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Changeset 2417 for branches/nemo_v3_3_beta/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM_PISCES/EXP00/namelist – NEMO

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2010-11-22T08:58:05+01:00 (13 years ago)
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gm
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v3.3beta: review of config. namelist (diff= true changes not style)

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  • branches/nemo_v3_3_beta/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM_PISCES/EXP00/namelist

    r2399 r2417  
    11!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
    22!! NEMO/OPA  :  1 - run manager      (namrun) 
    3 !! namelists    2 - Domain           (namzgr, namzgr_sco, namdom) 
     3!! namelists    2 - Domain           (namzgr, namzgr_sco, namdom, namdta_tem, namdta_sal) 
    44!!              3 - Surface boundary (namsbc, namsbc_ana, namsbc_flx, namsbc_clio, namsbc_core 
    5 !!                                    namsbc_cpl, namqsr, namsbc_rnf, namsbc_ssr, namsbc_alb) 
     5!!                                    namsbc_cpl, namsbc_cpl_co2 namtra_qsr, namsbc_rnf,  
     6!!                                    namsbc_apr, namsbc_ssr, namsbc_alb) 
    67!!              4 - lateral boundary (namlbc, namcla, namobc, namagrif, nambdy, nambdy_tide) 
    78!!              5 - bottom  boundary (nambfr, nambbc, nambbl) 
     
    910!!              7 - dynamics         (namdyn_adv, namdyn_vor, namdyn_hpg, namdyn_spg, namdyn_ldf) 
    1011!!              8 - Verical physics  (namzdf, namzdf_ric, namzdf_tke, namzdf_kpp, namzdf_ddm, namzdf_tmx) 
    11 !!              9 - diagnostics      (namtrd, namgap, namspr, namflo, namptr) 
    12 !!              9 - miscellaneous    (namsol, nammpp, nammpp_dyndist, namctl) 
     12!!              9 - diagnostics      (namnc4, namtrd, namspr, namflo, namptr, namhsb) 
     13!!             10 - miscellaneous    (namsol, nammpp, nammpp_dyndist, namctl) 
     14!!             11 - Obs & Assim      (namobs, nam_asminc) 
    1315!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
    1416!  CAUTION: some scripts does not support CAPITALs for logical use .true./.false., not .TRUE./.FALSE. 
     
    1719!!                   ***  Run management namelists  *** 
    1820!!====================================================================== 
    19 !!   namrun            parameters of the run 
    20 !!====================================================================== 
    21  
     21!!   namrun        parameters of the run 
     22!!====================================================================== 
     23! 
    2224!----------------------------------------------------------------------- 
    2325&namrun        !   parameters of the run 
     
    4345   cn_ocerst_out = "restart"   !  suffix of ocean restart name (output) 
    4446/ 
    45 !!====================================================================== 
    46 !!   namnc4            netcdf4 chunking and compression settings 
    47 !!====================================================================== 
    48 !----------------------------------------------------------------------- 
    49 &namnc4         !  netcdf4 chunking and compression settings     ("key_netcdf4") 
    50                 !  (ignored if "key_netcdf4" is not used) 
    51 !----------------------------------------------------------------------- 
    52    nn_nchunks_i   =   4       !  number of chunks in i-dimension 
    53    nn_nchunks_j   =   4       !  number of chunks in j-dimension 
    54    nn_nchunks_k   =   31      !  number of chunks in k-dimension 
    55                               !  setting nn_nchunks_k = jpk will give a chunk size of 1 in the vertical which 
    56                               !  is optimal for postprocessing which works exclusively with horizontal slabs 
    57    ln_nc4zip      =   .TRUE.  !  (T) use netcdf4 chunking and compression 
    58                               !  (F) ignore chunking information and produce netcdf3-compatible files 
    59 / 
     47 
    6048!!====================================================================== 
    6149!!                      ***  Domain namelists  *** 
     
    6452!!   namzgr_sco   s-coordinate or hybrid z-s-coordinate 
    6553!!   namdom       space and time domain (bathymetry, mesh, timestep) 
    66 !!====================================================================== 
    67  
     54!!   namdta_tem   data: temperature                                     ("key_dtatem") 
     55!!   namdta_sal   data: salinity                                        ("key_dtasal") 
     56!!====================================================================== 
     57! 
    6858!----------------------------------------------------------------------- 
    6959&namzgr        !   vertical coordinate 
     
    10393   rn_rdth     =  800.           !  depth variation of tracer time step  (used if nacc=1) 
    10494/ 
     95!----------------------------------------------------------------------- 
     96&namdta_tem    !   data : temperature                                   ("key_dtatem") 
     97!----------------------------------------------------------------------- 
     98!              ! file name ! frequency (hours)    ! variable ! time interp. ! clim  !'yearly' or ! weights  ! rotation ! 
     99!              !           !  (if <0  months)     !   name   !  (logical)   ! (T/F) ! 'monthly'  ! filename ! pairing  ! 
     100   sn_tem = 'data_1m_potential_temperature_nomask', -1,'votemper',  .true.  , .true., 'yearly'   , ' '      , ' ' 
     101   ! 
     102   cn_dir       = './'     !  root directory for the location of the runoff files 
     103/ 
     104!----------------------------------------------------------------------- 
     105&namdta_sal    !   data : salinity                                      ("key_dtasal") 
     106!----------------------------------------------------------------------- 
     107!              ! file name ! frequency (hours)    ! variable ! time interp. ! clim  !'yearly' or ! weights  ! rotation ! 
     108!              !           !  (if <0  months)     !   name   !   (logical)  ! (T/F) ! 'monthly'  ! filename ! pairing  ! 
     109   sn_sal      =  'data_1m_salinity_nomask',  -1  ,'vosaline',    .true.    , .true., 'yearly'   , ''       , ' ' 
     110   ! 
     111   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
     112/ 
     113 
    105114!!====================================================================== 
    106115!!            ***  Surface Boundary Condition namelists  *** 
    107116!!====================================================================== 
    108 !!   namsbc        surface boundary condition 
    109 !!   namsbc_ana    analytical         formulation 
    110 !!   namsbc_flx    flux               formulation 
    111 !!   namsbc_clio   CLIO bulk formulea formulation 
    112 !!   namsbc_core   CORE bulk formulea formulation 
    113 !!   namsbc_cpl    CouPLed            formulation                       ("key_coupled") 
    114 !!   namtra_qsr    penetrative solar radiation 
    115 !!   namsbc_rnf    river runoffs 
    116 !!   namsbc_ssr    sea surface restoring term (for T and/or S) 
    117 !!   namsbc_alb    albedo parameters 
    118 !!====================================================================== 
    119  
     117!!   namsbc          surface boundary condition 
     118!!   namsbc_ana      analytical         formulation 
     119!!   namsbc_flx      flux               formulation 
     120!!   namsbc_clio     CLIO bulk formulea formulation 
     121!!   namsbc_core     CORE bulk formulea formulation 
     122!!   namsbc_cpl      CouPLed            formulation                     ("key_coupled") 
     123!!   namsbc_cpl_co2  coupled ocean/biogeo/atmosphere model              ("key_cpl_carbon_cycle") 
     124!!   namtra_qsr      penetrative solar radiation 
     125!!   namsbc_rnf      river runoffs 
     126!!   namsbc_apr      Atmospheric Pressure 
     127!!   namsbc_ssr      sea surface restoring term (for T and/or S) 
     128!!   namsbc_alb      albedo parameters 
     129!!====================================================================== 
     130! 
    120131!----------------------------------------------------------------------- 
    121132&namsbc        !   Surface Boundary Condition (surface module) 
    122133!----------------------------------------------------------------------- 
    123134   nn_fsbc     = 5         !  frequency of surface boundary condition computation  
    124                            !               (= the frequency of sea-ice model call) 
    125    ln_ana      = .false.   !  analytical formulation (T => fill namsbc_ana )  
    126    ln_flx      = .false.   !  flux formulation       (T => fill namsbc_flx ) 
    127    ln_blk_clio = .false.   !  CLIO bulk formulation  (T => fill namsbc_clio)  
    128    ln_blk_core = .true.    !  CORE bulk formulation  (T => fill namsbc_core)  
    129    ln_cpl      = .false.   !  Coupled formulation    (T => fill namsbc_cpl ) 
     135                           !     (also = the frequency of sea-ice model call) 
     136   ln_ana      = .false.   !  analytical formulation                    (T => fill namsbc_ana )  
     137   ln_flx      = .false.   !  flux formulation                          (T => fill namsbc_flx ) 
     138   ln_blk_clio = .false.   !  CLIO bulk formulation                     (T => fill namsbc_clio)  
     139   ln_blk_core = .true.    !  CORE bulk formulation                     (T => fill namsbc_core)  
     140   ln_cpl      = .false.   !  Coupled formulation                       (T => fill namsbc_cpl ) 
    130141   ln_apr_dyn  = .false.   !  Patm gradient added in ocean & ice Eqs.   (T => fill namsbc_apr ) 
    131142   nn_ice      = 2         !  =0 no ice boundary condition   , 
    132143                           !  =1 use observed ice-cover      , 
    133                            !  =2 ice-model used                             ("key_lim3" or "key_lim2) 
     144                           !  =2 ice-model used                         ("key_lim3" or "key_lim2) 
    134145   ln_dm2dc    = .false.   !  daily mean to diurnal cycle short wave (qsr) 
    135    ln_rnf      = .true.    !  runoffs (T => fill namsbc_rnf) 
    136    ln_ssr      = .true.    !  Sea Surface Restoring on T and/or S (T => fill namsbc_ssr) 
     146   ln_rnf      = .true.    !  runoffs                                   (T => fill namsbc_rnf) 
     147   ln_ssr      = .true.    !  Sea Surface Restoring on T and/or S       (T => fill namsbc_ssr) 
    137148   nn_fwb      = 3         !  FreshWater Budget: =0 unchecked  
    138                            !                     =1 global mean of e-p-r set to zero at each time step  
    139                            !                     =2 annual global mean of e-p-r set to zero 
    140                            !                     =3 global emp set to zero and spread out over erp area 
     149                           !     =1 global mean of e-p-r set to zero at each time step  
     150                           !     =2 annual global mean of e-p-r set to zero 
     151                           !     =3 global emp set to zero and spread out over erp area 
    141152/ 
    142153!----------------------------------------------------------------------- 
     
