New URL for NEMO forge!   http://forge.nemo-ocean.eu

Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
This present forge is now archived and remained online for history.
Changeset 5581 for branches/2014/dev_r4765_CNRS_agrif/NEMOGCM/CONFIG/SHARED/namelist_ref – NEMO

Ignore:
Timestamp:
2015-07-10T13:28:53+02:00 (9 years ago)
Author:
timgraham
Message:

Merged head of trunk into branch

File:
1 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • branches/2014/dev_r4765_CNRS_agrif/NEMOGCM/CONFIG/SHARED/namelist_ref

    r4699 r5581  
    11!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
    2 !! NEMO/OPA  :  1 - run manager      (namrun, namcfg) 
    3 !! namelists    2 - Domain           (namzgr, namzgr_sco, namdom, namtsd) 
     2!! NEMO/OPA  :  1 - run manager      (namrun) 
     3!! namelists    2 - Domain           (namcfg, namzgr, namzgr_sco, namdom, namtsd) 
    44!!              3 - Surface boundary (namsbc, namsbc_ana, namsbc_flx, namsbc_clio, namsbc_core, namsbc_sas 
    55!!                                    namsbc_cpl, namtra_qsr, namsbc_rnf, 
     
    1010!!              7 - dynamics         (namdyn_adv, namdyn_vor, namdyn_hpg, namdyn_spg, namdyn_ldf) 
    1111!!              8 - Verical physics  (namzdf, namzdf_ric, namzdf_tke, namzdf_kpp, namzdf_ddm, namzdf_tmx) 
    12 !!              9 - diagnostics      (namnc4, namtrd, namspr, namflo, namptr, namhsb) 
     12!!              9 - diagnostics      (namnc4, namtrd, namspr, namflo, namhsb, namsto) 
    1313!!             10 - miscellaneous    (namsol, nammpp, namctl) 
    1414!!             11 - Obs & Assim      (namobs, nam_asminc) 
     
    1818!!                   ***  Run management namelists  *** 
    1919!!====================================================================== 
    20 !!   namrun        parameters of the run 
     20!!   namrun       parameters of the run 
    2121!!====================================================================== 
    2222! 
     
    3131   nn_leapy    =       0   !  Leap year calendar (1) or not (0) 
    3232   ln_rstart   = .false.   !  start from rest (F) or from a restart file (T) 
    33    nn_euler    =       1   !  = 0 : start with forward time step if ln_rstart=.true. 
    34    nn_rstctl   =       0   !  restart control => activated only if ln_rstart = T 
     33   nn_euler    =       1   !  = 0 : start with forward time step if ln_rstart=T 
     34   nn_rstctl   =       0   !  restart control ==> activated only if ln_rstart=T 
    3535                           !    = 0 nn_date0 read in namelist ; nn_it000 : read in namelist 
    3636                           !    = 1 nn_date0 read in namelist ; nn_it000 : check consistancy between namelist and restart 
    3737                           !    = 2 nn_date0 read in restart  ; nn_it000 : check consistancy between namelist and restart 
    3838   cn_ocerst_in  = "restart"   !  suffix of ocean restart name (input) 
     39   cn_ocerst_indir = "."       !  directory from which to read input ocean restarts 
    3940   cn_ocerst_out = "restart"   !  suffix of ocean restart name (output) 
     41   cn_ocerst_outdir = "."      !  directory in which to write output ocean restarts 
    4042   nn_istate   =       0   !  output the initial state (1) or not (0) 
     43   ln_rst_list = .false.   !  output restarts at list of times using nn_stocklist (T) or at set frequency with nn_stock (F) 
    4144   nn_stock    =    5475   !  frequency of creation of a restart file (modulo referenced to 1) 
     45   nn_stocklist = 0,0,0,0,0,0,0,0,0,0 ! List of timesteps when a restart file is to be written 
    4246   nn_write    =    5475   !  frequency of write in the output file   (modulo referenced to nn_it000) 
    4347   ln_dimgnnn  = .false.   !  DIMG file format: 1 file for all processors (F) or by processor (T) 
    4448   ln_mskland  = .false.   !  mask land points in NetCDF outputs (costly: + ~15%) 
     49   ln_cfmeta   = .false.   !  output additional data to netCDF files required for compliance with the CF metadata standard 
    4550   ln_clobber  = .false.   !  clobber (overwrite) an existing file 
    4651   nn_chunksz  =       0   !  chunksize (bytes) for NetCDF file (works only with iom_nf90 routines) 
    4752/ 
    4853! 
    49 !----------------------------------------------------------------------- 
    50 &namcfg     !   default parameters of the configuration       
     54!!====================================================================== 
     55!!                      ***  Domain namelists  *** 
     56!!====================================================================== 
     57!!   namcfg       parameters of the configuration 
     58!!   namzgr       vertical coordinate 
     59!!   namzgr_sco   s-coordinate or hybrid z-s-coordinate 
     60!!   namdom       space and time domain (bathymetry, mesh, timestep) 
     61!!   namtsd       data: temperature & salinity 
     62!!====================================================================== 
     63! 
     64!----------------------------------------------------------------------- 
     65&namcfg     !   parameters of the configuration 
    5166!----------------------------------------------------------------------- 
    5267   cp_cfg      =  "default"            !  name of the configuration 
    53    cp_cfz      =         ''            !  name of the zoom of configuration 
     68   cp_cfz      =  "no zoom"            !  name of the zoom of configuration 
    5469   jp_cfg      =       0               !  resolution of the configuration 
    5570   jpidta      =      10               !  1st lateral dimension ( >= jpi ) 
     
    5772   jpkdta      =      31               !  number of levels      ( >= jpk ) 
    5873   jpiglo      =      10               !  1st dimension of global domain --> i =jpidta 
    59    jpjglo      =      12               !  2nd    -                  -    --> j  =jpjdta 
     74   jpjglo      =      12               !  2nd    -                  -    --> j =jpjdta 
    6075   jpizoom     =       1               !  left bottom (i,j) indices of the zoom 
    6176   jpjzoom     =       1               !  in data domain indices 
    6277   jperio      =       0               !  lateral cond. type (between 0 and 6) 
    6378                                       !  = 0 closed                 ;   = 1 cyclic East-West 
    64                                        !  = 2 equatorial symmetric   ;   = 3 North fold T-point pivot  
     79                                       !  = 2 equatorial symmetric   ;   = 3 North fold T-point pivot 
    6580                                       !  = 4 cyclic East-West AND North fold T-point pivot 
    6681                                       !  = 5 North fold F-point pivot 
    6782                                       !  = 6 cyclic East-West AND North fold F-point pivot 
    68 / 
    69 !!====================================================================== 
    70 !!                      ***  Domain namelists  *** 
    71 !!====================================================================== 
    72 !!   namzgr       vertical coordinate 
    73 !!   namzgr_sco   s-coordinate or hybrid z-s-coordinate 
    74 !!   namdom       space and time domain (bathymetry, mesh, timestep) 
    75 !!   namtsd       data: temperature & salinity 
    76 !!====================================================================== 
    77 ! 
     83   ln_use_jattr = .false.              !  use (T) the file attribute: open_ocean_jstart, if present 
     84                                       !  in netcdf input files, as the start j-row for reading 
     85/ 
    7886!----------------------------------------------------------------------- 
    7987&namzgr        !   vertical coordinate 
     
