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Changeset 2417 – NEMO

Changeset 2417


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Timestamp:
2010-11-22T08:58:05+01:00 (13 years ago)
Author:
gm
Message:

v3.3beta: review of config. namelist (diff= true changes not style)

Location:
branches/nemo_v3_3_beta/NEMOGCM/CONFIG
Files:
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  • branches/nemo_v3_3_beta/NEMOGCM/CONFIG/GYRE/EXP00/namelist

    r2399 r2417  
    11!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
    22!! NEMO/OPA  :  1 - run manager      (namrun) 
    3 !! namelists    2 - Domain           (namzgr, namzgr_sco, namdom) 
     3!! namelists    2 - Domain           (namzgr, namzgr_sco, namdom, namdta_tem, namdta_sal) 
    44!!              3 - Surface boundary (namsbc, namsbc_ana, namsbc_flx, namsbc_clio, namsbc_core 
    5 !!                                    namsbc_cpl, namqsr, namsbc_rnf, namsbc_ssr, namsbc_alb) 
     5!!                                    namsbc_cpl, namsbc_cpl_co2 namtra_qsr, namsbc_rnf,  
     6!!                                    namsbc_apr, namsbc_ssr, namsbc_alb) 
    67!!              4 - lateral boundary (namlbc, namcla, namobc, namagrif, nambdy, nambdy_tide) 
    78!!              5 - bottom  boundary (nambfr, nambbc, nambbl) 
     
    910!!              7 - dynamics         (namdyn_adv, namdyn_vor, namdyn_hpg, namdyn_spg, namdyn_ldf) 
    1011!!              8 - Verical physics  (namzdf, namzdf_ric, namzdf_tke, namzdf_kpp, namzdf_ddm, namzdf_tmx) 
    11 !!              9 - diagnostics      (namtrd, namgap, namspr, namflo, namptr) 
    12 !!              9 - miscellaneous    (namsol, nammpp, nammpp_dyndist, namctl) 
     12!!              9 - diagnostics      (namnc4, namtrd, namspr, namflo, namptr, namhsb) 
     13!!             10 - miscellaneous    (namsol, nammpp, nammpp_dyndist, namctl) 
     14!!             11 - Obs & Assim      (namobs, nam_asminc) 
    1315!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
    1416!  CAUTION: some scripts does not support CAPITALs for logical use .true./.false., not .TRUE./.FALSE. 
     
    1719!!                   ***  Run management namelists  *** 
    1820!!====================================================================== 
    19 !!   namrun            parameters of the run 
    20 !!====================================================================== 
    21  
     21!!   namrun        parameters of the run 
     22!!====================================================================== 
     23! 
    2224!----------------------------------------------------------------------- 
    2325&namrun        !   parameters of the run 
     
    4345   cn_ocerst_out = "restart"   !  suffix of ocean restart name (output) 
    4446/ 
    45 !!====================================================================== 
    46 !!   namnc4            netcdf4 chunking and compression settings 
    47 !!====================================================================== 
    48 !----------------------------------------------------------------------- 
    49 &namnc4         !  netcdf4 chunking and compression settings     ("key_netcdf4") 
    50                 !  (ignored if "key_netcdf4" is not used) 
    51 !----------------------------------------------------------------------- 
    52    nn_nchunks_i   =   4       !  number of chunks in i-dimension 
    53    nn_nchunks_j   =   4       !  number of chunks in j-dimension 
    54    nn_nchunks_k   =   31      !  number of chunks in k-dimension 
    55                               !  setting nn_nchunks_k = jpk will give a chunk size of 1 in the vertical which 
    56                               !  is optimal for postprocessing which works exclusively with horizontal slabs 
    57    ln_nc4zip      =   .TRUE.  !  (T) use netcdf4 chunking and compression 
    58                               !  (F) ignore chunking information and produce netcdf3-compatible files 
    59 / 
     47 
    6048!!====================================================================== 
    6149!!                      ***  Domain namelists  *** 
     
    6452!!   namzgr_sco   s-coordinate or hybrid z-s-coordinate 
    6553!!   namdom       space and time domain (bathymetry, mesh, timestep) 
    66 !!====================================================================== 
    67  
     54!!   namdta_tem   data: temperature                                     ("key_dtatem") 
     55!!   namdta_sal   data: salinity                                        ("key_dtasal") 
     56!!====================================================================== 
     57! 
    6858!----------------------------------------------------------------------- 
    6959&namzgr        !   vertical coordinate 
     
    10393   rn_rdth     =  800.           !  depth variation of tracer time step  (used if nacc=1) 
    10494/ 
     95!----------------------------------------------------------------------- 
     96&namdta_tem    !   data : temperature                                   ("key_dtatem") 
     97!----------------------------------------------------------------------- 
     98!              ! file name ! frequency (hours)    ! variable ! time interp. ! clim  !'yearly' or ! weights  ! rotation ! 
     99!              !           !  (if <0  months)     !   name   !  (logical)   ! (T/F) ! 'monthly'  ! filename ! pairing  ! 
     100   sn_tem = 'data_1m_potential_temperature_nomask', -1,'votemper',  .true.  , .true., 'yearly'   , ' '      , ' ' 
     101   ! 
     102   cn_dir       = './'     !  root directory for the location of the runoff files 
     103/ 
     104!----------------------------------------------------------------------- 
     105&namdta_sal    !   data : salinity                                      ("key_dtasal") 
     106!----------------------------------------------------------------------- 
     107!              ! file name ! frequency (hours)    ! variable ! time interp. ! clim  !'yearly' or ! weights  ! rotation ! 
     108!              !           !  (if <0  months)     !   name   !   (logical)  ! (T/F) ! 'monthly'  ! filename ! pairing  ! 
     109   sn_sal      =  'data_1m_salinity_nomask',  -1  ,'vosaline',    .true.    , .true., 'yearly'   , ''       , ' ' 
     110   ! 
     111   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
     112/ 
     113 
    105114!!====================================================================== 
    106115!!            ***  Surface Boundary Condition namelists  *** 
    107116!!====================================================================== 
    108 !!   namsbc        surface boundary condition 
    109 !!   namsbc_ana    analytical         formulation 
    110 !!   namsbc_flx    flux               formulation 
    111 !!   namsbc_clio   CLIO bulk formulea formulation 
    112 !!   namsbc_core   CORE bulk formulea formulation 
    113 !!   namsbc_cpl    CouPLed            formulation                       ("key_coupled") 
    114 !!   namtra_qsr    penetrative solar radiation 
    115 !!   namsbc_rnf    river runoffs 
    116 !!   namsbc_ssr    sea surface restoring term (for T and/or S) 
    117 !!   namsbc_alb    albedo parameters 
    118 !!====================================================================== 
    119  
     117!!   namsbc          surface boundary condition 
     118!!   namsbc_ana      analytical         formulation 
     119!!   namsbc_flx      flux               formulation 
     120!!   namsbc_clio     CLIO bulk formulea formulation 
     121!!   namsbc_core     CORE bulk formulea formulation 
     122!!   namsbc_cpl      CouPLed            formulation                     ("key_coupled") 
     123!!   namsbc_cpl_co2  coupled ocean/biogeo/atmosphere model              ("key_cpl_carbon_cycle") 
     124!!   namtra_qsr      penetrative solar radiation 
     125!!   namsbc_rnf      river runoffs 
     126!!   namsbc_apr      Atmospheric Pressure 
     127!!   namsbc_ssr      sea surface restoring term (for T and/or S) 
     128!!   namsbc_alb      albedo parameters 
     129!!====================================================================== 
     130! 
    120131!----------------------------------------------------------------------- 
    121132&namsbc        !   Surface Boundary Condition (surface module) 
    122133!----------------------------------------------------------------------- 
    123134   nn_fsbc     = 1         !  frequency of surface boundary condition computation  
    124                            !               (= the frequency of sea-ice model call) 
    125    ln_ana      = .true.    !  analytical formulation (T => fill namsbc_ana )  
    126    ln_flx      = .false.   !  flux formulation       (T => fill namsbc_flx ) 
    127    ln_blk_clio = .false.   !  CLIO bulk formulation  (T => fill namsbc_clio)  
    128    ln_blk_core = .false.   !  CORE bulk formulation  (T => fill namsbc_core)  
    129    ln_cpl      = .false.   !  Coupled formulation    (T => fill namsbc_cpl ) 
     135                           !     (also = the frequency of sea-ice model call) 
     136   ln_ana      = .true.    !  analytical formulation                    (T => fill namsbc_ana )  
     137   ln_flx      = .false.   !  flux formulation                          (T => fill namsbc_flx ) 
     138   ln_blk_clio = .false.   !  CLIO bulk formulation                     (T => fill namsbc_clio)  
     139   ln_blk_core = .false.   !  CORE bulk formulation                     (T => fill namsbc_core)  
     140   ln_cpl      = .false.   !  Coupled formulation                       (T => fill namsbc_cpl ) 
    130141   ln_apr_dyn  = .false.   !  Patm gradient added in ocean & ice Eqs.   (T => fill namsbc_apr ) 
    131142   nn_ice      = 0         !  =0 no ice boundary condition   , 
    132143                           !  =1 use observed ice-cover      , 
    133                            !  =2 ice-model used                             ("key_lim3" or "key_lim2) 
     144                           !  =2 ice-model used                         ("key_lim3" or "key_lim2) 
    134145   ln_dm2dc    = .false.   !  daily mean to diurnal cycle short wave (qsr) 
    135146   ln_rnf      = .false.   !  runoffs (T => fill namsbc_rnf) 
    136    ln_ssr      = .false.   !  Sea Surface Restoring on T and/or S (T => fill namsbc_ssr) 
     147   ln_ssr      = .false.   !  Sea Surface Restoring on T and/or S       (T => fill namsbc_ssr) 
    137148   nn_fwb      = 0         !  FreshWater Budget: =0 unchecked                              ,  
    138                            !                     =1 global mean of e-p-r set to zero at each nn_fsbc time step   , 
    139                            !                     =2 annual global mean of e-p-r set to zero 
    140                            !                     =3 global emp set to zero and spread out over erp area 
     149                           !     =1 global mean of e-p-r set to zero at each time step  
     150                           !     =2 annual global mean of e-p-r set to zero 
     151                           !     =3 global emp set to zero and spread out over erp area 
    141152/ 
    142153!----------------------------------------------------------------------- 
     
    153164&namsbc_flx    !   surface boundary condition : flux formulation 
    154165!----------------------------------------------------------------------- 
    155 !              !   file name  ! frequency (hours) !  variable  ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    156 !              !              !  (if <0  months)  !    name    !    (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    157    sn_utau     = 'utau'       ,        24         ,    'utau'  ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    158    sn_vtau     = 'vtau'       ,        24         ,    'vtau'  ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    159    sn_qtot     = 'qtot'       ,        24         ,    'qtot'  ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    160    sn_qsr      = 'qsr'        ,        24         ,    'qsr'   ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    161    sn_emp      = 'emp'        ,        24         ,    'emp'   ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    162 ! 
     166!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     167!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     168   sn_utau     = 'utau'      ,        24         , 'utau'    , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     169   sn_vtau     = 'vtau'      ,        24         , 'vtau'    , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     170   sn_qtot     = 'qtot'      ,        24         , 'qtot'    , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     171   sn_qsr      = 'qsr'       ,        24         , 'qsr'     , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     172   sn_emp      = 'emp'       ,        24         , 'emp'     , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     173 
    163174   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the flux files 
    164175/       
     
    166177&namsbc_clio   !   namsbc_clio  CLIO bulk formulea 
    167178!----------------------------------------------------------------------- 
    168 !              !   file name  ! frequency (hours) !  variable  ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    169 !              !              !  (if <0  months)  !    name    !    (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    170    sn_utau     = 'taux_1m'    ,       -1          , 'sozotaux' ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    171    sn_vtau     = 'tauy_1m'    ,       -1          , 'sometauy' ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    172    sn_wndm     = 'flx'        ,       -1          , 'socliowi' ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    173    sn_tair     = 'flx'        ,       -1          , 'socliot2' ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    174    sn_humi     = 'flx'        ,       -1          , 'socliohu' ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    175    sn_ccov     = 'flx'        ,       -1          , 'socliocl' ,    .false.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    176    sn_prec     = 'flx'        ,       -1          , 'socliopl' ,    .false.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    177 ! 
     179!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     180!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     181   sn_utau     = 'taux_1m'   ,       -1          , 'sozotaux',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     182   sn_vtau     = 'tauy_1m'   ,       -1          , 'sometauy',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     183   sn_wndm     = 'flx'       ,       -1          , 'socliowi',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     184   sn_tair     = 'flx'       ,       -1          , 'socliot2',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     185   sn_humi     = 'flx'       ,       -1          , 'socliohu',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     186   sn_ccov     = 'flx'       ,       -1          , 'socliocl',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     187   sn_prec     = 'flx'       ,       -1          , 'socliopl',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     188 
    178189   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the bulk files are 
    179190/ 
     
    181192&namsbc_core   !   namsbc_core  CORE bulk formulea 
    182193!----------------------------------------------------------------------- 
    183 !              !   file name  ! frequency (hours) ! variable   ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights              ! rotation ! 
    184 !              !              !  (if <0  months)  !   name     !    (logical)   !  (T/F)  ! 'monthly' ! filename            ! pairing  ! 
    185    sn_wndi     = 'u10_core'   ,       -1          , 'u10'      ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,'bicubic_weights_orca2.nc' , 'U1' 
    186    sn_wndj     = 'v10_core'   ,       -1          , 'v10'      ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,'bicubic_weights_orca2.nc' , 'V1' 
    187    sn_qsr      = 'qsw_core'   ,       -1          , 'swdn'     ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,'bilinear_weights_orca2.nc', '' 
    188    sn_qlw      = 'qlw_core'   ,       -1          , 'lwdn'     ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,'bilinear_weights_orca2.nc', '' 
    189    sn_tair     = 't2_core'    ,       -1          , 't2'       ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,'bilinear_weights_orca2.nc', '' 
    190    sn_humi     = 'q2_core'    ,       -1          , 'q2'       ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,'bilinear_weights_orca2.nc', '' 
    191    sn_prec     = 'precip_core',       -1          , 'precip'   ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,'bilinear_weights_orca2.nc', '' 
    192    sn_snow     = 'snow_core'  ,       -1          , 'snow'     ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,'bilinear_weights_orca2.nc', '' 
    193    sn_tdif     = 'taudif_core',       24          , 'taudif'   ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,'bilinear_weights_orca2.nc', '' 
    194 ! 
     194!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     195!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     196   sn_wndi = 'u_10.15JUNE2009_orca2'       ,  6  , 'U_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , 'Uwnd' 
     197   sn_wndj = 'v_10.15JUNE2009_orca2'       ,  6  , 'V_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , 'Vwnd' 
     198   sn_qsr  = 'ncar_rad.15JUNE2009_orca2'   , 24  , 'SWDN_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     199   sn_qlw  = 'ncar_rad.15JUNE2009_orca2'   , 24  , 'LWDN_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     200   sn_tair = 't_10.15JUNE2009_orca2'       ,  6  , 'T_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     201   sn_humi = 'q_10.15JUNE2009_orca2'       ,  6  , 'Q_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     202   sn_prec = 'ncar_precip.15JUNE2009_orca2', -1  , 'PRC_MOD1',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     203   sn_snow = 'ncar_precip.15JUNE2009_orca2', -1  , 'SNOW'    ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     204   sn_tdif = 'taudif_core'                 , 24  , 'taudif'  ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     205 
    195206   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the bulk files 
    196    ln_2m       = .true.    !  air temperature and humidity referenced at 2m (T) instead 10m (F) 
     207   ln_2m       = .false.   !  air temperature and humidity referenced at 2m (T) instead 10m (F) 
    197208   ln_taudif   = .false.   !  HF tau contribution: use "mean of stress module - module of the mean stress" data ? 
    198209   rn_pfac     = 1.        !  multiplicative factor for precipitation (total & snow) 
    199210/ 
    200211!----------------------------------------------------------------------- 
    201 &namsbc_cpl    !   coupled ocean/atmosphere model                        ("key_coupled") 
    202 !----------------------------------------------------------------------- 
     212&namsbc_cpl    !   coupled ocean/atmosphere model                       ("key_coupled") 
     213!----------------------------------------------------------------------- 
     214!                                      ! send 
     215cn_snd_temperature= 'weighted oce and ice'  !  'oce only' 'weighted oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     216cn_snd_albedo     = 'weighted ice'          !  'none' 'weighted ice' 'mixed oce-ice' 
     217cn_snd_thickness  = 'none'                  !  'none' 'weighted ice and snow' 
     218cn_snd_crt_nature = 'none'                  !  'none' 'oce only' 'weighted oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     219cn_snd_crt_refere = 'spherical'             !  'spherical' 'cartesian' 
     220cn_snd_crt_orient = 'eastward-northward'    !  'eastward-northward' or 'local grid' 
     221cn_snd_crt_grid   = 'T'                     !  'T' 
     222!                                      ! receive 
     223cn_rcv_w10m       = 'none'                  !  'none' 'coupled' 
     224cn_rcv_taumod     = 'coupled'               !  'none' 'coupled' 
     225cn_rcv_tau_nature = 'oce only'              !  'oce only' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     226cn_rcv_tau_refere = 'cartesian'             !  'spherical' 'cartesian' 
     227cn_rcv_tau_orient = 'eastward-northward'    !  'eastward-northward' or 'local grid' 
     228cn_rcv_tau_grid   = 'U,V'                   !  'T' 'U,V' 'U,V,F' 'U,V,I' 'T,F' 'T,I' 'T,U,V' 
     229cn_rcv_dqnsdt     = 'coupled'               !  'none' 'coupled' 
     230cn_rcv_qsr        = 'oce and ice'           !  'conservative' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     231cn_rcv_qns        = 'oce and ice'           !  'conservative' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     232cn_rcv_emp        = 'conservative'          !  'conservative' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     233cn_rcv_rnf        = 'coupled'               !  'coupled' 'climato' 'mixed' 
     234cn_rcv_cal        = 'coupled'               !  'none' 'coupled' 
     235/ 
     236!----------------------------------------------------------------------- 
     237&namsbc_cpl_co2   !   coupled ocean/biogeo/atmosphere model             ("key_cpl_carbon_cycle") 
     238!----------------------------------------------------------------------- 
     239cn_snd_co2        = 'coupled'         ! send    :  'none' 'coupled' 
     240cn_rcv_co2        = 'coupled'         ! receive : 'none' 'coupled' 
    203241/ 
    204242!----------------------------------------------------------------------- 
    205243&namtra_qsr    !   penetrative solar radiation 
    206244!----------------------------------------------------------------------- 
    207 !              !   file name  ! frequency (hours) ! variable   ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    208 !              !              !  (if <0  months)  !   name     !    (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    209    sn_chl      = 'chlorophyll',        -1         , 'CHLA'     ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     245!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     246!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     247   sn_chl      ='chlorophyll',        -1         , 'CHLA'    ,   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    210248  
    211249   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
     
    222260&namsbc_rnf    !   runoffs namelist surface boundary condition 
    223261!----------------------------------------------------------------------- 
    224 !              !   file name  ! frequency (hours) ! variable   ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    225 !              !              !  (if <0  months)  !   name     !    (logical)   !  (T/F)  ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    226    sn_rnf      = 'runoff_1m_nomask' ,  -1         , 'sorunoff' ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  , ''       , '' 
    227    sn_cnf      = 'runoff_1m_nomask' ,   0         , 'socoefr'  ,    .false.     , .true.  , 'yearly'  , ''       , '' 
    228    sn_s_rnf    = 'runoffs'          ,  24         , 'rosaline' ,    .true.      , .true.  ,   'yearly', ''       , '' 
    229    sn_t_rnf    = 'runoffs'          ,  24         , 'rotemper' ,    .true.      , .true.  ,   'yearly', ''       , '' 
    230    sn_dep_rnf  = 'runoffs'          ,   0         , 'rodepth'  ,    .false.     , .true.  ,   'yearly', ''       , '' 
     262!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     263!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     264   sn_rnf      = 'runoff_1m_nomask' ,  -1        , 'sorunoff',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     265   sn_cnf      = 'runoff_1m_nomask' ,   0        , 'socoefr' ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     266   sn_s_rnf    = 'runoffs'          ,  24        , 'rosaline',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     267   sn_t_rnf    = 'runoffs'          ,  24        , 'rotemper',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     268   sn_dep_rnf  = 'runoffs'          ,   0        , 'rodepth' ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     269 
    231270   cn_dir       = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
    232271   ln_rnf_emp   =   .false. !  runoffs included into precipitation field (T) or into a file (F) 
     
    244283!              ! file name ! frequency (hours) ! variable ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    245284!              !           !  (if <0  months)  !   name   !    (logical)   !  (T/F)  ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    246    sn_apr      = 'patm'    ,         -1        , 'somslpre',    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,  ''      ,   '' 
    247 ! 
     285   sn_apr      = 'patm'    ,         -1        ,'somslpre',    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,  ''      ,   '' 
     286 
    248287   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the bulk files 
    249288   ln_ref_apr  = .false.   !  ref. pressure: global mean Patm (T) or a constant (F) 
     
    252291&namsbc_ssr    !   surface boundary condition : sea surface restoring 
    253292!----------------------------------------------------------------------- 
    254 !              !   file name  ! frequency (hours) ! variable   ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    255 !              !              !  (if <0  months)  !   name     !    (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    256    sn_sst      = 'sst_data'   ,        24         ,  'sst'     ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    257    sn_sss      = 'sss_data'   ,        -1         ,  'sss'     ,     .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     293!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     294!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     295   sn_sst      = 'sst_data'  ,        24         ,  'sst'    ,    .false.   , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     296   sn_sss      = 'sss_data'  ,        -1         ,  'sss'    ,    .true.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    258297     
    259298   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
     
    264303   rn_deds     =   -27.7   !  magnitude of the damping on salinity   [mm/day] 
    265304   ln_sssr_bnd =   .false. !  flag to bound erp term (associated with nn_sssr=2) 
    266    rn_sssr_bnd =   0.e0    !  ABS(Max/Min) value of the damping erp term [mm/day] 
     305   rn_sssr_bnd =   4.e0    !  ABS(Max/Min) value of the damping erp term [mm/day] 
    267306/       
    268307!----------------------------------------------------------------------- 
     
    286325!!   namtide       Tidal forcing at open boundaries                     ("key_bdy_tides") 
    287326!!====================================================================== 
    288  
     327! 
    289328!----------------------------------------------------------------------- 
    290329&namlbc        !   lateral momentum boundary condition 
     
    301340&namobc        !   open boundaries parameters                           ("key_obc") 
    302341!----------------------------------------------------------------------- 
    303     ln_obc_clim= .false.   !  climatological obc data files (T) or not (F) 
    304     ln_vol_cst = .true.    !  impose the total volume conservation (T) or not (F) 
    305     ln_obc_fla = .false.   !  Flather open boundary condition  
    306     nn_obcdta  =    1      !  = 0 the obc data are equal to the initial state 
     342   ln_obc_clim = .false.   !  climatological obc data files (T) or not (F) 
     343   ln_vol_cst = .true.    !  impose the total volume conservation (T) or not (F) 
     344   ln_obc_fla = .false.   !  Flather open boundary condition  
     345   nn_obcdta   =    1      !  = 0 the obc data are equal to the initial state 
    307346                           !  = 1 the obc data are read in 'obc.dta' files 
    308     cn_obcdta  = 'annual'  !  set to annual if obc datafile hold 1 year of data 
     347   cn_obcdta   = 'annual'  !  set to annual if obc datafile hold 1 year of data 
    309348                           !  set to monthly if obc datafile hold 1 month of data 
    310     rn_dpein   =    1.     !  damping time scale for inflow at east  open boundary 
    311     rn_dpwin   =    1.     !     -           -         -       west    -      - 
    312     rn_dpnin   =    1.     !     -           -         -       north   -      - 
    313     rn_dpsin   =    1.     !     -           -         -       south   -      - 
    314     rn_dpeob   = 3000.     !  time relaxation (days) for the east  open boundary 
    315     rn_dpwob   =   15.     !     -           -         -     west    -      - 
    316     rn_dpnob   = 3000.     !     -           -         -     north   -      - 
    317     rn_dpsob   =   15.     !     -           -         -     south   -      - 
    318     rn_volemp  =  1.       !  = 0 the total volume change with the surface flux (E-P-R) 
     349   rn_dpein    =    1.     !  damping time scale for inflow at east  open boundary 
     350   rn_dpwin    =    1.     !     -           -         -       west    -      - 
     351   rn_dpnin    =    1.     !     -           -         -       north   -      - 
     352   rn_dpsin    =    1.     !     -           -         -       south   -      - 
     353   rn_dpeob    = 3000.     !  time relaxation (days) for the east  open boundary 
     354   rn_dpwob    =   15.     !     -           -         -     west    -      - 
     355   rn_dpnob    = 3000.     !     -           -         -     north   -      - 
     356   rn_dpsob    =   15.     !     -           -         -     south   -      - 
     357   rn_volemp   =  1.       !  = 0 the total volume change with the surface flux (E-P-R) 
    319358                           !  = 1 the total volume remains constant 
    320359/ 
     
    322361&namagrif      !  AGRIF zoom                                            ("key_agrif") 
    323362!----------------------------------------------------------------------- 
    324     nn_cln_update = 3      !  baroclinic update frequency 
    325     ln_spc_dyn    = .true. !  use 0 as special value for dynamics 
    326     rn_sponge_tra = 2880.  !  coefficient for tracer   sponge layer [s] 
    327     rn_sponge_dyn = 2880.  !  coefficient for dynamics sponge layer [s] 
     363   nn_cln_update = 3       !  baroclinic update frequency 
     364   ln_spc_dyn    = .true. !  use 0 as special value for dynamics 
     365   rn_sponge_tra = 2880.   !  coefficient for tracer   sponge layer [s] 
     366   rn_sponge_dyn = 2880.   !  coefficient for dynamics sponge layer [s] 
    328367/ 
    329368!----------------------------------------------------------------------- 
    330369&nambdy        !  unstructured open boundaries                          ("key_bdy") 
    331370!----------------------------------------------------------------------- 
    332     cn_mask    =  ''                        !  name of mask file (if ln_bdy_mask=.TRUE.) 
    333     cn_dta_frs_T  = 'bdydata_grid_T.nc'     !  name of data file (T-points) 
    334     cn_dta_frs_U  = 'bdydata_grid_U.nc'     !  name of data file (U-points) 
    335     cn_dta_frs_V  = 'bdydata_grid_V.nc'     !  name of data file (V-points) 
    336     cn_dta_fla_T  = 'bdydata_bt_grid_T.nc'  !  name of data file for Flather condition (T-points) 
    337     cn_dta_fla_U  = 'bdydata_bt_grid_U.nc'  !  name of data file for Flather condition (U-points) 
    338     cn_dta_fla_V  = 'bdydata_bt_grid_V.nc'  !  name of data file for Flather condition (V-points) 
    339     ln_clim    = .false.                    !  contain 1 (T) or 12 (F) time dumps and be cyclic 
    340     ln_vol     = .false.                    !  total volume correction (see volbdy parameter) 
    341     ln_mask    = .false.                    !  boundary mask from filbdy_mask (T) or boundaries are on edges of domain (F) 
    342     ln_tides   = .false.                    !  Apply tidal harmonic forcing with Flather condition 
    343     ln_dyn_fla = .false.                    !  Apply Flather condition to velocities 
    344     ln_tra_frs = .false.                    !  Apply FRS condition to temperature and salinity  
    345     ln_dyn_frs = .false.                    !  Apply FRS condition to velocities 
    346     nn_rimwidth    =  9                     !  width of the relaxation zone 
    347     nn_dtactl      =  1                     !  = 0, bdy data are equal to the initial state 
    348                                             !  = 1, bdy data are read in 'bdydata   .nc' files 
    349     nn_volctl      =  0                     !  = 0, the total water flux across open boundaries is zero 
    350                                             !  = 1, the total volume of the system is conserved 
    351 / 
    352 !----------------------------------------------------------------------- 
    353 &nambdy_tide     ! tidal forcing at unstructured boundaries               
    354 !----------------------------------------------------------------------- 
    355     filtide      = 'bdytide_'           !  file name root of tidal forcing files 
    356     tide_cpt     = 'M2','S1'            !  names of tidal components used 
    357     tide_speed   = 28.984106, 15.000001 !  phase speeds of tidal components (deg/hour) 
    358     ln_tide_date = .false.              !  adjust tidal harmonics for start date of run 
     371   cn_mask       =  ''                     !  name of mask file (if ln_bdy_mask=.TRUE.) 
     372   cn_dta_frs_T  = 'bdydata_grid_T.nc'     !  name of data file (T-points) 
     373   cn_dta_frs_U  = 'bdydata_grid_U.nc'     !  name of data file (U-points) 
     374   cn_dta_frs_V  = 'bdydata_grid_V.nc'     !  name of data file (V-points) 
     375   cn_dta_fla_T  = 'bdydata_bt_grid_T.nc'  !  name of data file for Flather condition (T-points) 
     376   cn_dta_fla_U  = 'bdydata_bt_grid_U.nc'  !  name of data file for Flather condition (U-points) 
     377   cn_dta_fla_V  = 'bdydata_bt_grid_V.nc'  !  name of data file for Flather condition (V-points) 
     378 
     379   ln_clim    = .false.    !  contain 1 (T) or 12 (F) time dumps and be cyclic 
     380   ln_vol     = .false.    !  total volume correction (see volbdy parameter) 
     381   ln_mask    = .false.    !  boundary mask from filbdy_mask (T), boundaries are on edges of domain (F) 
     382   ln_tides   = .false.    !  Apply tidal harmonic forcing with Flather condition 
     383   ln_dyn_fla = .false.    !  Apply Flather condition to velocities 
     384   ln_tra_frs = .false.    !  Apply FRS condition to temperature and salinity  
     385   ln_dyn_frs = .false.    !  Apply FRS condition to velocities 
     386   nn_rimwidth=  9         !  width of the relaxation zone 
     387   nn_dtactl  =  1         !  = 0, bdy data are equal to the initial state 
     388                           !  = 1, bdy data are read in 'bdydata   .nc' files 
     389   nn_volctl  =  0         !  = 0, the total water flux across open boundaries is zero 
     390                           !  = 1, the total volume of the system is conserved 
     391/ 
     392!----------------------------------------------------------------------- 
     393&nambdy_tide   !  tidal forcing at unstructured boundaries               
     394!----------------------------------------------------------------------- 
     395   filtide     = 'bdytide_'           !  file name root of tidal forcing files 
     396   tide_cpt    = 'M2','S1'            !  names of tidal components used 
     397   tide_speed  = 28.984106, 15.000001 !  phase speeds of tidal components (deg/hour) 
     398   ln_tide_date= .false.              !  adjust tidal harmonics for start date of run 
    359399/ 
    360400 
     
    363403!!====================================================================== 
    364404!!   nambfr        bottom friction 
    365 !!   nambbc        bottom temperature boundary condition                 
     405!!   nambbc        bottom temperature boundary condition                
    366406!!   nambbl        bottom boundary layer scheme                         ("key_trabbl") 
    367407!!====================================================================== 
    368  
     408! 
    369409!----------------------------------------------------------------------- 
    370410&nambfr        !   bottom friction 
     
    395435   rn_gambbl   =  10.    !  advective bbl coefficient                 [s] 
    396436/ 
     437 
    397438!!====================================================================== 
    398439!!                        Tracer (T & S ) namelists 
     
    403444!!   namtra_dmp    T & S newtonian damping                              ("key_tradmp") 
    404445!!====================================================================== 
    405  
     446! 
    406447!----------------------------------------------------------------------- 
    407448&nameos        !   ocean physical parameters 
     
    422463   ln_traadv_muscl2 =  .false.  !  MUSCL2 scheme + cen2 at boundaries   
    423464   ln_traadv_ubs    =  .false.  !  UBS scheme                  
     465   ln_traadv_qck    =  .false.  !  QUCIKEST scheme                  
    424466/ 
    425467!----------------------------------------------------------------------- 
    426468&namtra_ldf    !   lateral diffusion scheme for tracer  
    427469!----------------------------------------------------------------------- 
    428                            !  Type of the operator :  
    429    ln_traldf_lap    =  .true.   !     laplacian operator        
    430    ln_traldf_bilap  =  .false.  !     bilaplacian operator      
    431                            !  Direction of action  : 
    432    ln_traldf_level  =  .false.  !     iso-level                 
    433    ln_traldf_hor    =  .false.  !     horizontal (geopotential)         (require "key_ldfslp" when ln_sco=T) 
    434    ln_traldf_iso    =  .true.   !     iso-neutral                       (require "key_ldfslp") 
    435    ln_traldf_grif   =  .false.  !     griffies skew flux formulation    (require "key_ldfslp")   ! UNDER TEST, DO NOT USE 
    436    ln_traldf_gdia   =  .false.  !     griffies operator strfn diagnostics (require "key_ldfslp") ! UNDER TEST, DO NOT USE 
    437                            !  Coefficient 
    438    rn_aht_0         =  1000.    !     horizontal eddy diffusivity for tracers [m2/s] 
    439    rn_ahtb_0        =     0.    !     background eddy diffusivity for ldf_iso [m2/s] 
    440    rn_aeiv_0        =     0.    !     eddy induced velocity coefficient [m2/s]    (require "key_traldf_eiv") 
     470   !                       !  Type of the operator :  
     471   ln_traldf_lap    =  .true.   !  laplacian operator        
     472   ln_traldf_bilap  =  .false.  !  bilaplacian operator      
     473   !                       !  Direction of action  : 
     474   ln_traldf_level  =  .false.  !  iso-level                 
     475   ln_traldf_hor    =  .false.  !  horizontal (geopotential)            (require "key_ldfslp" when ln_sco=T) 
     476   ln_traldf_iso    =  .true.   !  iso-neutral                          (require "key_ldfslp") 
     477   ln_traldf_grif   =  .false.  !  griffies skew flux formulation       (require "key_ldfslp")  ! UNDER TEST, DO NOT USE 
     478   ln_traldf_gdia   =  .false.  !  griffies operator strfn diagnostics  (require "key_ldfslp") ! UNDER TEST, DO NOT USE 
     479   !                       !  Coefficient 
     480   rn_aht_0         =  1000.    !  horizontal eddy diffusivity for tracers [m2/s] 
     481   rn_ahtb_0        =     0.    !  background eddy diffusivity for ldf_iso [m2/s] 
     482   rn_aeiv_0        =     0.    !  eddy induced velocity coefficient [m2/s]    (require "key_traldf_eiv") 
    441483/ 
    442484!----------------------------------------------------------------------- 
     
    454496   nn_file     =    1      !  create a damping.coeff NetCDF file (=1) or not (=0) 
    455497/ 
     498 
    456499!!====================================================================== 
    457500!!                      ***  Dynamics namelists  *** 
     
    463506!!   namdyn_ldf    lateral diffusion scheme 
    464507!!====================================================================== 
    465  
     508! 
    466509!----------------------------------------------------------------------- 
    467510&namdyn_adv    !   formulation of the momentum advection 
     
    504547&namdyn_ldf    !   lateral diffusion on momentum 
    505548!----------------------------------------------------------------------- 
    506                            !  Type of the operator :  
     549   !                       !  Type of the operator :  
    507550   ln_dynldf_lap    =  .true.   !  laplacian operator          
    508551   ln_dynldf_bilap  =  .false.  !  bilaplacian operator     
    509                            !  Direction of action  :  
     552   !                       !  Direction of action  :  
    510553   ln_dynldf_level  =  .false.  !  iso-level                
    511554   ln_dynldf_hor    =  .true.   !  horizontal (geopotential)            (require "key_ldfslp" in s-coord.) 
    512555   ln_dynldf_iso    =  .false.  !  iso-neutral                          (require "key_ldfslp") 
    513                            !  Coefficient 
     556   !                       !  Coefficient 
    514557   rn_ahm_0_lap     = 100000.   !  horizontal laplacian eddy viscosity   [m2/s] 
    515558   rn_ahmb_0        =     0.    !  background eddy viscosity for ldf_iso [m2/s] 
    516559   rn_ahm_0_blp     =     0.    !  horizontal bilaplacian eddy viscosity [m4/s] 
    517560/ 
     561 
    518562!!====================================================================== 
    519563!!             Tracers & Dynamics vertical physics namelists 
    520564!!====================================================================== 
    521 !!       namzdf        vertical physics 
    522 !!       namzdf_ric    richardson number dependent vertical mixing      ("key_zdfric"      ) 
    523 !!       namzdf_tke    TKE dependent vertical mixing                    ("key_zdftke"      ) 
    524 !!       namzdf_kpp    KPP dependent vertical mixing                    ("key_zdfkpp"      ) 
    525 !!       namzdf_ddm    double diffusive mixing parameterization         ("key_zdfddm"      ) 
    526 !!       namzdf_tmx    tidal mixing parameterization                    ("key_zdftmx"      ) 
    527 !!====================================================================== 
    528  
     565!!    namzdf        vertical physics 
     566!!    namzdf_ric    richardson number dependent vertical mixing         ("key_zdfric") 
     567!!    namzdf_tke    TKE dependent vertical mixing                       ("key_zdftke") 
     568!!    namzdf_kpp    KPP dependent vertical mixing                       ("key_zdfkpp") 
     569!!    namzdf_ddm    double diffusive mixing parameterization            ("key_zdfddm") 
     570!!    namzdf_tmx    tidal mixing parameterization                       ("key_zdftmx") 
     571!!====================================================================== 
     572! 
    529573!----------------------------------------------------------------------- 
    530574&namzdf        !   vertical physics 
     
    591635/ 
    592636!----------------------------------------------------------------------- 
    593 &namzdf_gls                !   GLS vertical diffusion  ("key_zdfgls") 
    594 !----------------------------------------------------------------------- 
    595    rn_emin        = 1.e-6  !  minimum value of e   [m2/s2] 
    596    rn_epsmin      = 1.e-12 !  minimum value of eps [m2/s3] 
    597    ln_length_lim  = .true. !  limit on the dissipation rate under stable stratification (Galperin et al., 1988) 
    598    rn_clim_galp   = 0.53   !  galperin limit 
    599    ln_crban       = .TRUE. !  Use Craig & Banner (1994) surface wave mixing parametrisation 
    600    ln_sigpsi      = .TRUE. !  Activate or not Burchard 2001 mods on psi schmidt number in the wb case 
    601    rn_crban       = 100.   !  Craig and Banner 1994 constant for wb tke flux 
    602    rn_charn       = 70000. !  Charnock constant for wb induced roughness length 
    603    nn_tkebc_surf  =   1    !  surface tke condition (0/1/2=Dir/Neum/Dir Mellor-Blumberg) 
    604    nn_tkebc_bot   =   1    !  bottom tke condition (0/1=Dir/Neum) 
    605    nn_psibc_surf  =   1    !  surface psi condition (0/1/2=Dir/Neum/Dir Mellor-Blumberg) 
    606    nn_psibc_bot   =   1    !  bottom psi condition (0/1=Dir/Neum) 
    607    nn_stab_func   =   2    !  stability function (0=Galp, 1= KC94, 2=CanutoA, 3=CanutoB) 
    608    nn_clos        =   1    !  predefined closure type (0=MY82, 1=k-eps, 2=k-w, 3=Gen) 
     637&namzdf_gls                !   GLS vertical diffusion                   ("key_zdfgls") 
     638!----------------------------------------------------------------------- 
     639   rn_emin       = 1.e-6   !  minimum value of e   [m2/s2] 
     640   rn_epsmin     = 1.e-12 !  minimum value of eps [m2/s3] 
     641   ln_length_lim = .true. !  limit on the dissipation rate under stable stratification (Galperin et al., 1988) 
     642   rn_clim_galp  = 0.53    !  galperin limit 
     643   ln_crban      = .TRUE. !  Use Craig & Banner (1994) surface wave mixing parametrisation 
     644   ln_sigpsi     = .TRUE. !  Activate or not Burchard 2001 mods on psi schmidt number in the wb case 
     645   rn_crban      = 100.    !  Craig and Banner 1994 constant for wb tke flux 
     646   rn_charn      = 70000. !  Charnock constant for wb induced roughness length 
     647   nn_tkebc_surf =   1     !  surface tke condition (0/1/2=Dir/Neum/Dir Mellor-Blumberg) 
     648   nn_tkebc_bot  =   1     !  bottom tke condition (0/1=Dir/Neum) 
     649   nn_psibc_surf =   1     !  surface psi condition (0/1/2=Dir/Neum/Dir Mellor-Blumberg) 
     650   nn_psibc_bot  =   1     !  bottom psi condition (0/1=Dir/Neum) 
     651   nn_stab_func  =   2     !  stability function (0=Galp, 1= KC94, 2=CanutoA, 3=CanutoB) 
     652   nn_clos       =   1     !  predefined closure type (0=MY82, 1=k-eps, 2=k-w, 3=Gen) 
    609653/ 
    610654!----------------------------------------------------------------------- 
     
    624668   rn_tfe_itf  = 1.        !  ITF tidal dissipation efficiency 
    625669/ 
     670 
    626671!!====================================================================== 
    627672!!                  ***  Miscelaneous namelists  *** 
     
    632677!!   namsol            elliptic solver / island / free surface  
    633678!!====================================================================== 
    634  
     679! 
    635680!----------------------------------------------------------------------- 
    636681&namsol        !   elliptic solver / island / free surface  
     
    676721 
    677722!!====================================================================== 
    678 !!                       ***  Diagnostics namelists  *** 
    679 !!====================================================================== 
     723!!                  ***  Diagnostics namelists  *** 
     724!!====================================================================== 
     725!!   namnc4       netcdf4 chunking and compression settings             ("key_netcdf4") 
    680726!!   namtrd       dynamics and/or tracer trends                         ("key_trddyn","key_trdtra","key_trdmld") 
    681 !!   namgap       level mean model-data gap                             ("key_diagap") 
    682727!!   namflo       float parameters                                      ("key_float") 
    683728!!   namptr       Poleward Transport Diagnostics 
    684 !!====================================================================== 
    685  
     729!!   namhsb       Heat and salt budgets  
     730!!====================================================================== 
     731! 
     732!----------------------------------------------------------------------- 
     733&namnc4        !   netcdf4 chunking and compression settings            ("key_netcdf4") 
     734!----------------------------------------------------------------------- 
     735   nn_nchunks_i=   4       !  number of chunks in i-dimension 
     736   nn_nchunks_j=   4       !  number of chunks in j-dimension 
     737   nn_nchunks_k=   31      !  number of chunks in k-dimension 
     738                           !  setting nn_nchunks_k = jpk will give a chunk size of 1 in the vertical which 
     739                           !  is optimal for postprocessing which works exclusively with horizontal slabs 
     740   ln_nc4zip   = .TRUE.    !  (T) use netcdf4 chunking and compression 
     741                           !  (F) ignore chunking information and produce netcdf3-compatible files 
     742/ 
    686743!----------------------------------------------------------------------- 
    687744&namtrd        !   diagnostics on dynamics and/or tracer trends         ("key_trddyn" and/or "key_trdtra") 
    688 !              !       or mixed-layer trends or barotropic vorticity    ('key_trdmld' or  "key_trdvor") 
     745!              !       or mixed-layer trends or barotropic vorticity    ("key_trdmld" or     "key_trdvor") 
    689746!----------------------------------------------------------------------- 
    690747   nn_trd      = 365       !  time step frequency dynamics and tracers trends 
     
    697754/ 
    698755!----------------------------------------------------------------------- 
    699 &namgap       !   level mean model-data gap                             ('key_diagap') 
    700 !----------------------------------------------------------------------- 
    701    nn_gap     =  15        !  time-step frequency of model-data gap computation 
    702    nn_prg     =  10        !  time-step frequency of gap print in model output 
    703 / 
    704 !----------------------------------------------------------------------- 
    705756&namflo       !   float parameters                                      ("key_float") 
    706757!----------------------------------------------------------------------- 
    707     ln_rstflo = .false.    !  float restart (T) or not (F) 
    708     nn_writefl=      75    !  frequency of writing in float output file  
    709     nn_stockfl=    5475    !  frequency of creation of the float restart file  
    710     ln_argo   = .false.    !  Argo type floats (stay at the surface each 10 days) 
    711     ln_flork4 = .false.    !  trajectories computed with a 4th order Runge-Kutta (T) 
     758   ln_rstflo = .false.    !  float restart (T) or not (F) 
     759   nn_writefl =      75    !  frequency of writing in float output file  
     760   nn_stockfl =    5475    !  frequency of creation of the float restart file  
     761   ln_argo    = .false.    !  Argo type floats (stay at the surface each 10 days) 
     762   ln_flork4 = .false.    !  trajectories computed with a 4th order Runge-Kutta (T) 
    712763                           !  or computed with Blanke' scheme (F) 
    713764/ 
     
    716767!----------------------------------------------------------------------- 
    717768   ln_diaptr  = .false.    !  Poleward heat and salt transport (T) or not (F) 
    718    ln_diaznl  = .false.    !  Add zonal means and meridional stream functions 
    719    ln_subbas  = .false.    !  Atlantic/Pacific/Indian basins computation (T) or not  
     769   ln_diaznl  = .true.     !  Add zonal means and meridional stream functions 
     770   ln_subbas  = .true.     !  Atlantic/Pacific/Indian basins computation (T) or not  
    720771                           !  (orca configuration only, need input basins mask file named "subbasins.nc" 
     772   ln_ptrcomp = .true.     !  Add decomposition : overturning 
    721773   nn_fptr    =  1         !  Frequency of ptr computation [time step] 
    722774   nn_fwri    =  15        !  Frequency of ptr outputs [time step] 
     
    727779   ln_diahsb  = .false.     !  check the heat and salt budgets (T) or not (F) 
    728780/ 
    729 !----------------------------------------------------------------------- 
    730 !       namobs    observation usage switch 
    731 !----------------------------------------------------------------------- 
    732 ! 
    733 !  ln_t3d                  Logical switch for T profile observations          
    734 !  ln_s3d                  Logical switch for S profile observations           
    735 !  ln_ena                  Logical switch for ENACT insitu data set            
    736 !  ln_cor                  Logical switch for Coriolis insitu data set        
    737 !  ln_profb                Logical switch for feedback insitu data set      
    738 !  ln_sla                  Logical switch for SLA observations                
    739 !  ln_sladt                Logical switch for AVISO SLA data               
    740 !  ln_slafb                Logical switch for feedback SLA data             
    741 !  ln_ssh                  Logical switch for SSH observations               
    742 !  ln_sst                  Logical switch for SST observations               
    743 !  ln_reysst               Logical switch for Reynolds observations        
    744 !  ln_ghrsst               Logical switch for GHRSST observations           
    745 !  ln_sstfb                Logical switch for feedback SST data           
    746 !  ln_sss                  Logical switch for SSS observations               
    747 !  ln_seaice               Logical switch for Sea Ice observations         
    748 !  ln_vel3d                Logical switch for velocity observations          
    749 !  ln_velavcur             Logical switch for velocity daily av. cur.     
    750 !  ln_velhrcur             Logical switch for velocity high freq. cur.    
    751 !  ln_velavadcp            Logical switch for velocity daily av. ADCP   
    752 !  ln_velhradcp            Logical switch for velocity high freq. ADCP 
    753 !  ln_velfb                Logical switch for feedback velocity data        
    754 !  ln_grid_global          Global distribtion of observations          
    755 !  ln_grid_search_lookup   Logical switch for obs grid search w/lookup table   
    756 !  grid_search_file        Grid search lookup file header  
    757 !  enactfiles              ENACT input observation file names  
    758 !  coriofiles              Coriolis input observation file name   
    759 !  profbfiles              Profile feedback input observation file name  
    760 !  ln_profb_enatim         Enact feedback input time setting switch     
    761 !  slafilesact             Active SLA input observation file name 
    762 !  slafilespas             Passive SLA input observation file name  
    763 !  slafbfiles              Feedback SLA input observation file name  
    764 !  sstfiles                GHRSST input observation file name        
    765 !  sstfbfiles              Feedback SST input observation file name  
    766 !  seaicefiles             Sea Ice input observation file name  
    767 !  velavcurfiles           Vel. cur. daily av. input file name   
    768 !  velhvcurfiles           Vel. cur. high freq. input file name   
    769 !  velavadcpfiles          Vel. ADCP daily av. input file name     
    770 !  velhvadcpfiles          Vel. ADCP high freq. input file name  
    771 !  velfbfiles              Vel. feedback input observation file name  
    772 !  dobsini                 Initial date in window YYYYMMDD.HHMMSS        
    773 !  dobsend                 Final date in window YYYYMMDD.HHMMSS          
    774 !  n1dint                  Type of vertical interpolation method         
    775 !  n2dint                  Type of horizontal interpolation method        
    776 !  ln_nea                  Rejection of observations near land switch     
    777 !  nmsshc                  MSSH correction scheme                          
    778 !  mdtcorr                 MDT  correction                                
    779 !  mdtcutoff               MDT cutoff for computed correction           
    780 !  ln_altbias              Logical switch for alt bias                 
    781 !  ln_ignmis               Logical switch for ignoring missing files    
    782 !  endailyavtypes          ENACT daily average types                     
    783  &namobs 
    784    ln_t3d = .false. 
    785    ln_s3d = .false. 
    786    ln_ena = .false. 
    787    ln_profb = .false. 
    788    ln_sla = .false. 
    789    ln_sladt = .false. 
    790    ln_slafb = .false. 
    791    ln_sst = .false. 
    792    ln_sstfb = .false. 
    793    nmsshc = 0 
     781 
     782!!====================================================================== 
     783!!            ***  Observation & Assimilation namelists *** 
     784!!====================================================================== 
     785!!   namobs       observation and model comparison                      ('key_diaobs') 
     786!!   nam_asminc   assimilation increments                               ('key_asminc') 
     787!!====================================================================== 
     788! 
     789!----------------------------------------------------------------------- 
     790&namobs       !  observation usage switch                               ('key_diaobs') 
     791!----------------------------------------------------------------------- 
     792   ln_t3d     = .false.    ! Logical switch for T profile observations          
     793   ln_s3d     = .false.    ! Logical switch for S profile observations           
     794   ln_ena     = .false.    ! Logical switch for ENACT insitu data set            
     795   !                       !     ln_cor                  Logical switch for Coriolis insitu data set        
     796   ln_profb   = .false.    ! Logical switch for feedback insitu data set      
     797   ln_sla     = .false.    ! Logical switch for SLA observations                
     798 
     799   ln_sladt   = .false.    ! Logical switch for AVISO SLA data               
     800 
     801   ln_slafb   = .false.    ! Logical switch for feedback SLA data             
     802                           !     ln_ssh                  Logical switch for SSH observations               
     803 
     804   ln_sst     = .false.    ! Logical switch for SST observations               
     805                           !     ln_reysst               Logical switch for Reynolds observations        
     806                           !     ln_ghrsst               Logical switch for GHRSST observations           
     807 
     808   ln_sstfb   = .false.    ! Logical switch for feedback SST data           
     809                           !     ln_sss                  Logical switch for SSS observations               
     810                           !     ln_seaice               Logical switch for Sea Ice observations         
     811                           !     ln_vel3d                Logical switch for velocity observations          
     812                           !     ln_velavcur             Logical switch for velocity daily av. cur.     
     813                           !     ln_velhrcur             Logical switch for velocity high freq. cur.    
     814                           !     ln_velavadcp            Logical switch for velocity daily av. ADCP   
     815                           !     ln_velhradcp            Logical switch for velocity high freq. ADCP 
     816                           !     ln_velfb                Logical switch for feedback velocity data        
     817                           !     ln_grid_global          Global distribtion of observations          
     818                           !     ln_grid_search_lookup   Logical switch for obs grid search w/lookup table   
     819                           !     grid_search_file        Grid search lookup file header  
     820                           !     enactfiles              ENACT input observation file names  
     821                           !     coriofiles              Coriolis input observation file name   
     822   !                       ! profbfiles: Profile feedback input observation file name  
    794823   profbfiles = 'profiles_01.nc' 
     824                           !     ln_profb_enatim         Enact feedback input time setting switch     
     825                           !     slafilesact             Active SLA input observation file name 
     826                           !     slafilespas             Passive SLA input observation file name  
     827   !                       ! slafbfiles: Feedback SLA input observation file name  
    795828   slafbfiles = 'sla_01.nc' 
     829                           !     sstfiles                GHRSST input observation file name        
     830   !                       ! sstfbfiles: Feedback SST input observation file name  
    796831   sstfbfiles = 'sst_01.nc' 'sst_02.nc' 'sst_03.nc' 'sst_04.nc' 'sst_05.nc' 
    797    ln_altbias = .false. 
     832                           !     seaicefiles             Sea Ice input observation file name  
     833                           !     velavcurfiles           Vel. cur. daily av. input file name   
     834                           !     velhvcurfiles           Vel. cur. high freq. input file name   
     835                           !     velavadcpfiles          Vel. ADCP daily av. input file name     
     836                           !     velhvadcpfiles          Vel. ADCP high freq. input file name  
     837                           !     velfbfiles              Vel. feedback input observation file name  
     838                           !     dobsini                 Initial date in window YYYYMMDD.HHMMSS        
     839                           !     dobsend                 Final date in window YYYYMMDD.HHMMSS          
     840                           !     n1dint                  Type of vertical interpolation method         
     841                           !     n2dint                  Type of horizontal interpolation method        
     842                           !     ln_nea                  Rejection of observations near land switch     
     843   nmsshc     = 0          ! MSSH correction scheme                          
     844                           !     mdtcorr                 MDT  correction                                
     845                           !     mdtcutoff               MDT cutoff for computed correction           
     846   ln_altbias = .false.    ! Logical switch for alt bias                 
     847   ln_ignmis  = .true.     ! Logical switch for ignoring missing files    
     848                           !     endailyavtypes   ENACT daily average types                     
    798849   ln_grid_global = .true. 
    799850   ln_grid_search_lookup = .false. 
    800    ln_ignmis = .true.   
    801851/  
    802852!----------------------------------------------------------------------- 
    803 !       nam_asminc    assimilation increments namelist 
    804 !----------------------------------------------------------------------- 
    805 ! ln_bkgwri   Logical switch for writing out background state  
    806 ! ln_trjwri   Logical switch for writing out state trajectory 
    807 ! ln_trainc   Logical switch for applying tracer increments 
    808 ! ln_dyninc   Logical switch for applying velocity increments 
    809 ! ln_sshinc   Logical switch for applying SSH increments  
    810 ! ln_asmdin   Logical switch for Direct Initialization (DI) 
    811 ! ln_asmiau   Logical switch for Incremental Analysis Updating (IAU) 
    812 ! nitbkg      Timestep of background in [0,nitend-nit000-1] 
    813 ! nitdin      Timestep of background for DI in [0,nitend-nit000-1] 
    814 ! nitiaustr   Timestep of start of IAU interval in [0,nitend-nit000-1] 
    815 ! nitiaufin   Timestep of end of IAU interval in [0,nitend-nit000-1] 
    816 ! niaufn      Type of IAU weighting function 
    817 ! nittrjfrq   Frequency of trajectory output for 4D-VAR 
    818 ! ln_salfix   Logical switch for ensuring that the sa > salfixmin 
    819 ! salfixmin   Minimum salinity after applying the increments 
    820 &nam_asminc 
    821     ln_bkgwri = .false. 
    822     ln_trjwri = .false. 
    823     ln_trainc = .false. 
    824     ln_dyninc = .false. 
    825     ln_sshinc = .false. 
    826     ln_asmdin = .false. 
    827     ln_asmiau = .false. 
    828     nitbkg = 0 
    829     nitdin = 0 
    830     nitiaustr = 1 
    831     nitiaufin = 15 
    832     niaufn = 0 
    833     nittrjfrq = 0 
    834     ln_salfix = .false. 
    835     salfixmin = -9999 
    836 / 
     853&nam_asminc   !   assimilation increments                               ('key_asminc') 
     854!----------------------------------------------------------------------- 
     855    ln_bkgwri = .false.    !  Logical switch for writing out background state  
     856    ln_trjwri = .false.    !  Logical switch for writing out state trajectory 
     857    ln_trainc = .false.    !  Logical switch for applying tracer increments 
     858    ln_dyninc = .false.    !  Logical switch for applying velocity increments 
     859    ln_sshinc = .false.    !  Logical switch for applying SSH increments  
     860    ln_asmdin = .false.    !  Logical switch for Direct Initialization (DI) 
     861    ln_asmiau = .false.    !  Logical switch for Incremental Analysis Updating (IAU) 
     862    nitbkg    = 0          !  Timestep of background in [0,nitend-nit000-1] 
     863    nitdin    = 0          !  Timestep of background for DI in [0,nitend-nit000-1] 
     864    nitiaustr = 1          !  Timestep of start of IAU interval in [0,nitend-nit000-1] 
     865    nitiaufin = 15         !  Timestep of end of IAU interval in [0,nitend-nit000-1] 
     866    niaufn    = 0          !  Type of IAU weighting function 
     867    nittrjfrq = 0          !  Frequency of trajectory output for 4D-VAR 
     868    ln_salfix = .false.    !  Logical switch for ensuring that the sa > salfixmin 
     869    salfixmin = -9999      !  Minimum salinity after applying the increments 
     870/ 
  • branches/nemo_v3_3_beta/NEMOGCM/CONFIG/GYRE_LOBSTER/EXP00/namelist

    r2399 r2417  
    11!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
    22!! NEMO/OPA  :  1 - run manager      (namrun) 
    3 !! namelists    2 - Domain           (namzgr, namzgr_sco, namdom) 
     3!! namelists    2 - Domain           (namzgr, namzgr_sco, namdom, namdta_tem, namdta_sal) 
    44!!              3 - Surface boundary (namsbc, namsbc_ana, namsbc_flx, namsbc_clio, namsbc_core 
    5 !!                                    namsbc_cpl, namqsr, namsbc_rnf, namsbc_ssr, namsbc_alb) 
     5!!                                    namsbc_cpl, namsbc_cpl_co2 namtra_qsr, namsbc_rnf,  
     6!!                                    namsbc_apr, namsbc_ssr, namsbc_alb) 
    67!!              4 - lateral boundary (namlbc, namcla, namobc, namagrif, nambdy, nambdy_tide) 
    78!!              5 - bottom  boundary (nambfr, nambbc, nambbl) 
     
    910!!              7 - dynamics         (namdyn_adv, namdyn_vor, namdyn_hpg, namdyn_spg, namdyn_ldf) 
    1011!!              8 - Verical physics  (namzdf, namzdf_ric, namzdf_tke, namzdf_kpp, namzdf_ddm, namzdf_tmx) 
    11 !!              9 - diagnostics      (namtrd, namgap, namspr, namflo, namptr) 
    12 !!              9 - miscellaneous    (namsol, nammpp, nammpp_dyndist, namctl) 
     12!!              9 - diagnostics      (namnc4, namtrd, namspr, namflo, namptr, namhsb) 
     13!!             10 - miscellaneous    (namsol, nammpp, nammpp_dyndist, namctl) 
     14!!             11 - Obs & Assim      (namobs, nam_asminc) 
    1315!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
    1416!  CAUTION: some scripts does not support CAPITALs for logical use .true./.false., not .TRUE./.FALSE. 
     
