New URL for NEMO forge!   http://forge.nemo-ocean.eu

Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
This present forge is now archived and remained online for history.
Changeset 6140 for trunk/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/DOM/domvvl.F90 – NEMO

Ignore:
Timestamp:
2015-12-21T12:35:23+01:00 (8 years ago)
Author:
timgraham
Message:

Merge of branches/2015/dev_merge_2015 back into trunk. Merge excludes NEMOGCM/TOOLS/OBSTOOLS/ for now due to issues with the change of file type. Will sort these manually with further commits.

Branch merged as follows:
In the working copy of branch ran:
svn merge svn+ssh://forge.ipsl.jussieu.fr/ipsl/forge/projets/nemo/svn/trunk@HEAD
Small conflicts due to bug fixes applied to trunk since the dev_merge_2015 was copied. Bug fixes were applied to the branch as well so these were easy to resolve.
Branch committed at this stage

In working copy run:
svn switch svn+ssh://forge.ipsl.jussieu.fr/ipsl/forge/projets/nemo/svn/trunk
to switch working copy

Run:
svn merge --reintegrate svn+ssh://forge.ipsl.jussieu.fr/ipsl/forge/projets/nemo/svn/branches/2015/dev_merge_2015
to merge the branch into the trunk and then commit - no conflicts at this stage.

File:
1 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • trunk/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/DOM/domvvl.F90

    r5836 r6140  
    2020   !!---------------------------------------------------------------------- 
    2121   USE oce             ! ocean dynamics and tracers 
     22   USE phycst          ! physical constant 
    2223   USE dom_oce         ! ocean space and time domain 
    2324   USE sbc_oce         ! ocean surface boundary condition 
     25   USE restart         ! ocean restart 
     26   ! 
    2427   USE in_out_manager  ! I/O manager 
    2528   USE iom             ! I/O manager library 
    26    USE restart         ! ocean restart 
    2729   USE lib_mpp         ! distributed memory computing library 
    2830   USE lbclnk          ! ocean lateral boundary conditions (or mpp link) 
     
    6062 
    6163   !! * Substitutions 
    62 #  include "domzgr_substitute.h90" 
    6364#  include "vectopt_loop_substitute.h90" 
    6465   !!---------------------------------------------------------------------- 
    65    !! NEMO/OPA 3.3 , NEMO-Consortium (2010)  
     66   !! NEMO/OPA 3.7 , NEMO-Consortium (2015)  
    6667   !! $Id$ 
    6768   !! Software governed by the CeCILL licence     (NEMOGCM/NEMO_CeCILL.txt) 
    6869   !!---------------------------------------------------------------------- 
    69  
    7070CONTAINS 
    7171 
     
    7474      !!                ***  FUNCTION dom_vvl_alloc  *** 
    7575      !!---------------------------------------------------------------------- 
    76       IF( ln_vvl_zstar ) dom_vvl_alloc = 0 
     76      IF( ln_vvl_zstar )   dom_vvl_alloc = 0 
    7777      IF( ln_vvl_ztilde .OR. ln_vvl_layer ) THEN 
    7878         ALLOCATE( tilde_e3t_b(jpi,jpj,jpk)  , tilde_e3t_n(jpi,jpj,jpk) , tilde_e3t_a(jpi,jpj,jpk) ,   & 
     
    8181         IF( lk_mpp             )   CALL mpp_sum ( dom_vvl_alloc ) 
    8282         IF( dom_vvl_alloc /= 0 )   CALL ctl_warn('dom_vvl_alloc: failed to allocate arrays') 
    83          un_td = 0.0_wp 
    84          vn_td = 0.0_wp 
     83         un_td = 0._wp 
     84         vn_td = 0._wp 
    8585      ENDIF 
    8686      IF( ln_vvl_ztilde ) THEN 
     
    8989         IF( dom_vvl_alloc /= 0 )   CALL ctl_warn('dom_vvl_alloc: failed to allocate arrays') 
    9090      ENDIF 
    91  
     91      ! 
    9292   END FUNCTION dom_vvl_alloc 
    9393 
     
    103103      !!               - interpolate scale factors 
    104104      !! 
    105       !! ** Action  : - fse3t_(n/b) and tilde_e3t_(n/b) 
    106       !!              - Regrid: fse3(u/v)_n 
    107       !!                        fse3(u/v)_b        
    108       !!                        fse3w_n            
    109       !!                        fse3(u/v)w_b       
    110       !!                        fse3(u/v)w_n       
    111       !!                        fsdept_n, fsdepw_n and fsde3w_n 
     105      !! ** Action  : - e3t_(n/b) and tilde_e3t_(n/b) 
     106      !!              - Regrid: e3(u/v)_n 
     107      !!                        e3(u/v)_b        
     108      !!                        e3w_n            
     109      !!                        e3(u/v)w_b       
     110      !!                        e3(u/v)w_n       
     111      !!                        gdept_n, gdepw_n and gde3w_n 
    112112      !!              - h(t/u/v)_0 
    113113      !!              - frq_rst_e3t and frq_rst_hdv 
     