    8290   ln_zps      = .true.    !  z-coordinate - partial steps   (T/F) 
    8391   ln_sco      = .false.   !  s- or hybrid z-s-coordinate    (T/F) 
     92   ln_isfcav   = .false.   !  ice shelf cavity               (T/F) 
    8493/ 
    8594!----------------------------------------------------------------------- 
     
    97106                        !!!!!!!  SH94 stretching coefficients  (ln_s_sh94 = .true.) 
    98107   rn_theta    =    6.0    !  surface control parameter (0<=theta<=20) 
    99    rn_bb       =    0.8    !  stretching with SH94 s-sigma    
     108   rn_bb       =    0.8    !  stretching with SH94 s-sigma 
    100109                        !!!!!!!  SF12 stretching coefficient  (ln_s_sf12 = .true.) 
    101110   rn_alpha    =    4.4    !  stretching with SF12 s-sigma 
     
    106115   rn_zb_b     =   -0.2    !  offset for calculating Zb 
    107116                        !!!!!!!! Other stretching (not SH94 or SF12) [also uses rn_theta above] 
    108    rn_thetb    =    1.0    !  bottom control parameter  (0<=thetb<= 1)  
     117   rn_thetb    =    1.0    !  bottom control parameter  (0<=thetb<= 1) 
    109118/ 
    110119!----------------------------------------------------------------------- 
     
    114123   rn_bathy    =    0.     !  value of the bathymetry. if (=0) bottom flat at jpkm1 
    115124   nn_closea   =    0      !  remove (=0) or keep (=1) closed seas and lakes (ORCA) 
    116    nn_msh      =    0      !  create (=1) a mesh file or not (=0) 
     125   nn_msh      =    1      !  create (=1) a mesh file or not (=0) 
    117126   rn_hmin     =   -3.     !  min depth of the ocean (>0) or min number of ocean level (<0) 
    118127   rn_e3zps_min=   20.     !  partial step thickness is set larger than the minimum of 
     
    160169   nn_baro       =    30               !  Number of iterations of barotropic mode 
    161170                                       !  during rn_rdt seconds. Only used if ln_bt_nn_auto=F 
    162    rn_bt_cmax    =    0.8              !  Maximum courant number allowed if ln_bt_nn_auto=T  
     171   rn_bt_cmax    =    0.8              !  Maximum courant number allowed if ln_bt_nn_auto=T 
    163172   nn_bt_flt     =    1                !  Time filter choice 
    164173                                       !  = 0 None 
    165174                                       !  = 1 Boxcar over   nn_baro barotropic steps 
    166                                        !  = 2 Boxcar over 2*nn_baro     "        "   
     175                                       !  = 2 Boxcar over 2*nn_baro     "        " 
    167176/ 
    168177!----------------------------------------------------------------------- 
     
    211220!!   namsbc_core     CORE bulk formulae formulation 
    212221!!   namsbc_mfs      MFS  bulk formulae formulation 
    213 !!   namsbc_cpl      CouPLed            formulation                     ("key_coupled") 
     222!!   namsbc_cpl      CouPLed            formulation                     ("key_oasis3") 
    214223!!   namsbc_sas      StAndalone Surface module 
    215224!!   namtra_qsr      penetrative solar radiation 
    216225!!   namsbc_rnf      river runoffs 
     226!!   namsbc_isf      ice shelf melting/freezing 
    217227!!   namsbc_apr      Atmospheric Pressure 
    218228!!   namsbc_ssr      sea surface restoring term (for T and/or S) 
     
    230240   ln_blk_core = .true.    !  CORE bulk formulation                     (T => fill namsbc_core) 
    231241   ln_blk_mfs  = .false.   !  MFS bulk formulation                      (T => fill namsbc_mfs ) 
    232    ln_cpl      = .false.   !  Coupled formulation                       (T => fill namsbc_cpl ) 
     242   ln_cpl      = .false.   !  atmosphere coupled   formulation          ( requires key_oasis3 ) 
     243   ln_mixcpl   = .false.   !  forced-coupled mixed formulation          ( requires key_oasis3 ) 
     244   nn_components = 0       !  configuration of the opa-sas OASIS coupling 
     245                           !  =0 no opa-sas OASIS coupling: default single executable configuration 
     246                           !  =1 opa-sas OASIS coupling: multi executable configuration, OPA component 
     247                           !  =2 opa-sas OASIS coupling: multi executable configuration, SAS component  
    233248   ln_apr_dyn  = .false.   !  Patm gradient added in ocean & ice Eqs.   (T => fill namsbc_apr ) 
    234249   nn_ice      = 2         !  =0 no ice boundary condition   , 
    235250                           !  =1 use observed ice-cover      , 
    236                            !  =2 ice-model used                         ("key_lim3" or "key_lim2) 
     251                           !  =2 ice-model used                         ("key_lim3" or "key_lim2") 
    237252   nn_ice_embd = 1         !  =0 levitating ice (no mass exchange, concentration/dilution effect) 
    238253                           !  =1 levitating ice with mass and salt exchange but no presure effect 
    239254                           !  =2 embedded sea-ice (full salt and mass exchanges and pressure) 
    240255   ln_dm2dc    = .false.   !  daily mean to diurnal cycle on short wave 
    241    ln_rnf      = .true.    !  runoffs                                   (T => fill namsbc_rnf) 
     256   ln_rnf      = .true.    !  runoffs                                   (T   => fill namsbc_rnf) 
     257   nn_isf      = 0         !  ice shelf melting/freezing                (/=0 => fill namsbc_isf) 
     258                           !  0 =no isf                  1 = presence of ISF 
     259                           !  2 = bg03 parametrisation   3 = rnf file for isf 
     260                           !  4 = ISF fwf specified 
     261                           !  option 1 and 4 need ln_isfcav = .true. (domzgr) 
    242262   ln_ssr      = .true.    !  Sea Surface Restoring on T and/or S       (T => fill namsbc_ssr) 
    243263   nn_fwb      = 2         !  FreshWater Budget: =0 unchecked 
    244264                           !     =1 global mean of e-p-r set to zero at each time step 
    245265                           !     =2 annual global mean of e-p-r set to zero 
    246                            !     =3 global emp set to zero and spread out over erp area 
    247266   ln_wave = .false.       !  Activate coupling with wave (either Stokes Drift or Drag coefficient, or both)  (T => fill namsbc_wave) 
    248267   ln_cdgw = .false.       !  Neutral drag coefficient read from wave model (T => fill namsbc_wave) 
     
    250269   nn_lsm  = 0             !  =0 land/sea mask for input fields is not applied (keep empty land/sea mask filename field) , 
    251270                           !  =1:n number of iterations of land/sea mask application for input fields (fill land/sea mask filename field) 
    252    cn_iceflx = 'linear'    !  redistribution of solar input into ice categories during coupling ice/atm. 
     271   nn_limflx = -1          !  LIM3 Multi-category heat flux formulation (use -1 if LIM3 is not used) 
     272                           !  =-1  Use per-category fluxes, bypass redistributor, forced mode only, not yet implemented coupled 
     273                           !  = 0  Average per-category fluxes (forced and coupled mode) 
     274                           !  = 1  Average and redistribute per-category fluxes, forced mode only, not yet implemented coupled 
     275                           !  = 2  Redistribute a single flux over categories (coupled mode only) 
    253276/ 
    254277!----------------------------------------------------------------------- 
     
