       IF( iom_use('icealb_cat'  ) )   CALL iom_put( 'icealb_cat'  ,   alb_ice      * zmsk00l + zmiss_val * ( 1._wp - zmsk00l ) ) ! ice albedo for categories 
     166      IF( iom_use('icealb_cat'  ) )   CALL iom_put( 'icealb_cat'  ,   alb_ice      * zmsk00l                                   ) ! ice albedo for categories 
    167167 
    168168      !------------------ 
  • NEMO/branches/UKMO/NEMO_4.0.2_GO8_package/src/OCE/DIA/diawri.F90

    r12658 r12660  
    4949   USE iom            !  
    5050   USE ioipsl         !  
    51  
     51   USE eosbn2 
    5252#if defined key_si3 
    5353   USE ice  
     
    113113      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj)     ::   z2d   ! 2D workspace 
    114114      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk) ::   z3d   ! 3D workspace 
     115      CHARACTER(len=4),SAVE :: ttype , stype           ! temperature and salinity type 
    115116      !!---------------------------------------------------------------------- 
    116117      !  
     118      IF( kt == nit000 ) THEN 
     119         IF( ln_TEOS10 ) THEN 
     120            IF ( iom_use("toce_pot") .OR. iom_use("soce_pra") .OR. iom_use("sst_pot") .OR. iom_use("sss_pra") & 
     121                  & .OR. iom_use("sbt_pot") .OR. iom_use("sbs_pra") .OR. iom_use("sstgrad_pot") .OR. iom_use("sstgrad2_pot") & 
     122                  & .OR. iom_use("tosmint_pot") .OR. iom_use("somint_pra"))  THEN  
     123               CALL ctl_stop( 'diawri: potential temperature and practical salinity not available with ln_TEOS10' ) 
     124            ELSE 
     125               ttype='con' ; stype='abs'   ! teos-10 using conservative temperature and absolute salinity 
     126            ENDIF  
     127         ELSE IF( ln_EOS80  ) THEN 
     128            IF ( iom_use("toce_con") .OR. iom_use("soce_abs") .OR. iom_use("sst_con") .OR. iom_use("sss_abs") & 
     129                  & .OR. iom_use("sbt_con") .OR. iom_use("sbs_abs") .OR. iom_use("sstgrad_con") .OR. iom_use("sstgrad2_con") & 
     130                  & .OR. iom_use("tosmint_con") .OR. iom_use("somint_abs"))  THEN  
     131               CALL ctl_stop( 'diawri: conservative temperature and absolute salinity not available with ln_EOS80' ) 
     132            ELSE 
     133               ttype='pot' ; stype='pra'   ! eos-80 using potential temperature and practical salinity 
     134            ENDIF 
     135         ELSE IF ( ln_SEOS) THEN 
     136            ttype='seos' ; stype='seos' ! seos using Simplified Equation of state 
     137         ENDIF 
     138      ENDIF 
     139 
    117140      IF( ln_timing )   CALL timing_start('dia_wri') 
    118141      !  
     
    144167         CALL iom_put( "wetdep" , ht_0(:,:) + sshn(:,:) ) 
    145168       
    146       CALL iom_put( "toce", tsn(:,:,:,jp_tem) )    ! 3D temperature 
    147       CALL iom_put(  "sst", tsn(:,:,1,jp_tem) )    ! surface temperature 
    148       IF ( iom_use("sbt") ) THEN 
     169      CALL iom_put( "toce_"//ttype, tsn(:,:,:,jp_tem) )    ! 3D temperature 
     170      CALL iom_put(  "sst_"//ttype, tsn(:,:,1,jp_tem) )    ! surface temperature 
     171      IF ( iom_use("sbt_"//ttype) ) THEN 
    149172         DO jj = 1, jpj 
    150173            DO ji = 1, jpi 
     
    153176            END DO 
    154177         END DO 
    155          CALL iom_put( "sbt", z2d )                ! bottom temperature 
     178         CALL iom_put( "sbt_"//ttype, z2d )                ! bottom temperature 
    156179      ENDIF 
    157180       
    158       CALL iom_put( "soce", tsn(:,:,:,jp_sal) )    ! 3D salinity 
    159       CALL iom_put(  "sss", tsn(:,:,1,jp_sal) )    ! surface salinity 
    160       IF ( iom_use("sbs") ) THEN 
     181      CALL iom_put( "soce_"//stype, tsn(:,:,:,jp_sal) )    ! 3D salinity 
     182      CALL iom_put(  "sss_"//stype, tsn(:,:,1,jp_sal) )    ! surface salinity 
     183      IF ( iom_use("sbs_"//stype) ) THEN 
    161184         DO jj = 1, jpj 
    162185            DO ji = 1, jpi 
     
    165188            END DO 
    166189         END DO 
    167          CALL iom_put( "sbs", z2d )                ! bottom salinity 
     190         CALL iom_put( "sbs_"//stype, z2d )                ! bottom salinity 
    168191      ENDIF 
    169192 
     
    231254      IF( iom_use('logavs') )   CALL iom_put( "logavs", LOG( MAX( 1.e-20_wp, avs(:,:,:) ) ) ) 
    232255 
    233       IF ( iom_use("sstgrad") .OR. iom_use("sstgrad2") ) THEN 
     256      IF ( iom_use("sstgrad_"//ttype) .OR. iom_use("sstgrad2_"//ttype) ) THEN 
    234257         DO jj = 2, jpjm1                                    ! sst gradient 
    235258            DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
     
    242265         END DO 
    243266         CALL lbc_lnk( 'diawri', z2d, 'T', 1. ) 
    244          CALL iom_put( "sstgrad2",  z2d )          ! square of module of sst gradient 
     267         CALL iom_put( "sstgrad2_"//ttype,  z2d )          ! square of module of sst gradient 
    245268         z2d(:,:) = SQRT( z2d(:,:) ) 
    246          CALL iom_put( "sstgrad" ,  z2d )          ! module of sst gradient 
     269         CALL iom_put( "sstgrad_"//ttype ,  z2d )          ! module of sst gradient 
    247270      ENDIF 
    248271          
     
    363386      ENDIF 
    364387 
    365       IF( iom_use("tosmint") ) THEN 
     388      IF( iom_use("tosmint_"//ttype) ) THEN 
    366389         z2d(:,:) = 0._wp 
    367390         DO jk = 1, jpkm1 
     
    373396         END DO 
    374397         CALL lbc_lnk( 'diawri', z2d, 'T', -1. ) 
    375          CALL iom_put( "tosmint", rau0 * z2d )        ! Vertical integral of temperature 
    376       ENDIF 
    377       IF( iom_use("somint") ) THEN 
     398         CALL iom_put( "tosmint_"//ttype, rau0 * z2d )        ! Vertical integral of temperature 
     399      ENDIF 
     400      IF( iom_use("somint_"//stype) ) THEN 
    378401         z2d(:,:)=0._wp 
    379402         DO jk = 1, jpkm1 
     
