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andmirek
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    r5426 r7923  
    11 
    22   <domain_definition> 
    3       <domain_group id="grid_T"> 
    4          <domain id="grid_T" long_name="grid T"/> 
    5     <!--   My zoom: example of hand defined zoom   --> 
    6          <domain id="myzoom" zoom_ibegin="10" zoom_jbegin="10" zoom_ni="5" zoom_nj="5" /> 
    7          <domain id="1point" zoom_ibegin="10" zoom_jbegin="10" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
     3     <domain_group id="grid_T"> 
     4       <domain id="grid_T" long_name="grid T"/> 
     5       <!--   My zoom: example of hand defined zoom   --> 
     6       <domain id="myzoom" domain_ref="grid_T" > 
     7    <zoom_domain id="myzoom"  ibegin="10" jbegin="10" ni="5" nj="5" /> 
     8       </domain> 
     9       <domain id="1point" domain_ref="grid_T" > 
     10    <zoom_domain id="1point" ibegin="10" jbegin="10" ni="1" nj="1" /> 
     11       </domain> 
    812         <!--   Eq section   --> 
    9          <domain id="EqT" zoom_ibegin="1" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="0000" zoom_nj="1" /> 
     13         <domain id="EqT" domain_ref="grid_T" > 
     14      <zoom_domain id="EqT" ibegin="1" jbegin="0000" ni="0000" nj="1" /> 
     15    </domain> 
    1016         <!--   TAO   --> 
    1117         <!--   137e   --> 
    12          <domain id="2n137eT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    13          <domain id="5n137eT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    14          <domain id="8n137eT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    15          <!--   147e  --> 
    16          <domain id="0n147eT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    17          <domain id="2n147eT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    18          <domain id="5n147eT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    19          <!--   156e  --> 
    20          <domain id="5s156eT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    21          <domain id="2s156eT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    22          <domain id="0n156eT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    23          <domain id="2n156eT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    24          <domain id="5n156eT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    25          <domain id="8n156eT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    26          <!--   165e  --> 
    27          <domain id="8s165eT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    28          <domain id="5s165eT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    29          <domain id="2s165eT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    30          <domain id="0n165eT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    31          <domain id="2n165eT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    32          <domain id="5n165eT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    33          <domain id="8n165eT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    34          <!--   180w  --> 
    35          <domain id="8s180wT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    36          <domain id="5s180wT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    37          <domain id="2s180wT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    38          <domain id="0n180wT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    39          <domain id="2n180wT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    40          <domain id="5n180wT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    41          <domain id="8n180wT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    42          <!--   170w  --> 
    43          <domain id="8s170wT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    44          <domain id="5s170wT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    45          <domain id="2s170wT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    46          <domain id="0n170wT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    47          <domain id="2n170wT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    48          <domain id="5n170wT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    49          <domain id="8n170wT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    50          <!--   155w  --> 
    51          <domain id="8s155wT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    52          <domain id="5s155wT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    53          <domain id="2s155wT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    54          <domain id="0n155wT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    55          <domain id="2n155wT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    56          <domain id="5n155wT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    57          <domain id="8n155wT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    58          <!--   140w  --> 
    59          <domain id="8s140wT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    60          <domain id="5s140wT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    61          <domain id="2s140wT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    62          <domain id="0n140wT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    63          <domain id="2n140wT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    64          <domain id="5n140wT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    65          <domain id="8n140wT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    66          <!--   125w  --> 
    67          <domain id="8s125wT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    68          <domain id="5s125wT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    69          <domain id="2s125wT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    70          <domain id="0n125wT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    71          <domain id="2n125wT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    72          <domain id="5n125wT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    73          <domain id="8n125wT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    74          <!--   110w  --> 
    75          <domain id="8s110wT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    76          <domain id="5s110wT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    77          <domain id="2s110wT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    78          <domain id="0n110wT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    79          <domain id="2n110wT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    80          <domain id="5n110wT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    81          <domain id="8n110wT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    82          <!--   95w  --> 
    83          <domain id="8s95wT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    84          <domain id="5s95wT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    85          <domain id="2s95wT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    86          <domain id="0n95wT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    87          <domain id="2n95wT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    88          <domain id="5n95wT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    89          <domain id="8n95wT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    90          <!--   RAMA  --> 
    91          <!--   55e  --> 
    92          <domain id="16s55eT"    zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    93          <domain id="12s55eT"    zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    94          <domain id="8s55eT"     zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    95          <domain id="4s55eT"     zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    96          <domain id="1.5s55eT"   zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    97          <domain id="0n55eT"     zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    98          <domain id="1.5n55eT"   zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    99          <domain id="4n55eT"     zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    100             <!--   65e  --> 
    101          <domain id="15n65eT"    zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    102             <!--   67e  --> 
    103          <domain id="16s67eT"    zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    104          <domain id="12s67eT"    zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    105          <domain id="8s67eT"     zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    106          <domain id="4s67eT"     zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    107          <domain id="1.5s67eT"   zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    108          <domain id="0n67eT"     zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    109          <domain id="1.5n67eT"   zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    110          <domain id="4n67eT"     zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    111          <domain id="8n67eT"     zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    112          <!--   80.5e  --> 
    113          <domain id="16s80.5eT"  zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    114          <domain id="12s80.5eT"  zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    115          <domain id="8s80.5eT"   zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    116          <domain id="4s80.5eT"   zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    117          <domain id="1.5s80.5eT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    118          <domain id="0n80.5eT"   zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    119          <domain id="1.5n80.5eT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    120          <domain id="4n80.5eT"   zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    121          <!--   90e  --> 
    122          <domain id="1.5s90eT"   zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    123          <domain id="0n90eT"     zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    124          <domain id="1.5n90eT"   zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    125          <domain id="4n90eT"     zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    126          <domain id="8n90eT"     zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    127          <domain id="12n90eT"    zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    128          <domain id="15n90eT"    zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    129          <!--   95e  --> 
    130          <domain id="16s95eT"    zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    131          <domain id="12s95eT"    zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    132          <domain id="8s95eT"     zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    133          <domain id="5s95eT"     zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    134          <!--   PIRATA  --> 
    135          <!--   38w-30w  --> 
    136          <domain id="19s34wT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    137          <domain id="14s32wT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    138          <domain id="8s30wT"  zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    139          <domain id="0n35wT"  zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    140          <domain id="4n38wT"  zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    141          <domain id="8n38wT"  zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    142          <domain id="12n38wT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
    143          <domain id="15n38wT" zoom_ibegin="0000" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="1" zoom_nj="1" /> 
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    168          <domain id="EqW" zoom_ibegin="1" zoom_jbegin="0000" zoom_ni="0000" zoom_nj="1" /> 
     176         <domain id="EqW" domain_ref="grid_W" > 
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     178    </domain>    
    169179      </domain_group> 
    170180 
    171       <domain_group id="scalarpoint">  
    172          <domain id="scalarpoint" long_name="scalar"/>  
     181      <domain_group id="scalarpoint"> 
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    30          <field id="soce"         long_name="salinity"            standard_name="sea_water_practical_salinity"      unit="1e-3"     grid_ref="grid_T_3D"/> 
    31          <field id="soce_e3t"     long_name="salinity * e3t"                                                        unit="1e-3*m"   grid_ref="grid_T_3D" > soce * e3t </field > 
     31         <field id="soce"         long_name="Sea Water Salinity"            standard_name="sea_water_salinity"      unit="0.001"     grid_ref="grid_T_3D"/> 
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    3233         <field id="soce2_e3t"    long_name="salinity squared * e3t"                                                unit="1e-3*1e-3*m"   grid_ref="grid_T_3D" > soce * soce * e3t </field > 
    33  
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     34         <field id="toce_e3t_vsum" field_ref="toce_e3t" grid_ref="vert_sum" /> 
     35         <field id="e3t_vsum" field_ref="e3t" grid_ref="vert_sum" /> 
     36         <field id="toce_vmean" field_ref="toce_e3t_vsum" grid_ref="vert_sum"> toce_e3t_vsum/e3t_vsum </field> 
     37         <field id="toce_e3t_300" field_ref="toce_e3t"  unit="degree_C*m"   grid_ref="zoom_300" /> 
     38         <field id="e3t_300" field_ref="e3t"  unit="degree_C*m"   grid_ref="zoom_300" /> 
     39         <field id="toce_e3t_vsum300" field_ref="toce_e3t_300" grid_ref="zoom_300_sum" /> 
     40         <field id="e3t_vsum300" field_ref="e3t_300" grid_ref="zoom_300_sum" /> 
     41         <field id="toce_vmean300" field_ref="toce_e3t_vsum300" grid_ref="zoom_300_sum"> toce_e3t_vsum300/e3t_vsum300 </field> 
     42 
     43         <field id="sst"          long_name="Sea Surface Temperature"             standard_name="sea_surface_temperature"             unit="degree_C"     /> 
     44         <field id="sst2"         long_name="Square of Sea Surface Temperature"   standard_name="square_of_sea_surface_temperature"   unit="degree_C2"     > sst * sst </field > 
    3645         <field id="sstmax"       long_name="max of sea surface temperature"   field_ref="sst"   operation="maximum"                                  /> 
    3746         <field id="sstmin"       long_name="min of sea surface temperature"   field_ref="sst"   operation="minimum"                                  /> 
    38          <field id="sstgrad"      long_name="module of sst gradient"                                                                  unit="degC/m"   /> 
    39          <field id="sstgrad2"     long_name="square of module of sst gradient"                                                        unit="degC2/m2" /> 
    40          <field id="sbt"          long_name="sea bottom temperature"                                                                  unit="degC"     /> 
     47         <field id="sstgrad"      long_name="module of sst gradient"                                                                  unit="degree_C/m"   /> 
     48         <field id="sstgrad2"     long_name="square of module of sst gradient"                                                        unit="degree_C2/m2" /> 
     49         <field id="sbt"          long_name="sea bottom temperature"                                                                  unit="degree_C"     /> 
     50         <field id="tosmint"      long_name="vertical integral of temperature times density"   standard_name="integral_wrt_depth_of_product_of_density_and_potential_temperature"  unit="(kg m2) degree_C" /> 
    4151     
    42          <field id="sss"          long_name="sea surface salinity"             standard_name="sea_surface_salinity"   unit="1e-3" /> 
     52         <field id="sss"          long_name="Sea Surface Salinity"             standard_name="sea_surface_salinity"   unit="0.001" /> 
    4353         <field id="sss2"         long_name="square of sea surface salinity"                                          unit="1e-6"  > sss * sss </field > 
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     56         <field id="sbs"          long_name="sea bottom salinity"                                                     unit="0.001" /> 
     57         <field id="somint"       long_name="vertical integral of salinity times density"   standard_name="integral_wrt_depth_of_product_of_density_and_salinity"  unit="(kg m2) x (1e-3)" />  
    4758 
    4859         <field id="taubot"       long_name="bottom stress module"                                                    unit="N/m2" />  
     