    153164&namsbc_flx    !   surface boundary condition : flux formulation 
    154165!----------------------------------------------------------------------- 
    155 !              !   file name  ! frequency (hours) !  variable  ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    156 !              !              !  (if <0  months)  !    name    !    (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    157    sn_utau     = 'utau'       ,        24         ,    'utau'  ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    158    sn_vtau     = 'vtau'       ,        24         ,    'vtau'  ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    159    sn_qtot     = 'qtot'       ,        24         ,    'qtot'  ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    160    sn_qsr      = 'qsr'        ,        24         ,    'qsr'   ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    161    sn_emp      = 'emp'        ,        24         ,    'emp'   ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    162 ! 
     166!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     167!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     168   sn_utau     = 'utau'      ,        24         , 'utau'    , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     169   sn_vtau     = 'vtau'      ,        24         , 'vtau'    , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     170   sn_qtot     = 'qtot'      ,        24         , 'qtot'    , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     171   sn_qsr      = 'qsr'       ,        24         , 'qsr'     , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     172   sn_emp      = 'emp'       ,        24         , 'emp'     , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     173 
    163174   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the flux files 
    164175/       
     
    166177&namsbc_clio   !   namsbc_clio  CLIO bulk formulea 
    167178!----------------------------------------------------------------------- 
    168 !              !   file name  ! frequency (hours) !  variable  ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    169 !              !              !  (if <0  months)  !    name    !    (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    170    sn_utau     = 'taux_1m'    ,       -1          , 'sozotaux' ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    171    sn_vtau     = 'tauy_1m'    ,       -1          , 'sometauy' ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    172    sn_wndm     = 'flx'        ,       -1          , 'socliowi' ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    173    sn_tair     = 'flx'        ,       -1          , 'socliot2' ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    174    sn_humi     = 'flx'        ,       -1          , 'socliohu' ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    175    sn_ccov     = 'flx'        ,       -1          , 'socliocl' ,    .false.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    176    sn_prec     = 'flx'        ,       -1          , 'socliopl' ,    .false.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    177 ! 
     179!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     180!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     181   sn_utau     = 'taux_1m'   ,       -1          , 'sozotaux',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     182   sn_vtau     = 'tauy_1m'   ,       -1          , 'sometauy',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     183   sn_wndm     = 'flx'       ,       -1          , 'socliowi',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     184   sn_tair     = 'flx'       ,       -1          , 'socliot2',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     185   sn_humi     = 'flx'       ,       -1          , 'socliohu',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     186   sn_ccov     = 'flx'       ,       -1          , 'socliocl',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     187   sn_prec     = 'flx'       ,       -1          , 'socliopl',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     188 
    178189   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the bulk files are 
    179190/ 
     
    181192&namsbc_core   !   namsbc_core  CORE bulk formulea 
    182193!----------------------------------------------------------------------- 
    183 !              !   file name                   ! frequency (hours) ! variable    ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    184 !              !                               !  (if <0  months)  !   name      !    (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    185    sn_wndi     = 'u_10.15JUNE2009_orca2'       ,       6           , 'U_10_MOD'  ,    .false.     , .true.  , 'yearly'  ,   ''     ,  'Uwnd' 
    186    sn_wndj     = 'v_10.15JUNE2009_orca2'       ,       6           , 'V_10_MOD'  ,    .false.     , .true.  , 'yearly'  ,   ''     ,  'Vwnd' 
    187    sn_qsr      = 'ncar_rad.15JUNE2009_orca2'   ,       24          , 'SWDN_MOD'  ,    .false.     , .true.  , 'yearly'  ,   ''     ,  '' 
    188    sn_qlw      = 'ncar_rad.15JUNE2009_orca2'   ,       24          , 'LWDN_MOD'  ,    .false.     , .true.  , 'yearly'  ,   ''     ,  '' 
    189    sn_tair     = 't_10.15JUNE2009_orca2'       ,       6           , 'T_10_MOD'  ,    .false.     , .true.  , 'yearly'  ,   ''     ,  '' 
    190    sn_humi     = 'q_10.15JUNE2009_orca2'       ,       6           , 'Q_10_MOD'  ,    .false.     , .true.  , 'yearly'  ,   ''     ,  '' 
    191    sn_prec     = 'ncar_precip.15JUNE2009_orca2',       -1          , 'PRC_MOD1'  ,    .false.     , .true.  , 'yearly'  ,   ''     ,  '' 
    192    sn_snow     = 'ncar_precip.15JUNE2009_orca2',       -1          , 'SNOW'      ,    .false.     , .true.  , 'yearly'  ,   ''     ,  '' 
    193    sn_tdif     = 'taudif_core'                 ,       24          , 'taudif'    ,    .false.     , .true.  , 'yearly'  ,   ''     ,  '' 
    194 ! 
     194!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     195!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     196   sn_wndi = 'u_10.15JUNE2009_orca2'       ,  6  , 'U_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , 'Uwnd' 
     197   sn_wndj = 'v_10.15JUNE2009_orca2'       ,  6  , 'V_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , 'Vwnd' 
     198   sn_qsr  = 'ncar_rad.15JUNE2009_orca2'   , 24  , 'SWDN_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     199   sn_qlw  = 'ncar_rad.15JUNE2009_orca2'   , 24  , 'LWDN_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     200   sn_tair = 't_10.15JUNE2009_orca2'       ,  6  , 'T_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     201   sn_humi = 'q_10.15JUNE2009_orca2'       ,  6  , 'Q_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     202   sn_prec = 'ncar_precip.15JUNE2009_orca2', -1  , 'PRC_MOD1',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     203   sn_snow = 'ncar_precip.15JUNE2009_orca2', -1  , 'SNOW'    ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     204   sn_tdif = 'taudif_core'                 , 24  , 'taudif'  ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     205 
    195206   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the bulk files 
    196207   ln_2m       = .false.   !  air temperature and humidity referenced at 2m (T) instead 10m (F) 
     