    115115      !! Reference  : Leclair, M., and G. Madec, 2011, Ocean Modelling. 
    116116      !!---------------------------------------------------------------------- 
    117       USE phycst,  ONLY : rpi, rsmall, rad 
    118       !! * Local declarations 
    119       INTEGER ::   ji,jj,jk 
     117      INTEGER ::   ji, jj, jk 
    120118      INTEGER ::   ii0, ii1, ij0, ij1 
    121119      REAL(wp)::   zcoef 
    122120      !!---------------------------------------------------------------------- 
    123       IF( nn_timing == 1 )  CALL timing_start('dom_vvl_init') 
    124  
     121      ! 
     122      IF( nn_timing == 1 )   CALL timing_start('dom_vvl_init') 
     123      ! 
    125124      IF(lwp) WRITE(numout,*) 
    126125      IF(lwp) WRITE(numout,*) 'dom_vvl_init : Variable volume activated' 
    127126      IF(lwp) WRITE(numout,*) '~~~~~~~~~~~~' 
    128  
    129       ! choose vertical coordinate (z_star, z_tilde or layer) 
    130       ! ========================== 
    131       CALL dom_vvl_ctl 
    132  
    133       ! Allocate module arrays 
    134       ! ====================== 
     127      ! 
     128      CALL dom_vvl_ctl     ! choose vertical coordinate (z_star, z_tilde or layer) 
     129      ! 
     130      !                    ! Allocate module arrays 
    135131      IF( dom_vvl_alloc() /= 0 )   CALL ctl_stop( 'STOP', 'dom_vvl_init : unable to allocate arrays' ) 
    136  
    137       ! Read or initialize fse3t_(b/n), tilde_e3t_(b/n) and hdiv_lf (and e3t_a(jpk)) 
    138       ! ============================================================================ 
     132      ! 
     133      !                    ! Read or initialize e3t_(b/n), tilde_e3t_(b/n) and hdiv_lf 
    139134      CALL dom_vvl_rst( nit000, 'READ' ) 
    140       fse3t_a(:,:,jpk) = e3t_0(:,:,jpk) 
    141  
    142       ! Reconstruction of all vertical scale factors at now and before time steps 
    143       ! ============================================================================= 
    144       ! Horizontal scale factor interpolations 
    145       ! -------------------------------------- 
    146       CALL dom_vvl_interpol( fse3t_b(:,:,:), fse3u_b(:,:,:), 'U' ) 
    147       CALL dom_vvl_interpol( fse3t_b(:,:,:), fse3v_b(:,:,:), 'V' ) 
    148       CALL dom_vvl_interpol( fse3t_n(:,:,:), fse3u_n(:,:,:), 'U' ) 
    149       CALL dom_vvl_interpol( fse3t_n(:,:,:), fse3v_n(:,:,:), 'V' ) 
    150       CALL dom_vvl_interpol( fse3u_n(:,:,:), fse3f_n(:,:,:), 'F' ) 
    151       ! Vertical scale factor interpolations 
    152       ! ------------------------------------ 
    153       CALL dom_vvl_interpol( fse3t_n(:,:,:), fse3w_n (:,:,:), 'W'  ) 
    154       CALL dom_vvl_interpol( fse3u_n(:,:,:), fse3uw_n(:,:,:), 'UW' ) 
    155       CALL dom_vvl_interpol( fse3v_n(:,:,:), fse3vw_n(:,:,:), 'VW' ) 
    156       CALL dom_vvl_interpol( fse3t_b(:,:,:), fse3w_b (:,:,:), 'W'  ) 
    157       CALL dom_vvl_interpol( fse3u_b(:,:,:), fse3uw_b(:,:,:), 'UW' ) 
    158       CALL dom_vvl_interpol( fse3v_b(:,:,:), fse3vw_b(:,:,:), 'VW' ) 
    159       ! t- and w- points depth 
    160       ! ---------------------- 
    161       ! set the isf depth as it is in the initial step 
    162       fsdept_n(:,:,1) = 0.5_wp * fse3w_n(:,:,1) 
    163       fsdepw_n(:,:,1) = 0.0_wp 
    164       fsde3w_n(:,:,1) = fsdept_n(:,:,1) - sshn(:,:) 
    165       fsdept_b(:,:,1) = 0.5_wp * fse3w_b(:,:,1) 
    166       fsdepw_b(:,:,1) = 0.0_wp 
    167  
    168       DO jk = 2, jpk 
     135      e3t_a(:,:,jpk) = e3t_0(:,:,jpk)  ! last level always inside the sea floor set one for all 
     136      ! 
     137      !                    !== Set of all other vertical scale factors  ==!  (now and before) 
     138      !                                ! Horizontal interpolation of e3t 
     139      CALL dom_vvl_interpol( e3t_b(:,:,:), e3u_b(:,:,:), 'U' )    ! from T to U 
     140      CALL dom_vvl_interpol( e3t_n(:,:,:), e3u_n(:,:,:), 'U' ) 
     141      CALL dom_vvl_interpol( e3t_b(:,:,:), e3v_b(:,:,:), 'V' )    ! from T to V  
     142      CALL dom_vvl_interpol( e3t_n(:,:,:), e3v_n(:,:,:), 'V' ) 
     143      CALL dom_vvl_interpol( e3u_n(:,:,:), e3f_n(:,:,:), 'F' )    ! from U to F 
     144      !                                ! Vertical interpolation of e3t,u,v  
     145      CALL dom_vvl_interpol( e3t_n(:,:,:), e3w_n (:,:,:), 'W'  )  ! from T to W 
     146      CALL dom_vvl_interpol( e3t_b(:,:,:), e3w_b (:,:,:), 'W'  ) 
     147      CALL dom_vvl_interpol( e3u_n(:,:,:), e3uw_n(:,:,:), 'UW' )  ! from U to UW 
     148      CALL dom_vvl_interpol( e3u_b(:,:,:), e3uw_b(:,:,:), 'UW' ) 
     149      CALL dom_vvl_interpol( e3v_n(:,:,:), e3vw_n(:,:,:), 'VW' )  ! from V to UW 
     150      CALL dom_vvl_interpol( e3v_b(:,:,:), e3vw_b(:,:,:), 'VW' ) 
     151      ! 
     152      !                    !==  depth of t and w-point  ==!   (set the isf depth as it is in the initial timestep) 
     153      gdept_n(:,:,1) = 0.5_wp * e3w_n(:,:,1)       ! reference to the ocean surface (used for MLD and light penetration) 
     154      gdepw_n(:,:,1) = 0.0_wp 
     155      gde3w_n(:,:,1) = gdept_n(:,:,1) - sshn(:,:)  ! reference to a common level z=0 for hpg 
     156      gdept_b(:,:,1) = 0.5_wp * e3w_b(:,:,1) 
     157      gdepw_b(:,:,1) = 0.0_wp 
     158      DO jk = 2, jpk                               ! vertical sum 
    169159         DO jj = 1,jpj 
    170160            DO ji = 1,jpi 
    171               !    zcoef = (tmask(ji,jj,jk) - wmask(ji,jj,jk))   ! 0 everywhere tmask = wmask, ie everywhere expect at jk = mikt 
    172                                                      ! 1 everywhere from mbkt to mikt + 1 or 1 (if no isf) 
    173                                                      ! 0.5 where jk = mikt   
    174                zcoef = (tmask(ji,jj,jk) - wmask(ji,jj,jk)) 
    175                fsdepw_n(ji,jj,jk) = fsdepw_n(ji,jj,jk-1) + fse3t_n(ji,jj,jk-1) 
    176                fsdept_n(ji,jj,jk) =      zcoef  * ( fsdepw_n(ji,jj,jk  ) + 0.5 * fse3w_n(ji,jj,jk))  & 
    177                    &                + (1-zcoef) * ( fsdept_n(ji,jj,jk-1) +       fse3w_n(ji,jj,jk))  
    178                fsde3w_n(ji,jj,jk) = fsdept_n(ji,jj,jk) - sshn(ji,jj) 
    179                fsdepw_b(ji,jj,jk) = fsdepw_b(ji,jj,jk-1) + fse3t_b(ji,jj,jk-1) 
    180                fsdept_b(ji,jj,jk) =      zcoef  * ( fsdepw_b(ji,jj,jk  ) + 0.5 * fse3w_b(ji,jj,jk))  & 