    6778         <field id="mldhtc_5"     long_name="Mixed Layer Depth integrated heat content"          standard_name="integral_of_sea_water_potential_temperature_wrt_depth_expressed_as_heat_content"   unit="J/m2"       /> 
    6879         <field id="heatc"        long_name="Heat content vertically integrated"                 standard_name="integral_of_sea_water_potential_temperature_wrt_depth_expressed_as_heat_content"   unit="J/m2"       /> 
    69          <field id="saltc"        long_name="Salt content vertically integrated"                                                                                                                   unit="1e-3*kg/m2" /> 
     80         <field id="saltc"        long_name="Salt content vertically integrated"                                                                                                                   unit="0.001*kg/m2" /> 
    7081 
    7182         <!-- EOS --> 
    72          <field id="alpha"        long_name="thermal expansion"                                                         unit="degC-1" grid_ref="grid_T_3D" /> 
     83         <field id="alpha"        long_name="thermal expansion"                                                         unit="degree_C-1" grid_ref="grid_T_3D" /> 
    7384         <field id="beta"         long_name="haline contraction"                                                        unit="1e3"    grid_ref="grid_T_3D" /> 
    7485         <field id="rhop"         long_name="potential density (sigma0)"        standard_name="sea_water_sigma_theta"   unit="kg/m3"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
     
    90101         <field id="pycndep"      long_name="Pycnocline Depth (dsigma[dT=-0.2] wrt 10m)"     standard_name="ocean_mixed_layer_thickness_defined_by_sigma_theta"                                unit="m"                         /> 
    91102         <field id="BLT"          long_name="Barrier Layer Thickness"                                                                                                                          unit="m"                          > topthdep - pycndep </field> 
    92          <field id="tinv"         long_name="Max of vertical invertion of temperature"                                                                                                         unit="degC"                      /> 
     103         <field id="tinv"         long_name="Max of vertical invertion of temperature"                                                                                                         unit="degree_C"                      /> 
    93104         <field id="depti"        long_name="Depth of max. vert. inv. of temperature"                                                                                                          unit="m"                         /> 
    94          <field id="20d"          long_name="Depth of 20C isotherm"                          standard_name="depth_of_isosurface_of_sea_water_potential_temperature"                            unit="m"      axis_ref="iax_20C" /> 
    95          <field id="28d"          long_name="Depth of 28C isotherm"                          standard_name="depth_of_isosurface_of_sea_water_potential_temperature"                            unit="m"      axis_ref="iax_28C" /> 
     105         <field id="20d"          long_name="Depth of 20C isotherm"                          standard_name="depth_of_isosurface_of_sea_water_potential_temperature"                            unit="m"      /> 
     106         <field id="28d"          long_name="Depth of 28C isotherm"                          standard_name="depth_of_isosurface_of_sea_water_potential_temperature"                            unit="m"      /> 
    96107         <field id="hc300"        long_name="Heat content 0-300m"                            standard_name="integral_of_sea_water_potential_temperature_wrt_depth_expressed_as_heat_content"   unit="J/m2"                      /> 
    97108 
    98109         <!-- variables available with key_diaar5 --> 
    99          <field id="botpres"      long_name="Pressure at sea floor"   standard_name="sea_water_pressure_at_sea_floor"   unit="dbar" /> 
     110         <field id="botpres"      long_name="Sea Water Pressure at Sea Floor"   standard_name="sea_water_pressure_at_sea_floor"   unit="dbar" /> 
     111         <field id="sshdyn"       long_name="dynamic sea surface height"     standard_name="dynamic_sea_surface_height_above_geoid"     unit="m" /> 
     112         <field id="sshdyn2"      long_name="square of dynamic sea surface height"     standard_name="dynamic_sea_surface_height_above_geoid_squared"     unit="m2" > sshdyn * sshdyn </field> 
    100113 
    101114         <!-- variables available with key_vvl --> 
     
    189202         <field id="emp_oce"      long_name="Evap minus Precip over ocean"         standard_name="evap_minus_precip_over_sea_water"                                     unit="kg/m2/s"   /> 
    190203         <field id="emp_ice"      long_name="Evap minus Precip over ice"           standard_name="evap_minus_precip_over_sea_ice"                                       unit="kg/m2/s"   /> 
    191          <field id="saltflx"      long_name="Downward salt flux"                                                                                                        unit="1e-3/m2/s" /> 
     204         <field id="saltflx"      long_name="Downward salt flux"                                                                                                        unit="0.001/m2/s" /> 
    192205         <field id="fmmflx"       long_name="Water flux due to freezing/melting"                                                                                        unit="kg/m2/s"   /> 
    193206         <field id="snowpre"      long_name="Snow precipitation"                   standard_name="snowfall_flux"                                                        unit="kg/m2/s"   /> 
    194          <field id="runoffs"      long_name="River Runoffs"                        standard_name="water_flux_into_sea_water_from_rivers"                                unit="kg/m2/s"   /> 
     207         <field id="runoffs"      long_name="Water Flux into Sea Water From Rivers" standard_name="water_flux_into_sea_water_from_rivers"                                unit="kg/m2/s"   /> 
    195208         <field id="precip"       long_name="Total precipitation"                  standard_name="precipitation_flux"                                                   unit="kg/m2/s"   /> 
    196209  
     
    210223         <field id="berg_calve"   long_name="Iceberg calving"                               unit="kg/m2/s"  /> 
    211224         <field id="fwfisf"       long_name="Ice shelf melting"                             unit="kg/m2/s"  /> 
    212          <field id="qisf"         long_name="Ice Shelf Heat Flux"                           unit="W/m2"     /> 
     225         <field id="fwfisf3d"     long_name="Ice shelf melting"                             unit="kg/m2/s"  grid_ref="grid_T_3D" /> 
     226         <field id="qlatisf"      long_name="Ice shelf latent heat flux"                    unit="W/m2"     /> 
     227         <field id="qlatisf3d"    long_name="Ice shelf latent heat flux"                    unit="W/m2"     grid_ref="grid_T_3D" /> 
     228         <field id="qhcisf"       long_name="Ice shelf heat content flux"                   unit="W/m2"     /> 
     229         <field id="qhcisf3d"     long_name="Ice shelf heat content flux"                   unit="W/m2"     grid_ref="grid_T_3D" /> 
    213230         <field id="isfgammat"    long_name="transfert coefficient for isf (temperature)"   unit="m/s"      /> 
    214231         <field id="isfgammas"    long_name="transfert coefficient for isf (salinity)"      unit="m/s"      /> 
    215          <field id="stbl"         long_name="salinity in the Losh tbl"                      unit="1e-3"     /> 
    216          <field id="ttbl"         long_name="temperature in the Losh tbl"                   unit="degC"     /> 
     232         <field id="stbl"         long_name="salinity in the Losh tbl"                      unit="0.001"     /> 
     233         <field id="ttbl"         long_name="temperature in the Losh tbl"                   unit="degree_C"     /> 
    217234 
    218235         <!-- *_oce variables available with ln_blk_clio or ln_blk_core --> 
     
    232249         <!-- available if key_oasis3 + conservative method --> 
    233250         <field id="rain"          long_name="Liquid precipitation"                                     standard_name="rainfall_flux"                                                                 unit="kg/m2/s"  /> 
     251         <field id="rain_ao_cea"   long_name="Liquid precipitation over ice-free ocean (cell average)"  standard_name="rainfall_flux"                                                                 unit="kg/m2/s"  /> 
    234252         <field id="evap_ao_cea"   long_name="Evaporation over ice-free ocean (cell average)"           standard_name="water_evaporation_flux"                                                        unit="kg/m2/s"  /> 
    235253         <field id="isnwmlt_cea"   long_name="Snow over Ice melting (cell average)"                     standard_name="surface_snow_melt_flux"                                                        unit="kg/m2/s"  /> 
     