    1921!!   namrun            parameters of the run 
    2022!!====================================================================== 
    21  
     23! 
    2224!----------------------------------------------------------------------- 
    2325&namrun        !   parameters of the run 
     
    4345   cn_ocerst_out = "restart"   !  suffix of ocean restart name (output) 
    4446/ 
    45 !!====================================================================== 
    46 !!   namnc4            netcdf4 chunking and compression settings 
    47 !!====================================================================== 
    48 !----------------------------------------------------------------------- 
    49 &namnc4         !  netcdf4 chunking and compression settings     ("key_netcdf4") 
    50                 !  (ignored if "key_netcdf4" is not used) 
    51 !----------------------------------------------------------------------- 
    52    nn_nchunks_i   =   4       !  number of chunks in i-dimension 
    53    nn_nchunks_j   =   4       !  number of chunks in j-dimension 
    54    nn_nchunks_k   =   31      !  number of chunks in k-dimension 
    55                               !  setting nn_nchunks_k = jpk will give a chunk size of 1 in the vertical which 
    56                               !  is optimal for postprocessing which works exclusively with horizontal slabs 
    57    ln_nc4zip      =   .TRUE.  !  (T) use netcdf4 chunking and compression 
    58                               !  (F) ignore chunking information and produce netcdf3-compatible files 
    59 / 
     47 
    6048!!====================================================================== 
    6149!!                      ***  Domain namelists  *** 
     
    6452!!   namzgr_sco   s-coordinate or hybrid z-s-coordinate 
    6553!!   namdom       space and time domain (bathymetry, mesh, timestep) 
    66 !!====================================================================== 
    67  
     54!!   namdta_tem   data: temperature                                     ("key_dtatem") 
     55!!   namdta_sal   data: salinity                                        ("key_dtasal") 
     56!!====================================================================== 
     57! 
    6858!----------------------------------------------------------------------- 
    6959&namzgr        !   vertical coordinate 
     
    10393   rn_rdth     =  800.           !  depth variation of tracer time step  (used if nacc=1) 
    10494/ 
     95!----------------------------------------------------------------------- 
     96&namdta_tem    !   data : temperature                                   ("key_dtatem") 
     97!----------------------------------------------------------------------- 
     98!              ! file name ! frequency (hours)    ! variable ! time interp. ! clim  !'yearly' or ! weights  ! rotation ! 
     99!              !           !  (if <0  months)     !   name   !  (logical)   ! (T/F) ! 'monthly'  ! filename ! pairing  ! 
     100   sn_tem = 'data_1m_potential_temperature_nomask', -1,'votemper',  .true.  , .true., 'yearly'   , ' '      , ' ' 
     101   ! 
     102   cn_dir       = './'     !  root directory for the location of the runoff files 
     103/ 
     104!----------------------------------------------------------------------- 
     105&namdta_sal    !   data : salinity                                      ("key_dtasal") 
     106!----------------------------------------------------------------------- 
     107!              ! file name ! frequency (hours)    ! variable ! time interp. ! clim  !'yearly' or ! weights  ! rotation ! 
     108!              !           !  (if <0  months)     !   name   !   (logical)  ! (T/F) ! 'monthly'  ! filename ! pairing  ! 
     109   sn_sal      =  'data_1m_salinity_nomask',  -1  ,'vosaline',    .true.    , .true., 'yearly'   , ''       , ' ' 
     110   ! 
     111   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
     112/ 
     113 
    105114!!====================================================================== 
    106115!!            ***  Surface Boundary Condition namelists  *** 
    107116!!====================================================================== 
    108 !!   namsbc        surface boundary condition 
    109 !!   namsbc_ana    analytical         formulation 
    110 !!   namsbc_flx    flux               formulation 
    111 !!   namsbc_clio   CLIO bulk formulea formulation 
    112 !!   namsbc_core   CORE bulk formulea formulation 
    113 !!   namsbc_cpl    CouPLed            formulation                       ("key_coupled") 
    114 !!   namtra_qsr    penetrative solar radiation 
    115 !!   namsbc_rnf    river runoffs 
    116 !!   namsbc_ssr    sea surface restoring term (for T and/or S) 
    117 !!   namsbc_alb    albedo parameters 
    118 !!====================================================================== 
    119  
     117!!   namsbc          surface boundary condition 
     118!!   namsbc_ana      analytical         formulation 
     119!!   namsbc_flx      flux               formulation 
     120!!   namsbc_clio     CLIO bulk formulea formulation 
     121!!   namsbc_core     CORE bulk formulea formulation 
     122!!   namsbc_cpl      CouPLed            formulation                     ("key_coupled") 
     123!!   namsbc_cpl_co2  coupled ocean/biogeo/atmosphere model              ("key_cpl_carbon_cycle") 
     124!!   namtra_qsr      penetrative solar radiation 
     125!!   namsbc_rnf      river runoffs 
     126!!   namsbc_apr      Atmospheric Pressure 
     127!!   namsbc_ssr      sea surface restoring term (for T and/or S) 
     128!!   namsbc_alb      albedo parameters 
     129!!====================================================================== 
     130! 
    120131!----------------------------------------------------------------------- 
    121132&namsbc        !   Surface Boundary Condition (surface module) 
    122133!----------------------------------------------------------------------- 
    123134   nn_fsbc     = 1         !  frequency of surface boundary condition computation  
    124                            !               (= the frequency of sea-ice model call) 
    125    ln_ana      = .true.    !  analytical formulation (T => fill namsbc_ana )  
    126    ln_flx      = .false.   !  flux formulation       (T => fill namsbc_flx ) 
    127    ln_blk_clio = .false.   !  CLIO bulk formulation  (T => fill namsbc_clio)  
    128    ln_blk_core = .false.   !  CORE bulk formulation  (T => fill namsbc_core)  
    129    ln_cpl      = .false.   !  Coupled formulation    (T => fill namsbc_cpl ) 
     135                           !     (also = the frequency of sea-ice model call) 
     136   ln_ana      = .true.    !  analytical formulation                    (T => fill namsbc_ana )  
     137   ln_flx      = .false.   !  flux formulation                          (T => fill namsbc_flx ) 
     138   ln_blk_clio = .false.   !  CLIO bulk formulation                     (T => fill namsbc_clio)  
     139   ln_blk_core = .false.   !  CORE bulk formulation                     (T => fill namsbc_core)  
     140   ln_cpl      = .false.   !  Coupled formulation                       (T => fill namsbc_cpl ) 
    130141   ln_apr_dyn  = .false.   !  Patm gradient added in ocean & ice Eqs.   (T => fill namsbc_apr ) 
    131142   nn_ice      = 0         !  =0 no ice boundary condition   , 
    132143                           !  =1 use observed ice-cover      , 
    133                            !  =2 ice-model used                             ("key_lim3" or "key_lim2) 
     144                           !  =2 ice-model used                         ("key_lim3" or "key_lim2) 
    134145   ln_dm2dc    = .false.   !  daily mean to diurnal cycle short wave (qsr) 
    135146   ln_rnf      = .false.   !  runoffs (T => fill namsbc_rnf) 
    136    ln_ssr      = .false.   !  Sea Surface Restoring on T and/or S (T => fill namsbc_ssr) 
     147   ln_ssr      = .false.   !  Sea Surface Restoring on T and/or S       (T => fill namsbc_ssr) 
    137148   nn_fwb      = 0         !  FreshWater Budget: =0 unchecked                              ,  
    138                            !                     =1 global mean of e-p-r set to zero at each nn_fsbc time step   , 
    139                            !                     =2 annual global mean of e-p-r set to zero 
    140                            !                     =3 global emp set to zero and spread out over erp area 
     149                           !     =1 global mean of e-p-r set to zero at each time step  
     150                           !     =2 annual global mean of e-p-r set to zero 
     151                           !     =3 global emp set to zero and spread out over erp area 
    141152/ 
    142153!----------------------------------------------------------------------- 
     
    153164&namsbc_flx    !   surface boundary condition : flux formulation 
    154165!----------------------------------------------------------------------- 
    155 !              !   file name  ! frequency (hours) !  variable  ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    156 !              !              !  (if <0  months)  !    name    !    (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    157    sn_utau     = 'utau'       ,        24         ,    'utau'  ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    158    sn_vtau     = 'vtau'       ,        24         ,    'vtau'  ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    159    sn_qtot     = 'qtot'       ,        24         ,    'qtot'  ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    160    sn_qsr      = 'qsr'        ,        24         ,    'qsr'   ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    161    sn_emp      = 'emp'        ,        24         ,    'emp'   ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    162 ! 
     166!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     167!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     168   sn_utau     = 'utau'      ,        24         , 'utau'    , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     169   sn_vtau     = 'vtau'      ,        24         , 'vtau'    , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     170   sn_qtot     = 'qtot'      ,        24         , 'qtot'    , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     171   sn_qsr      = 'qsr'       ,        24         , 'qsr'     , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     172   sn_emp      = 'emp'       ,        24         , 'emp'     , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     173 
    163174   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the flux files 
    164175/       
     
    166177&namsbc_clio   !   namsbc_clio  CLIO bulk formulea 
    167178!----------------------------------------------------------------------- 
    168 !              !   file name  ! frequency (hours) !  variable  ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    169 !              !              !  (if <0  months)  !    name    !    (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    170    sn_utau     = 'taux_1m'    ,       -1          , 'sozotaux' ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    171    sn_vtau     = 'tauy_1m'    ,       -1          , 'sometauy' ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    172    sn_wndm     = 'flx'        ,       -1          , 'socliowi' ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    173    sn_tair     = 'flx'        ,       -1          , 'socliot2' ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    174    sn_humi     = 'flx'        ,       -1          , 'socliohu' ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    175    sn_ccov     = 'flx'        ,       -1          , 'socliocl' ,    .false.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    176    sn_prec     = 'flx'        ,       -1          , 'socliopl' ,    .false.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    177 ! 
     179!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     180!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     181   sn_utau     = 'taux_1m'   ,       -1          , 'sozotaux',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     182   sn_vtau     = 'tauy_1m'   ,       -1          , 'sometauy',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     183   sn_wndm     = 'flx'       ,       -1          , 'socliowi',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     184   sn_tair     = 'flx'       ,       -1          , 'socliot2',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     185   sn_humi     = 'flx'       ,       -1          , 'socliohu',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     186   sn_ccov     = 'flx'       ,       -1          , 'socliocl',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     187   sn_prec     = 'flx'       ,       -1          , 'socliopl',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     188 
    178189   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the bulk files are 
    179190/ 
     
    181192&namsbc_core   !   namsbc_core  CORE bulk formulea 
    182193!----------------------------------------------------------------------- 
    183 !              !   file name  ! frequency (hours) ! variable   ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights              ! rotation ! 
    184 !              !              !  (if <0  months)  !   name     !    (logical)   !  (T/F)  ! 'monthly' ! filename            ! pairing  ! 
    185    sn_wndi     = 'u10_core'   ,       -1          , 'u10'      ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,'bicubic_weights_orca2.nc' , 'U1' 
    186    sn_wndj     = 'v10_core'   ,       -1          , 'v10'      ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,'bicubic_weights_orca2.nc' , 'V1' 
    187    sn_qsr      = 'qsw_core'   ,       -1          , 'swdn'     ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,'bilinear_weights_orca2.nc', '' 
    188    sn_qlw      = 'qlw_core'   ,       -1          , 'lwdn'     ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,'bilinear_weights_orca2.nc', '' 
    189    sn_tair     = 't2_core'    ,       -1          , 't2'       ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,'bilinear_weights_orca2.nc', '' 
    190    sn_humi     = 'q2_core'    ,       -1          , 'q2'       ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,'bilinear_weights_orca2.nc', '' 
    191    sn_prec     = 'precip_core',       -1          , 'precip'   ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,'bilinear_weights_orca2.nc', '' 
    192    sn_snow     = 'snow_core'  ,       -1          , 'snow'     ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,'bilinear_weights_orca2.nc', '' 
    193    sn_tdif     = 'taudif_core',       24          , 'taudif'   ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,'bilinear_weights_orca2.nc', '' 
    194 ! 
     194!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     195!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     196   sn_wndi = 'u_10.15JUNE2009_orca2'       ,  6  , 'U_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , 'Uwnd' 
     197   sn_wndj = 'v_10.15JUNE2009_orca2'       ,  6  , 'V_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , 'Vwnd' 
     198   sn_qsr  = 'ncar_rad.15JUNE2009_orca2'   , 24  , 'SWDN_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     199   sn_qlw  = 'ncar_rad.15JUNE2009_orca2'   , 24  , 'LWDN_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     200   sn_tair = 't_10.15JUNE2009_orca2'       ,  6  , 'T_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     201   sn_humi = 'q_10.15JUNE2009_orca2'       ,  6  , 'Q_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     202   sn_prec = 'ncar_precip.15JUNE2009_orca2', -1  , 'PRC_MOD1',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     203   sn_snow = 'ncar_precip.15JUNE2009_orca2', -1  , 'SNOW'    ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     204   sn_tdif = 'taudif_core'                 , 24  , 'taudif'  ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     205 
    195206   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the bulk files 
    196    ln_2m       = .true.    !  air temperature and humidity referenced at 2m (T) instead 10m (F) 
     207   ln_2m       = .false.   !  air temperature and humidity referenced at 2m (T) instead 10m (F) 
    197208   ln_taudif   = .false.   !  HF tau contribution: use "mean of stress module - module of the mean stress" data ? 
    198209   rn_pfac     = 1.        !  multiplicative factor for precipitation (total & snow) 
    199210/ 
    200211!----------------------------------------------------------------------- 
    201 &namsbc_cpl    !   coupled ocean/atmosphere model                        ("key_coupled") 
    202 !----------------------------------------------------------------------- 
     212&namsbc_cpl    !   coupled ocean/atmosphere model                       ("key_coupled") 
     213!----------------------------------------------------------------------- 
     214!                                      ! send 
     215cn_snd_temperature= 'weighted oce and ice'  !  'oce only' 'weighted oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     216cn_snd_albedo     = 'weighted ice'          !  'none' 'weighted ice' 'mixed oce-ice' 
     217cn_snd_thickness  = 'none'                  !  'none' 'weighted ice and snow' 
     218cn_snd_crt_nature = 'none'                  !  'none' 'oce only' 'weighted oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     219cn_snd_crt_refere = 'spherical'             !  'spherical' 'cartesian' 
     220cn_snd_crt_orient = 'eastward-northward'    !  'eastward-northward' or 'local grid' 
     221cn_snd_crt_grid   = 'T'                     !  'T' 
     222!                                      ! receive 
     223cn_rcv_w10m       = 'none'                  !  'none' 'coupled' 
     224cn_rcv_taumod     = 'coupled'               !  'none' 'coupled' 
     225cn_rcv_tau_nature = 'oce only'              !  'oce only' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     226cn_rcv_tau_refere = 'cartesian'             !  'spherical' 'cartesian' 
     227cn_rcv_tau_orient = 'eastward-northward'    !  'eastward-northward' or 'local grid' 
     228cn_rcv_tau_grid   = 'U,V'                   !  'T' 'U,V' 'U,V,F' 'U,V,I' 'T,F' 'T,I' 'T,U,V' 
     229cn_rcv_dqnsdt     = 'coupled'               !  'none' 'coupled' 
     230cn_rcv_qsr        = 'oce and ice'           !  'conservative' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     231cn_rcv_qns        = 'oce and ice'           !  'conservative' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     232cn_rcv_emp        = 'conservative'          !  'conservative' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     233cn_rcv_rnf        = 'coupled'               !  'coupled' 'climato' 'mixed' 
     234cn_rcv_cal        = 'coupled'               !  'none' 'coupled' 
     235/ 
     236!----------------------------------------------------------------------- 
     237&namsbc_cpl_co2   !   coupled ocean/biogeo/atmosphere model             ("key_cpl_carbon_cycle") 
     238!----------------------------------------------------------------------- 
     239cn_snd_co2        = 'coupled'         ! send    :  'none' 'coupled' 
     240cn_rcv_co2        = 'coupled'         ! receive : 'none' 'coupled' 
    203241/ 
    204242!----------------------------------------------------------------------- 
    205243&namtra_qsr    !   penetrative solar radiation 
    206244!----------------------------------------------------------------------- 
    207 !              !   file name  ! frequency (hours) ! variable   ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    208 !              !              !  (if <0  months)  !   name     !    (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    209    sn_chl      = 'chlorophyll',        -1         , 'CHLA'     ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    210   
     245!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     246!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     247   sn_chl      ='chlorophyll',        -1         , 'CHLA'    ,   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     248 
    211249   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
    212250   ln_traqsr   = .true.    !  Light penetration (T) or not (F) 
     
    222260&namsbc_rnf    !   runoffs namelist surface boundary condition 
    223261!----------------------------------------------------------------------- 
    224 !              !   file name  ! frequency (hours) ! variable   ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    225 !              !              !  (if <0  months)  !   name     !    (logical)   !  (T/F)  ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    226    sn_rnf      = 'runoff_1m_nomask' ,  -1         , 'sorunoff' ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  , ''       , '' 
    227    sn_cnf      = 'runoff_1m_nomask' ,   0         , 'socoefr'  ,    .false.     , .true.  , 'yearly'  , ''       , '' 
    228    sn_s_rnf    = 'runoffs'          ,  24         , 'rosaline' ,    .true.      , .true.  ,   'yearly', ''       , '' 
    229    sn_t_rnf    = 'runoffs'          ,  24         , 'rotemper' ,    .true.      , .true.  ,   'yearly', ''       , '' 
    230    sn_dep_rnf  = 'runoffs'          ,   0         , 'rodepth'  ,    .false.     , .true.  ,   'yearly', ''       , '' 
     262!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     263!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     264   sn_rnf      = 'runoff_1m_nomask' ,  -1        , 'sorunoff',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     265   sn_cnf      = 'runoff_1m_nomask' ,   0        , 'socoefr' ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     266   sn_s_rnf    = 'runoffs'          ,  24        , 'rosaline',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     267   sn_t_rnf    = 'runoffs'          ,  24        , 'rotemper',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     268   sn_dep_rnf  = 'runoffs'          ,   0        , 'rodepth' ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     269 
    231270   cn_dir       = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
    232271   ln_rnf_emp   =   .false. !  runoffs included into precipitation field (T) or into a file (F) 
    233272   ln_rnf_mouth =   .false. !  specific treatment at rivers mouths 
    234    rn_hrnf      =   0.e0    !  depth over which enhanced vertical mixing is used 
     273   rn_hrnf      =  15.e0    !  depth over which enhanced vertical mixing is used 
    235274   rn_avt_rnf   =   1.e-3   !  value of the additional vertical mixing coef. [m2/s] 
    236275   rn_rfact     =   1.e0    !  multiplicative factor for runoff 
     
    244283!              ! file name ! frequency (hours) ! variable ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    245284!              !           !  (if <0  months)  !   name   !    (logical)   !  (T/F)  ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    246    sn_apr      = 'patm'    ,         -1        , 'somslpre',    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,  ''      ,   '' 
    247 ! 
     285   sn_apr      = 'patm'    ,         -1        ,'somslpre',    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,  ''      ,   '' 
     286 
    248287   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the bulk files 
    249288   ln_ref_apr  = .false.   !  ref. pressure: global mean Patm (T) or a constant (F) 
     
    252291&namsbc_ssr    !   surface boundary condition : sea surface restoring 
    253292!----------------------------------------------------------------------- 
    254 !              !   file name  ! frequency (hours) ! variable   ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    255 !              !              !  (if <0  months)  !   name     !    (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    256    sn_sst      = 'sst_data'   ,        24         ,  'sst'     ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    257    sn_sss      = 'sss_data'   ,        -1         ,  'sss'     ,     .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    258      
     293!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     294!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     295   sn_sst      = 'sst_data'  ,        24         ,  'sst'    ,    .false.   , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     296   sn_sss      = 'sss_data'  ,        -1         ,  'sss'    ,    .true.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     297 
    259298   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
    260299   nn_sstr     =     0     !  add a retroaction term in the surface heat       flux (=1) or not (=0) 
     
    264303   rn_deds     =   -27.7   !  magnitude of the damping on salinity   [mm/day] 
    265304   ln_sssr_bnd =   .false. !  flag to bound erp term (associated with nn_sssr=2) 
    266    rn_sssr_bnd =   0.e0    !  ABS(Max/Min) value of the damping erp term [mm/day] 
     305   rn_sssr_bnd =   4.e0    !  ABS(Max/Min) value of the damping erp term [mm/day] 
    267306/       
    268307!----------------------------------------------------------------------- 
     
    286325!!   namtide       Tidal forcing at open boundaries                     ("key_bdy_tides") 
    287326!!====================================================================== 
    288  
     327! 
    289328!----------------------------------------------------------------------- 
    290329&namlbc        !   lateral momentum boundary condition 
     
    301340&namobc        !   open boundaries parameters                           ("key_obc") 
    302341!----------------------------------------------------------------------- 
    303     ln_obc_clim= .false.   !  climatological obc data files (T) or not (F) 
    304     ln_vol_cst = .true.    !  impose the total volume conservation (T) or not (F) 
    305     ln_obc_fla = .false.   !  Flather open boundary condition  
    306     nn_obcdta  =    1      !  = 0 the obc data are equal to the initial state 
     342   ln_obc_clim = .false.   !  climatological obc data files (T) or not (F) 
     343   ln_vol_cst = .true.    !  impose the total volume conservation (T) or not (F) 
     344   ln_obc_fla = .false.   !  Flather open boundary condition  
     345   nn_obcdta   =    1      !  = 0 the obc data are equal to the initial state 
    307346                           !  = 1 the obc data are read in 'obc.dta' files 
    308     cn_obcdta  = 'annual'  !  set to annual if obc datafile hold 1 year of data 
     347   cn_obcdta   = 'annual'  !  set to annual if obc datafile hold 1 year of data 
    309348                           !  set to monthly if obc datafile hold 1 month of data 
    310     rn_dpein   =    1.     !  damping time scale for inflow at east  open boundary 
    311     rn_dpwin   =    1.     !     -           -         -       west    -      - 
    312     rn_dpnin   =    1.     !     -           -         -       north   -      - 
    313     rn_dpsin   =    1.     !     -           -         -       south   -      - 
    314     rn_dpeob   = 3000.     !  time relaxation (days) for the east  open boundary 
    315     rn_dpwob   =   15.     !     -           -         -     west    -      - 
    316     rn_dpnob   = 3000.     !     -           -         -     north   -      - 
    317     rn_dpsob   =   15.     !     -           -         -     south   -      - 
    318     rn_volemp  =  1.       !  = 0 the total volume change with the surface flux (E-P-R) 
     349   rn_dpein    =    1.     !  damping time scale for inflow at east  open boundary 
     350   rn_dpwin    =    1.     !     -           -         -       west    -      - 
     351   rn_dpnin    =    1.     !     -           -         -       north   -      - 
     352   rn_dpsin    =    1.     !     -           -         -       south   -      - 
     353   rn_dpeob    = 3000.     !  time relaxation (days) for the east  open boundary 
     354   rn_dpwob    =   15.     !     -           -         -     west    -      - 
     355   rn_dpnob    = 3000.     !     -           -         -     north   -      - 
     356   rn_dpsob    =   15.     !     -           -         -     south   -      - 
     357   rn_volemp   =  1.       !  = 0 the total volume change with the surface flux (E-P-R) 
    319358                           !  = 1 the total volume remains constant 
    320359/ 
     
    322361&namagrif      !  AGRIF zoom                                            ("key_agrif") 
    323362!----------------------------------------------------------------------- 
    324     nn_cln_update = 3      !  baroclinic update frequency 
    325     ln_spc_dyn    = .true. !  use 0 as special value for dynamics 
    326     rn_sponge_tra = 2880.  !  coefficient for tracer   sponge layer [s] 
    327     rn_sponge_dyn = 2880.  !  coefficient for dynamics sponge layer [s] 
     363   nn_cln_update = 3       !  baroclinic update frequency 
     364   ln_spc_dyn    = .true. !  use 0 as special value for dynamics 
     365   rn_sponge_tra = 2880.   !  coefficient for tracer   sponge layer [s] 
     366   rn_sponge_dyn = 2880.   !  coefficient for dynamics sponge layer [s] 
    328367/ 
    329368!----------------------------------------------------------------------- 
    330369&nambdy        !  unstructured open boundaries                          ("key_bdy") 
    331370!----------------------------------------------------------------------- 
    332     cn_mask    =  ''                        !  name of mask file (if ln_bdy_mask=.TRUE.) 
    333     cn_dta_frs_T  = 'bdydata_grid_T.nc'     !  name of data file (T-points) 
    334     cn_dta_frs_U  = 'bdydata_grid_U.nc'     !  name of data file (U-points) 
    335     cn_dta_frs_V  = 'bdydata_grid_V.nc'     !  name of data file (V-points) 
    336     cn_dta_fla_T  = 'bdydata_bt_grid_T.nc'  !  name of data file for Flather condition (T-points) 
    337     cn_dta_fla_U  = 'bdydata_bt_grid_U.nc'  !  name of data file for Flather condition (U-points) 
    338     cn_dta_fla_V  = 'bdydata_bt_grid_V.nc'  !  name of data file for Flather condition (V-points) 
    339     ln_clim    = .false.                    !  contain 1 (T) or 12 (F) time dumps and be cyclic 
    340     ln_vol     = .false.                    !  total volume correction (see volbdy parameter) 
    341     ln_mask    = .false.                    !  boundary mask from filbdy_mask (T) or boundaries are on edges of domain (F) 
    342     ln_tides   = .false.                    !  Apply tidal harmonic forcing with Flather condition 
    343     ln_dyn_fla = .false.                    !  Apply Flather condition to velocities 
    344     ln_tra_frs = .false.                    !  Apply FRS condition to temperature and salinity  
    345     ln_dyn_frs = .false.                    !  Apply FRS condition to velocities 
    346     nn_rimwidth    =  9                     !  width of the relaxation zone 
    347     nn_dtactl      =  1                     !  = 0, bdy data are equal to the initial state 
    348                                             !  = 1, bdy data are read in 'bdydata   .nc' files 
    349     nn_volctl      =  0                     !  = 0, the total water flux across open boundaries is zero 
    350                                             !  = 1, the total volume of the system is conserved 
    351 / 
    352 !----------------------------------------------------------------------- 
    353 &nambdy_tide     ! tidal forcing at unstructured boundaries               
    354 !----------------------------------------------------------------------- 
    355     filtide      = 'bdytide_'           !  file name root of tidal forcing files 
    356     tide_cpt     = 'M2','S1'            !  names of tidal components used 
    357     tide_speed   = 28.984106, 15.000001 !  phase speeds of tidal components (deg/hour) 
    358     ln_tide_date = .false.              !  adjust tidal harmonics for start date of run 
     371   cn_mask       =  ''                     !  name of mask file (if ln_bdy_mask=.TRUE.) 
     372   cn_dta_frs_T  = 'bdydata_grid_T.nc'     !  name of data file (T-points) 
     373   cn_dta_frs_U  = 'bdydata_grid_U.nc'     !  name of data file (U-points) 
     374   cn_dta_frs_V  = 'bdydata_grid_V.nc'     !  name of data file (V-points) 
     375   cn_dta_fla_T  = 'bdydata_bt_grid_T.nc'  !  name of data file for Flather condition (T-points) 
     376   cn_dta_fla_U  = 'bdydata_bt_grid_U.nc'  !  name of data file for Flather condition (U-points) 
     377   cn_dta_fla_V  = 'bdydata_bt_grid_V.nc'  !  name of data file for Flather condition (V-points) 
     378 
     379   ln_clim     = .false.   !  contain 1 (T) or 12 (F) time dumps and be cyclic 
     380   ln_vol      = .false.   !  total volume correction (see volbdy parameter) 
     381   ln_mask     = .false.   !  boundary mask from filbdy_mask (T), boundaries are on edges of domain (F) 
     382   ln_tides    = .false.   !  Apply tidal harmonic forcing with Flather condition 
     383   ln_dyn_fla  = .false.   !  Apply Flather condition to velocities 
     384   ln_tra_frs  = .false.   !  Apply FRS condition to temperature and salinity  
     385   ln_dyn_frs  = .false.   !  Apply FRS condition to velocities 
     386   nn_rimwidth =  9        !  width of the relaxation zone 
     387   nn_dtactl   =  1        !  = 0, bdy data are equal to the initial state 
     388                           !  = 1, bdy data are read in 'bdydata   .nc' files 
     389   nn_volctl   =  0        !  = 0, the total water flux across open boundaries is zero 
     390                           !  = 1, the total volume of the system is conserved 
     391/ 
     392!----------------------------------------------------------------------- 
     393&nambdy_tide   !  tidal forcing at unstructured boundaries               
     394!----------------------------------------------------------------------- 
     395   filtide     = 'bdytide_'           !  file name root of tidal forcing files 
     396   tide_cpt    = 'M2','S1'            !  names of tidal components used 
     397   tide_speed  = 28.984106, 15.000001 !  phase speeds of tidal components (deg/hour) 
     398   ln_tide_date= .false.              !  adjust tidal harmonics for start date of run 
    359399/ 
    360400 
     
    366406!!   nambbl        bottom boundary layer scheme                         ("key_trabbl") 
    367407!!====================================================================== 
    368  
     408! 
    369409!----------------------------------------------------------------------- 
    370410&nambfr        !   bottom friction 
     
    388428/ 
    389429!----------------------------------------------------------------------- 
    390 &nambbl        !   bottom boundary layer scheme                     
     430&nambbl        !   bottom boundary layer scheme 
    391431!----------------------------------------------------------------------- 
    392432   nn_bbl_ldf  =  1      !  diffusive bbl (=1)   or not (=0) 
     
    395435   rn_gambbl   =  10.    !  advective bbl coefficient                 [s] 
    396436/ 
     437 
    397438!!====================================================================== 
    398439!!                        Tracer (T & S ) namelists 
     
    403444!!   namtra_dmp    T & S newtonian damping                              ("key_tradmp") 
    404445!!====================================================================== 
    405  
     446! 
    406447!----------------------------------------------------------------------- 
    407448&nameos        !   ocean physical parameters 
     
    422463   ln_traadv_muscl2 =  .false.  !  MUSCL2 scheme + cen2 at boundaries   
    423464   ln_traadv_ubs    =  .false.  !  UBS scheme                  
     465   ln_traadv_qck    =  .false.  !  QUCIKEST scheme                  
    424466/ 
    425467!----------------------------------------------------------------------- 
    426468&namtra_ldf    !   lateral diffusion scheme for tracer  
    427469!----------------------------------------------------------------------- 
    428                            !  Type of the operator :  
    429    ln_traldf_lap    =  .true.   !     laplacian operator        
    430    ln_traldf_bilap  =  .false.  !     bilaplacian operator      
    431                            !  Direction of action  : 
    432    ln_traldf_level  =  .false.  !     iso-level                 
    433    ln_traldf_hor    =  .false.  !     horizontal (geopotential)         (require "key_ldfslp" when ln_sco=T) 
    434    ln_traldf_iso    =  .true.   !     iso-neutral                       (require "key_ldfslp") 
    435    ln_traldf_grif   =  .false.  !     griffies skew flux formulation    (require "key_ldfslp")   ! UNDER TEST, DO NOT USE 
    436    ln_traldf_gdia   =  .false.  !     griffies operator strfn diagnostics (require "key_ldfslp") ! UNDER TEST, DO NOT USE 
    437                            !  Coefficient 
    438    rn_aht_0         =  1000.    !     horizontal eddy diffusivity for tracers [m2/s] 
    439    rn_ahtb_0        =     0.    !     background eddy diffusivity for ldf_iso [m2/s] 
    440    rn_aeiv_0        =     0.    !     eddy induced velocity coefficient [m2/s]    (require "key_traldf_eiv") 
     470   !                       !  Type of the operator :  
     471   ln_traldf_lap    =  .true.   !  laplacian operator        
     472   ln_traldf_bilap  =  .false.  !  bilaplacian operator      
     473   !                       !  Direction of action  : 
     474   ln_traldf_level  =  .false.  !  iso-level                 
     475   ln_traldf_hor    =  .false.  !  horizontal (geopotential)            (require "key_ldfslp" when ln_sco=T) 
     476   ln_traldf_iso    =  .true.   !  iso-neutral                          (require "key_ldfslp") 
     477   ln_traldf_grif   =  .false.  !  griffies skew flux formulation       (require "key_ldfslp")  ! UNDER TEST, DO NOT USE 
     478   ln_traldf_gdia   =  .false.  !  griffies operator strfn diagnostics  (require "key_ldfslp") ! UNDER TEST, DO NOT USE 
     479   !                       !  Coefficient 
     480   rn_aht_0         =  1000.    !  horizontal eddy diffusivity for tracers [m2/s] 
     481   rn_ahtb_0        =     0.    !  background eddy diffusivity for ldf_iso [m2/s] 
     482   rn_aeiv_0        =     0.    !  eddy induced velocity coefficient [m2/s]      (require "key_traldf_eiv") 
    441483/ 
    442484!----------------------------------------------------------------------- 
     
    454496   nn_file     =    1      !  create a damping.coeff NetCDF file (=1) or not (=0) 
    455497/ 
     498 
    456499!!====================================================================== 
    457500!!                      ***  Dynamics namelists  *** 
     
    463506!!   namdyn_ldf    lateral diffusion scheme 
    464507!!====================================================================== 
    465  
     508! 
    466509!----------------------------------------------------------------------- 
    467510&namdyn_adv    !   formulation of the momentum advection 
     
    504547&namdyn_ldf    !   lateral diffusion on momentum 
    505548!----------------------------------------------------------------------- 
    506                            !  Type of the operator :  
     549   !                       !  Type of the operator :  
    507550   ln_dynldf_lap    =  .true.   !  laplacian operator          
    508551   ln_dynldf_bilap  =  .false.  !  bilaplacian operator     
    509                            !  Direction of action  :  
     552   !                       !  Direction of action  :  
    510553   ln_dynldf_level  =  .false.  !  iso-level                
    511554   ln_dynldf_hor    =  .true.   !  horizontal (geopotential)            (require "key_ldfslp" in s-coord.) 
    512555   ln_dynldf_iso    =  .false.  !  iso-neutral                          (require "key_ldfslp") 
    513                            !  Coefficient 
     556   !                       !  Coefficient 
    514557   rn_ahm_0_lap     = 100000.   !  horizontal laplacian eddy viscosity   [m2/s] 
    515558   rn_ahmb_0        =     0.    !  background eddy viscosity for ldf_iso [m2/s] 
    516    rn_ahm_0_blp     =     0.    !  horizontal bilaplacian eddy viscosity [m4/s] 
    517 / 
     559   rn_ahm_0_blp     =     0.    !  horizontal bilaplacian eddy viscosity [m4/s]  
     560/ 
     561 
    518562!!====================================================================== 
    519563!!             Tracers & Dynamics vertical physics namelists 
    520564!!====================================================================== 
    521 !!       namzdf        vertical physics 
    522 !!       namzdf_ric    richardson number dependent vertical mixing      ("key_zdfric"      ) 
    523 !!       namzdf_tke    TKE dependent vertical mixing                    ("key_zdftke"      ) 
    524 !!       namzdf_kpp    KPP dependent vertical mixing                    ("key_zdfkpp"      ) 
    525 !!       namzdf_ddm    double diffusive mixing parameterization         ("key_zdfddm"      ) 
    526 !!       namzdf_tmx    tidal mixing parameterization                    ("key_zdftmx"      ) 
    527 !!====================================================================== 
    528  
     565!!    namzdf        vertical physics 
     566!!    namzdf_ric    richardson number dependent vertical mixing         ("key_zdfric") 
     567!!    namzdf_tke    TKE dependent vertical mixing                       ("key_zdftke") 
     568!!    namzdf_kpp    KPP dependent vertical mixing                       ("key_zdfkpp") 
     569!!    namzdf_ddm    double diffusive mixing parameterization            ("key_zdfddm") 
     570!!    namzdf_tmx    tidal mixing parameterization                       ("key_zdftmx") 
     571!!====================================================================== 
     572! 
    529573!----------------------------------------------------------------------- 
    530574&namzdf        !   vertical physics 
     
    591635/ 
    592636!----------------------------------------------------------------------- 
    593 &namzdf_gls                !   GLS vertical diffusion  ("key_zdfgls") 
    594 !----------------------------------------------------------------------- 
    595    rn_emin        = 1.e-6  !  minimum value of e   [m2/s2] 
    596    rn_epsmin      = 1.e-12 !  minimum value of eps [m2/s3] 
    597    ln_length_lim  = .true. !  limit on the dissipation rate under stable stratification (Galperin et al., 1988) 
    598    rn_clim_galp   = 0.53   !  galperin limit 
    599    ln_crban       = .TRUE. !  Use Craig & Banner (1994) surface wave mixing parametrisation 
    600    ln_sigpsi      = .TRUE. !  Activate or not Burchard 2001 mods on psi schmidt number in the wb case 
    601    rn_crban       = 100.   !  Craig and Banner 1994 constant for wb tke flux 
    602    rn_charn       = 70000. !  Charnock constant for wb induced roughness length 
    603    nn_tkebc_surf  =   1    !  surface tke condition (0/1/2=Dir/Neum/Dir Mellor-Blumberg) 
    604    nn_tkebc_bot   =   1    !  bottom tke condition (0/1=Dir/Neum) 
    605    nn_psibc_surf  =   1    !  surface psi condition (0/1/2=Dir/Neum/Dir Mellor-Blumberg) 
    606    nn_psibc_bot   =   1    !  bottom psi condition (0/1=Dir/Neum) 
    607    nn_stab_func   =   2    !  stability function (0=Galp, 1= KC94, 2=CanutoA, 3=CanutoB) 
    608    nn_clos        =   1    !  predefined closure type (0=MY82, 1=k-eps, 2=k-w, 3=Gen) 
     637&namzdf_gls                !   GLS vertical diffusion                   ("key_zdfgls") 
     638!----------------------------------------------------------------------- 
     639   rn_emin       = 1.e-6   !  minimum value of e   [m2/s2] 
     640   rn_epsmin     = 1.e-12 !  minimum value of eps [m2/s3] 
     641   ln_length_lim = .true. !  limit on the dissipation rate under stable stratification (Galperin et al., 1988) 
     642   rn_clim_galp  = 0.53    !  galperin limit 
     643   ln_crban      = .TRUE. !  Use Craig & Banner (1994) surface wave mixing parametrisation 
     644   ln_sigpsi     = .TRUE. !  Activate or not Burchard 2001 mods on psi schmidt number in the wb case 
     645   rn_crban      = 100.    !  Craig and Banner 1994 constant for wb tke flux 
     646   rn_charn      = 70000. !  Charnock constant for wb induced roughness length 
     647   nn_tkebc_surf =   1     !  surface tke condition (0/1/2=Dir/Neum/Dir Mellor-Blumberg) 
     648   nn_tkebc_bot  =   1     !  bottom tke condition (0/1=Dir/Neum) 
     649   nn_psibc_surf =   1     !  surface psi condition (0/1/2=Dir/Neum/Dir Mellor-Blumberg) 
     650   nn_psibc_bot  =   1     !  bottom psi condition (0/1=Dir/Neum) 
     651   nn_stab_func  =   2     !  stability function (0=Galp, 1= KC94, 2=CanutoA, 3=CanutoB) 
     652   nn_clos       =   1     !  predefined closure type (0=MY82, 1=k-eps, 2=k-w, 3=Gen) 
    609653/ 
    610654!----------------------------------------------------------------------- 
     
    624668   rn_tfe_itf  = 1.        !  ITF tidal dissipation efficiency 
    625669/ 
     670 
    626671!!====================================================================== 
    627672!!                  ***  Miscelaneous namelists  *** 
     
    632677!!   namsol            elliptic solver / island / free surface  
    633678!!====================================================================== 
    634  
     679! 
    635680!----------------------------------------------------------------------- 
    636681&namsol        !   elliptic solver / island / free surface  
     
    676721 
    677722!!====================================================================== 
    678 !!                       ***  Diagnostics namelists  *** 
    679 !!====================================================================== 
     723!!                  ***  Diagnostics namelists  *** 
     724!!====================================================================== 
     725!!   namnc4       netcdf4 chunking and compression settings             ("key_netcdf4") 
    680726!!   namtrd       dynamics and/or tracer trends                         ("key_trddyn","key_trdtra","key_trdmld") 
    681 !!   namgap       level mean model-data gap                             ("key_diagap") 
    682727!!   namflo       float parameters                                      ("key_float") 
    683728!!   namptr       Poleward Transport Diagnostics 
    684 !!====================================================================== 
    685  
     729!!   namhsb       Heat and salt budgets  
     730!!====================================================================== 
     731! 
     732!----------------------------------------------------------------------- 
     733&namnc4        !   netcdf4 chunking and compression settings            ("key_netcdf4") 
     734!----------------------------------------------------------------------- 
     735   nn_nchunks_i=   4       !  number of chunks in i-dimension 
     736   nn_nchunks_j=   4       !  number of chunks in j-dimension 
     737   nn_nchunks_k=   31      !  number of chunks in k-dimension 
     738                           !  setting nn_nchunks_k = jpk will give a chunk size of 1 in the vertical which 
     739                           !  is optimal for postprocessing which works exclusively with horizontal slabs 
     740   ln_nc4zip   = .TRUE.    !  (T) use netcdf4 chunking and compression 
     741                           !  (F) ignore chunking information and produce netcdf3-compatible files 
     742/ 
    686743!----------------------------------------------------------------------- 
    687744&namtrd        !   diagnostics on dynamics and/or tracer trends         ("key_trddyn" and/or "key_trdtra") 
    688 !              !       or mixed-layer trends or barotropic vorticity    ('key_trdmld' or  "key_trdvor") 
     745!              !       or mixed-layer trends or barotropic vorticity    ("key_trdmld" or     "key_trdvor") 
    689746!----------------------------------------------------------------------- 
    690747   nn_trd      = 365       !  time step frequency dynamics and tracers trends 
     
    697754/ 
    698755!----------------------------------------------------------------------- 
    699 &namgap       !   level mean model-data gap                             ('key_diagap') 
    700 !----------------------------------------------------------------------- 
    701    nn_gap     =  15        !  time-step frequency of model-data gap computation 
    702    nn_prg     =  10        !  time-step frequency of gap print in model output 
    703 / 
    704 !----------------------------------------------------------------------- 
    705756&namflo       !   float parameters                                      ("key_float") 
    706757!----------------------------------------------------------------------- 
    707     ln_rstflo = .false.    !  float restart (T) or not (F) 
    708     nn_writefl=      75    !  frequency of writing in float output file  
    709     nn_stockfl=    5475    !  frequency of creation of the float restart file  
    710     ln_argo   = .false.    !  Argo type floats (stay at the surface each 10 days) 
    711     ln_flork4 = .false.    !  trajectories computed with a 4th order Runge-Kutta (T) 
     758   ln_rstflo = .false.    !  float restart (T) or not (F) 
     759   nn_writefl =      75    !  frequency of writing in float output file  
     760   nn_stockfl =    5475    !  frequency of creation of the float restart file  
     761   ln_argo    = .false.    !  Argo type floats (stay at the surface each 10 days) 
     762   ln_flork4 = .false.    !  trajectories computed with a 4th order Runge-Kutta (T) 
    712763                           !  or computed with Blanke' scheme (F) 
    713764/ 
     
    716767!----------------------------------------------------------------------- 
    717768   ln_diaptr  = .false.    !  Poleward heat and salt transport (T) or not (F) 
    718    ln_diaznl  = .false.    !  Add zonal means and meridional stream functions 
    719    ln_subbas  = .false.    !  Atlantic/Pacific/Indian basins computation (T) or not  
     769   ln_diaznl  = .true.     !  Add zonal means and meridional stream functions 
     770   ln_subbas  = .true.     !  Atlantic/Pacific/Indian basins computation (T) or not  
    720771                           !  (orca configuration only, need input basins mask file named "subbasins.nc" 
    721    ln_ptrcomp = .false.    !  Add decomposition : overturning 
     772   ln_ptrcomp = .true.     !  Add decomposition : overturning 
    722773   nn_fptr    =  1         !  Frequency of ptr computation [time step] 
    723774   nn_fwri    =  15        !  Frequency of ptr outputs [time step] 
     