    199210/ 
    200211!----------------------------------------------------------------------- 
    201 &namsbc_cpl    !   coupled ocean/atmosphere model                        ("key_coupled") 
    202 !----------------------------------------------------------------------- 
    203                                        ! send 
    204 cn_snd_temperature= 'weighted oce and ice'  ! 'oce only' 'weighted oce and ice' 'mixed oce-ice' 
    205 cn_snd_albedo     = 'weighted ice'          ! 'none' 'weighted ice' 'mixed oce-ice' 
    206 cn_snd_thickness  = 'none'                  ! 'none' 'weighted ice and snow' 
    207 cn_snd_crt_nature = 'none'                  ! 'none' 'oce only' 'weighted oce and ice' 'mixed oce-ice' 
    208 cn_snd_crt_refere = 'spherical'             ! 'spherical' 'cartesian' 
    209 cn_snd_crt_orient = 'eastward-northward'    ! 'eastward-northward' or 'local grid' 
    210 cn_snd_crt_grid   = 'T'                     ! 'T' 
    211                                        ! receive 
    212 cn_rcv_w10m       = 'none'                  ! 'none' 'coupled' 
    213 cn_rcv_taumod     = 'coupled'               ! 'none' 'coupled' 
    214 cn_rcv_tau_nature = 'oce only'              ! 'oce only' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
    215 cn_rcv_tau_refere = 'cartesian'             ! 'spherical' 'cartesian' 
    216 cn_rcv_tau_orient = 'eastward-northward'    ! 'eastward-northward' or 'local grid' 
    217 cn_rcv_tau_grid   = 'U,V'                   ! 'T' 'U,V' 'U,V,F' 'U,V,I' 'T,F' 'T,I' 'T,U,V' 
    218 cn_rcv_dqnsdt     = 'coupled'               ! 'none' 'coupled' 
    219 cn_rcv_qsr        = 'oce and ice'           ! 'conservative' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
    220 cn_rcv_qns        = 'oce and ice'           ! 'conservative' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
    221 cn_rcv_emp        = 'conservative'          ! 'conservative' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
    222 cn_rcv_rnf        = 'coupled'               ! 'coupled' 'climato' 'mixed' 
    223 cn_rcv_cal        = 'coupled'               ! 'none' 'coupled' 
    224 / 
    225 !----------------------------------------------------------------------- 
    226 &namsbc_cpl_co2   !   coupled ocean/biogeo/atmosphere model            ("key_cpl_carbon_cycle") 
     212&namsbc_cpl    !   coupled ocean/atmosphere model                       ("key_coupled") 
     213!----------------------------------------------------------------------- 
     214!                                      ! send 
     215cn_snd_temperature= 'weighted oce and ice'  !  'oce only' 'weighted oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     216cn_snd_albedo     = 'weighted ice'          !  'none' 'weighted ice' 'mixed oce-ice' 
     217cn_snd_thickness  = 'none'                  !  'none' 'weighted ice and snow' 
     218cn_snd_crt_nature = 'none'                  !  'none' 'oce only' 'weighted oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     219cn_snd_crt_refere = 'spherical'             !  'spherical' 'cartesian' 
     220cn_snd_crt_orient = 'eastward-northward'    !  'eastward-northward' or 'local grid' 
     221cn_snd_crt_grid   = 'T'                     !  'T' 
     222!                                      ! receive 
     223cn_rcv_w10m       = 'none'                  !  'none' 'coupled' 
     224cn_rcv_taumod     = 'coupled'               !  'none' 'coupled' 
     225cn_rcv_tau_nature = 'oce only'              !  'oce only' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     226cn_rcv_tau_refere = 'cartesian'             !  'spherical' 'cartesian' 
     227cn_rcv_tau_orient = 'eastward-northward'    !  'eastward-northward' or 'local grid' 
     228cn_rcv_tau_grid   = 'U,V'                   !  'T' 'U,V' 'U,V,F' 'U,V,I' 'T,F' 'T,I' 'T,U,V' 
     229cn_rcv_dqnsdt     = 'coupled'               !  'none' 'coupled' 
     230cn_rcv_qsr        = 'oce and ice'           !  'conservative' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     231cn_rcv_qns        = 'oce and ice'           !  'conservative' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     232cn_rcv_emp        = 'conservative'          !  'conservative' 'oce and ice' 'mixed oce-ice' 
     233cn_rcv_rnf        = 'coupled'               !  'coupled' 'climato' 'mixed' 
     234cn_rcv_cal        = 'coupled'               !  'none' 'coupled' 
     235/ 
     236!----------------------------------------------------------------------- 
     237&namsbc_cpl_co2   !   coupled ocean/biogeo/atmosphere model             ("key_cpl_carbon_cycle") 
    227238!----------------------------------------------------------------------- 
    228239cn_snd_co2        = 'coupled'         ! send    :  'none' 'coupled' 
     
    232243&namtra_qsr    !   penetrative solar radiation 
    233244!----------------------------------------------------------------------- 
    234 !              !   file name  ! frequency (hours) ! variable   ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    235 !              !              !  (if <0  months)  !   name     !    (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    236    sn_chl      = 'chlorophyll',        -1         , 'CHLA'     ,    .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     245!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     246!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     247   sn_chl      ='chlorophyll',        -1         , 'CHLA'    ,   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    237248  
    238249   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
     
    249260&namsbc_rnf    !   runoffs namelist surface boundary condition 
    250261!----------------------------------------------------------------------- 
    251 !              !   file name  ! frequency (hours) ! variable   ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    252 !              !              !  (if <0  months)  !   name     !    (logical)   !  (T/F)  ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    253    sn_rnf      = 'runoff_1m_nomask' ,  -1         , 'sorunoff' ,    .true.      , .true.  , 'yearly'  , ''       , '' 
    254    sn_cnf      = 'runoff_1m_nomask' ,   0         , 'socoefr'  ,    .false.     , .true.  , 'yearly'  , ''       , '' 
    255    sn_s_rnf    = 'runoffs'          ,  24         , 'rosaline' ,    .true.      , .true.  ,   'yearly', ''       , '' 
    256    sn_t_rnf    = 'runoffs'          ,  24         , 'rotemper' ,    .true.      , .true.  ,   'yearly', ''       , '' 
    257    sn_dep_rnf  = 'runoffs'          ,   0         , 'rodepth'  ,    .false.     , .true.  ,   'yearly', ''       , '' 
     262!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     263!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     264   sn_rnf      = 'runoff_1m_nomask' ,  -1        , 'sorunoff',    .true.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     265   sn_cnf      = 'runoff_1m_nomask' ,   0        , 'socoefr' ,    .false.   , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     266   sn_s_rnf    = 'runoffs'          ,  24        , 'rosaline',    .true.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     267   sn_t_rnf    = 'runoffs'          ,  24        , 'rotemper',    .true.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     268   sn_dep_rnf  = 'runoffs'          ,   0        , 'rodepth' ,    .false.   , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     269 
    258270   cn_dir       = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
    259271   ln_rnf_emp   =   .false. !  runoffs included into precipitation field (T) or into a file (F) 
     