    265288&namsbc_flx    !   surface boundary condition : flux formulation 
    266289!----------------------------------------------------------------------- 
    267 !              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask !  
     290!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
    268291!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
    269292   sn_utau     = 'utau'      ,        24         , 'utau'    , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , ''       , '' 
     
    306329 
    307330   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the bulk files 
    308    ln_2m       = .false.   !  air temperature and humidity referenced at 2m (T) instead 10m (F) 
    309331   ln_taudif   = .false.   !  HF tau contribution: use "mean of stress module - module of the mean stress" data 
    310    ln_bulk2z   = .false.   !  Air temperature/humidity and wind vectors are referenced at heights rn_zqt and rn_zu 
    311    rn_zqt      = 3.        !  Air temperature and humidity reference height (m) (ln_bulk2z) 
    312    rn_zu       = 4.        !  Wind vector reference height (m)                  (ln_bulk2z) 
     332   rn_zqt      = 10.        !  Air temperature and humidity reference height (m) 
     333   rn_zu       = 10.        !  Wind vector reference height (m) 
    313334   rn_pfac     = 1.        !  multiplicative factor for precipitation (total & snow) 
    314335   rn_efac     = 1.        !  multiplicative factor for evaporation (0. or 1.) 
    315    rn_vfac     = 0.        !  multiplicative factor for ocean/ice velocity  
     336   rn_vfac     = 0.        !  multiplicative factor for ocean/ice velocity 
    316337                           !  in the calculation of the wind stress (0.=absolute winds or 1.=relative winds) 
    317338/ 
     
    332353/ 
    333354!----------------------------------------------------------------------- 
    334 &namsbc_cpl    !   coupled ocean/atmosphere model                       ("key_coupled") 
     355&namsbc_cpl    !   coupled ocean/atmosphere model                       ("key_oasis3") 
    335356!----------------------------------------------------------------------- 
    336357!                    !     description       !  multiple  !    vector   !      vector          ! vector ! 
    337358!                    !                       ! categories !  reference  !    orientation       ! grids  ! 
    338359! send 
    339 sn_snd_temp   =       'weighted oce and ice' ,    'no'    ,     ''      ,         ''           ,   '' 
    340 sn_snd_alb    =       'weighted ice'         ,    'no'    ,     ''      ,         ''           ,   '' 
    341 sn_snd_thick  =       'none'                 ,    'no'   ,     ''      ,         ''           ,   '' 
    342 sn_snd_crt    =       'none'                 ,    'no'    , 'spherical' , 'eastward-northward' ,  'T' 
    343 sn_snd_co2    =       'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''           ,   '' 
     360   sn_snd_temp   =       'weighted oce and ice' ,    'no'    ,     ''      ,         ''           ,   '' 
     361   sn_snd_alb    =       'weighted ice'         ,    'no'    ,     ''      ,         ''           ,   '' 
     362   sn_snd_thick  =       'none'                 ,    'no'   ,     ''      ,         ''           ,   '' 
     363   sn_snd_crt    =       'none'                 ,    'no'    , 'spherical' , 'eastward-northward' ,  'T' 
     364   sn_snd_co2    =       'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''           ,   '' 
    344365! receive 
    345 sn_rcv_w10m   =       'none'                 ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
    346 sn_rcv_taumod =       'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
    347 sn_rcv_tau    =       'oce only'             ,    'no'    , 'cartesian' , 'eastward-northward',  'U,V' 
    348 sn_rcv_dqnsdt =       'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
    349 sn_rcv_qsr    =       'oce and ice'          ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
    350 sn_rcv_qns    =       'oce and ice'          ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
    351 sn_rcv_emp    =       'conservative'         ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
    352 sn_rcv_rnf    =       'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
    353 sn_rcv_cal    =       'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
    354 sn_rcv_co2    =       'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
     366   sn_rcv_w10m   =       'none'                 ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
     367   sn_rcv_taumod =       'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
     368   sn_rcv_tau    =       'oce only'             ,    'no'    , 'cartesian' , 'eastward-northward',  'U,V' 
     369   sn_rcv_dqnsdt =       'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
     370   sn_rcv_qsr    =       'oce and ice'          ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
     371   sn_rcv_qns    =       'oce and ice'          ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
     372   sn_rcv_emp    =       'conservative'         ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
     373   sn_rcv_rnf    =       'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
     374   sn_rcv_cal    =       'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
     375   sn_rcv_co2    =       'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
     376! 
     377   nn_cplmodel   =     1     !  Maximum number of models to/from which NEMO is potentialy sending/receiving data 
     378   ln_usecplmask = .false.   !  use a coupling mask file to merge data received from several models 
     379                             !   -> file cplmask.nc with the float variable called cplmask (jpi,jpj,nn_cplmodel) 
    355380/ 
    356381!----------------------------------------------------------------------- 
     
    359384!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
    360385!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
    361    sn_usp      = 'sas_grid_U' ,    120           , 'vozocrtx' ,  .true.    , .true. ,   'yearly'  , ''       , ''             , ''       
     386   sn_usp      = 'sas_grid_U' ,    120           , 'vozocrtx' ,  .true.    , .true. ,   'yearly'  , ''       , ''             , '' 
    362387   sn_vsp      = 'sas_grid_V' ,    120           , 'vomecrty' ,  .true.    , .true. ,   'yearly'  , ''       , ''             , '' 
    363388   sn_tem      = 'sas_grid_T' ,    120           , 'sosstsst' ,  .true.    , .true. ,   'yearly'  , ''       , ''             , '' 
    364389   sn_sal      = 'sas_grid_T' ,    120           , 'sosaline' ,  .true.    , .true. ,   'yearly'  , ''       , ''             , '' 
    365390   sn_ssh      = 'sas_grid_T' ,    120           , 'sossheig' ,  .true.    , .true. ,   'yearly'  , ''       , ''             , '' 
    366  
    367    ln_3d_uv    = .true.    !  specify whether we are supplying a 3D u,v field 
     391   sn_e3t      = 'sas_grid_T' ,    120           , 'e3t_m'    ,  .true.    , .true. ,   'yearly'  , ''       , ''             , '' 
     392   sn_frq      = 'sas_grid_T' ,    120           , 'frq_m'    ,  .true.    , .true. ,   'yearly'  , ''       , ''             , '' 
     393 
     394   ln_3d_uve   = .true.    !  specify whether we are supplying a 3D u,v and e3 field 
     395   ln_read_frq = .false.    !  specify whether we must read frq or not 
    368396   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the bulk files are 
    369397/ 
     
    398426 
    399427   cn_dir       = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
    400    ln_rnf_emp   = .false.   !  runoffs included into precipitation field (T) or into a file (F) 
    401428   ln_rnf_mouth = .true.    !  specific treatment at rivers mouths 
    402429   rn_hrnf      =  15.e0    !  depth over which enhanced vertical mixing is used 
     