    237255         <field id="fsal_real_cea" long_name="Real salt flux due to ice formation (cell average)"       standard_name="downward_sea_ice_basal_salt_flux"                                              unit="kg/m2/s"  /> 
    238256         <field id="hflx_rain_cea" long_name="heat flux due to rainfall"                                standard_name="temperature_flux_due_to_rainfall_expressed_as_heat_flux_into_sea_water"        unit="W/m2"     /> 
     257         <field id="hflx_prec_cea" long_name="heat flux due to precipitation"                           standard_name="temperature_flux_due_to_precipitation_expressed_as_heat_flux_into_sea_water"        unit="W/m2"     /> 
    239258         <field id="hflx_evap_cea" long_name="heat flux due to evaporation"                             standard_name="temperature_flux_due_to_evaporation_expressed_as_heat_flux_out_of_sea_water"   unit="W/m2"     /> 
    240259         <field id="hflx_snow_cea" long_name="heat flux due to snow falling over ice-free ocean"        standard_name="heat_flux_into_sea_water_due_to_snow_thermodynamics"                           unit="W/m2"     /> 
     
    264283          
    265284         <field id="ice_pres"     long_name="Ice presence"                                                                                                                    unit=""             /> 
    266          <field id="ist_cea"      long_name="Ice surface temperature (cell average)"                       standard_name="surface_temperature"                                unit="degC"         /> 
    267          <field id="ist_ipa"      long_name="Ice surface temperature (ice presence average)"               standard_name="surface_temperature"                                unit="degC"         />       
     285         <field id="ist_cea"      long_name="Ice surface temperature (cell average)"                       standard_name="surface_temperature"                                unit="degree_C"         /> 
     286         <field id="ist_ipa"      long_name="Ice surface temperature (ice presence average)"               standard_name="surface_temperature"                                unit="degree_C"         />       
    268287         <field id="uice_ipa"     long_name="Ice velocity along i-axis at I-point (ice presence average)"  standard_name="sea_ice_x_velocity"                                 unit="m/s"          />       
    269288         <field id="vice_ipa"     long_name="Ice velocity along j-axis at I-point (ice presence average)"  standard_name="sea_ice_y_velocity"                                 unit="m/s"          />       
     
    274293         <field id="u_imasstr"    long_name="Sea-ice mass transport along i-axis"                          standard_name="sea_ice_x_transport"                                unit="kg/s"         /> 
    275294         <field id="v_imasstr"    long_name="Sea-ice mass transport along j-axis"                          standard_name="sea_ice_y_transport"                                unit="kg/s"         /> 
    276          <field id="emp_x_sst"    long_name="Concentration/Dilution term on SST"                                                                                              unit="kg*degC/m2/s" /> 
    277          <field id="emp_x_sss"    long_name="Concentration/Dilution term on SSS"                                                                                              unit="kg*1e-3/m2/s" />         
     295         <field id="emp_x_sst"    long_name="Concentration/Dilution term on SST"                                                                                              unit="kg*degree_C/m2/s" /> 
     296         <field id="emp_x_sss"    long_name="Concentration/Dilution term on SSS"                                                                                              unit="kg*0.001/m2/s" />         
    278297        
    279298         <field id="iceconc"      long_name="ice concentration"                                            standard_name="sea_ice_area_fraction"                              unit="%"            /> 
    280           <field id="isst"         long_name="sea surface temperature"                                      standard_name="sea_surface_temperature"                            unit="degC"         /> 
    281          <field id="isss"         long_name="sea surface salinity"                                         standard_name="sea_surface_salinity"                               unit="1e-3"         />  
     299          <field id="isst"         long_name="sea surface temperature"                                      standard_name="sea_surface_temperature"                            unit="degree_C"         /> 
     300         <field id="isss"         long_name="sea surface salinity"                                         standard_name="sea_surface_salinity"                               unit="0.001"         />  
    282301         <field id="qt_oce"       long_name="total flux at ocean surface"                                  standard_name="surface_downward_heat_flux_in_sea_water"            unit="W/m2"         /> 
    283302         <field id="qsr_oce"      long_name="solar heat flux at ocean surface"                             standard_name="net_downward_shortwave_flux_at_sea_water_surface"   unit="W/m2"         /> 
     
    288307         <field id="qtr_ice"      long_name="solar heat flux transmitted through ice: sum over categories"                                                                    unit="W/m2"         /> 
    289308         <field id="qemp_ice"     long_name="Downward Heat Flux from E-P over ice"                                                                                            unit="W/m2"         /> 
    290          <field id="micesalt"     long_name="Mean ice salinity"                                                                                                               unit="1e-3"         /> 
     309         <field id="micesalt"     long_name="Mean ice salinity"                                                                                                               unit="0.001"         /> 
    291310         <field id="miceage"      long_name="Mean ice age"                                                                                                                    unit="years"        /> 
    292311         <field id="alb_ice"      long_name="Mean albedo over sea ice"                                                                                                        unit=""             /> 
     
    299318         <field id="salinity_cat" long_name="Sea-Ice Bulk salinity for categories"                         unit="g/kg"   axis_ref="ncatice" /> 
    300319         <field id="brinevol_cat" long_name="Brine volume for categories"                                  unit="%"      axis_ref="ncatice" /> 
    301          <field id="icetemp_cat"  long_name="Ice temperature for categories"                               unit="degC"   axis_ref="ncatice" /> 
    302          <field id="snwtemp_cat"  long_name="Snow temperature for categories"                              unit="degC"   axis_ref="ncatice" /> 
    303  
    304          <field id="micet"        long_name="Mean ice temperature"                                         unit="degC"     /> 
     320         <field id="icetemp_cat"  long_name="Ice temperature for categories"                               unit="degree_C"   axis_ref="ncatice" /> 
     321         <field id="snwtemp_cat"  long_name="Snow temperature for categories"                              unit="degree_C"   axis_ref="ncatice" /> 
     322 
     323         <field id="micet"        long_name="Mean ice temperature"                                         unit="degree_C"     /> 
    305324         <field id="icehc"        long_name="ice total heat content"                                       unit="10^9J"    />  
    306325         <field id="isnowhc"      long_name="snow total heat content"                                      unit="10^9J"    /> 
    307          <field id="icest"        long_name="ice surface temperature"                                      unit="degC"     /> 
     326         <field id="icest"        long_name="ice surface temperature"                                      unit="degree_C"     /> 
    308327         <field id="ibrinv"       long_name="brine volume"                                                 unit="%"        /> 
    309328         <field id="icecolf"      long_name="frazil ice collection thickness"                              unit="m"        /> 
     
    317336         <field id="icetrp"       long_name="ice volume transport"                                         unit="m/day"          /> 
    318337         <field id="snwtrp"       long_name="snw volume transport"                                         unit="m/day"          /> 
    319          <field id="saltrp"       long_name="salt content transport"                                       unit="1e-3*kg/m2/day" /> 
     338         <field id="saltrp"       long_name="salt content transport"                                       unit="0.001*kg/m2/day" /> 
    320339         <field id="deitrp"       long_name="advected ice enthalpy"                                        unit="W/m2"           /> 
    321340         <field id="destrp"       long_name="advected snw enthalpy"                                        unit="W/m2"           /> 
    322341 
    323          <field id="sfxbri"       long_name="brine salt flux"                                              unit="1e-3*kg/m2/day" /> 
    324          <field id="sfxdyn"       long_name="salt flux from ridging rafting"                               unit="1e-3*kg/m2/day" /> 
    325          <field id="sfxres"       long_name="salt flux from lipupdate (resultant)"                         unit="1e-3*kg/m2/day" /> 
    326          <field id="sfxbog"       long_name="salt flux from bot growth"                                    unit="1e-3*kg/m2/day" /> 
    327          <field id="sfxbom"       long_name="salt flux from bot melt"                                      unit="1e-3*kg/m2/day" /> 
    328          <field id="sfxsum"       long_name="salt flux from surf melt"                                     unit="1e-3*kg/m2/day" /> 
    329          <field id="sfxsni"       long_name="salt flux from snow-ice formation"                            unit="1e-3*kg/m2/day" /> 
    330          <field id="sfxopw"       long_name="salt flux from open water ice formation"                      unit="1e-3*kg/m2/day" /> 
    331          <field id="sfxsub"       long_name="salt flux from sublimation"                                   unit="1e-3*kg/m2/day" /> 
    332          <field id="sfx"          long_name="salt flux total"                                              unit="1e-3*kg/m2/day" /> 
     342         <field id="sfxbri"       long_name="brine salt flux"                                              unit="0.001*kg/m2/day" /> 
     343         <field id="sfxdyn"       long_name="salt flux from ridging rafting"                               unit="0.001*kg/m2/day" /> 
     344         <field id="sfxres"       long_name="salt flux from lipupdate (resultant)"                         unit="0.001*kg/m2/day" /> 
     345         <field id="sfxbog"       long_name="salt flux from bot growth"                                    unit="0.001*kg/m2/day" /> 
     346         <field id="sfxbom"       long_name="salt flux from bot melt"                                      unit="0.001*kg/m2/day" /> 
     347         <field id="sfxsum"       long_name="salt flux from surf melt"                                     unit="0.001*kg/m2/day" /> 
     348         <field id="sfxsni"       long_name="salt flux from snow-ice formation"                            unit="0.001*kg/m2/day" /> 
     349         <field id="sfxopw"       long_name="salt flux from open water ice formation"                      unit="0.001*kg/m2/day" /> 
     350         <field id="sfxsub"       long_name="salt flux from sublimation"                                   unit="0.001*kg/m2/day" /> 
     351         <field id="sfx"          long_name="salt flux total"                                              unit="0.001*kg/m2/day" /> 
    333352 
    334353         <field id="vfxbog"       long_name="daily bottom thermo ice prod."                                unit="m/day"   /> 
     