    271283!              ! file name ! frequency (hours) ! variable ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    272284!              !           !  (if <0  months)  !   name   !    (logical)   !  (T/F)  ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    273    sn_apr      = 'patm'    ,         -1        , 'somslpre',    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,  ''      ,   '' 
    274 ! 
     285   sn_apr      = 'patm'    ,         -1        ,'somslpre',    .true.      , .true.  , 'yearly'  ,  ''      ,   '' 
     286 
    275287   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the bulk files 
    276288   ln_ref_apr  = .false.   !  ref. pressure: global mean Patm (T) or a constant (F) 
     
    279291&namsbc_ssr    !   surface boundary condition : sea surface restoring 
    280292!----------------------------------------------------------------------- 
    281 !              !   file name  ! frequency (hours) ! variable   ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    282 !              !              !  (if <0  months)  !   name     !    (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
    283    sn_sst      = 'sst_data'   ,        24         ,  'sst'     ,     .false.    , .false. , 'yearly'  , ''       , '' 
    284    sn_sss      = 'sss_data'   ,        -1         ,  'sss'     ,     .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     293!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     294!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     295   sn_sst      = 'sst_data'  ,        24         ,  'sst'    ,    .false.   , .false., 'yearly'  , ''       , '' 
     296   sn_sss      = 'sss_data'  ,        -1         ,  'sss'    ,    .true.    , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
    285297     
    286298   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
     
    302314   rn_alphdi   =    0.72   !  (Pyane, 1972) 
    303315/ 
    304 !----------------------------------------------------------------------- 
    305 &namdta_tem    !   surface boundary condition : sea surface restoring 
    306 !----------------------------------------------------------------------- 
    307 !              !     file name                  ! frequency (hours) ! variable   ! time interpol. !  clim   !'yearly' or ! weights  ! rotation ! 
    308 !              !                                !  (if <0  months)  !   name     !    (logical)   !  (T/F)  ! 'monthly'  ! filename ! pairing  ! 
    309   sn_tem       = 'data_1m_potential_temperature_nomask',  -1        , 'votemper' ,     .true.     , .true.  , 'yearly'   , ' '      , ' ' 
    310 ! 
    311   cn_dir       = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
    312 / 
    313 !----------------------------------------------------------------------- 
    314 &namdta_sal    !   surface boundary condition : sea surface restoring 
    315 !----------------------------------------------------------------------- 
    316 !              !     file name                  ! frequency (hours) ! variable   ! time interpol. !  clim   ! 'yearly' or ! weights  ! rotation ! 
    317 !              !                                !  (if <0  months)  !   name     !    (logical)   !  (T/F)  !  'monthly'  ! filename ! pairing  ! 
    318    sn_sal      =  'data_1m_salinity_nomask'     ,         -1        , 'vosaline' ,     .true.     , .true.  , 'yearly'    , ''       , ' ' 
    319 ! 
    320    cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
    321 / 
     316 
    322317!!====================================================================== 
    323318!!               ***  Lateral boundary condition  *** 
     
    330325!!   namtide       Tidal forcing at open boundaries                     ("key_bdy_tides") 
    331326!!====================================================================== 
    332  
     327! 
    333328!----------------------------------------------------------------------- 
    334329&namlbc        !   lateral momentum boundary condition 
     
    345340&namobc        !   open boundaries parameters                           ("key_obc") 
    346341!----------------------------------------------------------------------- 
    347     ln_obc_clim= .false.   !  climatological obc data files (T) or not (F) 
    348     ln_vol_cst = .true.    !  impose the total volume conservation (T) or not (F) 
    349     ln_obc_fla = .false.   !  Flather open boundary condition  
    350     nn_obcdta  =    1      !  = 0 the obc data are equal to the initial state 
     342   ln_obc_clim = .false.   !  climatological obc data files (T) or not (F) 
     343   ln_vol_cst = .true.    !  impose the total volume conservation (T) or not (F) 
     344   ln_obc_fla = .false.   !  Flather open boundary condition  
     345   nn_obcdta   =    1      !  = 0 the obc data are equal to the initial state 
    351346                           !  = 1 the obc data are read in 'obc.dta' files 
    352     cn_obcdta  = 'annual'  !  set to annual if obc datafile hold 1 year of data 
     347   cn_obcdta   = 'annual'  !  set to annual if obc datafile hold 1 year of data 
    353348                           !  set to monthly if obc datafile hold 1 month of data 
    354     rn_dpein   =    1.     !  damping time scale for inflow at east  open boundary 
    355     rn_dpwin   =    1.     !     -           -         -       west    -      - 
    356     rn_dpnin   =    1.     !     -           -         -       north   -      - 
    357     rn_dpsin   =    1.     !     -           -         -       south   -      - 
    358     rn_dpeob   = 3000.     !  time relaxation (days) for the east  open boundary 
    359     rn_dpwob   =   15.     !     -           -         -     west    -      - 
    360     rn_dpnob   = 3000.     !     -           -         -     north   -      - 
    361     rn_dpsob   =   15.     !     -           -         -     south   -      - 
    362     rn_volemp  =  1.       !  = 0 the total volume change with the surface flux (E-P-R) 
     349   rn_dpein    =    1.     !  damping time scale for inflow at east  open boundary 
     350   rn_dpwin    =    1.     !     -           -         -       west    -      - 
     351   rn_dpnin    =    1.     !     -           -         -       north   -      - 
     352   rn_dpsin    =    1.     !     -           -         -       south   -      - 
     353   rn_dpeob    = 3000.     !  time relaxation (days) for the east  open boundary 
     354   rn_dpwob    =   15.     !     -           -         -     west    -      - 
     355   rn_dpnob    = 3000.     !     -           -         -     north   -      - 
     356   rn_dpsob    =   15.     !     -           -         -     south   -      - 
     357   rn_volemp   =  1.       !  = 0 the total volume change with the surface flux (E-P-R) 
    363358                           !  = 1 the total volume remains constant 
    364359/ 
     