    728779   ln_diahsb  = .false.     !  check the heat and salt budgets (T) or not (F) 
    729780/ 
    730 !----------------------------------------------------------------------- 
    731 !       namobs    observation usage switch 
    732 !----------------------------------------------------------------------- 
    733 ! 
    734 !  ln_t3d                  Logical switch for T profile observations          
    735 !  ln_s3d                  Logical switch for S profile observations           
    736 !  ln_ena                  Logical switch for ENACT insitu data set            
    737 !  ln_cor                  Logical switch for Coriolis insitu data set        
    738 !  ln_profb                Logical switch for feedback insitu data set      
    739 !  ln_sla                  Logical switch for SLA observations                
    740 !  ln_sladt                Logical switch for AVISO SLA data               
    741 !  ln_slafb                Logical switch for feedback SLA data             
    742 !  ln_ssh                  Logical switch for SSH observations               
    743 !  ln_sst                  Logical switch for SST observations               
    744 !  ln_reysst               Logical switch for Reynolds observations        
    745 !  ln_ghrsst               Logical switch for GHRSST observations           
    746 !  ln_sstfb                Logical switch for feedback SST data           
    747 !  ln_sss                  Logical switch for SSS observations               
    748 !  ln_seaice               Logical switch for Sea Ice observations         
    749 !  ln_vel3d                Logical switch for velocity observations          
    750 !  ln_velavcur             Logical switch for velocity daily av. cur.     
    751 !  ln_velhrcur             Logical switch for velocity high freq. cur.    
    752 !  ln_velavadcp            Logical switch for velocity daily av. ADCP   
    753 !  ln_velhradcp            Logical switch for velocity high freq. ADCP 
    754 !  ln_velfb                Logical switch for feedback velocity data        
    755 !  ln_grid_global          Global distribtion of observations          
    756 !  ln_grid_search_lookup   Logical switch for obs grid search w/lookup table   
    757 !  grid_search_file        Grid search lookup file header  
    758 !  enactfiles              ENACT input observation file names  
    759 !  coriofiles              Coriolis input observation file name   
    760 !  profbfiles              Profile feedback input observation file name  
    761 !  ln_profb_enatim         Enact feedback input time setting switch     
    762 !  slafilesact             Active SLA input observation file name 
    763 !  slafilespas             Passive SLA input observation file name  
    764 !  slafbfiles              Feedback SLA input observation file name  
    765 !  sstfiles                GHRSST input observation file name        
    766 !  sstfbfiles              Feedback SST input observation file name  
    767 !  seaicefiles             Sea Ice input observation file name  
    768 !  velavcurfiles           Vel. cur. daily av. input file name   
    769 !  velhvcurfiles           Vel. cur. high freq. input file name   
    770 !  velavadcpfiles          Vel. ADCP daily av. input file name     
    771 !  velhvadcpfiles          Vel. ADCP high freq. input file name  
    772 !  velfbfiles              Vel. feedback input observation file name  
    773 !  dobsini                 Initial date in window YYYYMMDD.HHMMSS        
    774 !  dobsend                 Final date in window YYYYMMDD.HHMMSS          
    775 !  n1dint                  Type of vertical interpolation method         
    776 !  n2dint                  Type of horizontal interpolation method        
    777 !  ln_nea                  Rejection of observations near land switch     
    778 !  nmsshc                  MSSH correction scheme                          
    779 !  mdtcorr                 MDT  correction                                
    780 !  mdtcutoff               MDT cutoff for computed correction           
    781 !  ln_altbias              Logical switch for alt bias                 
    782 !  ln_ignmis               Logical switch for ignoring missing files    
    783 !  endailyavtypes          ENACT daily average types                     
    784  &namobs 
    785    ln_t3d = .false. 
    786    ln_s3d = .false. 
    787    ln_ena = .false. 
    788    ln_profb = .false. 
    789    ln_sla = .false. 
    790    ln_sladt = .false. 
    791    ln_slafb = .false. 
    792    ln_sst = .false. 
    793    ln_sstfb = .false. 
    794    nmsshc = 0 
     781 
     782!!====================================================================== 
     783!!            ***  Observation & Assimilation namelists *** 
     784!!====================================================================== 
     785!!   namobs       observation and model comparison                      ('key_diaobs') 
     786!!   nam_asminc   assimilation increments                               ('key_asminc') 
     787!!====================================================================== 
     788! 
     789!----------------------------------------------------------------------- 
     790&namobs       !  observation usage switch                               ('key_diaobs') 
     791!----------------------------------------------------------------------- 
     792   ln_t3d     = .false.    ! Logical switch for T profile observations          
     793   ln_s3d     = .false.    ! Logical switch for S profile observations           
     794   ln_ena     = .false.    ! Logical switch for ENACT insitu data set            
     795   !                       !     ln_cor                  Logical switch for Coriolis insitu data set        
     796   ln_profb   = .false.    ! Logical switch for feedback insitu data set      
     797   ln_sla     = .false.    ! Logical switch for SLA observations                
     798 
     799   ln_sladt   = .false.    ! Logical switch for AVISO SLA data               
     800 
     801   ln_slafb   = .false.    ! Logical switch for feedback SLA data             
     802                           !     ln_ssh                  Logical switch for SSH observations               
     803 
     804   ln_sst     = .false.    ! Logical switch for SST observations               
     805                           !     ln_reysst               Logical switch for Reynolds observations        
     806                           !     ln_ghrsst               Logical switch for GHRSST observations           
     807 
     808   ln_sstfb   = .false.    ! Logical switch for feedback SST data           
     809                           !     ln_sss                  Logical switch for SSS observations               
     810                           !     ln_seaice               Logical switch for Sea Ice observations         
     811                           !     ln_vel3d                Logical switch for velocity observations          
     812                           !     ln_velavcur             Logical switch for velocity daily av. cur.     
     813                           !     ln_velhrcur             Logical switch for velocity high freq. cur.    
     814                           !     ln_velavadcp            Logical switch for velocity daily av. ADCP   
     815                           !     ln_velhradcp            Logical switch for velocity high freq. ADCP 
     816                           !     ln_velfb                Logical switch for feedback velocity data        
     817                           !     ln_grid_global          Global distribtion of observations          
     818                           !     ln_grid_search_lookup   Logical switch for obs grid search w/lookup table   
     819                           !     grid_search_file        Grid search lookup file header  
     820                           !     enactfiles              ENACT input observation file names  
     821                           !     coriofiles              Coriolis input observation file name   
     822   !                       ! profbfiles: Profile feedback input observation file name  
    795823   profbfiles = 'profiles_01.nc' 
     824                           !     ln_profb_enatim         Enact feedback input time setting switch     
     825                           !     slafilesact             Active SLA input observation file name 
     826                           !     slafilespas             Passive SLA input observation file name  
     827   !                       ! slafbfiles: Feedback SLA input observation file name  
    796828   slafbfiles = 'sla_01.nc' 
     829                           !     sstfiles                GHRSST input observation file name        
     830   !                       ! sstfbfiles: Feedback SST input observation file name  
    797831   sstfbfiles = 'sst_01.nc' 'sst_02.nc' 'sst_03.nc' 'sst_04.nc' 'sst_05.nc' 
    798    ln_altbias = .false. 
     832                           !     seaicefiles             Sea Ice input observation file name  
     833                           !     velavcurfiles           Vel. cur. daily av. input file name   
     834                           !     velhvcurfiles           Vel. cur. high freq. input file name   
     835                           !     velavadcpfiles          Vel. ADCP daily av. input file name     
     836                           !     velhvadcpfiles          Vel. ADCP high freq. input file name  
     837                           !     velfbfiles              Vel. feedback input observation file name  
     838                           !     dobsini                 Initial date in window YYYYMMDD.HHMMSS        
     839                           !     dobsend                 Final date in window YYYYMMDD.HHMMSS          
     840                           !     n1dint                  Type of vertical interpolation method         
     841                           !     n2dint                  Type of horizontal interpolation method        
     842                           !     ln_nea                  Rejection of observations near land switch     
     843   nmsshc     = 0          ! MSSH correction scheme                          
     844                           !     mdtcorr                 MDT  correction                                
     845                           !     mdtcutoff               MDT cutoff for computed correction           
     846   ln_altbias = .false.    ! Logical switch for alt bias                 
     847   ln_ignmis  = .true.     ! Logical switch for ignoring missing files    
     848                           !     endailyavtypes   ENACT daily average types                     
    799849   ln_grid_global = .true. 
    800850   ln_grid_search_lookup = .false. 
    801    ln_ignmis = .true.   
    802851/  
    803852!----------------------------------------------------------------------- 
    804 !       nam_asminc    assimilation increments namelist 
    805 !----------------------------------------------------------------------- 
    806 ! ln_bkgwri   Logical switch for writing out background state  
    807 ! ln_trjwri   Logical switch for writing out state trajectory 
    808 ! ln_trainc   Logical switch for applying tracer increments 
    809 ! ln_dyninc   Logical switch for applying velocity increments 
    810 ! ln_sshinc   Logical switch for applying SSH increments  
    811 ! ln_asmdin   Logical switch for Direct Initialization (DI) 
    812 ! ln_asmiau   Logical switch for Incremental Analysis Updating (IAU) 
    813 ! nitbkg      Timestep of background in [0,nitend-nit000-1] 
    814 ! nitdin      Timestep of background for DI in [0,nitend-nit000-1] 
    815 ! nitiaustr   Timestep of start of IAU interval in [0,nitend-nit000-1] 
    816 ! nitiaufin   Timestep of end of IAU interval in [0,nitend-nit000-1] 
    817 ! niaufn      Type of IAU weighting function 
    818 ! nittrjfrq   Frequency of trajectory output for 4D-VAR 
    819 ! ln_salfix   Logical switch for ensuring that the sa > salfixmin 
    820 ! salfixmin   Minimum salinity after applying the increments 
    821 &nam_asminc 
    822     ln_bkgwri = .false. 
    823     ln_trjwri = .false. 
    824     ln_trainc = .false. 
    825     ln_dyninc = .false. 
    826     ln_sshinc = .false. 
    827     ln_asmdin = .false. 
    828     ln_asmiau = .false. 
    829     nitbkg = 0 
    830     nitdin = 0 
    831     nitiaustr = 1 
    832     nitiaufin = 15 
    833     niaufn = 0 
    834     nittrjfrq = 0 
    835     ln_salfix = .false. 
    836     salfixmin = -9999 
    837 / 
     853&nam_asminc   !   assimilation increments                               ('key_asminc') 
     854!----------------------------------------------------------------------- 
     855    ln_bkgwri = .false.    !  Logical switch for writing out background state  
     856    ln_trjwri = .false.    !  Logical switch for writing out state trajectory 
     857    ln_trainc = .false.    !  Logical switch for applying tracer increments 
     858    ln_dyninc = .false.    !  Logical switch for applying velocity increments 
     859    ln_sshinc = .false.    !  Logical switch for applying SSH increments  
     860    ln_asmdin = .false.    !  Logical switch for Direct Initialization (DI) 
     861    ln_asmiau = .false.    !  Logical switch for Incremental Analysis Updating (IAU) 
     862    nitbkg    = 0          !  Timestep of background in [0,nitend-nit000-1] 
     863    nitdin    = 0          !  Timestep of background for DI in [0,nitend-nit000-1] 
     864    nitiaustr = 1          !  Timestep of start of IAU interval in [0,nitend-nit000-1] 
     865    nitiaufin = 15         !  Timestep of end of IAU interval in [0,nitend-nit000-1] 
     866    niaufn    = 0          !  Type of IAU weighting function 
     867    nittrjfrq = 0          !  Frequency of trajectory output for 4D-VAR 
     868    ln_salfix = .false.    !  Logical switch for ensuring that the sa > salfixmin 
     869    salfixmin = -9999      !  Minimum salinity after applying the increments 
     870/ 
  • branches/nemo_v3_3_beta/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/EXP00/1_namelist

    r2399 r2417  
    11!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
    22!! NEMO/OPA  :  1 - run manager      (namrun) 
    3 !! namelists    2 - Domain           (namzgr, namzgr_sco, namdom) 
     3!! namelists    2 - Domain           (namzgr, namzgr_sco, namdom, namdta_tem, namdta_sal) 
    44!!              3 - Surface boundary (namsbc, namsbc_ana, namsbc_flx, namsbc_clio, namsbc_core 
    5 !!                                    namsbc_cpl, namqsr, namsbc_rnf, namsbc_ssr, namsbc_alb) 
     5!!                                    namsbc_cpl, namsbc_cpl_co2 namtra_qsr, namsbc_rnf,  
     6!!                                    namsbc_apr, namsbc_ssr, namsbc_alb) 
    67!!              4 - lateral boundary (namlbc, namcla, namobc, namagrif, nambdy, nambdy_tide) 
    78!!              5 - bottom  boundary (nambfr, nambbc, nambbl) 
     
    910!!              7 - dynamics         (namdyn_adv, namdyn_vor, namdyn_hpg, namdyn_spg, namdyn_ldf) 
    1011!!              8 - Verical physics  (namzdf, namzdf_ric, namzdf_tke, namzdf_kpp, namzdf_ddm, namzdf_tmx) 
    11 !!              9 - diagnostics      (namtrd, namgap, namspr, namflo, namptr) 
    12 !!              9 - miscellaneous    (namsol, nammpp, nammpp_dyndist, namctl) 
     12!!              9 - diagnostics      (namnc4, namtrd, namspr, namflo, namptr, namhsb) 
     13!!             10 - miscellaneous    (namsol, nammpp, nammpp_dyndist, namctl) 
     14!!             11 - Obs & Assim      (namobs, nam_asminc) 
    1315!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
    1416!  CAUTION: some scripts does not support CAPITALs for logical use .true./.false., not .TRUE./.FALSE. 
     
    1719!!                   ***  Run management namelists  *** 
    1820!!====================================================================== 
    19 !!   namrun            parameters of the run 
    20 !!====================================================================== 
    21  
     21!!   namrun        parameters of the run 
     22!!====================================================================== 
     23! 
    2224!----------------------------------------------------------------------- 
    2325&namrun        !   parameters of the run 
    2426!----------------------------------------------------------------------- 
    2527   nn_no       =       0   !  job number 
    26    cn_exp      =  "Agulhas"!  experience name  
     28   cn_exp      = "Agulhas" !  experience name  
    2729   nn_it000    =       1   !  first time step 
    2830   nn_itend    =   10950   !  last  time step (std 5475) 
     
    4345   cn_ocerst_out = "restart"   !  suffix of ocean restart name (output) 
    4446/ 
    45 !!====================================================================== 
    46 !!   namnc4            netcdf4 chunking and compression settings 
    47 !!====================================================================== 
    48 !----------------------------------------------------------------------- 
    49 &namnc4         !  netcdf4 chunking and compression settings     ("key_netcdf4") 
    50                 !  (ignored if "key_netcdf4" is not used) 
    51 !----------------------------------------------------------------------- 
    52    nn_nchunks_i   =   4       !  number of chunks in i-dimension 
    53    nn_nchunks_j   =   4       !  number of chunks in j-dimension 
    54    nn_nchunks_k   =   31      !  number of chunks in k-dimension 
    55                               !  setting nn_nchunks_k = jpk will give a chunk size of 1 in the vertical which 
    56                               !  is optimal for postprocessing which works exclusively with horizontal slabs 
    57    ln_nc4zip      =   .TRUE.  !  (T) use netcdf4 chunking and compression 
    58                               !  (F) ignore chunking information and produce netcdf3-compatible files 
    59 / 
     47 
    6048!!====================================================================== 
    6149!!                      ***  Domain namelists  *** 
     
    6452!!   namzgr_sco   s-coordinate or hybrid z-s-coordinate 
    6553!!   namdom       space and time domain (bathymetry, mesh, timestep) 
    66 !!====================================================================== 
    67  
     54!!   namdta_tem   data: temperature                                     ("key_dtatem") 
     55!!   namdta_sal   data: salinity                                        ("key_dtasal") 
     56!!====================================================================== 
     57! 
    6858!----------------------------------------------------------------------- 
    6959&namzgr        !   vertical coordinate 
     
    10393   rn_rdth     =  800.           !  depth variation of tracer time step  (used if nacc=1) 
    10494/ 
     95!----------------------------------------------------------------------- 
     96&namdta_tem    !   data : temperature                                   ("key_dtatem") 
     97!----------------------------------------------------------------------- 
     98!              ! file name ! frequency (hours)    ! variable ! time interp. ! clim  !'yearly' or ! weights  ! rotation ! 
     99!              !           !  (if <0  months)     !   name   !  (logical)   ! (T/F) ! 'monthly'  ! filename ! pairing  ! 
     100   sn_tem = 'data_1m_potential_temperature_nomask', -1,'votemper',  .true.  , .true., 'yearly'   , ' '      , ' ' 
     101   ! 
     102   cn_dir       = './'     !  root directory for the location of the runoff files 
     103/ 
     104!----------------------------------------------------------------------- 
     105&namdta_sal    !   data : salinity                                      ("key_dtasal") 
     106!----------------------------------------------------------------------- 
     107!              ! file name ! frequency (hours)    ! variable ! time interp. ! clim  !'yearly' or ! weights  ! rotation ! 
     108!              !           !  (if <0  months)     !   name   !   (logical)  ! (T/F) ! 'monthly'  ! filename ! pairing  ! 
     109   sn_sal      =  'data_1m_salinity_nomask',  -1  ,'vosaline',    .true.    , .true., 'yearly'   , ''       , ' ' 
     110   ! 
     111   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
     112/ 
     113 
    105114!!====================================================================== 
    106115!!            ***  Surface Boundary Condition namelists  *** 
    107116!!====================================================================== 
    108 !!   namsbc        surface boundary condition 
    109 !!   namsbc_ana    analytical         formulation 
    110 !!   namsbc_flx    flux               formulation 
    111 !!   namsbc_clio   CLIO bulk formulea formulation 
    112 !!   namsbc_core   CORE bulk formulea formulation 
    113 !!   namsbc_cpl    CouPLed            formulation                       ("key_coupled") 
    114 !!   namtra_qsr    penetrative solar radiation 
    115 !!   namsbc_rnf    river runoffs 
    116 !!   namsbc_ssr    sea surface restoring term (for T and/or S) 
    117 !!   namsbc_alb    albedo parameters 
    118 !!====================================================================== 
    119  
     117!!   namsbc          surface boundary condition 
     118!!   namsbc_ana      analytical         formulation 
     119!!   namsbc_flx      flux               formulation 
     120!!   namsbc_clio     CLIO bulk formulea formulation 
     121!!   namsbc_core     CORE bulk formulea formulation 
     122!!   namsbc_cpl      CouPLed            formulation                     ("key_coupled") 
     123!!   namsbc_cpl_co2  coupled ocean/biogeo/atmosphere model              ("key_cpl_carbon_cycle") 
     124!!   namtra_qsr      penetrative solar radiation 
     125!!   namsbc_rnf      river runoffs 
     126!!   namsbc_apr      Atmospheric Pressure 
     127!!   namsbc_ssr      sea surface restoring term (for T and/or S) 
     128!!   namsbc_alb      albedo parameters 
     129!!====================================================================== 
     130! 
    120131!----------------------------------------------------------------------- 
    121132&namsbc        !   Surface Boundary Condition (surface module) 
    122133!----------------------------------------------------------------------- 
    123134   nn_fsbc     = 5         !  frequency of surface boundary condition computation  
    124                            !               (= the frequency of sea-ice model call) 
    125    ln_ana      = .false.   !  analytical formulation (T => fill namsbc_ana )  
    126    ln_flx      = .false.   !  flux formulation       (T => fill namsbc_flx ) 
    127    ln_blk_clio = .false.   !  CLIO bulk formulation  (T => fill namsbc_clio)  
    128    ln_blk_core = .true.    !  CORE bulk formulation  (T => fill namsbc_core)  
    129    ln_cpl      = .false.   !  Coupled formulation    (T => fill namsbc_cpl ) 
     135                           !     (also = the frequency of sea-ice model call) 
     136   ln_ana      = .false.   !  analytical formulation                    (T => fill namsbc_ana )  
     137   ln_flx      = .false.   !  flux formulation                          (T => fill namsbc_flx ) 
     138   ln_blk_clio = .false.   !  CLIO bulk formulation                     (T => fill namsbc_clio)  
     139   ln_blk_core = .true.    !  CORE bulk formulation                     (T => fill namsbc_core)  
     140   ln_cpl      = .false.   !  Coupled formulation                       (T => fill namsbc_cpl ) 
    130141   ln_apr_dyn  = .false.   !  Patm gradient added in ocean & ice Eqs.   (T => fill namsbc_apr ) 
    131142   nn_ice      = 0         !  =0 no ice boundary condition   , 
    132143                           !  =1 use observed ice-cover      , 
    133                            !  =2 ice-model used                             ("key_lim3" or "key_lim2) 
     144                           !  =2 ice-model used                         ("key_lim3" or "key_lim2) 
    134145   ln_dm2dc    = .false.   !  daily mean to diurnal cycle short wave (qsr) 
    135146   ln_rnf      = .false.   !  runoffs (T => fill namsbc_rnf) 
    136    ln_ssr      = .false.   !  Sea Surface Restoring on T and/or S (T => fill namsbc_ssr) 
     147   ln_ssr      = .false.   !  Sea Surface Restoring on T and/or S       (T => fill namsbc_ssr) 
    137148   nn_fwb      = 0         !  FreshWater Budget: =0 unchecked  
    138                            !                     =1 global mean of e-p-r set to zero at each time step  
    139                            !                     =2 annual global mean of e-p-r set to zero 
    140                            !                     =3 global emp set to zero and spread out over erp area 
     149                           !     =1 global mean of e-p-r set to zero at each time step  
     150                           !     =2 annual global mean of e-p-r set to zero 
     151                           !     =3 global emp set to zero and spread out over erp area 
    141152/ 
    142153!----------------------------------------------------------------------- 
     
    153164&namsbc_flx    !   surface boundary condition : flux formulation 
    154165!----------------------------------------------------------------------- 
    155 !              !   file name  ! frequency (hours) !  variable  ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    156 !              !              !  (if <0  months)  !    name    !    (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    157    sn_utau     = 'utau'       ,        24         ,    'utau'  ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    158    sn_vtau     = 'vtau'       ,        24         ,    'vtau'  ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    159    sn_qtot     = 'qtot'       ,        24         ,    'qtot'  ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    160    sn_qsr      = 'qsr'        ,        24         ,    'qsr'   ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    161    sn_emp      = 'emp'        ,        24         ,    'emp'   ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    162 ! 
     166!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     167!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     168   sn_utau     = 'utau'      ,        24         , 'utau'    , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     169   sn_vtau     = 'vtau'      ,        24         , 'vtau'    , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     170   sn_qtot     = 'qtot'      ,        24         , 'qtot'    , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     171   sn_qsr      = 'qsr'       ,        24         , 'qsr'     , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     172   sn_emp      = 'emp'       ,        24         , 'emp'     , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     173 
    163174   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the flux files 
    164175/       
     
    166177&namsbc_clio   !   namsbc_clio  CLIO bulk formulea 
    167178!----------------------------------------------------------------------- 
    168 !              !   file name  ! frequency (hours) !  variable  ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    169 !              !              !  (if <0  months)  !    name    !    (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    170    sn_utau     = 'taux_1m'    ,       -1          , 'sozotaux' ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    171    sn_vtau     = 'tauy_1m'    ,       -1          , 'sometauy' ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    172    sn_wndm     = 'flx'        ,       -1          , 'socliowi' ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    173    sn_tair     = 'flx'        ,       -1          , 'socliot2' ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    174    sn_humi     = 'flx'        ,       -1          , 'socliohu' ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    175    sn_ccov     = 'flx'        ,       -1          , 'socliocl' ,    .false.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    176    sn_prec     = 'flx'        ,       -1          , 'socliopl' ,    .false.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    177 ! 
     179!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     180!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     181   sn_utau     = 'taux_1m'   ,       -1          , 'sozotaux',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     182   sn_vtau     = 'tauy_1m'   ,       -1          , 'sometauy',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     183   sn_wndm     = 'flx'       ,       -1          , 'socliowi',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     184   sn_tair     = 'flx'       ,       -1          , 'socliot2',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     185   sn_humi     = 'flx'       ,       -1          , 'socliohu',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     186   sn_ccov     = 'flx'       ,       -1          , 'socliocl',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     187   sn_prec     = 'flx'       ,       -1          , 'socliopl',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     188 
    178189   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the bulk files are 
    179190/ 
     
    181192&namsbc_core   !   namsbc_core  CORE bulk formulea 
    182193!----------------------------------------------------------------------- 
    183 !              !   file name                   ! frequency (hours) ! variable    ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    184 !              !                               !  (if <0  months)  !   name      !    (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    185    sn_wndi     = 'u_10.15JUNE2009_orca2'       ,       6           , 'U_10_MOD'  ,    .false.     , .true.  , 'yearly'  ,   ''     ,  'Uwnd' 
    186    sn_wndj     = 'v_10.15JUNE2009_orca2'       ,       6           , 'V_10_MOD'  ,    .false.     , .true.  , 'yearly'  ,   ''     ,  'Vwnd' 
    187    sn_qsr      = 'ncar_rad.15JUNE2009_orca2'   ,       24          , 'SWDN_MOD'  ,    .false.     , .true.  , 'yearly'  ,   ''     ,  '' 
    188    sn_qlw      = 'ncar_rad.15JUNE2009_orca2'   ,       24          , 'LWDN_MOD'  ,    .false.     , .true.  , 'yearly'  ,   ''     ,  '' 
    189    sn_tair     = 't_10.15JUNE2009_orca2'       ,       6           , 'T_10_MOD'  ,    .false.     , .true.  , 'yearly'  ,   ''     ,  '' 
    190    sn_humi     = 'q_10.15JUNE2009_orca2'       ,       6           , 'Q_10_MOD'  ,    .false.     , .true.  , 'yearly'  ,   ''     ,  '' 
    191    sn_prec     = 'ncar_precip.15JUNE2009_orca2',       -1          , 'PRC_MOD1'  ,    .false.     , .true.  , 'yearly'  ,   ''     ,  '' 
    192    sn_snow     = 'ncar_precip.15JUNE2009_orca2',       -1          , 'SNOW'      ,    .false.     , .true.  , 'yearly'  ,   ''     ,  '' 
    193    sn_tdif     = 'taudif_core'                 ,       24          , 'taudif'    ,    .false.     , .true.  , 'yearly'  ,   ''     ,  '' 
    194 ! 
     194!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     195!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     196   sn_wndi = 'u_10.15JUNE2009_orca2'       ,  6  , 'U_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , 'Uwnd' 
     197   sn_wndj = 'v_10.15JUNE2009_orca2'       ,  6  , 'V_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , 'Vwnd' 
     198   sn_qsr  = 'ncar_rad.15JUNE2009_orca2'   , 24  , 'SWDN_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     199   sn_qlw  = 'ncar_rad.15JUNE2009_orca2'   , 24  , 'LWDN_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     200   sn_tair = 't_10.15JUNE2009_orca2'       ,  6  , 'T_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     201   sn_humi = 'q_10.15JUNE2009_orca2'       ,  6  , 'Q_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     202   sn_prec = 'ncar_precip.15JUNE2009_orca2', -1  , 'PRC_MOD1',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     203   sn_snow = 'ncar_precip.15JUNE2009_orca2', -1  , 'SNOW'    ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     204   sn_tdif = 'taudif_core'                 , 24  , 'taudif'  ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     205 
    195206   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the bulk files 
    196207   ln_2m       = .false.   !  air temperature and humidity referenced at 2m (T) instead 10m (F) 
     
    199210/ 
    200211!----------------------------------------------------------------------- 
    201 &namsbc_cpl    !   coupled ocean/atmosphere model                        ("key_coupled") 
    202 !----------------------------------------------------------------------- 
     212&namsbc_cpl    !   coupled ocean/atmosphere model                       ("key_coupled") 
     213!----------------------------------------------------------------------- 
     214!                                      ! send 
     215cn_snd_temperature= 'weighted oce and ice'  !  'oce only' 'weighted oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     216cn_snd_albedo     = 'weighted ice'          !  'none' 'weighted ice' 'mixed oce-ice' 
     217cn_snd_thickness  = 'none'                  !  'none' 'weighted ice and snow' 
     218cn_snd_crt_nature = 'none'                  !  'none' 'oce only' 'weighted oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     219cn_snd_crt_refere = 'spherical'             !  'spherical' 'cartesian' 
     220cn_snd_crt_orient = 'eastward-northward'    !  'eastward-northward' or 'local grid' 
     221cn_snd_crt_grid   = 'T'                     !  'T' 
     222!                                      ! receive 
     223cn_rcv_w10m       = 'none'                  !  'none' 'coupled' 
     224cn_rcv_taumod     = 'coupled'               !  'none' 'coupled' 
     225cn_rcv_tau_nature = 'oce only'              !  'oce only' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     226cn_rcv_tau_refere = 'cartesian'             !  'spherical' 'cartesian' 
     227cn_rcv_tau_orient = 'eastward-northward'    !  'eastward-northward' or 'local grid' 
     228cn_rcv_tau_grid   = 'U,V'                   !  'T' 'U,V' 'U,V,F' 'U,V,I' 'T,F' 'T,I' 'T,U,V' 
     229cn_rcv_dqnsdt     = 'coupled'               !  'none' 'coupled' 
     230cn_rcv_qsr        = 'oce and ice'           !  'conservative' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     231cn_rcv_qns        = 'oce and ice'           !  'conservative' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     232cn_rcv_emp        = 'conservative'          !  'conservative' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     233cn_rcv_rnf        = 'coupled'               !  'coupled' 'climato' 'mixed' 
     234cn_rcv_cal        = 'coupled'               !  'none' 'coupled' 
     235/ 
     236!----------------------------------------------------------------------- 
     237&namsbc_cpl_co2   !   coupled ocean/biogeo/atmosphere model             ("key_cpl_carbon_cycle") 
     238!----------------------------------------------------------------------- 
     239cn_snd_co2        = 'coupled'         ! send    :  'none' 'coupled' 
     240cn_rcv_co2        = 'coupled'         ! receive : 'none' 'coupled' 
    203241/ 
    204242!----------------------------------------------------------------------- 
    205243&namtra_qsr    !   penetrative solar radiation 
    206244!----------------------------------------------------------------------- 
    207 !              !   file name  ! frequency (hours) ! variable   ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    208 !              !              !  (if <0  months)  !   name     !    (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    209    sn_chl      = 'chlorophyll',        -1         , 'CHLA'     ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    210   
     245!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     246!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     247   sn_chl      ='chlorophyll',        -1         , 'CHLA'    ,   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     248 
    211249   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
    212250   ln_traqsr   = .true.    !  Light penetration (T) or not (F) 
     
    222260&namsbc_rnf    !   runoffs namelist surface boundary condition 
    223261!----------------------------------------------------------------------- 
    224 !              !   file name  ! frequency (hours) ! variable   ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    225 !              !              !  (if <0  months)  !   name     !    (logical)   !  (T/F)  ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    226    sn_rnf      = 'runoff_1m_nomask' ,  -1         , 'sorunoff' ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  , ''       , '' 
    227    sn_cnf      = 'runoff_1m_nomask' ,   0         , 'socoefr'  ,    .false.     , .true.  , 'yearly'  , ''       , '' 
    228   
     262!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     263!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     264   sn_rnf      = 'runoff_1m_nomask' ,  -1        , 'sorunoff',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     265   sn_cnf      = 'runoff_1m_nomask' ,   0        , 'socoefr' ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     266   sn_s_rnf    = 'runoffs'          ,  24        , 'rosaline',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     267   sn_t_rnf    = 'runoffs'          ,  24        , 'rotemper',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     268   sn_dep_rnf  = 'runoffs'          ,   0        , 'rodepth' ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     269 
    229270   cn_dir       = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
    230271   ln_rnf_emp   =   .false. !  runoffs included into precipitation field (T) or into a file (F) 
     
    233274   rn_avt_rnf   =   1.e-3   !  value of the additional vertical mixing coef. [m2/s] 
    234275   rn_rfact     =   1.e0    !  multiplicative factor for runoff 
     276   ln_rnf_depth =  .false.  !  read in depth information for runoff 
     277   ln_rnf_tem   =  .false.  !  read in temperature information for runoff 
     278   ln_rnf_sal   =  .false.  !  read in salinity information for runoff 
    235279/ 
    236280!----------------------------------------------------------------------- 
     
    239283!              ! file name ! frequency (hours) ! variable ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    240284!              !           !  (if <0  months)  !   name   !    (logical)   !  (T/F)  ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    241    sn_apr      = 'patm'    ,         -1        , 'somslpre',    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,  ''      ,   '' 
    242 ! 
     285   sn_apr      = 'patm'    ,         -1        ,'somslpre',    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,  ''      ,   '' 
     286 
    243287   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the bulk files 
    244288   ln_ref_apr  = .false.   !  ref. pressure: global mean Patm (T) or a constant (F) 
     
    247291&namsbc_ssr    !   surface boundary condition : sea surface restoring 
    248292!----------------------------------------------------------------------- 
    249 !              !   file name  ! frequency (hours) ! variable   ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    250 !              !              !  (if <0  months)  !   name     !    (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    251    sn_sst      = 'sst_data'   ,        24         ,  'sst'     ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    252    sn_sss      = 'sss_data'   ,        -1         ,  'sss'     ,     .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    253      
     293!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     294!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     295   sn_sst      = 'sst_data'  ,        24         ,  'sst'    ,    .false.   , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     296   sn_sss      = 'sss_data'  ,        -1         ,  'sss'    ,    .true.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     297 
    254298   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
    255299   nn_sstr     =     0     !  add a retroaction term in the surface heat       flux (=1) or not (=0) 
    256300   nn_sssr     =     0     !  add a damping     term in the surface freshwater flux (=1) or not (=0) 
     301                           !  or to SSS only (=1) or no damping term (=0) 
    257302   rn_dqdt     =   -40.    !  magnitude of the retroaction on temperature   [W/m2/K] 
    258303   rn_deds     =   -27.7   !  magnitude of the damping on salinity   [mm/day] 
    259    ln_sssr_bnd =   .false. !  flag to bound erp term (associated with nn_sssr=2) 
    260    rn_sssr_bnd =   0.e0    !  ABS(Max/Min) value of the damping erp term [mm/day] 
     304   ln_sssr_bnd =   .true. !  flag to bound erp term (associated with nn_sssr=2) 
     305   rn_sssr_bnd =   4.e0    !  ABS(Max/Min) value of the damping erp term [mm/day] 
    261306/       
    262307!----------------------------------------------------------------------- 
     
    268313   rn_alphc    =    0.65   !  compute albedo between two extremes values  
    269314   rn_alphdi   =    0.72   !  (Pyane, 1972) 
    270 / 
    271 &namdta_tem    !   surface boundary condition : sea surface restoring 
    272 !----------------------------------------------------------------------- 
    273 !              !     file name                  ! frequency (hours) ! variable   ! time interpol. !  clim   !'yearly' or ! weights  ! rotation ! 
    274 !              !                                !  (if <0  months)  !   name     !    (logical)   !  (T/F)  ! 'monthly'  ! filename ! pairing  ! 
    275   sn_tem       = 'data_1m_potential_temperature_nomask',  -1        , 'votemper' ,     .true.     , .true.  , 'yearly'   , ' '      , ' ' 
    276 ! 
    277   cn_dir       = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
    278 / 
    279 !----------------------------------------------------------------------- 
    280 &namdta_sal    !   surface boundary condition : sea surface restoring 
    281 !----------------------------------------------------------------------- 
    282 !              !     file name                  ! frequency (hours) ! variable   ! time interpol. !  clim   ! 'yearly' or ! weights  ! rotation ! 
    283 !              !                                !  (if <0  months)  !   name     !    (logical)   !  (T/F)  !  'monthly'  ! filename ! pairing  ! 
    284    sn_sal      =  'data_1m_salinity_nomask'     ,         -1        , 'vosaline' ,     .true.     , .true.  , 'yearly'    , ''       , ' ' 
    285 ! 
    286    cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
    287315/ 
    288316 
     
    297325!!   namtide       Tidal forcing at open boundaries                     ("key_bdy_tides") 
    298326!!====================================================================== 
    299  
     327! 
    300328!----------------------------------------------------------------------- 
    301329&namlbc        !   lateral momentum boundary condition 
     
    312340&namobc        !   open boundaries parameters                           ("key_obc") 
    313341!----------------------------------------------------------------------- 
    314     ln_obc_clim= .false.   !  climatological obc data files (T) or not (F) 
    315     ln_vol_cst = .true.    !  impose the total volume conservation (T) or not (F) 
    316     ln_obc_fla = .false.   !  Flather open boundary condition  
    317     nn_obcdta  =    1      !  = 0 the obc data are equal to the initial state 
     342   ln_obc_clim = .false.   !  climatological obc data files (T) or not (F) 
     343   ln_vol_cst = .true.    !  impose the total volume conservation (T) or not (F) 
     344   ln_obc_fla = .false.   !  Flather open boundary condition  
     345   nn_obcdta   =    1      !  = 0 the obc data are equal to the initial state 
    318346                           !  = 1 the obc data are read in 'obc.dta' files 
    319     cn_obcdta  = 'annual'  !  set to annual if obc datafile hold 1 year of data 
     347   cn_obcdta   = 'annual'  !  set to annual if obc datafile hold 1 year of data 
    320348                           !  set to monthly if obc datafile hold 1 month of data 
    321     rn_dpein   =    1.     !  damping time scale for inflow at east  open boundary 
    322     rn_dpwin   =    1.     !     -           -         -       west    -      - 
    323     rn_dpnin   =    1.     !     -           -         -       north   -      - 
    324     rn_dpsin   =    1.     !     -           -         -       south   -      - 
    325     rn_dpeob   = 3000.     !  time relaxation (days) for the east  open boundary 
    326     rn_dpwob   =   15.     !     -           -         -     west    -      - 
    327     rn_dpnob   = 3000.     !     -           -         -     north   -      - 
    328     rn_dpsob   =   15.     !     -           -         -     south   -      - 
    329     rn_volemp  =  1.       !  = 0 the total volume change with the surface flux (E-P-R) 
     349   rn_dpein    =    1.     !  damping time scale for inflow at east  open boundary 
     350   rn_dpwin    =    1.     !     -           -         -       west    -      - 
     351   rn_dpnin    =    1.     !     -           -         -       north   -      - 
     352   rn_dpsin    =    1.     !     -           -         -       south   -      - 
     353   rn_dpeob    = 3000.     !  time relaxation (days) for the east  open boundary 
     354   rn_dpwob    =   15.     !     -           -         -     west    -      - 
     355   rn_dpnob    = 3000.     !     -           -         -     north   -      - 
     356   rn_dpsob    =   15.     !     -           -         -     south   -      - 
     357   rn_volemp   =  1.       !  = 0 the total volume change with the surface flux (E-P-R) 
    330358                           !  = 1 the total volume remains constant 
    331359/ 
     
    333361&namagrif      !  AGRIF zoom                                            ("key_agrif") 
    334362!----------------------------------------------------------------------- 
    335     nn_cln_update = 3      !  baroclinic update frequency 
    336     ln_spc_dyn    = .true. !  use 0 as special value for dynamics 
    337     rn_sponge_tra = 2880.  !  coefficient for tracer   sponge layer [s] 
    338     rn_sponge_dyn = 2880.  !  coefficient for dynamics sponge layer [s] 
     363   nn_cln_update = 3       !  baroclinic update frequency 
     364   ln_spc_dyn    = .true. !  use 0 as special value for dynamics 
     365   rn_sponge_tra = 2880.   !  coefficient for tracer   sponge layer [s] 
     366   rn_sponge_dyn = 2880.   !  coefficient for dynamics sponge layer [s] 
    339367/ 
    340368!----------------------------------------------------------------------- 
    341369&nambdy        !  unstructured open boundaries                          ("key_bdy") 
    342370!----------------------------------------------------------------------- 
    343     filbdy_mask    =  ''                  !  name of mask file (if ln_bdy_mask=.TRUE.) 
    344     filbdy_data_T  = 'bdydata_grid_T.nc'  !  name of data file (T-points) 
    345     filbdy_data_U  = 'bdydata_grid_U.nc'  !  name of data file (U-points) 
    346     filbdy_data_V  = 'bdydata_grid_V.nc'  !  name of data file (V-points) 
    347     ln_bdy_clim    = .false.              !  contain 1 (T) or 12 (F) time dumps and be cyclic 
    348     ln_bdy_vol     = .true.               !  total volume correction (see volbdy parameter) 
    349     ln_bdy_mask    = .false.              !  boundary mask from filbdy_mask (T) or boundaries are on edges of domain (F) 
    350     ln_bdy_tides   = .true.               !  Apply tidal harmonic forcing with Flather condition 
    351     ln_bdy_dyn_fla = .true.               !  Apply Flather condition to velocities 
    352     ln_bdy_tra_frs = .false.              !  Apply FRS condition to temperature and salinity  
    353     ln_bdy_dyn_frs = .false.              !  Apply FRS condition to velocities 
    354     nbdy_dta       =  1                   !  = 0, bdy data are equal to the initial state 
    355                                           !  = 1, bdy data are read in 'bdydata   .nc' files 
    356     nb_rimwidth    = 9                    !  width of the relaxation zone 
    357     volbdy         = 0                    !  = 0, the total water flux across open boundaries is zero 
    358                                           !  = 1, the total volume of the system is conserved 
    359 / 
    360 !----------------------------------------------------------------------- 
    361 &nambdy_tide     ! tidal forcing at unstructured boundaries               
    362 !----------------------------------------------------------------------- 
    363     filtide      = 'bdytide_'           !  file name root of tidal forcing files 
    364     tide_cpt     = 'M2','S1'            !  names of tidal components used 
    365     tide_speed   = 28.984106, 15.000001 !  phase speeds of tidal components (deg/hour) 
    366     ln_tide_date = .false.              !  adjust tidal harmonics for start date of run 
     371   cn_mask       =  ''                     !  name of mask file (if ln_bdy_mask=.TRUE.) 
     372   cn_dta_frs_T  = 'bdydata_grid_T.nc'     !  name of data file (T-points) 
     373   cn_dta_frs_U  = 'bdydata_grid_U.nc'     !  name of data file (U-points) 
     374   cn_dta_frs_V  = 'bdydata_grid_V.nc'     !  name of data file (V-points) 
     375   cn_dta_fla_T  = 'bdydata_bt_grid_T.nc'  !  name of data file for Flather condition (T-points) 
     376   cn_dta_fla_U  = 'bdydata_bt_grid_U.nc'  !  name of data file for Flather condition (U-points) 
     377   cn_dta_fla_V  = 'bdydata_bt_grid_V.nc'  !  name of data file for Flather condition (V-points) 
     378 
     379   ln_clim     = .false.   !  contain 1 (T) or 12 (F) time dumps and be cyclic 
     380   ln_vol      = .false.   !  total volume correction (see volbdy parameter) 
     381   ln_mask     = .false.   !  boundary mask from filbdy_mask (T), boundaries are on edges of domain (F) 
     382   ln_tides    = .false.   !  Apply tidal harmonic forcing with Flather condition 
     383   ln_dyn_fla  = .false.   !  Apply Flather condition to velocities 
     384   ln_tra_frs  = .false.   !  Apply FRS condition to temperature and salinity  
     385   ln_dyn_frs  = .false.   !  Apply FRS condition to velocities 
     386   nn_rimwidth =  9        !  width of the relaxation zone 
     387   nn_dtactl   =  1        !  = 0, bdy data are equal to the initial state 
     388                           !  = 1, bdy data are read in 'bdydata   .nc' files 
     389   nn_volctl   =  0        !  = 0, the total water flux across open boundaries is zero 
     390                           !  = 1, the total volume of the system is conserved 
     391/ 
     392!----------------------------------------------------------------------- 
     393&nambdy_tide   !  tidal forcing at unstructured boundaries               
     394!----------------------------------------------------------------------- 
     395   filtide     = 'bdytide_'           !  file name root of tidal forcing files 
     396   tide_cpt    = 'M2','S1'            !  names of tidal components used 
     397   tide_speed  = 28.984106, 15.000001 !  phase speeds of tidal components (deg/hour) 
     398   ln_tide_date= .false.              !  adjust tidal harmonics for start date of run 
    367399/ 
    368400 
     
    371403!!====================================================================== 
    372404!!   nambfr        bottom friction 
    373 !!   nambbc        bottom temperature boundary condition                 
     405!!   nambbc        bottom temperature boundary condition                
    374406!!   nambbl        bottom boundary layer scheme                         ("key_trabbl") 
    375407!!====================================================================== 
    376  
     408! 
    377409!----------------------------------------------------------------------- 
    378410&nambfr        !   bottom friction 
     
    403435   rn_gambbl   =  10.    !  advective bbl coefficient                 [s] 
    404436/ 
     437 
    405438!!====================================================================== 
    406439!!                        Tracer (T & S ) namelists 
     
    411444!!   namtra_dmp    T & S newtonian damping                              ("key_tradmp") 
    412445!!====================================================================== 
    413  
     446! 
    414447!----------------------------------------------------------------------- 
    415448&nameos        !   ocean physical parameters 
     
    430463   ln_traadv_muscl2 =  .false.  !  MUSCL2 scheme + cen2 at boundaries   
    431464   ln_traadv_ubs    =  .false.  !  UBS scheme                  
     465   ln_traadv_qck    =  .false.  !  QUCIKEST scheme                  
    432466/ 
    433467!----------------------------------------------------------------------- 
    434468&namtra_ldf    !   lateral diffusion scheme for tracer  
    435469!----------------------------------------------------------------------- 
    436                            !  Type of the operator :  
    437    ln_traldf_lap    =  .true.   !     laplacian operator        
    438    ln_traldf_bilap  =  .false.  !     bilaplacian operator      
    439                            !  Direction of action  : 
    440    ln_traldf_level  =  .false.  !     iso-level                 
    441    ln_traldf_hor    =  .false.  !     horizontal (geopotential)         (require "key_ldfslp" when ln_sco=T) 
    442    ln_traldf_iso    =  .true.   !     iso-neutral                       (require "key_ldfslp") 
    443    ln_traldf_grif   =  .false.  !     griffies skew flux formulation    (require "key_ldfslp")   ! UNDER TEST, DO NOT USE 
    444    ln_traldf_gdia   =  .false.  !     griffies operator strfn diagnostics (require "key_ldfslp") ! UNDER TEST, DO NOT USE 
    445                            !  Coefficient 
    446    rn_aht_0         =  1000.    !     horizontal eddy diffusivity for tracers [m2/s] 
    447    rn_ahtb_0        =     0.    !     background eddy diffusivity for ldf_iso [m2/s] 
    448    rn_aeiv_0        =     0.    !     eddy induced velocity coefficient [m2/s]    (require "key_traldf_eiv") 
     470   !                       !  Type of the operator :  
     471   ln_traldf_lap    =  .true.   !  laplacian operator        
     472   ln_traldf_bilap  =  .false.  !  bilaplacian operator      
     473   !                       !  Direction of action  : 
     474   ln_traldf_level  =  .false.  !  iso-level                 
     475   ln_traldf_hor    =  .false.  !  horizontal (geopotential)            (require "key_ldfslp" when ln_sco=T) 
     476   ln_traldf_iso    =  .true.   !  iso-neutral                          (require "key_ldfslp") 
     477   ln_traldf_grif   =  .false.  !  griffies skew flux formulation       (require "key_ldfslp")  ! UNDER TEST, DO NOT USE 
     478   ln_traldf_gdia   =  .false.  !  griffies operator strfn diagnostics  (require "key_ldfslp") ! UNDER TEST, DO NOT USE 
     479   !                       !  Coefficient 
     480   rn_aht_0         =  1000.    !  horizontal eddy diffusivity for tracers [m2/s] 
     481   rn_ahtb_0        =     0.    !  background eddy diffusivity for ldf_iso [m2/s] 
     482   rn_aeiv_0        =     0.    !  eddy induced velocity coefficient [m2/s]    (require "key_traldf_eiv") 
    449483/ 
    450484!----------------------------------------------------------------------- 
     
    462496   nn_file     =    1      !  create a damping.coeff NetCDF file (=1) or not (=0) 
    463497/ 
     498 
    464499!!====================================================================== 
    465500!!                      ***  Dynamics namelists  *** 
     
    471506!!   namdyn_ldf    lateral diffusion scheme 
    472507!!====================================================================== 
    473  
     508! 
    474509!----------------------------------------------------------------------- 
    475510&namdyn_adv    !   formulation of the momentum advection 
     
    512547&namdyn_ldf    !   lateral diffusion on momentum 
    513548!----------------------------------------------------------------------- 
    514                            !  Type of the operator :  
     549   !                       !  Type of the operator :  
    515550   ln_dynldf_lap    =  .false.  !  laplacian operator          
    516551   ln_dynldf_bilap  =  .true.   !  bilaplacian operator     
    517                            !  Direction of action  :  
     552   !                       !  Direction of action  :  
    518553   ln_dynldf_level  =  .false.  !  iso-level                
    519554   ln_dynldf_hor    =  .true.   !  horizontal (geopotential)            (require "key_ldfslp" in s-coord.) 
    520555   ln_dynldf_iso    =  .false.  !  iso-neutral                          (require "key_ldfslp") 
    521                            !  Coefficient 
     556   !                       !  Coefficient 
    522557   rn_ahm_0_lap     =     0.    !  horizontal laplacian eddy viscosity   [m2/s] 
    523558   rn_ahmb_0        =     0.    !  background eddy viscosity for ldf_iso [m2/s] 
    524559   rn_ahm_0_blp     = -8.5e+11  !  horizontal bilaplacian eddy viscosity [m4/s]  
    525560/ 
     561 
    526562!!====================================================================== 
    527563!!             Tracers & Dynamics vertical physics namelists 
    528564!!====================================================================== 
    529 !!       namzdf        vertical physics 
    530 !!       namzdf_ric    richardson number dependent vertical mixing      ("key_zdfric"      ) 
    531 !!       namzdf_tke    TKE dependent vertical mixing                    ("key_zdftke"      ) 
    532 !!       namzdf_kpp    KPP dependent vertical mixing                    ("key_zdfkpp"      ) 
    533 !!       namzdf_ddm    double diffusive mixing parameterization         ("key_zdfddm"      ) 
    534 !!       namzdf_tmx    tidal mixing parameterization                    ("key_zdftmx"      ) 
    535 !!====================================================================== 
    536  
     565!!    namzdf        vertical physics 
     566!!    namzdf_ric    richardson number dependent vertical mixing         ("key_zdfric") 
     567!!    namzdf_tke    TKE dependent vertical mixing                       ("key_zdftke") 
     568!!    namzdf_kpp    KPP dependent vertical mixing                       ("key_zdfkpp") 
     569!!    namzdf_ddm    double diffusive mixing parameterization            ("key_zdfddm") 
     570!!    namzdf_tmx    tidal mixing parameterization                       ("key_zdftmx") 
     571!!====================================================================== 
     572! 
    537573!----------------------------------------------------------------------- 
    538574&namzdf        !   vertical physics 
     
    599635/ 
    600636!----------------------------------------------------------------------- 
    601 &namzdf_gls                !   GLS vertical diffusion  ("key_zdfgls") 
    602 !----------------------------------------------------------------------- 
    603    rn_emin        = 1.e-6  !  minimum value of e   [m2/s2] 
    604    rn_epsmin      = 1.e-12 !  minimum value of eps [m2/s3] 
    605    ln_length_lim  = .true. !  limit on the dissipation rate under stable stratification (Galperin et al., 1988) 
    606    rn_clim_galp   = 0.53   !  galperin limit 
    607    ln_crban       = .TRUE. !  Use Craig & Banner (1994) surface wave mixing parametrisation 
    608    ln_sigpsi      = .TRUE. !  Activate or not Burchard 2001 mods on psi schmidt number in the wb case 
    609    rn_crban       = 100.   !  Craig and Banner 1994 constant for wb tke flux 
    610    rn_charn       = 70000. !  Charnock constant for wb induced roughness length 
    611    nn_tkebc_surf  =   1    !  surface tke condition (0/1/2=Dir/Neum/Dir Mellor-Blumberg) 
    612    nn_tkebc_bot   =   1    !  bottom tke condition (0/1=Dir/Neum) 
    613    nn_psibc_surf  =   1    !  surface psi condition (0/1/2=Dir/Neum/Dir Mellor-Blumberg) 
    614    nn_psibc_bot   =   1    !  bottom psi condition (0/1=Dir/Neum) 
    615    nn_stab_func   =   2    !  stability function (0=Galp, 1= KC94, 2=CanutoA, 3=CanutoB) 
    616    nn_clos        =   1    !  predefined closure type (0=MY82, 1=k-eps, 2=k-w, 3=Gen) 
     637&namzdf_gls                !   GLS vertical diffusion                   ("key_zdfgls") 
     638!----------------------------------------------------------------------- 
     639   rn_emin       = 1.e-6   !  minimum value of e   [m2/s2] 
     640   rn_epsmin     = 1.e-12 !  minimum value of eps [m2/s3] 
     641   ln_length_lim = .true. !  limit on the dissipation rate under stable stratification (Galperin et al., 1988) 
     642   rn_clim_galp  = 0.53    !  galperin limit 
     643   ln_crban      = .TRUE. !  Use Craig & Banner (1994) surface wave mixing parametrisation 
     644   ln_sigpsi     = .TRUE. !  Activate or not Burchard 2001 mods on psi schmidt number in the wb case 
     645   rn_crban      = 100.    !  Craig and Banner 1994 constant for wb tke flux 
     646   rn_charn      = 70000. !  Charnock constant for wb induced roughness length 
     647   nn_tkebc_surf =   1     !  surface tke condition (0/1/2=Dir/Neum/Dir Mellor-Blumberg) 
     648   nn_tkebc_bot  =   1     !  bottom tke condition (0/1=Dir/Neum) 
     649   nn_psibc_surf =   1     !  surface psi condition (0/1/2=Dir/Neum/Dir Mellor-Blumberg) 
     650   nn_psibc_bot  =   1     !  bottom psi condition (0/1=Dir/Neum) 
     651   nn_stab_func  =   2     !  stability function (0=Galp, 1= KC94, 2=CanutoA, 3=CanutoB) 
     652   nn_clos       =   1     !  predefined closure type (0=MY82, 1=k-eps, 2=k-w, 3=Gen) 
    617653/ 
    618654!----------------------------------------------------------------------- 
     
