New URL for NEMO forge!   http://forge.nemo-ocean.eu

Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
This present forge is now archived and remained online for history.
Changeset 6140 for trunk/NEMOGCM/CONFIG/SHARED/namelist_ref – NEMO

Ignore:
Timestamp:
2015-12-21T12:35:23+01:00 (8 years ago)
Author:
timgraham
Message:

Merge of branches/2015/dev_merge_2015 back into trunk. Merge excludes NEMOGCM/TOOLS/OBSTOOLS/ for now due to issues with the change of file type. Will sort these manually with further commits.

Branch merged as follows:
In the working copy of branch ran:
svn merge svn+ssh://forge.ipsl.jussieu.fr/ipsl/forge/projets/nemo/svn/trunk@HEAD
Small conflicts due to bug fixes applied to trunk since the dev_merge_2015 was copied. Bug fixes were applied to the branch as well so these were easy to resolve.
Branch committed at this stage

In working copy run:
svn switch svn+ssh://forge.ipsl.jussieu.fr/ipsl/forge/projets/nemo/svn/trunk
to switch working copy

Run:
svn merge --reintegrate svn+ssh://forge.ipsl.jussieu.fr/ipsl/forge/projets/nemo/svn/branches/2015/dev_merge_2015
to merge the branch into the trunk and then commit - no conflicts at this stage.

File:
1 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/SHARED/namelist_ref

    • Property svn:keywords set to Id
    r5930 r6140  
    66!!              3 - Surface boundary (namsbc, namsbc_ana, namsbc_flx, namsbc_clio, namsbc_core, namsbc_sas 
    77!!                                    namsbc_cpl, namtra_qsr, namsbc_rnf, 
    8 !!                                    namsbc_apr, namsbc_ssr, namsbc_alb) 
     8!!                                    namsbc_apr, namsbc_ssr, namsbc_alb, namsbc_wave) 
    99!!              4 - lateral boundary (namlbc, namagrif, nambdy, nambdy_tide) 
    1010!!              5 - bottom  boundary (nambfr, nambbc, nambbl) 
     
    3131   nn_itend    =    5475   !  last  time step (std 5475) 
    3232   nn_date0    =  010101   !  date at nit_0000 (format yyyymmdd) used if ln_rstart=F or (ln_rstart=T and nn_rstctl=0 or 1) 
     33   nn_time0    =       0   !  initial time of day in hhmm 
    3334   nn_leapy    =       0   !  Leap year calendar (1) or not (0) 
    3435   ln_rstart   = .false.   !  start from rest (F) or from a restart file (T) 
    35    nn_euler    =       1   !  = 0 : start with forward time step if ln_rstart=T 
    36    nn_rstctl   =       0   !  restart control ==> activated only if ln_rstart=T 
    37                            !    = 0 nn_date0 read in namelist ; nn_it000 : read in namelist 
    38                            !    = 1 nn_date0 read in namelist ; nn_it000 : check consistancy between namelist and restart 
    39                            !    = 2 nn_date0 read in restart  ; nn_it000 : check consistancy between namelist and restart 
    40    cn_ocerst_in  = "restart"   !  suffix of ocean restart name (input) 
    41    cn_ocerst_indir = "."       !  directory from which to read input ocean restarts 
    42    cn_ocerst_out = "restart"   !  suffix of ocean restart name (output) 
    43    cn_ocerst_outdir = "."      !  directory in which to write output ocean restarts 
     36      nn_euler    =    1            !  = 0 : start with forward time step if ln_rstart=T 
     37      nn_rstctl   =    0            !  restart control ==> activated only if ln_rstart=T 
     38      !                             !    = 0 nn_date0 read in namelist ; nn_it000 : read in namelist 
     39      !                             !    = 1 nn_date0 read in namelist ; nn_it000 : check consistancy between namelist and restart 
     40      !                             !    = 2 nn_date0 read in restart  ; nn_it000 : check consistancy between namelist and restart 
     41      cn_ocerst_in    = "restart"   !  suffix of ocean restart name (input) 
     42      cn_ocerst_indir = "."         !  directory from which to read input ocean restarts 
     43      cn_ocerst_out   = "restart"   !  suffix of ocean restart name (output) 
     44      cn_ocerst_outdir= "."         !  directory in which to write output ocean restarts 
     45   ln_iscpl    = .false.   !  cavity evolution forcing or coupling to ice sheet model 
    4446   nn_istate   =       0   !  output the initial state (1) or not (0) 
    4547   ln_rst_list = .false.   !  output restarts at list of times using nn_stocklist (T) or at set frequency with nn_stock (F) 
     
    4749   nn_stocklist = 0,0,0,0,0,0,0,0,0,0 ! List of timesteps when a restart file is to be written 
    4850   nn_write    =    5475   !  frequency of write in the output file   (modulo referenced to nn_it000) 
    49    ln_dimgnnn  = .false.   !  DIMG file format: 1 file for all processors (F) or by processor (T) 
    5051   ln_mskland  = .false.   !  mask land points in NetCDF outputs (costly: + ~15%) 
    5152   ln_cfmeta   = .false.   !  output additional data to netCDF files required for compliance with the CF metadata standard 
    52    ln_clobber  = .true.   !  clobber (overwrite) an existing file 
     53   ln_clobber  = .true.    !  clobber (overwrite) an existing file 
    5354   nn_chunksz  =       0   !  chunksize (bytes) for NetCDF file (works only with iom_nf90 routines) 
    5455/ 
     
    6162!!   namzgr_sco   s-coordinate or hybrid z-s-coordinate 
    6263!!   namdom       space and time domain (bathymetry, mesh, timestep) 
     64!!   namcrs       coarsened grid (for outputs and/or TOP)               ("key_crs") 
     65!!   namc1d       1D configuration options                              ("key_c1d") 
     66!!   namc1d_uvd   1D data (currents)                                    ("key_c1d") 
     67!!   namc1d_dyndmp 1D newtonian damping applied on currents             ("key_c1d") 
    6368!!   namtsd       data: temperature & salinity 
    6469!!====================================================================== 
    6570! 
    6671!----------------------------------------------------------------------- 
    67 &namcfg     !   parameters of the configuration 
    68 !----------------------------------------------------------------------- 
    69    cp_cfg      =  "default"            !  name of the configuration 
    70    cp_cfz      =  "no zoom"            !  name of the zoom of configuration 
    71    jp_cfg      =       0               !  resolution of the configuration 
    72    jpidta      =      10               !  1st lateral dimension ( >= jpi ) 
    73    jpjdta      =      12               !  2nd    "         "    ( >= jpj ) 
    74    jpkdta      =      31               !  number of levels      ( >= jpk ) 
    75    jpiglo      =      10               !  1st dimension of global domain --> i =jpidta 
    76    jpjglo      =      12               !  2nd    -                  -    --> j =jpjdta 
    77    jpizoom     =       1               !  left bottom (i,j) indices of the zoom 
    78    jpjzoom     =       1               !  in data domain indices 
    79    jperio      =       0               !  lateral cond. type (between 0 and 6) 
    80                                        !  = 0 closed                 ;   = 1 cyclic East-West 
    81                                        !  = 2 equatorial symmetric   ;   = 3 North fold T-point pivot 
    82                                        !  = 4 cyclic East-West AND North fold T-point pivot 
    83                                        !  = 5 North fold F-point pivot 
    84                                        !  = 6 cyclic East-West AND North fold F-point pivot 
    85    ln_use_jattr = .false.              !  use (T) the file attribute: open_ocean_jstart, if present 
    86                                        !  in netcdf input files, as the start j-row for reading 
    87 / 
    88 !----------------------------------------------------------------------- 
    89 &namzgr        !   vertical coordinate 
    90 !----------------------------------------------------------------------- 
    91    ln_zco      = .false.   !  z-coordinate - full    steps   (T/F)      ("key_zco" may also be defined) 
    92    ln_zps      = .true.    !  z-coordinate - partial steps   (T/F) 
    93    ln_sco      = .false.   !  s- or hybrid z-s-coordinate    (T/F) 
    94    ln_isfcav   = .false.   !  ice shelf cavity               (T/F) 
     72&namcfg        !   parameters of the configuration 
     73!----------------------------------------------------------------------- 
     74   cp_cfg      = "default" !  name of the configuration 
     75   cp_cfz      = "no zoom" !  name of the zoom of configuration 
     76   jp_cfg      =      0    !  resolution of the configuration 
     77   jpidta      =     10    !  1st lateral dimension ( >= jpi ) 
     78   jpjdta      =     12    !  2nd    "         "    ( >= jpj ) 
     79   jpkdta      =     31    !  number of levels      ( >= jpk ) 
     80   jpiglo      =     10    !  1st dimension of global domain --> i =jpidta 
     81   jpjglo      =     12    !  2nd    -                  -    --> j =jpjdta 
     82   jpizoom     =      1    !  left bottom (i,j) indices of the zoom 
     83   jpjzoom     =      1    !  in data domain indices 
     84   jperio      =      0    !  lateral cond. type (between 0 and 6) 
     85                                 !  = 0 closed                 ;   = 1 cyclic East-West 
     86                                 !  = 2 equatorial symmetric   ;   = 3 North fold T-point pivot 
     87                                 !  = 4 cyclic East-West AND North fold T-point pivot 
     88                                 !  = 5 North fold F-point pivot 
     89                                 !  = 6 cyclic East-West AND North fold F-point pivot 
     90   ln_use_jattr = .false.  !  use (T) the file attribute: open_ocean_jstart, if present 
     91                           !  in netcdf input files, as the start j-row for reading 
     92/ 
     93!----------------------------------------------------------------------- 
     94&namzgr        !   vertical coordinate                                  (default: NO selection) 
     95!----------------------------------------------------------------------- 
     96   ln_zco      = .false.   !  z-coordinate - full    steps 
     97   ln_zps      = .false.   !  z-coordinate - partial steps 
     98   ln_sco      = .false.   !  s- or hybrid z-s-coordinate 
     99   ln_isfcav   = .false.   !  ice shelf cavity 
     100   ln_linssh   = .false.   !  linear free surface 
    95101/ 
    96102!----------------------------------------------------------------------- 
    97103&namzgr_sco    !   s-coordinate or hybrid z-s-coordinate 
    98104!----------------------------------------------------------------------- 
    99    ln_s_sh94   = .true.    !  Song & Haidvogel 1994 hybrid S-sigma   (T)| 
     105   ln_s_sh94   = .false.    !  Song & Haidvogel 1994 hybrid S-sigma   (T)| 
    100106   ln_s_sf12   = .false.   !  Siddorn & Furner 2012 hybrid S-z-sigma (T)| if both are false the NEMO tanh stretching is applied 
    101107   ln_sigcrit  = .false.   !  use sigma coordinates below critical depth (T) or Z coordinates (F) for Siddorn & Furner stretch 
     
