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Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
This present forge is now archived and remained online for history.
Changeset 7646 for trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_OFF_PISCES/EXP00/namelist_pisces_cfg – NEMO

Ignore:
Timestamp:
2017-02-06T10:25:03+01:00 (7 years ago)
Author:
timgraham
Message:

Merge of dev_merge_2016 into trunk. UPDATE TO ARCHFILES NEEDED for XIOS2.
LIM_SRC_s/limrhg.F90 to follow in next commit due to change of kind (I'm unable to do it in this commit).
Merged using the following steps:

1) svn merge --reintegrate svn+ssh://forge.ipsl.jussieu.fr/ipsl/forge/projets/nemo/svn/trunk .
2) Resolve minor conflicts in sette.sh and namelist_cfg for ORCA2LIM3 (due to a change in trunk after branch was created)
3) svn commit
4) svn switch svn+ssh://forge.ipsl.jussieu.fr/ipsl/forge/projets/nemo/svn/trunk
5) svn merge svn+ssh://forge.ipsl.jussieu.fr/ipsl/forge/projets/nemo/svn/branches/2016/dev_merge_2016 .
6) At this stage I checked out a clean copy of the branch to compare against what is about to be committed to the trunk.
6) svn commit #Commit code to the trunk

In this commit I have also reverted a change to Fcheck_archfile.sh which was causing problems on the Paris machine.

File:
1 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_OFF_PISCES/EXP00/namelist_pisces_cfg