    181                    &                + (1-zcoef) * ( fsdept_b(ji,jj,jk-1) +       fse3w_b(ji,jj,jk))  
     161               !    zcoef = tmask - wmask    ! 0 everywhere tmask = wmask, ie everywhere expect at jk = mikt 
     162               !                             ! 1 everywhere from mbkt to mikt + 1 or 1 (if no isf) 
     163               !                             ! 0.5 where jk = mikt      
     164!!gm ???????   BUG ?  gdept_n as well as gde3w_n  does not include the thickness of ISF ?? 
     165               zcoef = ( tmask(ji,jj,jk) - wmask(ji,jj,jk) ) 
     166               gdepw_n(ji,jj,jk) = gdepw_n(ji,jj,jk-1) + e3t_n(ji,jj,jk-1) 
     167               gdept_n(ji,jj,jk) =      zcoef  * ( gdepw_n(ji,jj,jk  ) + 0.5 * e3w_n(ji,jj,jk))  & 
     168                  &                + (1-zcoef) * ( gdept_n(ji,jj,jk-1) +       e3w_n(ji,jj,jk))  
     169               gde3w_n(ji,jj,jk) = gdept_n(ji,jj,jk) - sshn(ji,jj) 
     170               gdepw_b(ji,jj,jk) = gdepw_b(ji,jj,jk-1) + e3t_b(ji,jj,jk-1) 
     171               gdept_b(ji,jj,jk) =      zcoef  * ( gdepw_b(ji,jj,jk  ) + 0.5 * e3w_b(ji,jj,jk))  & 
     172                  &                + (1-zcoef) * ( gdept_b(ji,jj,jk-1) +       e3w_b(ji,jj,jk))  
    182173            END DO 
    183174         END DO 
    184175      END DO 
    185  
    186       ! Before depth and Inverse of the local depth of the water column at u- and v- points 
    187       ! ----------------------------------------------------------------------------------- 
    188       hu_b(:,:) = 0. 
    189       hv_b(:,:) = 0. 
    190       DO jk = 1, jpkm1 
    191          hu_b(:,:) = hu_b(:,:) + fse3u_b(:,:,jk) * umask(:,:,jk) 
    192          hv_b(:,:) = hv_b(:,:) + fse3v_b(:,:,jk) * vmask(:,:,jk) 
     176      ! 
     177      !                    !==  thickness of the water column  !!   (ocean portion only) 
     178      ht_n(:,:) = e3t_n(:,:,1) * tmask(:,:,1)   !!gm  BUG  :  this should be 1/2 * e3w(k=1) .... 
     179      hu_b(:,:) = e3u_b(:,:,1) * umask(:,:,1) 
     180      hu_n(:,:) = e3u_n(:,:,1) * umask(:,:,1) 
     181      hv_b(:,:) = e3v_b(:,:,1) * vmask(:,:,1) 
     182      hv_n(:,:) = e3v_n(:,:,1) * vmask(:,:,1) 
     183      DO jk = 2, jpkm1 
     184         ht_n(:,:) = ht_n(:,:) + e3t_n(:,:,jk) * tmask(:,:,jk) 
     185         hu_b(:,:) = hu_b(:,:) + e3u_b(:,:,jk) * umask(:,:,jk) 
     186         hu_n(:,:) = hu_n(:,:) + e3u_n(:,:,jk) * umask(:,:,jk) 
     187         hv_b(:,:) = hv_b(:,:) + e3v_b(:,:,jk) * vmask(:,:,jk) 
     188         hv_n(:,:) = hv_n(:,:) + e3v_n(:,:,jk) * vmask(:,:,jk) 
    193189      END DO 
    194       hur_b(:,:) = umask_i(:,:) / ( hu_b(:,:) + 1. - umask_i(:,:) ) 
    195       hvr_b(:,:) = vmask_i(:,:) / ( hv_b(:,:) + 1. - vmask_i(:,:) ) 
    196  
    197       ! Restoring frequencies for z_tilde coordinate 
    198       ! ============================================ 
     190      ! 
     191      !                    !==  inverse of water column thickness   ==!   (u- and v- points) 
     192      r1_hu_b(:,:) = ssumask(:,:) / ( hu_b(:,:) + 1._wp - ssumask(:,:) )    ! _i mask due to ISF 
     193      r1_hu_n(:,:) = ssumask(:,:) / ( hu_n(:,:) + 1._wp - ssumask(:,:) ) 
     194      r1_hv_b(:,:) = ssvmask(:,:) / ( hv_b(:,:) + 1._wp - ssvmask(:,:) ) 
     195      r1_hv_n(:,:) = ssvmask(:,:) / ( hv_n(:,:) + 1._wp - ssvmask(:,:) ) 
     196 
     197      !                    !==   z_tilde coordinate case  ==!   (Restoring frequencies) 
    199198      IF( ln_vvl_ztilde ) THEN 
    200          ! Values in days provided via the namelist; use rsmall to avoid possible division by zero errors with faulty settings 
    201          frq_rst_e3t(:,:) = 2.0_wp * rpi / ( MAX( rn_rst_e3t  , rsmall ) * 86400.0_wp ) 
    202          frq_rst_hdv(:,:) = 2.0_wp * rpi / ( MAX( rn_lf_cutoff, rsmall ) * 86400.0_wp ) 
    203          IF( ln_vvl_ztilde_as_zstar ) THEN 
    204             ! Ignore namelist settings and use these next two to emulate z-star using z-tilde 
    205             frq_rst_e3t(:,:) = 0.0_wp  
    206             frq_rst_hdv(:,:) = 1.0_wp / rdt 
    207          ENDIF 
    208          IF ( ln_vvl_zstar_at_eqtor ) THEN 
     199!!gm : idea: add here a READ in a file of custumized restoring frequency 
     200         !                                   ! Values in days provided via the namelist 
     201         !                                   ! use rsmall to avoid possible division by zero errors with faulty settings 
     202         frq_rst_e3t(:,:) = 2._wp * rpi / ( MAX( rn_rst_e3t  , rsmall ) * 86400.0_wp ) 
     203         frq_rst_hdv(:,:) = 2._wp * rpi / ( MAX( rn_lf_cutoff, rsmall ) * 86400.0_wp ) 
     204         ! 
     205         IF( ln_vvl_ztilde_as_zstar ) THEN   ! z-star emulation using z-tile 
     206            frq_rst_e3t(:,:) = 0._wp               !Ignore namelist settings 
     207            frq_rst_hdv(:,:) = 1._wp / rdt 
     208         ENDIF 
     209         IF ( ln_vvl_zstar_at_eqtor ) THEN   ! use z-star in vicinity of the Equator 
    209210            DO jj = 1, jpj 
    210211               DO ji = 1, jpi 
     212!!gm  case |gphi| >= 6 degrees is useless   initialized just above by default 
    211213                  IF( ABS(gphit(ji,jj)) >= 6.) THEN 
    212214                     ! values outside the equatorial band and transition zone (ztilde) 
    213215                     frq_rst_e3t(ji,jj) =  2.0_wp * rpi / ( MAX( rn_rst_e3t  , rsmall ) * 86400.e0_wp ) 
    214216                     frq_rst_hdv(ji,jj) =  2.0_wp * rpi / ( MAX( rn_lf_cutoff, rsmall ) * 86400.e0_wp ) 
    215                   ELSEIF( ABS(gphit(ji,jj)) <= 2.5) THEN 
     217                  ELSEIF( ABS(gphit(ji,jj)) <= 2.5) THEN    ! Equator strip ==> z-star 
    216218                     ! values inside the equatorial band (ztilde as zstar) 
    217219                     frq_rst_e3t(ji,jj) =  0.0_wp 
    218220                     frq_rst_hdv(ji,jj) =  1.0_wp / rdt 
    219                   ELSE 
    220                      ! values in the transition band (linearly vary from ztilde to ztilde as zstar values) 
     221                  ELSE                                      ! transition band (2.5 to 6 degrees N/S) 
     222                     !                                      ! (linearly transition from z-tilde to z-star) 
    221223                     frq_rst_e3t(ji,jj) = 0.0_wp + (frq_rst_e3t(ji,jj)-0.0_wp)*0.5_wp   & 
    222224                        &            * (  1.0_wp - COS( rad*(ABS(gphit(ji,jj))-2.5_wp)  & 
     