    127133   nn_msh      =    1      !  create (=1) a mesh file or not (=0) 
    128134   rn_hmin     =   -3.     !  min depth of the ocean (>0) or min number of ocean level (<0) 
     135   rn_isfhmin  =    1.00   !  treshold (m) to discriminate grounding ice to floating ice 
    129136   rn_e3zps_min=   20.     !  partial step thickness is set larger than the minimum of 
    130137   rn_e3zps_rat=    0.1    !  rn_e3zps_min and rn_e3zps_rat*e3t, with 0<rn_e3zps_rat<1 
     
    132139   rn_rdt      = 5760.     !  time step for the dynamics (and tracer if nn_acc=0) 
    133140   rn_atfp     =    0.1    !  asselin time filter parameter 
    134    nn_acc      =    0      !  acceleration of convergence : =1      used, rdt < rdttra(k) 
    135                                  !                          =0, not used, rdt = rdttra 
    136    rn_rdtmin   = 28800.          !  minimum time step on tracers (used if nn_acc=1) 
    137    rn_rdtmax   = 28800.          !  maximum time step on tracers (used if nn_acc=1) 
    138    rn_rdth     =  800.           !  depth variation of tracer time step  (used if nn_acc=1) 
    139141   ln_crs      = .false.      !  Logical switch for coarsening module 
    140142   jphgr_msh   =       0               !  type of horizontal mesh 
     
    163165/ 
    164166!----------------------------------------------------------------------- 
    165 &namcrs        !   Grid coarsening for dynamics output and/or 
    166                !   passive tracer coarsened online simulations 
     167&namcrs        !   coarsened grid (for outputs and/or TOP)              ("key_crs") 
    167168!----------------------------------------------------------------------- 
    168169   nn_factx    = 3         !  Reduction factor of x-direction 
     
    186187/ 
    187188!----------------------------------------------------------------------- 
     189&namc1d_dyndmp !   U & V newtonian damping                              ("key_c1d") 
     190!----------------------------------------------------------------------- 
     191   ln_dyndmp   =  .false.  !  add a damping term (T) or not (F) 
     192/ 
     193!----------------------------------------------------------------------- 
     194&namc1d_uvd    !   data: U & V currents                                 ("key_c1d") 
     195!----------------------------------------------------------------------- 
     196!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
     197!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
     198   sn_ucur     = 'ucurrent'  ,         -1        ,'u_current',   .false.    , .true. , 'monthly' ,  ''      ,  'Ume'   , '' 
     199   sn_vcur     = 'vcurrent'  ,         -1        ,'v_current',   .false.    , .true. , 'monthly' ,  ''      ,  'Vme'   , '' 
     200! 
     201   cn_dir        = './'    !  root directory for the location of the files 
     202   ln_uvd_init   = .false. !  Initialisation of ocean U & V with U & V input data (T) or not (F) 
     203   ln_uvd_dyndmp = .false. !  damping of ocean U & V toward U & V input data (T) or not (F) 
     204/ 
     205!----------------------------------------------------------------------- 
    188206&namtsd    !   data : Temperature  & Salinity 
    189207!----------------------------------------------------------------------- 
     
    197215   ln_tsd_tradmp = .true.   !  damping of ocean T & S toward T &S input data (T) or not (F) 
    198216/ 
     217 
    199218!!====================================================================== 
    200219!!            ***  Surface Boundary Condition namelists  *** 
    201220!!====================================================================== 
    202221!!   namsbc          surface boundary condition 
    203 !!   namsbc_ana      analytical         formulation 
    204 !!   namsbc_flx      flux               formulation 
    205 !!   namsbc_clio     CLIO bulk formulae formulation 
    206 !!   namsbc_core     CORE bulk formulae formulation 
    207 !!   namsbc_mfs      MFS  bulk formulae formulation 
    208 !!   namsbc_cpl      CouPLed            formulation                     ("key_oasis3") 
     222!!   namsbc_ana      analytical         formulation                     (ln_ana     =T) 
     223!!   namsbc_flx      flux               formulation                     (ln_flx     =T) 
     224!!   namsbc_clio     CLIO bulk formulae formulation                     (ln_blk_clio=T) 
     225!!   namsbc_core     CORE bulk formulae formulation                     (ln_blk_core=T) 
     226!!   namsbc_mfs      MFS  bulk formulae formulation                     (ln_blk_mfs =T) 
     227!!   namsbc_cpl      CouPLed            formulation                     ("key_oasis3" ) 
    209228!!   namsbc_sas      StAndalone Surface module 
    210 !!   namtra_qsr      penetrative solar radiation 
    211 !!   namsbc_rnf      river runoffs 
    212 !!   namsbc_isf      ice shelf melting/freezing 
    213 !!   namsbc_apr      Atmospheric Pressure 
    214 !!   namsbc_ssr      sea surface restoring term (for T and/or S) 
     229!!   namtra_qsr      penetrative solar radiation                        (ln_traqsr  =T) 
     230!!   namsbc_rnf      river runoffs                                      (ln_rnf     =T) 
     231!!   namsbc_isf      ice shelf melting/freezing                         (nn_isf     >0) 
     232!!   namsbc_iscpl    coupling option between land ice model and ocean 
     233!!   namsbc_apr      Atmospheric Pressure                               (ln_apr_dyn =T) 
     234!!   namsbc_ssr      sea surface restoring term (for T and/or S)        (ln_ssr     =T) 
    215235!!   namsbc_alb      albedo parameters 
     236!!   namsbc_wave     external fields from wave model                    (ln_wave    =T) 
     237!!   namberg         iceberg floats                                     (ln_icebergs=T) 
    216238!!====================================================================== 
    217239! 
     
    220242!----------------------------------------------------------------------- 
    221243   nn_fsbc     = 5         !  frequency of surface boundary condition computation 
    222                            !     (also = the frequency of sea-ice model call) 
     244                           !     (also = the frequency of sea-ice & iceberg model call) 
     245                     ! Type of air-sea fluxes  
    223246   ln_ana      = .false.   !  analytical formulation                    (T => fill namsbc_ana ) 
    224247   ln_flx      = .false.   !  flux formulation                          (T => fill namsbc_flx ) 
     
    226249   ln_blk_core = .true.    !  CORE bulk formulation                     (T => fill namsbc_core) 
    227250   ln_blk_mfs  = .false.   !  MFS bulk formulation                      (T => fill namsbc_mfs ) 
     251                     ! Type of coupling (Ocean/Ice/Atmosphere) : 
    228252   ln_cpl      = .false.   !  atmosphere coupled   formulation          ( requires key_oasis3 ) 
    229253   ln_mixcpl   = .false.   !  forced-coupled mixed formulation          ( requires key_oasis3 ) 
     
    232256                           !  =1 opa-sas OASIS coupling: multi executable configuration, OPA component 
    233257                           !  =2 opa-sas OASIS coupling: multi executable configuration, SAS component  
    234    ln_apr_dyn  = .false.   !  Patm gradient added in ocean & ice Eqs.   (T => fill namsbc_apr ) 
    235    nn_ice      = 2         !  =0 no ice boundary condition   , 
    236                            !  =1 use observed ice-cover      , 
    237                            !  =2 ice-model used                         ("key_lim3" or "key_lim2") 
    238    nn_ice_embd = 1         !  =0 levitating ice (no mass exchange, concentration/dilution effect) 
    239                            !  =1 levitating ice with mass and salt exchange but no presure effect 
    240                            !  =2 embedded sea-ice (full salt and mass exchanges and pressure) 
    241    ln_dm2dc    = .false.   !  daily mean to diurnal cycle on short wave 
    242    ln_rnf      = .true.    !  runoffs                                   (T   => fill namsbc_rnf) 
    243    nn_isf      = 0         !  ice shelf melting/freezing                (/=0 => fill namsbc_isf) 
    244                            !  0 =no isf                  1 = presence of ISF 
    245                            !  2 = bg03 parametrisation   3 = rnf file for isf 
    246                            !  4 = ISF fwf specified 
    247                            !  option 1 and 4 need ln_isfcav = .true. (domzgr) 
    248    ln_ssr      = .true.    !  Sea Surface Restoring on T and/or S       (T => fill namsbc_ssr) 
    249    nn_fwb      = 2         !  FreshWater Budget: =0 unchecked 
    250                            !     =1 global mean of e-p-r set to zero at each time step 
    251                            !     =2 annual global mean of e-p-r set to zero 
    252    ln_wave = .false.       !  Activate coupling with wave (either Stokes Drift or Drag coefficient, or both)  (T => fill namsbc_wave) 
    253    ln_cdgw = .false.       !  Neutral drag coefficient read from wave model (T => fill namsbc_wave) 
    254    ln_sdw  = .false.       !  Computation of 3D stokes drift                (T => fill namsbc_wave) 
    255    nn_lsm  = 0             !  =0 land/sea mask for input fields is not applied (keep empty land/sea mask filename field) , 
    256                            !  =1:n number of iterations of land/sea mask application for input fields (fill land/sea mask filename field) 
    257258   nn_limflx = -1          !  LIM3 Multi-category heat flux formulation (use -1 if LIM3 is not used) 
    258259                           !  =-1  Use per-category fluxes, bypass redistributor, forced mode only, not yet implemented coupled 
     
