New URL for NEMO forge!   http://forge.nemo-ocean.eu

Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
This present forge is now archived and remained online for history.
Changeset 13742 for NEMO/branches/2020/dev_r13383_HPC-02_Daley_Tiling/tests/VORTEX – NEMO

Ignore:
Timestamp:
2020-11-06T15:28:05+01:00 (4 years ago)
Author:
hadcv
Message:

#2365: Merge in trunk changes to [13688] for code other than src/cfgs

Location:
NEMO/branches/2020/dev_r13383_HPC-02_Daley_Tiling
Files:
6 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed

  • NEMO/branches/2020/dev_r13383_HPC-02_Daley_Tiling

    • Property svn:externals

      •  

        old new  
        88 
        99# SETTE 
        10 ^/utils/CI/sette@13382        sette 
         10^/utils/CI/sette@13559        sette 

  • NEMO/branches/2020/dev_r13383_HPC-02_Daley_Tiling/tests/VORTEX/EXPREF/1_context_nemo.xml

    r12276 r13742  
    1111       <variable id="ref_month" type="int"> 01 </variable> 
    1212       <variable id="ref_day"   type="int"> 01 </variable> 
    13        <variable id="rau0"      type="float" > 1026.0 </variable> 
     13       <variable id="rho0"      type="float" > 1026.0 </variable> 
    1414       <variable id="cpocean"   type="float" > 3991.86795711963 </variable> 
    1515       <variable id="convSpsu"  type="float" > 0.99530670233846  </variable> 

  • NEMO/branches/2020/dev_r13383_HPC-02_Daley_Tiling/tests/VORTEX/EXPREF/1_namelist_cfg

    r13216 r13742  
    105105!!                                                                    !! 
    106106!!   namdrg        top/bottom drag coefficient                          (default: NO selection) 
    107 !!   namdrg_top    top    friction                                      (ln_OFF=F & ln_isfcav=T) 
    108 !!   namdrg_bot    bottom friction                                      (ln_OFF=F) 
     107!!   namdrg_top    top    friction                                      (ln_drg_OFF=F & ln_isfcav=T) 
     108!!   namdrg_bot    bottom friction                                      (ln_drg_OFF=F) 
    109109!!   nambbc        bottom temperature boundary condition                (default: OFF) 
    110110!!   nambbl        bottom boundary layer scheme                         (default: OFF) 
    … …  
    114114&namdrg        !   top/bottom drag coefficient                          (default: NO selection) 
    115115!----------------------------------------------------------------------- 
    116    ln_OFF     = .true.    !  free-slip       : Cd = 0 
     116   ln_drg_OFF = .true.     !  free-slip       : Cd = 0                  (F => fill namdrg_bot 
    117117/ 
    118118!!====================================================================== 
    … …  
    131131!----------------------------------------------------------------------- 
    132132   ln_seos     = .true.         !  = Use simplified equation of state (S-EOS) 
    133       !                            !  rd(T,S,Z)*rau0 = -a0*(1+.5*lambda*dT+mu*Z+nu*dS)*dT+b0*dS 
     133      !                            !  rd(T,S,Z)*rho0 = -a0*(1+.5*lambda*dT+mu*Z+nu*dS)*dT+b0*dS 
    134134      rn_a0       =  0.28        !  thermal expension coefficient (for simplified equation of state) 
    135135      rn_b0       =  0.          !  saline  expension coefficient (for simplified equation of state) 
    … …  
    266266!!                                                                    !! 
    267267!!   namtrd       dynamics and/or tracer trends                         (default: OFF) 
    268 !!   namptr       Poleward Transport Diagnostics                        (default: OFF) 
    269268!!   namhsb       Heat and salt budgets                                 (default: OFF) 
    270269!!   namdiu       Cool skin and warm layer models                       (default: OFF) 