    385408         END DO 
    386409         CALL lbc_lnk( 'diawri', z2d, 'T', -1. ) 
    387          CALL iom_put( "somint", rau0 * z2d )         ! Vertical integral of salinity 
     410         CALL iom_put( "somint_"//stype, rau0 * z2d )         ! Vertical integral of salinity 
    388411      ENDIF 
    389412 
     
    923946         CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'sdvecrtz', wsd            )    ! now StokesDrift k-velocity 
    924947      ENDIF 
    925   
    926948#if defined key_si3 
    927949      IF( nn_ice == 2 ) THEN   ! condition needed in case agrif + ice-model but no-ice in child grid 
  • NEMO/branches/UKMO/NEMO_4.0.2_GO8_package/src/OCE/DOM/domain.F90

    r12658 r12660  
    292292         &             nn_it000, nn_itend , nn_date0    , nn_time0     , nn_leapy  , nn_istate ,     & 
    293293         &             nn_stock, nn_write , ln_mskland  , ln_clobber   , nn_chunksz, nn_euler  ,     & 
    294          &             ln_cfmeta, ln_iscpl, ln_xios_read, nn_wxios 
     294         &             ln_cfmeta, ln_iscpl, ln_xios_read, nn_wxios, ln_rstdate, ln_rst_eos 
     295 
    295296      NAMELIST/namdom/ ln_linssh, rn_isfhmin, rn_rdt, rn_atfp, ln_crs, ln_meshmask 
    296297#if defined key_netcdf4 
     
    340341#endif 
    341342         WRITE(numout,*) '      mask land points                ln_mskland      = ', ln_mskland 
     343         WRITE(numout,*) '      date-stamp restart files        ln_rstdate = ', ln_rstdate 
    342344         WRITE(numout,*) '      additional CF standard metadata ln_cfmeta       = ', ln_cfmeta 
    343345         WRITE(numout,*) '      overwrite an existing file      ln_clobber      = ', ln_clobber 
    344346         WRITE(numout,*) '      NetCDF chunksize (bytes)        nn_chunksz      = ', nn_chunksz 
    345347         WRITE(numout,*) '      IS coupling at the restart step ln_iscpl        = ', ln_iscpl 
     348         WRITE(numout,*) '      check restart equation of state ln_rst_eos      = ', ln_rst_eos 
     349 
    346350         IF( TRIM(Agrif_CFixed()) == '0' ) THEN 
    347351            WRITE(numout,*) '      READ restart for a single file using XIOS ln_xios_read =', ln_xios_read 
  • NEMO/branches/UKMO/NEMO_4.0.2_GO8_package/src/OCE/DOM/dommsk.F90

    r12658 r12660  
    3232   USE lbclnk         ! ocean lateral boundary conditions (or mpp link) 
    3333   USE lib_mpp        ! Massively Parallel Processing library 
     34   USE iom             ! For shlat2d 
     35   USE fldread         ! for sn_shlat2d 
    3436 
    3537   IMPLICIT NONE 
     
    9294      INTEGER  ::   iktop, ikbot   !   -       - 
    9395      INTEGER  ::   ios, inum 
    94       REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) ::   zwf   ! 2D workspace 
    95       !! 
    96       NAMELIST/namlbc/ rn_shlat, ln_vorlat 
     96      !! 
     97      INTEGER  :: inum             !  logical unit for shlat2d 
     98      REAL(wp) :: zshlat           !: locally modified shlat for some strait 
     99      REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: zshlat2d 
     100      LOGICAL                         :: ln_shlat2d 
     101      CHARACTER(len = 256)            :: cn_shlat2d_file, cn_shlat2d_var   
     102      !! 
     103      NAMELIST/namlbc/ rn_shlat, ln_vorlat, ln_shlat2d, cn_shlat2d_file, cn_shlat2d_var 
    97104      NAMELIST/nambdy/ ln_bdy ,nb_bdy, ln_coords_file, cn_coords_file,         & 
    98105         &             ln_mask_file, cn_mask_file, cn_dyn2d, nn_dyn2d_dta,     & 
     
    121128      ! 
    122129      IF(lwp) WRITE(numout,*) 
    123       IF     (      rn_shlat == 0.               ) THEN   ;   IF(lwp) WRITE(numout,*) '   ==>>>   ocean lateral  free-slip' 
    124       ELSEIF (      rn_shlat == 2.               ) THEN   ;   IF(lwp) WRITE(numout,*) '   ==>>>   ocean lateral  no-slip' 
    125       ELSEIF ( 0. < rn_shlat .AND. rn_shlat < 2. ) THEN   ;   IF(lwp) WRITE(numout,*) '   ==>>>   ocean lateral  partial-slip' 
    126       ELSEIF ( 2. < rn_shlat                     ) THEN   ;   IF(lwp) WRITE(numout,*) '   ==>>>   ocean lateral  strong-slip' 
     130 
     131      IF ( ln_shlat2d ) THEN 
     132         IF(lwp) WRITE(numout,*) '         READ shlat as a 2D coefficient in a file ' 
     133         ALLOCATE( zshlat2d(jpi,jpj) ) 
     134         CALL iom_open(TRIM(cn_shlat2d_file), inum) 
     135         CALL iom_get (inum, jpdom_data, TRIM(cn_shlat2d_var), zshlat2d, 1) ! 
     136         CALL iom_close(inum) 
    127137      ELSE 
    128          CALL ctl_stop( 'dom_msk: wrong value for rn_shlat (i.e. a negalive value). We stop.' ) 
     138         IF     (      rn_shlat == 0.               ) THEN   ;   IF(lwp) WRITE(numout,*) '   ==>>>   ocean lateral  free-slip' 
     139         ELSEIF (      rn_shlat == 2.               ) THEN   ;   IF(lwp) WRITE(numout,*) '   ==>>>   ocean lateral  no-slip' 
     140         ELSEIF ( 0. < rn_shlat .AND. rn_shlat < 2. ) THEN   ;   IF(lwp) WRITE(numout,*) '   ==>>>   ocean lateral  partial-slip' 
     141         ELSEIF ( 2. < rn_shlat                     ) THEN   ;   IF(lwp) WRITE(numout,*) '   ==>>>   ocean lateral  strong-slip' 
     142         ELSE 
     143            CALL ctl_stop( 'dom_msk: wrong value for rn_shlat (i.e. a negalive value). We stop.' ) 
     144         ENDIF 
    129145      ENDIF 
    130146 
     