    406433   ln_rnf_tem   = .false.   !  read in temperature information for runoff 
    407434   ln_rnf_sal   = .false.   !  read in salinity information for runoff 
     435   ln_rnf_depth_ini = .false.  ! compute depth at initialisation from runoff file 
     436   rn_rnf_max   = 5.735e-4  !  max value of the runoff climatologie over global domain ( ln_rnf_depth_ini = .true ) 
     437   rn_dep_max   = 150.      !  depth over which runoffs is spread ( ln_rnf_depth_ini = .true ) 
     438   nn_rnf_depth_file = 0    !  create (=1) a runoff depth file or not (=0) 
     439/ 
     440!----------------------------------------------------------------------- 
     441&namsbc_isf    !  Top boundary layer (ISF) 
     442!----------------------------------------------------------------------- 
     443!              ! file name ! frequency (hours) ! variable ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     444!              !           !  (if <0  months)  !   name   !    (logical)   !  (T/F)  ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     445! nn_isf == 4 
     446   sn_qisf      = 'rnfisf' ,         -12      ,'sohflisf',    .false.      , .true.  , 'yearly'  ,  ''      ,   '' 
     447   sn_fwfisf    = 'rnfisf' ,         -12      ,'sowflisf',    .false.      , .true.  , 'yearly'  ,  ''      ,   '' 
     448! nn_isf == 3 
     449   sn_rnfisf    = 'runoffs' ,         -12      ,'sofwfisf',    .false.      , .true.  , 'yearly'  ,  ''      ,   '' 
     450! nn_isf == 2 and 3 
     451   sn_depmax_isf = 'runoffs' ,       -12        ,'sozisfmax' ,   .false.  , .true.  , 'yearly'  ,  ''      ,   '' 
     452   sn_depmin_isf = 'runoffs' ,       -12        ,'sozisfmin' ,   .false.  , .true.  , 'yearly'  ,  ''      ,   '' 
     453! nn_isf == 2 
     454   sn_Leff_isf = 'rnfisf' ,       0          ,'Leff'         ,   .false.  , .true.  , 'yearly'  ,  ''      ,   '' 
     455! for all case 
     456   ln_divisf   = .true.  ! apply isf melting as a mass flux or in the salinity trend. (maybe I should remove this option as for runoff?) 
     457! only for nn_isf = 1 or 2 
     458   rn_gammat0  = 1.0e-4   ! gammat coefficient used in blk formula 
     459   rn_gammas0  = 1.0e-4   ! gammas coefficient used in blk formula 
     460! only for nn_isf = 1 
     461   nn_isfblk   =  1       ! 1 ISOMIP ; 2 conservative (3 equation formulation, Jenkins et al. 1991 ??) 
     462   rn_hisf_tbl =  30.      ! thickness of the top boundary layer           (Losh et al. 2008) 
     463                          ! 0 => thickness of the tbl = thickness of the first wet cell 
     464   ln_conserve = .true.   ! conservative case (take into account meltwater advection) 
     465   nn_gammablk = 1        ! 0 = cst Gammat (= gammat/s) 
     466                          ! 1 = velocity dependend Gamma (u* * gammat/s)  (Jenkins et al. 2010) 
     467                          !     if you want to keep the cd as in global config, adjust rn_gammat0 to compensate 
     468                          ! 2 = velocity and stability dependent Gamma    Holland et al. 1999 
    408469/ 
    409470!----------------------------------------------------------------------- 
     
    415476 
    416477   cn_dir      = './'       !  root directory for the location of the bulk files 
    417    rn_pref     = 101000._wp !  reference atmospheric pressure   [N/m2]/ 
     478   rn_pref     = 101000.    !  reference atmospheric pressure   [N/m2]/ 
    418479   ln_ref_apr  = .false.    !  ref. pressure: global mean Patm (T) or a constant (F) 
    419480   ln_apr_obc  = .false.    !  inverse barometer added to OBC ssh data 
     
    455516                                                      ! Initial mass required for an iceberg of each class 
    456517      rn_initial_mass          = 8.8e7, 4.1e8, 3.3e9, 1.8e10, 3.8e10, 7.5e10, 1.2e11, 2.2e11, 3.9e11, 7.4e11 
    457                                                       ! Proportion of calving mass to apportion to each class   
     518                                                      ! Proportion of calving mass to apportion to each class 
    458519      rn_distribution          = 0.24, 0.12, 0.15, 0.18, 0.12, 0.07, 0.03, 0.03, 0.03, 0.02 
    459520                                                      ! Ratio between effective and real iceberg mass (non-dim) 
    460                                                       ! i.e. number of icebergs represented at a point          
     521                                                      ! i.e. number of icebergs represented at a point 
    461522      rn_mass_scaling          = 2000, 200, 50, 20, 10, 5, 2, 1, 1, 1 
    462523                                                      ! thickness of newly calved bergs (m) 
     
    467528      rn_bits_erosion_fraction = 0.                   ! Fraction of erosion melt flux to divert to bergy bits 
    468529      rn_sicn_shift            = 0.                   ! Shift of sea-ice concn in erosion flux (0<sicn_shift<1) 
    469       ln_passive_mode          = .false.              ! iceberg - ocean decoupling    
     530      ln_passive_mode          = .false.              ! iceberg - ocean decoupling 
    470531      nn_test_icebergs         =  10                  ! Create test icebergs of this class (-1 = no) 
    471532                                                      ! Put a test iceberg at each gridpoint in box (lon1,lon2,lat1,lat2) 
    472533      rn_test_box              = 108.0,  116.0, -66.0, -58.0 
    473       rn_speed_limit           = 0.                   ! CFL speed limit for a berg    
     534      rn_speed_limit           = 0.                   ! CFL speed limit for a berg 
    474535 
    475536!              ! file name ! frequency (hours) !   variable   ! time interp.   !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
    476537!              !           !  (if <0  months)  !     name     !   (logical)    !  (T/F ) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
    477538      sn_icb =  'calving' ,       -1           , 'calvingmask',  .true.        , .true.  , 'yearly'  , ''       , ''       , '' 
    478     
    479       cn_dir = './'  
     539 
     540      cn_dir = './' 
    480541/ 
    481542 
     
    531592   rn_sponge_tra = 2880.   !  coefficient for tracer   sponge layer [m2/s] 
    532593   rn_sponge_dyn = 2880.   !  coefficient for dynamics sponge layer [m2/s] 
     594   ln_chk_bathy  = .FALSE. ! 
    533595/ 
    534596!----------------------------------------------------------------------- 
     
    538600   ln_tide_ramp  = .false.  ! 
    539601   rdttideramp   =    0.    ! 
    540    clname(1)     =   'M2'   !  name of constituent 
    541    clname(2)     =   'S2' 
    542    clname(3)     =   'N2' 
    543    clname(4)     =   'K1' 
    544    clname(5)     =   'O1' 
    545    clname(6)     =   'Q1' 
    546    clname(7)     =   'M4' 
    547    clname(8)     =   'K2' 
    548    clname(9)     =   'P1' 
    549    clname(10)    =   'Mf' 
    550    clname(11)    =   'Mm' 
     602   clname(1)     = 'DUMMY'  !  name of constituent - all tidal components must be set in namelist_cfg 
    551603/ 
    552604!----------------------------------------------------------------------- 
     
