New URL for NEMO forge!   http://forge.nemo-ocean.eu

Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
This present forge is now archived and remained online for history.
Changeset 5260 for branches/2014/dev_r4650_UKMO10_Tidally_Meaned_Diagnostics/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/step.F90 – NEMO

Ignore:
Timestamp:
2015-05-12T12:37:15+02:00 (9 years ago)
Author:
deazer
Message:

Merged branch with Trunk at revision 5253.
Checked with SETTE, passes modified iodef.xml for AMM12 experiment

File:
1 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • branches/2014/dev_r4650_UKMO10_Tidally_Meaned_Diagnostics/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/step.F90

    r4624 r5260  
    2424   !!             -   !  2010-10  (C. Ethe, G. Madec) reorganisation of initialisation phase + merge TRC-TRA 
    2525   !!            3.4  !  2011-04  (G. Madec, C. Ethe) Merge of dtatem and dtasal 
    26    !!                 !  2012-07  (J. Simeon, G. Madec. C. Ethe) Online coarsening of outputs 
     26   !!                 !  2012-07  (J. Simeon, G. Madec, C. Ethe) Online coarsening of outputs 
     27   !!            3.7  !  2014-04  (F. Roquet, G. Madec) New equations of state 
    2728   !!---------------------------------------------------------------------- 
    2829 
     
    3132   !!---------------------------------------------------------------------- 
    3233   USE step_oce         ! time stepping definition modules 
     34   USE iom 
    3335 
    3436   IMPLICIT NONE 
     
    3941   !! * Substitutions 
    4042#  include "domzgr_substitute.h90" 
    41 #  include "zdfddm_substitute.h90" 
    42    !!---------------------------------------------------------------------- 
    43    !! NEMO/OPA 3.3 , NEMO Consortium (2010) 
     43!!gm   #  include "zdfddm_substitute.h90" 
     44   !!---------------------------------------------------------------------- 
     45   !! NEMO/OPA 3.7 , NEMO Consortium (2014) 
    4446   !! $Id$ 
    4547   !! Software governed by the CeCILL licence     (NEMOGCM/NEMO_CeCILL.txt) 
     
    106108      ! Ocean physics update                (ua, va, tsa used as workspace) 
    107109      !<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< 
    108                          CALL bn2( tsb, rn2b )        ! before Brunt-Vaisala frequency 
    109                          CALL bn2( tsn, rn2  )        ! now    Brunt-Vaisala frequency 
     110      !  THERMODYNAMICS 
     111                         CALL eos_rab( tsb, rab_b )       ! before local thermal/haline expension ratio at T-points 
     112                         CALL eos_rab( tsn, rab_n )       ! now    local thermal/haline expension ratio at T-points 
     113                         CALL bn2    ( tsb, rab_b, rn2b ) ! before Brunt-Vaisala frequency 
     114                         CALL bn2    ( tsn, rab_n, rn2  ) ! now    Brunt-Vaisala frequency 
    110115      ! 
    111116      !  VERTICAL PHYSICS 
     
    117122      IF( lk_zdfkpp  )   CALL zdf_kpp( kstp )            ! KPP closure scheme for Kz 
    118123      IF( lk_zdfcst  ) THEN                              ! Constant Kz (reset avt, avm[uv] to the background value) 
    119          avt (:,:,:) = rn_avt0 * tmask(:,:,:) 
    120          avmu(:,:,:) = rn_avm0 * umask(:,:,:) 
    121          avmv(:,:,:) = rn_avm0 * vmask(:,:,:) 
     124         avt (:,:,:) = rn_avt0 * wmask (:,:,:) 
     125         avmu(:,:,:) = rn_avm0 * wumask(:,:,:) 
     126         avmv(:,:,:) = rn_avm0 * wvmask(:,:,:) 
    122127      ENDIF 
    123128      IF( ln_rnf_mouth ) THEN                         ! increase diffusivity at rivers mouths 
     
    140145      ! 
    141146      IF( lk_ldfslp ) THEN                            ! slope of lateral mixing 
    142                          CALL eos( tsb, rhd, gdept_0(:,:,:) )             ! before in situ density 
    143          IF( ln_zps )    CALL zps_hde( kstp, jpts, tsb, gtsu, gtsv,  &    ! Partial steps: before horizontal gradient 
    144             &                                      rhd, gru , grv  )      ! of t, s, rd at the last ocean level 
     147                         CALL eos( tsb, rhd, gdept_0(:,:,:) )               ! before in situ density 
     148         IF( ln_zps .AND. .NOT. ln_isfcav)                               & 
     149            &            CALL zps_hde    ( kstp, jpts, tsb, gtsu, gtsv,  &  ! Partial steps: before horizontal gradient 
     150            &                                          rhd, gru , grv    )  ! of t, s, rd at the last ocean level 
     151         IF( ln_zps .AND.       ln_isfcav)                               & 
     152            &            CALL zps_hde_isf( kstp, jpts, tsb, gtsu, gtsv,  &    ! Partial steps for top cell (ISF) 
     153            &                                          rhd, gru , grv , aru , arv , gzu , gzv , ge3ru , ge3rv ,   & 
     154            &                                   gtui, gtvi, grui, grvi, arui, arvi, gzui, gzvi, ge3rui, ge3rvi    ) ! of t, s, rd at the first ocean level 
    145155         IF( ln_traldf_grif ) THEN                           ! before slope for Griffies operator 
    146156                         CALL ldf_slp_grif( kstp ) 
     