    241257      ! Lateral boundary conditions on velocity (modify fmask) 
    242258      ! ---------------------------------------   
    243       IF( rn_shlat /= 0 ) THEN      ! Not free-slip lateral boundary condition 
    244          ! 
    245          ALLOCATE( zwf(jpi,jpj) ) 
     259      IF( rn_shlat /= 0 .or. ln_shlat2d ) THEN      ! Not free-slip lateral boundary condition everywhere 
    246260         ! 
    247261         DO jk = 1, jpk 
    248             zwf(:,:) = fmask(:,:,jk)          
    249             DO jj = 2, jpjm1 
    250                DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
    251                   IF( fmask(ji,jj,jk) == 0._wp ) THEN 
    252                      fmask(ji,jj,jk) = rn_shlat * MIN( 1._wp , MAX( zwf(ji+1,jj), zwf(ji,jj+1),   & 
    253                         &                                           zwf(ji-1,jj), zwf(ji,jj-1)  )  ) 
    254                   ENDIF 
     262            IF (  ln_shlat2d ) THEN 
     263               DO jj = 2, jpjm1 
     264                  DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
     265                     IF( fmask(ji,jj,jk) == 0._wp ) THEN 
     266                        fmask(ji,jj,jk) = zshlat2d(ji,jj) * MIN( 1._wp , MAX( umask(ji,jj,jk), umask(ji,jj+1,jk),   & 
     267                           &                                                  vmask(ji,jj,jk), vmask(ji+1,jj,jk)  )  ) 
     268                     ENDIF 
     269                  END DO 
    255270               END DO 
    256             END DO 
     271            ELSE 
     272               DO jj = 2, jpjm1 
     273                  DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
     274                     IF( fmask(ji,jj,jk) == 0._wp ) THEN 
     275                        fmask(ji,jj,jk) = rn_shlat * MIN( 1._wp , MAX( umask(ji,jj,jk), umask(ji,jj+1,jk),   & 
     276                           &                                           vmask(ji,jj,jk), vmask(ji+1,jj,jk)   )  ) 
     277                     ENDIF 
     278                  END DO 
     279               END DO 
     280            ENDIF 
    257281            DO jj = 2, jpjm1 
    258282               IF( fmask(1,jj,jk) == 0._wp ) THEN 
    259                   fmask(1  ,jj,jk) = rn_shlat * MIN( 1._wp , MAX( zwf(2,jj), zwf(1,jj+1), zwf(1,jj-1) ) ) 
     283                  fmask(1  ,jj,jk) = rn_shlat * MIN( 1._wp , MAX( vmask(2,jj,jk), umask(1,jj+1,jk), umask(1,jj,jk) ) ) 
    260284               ENDIF 
    261285               IF( fmask(jpi,jj,jk) == 0._wp ) THEN 
    262                   fmask(jpi,jj,jk) = rn_shlat * MIN( 1._wp , MAX( zwf(jpi,jj+1), zwf(jpim1,jj), zwf(jpi,jj-1) ) ) 
     286                  fmask(jpi,jj,jk) = rn_shlat * MIN( 1._wp , MAX( umask(jpi,jj+1,jk), vmask(jpim1,jj,jk), umask(jpi,jj-1,jk) ) ) 
    263287               ENDIF 
    264288            END DO          
    265289            DO ji = 2, jpim1 
    266290               IF( fmask(ji,1,jk) == 0._wp ) THEN 
    267                   fmask(ji, 1 ,jk) = rn_shlat * MIN( 1._wp , MAX( zwf(ji+1,1), zwf(ji,2), zwf(ji-1,1) ) ) 
     291                  fmask(ji, 1 ,jk) = rn_shlat * MIN( 1._wp , MAX( vmask(ji+1,1,jk), umask(ji,2,jk), vmask(ji,1,jk) ) ) 
    268292               ENDIF 
    269293               IF( fmask(ji,jpj,jk) == 0._wp ) THEN 
    270                   fmask(ji,jpj,jk) = rn_shlat * MIN( 1._wp , MAX( zwf(ji+1,jpj), zwf(ji-1,jpj), zwf(ji,jpjm1) ) ) 
     294                  fmask(ji,jpj,jk) = rn_shlat * MIN( 1._wp , MAX( vmask(ji+1,jpj,jk), vmask(ji-1,jpj,jk), umask(ji,jpjm1,jk) ) ) 
    271295               ENDIF 
    272296            END DO 
     
    281305         END DO 
    282306         ! 
    283          DEALLOCATE( zwf ) 
     307         IF( ln_shlat2d ) DEALLOCATE( zshlat2d ) 
    284308         ! 
    285309         CALL lbc_lnk( 'dommsk', fmask, 'F', 1._wp )      ! Lateral boundary conditions on fmask 
  • NEMO/branches/UKMO/NEMO_4.0.2_GO8_package/src/OCE/ICB/icbrst.F90

    r12658 r12660  
    2525   USE netcdf         ! netcdf routines for IO 
    2626   USE iom 
     27   USE ioipsl, ONLY : ju2ymds    ! for calendar 
    2728   USE icb_oce        ! define iceberg arrays 
    2829   USE icbutl         ! iceberg utility routines 
     
    190191      INTEGER ::   jn   ! dummy loop index 
    191192      INTEGER ::   ix_dim, iy_dim, ik_dim, in_dim 
    192       CHARACTER(len=256)     :: cl_path 
    193       CHARACTER(len=256)     :: cl_filename 
     193      INTEGER             ::   iyear, imonth, iday 
     194      REAL (wp)           ::   zsec 
     195      REAL (wp)           ::   zfjulday 
     196      CHARACTER(len=256)  :: cl_path 
     197      CHARACTER(len=256)  :: cl_filename 
     198      CHARACTER(LEN=20)   ::   clkt     ! ocean time-step deine as a character 
    194199      TYPE(iceberg), POINTER :: this 
    195200      TYPE(point)  , POINTER :: pt 
     
    206211         cl_path = TRIM(cn_ocerst_outdir) 
    207212         IF( cl_path(LEN_TRIM(cl_path):) /= '/' ) cl_path = TRIM(cl_path) // '/' 
     213         IF ( ln_rstdate ) THEN 
     214            zfjulday = fjulday + rdt / rday 
     215            IF( ABS(zfjulday - REAL(NINT(zfjulday),wp)) < 0.1 / rday )   zfjulday = REAL(NINT(zfjulday),wp)   ! avoid truncation error 
     216            CALL ju2ymds( zfjulday, iyear, imonth, iday, zsec )            
     217            WRITE(clkt, '(i4.4,2i2.2)') iyear, imonth, iday 
     218         ELSE 
     219            IF( kt > 999999999 ) THEN   ;   WRITE(clkt, *       ) kt 
     220            ELSE                        ;   WRITE(clkt, '(i8.8)') kt 
     221            ENDIF 
     222         ENDIF 
    208223         IF( lk_mpp ) THEN 
    209             WRITE(cl_filename,'(A,"_icebergs_",I8.8,"_restart_",I4.4,".nc")') TRIM(cexper), kt, narea-1 
     224            WRITE(cl_filename,'(A,"_icebergs_",A,"_restart_",I4.4,".nc")') TRIM(cexper), TRIM(ADJUSTL(clkt)), narea-1 
    210225         ELSE 
    211             WRITE(cl_filename,'(A,"_icebergs_",I8.8,"_restart.nc")') TRIM(cexper), kt 
     226            WRITE(cl_filename,'(A,"_icebergs_",A,"_restart.nc")') TRIM(cexper), TRIM(ADJUSTL(clkt)) 
    212227         ENDIF 
    213228         IF ( lwp .AND. nn_verbose_level >= 0) WRITE(numout,'(2a)') 'icebergs, write_restart: creating ',  & 
  • NEMO/branches/UKMO/NEMO_4.0.2_GO8_package/src/OCE/IOM/in_out_manager.F90