    366361&namagrif      !  AGRIF zoom                                            ("key_agrif") 
    367362!----------------------------------------------------------------------- 
    368     nn_cln_update = 3      !  baroclinic update frequency 
    369     ln_spc_dyn    = .true. !  use 0 as special value for dynamics 
    370     rn_sponge_tra = 2880.  !  coefficient for tracer   sponge layer [s] 
    371     rn_sponge_dyn = 2880.  !  coefficient for dynamics sponge layer [s] 
     363   nn_cln_update = 3       !  baroclinic update frequency 
     364   ln_spc_dyn    = .true. !  use 0 as special value for dynamics 
     365   rn_sponge_tra = 2880.   !  coefficient for tracer   sponge layer [s] 
     366   rn_sponge_dyn = 2880.   !  coefficient for dynamics sponge layer [s] 
    372367/ 
    373368!----------------------------------------------------------------------- 
    374369&nambdy        !  unstructured open boundaries                          ("key_bdy") 
    375370!----------------------------------------------------------------------- 
    376     cn_mask    =  ''                        !  name of mask file (if ln_bdy_mask=.TRUE.) 
    377     cn_dta_frs_T  = 'bdydata_grid_T.nc'     !  name of data file (T-points) 
    378     cn_dta_frs_U  = 'bdydata_grid_U.nc'     !  name of data file (U-points) 
    379     cn_dta_frs_V  = 'bdydata_grid_V.nc'     !  name of data file (V-points) 
    380     cn_dta_fla_T  = 'bdydata_bt_grid_T.nc'  !  name of data file for Flather condition (T-points) 
    381     cn_dta_fla_U  = 'bdydata_bt_grid_U.nc'  !  name of data file for Flather condition (U-points) 
    382     cn_dta_fla_V  = 'bdydata_bt_grid_V.nc'  !  name of data file for Flather condition (V-points) 
    383     ln_clim    = .false.                    !  contain 1 (T) or 12 (F) time dumps and be cyclic 
    384     ln_vol     = .false.                    !  total volume correction (see volbdy parameter) 
    385     ln_mask    = .false.                    !  boundary mask from filbdy_mask (T) or boundaries are on edges of domain (F) 
    386     ln_tides   = .false.                    !  Apply tidal harmonic forcing with Flather condition 
    387     ln_dyn_fla = .false.                    !  Apply Flather condition to velocities 
    388     ln_tra_frs = .false.                    !  Apply FRS condition to temperature and salinity  
    389     ln_dyn_frs = .false.                    !  Apply FRS condition to velocities 
    390     nn_rimwidth    =  9                     !  width of the relaxation zone 
    391     nn_dtactl      =  1                     !  = 0, bdy data are equal to the initial state 
    392                                             !  = 1, bdy data are read in 'bdydata   .nc' files 
    393     nn_volctl      =  0                     !  = 0, the total water flux across open boundaries is zero 
    394                                             !  = 1, the total volume of the system is conserved 
    395 / 
    396 !----------------------------------------------------------------------- 
    397 &nambdy_tide     ! tidal forcing at unstructured boundaries               
    398 !----------------------------------------------------------------------- 
    399     filtide      = 'bdytide_'           !  file name root of tidal forcing files 
    400     tide_cpt     = 'M2','S1'            !  names of tidal components used 
    401     tide_speed   = 28.984106, 15.000001 !  phase speeds of tidal components (deg/hour) 
    402     ln_tide_date = .false.              !  adjust tidal harmonics for start date of run 
     371   cn_mask       =  ''                     !  name of mask file (if ln_bdy_mask=.TRUE.) 
     372   cn_dta_frs_T  = 'bdydata_grid_T.nc'     !  name of data file (T-points) 
     373   cn_dta_frs_U  = 'bdydata_grid_U.nc'     !  name of data file (U-points) 
     374   cn_dta_frs_V  = 'bdydata_grid_V.nc'     !  name of data file (V-points) 
     375   cn_dta_fla_T  = 'bdydata_bt_grid_T.nc'  !  name of data file for Flather condition (T-points) 
     376   cn_dta_fla_U  = 'bdydata_bt_grid_U.nc'  !  name of data file for Flather condition (U-points) 
     377   cn_dta_fla_V  = 'bdydata_bt_grid_V.nc'  !  name of data file for Flather condition (V-points) 
     378 
     379   ln_clim     = .false.    !  contain 1 (T) or 12 (F) time dumps and be cyclic 
     380   ln_vol      = .false.    !  total volume correction (see volbdy parameter) 
     381   ln_mask     = .false.    !  boundary mask from filbdy_mask (T), boundaries are on edges of domain (F) 
     382   ln_tides    = .false.    !  Apply tidal harmonic forcing with Flather condition 
     383   ln_dyn_fla  = .false.    !  Apply Flather condition to velocities 
     384   ln_tra_frs  = .false.    !  Apply FRS condition to temperature and salinity  
     385   ln_dyn_frs  = .false.    !  Apply FRS condition to velocities 
     386   nn_rimwidth =  9         !  width of the relaxation zone 
     387   nn_dtactl   =  1         !  = 0, bdy data are equal to the initial state 
     388                           !  = 1, bdy data are read in 'bdydata   .nc' files 
     389   nn_volctl   =  0         !  = 0, the total water flux across open boundaries is zero 
     390                           !  = 1, the total volume of the system is conserved 
     391/ 
     392!----------------------------------------------------------------------- 
     393&nambdy_tide   !  tidal forcing at unstructured boundaries               
     394!----------------------------------------------------------------------- 
     395   filtide     = 'bdytide_'           !  file name root of tidal forcing files 
     396   tide_cpt    = 'M2','S1'            !  names of tidal components used 
     397   tide_speed  = 28.984106, 15.000001 !  phase speeds of tidal components (deg/hour) 
     398   ln_tide_date= .false.              !  adjust tidal harmonics for start date of run 
    403399/ 
    404400 
     
    410406!!   nambbl        bottom boundary layer scheme                         ("key_trabbl") 
    411407!!====================================================================== 
    412  
     408! 
    413409!----------------------------------------------------------------------- 
    414410&nambfr        !   bottom friction 
     
    439435   rn_gambbl   =  10.    !  advective bbl coefficient                 [s] 
    440436/ 
     437 
    441438!!====================================================================== 
    442439!!                        Tracer (T & S ) namelists 
     
    447444!!   namtra_dmp    T & S newtonian damping                              ("key_tradmp") 
    448445!!====================================================================== 
    449  
     446! 
    450447!----------------------------------------------------------------------- 
    451448&nameos        !   ocean physical parameters 
     
    471468&namtra_ldf    !   lateral diffusion scheme for tracer  
    472469!----------------------------------------------------------------------- 
    473                            !  Type of the operator :  
    474    ln_traldf_lap    =  .true.   !     laplacian operator        
    475    ln_traldf_bilap  =  .false.  !     bilaplacian operator      
    476                            !  Direction of action  : 
    477    ln_traldf_level  =  .false.  !     iso-level                 
    478    ln_traldf_hor    =  .false.  !     horizontal (geopotential)         (require "key_ldfslp" when ln_sco=T) 
    479    ln_traldf_iso    =  .true.   !     iso-neutral                       (require "key_ldfslp") 
    480    ln_traldf_grif   =  .false.  !     griffies skew flux formulation    (require "key_ldfslp")   ! UNDER TEST, DO NOT USE 
    481    ln_traldf_gdia   =  .false.  !     griffies operator strfn diagnostics (require "key_ldfslp") ! UNDER TEST, DO NOT USE 
    482                            !  Coefficient 
    483    rn_aht_0         =  2000.    !     horizontal eddy diffusivity for tracers [m2/s] 
    484    rn_ahtb_0        =     0.    !     background eddy diffusivity for ldf_iso [m2/s] 
    485    rn_aeiv_0        =  2000.    !     eddy induced velocity coefficient [m2/s]    (require "key_traldf_eiv") 
     470   !                       !  Type of the operator :  
     471   ln_traldf_lap    =  .true.   !  laplacian operator        
     472   ln_traldf_bilap  =  .false.  !  bilaplacian operator      
     473   !                       !  Direction of action  : 
     474   ln_traldf_level  =  .false.  !  iso-level                 
     475   ln_traldf_hor    =  .false.  !  horizontal (geopotential)            (require "key_ldfslp" when ln_sco=T) 
     476   ln_traldf_iso    =  .true.   !  iso-neutral                          (require "key_ldfslp") 
     477   ln_traldf_grif   =  .false.  !  griffies skew flux formulation       (require "key_ldfslp")  ! UNDER TEST, DO NOT USE 
     478   ln_traldf_gdia   =  .false.  !  griffies operator strfn diagnostics  (require "key_ldfslp") ! UNDER TEST, DO NOT USE 
     479   !                       !  Coefficient 
     480   rn_aht_0         =  2000.    !  horizontal eddy diffusivity for tracers [m2/s] 
     481   rn_ahtb_0        =     0.    !  background eddy diffusivity for ldf_iso [m2/s] 
     482   rn_aeiv_0        =  2000.    !  eddy induced velocity coefficient [m2/s]       (require "key_traldf_eiv") 
    486483/ 
    487484!----------------------------------------------------------------------- 
     