    632668   rn_tfe_itf  = 1.        !  ITF tidal dissipation efficiency 
    633669/ 
     670 
    634671!!====================================================================== 
    635672!!                  ***  Miscelaneous namelists  *** 
     
    640677!!   namsol            elliptic solver / island / free surface  
    641678!!====================================================================== 
    642  
     679! 
    643680!----------------------------------------------------------------------- 
    644681&namsol        !   elliptic solver / island / free surface  
     
    684721 
    685722!!====================================================================== 
    686 !!                       ***  Diagnostics namelists  *** 
    687 !!====================================================================== 
     723!!                  ***  Diagnostics namelists  *** 
     724!!====================================================================== 
     725!!   namnc4       netcdf4 chunking and compression settings             ("key_netcdf4") 
    688726!!   namtrd       dynamics and/or tracer trends                         ("key_trddyn","key_trdtra","key_trdmld") 
    689 !!   namgap       level mean model-data gap                             ("key_diagap") 
    690727!!   namflo       float parameters                                      ("key_float") 
    691728!!   namptr       Poleward Transport Diagnostics 
    692 !!====================================================================== 
    693  
     729!!   namhsb       Heat and salt budgets  
     730!!====================================================================== 
     731! 
     732!----------------------------------------------------------------------- 
     733&namnc4        !   netcdf4 chunking and compression settings            ("key_netcdf4") 
     734!----------------------------------------------------------------------- 
     735   nn_nchunks_i=   4       !  number of chunks in i-dimension 
     736   nn_nchunks_j=   4       !  number of chunks in j-dimension 
     737   nn_nchunks_k=   31      !  number of chunks in k-dimension 
     738                           !  setting nn_nchunks_k = jpk will give a chunk size of 1 in the vertical which 
     739                           !  is optimal for postprocessing which works exclusively with horizontal slabs 
     740   ln_nc4zip   = .TRUE.    !  (T) use netcdf4 chunking and compression 
     741                           !  (F) ignore chunking information and produce netcdf3-compatible files 
     742/ 
    694743!----------------------------------------------------------------------- 
    695744&namtrd        !   diagnostics on dynamics and/or tracer trends         ("key_trddyn" and/or "key_trdtra") 
    696 !              !       or mixed-layer trends or barotropic vorticity    ('key_trdmld' or  "key_trdvor") 
     745!              !       or mixed-layer trends or barotropic vorticity    ("key_trdmld" or     "key_trdvor") 
    697746!----------------------------------------------------------------------- 
    698747   nn_trd      = 365       !  time step frequency dynamics and tracers trends 
     
    705754/ 
    706755!----------------------------------------------------------------------- 
    707 &namgap       !   level mean model-data gap                             ('key_diagap') 
    708 !----------------------------------------------------------------------- 
    709    nn_gap     =  15        !  time-step frequency of model-data gap computation 
    710    nn_prg     =  10        !  time-step frequency of gap print in model output 
    711 / 
    712 !----------------------------------------------------------------------- 
    713756&namflo       !   float parameters                                      ("key_float") 
    714757!----------------------------------------------------------------------- 
    715     ln_rstflo = .false.    !  float restart (T) or not (F) 
    716     nn_writefl=      75    !  frequency of writing in float output file  
    717     nn_stockfl=    5475    !  frequency of creation of the float restart file  
    718     ln_argo   = .false.    !  Argo type floats (stay at the surface each 10 days) 
    719     ln_flork4 = .false.    !  trajectories computed with a 4th order Runge-Kutta (T) 
     758   ln_rstflo = .false.    !  float restart (T) or not (F) 
     759   nn_writefl =      75    !  frequency of writing in float output file  
     760   nn_stockfl =    5475    !  frequency of creation of the float restart file  
     761   ln_argo    = .false.    !  Argo type floats (stay at the surface each 10 days) 
     762   ln_flork4 = .false.    !  trajectories computed with a 4th order Runge-Kutta (T) 
    720763                           !  or computed with Blanke' scheme (F) 
    721764/ 
     
    732775/ 
    733776!----------------------------------------------------------------------- 
    734 &namhsb       !  Heat and salt budgets 
    735 !----------------------------------------------------------------------- 
    736    ln_diahsb  = .false.     !  check the heat and salt budgets (T) or not (F) 
    737 / 
    738 !----------------------------------------------------------------------- 
    739 !       namobs    observation usage switch 
    740 !----------------------------------------------------------------------- 
    741 ! 
    742 !  ln_t3d                  Logical switch for T profile observations          
    743 !  ln_s3d                  Logical switch for S profile observations           
    744 !  ln_ena                  Logical switch for ENACT insitu data set            
    745 !  ln_cor                  Logical switch for Coriolis insitu data set        
    746 !  ln_profb                Logical switch for feedback insitu data set      
    747 !  ln_sla                  Logical switch for SLA observations                
    748 !  ln_sladt                Logical switch for AVISO SLA data               
    749 !  ln_slafb                Logical switch for feedback SLA data             
    750 !  ln_ssh                  Logical switch for SSH observations               
    751 !  ln_sst                  Logical switch for SST observations               
    752 !  ln_reysst               Logical switch for Reynolds observations        
    753 !  ln_ghrsst               Logical switch for GHRSST observations           
    754 !  ln_sstfb                Logical switch for feedback SST data           
    755 !  ln_sss                  Logical switch for SSS observations               
    756 !  ln_seaice               Logical switch for Sea Ice observations         
    757 !  ln_vel3d                Logical switch for velocity observations          
    758 !  ln_velavcur             Logical switch for velocity daily av. cur.     
    759 !  ln_velhrcur             Logical switch for velocity high freq. cur.    
    760 !  ln_velavadcp            Logical switch for velocity daily av. ADCP   
    761 !  ln_velhradcp            Logical switch for velocity high freq. ADCP 
    762 !  ln_velfb                Logical switch for feedback velocity data        
    763 !  ln_grid_global          Global distribtion of observations          
    764 !  ln_grid_search_lookup   Logical switch for obs grid search w/lookup table   
    765 !  grid_search_file        Grid search lookup file header  
    766 !  enactfiles              ENACT input observation file names  
    767 !  coriofiles              Coriolis input observation file name   
    768 !  profbfiles              Profile feedback input observation file name  
    769 !  ln_profb_enatim         Enact feedback input time setting switch     
    770 !  slafilesact             Active SLA input observation file name 
    771 !  slafilespas             Passive SLA input observation file name  
    772 !  slafbfiles              Feedback SLA input observation file name  
    773 !  sstfiles                GHRSST input observation file name        
    774 !  sstfbfiles              Feedback SST input observation file name  
    775 !  seaicefiles             Sea Ice input observation file name  
    776 !  velavcurfiles           Vel. cur. daily av. input file name   
    777 !  velhvcurfiles           Vel. cur. high freq. input file name   
    778 !  velavadcpfiles          Vel. ADCP daily av. input file name     
    779 !  velhvadcpfiles          Vel. ADCP high freq. input file name  
    780 !  velfbfiles              Vel. feedback input observation file name  
    781 !  dobsini                 Initial date in window YYYYMMDD.HHMMSS        
    782 !  dobsend                 Final date in window YYYYMMDD.HHMMSS          
    783 !  n1dint                  Type of vertical interpolation method         
    784 !  n2dint                  Type of horizontal interpolation method        
    785 !  ln_nea                  Rejection of observations near land switch     
    786 !  nmsshc                  MSSH correction scheme                          
    787 !  mdtcorr                 MDT  correction                                
    788 !  mdtcutoff               MDT cutoff for computed correction           
    789 !  ln_altbias              Logical switch for alt bias                 
    790 !  ln_ignmis               Logical switch for ignoring missing files    
    791 !  endailyavtypes          ENACT daily average types                     
    792  &namobs 
    793    ln_t3d = .false. 
    794    ln_s3d = .false. 
    795    ln_ena = .false. 
    796    ln_profb = .false. 
    797    ln_sla = .false. 
    798    ln_sladt = .false. 
    799    ln_slafb = .false. 
    800    ln_sst = .false. 
    801    ln_sstfb = .false. 
    802    nmsshc = 0 
     777&namhsb       !  Heat and salt budgets  
     778!----------------------------------------------------------------------- 
     779   ln_diahsb  = .false.    !  check the heat and salt budgets (T) or not (F) 
     780/ 
     781 
     782!!====================================================================== 
     783!!            ***  Observation & Assimilation namelists *** 
     784!!====================================================================== 
     785!!   namobs       observation and model comparison                      ('key_diaobs') 
     786!!   nam_asminc   assimilation increments                               ('key_asminc') 
     787!!====================================================================== 
     788! 
     789!----------------------------------------------------------------------- 
     790&namobs       !  observation usage switch                               ('key_diaobs') 
     791!----------------------------------------------------------------------- 
     792   ln_t3d     = .false.    ! Logical switch for T profile observations          
     793   ln_s3d     = .false.    ! Logical switch for S profile observations           
     794   ln_ena     = .false.    ! Logical switch for ENACT insitu data set            
     795   !                       !     ln_cor                  Logical switch for Coriolis insitu data set        
     796   ln_profb   = .false.    ! Logical switch for feedback insitu data set      
     797   ln_sla     = .false.    ! Logical switch for SLA observations                
     798 
     799   ln_sladt   = .false.    ! Logical switch for AVISO SLA data               
     800 
     801   ln_slafb   = .false.    ! Logical switch for feedback SLA data             
     802                           !     ln_ssh                  Logical switch for SSH observations               
     803 
     804   ln_sst     = .false.    ! Logical switch for SST observations               
     805                           !     ln_reysst               Logical switch for Reynolds observations        
     806                           !     ln_ghrsst               Logical switch for GHRSST observations           
     807 
     808   ln_sstfb   = .false.    ! Logical switch for feedback SST data           
     809                           !     ln_sss                  Logical switch for SSS observations               
     810                           !     ln_seaice               Logical switch for Sea Ice observations         
     811                           !     ln_vel3d                Logical switch for velocity observations          
     812                           !     ln_velavcur             Logical switch for velocity daily av. cur.     
     813                           !     ln_velhrcur             Logical switch for velocity high freq. cur.    
     814                           !     ln_velavadcp            Logical switch for velocity daily av. ADCP   
     815                           !     ln_velhradcp            Logical switch for velocity high freq. ADCP 
     816                           !     ln_velfb                Logical switch for feedback velocity data        
     817                           !     ln_grid_global          Global distribtion of observations          
     818                           !     ln_grid_search_lookup   Logical switch for obs grid search w/lookup table   
     819                           !     grid_search_file        Grid search lookup file header  
     820                           !     enactfiles              ENACT input observation file names  
     821                           !     coriofiles              Coriolis input observation file name   
     822   !                       ! profbfiles: Profile feedback input observation file name  
    803823   profbfiles = 'profiles_01.nc' 
     824                           !     ln_profb_enatim         Enact feedback input time setting switch     
     825                           !     slafilesact             Active SLA input observation file name 
     826                           !     slafilespas             Passive SLA input observation file name  
     827   !                       ! slafbfiles: Feedback SLA input observation file name  
    804828   slafbfiles = 'sla_01.nc' 
     829                           !     sstfiles                GHRSST input observation file name        
     830   !                       ! sstfbfiles: Feedback SST input observation file name  
    805831   sstfbfiles = 'sst_01.nc' 'sst_02.nc' 'sst_03.nc' 'sst_04.nc' 'sst_05.nc' 
    806    ln_altbias = .false. 
     832                           !     seaicefiles             Sea Ice input observation file name  
     833                           !     velavcurfiles           Vel. cur. daily av. input file name   
     834                           !     velhvcurfiles           Vel. cur. high freq. input file name   
     835                           !     velavadcpfiles          Vel. ADCP daily av. input file name     
     836                           !     velhvadcpfiles          Vel. ADCP high freq. input file name  
     837                           !     velfbfiles              Vel. feedback input observation file name  
     838                           !     dobsini                 Initial date in window YYYYMMDD.HHMMSS        
     839                           !     dobsend                 Final date in window YYYYMMDD.HHMMSS          
     840                           !     n1dint                  Type of vertical interpolation method         
     841                           !     n2dint                  Type of horizontal interpolation method        
     842                           !     ln_nea                  Rejection of observations near land switch     
     843   nmsshc     = 0          ! MSSH correction scheme                          
     844                           !     mdtcorr                 MDT  correction                                
     845                           !     mdtcutoff               MDT cutoff for computed correction           
     846   ln_altbias = .false.    ! Logical switch for alt bias                 
     847   ln_ignmis  = .true.     ! Logical switch for ignoring missing files    
     848                           !     endailyavtypes   ENACT daily average types                     
    807849   ln_grid_global = .true. 
    808850   ln_grid_search_lookup = .false. 
    809    ln_ignmis = .true.   
    810851/  
    811852!----------------------------------------------------------------------- 
    812 !       nam_asminc    assimilation increments namelist 
    813 !----------------------------------------------------------------------- 
    814 ! ln_bkgwri   Logical switch for writing out background state  
    815 ! ln_trjwri   Logical switch for writing out state trajectory 
    816 ! ln_trainc   Logical switch for applying tracer increments 
    817 ! ln_dyninc   Logical switch for applying velocity increments 
    818 ! ln_sshinc   Logical switch for applying SSH increments  
    819 ! ln_asmdin   Logical switch for Direct Initialization (DI) 
    820 ! ln_asmiau   Logical switch for Incremental Analysis Updating (IAU) 
    821 ! nitbkg      Timestep of background in [0,nitend-nit000-1] 
    822 ! nitdin      Timestep of background for DI in [0,nitend-nit000-1] 
    823 ! nitiaustr   Timestep of start of IAU interval in [0,nitend-nit000-1] 
    824 ! nitiaufin   Timestep of end of IAU interval in [0,nitend-nit000-1] 
    825 ! niaufn      Type of IAU weighting function 
    826 ! nittrjfrq   Frequency of trajectory output for 4D-VAR 
    827 ! ln_salfix   Logical switch for ensuring that the sa > salfixmin 
    828 ! salfixmin   Minimum salinity after applying the increments 
    829 &nam_asminc 
    830     ln_bkgwri = .false. 
    831     ln_trjwri = .false. 
    832     ln_trainc = .false. 
    833     ln_dyninc = .false. 
    834     ln_sshinc = .false. 
    835     ln_asmdin = .false. 
    836     ln_asmiau = .false. 
    837     nitbkg = 0 
    838     nitdin = 0 
    839     nitiaustr = 1 
    840     nitiaufin = 15 
    841     niaufn = 0 
    842     nittrjfrq = 0 
    843     ln_salfix = .false. 
    844     salfixmin = -9999 
    845 / 
     853&nam_asminc   !   assimilation increments                               ('key_asminc') 
     854!----------------------------------------------------------------------- 
     855    ln_bkgwri = .false.    !  Logical switch for writing out background state  
     856    ln_trjwri = .false.    !  Logical switch for writing out state trajectory 
     857    ln_trainc = .false.    !  Logical switch for applying tracer increments 
     858    ln_dyninc = .false.    !  Logical switch for applying velocity increments 
     859    ln_sshinc = .false.    !  Logical switch for applying SSH increments  
     860    ln_asmdin = .false.    !  Logical switch for Direct Initialization (DI) 
     861    ln_asmiau = .false.    !  Logical switch for Incremental Analysis Updating (IAU) 
     862    nitbkg    = 0          !  Timestep of background in [0,nitend-nit000-1] 
     863    nitdin    = 0          !  Timestep of background for DI in [0,nitend-nit000-1] 
     864    nitiaustr = 1          !  Timestep of start of IAU interval in [0,nitend-nit000-1] 
     865    nitiaufin = 15         !  Timestep of end of IAU interval in [0,nitend-nit000-1] 
     866    niaufn    = 0          !  Type of IAU weighting function 
     867    nittrjfrq = 0          !  Frequency of trajectory output for 4D-VAR 
     868    ln_salfix = .false.    !  Logical switch for ensuring that the sa > salfixmin 
     869    salfixmin = -9999      !  Minimum salinity after applying the increments 
     870/ 
  • branches/nemo_v3_3_beta/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/EXP00/namelist

    r2399 r2417  
    11!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
    22!! NEMO/OPA  :  1 - run manager      (namrun) 
    3 !! namelists    2 - Domain           (namzgr, namzgr_sco, namdom) 
     3!! namelists    2 - Domain           (namzgr, namzgr_sco, namdom, namdta_tem, namdta_sal) 
    44!!              3 - Surface boundary (namsbc, namsbc_ana, namsbc_flx, namsbc_clio, namsbc_core 
    5 !!                                    namsbc_cpl, namqsr, namsbc_rnf, namsbc_ssr, namsbc_alb) 
     5!!                                    namsbc_cpl, namsbc_cpl_co2 namtra_qsr, namsbc_rnf,  
     6!!                                    namsbc_apr, namsbc_ssr, namsbc_alb) 
    67!!              4 - lateral boundary (namlbc, namcla, namobc, namagrif, nambdy, nambdy_tide) 
    78!!              5 - bottom  boundary (nambfr, nambbc, nambbl) 
     
    910!!              7 - dynamics         (namdyn_adv, namdyn_vor, namdyn_hpg, namdyn_spg, namdyn_ldf) 
    1011!!              8 - Verical physics  (namzdf, namzdf_ric, namzdf_tke, namzdf_kpp, namzdf_ddm, namzdf_tmx) 
    11 !!              9 - diagnostics      (namtrd, namgap, namspr, namflo, namptr) 
    12 !!              9 - miscellaneous    (namsol, nammpp, nammpp_dyndist, namctl) 
     12!!              9 - diagnostics      (namnc4, namtrd, namspr, namflo, namptr, namhsb) 
     13!!             10 - miscellaneous    (namsol, nammpp, nammpp_dyndist, namctl) 
     14!!             11 - Obs & Assim      (namobs, nam_asminc) 
    1315!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
    1416!  CAUTION: some scripts does not support CAPITALs for logical use .true./.false., not .TRUE./.FALSE. 
     
    1719!!                   ***  Run management namelists  *** 
    1820!!====================================================================== 
    19 !!   namrun            parameters of the run 
    20 !!====================================================================== 
    21  
     21!!   namrun        parameters of the run 
     22!!====================================================================== 
     23! 
    2224!----------------------------------------------------------------------- 
    2325&namrun        !   parameters of the run 
     
    4345   cn_ocerst_out = "restart"   !  suffix of ocean restart name (output) 
    4446/ 
    45 !!====================================================================== 
    46 !!   namnc4            netcdf4 chunking and compression settings 
    47 !!====================================================================== 
    48 !----------------------------------------------------------------------- 
    49 &namnc4         !  netcdf4 chunking and compression settings     ("key_netcdf4") 
    50                 !  (ignored if "key_netcdf4" is not used) 
    51 !----------------------------------------------------------------------- 
    52    nn_nchunks_i   =   4       !  number of chunks in i-dimension 
    53    nn_nchunks_j   =   4       !  number of chunks in j-dimension 
    54    nn_nchunks_k   =   31      !  number of chunks in k-dimension 
    55                               !  setting nn_nchunks_k = jpk will give a chunk size of 1 in the vertical which 
    56                               !  is optimal for postprocessing which works exclusively with horizontal slabs 
    57    ln_nc4zip      =   .TRUE.  !  (T) use netcdf4 chunking and compression 
    58                               !  (F) ignore chunking information and produce netcdf3-compatible files 
    59 / 
     47 
    6048!!====================================================================== 
    6149!!                      ***  Domain namelists  *** 
     
    6452!!   namzgr_sco   s-coordinate or hybrid z-s-coordinate 
    6553!!   namdom       space and time domain (bathymetry, mesh, timestep) 
    66 !!====================================================================== 
    67  
     54!!   namdta_tem   data: temperature                                     ("key_dtatem") 
     55!!   namdta_sal   data: salinity                                        ("key_dtasal") 
     56!!====================================================================== 
     57! 
    6858!----------------------------------------------------------------------- 
    6959&namzgr        !   vertical coordinate 
     
    10393   rn_rdth     =  800.           !  depth variation of tracer time step  (used if nacc=1) 
    10494/ 
     95!----------------------------------------------------------------------- 
     96&namdta_tem    !   data : temperature                                   ("key_dtatem") 
     97!----------------------------------------------------------------------- 
     98!              ! file name ! frequency (hours)    ! variable ! time interp. ! clim  !'yearly' or ! weights  ! rotation ! 
     99!              !           !  (if <0  months)     !   name   !  (logical)   ! (T/F) ! 'monthly'  ! filename ! pairing  ! 
     100   sn_tem = 'data_1m_potential_temperature_nomask', -1,'votemper',  .true.  , .true., 'yearly'   , ' '      , ' ' 
     101   ! 
     102   cn_dir       = './'     !  root directory for the location of the runoff files 
     103/ 
     104!----------------------------------------------------------------------- 
     105&namdta_sal    !   data : salinity                                      ("key_dtasal") 
     106!----------------------------------------------------------------------- 
     107!              ! file name ! frequency (hours)    ! variable ! time interp. ! clim  !'yearly' or ! weights  ! rotation ! 
     108!              !           !  (if <0  months)     !   name   !   (logical)  ! (T/F) ! 'monthly'  ! filename ! pairing  ! 
     109   sn_sal      =  'data_1m_salinity_nomask',  -1  ,'vosaline',    .true.    , .true., 'yearly'   , ''       , ' ' 
     110   ! 
     111   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
     112/ 
     113 
    105114!!====================================================================== 
    106115!!            ***  Surface Boundary Condition namelists  *** 
    107116!!====================================================================== 
    108 !!   namsbc        surface boundary condition 
    109 !!   namsbc_ana    analytical         formulation 
    110 !!   namsbc_flx    flux               formulation 
    111 !!   namsbc_clio   CLIO bulk formulea formulation 
    112 !!   namsbc_core   CORE bulk formulea formulation 
    113 !!   namsbc_cpl    CouPLed            formulation                       ("key_coupled") 
    114 !!   namtra_qsr    penetrative solar radiation 
    115 !!   namsbc_rnf    river runoffs 
    116 !!   namsbc_ssr    sea surface restoring term (for T and/or S) 
    117 !!   namsbc_alb    albedo parameters 
    118 !!====================================================================== 
    119  
     117!!   namsbc          surface boundary condition 
     118!!   namsbc_ana      analytical         formulation 
     119!!   namsbc_flx      flux               formulation 
     120!!   namsbc_clio     CLIO bulk formulea formulation 
     121!!   namsbc_core     CORE bulk formulea formulation 
     122!!   namsbc_cpl      CouPLed            formulation                     ("key_coupled") 
     123!!   namsbc_cpl_co2  coupled ocean/biogeo/atmosphere model              ("key_cpl_carbon_cycle") 
     124!!   namtra_qsr      penetrative solar radiation 
     125!!   namsbc_rnf      river runoffs 
     126!!   namsbc_apr      Atmospheric Pressure 
     127!!   namsbc_ssr      sea surface restoring term (for T and/or S) 
     128!!   namsbc_alb      albedo parameters 
     129!!====================================================================== 
     130! 
    120131!----------------------------------------------------------------------- 
    121132&namsbc        !   Surface Boundary Condition (surface module) 
    122133!----------------------------------------------------------------------- 
    123134   nn_fsbc     = 5         !  frequency of surface boundary condition computation  
    124                            !               (= the frequency of sea-ice model call) 
    125    ln_ana      = .false.   !  analytical formulation (T => fill namsbc_ana )  
    126    ln_flx      = .false.   !  flux formulation       (T => fill namsbc_flx ) 
    127    ln_blk_clio = .false.   !  CLIO bulk formulation  (T => fill namsbc_clio)  
    128    ln_blk_core = .true.    !  CORE bulk formulation  (T => fill namsbc_core)  
    129    ln_cpl      = .false.   !  Coupled formulation    (T => fill namsbc_cpl ) 
     135                           !     (also = the frequency of sea-ice model call) 
     136   ln_ana      = .false.   !  analytical formulation                    (T => fill namsbc_ana )  
     137   ln_flx      = .false.   !  flux formulation                          (T => fill namsbc_flx ) 
     138   ln_blk_clio = .false.   !  CLIO bulk formulation                     (T => fill namsbc_clio)  
     139   ln_blk_core = .true.    !  CORE bulk formulation                     (T => fill namsbc_core)  
     140   ln_cpl      = .false.   !  Coupled formulation                       (T => fill namsbc_cpl ) 
    130141   ln_apr_dyn  = .false.   !  Patm gradient added in ocean & ice Eqs.   (T => fill namsbc_apr ) 
    131142   nn_ice      = 2         !  =0 no ice boundary condition   , 
    132143                           !  =1 use observed ice-cover      , 
    133                            !  =2 ice-model used                             ("key_lim3" or "key_lim2) 
     144                           !  =2 ice-model used                         ("key_lim3" or "key_lim2) 
    134145   ln_dm2dc    = .false.   !  daily mean to diurnal cycle short wave (qsr) 
    135    ln_rnf      = .true.    !  runoffs (T => fill namsbc_rnf) 
    136    ln_ssr      = .true.    !  Sea Surface Restoring on T and/or S (T => fill namsbc_ssr) 
     146   ln_rnf      = .true.    !  runoffs                                   (T => fill namsbc_rnf) 
     147   ln_ssr      = .true.    !  Sea Surface Restoring on T and/or S       (T => fill namsbc_ssr) 
    137148   nn_fwb      = 3         !  FreshWater Budget: =0 unchecked  
    138                            !                     =1 global mean of e-p-r set to zero at each time step  
    139                            !                     =2 annual global mean of e-p-r set to zero 
    140                            !                     =3 global emp set to zero and spread out over erp area 
     149                           !     =1 global mean of e-p-r set to zero at each time step  
     150                           !     =2 annual global mean of e-p-r set to zero 
     151                           !     =3 global emp set to zero and spread out over erp area 
    141152/ 
    142153!----------------------------------------------------------------------- 
     
    153164&namsbc_flx    !   surface boundary condition : flux formulation 
    154165!----------------------------------------------------------------------- 
    155 !              !   file name  ! frequency (hours) !  variable  ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    156 !              !              !  (if <0  months)  !    name    !    (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    157    sn_utau     = 'utau'       ,        24         ,    'utau'  ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    158    sn_vtau     = 'vtau'       ,        24         ,    'vtau'  ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    159    sn_qtot     = 'qtot'       ,        24         ,    'qtot'  ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    160    sn_qsr      = 'qsr'        ,        24         ,    'qsr'   ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    161    sn_emp      = 'emp'        ,        24         ,    'emp'   ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    162 ! 
     166!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     167!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     168   sn_utau     = 'utau'      ,        24         , 'utau'    , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     169   sn_vtau     = 'vtau'      ,        24         , 'vtau'    , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     170   sn_qtot     = 'qtot'      ,        24         , 'qtot'    , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     171   sn_qsr      = 'qsr'       ,        24         , 'qsr'     , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     172   sn_emp      = 'emp'       ,        24         , 'emp'     , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     173 
    163174   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the flux files 
    164175/       
     
    166177&namsbc_clio   !   namsbc_clio  CLIO bulk formulea 
    167178!----------------------------------------------------------------------- 
    168 !              !   file name  ! frequency (hours) !  variable  ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    169 !              !              !  (if <0  months)  !    name    !    (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    170    sn_utau     = 'taux_1m'    ,       -1          , 'sozotaux' ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    171    sn_vtau     = 'tauy_1m'    ,       -1          , 'sometauy' ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    172    sn_wndm     = 'flx'        ,       -1          , 'socliowi' ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    173    sn_tair     = 'flx'        ,       -1          , 'socliot2' ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    174    sn_humi     = 'flx'        ,       -1          , 'socliohu' ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    175    sn_ccov     = 'flx'        ,       -1          , 'socliocl' ,    .false.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    176    sn_prec     = 'flx'        ,       -1          , 'socliopl' ,    .false.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    177 ! 
     179!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     180!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     181   sn_utau     = 'taux_1m'   ,       -1          , 'sozotaux',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     182   sn_vtau     = 'tauy_1m'   ,       -1          , 'sometauy',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     183   sn_wndm     = 'flx'       ,       -1          , 'socliowi',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     184   sn_tair     = 'flx'       ,       -1          , 'socliot2',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     185   sn_humi     = 'flx'       ,       -1          , 'socliohu',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     186   sn_ccov     = 'flx'       ,       -1          , 'socliocl',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     187   sn_prec     = 'flx'       ,       -1          , 'socliopl',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     188 
    178189   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the bulk files are 
    179190/ 
     
    181192&namsbc_core   !   namsbc_core  CORE bulk formulea 
    182193!----------------------------------------------------------------------- 
    183 !              !   file name                   ! frequency (hours) ! variable    ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    184 !              !                               !  (if <0  months)  !   name      !    (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    185    sn_wndi     = 'u_10.15JUNE2009_orca2'       ,       6           , 'U_10_MOD'  ,    .false.     , .true.  , 'yearly'  ,   ''     ,  'Uwnd' 
    186    sn_wndj     = 'v_10.15JUNE2009_orca2'       ,       6           , 'V_10_MOD'  ,    .false.     , .true.  , 'yearly'  ,   ''     ,  'Vwnd' 
    187    sn_qsr      = 'ncar_rad.15JUNE2009_orca2'   ,       24          , 'SWDN_MOD'  ,    .false.     , .true.  , 'yearly'  ,   ''     ,  '' 
    188    sn_qlw      = 'ncar_rad.15JUNE2009_orca2'   ,       24          , 'LWDN_MOD'  ,    .false.     , .true.  , 'yearly'  ,   ''     ,  '' 
    189    sn_tair     = 't_10.15JUNE2009_orca2'       ,       6           , 'T_10_MOD'  ,    .false.     , .true.  , 'yearly'  ,   ''     ,  '' 
    190    sn_humi     = 'q_10.15JUNE2009_orca2'       ,       6           , 'Q_10_MOD'  ,    .false.     , .true.  , 'yearly'  ,   ''     ,  '' 
    191    sn_prec     = 'ncar_precip.15JUNE2009_orca2',       -1          , 'PRC_MOD1'  ,    .false.     , .true.  , 'yearly'  ,   ''     ,  '' 
    192    sn_snow     = 'ncar_precip.15JUNE2009_orca2',       -1          , 'SNOW'      ,    .false.     , .true.  , 'yearly'  ,   ''     ,  '' 
    193    sn_tdif     = 'taudif_core'                 ,       24          , 'taudif'    ,    .false.     , .true.  , 'yearly'  ,   ''     ,  '' 
    194 ! 
     194!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     195!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     196   sn_wndi = 'u_10.15JUNE2009_orca2'       ,  6  , 'U_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , 'Uwnd' 
     197   sn_wndj = 'v_10.15JUNE2009_orca2'       ,  6  , 'V_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , 'Vwnd' 
     198   sn_qsr  = 'ncar_rad.15JUNE2009_orca2'   , 24  , 'SWDN_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     199   sn_qlw  = 'ncar_rad.15JUNE2009_orca2'   , 24  , 'LWDN_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     200   sn_tair = 't_10.15JUNE2009_orca2'       ,  6  , 'T_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     201   sn_humi = 'q_10.15JUNE2009_orca2'       ,  6  , 'Q_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     202   sn_prec = 'ncar_precip.15JUNE2009_orca2', -1  , 'PRC_MOD1',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     203   sn_snow = 'ncar_precip.15JUNE2009_orca2', -1  , 'SNOW'    ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     204   sn_tdif = 'taudif_core'                 , 24  , 'taudif'  ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     205 
    195206   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the bulk files 
    196207   ln_2m       = .false.   !  air temperature and humidity referenced at 2m (T) instead 10m (F) 
     
    199210/ 
    200211!----------------------------------------------------------------------- 
    201 &namsbc_cpl    !   coupled ocean/atmosphere model                        ("key_coupled") 
    202 !----------------------------------------------------------------------- 
    203                                        ! send 
    204 cn_snd_temperature= 'weighted oce and ice'  ! 'oce only' 'weighted oce and ice' 'mixed oce-ice' 
    205 cn_snd_albedo     = 'weighted ice'          ! 'none' 'weighted ice' 'mixed oce-ice' 
    206 cn_snd_thickness  = 'none'                  ! 'none' 'weighted ice and snow' 
    207 cn_snd_crt_nature = 'none'                  ! 'none' 'oce only' 'weighted oce and ice' 'mixed oce-ice' 
    208 cn_snd_crt_refere = 'spherical'             ! 'spherical' 'cartesian' 
    209 cn_snd_crt_orient = 'eastward-northward'    ! 'eastward-northward' or 'local grid' 
    210 cn_snd_crt_grid   = 'T'                     ! 'T' 
    211                                        ! receive 
    212 cn_rcv_w10m       = 'none'                  ! 'none' 'coupled' 
    213 cn_rcv_taumod     = 'coupled'               ! 'none' 'coupled' 
    214 cn_rcv_tau_nature = 'oce only'              ! 'oce only' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
    215 cn_rcv_tau_refere = 'cartesian'             ! 'spherical' 'cartesian' 
    216 cn_rcv_tau_orient = 'eastward-northward'    ! 'eastward-northward' or 'local grid' 
    217 cn_rcv_tau_grid   = 'U,V'                   ! 'T' 'U,V' 'U,V,F' 'U,V,I' 'T,F' 'T,I' 'T,U,V' 
    218 cn_rcv_dqnsdt     = 'coupled'               ! 'none' 'coupled' 
    219 cn_rcv_qsr        = 'oce and ice'           ! 'conservative' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
    220 cn_rcv_qns        = 'oce and ice'           ! 'conservative' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
    221 cn_rcv_emp        = 'conservative'          ! 'conservative' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
    222 cn_rcv_rnf        = 'coupled'               ! 'coupled' 'climato' 'mixed' 
    223 cn_rcv_cal        = 'coupled'               ! 'none' 'coupled' 
    224 / 
    225 !----------------------------------------------------------------------- 
    226 &namsbc_cpl_co2   !   coupled ocean/biogeo/atmosphere model            ("key_cpl_carbon_cycle") 
     212&namsbc_cpl    !   coupled ocean/atmosphere model                       ("key_coupled") 
     213!----------------------------------------------------------------------- 
     214!                                      ! send 
     215cn_snd_temperature= 'weighted oce and ice'  !  'oce only' 'weighted oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     216cn_snd_albedo     = 'weighted ice'          !  'none' 'weighted ice' 'mixed oce-ice' 
     217cn_snd_thickness  = 'none'                  !  'none' 'weighted ice and snow' 
     218cn_snd_crt_nature = 'none'                  !  'none' 'oce only' 'weighted oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     219cn_snd_crt_refere = 'spherical'             !  'spherical' 'cartesian' 
     220cn_snd_crt_orient = 'eastward-northward'    !  'eastward-northward' or 'local grid' 
     221cn_snd_crt_grid   = 'T'                     !  'T' 
     222!                                      ! receive 
     223cn_rcv_w10m       = 'none'                  !  'none' 'coupled' 
     224cn_rcv_taumod     = 'coupled'               !  'none' 'coupled' 
     225cn_rcv_tau_nature = 'oce only'              !  'oce only' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     226cn_rcv_tau_refere = 'cartesian'             !  'spherical' 'cartesian' 
     227cn_rcv_tau_orient = 'eastward-northward'    !  'eastward-northward' or 'local grid' 
     228cn_rcv_tau_grid   = 'U,V'                   !  'T' 'U,V' 'U,V,F' 'U,V,I' 'T,F' 'T,I' 'T,U,V' 
     229cn_rcv_dqnsdt     = 'coupled'               !  'none' 'coupled' 
     230cn_rcv_qsr        = 'oce and ice'           !  'conservative' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     231cn_rcv_qns        = 'oce and ice'           !  'conservative' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     232cn_rcv_emp        = 'conservative'          !  'conservative' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     233cn_rcv_rnf        = 'coupled'               !  'coupled' 'climato' 'mixed' 
     234cn_rcv_cal        = 'coupled'               !  'none' 'coupled' 
     235/ 
     236!----------------------------------------------------------------------- 
     237&namsbc_cpl_co2   !   coupled ocean/biogeo/atmosphere model             ("key_cpl_carbon_cycle") 
    227238!----------------------------------------------------------------------- 
    228239cn_snd_co2        = 'coupled'         ! send    :  'none' 'coupled' 
     
    232243&namtra_qsr    !   penetrative solar radiation 
    233244!----------------------------------------------------------------------- 
    234 !              !   file name  ! frequency (hours) ! variable   ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    235 !              !              !  (if <0  months)  !   name     !    (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    236    sn_chl      = 'chlorophyll',        -1         , 'CHLA'     ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    237   
     245!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     246!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     247   sn_chl      ='chlorophyll',        -1         , 'CHLA'    ,   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     248 
    238249   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
    239250   ln_traqsr   = .true.    !  Light penetration (T) or not (F) 
     
    249260&namsbc_rnf    !   runoffs namelist surface boundary condition 
    250261!----------------------------------------------------------------------- 
    251 !              !   file name  ! frequency (hours) ! variable   ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    252 !              !              !  (if <0  months)  !   name     !    (logical)   !  (T/F)  ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    253    sn_rnf      = 'runoff_1m_nomask' ,  -1         , 'sorunoff' ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  , ''       , '' 
    254    sn_cnf      = 'runoff_1m_nomask' ,   0         , 'socoefr'  ,    .false.     , .true.  , 'yearly'  , ''       , '' 
    255    sn_s_rnf    = 'runoffs'          ,  24         , 'rosaline' ,    .true.      , .true.  ,   'yearly', ''       , '' 
    256    sn_t_rnf    = 'runoffs'          ,  24         , 'rotemper' ,    .true.      , .true.  ,   'yearly', ''       , '' 
    257    sn_dep_rnf  = 'runoffs'          ,   0         , 'rodepth'  ,    .false.     , .true.  ,   'yearly', ''       , '' 
     262!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     263!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     264   sn_rnf      = 'runoff_1m_nomask' ,  -1        , 'sorunoff',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     265   sn_cnf      = 'runoff_1m_nomask' ,   0        , 'socoefr' ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     266   sn_s_rnf    = 'runoffs'          ,  24        , 'rosaline',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     267   sn_t_rnf    = 'runoffs'          ,  24        , 'rotemper',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     268   sn_dep_rnf  = 'runoffs'          ,   0        , 'rodepth' ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     269 
    258270   cn_dir       = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
    259271   ln_rnf_emp   =   .false. !  runoffs included into precipitation field (T) or into a file (F) 
     
    271283!              ! file name ! frequency (hours) ! variable ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    272284!              !           !  (if <0  months)  !   name   !    (logical)   !  (T/F)  ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    273    sn_apr      = 'patm'    ,         -1        , 'somslpre',    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,  ''      ,   '' 
    274 ! 
     285   sn_apr      = 'patm'    ,         -1        ,'somslpre',    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,  ''      ,   '' 
     286 
    275287   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the bulk files 
    276288   ln_ref_apr  = .false.   !  ref. pressure: global mean Patm (T) or a constant (F) 
     
    279291&namsbc_ssr    !   surface boundary condition : sea surface restoring 
    280292!----------------------------------------------------------------------- 
    281 !              !   file name  ! frequency (hours) ! variable   ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    282 !              !              !  (if <0  months)  !   name     !    (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    283    sn_sst      = 'sst_data'   ,        24         ,  'sst'     ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    284    sn_sss      = 'sss_data'   ,        -1         ,  'sss'     ,     .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    285      
     293!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     294!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     295   sn_sst      = 'sst_data'  ,        24         ,  'sst'    ,    .false.   , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     296   sn_sss      = 'sss_data'  ,        -1         ,  'sss'    ,    .true.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     297 
    286298   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
    287299   nn_sstr     =     0     !  add a retroaction term in the surface heat       flux (=1) or not (=0) 
     
    302314   rn_alphdi   =    0.72   !  (Pyane, 1972) 
    303315/ 
    304 !----------------------------------------------------------------------- 
    305 &namdta_tem    !   surface boundary condition : sea surface restoring 
    306 !----------------------------------------------------------------------- 
    307 !              !     file name                  ! frequency (hours) ! variable   ! time interpol. !  clim   !'yearly' or ! weights  ! rotation ! 
    308 !              !                                !  (if <0  months)  !   name     !    (logical)   !  (T/F)  ! 'monthly'  ! filename ! pairing  ! 
    309   sn_tem       = 'data_1m_potential_temperature_nomask',  -1        , 'votemper' ,     .true.     , .true.  , 'yearly'   , ' '      , ' ' 
    310 ! 
    311   cn_dir       = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
    312 / 
    313 !----------------------------------------------------------------------- 
    314 &namdta_sal    !   surface boundary condition : sea surface restoring 
    315 !----------------------------------------------------------------------- 
    316 !              !     file name                  ! frequency (hours) ! variable   ! time interpol. !  clim   ! 'yearly' or ! weights  ! rotation ! 
    317 !              !                                !  (if <0  months)  !   name     !    (logical)   !  (T/F)  !  'monthly'  ! filename ! pairing  ! 
    318    sn_sal      =  'data_1m_salinity_nomask'     ,         -1        , 'vosaline' ,     .true.     , .true.  , 'yearly'    , ''       , ' ' 
    319 ! 
    320    cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
    321 / 
     316 
    322317!!====================================================================== 
    323318!!               ***  Lateral boundary condition  *** 
     
    330325!!   namtide       Tidal forcing at open boundaries                     ("key_bdy_tides") 
    331326!!====================================================================== 
    332  
     327! 
    333328!----------------------------------------------------------------------- 
    334329&namlbc        !   lateral momentum boundary condition 
     
    345340&namobc        !   open boundaries parameters                           ("key_obc") 
    346341!----------------------------------------------------------------------- 
    347     ln_obc_clim= .false.   !  climatological obc data files (T) or not (F) 
    348     ln_vol_cst = .true.    !  impose the total volume conservation (T) or not (F) 
    349     ln_obc_fla = .false.   !  Flather open boundary condition  
    350     nn_obcdta  =    1      !  = 0 the obc data are equal to the initial state 
     342   ln_obc_clim = .false.   !  climatological obc data files (T) or not (F) 
     343   ln_vol_cst = .true.    !  impose the total volume conservation (T) or not (F) 
     344   ln_obc_fla = .false.   !  Flather open boundary condition  
     345   nn_obcdta   =    1      !  = 0 the obc data are equal to the initial state 
    351346                           !  = 1 the obc data are read in 'obc.dta' files 
    352     cn_obcdta  = 'annual'  !  set to annual if obc datafile hold 1 year of data 
     347   cn_obcdta   = 'annual'  !  set to annual if obc datafile hold 1 year of data 
    353348                           !  set to monthly if obc datafile hold 1 month of data 
    354     rn_dpein   =    1.     !  damping time scale for inflow at east  open boundary 
    355     rn_dpwin   =    1.     !     -           -         -       west    -      - 
    356     rn_dpnin   =    1.     !     -           -         -       north   -      - 
    357     rn_dpsin   =    1.     !     -           -         -       south   -      - 
    358     rn_dpeob   = 3000.     !  time relaxation (days) for the east  open boundary 
    359     rn_dpwob   =   15.     !     -           -         -     west    -      - 
    360     rn_dpnob   = 3000.     !     -           -         -     north   -      - 
    361     rn_dpsob   =   15.     !     -           -         -     south   -      - 
    362     rn_volemp  =  1.       !  = 0 the total volume change with the surface flux (E-P-R) 
     349   rn_dpein    =    1.     !  damping time scale for inflow at east  open boundary 
     350   rn_dpwin    =    1.     !     -           -         -       west    -      - 
     351   rn_dpnin    =    1.     !     -           -         -       north   -      - 
     352   rn_dpsin    =    1.     !     -           -         -       south   -      - 
     353   rn_dpeob    = 3000.     !  time relaxation (days) for the east  open boundary 
     354   rn_dpwob    =   15.     !     -           -         -     west    -      - 
     355   rn_dpnob    = 3000.     !     -           -         -     north   -      - 
     356   rn_dpsob    =   15.     !     -           -         -     south   -      - 
     357   rn_volemp   =  1.       !  = 0 the total volume change with the surface flux (E-P-R) 
    363358                           !  = 1 the total volume remains constant 
    364359/ 
     
    366361&namagrif      !  AGRIF zoom                                            ("key_agrif") 
    367362!----------------------------------------------------------------------- 
    368     nn_cln_update = 3      !  baroclinic update frequency 
    369     ln_spc_dyn    = .true. !  use 0 as special value for dynamics 
    370     rn_sponge_tra = 2880.  !  coefficient for tracer   sponge layer [s] 
    371     rn_sponge_dyn = 2880.  !  coefficient for dynamics sponge layer [s] 
     363   nn_cln_update = 3       !  baroclinic update frequency 
     364   ln_spc_dyn    = .true. !  use 0 as special value for dynamics 
     365   rn_sponge_tra = 2880.   !  coefficient for tracer   sponge layer [s] 
     366   rn_sponge_dyn = 2880.   !  coefficient for dynamics sponge layer [s] 
    372367/ 
    373368!----------------------------------------------------------------------- 
    374369&nambdy        !  unstructured open boundaries                          ("key_bdy") 
    375370!----------------------------------------------------------------------- 
    376     cn_mask    =  ''                        !  name of mask file (if ln_bdy_mask=.TRUE.) 
    377     cn_dta_frs_T  = 'bdydata_grid_T.nc'     !  name of data file (T-points) 
    378     cn_dta_frs_U  = 'bdydata_grid_U.nc'     !  name of data file (U-points) 
    379     cn_dta_frs_V  = 'bdydata_grid_V.nc'     !  name of data file (V-points) 
    380     cn_dta_fla_T  = 'bdydata_bt_grid_T.nc'  !  name of data file for Flather condition (T-points) 
    381     cn_dta_fla_U  = 'bdydata_bt_grid_U.nc'  !  name of data file for Flather condition (U-points) 
    382     cn_dta_fla_V  = 'bdydata_bt_grid_V.nc'  !  name of data file for Flather condition (V-points) 
    383     ln_clim    = .false.                    !  contain 1 (T) or 12 (F) time dumps and be cyclic 
    384     ln_vol     = .false                     !  total volume correction (see volbdy parameter) 
    385     ln_mask    = .false.                    !  boundary mask from filbdy_mask (T) or boundaries are on edges of domain (F) 
    386     ln_tides   = .false.                    !  Apply tidal harmonic forcing with Flather condition 
    387     ln_dyn_fla = .false.                    !  Apply Flather condition to velocities 
    388     ln_tra_frs = .false.                    !  Apply FRS condition to temperature and salinity  
    389     ln_dyn_frs = .false.                    !  Apply FRS condition to velocities 
    390     nn_rimwidth    =  9                     !  width of the relaxation zone 
    391     nn_dtactl      =  1                     !  = 0, bdy data are equal to the initial state 
    392                                             !  = 1, bdy data are read in 'bdydata   .nc' files 
    393     nn_volctl      =  0                     !  = 0, the total water flux across open boundaries is zero 
    394                                             !  = 1, the total volume of the system is conserved 
    395 / 
    396 !----------------------------------------------------------------------- 
    397 &nambdy_tide     ! tidal forcing at unstructured boundaries               
    398 !----------------------------------------------------------------------- 
    399     filtide      = 'bdytide_'           !  file name root of tidal forcing files 
    400     tide_cpt     = 'M2','S1'            !  names of tidal components used 
    401     tide_speed   = 28.984106, 15.000001 !  phase speeds of tidal components (deg/hour) 
    402     ln_tide_date = .false.              !  adjust tidal harmonics for start date of run 
     371   cn_mask       =  ''                     !  name of mask file (if ln_bdy_mask=.TRUE.) 
     372   cn_dta_frs_T  = 'bdydata_grid_T.nc'     !  name of data file (T-points) 
     373   cn_dta_frs_U  = 'bdydata_grid_U.nc'     !  name of data file (U-points) 
     374   cn_dta_frs_V  = 'bdydata_grid_V.nc'     !  name of data file (V-points) 
     375   cn_dta_fla_T  = 'bdydata_bt_grid_T.nc'  !  name of data file for Flather condition (T-points) 
     376   cn_dta_fla_U  = 'bdydata_bt_grid_U.nc'  !  name of data file for Flather condition (U-points) 
     377   cn_dta_fla_V  = 'bdydata_bt_grid_V.nc'  !  name of data file for Flather condition (V-points) 
     378 
     379   ln_clim     = .false.   !  contain 1 (T) or 12 (F) time dumps and be cyclic 
     380   ln_vol      = .false.   !  total volume correction (see volbdy parameter) 
     381   ln_mask     = .false.   !  boundary mask from filbdy_mask (T), boundaries are on edges of domain (F) 
     382   ln_tides    = .false.   !  Apply tidal harmonic forcing with Flather condition 
     383   ln_dyn_fla  = .false.   !  Apply Flather condition to velocities 
     384   ln_tra_frs  = .false.   !  Apply FRS condition to temperature and salinity  
     385   ln_dyn_frs  = .false.   !  Apply FRS condition to velocities 
     386   nn_rimwidth =  9        !  width of the relaxation zone 
     387   nn_dtactl   =  1        !  = 0, bdy data are equal to the initial state 
     388                           !  = 1, bdy data are read in 'bdydata   .nc' files 
     389   nn_volctl   =  0        !  = 0, the total water flux across open boundaries is zero 
     390                           !  = 1, the total volume of the system is conserved 
     391/ 
     392!----------------------------------------------------------------------- 
     393&nambdy_tide   !  tidal forcing at unstructured boundaries               
     394!----------------------------------------------------------------------- 
     395   filtide     = 'bdytide_'           !  file name root of tidal forcing files 
     396   tide_cpt    = 'M2','S1'            !  names of tidal components used 
     397   tide_speed  = 28.984106, 15.000001 !  phase speeds of tidal components (deg/hour) 
     398   ln_tide_date= .false.              !  adjust tidal harmonics for start date of run 
    403399/ 
    404400 
     
    410406!!   nambbl        bottom boundary layer scheme                         ("key_trabbl") 
    411407!!====================================================================== 
    412  
     408! 
    413409!----------------------------------------------------------------------- 
    414410&nambfr        !   bottom friction 
     
    439435   rn_gambbl   =  10.    !  advective bbl coefficient                 [s] 
    440436/ 
     437 
    441438!!====================================================================== 
    442439!!                        Tracer (T & S ) namelists 
     
    447444!!   namtra_dmp    T & S newtonian damping                              ("key_tradmp") 
    448445!!====================================================================== 
    449  
     446! 
    450447!----------------------------------------------------------------------- 
    451448&nameos        !   ocean physical parameters 
     
    471468&namtra_ldf    !   lateral diffusion scheme for tracer  
    472469!----------------------------------------------------------------------- 
    473                            !  Type of the operator :  
    474    ln_traldf_lap    =  .true.   !     laplacian operator        
    475    ln_traldf_bilap  =  .false.  !     bilaplacian operator      
    476                            !  Direction of action  : 
    477    ln_traldf_level  =  .false.  !     iso-level                 
    478    ln_traldf_hor    =  .false.  !     horizontal (geopotential)         (require "key_ldfslp" when ln_sco=T) 
    479    ln_traldf_iso    =  .true.   !     iso-neutral                       (require "key_ldfslp") 
    480    ln_traldf_grif   =  .false.  !     griffies skew flux formulation    (require "key_ldfslp")   ! UNDER TEST, DO NOT USE 
    481    ln_traldf_gdia   =  .false.  !     griffies operator strfn diagnostics (require "key_ldfslp") ! UNDER TEST, DO NOT USE 
    482                            !  Coefficient 
    483    rn_aht_0         =  2000.    !     horizontal eddy diffusivity for tracers [m2/s] 
    484    rn_ahtb_0        =     0.    !     background eddy diffusivity for ldf_iso [m2/s] 
    485    rn_aeiv_0        =  2000.    !     eddy induced velocity coefficient [m2/s]    (require "key_traldf_eiv") 
     470   !                       !  Type of the operator :  
     471   ln_traldf_lap    =  .true.   !  laplacian operator        
     472   ln_traldf_bilap  =  .false.  !  bilaplacian operator      
     473   !                       !  Direction of action  : 
     474   ln_traldf_level  =  .false.  !  iso-level                 
     475   ln_traldf_hor    =  .false.  !  horizontal (geopotential)            (require "key_ldfslp" when ln_sco=T) 
     476   ln_traldf_iso    =  .true.   !  iso-neutral                          (require "key_ldfslp") 
     477   ln_traldf_grif   =  .false.  !  griffies skew flux formulation       (require "key_ldfslp")  ! UNDER TEST, DO NOT USE 
     478   ln_traldf_gdia   =  .false.  !  griffies operator strfn diagnostics  (require "key_ldfslp") ! UNDER TEST, DO NOT USE 
     479   !                       !  Coefficient 
     480   rn_aht_0         =  2000.    !  horizontal eddy diffusivity for tracers [m2/s] 
     481   rn_ahtb_0        =     0.    !  background eddy diffusivity for ldf_iso [m2/s] 
     482   rn_aeiv_0        =  2000.    !  eddy induced velocity coefficient [m2/s]    (require "key_traldf_eiv") 
    486483/ 
    487484!----------------------------------------------------------------------- 
     