    r12658 r12660  
    2828   LOGICAL       ::   ln_rstart        !: start from (F) rest or (T) a restart file 
    2929   LOGICAL       ::   ln_rst_list      !: output restarts at list of times (T) or by frequency (F) 
     30   LOGICAL       ::   ln_rst_eos       !: check equation of state used for the restart is consistent with model 
    3031   INTEGER       ::   nn_rstctl        !: control of the time step (0, 1 or 2) 
    3132   INTEGER       ::   nn_rstssh   = 0  !: hand made initilization of ssh or not (1/0) 
     
    4041   INTEGER, DIMENSION(10) :: nn_stocklist  !: restart dump times 
    4142   LOGICAL       ::   ln_mskland       !: mask land points in NetCDF outputs (costly: + ~15%) 
     43   LOGICAL       ::   ln_rstdate       !: T=> stamp output restart files with date instead of timestep 
    4244   LOGICAL       ::   ln_cfmeta        !: output additional data to netCDF files required for compliance with the CF metadata standard 
    4345   LOGICAL       ::   ln_clobber       !: clobber (overwrite) an existing file 
  • NEMO/branches/UKMO/NEMO_4.0.2_GO8_package/src/OCE/IOM/iom.F90

    r12658 r12660  
    369369!from restart.F90 
    370370   CALL iom_set_rstw_var_active("rdt") 
     371   CALL iom_set_rstw_var_active("neos") 
     372 
    371373   IF ( .NOT. ln_diurnal_only ) THEN 
    372374        CALL iom_set_rstw_var_active('ub'  ) 
     
    418420        i = 0 
    419421        i = i + 1; fields(i)%vname="rdt";            fields(i)%grid="grid_scalar" 
     422        i = i + 1; fields(i)%vname="neos";           fields(i)%grid="grid_scalar" 
    420423        i = i + 1; fields(i)%vname="un";             fields(i)%grid="grid_N_3D" 
    421424        i = i + 1; fields(i)%vname="ub";             fields(i)%grid="grid_N_3D" 
  • NEMO/branches/UKMO/NEMO_4.0.2_GO8_package/src/OCE/IOM/restart.F90

    r12658 r12660  
    2727   USE in_out_manager  ! I/O manager 
    2828   USE iom             ! I/O module 
     29   USE ioipsl, ONLY : ju2ymds    ! for calendar 
    2930   USE diurnal_bulk 
    3031   USE lib_mpp         ! distribued memory computing library 
     
    5960      INTEGER, INTENT(in) ::   kt     ! ocean time-step 
    6061      !! 
     62      INTEGER             ::   iyear, imonth, iday 
     63      REAL (wp)           ::   zsec 
     64      REAL (wp)           ::   zfjulday 
    6165      CHARACTER(LEN=20)   ::   clkt     ! ocean time-step deine as a character 
    6266      CHARACTER(LEN=50)   ::   clname   ! ocean output restart file name 
     
    9094         IF( nitrst <= nitend .AND. nitrst > 0 ) THEN  
    9195            ! beware of the format used to write kt (default is i8.8, that should be large enough...) 
    92             IF( nitrst > 999999999 ) THEN   ;   WRITE(clkt, *       ) nitrst 
    93             ELSE                            ;   WRITE(clkt, '(i8.8)') nitrst 
     96            IF ( ln_rstdate ) THEN 
     97               zfjulday = fjulday + rdt / rday 
     98               IF( ABS(zfjulday - REAL(NINT(zfjulday),wp)) < 0.1 / rday )   zfjulday = REAL(NINT(zfjulday),wp)   ! avoid truncation error 
     99               CALL ju2ymds( zfjulday, iyear, imonth, iday, zsec )            
     100               WRITE(clkt, '(i4.4,2i2.2)') iyear, imonth, iday 
     101            ELSE 
     102               IF( nitrst > 999999999 ) THEN   ;   WRITE(clkt, *       ) nitrst 
     103               ELSE                            ;   WRITE(clkt, '(i8.8)') nitrst 
     104               ENDIF 
    94105            ENDIF 
    95106            ! create the file 
     
    173184                  END IF 
    174185      ENDIF 
     186                     CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'neos'    , REAL(neos)      , ldxios = lwxios)   ! equation of state 
     187                     !CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'neos'    , neos      , ktype = jp_i1, ldxios = lwxios)   ! equation of state 
     188 
    175189       
    176190      IF (ln_diurnal) CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'Dsst', x_dsst, ldxios = lwxios )   
     
    249263      !!---------------------------------------------------------------------- 
    250264      REAL(wp) ::   zrdt 
     265      REAL(wp) ::   zeos 
    251266      INTEGER  ::   jk 
    252267      REAL(wp), DIMENSION(jpi, jpj, jpk) :: w3d 
     
    255270      CALL rst_read_open           ! open restart for reading (if not already opened) 
    256271 
     272      IF ( ln_rst_eos ) THEN 
     273         ! Check equation of state used is consistent with the restart 
     274         IF( iom_varid( numror, 'neos') == -1) THEN 
     275            CALL ctl_stop( 'restart, rst_read: variable neos not found. STOP check that the equations of state in the restart file and in the namelist nameos are consistent and use ln_rst_eos=F') 
     276         ELSE 
     277            CALL iom_get( numror, 'neos', zeos, ldxios = lrxios ) 
     278            IF ( INT(zeos) /= neos ) CALL ctl_stop( 'restart, rst_read: equation of state used in restart file differs from namelist nameos') 
     279         ENDIF 
     280      ENDIF 
     281 
    257282      ! Check dynamics and tracer time-step consistency and force Euler restart if changed 
    258       IF( iom_varid( numror, 'rdt', ldstop = .FALSE. ) > 0 )   THEN 
     283      IF( iom_varid( numror, 'rdt', ldstop = .FALSE. ) > 0 )   THEN  
    259284         CALL iom_get( numror, 'rdt', zrdt, ldxios = lrxios ) 
    260285         IF( zrdt /= rdt )   neuler = 0 
  • NEMO/branches/UKMO/NEMO_4.0.2_GO8_package/src/OCE/SBC/sbcssm.F90

    r12658 r12660  
    5757      REAL(wp) ::   zcoef, zf_sbc       ! local scalar 
    5858      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpts) :: zts 
     59      CHARACTER(len=4),SAVE :: stype 
    5960      !!--------------------------------------------------------------------- 
     61      IF( kt == nit000 ) THEN 
     62         IF( ln_TEOS10 ) THEN 
     63            stype='abs'   ! teos-10: using absolute salinity (sst is converted to potential temperature for the surface module) 
     64         ELSE IF( ln_EOS80  ) THEN 
     65            stype='pra'   ! eos-80: using practical salinity 
     66         ELSE IF ( ln_SEOS) THEN 
     67            stype='seos' ! seos using Simplified Equation of state (sst is converted to potential temperature for the surface module) 
     68         ENDIF 
     69      ENDIF 
    6070      ! 
    6171      !                                        !* surface T-, U-, V- ocean level variables (T, S, depth, velocity) 
     