    229231               END DO 
    230232            END DO 
    231             IF( cp_cfg == "orca" .AND. jp_cfg == 3 ) THEN 
    232                ii0 = 103   ;   ii1 = 111        ! Suppress ztilde in the Foxe Basin for ORCA2 
     233            IF( cp_cfg == "orca" .AND. jp_cfg == 3 ) THEN   ! ORCA2: Suppress ztilde in the Foxe Basin for ORCA2 
     234               ii0 = 103   ;   ii1 = 111        
    233235               ij0 = 128   ;   ij1 = 135   ;    
    234236               frq_rst_e3t( mi0(ii0):mi1(ii1) , mj0(ij0):mj1(ij1) ) =  0.0_wp 
     
    237239         ENDIF 
    238240      ENDIF 
    239  
     241      ! 
    240242      IF( nn_timing == 1 )  CALL timing_stop('dom_vvl_init') 
    241  
     243      ! 
    242244   END SUBROUTINE dom_vvl_init 
    243245 
     
    261263      !!               - tilde_e3t_a: after increment of vertical scale factor  
    262264      !!                              in z_tilde case 
    263       !!               - fse3(t/u/v)_a 
     265      !!               - e3(t/u/v)_a 
    264266      !! 
    265267      !! Reference  : Leclair, M., and Madec, G. 2011, Ocean Modelling. 
    266268      !!---------------------------------------------------------------------- 
    267       REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:,:) :: ze3t 
    268       REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:  ) :: zht, z_scale, zwu, zwv, zhdiv 
    269       !! * Arguments 
    270       INTEGER, INTENT( in )                  :: kt                    ! time step 
    271       INTEGER, INTENT( in ), OPTIONAL        :: kcall                 ! optional argument indicating call sequence 
    272       !! * Local declarations 
    273       INTEGER                                :: ji, jj, jk            ! dummy loop indices 
    274       INTEGER , DIMENSION(3)                 :: ijk_max, ijk_min      ! temporary integers 
    275       REAL(wp)                               :: z2dt                  ! temporary scalars 
    276       REAL(wp)                               :: z_tmin, z_tmax        ! temporary scalars 
    277       LOGICAL                                :: ll_do_bclinic         ! temporary logical 
    278       !!---------------------------------------------------------------------- 
    279       IF( nn_timing == 1 )  CALL timing_start('dom_vvl_sf_nxt') 
    280       CALL wrk_alloc( jpi, jpj, zht, z_scale, zwu, zwv, zhdiv ) 
    281       CALL wrk_alloc( jpi, jpj, jpk, ze3t                     ) 
    282  
    283       IF(kt == nit000)   THEN 
     269      INTEGER, INTENT( in )           ::   kt      ! time step 
     270      INTEGER, INTENT( in ), OPTIONAL ::   kcall   ! optional argument indicating call sequence 
     271      ! 
     272      INTEGER                ::   ji, jj, jk            ! dummy loop indices 
     273      INTEGER , DIMENSION(3) ::   ijk_max, ijk_min      ! temporary integers 
     274      REAL(wp)               ::   z2dt, z_tmin, z_tmax  ! local scalars 
     275      LOGICAL                ::   ll_do_bclinic         ! local logical 
     276      REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:,:) ::   ze3t 
     277      REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:  ) ::   zht, z_scale, zwu, zwv, zhdiv 
     278      !!---------------------------------------------------------------------- 
     279      ! 
     280      IF( ln_linssh )   RETURN      ! No calculation in linear free surface 
     281      ! 
     282      IF( nn_timing == 1 )   CALL timing_start('dom_vvl_sf_nxt') 
     283      ! 
     284      CALL wrk_alloc( jpi,jpj,zht,   z_scale, zwu, zwv, zhdiv ) 
     285      CALL wrk_alloc( jpi,jpj,jpk,   ze3t ) 
     286 
     287      IF( kt == nit000 ) THEN 
    284288         IF(lwp) WRITE(numout,*) 
    285289         IF(lwp) WRITE(numout,*) 'dom_vvl_sf_nxt : compute after scale factors' 
     
    289293      ll_do_bclinic = .TRUE. 
    290294      IF( PRESENT(kcall) ) THEN 
    291          IF ( kcall == 2 .AND. ln_vvl_ztilde ) ll_do_bclinic = .FALSE. 
     295         IF( kcall == 2 .AND. ln_vvl_ztilde )  ll_do_bclinic = .FALSE. 
    292296      ENDIF 
    293297 
     
    295299      ! After acale factors at t-points ! 
    296300      ! ******************************* ! 
    297  
    298301      !                                                ! --------------------------------------------- ! 
    299                                                        ! z_star coordinate and barotropic z-tilde part ! 
     302      !                                                ! z_star coordinate and barotropic z-tilde part ! 
    300303      !                                                ! --------------------------------------------- ! 
    301  
     304      ! 
    302305      z_scale(:,:) = ( ssha(:,:) - sshb(:,:) ) * ssmask(:,:) / ( ht_0(:,:) + sshn(:,:) + 1. - ssmask(:,:) ) 
    303306      DO jk = 1, jpkm1 
    304          ! formally this is the same as fse3t_a = e3t_0*(1+ssha/ht_0) 
    305          fse3t_a(:,:,jk) = fse3t_b(:,:,jk) + fse3t_n(:,:,jk) * z_scale(:,:) * tmask(:,:,jk) 
     307         ! formally this is the same as e3t_a = e3t_0*(1+ssha/ht_0) 
     308         e3t_a(:,:,jk) = e3t_b(:,:,jk) + e3t_n(:,:,jk) * z_scale(:,:) * tmask(:,:,jk) 
    306309      END DO 
    307  
     310      ! 
    308311      IF( ln_vvl_ztilde .OR. ln_vvl_layer .AND. ll_do_bclinic ) THEN   ! z_tilde or layer coordinate ! 
    309312         !                                                            ! ------baroclinic part------ ! 
    310  
    311313         ! I - initialization 
    312314         ! ================== 
     
    314316         ! 1 - barotropic divergence 
    315317         ! ------------------------- 
    316          zhdiv(:,:) = 0. 
    317          zht(:,:)   = 0. 
     318         zhdiv(:,:) = 0._wp 
     319         zht(:,:)   = 0._wp 
    318320         DO jk = 1, jpkm1 
    319             zhdiv(:,:) = zhdiv(:,:) + fse3t_n(:,:,jk) * hdivn(:,:,jk) 
    320             zht  (:,:) = zht  (:,:) + fse3t_n(:,:,jk) * tmask(:,:,jk) 
     321            zhdiv(:,:) = zhdiv(:,:) + e3t_n(:,:,jk) * hdivn(:,:,jk) 
     322            zht  (:,:) = zht  (:,:) + e3t_n(:,:,jk) * tmask(:,:,jk) 
    321323         END DO 
    322324         zhdiv(:,:) = zhdiv(:,:) / ( zht(:,:) + 1. - tmask_i(:,:) ) 
     
    325327         ! -------------------------------------------------- 
    326328         IF( ln_vvl_ztilde ) THEN 
    327             IF( kt .GT. nit000 ) THEN 
     329            IF( kt > nit000 ) THEN 
    328330               DO jk = 1, jpkm1 
    329331                  hdiv_lf(:,:,jk) = hdiv_lf(:,:,jk) - rdt * frq_rst_hdv(:,:)   & 
    330                      &          * ( hdiv_lf(:,:,jk) - fse3t_n(:,:,jk) * ( hdivn(:,:,jk) - zhdiv(:,:) ) ) 
     332                     &          * ( hdiv_lf(:,:,jk) - e3t_n(:,:,jk) * ( hdivn(:,:,jk) - zhdiv(:,:) ) ) 
    331333               END DO 
    332334            ENDIF 
    333          END IF 
     335         ENDIF 
    334336 
    335337         ! II - after z_tilde increments of vertical scale factors 
    336338         ! ======================================================= 
    337          tilde_e3t_a(:,:,:) = 0.0_wp  ! tilde_e3t_a used to store tendency terms 
     339         tilde_e3t_a(:,:,:) = 0._wp  ! tilde_e3t_a used to store tendency terms 
    338340 
    339341         ! 1 - High frequency divergence term 
     
    341343         IF( ln_vvl_ztilde ) THEN     ! z_tilde case 
    342344            DO jk = 1, jpkm1 
    343                tilde_e3t_a(:,:,jk) = tilde_e3t_a(:,:,jk) - ( fse3t_n(:,:,jk) * ( hdivn(:,:,jk) - zhdiv(:,:) ) - hdiv_lf(:,:,jk) ) 
     345               tilde_e3t_a(:,:,jk) = tilde_e3t_a(:,:,jk) - ( e3t_n(:,:,jk) * ( hdivn(:,:,jk) - zhdiv(:,:) ) - hdiv_lf(:,:,jk) ) 
    344346            END DO 
    345347         ELSE                         ! layer case 
    346348            DO jk = 1, jpkm1 
    347                tilde_e3t_a(:,:,jk) = tilde_e3t_a(:,:,jk) -   fse3t_n(:,:,jk) * ( hdivn(:,:,jk) - zhdiv(:,:) ) * tmask(:,:,jk) 
    348             END DO 
    349          END IF 
     349               tilde_e3t_a(:,:,jk) = tilde_e3t_a(:,:,jk) -   e3t_n(:,:,jk) * ( hdivn(:,:,jk) - zhdiv(:,:) ) * tmask(:,:,jk) 
     350            END DO 
     351         ENDIF 
    350352 
    351353         ! 2 - Restoring term (z-tilde case only) 
     