    170180          ! Note that the computation of vertical velocity above, hence "after" sea level 
    171181          ! is necessary to compute momentum advection for the rhs of barotropic loop: 
    172                                   CALL eos    ( tsn, rhd, rhop, fsdept_n(:,:,:) ) ! now in situ density for hpg computation 
    173           IF( ln_zps      )       CALL zps_hde( kstp, jpts, tsn, gtsu, gtsv,  &   ! zps: now hor. derivative 
    174                 &                                          rhd, gru , grv  )      ! of t, s, rd at the last ocean level 
     182                            CALL eos    ( tsn, rhd, rhop, fsdept_n(:,:,:) ) ! now in situ density for hpg computation 
     183            IF( ln_zps .AND. .NOT. ln_isfcav)                               & 
     184               &            CALL zps_hde    ( kstp, jpts, tsn, gtsu, gtsv,  &    ! Partial steps: before horizontal gradient 
     185               &                                          rhd, gru , grv    )  ! of t, s, rd at the last ocean level 
     186            IF( ln_zps .AND.       ln_isfcav)                               & 
     187               &            CALL zps_hde_isf( kstp, jpts, tsn, gtsu, gtsv,  &    ! Partial steps for top cell (ISF) 
     188               &                                          rhd, gru , grv , aru , arv , gzu , gzv , ge3ru , ge3rv ,   & 
     189               &                                   gtui, gtvi, grui, grvi, arui, arvi, gzui, gzvi, ge3rui, ge3rvi    ) ! of t, s, rd at the last ocean level 
    175190 
    176191                                  ua(:,:,:) = 0.e0             ! set dynamics trends to zero 
     
    201216      ! diagnostics and outputs             (ua, va, tsa used as workspace) 
    202217      !<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< 
    203       IF( lk_floats  )   CALL flo_stp( kstp )         ! drifting Floats 
    204       IF( lk_diahth  )   CALL dia_hth( kstp )         ! Thermocline depth (20 degres isotherm depth) 
    205       IF( lk_diafwb  )   CALL dia_fwb( kstp )         ! Fresh water budget diagnostics 
    206       IF( ln_diaptr  )   CALL dia_ptr( kstp )         ! Poleward TRansports diagnostics 
    207       IF( lk_diadct  )   CALL dia_dct( kstp )         ! Transports 
    208       IF( lk_diaar5  )   CALL dia_ar5( kstp )         ! ar5 diag 
    209       IF( lk_diaharm )   CALL dia_harm( kstp )        ! Tidal harmonic analysis 
    210                          CALL dia_wri( kstp )         ! ocean model: outputs 
    211       ! 
    212       IF( ln_crs     )   CALL crs_fld( kstp )         ! ocean model: online field coarsening & output 
    213  
     218      IF( lk_floats  )      CALL flo_stp( kstp )         ! drifting Floats 
     219      IF( lk_diahth  )      CALL dia_hth( kstp )         ! Thermocline depth (20 degres isotherm depth) 
     220      IF( .NOT. lk_cpl )    CALL dia_fwb( kstp )         ! Fresh water budget diagnostics 
     221      IF( lk_diadct  )      CALL dia_dct( kstp )         ! Transports 
     222      IF( lk_diaar5  )      CALL dia_ar5( kstp )         ! ar5 diag 
     223      IF( lk_diaharm )      CALL dia_harm( kstp )        ! Tidal harmonic analysis 
     224                            CALL dia_wri( kstp )         ! ocean model: outputs 
     225      ! 
     226      IF( ln_crs     )      CALL crs_fld( kstp )         ! ocean model: online field coarsening & output 
    214227 
    215228#if defined key_top 
     
    219232                         CALL trc_stp( kstp )         ! time-stepping 
    220233#endif 
     234 
    221235 
    222236      !>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
     
    236250      IF( lk_zdfkpp      )   CALL tra_kpp    ( kstp )       ! KPP non-local tracer fluxes 
    237251                             CALL tra_ldf    ( kstp )       ! lateral mixing 
     252 
     253      IF( ln_diaptr      )   CALL dia_ptr                   ! Poleward adv/ldf TRansports diagnostics 
     254 
    238255#if defined key_agrif 
    239256      IF(.NOT. Agrif_Root()) CALL Agrif_Sponge_tra          ! tracers sponge 
     