    174184         CALL iom_put( 'ssu_m', ssu_m ) 
    175185         CALL iom_put( 'ssv_m', ssv_m ) 
    176          CALL iom_put( 'sst_m', sst_m ) 
    177          CALL iom_put( 'sss_m', sss_m ) 
     186         CALL iom_put( 'sst_m_pot', sst_m ) 
     187         CALL iom_put( 'sss_m_'//stype, sss_m ) 
    178188         CALL iom_put( 'ssh_m', ssh_m ) 
    179189         CALL iom_put( 'e3t_m', e3t_m ) 
  • NEMO/branches/UKMO/NEMO_4.0.2_GO8_package/src/OCE/TRA/trabbl.F90

    r12658 r12660  
    513513      IF( tra_bbl_alloc() /= 0 )   CALL ctl_stop( 'STOP', 'tra_bbl_init : unable to allocate arrays' ) 
    514514      ! 
    515       IF( nn_bbl_adv == 1 )    WRITE(numout,*) '       * Advective BBL using upper velocity' 
    516       IF( nn_bbl_adv == 2 )    WRITE(numout,*) '       * Advective BBL using velocity = F( delta rho)' 
     515      IF(lwp) THEN 
     516         IF( nn_bbl_adv == 1 )    WRITE(numout,*) '       * Advective BBL using upper velocity' 
     517         IF( nn_bbl_adv == 2 )    WRITE(numout,*) '       * Advective BBL using velocity = F( delta rho)' 
     518      ENDIF 
    517519      ! 
    518520      !                             !* vertical index of  "deep" bottom u- and v-points 
  • NEMO/branches/UKMO/NEMO_4.0.2_GO8_package/src/OCE/ZDF/zdfmxl.F90

    r12658 r12660  
    1515   USE trc_oce  , ONLY: l_offline         ! ocean space and time domain variables 
    1616   USE zdf_oce        ! ocean vertical physics 
     17   USE eosbn2         ! for zdf_mxl_zint 
    1718   ! 
    1819   USE in_out_manager ! I/O manager 
     
    3132   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:) ::   hmlp    !: mixed layer depth  (rho=rho0+zdcrit) [m]   (used by LDF) 
    3233   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:) ::   hmlpt   !: depth of the last T-point inside the mixed layer [m] (used by LDF) 
     34   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE,       DIMENSION(:,:) ::   hmld_zint  !: vertically-interpolated mixed layer depth   [m] 
     35   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE,       DIMENSION(:,:) ::   htc_mld    ! Heat content of hmld_zint 
     36   LOGICAL, PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:)    :: ll_found   ! Is T_b to be found by interpolation ? 
     37   LOGICAL, PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:)  :: ll_belowml ! Flag points below mixed layer when ll_found=F 
    3338 
    3439   REAL(wp), PUBLIC ::   rho_c = 0.01_wp    !: density criterion for mixed layer depth 
    3540   REAL(wp), PUBLIC ::   avt_c = 5.e-4_wp   ! Kz criterion for the turbocline depth 
     41 
     42   TYPE, PUBLIC :: MXL_ZINT   !: Structure for MLD defs 
     43      INTEGER   :: mld_type   ! mixed layer type      
     44      REAL(wp)  :: zref       ! depth of initial T_ref 
     45      REAL(wp)  :: dT_crit    ! Critical temp diff 
     46      REAL(wp)  :: iso_frac   ! Fraction of rn_dT_crit  
     47   END TYPE MXL_ZINT 
    3648 
    3749   !!---------------------------------------------------------------------- 
     
    4860      zdf_mxl_alloc = 0      ! set to zero if no array to be allocated 
    4961      IF( .NOT. ALLOCATED( nmln ) ) THEN 
    50          ALLOCATE( nmln(jpi,jpj), hmld(jpi,jpj), hmlp(jpi,jpj), hmlpt(jpi,jpj), STAT= zdf_mxl_alloc ) 
     62         ALLOCATE( nmln(jpi,jpj), hmld(jpi,jpj), hmlp(jpi,jpj), hmlpt(jpi,jpj), hmld_zint(jpi,jpj),     & 
     63   &          htc_mld(jpi,jpj), ll_found(jpi,jpj), ll_belowml(jpi,jpj,jpk), STAT= zdf_mxl_alloc )          
    5164         ! 
    5265         CALL mpp_sum ( 'zdfmxl', zdf_mxl_alloc ) 
     