    260261                           !  = 1  Average and redistribute per-category fluxes, forced mode only, not yet implemented coupled 
    261262                           !  = 2  Redistribute a single flux over categories (coupled mode only) 
     263                     ! Sea-ice : 
     264   nn_ice      = 2         !  =0 no ice boundary condition   , 
     265                           !  =1 use observed ice-cover      , 
     266                           !  =2 ice-model used                         ("key_lim3", "key_lim2", "key_cice") 
     267   nn_ice_embd = 1         !  =0 levitating ice (no mass exchange, concentration/dilution effect) 
     268                           !  =1 levitating ice with mass and salt exchange but no presure effect 
     269                           !  =2 embedded sea-ice (full salt and mass exchanges and pressure) 
     270                     ! Misc. options of sbc :  
     271   ln_traqsr   = .true.    !  Light penetration in the ocean            (T => fill namtra_qsr ) 
     272   ln_dm2dc    = .false.   !  daily mean to diurnal cycle on short wave 
     273   ln_rnf      = .true.    !  runoffs                                   (T => fill namsbc_rnf) 
     274   ln_ssr      = .true.    !  Sea Surface Restoring on T and/or S       (T => fill namsbc_ssr) 
     275   nn_fwb      = 2         !  FreshWater Budget: =0 unchecked 
     276                           !     =1 global mean of e-p-r set to zero at each time step 
     277                           !     =2 annual global mean of e-p-r set to zero 
     278   ln_apr_dyn  = .false.   !  Patm gradient added in ocean & ice Eqs.   (T => fill namsbc_apr ) 
     279   ln_isf      = .false.   !  ice shelf                                 (T   => fill namsbc_isf) 
     280   ln_wave = .false.       !  coupling with surface wave                (T => fill namsbc_wave) 
     281   nn_lsm  = 0             !  =0 land/sea mask for input fields is not applied (keep empty land/sea mask filename field) , 
     282                           !  =1:n number of iterations of land/sea mask application for input fields (fill land/sea mask filename field) 
    262283/ 
    263284!----------------------------------------------------------------------- 
     
    302323&namsbc_core   !   namsbc_core  CORE bulk formulae 
    303324!----------------------------------------------------------------------- 
    304 !              !  file name                    ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights                               ! rotation ! land/sea mask ! 
    305 !              !                               !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename                              ! pairing  ! filename      ! 
    306    sn_wndi     = 'u_10.15JUNE2009_fill'        ,         6         , 'U_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bicubic_noc.nc'   , 'Uwnd'   , '' 
    307    sn_wndj     = 'v_10.15JUNE2009_fill'        ,         6         , 'V_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bicubic_noc.nc'   , 'Vwnd'   , '' 
    308    sn_qsr      = 'ncar_rad.15JUNE2009_fill'    ,        24         , 'SWDN_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc'  , ''       , '' 
    309    sn_qlw      = 'ncar_rad.15JUNE2009_fill'    ,        24         , 'LWDN_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc'  , ''       , '' 
    310    sn_tair     = 't_10.15JUNE2009_fill'        ,         6         , 'T_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc'  , ''       , '' 
    311    sn_humi     = 'q_10.15JUNE2009_fill'        ,         6         , 'Q_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc'  , ''       , '' 
    312    sn_prec     = 'ncar_precip.15JUNE2009_fill' ,        -1         , 'PRC_MOD1',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc'  , ''       , '' 
    313    sn_snow     = 'ncar_precip.15JUNE2009_fill' ,        -1         , 'SNOW'    ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc'  , ''       , '' 
    314    sn_tdif     = 'taudif_core'                 ,        24         , 'taudif'  ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc'  , ''       , '' 
     325!              !  file name                   ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights                               ! rotation ! land/sea mask ! 
     326!              !                              !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename                              ! pairing  ! filename      ! 
     327   sn_wndi     = 'u_10.15JUNE2009_fill'       ,         6         , 'U_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bicubic_noc.nc'   , 'Uwnd'   , '' 
     328   sn_wndj     = 'v_10.15JUNE2009_fill'       ,         6         , 'V_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bicubic_noc.nc'   , 'Vwnd'   , '' 
     329   sn_qsr      = 'ncar_rad.15JUNE2009_fill'   ,        24         , 'SWDN_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc'  , ''       , '' 
     330   sn_qlw      = 'ncar_rad.15JUNE2009_fill'   ,        24         , 'LWDN_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc'  , ''       , '' 
     331   sn_tair     = 't_10.15JUNE2009_fill'       ,         6         , 'T_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc'  , ''       , '' 
     332   sn_humi     = 'q_10.15JUNE2009_fill'       ,         6         , 'Q_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc'  , ''       , '' 
     333   sn_prec     = 'ncar_precip.15JUNE2009_fill',        -1         , 'PRC_MOD1',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc'  , ''       , '' 
     334   sn_snow     = 'ncar_precip.15JUNE2009_fill',        -1         , 'SNOW'    ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc'  , ''       , '' 
     335   sn_tdif     = 'taudif_core'                ,        24         , 'taudif'  ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc'  , ''       , '' 
    315336 
    316337   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the bulk files 
    317338   ln_taudif   = .false.   !  HF tau contribution: use "mean of stress module - module of the mean stress" data 
    318    rn_zqt      = 10.        !  Air temperature and humidity reference height (m) 
    319    rn_zu       = 10.        !  Wind vector reference height (m) 
     339   rn_zqt      = 10.       !  Air temperature and humidity reference height (m) 
     340   rn_zu       = 10.       !  Wind vector reference height (m) 
    320341   rn_pfac     = 1.        !  multiplicative factor for precipitation (total & snow) 
    321342   rn_efac     = 1.        !  multiplicative factor for evaporation (0. or 1.) 
     
    326347&namsbc_mfs   !   namsbc_mfs  MFS bulk formulae 
    327348!----------------------------------------------------------------------- 
    328 !              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights     ! rotation ! land/sea mask ! 
    329 !              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename    ! pairing  ! filename      ! 
    330    sn_wndi     =   'ecmwf'   ,        6          , 'u10'     ,    .true.    , .false. , 'daily'  ,'bicubic.nc' , ''       , '' 
    331    sn_wndj     =   'ecmwf'   ,        6          , 'v10'     ,    .true.    , .false. , 'daily'  ,'bicubic.nc' , ''       , '' 
    332    sn_clc      =   'ecmwf'   ,        6          , 'clc'     ,    .true.    , .false. , 'daily'  ,'bilinear.nc', ''       , '' 
    333    sn_msl      =   'ecmwf'   ,        6          , 'msl'     ,    .true.    , .false. , 'daily'  ,'bicubic.nc' , ''       , '' 
    334    sn_tair     =   'ecmwf'   ,        6          , 't2'      ,    .true.    , .false. , 'daily'  ,'bicubic.nc' , ''       , '' 
    335    sn_rhm      =   'ecmwf'   ,        6          , 'rh'      ,    .true.    , .false. , 'daily'  ,'bilinear.nc', ''       , '' 
    336    sn_prec     =   'ecmwf'   ,        6          , 'precip'  ,    .true.    , .true.  , 'daily'  ,'bicubic.nc' , ''       , '' 
     349!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights     ! rotation ! land/sea mask ! 
     350!              !             !  (if <0  months)  !   name   !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename    ! pairing  ! filename      ! 
     351   sn_wndi     =   'ecmwf'   ,        6          , 'u10'    ,    .true.    , .false., 'daily'   ,'bicubic.nc' ,   ''     ,  '' 
     352   sn_wndj     =   'ecmwf'   ,        6          , 'v10'    ,    .true.    , .false., 'daily'   ,'bicubic.nc' ,   ''     ,  '' 
     353   sn_clc      =   'ecmwf'   ,        6          , 'clc'    ,    .true.    , .false., 'daily'   ,'bilinear.nc',   ''     ,  '' 
     354   sn_msl      =   'ecmwf'   ,        6          , 'msl'    ,    .true.    , .false., 'daily'   ,'bicubic.nc' ,   ''     ,  '' 
     355   sn_tair     =   'ecmwf'   ,        6          , 't2'     ,    .true.    , .false., 'daily'   ,'bicubic.nc' ,   ''     ,  '' 
     356   sn_rhm      =   'ecmwf'   ,        6          , 'rh'     ,    .true.    , .false., 'daily'   ,'bilinear.nc',   ''     ,  '' 
     357   sn_prec     =   'ecmwf'   ,        6          , 'precip' ,    .true.    , .true. , 'daily'   ,'bicubic.nc' ,   ''     ,  '' 
    337358 
    338359   cn_dir      = './ECMWF/'      !  root directory for the location of the bulk files 
     
    341362&namsbc_cpl    !   coupled ocean/atmosphere model                       ("key_oasis3") 
    342363!----------------------------------------------------------------------- 
    343 !                    !     description       !  multiple  !    vector   !      vector          ! vector ! 
    344 !                    !                       ! categories !  reference  !    orientation       ! grids  ! 
     364!                    !     description      !  multiple  !    vector   !      vector          ! vector ! 
     365!                    !                      ! categories !  reference  !    orientation       ! grids  ! 
    345366! send 
    346    sn_snd_temp   =       'weighted oce and ice' ,    'no'    ,     ''      ,         ''           ,   '' 
    347    sn_snd_alb    =       'weighted ice'         ,    'no'    ,     ''      ,         ''           ,   '' 
    348    sn_snd_thick  =       'none'                 ,    'no'   ,     ''      ,         ''           ,   '' 
    349    sn_snd_crt    =       'none'                 ,    'no'    , 'spherical' , 'eastward-northward' ,  'T' 
    350    sn_snd_co2    =       'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''           ,   '' 
     367   sn_snd_temp   =   'weighted oce and ice' ,    'no'    ,     ''      ,         ''           ,   '' 
     368   sn_snd_alb    =   'weighted ice'         ,    'no'    ,     ''      ,         ''           ,   '' 
     369   sn_snd_thick  =   'none'                 ,    'no'    ,     ''      ,         ''           ,   '' 
     370   sn_snd_crt    =   'none'                 ,    'no'    , 'spherical' , 'eastward-northward' ,  'T' 
     371   sn_snd_co2    =   'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''           ,   '' 
    351372! receive 
    352    sn_rcv_w10m   =       'none'                 ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
    353    sn_rcv_taumod =       'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
    354    sn_rcv_tau    =       'oce only'             ,    'no'    , 'cartesian' , 'eastward-northward',  'U,V' 
    355    sn_rcv_dqnsdt =       'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
    356    sn_rcv_qsr    =       'oce and ice'          ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
    357    sn_rcv_qns    =       'oce and ice'          ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
    358    sn_rcv_emp    =       'conservative'         ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
    359    sn_rcv_rnf    =       'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
    360    sn_rcv_cal    =       'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
    361    sn_rcv_co2    =       'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
     373   sn_rcv_w10m   =   'none'                 ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
     374   sn_rcv_taumod =   'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
     375   sn_rcv_tau    =   'oce only'             ,    'no'    , 'cartesian' , 'eastward-northward',  'U,V' 
     376   sn_rcv_dqnsdt =   'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
     377   sn_rcv_qsr    =   'oce and ice'          ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
     378   sn_rcv_qns    =   'oce and ice'          ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
     379   sn_rcv_emp    =   'conservative'         ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
     380   sn_rcv_rnf    =   'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
     381   sn_rcv_cal    =   'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
     382   sn_rcv_co2    =   'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   '' 
    362383! 
    363384   nn_cplmodel   =     1     !  Maximum number of models to/from which NEMO is potentialy sending/receiving data 
     