    371390         <field id="hfxtur"       long_name="turbulent heat flux at the ice base"                          unit="W/m2" /> 
    372391    <!-- sbcssm variables --> 
    373          <field id="sst_m"    unit="degC" /> 
     392         <field id="sst_m"    unit="degree_C" /> 
    374393         <field id="sss_m"    unit="psu"  /> 
    375394         <field id="ssu_m"    unit="m/s"  /> 
     
    386405         <field id="e3u"          long_name="U-cell thickness"                                       standard_name="cell_thickness"              unit="m"          grid_ref="grid_U_3D" /> 
    387406         <field id="e3u_0"        long_name="Initial U-cell thickness"                               standard_name="ref_cell_thickness"          unit="m"          grid_ref="grid_U_3D"/> 
    388          <field id="utau"         long_name="Wind Stress along i-axis"                               standard_name="surface_downward_x_stress"   unit="N/m2"                            /> 
    389          <field id="uoce"         long_name="ocean current along i-axis"                             standard_name="sea_water_x_velocity"        unit="m/s"        grid_ref="grid_U_3D" /> 
     407         <field id="utau"         long_name="Surface Downward X Stress"                               standard_name="surface_downward_x_stress"   unit="N/m2"                            /> 
     408         <field id="uoce"         long_name="Sea Water X Velocity"                             standard_name="sea_water_x_velocity"        unit="m/s"        grid_ref="grid_U_3D" /> 
    390409         <field id="uoce_e3u"     long_name="ocean current along i-axis * e3u"                                                                   unit="m2/s"       grid_ref="grid_U_3D"  > uoce * e3u </field> 
    391410         <field id="uoce2_e3u"    long_name="ocean current along i-axis squared * e3u"                                                           unit="m3/s2"      grid_ref="grid_U_3D"  > uoce * uoce * e3u </field> 
     
    394413         <field id="ubar"         long_name="ocean barotropic current along i-axis"                                                              unit="m/s"                             /> 
    395414         <field id="uocetr_eff"   long_name="Effective ocean transport along i-axis"                 standard_name="ocean_volume_x_transport"    unit="m3/s"       grid_ref="grid_U_3D" /> 
    396          <field id="uocet"        long_name="ocean transport along i-axis times temperature (CRS)"                                               unit="degC*m/s"   grid_ref="grid_U_3D" /> 
    397          <field id="uoces"        long_name="ocean transport along i-axis times salinity (CRS)"                                                  unit="1e-3*m/s"   grid_ref="grid_U_3D" /> 
     415         <field id="uocet"        long_name="ocean transport along i-axis times temperature (CRS)"                                               unit="degree_C*m/s"   grid_ref="grid_U_3D" /> 
     416         <field id="uoces"        long_name="ocean transport along i-axis times salinity (CRS)"                                                  unit="0.001*m/s"   grid_ref="grid_U_3D" /> 
    398417 
    399418         <!-- variables available with MLE --> 
     
    401420 
    402421         <!-- uoce_eiv: available with key_traldf_eiv and key_diaeiv --> 
    403          <field id="uoce_eiv"     long_name="EIV ocean current along i-axis"   standard_name="bolus_sea_water_x_velocity"   unit="m/s"   grid_ref="grid_U_3D" /> 
     422         <field id="uoce_eiv"      long_name="EIV ocean current along i-axis"   standard_name="bolus_sea_water_x_velocity"   unit="m/s"   grid_ref="grid_U_3D" /> 
     423         <field id="ueiv_masstr"   long_name="EIV Ocean Mass X Transport"    standard_name="bolus_ocean_mass_x_transport"                          unit="kg/s"        grid_ref="grid_U_3D" /> 
     424         <field id="ueiv_heattr3d" long_name="ocean bolus heat transport along i-axis"    standard_name="ocean_heat_x_transport_due_to_bolus_advection"   unit="W"    grid_ref="grid_U_3D" /> 
     425         <field id="ueiv_salttr3d" long_name="ocean bolus salt transport along i-axis"    standard_name="ocean_salt_x_transport_due_to_bolus_advection"   unit="kg"   grid_ref="grid_U_3D" /> 
     426         <field id="ueiv_masstr"  long_name="EIV Ocean Mass X Transport"    standard_name="bolus_ocean_mass_x_transport"                          unit="kg/s"        grid_ref="grid_U_3D" /> 
    404427 
    405428         <!-- uoce_eiv: available with key_trabbl --> 
     
    411434 
    412435         <!-- variables available with key_diaar5 --> 
    413          <field id="u_masstr"     long_name="ocean eulerian mass transport along i-axis"    standard_name="ocean_mass_x_transport"                          unit="kg/s"        grid_ref="grid_U_3D" /> 
     436         <field id="u_masstr"     long_name="Ocean Mass X Transport"    standard_name="ocean_mass_x_transport"                          unit="kg/s"        grid_ref="grid_U_3D" /> 
     437         <field id="u_masstr_vint" long_name="vertical integral of ocean eulerian mass transport along i-axis"    standard_name="vertical_integral_of_ocean_mass_x_transport"  unit="kg/s" /> 
    414438         <field id="u_heattr"     long_name="ocean eulerian heat transport along i-axis"    standard_name="ocean_heat_x_transport"                          unit="W"                                /> 
    415          <field id="u_salttr"     long_name="ocean eulerian salt transport along i-axis"    standard_name="ocean_salt_x_transport"                          unit="1e-3*kg/s"                        /> 
     439         <field id="uadv_heattr"  long_name="ocean advective heat transport along i-axis"    standard_name="advectice_ocean_heat_x_transport"                          unit="W"                                /> 
     440         <field id="u_salttr"     long_name="ocean eulerian salt transport along i-axis"    standard_name="ocean_salt_x_transport"                          unit="0.001*kg/s"                        /> 
    416441         <field id="ueiv_heattr"  long_name="ocean bolus heat transport along i-axis"       standard_name="ocean_heat_x_transport_due_to_bolus_advection"   unit="W"                                /> 
     442         <field id="ueiv_salttr"  long_name="ocean bolus salt transport along i-axis"       standard_name="ocean_salt_x_transport_due_to_bolus_advection"   unit="W"                                /> 
    417443         <field id="udiff_heattr" long_name="ocean diffusion heat transport along i-axis"   standard_name="ocean_heat_x_transport_due_to_diffusion"         unit="W"                                /> 
    418444      </field_group> 
     
    423449         <field id="e3v"          long_name="V-cell thickness"                                       standard_name="cell_thickness"              unit="m"          grid_ref="grid_V_3D" /> 
    424450         <field id="e3v_0"        long_name="Initial V-cell thickness"                               standard_name="ref_cell_thickness"          unit="m"          grid_ref="grid_V_3D"/> 
    425          <field id="vtau"         long_name="Wind Stress along j-axis"                               standard_name="surface_downward_y_stress"   unit="N/m2"                            /> 
    426          <field id="voce"         long_name="ocean current along j-axis"                             standard_name="sea_water_y_velocity"        unit="m/s"        grid_ref="grid_V_3D" /> 
     451         <field id="vtau"         long_name="Surface Downward Y Stress"                               standard_name="surface_downward_y_stress"   unit="N/m2"                            /> 
     452         <field id="voce"         long_name="Sea Water Y Velocity"                             standard_name="sea_water_y_velocity"        unit="m/s"        grid_ref="grid_V_3D" /> 
    427453         <field id="voce_e3v"     long_name="ocean current along j-axis * e3v"                                                                   unit="m2/s"       grid_ref="grid_V_3D"  > voce * e3v </field> 
    428454         <field id="voce2_e3v"    long_name="ocean current along j-axis squared * e3v"                                                           unit="m3/s2"      grid_ref="grid_V_3D"  > voce * voce * e3v </field> 
     
    431457         <field id="vbar"         long_name="ocean barotropic current along j-axis"                                                              unit="m/s"                             /> 
    432458         <field id="vocetr_eff"   long_name="Effective ocean transport along j-axis"                 standard_name="ocean_volume_y_transport"    unit="m3/s"       grid_ref="grid_V_3D" /> 
    433          <field id="vocet"        long_name="ocean transport along j-axis times temperature (CRS)"                                               unit="degC*m/s"   grid_ref="grid_V_3D" /> 
    434          <field id="voces"        long_name="ocean transport along j-axis times salinity (CRS)"                                                  unit="1e-3*m/s"   grid_ref="grid_V_3D" /> 
     459         <field id="vocet"        long_name="ocean transport along j-axis times temperature (CRS)"                                               unit="degree_C*m/s"   grid_ref="grid_V_3D" /> 
     460         <field id="voces"        long_name="ocean transport along j-axis times salinity (CRS)"                                                  unit="0.001*m/s"   grid_ref="grid_V_3D" /> 
    435461 
    436462         <!-- variables available with MLE --> 
     