    499496   nn_file     =    0      !  create a damping.coeff NetCDF file (=1) or not (=0) 
    500497/ 
     498 
    501499!!====================================================================== 
    502500!!                      ***  Dynamics namelists  *** 
     
    508506!!   namdyn_ldf    lateral diffusion scheme 
    509507!!====================================================================== 
    510  
     508! 
    511509!----------------------------------------------------------------------- 
    512510&namdyn_adv    !   formulation of the momentum advection 
     
    549547&namdyn_ldf    !   lateral diffusion on momentum 
    550548!----------------------------------------------------------------------- 
    551                            !  Type of the operator :  
     549   !                       !  Type of the operator :  
    552550   ln_dynldf_lap    =  .true.   !  laplacian operator          
    553551   ln_dynldf_bilap  =  .false.  !  bilaplacian operator     
    554                            !  Direction of action  :  
     552   !                       !  Direction of action  :  
    555553   ln_dynldf_level  =  .false.  !  iso-level                
    556554   ln_dynldf_hor    =  .true.   !  horizontal (geopotential)            (require "key_ldfslp" in s-coord.) 
    557555   ln_dynldf_iso    =  .false.  !  iso-neutral                          (require "key_ldfslp") 
    558                            !  Coefficient 
     556   !                       !  Coefficient 
    559557   rn_ahm_0_lap     = 40000.    !  horizontal laplacian eddy viscosity   [m2/s] 
    560558   rn_ahmb_0        =     0.    !  background eddy viscosity for ldf_iso [m2/s] 
    561559   rn_ahm_0_blp     =     0.    !  horizontal bilaplacian eddy viscosity [m4/s]  
    562560/ 
     561 
    563562!!====================================================================== 
    564563!!             Tracers & Dynamics vertical physics namelists 
    565564!!====================================================================== 
    566 !!       namzdf        vertical physics 
    567 !!       namzdf_ric    richardson number dependent vertical mixing      ("key_zdfric"      ) 
    568 !!       namzdf_tke    TKE dependent vertical mixing                    ("key_zdftke"      ) 
    569 !!       namzdf_kpp    KPP dependent vertical mixing                    ("key_zdfkpp"      ) 
    570 !!       namzdf_ddm    double diffusive mixing parameterization         ("key_zdfddm"      ) 
    571 !!       namzdf_tmx    tidal mixing parameterization                    ("key_zdftmx"      ) 
    572 !!====================================================================== 
    573  
     565!!    namzdf        vertical physics 
     566!!    namzdf_ric    richardson number dependent vertical mixing         ("key_zdfric") 
     567!!    namzdf_tke    TKE dependent vertical mixing                       ("key_zdftke") 
     568!!    namzdf_kpp    KPP dependent vertical mixing                       ("key_zdfkpp") 
     569!!    namzdf_ddm    double diffusive mixing parameterization            ("key_zdfddm") 
     570!!    namzdf_tmx    tidal mixing parameterization                       ("key_zdftmx") 
     571!!====================================================================== 
     572! 
    574573!----------------------------------------------------------------------- 
    575574&namzdf        !   vertical physics 
     
    636635/ 
    637636!----------------------------------------------------------------------- 
    638 &namzdf_gls                !   GLS vertical diffusion  ("key_zdfgls") 
    639 !----------------------------------------------------------------------- 
    640    rn_emin        = 1.e-6  !  minimum value of e   [m2/s2] 
    641    rn_epsmin      = 1.e-12 !  minimum value of eps [m2/s3] 
    642    ln_length_lim  = .true. !  limit on the dissipation rate under stable stratification (Galperin et al., 1988) 
    643    rn_clim_galp   = 0.53   !  galperin limit 
    644    ln_crban       = .TRUE. !  Use Craig & Banner (1994) surface wave mixing parametrisation 
    645    ln_sigpsi      = .TRUE. !  Activate or not Burchard 2001 mods on psi schmidt number in the wb case 
    646    rn_crban       = 100.   !  Craig and Banner 1994 constant for wb tke flux 
    647    rn_charn       = 70000. !  Charnock constant for wb induced roughness length 
    648    nn_tkebc_surf  =   1    !  surface tke condition (0/1/2=Dir/Neum/Dir Mellor-Blumberg) 
    649    nn_tkebc_bot   =   1    !  bottom tke condition (0/1=Dir/Neum) 
    650    nn_psibc_surf  =   1    !  surface psi condition (0/1/2=Dir/Neum/Dir Mellor-Blumberg) 
    651    nn_psibc_bot   =   1    !  bottom psi condition (0/1=Dir/Neum) 
    652    nn_stab_func   =   2    !  stability function (0=Galp, 1= KC94, 2=CanutoA, 3=CanutoB) 
    653    nn_clos        =   1    !  predefined closure type (0=MY82, 1=k-eps, 2=k-w, 3=Gen) 
     637&namzdf_gls                !   GLS vertical diffusion                   ("key_zdfgls") 
     638!----------------------------------------------------------------------- 
     639   rn_emin       = 1.e-6   !  minimum value of e   [m2/s2] 
     640   rn_epsmin     = 1.e-12 !  minimum value of eps [m2/s3] 
     641   ln_length_lim = .true. !  limit on the dissipation rate under stable stratification (Galperin et al., 1988) 
     642   rn_clim_galp  = 0.53    !  galperin limit 
     643   ln_crban      = .TRUE. !  Use Craig & Banner (1994) surface wave mixing parametrisation 
     644   ln_sigpsi     = .TRUE. !  Activate or not Burchard 2001 mods on psi schmidt number in the wb case 
     645   rn_crban      = 100.    !  Craig and Banner 1994 constant for wb tke flux 
     646   rn_charn      = 70000. !  Charnock constant for wb induced roughness length 
     647   nn_tkebc_surf =   1     !  surface tke condition (0/1/2=Dir/Neum/Dir Mellor-Blumberg) 
     648   nn_tkebc_bot  =   1     !  bottom tke condition (0/1=Dir/Neum) 
     649   nn_psibc_surf =   1     !  surface psi condition (0/1/2=Dir/Neum/Dir Mellor-Blumberg) 
     650   nn_psibc_bot  =   1     !  bottom psi condition (0/1=Dir/Neum) 
     651   nn_stab_func  =   2     !  stability function (0=Galp, 1= KC94, 2=CanutoA, 3=CanutoB) 
     652   nn_clos       =   1     !  predefined closure type (0=MY82, 1=k-eps, 2=k-w, 3=Gen) 
    654653/ 
    655654!----------------------------------------------------------------------- 
     
    669668   rn_tfe_itf  = 1.        !  ITF tidal dissipation efficiency 
    670669/ 
     670 
    671671!!====================================================================== 
    672672!!                  ***  Miscelaneous namelists  *** 
     
    677677!!   namsol            elliptic solver / island / free surface  
    678678!!====================================================================== 
    679  
     679! 
    680680!----------------------------------------------------------------------- 
    681681&namsol        !   elliptic solver / island / free surface  
     