    355357               tilde_e3t_a(:,:,jk) = tilde_e3t_a(:,:,jk) - frq_rst_e3t(:,:) * tilde_e3t_b(:,:,jk) 
    356358            END DO 
    357          END IF 
     359         ENDIF 
    358360 
    359361         ! 3 - Thickness diffusion term 
    360362         ! ---------------------------- 
    361          zwu(:,:) = 0.0_wp 
    362          zwv(:,:) = 0.0_wp 
    363          ! a - first derivative: diffusive fluxes 
    364          DO jk = 1, jpkm1 
     363         zwu(:,:) = 0._wp 
     364         zwv(:,:) = 0._wp 
     365         DO jk = 1, jpkm1        ! a - first derivative: diffusive fluxes 
    365366            DO jj = 1, jpjm1 
    366367               DO ji = 1, fs_jpim1   ! vector opt. 
     
    374375            END DO 
    375376         END DO 
    376          ! b - correction for last oceanic u-v points 
    377          DO jj = 1, jpj 
     377         DO jj = 1, jpj          ! b - correction for last oceanic u-v points 
    378378            DO ji = 1, jpi 
    379379               un_td(ji,jj,mbku(ji,jj)) = un_td(ji,jj,mbku(ji,jj)) - zwu(ji,jj) 
     
    381381            END DO 
    382382         END DO 
    383          ! c - second derivative: divergence of diffusive fluxes 
    384          DO jk = 1, jpkm1 
     383         DO jk = 1, jpkm1        ! c - second derivative: divergence of diffusive fluxes 
    385384            DO jj = 2, jpjm1 
    386385               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
     
    391390            END DO 
    392391         END DO 
    393          ! d - thickness diffusion transport: boundary conditions 
    394          !     (stored for tracer advction and continuity equation) 
     392         !                       ! d - thickness diffusion transport: boundary conditions 
     393         !                             (stored for tracer advction and continuity equation) 
    395394         CALL lbc_lnk( un_td , 'U' , -1._wp) 
    396395         CALL lbc_lnk( vn_td , 'V' , -1._wp) 
     
    410409         ! Maximum deformation control 
    411410         ! ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 
    412          ze3t(:,:,jpk) = 0.0_wp 
     411         ze3t(:,:,jpk) = 0._wp 
    413412         DO jk = 1, jpkm1 
    414413            ze3t(:,:,jk) = tilde_e3t_a(:,:,jk) / e3t_0(:,:,jk) * tmask(:,:,jk) * tmask_i(:,:) 
     
    419418         IF( lk_mpp )   CALL mpp_min( z_tmin )                 ! min over the global domain 
    420419         ! - ML - test: for the moment, stop simulation for too large e3_t variations 
    421          IF( ( z_tmax .GT. rn_zdef_max ) .OR. ( z_tmin .LT. - rn_zdef_max ) ) THEN 
     420         IF( ( z_tmax >  rn_zdef_max ) .OR. ( z_tmin < - rn_zdef_max ) ) THEN 
    422421            IF( lk_mpp ) THEN 
    423422               CALL mpp_maxloc( ze3t, tmask, z_tmax, ijk_max(1), ijk_max(2), ijk_max(3) ) 
     
    462461         z_scale(:,:) =  - zht(:,:) / ( ht_0(:,:) + sshn(:,:) + 1. - ssmask(:,:) ) 
    463462         DO jk = 1, jpkm1 
    464             dtilde_e3t_a(:,:,jk) = dtilde_e3t_a(:,:,jk) + fse3t_n(:,:,jk) * z_scale(:,:) * tmask(:,:,jk) 
     463            dtilde_e3t_a(:,:,jk) = dtilde_e3t_a(:,:,jk) + e3t_n(:,:,jk) * z_scale(:,:) * tmask(:,:,jk) 
    465464         END DO 
    466465 
     
    470469      !                                           ! ---baroclinic part--------- ! 
    471470         DO jk = 1, jpkm1 
    472             fse3t_a(:,:,jk) = fse3t_a(:,:,jk) + dtilde_e3t_a(:,:,jk) * tmask(:,:,jk) 
     471            e3t_a(:,:,jk) = e3t_a(:,:,jk) + dtilde_e3t_a(:,:,jk) * tmask(:,:,jk) 
    473472         END DO 
    474473      ENDIF 
     
    485484         zht(:,:) = 0.0_wp 
    486485         DO jk = 1, jpkm1 
    487             zht(:,:) = zht(:,:) + fse3t_n(:,:,jk) * tmask(:,:,jk) 
     486            zht(:,:) = zht(:,:) + e3t_n(:,:,jk) * tmask(:,:,jk) 
    488487         END DO 
    489488         z_tmax = MAXVAL( tmask(:,:,1) * tmask_i(:,:) * ABS( ht_0(:,:) + sshn(:,:) - zht(:,:) ) ) 
    490489         IF( lk_mpp ) CALL mpp_max( z_tmax )                                ! max over the global domain 
    491          IF( lwp    ) WRITE(numout, *) kt,' MAXVAL(abs(ht_0+sshn-SUM(fse3t_n))) =', z_tmax 
     490         IF( lwp    ) WRITE(numout, *) kt,' MAXVAL(abs(ht_0+sshn-SUM(e3t_n))) =', z_tmax 
    492491         ! 
    493492         zht(:,:) = 0.0_wp 
    494493         DO jk = 1, jpkm1 
    495             zht(:,:) = zht(:,:) + fse3t_a(:,:,jk) * tmask(:,:,jk) 
     494            zht(:,:) = zht(:,:) + e3t_a(:,:,jk) * tmask(:,:,jk) 
    496495         END DO 
    497496         z_tmax = MAXVAL( tmask(:,:,1) * tmask_i(:,:) * ABS( ht_0(:,:) + ssha(:,:) - zht(:,:) ) ) 
    498497         IF( lk_mpp ) CALL mpp_max( z_tmax )                                ! max over the global domain 
    499          IF( lwp    ) WRITE(numout, *) kt,' MAXVAL(abs(ht_0+ssha-SUM(fse3t_a))) =', z_tmax 
     498         IF( lwp    ) WRITE(numout, *) kt,' MAXVAL(abs(ht_0+ssha-SUM(e3t_a))) =', z_tmax 
    500499         ! 
    501500         zht(:,:) = 0.0_wp 
    502501         DO jk = 1, jpkm1 
    503             zht(:,:) = zht(:,:) + fse3t_b(:,:,jk) * tmask(:,:,jk) 
     502            zht(:,:) = zht(:,:) + e3t_b(:,:,jk) * tmask(:,:,jk) 
    504503         END DO 
    505504         z_tmax = MAXVAL( tmask(:,:,1) * tmask_i(:,:) * ABS( ht_0(:,:) + sshb(:,:) - zht(:,:) ) ) 
    506505         IF( lk_mpp ) CALL mpp_max( z_tmax )                                ! max over the global domain 
    507          IF( lwp    ) WRITE(numout, *) kt,' MAXVAL(abs(ht_0+sshb-SUM(fse3t_b))) =', z_tmax 
     506         IF( lwp    ) WRITE(numout, *) kt,' MAXVAL(abs(ht_0+sshb-SUM(e3t_b))) =', z_tmax 
    508507         ! 
    509508         z_tmax = MAXVAL( tmask(:,:,1) *  ABS( sshb(:,:) ) ) 
     
    524523      ! *********************************** ! 
    525524 
    526       CALL dom_vvl_interpol( fse3t_a(:,:,:), fse3u_a(:,:,:), 'U' ) 
    527       CALL dom_vvl_interpol( fse3t_a(:,:,:), fse3v_a(:,:,:), 'V' ) 
     525      CALL dom_vvl_interpol( e3t_a(:,:,:), e3u_a(:,:,:), 'U' ) 
     526      CALL dom_vvl_interpol( e3t_a(:,:,:), e3v_a(:,:,:), 'V' ) 
    528527 
    529528      ! *********************************** ! 
     