    439465         <!-- voce_eiv: available with key_traldf_eiv and key_diaeiv --> 
    440466         <field id="voce_eiv"     long_name="EIV ocean current along j-axis"   standard_name="bolus_sea_water_y_velocity"   unit="m/s"   grid_ref="grid_V_3D" /> 
     467         <field id="veiv_masstr"   long_name="EIV Ocean Mass Y Transport"    standard_name="bolus_ocean_mass_y_transport"                          unit="kg/s"        grid_ref="grid_V_3D" /> 
     468         <field id="veiv_heattr3d" long_name="ocean bolus heat transport along j-axis"    standard_name="ocean_heat_y_transport_due_to_bolus_advection"   unit="W"    grid_ref="grid_V_3D" /> 
     469         <field id="veiv_salttr3d" long_name="ocean bolus salt transport along j-axis"    standard_name="ocean_salt_y_transport_due_to_bolus_advection"   unit="kg"   grid_ref="grid_U_3D" /> 
    441470 
    442471         <!-- voce_eiv: available with key_trabbl --> 
     
    448477 
    449478         <!-- variables available with key_diaar5 --> 
    450          <field id="v_masstr"     long_name="ocean eulerian mass transport along j-axis"    standard_name="ocean_mass_y_transport"                          unit="kg/s"        grid_ref="grid_V_3D" /> 
    451          <field id="v_heattr"     long_name="ocean eulerian heat transport along j-axis"    standard_name="ocean_heat_y_transport"                          unit="W"                                /> 
    452          <field id="v_salttr"     long_name="ocean eulerian salt transport along i-axis"    standard_name="ocean_salt_y_transport"                          unit="1e-3*kg/s"                        /> 
     479         <field id="v_masstr"     long_name="Ocean Mass Y Transport"    standard_name="ocean_mass_y_transport"                          unit="kg/s"        grid_ref="grid_V_3D" /> 
     480         <field id="v_heattr"     long_name="Ocean Heat X Transport"    standard_name="ocean_heat_y_transport"                          unit="W"                                /> 
     481         <field id="vadv_heattr"  long_name="ocean advective heat transport along j-axis"    standard_name="advectice_ocean_heat_y_transport"                          unit="W"                                /> 
     482         <field id="v_salttr"     long_name="ocean eulerian salt transport along i-axis"    standard_name="ocean_salt_y_transport"                          unit="0.001*kg/s"                        /> 
    453483         <field id="veiv_heattr"  long_name="ocean bolus heat transport along j-axis"       standard_name="ocean_heat_y_transport_due_to_bolus_advection"   unit="W"                                /> 
     484         <field id="veiv_salttr"  long_name="ocean bolus salt transport along j-axis"       standard_name="ocean_salt_y_transport_due_to_bolus_advection"   unit="W"                                /> 
    454485         <field id="vdiff_heattr" long_name="ocean diffusion heat transport along j-axis"   standard_name="ocean_heat_y_transport_due_to_diffusion"         unit="W"                                /> 
    455486      </field_group> 
     
    464495        <!-- woce_eiv: available with key_traldf_eiv and key_diaeiv --> 
    465496        <field id="woce_eiv"     long_name="EIV ocean vertical velocity"   standard_name="bolus_upward_sea_water_velocity"   unit="m/s" /> 
     497        <field id="weiv_masstr"  long_name="EIV Upward Ocean Mass Transport"  standard_name="bolus_upward_ocean_mass_transport"             unit="kg/s"   /> 
     498        <field id="weiv_heattr3d" long_name="ocean bolus heat transport along k-axis"    standard_name="ocean_heat_z_transport_due_to_bolus_advection"   unit="W" /> 
     499        <field id="weiv_salttr3d" long_name="ocean bolus salt transport along k-axis"    standard_name="ocean_salt_z_transport_due_to_bolus_advection"   unit="kg"   grid_ref="grid_U_3D" /> 
    466500 
    467501        <field id="avt"          long_name="vertical eddy diffusivity"   standard_name="ocean_vertical_heat_diffusivity"       unit="m2/s" /> 
     
    483517        <field id="av_ratio"     long_name="S over T diffusivity ratio"            standard_name="salinity_over_temperature_diffusivity_ratio"                     unit="1"    /> 
    484518        <field id="av_wave"      long_name="wave-induced vertical diffusivity"     standard_name="ocean_vertical_tracer_diffusivity_due_to_internal_waves"         unit="m2/s" /> 
    485         <field id="bn2"          long_name="squared Brunt-Vaisala frequency"       standard_name="squared_brunt_vaisala_frequency"                                 unit="s-1"  /> 
    486519        <field id="bflx_tmx"     long_name="wave-induced buoyancy flux"            standard_name="buoyancy_flux_due_to_internal_waves"                             unit="W/kg" /> 
    487520        <field id="pcmap_tmx"    long_name="power consumed by wave-driven mixing"  standard_name="vertically_integrated_power_consumption_by_wave_driven_mixing"   unit="W/m2"      grid_ref="grid_W_2D" /> 
     
    489522 
    490523        <!-- variables available with key_diaar5 -->    
    491         <field id="w_masstr"     long_name="vertical mass transport"             standard_name="upward_ocean_mass_transport"             unit="kg/s"   /> 
     524        <field id="w_masstr"     long_name="Upward Ocean Mass Transport"             standard_name="upward_ocean_mass_transport"             unit="kg/s"   /> 
    492525        <field id="w_masstr2"    long_name="square of vertical mass transport"   standard_name="square_of_upward_ocean_mass_transport"   unit="kg2/s2" /> 
    493526 
     
    499532        <field id="tke"          long_name="Turbulent Kinetic Energy"                  unit="m2/s2"    /> 
    500533        <field id="tke_niw"      long_name="Turbulent Kinetic Energy due to near-inertial wave breaking"  unit="m2/s2" /> 
     534 
     535         <!-- Variable from eosbn2 --> 
     536         <field id="bn2"          long_name="Squared buoyancy frequency measuring ocean vertical stratification"        standard_name="square_of_brunt_vaisala_frequency_in_sea_water"   unit="1/s^2"  /> 
    501537      </field_group> 
    502538           
    503539      <!-- product fields --> 
    504540      <field_group id="diaprod"> 
    505    <field id="ut"           long_name="product_of_sea_water_x_velocity_and_potential_temperature"      unit="degC m/s"      grid_ref="grid_U_3D"   /> 
    506         <field id="ut_e3u"       long_name="product_of_sea_water_x_velocity_and_potential_temperature * e3u"  unit="degC m2/s"   grid_ref="grid_U_3D" > ut * e3u </field > 
     541   <field id="ut"           long_name="product_of_sea_water_x_velocity_and_potential_temperature"      unit="degree_C m/s"      grid_ref="grid_U_3D"   /> 
     542        <field id="ut_e3u"       long_name="product_of_sea_water_x_velocity_and_potential_temperature * e3u"  unit="degree_C m2/s"   grid_ref="grid_U_3D" > ut * e3u </field > 
    507543   <field id="us"           long_name="product_of_sea_water_x_velocity_and_salinity"                   unit="PSU m/s"       grid_ref="grid_U_3D"   /> 
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    575611 
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     615         <field id="ibgsfxres"    long_name="global mean salt flux (resultant)"                      unit="0.001*m/day" /> 
     616         <field id="ibgsfxbog"    long_name="global mean salt flux (thermo)"                         unit="0.001*m/day" /> 
     617         <field id="ibgsfxopw"    long_name="global mean salt flux (thermo)"                         unit="0.001*m/day" /> 
     618         <field id="ibgsfxsni"    long_name="global mean salt flux (thermo)"                         unit="0.001*m/day" /> 
     619         <field id="ibgsfxbom"    long_name="global mean salt flux (thermo)"                         unit="0.001*m/day" /> 
     620         <field id="ibgsfxsum"    long_name="global mean salt flux (thermo)"                         unit="0.001*m/day" /> 
     621         <field id="ibgsfxsub"    long_name="global mean salt flux (thermo)"                         unit="0.001*m/day" /> 
    586622 
    587623         <field id="ibghfxdhc"    long_name="Heat content variation in snow and ice"                 unit="W"          /> 
     
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     640         <field id="ibgfrcsfx"    long_name="global mean forcing salt   (sfx)"                       unit="0.001*km3"   /> 
    605641         <field id="ibgvolgrm"    long_name="global mean ice growth+melt volume"                     unit="km3"        /> 
    606642      </field_group> 
     
    612648        <field id="traj_lat"      long_name="floats latitude"                                                            unit="degrees_north" /> 
    613649        <field id="traj_dep"      long_name="floats depth"                                                               unit="m"             /> 
    614         <field id="traj_temp"     long_name="floats temperature"       standard_name="sea_water_potential_temperature"   unit="degC"          /> 
    615         <field id="traj_salt"     long_name="floats salinity"          standard_name="sea_water_practical_salinity"      unit="1e-3"          /> 
     650        <field id="traj_temp"     long_name="floats temperature"       standard_name="sea_water_potential_temperature"   unit="degree_C"          /> 
     651        <field id="traj_salt"     long_name="floats salinity"          standard_name="sea_water_practical_salinity"      unit="0.001"          /> 
    616652        <field id="traj_dens"     long_name="floats in-situ density"   standard_name="sea_water_density"                 unit="kg/m3"         /> 
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    639675 
    640676      <!-- Poleward transport : ptr -->      
    641       <field_group id="diaptr" domain_ref="ptr" >  
     677      <field_group id="diaptr">  
    642678        <field id="zomsfglo"          long_name="Meridional Stream-Function: Global"           unit="Sv"       grid_ref="gznl_W_3D" /> 
    643679        <field id="zomsfatl"          long_name="Meridional Stream-Function: Atlantic"         unit="Sv"       grid_ref="gznl_W_3D" /> 
     