    721721 
    722722!!====================================================================== 
    723 !!                       ***  Diagnostics namelists  *** 
    724 !!====================================================================== 
     723!!                  ***  Diagnostics namelists  *** 
     724!!====================================================================== 
     725!!   namnc4       netcdf4 chunking and compression settings             ("key_netcdf4") 
    725726!!   namtrd       dynamics and/or tracer trends                         ("key_trddyn","key_trdtra","key_trdmld") 
    726 !!   namgap       level mean model-data gap                             ("key_diagap") 
    727727!!   namflo       float parameters                                      ("key_float") 
    728728!!   namptr       Poleward Transport Diagnostics 
    729 !!====================================================================== 
    730  
     729!!   namhsb       Heat and salt budgets  
     730!!====================================================================== 
     731! 
     732!----------------------------------------------------------------------- 
     733&namnc4        !   netcdf4 chunking and compression settings            ("key_netcdf4") 
     734!----------------------------------------------------------------------- 
     735   nn_nchunks_i=   4       !  number of chunks in i-dimension 
     736   nn_nchunks_j=   4       !  number of chunks in j-dimension 
     737   nn_nchunks_k=   31      !  number of chunks in k-dimension 
     738                           !  setting nn_nchunks_k = jpk will give a chunk size of 1 in the vertical which 
     739                           !  is optimal for postprocessing which works exclusively with horizontal slabs 
     740   ln_nc4zip   = .TRUE.    !  (T) use netcdf4 chunking and compression 
     741                           !  (F) ignore chunking information and produce netcdf3-compatible files 
     742/ 
    731743!----------------------------------------------------------------------- 
    732744&namtrd        !   diagnostics on dynamics and/or tracer trends         ("key_trddyn" and/or "key_trdtra") 
     
    742754/ 
    743755!----------------------------------------------------------------------- 
    744 &namgap       !   level mean model-data gap                             ('key_diagap') 
    745 !----------------------------------------------------------------------- 
    746    nn_gap     =  15        !  time-step frequency of model-data gap computation 
    747    nn_prg     =  10        !  time-step frequency of gap print in model output 
    748 / 
    749 !----------------------------------------------------------------------- 
    750756&namflo       !   float parameters                                      ("key_float") 
    751757!----------------------------------------------------------------------- 
    752     ln_rstflo = .false.    !  float restart (T) or not (F) 
    753     nn_writefl=      75    !  frequency of writing in float output file  
    754     nn_stockfl=    5475    !  frequency of creation of the float restart file  
    755     ln_argo   = .false.    !  Argo type floats (stay at the surface each 10 days) 
    756     ln_flork4 = .false.    !  trajectories computed with a 4th order Runge-Kutta (T) 
     758   ln_rstflo = .false.    !  float restart (T) or not (F) 
     759   nn_writefl =      75    !  frequency of writing in float output file  
     760   nn_stockfl =    5475    !  frequency of creation of the float restart file  
     761   ln_argo    = .false.    !  Argo type floats (stay at the surface each 10 days) 
     762   ln_flork4 = .false.    !  trajectories computed with a 4th order Runge-Kutta (T) 
    757763                           !  or computed with Blanke' scheme (F) 
    758764/ 
     
    760766&namptr       !   Poleward Transport Diagnostic 
    761767!----------------------------------------------------------------------- 
    762    ln_diaptr  = .false.     !  Poleward heat and salt transport (T) or not (F) 
     768   ln_diaptr  = .false.    !  Poleward heat and salt transport (T) or not (F) 
    763769   ln_diaznl  = .true.     !  Add zonal means and meridional stream functions 
    764770   ln_subbas  = .true.     !  Atlantic/Pacific/Indian basins computation (T) or not  
     