    499496   nn_file     =    0      !  create a damping.coeff NetCDF file (=1) or not (=0) 
    500497/ 
     498 
    501499!!====================================================================== 
    502500!!                      ***  Dynamics namelists  *** 
     
    508506!!   namdyn_ldf    lateral diffusion scheme 
    509507!!====================================================================== 
    510  
     508! 
    511509!----------------------------------------------------------------------- 
    512510&namdyn_adv    !   formulation of the momentum advection 
     
    549547&namdyn_ldf    !   lateral diffusion on momentum 
    550548!----------------------------------------------------------------------- 
    551                            !  Type of the operator :  
     549   !                       !  Type of the operator :  
    552550   ln_dynldf_lap    =  .true.   !  laplacian operator          
    553551   ln_dynldf_bilap  =  .false.  !  bilaplacian operator     
    554                            !  Direction of action  :  
     552   !                       !  Direction of action  :  
    555553   ln_dynldf_level  =  .false.  !  iso-level                
    556554   ln_dynldf_hor    =  .true.   !  horizontal (geopotential)            (require "key_ldfslp" in s-coord.) 
    557555   ln_dynldf_iso    =  .false.  !  iso-neutral                          (require "key_ldfslp") 
    558                            !  Coefficient 
     556   !                       !  Coefficient 
    559557   rn_ahm_0_lap     = 40000.    !  horizontal laplacian eddy viscosity   [m2/s] 
    560558   rn_ahmb_0        =     0.    !  background eddy viscosity for ldf_iso [m2/s] 
    561559   rn_ahm_0_blp     =     0.    !  horizontal bilaplacian eddy viscosity [m4/s]  
    562560/ 
     561 
    563562!!====================================================================== 
    564563!!             Tracers & Dynamics vertical physics namelists 
    565564!!====================================================================== 
    566 !!       namzdf        vertical physics 
    567 !!       namzdf_ric    richardson number dependent vertical mixing      ("key_zdfric"      ) 
    568 !!       namzdf_tke    TKE dependent vertical mixing                    ("key_zdftke"      ) 
    569 !!       namzdf_kpp    KPP dependent vertical mixing                    ("key_zdfkpp"      ) 
    570 !!       namzdf_ddm    double diffusive mixing parameterization         ("key_zdfddm"      ) 
    571 !!       namzdf_tmx    tidal mixing parameterization                    ("key_zdftmx"      ) 
    572 !!====================================================================== 
    573  
     565!!    namzdf        vertical physics 
     566!!    namzdf_ric    richardson number dependent vertical mixing         ("key_zdfric") 
     567!!    namzdf_tke    TKE dependent vertical mixing                       ("key_zdftke") 
     568!!    namzdf_kpp    KPP dependent vertical mixing                       ("key_zdfkpp") 
     569!!    namzdf_ddm    double diffusive mixing parameterization            ("key_zdfddm") 
     570!!    namzdf_tmx    tidal mixing parameterization                       ("key_zdftmx") 
     571!!====================================================================== 
     572! 
    574573!----------------------------------------------------------------------- 
    575574&namzdf        !   vertical physics 
     
    636635/ 
    637636!----------------------------------------------------------------------- 
    638 &namzdf_gls                !   GLS vertical diffusion  ("key_zdfgls") 
    639 !----------------------------------------------------------------------- 
    640    rn_emin        = 1.e-6  !  minimum value of e   [m2/s2] 
    641    rn_epsmin      = 1.e-12 !  minimum value of eps [m2/s3] 
    642    ln_length_lim  = .true. !  limit on the dissipation rate under stable stratification (Galperin et al., 1988) 
    643    rn_clim_galp   = 0.53   !  galperin limit 
    644    ln_crban       = .TRUE. !  Use Craig & Banner (1994) surface wave mixing parametrisation 
    645    ln_sigpsi      = .TRUE. !  Activate or not Burchard 2001 mods on psi schmidt number in the wb case 
    646    rn_crban       = 100.   !  Craig and Banner 1994 constant for wb tke flux 
    647    rn_charn       = 70000. !  Charnock constant for wb induced roughness length 
    648    nn_tkebc_surf  =   1    !  surface tke condition (0/1/2=Dir/Neum/Dir Mellor-Blumberg) 
    649    nn_tkebc_bot   =   1    !  bottom tke condition (0/1=Dir/Neum) 
    650    nn_psibc_surf  =   1    !  surface psi condition (0/1/2=Dir/Neum/Dir Mellor-Blumberg) 
    651    nn_psibc_bot   =   1    !  bottom psi condition (0/1=Dir/Neum) 
    652    nn_stab_func   =   2    !  stability function (0=Galp, 1= KC94, 2=CanutoA, 3=CanutoB) 
    653    nn_clos        =   1    !  predefined closure type (0=MY82, 1=k-eps, 2=k-w, 3=Gen) 
     637&namzdf_gls                !   GLS vertical diffusion                   ("key_zdfgls") 
     638!----------------------------------------------------------------------- 
     639   rn_emin       = 1.e-6   !  minimum value of e   [m2/s2] 
     640   rn_epsmin     = 1.e-12 !  minimum value of eps [m2/s3] 
     641   ln_length_lim = .true. !  limit on the dissipation rate under stable stratification (Galperin et al., 1988) 
     642   rn_clim_galp  = 0.53    !  galperin limit 
     643   ln_crban      = .TRUE. !  Use Craig & Banner (1994) surface wave mixing parametrisation 
     644   ln_sigpsi     = .TRUE. !  Activate or not Burchard 2001 mods on psi schmidt number in the wb case 
     645   rn_crban      = 100.    !  Craig and Banner 1994 constant for wb tke flux 
     646   rn_charn      = 70000. !  Charnock constant for wb induced roughness length 
     647   nn_tkebc_surf =   1     !  surface tke condition (0/1/2=Dir/Neum/Dir Mellor-Blumberg) 
     648   nn_tkebc_bot  =   1     !  bottom tke condition (0/1=Dir/Neum) 
     649   nn_psibc_surf =   1     !  surface psi condition (0/1/2=Dir/Neum/Dir Mellor-Blumberg) 
     650   nn_psibc_bot  =   1     !  bottom psi condition (0/1=Dir/Neum) 
     651   nn_stab_func  =   2     !  stability function (0=Galp, 1= KC94, 2=CanutoA, 3=CanutoB) 
     652   nn_clos       =   1     !  predefined closure type (0=MY82, 1=k-eps, 2=k-w, 3=Gen) 
    654653/ 
    655654!----------------------------------------------------------------------- 
     
    669668   rn_tfe_itf  = 1.        !  ITF tidal dissipation efficiency 
    670669/ 
     670 
    671671!!====================================================================== 
    672672!!                  ***  Miscelaneous namelists  *** 
     
    677677!!   namsol            elliptic solver / island / free surface  
    678678!!====================================================================== 
    679  
     679! 
    680680!----------------------------------------------------------------------- 
    681681&namsol        !   elliptic solver / island / free surface  
     
    721721 
    722722!!====================================================================== 
    723 !!                       ***  Diagnostics namelists  *** 
    724 !!====================================================================== 
     723!!                  ***  Diagnostics namelists  *** 
     724!!====================================================================== 
     725!!   namnc4       netcdf4 chunking and compression settings             ("key_netcdf4") 
    725726!!   namtrd       dynamics and/or tracer trends                         ("key_trddyn","key_trdtra","key_trdmld") 
    726 !!   namgap       level mean model-data gap                             ("key_diagap") 
    727727!!   namflo       float parameters                                      ("key_float") 
    728728!!   namptr       Poleward Transport Diagnostics 
    729 !!====================================================================== 
    730  
     729!!   namhsb       Heat and salt budgets  
     730!!====================================================================== 
     731! 
     732!----------------------------------------------------------------------- 
     733&namnc4        !   netcdf4 chunking and compression settings            ("key_netcdf4") 
     734!----------------------------------------------------------------------- 
     735   nn_nchunks_i=   4       !  number of chunks in i-dimension 
     736   nn_nchunks_j=   4       !  number of chunks in j-dimension 
     737   nn_nchunks_k=   31      !  number of chunks in k-dimension 
     738                           !  setting nn_nchunks_k = jpk will give a chunk size of 1 in the vertical which 
     739                           !  is optimal for postprocessing which works exclusively with horizontal slabs 
     740   ln_nc4zip   = .TRUE.    !  (T) use netcdf4 chunking and compression 
     741                           !  (F) ignore chunking information and produce netcdf3-compatible files 
     742/ 
    731743!----------------------------------------------------------------------- 
    732744&namtrd        !   diagnostics on dynamics and/or tracer trends         ("key_trddyn" and/or "key_trdtra") 
    733 !              !       or mixed-layer trends or barotropic vorticity    ('key_trdmld' or  "key_trdvor") 
     745!              !       or mixed-layer trends or barotropic vorticity    ("key_trdmld" or     "key_trdvor") 
    734746!----------------------------------------------------------------------- 
    735747   nn_trd      = 365       !  time step frequency dynamics and tracers trends 
     
    742754/ 
    743755!----------------------------------------------------------------------- 
    744 &namgap       !   level mean model-data gap                             ('key_diagap') 
    745 !----------------------------------------------------------------------- 
    746    nn_gap     =  15        !  time-step frequency of model-data gap computation 
    747    nn_prg     =  10        !  time-step frequency of gap print in model output 
    748 / 
    749 !----------------------------------------------------------------------- 
    750756&namflo       !   float parameters                                      ("key_float") 
    751757!----------------------------------------------------------------------- 
    752     ln_rstflo = .false.    !  float restart (T) or not (F) 
    753     nn_writefl=      75    !  frequency of writing in float output file  
    754     nn_stockfl=    5475    !  frequency of creation of the float restart file  
    755     ln_argo   = .false.    !  Argo type floats (stay at the surface each 10 days) 
    756     ln_flork4 = .false.    !  trajectories computed with a 4th order Runge-Kutta (T) 
     758   ln_rstflo = .false.    !  float restart (T) or not (F) 
     759   nn_writefl =      75    !  frequency of writing in float output file  
     760   nn_stockfl =    5475    !  frequency of creation of the float restart file  
     761   ln_argo    = .false.    !  Argo type floats (stay at the surface each 10 days) 
     762   ln_flork4 = .false.    !  trajectories computed with a 4th order Runge-Kutta (T) 
    757763                           !  or computed with Blanke' scheme (F) 
    758764/ 
     
    760766&namptr       !   Poleward Transport Diagnostic 
    761767!----------------------------------------------------------------------- 
    762    ln_diaptr  = .false.     !  Poleward heat and salt transport (T) or not (F) 
     768   ln_diaptr  = .false.    !  Poleward heat and salt transport (T) or not (F) 
    763769   ln_diaznl  = .true.     !  Add zonal means and meridional stream functions 
    764770   ln_subbas  = .true.     !  Atlantic/Pacific/Indian basins computation (T) or not  
     
    771777&namhsb       !  Heat and salt budgets  
    772778!----------------------------------------------------------------------- 
    773    ln_diahsb  = .false.     !  check the heat and salt budgets (T) or not (F) 
    774 / 
    775 !----------------------------------------------------------------------- 
    776 !       namobs    observation usage switch 
    777 !----------------------------------------------------------------------- 
    778 ! 
    779 !  ln_t3d                  Logical switch for T profile observations          
    780 !  ln_s3d                  Logical switch for S profile observations           
    781 !  ln_ena                  Logical switch for ENACT insitu data set            
    782 !  ln_cor                  Logical switch for Coriolis insitu data set        
    783 !  ln_profb                Logical switch for feedback insitu data set      
    784 !  ln_sla                  Logical switch for SLA observations                
    785 !  ln_sladt                Logical switch for AVISO SLA data               
    786 !  ln_slafb                Logical switch for feedback SLA data             
    787 !  ln_ssh                  Logical switch for SSH observations               
    788 !  ln_sst                  Logical switch for SST observations               
    789 !  ln_reysst               Logical switch for Reynolds observations        
    790 !  ln_ghrsst               Logical switch for GHRSST observations           
    791 !  ln_sstfb                Logical switch for feedback SST data           
    792 !  ln_sss                  Logical switch for SSS observations               
    793 !  ln_seaice               Logical switch for Sea Ice observations         
    794 !  ln_vel3d                Logical switch for velocity observations          
    795 !  ln_velavcur             Logical switch for velocity daily av. cur.     
    796 !  ln_velhrcur             Logical switch for velocity high freq. cur.    
    797 !  ln_velavadcp            Logical switch for velocity daily av. ADCP   
    798 !  ln_velhradcp            Logical switch for velocity high freq. ADCP 
    799 !  ln_velfb                Logical switch for feedback velocity data        
    800 !  ln_grid_global          Global distribtion of observations          
    801 !  ln_grid_search_lookup   Logical switch for obs grid search w/lookup table   
    802 !  grid_search_file        Grid search lookup file header  
    803 !  enactfiles              ENACT input observation file names  
    804 !  coriofiles              Coriolis input observation file name   
    805 !  profbfiles              Profile feedback input observation file name  
    806 !  ln_profb_enatim         Enact feedback input time setting switch     
    807 !  slafilesact             Active SLA input observation file name 
    808 !  slafilespas             Passive SLA input observation file name  
    809 !  slafbfiles              Feedback SLA input observation file name  
    810 !  sstfiles                GHRSST input observation file name        
    811 !  sstfbfiles              Feedback SST input observation file name  
    812 !  seaicefiles             Sea Ice input observation file name  
    813 !  velavcurfiles           Vel. cur. daily av. input file name   
    814 !  velhvcurfiles           Vel. cur. high freq. input file name   
    815 !  velavadcpfiles          Vel. ADCP daily av. input file name     
    816 !  velhvadcpfiles          Vel. ADCP high freq. input file name  
    817 !  velfbfiles              Vel. feedback input observation file name  
    818 !  dobsini                 Initial date in window YYYYMMDD.HHMMSS        
    819 !  dobsend                 Final date in window YYYYMMDD.HHMMSS          
    820 !  n1dint                  Type of vertical interpolation method         
    821 !  n2dint                  Type of horizontal interpolation method        
    822 !  ln_nea                  Rejection of observations near land switch     
    823 !  nmsshc                  MSSH correction scheme                          
    824 !  mdtcorr                 MDT  correction                                
    825 !  mdtcutoff               MDT cutoff for computed correction           
    826 !  ln_altbias              Logical switch for alt bias                 
    827 !  ln_ignmis               Logical switch for ignoring missing files    
    828 !  endailyavtypes          ENACT daily average types                     
    829  &namobs 
    830    ln_t3d = .false. 
    831    ln_s3d = .false. 
    832    ln_ena = .false. 
    833    ln_profb = .false. 
    834    ln_sla = .false. 
    835    ln_sladt = .false. 
    836    ln_slafb = .false. 
    837    ln_sst = .false. 
    838    ln_sstfb = .false. 
    839    nmsshc = 0 
     779   ln_diahsb  = .false.    !  check the heat and salt budgets (T) or not (F) 
     780/ 
     781 
     782!!====================================================================== 
     783!!            ***  Observation & Assimilation namelists *** 
     784!!====================================================================== 
     785!!   namobs       observation and model comparison                      ('key_diaobs') 
     786!!   nam_asminc   assimilation increments                               ('key_asminc') 
     787!!====================================================================== 
     788! 
     789!----------------------------------------------------------------------- 
     790&namobs       !  observation usage switch                               ('key_diaobs') 
     791!----------------------------------------------------------------------- 
     792   ln_t3d     = .false.    ! Logical switch for T profile observations          
     793   ln_s3d     = .false.    ! Logical switch for S profile observations           
     794   ln_ena     = .false.    ! Logical switch for ENACT insitu data set            
     795   !                       !     ln_cor                  Logical switch for Coriolis insitu data set        
     796   ln_profb   = .false.    ! Logical switch for feedback insitu data set      
     797   ln_sla     = .false.    ! Logical switch for SLA observations                
     798 
     799   ln_sladt   = .false.    ! Logical switch for AVISO SLA data               
     800 
     801   ln_slafb   = .false.    ! Logical switch for feedback SLA data             
     802                           !     ln_ssh                  Logical switch for SSH observations               
     803 
     804   ln_sst     = .false.    ! Logical switch for SST observations               
     805                           !     ln_reysst               Logical switch for Reynolds observations        
     806                           !     ln_ghrsst               Logical switch for GHRSST observations           
     807 
     808   ln_sstfb   = .false.    ! Logical switch for feedback SST data           
     809                           !     ln_sss                  Logical switch for SSS observations               
     810                           !     ln_seaice               Logical switch for Sea Ice observations         
     811                           !     ln_vel3d                Logical switch for velocity observations          
     812                           !     ln_velavcur             Logical switch for velocity daily av. cur.     
     813                           !     ln_velhrcur             Logical switch for velocity high freq. cur.    
     814                           !     ln_velavadcp            Logical switch for velocity daily av. ADCP   
     815                           !     ln_velhradcp            Logical switch for velocity high freq. ADCP 
     816                           !     ln_velfb                Logical switch for feedback velocity data        
     817                           !     ln_grid_global          Global distribtion of observations          
     818                           !     ln_grid_search_lookup   Logical switch for obs grid search w/lookup table   
     819                           !     grid_search_file        Grid search lookup file header  
     820                           !     enactfiles              ENACT input observation file names  
     821                           !     coriofiles              Coriolis input observation file name   
     822   !                       ! profbfiles: Profile feedback input observation file name  
    840823   profbfiles = 'profiles_01.nc' 
     824                           !     ln_profb_enatim         Enact feedback input time setting switch     
     825                           !     slafilesact             Active SLA input observation file name 
     826                           !     slafilespas             Passive SLA input observation file name  
     827   !                       ! slafbfiles: Feedback SLA input observation file name  
    841828   slafbfiles = 'sla_01.nc' 
     829                           !     sstfiles                GHRSST input observation file name        
     830   !                       ! sstfbfiles: Feedback SST input observation file name  
    842831   sstfbfiles = 'sst_01.nc' 'sst_02.nc' 'sst_03.nc' 'sst_04.nc' 'sst_05.nc' 
    843    ln_altbias = .false. 
     832                           !     seaicefiles             Sea Ice input observation file name  
     833                           !     velavcurfiles           Vel. cur. daily av. input file name   
     834                           !     velhvcurfiles           Vel. cur. high freq. input file name   
     835                           !     velavadcpfiles          Vel. ADCP daily av. input file name     
     836                           !     velhvadcpfiles          Vel. ADCP high freq. input file name  
     837                           !     velfbfiles              Vel. feedback input observation file name  
     838                           !     dobsini                 Initial date in window YYYYMMDD.HHMMSS        
     839                           !     dobsend                 Final date in window YYYYMMDD.HHMMSS          
     840                           !     n1dint                  Type of vertical interpolation method         
     841                           !     n2dint                  Type of horizontal interpolation method        
     842                           !     ln_nea                  Rejection of observations near land switch     
     843   nmsshc     = 0          ! MSSH correction scheme                          
     844                           !     mdtcorr                 MDT  correction                                
     845                           !     mdtcutoff               MDT cutoff for computed correction           
     846   ln_altbias = .false.    ! Logical switch for alt bias                 
     847   ln_ignmis  = .true.     ! Logical switch for ignoring missing files    
     848                           !     endailyavtypes   ENACT daily average types                     
    844849   ln_grid_global = .true. 
    845850   ln_grid_search_lookup = .false. 
    846    ln_ignmis = .true.   
    847851/  
    848852!----------------------------------------------------------------------- 
    849 !       nam_asminc    assimilation increments namelist 
    850 !----------------------------------------------------------------------- 
    851 ! ln_bkgwri   Logical switch for writing out background state  
    852 ! ln_trjwri   Logical switch for writing out state trajectory 
    853 ! ln_trainc   Logical switch for applying tracer increments 
    854 ! ln_dyninc   Logical switch for applying velocity increments 
    855 ! ln_sshinc   Logical switch for applying SSH increments  
    856 ! ln_asmdin   Logical switch for Direct Initialization (DI) 
    857 ! ln_asmiau   Logical switch for Incremental Analysis Updating (IAU) 
    858 ! nitbkg      Timestep of background in [0,nitend-nit000-1] 
    859 ! nitdin      Timestep of background for DI in [0,nitend-nit000-1] 
    860 ! nitiaustr   Timestep of start of IAU interval in [0,nitend-nit000-1] 
    861 ! nitiaufin   Timestep of end of IAU interval in [0,nitend-nit000-1] 
    862 ! niaufn      Type of IAU weighting function 
    863 ! nittrjfrq   Frequency of trajectory output for 4D-VAR 
    864 ! ln_salfix   Logical switch for ensuring that the sa > salfixmin 
    865 ! salfixmin   Minimum salinity after applying the increments 
    866 &nam_asminc 
    867     ln_bkgwri = .false. 
    868     ln_trjwri = .false. 
    869     ln_trainc = .false. 
    870     ln_dyninc = .false. 
    871     ln_sshinc = .false. 
    872     ln_asmdin = .false. 
    873     ln_asmiau = .false. 
    874     nitbkg = 0 
    875     nitdin = 0 
    876     nitiaustr = 1 
    877     nitiaufin = 15 
    878     niaufn = 0 
    879     nittrjfrq = 0 
    880     ln_salfix = .false. 
    881     salfixmin = -9999 
    882 / 
     853&nam_asminc   !   assimilation increments                               ('key_asminc') 
     854!----------------------------------------------------------------------- 
     855    ln_bkgwri = .false.    !  Logical switch for writing out background state  
     856    ln_trjwri = .false.    !  Logical switch for writing out state trajectory 
     857    ln_trainc = .false.    !  Logical switch for applying tracer increments 
     858    ln_dyninc = .false.    !  Logical switch for applying velocity increments 
     859    ln_sshinc = .false.    !  Logical switch for applying SSH increments  
     860    ln_asmdin = .false.    !  Logical switch for Direct Initialization (DI) 
     861    ln_asmiau = .false.    !  Logical switch for Incremental Analysis Updating (IAU) 
     862    nitbkg    = 0          !  Timestep of background in [0,nitend-nit000-1] 
     863    nitdin    = 0          !  Timestep of background for DI in [0,nitend-nit000-1] 
     864    nitiaustr = 1          !  Timestep of start of IAU interval in [0,nitend-nit000-1] 
     865    nitiaufin = 15         !  Timestep of end of IAU interval in [0,nitend-nit000-1] 
     866    niaufn    = 0          !  Type of IAU weighting function 
     867    nittrjfrq = 0          !  Frequency of trajectory output for 4D-VAR 
     868    ln_salfix = .false.    !  Logical switch for ensuring that the sa > salfixmin 
     869    salfixmin = -9999      !  Minimum salinity after applying the increments 
     870/ 
  • branches/nemo_v3_3_beta/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM_PISCES/EXP00/namelist

    r2399 r2417  
    11!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
    22!! NEMO/OPA  :  1 - run manager      (namrun) 
    3 !! namelists    2 - Domain           (namzgr, namzgr_sco, namdom) 
     3!! namelists    2 - Domain           (namzgr, namzgr_sco, namdom, namdta_tem, namdta_sal) 
    44!!              3 - Surface boundary (namsbc, namsbc_ana, namsbc_flx, namsbc_clio, namsbc_core 
    5 !!                                    namsbc_cpl, namqsr, namsbc_rnf, namsbc_ssr, namsbc_alb) 
     5!!                                    namsbc_cpl, namsbc_cpl_co2 namtra_qsr, namsbc_rnf,  
     6!!                                    namsbc_apr, namsbc_ssr, namsbc_alb) 
    67!!              4 - lateral boundary (namlbc, namcla, namobc, namagrif, nambdy, nambdy_tide) 
    78!!              5 - bottom  boundary (nambfr, nambbc, nambbl) 
     
    910!!              7 - dynamics         (namdyn_adv, namdyn_vor, namdyn_hpg, namdyn_spg, namdyn_ldf) 
    1011!!              8 - Verical physics  (namzdf, namzdf_ric, namzdf_tke, namzdf_kpp, namzdf_ddm, namzdf_tmx) 
    11 !!              9 - diagnostics      (namtrd, namgap, namspr, namflo, namptr) 
    12 !!              9 - miscellaneous    (namsol, nammpp, nammpp_dyndist, namctl) 
     12!!              9 - diagnostics      (namnc4, namtrd, namspr, namflo, namptr, namhsb) 
     13!!             10 - miscellaneous    (namsol, nammpp, nammpp_dyndist, namctl) 
     14!!             11 - Obs & Assim      (namobs, nam_asminc) 
    1315!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
    1416!  CAUTION: some scripts does not support CAPITALs for logical use .true./.false., not .TRUE./.FALSE. 
     
    1719!!                   ***  Run management namelists  *** 
    1820!!====================================================================== 
    19 !!   namrun            parameters of the run 
    20 !!====================================================================== 
    21  
     21!!   namrun        parameters of the run 
     22!!====================================================================== 
     23! 
    2224!----------------------------------------------------------------------- 
    2325&namrun        !   parameters of the run 
     
    4345   cn_ocerst_out = "restart"   !  suffix of ocean restart name (output) 
    4446/ 
    45 !!====================================================================== 
    46 !!   namnc4            netcdf4 chunking and compression settings 
    47 !!====================================================================== 
    48 !----------------------------------------------------------------------- 
    49 &namnc4         !  netcdf4 chunking and compression settings     ("key_netcdf4") 
    50                 !  (ignored if "key_netcdf4" is not used) 
    51 !----------------------------------------------------------------------- 
    52    nn_nchunks_i   =   4       !  number of chunks in i-dimension 
    53    nn_nchunks_j   =   4       !  number of chunks in j-dimension 
    54    nn_nchunks_k   =   31      !  number of chunks in k-dimension 
    55                               !  setting nn_nchunks_k = jpk will give a chunk size of 1 in the vertical which 
    56                               !  is optimal for postprocessing which works exclusively with horizontal slabs 
    57    ln_nc4zip      =   .TRUE.  !  (T) use netcdf4 chunking and compression 
    58                               !  (F) ignore chunking information and produce netcdf3-compatible files 
    59 / 
     47 
    6048!!====================================================================== 
    6149!!                      ***  Domain namelists  *** 
     
    6452!!   namzgr_sco   s-coordinate or hybrid z-s-coordinate 
    6553!!   namdom       space and time domain (bathymetry, mesh, timestep) 
    66 !!====================================================================== 
    67  
     54!!   namdta_tem   data: temperature                                     ("key_dtatem") 
     55!!   namdta_sal   data: salinity                                        ("key_dtasal") 
     56!!====================================================================== 
     57! 
    6858!----------------------------------------------------------------------- 
    6959&namzgr        !   vertical coordinate 
     
    10393   rn_rdth     =  800.           !  depth variation of tracer time step  (used if nacc=1) 
    10494/ 
     95!----------------------------------------------------------------------- 
     96&namdta_tem    !   data : temperature                                   ("key_dtatem") 
     97!----------------------------------------------------------------------- 
     98!              ! file name ! frequency (hours)    ! variable ! time interp. ! clim  !'yearly' or ! weights  ! rotation ! 
     99!              !           !  (if <0  months)     !   name   !  (logical)   ! (T/F) ! 'monthly'  ! filename ! pairing  ! 
     100   sn_tem = 'data_1m_potential_temperature_nomask', -1,'votemper',  .true.  , .true., 'yearly'   , ' '      , ' ' 
     101   ! 
     102   cn_dir       = './'     !  root directory for the location of the runoff files 
     103/ 
     104!----------------------------------------------------------------------- 
     105&namdta_sal    !   data : salinity                                      ("key_dtasal") 
     106!----------------------------------------------------------------------- 
     107!              ! file name ! frequency (hours)    ! variable ! time interp. ! clim  !'yearly' or ! weights  ! rotation ! 
     108!              !           !  (if <0  months)     !   name   !   (logical)  ! (T/F) ! 'monthly'  ! filename ! pairing  ! 
     109   sn_sal      =  'data_1m_salinity_nomask',  -1  ,'vosaline',    .true.    , .true., 'yearly'   , ''       , ' ' 
     110   ! 
     111   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
     112/ 
     113 
    105114!!====================================================================== 
    106115!!            ***  Surface Boundary Condition namelists  *** 
    107116!!====================================================================== 
    108 !!   namsbc        surface boundary condition 
    109 !!   namsbc_ana    analytical         formulation 
    110 !!   namsbc_flx    flux               formulation 
    111 !!   namsbc_clio   CLIO bulk formulea formulation 
    112 !!   namsbc_core   CORE bulk formulea formulation 
    113 !!   namsbc_cpl    CouPLed            formulation                       ("key_coupled") 
    114 !!   namtra_qsr    penetrative solar radiation 
    115 !!   namsbc_rnf    river runoffs 
    116 !!   namsbc_ssr    sea surface restoring term (for T and/or S) 
    117 !!   namsbc_alb    albedo parameters 
    118 !!====================================================================== 
    119  
     117!!   namsbc          surface boundary condition 
     118!!   namsbc_ana      analytical         formulation 
     119!!   namsbc_flx      flux               formulation 
     120!!   namsbc_clio     CLIO bulk formulea formulation 
     121!!   namsbc_core     CORE bulk formulea formulation 
     122!!   namsbc_cpl      CouPLed            formulation                     ("key_coupled") 
     123!!   namsbc_cpl_co2  coupled ocean/biogeo/atmosphere model              ("key_cpl_carbon_cycle") 
     124!!   namtra_qsr      penetrative solar radiation 
     125!!   namsbc_rnf      river runoffs 
     126!!   namsbc_apr      Atmospheric Pressure 
     127!!   namsbc_ssr      sea surface restoring term (for T and/or S) 
     128!!   namsbc_alb      albedo parameters 
     129!!====================================================================== 
     130! 
    120131!----------------------------------------------------------------------- 
    121132&namsbc        !   Surface Boundary Condition (surface module) 
    122133!----------------------------------------------------------------------- 
    123134   nn_fsbc     = 5         !  frequency of surface boundary condition computation  
    124                            !               (= the frequency of sea-ice model call) 
    125    ln_ana      = .false.   !  analytical formulation (T => fill namsbc_ana )  
    126    ln_flx      = .false.   !  flux formulation       (T => fill namsbc_flx ) 
    127    ln_blk_clio = .false.   !  CLIO bulk formulation  (T => fill namsbc_clio)  
    128    ln_blk_core = .true.    !  CORE bulk formulation  (T => fill namsbc_core)  
    129    ln_cpl      = .false.   !  Coupled formulation    (T => fill namsbc_cpl ) 
     135                           !     (also = the frequency of sea-ice model call) 
     136   ln_ana      = .false.   !  analytical formulation                    (T => fill namsbc_ana )  
     137   ln_flx      = .false.   !  flux formulation                          (T => fill namsbc_flx ) 
     138   ln_blk_clio = .false.   !  CLIO bulk formulation                     (T => fill namsbc_clio)  
     139   ln_blk_core = .true.    !  CORE bulk formulation                     (T => fill namsbc_core)  
     140   ln_cpl      = .false.   !  Coupled formulation                       (T => fill namsbc_cpl ) 
    130141   ln_apr_dyn  = .false.   !  Patm gradient added in ocean & ice Eqs.   (T => fill namsbc_apr ) 
    131142   nn_ice      = 2         !  =0 no ice boundary condition   , 
    132143                           !  =1 use observed ice-cover      , 
    133                            !  =2 ice-model used                             ("key_lim3" or "key_lim2) 
     144                           !  =2 ice-model used                         ("key_lim3" or "key_lim2) 
    134145   ln_dm2dc    = .false.   !  daily mean to diurnal cycle short wave (qsr) 
    135    ln_rnf      = .true.    !  runoffs (T => fill namsbc_rnf) 
    136    ln_ssr      = .true.    !  Sea Surface Restoring on T and/or S (T => fill namsbc_ssr) 
     146   ln_rnf      = .true.    !  runoffs                                   (T => fill namsbc_rnf) 
     147   ln_ssr      = .true.    !  Sea Surface Restoring on T and/or S       (T => fill namsbc_ssr) 
    137148   nn_fwb      = 3         !  FreshWater Budget: =0 unchecked  
    138                            !                     =1 global mean of e-p-r set to zero at each time step  
    139                            !                     =2 annual global mean of e-p-r set to zero 
    140                            !                     =3 global emp set to zero and spread out over erp area 
     149                           !     =1 global mean of e-p-r set to zero at each time step  
     150                           !     =2 annual global mean of e-p-r set to zero 
     151                           !     =3 global emp set to zero and spread out over erp area 
    141152/ 
    142153!----------------------------------------------------------------------- 
     
    153164&namsbc_flx    !   surface boundary condition : flux formulation 
    154165!----------------------------------------------------------------------- 
    155 !              !   file name  ! frequency (hours) !  variable  ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    156 !              !              !  (if <0  months)  !    name    !    (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    157    sn_utau     = 'utau'       ,        24         ,    'utau'  ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    158    sn_vtau     = 'vtau'       ,        24         ,    'vtau'  ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    159    sn_qtot     = 'qtot'       ,        24         ,    'qtot'  ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    160    sn_qsr      = 'qsr'        ,        24         ,    'qsr'   ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    161    sn_emp      = 'emp'        ,        24         ,    'emp'   ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    162 ! 
     166!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     167!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     168   sn_utau     = 'utau'      ,        24         , 'utau'    , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     169   sn_vtau     = 'vtau'      ,        24         , 'vtau'    , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     170   sn_qtot     = 'qtot'      ,        24         , 'qtot'    , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     171   sn_qsr      = 'qsr'       ,        24         , 'qsr'     , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     172   sn_emp      = 'emp'       ,        24         , 'emp'     , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     173 
    163174   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the flux files 
    164175/       
     
    166177&namsbc_clio   !   namsbc_clio  CLIO bulk formulea 
    167178!----------------------------------------------------------------------- 
    168 !              !   file name  ! frequency (hours) !  variable  ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    169 !              !              !  (if <0  months)  !    name    !    (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    170    sn_utau     = 'taux_1m'    ,       -1          , 'sozotaux' ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    171    sn_vtau     = 'tauy_1m'    ,       -1          , 'sometauy' ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    172    sn_wndm     = 'flx'        ,       -1          , 'socliowi' ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    173    sn_tair     = 'flx'        ,       -1          , 'socliot2' ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    174    sn_humi     = 'flx'        ,       -1          , 'socliohu' ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    175    sn_ccov     = 'flx'        ,       -1          , 'socliocl' ,    .false.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    176    sn_prec     = 'flx'        ,       -1          , 'socliopl' ,    .false.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    177 ! 
     179!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     180!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     181   sn_utau     = 'taux_1m'   ,       -1          , 'sozotaux',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     182   sn_vtau     = 'tauy_1m'   ,       -1          , 'sometauy',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     183   sn_wndm     = 'flx'       ,       -1          , 'socliowi',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     184   sn_tair     = 'flx'       ,       -1          , 'socliot2',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     185   sn_humi     = 'flx'       ,       -1          , 'socliohu',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     186   sn_ccov     = 'flx'       ,       -1          , 'socliocl',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     187   sn_prec     = 'flx'       ,       -1          , 'socliopl',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     188 
    178189   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the bulk files are 
    179190/ 
     
    181192&namsbc_core   !   namsbc_core  CORE bulk formulea 
    182193!----------------------------------------------------------------------- 
    183 !              !   file name                   ! frequency (hours) ! variable    ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    184 !              !                               !  (if <0  months)  !   name      !    (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    185    sn_wndi     = 'u_10.15JUNE2009_orca2'       ,       6           , 'U_10_MOD'  ,    .false.     , .true.  , 'yearly'  ,   ''     ,  'Uwnd' 
    186    sn_wndj     = 'v_10.15JUNE2009_orca2'       ,       6           , 'V_10_MOD'  ,    .false.     , .true.  , 'yearly'  ,   ''     ,  'Vwnd' 
    187    sn_qsr      = 'ncar_rad.15JUNE2009_orca2'   ,       24          , 'SWDN_MOD'  ,    .false.     , .true.  , 'yearly'  ,   ''     ,  '' 
    188    sn_qlw      = 'ncar_rad.15JUNE2009_orca2'   ,       24          , 'LWDN_MOD'  ,    .false.     , .true.  , 'yearly'  ,   ''     ,  '' 
    189    sn_tair     = 't_10.15JUNE2009_orca2'       ,       6           , 'T_10_MOD'  ,    .false.     , .true.  , 'yearly'  ,   ''     ,  '' 
    190    sn_humi     = 'q_10.15JUNE2009_orca2'       ,       6           , 'Q_10_MOD'  ,    .false.     , .true.  , 'yearly'  ,   ''     ,  '' 
    191    sn_prec     = 'ncar_precip.15JUNE2009_orca2',       -1          , 'PRC_MOD1'  ,    .false.     , .true.  , 'yearly'  ,   ''     ,  '' 
    192    sn_snow     = 'ncar_precip.15JUNE2009_orca2',       -1          , 'SNOW'      ,    .false.     , .true.  , 'yearly'  ,   ''     ,  '' 
    193    sn_tdif     = 'taudif_core'                 ,       24          , 'taudif'    ,    .false.     , .true.  , 'yearly'  ,   ''     ,  '' 
    194 ! 
     194!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     195!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     196   sn_wndi = 'u_10.15JUNE2009_orca2'       ,  6  , 'U_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , 'Uwnd' 
     197   sn_wndj = 'v_10.15JUNE2009_orca2'       ,  6  , 'V_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , 'Vwnd' 
     198   sn_qsr  = 'ncar_rad.15JUNE2009_orca2'   , 24  , 'SWDN_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     199   sn_qlw  = 'ncar_rad.15JUNE2009_orca2'   , 24  , 'LWDN_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     200   sn_tair = 't_10.15JUNE2009_orca2'       ,  6  , 'T_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     201   sn_humi = 'q_10.15JUNE2009_orca2'       ,  6  , 'Q_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     202   sn_prec = 'ncar_precip.15JUNE2009_orca2', -1  , 'PRC_MOD1',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     203   sn_snow = 'ncar_precip.15JUNE2009_orca2', -1  , 'SNOW'    ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     204   sn_tdif = 'taudif_core'                 , 24  , 'taudif'  ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     205 
    195206   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the bulk files 
    196207   ln_2m       = .false.   !  air temperature and humidity referenced at 2m (T) instead 10m (F) 
     
    199210/ 
    200211!----------------------------------------------------------------------- 
    201 &namsbc_cpl    !   coupled ocean/atmosphere model                        ("key_coupled") 
    202 !----------------------------------------------------------------------- 
    203                                        ! send 
    204 cn_snd_temperature= 'weighted oce and ice'  ! 'oce only' 'weighted oce and ice' 'mixed oce-ice' 
    205 cn_snd_albedo     = 'weighted ice'          ! 'none' 'weighted ice' 'mixed oce-ice' 
    206 cn_snd_thickness  = 'none'                  ! 'none' 'weighted ice and snow' 
    207 cn_snd_crt_nature = 'none'                  ! 'none' 'oce only' 'weighted oce and ice' 'mixed oce-ice' 
    208 cn_snd_crt_refere = 'spherical'             ! 'spherical' 'cartesian' 
    209 cn_snd_crt_orient = 'eastward-northward'    ! 'eastward-northward' or 'local grid' 
    210 cn_snd_crt_grid   = 'T'                     ! 'T' 
    211                                        ! receive 
    212 cn_rcv_w10m       = 'none'                  ! 'none' 'coupled' 
    213 cn_rcv_taumod     = 'coupled'               ! 'none' 'coupled' 
    214 cn_rcv_tau_nature = 'oce only'              ! 'oce only' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
    215 cn_rcv_tau_refere = 'cartesian'             ! 'spherical' 'cartesian' 
    216 cn_rcv_tau_orient = 'eastward-northward'    ! 'eastward-northward' or 'local grid' 
    217 cn_rcv_tau_grid   = 'U,V'                   ! 'T' 'U,V' 'U,V,F' 'U,V,I' 'T,F' 'T,I' 'T,U,V' 
    218 cn_rcv_dqnsdt     = 'coupled'               ! 'none' 'coupled' 
    219 cn_rcv_qsr        = 'oce and ice'           ! 'conservative' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
    220 cn_rcv_qns        = 'oce and ice'           ! 'conservative' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
    221 cn_rcv_emp        = 'conservative'          ! 'conservative' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
    222 cn_rcv_rnf        = 'coupled'               ! 'coupled' 'climato' 'mixed' 
    223 cn_rcv_cal        = 'coupled'               ! 'none' 'coupled' 
    224 / 
    225 !----------------------------------------------------------------------- 
    226 &namsbc_cpl_co2   !   coupled ocean/biogeo/atmosphere model            ("key_cpl_carbon_cycle") 
     212&namsbc_cpl    !   coupled ocean/atmosphere model                       ("key_coupled") 
     213!----------------------------------------------------------------------- 
     214!                                      ! send 
     215cn_snd_temperature= 'weighted oce and ice'  !  'oce only' 'weighted oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     216cn_snd_albedo     = 'weighted ice'          !  'none' 'weighted ice' 'mixed oce-ice' 
     217cn_snd_thickness  = 'none'                  !  'none' 'weighted ice and snow' 
     218cn_snd_crt_nature = 'none'                  !  'none' 'oce only' 'weighted oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     219cn_snd_crt_refere = 'spherical'             !  'spherical' 'cartesian' 
     220cn_snd_crt_orient = 'eastward-northward'    !  'eastward-northward' or 'local grid' 
     221cn_snd_crt_grid   = 'T'                     !  'T' 
     222!                                      ! receive 
     223cn_rcv_w10m       = 'none'                  !  'none' 'coupled' 
     224cn_rcv_taumod     = 'coupled'               !  'none' 'coupled' 
     225cn_rcv_tau_nature = 'oce only'              !  'oce only' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     226cn_rcv_tau_refere = 'cartesian'             !  'spherical' 'cartesian' 
     227cn_rcv_tau_orient = 'eastward-northward'    !  'eastward-northward' or 'local grid' 
     228cn_rcv_tau_grid   = 'U,V'                   !  'T' 'U,V' 'U,V,F' 'U,V,I' 'T,F' 'T,I' 'T,U,V' 
     229cn_rcv_dqnsdt     = 'coupled'               !  'none' 'coupled' 
     230cn_rcv_qsr        = 'oce and ice'           !  'conservative' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     231cn_rcv_qns        = 'oce and ice'           !  'conservative' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     232cn_rcv_emp        = 'conservative'          !  'conservative' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     233cn_rcv_rnf        = 'coupled'               !  'coupled' 'climato' 'mixed' 
     234cn_rcv_cal        = 'coupled'               !  'none' 'coupled' 
     235/ 
     236!----------------------------------------------------------------------- 
     237&namsbc_cpl_co2   !   coupled ocean/biogeo/atmosphere model             ("key_cpl_carbon_cycle") 
    227238!----------------------------------------------------------------------- 
    228239cn_snd_co2        = 'coupled'         ! send    :  'none' 'coupled' 
     
    232243&namtra_qsr    !   penetrative solar radiation 
    233244!----------------------------------------------------------------------- 
    234 !              !   file name  ! frequency (hours) ! variable   ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    235 !              !              !  (if <0  months)  !   name     !    (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    236    sn_chl      = 'chlorophyll',        -1         , 'CHLA'     ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     245!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     246!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     247   sn_chl      ='chlorophyll',        -1         , 'CHLA'    ,   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    237248  
    238249   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
     
    249260&namsbc_rnf    !   runoffs namelist surface boundary condition 
    250261!----------------------------------------------------------------------- 
    251 !              !   file name  ! frequency (hours) ! variable   ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    252 !              !              !  (if <0  months)  !   name     !    (logical)   !  (T/F)  ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    253    sn_rnf      = 'runoff_1m_nomask' ,  -1         , 'sorunoff' ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  , ''       , '' 
    254    sn_cnf      = 'runoff_1m_nomask' ,   0         , 'socoefr'  ,    .false.     , .true.  , 'yearly'  , ''       , '' 
    255    sn_s_rnf    = 'runoffs'          ,  24         , 'rosaline' ,    .true.      , .true.  ,   'yearly', ''       , '' 
    256    sn_t_rnf    = 'runoffs'          ,  24         , 'rotemper' ,    .true.      , .true.  ,   'yearly', ''       , '' 
    257    sn_dep_rnf  = 'runoffs'          ,   0         , 'rodepth'  ,    .false.     , .true.  ,   'yearly', ''       , '' 
     262!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     263!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     264   sn_rnf      = 'runoff_1m_nomask' ,  -1        , 'sorunoff',    .true.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     265   sn_cnf      = 'runoff_1m_nomask' ,   0        , 'socoefr' ,    .false.   , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     266   sn_s_rnf    = 'runoffs'          ,  24        , 'rosaline',    .true.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     267   sn_t_rnf    = 'runoffs'          ,  24        , 'rotemper',    .true.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     268   sn_dep_rnf  = 'runoffs'          ,   0        , 'rodepth' ,    .false.   , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     269 
    258270   cn_dir       = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
    259271   ln_rnf_emp   =   .false. !  runoffs included into precipitation field (T) or into a file (F) 
     
    271283!              ! file name ! frequency (hours) ! variable ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    272284!              !           !  (if <0  months)  !   name   !    (logical)   !  (T/F)  ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    273    sn_apr      = 'patm'    ,         -1        , 'somslpre',    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,  ''      ,   '' 
    274 ! 
     285   sn_apr      = 'patm'    ,         -1        ,'somslpre',    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,  ''      ,   '' 
     286 
    275287   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the bulk files 
    276288   ln_ref_apr  = .false.   !  ref. pressure: global mean Patm (T) or a constant (F) 
     
    279291&namsbc_ssr    !   surface boundary condition : sea surface restoring 
    280292!----------------------------------------------------------------------- 
    281 !              !   file name  ! frequency (hours) ! variable   ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    282 !              !              !  (if <0  months)  !   name     !    (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    283    sn_sst      = 'sst_data'   ,        24         ,  'sst'     ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    284    sn_sss      = 'sss_data'   ,        -1         ,  'sss'     ,     .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     293!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     294!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     295   sn_sst      = 'sst_data'  ,        24         ,  'sst'    ,    .false.   , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     296   sn_sss      = 'sss_data'  ,        -1         ,  'sss'    ,    .true.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    285297     
    286298   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
     
    302314   rn_alphdi   =    0.72   !  (Pyane, 1972) 
    303315/ 
    304 !----------------------------------------------------------------------- 
    305 &namdta_tem    !   surface boundary condition : sea surface restoring 
    306 !----------------------------------------------------------------------- 
    307 !              !     file name                  ! frequency (hours) ! variable   ! time interpol. !  clim   !'yearly' or ! weights  ! rotation ! 
    308 !              !                                !  (if <0  months)  !   name     !    (logical)   !  (T/F)  ! 'monthly'  ! filename ! pairing  ! 
    309   sn_tem       = 'data_1m_potential_temperature_nomask',  -1        , 'votemper' ,     .true.     , .true.  , 'yearly'   , ' '      , ' ' 
    310 ! 
    311   cn_dir       = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
    312 / 
    313 !----------------------------------------------------------------------- 
    314 &namdta_sal    !   surface boundary condition : sea surface restoring 
    315 !----------------------------------------------------------------------- 
    316 !              !     file name                  ! frequency (hours) ! variable   ! time interpol. !  clim   ! 'yearly' or ! weights  ! rotation ! 
    317 !              !                                !  (if <0  months)  !   name     !    (logical)   !  (T/F)  !  'monthly'  ! filename ! pairing  ! 
    318    sn_sal      =  'data_1m_salinity_nomask'     ,         -1        , 'vosaline' ,     .true.     , .true.  , 'yearly'    , ''       , ' ' 
    319 ! 
    320    cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
    321 / 
     316 
    322317!!====================================================================== 
    323318!!               ***  Lateral boundary condition  *** 
     
    330325!!   namtide       Tidal forcing at open boundaries                     ("key_bdy_tides") 
    331326!!====================================================================== 
    332  
     327! 
    333328!----------------------------------------------------------------------- 
    334329&namlbc        !   lateral momentum boundary condition 
     
    345340&namobc        !   open boundaries parameters                           ("key_obc") 
    346341!----------------------------------------------------------------------- 
    347     ln_obc_clim= .false.   !  climatological obc data files (T) or not (F) 
    348     ln_vol_cst = .true.    !  impose the total volume conservation (T) or not (F) 
    349     ln_obc_fla = .false.   !  Flather open boundary condition  
    350     nn_obcdta  =    1      !  = 0 the obc data are equal to the initial state 
     342   ln_obc_clim = .false.   !  climatological obc data files (T) or not (F) 
     343   ln_vol_cst = .true.    !  impose the total volume conservation (T) or not (F) 
     344   ln_obc_fla = .false.   !  Flather open boundary condition  
     345   nn_obcdta   =    1      !  = 0 the obc data are equal to the initial state 
    351346                           !  = 1 the obc data are read in 'obc.dta' files 
    352     cn_obcdta  = 'annual'  !  set to annual if obc datafile hold 1 year of data 
     347   cn_obcdta   = 'annual'  !  set to annual if obc datafile hold 1 year of data 
    353348                           !  set to monthly if obc datafile hold 1 month of data 
    354     rn_dpein   =    1.     !  damping time scale for inflow at east  open boundary 
    355     rn_dpwin   =    1.     !     -           -         -       west    -      - 
    356     rn_dpnin   =    1.     !     -           -         -       north   -      - 
    357     rn_dpsin   =    1.     !     -           -         -       south   -      - 
    358     rn_dpeob   = 3000.     !  time relaxation (days) for the east  open boundary 
    359     rn_dpwob   =   15.     !     -           -         -     west    -      - 
    360     rn_dpnob   = 3000.     !     -           -         -     north   -      - 
    361     rn_dpsob   =   15.     !     -           -         -     south   -      - 
    362     rn_volemp  =  1.       !  = 0 the total volume change with the surface flux (E-P-R) 
     349   rn_dpein    =    1.     !  damping time scale for inflow at east  open boundary 
     350   rn_dpwin    =    1.     !     -           -         -       west    -      - 
     351   rn_dpnin    =    1.     !     -           -         -       north   -      - 
     352   rn_dpsin    =    1.     !     -           -         -       south   -      - 
     353   rn_dpeob    = 3000.     !  time relaxation (days) for the east  open boundary 
     354   rn_dpwob    =   15.     !     -           -         -     west    -      - 
     355   rn_dpnob    = 3000.     !     -           -         -     north   -      - 
     356   rn_dpsob    =   15.     !     -           -         -     south   -      - 
     357   rn_volemp   =  1.       !  = 0 the total volume change with the surface flux (E-P-R) 
    363358                           !  = 1 the total volume remains constant 
    364359/ 
     