    645681        <field id="zomsfind"          long_name="Meridional Stream-Function: Indian"           unit="Sv"       grid_ref="gznl_W_3D" /> 
    646682        <field id="zomsfipc"          long_name="Meridional Stream-Function: Pacific+Indian"   unit="Sv"       grid_ref="gznl_W_3D" /> 
    647         <field id="zotemglo"          long_name="Zonal Mean Temperature : Global"              unit="degC"     grid_ref="gznl_T_3D" /> 
    648         <field id="zotematl"          long_name="Zonal Mean Temperature : Atlantic"            unit="degC"     grid_ref="gznl_T_3D" /> 
    649         <field id="zotempac"          long_name="Zonal Mean Temperature : Pacific"             unit="degC"     grid_ref="gznl_T_3D" /> 
    650         <field id="zotemind"          long_name="Zonal Mean Temperature : Indian"              unit="degC"     grid_ref="gznl_T_3D" /> 
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     684        <field id="zotematl"          long_name="Zonal Mean Temperature : Atlantic"            unit="degree_C"     grid_ref="gznl_T_3D" /> 
     685        <field id="zotempac"          long_name="Zonal Mean Temperature : Pacific"             unit="degree_C"     grid_ref="gznl_T_3D" /> 
     686        <field id="zotemind"          long_name="Zonal Mean Temperature : Indian"              unit="degree_C"     grid_ref="gznl_T_3D" /> 
     687        <field id="zotemipc"          long_name="Zonal Mean Temperature : Pacific+Indian"      unit="degree_C"     grid_ref="gznl_T_3D" /> 
     688        <field id="zosalglo"          long_name="Zonal Mean Salinity : Global"                 unit="0.001"     grid_ref="gznl_T_3D" /> 
     689        <field id="zosalatl"          long_name="Zonal Mean Salinity : Atlantic"               unit="0.001"     grid_ref="gznl_T_3D" /> 
     690        <field id="zosalpac"          long_name="Zonal Mean Salinity : Pacific"                unit="0.001"     grid_ref="gznl_T_3D" /> 
     691        <field id="zosalind"          long_name="Zonal Mean Salinity : Indian"                 unit="0.001"     grid_ref="gznl_T_3D" /> 
     692        <field id="zosalipc"          long_name="Zonal Mean Salinity : Pacific+Indian"         unit="0.001"     grid_ref="gznl_T_3D" /> 
    657693        <field id="zosrfglo"          long_name="Zonal Mean Surface"                           unit="m2"       grid_ref="gznl_T_3D" /> 
    658694        <field id="zosrfatl"          long_name="Zonal Mean Surface : Atlantic"                unit="m2"       grid_ref="gznl_T_3D" /> 
     
    661697        <field id="zosrfipc"          long_name="Zonal Mean Surface : Pacific+Indian"          unit="m2"       grid_ref="gznl_T_3D" /> 
    662698        <field id="sophtadv"          long_name="Advective Heat Transport"                     unit="PW"       grid_ref="gznl_T_2D" /> 
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     700        <field id="sophtadv_pac"      long_name="Advective Heat Transport: Pacific"            unit="PW"       grid_ref="gznl_T_2D" /> 
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     702        <field id="sophtadv_ipc"      long_name="Advective Heat Transport: Pacific+Indian"     unit="PW"       grid_ref="gznl_T_2D" /> 
    663703        <field id="sophtldf"          long_name="Diffusive Heat Transport"                     unit="PW"       grid_ref="gznl_T_2D" /> 
     704        <field id="sophtldf_atl"      long_name="Diffusive Heat Transport: Atlantic"           unit="PW"       grid_ref="gznl_T_2D" /> 
     705        <field id="sophtldf_pac"      long_name="Diffusive Heat Transport: Pacific"            unit="PW"       grid_ref="gznl_T_2D" /> 
     706        <field id="sophtldf_ind"      long_name="Diffusive Heat Transport: Indian"             unit="PW"       grid_ref="gznl_T_2D" /> 
     707        <field id="sophtldf_ipc"      long_name="Diffusive Heat Transport: Pacific+Indian"     unit="PW"       grid_ref="gznl_T_2D" /> 
     708        <field id="sophtove"          long_name="Overturning Heat Transport"                     unit="PW"       grid_ref="gznl_T_2D" /> 
     709        <field id="sophtove_atl"      long_name="Overturning Heat Transport: Atlantic"           unit="PW"       grid_ref="gznl_T_2D" /> 
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     712        <field id="sophtove_ipc"      long_name="Overturning Heat Transport: Pacific+Indian"     unit="PW"       grid_ref="gznl_T_2D" /> 
     713        <field id="sophtbtr"          long_name="Barotropic Heat Transport"                     unit="PW"       grid_ref="gznl_T_2D" /> 
     714        <field id="sophtbtr_atl"      long_name="Barotropic Heat Transport: Atlantic"           unit="PW"       grid_ref="gznl_T_2D" /> 
     715        <field id="sophtbtr_pac"      long_name="Barotropic Heat Transport: Pacific"            unit="PW"       grid_ref="gznl_T_2D" /> 
     716        <field id="sophtbtr_ind"      long_name="Barotropic Heat Transport: Indian"             unit="PW"       grid_ref="gznl_T_2D" /> 
     717        <field id="sophtbtr_ipc"      long_name="Barotropic Heat Transport: Pacific+Indian"     unit="PW"       grid_ref="gznl_T_2D" /> 
     718        <field id="sophteiv"          long_name="Heat Transport from mesoscale eddy oveection"                     unit="PW"       grid_ref="gznl_T_2D" /> 
     719        <field id="sophteiv_atl"      long_name="Heat Transport from mesoscale eddy advection: Atlantic"           unit="PW"       grid_ref="gznl_T_2D" /> 
     720        <field id="sophteiv_pac"      long_name="Heat Transport from mesoscale eddy advection: Pacific"            unit="PW"       grid_ref="gznl_T_2D" /> 
     721        <field id="sophteiv_ind"      long_name="Heat Transport from mesoscale eddy advection: Indian"             unit="PW"       grid_ref="gznl_T_2D" /> 
     722        <field id="sophteiv_ipc"      long_name="Heat Transport from mesoscale eddy advection: Pacific+Indian"     unit="PW"       grid_ref="gznl_T_2D" /> 
    664723        <field id="sopstadv"          long_name="Advective Salt Transport"                     unit="Giga g/s" grid_ref="gznl_T_2D" /> 
     724        <field id="sopstadv_atl"      long_name="Advective Salt Transport: Atlantic"           unit="Giga g/s" grid_ref="gznl_T_2D" /> 
     725        <field id="sopstadv_pac"      long_name="Advective Salt Transport: Pacific"            unit="Giga g/s" grid_ref="gznl_T_2D" /> 
     726        <field id="sopstadv_ind"      long_name="Advective Salt Transport: Indian"             unit="Giga g/s" grid_ref="gznl_T_2D" /> 
     727        <field id="sopstadv_ipc"      long_name="Advective Salt Transport: Pacific+Indian"     unit="Giga g/s" grid_ref="gznl_T_2D" /> 
     728        <field id="sopstove"          long_name="Overturning Salt Transport"                     unit="Giga g/s" grid_ref="gznl_T_2D" /> 
     729        <field id="sopstove_atl"      long_name="Overturning Salt Transport: Atlantic"           unit="Giga g/s" grid_ref="gznl_T_2D" /> 
     730        <field id="sopstove_pac"      long_name="Overturning Salt Transport: Pacific"            unit="Giga g/s" grid_ref="gznl_T_2D" /> 
     731        <field id="sopstove_ind"      long_name="Overturning Salt Transport: Indian"             unit="Giga g/s" grid_ref="gznl_T_2D" /> 
     732        <field id="sopstove_ipc"      long_name="Overturning Salt Transport: Pacific+Indian"     unit="Giga g/s" grid_ref="gznl_T_2D" /> 
     733        <field id="sopstbtr"          long_name="Barotropic Salt Transport"                     unit="Giga g/s" grid_ref="gznl_T_2D" /> 
     734        <field id="sopstbtr_atl"      long_name="Barotropic Salt Transport: Atlantic"           unit="Giga g/s" grid_ref="gznl_T_2D" /> 
     735        <field id="sopstbtr_pac"      long_name="Barotropic Salt Transport: Pacific"            unit="Giga g/s" grid_ref="gznl_T_2D" /> 
     736        <field id="sopstbtr_ind"      long_name="Barotropic Salt Transport: Indian"             unit="Giga g/s" grid_ref="gznl_T_2D" /> 
     737        <field id="sopstbtr_ipc"      long_name="Barotropic Salt Transport: Pacific+Indian"     unit="Giga g/s" grid_ref="gznl_T_2D" /> 
    665738        <field id="sopstldf"          long_name="Diffusive Salt Transport"                     unit="Giga g/s" grid_ref="gznl_T_2D" /> 
     739        <field id="sopstldf_atl"      long_name="Diffusive Salt Transport: Atlantic"           unit="Giga g/s" grid_ref="gznl_T_2D" /> 
     740        <field id="sopstldf_pac"      long_name="Diffusive Salt Transport: Pacific"            unit="Giga g/s" grid_ref="gznl_T_2D" /> 
     741        <field id="sopstldf_ind"      long_name="Diffusive Salt Transport: Indian"             unit="Giga g/s" grid_ref="gznl_T_2D" /> 
     742        <field id="sopstldf_ipc"      long_name="Diffusive Salt Transport: Pacific+Indian"     unit="Giga g/s" grid_ref="gznl_T_2D" /> 
     743        <field id="sopsteiv"          long_name="Salt Transport from mesoscale eddy advection"                     unit="Giga g/s"       grid_ref="gznl_T_2D" /> 
     744        <field id="sopsteiv_atl"      long_name="Salt Transport from mesoscale eddy advection: Atlantic"           unit="Giga g/s"       grid_ref="gznl_T_2D" /> 
     745        <field id="sopsteiv_pac"      long_name="Salt Transport from mesoscale eddy advection: Pacific"            unit="Giga g/s"       grid_ref="gznl_T_2D" /> 
     746        <field id="sopsteiv_ind"      long_name="Salt Transport from mesoscale eddy advection: Indian"             unit="Giga g/s"       grid_ref="gznl_T_2D" /> 
     747        <field id="sopsteiv_ipc"      long_name="Salt Transport from mesoscale eddy advection: Pacific+Indian"     unit="Giga g/s"       grid_ref="gznl_T_2D" />        
     748        <field id="sopht_vt"          long_name="Heat Transport"                     unit="PW"       grid_ref="gznl_T_2D" /> 
     749        <field id="sopht_vt_atl"      long_name="Heat Transport: Atlantic"           unit="PW"       grid_ref="gznl_T_2D" /> 
     750        <field id="sopht_vt_ind"      long_name="Heat Transport: Indian"             unit="PW"       grid_ref="gznl_T_2D" /> 
     751        <field id="sopht_vt_pac"      long_name="Heat Transport: Pacific"            unit="PW"       grid_ref="gznl_T_2D" /> 
     752        <field id="sopht_vt_ipc"      long_name="Heat Transport: Indo-Pacific"       unit="PW"       grid_ref="gznl_T_2D" /> 
     753        <field id="sopst_vs"          long_name="Salt Transport"                     unit="Giga g/s"       grid_ref="gznl_T_2D" /> 
     754        <field id="sopst_vs_atl"      long_name="Salt Transport: Atlantic"           unit="Giga g/s"       grid_ref="gznl_T_2D" /> 
     755        <field id="sopst_vs_ind"      long_name="Salt Transport: Indian"             unit="Giga g/s"       grid_ref="gznl_T_2D" /> 
     756        <field id="sopst_vs_pac"      long_name="Salt Transport: Pacific"            unit="Giga g/s"       grid_ref="gznl_T_2D" /> 
     757        <field id="sopst_vs_ipc"      long_name="Salt Transport: Indo-Pacific"       unit="Giga g/s"       grid_ref="gznl_T_2D" /> 
     758        <field id="vsum" grid_ref="gznl_T_2D" unit="none" standard_name="none" /> 
     759        <field id="tmean" grid_ref="gznl_T_2D" unit="none" standard_name="none" /> 
     760        <field id="section_area" grid_ref="gznl_T_2D" unit="none" standard_name="none" /> 
    666761      </field_group> 
    667762 
     