    563615                                          !  = 2, use tidal harmonic forcing data from files 
    564616                                          !  = 3, use external data AND tidal harmonic forcing 
    565     cn_dyn3d      =  'none'               !   
     617    cn_dyn3d      =  'none'               ! 
    566618    nn_dyn3d_dta  =  0                    !  = 0, bdy data are equal to the initial state 
    567619                                          !  = 1, bdy data are read in 'bdydata   .nc' files 
    568     cn_tra        =  'none'               !  
     620    cn_tra        =  'none'               ! 
    569621    nn_tra_dta    =  0                    !  = 0, bdy data are equal to the initial state 
    570622                                          !  = 1, bdy data are read in 'bdydata   .nc' files 
    571     cn_ice_lim      =  'none'             !   
     623    cn_ice_lim      =  'none'             ! 
    572624    nn_ice_lim_dta  =  0                  !  = 0, bdy data are equal to the initial state 
    573625                                          !  = 1, bdy data are read in 'bdydata   .nc' files 
     
    578630    ln_tra_dmp    =.false.                !  open boudaries conditions for tracers 
    579631    ln_dyn3d_dmp  =.false.                !  open boundary condition for baroclinic velocities 
    580     rn_time_dmp   =  1.                   ! Damping time scale in days  
     632    rn_time_dmp   =  1.                   ! Damping time scale in days 
    581633    rn_time_dmp_out =  1.                 ! Outflow damping time scale 
    582634    nn_rimwidth   = 10                    !  width of the relaxation zone 
     
    631683   rn_bfri2_max =   1.e-1  !  max. bottom drag coefficient (non linear case and ln_loglayer=T) 
    632684   rn_bfeb2    =    2.5e-3 !  bottom turbulent kinetic energy background  (m2/s2) 
    633    rn_bfrz0    =    3.e-3  !  bottom roughness [m] if ln_loglayer=T  
    634    ln_loglayer = .false.   !  logarithmic formulation (non linear case) 
     685   rn_bfrz0    =    3.e-3  !  bottom roughness [m] if ln_loglayer=T 
    635686   ln_bfr2d    = .false.   !  horizontal variation of the bottom friction coef (read a 2D mask file ) 
    636687   rn_bfrien   =    50.    !  local multiplying factor of bfr (ln_bfr2d=T) 
     688   rn_tfri1    =    4.e-4  !  top drag coefficient (linear case) 
     689   rn_tfri2    =    2.5e-3 !  top drag coefficient (non linear case). Minimum coeft if ln_loglayer=T 
     690   rn_tfri2_max =   1.e-1  !  max. top drag coefficient (non linear case and ln_loglayer=T) 
     691   rn_tfeb2    =    0.0    !  top turbulent kinetic energy background  (m2/s2) 
     692   rn_tfrz0    =    3.e-3  !  top roughness [m] if ln_loglayer=T 
     693   ln_tfr2d    = .false.   !  horizontal variation of the top friction coef (read a 2D mask file ) 
     694   rn_tfrien   =    50.    !  local multiplying factor of tfr (ln_tfr2d=T) 
     695 
    637696   ln_bfrimp   = .true.    !  implicit bottom friction (requires ln_zdfexp = .false. if true) 
     697   ln_loglayer = .false.   !  logarithmic formulation (non linear case) 
    638698/ 
    639699!----------------------------------------------------------------------- 
    640700&nambbc        !   bottom temperature boundary condition 
    641701!----------------------------------------------------------------------- 
     702!              !                              !  (if <0  months)  !   
     703!              !  file name      ! frequency (hours) ! variable   ! time interp.   !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
     704!              !                 !  (if <0  months)  !   name     !   (logical)    !  (T/F ) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
     705   sn_qgh      ='geothermal_heating.nc',  -12.  , 'heatflow'      ,   .false.      , .true.  , 'yearly'  , ''       , ''       , '' 
     706   ! 
     707   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
    642708   ln_trabbc   = .true.    !  Apply a geothermal heating at the ocean bottom 
    643709   nn_geoflx   =    2      !  geothermal heat flux: = 0 no flux 
     
    645711                           !     = 2 variable flux (read in geothermal_heating.nc in mW/m2) 
    646712   rn_geoflx_cst = 86.4e-3 !  Constant value of geothermal heat flux [W/m2] 
     713 
    647714/ 
    648715!----------------------------------------------------------------------- 
     
    660727!!   nameos        equation of state 
    661728!!   namtra_adv    advection scheme 
     729!!   namtra_adv_mle   mixed layer eddy param. (Fox-Kemper param.) 
    662730!!   namtra_ldf    lateral diffusion scheme 
    663731!!   namtra_dmp    T & S newtonian damping 
     
    667735&nameos        !   ocean physical parameters 
    668736!----------------------------------------------------------------------- 
    669    nn_eos      =   0       !  type of equation of state and Brunt-Vaisala frequency 
    670                            !     = 0, UNESCO (formulation of Jackett and McDougall (1994) and of McDougall (1987) ) 
    671                            !     = 1, linear: rho(T)   = rau0 * ( 1.028 - ralpha * T ) 
    672                            !     = 2, linear: rho(T,S) = rau0 * ( rbeta * S - ralpha * T ) 
    673    rn_alpha    =   2.0e-4  !  thermal expension coefficient (nn_eos= 1 or 2) 
    674    rn_beta     =   7.7e-4  !  saline  expension coefficient (nn_eos= 2) 
     737   nn_eos      =  -1     !  type of equation of state and Brunt-Vaisala frequency 
     738                                 !  =-1, TEOS-10 
     739                                 !  = 0, EOS-80 
     740                                 !  = 1, S-EOS   (simplified eos) 
     741   ln_useCT    = .true.  ! use of Conservative Temp. ==> surface CT converted in Pot. Temp. in sbcssm 
     742   !                             ! 
     743   !                     ! S-EOS coefficients : 
     744   !                             !  rd(T,S,Z)*rau0 = -a0*(1+.5*lambda*dT+mu*Z+nu*dS)*dT+b0*dS 
     745   rn_a0       =  1.6550e-1      !  thermal expension coefficient (nn_eos= 1) 
     746   rn_b0       =  7.6554e-1      !  saline  expension coefficient (nn_eos= 1) 
     747   rn_lambda1  =  5.9520e-2      !  cabbeling coeff in T^2  (=0 for linear eos) 
     748   rn_lambda2  =  7.4914e-4      !  cabbeling coeff in S^2  (=0 for linear eos) 
     749   rn_mu1      =  1.4970e-4      !  thermobaric coeff. in T (=0 for linear eos) 
     750   rn_mu2      =  1.1090e-5      !  thermobaric coeff. in S (=0 for linear eos) 
     751   rn_nu       =  2.4341e-3      !  cabbeling coeff in T*S  (=0 for linear eos) 
    675752/ 
    676753!----------------------------------------------------------------------- 
    677754&namtra_adv    !   advection scheme for tracer 
    678755!----------------------------------------------------------------------- 
    679    ln_traadv_cen2   =  .false.  !  2nd order centered scheme 
    680    ln_traadv_tvd    =  .true.   !  TVD scheme 
    681    ln_traadv_muscl  =  .false.  !  MUSCL scheme 
    682    ln_traadv_muscl2 =  .false.  !  MUSCL2 scheme + cen2 at boundaries 
    683    ln_traadv_ubs    =  .false.  !  UBS scheme 
    684    ln_traadv_qck    =  .false.  !  QUICKEST scheme 
    685    ln_traadv_msc_ups=  .false.  !  use upstream scheme within muscl 
     756   ln_traadv_cen2   =  .false.   !  2nd order centered scheme 
     757   ln_traadv_tvd    =  .true.    !  TVD scheme 
     758   ln_traadv_muscl  =  .false.   !  MUSCL scheme 
     759   ln_traadv_muscl2 =  .false.   !  MUSCL2 scheme + cen2 at boundaries 
     760   ln_traadv_ubs    =  .false.   !  UBS scheme 
     761   ln_traadv_qck    =  .false.   !  QUICKEST scheme 
     762   ln_traadv_msc_ups=  .false.   !  use upstream scheme within muscl 
     763   ln_traadv_tvd_zts=  .false.  !  TVD scheme with sub-timestepping of vertical tracer advection 
    686764/ 
    687765!----------------------------------------------------------------------- 
     