    366361&namagrif      !  AGRIF zoom                                            ("key_agrif") 
    367362!----------------------------------------------------------------------- 
    368     nn_cln_update = 3      !  baroclinic update frequency 
    369     ln_spc_dyn    = .true. !  use 0 as special value for dynamics 
    370     rn_sponge_tra = 2880.  !  coefficient for tracer   sponge layer [s] 
    371     rn_sponge_dyn = 2880.  !  coefficient for dynamics sponge layer [s] 
     363   nn_cln_update = 3       !  baroclinic update frequency 
     364   ln_spc_dyn    = .true. !  use 0 as special value for dynamics 
     365   rn_sponge_tra = 2880.   !  coefficient for tracer   sponge layer [s] 
     366   rn_sponge_dyn = 2880.   !  coefficient for dynamics sponge layer [s] 
    372367/ 
    373368!----------------------------------------------------------------------- 
    374369&nambdy        !  unstructured open boundaries                          ("key_bdy") 
    375370!----------------------------------------------------------------------- 
    376     cn_mask    =  ''                        !  name of mask file (if ln_bdy_mask=.TRUE.) 
    377     cn_dta_frs_T  = 'bdydata_grid_T.nc'     !  name of data file (T-points) 
    378     cn_dta_frs_U  = 'bdydata_grid_U.nc'     !  name of data file (U-points) 
    379     cn_dta_frs_V  = 'bdydata_grid_V.nc'     !  name of data file (V-points) 
    380     cn_dta_fla_T  = 'bdydata_bt_grid_T.nc'  !  name of data file for Flather condition (T-points) 
    381     cn_dta_fla_U  = 'bdydata_bt_grid_U.nc'  !  name of data file for Flather condition (U-points) 
    382     cn_dta_fla_V  = 'bdydata_bt_grid_V.nc'  !  name of data file for Flather condition (V-points) 
    383     ln_clim    = .false.                    !  contain 1 (T) or 12 (F) time dumps and be cyclic 
    384     ln_vol     = .false.                    !  total volume correction (see volbdy parameter) 
    385     ln_mask    = .false.                    !  boundary mask from filbdy_mask (T) or boundaries are on edges of domain (F) 
    386     ln_tides   = .false.                    !  Apply tidal harmonic forcing with Flather condition 
    387     ln_dyn_fla = .false.                    !  Apply Flather condition to velocities 
    388     ln_tra_frs = .false.                    !  Apply FRS condition to temperature and salinity  
    389     ln_dyn_frs = .false.                    !  Apply FRS condition to velocities 
    390     nn_rimwidth    =  9                     !  width of the relaxation zone 
    391     nn_dtactl      =  1                     !  = 0, bdy data are equal to the initial state 
    392                                             !  = 1, bdy data are read in 'bdydata   .nc' files 
    393     nn_volctl      =  0                     !  = 0, the total water flux across open boundaries is zero 
    394                                             !  = 1, the total volume of the system is conserved 
    395 / 
    396 !----------------------------------------------------------------------- 
    397 &nambdy_tide     ! tidal forcing at unstructured boundaries               
    398 !----------------------------------------------------------------------- 
    399     filtide      = 'bdytide_'           !  file name root of tidal forcing files 
    400     tide_cpt     = 'M2','S1'            !  names of tidal components used 
    401     tide_speed   = 28.984106, 15.000001 !  phase speeds of tidal components (deg/hour) 
    402     ln_tide_date = .false.              !  adjust tidal harmonics for start date of run 
     371   cn_mask       =  ''                     !  name of mask file (if ln_bdy_mask=.TRUE.) 
     372   cn_dta_frs_T  = 'bdydata_grid_T.nc'     !  name of data file (T-points) 
     373   cn_dta_frs_U  = 'bdydata_grid_U.nc'     !  name of data file (U-points) 
     374   cn_dta_frs_V  = 'bdydata_grid_V.nc'     !  name of data file (V-points) 
     375   cn_dta_fla_T  = 'bdydata_bt_grid_T.nc'  !  name of data file for Flather condition (T-points) 
     376   cn_dta_fla_U  = 'bdydata_bt_grid_U.nc'  !  name of data file for Flather condition (U-points) 
     377   cn_dta_fla_V  = 'bdydata_bt_grid_V.nc'  !  name of data file for Flather condition (V-points) 
     378 
     379   ln_clim     = .false.    !  contain 1 (T) or 12 (F) time dumps and be cyclic 
     380   ln_vol      = .false.    !  total volume correction (see volbdy parameter) 
     381   ln_mask     = .false.    !  boundary mask from filbdy_mask (T), boundaries are on edges of domain (F) 
     382   ln_tides    = .false.    !  Apply tidal harmonic forcing with Flather condition 
     383   ln_dyn_fla  = .false.    !  Apply Flather condition to velocities 
     384   ln_tra_frs  = .false.    !  Apply FRS condition to temperature and salinity  
     385   ln_dyn_frs  = .false.    !  Apply FRS condition to velocities 
     386   nn_rimwidth =  9         !  width of the relaxation zone 
     387   nn_dtactl   =  1         !  = 0, bdy data are equal to the initial state 
     388                           !  = 1, bdy data are read in 'bdydata   .nc' files 
     389   nn_volctl   =  0         !  = 0, the total water flux across open boundaries is zero 
     390                           !  = 1, the total volume of the system is conserved 
     391/ 
     392!----------------------------------------------------------------------- 
     393&nambdy_tide   !  tidal forcing at unstructured boundaries               
     394!----------------------------------------------------------------------- 
     395   filtide     = 'bdytide_'           !  file name root of tidal forcing files 
     396   tide_cpt    = 'M2','S1'            !  names of tidal components used 
     397   tide_speed  = 28.984106, 15.000001 !  phase speeds of tidal components (deg/hour) 
     398   ln_tide_date= .false.              !  adjust tidal harmonics for start date of run 
    403399/ 
    404400 
     
    410406!!   nambbl        bottom boundary layer scheme                         ("key_trabbl") 
    411407!!====================================================================== 
    412  
     408! 
    413409!----------------------------------------------------------------------- 
    414410&nambfr        !   bottom friction 
     
    439435   rn_gambbl   =  10.    !  advective bbl coefficient                 [s] 
    440436/ 
     437 
    441438!!====================================================================== 
    442439!!                        Tracer (T & S ) namelists 
     
    447444!!   namtra_dmp    T & S newtonian damping                              ("key_tradmp") 
    448445!!====================================================================== 
    449  
     446! 
    450447!----------------------------------------------------------------------- 
    451448&nameos        !   ocean physical parameters 
     
    471468&namtra_ldf    !   lateral diffusion scheme for tracer  
    472469!----------------------------------------------------------------------- 
    473                            !  Type of the operator :  
    474    ln_traldf_lap    =  .true.   !     laplacian operator        
    475    ln_traldf_bilap  =  .false.  !     bilaplacian operator      
    476                            !  Direction of action  : 
    477    ln_traldf_level  =  .false.  !     iso-level                 
    478    ln_traldf_hor    =  .false.  !     horizontal (geopotential)         (require "key_ldfslp" when ln_sco=T) 
    479    ln_traldf_iso    =  .true.   !     iso-neutral                       (require "key_ldfslp") 
    480    ln_traldf_grif   =  .false.  !     griffies skew flux formulation    (require "key_ldfslp")   ! UNDER TEST, DO NOT USE 
    481    ln_traldf_gdia   =  .false.  !     griffies operator strfn diagnostics (require "key_ldfslp") ! UNDER TEST, DO NOT USE 
    482                            !  Coefficient 
    483    rn_aht_0         =  2000.    !     horizontal eddy diffusivity for tracers [m2/s] 
    484    rn_ahtb_0        =     0.    !     background eddy diffusivity for ldf_iso [m2/s] 
    485    rn_aeiv_0        =  2000.    !     eddy induced velocity coefficient [m2/s]    (require "key_traldf_eiv") 
     470   !                       !  Type of the operator :  
     471   ln_traldf_lap    =  .true.   !  laplacian operator        
     472   ln_traldf_bilap  =  .false.  !  bilaplacian operator      
     473   !                       !  Direction of action  : 
     474   ln_traldf_level  =  .false.  !  iso-level                 
     475   ln_traldf_hor    =  .false.  !  horizontal (geopotential)            (require "key_ldfslp" when ln_sco=T) 
     476   ln_traldf_iso    =  .true.   !  iso-neutral                          (require "key_ldfslp") 
     477   ln_traldf_grif   =  .false.  !  griffies skew flux formulation       (require "key_ldfslp")  ! UNDER TEST, DO NOT USE 
     478   ln_traldf_gdia   =  .false.  !  griffies operator strfn diagnostics  (require "key_ldfslp") ! UNDER TEST, DO NOT USE 
     479   !                       !  Coefficient 
     480   rn_aht_0         =  2000.    !  horizontal eddy diffusivity for tracers [m2/s] 
     481   rn_ahtb_0        =     0.    !  background eddy diffusivity for ldf_iso [m2/s] 
     482   rn_aeiv_0        =  2000.    !  eddy induced velocity coefficient [m2/s]       (require "key_traldf_eiv") 
    486483/ 
    487484!----------------------------------------------------------------------- 
     
    499496   nn_file     =    0      !  create a damping.coeff NetCDF file (=1) or not (=0) 
    500497/ 
     498 
    501499!!====================================================================== 
    502500!!                      ***  Dynamics namelists  *** 
     
    508506!!   namdyn_ldf    lateral diffusion scheme 
    509507!!====================================================================== 
    510  
     508! 
    511509!----------------------------------------------------------------------- 
    512510&namdyn_adv    !   formulation of the momentum advection 
     
    549547&namdyn_ldf    !   lateral diffusion on momentum 
    550548!----------------------------------------------------------------------- 
    551                            !  Type of the operator :  
     549   !                       !  Type of the operator :  
    552550   ln_dynldf_lap    =  .true.   !  laplacian operator          
    553551   ln_dynldf_bilap  =  .false.  !  bilaplacian operator     
    554                            !  Direction of action  :  
     552   !                       !  Direction of action  :  
    555553   ln_dynldf_level  =  .false.  !  iso-level                
    556554   ln_dynldf_hor    =  .true.   !  horizontal (geopotential)            (require "key_ldfslp" in s-coord.) 
    557555   ln_dynldf_iso    =  .false.  !  iso-neutral                          (require "key_ldfslp") 
    558                            !  Coefficient 
     556   !                       !  Coefficient 
    559557   rn_ahm_0_lap     = 40000.    !  horizontal laplacian eddy viscosity   [m2/s] 
    560558   rn_ahmb_0        =     0.    !  background eddy viscosity for ldf_iso [m2/s] 
    561559   rn_ahm_0_blp     =     0.    !  horizontal bilaplacian eddy viscosity [m4/s]  
    562560/ 
     561 
    563562!!====================================================================== 
    564563!!             Tracers & Dynamics vertical physics namelists 
    565564!!====================================================================== 
    566 !!       namzdf        vertical physics 
    567 !!       namzdf_ric    richardson number dependent vertical mixing      ("key_zdfric"      ) 
    568 !!       namzdf_tke    TKE dependent vertical mixing                    ("key_zdftke"      ) 
    569 !!       namzdf_kpp    KPP dependent vertical mixing                    ("key_zdfkpp"      ) 
    570 !!       namzdf_ddm    double diffusive mixing parameterization         ("key_zdfddm"      ) 
    571 !!       namzdf_tmx    tidal mixing parameterization                    ("key_zdftmx"      ) 
    572 !!====================================================================== 
    573  
     565!!    namzdf        vertical physics 
     566!!    namzdf_ric    richardson number dependent vertical mixing         ("key_zdfric") 
     567!!    namzdf_tke    TKE dependent vertical mixing                       ("key_zdftke") 
     568!!    namzdf_kpp    KPP dependent vertical mixing                       ("key_zdfkpp") 
     569!!    namzdf_ddm    double diffusive mixing parameterization            ("key_zdfddm") 
     570!!    namzdf_tmx    tidal mixing parameterization                       ("key_zdftmx") 
     571!!====================================================================== 
     572! 
    574573!----------------------------------------------------------------------- 
    575574&namzdf        !   vertical physics 
     
    636635/ 
    637636!----------------------------------------------------------------------- 
    638 &namzdf_gls                !   GLS vertical diffusion  ("key_zdfgls") 
    639 !----------------------------------------------------------------------- 
    640    rn_emin        = 1.e-6  !  minimum value of e   [m2/s2] 
    641    rn_epsmin      = 1.e-12 !  minimum value of eps [m2/s3] 
    642    ln_length_lim  = .true. !  limit on the dissipation rate under stable stratification (Galperin et al., 1988) 
    643    rn_clim_galp   = 0.53   !  galperin limit 
    644    ln_crban       = .TRUE. !  Use Craig & Banner (1994) surface wave mixing parametrisation 
    645    ln_sigpsi      = .TRUE. !  Activate or not Burchard 2001 mods on psi schmidt number in the wb case 
    646    rn_crban       = 100.   !  Craig and Banner 1994 constant for wb tke flux 
    647    rn_charn       = 70000. !  Charnock constant for wb induced roughness length 
    648    nn_tkebc_surf  =   1    !  surface tke condition (0/1/2=Dir/Neum/Dir Mellor-Blumberg) 
    649    nn_tkebc_bot   =   1    !  bottom tke condition (0/1=Dir/Neum) 
    650    nn_psibc_surf  =   1    !  surface psi condition (0/1/2=Dir/Neum/Dir Mellor-Blumberg) 
    651    nn_psibc_bot   =   1    !  bottom psi condition (0/1=Dir/Neum) 
    652    nn_stab_func   =   2    !  stability function (0=Galp, 1= KC94, 2=CanutoA, 3=CanutoB) 
    653    nn_clos        =   1    !  predefined closure type (0=MY82, 1=k-eps, 2=k-w, 3=Gen) 
     637&namzdf_gls                !   GLS vertical diffusion                   ("key_zdfgls") 
     638!----------------------------------------------------------------------- 
     639   rn_emin       = 1.e-6   !  minimum value of e   [m2/s2] 
     640   rn_epsmin     = 1.e-12 !  minimum value of eps [m2/s3] 
     641   ln_length_lim = .true. !  limit on the dissipation rate under stable stratification (Galperin et al., 1988) 
     642   rn_clim_galp  = 0.53    !  galperin limit 
     643   ln_crban      = .TRUE. !  Use Craig & Banner (1994) surface wave mixing parametrisation 
     644   ln_sigpsi     = .TRUE. !  Activate or not Burchard 2001 mods on psi schmidt number in the wb case 
     645   rn_crban      = 100.    !  Craig and Banner 1994 constant for wb tke flux 
     646   rn_charn      = 70000. !  Charnock constant for wb induced roughness length 
     647   nn_tkebc_surf =   1     !  surface tke condition (0/1/2=Dir/Neum/Dir Mellor-Blumberg) 
     648   nn_tkebc_bot  =   1     !  bottom tke condition (0/1=Dir/Neum) 
     649   nn_psibc_surf =   1     !  surface psi condition (0/1/2=Dir/Neum/Dir Mellor-Blumberg) 
     650   nn_psibc_bot  =   1     !  bottom psi condition (0/1=Dir/Neum) 
     651   nn_stab_func  =   2     !  stability function (0=Galp, 1= KC94, 2=CanutoA, 3=CanutoB) 
     652   nn_clos       =   1     !  predefined closure type (0=MY82, 1=k-eps, 2=k-w, 3=Gen) 
    654653/ 
    655654!----------------------------------------------------------------------- 
     
    669668   rn_tfe_itf  = 1.        !  ITF tidal dissipation efficiency 
    670669/ 
     670 
    671671!!====================================================================== 
    672672!!                  ***  Miscelaneous namelists  *** 
     
    677677!!   namsol            elliptic solver / island / free surface  
    678678!!====================================================================== 
    679  
     679! 
    680680!----------------------------------------------------------------------- 
    681681&namsol        !   elliptic solver / island / free surface  
     
    721721 
    722722!!====================================================================== 
    723 !!                       ***  Diagnostics namelists  *** 
    724 !!====================================================================== 
     723!!                  ***  Diagnostics namelists  *** 
     724!!====================================================================== 
     725!!   namnc4       netcdf4 chunking and compression settings             ("key_netcdf4") 
    725726!!   namtrd       dynamics and/or tracer trends                         ("key_trddyn","key_trdtra","key_trdmld") 
    726 !!   namgap       level mean model-data gap                             ("key_diagap") 
    727727!!   namflo       float parameters                                      ("key_float") 
    728728!!   namptr       Poleward Transport Diagnostics 
    729 !!====================================================================== 
    730  
     729!!   namhsb       Heat and salt budgets  
     730!!====================================================================== 
     731! 
     732!----------------------------------------------------------------------- 
     733&namnc4        !   netcdf4 chunking and compression settings            ("key_netcdf4") 
     734!----------------------------------------------------------------------- 
     735   nn_nchunks_i=   4       !  number of chunks in i-dimension 
     736   nn_nchunks_j=   4       !  number of chunks in j-dimension 
     737   nn_nchunks_k=   31      !  number of chunks in k-dimension 
     738                           !  setting nn_nchunks_k = jpk will give a chunk size of 1 in the vertical which 
     739                           !  is optimal for postprocessing which works exclusively with horizontal slabs 
     740   ln_nc4zip   = .TRUE.    !  (T) use netcdf4 chunking and compression 
     741                           !  (F) ignore chunking information and produce netcdf3-compatible files 
     742/ 
    731743!----------------------------------------------------------------------- 
    732744&namtrd        !   diagnostics on dynamics and/or tracer trends         ("key_trddyn" and/or "key_trdtra") 
     
    742754/ 
    743755!----------------------------------------------------------------------- 
    744 &namgap       !   level mean model-data gap                             ('key_diagap') 
    745 !----------------------------------------------------------------------- 
    746    nn_gap     =  15        !  time-step frequency of model-data gap computation 
    747    nn_prg     =  10        !  time-step frequency of gap print in model output 
    748 / 
    749 !----------------------------------------------------------------------- 
    750756&namflo       !   float parameters                                      ("key_float") 
    751757!----------------------------------------------------------------------- 
    752     ln_rstflo = .false.    !  float restart (T) or not (F) 
    753     nn_writefl=      75    !  frequency of writing in float output file  
    754     nn_stockfl=    5475    !  frequency of creation of the float restart file  
    755     ln_argo   = .false.    !  Argo type floats (stay at the surface each 10 days) 
    756     ln_flork4 = .false.    !  trajectories computed with a 4th order Runge-Kutta (T) 
     758   ln_rstflo = .false.    !  float restart (T) or not (F) 
     759   nn_writefl =      75    !  frequency of writing in float output file  
     760   nn_stockfl =    5475    !  frequency of creation of the float restart file  
     761   ln_argo    = .false.    !  Argo type floats (stay at the surface each 10 days) 
     762   ln_flork4 = .false.    !  trajectories computed with a 4th order Runge-Kutta (T) 
    757763                           !  or computed with Blanke' scheme (F) 
    758764/ 
     
    760766&namptr       !   Poleward Transport Diagnostic 
    761767!----------------------------------------------------------------------- 
    762    ln_diaptr  = .false.     !  Poleward heat and salt transport (T) or not (F) 
     768   ln_diaptr  = .false.    !  Poleward heat and salt transport (T) or not (F) 
    763769   ln_diaznl  = .true.     !  Add zonal means and meridional stream functions 
    764770   ln_subbas  = .true.     !  Atlantic/Pacific/Indian basins computation (T) or not  
     
    771777&namhsb       !  Heat and salt budgets  
    772778!----------------------------------------------------------------------- 
    773    ln_diahsb  = .false.     !  check the heat and salt budgets (T) or not (F) 
    774 / 
    775 !----------------------------------------------------------------------- 
    776 !       namobs    observation usage switch 
    777 !----------------------------------------------------------------------- 
    778 ! 
    779 !  ln_t3d                  Logical switch for T profile observations          
    780 !  ln_s3d                  Logical switch for S profile observations           
    781 !  ln_ena                  Logical switch for ENACT insitu data set            
    782 !  ln_cor                  Logical switch for Coriolis insitu data set        
    783 !  ln_profb                Logical switch for feedback insitu data set      
    784 !  ln_sla                  Logical switch for SLA observations                
    785 !  ln_sladt                Logical switch for AVISO SLA data               
    786 !  ln_slafb                Logical switch for feedback SLA data             
    787 !  ln_ssh                  Logical switch for SSH observations               
    788 !  ln_sst                  Logical switch for SST observations               
    789 !  ln_reysst               Logical switch for Reynolds observations        
    790 !  ln_ghrsst               Logical switch for GHRSST observations           
    791 !  ln_sstfb                Logical switch for feedback SST data           
    792 !  ln_sss                  Logical switch for SSS observations               
    793 !  ln_seaice               Logical switch for Sea Ice observations         
    794 !  ln_vel3d                Logical switch for velocity observations          
    795 !  ln_velavcur             Logical switch for velocity daily av. cur.     
    796 !  ln_velhrcur             Logical switch for velocity high freq. cur.    
    797 !  ln_velavadcp            Logical switch for velocity daily av. ADCP   
    798 !  ln_velhradcp            Logical switch for velocity high freq. ADCP 
    799 !  ln_velfb                Logical switch for feedback velocity data        
    800 !  ln_grid_global          Global distribtion of observations          
    801 !  ln_grid_search_lookup   Logical switch for obs grid search w/lookup table   
    802 !  grid_search_file        Grid search lookup file header  
    803 !  enactfiles              ENACT input observation file names  
    804 !  coriofiles              Coriolis input observation file name   
    805 !  profbfiles              Profile feedback input observation file name  
    806 !  ln_profb_enatim         Enact feedback input time setting switch     
    807 !  slafilesact             Active SLA input observation file name 
    808 !  slafilespas             Passive SLA input observation file name  
    809 !  slafbfiles              Feedback SLA input observation file name  
    810 !  sstfiles                GHRSST input observation file name        
    811 !  sstfbfiles              Feedback SST input observation file name  
    812 !  seaicefiles             Sea Ice input observation file name  
    813 !  velavcurfiles           Vel. cur. daily av. input file name   
    814 !  velhvcurfiles           Vel. cur. high freq. input file name   
    815 !  velavadcpfiles          Vel. ADCP daily av. input file name     
    816 !  velhvadcpfiles          Vel. ADCP high freq. input file name  
    817 !  velfbfiles              Vel. feedback input observation file name  
    818 !  dobsini                 Initial date in window YYYYMMDD.HHMMSS        
    819 !  dobsend                 Final date in window YYYYMMDD.HHMMSS          
    820 !  n1dint                  Type of vertical interpolation method         
    821 !  n2dint                  Type of horizontal interpolation method        
    822 !  ln_nea                  Rejection of observations near land switch     
    823 !  nmsshc                  MSSH correction scheme                          
    824 !  mdtcorr                 MDT  correction                                
    825 !  mdtcutoff               MDT cutoff for computed correction           
    826 !  ln_altbias              Logical switch for alt bias                 
    827 !  ln_ignmis               Logical switch for ignoring missing files    
    828 !  endailyavtypes          ENACT daily average types                     
    829  &namobs 
    830    ln_t3d = .false. 
    831    ln_s3d = .false. 
    832    ln_ena = .false. 
    833    ln_profb = .false. 
    834    ln_sla = .false. 
    835    ln_sladt = .false. 
    836    ln_slafb = .false. 
    837    ln_sst = .false. 
    838    ln_sstfb = .false. 
    839    nmsshc = 0 
     779   ln_diahsb  = .false.    !  check the heat and salt budgets (T) or not (F) 
     780/ 
     781 
     782!!====================================================================== 
     783!!            ***  Observation & Assimilation namelists *** 
     784!!====================================================================== 
     785!!   namobs       observation and model comparison                      ('key_diaobs') 
     786!!   nam_asminc   assimilation increments                               ('key_asminc') 
     787!!====================================================================== 
     788! 
     789!----------------------------------------------------------------------- 
     790&namobs       !  observation usage switch                               ('key_diaobs') 
     791!----------------------------------------------------------------------- 
     792   ln_t3d     = .false.    ! Logical switch for T profile observations          
     793   ln_s3d     = .false.    ! Logical switch for S profile observations           
     794   ln_ena     = .false.    ! Logical switch for ENACT insitu data set            
     795   !                       !     ln_cor                  Logical switch for Coriolis insitu data set        
     796   ln_profb   = .false.    ! Logical switch for feedback insitu data set      
     797   ln_sla     = .false.    ! Logical switch for SLA observations                
     798 
     799   ln_sladt   = .false.    ! Logical switch for AVISO SLA data               
     800 
     801   ln_slafb   = .false.    ! Logical switch for feedback SLA data             
     802                           !     ln_ssh                  Logical switch for SSH observations               
     803 
     804   ln_sst     = .false.    ! Logical switch for SST observations               
     805                           !     ln_reysst               Logical switch for Reynolds observations        
     806                           !     ln_ghrsst               Logical switch for GHRSST observations           
     807 
     808   ln_sstfb   = .false.    ! Logical switch for feedback SST data           
     809                           !     ln_sss                  Logical switch for SSS observations               
     810                           !     ln_seaice               Logical switch for Sea Ice observations         
     811                           !     ln_vel3d                Logical switch for velocity observations          
     812                           !     ln_velavcur             Logical switch for velocity daily av. cur.     
     813                           !     ln_velhrcur             Logical switch for velocity high freq. cur.    
     814                           !     ln_velavadcp            Logical switch for velocity daily av. ADCP   
     815                           !     ln_velhradcp            Logical switch for velocity high freq. ADCP 
     816                           !     ln_velfb                Logical switch for feedback velocity data        
     817                           !     ln_grid_global          Global distribtion of observations          
     818                           !     ln_grid_search_lookup   Logical switch for obs grid search w/lookup table   
     819                           !     grid_search_file        Grid search lookup file header  
     820                           !     enactfiles              ENACT input observation file names  
     821                           !     coriofiles              Coriolis input observation file name   
     822   !                       ! profbfiles: Profile feedback input observation file name  
    840823   profbfiles = 'profiles_01.nc' 
     824                           !     ln_profb_enatim         Enact feedback input time setting switch     
     825                           !     slafilesact             Active SLA input observation file name 
     826                           !     slafilespas             Passive SLA input observation file name  
     827   !                       ! slafbfiles: Feedback SLA input observation file name  
    841828   slafbfiles = 'sla_01.nc' 
     829                           !     sstfiles                GHRSST input observation file name        
     830   !                       ! sstfbfiles: Feedback SST input observation file name  
    842831   sstfbfiles = 'sst_01.nc' 'sst_02.nc' 'sst_03.nc' 'sst_04.nc' 'sst_05.nc' 
    843    ln_altbias = .false. 
     832                           !     seaicefiles             Sea Ice input observation file name  
     833                           !     velavcurfiles           Vel. cur. daily av. input file name   
     834                           !     velhvcurfiles           Vel. cur. high freq. input file name   
     835                           !     velavadcpfiles          Vel. ADCP daily av. input file name     
     836                           !     velhvadcpfiles          Vel. ADCP high freq. input file name  
     837                           !     velfbfiles              Vel. feedback input observation file name  
     838                           !     dobsini                 Initial date in window YYYYMMDD.HHMMSS        
     839                           !     dobsend                 Final date in window YYYYMMDD.HHMMSS          
     840                           !     n1dint                  Type of vertical interpolation method         
     841                           !     n2dint                  Type of horizontal interpolation method        
     842                           !     ln_nea                  Rejection of observations near land switch     
     843   nmsshc     = 0          ! MSSH correction scheme                          
     844                           !     mdtcorr                 MDT  correction                                
     845                           !     mdtcutoff               MDT cutoff for computed correction           
     846   ln_altbias = .false.    ! Logical switch for alt bias                 
     847   ln_ignmis  = .true.     ! Logical switch for ignoring missing files    
     848                           !     endailyavtypes   ENACT daily average types                     
    844849   ln_grid_global = .true. 
    845850   ln_grid_search_lookup = .false. 
    846    ln_ignmis = .true.   
    847851/  
    848852!----------------------------------------------------------------------- 
    849 !       nam_asminc    assimilation increments namelist 
    850 !----------------------------------------------------------------------- 
    851 ! ln_bkgwri   Logical switch for writing out background state  
    852 ! ln_trjwri   Logical switch for writing out state trajectory 
    853 ! ln_trainc   Logical switch for applying tracer increments 
    854 ! ln_dyninc   Logical switch for applying velocity increments 
    855 ! ln_sshinc   Logical switch for applying SSH increments  
    856 ! ln_asmdin   Logical switch for Direct Initialization (DI) 
    857 ! ln_asmiau   Logical switch for Incremental Analysis Updating (IAU) 
    858 ! nitbkg      Timestep of background in [0,nitend-nit000-1] 
    859 ! nitdin      Timestep of background for DI in [0,nitend-nit000-1] 
    860 ! nitiaustr   Timestep of start of IAU interval in [0,nitend-nit000-1] 
    861 ! nitiaufin   Timestep of end of IAU interval in [0,nitend-nit000-1] 
    862 ! niaufn      Type of IAU weighting function 
    863 ! nittrjfrq   Frequency of trajectory output for 4D-VAR 
    864 ! ln_salfix   Logical switch for ensuring that the sa > salfixmin 
    865 ! salfixmin   Minimum salinity after applying the increments 
    866 &nam_asminc 
    867     ln_bkgwri = .false. 
    868     ln_trjwri = .false. 
    869     ln_trainc = .false. 
    870     ln_dyninc = .false. 
    871     ln_sshinc = .false. 
    872     ln_asmdin = .false. 
    873     ln_asmiau = .false. 
    874     nitbkg = 0 
    875     nitdin = 0 
    876     nitiaustr = 1 
    877     nitiaufin = 15 
    878     niaufn = 0 
    879     nittrjfrq = 0 
    880     ln_salfix = .false. 
    881     salfixmin = -9999 
    882 / 
     853&nam_asminc   !   assimilation increments                               ('key_asminc') 
     854!----------------------------------------------------------------------- 
     855    ln_bkgwri = .false.    !  Logical switch for writing out background state  
     856    ln_trjwri = .false.    !  Logical switch for writing out state trajectory 
     857    ln_trainc = .false.    !  Logical switch for applying tracer increments 
     858    ln_dyninc = .false.    !  Logical switch for applying velocity increments 
     859    ln_sshinc = .false.    !  Logical switch for applying SSH increments  
     860    ln_asmdin = .false.    !  Logical switch for Direct Initialization (DI) 
     861    ln_asmiau = .false.    !  Logical switch for Incremental Analysis Updating (IAU) 
     862    nitbkg    = 0          !  Timestep of background in [0,nitend-nit000-1] 
     863    nitdin    = 0          !  Timestep of background for DI in [0,nitend-nit000-1] 
     864    nitiaustr = 1          !  Timestep of start of IAU interval in [0,nitend-nit000-1] 
     865    nitiaufin = 15         !  Timestep of end of IAU interval in [0,nitend-nit000-1] 
     866    niaufn    = 0          !  Type of IAU weighting function 
     867    nittrjfrq = 0          !  Frequency of trajectory output for 4D-VAR 
     868    ln_salfix = .false.    !  Logical switch for ensuring that the sa > salfixmin 
     869    salfixmin = -9999      !  Minimum salinity after applying the increments 
     870/ 
  • branches/nemo_v3_3_beta/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_OFF_PISCES/EXP00/namelist

    r2399 r2417  
    11!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
    22!! NEMO/OPA  :  1 - run manager      (namrun) 
    3 !! namelists    2 - Domain           (namzgr, namzgr_sco, namdom) 
     3!! namelists    2 - Domain           (namzgr, namzgr_sco, namdom, namdta_tem, namdta_sal) 
    44!!              3 - Surface boundary (namsbc, namsbc_ana, namsbc_flx, namsbc_clio, namsbc_core 
    5 !!                                    namsbc_cpl, namqsr, namsbc_rnf, namsbc_ssr, namsbc_alb) 
     5!!                                    namsbc_cpl, namsbc_cpl_co2 namtra_qsr, namsbc_rnf,  
     6!!                                    namsbc_apr, namsbc_ssr, namsbc_alb) 
    67!!              4 - lateral boundary (namlbc, namcla, namobc, namagrif, nambdy, nambdy_tide) 
    78!!              5 - bottom  boundary (nambfr, nambbc, nambbl) 
     
    910!!              7 - dynamics         (namdyn_adv, namdyn_vor, namdyn_hpg, namdyn_spg, namdyn_ldf) 
    1011!!              8 - Verical physics  (namzdf, namzdf_ric, namzdf_tke, namzdf_kpp, namzdf_ddm, namzdf_tmx) 
    11 !!              9 - diagnostics      (namtrd, namgap, namspr, namflo, namptr) 
    12 !!              9 - miscellaneous    (namsol, nammpp, nammpp_dyndist, namctl) 
     12!!              9 - diagnostics      (namnc4, namtrd, namspr, namflo, namptr, namhsb) 
     13!!             10 - miscellaneous    (namsol, nammpp, nammpp_dyndist, namctl) 
     14!!             11 - Obs & Assim      (namobs, nam_asminc) 
    1315!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
    1416!  CAUTION: some scripts does not support CAPITALs for logical use .true./.false., not .TRUE./.FALSE. 
     
    1719!!                   ***  Run management namelists  *** 
    1820!!====================================================================== 
    19 !!   namrun            parameters of the run 
    20 !!====================================================================== 
    21  
     21!!   namrun        parameters of the run 
     22!!====================================================================== 
     23! 
    2224!----------------------------------------------------------------------- 
    2325&namrun        !   parameters of the run 
     
    4345   cn_ocerst_out = "restart"   !  suffix of ocean restart name (output) 
    4446/ 
    45 !!====================================================================== 
    46 !!   namnc4            netcdf4 chunking and compression settings 
    47 !!====================================================================== 
    48 !----------------------------------------------------------------------- 
    49 &namnc4         !  netcdf4 chunking and compression settings     ("key_netcdf4") 
    50                 !  (ignored if "key_netcdf4" is not used) 
    51 !----------------------------------------------------------------------- 
    52    nn_nchunks_i   =   4       !  number of chunks in i-dimension 
    53    nn_nchunks_j   =   4       !  number of chunks in j-dimension 
    54    nn_nchunks_k   =   31      !  number of chunks in k-dimension 
    55                               !  setting nn_nchunks_k = jpk will give a chunk size of 1 in the vertical which 
    56                               !  is optimal for postprocessing which works exclusively with horizontal slabs 
    57    ln_nc4zip      =   .TRUE.  !  (T) use netcdf4 chunking and compression 
    58                               !  (F) ignore chunking information and produce netcdf3-compatible files 
    59 / 
     47 
    6048!!====================================================================== 
    6149!!                      ***  Domain namelists  *** 
     
    6452!!   namzgr_sco   s-coordinate or hybrid z-s-coordinate 
    6553!!   namdom       space and time domain (bathymetry, mesh, timestep) 
    66 !!====================================================================== 
    67  
     54!!   namdta_tem   data: temperature                                     ("key_dtatem") 
     55!!   namdta_sal   data: salinity                                        ("key_dtasal") 
     56!!====================================================================== 
     57! 
    6858!----------------------------------------------------------------------- 
    6959&namzgr        !   vertical coordinate 
     
    10393   rn_rdth     =  800.           !  depth variation of tracer time step  (used if nacc=1) 
    10494/ 
     95!----------------------------------------------------------------------- 
     96&namdta_tem    !   data : temperature                                   ("key_dtatem") 
     97!----------------------------------------------------------------------- 
     98!              ! file name ! frequency (hours)    ! variable ! time interp. ! clim  !'yearly' or ! weights  ! rotation ! 
     99!              !           !  (if <0  months)     !   name   !  (logical)   ! (T/F) ! 'monthly'  ! filename ! pairing  ! 
     100   sn_tem = 'data_1m_potential_temperature_nomask', -1,'votemper',  .true.  , .true., 'yearly'   , ' '      , ' ' 
     101   ! 
     102   cn_dir       = './'     !  root directory for the location of the runoff files 
     103/ 
     104!----------------------------------------------------------------------- 
     105&namdta_sal    !   data : salinity                                      ("key_dtasal") 
     106!----------------------------------------------------------------------- 
     107!              ! file name ! frequency (hours)    ! variable ! time interp. ! clim  !'yearly' or ! weights  ! rotation ! 
     108!              !           !  (if <0  months)     !   name   !   (logical)  ! (T/F) ! 'monthly'  ! filename ! pairing  ! 
     109   sn_sal      =  'data_1m_salinity_nomask',  -1  ,'vosaline',    .true.    , .true., 'yearly'   , ''       , ' ' 
     110   ! 
     111   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
     112/ 
     113 
    105114!!====================================================================== 
    106115!!            ***  Surface Boundary Condition namelists  *** 
    107116!!====================================================================== 
    108 !!   namsbc        surface boundary condition 
    109 !!   namsbc_ana    analytical         formulation 
    110 !!   namsbc_flx    flux               formulation 
    111 !!   namsbc_clio   CLIO bulk formulea formulation 
    112 !!   namsbc_core   CORE bulk formulea formulation 
    113 !!   namsbc_cpl    CouPLed            formulation                       ("key_coupled") 
    114 !!   namtra_qsr    penetrative solar radiation 
    115 !!   namsbc_rnf    river runoffs 
    116 !!   namsbc_ssr    sea surface restoring term (for T and/or S) 
    117 !!   namsbc_alb    albedo parameters 
    118 !!====================================================================== 
    119  
     117!!   namsbc          surface boundary condition 
     118!!   namsbc_ana      analytical         formulation 
     119!!   namsbc_flx      flux               formulation 
     120!!   namsbc_clio     CLIO bulk formulea formulation 
     121!!   namsbc_core     CORE bulk formulea formulation 
     122!!   namsbc_cpl      CouPLed            formulation                     ("key_coupled") 
     123!!   namsbc_cpl_co2  coupled ocean/biogeo/atmosphere model              ("key_cpl_carbon_cycle") 
     124!!   namtra_qsr      penetrative solar radiation 
     125!!   namsbc_rnf      river runoffs 
     126!!   namsbc_apr      Atmospheric Pressure 
     127!!   namsbc_ssr      sea surface restoring term (for T and/or S) 
     128!!   namsbc_alb      albedo parameters 
     129!!====================================================================== 
     130! 
    120131!----------------------------------------------------------------------- 
    121132&namsbc        !   Surface Boundary Condition (surface module) 
    122133!----------------------------------------------------------------------- 
    123134   nn_fsbc     = 5         !  frequency of surface boundary condition computation  
    124                            !               (= the frequency of sea-ice model call) 
    125    ln_ana      = .false.   !  analytical formulation (T => fill namsbc_ana )  
    126    ln_flx      = .false.   !  flux formulation       (T => fill namsbc_flx ) 
    127    ln_blk_clio = .true.    !  CLIO bulk formulation  (T => fill namsbc_clio)  
    128    ln_blk_core = .false.   !  CORE bulk formulation  (T => fill namsbc_core)  
    129    ln_cpl      = .false.   !  Coupled formulation    (T => fill namsbc_cpl ) 
     135                           !     (also = the frequency of sea-ice model call) 
     136   ln_ana      = .false.   !  analytical formulation                    (T => fill namsbc_ana )  
     137   ln_flx      = .false.   !  flux formulation                          (T => fill namsbc_flx ) 
     138   ln_blk_clio = .false.   !  CLIO bulk formulation                     (T => fill namsbc_clio)  
     139   ln_blk_core = .true.    !  CORE bulk formulation                     (T => fill namsbc_core)  
     140   ln_cpl      = .false.   !  Coupled formulation                       (T => fill namsbc_cpl ) 
     141   ln_apr_dyn  = .false.   !  Patm gradient added in ocean & ice Eqs.   (T => fill namsbc_apr ) 
    130142   nn_ice      = 2         !  =0 no ice boundary condition   , 
    131143                           !  =1 use observed ice-cover      , 
    132                            !  =2 ice-model used                             ("key_lim3" or "key_lim2) 
     144                           !  =2 ice-model used                         ("key_lim3" or "key_lim2) 
    133145   ln_dm2dc    = .false.   !  daily mean to diurnal cycle short wave (qsr) 
    134    ln_rnf      = .true.    !  runoffs (T => fill namsbc_rnf) 
    135    ln_ssr      = .true.    !  Sea Surface Restoring on T and/or S (T => fill namsbc_ssr) 
     146   ln_rnf      = .true.    !  runoffs                                   (T => fill namsbc_rnf) 
     147   ln_ssr      = .true.    !  Sea Surface Restoring on T and/or S       (T => fill namsbc_ssr) 
    136148   nn_fwb      = 3         !  FreshWater Budget: =0 unchecked  
    137                            !                     =1 global mean of e-p-r set to zero at each time step  
    138                            !                     =2 annual global mean of e-p-r set to zero 
    139                            !                     =3 global emp set to zero and spread out over erp area 
     149                           !     =1 global mean of e-p-r set to zero at each time step  
     150                           !     =2 annual global mean of e-p-r set to zero 
     151                           !     =3 global emp set to zero and spread out over erp area 
    140152/ 
    141153!----------------------------------------------------------------------- 
     
    152164&namsbc_flx    !   surface boundary condition : flux formulation 
    153165!----------------------------------------------------------------------- 
    154 !              !   file name  ! frequency (hours) !  variable  ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    155 !              !              !  (if <0  months)  !    name    !    (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    156    sn_utau     = 'utau'       ,        24         ,    'utau'  ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    157    sn_vtau     = 'vtau'       ,        24         ,    'vtau'  ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    158    sn_qtot     = 'qtot'       ,        24         ,    'qtot'  ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    159    sn_qsr      = 'qsr'        ,        24         ,    'qsr'   ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    160    sn_emp      = 'emp'        ,        24         ,    'emp'   ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    161 ! 
     166!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     167!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     168   sn_utau     = 'utau'      ,        24         , 'utau'    , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     169   sn_vtau     = 'vtau'      ,        24         , 'vtau'    , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     170   sn_qtot     = 'qtot'      ,        24         , 'qtot'    , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     171   sn_qsr      = 'qsr'       ,        24         , 'qsr'     , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     172   sn_emp      = 'emp'       ,        24         , 'emp'     , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     173 
    162174   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the flux files 
    163175/       
     
    165177&namsbc_clio   !   namsbc_clio  CLIO bulk formulea 
    166178!----------------------------------------------------------------------- 
    167 !              !   file name  ! frequency (hours) !  variable  ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    168 !              !              !  (if <0  months)  !    name    !    (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    169    sn_utau     = 'taux_1m'    ,       -1          , 'sozotaux' ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    170    sn_vtau     = 'tauy_1m'    ,       -1          , 'sometauy' ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    171    sn_wndm     = 'flx'        ,       -1          , 'socliowi' ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    172    sn_tair     = 'flx'        ,       -1          , 'socliot2' ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    173    sn_humi     = 'flx'        ,       -1          , 'socliohu' ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    174    sn_ccov     = 'flx'        ,       -1          , 'socliocl' ,    .false.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    175    sn_prec     = 'flx'        ,       -1          , 'socliopl' ,    .false.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    176 ! 
     179!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     180!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     181   sn_utau     = 'taux_1m'   ,       -1          , 'sozotaux',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     182   sn_vtau     = 'tauy_1m'   ,       -1          , 'sometauy',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     183   sn_wndm     = 'flx'       ,       -1          , 'socliowi',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     184   sn_tair     = 'flx'       ,       -1          , 'socliot2',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     185   sn_humi     = 'flx'       ,       -1          , 'socliohu',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     186   sn_ccov     = 'flx'       ,       -1          , 'socliocl',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     187   sn_prec     = 'flx'       ,       -1          , 'socliopl',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     188 
    177189   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the bulk files are 
    178190/ 
     
    180192&namsbc_core   !   namsbc_core  CORE bulk formulea 
    181193!----------------------------------------------------------------------- 
    182 !              !   file name  ! frequency (hours) ! variable   ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights              ! rotation ! 
    183 !              !              !  (if <0  months)  !   name     !    (logical)   !  (T/F)  ! 'monthly' ! filename            ! pairing  ! 
    184    sn_wndi     = 'u10_core'   ,       -1          , 'u10'      ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,'bicubic_weights_orca2.nc' , 'U1' 
    185    sn_wndj     = 'v10_core'   ,       -1          , 'v10'      ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,'bicubic_weights_orca2.nc' , 'V1' 
    186    sn_qsr      = 'qsw_core'   ,       -1          , 'swdn'     ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,'bilinear_weights_orca2.nc', '' 
    187    sn_qlw      = 'qlw_core'   ,       -1          , 'lwdn'     ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,'bilinear_weights_orca2.nc', '' 
    188    sn_tair     = 't2_core'    ,       -1          , 't2'       ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,'bilinear_weights_orca2.nc', '' 
    189    sn_humi     = 'q2_core'    ,       -1          , 'q2'       ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,'bilinear_weights_orca2.nc', '' 
    190    sn_prec     = 'precip_core',       -1          , 'precip'   ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,'bilinear_weights_orca2.nc', '' 
    191    sn_snow     = 'snow_core'  ,       -1          , 'snow'     ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,'bilinear_weights_orca2.nc', '' 
    192    sn_tdif     = 'taudif_core',       24          , 'taudif'   ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,'bilinear_weights_orca2.nc', '' 
    193 ! 
     194!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     195!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     196   sn_wndi = 'u_10.15JUNE2009_orca2'       ,  6  , 'U_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , 'Uwnd' 
     197   sn_wndj = 'v_10.15JUNE2009_orca2'       ,  6  , 'V_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , 'Vwnd' 
     198   sn_qsr  = 'ncar_rad.15JUNE2009_orca2'   , 24  , 'SWDN_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     199   sn_qlw  = 'ncar_rad.15JUNE2009_orca2'   , 24  , 'LWDN_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     200   sn_tair = 't_10.15JUNE2009_orca2'       ,  6  , 'T_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     201   sn_humi = 'q_10.15JUNE2009_orca2'       ,  6  , 'Q_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     202   sn_prec = 'ncar_precip.15JUNE2009_orca2', -1  , 'PRC_MOD1',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     203   sn_snow = 'ncar_precip.15JUNE2009_orca2', -1  , 'SNOW'    ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     204   sn_tdif = 'taudif_core'                 , 24  , 'taudif'  ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     205 
    194206   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the bulk files 
    195    ln_2m       = .true.    !  air temperature and humidity referenced at 2m (T) instead 10m (F) 
     207   ln_2m       = .false.   !  air temperature and humidity referenced at 2m (T) instead 10m (F) 
    196208   ln_taudif   = .false.   !  HF tau contribution: use "mean of stress module - module of the mean stress" data ? 
    197209   rn_pfac     = 1.        !  multiplicative factor for precipitation (total & snow) 
    198210/ 
    199211!----------------------------------------------------------------------- 
    200 &namsbc_cpl    !   coupled ocean/atmosphere model                        ("key_coupled") 
    201 !----------------------------------------------------------------------- 
    202                                        ! send 
    203 cn_snd_temperature= 'weighted oce and ice'  ! 'oce only' 'weighted oce and ice' 'mixed oce-ice' 
    204 cn_snd_albedo     = 'weighted ice'          ! 'none' 'weighted ice' 'mixed oce-ice' 
    205 cn_snd_thickness  = 'none'                  ! 'none' 'weighted ice and snow' 
    206 cn_snd_crt_nature = 'none'                  ! 'none' 'oce only' 'weighted oce and ice' 'mixed oce-ice' 
    207 cn_snd_crt_refere = 'spherical'             ! 'spherical' 'cartesian' 
    208 cn_snd_crt_orient = 'eastward-northward'    ! 'eastward-northward' or 'local grid' 
    209 cn_snd_crt_grid   = 'T'                     ! 'T' 
    210                                        ! receive 
    211 cn_rcv_w10m       = 'none'                  ! 'none' 'coupled' 
    212 cn_rcv_taumod     = 'coupled'               ! 'none' 'coupled' 
    213 cn_rcv_tau_nature = 'oce only'              ! 'oce only' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
    214 cn_rcv_tau_refere = 'cartesian'             ! 'spherical' 'cartesian' 
    215 cn_rcv_tau_orient = 'eastward-northward'    ! 'eastward-northward' or 'local grid' 
    216 cn_rcv_tau_grid   = 'U,V'                   ! 'T' 'U,V' 'U,V,F' 'U,V,I' 'T,F' 'T,I' 'T,U,V' 
    217 cn_rcv_dqnsdt     = 'coupled'               ! 'none' 'coupled' 
    218 cn_rcv_qsr        = 'oce and ice'           ! 'conservative' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
    219 cn_rcv_qns        = 'oce and ice'           ! 'conservative' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
    220 cn_rcv_emp        = 'conservative'          ! 'conservative' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
    221 cn_rcv_rnf        = 'coupled'               ! 'coupled' 'climato' 'mixed' 
    222 cn_rcv_cal        = 'coupled'               ! 'none' 'coupled' 
    223 / 
    224 !----------------------------------------------------------------------- 
    225 &namsbc_cpl_co2   !   coupled ocean/biogeo/atmosphere model            ("key_cpl_carbon_cycle") 
     212&namsbc_cpl    !   coupled ocean/atmosphere model                       ("key_coupled") 
     213!----------------------------------------------------------------------- 
     214!                                      ! send 
     215cn_snd_temperature= 'weighted oce and ice'  !  'oce only' 'weighted oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     216cn_snd_albedo     = 'weighted ice'          !  'none' 'weighted ice' 'mixed oce-ice' 
     217cn_snd_thickness  = 'none'                  !  'none' 'weighted ice and snow' 
     218cn_snd_crt_nature = 'none'                  !  'none' 'oce only' 'weighted oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     219cn_snd_crt_refere = 'spherical'             !  'spherical' 'cartesian' 
     220cn_snd_crt_orient = 'eastward-northward'    !  'eastward-northward' or 'local grid' 
     221cn_snd_crt_grid   = 'T'                     !  'T' 
     222!                                      ! receive 
     223cn_rcv_w10m       = 'none'                  !  'none' 'coupled' 
     224cn_rcv_taumod     = 'coupled'               !  'none' 'coupled' 
     225cn_rcv_tau_nature = 'oce only'              !  'oce only' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     226cn_rcv_tau_refere = 'cartesian'             !  'spherical' 'cartesian' 
     227cn_rcv_tau_orient = 'eastward-northward'    !  'eastward-northward' or 'local grid' 
     228cn_rcv_tau_grid   = 'U,V'                   !  'T' 'U,V' 'U,V,F' 'U,V,I' 'T,F' 'T,I' 'T,U,V' 
     229cn_rcv_dqnsdt     = 'coupled'               !  'none' 'coupled' 
     230cn_rcv_qsr        = 'oce and ice'           !  'conservative' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     231cn_rcv_qns        = 'oce and ice'           !  'conservative' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     232cn_rcv_emp        = 'conservative'          !  'conservative' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     233cn_rcv_rnf        = 'coupled'               !  'coupled' 'climato' 'mixed' 
     234cn_rcv_cal        = 'coupled'               !  'none' 'coupled' 
     235/ 
     236!----------------------------------------------------------------------- 
     237&namsbc_cpl_co2   !   coupled ocean/biogeo/atmosphere model             ("key_cpl_carbon_cycle") 
    226238!----------------------------------------------------------------------- 
    227239cn_snd_co2        = 'coupled'         ! send    :  'none' 'coupled' 
     
    231243&namtra_qsr    !   penetrative solar radiation 
    232244!----------------------------------------------------------------------- 
    233 !              !   file name  ! frequency (hours) ! variable   ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    234 !              !              !  (if <0  months)  !   name     !    (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    235    sn_chl      = 'chlorophyll',        -1         , 'CHLA'     ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    236   
     245!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     246!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     247   sn_chl      ='chlorophyll',        -1         , 'CHLA'    ,   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     248 
    237249   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
    238    ln_traqsr   = .false.    !  Light penetration (T) or not (F) 
     250   ln_traqsr   = .false.   !  Light penetration (T) or not (F) 
    239251   ln_qsr_rgb  = .true.    !  RGB (Red-Green-Blue) light penetration 
    240252   ln_qsr_2bd  = .false.   !  2 bands              light penetration 
     
    248260&namsbc_rnf    !   runoffs namelist surface boundary condition 
    249261!----------------------------------------------------------------------- 
    250 !              !   file name  ! frequency (hours) ! variable   ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    251 !              !              !  (if <0  months)  !   name     !    (logical)   !  (T/F)  ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    252    sn_rnf      = 'runoff_1m_nomask' ,  -1         , 'sorunoff' ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  , ''       , '' 
    253    sn_cnf      = 'runoff_1m_nomask' ,   0         , 'socoefr'  ,    .false.     , .true.  , 'yearly'  , ''       , '' 
    254    sn_s_rnf    = 'runoffs'          ,  24         , 'rosaline' ,    .true.      , .true.  ,   'yearly', ''       , '' 
    255    sn_t_rnf    = 'runoffs'          ,  24         , 'rotemper' ,    .true.      , .true.  ,   'yearly', ''       , '' 
    256    sn_dep_rnf  = 'runoffs'          ,   0         , 'rodepth'  ,    .false.     , .true.  ,   'yearly', ''       , '' 
     262!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     263!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     264   sn_rnf      = 'runoff_1m_nomask' ,  -1        , 'sorunoff',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     265   sn_cnf      = 'runoff_1m_nomask' ,   0        , 'socoefr' ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     266   sn_s_rnf    = 'runoffs'          ,  24        , 'rosaline',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     267   sn_t_rnf    = 'runoffs'          ,  24        , 'rotemper',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     268   sn_dep_rnf  = 'runoffs'          ,   0        , 'rodepth' ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     269 
    257270   cn_dir       = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
    258271   ln_rnf_emp   =   .false. !  runoffs included into precipitation field (T) or into a file (F) 
     