    531530      ! *********************************** ! 
    532531 
    533       hu_a(:,:) = 0._wp                        ! Ocean depth at U-points 
    534       hv_a(:,:) = 0._wp                        ! Ocean depth at V-points 
    535       DO jk = 1, jpkm1 
    536          hu_a(:,:) = hu_a(:,:) + fse3u_a(:,:,jk) * umask(:,:,jk) 
    537          hv_a(:,:) = hv_a(:,:) + fse3v_a(:,:,jk) * vmask(:,:,jk) 
     532      hu_a(:,:) = e3u_a(:,:,1) * umask(:,:,1) 
     533      hv_a(:,:) = e3v_a(:,:,1) * vmask(:,:,1) 
     534      DO jk = 2, jpkm1 
     535         hu_a(:,:) = hu_a(:,:) + e3u_a(:,:,jk) * umask(:,:,jk) 
     536         hv_a(:,:) = hv_a(:,:) + e3v_a(:,:,jk) * vmask(:,:,jk) 
    538537      END DO 
    539538      !                                        ! Inverse of the local depth 
    540       hur_a(:,:) = 1._wp / ( hu_a(:,:) + 1._wp - umask_i(:,:) ) * umask_i(:,:) 
    541       hvr_a(:,:) = 1._wp / ( hv_a(:,:) + 1._wp - vmask_i(:,:) ) * vmask_i(:,:) 
    542  
    543       CALL wrk_dealloc( jpi, jpj, zht, z_scale, zwu, zwv, zhdiv ) 
    544       CALL wrk_dealloc( jpi, jpj, jpk, ze3t                     ) 
    545  
     539!!gm BUG ?  don't understand the use of umask_i here ..... 
     540      r1_hu_a(:,:) = ssumask(:,:) / ( hu_a(:,:) + 1._wp - ssumask(:,:) ) 
     541      r1_hv_a(:,:) = ssvmask(:,:) / ( hv_a(:,:) + 1._wp - ssvmask(:,:) ) 
     542      ! 
     543      CALL wrk_dealloc( jpi,jpj,       zht, z_scale, zwu, zwv, zhdiv ) 
     544      CALL wrk_dealloc( jpi,jpj,jpk,   ze3t ) 
     545      ! 
    546546      IF( nn_timing == 1 )  CALL timing_stop('dom_vvl_sf_nxt') 
    547  
     547      ! 
    548548   END SUBROUTINE dom_vvl_sf_nxt 
    549549 
     
    561561      !!               - recompute depths and water height fields 
    562562      !! 
    563       !! ** Action  :  - fse3t_(b/n), tilde_e3t_(b/n) and fse3(u/v)_n ready for next time step 
     563      !! ** Action  :  - e3t_(b/n), tilde_e3t_(b/n) and e3(u/v)_n ready for next time step 
    564564      !!               - Recompute: 
    565       !!                    fse3(u/v)_b        
    566       !!                    fse3w_n            
    567       !!                    fse3(u/v)w_b       
    568       !!                    fse3(u/v)w_n       
    569       !!                    fsdept_n, fsdepw_n  and fsde3w_n 
     565      !!                    e3(u/v)_b        
     566      !!                    e3w_n            
     567      !!                    e3(u/v)w_b       
     568      !!                    e3(u/v)w_n       
     569      !!                    gdept_n, gdepw_n  and gde3w_n 
    570570      !!                    h(u/v) and h(u/v)r 
    571571      !! 
     
    573573      !!              Leclair, M., and G. Madec, 2011, Ocean Modelling. 
    574574      !!---------------------------------------------------------------------- 
    575       !! * Arguments 
    576       INTEGER, INTENT( in )               :: kt       ! time step 
    577       !! * Local declarations 
    578       INTEGER                             :: ji,jj,jk       ! dummy loop indices 
    579       REAL(wp)                            :: zcoef 
    580       !!---------------------------------------------------------------------- 
    581  
     575      INTEGER, INTENT( in ) ::   kt   ! time step 
     576      ! 
     577      INTEGER  ::   ji, jj, jk   ! dummy loop indices 
     578      REAL(wp) ::   zcoef        ! local scalar 
     579      !!---------------------------------------------------------------------- 
     580      ! 
     581      IF( ln_linssh )   RETURN      ! No calculation in linear free surface 
     582      ! 
    582583      IF( nn_timing == 1 )  CALL timing_start('dom_vvl_sf_swp') 
    583584      ! 
     
    590591      ! Time filter and swap of scale factors 
    591592      ! ===================================== 
    592       ! - ML - fse3(t/u/v)_b are allready computed in dynnxt. 
     593      ! - ML - e3(t/u/v)_b are allready computed in dynnxt. 
    593594      IF( ln_vvl_ztilde .OR. ln_vvl_layer ) THEN 
    594595         IF( neuler == 0 .AND. kt == nit000 ) THEN 
     
    600601         tilde_e3t_n(:,:,:) = tilde_e3t_a(:,:,:) 
    601602      ENDIF 
    602       fsdept_b(:,:,:) = fsdept_n(:,:,:) 
    603       fsdepw_b(:,:,:) = fsdepw_n(:,:,:) 
    604  
    605       fse3t_n(:,:,:) = fse3t_a(:,:,:) 
    606       fse3u_n(:,:,:) = fse3u_a(:,:,:) 
    607       fse3v_n(:,:,:) = fse3v_a(:,:,:) 
     603      gdept_b(:,:,:) = gdept_n(:,:,:) 
     604      gdepw_b(:,:,:) = gdepw_n(:,:,:) 
     605 
     606      e3t_n(:,:,:) = e3t_a(:,:,:) 
     607      e3u_n(:,:,:) = e3u_a(:,:,:) 
     608      e3v_n(:,:,:) = e3v_a(:,:,:) 
    608609 
    609610      ! Compute all missing vertical scale factor and depths 
     