    383404/ 
    384405!----------------------------------------------------------------------- 
    385 &namtra_qsr    !   penetrative solar radiation 
     406&namtra_qsr    !   penetrative solar radiation                          (ln_traqsr=T) 
    386407!----------------------------------------------------------------------- 
    387408!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
     
    390411 
    391412   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
    392    ln_traqsr   = .true.    !  Light penetration (T) or not (F) 
    393413   ln_qsr_rgb  = .true.    !  RGB (Red-Green-Blue) light penetration 
    394414   ln_qsr_2bd  = .false.   !  2 bands              light penetration 
     
    401421/ 
    402422!----------------------------------------------------------------------- 
    403 &namsbc_rnf    !   runoffs namelist surface boundary condition 
     423&namsbc_rnf    !   runoffs namelist surface boundary condition          (ln_rnf=T) 
    404424!----------------------------------------------------------------------- 
    405425!              !  file name           ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
     
    425445/ 
    426446!----------------------------------------------------------------------- 
    427 &namsbc_isf    !  Top boundary layer (ISF) 
    428 !----------------------------------------------------------------------- 
    429 !              ! file name ! frequency (hours) ! variable ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
    430 !              !           !  (if <0  months)  !   name   !    (logical)   !  (T/F)  ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     447&namsbc_isf    !  Top boundary layer (ISF)                              (nn_isf >0) 
     448!----------------------------------------------------------------------- 
     449!              ! file name ! frequency (hours) ! variable ! time interp. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
     450!              !           !  (if <0  months)  !   name   !  (logical)   !  (T/F)  ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
    431451! nn_isf == 4 
    432    sn_qisf      = 'rnfisf' ,         -12      ,'sohflisf',    .false.      , .true.  , 'yearly'  ,  ''      ,   '' 
    433    sn_fwfisf    = 'rnfisf' ,         -12      ,'sowflisf',    .false.      , .true.  , 'yearly'  ,  ''      ,   '' 
     452   sn_fwfisf   = 'rnfisf'  ,         -12       ,'sowflisf',   .false.    , .true.  , 'yearly'  ,  ''      ,   ''     , '' 
    434453! nn_isf == 3 
    435    sn_rnfisf    = 'runoffs' ,         -12      ,'sofwfisf',    .false.      , .true.  , 'yearly'  ,  ''      ,  '' 
     454   sn_rnfisf   = 'rnfisf'  ,         -12       ,'sofwfisf',   .false.    , .true.  , 'yearly'  ,  ''      ,   ''     , '' 
    436455! nn_isf == 2 and 3 
    437    sn_depmax_isf = 'runoffs' ,       -12        ,'sozisfmax' ,   .false.  , .true.  , 'yearly'  ,  ''      ,  '' 
    438    sn_depmin_isf = 'runoffs' ,       -12        ,'sozisfmin' ,   .false.  , .true.  , 'yearly'  ,  ''      ,  '' 
     456   sn_depmax_isf='rnfisf'  ,         -12       ,'sozisfmax',  .false.    , .true.  , 'yearly'  ,  ''      ,   ''     , '' 
     457   sn_depmin_isf='rnfisf'  ,         -12       ,'sozisfmin',  .false.    , .true.  , 'yearly'  ,  ''      ,   ''     , '' 
    439458! nn_isf == 2 
    440    sn_Leff_isf = 'rnfisf' ,       0          ,'Leff'         ,   .false.  , .true.  , 'yearly'  ,  ''      ,   '' 
     459   sn_Leff_isf = 'rnfisf'  ,         -12       ,'Leff'    ,   .false.    , .true.  , 'yearly'  ,  ''      ,   ''     , '' 
     460! 
    441461! for all case 
    442    ln_divisf   = .true.  ! apply isf melting as a mass flux or in the salinity trend. (maybe I should remove this option as for runoff?) 
     462   nn_isf      = 1         !  ice shelf melting/freezing 
     463                           !  1 = presence of ISF    2 = bg03 parametrisation  
     464                           !  3 = rnf file for isf   4 = ISF fwf specified 
     465                           !  option 1 and 4 need ln_isfcav = .true. (domzgr) 
    443466! only for nn_isf = 1 or 2 
    444    rn_gammat0  = 1.0e-4   ! gammat coefficient used in blk formula 
    445    rn_gammas0  = 1.0e-4   ! gammas coefficient used in blk formula 
     467   rn_gammat0  = 1.e-4    ! gammat coefficient used in blk formula 
     468   rn_gammas0  = 1.e-4    ! gammas coefficient used in blk formula 
     469! only for nn_isf = 1 or 4 
     470   rn_hisf_tbl =  30.      ! thickness of the top boundary layer    (Losh et al. 2008) 
     471                          ! 0 => thickness of the tbl = thickness of the first wet cell 
    446472! only for nn_isf = 1 
    447    nn_isfblk   =  1       ! 1 ISOMIP ; 2 conservative (3 equation formulation, Jenkins et al. 1991 ??) 
    448    rn_hisf_tbl =  30.      ! thickness of the top boundary layer           (Losh et al. 2008) 
    449                           ! 0 => thickness of the tbl = thickness of the first wet cell 
    450    ln_conserve = .true.   ! conservative case (take into account meltwater advection) 
     473   nn_isfblk   = 1        ! 1 ISOMIP  like: 2 equations formulation (Hunter et al., 2006) 
     474                          ! 2 ISOMIP+ like: 3 equations formulation (Asay-Davis et al., 2015) 
    451475   nn_gammablk = 1        ! 0 = cst Gammat (= gammat/s) 
    452476                          ! 1 = velocity dependend Gamma (u* * gammat/s)  (Jenkins et al. 2010) 
    453                           !     if you want to keep the cd as in global config, adjust rn_gammat0 to compensate 
    454                           ! 2 = velocity and stability dependent Gamma    Holland et al. 1999 
     477                          ! 2 = velocity and stability dependent Gamma    (Holland et al. 1999) 
     478/ 
     479!----------------------------------------------------------------------- 
     480&namsbc_iscpl  !   land ice / ocean coupling option                      
     481!----------------------------------------------------------------------- 
     482   nn_drown  = 10       ! number of iteration of the extrapolation loop (fill the new wet cells) 
     483   ln_hsb    = .false.  ! activate conservation module (conservation exact after a time of rn_fiscpl) 
     484   nn_fiscpl = 43800    ! (number of time step) conservation period (maybe should be fix to the coupling frequencey of restart frequency) 
    455485/ 
    456486!----------------------------------------------------------------------- 
    457487&namsbc_apr    !   Atmospheric pressure used as ocean forcing or in bulk 
    458488!----------------------------------------------------------------------- 
    459 !              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
    460 !              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
    461    sn_apr      = 'patm'      ,         -1        ,'somslpre',    .true.     , .true. , 'yearly'  ,  ''      ,   ''     , '' 
     489!              !  file name ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
     490!              !            !  (if <0  months)  !   name    !  (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
     491   sn_apr      = 'patm'     ,         -1        ,'somslpre',    .true.     , .true. , 'yearly'  ,  ''      ,   ''     , '' 
    462492 
    463493   cn_dir      = './'       !  root directory for the location of the bulk files 
     
    467497/ 
    468498!----------------------------------------------------------------------- 
    469 &namsbc_ssr    !   surface boundary condition : sea surface restoring 
     499&namsbc_ssr    !   surface boundary condition : sea surface restoring   (ln_ssr=T) 
    470500!----------------------------------------------------------------------- 
    471501!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
     
    493523/ 
    494524!----------------------------------------------------------------------- 
    495 &namberg       !   iceberg parameters 
    496 !----------------------------------------------------------------------- 
    497       ln_icebergs              = .false. 
     525&namsbc_wave   ! External fields from wave model                        (ln_wave=T) 
     526!----------------------------------------------------------------------- 
     527!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable    ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
     528!              !             !  (if <0  months)  !   name      !  (logical)   !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
     529   sn_cdg      =  'cdg_wave' ,        1          , 'drag_coeff',     .true.   , .false., 'daily'   ,  ''      , ''       , '' 
     530   sn_usd      =  'sdw_wave' ,        1          , 'u_sd2d'    ,     .true.   , .false., 'daily'   ,  ''      , ''       , '' 
     531   sn_vsd      =  'sdw_wave' ,        1          , 'v_sd2d'    ,     .true.   , .false., 'daily'   ,  ''      , ''       , '' 
     532   sn_wn       =  'sdw_wave' ,        1          , 'wave_num'  ,     .true.   , .false., 'daily'   ,  ''      , ''       , '' 
     533! 
     534   cn_dir_cdg  = './'      !  root directory for the location of drag coefficient files 
     535   ln_cdgw = .false.       !  Neutral drag coefficient read from wave model 
     536   ln_sdw  = .false.       !  Computation of 3D stokes drift                
     537/ 
     538!----------------------------------------------------------------------- 
     539&namberg       !   iceberg parameters                                   (default: No iceberg) 
     540!----------------------------------------------------------------------- 
     541      ln_icebergs              = .false.              ! iceberg floats or not 
    498542      ln_bergdia               = .true.               ! Calculate budgets 
    499543      nn_verbose_level         = 1                    ! Turn on more verbose output if level > 0 
     