    266279/ 
    267280!----------------------------------------------------------------------- 
     281&namsbc_apr    !   Atmospheric pressure used as ocean forcing or in bulk 
     282!----------------------------------------------------------------------- 
     283!              ! file name ! frequency (hours) ! variable ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     284!              !           !  (if <0  months)  !   name   !    (logical)   !  (T/F)  ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     285   sn_apr      = 'patm'    ,         -1        ,'somslpre',    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,  ''      ,   '' 
     286 
     287   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the bulk files 
     288   ln_ref_apr  = .false.   !  ref. pressure: global mean Patm (T) or a constant (F) 
     289/ 
     290!----------------------------------------------------------------------- 
    268291&namsbc_ssr    !   surface boundary condition : sea surface restoring 
    269292!----------------------------------------------------------------------- 
    270 !              !   file name  ! frequency (hours) ! variable   ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    271 !              !              !  (if <0  months)  !   name     !    (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    272    sn_sst      = 'sst_data'   ,        24         ,  'sst'     ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    273    sn_sss      = 'sss_data'   ,        -1         ,  'sss'     ,     .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    274      
     293!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     294!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     295   sn_sst      = 'sst_data'  ,        24         ,  'sst'    ,    .false.   , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     296   sn_sss      = 'sss_data'  ,        -1         ,  'sss'    ,    .true.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     297 
    275298   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
    276299   nn_sstr     =     0     !  add a retroaction term in the surface heat       flux (=1) or not (=0) 
     
    291314   rn_alphdi   =    0.72   !  (Pyane, 1972) 
    292315/ 
    293 !----------------------------------------------------------------------- 
    294 &namdta_tem    !   surface boundary condition : sea surface restoring 
    295 !----------------------------------------------------------------------- 
    296 !              !     file name                  ! frequency (hours) ! variable   ! time interpol. !  clim   !'yearly' or ! weights  ! rotation ! 
    297 !              !                                !  (if <0  months)  !   name     !    (logical)   !  (T/F)  ! 'monthly'  ! filename ! pairing  ! 
    298   sn_tem       = 'data_1m_potential_temperature_nomask',  -1        , 'votemper' ,     .true.     , .true.  , 'yearly'   , ' '      , ' ' 
    299 ! 
    300   cn_dir       = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
    301 / 
    302 !----------------------------------------------------------------------- 
    303 &namdta_sal    !   surface boundary condition : sea surface restoring 
    304 !----------------------------------------------------------------------- 
    305 !              !     file name                  ! frequency (hours) ! variable   ! time interpol. !  clim   ! 'yearly' or ! weights  ! rotation ! 
    306 !              !                                !  (if <0  months)  !   name     !    (logical)   !  (T/F)  !  'monthly'  ! filename ! pairing  ! 
    307    sn_sal      =  'data_1m_salinity_nomask'     ,         -1        , 'vosaline' ,     .true.     , .true.  , 'yearly'    , ''       , ' ' 
    308 ! 
    309    cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
    310 / 
     316 
    311317!!====================================================================== 
    312318!!               ***  Lateral boundary condition  *** 
     
    319325!!   namtide       Tidal forcing at open boundaries                     ("key_bdy_tides") 
    320326!!====================================================================== 
    321  
     327! 
    322328!----------------------------------------------------------------------- 
    323329&namlbc        !   lateral momentum boundary condition 
     
    334340&namobc        !   open boundaries parameters                           ("key_obc") 
    335341!----------------------------------------------------------------------- 
    336     ln_obc_clim= .false.   !  climatological obc data files (T) or not (F) 
    337     ln_vol_cst = .true.    !  impose the total volume conservation (T) or not (F) 
    338     ln_obc_fla = .false.   !  Flather open boundary condition  
    339     nn_obcdta  =    1      !  = 0 the obc data are equal to the initial state 
     342   ln_obc_clim = .false.   !  climatological obc data files (T) or not (F) 
     343   ln_vol_cst = .true.    !  impose the total volume conservation (T) or not (F) 
     344   ln_obc_fla = .false.   !  Flather open boundary condition  
     345   nn_obcdta   =    1      !  = 0 the obc data are equal to the initial state 
    340346                           !  = 1 the obc data are read in 'obc.dta' files 
    341     cn_obcdta  = 'annual'  !  set to annual if obc datafile hold 1 year of data 
     347   cn_obcdta   = 'annual'  !  set to annual if obc datafile hold 1 year of data 
    342348                           !  set to monthly if obc datafile hold 1 month of data 
    343     rn_dpein   =    1.     !  damping time scale for inflow at east  open boundary 
    344     rn_dpwin   =    1.     !     -           -         -       west    -      - 
    345     rn_dpnin   =    1.     !     -           -         -       north   -      - 
    346     rn_dpsin   =    1.     !     -           -         -       south   -      - 
    347     rn_dpeob   = 3000.     !  time relaxation (days) for the east  open boundary 
    348     rn_dpwob   =   15.     !     -           -         -     west    -      - 
    349     rn_dpnob   = 3000.     !     -           -         -     north   -      - 
    350     rn_dpsob   =   15.     !     -           -         -     south   -      - 
    351     rn_volemp  =  1.       !  = 0 the total volume change with the surface flux (E-P-R) 
     349   rn_dpein    =    1.     !  damping time scale for inflow at east  open boundary 
     350   rn_dpwin    =    1.     !     -           -         -       west    -      - 
     351   rn_dpnin    =    1.     !     -           -         -       north   -      - 
     352   rn_dpsin    =    1.     !     -           -         -       south   -      - 
     353   rn_dpeob    = 3000.     !  time relaxation (days) for the east  open boundary 
     354   rn_dpwob    =   15.     !     -           -         -     west    -      - 
     355   rn_dpnob    = 3000.     !     -           -         -     north   -      - 
     356   rn_dpsob    =   15.     !     -           -         -     south   -      - 
     357   rn_volemp   =  1.       !  = 0 the total volume change with the surface flux (E-P-R) 
    352358                           !  = 1 the total volume remains constant 
    353359/ 
     
    355361&namagrif      !  AGRIF zoom                                            ("key_agrif") 
    356362!----------------------------------------------------------------------- 
    357     nn_cln_update = 3      !  baroclinic update frequency 
    358     ln_spc_dyn    = .true. !  use 0 as special value for dynamics 
    359     rn_sponge_tra = 2880.  !  coefficient for tracer   sponge layer [s] 
    360     rn_sponge_dyn = 2880.  !  coefficient for dynamics sponge layer [s] 
     363   nn_cln_update = 3       !  baroclinic update frequency 
     364   ln_spc_dyn    = .true. !  use 0 as special value for dynamics 
     365   rn_sponge_tra = 2880.   !  coefficient for tracer   sponge layer [s] 
     366   rn_sponge_dyn = 2880.   !  coefficient for dynamics sponge layer [s] 
    361367/ 
    362368!----------------------------------------------------------------------- 
    363369&nambdy        !  unstructured open boundaries                          ("key_bdy") 
    364370!----------------------------------------------------------------------- 
    365     cn_mask    =  ''                        !  name of mask file (if ln_bdy_mask=.TRUE.) 
    366     cn_dta_frs_T  = 'bdydata_grid_T.nc'     !  name of data file (T-points) 
    367     cn_dta_frs_U  = 'bdydata_grid_U.nc'     !  name of data file (U-points) 
    368     cn_dta_frs_V  = 'bdydata_grid_V.nc'     !  name of data file (V-points) 
    369     cn_dta_fla_T  = 'bdydata_bt_grid_T.nc'  !  name of data file for Flather condition (T-points) 
    370     cn_dta_fla_U  = 'bdydata_bt_grid_U.nc'  !  name of data file for Flather condition (U-points) 
    371     cn_dta_fla_V  = 'bdydata_bt_grid_V.nc'  !  name of data file for Flather condition (V-points) 
    372     ln_clim    = .false.                    !  contain 1 (T) or 12 (F) time dumps and be cyclic 
    373     ln_vol     = .false.                    !  total volume correction (see volbdy parameter) 
    374     ln_mask    = .false.                    !  boundary mask from filbdy_mask (T) or boundaries are on edges of domain (F) 
    375     ln_tides   = .false.                    !  Apply tidal harmonic forcing with Flather condition 
    376     ln_dyn_fla = .false.                    !  Apply Flather condition to velocities 
    377     ln_tra_frs = .false.                    !  Apply FRS condition to temperature and salinity  
    378     ln_dyn_frs = .false.                    !  Apply FRS condition to velocities 
    379     nn_rimwidth    =  9                     !  width of the relaxation zone 
    380     nn_dtactl      =  1                     !  = 0, bdy data are equal to the initial state 
    381                                             !  = 1, bdy data are read in 'bdydata   .nc' files 
    382     nn_volctl      =  0                     !  = 0, the total water flux across open boundaries is zero 
    383                                             !  = 1, the total volume of the system is conserved 
    384 / 
    385 !----------------------------------------------------------------------- 
    386 &nambdy_tide     ! tidal forcing at unstructured boundaries               
    387 !----------------------------------------------------------------------- 
    388     filtide      = 'bdytide_'           !  file name root of tidal forcing files 
    389     tide_cpt     = 'M2','S1'            !  names of tidal components used 
    390     tide_speed   = 28.984106, 15.000001 !  phase speeds of tidal components (deg/hour) 
    391     ln_tide_date = .false.              !  adjust tidal harmonics for start date of run 
     371   cn_mask       =  ''                     !  name of mask file (if ln_bdy_mask=.TRUE.) 
     372   cn_dta_frs_T  = 'bdydata_grid_T.nc'     !  name of data file (T-points) 
     373   cn_dta_frs_U  = 'bdydata_grid_U.nc'     !  name of data file (U-points) 
     374   cn_dta_frs_V  = 'bdydata_grid_V.nc'     !  name of data file (V-points) 
     375   cn_dta_fla_T  = 'bdydata_bt_grid_T.nc'  !  name of data file for Flather condition (T-points) 
     376   cn_dta_fla_U  = 'bdydata_bt_grid_U.nc'  !  name of data file for Flather condition (U-points) 
     377   cn_dta_fla_V  = 'bdydata_bt_grid_V.nc'  !  name of data file for Flather condition (V-points) 
     378 
     379   ln_clim     = .false.   !  contain 1 (T) or 12 (F) time dumps and be cyclic 
     380   ln_vol      = .false.   !  total volume correction (see volbdy parameter) 
     381   ln_mask     = .false.   !  boundary mask from filbdy_mask (T), boundaries are on edges of domain (F) 
     382   ln_tides    = .false.   !  Apply tidal harmonic forcing with Flather condition 
     383   ln_dyn_fla  = .false.   !  Apply Flather condition to velocities 
     384   ln_tra_frs  = .false.   !  Apply FRS condition to temperature and salinity  
     385   ln_dyn_frs  = .false.   !  Apply FRS condition to velocities 
     386   nn_rimwidth =  9        !  width of the relaxation zone 
     387   nn_dtactl   =  1        !  = 0, bdy data are equal to the initial state 
     388                           !  = 1, bdy data are read in 'bdydata   .nc' files 
     389   nn_volctl   =  0        !  = 0, the total water flux across open boundaries is zero 
     390                           !  = 1, the total volume of the system is conserved 
     391/ 
     392!----------------------------------------------------------------------- 
     393&nambdy_tide   !  tidal forcing at unstructured boundaries               
     394!----------------------------------------------------------------------- 
     395   filtide     = 'bdytide_'           !  file name root of tidal forcing files 
     396   tide_cpt    = 'M2','S1'            !  names of tidal components used 
     397   tide_speed  = 28.984106, 15.000001 !  phase speeds of tidal components (deg/hour) 
     398   ln_tide_date= .false.              !  adjust tidal harmonics for start date of run 
    392399/ 
    393400 
     
    396403!!====================================================================== 
    397404!!   nambfr        bottom friction 
    398 !!   nambbc        bottom temperature boundary condition               
     405!!   nambbc        bottom temperature boundary condition                
    399406!!   nambbl        bottom boundary layer scheme                         ("key_trabbl") 
    400407!!====================================================================== 
    401  
     408! 
    402409!----------------------------------------------------------------------- 
    403410&nambfr        !   bottom friction 
     
    428435   rn_gambbl   =  10.    !  advective bbl coefficient                 [s] 
    429436/ 
     437 
    430438!!====================================================================== 
    431439!!                        Tracer (T & S ) namelists 
     
    460468&namtra_ldf    !   lateral diffusion scheme for tracer  
    461469!----------------------------------------------------------------------- 
    462                            !  Type of the operator :  
    463    ln_traldf_lap    =  .true.   !     laplacian operator        
    464    ln_traldf_bilap  =  .false.  !     bilaplacian operator      
    465                            !  Direction of action  : 
    466    ln_traldf_level  =  .false.  !     iso-level                 
    467    ln_traldf_hor    =  .false.  !     horizontal (geopotential)         (require "key_ldfslp" when ln_sco=T) 
    468    ln_traldf_iso    =  .true.   !     iso-neutral                       (require "key_ldfslp") 
    469    ln_traldf_grif   =  .false.  !     griffies skew flux formulation    (require "key_ldfslp")   ! UNDER TEST, DO NOT USE 
    470    ln_traldf_gdia   =  .false.  !     griffies operator strfn diagnostics (require "key_ldfslp") ! UNDER TEST, DO NOT USE 
    471                            !  Coefficient 
    472    rn_aht_0         =  2000.    !     horizontal eddy diffusivity for tracers [m2/s] 
    473    rn_ahtb_0        =     0.    !     background eddy diffusivity for ldf_iso [m2/s] 
    474    rn_aeiv_0        =  2000.    !     eddy induced velocity coefficient [m2/s]    (require "key_traldf_eiv") 
     470   !                       !  Type of the operator :  
     471   ln_traldf_lap    =  .true.   !  laplacian operator        
     472   ln_traldf_bilap  =  .false.  !  bilaplacian operator      
     473   !                       !  Direction of action  : 
     474   ln_traldf_level  =  .false.  !  iso-level                 
     475   ln_traldf_hor    =  .false.  !  horizontal (geopotential)            (require "key_ldfslp" when ln_sco=T) 
     476   ln_traldf_iso    =  .true.   !  iso-neutral                          (require "key_ldfslp") 
     477   ln_traldf_grif   =  .false.  !  griffies skew flux formulation       (require "key_ldfslp")  ! UNDER TEST, DO NOT USE 
     478   ln_traldf_gdia   =  .false.  !  griffies operator strfn diagnostics  (require "key_ldfslp") ! UNDER TEST, DO NOT USE 
     479   !                       !  Coefficient 
     480   rn_aht_0         =  2000.    !  horizontal eddy diffusivity for tracers [m2/s] 
     481   rn_ahtb_0        =     0.    !  background eddy diffusivity for ldf_iso [m2/s] 
     482   rn_aeiv_0        =  2000.    !  eddy induced velocity coefficient [m2/s]    (require "key_traldf_eiv") 
    475483/ 
    476484!----------------------------------------------------------------------- 
     
    488496   nn_file     =    0      !  create a damping.coeff NetCDF file (=1) or not (=0) 
    489497/ 
     498 
    490499!!====================================================================== 
    491500!!                      ***  Dynamics namelists  *** 
     
    496505!!   namdyn_spg    surface pressure gradient                            (CPP key only) 
    497506!!   namdyn_ldf    lateral diffusion scheme 
    498 !!====================================================================== 
    499  
     507!!   namdyn        offline: dynamics read in files                      ("key_offline") 
     508!!====================================================================== 
     509! 
    500510!----------------------------------------------------------------------- 
    501511&namdyn_adv    !   formulation of the momentum advection 
     
    538548&namdyn_ldf    !   lateral diffusion on momentum 
    539549!----------------------------------------------------------------------- 
    540                            !  Type of the operator :  
     550   !                       !  Type of the operator :  
    541551   ln_dynldf_lap    =  .true.   !  laplacian operator          
    542552   ln_dynldf_bilap  =  .false.  !  bilaplacian operator     
    543                            !  Direction of action  :  
     553   !                       !  Direction of action  :  
    544554   ln_dynldf_level  =  .false.  !  iso-level                
    545    ln_dynldf_hor    =  .false.   !  horizontal (geopotential)            (require "key_ldfslp" in s-coord.) 
    546    ln_dynldf_iso    =  .true.  !  iso-neutral                          (require "key_ldfslp") 
    547                            !  Coefficient 
     555   ln_dynldf_hor    =  .true.   !  horizontal (geopotential)            (require "key_ldfslp" in s-coord.) 
     556   ln_dynldf_iso    =  .false.  !  iso-neutral                          (require "key_ldfslp") 
     557   !                       !  Coefficient 
    548558   rn_ahm_0_lap     = 40000.    !  horizontal laplacian eddy viscosity   [m2/s] 
    549559   rn_ahmb_0        =     0.    !  background eddy viscosity for ldf_iso [m2/s] 
    550560   rn_ahm_0_blp     =     0.    !  horizontal bilaplacian eddy viscosity [m4/s]  
    551561/ 
     562!----------------------------------------------------------------------- 
     563&namdyn        !   offline dynamics read in files                       ("key_offline") 
     564!----------------------------------------------------------------------- 
     565    ndtadyn   =  73        ! number of period in the file for one year 
     566    ndtatot   =  73        ! total number of period in the file 
     567    nsptint   =  1         ! indicator for time interpolation 
     568    lperdyn   = .true.     ! periodicity of the unique file (T) 
     569                           ! F  (default)   computed with Blanke' scheme 
     570    cfile_grid_T = 'dyna_grid_T.nc' ! name of grid_T file 
     571    cfile_grid_U = 'dyna_grid_U.nc' ! name of grid_U file 
     572    cfile_grid_V = 'dyna_grid_V.nc' ! name of grid_V file 
     573    cfile_grid_W = 'dyna_grid_W.nc' ! name of grid_W file 
     574/ 
     575 
    552576!!====================================================================== 
    553577!!             Tracers & Dynamics vertical physics namelists 
    554578!!====================================================================== 
    555 !!       namzdf        vertical physics 
    556 !!       namzdf_ric    richardson number dependent vertical mixing      ("key_zdfric"      ) 
    557 !!       namzdf_tke    TKE dependent vertical mixing                    ("key_zdftke"      ) 
    558 !!       namzdf_kpp    KPP dependent vertical mixing                    ("key_zdfkpp"      ) 
    559 !!       namzdf_ddm    double diffusive mixing parameterization         ("key_zdfddm"      ) 
    560 !!       namzdf_tmx    tidal mixing parameterization                    ("key_zdftmx"      ) 
    561 !!====================================================================== 
    562  
     579!!    namzdf        vertical physics 
     580!!    namzdf_ric    richardson number dependent vertical mixing         ("key_zdfric") 
     581!!    namzdf_tke    TKE dependent vertical mixing                       ("key_zdftke") 
     582!!    namzdf_kpp    KPP dependent vertical mixing                       ("key_zdfkpp") 
     583!!    namzdf_ddm    double diffusive mixing parameterization            ("key_zdfddm") 
     584!!    namzdf_tmx    tidal mixing parameterization                       ("key_zdftmx") 
     585!!====================================================================== 
     586! 
    563587!----------------------------------------------------------------------- 
    564588&namzdf        !   vertical physics 
     
    625649/ 
    626650!----------------------------------------------------------------------- 
    627 &namzdf_gls                !   GLS vertical diffusion  ("key_zdfgls") 
    628 !----------------------------------------------------------------------- 
    629    rn_emin        = 1.e-6  !  minimum value of e   [m2/s2] 
    630    rn_epsmin      = 1.e-12 !  minimum value of eps [m2/s3] 
    631    ln_length_lim  = .true. !  limit on the dissipation rate under stable stratification (Galperin et al., 1988) 
    632    rn_clim_galp   = 0.53   !  galperin limit 
    633    ln_crban       = .TRUE. !  Use Craig & Banner (1994) surface wave mixing parametrisation 
    634    ln_sigpsi      = .TRUE. !  Activate or not Burchard 2001 mods on psi schmidt number in the wb case 
    635    rn_crban       = 100.   !  Craig and Banner 1994 constant for wb tke flux 
    636    rn_charn       = 70000. !  Charnock constant for wb induced roughness length 
    637    nn_tkebc_surf  =   1    !  surface tke condition (0/1/2=Dir/Neum/Dir Mellor-Blumberg) 
    638    nn_tkebc_bot   =   1    !  bottom tke condition (0/1=Dir/Neum) 
    639    nn_psibc_surf  =   1    !  surface psi condition (0/1/2=Dir/Neum/Dir Mellor-Blumberg) 
    640    nn_psibc_bot   =   1    !  bottom psi condition (0/1=Dir/Neum) 
    641    nn_stab_func   =   2    !  stability function (0=Galp, 1= KC94, 2=CanutoA, 3=CanutoB) 
    642    nn_clos        =   1    !  predefined closure type (0=MY82, 1=k-eps, 2=k-w, 3=Gen) 
     651&namzdf_gls                !   GLS vertical diffusion                   ("key_zdfgls") 
     652!----------------------------------------------------------------------- 
     653   rn_emin       = 1.e-6   !  minimum value of e   [m2/s2] 
     654   rn_epsmin     = 1.e-12 !  minimum value of eps [m2/s3] 
     655   ln_length_lim = .true. !  limit on the dissipation rate under stable stratification (Galperin et al., 1988) 
     656   rn_clim_galp  = 0.53    !  galperin limit 
     657   ln_crban      = .TRUE. !  Use Craig & Banner (1994) surface wave mixing parametrisation 
     658   ln_sigpsi     = .TRUE. !  Activate or not Burchard 2001 mods on psi schmidt number in the wb case 
     659   rn_crban      = 100.    !  Craig and Banner 1994 constant for wb tke flux 
     660   rn_charn      = 70000. !  Charnock constant for wb induced roughness length 
     661   nn_tkebc_surf =   1     !  surface tke condition (0/1/2=Dir/Neum/Dir Mellor-Blumberg) 
     662   nn_tkebc_bot  =   1     !  bottom tke condition (0/1=Dir/Neum) 
     663   nn_psibc_surf =   1     !  surface psi condition (0/1/2=Dir/Neum/Dir Mellor-Blumberg) 
     664   nn_psibc_bot  =   1     !  bottom psi condition (0/1=Dir/Neum) 
     665   nn_stab_func  =   2     !  stability function (0=Galp, 1= KC94, 2=CanutoA, 3=CanutoB) 
     666   nn_clos       =   1     !  predefined closure type (0=MY82, 1=k-eps, 2=k-w, 3=Gen) 
    643667/ 
    644668!----------------------------------------------------------------------- 
     
    658682   rn_tfe_itf  = 1.        !  ITF tidal dissipation efficiency 
    659683/ 
     684 
    660685!!====================================================================== 
    661686!!                  ***  Miscelaneous namelists  *** 
     
    666691!!   namsol            elliptic solver / island / free surface  
    667692!!====================================================================== 
    668  
     693! 
    669694!----------------------------------------------------------------------- 
    670695&namsol        !   elliptic solver / island / free surface  
     
    710735 
    711736!!====================================================================== 
    712 !!                       ***  Diagnostics namelists  *** 
    713 !!====================================================================== 
     737!!                  ***  Diagnostics namelists  *** 
     738!!====================================================================== 
     739!!   namnc4       netcdf4 chunking and compression settings             ("key_netcdf4") 
    714740!!   namtrd       dynamics and/or tracer trends                         ("key_trddyn","key_trdtra","key_trdmld") 
    715 !!   namgap       level mean model-data gap                             ("key_diagap") 
    716741!!   namflo       float parameters                                      ("key_float") 
    717742!!   namptr       Poleward Transport Diagnostics 
    718 !!====================================================================== 
    719  
     743!!   namhsb       Heat and salt budgets  
     744!!====================================================================== 
     745! 
     746!----------------------------------------------------------------------- 
     747&namnc4        !   netcdf4 chunking and compression settings            ("key_netcdf4") 
     748!----------------------------------------------------------------------- 
     749   nn_nchunks_i=   4       !  number of chunks in i-dimension 
     750   nn_nchunks_j=   4       !  number of chunks in j-dimension 
     751   nn_nchunks_k=   31      !  number of chunks in k-dimension 
     752                           !  setting nn_nchunks_k = jpk will give a chunk size of 1 in the vertical which 
     753                           !  is optimal for postprocessing which works exclusively with horizontal slabs 
     754   ln_nc4zip   = .TRUE.    !  (T) use netcdf4 chunking and compression 
     755                           !  (F) ignore chunking information and produce netcdf3-compatible files 
     756/ 
    720757!----------------------------------------------------------------------- 
    721758&namtrd        !   diagnostics on dynamics and/or tracer trends         ("key_trddyn" and/or "key_trdtra") 
    722 !              !       or mixed-layer trends or barotropic vorticity    ('key_trdmld' or  "key_trdvor") 
     759!              !       or mixed-layer trends or barotropic vorticity    ("key_trdmld" or     "key_trdvor") 
    723760!----------------------------------------------------------------------- 
    724761   nn_trd      = 365       !  time step frequency dynamics and tracers trends 
     
    731768/ 
    732769!----------------------------------------------------------------------- 
    733 &namgap       !   level mean model-data gap                             ('key_diagap') 
    734 !----------------------------------------------------------------------- 
    735    nn_gap     =  15        !  time-step frequency of model-data gap computation 
    736    nn_prg     =  10        !  time-step frequency of gap print in model output 
    737 / 
    738 !----------------------------------------------------------------------- 
    739770&namflo       !   float parameters                                      ("key_float") 
    740771!----------------------------------------------------------------------- 
    741     ln_rstflo = .false.    !  float restart (T) or not (F) 
    742     nn_writefl=      75    !  frequency of writing in float output file  
    743     nn_stockfl=    5475    !  frequency of creation of the float restart file  
    744     ln_argo   = .false.    !  Argo type floats (stay at the surface each 10 days) 
    745     ln_flork4 = .false.    !  trajectories computed with a 4th order Runge-Kutta (T) 
     772   ln_rstflo  = .false.    !  float restart (T) or not (F) 
     773   nn_writefl =      75    !  frequency of writing in float output file  
     774   nn_stockfl =    5475    !  frequency of creation of the float restart file  
     775   ln_argo    = .false.    !  Argo type floats (stay at the surface each 10 days) 
     776   ln_flork4  = .false.    !  trajectories computed with a 4th order Runge-Kutta (T) 
     777                           !  or computed with Blanke' scheme (F) 
    746778                           !  or computed with Blanke' scheme (F) 
    747779/ 
     
    762794   ln_diahsb  = .false.     !  check the heat and salt budgets (T) or not (F) 
    763795/ 
    764 !----------------------------------------------------------------------- 
    765 &namdyn        !   offline parameters 
    766 !----------------------------------------------------------------------- 
    767     ndtadyn   =  73        ! number of period in the file for one year 
    768     ndtatot   =  73        ! total number of period in the file 
    769     nsptint   =  1         ! indicator for time interpolation 
    770     lperdyn   = .true.     ! periodicity of the unique file (T) 
    771 !                          ! F  (default)   computed with Blanke' scheme 
    772     cfile_grid_T = 'dyna_grid_T.nc' ! name of grid_T file 
    773     cfile_grid_U = 'dyna_grid_U.nc' ! name of grid_U file 
    774     cfile_grid_V = 'dyna_grid_V.nc' ! name of grid_V file 
    775     cfile_grid_W = 'dyna_grid_W.nc' ! name of grid_W file 
    776 / 
    777 !----------------------------------------------------------------------- 
    778 !       namobs    observation usage switch 
    779 !----------------------------------------------------------------------- 
    780 ! 
    781 !  ln_t3d                  Logical switch for T profile observations          
    782 !  ln_s3d                  Logical switch for S profile observations           
    783 !  ln_ena                  Logical switch for ENACT insitu data set            
    784 !  ln_cor                  Logical switch for Coriolis insitu data set        
    785 !  ln_profb                Logical switch for feedback insitu data set      
    786 !  ln_sla                  Logical switch for SLA observations                
    787 !  ln_sladt                Logical switch for AVISO SLA data               
    788 !  ln_slafb                Logical switch for feedback SLA data             
    789 !  ln_ssh                  Logical switch for SSH observations               
    790 !  ln_sst                  Logical switch for SST observations               
    791 !  ln_reysst               Logical switch for Reynolds observations        
    792 !  ln_ghrsst               Logical switch for GHRSST observations           
    793 !  ln_sstfb                Logical switch for feedback SST data           
    794 !  ln_sss                  Logical switch for SSS observations               
    795 !  ln_seaice               Logical switch for Sea Ice observations         
    796 !  ln_vel3d                Logical switch for velocity observations          
    797 !  ln_velavcur             Logical switch for velocity daily av. cur.     
    798 !  ln_velhrcur             Logical switch for velocity high freq. cur.    
    799 !  ln_velavadcp            Logical switch for velocity daily av. ADCP   
    800 !  ln_velhradcp            Logical switch for velocity high freq. ADCP 
    801 !  ln_velfb                Logical switch for feedback velocity data        
    802 !  ln_grid_global          Global distribtion of observations          
    803 !  ln_grid_search_lookup   Logical switch for obs grid search w/lookup table   
    804 !  grid_search_file        Grid search lookup file header  
    805 !  enactfiles              ENACT input observation file names  
    806 !  coriofiles              Coriolis input observation file name   
    807 !  profbfiles              Profile feedback input observation file name  
    808 !  ln_profb_enatim         Enact feedback input time setting switch     
    809 !  slafilesact             Active SLA input observation file name 
    810 !  slafilespas             Passive SLA input observation file name  
    811 !  slafbfiles              Feedback SLA input observation file name  
    812 !  sstfiles                GHRSST input observation file name        
    813 !  sstfbfiles              Feedback SST input observation file name  
    814 !  seaicefiles             Sea Ice input observation file name  
    815 !  velavcurfiles           Vel. cur. daily av. input file name   
    816 !  velhvcurfiles           Vel. cur. high freq. input file name   
    817 !  velavadcpfiles          Vel. ADCP daily av. input file name     
    818 !  velhvadcpfiles          Vel. ADCP high freq. input file name  
    819 !  velfbfiles              Vel. feedback input observation file name  
    820 !  dobsini                 Initial date in window YYYYMMDD.HHMMSS        
    821 !  dobsend                 Final date in window YYYYMMDD.HHMMSS          
    822 !  n1dint                  Type of vertical interpolation method         
    823 !  n2dint                  Type of horizontal interpolation method        
    824 !  ln_nea                  Rejection of observations near land switch     
    825 !  nmsshc                  MSSH correction scheme                          
    826 !  mdtcorr                 MDT  correction                                
    827 !  mdtcutoff               MDT cutoff for computed correction           
    828 !  ln_altbias              Logical switch for alt bias                 
    829 !  ln_ignmis               Logical switch for ignoring missing files    
    830 !  endailyavtypes          ENACT daily average types                     
    831  &namobs 
    832    ln_t3d = .false. 
    833    ln_s3d = .false. 
    834    ln_ena = .false. 
    835    ln_profb = .false. 
    836    ln_sla = .false. 
    837    ln_sladt = .false. 
    838    ln_slafb = .false. 
    839    ln_sst = .false. 
    840    ln_sstfb = .false. 
    841    nmsshc = 0 
     796 
     797!!====================================================================== 
     798!!            ***  Observation & Assimilation namelists *** 
     799!!====================================================================== 
     800!!   namobs       observation and model comparison                      ('key_diaobs') 
     801!!   nam_asminc   assimilation increments                               ('key_asminc') 
     802!!====================================================================== 
     803! 
     804!----------------------------------------------------------------------- 
     805 &namobs      !  observation usage switch                               ('key_diaobs') 
     806!----------------------------------------------------------------------- 
     807   ln_t3d     = .false.    ! Logical switch for T profile observations          
     808   ln_s3d     = .false.    ! Logical switch for S profile observations           
     809   ln_ena     = .false.    ! Logical switch for ENACT insitu data set            
     810   !                       !     ln_cor                  Logical switch for Coriolis insitu data set        
     811   ln_profb   = .false.    ! Logical switch for feedback insitu data set      
     812   ln_sla     = .false.    ! Logical switch for SLA observations                
     813 
     814   ln_sladt   = .false.    ! Logical switch for AVISO SLA data               
     815 
     816   ln_slafb   = .false.    ! Logical switch for feedback SLA data             
     817                           !     ln_ssh                  Logical switch for SSH observations               
     818 
     819   ln_sst     = .false.    ! Logical switch for SST observations               
     820                           !     ln_reysst               Logical switch for Reynolds observations        
     821                           !     ln_ghrsst               Logical switch for GHRSST observations           
     822 
     823   ln_sstfb   = .false.    ! Logical switch for feedback SST data           
     824                           !     ln_sss                  Logical switch for SSS observations               
     825                           !     ln_seaice               Logical switch for Sea Ice observations         
     826                           !     ln_vel3d                Logical switch for velocity observations          
     827                           !     ln_velavcur             Logical switch for velocity daily av. cur.     
     828                           !     ln_velhrcur             Logical switch for velocity high freq. cur.    
     829                           !     ln_velavadcp            Logical switch for velocity daily av. ADCP   
     830                           !     ln_velhradcp            Logical switch for velocity high freq. ADCP 
     831                           !     ln_velfb                Logical switch for feedback velocity data        
     832                           !     ln_grid_global          Global distribtion of observations          
     833                           !     ln_grid_search_lookup   Logical switch for obs grid search w/lookup table   
     834                           !     grid_search_file        Grid search lookup file header  
     835                           !     enactfiles              ENACT input observation file names  
     836                           !     coriofiles              Coriolis input observation file name   
     837   !                       ! profbfiles: Profile feedback input observation file name  
    842838   profbfiles = 'profiles_01.nc' 
     839                           !     ln_profb_enatim         Enact feedback input time setting switch     
     840                           !     slafilesact             Active SLA input observation file name 
     841                           !     slafilespas             Passive SLA input observation file name  
     842   !                       ! slafbfiles: Feedback SLA input observation file name  
    843843   slafbfiles = 'sla_01.nc' 
     844                           !     sstfiles                GHRSST input observation file name        
     845   !                       ! sstfbfiles: Feedback SST input observation file name  
    844846   sstfbfiles = 'sst_01.nc' 'sst_02.nc' 'sst_03.nc' 'sst_04.nc' 'sst_05.nc' 
    845    ln_altbias = .false. 
     847                           !     seaicefiles             Sea Ice input observation file name  
     848                           !     velavcurfiles           Vel. cur. daily av. input file name   
     849                           !     velhvcurfiles           Vel. cur. high freq. input file name   
     850                           !     velavadcpfiles          Vel. ADCP daily av. input file name     
     851                           !     velhvadcpfiles          Vel. ADCP high freq. input file name  
     852                           !     velfbfiles              Vel. feedback input observation file name  
     853                           !     dobsini                 Initial date in window YYYYMMDD.HHMMSS        
     854                           !     dobsend                 Final date in window YYYYMMDD.HHMMSS          
     855                           !     n1dint                  Type of vertical interpolation method         
     856                           !     n2dint                  Type of horizontal interpolation method        
     857                           !     ln_nea                  Rejection of observations near land switch     
     858   nmsshc     = 0          ! MSSH correction scheme                          
     859                           !     mdtcorr                 MDT  correction                                
     860                           !     mdtcutoff               MDT cutoff for computed correction           
     861   ln_altbias = .false.    ! Logical switch for alt bias                 
     862   ln_ignmis  = .true.     ! Logical switch for ignoring missing files    
     863                           !     endailyavtypes   ENACT daily average types                     
    846864   ln_grid_global = .true. 
    847865   ln_grid_search_lookup = .false. 
    848    ln_ignmis = .true.   
    849866/  
    850867!----------------------------------------------------------------------- 
    851 !       nam_asminc    assimilation increments namelist 
    852 !----------------------------------------------------------------------- 
    853 ! ln_bkgwri   Logical switch for writing out background state  
    854 ! ln_trjwri   Logical switch for writing out state trajectory 
    855 ! ln_trainc   Logical switch for applying tracer increments 
    856 ! ln_dyninc   Logical switch for applying velocity increments 
    857 ! ln_sshinc   Logical switch for applying SSH increments  
    858 ! ln_asmdin   Logical switch for Direct Initialization (DI) 
    859 ! ln_asmiau   Logical switch for Incremental Analysis Updating (IAU) 
    860 ! nitbkg      Timestep of background in [0,nitend-nit000-1] 
    861 ! nitdin      Timestep of background for DI in [0,nitend-nit000-1] 
    862 ! nitiaustr   Timestep of start of IAU interval in [0,nitend-nit000-1] 
    863 ! nitiaufin   Timestep of end of IAU interval in [0,nitend-nit000-1] 
    864 ! niaufn      Type of IAU weighting function 
    865 ! nittrjfrq   Frequency of trajectory output for 4D-VAR 
    866 ! ln_salfix   Logical switch for ensuring that the sa > salfixmin 
    867 ! salfixmin   Minimum salinity after applying the increments 
    868 &nam_asminc 
    869     ln_bkgwri = .false. 
    870     ln_trjwri = .false. 
    871     ln_trainc = .false. 
    872     ln_dyninc = .false. 
    873     ln_sshinc = .false. 
    874     ln_asmdin = .false. 
    875     ln_asmiau = .false. 
    876     nitbkg = 0 
    877     nitdin = 0 
    878     nitiaustr = 1 
    879     nitiaufin = 15 
    880     niaufn = 0 
    881     nittrjfrq = 0 
    882     ln_salfix = .false. 
    883     salfixmin = -9999 
    884 / 
     868&nam_asminc   !   assimilation increments                               ('key_asminc') 
     869!----------------------------------------------------------------------- 
     870    ln_bkgwri = .false.    !  Logical switch for writing out background state  
     871    ln_trjwri = .false.    !  Logical switch for writing out state trajectory 
     872    ln_trainc = .false.    !  Logical switch for applying tracer increments 
     873    ln_dyninc = .false.    !  Logical switch for applying velocity increments 
     874    ln_sshinc = .false.    !  Logical switch for applying SSH increments  
     875    ln_asmdin = .false.    !  Logical switch for Direct Initialization (DI) 
     876    ln_asmiau = .false.    !  Logical switch for Incremental Analysis Updating (IAU) 
     877    nitbkg    = 0          !  Timestep of background in [0,nitend-nit000-1] 
     878    nitdin    = 0          !  Timestep of background for DI in [0,nitend-nit000-1] 
     879    nitiaustr = 1          !  Timestep of start of IAU interval in [0,nitend-nit000-1] 
     880    nitiaufin = 15         !  Timestep of end of IAU interval in [0,nitend-nit000-1] 
     881    niaufn    = 0          !  Type of IAU weighting function 
     882    nittrjfrq = 0          !  Frequency of trajectory output for 4D-VAR 
     883    ln_salfix = .false.    !  Logical switch for ensuring that the sa > salfixmin 
     884    salfixmin = -9999      !  Minimum salinity after applying the increments 
     885/ 
  • branches/nemo_v3_3_beta/NEMOGCM/CONFIG/POMME/EXP00/namelist

    r2399 r2417  
    11!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
    22!! NEMO/OPA  :  1 - run manager      (namrun) 
    3 !! namelists    2 - Domain           (namzgr, namzgr_sco, namdom) 
     3!! namelists    2 - Domain           (namzgr, namzgr_sco, namdom, namdta_tem, namdta_sal) 
    44!!              3 - Surface boundary (namsbc, namsbc_ana, namsbc_flx, namsbc_clio, namsbc_core 
    5 !!                                    namsbc_cpl, namqsr, namsbc_rnf, namsbc_ssr, namsbc_alb) 
     5!!                                    namsbc_cpl, namsbc_cpl_co2 namtra_qsr, namsbc_rnf,  
     6!!                                    namsbc_apr, namsbc_ssr, namsbc_alb) 
    67!!              4 - lateral boundary (namlbc, namcla, namobc, namagrif, nambdy, nambdy_tide) 
    78!!              5 - bottom  boundary (nambfr, nambbc, nambbl) 
     
    910!!              7 - dynamics         (namdyn_adv, namdyn_vor, namdyn_hpg, namdyn_spg, namdyn_ldf) 
    1011!!              8 - Verical physics  (namzdf, namzdf_ric, namzdf_tke, namzdf_kpp, namzdf_ddm, namzdf_tmx) 
    11 !!              9 - diagnostics      (namtrd, namgap, namspr, namflo, namptr) 
    12 !!              9 - miscellaneous    (namsol, nammpp, nammpp_dyndist, namctl) 
     12!!              9 - diagnostics      (namnc4, namtrd, namspr, namflo, namptr, namhsb) 
     13!!             10 - miscellaneous    (namsol, nammpp, nammpp_dyndist, namctl) 
     14!!             11 - Obs & Assim      (namobs, nam_asminc) 
    1315!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
    1416!  CAUTION: some scripts does not support CAPITALs for logical use .true./.false., not .TRUE./.FALSE. 
     
    1719!!                   ***  Run management namelists  *** 
    1820!!====================================================================== 
    19 !!   namrun            parameters of the run 
    20 !!====================================================================== 
    21  
     21!!   namrun        parameters of the run 
     22!!====================================================================== 
     23! 
    2224!----------------------------------------------------------------------- 
    2325&namrun        !   parameters of the run 
     
    4345   cn_ocerst_out = "restart"   !  suffix of ocean restart name (output) 
    4446/ 
    45 !!====================================================================== 
    46 !!   namnc4            netcdf4 chunking and compression settings 
    47 !!====================================================================== 
    48 !----------------------------------------------------------------------- 
    49 &namnc4         !  netcdf4 chunking and compression settings     ("key_netcdf4") 
    50                 !  (ignored if "key_netcdf4" is not used) 
    51 !----------------------------------------------------------------------- 
    52    nn_nchunks_i   =   4       !  number of chunks in i-dimension 
    53    nn_nchunks_j   =   4       !  number of chunks in j-dimension 
    54    nn_nchunks_k   =   31      !  number of chunks in k-dimension 
    55                               !  setting nn_nchunks_k = jpk will give a chunk size of 1 in the vertical which 
    56                               !  is optimal for postprocessing which works exclusively with horizontal slabs 
    57    ln_nc4zip      =   .TRUE.  !  (T) use netcdf4 chunking and compression 
    58                               !  (F) ignore chunking information and produce netcdf3-compatible files 
    59 / 
     47 
    6048!!====================================================================== 
    6149!!                      ***  Domain namelists  *** 
     
    6452!!   namzgr_sco   s-coordinate or hybrid z-s-coordinate 
    6553!!   namdom       space and time domain (bathymetry, mesh, timestep) 
    66 !!====================================================================== 
    67  
     54!!   namdta_tem   data: temperature                                     ("key_dtatem") 
     55!!   namdta_sal   data: salinity                                        ("key_dtasal") 
     56!!====================================================================== 
     57! 
    6858!----------------------------------------------------------------------- 
    6959&namzgr        !   vertical coordinate 
     
    10393   rn_rdth     =  800.           !  depth variation of tracer time step  (used if nacc=1) 
    10494/ 
     95!----------------------------------------------------------------------- 
     96&namdta_tem    !   data : temperature                                   ("key_dtatem") 
     97!----------------------------------------------------------------------- 
     98!              ! file name ! frequency (hours)    ! variable ! time interp. ! clim  !'yearly' or ! weights  ! rotation ! 
     99!              !           !  (if <0  months)     !   name   !  (logical)   ! (T/F) ! 'monthly'  ! filename ! pairing  ! 
     100   sn_tem = 'data_1m_potential_temperature_nomask', -1,'votemper',  .true.  , .true., 'yearly'   , ' '      , ' ' 
     101   ! 
     102   cn_dir       = './'     !  root directory for the location of the runoff files 
     103/ 
     104!----------------------------------------------------------------------- 
     105&namdta_sal    !   data : salinity                                      ("key_dtasal") 
     106!----------------------------------------------------------------------- 
     107!              ! file name ! frequency (hours)    ! variable ! time interp. ! clim  !'yearly' or ! weights  ! rotation ! 
     108!              !           !  (if <0  months)     !   name   !   (logical)  ! (T/F) ! 'monthly'  ! filename ! pairing  ! 
     109   sn_sal      =  'data_1m_salinity_nomask',  -1  ,'vosaline',    .true.    , .true., 'yearly'   , ''       , ' ' 
     110   ! 
     111   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
     112/ 
     113 
    105114!!====================================================================== 
    106115!!            ***  Surface Boundary Condition namelists  *** 
    107116!!====================================================================== 
    108 !!   namsbc        surface boundary condition 
    109 !!   namsbc_ana    analytical         formulation 
    110 !!   namsbc_flx    flux               formulation 
    111 !!   namsbc_clio   CLIO bulk formulea formulation 
    112 !!   namsbc_core   CORE bulk formulea formulation 
    113 !!   namsbc_cpl    CouPLed            formulation                       ("key_coupled") 
    114 !!   namtra_qsr    penetrative solar radiation 
    115 !!   namsbc_rnf    river runoffs 
    116 !!   namsbc_ssr    sea surface restoring term (for T and/or S) 
    117 !!   namsbc_alb    albedo parameters 
    118 !!====================================================================== 
    119  
     117!!   namsbc          surface boundary condition 
     118!!   namsbc_ana      analytical         formulation 
     119!!   namsbc_flx      flux               formulation 
     120!!   namsbc_clio     CLIO bulk formulea formulation 
     121!!   namsbc_core     CORE bulk formulea formulation 
     122!!   namsbc_cpl      CouPLed            formulation                     ("key_coupled") 
     123!!   namsbc_cpl_co2  coupled ocean/biogeo/atmosphere model              ("key_cpl_carbon_cycle") 
     124!!   namtra_qsr      penetrative solar radiation 
     125!!   namsbc_rnf      river runoffs 
     126!!   namsbc_apr      Atmospheric Pressure 
     127!!   namsbc_ssr      sea surface restoring term (for T and/or S) 
     128!!   namsbc_alb      albedo parameters 
     129!!====================================================================== 
     130! 
    120131!----------------------------------------------------------------------- 
    121132&namsbc        !   Surface Boundary Condition (surface module) 
    122133!----------------------------------------------------------------------- 
    123134   nn_fsbc     = 5         !  frequency of surface boundary condition computation  
    124                            !               (= the frequency of sea-ice model call) 
    125    ln_ana      = .false.   !  analytical formulation (T => fill namsbc_ana )  
    126    ln_flx      = .false.   !  flux formulation       (T => fill namsbc_flx ) 
    127    ln_blk_clio = .false.   !  CLIO bulk formulation  (T => fill namsbc_clio)  
    128    ln_blk_core = .true.    !  CORE bulk formulation  (T => fill namsbc_core)  
    129    ln_cpl      = .false.   !  Coupled formulation    (T => fill namsbc_cpl ) 
     135                           !     (also = the frequency of sea-ice model call) 
     136   ln_ana      = .false.   !  analytical formulation                    (T => fill namsbc_ana )  
     137   ln_flx      = .false.   !  flux formulation                          (T => fill namsbc_flx ) 
     138   ln_blk_clio = .false.   !  CLIO bulk formulation                     (T => fill namsbc_clio)  
     139   ln_blk_core = .true.    !  CORE bulk formulation                     (T => fill namsbc_core)  
     140   ln_cpl      = .false.   !  Coupled formulation                       (T => fill namsbc_cpl ) 
     141   ln_apr_dyn  = .false.   !  Patm gradient added in ocean & ice Eqs.   (T => fill namsbc_apr ) 
    130142   nn_ice      = 0         !  =0 no ice boundary condition   , 
    131143                           !  =1 use observed ice-cover      , 
    132                            !  =2 ice-model used                             ("key_lim3" or "key_lim2) 
    133    nn_ico_cpl  = 0         !  ice-ocean coupling : =0 each nn_fsbc  
    134                            !                       =1 stresses recomputed each ocean time step ("key_lim3" only) 
    135                            !                       =2 combination of 0 and 1 cases             ("key_lim3" only) 
     144                           !  =2 ice-model used                         ("key_lim3" or "key_lim2) 
    136145   ln_dm2dc    = .false.   !  daily mean to diurnal cycle short wave (qsr) 
    137    ln_rnf      = .false.    !  runoffs (T => fill namsbc_rnf) 
    138    ln_ssr      = .true.    !  Sea Surface Restoring on T and/or S (T => fill namsbc_ssr) 
     146   ln_rnf      = .false.   !  runoffs                                  (T => fill namsbc_rnf) 
     147   ln_ssr      = .true.    !  Sea Surface Restoring on T and/or S       (T => fill namsbc_ssr) 
    139148   nn_fwb      = 0         !  FreshWater Budget: =0 unchecked  
    140                            !                     =1 global mean of e-p-r set to zero at each time step  
    141                            !                     =2 annual global mean of e-p-r set to zero 
    142                            !                     =3 global emp set to zero and spread out over erp area 
     149                           !     =1 global mean of e-p-r set to zero at each time step  
     150                           !     =2 annual global mean of e-p-r set to zero 
     151                           !     =3 global emp set to zero and spread out over erp area 
    143152/ 
    144153!----------------------------------------------------------------------- 
     
    148157   rn_utau0    =   0.5     !  uniform value for the i-stress 
    149158   rn_vtau0    =   0.e0    !  uniform value for the j-stress 
    150    rn_q     =   0.e0    !  uniform value for the total heat flux 
     159   rn_qns0     =   0.e0    !  uniform value for the total heat flux 
    151160   rn_qsr0     =   0.e0    !  uniform value for the solar radiation 
    152161   rn_emp0     =   0.e0    !  uniform value for the freswater budget (E-P) 
     
    155164&namsbc_flx    !   surface boundary condition : flux formulation 
    156165!----------------------------------------------------------------------- 
    157 !              !   file name  ! frequency (hours) !  variable  ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    158 !              !              !  (if <0  months)  !    name    !    (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    159    sn_utau     = 'utau'       ,        24         ,    'utau'  ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    160    sn_vtau     = 'vtau'       ,        24         ,    'vtau'  ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    161    sn_qtot     = 'qtot'       ,        24         ,    'qtot'  ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    162    sn_qsr      = 'qsr'        ,        24         ,    'qsr'   ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    163    sn_emp      = 'emp'        ,        24         ,    'emp'   ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    164 ! 
     166!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     167!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     168   sn_utau     = 'utau'      ,        24         , 'utau'    , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     169   sn_vtau     = 'vtau'      ,        24         , 'vtau'    , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     170   sn_qtot     = 'qtot'      ,        24         , 'qtot'    , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     171   sn_qsr      = 'qsr'       ,        24         , 'qsr'     , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     172   sn_emp      = 'emp'       ,        24         , 'emp'     , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     173 
    165174   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the flux files 
    166175/       
     
    168177&namsbc_clio   !   namsbc_clio  CLIO bulk formulea 
    169178!----------------------------------------------------------------------- 
    170 !              !   file name  ! frequency (hours) !  variable  ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    171 !              !              !  (if <0  months)  !    name    !    (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    172    sn_utau     = 'taux_1m'    ,       -1          , 'sozotaux' ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    173    sn_vtau     = 'tauy_1m'    ,       -1          , 'sometauy' ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    174    sn_wndm     = 'flx'        ,       -1          , 'socliowi' ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    175    sn_tair     = 'flx'        ,       -1          , 'socliot2' ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    176    sn_humi     = 'flx'        ,       -1          , 'socliohu' ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    177    sn_ccov     = 'flx'        ,       -1          , 'socliocl' ,    .false.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    178    sn_prec     = 'flx'        ,       -1          , 'socliopl' ,    .false.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    179 ! 
     179!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     180!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     181   sn_utau     = 'taux_1m'   ,       -1          , 'sozotaux',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     182   sn_vtau     = 'tauy_1m'   ,       -1          , 'sometauy',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     183   sn_wndm     = 'flx'       ,       -1          , 'socliowi',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     184   sn_tair     = 'flx'       ,       -1          , 'socliot2',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     185   sn_humi     = 'flx'       ,       -1          , 'socliohu',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     186   sn_ccov     = 'flx'       ,       -1          , 'socliocl',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     187   sn_prec     = 'flx'       ,       -1          , 'socliopl',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     188 
    180189   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the bulk files are 
    181190/ 
     