    611612      ! Horizontal scale factor interpolations 
    612613      ! -------------------------------------- 
    613       ! - ML - fse3u_b and fse3v_b are allready computed in dynnxt 
     614      ! - ML - e3u_b and e3v_b are allready computed in dynnxt 
    614615      ! - JC - hu_b, hv_b, hur_b, hvr_b also 
    615       CALL dom_vvl_interpol( fse3u_n(:,:,:), fse3f_n (:,:,:), 'F'  ) 
     616       
     617      CALL dom_vvl_interpol( e3u_n(:,:,:), e3f_n(:,:,:), 'F'  ) 
     618       
    616619      ! Vertical scale factor interpolations 
    617       ! ------------------------------------ 
    618       CALL dom_vvl_interpol( fse3t_n(:,:,:), fse3w_n (:,:,:), 'W'  ) 
    619       CALL dom_vvl_interpol( fse3u_n(:,:,:), fse3uw_n(:,:,:), 'UW' ) 
    620       CALL dom_vvl_interpol( fse3v_n(:,:,:), fse3vw_n(:,:,:), 'VW' ) 
    621       CALL dom_vvl_interpol( fse3t_b(:,:,:), fse3w_b (:,:,:), 'W'  ) 
    622       CALL dom_vvl_interpol( fse3u_b(:,:,:), fse3uw_b(:,:,:), 'UW' ) 
    623       CALL dom_vvl_interpol( fse3v_b(:,:,:), fse3vw_b(:,:,:), 'VW' ) 
    624       ! t- and w- points depth 
    625       ! ---------------------- 
    626       ! set the isf depth as it is in the initial step 
    627       fsdept_n(:,:,1) = 0.5_wp * fse3w_n(:,:,1) 
    628       fsdepw_n(:,:,1) = 0.0_wp 
    629       fsde3w_n(:,:,1) = fsdept_n(:,:,1) - sshn(:,:) 
    630  
     620      CALL dom_vvl_interpol( e3t_n(:,:,:),  e3w_n(:,:,:), 'W'  ) 
     621      CALL dom_vvl_interpol( e3u_n(:,:,:), e3uw_n(:,:,:), 'UW' ) 
     622      CALL dom_vvl_interpol( e3v_n(:,:,:), e3vw_n(:,:,:), 'VW' ) 
     623      CALL dom_vvl_interpol( e3t_b(:,:,:),  e3w_b(:,:,:), 'W'  ) 
     624      CALL dom_vvl_interpol( e3u_b(:,:,:), e3uw_b(:,:,:), 'UW' ) 
     625      CALL dom_vvl_interpol( e3v_b(:,:,:), e3vw_b(:,:,:), 'VW' ) 
     626 
     627      ! t- and w- points depth (set the isf depth as it is in the initial step) 
     628      gdept_n(:,:,1) = 0.5_wp * e3w_n(:,:,1) 
     629      gdepw_n(:,:,1) = 0.0_wp 
     630      gde3w_n(:,:,1) = gdept_n(:,:,1) - sshn(:,:) 
    631631      DO jk = 2, jpk 
    632632         DO jj = 1,jpj 
     
    635635                                                                 ! 1 for jk = mikt 
    636636               zcoef = (tmask(ji,jj,jk) - wmask(ji,jj,jk)) 
    637                fsdepw_n(ji,jj,jk) = fsdepw_n(ji,jj,jk-1) + fse3t_n(ji,jj,jk-1) 
    638                fsdept_n(ji,jj,jk) =      zcoef  * ( fsdepw_n(ji,jj,jk  ) + 0.5 * fse3w_n(ji,jj,jk))  & 
    639                    &                + (1-zcoef) * ( fsdept_n(ji,jj,jk-1) +       fse3w_n(ji,jj,jk))  
    640                fsde3w_n(ji,jj,jk) = fsdept_n(ji,jj,jk) - sshn(ji,jj) 
     637               gdepw_n(ji,jj,jk) = gdepw_n(ji,jj,jk-1) + e3t_n(ji,jj,jk-1) 
     638               gdept_n(ji,jj,jk) =    zcoef  * ( gdepw_n(ji,jj,jk  ) + 0.5 * e3w_n(ji,jj,jk) )  & 
     639                   &             + (1-zcoef) * ( gdept_n(ji,jj,jk-1) +       e3w_n(ji,jj,jk) )  
     640               gde3w_n(ji,jj,jk) = gdept_n(ji,jj,jk) - sshn(ji,jj) 
    641641            END DO 
    642642         END DO 
    643643      END DO 
    644644 
    645       ! Local depth and Inverse of the local depth of the water column at u- and v- points 
    646       ! ---------------------------------------------------------------------------------- 
    647       hu (:,:) = hu_a (:,:) 
    648       hv (:,:) = hv_a (:,:) 
    649  
    650       ! Inverse of the local depth 
    651       hur(:,:) = hur_a(:,:) 
    652       hvr(:,:) = hvr_a(:,:) 
    653  
    654       ! Local depth of the water column at t- points 
    655       ! -------------------------------------------- 
    656       ht(:,:) = 0. 
    657       DO jk = 1, jpkm1 
    658          ht(:,:) = ht(:,:) + fse3t_n(:,:,jk) * tmask(:,:,jk) 
     645      ! Local depth and Inverse of the local depth of the water 
     646      ! ------------------------------------------------------- 
     647      hu_n(:,:) = hu_a(:,:)   ;   r1_hu_n(:,:) = r1_hu_a(:,:) 
     648      hv_n(:,:) = hv_a(:,:)   ;   r1_hv_n(:,:) = r1_hv_a(:,:) 
     649      ! 
     650      ht_n(:,:) = e3t_n(:,:,1) * tmask(:,:,1) 
     651      DO jk = 2, jpkm1 
     652         ht_n(:,:) = ht_n(:,:) + e3t_n(:,:,jk) * tmask(:,:,jk) 
    659653      END DO 
    660654 
    661655      ! Write outputs 
    662656      ! ============= 
    663       CALL iom_put(     "e3t" , fse3t_n  (:,:,:) ) 
    664       CALL iom_put(     "e3u" , fse3u_n  (:,:,:) ) 
    665       CALL iom_put(     "e3v" , fse3v_n  (:,:,:) ) 
    666       CALL iom_put(     "e3w" , fse3w_n  (:,:,:) ) 
    667       CALL iom_put( "tpt_dep" , fsde3w_n (:,:,:) ) 
     657      CALL iom_put(     "e3t",   e3t_n(:,:,:) ) 
     658      CALL iom_put(     "e3u",   e3u_n(:,:,:) ) 
     659      CALL iom_put(     "e3v",   e3v_n(:,:,:) ) 
     660      CALL iom_put(     "e3w",   e3w_n(:,:,:) ) 
     661      CALL iom_put( "tpt_dep", gde3w_n(:,:,:) ) 
    668662      IF( iom_use("e3tdef") )   & 
    669          CALL iom_put( "e3tdef"  , ( ( fse3t_n(:,:,:) - e3t_0(:,:,:) ) / e3t_0(:,:,:) * 100 * tmask(:,:,:) ) ** 2 ) 
     663         CALL iom_put( "e3tdef", ( ( e3t_n(:,:,:) - e3t_0(:,:,:) ) / e3t_0(:,:,:) * 100. * tmask(:,:,:) ) ** 2 ) 
    670664 
    671665      ! write restart file 
    672666      ! ================== 
    673       IF( lrst_oce ) CALL dom_vvl_rst( kt, 'WRITE' ) 
    674       ! 
    675       IF( nn_timing == 1 )  CALL timing_stop('dom_vvl_sf_swp') 
    676  
     667      IF( lrst_oce )   CALL dom_vvl_rst( kt, 'WRITE' ) 
     668      ! 
     669      IF( nn_timing == 1 )   CALL timing_stop('dom_vvl_sf_swp') 
     670      ! 
    677671   END SUBROUTINE dom_vvl_sf_swp 
    678672 
     
    696690      !!---------------------------------------------------------------------- 
    697691      ! 
    698       IF( nn_timing == 1 )  CALL timing_start('dom_vvl_interpol') 
     692      IF( nn_timing == 1 )   CALL timing_start('dom_vvl_interpol') 
    699693      ! 
    700694      SELECT CASE ( pout )    !==  type of interpolation  ==! 
     