    730808!----------------------------------------------------------------------- 
    731809   ln_tradmp   =  .true.   !  add a damping termn (T) or not (F) 
    732    nn_hdmp     =   -1      !  horizontal shape =-1, damping in Med and Red Seas only 
    733                            !                   =XX, damping poleward of XX degrees (XX>0) 
    734                            !                      + F(distance-to-coast) + Red and Med Seas 
    735810   nn_zdmp     =    0      !  vertical   shape =0    damping throughout the water column 
    736811                           !                   =1 no damping in the mixing layer (kz  criteria) 
    737812                           !                   =2 no damping in the mixed  layer (rho crieria) 
    738    rn_surf     =   50.     !  surface time scale of damping   [days] 
    739    rn_bot      =  360.     !  bottom  time scale of damping   [days] 
    740    rn_dep      =  800.     !  depth of transition between rn_surf and rn_bot [meters] 
    741    nn_file     =    0      !  create a damping.coeff NetCDF file (=1) or not (=0) 
     813   cn_resto    = 'resto.nc' ! Name of file containing restoration coefficient field (use dmp_tools to create this) 
    742814/ 
    743815 
     
    756828!----------------------------------------------------------------------- 
    757829   ln_dynadv_vec = .true.  !  vector form (T) or flux form (F) 
     830   nn_dynkeg     = 0       ! scheme for grad(KE): =0   C2  ;  =1   Hollingsworth correction 
    758831   ln_dynadv_cen2= .false. !  flux form - 2nd order centered scheme 
    759832   ln_dynadv_ubs = .false. !  flux form - 3rd order UBS      scheme 
     833   ln_dynzad_zts = .false. !  Use (T) sub timestepping for vertical momentum advection 
    760834/ 
    761835!----------------------------------------------------------------------- 
    762836&nam_vvl    !   vertical coordinate options 
    763837!----------------------------------------------------------------------- 
    764    ln_vvl_zstar  = .true.           !  zstar vertical coordinate                    
     838   ln_vvl_zstar  = .true.           !  zstar vertical coordinate 
    765839   ln_vvl_ztilde = .false.          !  ztilde vertical coordinate: only high frequency variations 
    766840   ln_vvl_layer  = .false.          !  full layer vertical coordinate 
     
    780854   ln_dynvor_mix = .false. !  mixed scheme 
    781855   ln_dynvor_een = .true.  !  energy & enstrophy scheme 
     856   ln_dynvor_een_old = .false.  !  energy & enstrophy scheme - original formulation 
    782857/ 
    783858!----------------------------------------------------------------------- 
     
    787862   ln_hpg_zps  = .true.    !  z-coordinate - partial steps (interpolation) 
    788863   ln_hpg_sco  = .false.   !  s-coordinate (standard jacobian formulation) 
     864   ln_hpg_isf  = .false.   !  s-coordinate (sco ) adapted to isf 
    789865   ln_hpg_djc  = .false.   !  s-coordinate (Density Jacobian with Cubic polynomial) 
    790866   ln_hpg_prj  = .false.   !  s-coordinate (Pressure Jacobian scheme) 
     
    882958                           !        = 1 add a tke source below the ML 
    883959                           !        = 2 add a tke source just at the base of the ML 
    884                            !        = 3 as = 1 applied on HF part of the stress    ("key_coupled") 
     960                           !        = 3 as = 1 applied on HF part of the stress    ("key_oasis3") 
    885961   rn_efr      =   0.05    !  fraction of surface tke value which penetrates below the ML (nn_etau=1 or 2) 
    886962   nn_htau     =   1       !  type of exponential decrease of tke penetration below the ML 
     
    904980&namzdf_gls                !   GLS vertical diffusion                   ("key_zdfgls") 
    905981!----------------------------------------------------------------------- 
    906    rn_emin       = 1.e-6   !  minimum value of e   [m2/s2] 
     982   rn_emin       = 1.e-7   !  minimum value of e   [m2/s2] 
    907983   rn_epsmin     = 1.e-12  !  minimum value of eps [m2/s3] 
    908984   ln_length_lim = .true.  !  limit on the dissipation rate under stable stratification (Galperin et al., 1988) 
    909    rn_clim_galp  = 0.53    !  galperin limit 
    910    ln_crban      = .true.  !  Use Craig & Banner (1994) surface wave mixing parametrisation 
     985   rn_clim_galp  = 0.267   !  galperin limit 
    911986   ln_sigpsi     = .true.  !  Activate or not Burchard 2001 mods on psi schmidt number in the wb case 
    912987   rn_crban      = 100.    !  Craig and Banner 1994 constant for wb tke flux 
    913988   rn_charn      = 70000.  !  Charnock constant for wb induced roughness length 
    914    nn_tkebc_surf =   1     !  surface tke condition (0/1/2=Dir/Neum/Dir Mellor-Blumberg) 
    915    nn_tkebc_bot  =   1     !  bottom tke condition (0/1=Dir/Neum) 
    916    nn_psibc_surf =   1     !  surface psi condition (0/1/2=Dir/Neum/Dir Mellor-Blumberg) 
    917    nn_psibc_bot  =   1     !  bottom psi condition (0/1=Dir/Neum) 
    918    nn_stab_func  =   2     !  stability function (0=Galp, 1= KC94, 2=CanutoA, 3=CanutoB) 
    919    nn_clos       =   1     !  predefined closure type (0=MY82, 1=k-eps, 2=k-w, 3=Gen) 
     989   rn_hsro       =  0.02   !  Minimum surface roughness 
     990   rn_frac_hs    =   1.3   !  Fraction of wave height as roughness (if nn_z0_met=2) 
     991   nn_z0_met     =     2   !  Method for surface roughness computation (0/1/2) 
     992   nn_bc_surf    =     1   !  surface condition (0/1=Dir/Neum) 
     993   nn_bc_bot     =     1   !  bottom condition (0/1=Dir/Neum) 
     994   nn_stab_func  =     2   !  stability function (0=Galp, 1= KC94, 2=CanutoA, 3=CanutoB) 
     995   nn_clos       =     1   !  predefined closure type (0=MY82, 1=k-eps, 2=k-w, 3=Gen) 
    920996/ 
    921997!----------------------------------------------------------------------- 
     
    9391015!!                  ***  Miscellaneous namelists  *** 
    9401016!!====================================================================== 
     1017!!   namsol            elliptic solver / island / free surface 
    9411018!!   nammpp            Massively Parallel Processing                    ("key_mpp_mpi) 
    9421019!!   namctl            Control prints & Benchmark 
    943 !!   namsol            elliptic solver / island / free surface 
     1020!!   namc1d            1D configuration options                         ("key_c1d") 
     1021!!   namc1d_uvd        data: U & V currents                             ("key_c1d") 
     1022!!   namc1d_dyndmp     U & V newtonian damping                          ("key_c1d") 
     1023!!   namsto            Stochastic parametrization of EOS 
    9441024!!====================================================================== 
    9451025! 
     