  • NEMO/branches/2020/dev_r13383_HPC-02_Daley_Tiling/tests/VORTEX/EXPREF/context_nemo.xml

    r12276 r13742  
    1111       <variable id="ref_month" type="int"> 01 </variable> 
    1212       <variable id="ref_day"   type="int"> 01 </variable> 
    13        <variable id="rau0"      type="float" > 1026.0 </variable> 
     13       <variable id="rho0"      type="float" > 1026.0 </variable> 
    1414       <variable id="cpocean"   type="float" > 3991.86795711963 </variable> 
    1515       <variable id="convSpsu"  type="float" > 0.99530670233846  </variable> 

  • NEMO/branches/2020/dev_r13383_HPC-02_Daley_Tiling/tests/VORTEX/EXPREF/namelist_cfg

    r12489 r13742  
    9999!!                                                                    !! 
    100100!!   namdrg        top/bottom drag coefficient                          (default: NO selection) 
    101 !!   namdrg_top    top    friction                                      (ln_OFF=F & ln_isfcav=T) 
    102 !!   namdrg_bot    bottom friction                                      (ln_OFF=F) 
     101!!   namdrg_top    top    friction                                      (ln_drg_OFF=F & ln_isfcav=T) 
     102!!   namdrg_bot    bottom friction                                      (ln_drg_OFF=F) 
    103103!!   nambbc        bottom temperature boundary condition                (default: OFF) 
    104104!!   nambbl        bottom boundary layer scheme                         (default: OFF) 
    … …  
    108108&namdrg        !   top/bottom drag coefficient                          (default: NO selection) 
    109109!----------------------------------------------------------------------- 
    110    ln_OFF     = .true.    !  free-slip       : Cd = 0 
     110   ln_drg_OFF  = .true.   !  free-slip       : Cd = 0                  (F => fill namdrg_bot 
    111111/ 
    112112!!====================================================================== 
    … …  
    125125!----------------------------------------------------------------------- 
    126126   ln_seos     = .true.         !  = Use simplified equation of state (S-EOS) 
    127    !                            !  rd(T,S,Z)*rau0 = -a0*(1+.5*lambda*dT+mu*Z+nu*dS)*dT+b0*dS 
     127   !                            !  rd(T,S,Z)*rho0 = -a0*(1+.5*lambda*dT+mu*Z+nu*dS)*dT+b0*dS 
    128128   rn_a0       =  0.28        !  thermal expension coefficient (for simplified equation of state) 
    129129   rn_b0       =  0.          !  saline  expension coefficient (for simplified equation of state) 
    … …  
    259259!!                                                                    !! 
    260260!!   namtrd       dynamics and/or tracer trends                         (default: OFF) 
    261 !!   namptr       Poleward Transport Diagnostics                        (default: OFF) 
    262261!!   namhsb       Heat and salt budgets                                 (default: OFF) 
    263262!!   namdiu       Cool skin and warm layer models                       (default: OFF) 

  • NEMO/branches/2020/dev_r13383_HPC-02_Daley_Tiling/tests/VORTEX/MY_SRC/domvvl.F90