    770764      END SELECT 
    771765      ! 
    772       IF( nn_timing == 1 )  CALL timing_stop('dom_vvl_interpol') 
     766      IF( nn_timing == 1 )   CALL timing_stop('dom_vvl_interpol') 
    773767      ! 
    774768   END SUBROUTINE dom_vvl_interpol 
     
    801795            CALL iom_get( numror, jpdom_autoglo, 'sshn'   , sshn    ) 
    802796            ! 
    803             id1 = iom_varid( numror, 'fse3t_b', ldstop = .FALSE. ) 
    804             id2 = iom_varid( numror, 'fse3t_n', ldstop = .FALSE. ) 
     797            id1 = iom_varid( numror, 'e3t_b', ldstop = .FALSE. ) 
     798            id2 = iom_varid( numror, 'e3t_n', ldstop = .FALSE. ) 
    805799            id3 = iom_varid( numror, 'tilde_e3t_b', ldstop = .FALSE. ) 
    806800            id4 = iom_varid( numror, 'tilde_e3t_n', ldstop = .FALSE. ) 
     
    810804            !                             ! --------- ! 
    811805            IF( MIN( id1, id2 ) > 0 ) THEN       ! all required arrays exist 
    812                CALL iom_get( numror, jpdom_autoglo, 'fse3t_b', fse3t_b(:,:,:) ) 
    813                CALL iom_get( numror, jpdom_autoglo, 'fse3t_n', fse3t_n(:,:,:) ) 
     806               CALL iom_get( numror, jpdom_autoglo, 'e3t_b', e3t_b(:,:,:) ) 
     807               CALL iom_get( numror, jpdom_autoglo, 'e3t_n', e3t_n(:,:,:) ) 
    814808               ! needed to restart if land processor not computed  
    815                IF(lwp) write(numout,*) 'dom_vvl_rst : fse3t_b and fse3t_n found in restart files' 
     809               IF(lwp) write(numout,*) 'dom_vvl_rst : e3t_b and e3t_n found in restart files' 
    816810               WHERE ( tmask(:,:,:) == 0.0_wp )  
    817                   fse3t_n(:,:,:) = e3t_0(:,:,:) 
    818                   fse3t_b(:,:,:) = e3t_0(:,:,:) 
     811                  e3t_n(:,:,:) = e3t_0(:,:,:) 
     812                  e3t_b(:,:,:) = e3t_0(:,:,:) 
    819813               END WHERE 
    820814               IF( neuler == 0 ) THEN 
    821                   fse3t_b(:,:,:) = fse3t_n(:,:,:) 
     815                  e3t_b(:,:,:) = e3t_n(:,:,:) 
    822816               ENDIF 
    823817            ELSE IF( id1 > 0 ) THEN 
    824                IF(lwp) write(numout,*) 'dom_vvl_rst WARNING : fse3t_n not found in restart files' 
    825                IF(lwp) write(numout,*) 'fse3t_n set equal to fse3t_b.' 
     818               IF(lwp) write(numout,*) 'dom_vvl_rst WARNING : e3t_n not found in restart files' 
     819               IF(lwp) write(numout,*) 'e3t_n set equal to e3t_b.' 
    826820               IF(lwp) write(numout,*) 'neuler is forced to 0' 
    827                CALL iom_get( numror, jpdom_autoglo, 'fse3t_b', fse3t_b(:,:,:) ) 
    828                fse3t_n(:,:,:) = fse3t_b(:,:,:) 
     821               CALL iom_get( numror, jpdom_autoglo, 'e3t_b', e3t_b(:,:,:) ) 
     822               e3t_n(:,:,:) = e3t_b(:,:,:) 
    829823               neuler = 0 
    830824            ELSE IF( id2 > 0 ) THEN 
    831                IF(lwp) write(numout,*) 'dom_vvl_rst WARNING : fse3t_b not found in restart files' 
    832                IF(lwp) write(numout,*) 'fse3t_b set equal to fse3t_n.' 
     825               IF(lwp) write(numout,*) 'dom_vvl_rst WARNING : e3t_b not found in restart files' 
     826               IF(lwp) write(numout,*) 'e3t_b set equal to e3t_n.' 
    833827               IF(lwp) write(numout,*) 'neuler is forced to 0' 
    834                CALL iom_get( numror, jpdom_autoglo, 'fse3t_n', fse3t_n(:,:,:) ) 
    835                fse3t_b(:,:,:) = fse3t_n(:,:,:) 
     828               CALL iom_get( numror, jpdom_autoglo, 'e3t_n', e3t_n(:,:,:) ) 
     829               e3t_b(:,:,:) = e3t_n(:,:,:) 
    836830               neuler = 0 
    837831            ELSE 
    838                IF(lwp) write(numout,*) 'dom_vvl_rst WARNING : fse3t_n not found in restart file' 
     832               IF(lwp) write(numout,*) 'dom_vvl_rst WARNING : e3t_n not found in restart file' 
    839833               IF(lwp) write(numout,*) 'Compute scale factor from sshn' 
    840834               IF(lwp) write(numout,*) 'neuler is forced to 0' 
    841                DO jk=1,jpk 
    842                   fse3t_n(:,:,jk) =  e3t_0(:,:,jk) * ( ht_0(:,:) + sshn(:,:) ) & 
    843                       &                            / ( ht_0(:,:) + 1._wp - ssmask(:,:) ) * tmask(:,:,jk) & 
    844                       &            + e3t_0(:,:,jk) * (1._wp -tmask(:,:,jk)) 
     835               DO jk = 1, jpk 
     836                  e3t_n(:,:,jk) =  e3t_0(:,:,jk) * ( ht_0(:,:) + sshn(:,:) ) & 
     837                      &                          / ( ht_0(:,:) + 1._wp - ssmask(:,:) ) * tmask(:,:,jk)  & 
     838                      &          + e3t_0(:,:,jk)                              * (1._wp -tmask(:,:,jk)) 
    845839               END DO 
    846                fse3t_b(:,:,:) = fse3t_n(:,:,:) 
     840               e3t_b(:,:,:) = e3t_n(:,:,:) 
    847841               neuler = 0 
    848842            ENDIF 
     
    875869            ! 
    876870         ELSE                                   !* Initialize at "rest" 
    877             fse3t_b(:,:,:) = e3t_0(:,:,:) 
    878             fse3t_n(:,:,:) = e3t_0(:,:,:) 
     871            e3t_b(:,:,:) = e3t_0(:,:,:) 
     872            e3t_n(:,:,:) = e3t_0(:,:,:) 
    879873            sshn(:,:) = 0.0_wp 
    880874            IF( ln_vvl_ztilde .OR. ln_vvl_layer) THEN 
     
    891885         !                                           ! all cases ! 
    892886         !                                           ! --------- ! 
    893          CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'fse3t_b', fse3t_b(:,:,:) ) 
    894          CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'fse3t_n', fse3t_n(:,:,:) ) 
     887         CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'e3t_b', e3t_b(:,:,:) ) 
     888         CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'e3t_n', e3t_n(:,:,:) ) 
    895889         !                                           ! ----------------------- ! 
    896890         IF( ln_vvl_ztilde .OR. ln_vvl_layer ) THEN  ! z_tilde and layer cases ! 
     
    975969      ! 
    976970      IF( ioptio /= 1 )   CALL ctl_stop( 'Choose ONE vertical coordinate in namelist nam_vvl' ) 
    977       IF( .NOT. ln_vvl_zstar .AND. nn_isf .NE. 0) CALL ctl_stop( 'Only vvl_zstar has been tested with ice shelf cavity' ) 
     971      IF( .NOT. ln_vvl_zstar .AND. ln_isf ) CALL ctl_stop( 'Only vvl_zstar has been tested with ice shelf cavity' ) 
    978972      ! 
    979973      IF(lwp) THEN                   ! Print the choice 
     
    989983      ! 
    990984#if defined key_agrif 
    991       IF (.NOT.Agrif_Root()) CALL ctl_stop( 'AGRIF not implemented with non-linear free surface (key_vvl)' ) 
     985      IF(.NOT.Agrif_Root() )   CALL ctl_stop( 'AGRIF not implemented with non-linear free surface' ) 
    992986#endif 
    993987      ! 
     
    996990   !!====================================================================== 
    997991END MODULE domvvl 
    998  
    999  
    1000  
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.