    520564      rn_speed_limit           = 0.                   ! CFL speed limit for a berg 
    521565 
    522 !              ! file name ! frequency (hours) !   variable   ! time interp.  !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
    523 !              !           !  (if <0  months)  !     name     !   (logical)    !  (T/F ) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
    524       sn_icb =  'calving' ,       -1           , 'calvingmask',  .true.        , .true.  , 'yearly'  , ''       , ''       , '' 
     566!            ! file name ! frequency (hours) !   variable   ! time interp. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
     567!            !           !  (if <0  months)  !     name     !   (logical)  !  (T/F ) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
     568      sn_icb =  'calving',       -1          , 'calvingmask',  .true.      , .true.  , 'yearly'  , ''       , ''       , '' 
    525569 
    526570      cn_dir = './' 
     
    540584&namlbc        !   lateral momentum boundary condition 
    541585!----------------------------------------------------------------------- 
     586   !                       !  free slip  !   partial slip  !   no slip   ! strong slip 
    542587   rn_shlat    =    2.     !  shlat = 0  !  0 < shlat < 2  !  shlat = 2  !  2 < shlat 
    543                            !  free slip  !   partial slip  !   no slip   ! strong slip 
    544    ln_vorlat   = .false.   !  consistency of vorticity boundary condition with analytical eqs. 
     588   ln_vorlat   = .false.   !  consistency of vorticity boundary condition with analytical Eqs. 
    545589/ 
    546590!----------------------------------------------------------------------- 
     
    554598/ 
    555599!----------------------------------------------------------------------- 
    556 &nam_tide      !   tide parameters (#ifdef key_tide) 
     600&nam_tide      !   tide parameters                                      ("key_tide") 
    557601!----------------------------------------------------------------------- 
    558602   ln_tide_pot   = .true.   !  use tidal potential forcing 
     
    596640/ 
    597641!----------------------------------------------------------------------- 
    598 &nambdy_dta      !  open boundaries - external data           ("key_bdy") 
    599 !----------------------------------------------------------------------- 
    600 !              !  file name      ! frequency (hours) ! variable   ! time interp.  !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
    601 !              !                 !  (if <0  months)  !   name     !   (logical)    !  (T/F ) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
    602    bn_ssh =     'amm12_bdyT_u2d' ,         24        , 'sossheig' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
    603    bn_u2d =     'amm12_bdyU_u2d' ,         24        , 'vobtcrtx' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
    604    bn_v2d =     'amm12_bdyV_u2d' ,         24        , 'vobtcrty' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
    605    bn_u3d  =    'amm12_bdyU_u3d' ,         24        , 'vozocrtx' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
    606    bn_v3d  =    'amm12_bdyV_u3d' ,         24        , 'vomecrty' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
    607    bn_tem  =    'amm12_bdyT_tra' ,         24        , 'votemper' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
    608    bn_sal  =    'amm12_bdyT_tra' ,         24        , 'vosaline' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
     642&nambdy_dta    !  open boundaries - external data                       ("key_bdy") 
     643!----------------------------------------------------------------------- 
     644!              !  file name      ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
     645!              !                 !  (if <0  months)  !   name    !  (logical)   !  (T/F ) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
     646   bn_ssh =     'amm12_bdyT_u2d' ,         24        , 'sossheig',     .true.   , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
     647   bn_u2d =     'amm12_bdyU_u2d' ,         24        , 'vobtcrtx',     .true.   , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
     648   bn_v2d =     'amm12_bdyV_u2d' ,         24        , 'vobtcrty',     .true.   , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
     649   bn_u3d  =    'amm12_bdyU_u3d' ,         24        , 'vozocrtx',     .true.   , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
     650   bn_v3d  =    'amm12_bdyV_u3d' ,         24        , 'vomecrty',     .true.   , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
     651   bn_tem  =    'amm12_bdyT_tra' ,         24        , 'votemper',     .true.   , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
     652   bn_sal  =    'amm12_bdyT_tra' ,         24        , 'vosaline',     .true.   , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
    609653! for lim2 
    610 !   bn_frld  =    'amm12_bdyT_ice' ,         24        , 'ileadfra' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
    611 !   bn_hicif =    'amm12_bdyT_ice' ,         24        , 'iicethic' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
    612 !   bn_hsnif =    'amm12_bdyT_ice' ,         24        , 'isnowthi' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
     654!   bn_frld  =   'amm12_bdyT_ice' ,         24        , 'ileadfra',     .true.   , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
     655!   bn_hicif =   'amm12_bdyT_ice' ,         24        , 'iicethic',     .true.   , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
     656!   bn_hsnif =   'amm12_bdyT_ice' ,         24        , 'isnowthi',     .true.   , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
    613657! for lim3 
    614 !   bn_a_i  =    'amm12_bdyT_ice' ,         24        , 'ileadfra' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
    615 !   bn_ht_i =    'amm12_bdyT_ice' ,         24        , 'iicethic' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
    616 !   bn_ht_s =    'amm12_bdyT_ice' ,         24        , 'isnowthi' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
    617    cn_dir  =    'bdydta/' 
    618    ln_full_vel = .false. 
     658!   bn_a_i  =    'amm12_bdyT_ice' ,         24        , 'ileadfra',     .true.   , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
     659!   bn_ht_i =    'amm12_bdyT_ice' ,         24        , 'iicethic',     .true.   , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
     660!   bn_ht_s =    'amm12_bdyT_ice' ,         24        , 'isnowthi',     .true.   , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     , '' 
     661 
     662   cn_dir      =    'bdydta/'   !  root directory for the location of the bulk files 
     663   ln_full_vel = .false.        !   
    619664/ 
    620665!----------------------------------------------------------------------- 
    621666&nambdy_tide     ! tidal forcing at open boundaries 
    622667!----------------------------------------------------------------------- 
    623    filtide          = 'bdydta/amm12_bdytide_'         !  file name root of tidal forcing files 
    624    ln_bdytide_2ddta = .false. 
    625    ln_bdytide_conj  = .false. 
     668   filtide          = 'bdydta/amm12_bdytide_'   !  file name root of tidal forcing files 
     669   ln_bdytide_2ddta = .false.                   ! 
     670   ln_bdytide_conj  = .false.                   !  
    626671/ 
    627672!!====================================================================== 
     
    634679! 
    635680!----------------------------------------------------------------------- 
    636 &nambfr        !   bottom friction 
     681&nambfr        !   bottom friction                                      (default: linear) 
    637682!----------------------------------------------------------------------- 
    638683   nn_bfr      =    1      !  type of bottom friction :   = 0 : free slip,  = 1 : linear friction 
     
    657702/ 
    658703!----------------------------------------------------------------------- 
    659 &nambbc        !   bottom temperature boundary condition 
    660 !----------------------------------------------------------------------- 
    661 !              !                              !  (if <0  months)  !   
    662 !              !  file name      ! frequency (hours) ! variable   ! time interp.   !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
    663 !              !                 !  (if <0  months)  !   name     !   (logical)    !  (T/F ) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
    664    sn_qgh      ='geothermal_heating.nc',  -12.  , 'heatflow'      ,   .false.      , .true.  , 'yearly'  , ''       , ''       , '' 
     704&nambbc        !   bottom temperature boundary condition                (default: NO) 
     705!----------------------------------------------------------------------- 
     706!              !  file name      ! frequency (hours) ! variable  ! time interp.!  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
     707!              !                 !  (if <0  months)  !   name    !  (logical)  !  (T/F ) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
     708   sn_qgh      ='geothermal_heating.nc',  -12.       , 'heatflow',   .false.   , .true.  , 'yearly'  ,   ''     ,   ''     ,   '' 
    665709   ! 
    666    cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
    667    ln_trabbc   = .true.    !  Apply a geothermal heating at the ocean bottom 
     710   ln_trabbc   = .false.   !  Apply a geothermal heating at the ocean bottom 
    668711   nn_geoflx   =    2      !  geothermal heat flux: = 0 no flux 
    669712                           !     = 1 constant flux 
    670713                           !     = 2 variable flux (read in geothermal_heating.nc in mW/m2) 
    671714   rn_geoflx_cst = 86.4e-3 !  Constant value of geothermal heat flux [W/m2] 
    672 / 
    673 !----------------------------------------------------------------------- 
    674 &nambbl        !   bottom boundary layer scheme 
     715   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the runoff files  
     716/ 
     717!----------------------------------------------------------------------- 
     718&nambbl        !   bottom boundary layer scheme                         ("key_trabbl") 
    675719!----------------------------------------------------------------------- 
    676720   nn_bbl_ldf  =  1      !  diffusive bbl (=1)   or not (=0) 
     
    711755/ 
    712756!----------------------------------------------------------------------- 
    713 &namtra_adv    !   advection scheme for tracer 
     757&namtra_adv    !   advection scheme for tracer                          (default: NO advection) 
    714758!----------------------------------------------------------------------- 
    715759   ln_traadv_cen =  .false.  !  2nd order centered scheme 
     
    724768      ln_mus_ups =  .false.         !  use upstream scheme near river mouths 
    725769   ln_traadv_ubs =  .false.  !  UBS scheme 
    726       nn_ubs_v   =  2               !  =2  , vertical 2nd order FCT 
     770      nn_ubs_v   =  2               !  =2  , vertical 2nd order FCT / COMPACT 4th order 
    727771   ln_traadv_qck =  .false.  !  QUICKEST scheme 
    728772/ 
    729773!----------------------------------------------------------------------- 
    730 &namtra_adv_mle !   mixed layer eddy parametrisation (Fox-Kemper param) 
     774&namtra_adv_mle !   mixed layer eddy parametrisation (Fox-Kemper param) (default: NO) 
    731775!----------------------------------------------------------------------- 
    732776   ln_mle    = .false.      ! (T) use the Mixed Layer Eddy (MLE) parameterisation 
     