    137150      ENDIF 
    138151      ! 
     152      ! Vertically-interpolated mixed-layer depth diagnostic 
     153      CALL zdf_mxl_zint( kt ) 
     154      ! 
    139155      IF(ln_ctl)   CALL prt_ctl( tab2d_1=REAL(nmln,wp), clinfo1=' nmln : ', tab2d_2=hmlp, clinfo2=' hmlp : ' ) 
    140156      ! 
    141157   END SUBROUTINE zdf_mxl 
     158 
     159   SUBROUTINE zdf_mxl_zint_mld( sf )  
     160      !!----------------------------------------------------------------------------------  
     161      !!                    ***  ROUTINE zdf_mxl_zint_mld  ***  
     162      !                                                                         
     163      !   Calculate vertically-interpolated mixed layer depth diagnostic.  
     164      !             
     165      !   This routine can calculate the mixed layer depth diagnostic suggested by 
     166      !   Kara et al, 2000, JGR, 105, 16803, but is more general and can calculate 
     167      !   vertically-interpolated mixed-layer depth diagnostics with other parameter 
     168      !   settings set in the namzdf_mldzint namelist.   
     169      !  
     170      !   If mld_type=1 the mixed layer depth is calculated as the depth at which the   
     171      !   density has increased by an amount equivalent to a temperature difference of   
     172      !   0.8C at the surface.  
     173      !  
     174      !   For other values of mld_type the mixed layer is calculated as the depth at   
     175      !   which the temperature differs by 0.8C from the surface temperature.   
     176      !                                                                         
     177      !   David Acreman, Daley Calvert                                       
     178      !  
     179      !!-----------------------------------------------------------------------------------  
     180 
     181      TYPE(MXL_ZINT), INTENT(in)  :: sf 
     182 
     183      ! Diagnostic criteria 
     184      INTEGER   :: nn_mld_type   ! mixed layer type      
     185      REAL(wp)  :: rn_zref       ! depth of initial T_ref 
     186      REAL(wp)  :: rn_dT_crit    ! Critical temp diff 
     187      REAL(wp)  :: rn_iso_frac   ! Fraction of rn_dT_crit used 
     188 
     189      ! Local variables 
     190      REAL(wp), PARAMETER :: zepsilon = 1.e-30          ! local small value 
     191      INTEGER, DIMENSION(jpi,jpj) :: ikmt          ! number of active tracer levels  
     192      INTEGER, DIMENSION(jpi,jpj) :: ik_ref        ! index of reference level  
     193      INTEGER, DIMENSION(jpi,jpj) :: ik_iso        ! index of last uniform temp level  
     194      REAL, DIMENSION(jpi,jpj,jpk)  :: zT            ! Temperature or density  
     195      REAL, DIMENSION(jpi,jpj)    :: ppzdep        ! depth for use in calculating d(rho)  
     196      REAL, DIMENSION(jpi,jpj)    :: zT_ref        ! reference temperature  
     197      REAL    :: zT_b                                   ! base temperature  
     198      REAL, DIMENSION(jpi,jpj,jpk)  :: zdTdz         ! gradient of zT  
     199      REAL, DIMENSION(jpi,jpj,jpk)  :: zmoddT        ! Absolute temperature difference  
     200      REAL    :: zdz                                    ! depth difference  
     201      REAL    :: zdT                                    ! temperature difference  
     202      REAL, DIMENSION(jpi,jpj)    :: zdelta_T      ! difference critereon  
     203      REAL, DIMENSION(jpi,jpj)    :: zRHO1, zRHO2  ! Densities  
     204      INTEGER :: ji, jj, jk                             ! loop counter  
     205 
     206      !!-------------------------------------------------------------------------------------  
     207      !   
     208      ! Unpack structure 
     209      nn_mld_type = sf%mld_type 
     210      rn_zref     = sf%zref 
     211      rn_dT_crit  = sf%dT_crit 
     212      rn_iso_frac = sf%iso_frac 
     213 
     214      ! Set the mixed layer depth criterion at each grid point  
     215      IF( nn_mld_type == 0 ) THEN 
     216         zdelta_T(:,:) = rn_dT_crit 
     217         zT(:,:,:) = rhop(:,:,:) 
     218      ELSE IF( nn_mld_type == 1 ) THEN 
     219         ppzdep(:,:)=0.0  
     220         call eos ( tsn(:,:,1,:), ppzdep(:,:), zRHO1(:,:) )  
     221! Use zT temporarily as a copy of tsn with rn_dT_crit added to SST  
     222! [assumes number of tracers less than number of vertical levels]  
     223         zT(:,:,1:jpts)=tsn(:,:,1,1:jpts)  
     224         zT(:,:,jp_tem)=zT(:,:,1)+rn_dT_crit  
     225         CALL eos( zT(:,:,1:jpts), ppzdep(:,:), zRHO2(:,:) )  
     226         zdelta_T(:,:) = abs( zRHO1(:,:) - zRHO2(:,:) ) * rau0  
     227         ! RHO from eos (2d version) doesn't calculate north or east halo:  
     228         CALL lbc_lnk( 'zdfmxl', zdelta_T, 'T', 1. )  
     229         zT(:,:,:) = rhop(:,:,:)  
     230      ELSE  
     231         zdelta_T(:,:) = rn_dT_crit                       
     232         zT(:,:,:) = tsn(:,:,:,jp_tem)                            
     233      END IF  
     234 
     235      ! Calculate the gradient of zT and absolute difference for use later  
     236      DO jk = 1 ,jpk-2  
     237         zdTdz(:,:,jk)  =    ( zT(:,:,jk+1) - zT(:,:,jk) ) / e3w_n(:,:,jk+1)  
     238         zmoddT(:,:,jk) = abs( zT(:,:,jk+1) - zT(:,:,jk) )  
     239      END DO  
     240 
     241      ! Find density/temperature at the reference level (Kara et al use 10m).           
     242      ! ik_ref is the index of the box centre immediately above or at the reference level  
     243      ! Find rn_zref in the array of model level depths and find the ref     
     244      ! density/temperature by linear interpolation.                                    
     245      DO jk = jpkm1, 2, -1  
     246         WHERE ( gdept_n(:,:,jk) > rn_zref )  
     247           ik_ref(:,:) = jk - 1  
     248           zT_ref(:,:) = zT(:,:,jk-1) + zdTdz(:,:,jk-1) * ( rn_zref - gdept_n(:,:,jk-1) )  
     249         END WHERE  
     250      END DO  
     251 
     252      ! If the first grid box centre is below the reference level then use the  
     253      ! top model level to get zT_ref  
     254      WHERE ( gdept_n(:,:,1) > rn_zref )   
     255         zT_ref = zT(:,:,1)  
     256         ik_ref = 1  
     257      END WHERE  
     258 
     259      ! The number of active tracer levels is 1 less than the number of active w levels  
     260      ikmt(:,:) = mbkt(:,:) - 1  
     261 
     262      ! Initialize / reset 
     263      ll_found(:,:) = .false. 
     264 
     265      IF ( rn_iso_frac - zepsilon > 0. ) THEN 
     266         ! Search for a uniform density/temperature region where adjacent levels           
     267         ! differ by less than rn_iso_frac * deltaT.                                       
     268         ! ik_iso is the index of the last level in the uniform layer   
     269         ! ll_found indicates whether the mixed layer depth can be found by interpolation  
     270         ik_iso(:,:)   = ik_ref(:,:)  
     271         DO jj = 1, nlcj  
     272            DO ji = 1, nlci  
     273!CDIR NOVECTOR  
     274               DO jk = ik_ref(ji,jj), ikmt(ji,jj)-1  
     275                  IF ( zmoddT(ji,jj,jk) > ( rn_iso_frac * zdelta_T(ji,jj) ) ) THEN  
     276                     ik_iso(ji,jj)   = jk  
     277                     ll_found(ji,jj) = ( zmoddT(ji,jj,jk) > zdelta_T(ji,jj) )  
     278                     EXIT  
     279                  END IF  
     280               END DO  
     281            END DO  
     282         END DO  
     283 
     284         ! Use linear interpolation to find depth of mixed layer base where possible  
     285         hmld_zint(:,:) = rn_zref  
     286         DO jj = 1, jpj  
     287            DO ji = 1, jpi  
     288               IF (ll_found(ji,jj) .and. tmask(ji,jj,1) == 1.0) THEN  
     289                  zdz =  abs( zdelta_T(ji,jj) / zdTdz(ji,jj,ik_iso(ji,jj)) )  
     290                  hmld_zint(ji,jj) = gdept_n(ji,jj,ik_iso(ji,jj)) + zdz  
     291               END IF  
     292            END DO  
     293         END DO  
     294      END IF 
     295 
     296      ! If ll_found = .false. then calculate MLD using difference of zdelta_T     
     297      ! from the reference density/temperature  
     298  
     299! Prevent this section from working on land points  
     300      WHERE ( tmask(:,:,1) /= 1.0 )  
     301         ll_found = .true.  
     302      END WHERE  
     303  
     304      DO jk=1, jpk  
     305         ll_belowml(:,:,jk) = abs( zT(:,:,jk) - zT_ref(:,:) ) >= zdelta_T(:,:)   
     306      END DO  
     307  
     308! Set default value where interpolation cannot be used (ll_found=false)   