    10001080   ln_dyndmp   =  .false.  !  add a damping term (T) or not (F) 
    10011081/ 
     1082!----------------------------------------------------------------------- 
     1083&namsto       ! Stochastic parametrization of EOS 
     1084!----------------------------------------------------------------------- 
     1085   ln_rststo = .false.           ! start from mean parameter (F) or from restart file (T) 
     1086   ln_rstseed = .true.           ! read seed of RNG from restart file 
     1087   cn_storst_in  = "restart_sto" !  suffix of stochastic parameter restart file (input) 
     1088   cn_storst_out = "restart_sto" !  suffix of stochastic parameter restart file (output) 
     1089 
     1090   ln_sto_eos = .false.          ! stochastic equation of state 
     1091   nn_sto_eos = 1                ! number of independent random walks 
     1092   rn_eos_stdxy = 1.4            ! random walk horz. standard deviation (in grid points) 
     1093   rn_eos_stdz  = 0.7            ! random walk vert. standard deviation (in grid points) 
     1094   rn_eos_tcor  = 1440.0         ! random walk time correlation (in timesteps) 
     1095   nn_eos_ord  = 1               ! order of autoregressive processes 
     1096   nn_eos_flt  = 0               ! passes of Laplacian filter 
     1097   rn_eos_lim  = 2.0             ! limitation factor (default = 3.0) 
     1098/ 
     1099 
    10021100!!====================================================================== 
    10031101!!                  ***  Diagnostics namelists  *** 
    10041102!!====================================================================== 
    10051103!!   namnc4       netcdf4 chunking and compression settings             ("key_netcdf4") 
    1006 !!   namtrd       dynamics and/or tracer trends                         ("key_trddyn","key_trdtra","key_trdmld") 
     1104!!   namtrd       dynamics and/or tracer trends 
     1105!!   namptr       Poleward Transport Diagnostics 
    10071106!!   namflo       float parameters                                      ("key_float") 
    1008 !!   namptr       Poleward Transport Diagnostics 
    10091107!!   namhsb       Heat and salt budgets 
    10101108!!====================================================================== 
     
    10221120/ 
    10231121!----------------------------------------------------------------------- 
    1024 &namtrd        !   diagnostics on dynamics and/or tracer trends         ("key_trddyn" and/or "key_trdtra") 
    1025 !              !       or mixed-layer trends or barotropic vorticity    ("key_trdmld" or     "key_trdvor") 
    1026 !----------------------------------------------------------------------- 
    1027    nn_trd      = 365       !  time step frequency dynamics and tracers trends 
    1028    nn_ctls     =   0       !  control surface type in mixed-layer trends (0,1 or n<jpk) 
    1029    rn_ucf      =   1.      !  unit conversion factor (=1 -> /seconds ; =86400. -> /day) 
    1030    cn_trdrst_in      = "restart_mld"   ! suffix of ocean restart name (input) 
    1031    cn_trdrst_out     = "restart_mld"   ! suffix of ocean restart name (output) 
    1032    ln_trdmld_restart = .false.         !  restart for ML diagnostics 
    1033    ln_trdmld_instant = .false.         !  flag to diagnose trends of instantantaneous or mean ML T/S 
    1034 / 
     1122&namtrd        !   diagnostics on dynamics and/or tracer trends 
     1123!              !       and/or mixed-layer trends and/or barotropic vorticity 
     1124!----------------------------------------------------------------------- 
     1125   ln_glo_trd  = .false.   ! (T) global domain averaged diag for T, T^2, KE, and PE 
     1126   ln_dyn_trd  = .false.   ! (T) 3D momentum trend output 
     1127   ln_dyn_mxl  = .FALSE.   ! (T) 2D momentum trends averaged over the mixed layer (not coded yet) 
     1128   ln_vor_trd  = .FALSE.   ! (T) 2D barotropic vorticity trends (not coded yet) 
     1129   ln_KE_trd   = .false.   ! (T) 3D Kinetic   Energy     trends 
     1130   ln_PE_trd   = .false.   ! (T) 3D Potential Energy     trends 
     1131   ln_tra_trd  = .FALSE.   ! (T) 3D tracer trend output 
     1132   ln_tra_mxl  = .false.   ! (T) 2D tracer trends averaged over the mixed layer (not coded yet) 
     1133   nn_trd      = 365       !  print frequency (ln_glo_trd=T) (unit=time step) 
     1134/ 
     1135!!gm   nn_ctls     =   0       !  control surface type in mixed-layer trends (0,1 or n<jpk) 
     1136!!gm   rn_ucf      =   1.      !  unit conversion factor (=1 -> /seconds ; =86400. -> /day) 
     1137!!gm   cn_trdrst_in      = "restart_mld"   ! suffix of ocean restart name (input) 
     1138!!gm   cn_trdrst_out     = "restart_mld"   ! suffix of ocean restart name (output) 
     1139!!gm   ln_trdmld_restart = .false.         !  restart for ML diagnostics 
     1140!!gm   ln_trdmld_instant = .false.         !  flag to diagnose trends of instantantaneous or mean ML T/S 
     1141!!gm 
    10351142!----------------------------------------------------------------------- 
    10361143&namflo       !   float parameters                                      ("key_float") 
     
    10511158!----------------------------------------------------------------------- 
    10521159   ln_diaptr  = .false.    !  Poleward heat and salt transport (T) or not (F) 
    1053    ln_diaznl  = .true.     !  Add zonal means and meridional stream functions 
    1054    ln_subbas  = .true.     !  Atlantic/Pacific/Indian basins computation (T) or not 
    1055                            !  (orca configuration only, need input basins mask file named "subbasins.nc" 
    1056    ln_ptrcomp = .true.     !  Add decomposition : overturning 
    1057    nn_fptr    =  1         !  Frequency of ptr computation [time step] 
    1058    nn_fwri    =  15        !  Frequency of ptr outputs [time step] 
     1160   ln_subbas  = .false.     !  Atlantic/Pacific/Indian basins computation (T) or not 
    10591161/ 
    10601162!----------------------------------------------------------------------- 
     