    740784   rn_rho_c_mle  = 0.01    ! delta rho criterion used to calculate MLD for FK 
    741785/ 
    742 !---------------------------------------------------------------------------------- 
    743 &namtra_ldf    !   lateral diffusion scheme for tracers 
    744 !---------------------------------------------------------------------------------- 
     786!----------------------------------------------------------------------- 
     787&namtra_ldf    !   lateral diffusion scheme for tracers                 (default: NO diffusion) 
     788!----------------------------------------------------------------------- 
    745789   !                       !  Operator type: 
    746790   !                           !  no diffusion: set ln_traldf_lap=..._blp=F  
     
    772816   rn_bht_0        = 1.e+12    !  lateral eddy diffusivity (bilap. operator) [m4/s] 
    773817/ 
    774 !---------------------------------------------------------------------------------- 
    775 &namtra_ldfeiv !   eddy induced velocity param. 
    776 !---------------------------------------------------------------------------------- 
    777    ln_ldfeiv     =.false.   ! use eddy induced velocity parameterization 
    778    ln_ldfeiv_dia =.false.   ! diagnose eiv stream function and velocities 
    779    rn_aeiv_0     = 2000.    ! eddy induced velocity coefficient   [m2/s] 
    780    nn_aei_ijk_t  = 21       ! space/time variation of the eiv coeficient 
     818!----------------------------------------------------------------------- 
     819&namtra_ldfeiv !   eddy induced velocity param.                         (default: NO) 
     820!----------------------------------------------------------------------- 
     821   ln_ldfeiv     =.false.  ! use eddy induced velocity parameterization 
     822   ln_ldfeiv_dia =.false.  ! diagnose eiv stream function and velocities 
     823   rn_aeiv_0     = 2000.   ! eddy induced velocity coefficient   [m2/s] 
     824   nn_aei_ijk_t  = 21      ! space/time variation of the eiv coeficient 
    781825   !                                !   =-20 (=-30)    read in eddy_induced_velocity_2D.nc (..._3D.nc) file 
    782826   !                                !   =  0           constant  
     
    787831/ 
    788832!----------------------------------------------------------------------- 
    789 &namtra_dmp    !   tracer: T & S newtonian damping 
     833&namtra_dmp    !   tracer: T & S newtonian damping                      (default: NO) 
    790834!----------------------------------------------------------------------- 
    791835   ln_tradmp   =  .true.   !  add a damping termn (T) or not (F) 
     
    793837                           !                   =1 no damping in the mixing layer (kz  criteria) 
    794838                           !                   =2 no damping in the mixed  layer (rho crieria) 
    795    cn_resto    = 'resto.nc' ! Name of file containing restoration coefficient field (use dmp_tools to create this) 
     839   cn_resto    ='resto.nc' !  Name of file containing restoration coeff. field (use dmp_tools to create this) 
    796840/ 
    797841 
     
    807851! 
    808852!----------------------------------------------------------------------- 
    809 &namdyn_adv    !   formulation of the momentum advection 
     853&namdyn_adv    !   formulation of the momentum advection                (default: vector form) 
    810854!----------------------------------------------------------------------- 
    811855   ln_dynadv_vec = .true.  !  vector form (T) or flux form (F) 
     
    816860/ 
    817861!----------------------------------------------------------------------- 
    818 &nam_vvl    !   vertical coordinate options 
     862&nam_vvl    !   vertical coordinate options                             (default: zstar) 
    819863!----------------------------------------------------------------------- 
    820864   ln_vvl_zstar  = .true.           !  zstar vertical coordinate 
     
    830874/ 
    831875!----------------------------------------------------------------------- 
    832 &namdyn_vor    !   option of physics/algorithm (not control by CPP keys) 
     876&namdyn_vor    !   option of physics/algorithm                          (default: NO) 
    833877!----------------------------------------------------------------------- 
    834878   ln_dynvor_ene = .false. !  enstrophy conserving scheme 
     
    836880   ln_dynvor_mix = .false. !  mixed scheme 
    837881   ln_dynvor_een = .false. !  energy & enstrophy scheme 
    838       nn_een_e3f = 1             ! e3f = masked averaging of e3t divided by 4 (=0) or by the sum of mask (=1) 
    839    ln_dynvor_msk = .false. !  vorticity multiplied by fmask (=T) or not (=F) (all vorticity schemes)  ! PLEASE DO NOT USE 
    840 / 
    841 !----------------------------------------------------------------------- 
    842 &namdyn_hpg    !   Hydrostatic pressure gradient option 
     882      nn_een_e3f = 1          ! e3f = masked averaging of e3t divided by 4 (=0) or by the sum of mask (=1) 
     883   ln_dynvor_msk = .false. !  vorticity multiplied by fmask (=T) or not (=F) (all vorticity schemes)  ! PLEASE DO NOT ACTIVATE 
     884/ 
     885!----------------------------------------------------------------------- 
     886&namdyn_hpg    !   Hydrostatic pressure gradient option                 (default: zps) 
    843887!----------------------------------------------------------------------- 
    844888   ln_hpg_zco  = .false.   !  z-coordinate - full steps 
     
    850894/ 
    851895!----------------------------------------------------------------------- 
    852 &namdyn_spg    !   surface pressure gradient 
     896&namdyn_spg    !   surface pressure gradient                            (default: NO) 
    853897!----------------------------------------------------------------------- 
    854898   ln_dynspg_exp  = .false.   ! explicit free surface 
    855899   ln_dynspg_ts   = .false.   ! split-explicit free surface 
    856       ln_bt_fw      = .true.    ! Forward integration of barotropic Eqs. 
    857       ln_bt_av      = .true.    ! Time filtering of barotropic variables 
    858          nn_bt_flt    =  1        ! Time filter choice  = 0 None 
    859          !                        !                     = 1 Boxcar over   nn_baro sub-steps 
    860          !                        !                     = 2 Boxcar over 2*nn_baro  "    " 
    861       ln_bt_auto    = .true.    ! Number of sub-step defined from: 
    862          rn_bt_cmax   =  0.8      ! =T : the Maximum Courant Number allowed 
    863          nn_baro      = 30        ! =F : the number of sub-step in rn_rdt seconds 
    864 / 
    865 !----------------------------------------------------------------------- 
    866 &namdyn_ldf    !   lateral diffusion on momentum 
     900      ln_bt_fw      = .true.     ! Forward integration of barotropic Eqs. 
     901      ln_bt_av      = .true.     ! Time filtering of barotropic variables 
     902         nn_bt_flt     = 1          ! Time filter choice  = 0 None 
     903         !                          !                     = 1 Boxcar over   nn_baro sub-steps 
     904         !                          !                     = 2 Boxcar over 2*nn_baro  "    " 
     905      ln_bt_auto    = .true.     ! Number of sub-step defined from: 
     906         rn_bt_cmax   =  0.8        ! =T : the Maximum Courant Number allowed 
     907         nn_baro      = 30          ! =F : the number of sub-step in rn_rdt seconds 
     908/ 
     909!----------------------------------------------------------------------- 
     910&namdyn_ldf    !   lateral diffusion on momentum                        (default: NO) 
    867911!----------------------------------------------------------------------- 
    868912   !                       !  Type of the operator : 
     
    896940!!    namzdf_ric    richardson number dependent vertical mixing         ("key_zdfric") 
    897941!!    namzdf_tke    TKE dependent vertical mixing                       ("key_zdftke") 
     942!!    namzdf_gls    GLS vertical mixing                                 ("key_zdfgls") 
    898943!!    namzdf_ddm    double diffusive mixing parameterization            ("key_zdfddm") 
    899944!!    namzdf_tmx    tidal mixing parameterization                       ("key_zdftmx") 
     
    927972   rn_wtmix    =  10.0     !  vertical eddy viscosity coeff [m2/s] in the mixed-layer 
    928973   rn_wvmix    =  10.0     !  vertical eddy diffusion coeff [m2/s] in the mixed-layer 
    929    ln_mldw     = .true.    !  Flag to use or not the mized layer depth param. 
     974   ln_mldw     = .true.    !  Flag to use or not the mixed layer depth param. 
    930975/ 
    931976!----------------------------------------------------------------------- 
     
    9971042!!   nammpp            Massively Parallel Processing                    ("key_mpp_mpi) 
    9981043!!   namctl            Control prints & Benchmark 
    999 !!   namc1d            1D configuration options                         ("key_c1d") 
    1000 !!   namc1d_uvd        data: U & V currents                             ("key_c1d") 
    1001 !!   namc1d_dyndmp     U & V newtonian damping                          ("key_c1d") 
    10021044!!   namsto            Stochastic parametrization of EOS 
    10031045!!====================================================================== 
     