    r4147 r7646  
    11!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
    2 !! PISCES  :   ORCA2_OFF_PISCES configuration namelsit used to overwrite SHARED/namelist_pisces_ref 
    3 !>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
     2!! PISCES reference namelist  
     3!!              1  - air-sea exchange                         (nampisext) 
     4!!              2  - biological parameters                    (nampisbio) 
     5!!              3  - parameters for nutrient limitations      (nampislim)     
     6!!              4  - parameters for phytoplankton             (nampisprod,nampismort) 
     7!!              5  - parameters for zooplankton               (nampismes,nampiszoo) 
     8!!              6  - parameters for remineralization          (nampisrem) 
     9!!              7  - parameters for calcite chemistry         (nampiscal) 
     10!!              8  - parameters for inputs deposition         (nampissed) 
     11!!              11 - Damping                                  (nampisdmp) 
     12!----------------------------------------------------------------------- 
     13&nampismod     !  Model used  
     14!----------------------------------------------------------------------- 
     15/ 
     16!----------------------------------------------------------------------- 
     17&nampisext     !   air-sea exchange 
     18!----------------------------------------------------------------------- 
     19/ 
     20!----------------------------------------------------------------------- 
     21&nampisatm     !  Atmospheric prrssure  
     22!----------------------------------------------------------------------- 
     23/ 
     24!----------------------------------------------------------------------- 
     25&nampisbio     !   biological parameters 
     26!----------------------------------------------------------------------- 
     27   nrdttrc    =  4        ! time step frequency for biology 
     28/ 
     29!----------------------------------------------------------------------- 
     30&namp4zlim     !   parameters for nutrient limitations for PISCES std - ln_p4z 
     31!----------------------------------------------------------------------- 
     32/ 
     33!----------------------------------------------------------------------- 
     34&namp5zlim     !   parameters for nutrient limitations PISCES QUOTA - ln_p5z 
     35!----------------------------------------------------------------------- 
     36/ 
     37!----------------------------------------------------------------------- 
     38&namp5zquota    !   parameters for nutrient limitations PISCES quota - ln_p5z 
     39!----------------------------------------------------------------------- 
     40/ 
     41!----------------------------------------------------------------------- 
     42&nampisopt     !   parameters for optics 
     43!----------------------------------------------------------------------- 
     44/  
     45!----------------------------------------------------------------------- 
     46&namp4zprod     !   parameters for phytoplankton growth for PISCES std - ln_p4z 
     47!----------------------------------------------------------------------- 
     48/ 
    449!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
    5 &nampisext     !   air-sea exchange 
     50&namp5zprod     !   parameters for phytoplankton growth for PISCES quota - ln_p5z 
    651!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
    752/ 
    8 !''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
    9 &nampisatm     !  Atmospheric prrssure  
    10 !,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
     53!----------------------------------------------------------------------- 
     54&namp4zmort     !   parameters for phytoplankton sinks for PISCES std - ln_p4z 
     55!----------------------------------------------------------------------- 
    1156/ 
    12 !''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
    13 &nampisbio     !   biological parameters 
    14 !,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
    15    nrdttrc    =  4        ! time step frequency for biology 
     57!----------------------------------------------------------------------- 
     58&namp5zmort     !   parameters for phytoplankton sinks for PISCES quota - ln_p5z 
     59!----------------------------------------------------------------------- 
    1660/ 
    17 !''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
    18 &nampislim     !   parameters for nutrient limitations 
    19 !,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
     61!----------------------------------------------------------------------- 
     62&namp4zmes     !   parameters for mesozooplankton for PISCES std - ln_p4z 
     63!----------------------------------------------------------------------- 
    2064/ 
    21 !''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
    22 &nampisopt     !   parameters for optics 
    23 !,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
    24 /  
    25 !''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
    26 &nampisprod     !   parameters for phytoplankton growth 
    27 !,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
     65!----------------------------------------------------------------------- 
     66&namp5zmes     !   parameters for mesozooplankton 
     67!----------------------------------------------------------------------- 
    2868/ 
    29 !''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
    30 &nampismort     !   parameters for phytoplankton sinks 
    31 !,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
     69!----------------------------------------------------------------------- 
     70&namp4zzoo     !   parameters for microzooplankton for PISCES std - ln_p4z 
     71!----------------------------------------------------------------------- 
    3272/ 
    33 !''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
    34 &nampismes     !   parameters for mesozooplankton 
    35 !,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
     73!----------------------------------------------------------------------- 
     74&namp5zzoo     !   parameters for microzooplankton 
     75!----------------------------------------------------------------------- 
    3676/ 
    37 !''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
    38 &nampiszoo     !   parameters for microzooplankton 
    39 !,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
     77!----------------------------------------------------------------------- 
     78&nampisfer     !   parameters for iron chemistry 
     79!----------------------------------------------------------------------- 
    4080/ 
    41 !''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
    42 &nampisfer     !   parameters for iron chemistry 
    43 !,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
    44  
    45 !''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
     81!-----------------------------------------------------------------------   
    4682&nampisrem     !   parameters for remineralization 
    47 !,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
     83!----------------------------------------------------------------------- 
    4884/ 
    49 !''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
     85!----------------------------------------------------------------------- 
     86&nampispoc     !   parameters for organic particles 
     87!----------------------------------------------------------------------- 
     88/ 
     89!----------------------------------------------------------------------- 
    5090&nampiscal     !   parameters for Calcite chemistry 
    51 !,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
     91!----------------------------------------------------------------------- 
    5292/ 
    53 !''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
     93!----------------------------------------------------------------------- 
    5494&nampissbc     !   parameters for inputs deposition 
    55 !,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
     95!----------------------------------------------------------------------- 
    5696/ 
    57 !''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
     97!----------------------------------------------------------------------- 
     98&nampislig      !  Namelist parameters for ligands, nampislig 
     99!----------------------------------------------------------------------- 
     100/ 
     101!----------------------------------------------------------------------- 
     102&nampisice      !  Prescribed sea ice tracers 
     103!----------------------------------------------------------------------- 
     104/ 
     105!----------------------------------------------------------------------- 
    58106&nampisdmp     !  Damping  
    59 !,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
    60    nn_pisdmp    =  1460       !  Frequency of Relaxation  
     107!----------------------------------------------------------------------- 
     108   nn_pisdmp    =  1460       !  Frequency of Relaxation 
    61109/ 
    62 !''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
     110!----------------------------------------------------------------------- 
    63111&nampismass     !  Mass conservation 
    64 !,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
     112!----------------------------------------------------------------------- 
    65113/ 
     114!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
     115!! PISCES reduced (key_pisces_reduced, ex LOBSTER) : namelists 
     116!!              1  - biological parameters for phytoplankton    (namlobphy) 
     117!!              2  - biological parameters for nutrients        (namlobnut) 
     118!!              3  - biological parameters for zooplankton      (namlobzoo)     
     119!!              4  - biological parameters for detritus         (namlobdet) 
     120!!              5  - biological parameters for DOM              (namlobdom) 
     121!!              6  - parameters from aphotic layers to sediment (namlobsed) 
     122!!              7  - general coefficients                       (namlobrat) 
     123!!              8  - optical parameters                         (namlobopt) 
     124!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
     125!----------------------------------------------------------------------- 
     126&namlobphy     !   biological parameters for phytoplankton 
     127!----------------------------------------------------------------------- 
     128/ 
     129!----------------------------------------------------------------------- 
     130&namlobnut     !   biological parameters for nutrients 
     131!----------------------------------------------------------------------- 
     132/ 
     133!----------------------------------------------------------------------- 
     134&namlobzoo     !   biological parameters for zooplankton 
     135!----------------------------------------------------------------------- 
     136/ 
     137!----------------------------------------------------------------------- 
     138&namlobdet     !   biological parameters for detritus 
     139!----------------------------------------------------------------------- 
     140/ 
     141!----------------------------------------------------------------------- 
     142&namlobdom     !   biological parameters for DOM 
     143!----------------------------------------------------------------------- 
     144/ 
     145!----------------------------------------------------------------------- 
     146&namlobsed     !   parameters from aphotic layers to sediment 
     147!----------------------------------------------------------------------- 
     148/ 
     149!----------------------------------------------------------------------- 
     150&namlobrat     !   general coefficients 
     151!----------------------------------------------------------------------- 
     152/ 
     153!----------------------------------------------------------------------- 
     154&namlobopt     !   optical parameters 
     155!----------------------------------------------------------------------- 
     156/ 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.