    r13295 r13742  
    99   !!            3.6  !  2014-11  (P. Mathiot) add ice shelf capability 
    1010   !!            4.1  !  2019-08  (A. Coward, D. Storkey) rename dom_vvl_sf_swp -> dom_vvl_sf_update for new timestepping 
     11   !!            4.x  ! 2020-02  (G. Madec, S. Techene) introduce ssh to h0 ratio 
    1112   !!---------------------------------------------------------------------- 
    1213 
    13    !!---------------------------------------------------------------------- 
    14    !!   dom_vvl_init     : define initial vertical scale factors, depths and column thickness 
    15    !!   dom_vvl_sf_nxt   : Compute next vertical scale factors 
    16    !!   dom_vvl_sf_update   : Swap vertical scale factors and update the vertical grid 
    17    !!   dom_vvl_interpol : Interpolate vertical scale factors from one grid point to another 
    18    !!   dom_vvl_rst      : read/write restart file 
    19    !!   dom_vvl_ctl      : Check the vvl options 
    20    !!---------------------------------------------------------------------- 
    2114   USE oce             ! ocean dynamics and tracers 
    2215   USE phycst          ! physical constant 
    … …  
    3629   PRIVATE 
    3730 
    38    PUBLIC  dom_vvl_init       ! called by domain.F90 
    39    PUBLIC  dom_vvl_zgr        ! called by isfcpl.F90 
    40    PUBLIC  dom_vvl_sf_nxt     ! called by step.F90 
    41    PUBLIC  dom_vvl_sf_update  ! called by step.F90 
    42    PUBLIC  dom_vvl_interpol   ! called by dynnxt.F90 
    43  
    4431   !                                                      !!* Namelist nam_vvl 
    4532   LOGICAL , PUBLIC :: ln_vvl_zstar           = .FALSE.    ! zstar  vertical coordinate 
    … …  
    6350   REAL(wp)        , ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:)   :: frq_rst_hdv                 ! retoring period for low freq. divergence 
    6451 
     52#if defined key_qco 
     53   !!---------------------------------------------------------------------- 
     54   !!   'key_qco'      EMPTY MODULE      Quasi-Eulerian vertical coordonate 
     55   !!---------------------------------------------------------------------- 
     56#else 
     57   !!---------------------------------------------------------------------- 
     58   !!   Default key      Old management of time varying vertical coordinate 
     59   !!---------------------------------------------------------------------- 
     60    
     61   !!---------------------------------------------------------------------- 
     62   !!   dom_vvl_init     : define initial vertical scale factors, depths and column thickness 
     63   !!   dom_vvl_sf_nxt   : Compute next vertical scale factors 
     64   !!   dom_vvl_sf_update   : Swap vertical scale factors and update the vertical grid 
     65   !!   dom_vvl_interpol : Interpolate vertical scale factors from one grid point to another 
     66   !!   dom_vvl_rst      : read/write restart file 
     67   !!   dom_vvl_ctl      : Check the vvl options 
     68   !!---------------------------------------------------------------------- 
     69 
     70   PUBLIC  dom_vvl_init       ! called by domain.F90 
     71   PUBLIC  dom_vvl_zgr        ! called by isfcpl.F90 
     72   PUBLIC  dom_vvl_sf_nxt     ! called by step.F90 
     73   PUBLIC  dom_vvl_sf_update  ! called by step.F90 
     74   PUBLIC  dom_vvl_interpol   ! called by dynnxt.F90 
     75    
    6576   !! * Substitutions 
    6677#  include "do_loop_substitute.h90" 
    … …  
    135146      ! 
    136147   END SUBROUTINE dom_vvl_init 
    137    ! 
     148 
     149 
    138150   SUBROUTINE dom_vvl_zgr(Kbb, Kmm, Kaa) 
    139151      !!---------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    261273            IF( cn_cfg == "orca" .OR. cn_cfg == "ORCA" ) THEN 
    262274               IF( nn_cfg == 3 ) THEN   ! ORCA2: Suppress ztilde in the Foxe Basin for ORCA2 
    263                   ii0 = 103   ;   ii1 = 111        
    264                   ij0 = 128   ;   ij1 = 135   ;    