     309      DO jj = 1, jpj  
     310         DO ji = 1, jpi  
     311            IF ( .not. ll_found(ji,jj) )  hmld_zint(ji,jj) = gdept_n(ji,jj,ikmt(ji,jj))  
     312         END DO  
     313      END DO  
     314 
     315      DO jj = 1, jpj  
     316         DO ji = 1, jpi  
     317!CDIR NOVECTOR  
     318            DO jk = ik_ref(ji,jj)+1, ikmt(ji,jj)  
     319               IF ( ll_found(ji,jj) ) EXIT  
     320               IF ( ll_belowml(ji,jj,jk) ) THEN                 
     321                  zT_b = zT_ref(ji,jj) + zdelta_T(ji,jj) * SIGN(1.0, zdTdz(ji,jj,jk-1) )  
     322                  zdT  = zT_b - zT(ji,jj,jk-1)                                       
     323                  zdz  = zdT / zdTdz(ji,jj,jk-1)                                        
     324                  hmld_zint(ji,jj) = gdept_n(ji,jj,jk-1) + zdz  
     325                  EXIT                                                    
     326               END IF  
     327            END DO  
     328         END DO  
     329      END DO  
     330 
     331      hmld_zint(:,:) = hmld_zint(:,:)*tmask(:,:,1)  
     332      !   
     333   END SUBROUTINE zdf_mxl_zint_mld 
     334 
     335   SUBROUTINE zdf_mxl_zint_htc( kt ) 
     336      !!---------------------------------------------------------------------- 
     337      !!                  ***  ROUTINE zdf_mxl_zint_htc  *** 
     338      !!  
     339      !! ** Purpose :    
     340      !! 
     341      !! ** Method  :    
     342      !!---------------------------------------------------------------------- 
     343 
     344      INTEGER, INTENT(in) ::   kt   ! ocean time-step index 
     345 
     346      INTEGER :: ji, jj, jk 
     347      INTEGER :: ikmax 
     348      REAL(wp) :: zc, zcoef 
     349      ! 
     350      INTEGER,  ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) ::   ilevel 
     351      REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) ::   zthick_0, zthick 
     352 
     353      !!---------------------------------------------------------------------- 
     354 
     355      IF( .NOT. ALLOCATED(ilevel) ) THEN 
     356         ALLOCATE( ilevel(jpi,jpj), zthick_0(jpi,jpj), & 
     357         &         zthick(jpi,jpj), STAT=ji ) 
     358         IF( lk_mpp  )   CALL mpp_sum( 'zdfmxl', ji ) 
     359         IF( ji /= 0 )   CALL ctl_stop( 'STOP', 'zdf_mxl_zint_htc : unable to allocate arrays' ) 
     360      ENDIF 
     361 
     362      ! Find last whole model T level above the MLD 
     363      ilevel(:,:)   = 0 
     364      zthick_0(:,:) = 0._wp 
     365 
     366      DO jk = 1, jpkm1   
     367         DO jj = 1, jpj 
     368            DO ji = 1, jpi                     
     369               zthick_0(ji,jj) = zthick_0(ji,jj) + e3t_n(ji,jj,jk) 
     370               IF( zthick_0(ji,jj) < hmld_zint(ji,jj) )   ilevel(ji,jj) = jk 
     371            END DO 
     372         END DO 
     373         WRITE(numout,*) 'zthick_0(jk =',jk,') =',zthick_0(2,2) 
     374         WRITE(numout,*) 'gdepw_n(jk+1 =',jk+1,') =',gdepw_n(2,2,jk+1) 
     375      END DO 
     376 
     377      ! Surface boundary condition 
     378      IF( ln_linssh ) THEN  ;   zthick(:,:) = sshn(:,:)   ;   htc_mld(:,:) = tsn(:,:,1,jp_tem) * sshn(:,:) * tmask(:,:,1)    
     379      ELSE                  ;   zthick(:,:) = 0._wp       ;   htc_mld(:,:) = 0._wp                                    
     380      ENDIF 
     381 
     382      ! Deepest whole T level above the MLD 
     383      ikmax = MIN( MAXVAL( ilevel(:,:) ), jpkm1 ) 
     384 
     385      ! Integration down to last whole model T level 
     386      DO jk = 1, ikmax 
     387         DO jj = 1, jpj 
     388            DO ji = 1, jpi 
     389               zc = e3t_n(ji,jj,jk) * REAL( MIN( MAX( 0, ilevel(ji,jj) - jk + 1 ) , 1  )  )    ! 0 below ilevel 
     390               zthick(ji,jj) = zthick(ji,jj) + zc 
     391               htc_mld(ji,jj) = htc_mld(ji,jj) + zc * tsn(ji,jj,jk,jp_tem) * tmask(ji,jj,jk) 
     392            END DO 
     393         END DO 
     394      END DO 
     395 
     396      ! Subsequent partial T level 
     397      zthick(:,:) = hmld_zint(:,:) - zthick(:,:)   !   remaining thickness to reach MLD 
     398 
     399      DO jj = 1, jpj 
     400         DO ji = 1, jpi 
     401            htc_mld(ji,jj) = htc_mld(ji,jj) + tsn(ji,jj,ilevel(ji,jj)+1,jp_tem)  &  
     402      &                      * MIN( e3t_n(ji,jj,ilevel(ji,jj)+1), zthick(ji,jj) ) * tmask(ji,jj,ilevel(ji,jj)+1) 
     403         END DO 
     404      END DO 
     405 
     406      WRITE(numout,*) 'htc_mld(after) =',htc_mld(2,2) 
     407 
     408      ! Convert to heat content 
     409      zcoef = rau0 * rcp 
     410      htc_mld(:,:) = zcoef * htc_mld(:,:) 
     411 
     412   END SUBROUTINE zdf_mxl_zint_htc 
     413 
     414   SUBROUTINE zdf_mxl_zint( kt ) 
     415      !!---------------------------------------------------------------------- 
     416      !!                  ***  ROUTINE zdf_mxl_zint  *** 
     417      !!  
     418      !! ** Purpose :    
     419      !! 
     420      !! ** Method  :    
     421      !!---------------------------------------------------------------------- 
     422 
     423      INTEGER, INTENT(in) ::   kt   ! ocean time-step index 
     424 
     425      INTEGER :: ios 
     426      INTEGER :: jn 
     427 
     428      INTEGER :: nn_mld_diag = 0    ! number of diagnostics 
     429 
     430      CHARACTER(len=1) :: cmld 
     431 
     432      TYPE(MXL_ZINT) :: sn_mld1, sn_mld2, sn_mld3, sn_mld4, sn_mld5 
     433      TYPE(MXL_ZINT), SAVE, DIMENSION(5) ::   mld_diags 
     434 
     435      NAMELIST/namzdf_mldzint/ nn_mld_diag, sn_mld1, sn_mld2, sn_mld3, sn_mld4, sn_mld5 
     436 
     437      !!---------------------------------------------------------------------- 
     438       
     439      IF( kt == nit000 ) THEN 
     440         REWIND( numnam_ref )              ! Namelist namzdf_mldzint in reference namelist  
     441         READ  ( numnam_ref, namzdf_mldzint, IOSTAT = ios, ERR = 901) 
     442901      IF( ios /= 0 ) CALL ctl_nam ( ios , 'namzdf_mldzint in reference namelist' ) 
     443 
     444         REWIND( numnam_cfg )              ! Namelist namzdf_mldzint in configuration namelist  
     445         READ  ( numnam_cfg, namzdf_mldzint, IOSTAT = ios, ERR = 902 ) 
     446902      IF( ios /= 0 ) CALL ctl_nam ( ios , 'namzdf_mldzint in configuration namelist' ) 
     447         IF(lwm) WRITE ( numond, namzdf_mldzint ) 
     448 
     449         IF( nn_mld_diag > 5 )   CALL ctl_stop( 'STOP', 'zdf_mxl_ini: Specify no more than 5 MLD definitions' ) 
     450 
     451         mld_diags(1) = sn_mld1 
     452         mld_diags(2) = sn_mld2 
     453         mld_diags(3) = sn_mld3 
     454         mld_diags(4) = sn_mld4 
     455         mld_diags(5) = sn_mld5 
     456 
     457         IF( lwp .AND. (nn_mld_diag > 0) ) THEN 
     458            WRITE(numout,*) '=============== Vertically-interpolated mixed layer ================' 
     459            WRITE(numout,*) '(Diagnostic number, nn_mld_type, rn_zref, rn_dT_crit, rn_iso_frac)' 
     460            DO jn = 1, nn_mld_diag 
     461               WRITE(numout,*) 'MLD criterion',jn,':' 
     462               WRITE(numout,*) '    nn_mld_type =', mld_diags(jn)%mld_type 
     463               WRITE(numout,*) '    rn_zref ='    , mld_diags(jn)%zref 
     464               WRITE(numout,*) '    rn_dT_crit =' , mld_diags(jn)%dT_crit 
     465               WRITE(numout,*) '    rn_iso_frac =', mld_diags(jn)%iso_frac 
     466            END DO 
     467            WRITE(numout,*) '====================================================================' 
     468         ENDIF 
     469      ENDIF 
     470 
     471      IF( nn_mld_diag > 0 ) THEN 
     472         DO jn = 1, nn_mld_diag 
     473            WRITE(cmld,'(I1)') jn 
     474            IF( iom_use( "mldzint_"//cmld ) .OR. iom_use( "mldhtc_"//cmld ) ) THEN 
     475               CALL zdf_mxl_zint_mld( mld_diags(jn) ) 
     476 
     477               IF( iom_use( "mldzint_"//cmld ) ) THEN 
     478                  CALL iom_put( "mldzint_"//cmld, hmld_zint(:,:) ) 
     479               ENDIF 
     480 
     481               IF( iom_use( "mldhtc_"//cmld ) )  THEN 
     482                  CALL zdf_mxl_zint_htc( kt ) 
     483                  CALL iom_put( "mldhtc_"//cmld , htc_mld(:,:)   ) 
     484               ENDIF 
     485            ENDIF 
     486         END DO 
     487      ENDIF 
     488 
     489   END SUBROUTINE zdf_mxl_zint 
    142490 
    143491   !!====================================================================== 
  • NEMO/branches/UKMO/NEMO_4.0.2_GO8_package/src/OCE/step.F90