    183192&namsbc_core   !   namsbc_core  CORE bulk formulea 
    184193!----------------------------------------------------------------------- 
    185 !              !   file name      ! frequency (hours) ! variable   ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    186 !              !                  !  (if <0  months)  !   name     !    (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    187    sn_wndi     = 'u10_1988'       ,       24          , 'u10'      ,    .true.      , .true. ,   'yearly' , '' 
    188    sn_wndj     = 'v10_1988'       ,       24          , 'v10'      ,    .true.      , .true. ,   'yearly' , '' 
    189    sn_qsr      = 'radsw_1988'     ,       24          , 'radsw'    ,    .true.      , .true. ,   'yearly' , '' 
    190    sn_qlw      = 'radlw_1988'     ,       24          , 'radlw'    ,    .true.      , .true. ,   'yearly' , '' 
    191    sn_tair     = 't2_1988.nc'     ,       24          , 't2'       ,    .true.      , .true. ,   'yearly' , '' 
    192    sn_humi     = 'q2_1988'        ,       24          , 'q2'       ,    .true.      , .true. ,   'yearly' , '' 
    193    sn_prec     = 'precip_1988.nc' ,       -1          , 'precip'   ,    .true.      , .true. ,   'yearly' , '' 
    194    sn_snow     = 'precip_1988.nc' ,       -1          , 'precip'   ,    .true.      , .true. ,   'yearly' , '' 
    195    sn_tdif     = 'taudif_core'    ,       24          , 'taudif'   ,    .true.      , .true.  ,   'yearly'  ,'' 
    196 ! 
     194!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     195!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     196   sn_wndi = 'u_10.15JUNE2009_orca2'       ,  6  , 'U_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , 'Uwnd' 
     197   sn_wndj = 'v_10.15JUNE2009_orca2'       ,  6  , 'V_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , 'Vwnd' 
     198   sn_qsr  = 'ncar_rad.15JUNE2009_orca2'   , 24  , 'SWDN_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''      , '' 
     199   sn_qlw  = 'ncar_rad.15JUNE2009_orca2'   , 24  , 'LWDN_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''      , '' 
     200   sn_tair = 't_10.15JUNE2009_orca2'       ,  6  , 'T_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''      , '' 
     201   sn_humi = 'q_10.15JUNE2009_orca2'       ,  6  , 'Q_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''      , '' 
     202   sn_prec = 'ncar_precip.15JUNE2009_orca2', -1  , 'PRC_MOD1',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''      , '' 
     203   sn_snow = 'ncar_precip.15JUNE2009_orca2', -1  , 'SNOW'    ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''      , '' 
     204   sn_tdif = 'taudif_core'                 , 24  , 'taudif'  ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     205 
    197206   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the bulk files 
    198207   ln_2m       = .false.   !  air temperature and humidity referenced at 2m (T) instead 10m (F) 
     
    201210/ 
    202211!----------------------------------------------------------------------- 
    203 &namsbc_cpl    !   coupled ocean/atmosphere model                        ("key_coupled") 
    204 !----------------------------------------------------------------------- 
    205                                        ! send 
    206 cn_snd_temperature= 'weighted oce and ice'  ! 'oce only' 'weighted oce and ice' 'mixed oce-ice' 
    207 cn_snd_albedo     = 'weighted ice'          ! 'none' 'weighted ice' 'mixed oce-ice' 
    208 cn_snd_thickness  = 'none'                  ! 'none' 'weighted ice and snow' 
    209 cn_snd_crt_nature = 'none'                  ! 'none' 'oce only' 'weighted oce and ice' 'mixed oce-ice' 
    210 cn_snd_crt_refere = 'spherical'             ! 'spherical' 'cartesian' 
    211 cn_snd_crt_orient = 'eastward-northward'    ! 'eastward-northward' or 'local grid' 
    212 cn_snd_crt_grid   = 'T'                     ! 'T' 
    213                                        ! receive 
    214 cn_rcv_w10m       = 'none'                  ! 'none' 'coupled' 
    215 cn_rcv_taumod     = 'coupled'               ! 'none' 'coupled' 
    216 cn_rcv_tau_nature = 'oce only'              ! 'oce only' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
    217 cn_rcv_tau_refere = 'cartesian'             ! 'spherical' 'cartesian' 
    218 cn_rcv_tau_orient = 'eastward-northward'    ! 'eastward-northward' or 'local grid' 
    219 cn_rcv_tau_grid   = 'U,V'                   ! 'T' 'U,V' 'U,V,F' 'U,V,I' 'T,F' 'T,I' 'T,U,V' 
    220 cn_rcv_dqnsdt     = 'coupled'               ! 'none' 'coupled' 
    221 cn_rcv_qsr        = 'oce and ice'           ! 'conservative' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
    222 cn_rcv_qns        = 'oce and ice'           ! 'conservative' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
    223 cn_rcv_emp        = 'conservative'          ! 'conservative' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
    224 cn_rcv_rnf        = 'coupled'               ! 'coupled' 'climato' 'mixed' 
    225 cn_rcv_cal        = 'coupled'               ! 'none' 'coupled' 
    226 / 
    227 !----------------------------------------------------------------------- 
    228 &namsbc_cpl_co2   !   coupled ocean/biogeo/atmosphere model            ("key_cpl_carbon_cycle") 
     212&namsbc_cpl    !   coupled ocean/atmosphere model                       ("key_coupled") 
     213!----------------------------------------------------------------------- 
     214!                                      ! send 
     215cn_snd_temperature= 'weighted oce and ice'  !  'oce only' 'weighted oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     216cn_snd_albedo     = 'weighted ice'          !  'none' 'weighted ice' 'mixed oce-ice' 
     217cn_snd_thickness  = 'none'                  !  'none' 'weighted ice and snow' 
     218cn_snd_crt_nature = 'none'                  !  'none' 'oce only' 'weighted oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     219cn_snd_crt_refere = 'spherical'             !  'spherical' 'cartesian' 
     220cn_snd_crt_orient = 'eastward-northward'    !  'eastward-northward' or 'local grid' 
     221cn_snd_crt_grid   = 'T'                     !  'T' 
     222!                                      ! receive 
     223cn_rcv_w10m       = 'none'                  !  'none' 'coupled' 
     224cn_rcv_taumod     = 'coupled'               !  'none' 'coupled' 
     225cn_rcv_tau_nature = 'oce only'              !  'oce only' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     226cn_rcv_tau_refere = 'cartesian'             !  'spherical' 'cartesian' 
     227cn_rcv_tau_orient = 'eastward-northward'    !  'eastward-northward' or 'local grid' 
     228cn_rcv_tau_grid   = 'U,V'                   !  'T' 'U,V' 'U,V,F' 'U,V,I' 'T,F' 'T,I' 'T,U,V' 
     229cn_rcv_dqnsdt     = 'coupled'               !  'none' 'coupled' 
     230cn_rcv_qsr        = 'oce and ice'           !  'conservative' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     231cn_rcv_qns        = 'oce and ice'           !  'conservative' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     232cn_rcv_emp        = 'conservative'          !  'conservative' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     233cn_rcv_rnf        = 'coupled'               !  'coupled' 'climato' 'mixed' 
     234cn_rcv_cal        = 'coupled'               !  'none' 'coupled' 
     235/ 
     236!----------------------------------------------------------------------- 
     237&namsbc_cpl_co2   !   coupled ocean/biogeo/atmosphere model             ("key_cpl_carbon_cycle") 
    229238!----------------------------------------------------------------------- 
    230239cn_snd_co2        = 'coupled'         ! send    :  'none' 'coupled' 
     
    234243&namtra_qsr    !   penetrative solar radiation 
    235244!----------------------------------------------------------------------- 
    236 !              !   file name  ! frequency (hours) ! variable   ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    237 !              !              !  (if <0  months)  !   name     !    (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    238    sn_chl      = 'chlorophyll',        -1         , 'CHLA'     ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     245!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     246!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     247   sn_chl      ='chlorophyll',        -1         , 'CHLA'    ,   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    239248  
    240249   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
     
    251260&namsbc_rnf    !   runoffs namelist surface boundary condition 
    252261!----------------------------------------------------------------------- 
    253 !              !   file name  ! frequency (hours) ! variable   ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    254 !              !              !  (if <0  months)  !   name     !    (logical)   !  (T/F)  ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    255    sn_rnf      = 'runoff_1m_nomask' ,  -1         , 'sorunoff' ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  , ''       , '' 
    256    sn_cnf      = 'runoff_1m_nomask' ,   0         , 'socoefr'  ,    .false.     , .true.  , 'yearly'  , ''       , '' 
    257    sn_s_rnf    = 'runoffs'          ,  24         , 'rosaline' ,    .true.      , .true.  ,   'yearly', ''       , '' 
    258    sn_t_rnf    = 'runoffs'          ,  24         , 'rotemper' ,    .true.      , .true.  ,   'yearly', ''       , '' 
    259    sn_dep_rnf  = 'runoffs'          ,   0         , 'rodepth'  ,    .false.     , .true.  ,   'yearly', ''       , '' 
     262!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     263!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     264   sn_rnf      = 'runoff_1m_nomask' ,  -1        , 'sorunoff',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     265   sn_cnf      = 'runoff_1m_nomask' ,   0        , 'socoefr' ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     266   sn_s_rnf    = 'runoffs'          ,  24        , 'rosaline',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     267   sn_t_rnf    = 'runoffs'          ,  24        , 'rotemper',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     268   sn_dep_rnf  = 'runoffs'          ,   0        , 'rodepth' ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     269 
    260270   cn_dir       = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
    261271   ln_rnf_emp   =   .false. !  runoffs included into precipitation field (T) or into a file (F) 
    262272   ln_rnf_mouth =   .false. !  specific treatment at rivers mouths 
    263    rn_hrnf      =  0.e0    !  depth over which enhanced vertical mixing is used 
     273   rn_hrnf      =  15.e0    !  depth over which enhanced vertical mixing is used 
    264274   rn_avt_rnf   =   1.e-3   !  value of the additional vertical mixing coef. [m2/s] 
    265275   rn_rfact     =   1.e0    !  multiplicative factor for runoff 
     
    269279/ 
    270280!----------------------------------------------------------------------- 
     281&namsbc_apr    !   Atmospheric pressure used as ocean forcing or in bulk 
     282!----------------------------------------------------------------------- 
     283!              ! file name ! frequency (hours) ! variable ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     284!              !           !  (if <0  months)  !   name   !    (logical)   !  (T/F)  ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     285   sn_apr      = 'patm'    ,         -1        ,'somslpre',    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,  ''      ,   '' 
     286 
     287   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the bulk files 
     288   ln_ref_apr  = .false.   !  ref. pressure: global mean Patm (T) or a constant (F) 
     289/ 
     290!----------------------------------------------------------------------- 
    271291&namsbc_ssr    !   surface boundary condition : sea surface restoring 
    272292!----------------------------------------------------------------------- 
    273 !              !   file name  ! frequency (hours) ! variable   ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    274 !              !              !  (if <0  months)  !   name     !    (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    275    sn_sst      = 'sst_data'   ,        24         ,  'sst'     ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    276    sn_sss      = 'sss_1m'     ,        -1         ,  'vosaline',     .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    277      
     293!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     294!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     295   sn_sst      = 'sst_data'  ,        24         , 'sst'     ,    .false.   , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     296   sn_sss      = 'sss_1m'    ,        -1         , 'vosaline',    .true.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     297 
    278298   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
    279299   nn_sstr     =     0     !  add a retroaction term in the surface heat       flux (=1) or not (=0) 
     
    294314   rn_alphdi   =    0.72   !  (Pyane, 1972) 
    295315/ 
    296 !----------------------------------------------------------------------- 
    297 &namdta_tem    !   surface boundary condition : sea surface restoring 
    298 !----------------------------------------------------------------------- 
    299 !              !     file name                  ! frequency (hours) ! variable   ! time interpol. !  clim   !'yearly' or ! weights  ! rotation ! 
    300 !              !                                !  (if <0  months)  !   name     !    (logical)   !  (T/F)  ! 'monthly'  ! filename ! pairing  ! 
    301   sn_tem       = 'data_1m_potential_temperature_nomask',  -1        , 'votemper' ,     .true.     , .true.  , 'yearly'   , ' '      , ' ' 
    302 ! 
    303   cn_dir       = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
    304 / 
    305 !----------------------------------------------------------------------- 
    306 &namdta_sal    !   surface boundary condition : sea surface restoring 
    307 !----------------------------------------------------------------------- 
    308 !              !     file name                  ! frequency (hours) ! variable   ! time interpol. !  clim   ! 'yearly' or ! weights  ! rotation ! 
    309 !              !                                !  (if <0  months)  !   name     !    (logical)   !  (T/F)  !  'monthly'  ! filename ! pairing  ! 
    310    sn_sal      =  'data_1m_salinity_nomask'     ,         -1        , 'vosaline' ,     .true.     , .true.  , 'yearly'    , ''       , ' ' 
    311 ! 
    312    cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
    313 / 
    314316 
    315317!!====================================================================== 
     
    323325!!   namtide       Tidal forcing at open boundaries                     ("key_bdy_tides") 
    324326!!====================================================================== 
    325  
     327! 
    326328!----------------------------------------------------------------------- 
    327329&namlbc        !   lateral momentum boundary condition 
     
    338340&namobc        !   open boundaries parameters                           ("key_obc") 
    339341!----------------------------------------------------------------------- 
    340     ln_obc_clim= .false.   !  climatological obc data files (T) or not (F) 
    341     ln_vol_cst = .false.    !  impose the total volume conservation (T) or not (F) 
    342     ln_obc_fla = .false.   !  Flather open boundary condition  
    343     nn_obcdta  =    1      !  = 0 the obc data are equal to the initial state 
     342   ln_obc_clim = .false.   !  climatological obc data files (T) or not (F) 
     343   ln_vol_cst  = .false.   !  impose the total volume conservation (T) or not (F) 
     344   ln_obc_fla = .false.   !  Flather open boundary condition  
     345   nn_obcdta   =    1      !  = 0 the obc data are equal to the initial state 
    344346                           !  = 1 the obc data are read in 'obc.dta' files 
    345     cn_obcdta  = 'annual'  !  set to annual if obc datafile hold 1 year of data 
     347   cn_obcdta   = 'annual'  !  set to annual if obc datafile hold 1 year of data 
    346348                           !  set to monthly if obc datafile hold 1 month of data 
    347     rn_dpein   =    1.     !  damping time scale for inflow at east  open boundary 
    348     rn_dpwin   =    1.     !     -           -         -       west    -      - 
    349     rn_dpnin   =   30.     !     -           -         -       north   -      - 
    350     rn_dpsin   =    1.     !     -           -         -       south   -      - 
    351     rn_dpeob   = 1500.     !  time relaxation (days) for the east  open boundary 
    352     rn_dpwob   =  150.     !     -           -         -     west    -      - 
    353     rn_dpnob   =  150.     !     -           -         -     north   -      - 
    354     rn_dpsob   =  150.     !     -           -         -     south   -      - 
    355     rn_volemp  =  1.       !  = 0 the total volume change with the surface flux (E-P-R) 
     349   rn_dpein    =    1.     !  damping time scale for inflow at east  open boundary 
     350   rn_dpwin    =    1.     !     -           -         -       west    -      - 
     351   rn_dpnin    =   30.     !     -           -         -       north   -      - 
     352   rn_dpsin    =    1.     !     -           -         -       south   -      - 
     353   rn_dpeob    = 1500.     !  time relaxation (days) for the east  open boundary 
     354   rn_dpwob    =  150.     !     -           -         -     west    -      - 
     355   rn_dpnob    =  150.     !     -           -         -     north   -      - 
     356   rn_dpsob    =  150.     !     -           -         -     south   -      - 
     357   rn_volemp   =  1.       !  = 0 the total volume change with the surface flux (E-P-R) 
    356358                           !  = 1 the total volume remains constant 
    357359/ 
     
    367369&nambdy        !  unstructured open boundaries                          ("key_bdy") 
    368370!----------------------------------------------------------------------- 
    369     cn_mask    =  ''                        !  name of mask file (if ln_bdy_mask=.TRUE.) 
    370     cn_dta_frs_T  = 'bdydata_grid_T.nc'     !  name of data file (T-points) 
    371     cn_dta_frs_U  = 'bdydata_grid_U.nc'     !  name of data file (U-points) 
    372     cn_dta_frs_V  = 'bdydata_grid_V.nc'     !  name of data file (V-points) 
    373     cn_dta_fla_T  = 'bdydata_bt_grid_T.nc'  !  name of data file for Flather condition (T-points) 
    374     cn_dta_fla_U  = 'bdydata_bt_grid_U.nc'  !  name of data file for Flather condition (U-points) 
    375     cn_dta_fla_V  = 'bdydata_bt_grid_V.nc'  !  name of data file for Flather condition (V-points) 
    376     ln_clim    = .false.                    !  contain 1 (T) or 12 (F) time dumps and be cyclic 
    377     ln_vol     = .false.                    !  total volume correction (see volbdy parameter) 
    378     ln_mask    = .false.                    !  boundary mask from filbdy_mask (T) or boundaries are on edges of domain (F) 
    379     ln_tides   = .false.                    !  Apply tidal harmonic forcing with Flather condition 
    380     ln_dyn_fla = .false.                    !  Apply Flather condition to velocities 
    381     ln_tra_frs = .false.                    !  Apply FRS condition to temperature and salinity  
    382     ln_dyn_frs = .false.                    !  Apply FRS condition to velocities 
    383     nn_rimwidth    =  9                     !  width of the relaxation zone 
    384     nn_dtactl      =  1                     !  = 0, bdy data are equal to the initial state 
    385                                             !  = 1, bdy data are read in 'bdydata   .nc' files 
    386     nn_volctl      =  0                     !  = 0, the total water flux across open boundaries is zero 
    387                                             !  = 1, the total volume of the system is conserved 
    388 / 
    389 !----------------------------------------------------------------------- 
    390 &nambdy_tide     ! tidal forcing at unstructured boundaries               
    391 !----------------------------------------------------------------------- 
    392     filtide      = 'bdytide_'           !  file name root of tidal forcing files 
    393     tide_cpt     = 'M2','S1'            !  names of tidal components used 
    394     tide_speed   = 28.984106, 15.000001 !  phase speeds of tidal components (deg/hour) 
    395     ln_tide_date = .false.              !  adjust tidal harmonics for start date of run 
     371   cn_mask       =  ''                     !  name of mask file (if ln_bdy_mask=.TRUE.) 
     372   cn_dta_frs_T  = 'bdydata_grid_T.nc'     !  name of data file (T-points) 
     373   cn_dta_frs_U  = 'bdydata_grid_U.nc'     !  name of data file (U-points) 
     374   cn_dta_frs_V  = 'bdydata_grid_V.nc'     !  name of data file (V-points) 
     375   cn_dta_fla_T  = 'bdydata_bt_grid_T.nc'  !  name of data file for Flather condition (T-points) 
     376   cn_dta_fla_U  = 'bdydata_bt_grid_U.nc'  !  name of data file for Flather condition (U-points) 
     377   cn_dta_fla_V  = 'bdydata_bt_grid_V.nc'  !  name of data file for Flather condition (V-points) 
     378 
     379   ln_clim     = .false.   !  contain 1 (T) or 12 (F) time dumps and be cyclic 
     380   ln_vol      = .false.   !  total volume correction (see volbdy parameter) 
     381   ln_mask     = .false.   !  boundary mask from filbdy_mask (T), boundaries are on edges of domain (F) 
     382   ln_tides    = .false.   !  Apply tidal harmonic forcing with Flather condition 
     383   ln_dyn_fla  = .false.   !  Apply Flather condition to velocities 
     384   ln_tra_frs  = .false.   !  Apply FRS condition to temperature and salinity  
     385   ln_dyn_frs  = .false.   !  Apply FRS condition to velocities 
     386   nn_rimwidth =  9        !  width of the relaxation zone 
     387   nn_dtactl   =  1        !  = 0, bdy data are equal to the initial state 
     388                           !  = 1, bdy data are read in 'bdydata   .nc' files 
     389   nn_volctl   =  0        !  = 0, the total water flux across open boundaries is zero 
     390                           !  = 1, the total volume of the system is conserved 
     391/ 
     392!----------------------------------------------------------------------- 
     393&nambdy_tide   !  tidal forcing at unstructured boundaries               
     394!----------------------------------------------------------------------- 
     395   filtide     = 'bdytide_'           !  file name root of tidal forcing files 
     396   tide_cpt    = 'M2','S1'            !  names of tidal components used 
     397   tide_speed  = 28.984106, 15.000001 !  phase speeds of tidal components (deg/hour) 
     398   ln_tide_date= .false.              !  adjust tidal harmonics for start date of run 
    396399/ 
    397400 
     
    400403!!====================================================================== 
    401404!!   nambfr        bottom friction 
    402 !!   nambbc        bottom temperature boundary condition                 
     405!!   nambbc        bottom temperature boundary condition                
    403406!!   nambbl        bottom boundary layer scheme                         ("key_trabbl") 
    404407!!====================================================================== 
    405  
     408! 
    406409!----------------------------------------------------------------------- 
    407410&nambfr        !   bottom friction 
    408411!----------------------------------------------------------------------- 
    409    nn_bfr      =    2      !  type of bottom friction :   = 0 : no   slip,  = 2 : nonlinear friction 
    410                            !                              = 3 : free slip,  = 1 :    linear friction 
     412   nn_bfr      =    2      !  type of bottom friction :   = 0 : free slip,  = 1 : linear friction 
     413                           !                              = 2 : nonlinear friction 
    411414   rn_bfri1    =    4.e-4  !  bottom drag coefficient (linear case) 
    412415   rn_bfri2    =    1.e-3  !  bottom drag coefficient (non linear case) 
    413416   rn_bfeb2    =    2.5e-3 !  bottom turbulent kinetic energy background  (m^2/s^2) 
     417   ln_bfr2d    =   .false. !  horizontal variation of the bottom friction coef (read a 2D mask file ) 
     418   rn_bfrien   =    50.    !  local multiplying factor of bfr (ln_bfr2d = .true.) 
    414419/ 
    415420!----------------------------------------------------------------------- 
     
    425430&nambbl        !   bottom boundary layer scheme 
    426431!----------------------------------------------------------------------- 
    427 !                          !  diffusive bbl                             ("key_trabbl") 
    428 !                          !  advective bbl                             ("key_trabbl_adv") 
    429    rn_ahtbbl   =  10000.   !  lateral mixing coefficient in the bbl  [m2/s] 
    430 / 
     432   nn_bbl_ldf  =  1      !  diffusive bbl (=1)   or not (=0) 
     433   nn_bbl_adv  =  0      !  advective bbl (=1/2) or not (=0) 
     434   rn_ahtbbl   =  1000.  !  lateral mixing coefficient in the bbl  [m2/s] 
     435   rn_gambbl   =  10.    !  advective bbl coefficient                 [s] 
     436/ 
     437 
    431438!!====================================================================== 
    432439!!                        Tracer (T & S ) namelists 
     
    437444!!   namtra_dmp    T & S newtonian damping                              ("key_tradmp") 
    438445!!====================================================================== 
    439  
     446! 
    440447!----------------------------------------------------------------------- 
    441448&nameos        !   ocean physical parameters 
     
    456463   ln_traadv_muscl2 =  .false.  !  MUSCL2 scheme + cen2 at boundaries   
    457464   ln_traadv_ubs    =  .false.  !  UBS scheme                  
     465   ln_traadv_qck    =  .false.  !  QUCIKEST scheme                  
    458466/ 
    459467!----------------------------------------------------------------------- 
    460468&namtra_ldf    !   lateral diffusion scheme for tracer  
    461469!----------------------------------------------------------------------- 
    462                            !  Type of the operator :  
    463    ln_traldf_lap    =  .true.   !     laplacian operator        
    464    ln_traldf_bilap  =  .false.  !     bilaplacian operator      
    465                            !  Direction of action  : 
    466    ln_traldf_level  =  .false.  !     iso-level                 
    467    ln_traldf_hor    =  .false.  !     horizontal (geopotential)         (require "key_ldfslp" when ln_sco=T) 
    468    ln_traldf_iso    =  .true.   !     iso-neutral                       (require "key_ldfslp") 
    469    ln_traldf_grif   =  .false.  !     griffies skew flux formulation    (require "key_ldfslp")   ! UNDER TEST, DO NOT USE 
    470    ln_traldf_gdia   =  .false.  !     griffies operator strfn diagnostics (require "key_ldfslp") ! UNDER TEST, DO NOT USE 
    471                            !  Coefficient 
    472    rn_aht_0         =   300.    !     horizontal eddy diffusivity for tracers [m2/s] 
    473    rn_ahtb_0        =     0.    !     background eddy diffusivity for ldf_iso [m2/s] 
    474    rn_aeiv_0        =     0.    !     eddy induced velocity coefficient [m2/s]    (require "key_traldf_eiv") 
     470   !                       !  Type of the operator :  
     471   ln_traldf_lap    =  .true.   !  laplacian operator        
     472   ln_traldf_bilap  =  .false.  !  bilaplacian operator      
     473   !                       !  Direction of action  : 
     474   ln_traldf_level  =  .false.  !  iso-level                 
     475   ln_traldf_hor    =  .false.  !  horizontal (geopotential)            (require "key_ldfslp" when ln_sco=T) 
     476   ln_traldf_iso    =  .true.   !  iso-neutral                          (require "key_ldfslp") 
     477   ln_traldf_grif   =  .false.  !  griffies skew flux formulation       (require "key_ldfslp")  ! UNDER TEST, DO NOT USE 
     478   ln_traldf_gdia   =  .false.  !  griffies operator strfn diagnostics  (require "key_ldfslp") ! UNDER TEST, DO NOT USE 
     479   !                       !  Coefficient 
     480   rn_aht_0         =   300.    !  horizontal eddy diffusivity for tracers [m2/s] 
     481   rn_ahtb_0        =     0.    !  background eddy diffusivity for ldf_iso [m2/s] 
     482   rn_aeiv_0        =     0.    !  eddy induced velocity coefficient [m2/s]    (require "key_traldf_eiv") 
    475483/ 
    476484!----------------------------------------------------------------------- 
    477485&namtra_dmp    !   tracer: T & S newtonian damping                      ('key_tradmp') 
    478486!----------------------------------------------------------------------- 
    479    nn_hdmp     =   1       !  horizontal shape =-1, damping in Med and Red Seas only 
     487   nn_hdmp     =    1      !  horizontal shape =-1, damping in Med and Red Seas only 
    480488                           !                   =XX, damping poleward of XX degrees (XX>0) 
    481489                           !                      + F(distance-to-coast) + Red and Med Seas 
     
    488496   nn_file     =    0      !  create a damping.coeff NetCDF file (=1) or not (=0) 
    489497/ 
     498 
    490499!!====================================================================== 
    491500!!                      ***  Dynamics namelists  *** 
     
    497506!!   namdyn_ldf    lateral diffusion scheme 
    498507!!====================================================================== 
    499  
     508! 
    500509!----------------------------------------------------------------------- 
    501510&namdyn_adv    !   formulation of the momentum advection 
     
    538547&namdyn_ldf    !   lateral diffusion on momentum 
    539548!----------------------------------------------------------------------- 
    540                            !  Type of the operator :  
     549   !                       !  Type of the operator :  
    541550   ln_dynldf_lap    =  .false.  !  laplacian operator          
    542551   ln_dynldf_bilap  =  .true.  !  bilaplacian operator     
    543                            !  Direction of action  :  
     552   !                       !  Direction of action  :  
    544553   ln_dynldf_level  =  .false.  !  iso-level                
    545554   ln_dynldf_hor    =  .true.   !  horizontal (geopotential)            (require "key_ldfslp" in s-coord.) 
    546555   ln_dynldf_iso    =  .false.  !  iso-neutral                          (require "key_ldfslp") 
    547                            !  Coefficient 
     556   !                       !  Coefficient 
    548557   rn_ahm_0_lap     =     0.    !  horizontal laplacian eddy viscosity   [m2/s] 
    549558   rn_ahmb_0        =    500.   !  background eddy viscosity for ldf_iso [m2/s] 
    550559   rn_ahm_0_blp     = -1.5e11   !  horizontal bilaplacian eddy viscosity [m4/s] 
    551560/ 
     561 
    552562!!====================================================================== 
    553563!!             Tracers & Dynamics vertical physics namelists 
    554564!!====================================================================== 
    555 !!       namzdf        vertical physics 
    556 !!       namzdf_ric    richardson number dependent vertical mixing      ("key_zdfric"      ) 
    557 !!       namzdf_tke    TKE dependent vertical mixing                    ("key_zdftke"      ) 
    558 !!       namzdf_kpp    KPP dependent vertical mixing                    ("key_zdfkpp"      ) 
    559 !!       namzdf_ddm    double diffusive mixing parameterization         ("key_zdfddm"      ) 
    560 !!       namzdf_tmx    tidal mixing parameterization                    ("key_zdftmx"      ) 
    561 !!====================================================================== 
    562  
     565!!    namzdf        vertical physics 
     566!!    namzdf_ric    richardson number dependent vertical mixing         ("key_zdfric") 
     567!!    namzdf_tke    TKE dependent vertical mixing                       ("key_zdftke") 
     568!!    namzdf_kpp    KPP dependent vertical mixing                       ("key_zdfkpp") 
     569!!    namzdf_ddm    double diffusive mixing parameterization            ("key_zdfddm") 
     570!!    namzdf_tmx    tidal mixing parameterization                       ("key_zdftmx") 
     571!!====================================================================== 
     572! 
    563573!----------------------------------------------------------------------- 
    564574&namzdf        !   vertical physics 
     
    589599   rn_ediff    =   0.1     !  coef. for vertical eddy coef. (avt=rn_ediff*mxl*sqrt(e) ) 
    590600   rn_ediss    =   0.7     !  coef. of the Kolmogoroff dissipation 
    591    rn_ebb      =   3.75    !  coef. of the surface input of tke 
     601   rn_ebb      =  67.83    !  coef. of the surface input of tke (=67.83 suggested when ln_mxl0=T) 
    592602   rn_emin     =   1.e-6   !  minimum value of tke [m2/s2] 
    593603   rn_emin0    =   1.e-4   !  surface minimum value of tke [m2/s2] 
    594    rn_bshear   =   1.e-20  !  background shear (>0) 
    595    nn_mxl      =   3       !  mixing length: = 0 bounded by the distance to surface and bottom 
     604   nn_mxl      =   2       !  mixing length: = 0 bounded by the distance to surface and bottom 
    596605                           !                 = 1 bounded by the local vertical scale factor 
    597606                           !                 = 2 first vertical derivative of mixing length bounded by 1 
    598                            !                 = 3 same criteria as case 2 but applied in a different way 
     607                           !                 = 3 as =2 with distinct disspipative an mixing length scale 
    599608   nn_pdl      =   1       !  Prandtl number function of richarson number (=1, avt=pdl(Ri)*avm) or not (=0, avt=avm) 
    600    ln_mxl0     = .false.   !  mixing length scale surface value as function of wind stress (T) or not (F) 
    601    rn_lmin     =   0.4     !  interior buoyancy lenght scale minimum value 
    602    rn_lmin0    =   0.4     !  surface  buoyancy lenght scale minimum value 
    603    nn_etau     =   0       !  exponentially deceasing penetration of tke due to internal & intertial waves 
    604                            !        = 0 no penetration ( O(2 km) resolution) 
    605                            !        = 1 additional tke source (rn_efr * en) 
    606                            !        = 2 additional tke source (rn_efr * en) applied only at the base of the mixed layer 
    607                            !        = 3 additional tke source (HF contribution: mean of stress module - module of mean stress) 
    608    nn_htau     =   1       !  type of exponential decrease of tke penetration 
     609   ln_mxl0     = .true.    !  surface mixing length scale = F(wind stress) (T) or not (F) 
     610   rn_mxl0     =   0.04    !  surface  buoyancy lenght scale minimum value 
     611   ln_lc       = .true.    !  Langmuir cell parameterisation (Axell 2002) 
     612   rn_lc       =   0.15    !  coef. associated to Langmuir cells 
     613   nn_etau     =   1       !  penetration of tke below the mixed layer (ML) due to internal & intertial waves 
     614                           !        = 0 no penetration 
     615                           !        = 1 add a tke source below the ML 
     616                           !        = 2 add a tke source just at the base of the ML 
     617                           !        = 3 as = 1 applied on HF part of the stress    ("key_coupled") 
     618   rn_efr      =   0.05    !  fraction of surface tke value which penetrates below the ML (nn_etau=1 or 2) 
     619   nn_htau     =   1       !  type of exponential decrease of tke penetration below the ML 
    609620                           !        = 0  constant 10 m length scale 
    610                            !        = 1  0.5m at the equator to 30m at high latitudes 
    611                            !        = 2  30 meters constant depth penetration 
    612                            !  otion used only if nn_etau = 1 or 2:  
    613    rn_efr      =   0.05    !     fraction of surface tke value which penetrates inside the ocean 
    614                            !  otion used only if nn_etau = 3: 
    615    rn_addhft   =  -1.e-3   !     add offset   applied to the "mean of stress module - module of mean stress" (always kept > 0) 
    616    rn_sclhft   =   1.      !     scale factor applied to the "mean of stress module - module of mean stress" 
    617    ln_lc       = .false.   !  Langmuir cell parameterisation 
    618    rn_lc       =   0.15    !  coef. associated to Langmuir cells 
     621                           !        = 1  0.5m at the equator to 30m poleward of 40 degrees 
    619622/ 
    620623!------------------------------------------------------------------------ 
     
    632635/ 
    633636!----------------------------------------------------------------------- 
    634 &namzdf_gls                !   GLS vertical diffusion  ("key_zdfgls") 
    635 !----------------------------------------------------------------------- 
    636    rn_emin        = 1.e-6  !  minimum value of e   [m2/s2] 
    637    rn_epsmin      = 1.e-12 !  minimum value of eps [m2/s3] 
    638    ln_length_lim  = .true. !  limit on the dissipation rate under stable stratification (Galperin et al., 1988) 
    639    rn_clim_galp   = 0.53   !  galperin limit 
    640    ln_crban       = .TRUE. !  Use Craig & Banner (1994) surface wave mixing parametrisation 
    641    ln_sigpsi      = .TRUE. !  Activate or not Burchard 2001 mods on psi schmidt number in the wb case 
    642    rn_crban       = 100.   !  Craig and Banner 1994 constant for wb tke flux 
    643    rn_charn       = 70000. !  Charnock constant for wb induced roughness length 
    644    nn_tkebc_surf  =   1    !  surface tke condition (0/1/2=Dir/Neum/Dir Mellor-Blumberg) 
    645    nn_tkebc_bot   =   1    !  bottom tke condition (0/1=Dir/Neum) 
    646    nn_psibc_surf  =   1    !  surface psi condition (0/1/2=Dir/Neum/Dir Mellor-Blumberg) 
    647    nn_psibc_bot   =   1    !  bottom psi condition (0/1=Dir/Neum) 
    648    nn_stab_func   =   2    !  stability function (0=Galp, 1= KC94, 2=CanutoA, 3=CanutoB) 
    649    nn_clos        =   1    !  predefined closure type (0=MY82, 1=k-eps, 2=k-w, 3=Gen) 
     637&namzdf_gls                !   GLS vertical diffusion                   ("key_zdfgls") 
     638!----------------------------------------------------------------------- 
     639   rn_emin       = 1.e-6   !  minimum value of e   [m2/s2] 
     640   rn_epsmin     = 1.e-12 !  minimum value of eps [m2/s3] 
     641   ln_length_lim = .true. !  limit on the dissipation rate under stable stratification (Galperin et al., 1988) 
     642   rn_clim_galp  = 0.53    !  galperin limit 
     643   ln_crban      = .TRUE. !  Use Craig & Banner (1994) surface wave mixing parametrisation 
     644   ln_sigpsi     = .TRUE. !  Activate or not Burchard 2001 mods on psi schmidt number in the wb case 
     645   rn_crban      = 100.    !  Craig and Banner 1994 constant for wb tke flux 
     646   rn_charn      = 70000. !  Charnock constant for wb induced roughness length 
     647   nn_tkebc_surf =   1     !  surface tke condition (0/1/2=Dir/Neum/Dir Mellor-Blumberg) 
     648   nn_tkebc_bot  =   1     !  bottom tke condition (0/1=Dir/Neum) 
     649   nn_psibc_surf =   1     !  surface psi condition (0/1/2=Dir/Neum/Dir Mellor-Blumberg) 
     650   nn_psibc_bot  =   1     !  bottom psi condition (0/1=Dir/Neum) 
     651   nn_stab_func  =   2     !  stability function (0=Galp, 1= KC94, 2=CanutoA, 3=CanutoB) 
     652   nn_clos       =   1     !  predefined closure type (0=MY82, 1=k-eps, 2=k-w, 3=Gen) 
    650653/ 
    651654!----------------------------------------------------------------------- 
     
    665668   rn_tfe_itf  = 1.        !  ITF tidal dissipation efficiency 
    666669/ 
     670 
    667671!!====================================================================== 
    668672!!                  ***  Miscelaneous namelists  *** 
     
    673677!!   namsol            elliptic solver / island / free surface  
    674678!!====================================================================== 
    675  
     679! 
    676680!----------------------------------------------------------------------- 
    677681&namsol        !   elliptic solver / island / free surface  
     
    717721 
    718722!!====================================================================== 
    719 !!                       ***  Diagnostics namelists  *** 
    720 !!====================================================================== 
     723!!                  ***  Diagnostics namelists  *** 
     724!!====================================================================== 
     725!!   namnc4       netcdf4 chunking and compression settings             ("key_netcdf4") 
    721726!!   namtrd       dynamics and/or tracer trends                         ("key_trddyn","key_trdtra","key_trdmld") 
    722 !!   namgap       level mean model-data gap                             ("key_diagap") 
    723727!!   namflo       float parameters                                      ("key_float") 
    724728!!   namptr       Poleward Transport Diagnostics 
    725 !!====================================================================== 
    726  
     729!!   namhsb       Heat and salt budgets  
     730!!====================================================================== 
     731! 
     732!----------------------------------------------------------------------- 
     733&namnc4        !   netcdf4 chunking and compression settings            ("key_netcdf4") 
     734!----------------------------------------------------------------------- 
     735   nn_nchunks_i=   4       !  number of chunks in i-dimension 
     736   nn_nchunks_j=   4       !  number of chunks in j-dimension 
     737   nn_nchunks_k=   31      !  number of chunks in k-dimension 
     738                           !  setting nn_nchunks_k = jpk will give a chunk size of 1 in the vertical which 
     739                           !  is optimal for postprocessing which works exclusively with horizontal slabs 
     740   ln_nc4zip   = .TRUE.    !  (T) use netcdf4 chunking and compression 
     741                           !  (F) ignore chunking information and produce netcdf3-compatible files 
     742/ 
    727743!----------------------------------------------------------------------- 
    728744&namtrd        !   diagnostics on dynamics and/or tracer trends         ("key_trddyn" and/or "key_trdtra") 
    729 !              !       or mixed-layer trends or barotropic vorticity    ('key_trdmld' or  "key_trdvor") 
     745!              !       or mixed-layer trends or barotropic vorticity    ("key_trdmld" or     "key_trdvor") 
    730746!----------------------------------------------------------------------- 
    731747   nn_trd      = 365       !  time step frequency dynamics and tracers trends 
     
    738754/ 
    739755!----------------------------------------------------------------------- 
    740 &namgap       !   level mean model-data gap                             ('key_diagap') 
    741 !----------------------------------------------------------------------- 
    742    nn_gap     =  15        !  time-step frequency of model-data gap computation 
    743    nn_prg     =  10        !  time-step frequency of gap print in model output 
    744 / 
    745 !----------------------------------------------------------------------- 
    746756&namflo       !   float parameters                                      ("key_float") 
    747757!----------------------------------------------------------------------- 
    748     ln_rstflo = .false.    !  float restart (T) or not (F) 
    749     nn_writefl=      75    !  frequency of writing in float output file  
    750     nn_stockfl=    5475    !  frequency of creation of the float restart file  
    751     ln_argo   = .false.    !  Argo type floats (stay at the surface each 10 days) 
    752     ln_flork4 = .false.    !  trajectories computed with a 4th order Runge-Kutta (T) 
     758   ln_rstflo = .false.    !  float restart (T) or not (F) 
     759   nn_writefl =      75    !  frequency of writing in float output file  
     760   nn_stockfl =    5475    !  frequency of creation of the float restart file  
     761   ln_argo    = .false.    !  Argo type floats (stay at the surface each 10 days) 
     762   ln_flork4 = .false.    !  trajectories computed with a 4th order Runge-Kutta (T) 
    753763                           !  or computed with Blanke' scheme (F) 
    754764/ 
     
    765775/ 
    766776!----------------------------------------------------------------------- 
    767 !       namobs    observation usage switch 
    768 !----------------------------------------------------------------------- 
    769 ! 
    770 !  ln_t3d                  Logical switch for T profile observations          
    771 !  ln_s3d                  Logical switch for S profile observations           
    772 !  ln_ena                  Logical switch for ENACT insitu data set            
    773 !  ln_cor                  Logical switch for Coriolis insitu data set        
    774 !  ln_profb                Logical switch for feedback insitu data set      
    775 !  ln_sla                  Logical switch for SLA observations                
    776 !  ln_sladt                Logical switch for AVISO SLA data               
    777 !  ln_slafb                Logical switch for feedback SLA data             
    778 !  ln_ssh                  Logical switch for SSH observations               
    779 !  ln_sst                  Logical switch for SST observations               
    780 !  ln_reysst               Logical switch for Reynolds observations        
    781 !  ln_ghrsst               Logical switch for GHRSST observations           
    782 !  ln_sstfb                Logical switch for feedback SST data           
    783 !  ln_sss                  Logical switch for SSS observations               
    784 !  ln_seaice               Logical switch for Sea Ice observations         
    785 !  ln_vel3d                Logical switch for velocity observations          
    786 !  ln_velavcur             Logical switch for velocity daily av. cur.     
    787 !  ln_velhrcur             Logical switch for velocity high freq. cur.    
    788 !  ln_velavadcp            Logical switch for velocity daily av. ADCP   
    789 !  ln_velhradcp            Logical switch for velocity high freq. ADCP 
    790 !  ln_velfb                Logical switch for feedback velocity data        
    791 !  ln_grid_global          Global distribtion of observations          
    792 !  ln_grid_search_lookup   Logical switch for obs grid search w/lookup table   
    793 !  grid_search_file        Grid search lookup file header  
    794 !  enactfiles              ENACT input observation file names  
    795 !  coriofiles              Coriolis input observation file name   
    796 !  profbfiles              Profile feedback input observation file name  
    797 !  ln_profb_enatim         Enact feedback input time setting switch     
    798 !  slafilesact             Active SLA input observation file name 
    799 !  slafilespas             Passive SLA input observation file name  
    800 !  slafbfiles              Feedback SLA input observation file name  
    801 !  sstfiles                GHRSST input observation file name        
    802 !  sstfbfiles              Feedback SST input observation file name  
    803 !  seaicefiles             Sea Ice input observation file name  
    804 !  velavcurfiles           Vel. cur. daily av. input file name   
    805 !  velhvcurfiles           Vel. cur. high freq. input file name   
    806 !  velavadcpfiles          Vel. ADCP daily av. input file name     
    807 !  velhvadcpfiles          Vel. ADCP high freq. input file name  
    808 !  velfbfiles              Vel. feedback input observation file name  
    809 !  dobsini                 Initial date in window YYYYMMDD.HHMMSS        
    810 !  dobsend                 Final date in window YYYYMMDD.HHMMSS          
    811 !  n1dint                  Type of vertical interpolation method         
    812 !  n2dint                  Type of horizontal interpolation method        
    813 !  ln_nea                  Rejection of observations near land switch     
    814 !  nmsshc                  MSSH correction scheme                          
    815 !  mdtcorr                 MDT  correction                                
    816 !  mdtcutoff               MDT cutoff for computed correction           
    817 !  ln_altbias              Logical switch for alt bias                 
    818 !  ln_ignmis               Logical switch for ignoring missing files    
    819 !  endailyavtypes          ENACT daily average types                     
    820  &namobs 
    821    ln_t3d = .false. 
    822    ln_s3d = .false. 
    823    ln_ena = .false. 
    824    ln_profb = .false. 
    825    ln_sla = .false. 
    826    ln_sladt = .false. 
    827    ln_slafb = .false. 
    828    ln_sst = .false. 
    829    ln_sstfb = .false. 
    830    nmsshc = 0 
     777&namhsb       !  Heat and salt budgets  
     778!----------------------------------------------------------------------- 
     779   ln_diahsb  = .false.    !  check the heat and salt budgets (T) or not (F) 
     780/ 
     781 
     782!!====================================================================== 
     783!!            ***  Observation & Assimilation namelists *** 
     784!!====================================================================== 
     785!!   namobs       observation and model comparison                      ('key_diaobs') 
     786!!   nam_asminc   assimilation increments                               ('key_asminc') 
     787!!====================================================================== 
     788! 
     789!----------------------------------------------------------------------- 
     790&namobs       !  observation usage switch                               ('key_diaobs') 
     791!----------------------------------------------------------------------- 
     792   ln_t3d     = .false.    ! Logical switch for T profile observations          
     793   ln_s3d     = .false.    ! Logical switch for S profile observations           
     794   ln_ena     = .false.    ! Logical switch for ENACT insitu data set            
     795   !                       !     ln_cor                  Logical switch for Coriolis insitu data set        
     796   ln_profb   = .false.    ! Logical switch for feedback insitu data set      
     797   ln_sla     = .false.    ! Logical switch for SLA observations                
     798 
     799   ln_sladt   = .false.    ! Logical switch for AVISO SLA data               
     800 
     801   ln_slafb   = .false.    ! Logical switch for feedback SLA data             
     802                           !     ln_ssh                  Logical switch for SSH observations               
     803 
     804   ln_sst     = .false.    ! Logical switch for SST observations               
     805                           !     ln_reysst               Logical switch for Reynolds observations        
     806                           !     ln_ghrsst               Logical switch for GHRSST observations           
     807 
     808   ln_sstfb   = .false.    ! Logical switch for feedback SST data           
     809                           !     ln_sss                  Logical switch for SSS observations               
     810                           !     ln_seaice               Logical switch for Sea Ice observations         
     811                           !     ln_vel3d                Logical switch for velocity observations          
     812                           !     ln_velavcur             Logical switch for velocity daily av. cur.     
     813                           !     ln_velhrcur             Logical switch for velocity high freq. cur.    
     814                           !     ln_velavadcp            Logical switch for velocity daily av. ADCP   
     815                           !     ln_velhradcp            Logical switch for velocity high freq. ADCP 
     816                           !     ln_velfb                Logical switch for feedback velocity data        
     817                           !     ln_grid_global          Global distribtion of observations          
     818                           !     ln_grid_search_lookup   Logical switch for obs grid search w/lookup table   
     819                           !     grid_search_file        Grid search lookup file header  
     820                           !     enactfiles              ENACT input observation file names  
     821                           !     coriofiles              Coriolis input observation file name   
     822   !                       ! profbfiles: Profile feedback input observation file name  
    831823   profbfiles = 'profiles_01.nc' 
     824                           !     ln_profb_enatim         Enact feedback input time setting switch     
     825                           !     slafilesact             Active SLA input observation file name 
     826                           !     slafilespas             Passive SLA input observation file name  
     827   !                       ! slafbfiles: Feedback SLA input observation file name  
    832828   slafbfiles = 'sla_01.nc' 
     829                           !     sstfiles                GHRSST input observation file name        
     830   !                       ! sstfbfiles: Feedback SST input observation file name  
    833831   sstfbfiles = 'sst_01.nc' 'sst_02.nc' 'sst_03.nc' 'sst_04.nc' 'sst_05.nc' 
    834    ln_altbias = .false. 
     832                           !     seaicefiles             Sea Ice input observation file name  
     833                           !     velavcurfiles           Vel. cur. daily av. input file name   
     834                           !     velhvcurfiles           Vel. cur. high freq. input file name   
     835                           !     velavadcpfiles          Vel. ADCP daily av. input file name     
     836                           !     velhvadcpfiles          Vel. ADCP high freq. input file name  
     837                           !     velfbfiles              Vel. feedback input observation file name  
     838                           !     dobsini                 Initial date in window YYYYMMDD.HHMMSS        
     839                           !     dobsend                 Final date in window YYYYMMDD.HHMMSS          
     840                           !     n1dint                  Type of vertical interpolation method         
     841                           !     n2dint                  Type of horizontal interpolation method        
     842                           !     ln_nea                  Rejection of observations near land switch     
     843   nmsshc     = 0          ! MSSH correction scheme                          
     844                           !     mdtcorr                 MDT  correction                                
     845                           !     mdtcutoff               MDT cutoff for computed correction           
     846   ln_altbias = .false.    ! Logical switch for alt bias                 
     847   ln_ignmis  = .true.     ! Logical switch for ignoring missing files    
     848                           !     endailyavtypes   ENACT daily average types                     
    835849   ln_grid_global = .true. 
    836850   ln_grid_search_lookup = .false. 
    837    ln_ignmis = .true.   
    838851/  
    839852!----------------------------------------------------------------------- 
    840 !       nam_asminc    assimilation increments namelist 
    841 !----------------------------------------------------------------------- 
    842 ! ln_bkgwri   Logical switch for writing out background state  
    843 ! ln_trjwri   Logical switch for writing out state trajectory 
    844 ! ln_trainc   Logical switch for applying tracer increments 
    845 ! ln_dyninc   Logical switch for applying velocity increments 
    846 ! ln_sshinc   Logical switch for applying SSH increments  
    847 ! ln_asmdin   Logical switch for Direct Initialization (DI) 
    848 ! ln_asmiau   Logical switch for Incremental Analysis Updating (IAU) 
    849 ! nitbkg      Timestep of background in [0,nitend-nit000-1] 
    850 ! nitdin      Timestep of background for DI in [0,nitend-nit000-1] 
    851 ! nitiaustr   Timestep of start of IAU interval in [0,nitend-nit000-1] 
    852 ! nitiaufin   Timestep of end of IAU interval in [0,nitend-nit000-1] 
    853 ! niaufn      Type of IAU weighting function 
    854 ! nittrjfrq   Frequency of trajectory output for 4D-VAR 
    855 ! ln_salfix   Logical switch for ensuring that the sa > salfixmin 
    856 ! salfixmin   Minimum salinity after applying the increments 
    857 &nam_asminc 
    858     ln_bkgwri = .false. 
    859     ln_trjwri = .false. 
    860     ln_trainc = .false. 
    861     ln_dyninc = .false. 
    862     ln_sshinc = .false. 
    863     ln_asmdin = .false. 
    864     ln_asmiau = .false. 
    865     nitbkg = 0 
    866     nitdin = 0 
    867     nitiaustr = 1 
    868     nitiaufin = 15 
    869     niaufn = 0 
    870     nittrjfrq = 0 
    871     ln_salfix = .false. 
    872     salfixmin = -9999 
    873 / 
     853&nam_asminc   !   assimilation increments                               ('key_asminc') 
     854!----------------------------------------------------------------------- 
     855    ln_bkgwri = .false.    !  Logical switch for writing out background state  
     856    ln_trjwri = .false.    !  Logical switch for writing out state trajectory 
     857    ln_trainc = .false.    !  Logical switch for applying tracer increments 
     858    ln_dyninc = .false.    !  Logical switch for applying velocity increments 
     859    ln_sshinc = .false.    !  Logical switch for applying SSH increments  
     860    ln_asmdin = .false.    !  Logical switch for Direct Initialization (DI) 
     861    ln_asmiau = .false.    !  Logical switch for Incremental Analysis Updating (IAU) 
     862    nitbkg    = 0          !  Timestep of background in [0,nitend-nit000-1] 
     863    nitdin    = 0          !  Timestep of background for DI in [0,nitend-nit000-1] 
     864    nitiaustr = 1          !  Timestep of start of IAU interval in [0,nitend-nit000-1] 
     865    nitiaufin = 15         !  Timestep of end of IAU interval in [0,nitend-nit000-1] 
     866    niaufn    = 0          !  Type of IAU weighting function 
     867    nittrjfrq = 0          !  Frequency of trajectory output for 4D-VAR 
     868    ln_salfix = .false.    !  Logical switch for ensuring that the sa > salfixmin 
     869    salfixmin = -9999      !  Minimum salinity after applying the increments 
     870/ 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.