    10281070                           !     (no physical validity of the results) 
    10291071   nn_timing   =    0      !  timing by routine activated (=1) creates timing.output file, or not (=0) 
    1030 / 
    1031 !----------------------------------------------------------------------- 
    1032 &namc1d_uvd    !   data: U & V currents                                 ("key_c1d") 
    1033 !----------------------------------------------------------------------- 
    1034 !              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
    1035 !              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
    1036    sn_ucur     = 'ucurrent'  ,         -1        ,'u_current',   .false.    , .true. , 'monthly' ,  ''      ,  'Ume'   , '' 
    1037    sn_vcur     = 'vcurrent'  ,         -1        ,'v_current',   .false.    , .true. , 'monthly' ,  ''      ,  'Vme'   , '' 
    1038 ! 
    1039    cn_dir        = './'    !  root directory for the location of the files 
    1040    ln_uvd_init   = .false. !  Initialisation of ocean U & V with U & V input data (T) or not (F) 
    1041    ln_uvd_dyndmp = .false. !  damping of ocean U & V toward U & V input data (T) or not (F) 
    1042 / 
    1043 !----------------------------------------------------------------------- 
    1044 &namc1d_dyndmp !   U & V newtonian damping                              ("key_c1d") 
    1045 !----------------------------------------------------------------------- 
    1046    ln_dyndmp   =  .false.  !  add a damping term (T) or not (F) 
    1047 / 
    1048 !----------------------------------------------------------------------- 
    1049 &namsto       ! Stochastic parametrization of EOS 
    1050 !----------------------------------------------------------------------- 
    1051    ln_rststo = .false.           ! start from mean parameter (F) or from restart file (T) 
     1072   nn_diacfl   =    0      !  Write out CFL diagnostics (=1) in cfl_diagnostics.ascii, or not (=0) 
     1073/ 
     1074!----------------------------------------------------------------------- 
     1075&namsto       ! Stochastic parametrization of EOS                       (default: NO) 
     1076!----------------------------------------------------------------------- 
     1077   ln_sto_eos   = .false.  ! stochastic equation of state 
     1078   nn_sto_eos   = 1        ! number of independent random walks 
     1079   rn_eos_stdxy = 1.4      ! random walk horz. standard deviation (in grid points) 
     1080   rn_eos_stdz  = 0.7      ! random walk vert. standard deviation (in grid points) 
     1081   rn_eos_tcor  = 1440.    ! random walk time correlation (in timesteps) 
     1082   nn_eos_ord   = 1        ! order of autoregressive processes 
     1083   nn_eos_flt   = 0        ! passes of Laplacian filter 
     1084   rn_eos_lim   = 2.0      ! limitation factor (default = 3.0) 
     1085   ln_rststo    = .false.  ! start from mean parameter (F) or from restart file (T) 
    10521086   ln_rstseed = .true.           ! read seed of RNG from restart file 
    10531087   cn_storst_in  = "restart_sto" !  suffix of stochastic parameter restart file (input) 
    10541088   cn_storst_out = "restart_sto" !  suffix of stochastic parameter restart file (output) 
    1055  
    1056    ln_sto_eos = .false.          ! stochastic equation of state 
    1057    nn_sto_eos = 1                ! number of independent random walks 
    1058    rn_eos_stdxy = 1.4            ! random walk horz. standard deviation (in grid points) 
    1059    rn_eos_stdz  = 0.7            ! random walk vert. standard deviation (in grid points) 
    1060    rn_eos_tcor  = 1440.0         ! random walk time correlation (in timesteps) 
    1061    nn_eos_ord  = 1               ! order of autoregressive processes 
    1062    nn_eos_flt  = 0               ! passes of Laplacian filter 
    1063    rn_eos_lim  = 2.0             ! limitation factor (default = 3.0) 
    10641089/ 
    10651090 
     
    10671092!!                  ***  Diagnostics namelists  *** 
    10681093!!====================================================================== 
    1069 !!   namnc4       netcdf4 chunking and compression settings             ("key_netcdf4") 
    10701094!!   namtrd       dynamics and/or tracer trends 
    10711095!!   namptr       Poleward Transport Diagnostics 
     1096!!   namhsb       Heat and salt budgets 
    10721097!!   namflo       float parameters                                      ("key_float") 
    1073 !!   namhsb       Heat and salt budgets 
    1074 !!====================================================================== 
    1075 ! 
    1076 !----------------------------------------------------------------------- 
    1077 &namnc4        !   netcdf4 chunking and compression settings            ("key_netcdf4") 
    1078 !----------------------------------------------------------------------- 
    1079    nn_nchunks_i=   4       !  number of chunks in i-dimension 
    1080    nn_nchunks_j=   4       !  number of chunks in j-dimension 
    1081    nn_nchunks_k=   31      !  number of chunks in k-dimension 
    1082                            !  setting nn_nchunks_k = jpk will give a chunk size of 1 in the vertical which 
    1083                            !  is optimal for postprocessing which works exclusively with horizontal slabs 
    1084    ln_nc4zip   = .true.    !  (T) use netcdf4 chunking and compression 
    1085                            !  (F) ignore chunking information and produce netcdf3-compatible files 
    1086 / 
    1087 !----------------------------------------------------------------------- 
    1088 &namtrd        !   diagnostics on dynamics and/or tracer trends 
    1089 !              !       and/or mixed-layer trends and/or barotropic vorticity 
     1098!!   nam_diaharm  Harmonic analysis of tidal constituents               ('key_diaharm') 
     1099!!   namdct       transports through some sections 
     1100!!   namnc4       netcdf4 chunking and compression settings             ("key_netcdf4") 
     1101!!====================================================================== 
     1102! 
     1103!----------------------------------------------------------------------- 
     1104&namtrd        !   diagnostics on dynamics and/or tracer trends         (default F) 
     1105!              !   and/or mixed-layer trends and/or barotropic vorticity 
    10901106!----------------------------------------------------------------------- 
    10911107   ln_glo_trd  = .false.   ! (T) global domain averaged diag for T, T^2, KE, and PE 
    10921108   ln_dyn_trd  = .false.   ! (T) 3D momentum trend output 
    1093    ln_dyn_mxl  = .FALSE.   ! (T) 2D momentum trends averaged over the mixed layer (not coded yet) 
    1094    ln_vor_trd  = .FALSE.   ! (T) 2D barotropic vorticity trends (not coded yet) 
     1109   ln_dyn_mxl  = .false.   ! (T) 2D momentum trends averaged over the mixed layer (not coded yet) 
     1110   ln_vor_trd  = .false.   ! (T) 2D barotropic vorticity trends (not coded yet) 
    10951111   ln_KE_trd   = .false.   ! (T) 3D Kinetic   Energy     trends 
    10961112   ln_PE_trd   = .false.   ! (T) 3D Potential Energy     trends 
    1097    ln_tra_trd  = .FALSE.   ! (T) 3D tracer trend output 
     1113   ln_tra_trd  = .false.   ! (T) 3D tracer trend output 
    10981114   ln_tra_mxl  = .false.   ! (T) 2D tracer trends averaged over the mixed layer (not coded yet) 
    10991115   nn_trd      = 365       !  print frequency (ln_glo_trd=T) (unit=time step) 
     
    11061122!!gm   ln_trdmld_instant = .false.         !  flag to diagnose trends of instantantaneous or mean ML T/S 
    11071123!!gm 
     1124!----------------------------------------------------------------------- 
     1125&namptr       !   Poleward Transport Diagnostic                         (default F) 
     1126!----------------------------------------------------------------------- 
     1127   ln_diaptr  = .false.    !  Poleward heat and salt transport (T) or not (F) 
     1128   ln_subbas  = .false.     !  Atlantic/Pacific/Indian basins computation (T) or not 
     1129/ 
     1130!----------------------------------------------------------------------- 
     1131&namhsb       !  Heat and salt budgets                                  (default F) 
     1132!----------------------------------------------------------------------- 
     1133   ln_diahsb  = .false.    !  check the heat and salt budgets (T) or not (F) 
     1134/ 
    11081135!----------------------------------------------------------------------- 
    11091136&namflo       !   float parameters                                      ("key_float") 
     
    11211148/ 
    11221149!----------------------------------------------------------------------- 
    1123 &namptr       !   Poleward Transport Diagnostic 
    1124 !----------------------------------------------------------------------- 
    1125    ln_diaptr  = .false.    !  Poleward heat and salt transport (T) or not (F) 
    1126    ln_subbas  = .false.     !  Atlantic/Pacific/Indian basins computation (T) or not 
    1127 / 
    1128 !----------------------------------------------------------------------- 
    1129 &namhsb       !  Heat and salt budgets 
    1130 !----------------------------------------------------------------------- 
    1131    ln_diahsb  = .false.    !  check the heat and salt budgets (T) or not (F) 
    1132 / 
    1133 !----------------------------------------------------------------------- 
    1134 &nam_diaharm   !   Harmonic analysis of tidal constituents ('key_diaharm') 
     1150&nam_diaharm   !   Harmonic analysis of tidal constituents              ('key_diaharm') 
    11351151!----------------------------------------------------------------------- 
    11361152    nit000_han = 1         ! First time step used for harmonic analysis 
     
    11411157/ 
    11421158!----------------------------------------------------------------------- 
    1143 &namdct        ! transports through sections 
     1159&namdct        ! transports through some sections 
    11441160!----------------------------------------------------------------------- 
    11451161    nn_dct      = 15       !  time step frequency for transports computing 
     