    245262                             CALL tra_nxt( kstp )                ! tracer fields at next time step 
    246263                             CALL eos    ( tsa, rhd, rhop, fsdept_n(:,:,:) )  ! Time-filtered in situ density for hpg computation 
    247          IF( ln_zps      )   CALL zps_hde( kstp, jpts, tsa, gtsu, gtsv,  &    ! zps: time filtered hor. derivative 
    248             &                                          rhd, gru , grv  )      ! of t, s, rd at the last ocean level 
    249  
     264            IF( ln_zps .AND. .NOT. ln_isfcav)                                & 
     265               &             CALL zps_hde    ( kstp, jpts, tsa, gtsu, gtsv,  &    ! Partial steps: before horizontal gradient 
     266               &                                           rhd, gru , grv    )  ! of t, s, rd at the last ocean level 
     267            IF( ln_zps .AND.       ln_isfcav)                                & 
     268               &             CALL zps_hde_isf( kstp, jpts, tsa, gtsu, gtsv,  &    ! Partial steps for top cell (ISF) 
     269               &                                           rhd, gru , grv , aru , arv , gzu , gzv , ge3ru , ge3rv ,   & 
     270               &                                    gtui, gtvi, grui, grvi, arui, arvi, gzui, gzvi, ge3rui, ge3rvi    ) ! of t, s, rd at the last ocean level 
    250271      ELSE                                                  ! centered hpg  (eos then time stepping) 
    251272         IF ( .NOT. lk_dynspg_ts ) THEN                     ! eos already called in time-split case 
    252                                 CALL eos    ( tsn, rhd, rhop, fsdept_n(:,:,:) )  ! now in situ density for hpg computation 
    253             IF( ln_zps      )   CALL zps_hde( kstp, jpts, tsn, gtsu, gtsv,  &    ! zps: now hor. derivative 
    254             &                                          rhd, gru , grv  )      ! of t, s, rd at the last ocean level 
     273                             CALL eos    ( tsn, rhd, rhop, fsdept_n(:,:,:) )  ! now in situ density for hpg computation 
     274         IF( ln_zps .AND. .NOT. ln_isfcav)                                   & 
     275               &             CALL zps_hde    ( kstp, jpts, tsn, gtsu, gtsv,  &    ! Partial steps: before horizontal gradient 
     276               &                                           rhd, gru , grv    )  ! of t, s, rd at the last ocean level 
     277         IF( ln_zps .AND.       ln_isfcav)                                   &  
     278               &             CALL zps_hde_isf( kstp, jpts, tsn, gtsu, gtsv,  &    ! Partial steps for top cell (ISF) 
     279               &                                           rhd, gru , grv , aru , arv , gzu , gzv , ge3ru , ge3rv ,   & 
     280               &                                    gtui, gtvi, grui, grvi, arui, arvi, gzui, gzvi, ge3rui, ge3rvi    ) ! of t, s, rd at the last ocean level 
    255281         ENDIF 
    256282         IF( ln_zdfnpc   )   CALL tra_npc( kstp )                ! update after fields by non-penetrative convection 
     
    302328      IF( lk_diaobs  )         CALL dia_obs( kstp )         ! obs-minus-model (assimilation) diagnostics (call after dynamics update) 
    303329 
    304       IF( lrst_oce .AND. ln_diahsb )   CALL dia_hsb_rst( kstp, 'WRITE' ) 
    305330      !>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
    306331      ! Control and restarts 
     
    314339                 CALL iom_close( numror )     ! close input  ocean restart file 
    315340         IF(lwm) CALL FLUSH    ( numond )     ! flush output namelist oce 
    316          IF(lwm) CALL FLUSH    ( numoni )     ! flush output namelist ice     
     341         IF( lwm.AND.numoni /= -1 ) CALL FLUSH    ( numoni )     ! flush output namelist ice 
    317342      ENDIF 
    318343      IF( lrst_oce         )   CALL rst_write    ( kstp )   ! write output ocean restart file 
    319  
    320       !>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
    321       ! Trends                              (ua, va, tsa used as workspace) 
    322       !<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< 
    323       IF( nstop == 0 ) THEN 
    324          IF( lk_trddyn     )   CALL trd_dwr( kstp )         ! trends: dynamics 
    325          IF( lk_trdtra     )   CALL trd_twr( kstp )         ! trends: active tracers 
    326          IF( lk_trdmld     )   CALL trd_mld( kstp )         ! trends: Mixed-layer 
    327          IF( lk_trdvor     )   CALL trd_vor( kstp )         ! trends: vorticity budget 
    328       ENDIF 
    329344 
    330345      !>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.