    r12658 r12660  
    209209      IF( ln_diaptr  )   CALL dia_ptr                 ! Poleward adv/ldf TRansports diagnostics 
    210210      IF( ln_diaharm )   CALL dia_harm( kstp )        ! Tidal harmonic analysis 
     211                         CALL dia_prod( kstp )        ! ocean model: product diagnostics 
    211212                         CALL dia_wri ( kstp )        ! ocean model: outputs 
    212213      ! 
  • NEMO/branches/UKMO/NEMO_4.0.2_GO8_package/src/OCE/step_oce.F90

    r12658 r12660  
    8080   USE diahsb          ! heat, salt and volume budgets    (dia_hsb routine) 
    8181   USE diaharm 
     82   USE diaprod 
    8283   USE diacfl 
    8384   USE diaobs          ! Observation operator 
  • NEMO/branches/UKMO/NEMO_4.0.2_GO8_package/src/SAS/sbcssm.F90

    r12658 r12660  
    7777      REAL(wp) ::   ztinta     ! ratio applied to after  records when doing time interpolation 
    7878      REAL(wp) ::   ztintb     ! ratio applied to before records when doing time interpolation 
    79       !!---------------------------------------------------------------------- 
     79      CHARACTER(len=4),SAVE :: stype 
     80      !!--------------------------------------------------------------------- 
     81      IF( kt == nit000 ) THEN 
     82         IF( ln_TEOS10 ) THEN 
     83            stype='abs'   ! teos-10: using absolute salinity (sst is converted to potential temperature for the surface module) 
     84         ELSE IF( ln_EOS80  ) THEN 
     85            stype='pra'   ! eos-80: using practical salinity 
     86         ELSE IF ( ln_SEOS) THEN 
     87            stype='seos' ! seos using Simplified Equation of state (sst is converted to potential temperature for the surface module) 
     88         ENDIF 
     89      ENDIF 
    8090      ! 
    8191      IF( ln_timing )   CALL timing_start( 'sbc_ssm') 
     
    144154         CALL iom_put( 'ssu_m', ssu_m ) 
    145155         CALL iom_put( 'ssv_m', ssv_m ) 
    146          CALL iom_put( 'sst_m', sst_m ) 
    147          CALL iom_put( 'sss_m', sss_m ) 
     156         CALL iom_put( 'sst_m_pot', sst_m ) 
     157         CALL iom_put( 'sss_m_'//stype, sss_m ) 
    148158         CALL iom_put( 'ssh_m', ssh_m ) 
    149159         IF( .NOT.ln_linssh )   CALL iom_put( 'e3t_m', e3t_m ) 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.