    11491165                           !  0 < n : debug section number n 
    11501166/ 
    1151  
    1152 !!====================================================================== 
    1153 !!            ***  Observation & Assimilation namelists *** 
    1154 !!====================================================================== 
    1155 !!   namobs       observation and model comparison                      ('key_diaobs') 
     1167!----------------------------------------------------------------------- 
     1168&namnc4        !   netcdf4 chunking and compression settings            ("key_netcdf4") 
     1169!----------------------------------------------------------------------- 
     1170   nn_nchunks_i=   4       !  number of chunks in i-dimension 
     1171   nn_nchunks_j=   4       !  number of chunks in j-dimension 
     1172   nn_nchunks_k=   31      !  number of chunks in k-dimension 
     1173                           !  setting nn_nchunks_k = jpk will give a chunk size of 1 in the vertical which 
     1174                           !  is optimal for postprocessing which works exclusively with horizontal slabs 
     1175   ln_nc4zip   = .true.    !  (T) use netcdf4 chunking and compression 
     1176                           !  (F) ignore chunking information and produce netcdf3-compatible files 
     1177/ 
     1178 
     1179!!====================================================================== 
     1180!!               ***  Observation & Assimilation  *** 
     1181!!====================================================================== 
     1182!!   namobs       observation and model comparison 
    11561183!!   nam_asminc   assimilation increments                               ('key_asminc') 
    11571184!!====================================================================== 
    11581185! 
    11591186!----------------------------------------------------------------------- 
    1160 &namobs       !  observation usage switch                               ('key_diaobs') 
    1161 !----------------------------------------------------------------------- 
    1162    ln_t3d     = .false.    ! Logical switch for T profile observations 
    1163    ln_s3d     = .false.    ! Logical switch for S profile observations 
    1164    ln_ena     = .false.    ! Logical switch for ENACT insitu data set 
    1165    ln_cor     = .false.    ! Logical switch for Coriolis insitu data set 
    1166    ln_profb   = .false.    ! Logical switch for feedback insitu data set 
    1167    ln_sla     = .false.    ! Logical switch for SLA observations 
    1168    ln_sladt   = .false.    ! Logical switch for AVISO SLA data 
    1169    ln_slafb   = .false.    ! Logical switch for feedback SLA data 
    1170    ln_ssh     = .false.    ! Logical switch for SSH observations 
    1171    ln_sst     = .false.    ! Logical switch for SST observations 
    1172    ln_reysst  = .false.    ! Logical switch for Reynolds observations 
    1173    ln_ghrsst  = .false.    ! Logical switch for GHRSST observations 
    1174    ln_sstfb   = .false.    ! Logical switch for feedback SST data 
    1175    ln_sss     = .false.    ! Logical switch for SSS observations 
    1176    ln_seaice  = .false.    ! Logical switch for Sea Ice observations 
    1177    ln_vel3d   = .false.    ! Logical switch for velocity observations 
    1178    ln_velavcur= .false     ! Logical switch for velocity daily av. cur. 
    1179    ln_velhrcur= .false     ! Logical switch for velocity high freq. cur. 
    1180    ln_velavadcp = .false.  ! Logical switch for velocity daily av. ADCP 
    1181    ln_velhradcp = .false.  ! Logical switch for velocity high freq. ADCP 
    1182    ln_velfb   = .false.    ! Logical switch for feedback velocity data 
    1183    ln_grid_global = .false. ! Global distribtion of observations 
    1184    ln_grid_search_lookup = .false. !  Logical switch for obs grid search w/lookup table 
    1185    grid_search_file = 'grid_search'  !  Grid search lookup file header 
     1187&namobs       !  observation usage switch 
     1188!----------------------------------------------------------------------- 
     1189   ln_diaobs  = .false.             ! Logical switch for the observation operator 
     1190   ln_t3d     = .false.             ! Logical switch for T profile observations 
     1191   ln_s3d     = .false.             ! Logical switch for S profile observations 
     1192   ln_sla     = .false.             ! Logical switch for SLA observations 
     1193   ln_sst     = .false.             ! Logical switch for SST observations 
     1194   ln_sic     = .false.             ! Logical switch for Sea Ice observations 
     1195   ln_vel3d   = .false.             ! Logical switch for velocity observations 
     1196   ln_altbias = .false.             ! Logical switch for altimeter bias correction 
     1197   ln_nea     = .false.             ! Logical switch for rejection of observations near land 
     1198   ln_grid_global = .true.          ! Logical switch for global distribution of observations 
     1199   ln_grid_search_lookup = .false.  ! Logical switch for obs grid search w/lookup table 
     1200   ln_ignmis  = .true.              ! Logical switch for ignoring missing files 
     1201   ln_s_at_t  = .false.             ! Logical switch for computing model S at T obs if not there 
     1202   ln_sstnight = .false.            ! Logical switch for calculating night-time average for SST obs 
    11861203! All of the *files* variables below are arrays. Use namelist_cfg to add more files 
    1187    enactfiles = 'enact.nc' !  ENACT input observation file names (specify full array in namelist_cfg) 
    1188    coriofiles = 'corio.nc' !  Coriolis input observation file name 
    1189    profbfiles = 'profiles_01.nc' ! Profile feedback input observation file name 
    1190    ln_profb_enatim = .false !        Enact feedback input time setting switch 
    1191    slafilesact = 'sla_act.nc' !  Active SLA input observation file names 
    1192    slafilespas = 'sla_pass.nc' ! Passive SLA input observation file names 
    1193    slafbfiles = 'sla_01.nc' ! slafbfiles: Feedback SLA input observation file names 
    1194    sstfiles = 'ghrsst.nc'   ! GHRSST input observation file names 
    1195    sstfbfiles = 'sst_01.nc' ! Feedback SST input observation file names 
    1196    seaicefiles = 'seaice_01.nc' ! Sea Ice input observation file names 
    1197    velavcurfiles = 'velavcurfile.nc'  ! Vel. cur. daily av. input file name 
    1198    velhrcurfiles = 'velhrcurfile.nc'  ! Vel. cur. high freq. input file name 
    1199    velavadcpfiles = 'velavadcpfile.nc' ! Vel. ADCP daily av. input file name 
    1200    velhradcpfiles = 'velhradcpfile.nc' ! Vel. ADCP high freq. input file name 
    1201    velfbfiles = 'velfbfile.nc' ! Vel. feedback input observation file name 
    1202    dobsini = 20000101.000000  !  Initial date in window YYYYMMDD.HHMMSS 
    1203    dobsend = 20010101.000000  !  Final date in window YYYYMMDD.HHMMSS 
    1204    n1dint = 0  !               Type of vertical interpolation method 
    1205    n2dint = 0  !               Type of horizontal interpolation method 
    1206    ln_nea = .false.   !        Rejection of observations near land switch 
    1207    nmsshc     = 0     !        MSSH correction scheme 
    1208    mdtcorr = 1.61     !        MDT  correction 
    1209    mdtcutoff = 65.0   !        MDT cutoff for computed correction 
    1210    ln_altbias = .false.    ! Logical switch for alt bias 
    1211    ln_ignmis  = .true.     ! Logical switch for ignoring missing files 
    1212    endailyavtypes = 820    ! ENACT daily average types - array (use namelist_cfg to set more values) 
    1213    ln_grid_global = .true. 
    1214    ln_grid_search_lookup = .false. 
     1204   cn_profbfiles = 'profiles_01.nc'    ! Profile feedback input observation file names 
     1205   cn_slafbfiles = 'sla_01.nc'         ! SLA feedback input observation file names 
     1206   cn_sstfbfiles = 'sst_01.nc'         ! SST feedback input observation file names 
     1207   cn_sicfbfiles = 'sic_01.nc'         ! SIC feedback input observation file names 
     1208   cn_velfbfiles = 'vel_01.nc'         ! Velocity feedback input observation file names 
     1209   cn_altbiasfile = 'altbias.nc'       ! Altimeter bias input file name 
     1210   cn_gridsearchfile = 'gridsearch.nc' ! Grid search file name 
     1211   rn_gridsearchres = 0.5              ! Grid search resolution 
     1212   rn_dobsini = 00010101.000000        ! Initial date in window YYYYMMDD.HHMMSS 
     1213   rn_dobsend = 00010102.000000        ! Final date in window YYYYMMDD.HHMMSS 
     1214   nn_1dint = 0                        ! Type of vertical interpolation method 
     1215   nn_2dint = 0                        ! Type of horizontal interpolation method 
     1216   nn_msshc = 0                        ! MSSH correction scheme 
     1217   rn_mdtcorr = 1.61                   ! MDT  correction 
     1218   rn_mdtcutoff = 65.0                 ! MDT cutoff for computed correction 
     1219   nn_profdavtypes = -1                ! Profile daily average types - array 
     1220   ln_sstbias = .false.  
     1221   cn_sstbias_files = 'sstbias.nc' 
    12151222/ 
    12161223!----------------------------------------------------------------------- 
     
    12331240/ 
    12341241!----------------------------------------------------------------------- 
    1235 &namsbc_wave   ! External fields from wave model 
    1236 !----------------------------------------------------------------------- 
    1237 !              !  file name  ! frequency (hours) ! variable     ! time interp. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask ! 
    1238 !              !             !  (if <0  months)  !   name       !   (logical)  !  (T/F)  ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
    1239    sn_cdg      =  'cdg_wave' ,        1          , 'drag_coeff' ,     .true.   , .false. , 'daily'   ,  ''      , ''       , '' 
    1240    sn_usd      =  'sdw_wave' ,        1          , 'u_sd2d'     ,     .true.   , .false. , 'daily'   ,  ''      , ''       , '' 
    1241    sn_vsd      =  'sdw_wave' ,        1          , 'v_sd2d'     ,     .true.   , .false. , 'daily'   ,  ''      , ''       , '' 
    1242    sn_wn       =  'sdw_wave' ,        1          , 'wave_num'   ,     .true.   , .false. , 'daily'   ,  ''      , ''       , '' 
    1243 ! 
    1244    cn_dir_cdg  = './'  !  root directory for the location of drag coefficient files 
    1245 / 
    1246 !----------------------------------------------------------------------- 
    1247 &namdyn_nept  !   Neptune effect (simplified: lateral and vertical diffusions removed) 
    1248 !----------------------------------------------------------------------- 
    1249    ! Suggested lengthscale values are those of Eby & Holloway (1994) for a coarse model 
    1250    ln_neptsimp       = .false.  ! yes/no use simplified neptune 
    1251  
    1252    ln_smooth_neptvel = .false.  ! yes/no smooth zunep, zvnep 
    1253    rn_tslse          =  1.2e4   ! value of lengthscale L at the equator 
    1254    rn_tslsp          =  3.0e3   ! value of lengthscale L at the pole 
    1255    ! Specify whether to ramp down the Neptune velocity in shallow 
    1256    ! water, and if so the depth range controlling such ramping down 
    1257    ln_neptramp       = .true.   ! ramp down Neptune velocity in shallow water 
    1258    rn_htrmin         =  100.0   ! min. depth of transition range 
    1259    rn_htrmax         =  200.0   ! max. depth of transition range 
    1260 / 
     1242&namdiu !   Cool skin and warm layer models 
     1243!----------------------------------------------------------------------- 
     1244   ln_diurnal      = .false.   !  
     1245   ln_diurnal_only = .false.   ! 
     1246/ 
     1247!----------------------------------------------------------------------- 
     1248&nam_diatmb  !  Top Middle Bottom Output 
     1249!----------------------------------------------------------------------- 
     1250   ln_diatmb  = .false.    !  Choose Top Middle and Bottom output or not 
     1251/ 
     1252!----------------------------------------------------------------------- 
     1253&nam_dia25h  !  25h Mean Output 
     1254!----------------------------------------------------------------------- 
     1255   ln_dia25h  = .false.    ! Choose 25h mean output or not 
     1256/ 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.