    682777      <field id="ttrd_ad"       long_name="temperature-trend: advection"               standard_name="tendency_of_sea_water_temperature_due_to_advection"           unit="degC/s"                         > sqrt( ttrd_xad^2 + ttrd_yad^2 + ttrd_zad^2 ) </field> 
    683778      <field id="strd_ad"       long_name="salinity   -trend: advection"               standard_name="tendency_of_sea_water_salinity_due_to_advection"              unit="1e-3/s"                         > sqrt( strd_xad^2 + strd_yad^2 + strd_zad^2 ) </field> 
     779      <field id="ttrd_totad"    long_name="temperature-trend: total advection"         standard_name="tendency_of_sea_water_salinity_due_to_advection"              unit="degC/s"                        /> 
     780      <field id="strd_totad"    long_name="salinity   -trend: total advection"         standard_name="tendency_of_sea_water_salinity_due_to_advection"              unit="1e-3/s"                        /> 
    684781      <field id="ttrd_sad"      long_name="temperature-trend: surface adv. (no-vvl)"                                                                                unit="degC/s"   grid_ref="grid_T_2D" /> 
    685782      <field id="strd_sad"      long_name="salinity   -trend: surface adv. (no-vvl)"                                                                                unit="1e-3/s"   grid_ref="grid_T_2D" /> 
     