     275                  ii0 = 103 + nn_hls - 1   ;   ii1 = 111 + nn_hls - 1       
     276                  ij0 = 128 + nn_hls       ;   ij1 = 135 + nn_hls 
    265277                  frq_rst_e3t( mi0(ii0):mi1(ii1) , mj0(ij0):mj1(ij1) ) =  0.0_wp 
    266278                  frq_rst_hdv( mi0(ii0):mi1(ii1) , mj0(ij0):mj1(ij1) ) =  1.e0_wp / rn_Dt 
    … …  
    322334      LOGICAL                ::   ll_do_bclinic         ! local logical 
    323335      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj)     ::   zht, z_scale, zwu, zwv, zhdiv 
    324       REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk) ::   ze3t 
     336      REAL(wp), DIMENSION(:,:,:), ALLOCATABLE ::   ze3t 
     337      LOGICAL , DIMENSION(:,:,:), ALLOCATABLE ::   llmsk 
    325338      !!---------------------------------------------------------------------- 
    326339      ! 
    … …  
    435448         ! Maximum deformation control 
    436449         ! ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 
    437          ze3t(:,:,jpk) = 0._wp 
    438          DO jk = 1, jpkm1 
    439             ze3t(:,:,jk) = tilde_e3t_a(:,:,jk) / e3t_0(:,:,jk) * tmask(:,:,jk) * tmask_i(:,:) 
    440          END DO 
    441          z_tmax = MAXVAL( ze3t(:,:,:) ) 
    442          CALL mpp_max( 'domvvl', z_tmax )                 ! max over the global domain 
    443          z_tmin = MINVAL( ze3t(:,:,:) ) 
    444          CALL mpp_min( 'domvvl', z_tmin )                 ! min over the global domain 
     450         ALLOCATE( ze3t(jpi,jpj,jpk), llmsk(jpi,jpj,jpk) ) 
     451         DO_3D( 0, 0, 0, 0, 1, jpkm1 ) 
     452            ze3t(ji,jj,jk) = tilde_e3t_a(ji,jj,jk) / e3t_0(ji,jj,jk) * tmask(ji,jj,jk) * tmask_i(ji,jj) 
     453         END_3D 
     454         ! 
     455         llmsk(   1:Nis1,:,:) = .FALSE.   ! exclude halos from the checked region 
     456         llmsk(Nie1: jpi,:,:) = .FALSE. 
     457         llmsk(:,   1:Njs1,:) = .FALSE. 
     458         llmsk(:,Nje1: jpj,:) = .FALSE. 
     459         ! 
     460         llmsk(Nis0:Nie0,Njs0:Nje0,:) = tmask(Nis0:Nie0,Njs0:Nje0,:) == 1._wp                  ! define only the inner domain 
     461         z_tmax = MAXVAL( ze3t(:,:,:), mask = llmsk )   ;   CALL mpp_max( 'domvvl', z_tmax )   ! max over the global domain 
     462         z_tmin = MINVAL( ze3t(:,:,:), mask = llmsk )   ;   CALL mpp_min( 'domvvl', z_tmin )   ! min over the global domain 
    445463         ! - ML - test: for the moment, stop simulation for too large e3_t variations 
    446464         IF( ( z_tmax >  rn_zdef_max ) .OR. ( z_tmin < - rn_zdef_max ) ) THEN 
    447             IF( lk_mpp ) THEN 
    448                CALL mpp_maxloc( 'domvvl', ze3t, tmask, z_tmax, ijk_max ) 
    449                CALL mpp_minloc( 'domvvl', ze3t, tmask, z_tmin, ijk_min ) 
    450             ELSE 
    451                ijk_max = MAXLOC( ze3t(:,:,:) ) 
    452                ijk_max(1) = mig0_oldcmp(ijk_max(1)) 
    453                ijk_max(2) = mjg0_oldcmp(ijk_max(2)) 
    454                ijk_min = MINLOC( ze3t(:,:,:) ) 
    455                ijk_min(1) = mig0_oldcmp(ijk_min(1)) 
    456                ijk_min(2) = mjg0_oldcmp(ijk_min(2)) 
    457             ENDIF 
     465            CALL mpp_maxloc( 'domvvl', ze3t, llmsk, z_tmax, ijk_max ) 
     466            CALL mpp_minloc( 'domvvl', ze3t, llmsk, z_tmin, ijk_min ) 
    458467            IF (lwp) THEN 
    459468               WRITE(numout, *) 'MAX( tilde_e3t_a(:,:,:) / e3t_0(:,:,:) ) =', z_tmax 
    … …  
    464473            ENDIF 
    465474         ENDIF 
     475         DEALLOCATE( ze3t, llmsk ) 
    466476         ! - ML - end test 
    467477         ! - ML - Imposing these limits will cause a baroclinicity error which is corrected for below 
    … …  
    10301040   END SUBROUTINE dom_vvl_ctl 
    10311041 
     1042#endif 
     1043 
    10321044   !!====================================================================== 
    10331045END MODULE domvvl 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.