    10951197   ln_s3d     = .false.    ! Logical switch for S profile observations 
    10961198   ln_ena     = .false.    ! Logical switch for ENACT insitu data set 
    1097    !                       !     ln_cor                  Logical switch for Coriolis insitu data set 
     1199   ln_cor     = .false.    ! Logical switch for Coriolis insitu data set 
    10981200   ln_profb   = .false.    ! Logical switch for feedback insitu data set 
    10991201   ln_sla     = .false.    ! Logical switch for SLA observations 
    1100  
    11011202   ln_sladt   = .false.    ! Logical switch for AVISO SLA data 
    1102  
    11031203   ln_slafb   = .false.    ! Logical switch for feedback SLA data 
    1104                            !     ln_ssh                  Logical switch for SSH observations 
    1105  
    1106    ln_sst     = .true.     ! Logical switch for SST observations 
    1107    ln_reysst  = .true.     !     ln_reysst               Logical switch for Reynolds observations 
    1108    ln_ghrsst  = .false.    !     ln_ghrsst               Logical switch for GHRSST observations       
    1109  
     1204   ln_ssh     = .false.    ! Logical switch for SSH observations 
     1205   ln_sst     = .false.    ! Logical switch for SST observations 
     1206   ln_reysst  = .false.    ! Logical switch for Reynolds observations 
     1207   ln_ghrsst  = .false.    ! Logical switch for GHRSST observations 
    11101208   ln_sstfb   = .false.    ! Logical switch for feedback SST data 
    1111                            !     ln_sss                  Logical switch for SSS observations 
    1112                            !     ln_seaice               Logical switch for Sea Ice observations 
    1113                            !     ln_vel3d                Logical switch for velocity observations 
    1114                            !     ln_velavcur             Logical switch for velocity daily av. cur. 
    1115                            !     ln_velhrcur             Logical switch for velocity high freq. cur. 
    1116                            !     ln_velavadcp            Logical switch for velocity daily av. ADCP 
    1117                            !     ln_velhradcp            Logical switch for velocity high freq. ADCP 
    1118                            !     ln_velfb                Logical switch for feedback velocity data 
    1119                            !     ln_grid_global          Global distribtion of observations 
    1120                            !     ln_grid_search_lookup   Logical switch for obs grid search w/lookup table 
    1121                            !     grid_search_file        Grid search lookup file header 
    1122                            !     enactfiles              ENACT input observation file names 
    1123                            !     coriofiles              Coriolis input observation file name 
    1124    !                       ! profbfiles: Profile feedback input observation file name 
    1125    profbfiles = 'profiles_01.nc' 
    1126                            !     ln_profb_enatim         Enact feedback input time setting switch 
    1127                            !     slafilesact             Active SLA input observation file name 
    1128                            !     slafilespas             Passive SLA input observation file name 
    1129    !                       ! slafbfiles: Feedback SLA input observation file name 
    1130    slafbfiles = 'sla_01.nc' 
    1131                            !     sstfiles                GHRSST input observation file name 
    1132    !                       ! sstfbfiles: Feedback SST input observation file name 
    1133    sstfbfiles = 'sst_01.nc' 'sst_02.nc' 'sst_03.nc' 'sst_04.nc' 'sst_05.nc' 
    1134                            !     seaicefiles             Sea Ice input observation file name 
    1135                            !     velavcurfiles           Vel. cur. daily av. input file name 
    1136                            !     velhvcurfiles           Vel. cur. high freq. input file name 
    1137                            !     velavadcpfiles          Vel. ADCP daily av. input file name 
    1138                            !     velhvadcpfiles          Vel. ADCP high freq. input file name 
    1139                            !     velfbfiles              Vel. feedback input observation file name 
    1140                            !     dobsini                 Initial date in window YYYYMMDD.HHMMSS 
    1141                            !     dobsend                 Final date in window YYYYMMDD.HHMMSS 
    1142                            !     n1dint                  Type of vertical interpolation method 
    1143                            !     n2dint                  Type of horizontal interpolation method 
    1144                            !     ln_nea                  Rejection of observations near land switch 
    1145    nmsshc     = 0          ! MSSH correction scheme 
    1146                            !     mdtcorr                 MDT  correction 
    1147                            !     mdtcutoff               MDT cutoff for computed correction 
     1209   ln_sss     = .false.    ! Logical switch for SSS observations 
     1210   ln_seaice  = .false.    ! Logical switch for Sea Ice observations 
     1211   ln_vel3d   = .false.    ! Logical switch for velocity observations 
     1212   ln_velavcur= .false     ! Logical switch for velocity daily av. cur. 
     1213   ln_velhrcur= .false     ! Logical switch for velocity high freq. cur. 
     1214   ln_velavadcp = .false.  ! Logical switch for velocity daily av. ADCP 
     1215   ln_velhradcp = .false.  ! Logical switch for velocity high freq. ADCP 
     1216   ln_velfb   = .false.    ! Logical switch for feedback velocity data 
     1217   ln_grid_global = .false. ! Global distribtion of observations 
     1218   ln_grid_search_lookup = .false. !  Logical switch for obs grid search w/lookup table 
     1219   grid_search_file = 'grid_search'  !  Grid search lookup file header 
     1220! All of the *files* variables below are arrays. Use namelist_cfg to add more files 
     1221   enactfiles = 'enact.nc' !  ENACT input observation file names (specify full array in namelist_cfg) 
     1222   coriofiles = 'corio.nc' !  Coriolis input observation file name 
     1223   profbfiles = 'profiles_01.nc' ! Profile feedback input observation file name 
     1224   ln_profb_enatim = .false !        Enact feedback input time setting switch 
     1225   slafilesact = 'sla_act.nc' !  Active SLA input observation file names 
     1226   slafilespas = 'sla_pass.nc' ! Passive SLA input observation file names 
     1227   slafbfiles = 'sla_01.nc' ! slafbfiles: Feedback SLA input observation file names 
     1228   sstfiles = 'ghrsst.nc'   ! GHRSST input observation file names 
     1229   sstfbfiles = 'sst_01.nc' ! Feedback SST input observation file names 
     1230   seaicefiles = 'seaice_01.nc' ! Sea Ice input observation file names 
     1231   velavcurfiles = 'velavcurfile.nc'  ! Vel. cur. daily av. input file name 
     1232   velhrcurfiles = 'velhrcurfile.nc'  ! Vel. cur. high freq. input file name 
     1233   velavadcpfiles = 'velavadcpfile.nc' ! Vel. ADCP daily av. input file name 
     1234   velhradcpfiles = 'velhradcpfile.nc' ! Vel. ADCP high freq. input file name 
     1235   velfbfiles = 'velfbfile.nc' ! Vel. feedback input observation file name 
     1236   dobsini = 20000101.000000  !  Initial date in window YYYYMMDD.HHMMSS 
     1237   dobsend = 20010101.000000  !  Final date in window YYYYMMDD.HHMMSS 
     1238   n1dint = 0  !               Type of vertical interpolation method 
     1239   n2dint = 0  !               Type of horizontal interpolation method 
     1240   ln_nea = .false.   !        Rejection of observations near land switch 
     1241   nmsshc     = 0     !        MSSH correction scheme 
     1242   mdtcorr = 1.61     !        MDT  correction 
     1243   mdtcutoff = 65.0   !        MDT cutoff for computed correction 
    11481244   ln_altbias = .false.    ! Logical switch for alt bias 
    11491245   ln_ignmis  = .true.     ! Logical switch for ignoring missing files 
    1150                            !     endailyavtypes   ENACT daily average types 
     1246   endailyavtypes = 820    ! ENACT daily average types - array (use namelist_cfg to set more values) 
    11511247   ln_grid_global = .true. 
    11521248   ln_grid_search_lookup = .false. 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.