    771777&namhsb       !  Heat and salt budgets  
    772778!----------------------------------------------------------------------- 
    773    ln_diahsb  = .false.     !  check the heat and salt budgets (T) or not (F) 
    774 / 
    775 !----------------------------------------------------------------------- 
    776 !       namobs    observation usage switch 
    777 !----------------------------------------------------------------------- 
    778 ! 
    779 !  ln_t3d                  Logical switch for T profile observations          
    780 !  ln_s3d                  Logical switch for S profile observations           
    781 !  ln_ena                  Logical switch for ENACT insitu data set            
    782 !  ln_cor                  Logical switch for Coriolis insitu data set        
    783 !  ln_profb                Logical switch for feedback insitu data set      
    784 !  ln_sla                  Logical switch for SLA observations                
    785 !  ln_sladt                Logical switch for AVISO SLA data               
    786 !  ln_slafb                Logical switch for feedback SLA data             
    787 !  ln_ssh                  Logical switch for SSH observations               
    788 !  ln_sst                  Logical switch for SST observations               
    789 !  ln_reysst               Logical switch for Reynolds observations        
    790 !  ln_ghrsst               Logical switch for GHRSST observations           
    791 !  ln_sstfb                Logical switch for feedback SST data           
    792 !  ln_sss                  Logical switch for SSS observations               
    793 !  ln_seaice               Logical switch for Sea Ice observations         
    794 !  ln_vel3d                Logical switch for velocity observations          
    795 !  ln_velavcur             Logical switch for velocity daily av. cur.     
    796 !  ln_velhrcur             Logical switch for velocity high freq. cur.    
    797 !  ln_velavadcp            Logical switch for velocity daily av. ADCP   
    798 !  ln_velhradcp            Logical switch for velocity high freq. ADCP 
    799 !  ln_velfb                Logical switch for feedback velocity data        
    800 !  ln_grid_global          Global distribtion of observations          
    801 !  ln_grid_search_lookup   Logical switch for obs grid search w/lookup table   
    802 !  grid_search_file        Grid search lookup file header  
    803 !  enactfiles              ENACT input observation file names  
    804 !  coriofiles              Coriolis input observation file name   
    805 !  profbfiles              Profile feedback input observation file name  
    806 !  ln_profb_enatim         Enact feedback input time setting switch     
    807 !  slafilesact             Active SLA input observation file name 
    808 !  slafilespas             Passive SLA input observation file name  
    809 !  slafbfiles              Feedback SLA input observation file name  
    810 !  sstfiles                GHRSST input observation file name        
    811 !  sstfbfiles              Feedback SST input observation file name  
    812 !  seaicefiles             Sea Ice input observation file name  
    813 !  velavcurfiles           Vel. cur. daily av. input file name   
    814 !  velhvcurfiles           Vel. cur. high freq. input file name   
    815 !  velavadcpfiles          Vel. ADCP daily av. input file name     
    816 !  velhvadcpfiles          Vel. ADCP high freq. input file name  
    817 !  velfbfiles              Vel. feedback input observation file name  
    818 !  dobsini                 Initial date in window YYYYMMDD.HHMMSS        
    819 !  dobsend                 Final date in window YYYYMMDD.HHMMSS          
    820 !  n1dint                  Type of vertical interpolation method         
    821 !  n2dint                  Type of horizontal interpolation method        
    822 !  ln_nea                  Rejection of observations near land switch     
    823 !  nmsshc                  MSSH correction scheme                          
    824 !  mdtcorr                 MDT  correction                                
    825 !  mdtcutoff               MDT cutoff for computed correction           
    826 !  ln_altbias              Logical switch for alt bias                 
    827 !  ln_ignmis               Logical switch for ignoring missing files    
    828 !  endailyavtypes          ENACT daily average types                     
    829  &namobs 
    830    ln_t3d = .false. 
    831    ln_s3d = .false. 
    832    ln_ena = .false. 
    833    ln_profb = .false. 
    834    ln_sla = .false. 
    835    ln_sladt = .false. 
    836    ln_slafb = .false. 
    837    ln_sst = .false. 
    838    ln_sstfb = .false. 
    839    nmsshc = 0 
     779   ln_diahsb  = .false.    !  check the heat and salt budgets (T) or not (F) 
     780/ 
     781 
     782!!====================================================================== 
     783!!            ***  Observation & Assimilation namelists *** 
     784!!====================================================================== 
     785!!   namobs       observation and model comparison                      ('key_diaobs') 
     786!!   nam_asminc   assimilation increments                               ('key_asminc') 
     787!!====================================================================== 
     788! 
     789!----------------------------------------------------------------------- 
     790&namobs       !  observation usage switch                               ('key_diaobs') 
     791!----------------------------------------------------------------------- 
     792   ln_t3d     = .false.    ! Logical switch for T profile observations          
     793   ln_s3d     = .false.    ! Logical switch for S profile observations           
     794   ln_ena     = .false.    ! Logical switch for ENACT insitu data set            
     795   !                       !     ln_cor                  Logical switch for Coriolis insitu data set        
     796   ln_profb   = .false.    ! Logical switch for feedback insitu data set      
     797   ln_sla     = .false.    ! Logical switch for SLA observations                
     798 
     799   ln_sladt   = .false.    ! Logical switch for AVISO SLA data               
     800 
     801   ln_slafb   = .false.    ! Logical switch for feedback SLA data             
     802                           !     ln_ssh                  Logical switch for SSH observations               
     803 
     804   ln_sst     = .false.    ! Logical switch for SST observations               
     805                           !     ln_reysst               Logical switch for Reynolds observations        
     806                           !     ln_ghrsst               Logical switch for GHRSST observations           
     807 
     808   ln_sstfb   = .false.    ! Logical switch for feedback SST data           
     809                           !     ln_sss                  Logical switch for SSS observations               
     810                           !     ln_seaice               Logical switch for Sea Ice observations         
     811                           !     ln_vel3d                Logical switch for velocity observations          
     812                           !     ln_velavcur             Logical switch for velocity daily av. cur.     
     813                           !     ln_velhrcur             Logical switch for velocity high freq. cur.    
     814                           !     ln_velavadcp            Logical switch for velocity daily av. ADCP   
     815                           !     ln_velhradcp            Logical switch for velocity high freq. ADCP 
     816                           !     ln_velfb                Logical switch for feedback velocity data        
     817                           !     ln_grid_global          Global distribtion of observations          
     818                           !     ln_grid_search_lookup   Logical switch for obs grid search w/lookup table   
     819                           !     grid_search_file        Grid search lookup file header  
     820                           !     enactfiles              ENACT input observation file names  
     821                           !     coriofiles              Coriolis input observation file name   
     822   !                       ! profbfiles: Profile feedback input observation file name  
    840823   profbfiles = 'profiles_01.nc' 
     824                           !     ln_profb_enatim         Enact feedback input time setting switch     
     825                           !     slafilesact             Active SLA input observation file name 
     826                           !     slafilespas             Passive SLA input observation file name  
     827   !                       ! slafbfiles: Feedback SLA input observation file name  
    841828   slafbfiles = 'sla_01.nc' 
     829                           !     sstfiles                GHRSST input observation file name        
     830   !                       ! sstfbfiles: Feedback SST input observation file name  
    842831   sstfbfiles = 'sst_01.nc' 'sst_02.nc' 'sst_03.nc' 'sst_04.nc' 'sst_05.nc' 
    843    ln_altbias = .false. 
     832                           !     seaicefiles             Sea Ice input observation file name  
     833                           !     velavcurfiles           Vel. cur. daily av. input file name   
     834                           !     velhvcurfiles           Vel. cur. high freq. input file name   
     835                           !     velavadcpfiles          Vel. ADCP daily av. input file name     
     836                           !     velhvadcpfiles          Vel. ADCP high freq. input file name  
     837                           !     velfbfiles              Vel. feedback input observation file name  
     838                           !     dobsini                 Initial date in window YYYYMMDD.HHMMSS        
     839                           !     dobsend                 Final date in window YYYYMMDD.HHMMSS          
     840                           !     n1dint                  Type of vertical interpolation method         
     841                           !     n2dint                  Type of horizontal interpolation method        
     842                           !     ln_nea                  Rejection of observations near land switch     
     843   nmsshc     = 0          ! MSSH correction scheme                          
     844                           !     mdtcorr                 MDT  correction                                
     845                           !     mdtcutoff               MDT cutoff for computed correction           
     846   ln_altbias = .false.    ! Logical switch for alt bias                 
     847   ln_ignmis  = .true.     ! Logical switch for ignoring missing files    
     848                           !     endailyavtypes   ENACT daily average types                     
    844849   ln_grid_global = .true. 
    845850   ln_grid_search_lookup = .false. 
    846    ln_ignmis = .true.   
    847851/  
    848852!----------------------------------------------------------------------- 
    849 !       nam_asminc    assimilation increments namelist 
    850 !----------------------------------------------------------------------- 
    851 ! ln_bkgwri   Logical switch for writing out background state  
    852 ! ln_trjwri   Logical switch for writing out state trajectory 
    853 ! ln_trainc   Logical switch for applying tracer increments 
    854 ! ln_dyninc   Logical switch for applying velocity increments 
    855 ! ln_sshinc   Logical switch for applying SSH increments  
    856 ! ln_asmdin   Logical switch for Direct Initialization (DI) 
    857 ! ln_asmiau   Logical switch for Incremental Analysis Updating (IAU) 
    858 ! nitbkg      Timestep of background in [0,nitend-nit000-1] 
    859 ! nitdin      Timestep of background for DI in [0,nitend-nit000-1] 
    860 ! nitiaustr   Timestep of start of IAU interval in [0,nitend-nit000-1] 
    861 ! nitiaufin   Timestep of end of IAU interval in [0,nitend-nit000-1] 
    862 ! niaufn      Type of IAU weighting function 
    863 ! nittrjfrq   Frequency of trajectory output for 4D-VAR 
    864 ! ln_salfix   Logical switch for ensuring that the sa > salfixmin 
    865 ! salfixmin   Minimum salinity after applying the increments 
    866 &nam_asminc 
    867     ln_bkgwri = .false. 
    868     ln_trjwri = .false. 
    869     ln_trainc = .false. 
    870     ln_dyninc = .false. 
    871     ln_sshinc = .false. 
    872     ln_asmdin = .false. 
    873     ln_asmiau = .false. 
    874     nitbkg = 0 
    875     nitdin = 0 
    876     nitiaustr = 1 
    877     nitiaufin = 15 
    878     niaufn = 0 
    879     nittrjfrq = 0 
    880     ln_salfix = .false. 
    881     salfixmin = -9999 
    882 / 
     853&nam_asminc   !   assimilation increments                               ('key_asminc') 
     854!----------------------------------------------------------------------- 
     855    ln_bkgwri = .false.    !  Logical switch for writing out background state  
     856    ln_trjwri = .false.    !  Logical switch for writing out state trajectory 
     857    ln_trainc = .false.    !  Logical switch for applying tracer increments 
     858    ln_dyninc = .false.    !  Logical switch for applying velocity increments 
     859    ln_sshinc = .false.    !  Logical switch for applying SSH increments  
     860    ln_asmdin = .false.    !  Logical switch for Direct Initialization (DI) 
     861    ln_asmiau = .false.    !  Logical switch for Incremental Analysis Updating (IAU) 
     862    nitbkg    = 0          !  Timestep of background in [0,nitend-nit000-1] 
     863    nitdin    = 0          !  Timestep of background for DI in [0,nitend-nit000-1] 
     864    nitiaustr = 1          !  Timestep of start of IAU interval in [0,nitend-nit000-1] 
     865    nitiaufin = 15         !  Timestep of end of IAU interval in [0,nitend-nit000-1] 
     866    niaufn    = 0          !  Type of IAU weighting function 
     867    nittrjfrq = 0          !  Frequency of trajectory output for 4D-VAR 
     868    ln_salfix = .false.    !  Logical switch for ensuring that the sa > salfixmin 
     869    salfixmin = -9999      !  Minimum salinity after applying the increments 
     870/ 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.