    688785      <field id="ttrd_zdf"      long_name="temperature-trend: vertical diffusion"      standard_name="tendency_of_sea_water_temperature_due_to_vertical_mixing"     unit="degC/s"                        /> 
    689786      <field id="strd_zdf"      long_name="salinity   -trend: vertical diffusion"      standard_name="tendency_of_sea_water_salinity_due_to_vertical_mixing"        unit="1e-3/s"                        /> 
     787      <field id="ttrd_evd"      long_name="temperature-trend: EVD convection"                                                                                       unit="degC/s"                        /> 
     788      <field id="strd_evd"      long_name="salinity   -trend: EVD convection"                                                                                       unit="1e-3/s"                        /> 
    690789 
    691790      <!-- ln_traldf_iso=T only (iso-neutral diffusion) --> 
     791      <field id="ttrd_iso_x"    long_name="temperature-trend: isopycnal diffusion x-component"                                                                      unit="degC/s"                        /> 
     792      <field id="strd_iso_x"    long_name="salinity   -trend: isopycnal diffusion x-component"                                                                      unit="1e-3/s"                        /> 
     793      <field id="ttrd_iso_y"    long_name="temperature-trend: isopycnal diffusion y-component"                                                                      unit="degC/s"                        /> 
     794      <field id="strd_iso_y"    long_name="salinity   -trend: isopycnal diffusion y-component"                                                                      unit="1e-3/s"                        /> 
     795      <field id="ttrd_iso_z1"   long_name="temperature-trend: isopycnal diffusion z-component part 1"                                                               unit="degC/s"                        /> 
     796      <field id="strd_iso_z1"   long_name="salinity   -trend: isopycnal diffusion z-component part 1"                                                               unit="1e-3/s"                        /> 
     797      <field id="ttrd_iso_z"    long_name="temperature-trend: isopycnal diffusion z-component"                 unit="degC/s" > ttrd_iso_z1 + ttrd_zdf - ttrd_zdfp </field> 
     798      <field id="strd_iso_z"    long_name="salinity   -trend: isopycnal diffusion z-component"                 unit="1e-3/s" > strd_iso_z1 + strd_zdf - strd_zdfp </field> 
     799      <field id="ttrd_iso"      long_name="temperature-trend: isopycnal diffusion"                             unit="degC/s" > ttrd_ldf + ttrd_zdf - ttrd_zdfp </field> 
     800      <field id="strd_iso"      long_name="salinity   -trend: isopycnal diffusion"                             unit="1e-3/s" > strd_ldf + strd_zdf - strd_zdfp </field> 
    692801      <field id="ttrd_zdfp"     long_name="temperature-trend: pure vert. diffusion"   unit="degC/s" /> 
    693802      <field id="strd_zdfp"     long_name="salinity   -trend: pure vert. diffusion"   unit="1e-3/s" /> 
    694803 
    695804      <!-- --> 
    696       <field id="ttrd_dmp"      long_name="temperature-trend: interior restoring"        unit="degC/s" /> 
    697       <field id="strd_dmp"      long_name="salinity   -trend: interior restoring"        unit="1e-3/s" /> 
    698       <field id="ttrd_bbl"      long_name="temperature-trend: bottom boundary layer"     unit="degC/s" /> 
    699       <field id="strd_bbl"      long_name="salinity   -trend: bottom boundary layer"     unit="1e-3/s" /> 
    700       <field id="ttrd_npc"      long_name="temperature-trend: non-penetrative conv."     unit="degC/s" /> 
    701       <field id="strd_npc"      long_name="salinity   -trend: non-penetrative conv."     unit="1e-3/s" /> 
    702       <field id="ttrd_qns"      long_name="temperature-trend: non-solar flux + runoff"   unit="degC/s" /> 
    703       <field id="strd_cdt"      long_name="salinity   -trend: C/D term       + runoff"   unit="degC/s" /> 
    704       <field id="ttrd_qsr"      long_name="temperature-trend: solar penetr. heating"     unit="degC/s" /> 
    705       <field id="ttrd_bbc"      long_name="temperature-trend: geothermal heating"        unit="degC/s" /> 
    706       <field id="ttrd_atf"      long_name="temperature-trend: asselin time filter"       unit="degC/s" /> 
    707       <field id="strd_atf"      long_name="salinity   -trend: asselin time filter"       unit="1e-3/s" /> 
     805      <field id="ttrd_dmp"      long_name="temperature-trend: interior restoring"        unit="degree_C/s" /> 
     806      <field id="strd_dmp"      long_name="salinity   -trend: interior restoring"        unit="0.001/s" /> 
     807      <field id="ttrd_bbl"      long_name="temperature-trend: bottom boundary layer"     unit="degree_C/s" /> 
     808      <field id="strd_bbl"      long_name="salinity   -trend: bottom boundary layer"     unit="0.001/s" /> 
     809      <field id="ttrd_npc"      long_name="temperature-trend: non-penetrative conv."     unit="degree_C/s" /> 
     810      <field id="strd_npc"      long_name="salinity   -trend: non-penetrative conv."     unit="0.001/s" /> 
     811      <field id="ttrd_qns"      long_name="temperature-trend: non-solar flux + runoff"   unit="degC/s" grid_ref="grid_T_2D"/> 
     812      <field id="strd_cdt"      long_name="salinity   -trend: C/D term       + runoff"   unit="degC/s" grid_ref="grid_T_2D"/> 
     813      <field id="ttrd_qsr"      long_name="temperature-trend: solar penetr. heating"     unit="degree_C/s" /> 
     814      <field id="ttrd_bbc"      long_name="temperature-trend: geothermal heating"        unit="degree_C/s" /> 
     815      <field id="ttrd_atf"      long_name="temperature-trend: asselin time filter"       unit="degree_C/s" /> 
     816      <field id="strd_atf"      long_name="salinity   -trend: asselin time filter"       unit="0.001/s" /> 
     817      <field id="ttrd_tot"      long_name="temperature-trend: total model trend"         unit="degC/s" /> 
     818      <field id="strd_tot"      long_name="salinity   -trend: total model trend"         unit="1e-3/s" /> 
     819 
     820      <!-- Thickness weighted versions: --> 
     821      <field id="ttrd_xad_e3t"      unit="degC/s * m" >  ttrd_xad * e3t </field> 
     822      <field id="strd_xad_e3t"      unit="1e-3/s * m" >  strd_xad * e3t </field> 
     823      <field id="ttrd_yad_e3t"      unit="degC/s * m" >  ttrd_yad * e3t </field> 
     824      <field id="strd_yad_e3t"      unit="1e-3/s * m" >  strd_yad * e3t </field> 
     825      <field id="ttrd_zad_e3t"      unit="degC/s * m" >  ttrd_zad * e3t </field> 
     826      <field id="strd_zad_e3t"      unit="1e-3/s * m" >  strd_zad * e3t </field> 
     827      <field id="ttrd_ad_e3t"       unit="degC/s * m" >  ttrd_ad  * e3t </field> 
     828      <field id="strd_ad_e3t"       unit="1e-3/s * m" >  strd_ad  * e3t </field> 
     829      <field id="ttrd_totad_e3t"    unit="degC/s * m" >  ttrd_totad  * e3t </field> 
     830      <field id="strd_totad_e3t"    unit="1e-3/s * m" >  strd_totad  * e3t </field> 
     831      <field id="ttrd_ldf_e3t"      unit="degC/s * m" >  ttrd_ldf * e3t </field> 
     832      <field id="strd_ldf_e3t"      unit="1e-3/s * m" >  strd_ldf * e3t </field> 
     833      <field id="ttrd_zdf_e3t"      unit="degC/s * m" >  ttrd_zdf * e3t </field> 
     834      <field id="strd_zdf_e3t"      unit="1e-3/s * m" >  strd_zdf * e3t </field> 
     835      <field id="ttrd_evd_e3t"      unit="degC/s * m" >  ttrd_evd * e3t </field> 
     836      <field id="strd_evd_e3t"      unit="1e-3/s * m" >  strd_evd * e3t </field> 
     837 
     838      <!-- ln_traldf_iso=T only (iso-neutral diffusion) --> 
     839      <field id="ttrd_iso_x_e3t"    unit="degC/s * m"  >  ttrd_iso_x * e3t </field> 
     840      <field id="strd_iso_x_e3t"    unit="1e-3/s * m"  >  strd_iso_x * e3t </field> 
     841      <field id="ttrd_iso_y_e3t"    unit="degC/s * m"  >  ttrd_iso_y * e3t </field> 
     842      <field id="strd_iso_y_e3t"    unit="1e-3/s * m"  >  strd_iso_y * e3t </field> 
     843      <field id="ttrd_iso_z_e3t"    unit="degC/s * m"  >  ttrd_iso_z * e3t </field> 
     844      <field id="strd_iso_z_e3t"    unit="1e-3/s * m"  >  strd_iso_z * e3t </field> 
     845      <field id="ttrd_iso_e3t"      unit="degC/s * m"  >  ttrd_iso * e3t </field> 
     846      <field id="strd_iso_e3t"      unit="1e-3/s * m"  >  strd_iso * e3t </field> 
     847      <field id="ttrd_zdfp_e3t"     unit="degC/s * m"  >  ttrd_zdfp * e3t </field> 
     848      <field id="strd_zdfp_e3t"     unit="1e-3/s * m"  >  strd_zdfp * e3t </field> 
     849 
     850      <!-- --> 
     851      <field id="ttrd_dmp_e3t"      unit="degC/s * m"  >  ttrd_dmp * e3t </field> 
     852      <field id="strd_dmp_e3t"      unit="1e-3/s * m"  >  strd_dmp * e3t </field> 
     853      <field id="ttrd_bbl_e3t"      unit="degC/s * m"  >  ttrd_bbl * e3t </field> 
     854      <field id="strd_bbl_e3t"      unit="1e-3/s * m"  >  strd_bbl * e3t </field> 
     855      <field id="ttrd_npc_e3t"      unit="degC/s * m"  >  ttrd_npc * e3t </field> 
     856      <field id="strd_npc_e3t"      unit="1e-3/s * m"  >  strd_npc * e3t </field> 
     857      <field id="ttrd_qns_e3t"      unit="degC/s * m"  >  ttrd_qns * e3t_surf </field> 
     858      <field id="strd_cdt_e3t"      unit="degC/s * m"  >  strd_cdt * e3t_surf </field> 
     859      <field id="ttrd_qsr_e3t"      unit="degC/s * m"  >  ttrd_qsr * e3t </field> 
     860      <field id="ttrd_bbc_e3t"      unit="degC/s * m"  >  ttrd_bbc * e3t </field> 
     861      <field id="ttrd_atf_e3t"      unit="degC/s * m"  >  ttrd_atf * e3t </field> 
     862      <field id="strd_atf_e3t"      unit="1e-3/s * m"  >  strd_atf * e3t </field> 
     863      <field id="ttrd_tot_e3t"      unit="degC/s * m"  >  ttrd_tot * e3t </field> 
     864      <field id="strd_tot_e3t"      unit="1e-3/s * m"  >  strd_tot * e3t </field> 
    708865 
    709866      <!-- variables available with ln_KE_trd --> 
     
    721878      <field id="ketrd_zad"     long_name="ke-trend: vertical  advection"                    unit="W/s^3"                        /> 
    722879      <field id="ketrd_udx"     long_name="ke-trend: U.dx[U]"                                unit="W/s^3"                        /> 
    723       <field id="ketrd_ldf"     long_name="ke-trend: lateral   diffusion"                    unit="W/s^3"                        /> 
     880      <field id="ketrd_ldf"     long_name="ke-trend: lateral   diffusion"                    unit="W/m^3"                        /> 
     881      <field id="ketrd_ldf_e3t" field_ref="ketrd_ldf" long_name="ke-trend: lateral   diffusion * e3t" unit="W/m^2" >ketrd_ldf*e3t</field> 
     882      <field id="ketrd_ldf_vsum" field_ref="ketrd_ldf_e3t" long_name="ke-trend: lateral diffusion vertical integral" unit="W/m^2" grid_ref="vert_sum" /> 
    724883      <field id="ketrd_zdf"     long_name="ke-trend: vertical  diffusion"                    unit="W/s^3"                        /> 
    725884      <field id="ketrd_tau"     long_name="ke-trend: wind stress "                           unit="W/s^3"   grid_ref="grid_T_2D" /> 
     
    729888      <field id="ketrd_convP2K" long_name="ke-trend: conversion (potential to kinetic)"      unit="W/s^3"                        /> 
    730889      <field id="KE"            long_name="kinetic energy: u(n)*u(n+1)/2"                    unit="W/s^2"                        />    
     890      <field id="ketrd_eiv"     long_name="Kinetic energy trend from mesoscale eddy advection"   unit="W/s^2" grid_ref="grid_T_2D" />    
    731891 
    732892      <!-- variables available with ln_PE_trd --> 
     
    746906      <field id="petrd_atf"     long_name="pe-trend: asselin time filter"        unit="W/m^3"                        /> 
    747907      <field id="PEanom"        long_name="potential energy anomaly"             unit="1"                            />    
    748       <field id="alphaPE"       long_name="partial deriv. of PEanom wrt T"       unit="degC-1"                       />    
     908      <field id="alphaPE"       long_name="partial deriv. of PEanom wrt T"       unit="degree_C-1"                       />    
    749909      <field id="betaPE"        long_name="partial deriv. of PEanom wrt S"       unit="1e3"                          />    
     910      <field id="petrd_zdfp_e3t"    unit="W/m^2" grid_ref="grid_T_3D"  > petrd_zdfp * e3t </field> 
     911      <field id="petrd_2d" field_ref="petrd_zdfp_e3t" grid_ref="vert_sum" /> 
    750912    </field_group> 
    751913 
     
    9541116       <field id="INTPBSI"     long_name="Vertically integrated of biogenic Si production"     unit="mol/m2/s"                       /> 
    9551117       <field id="INTPCAL"     long_name="Vertically integrated of calcite production"         unit="mol/m2/s"                       /> 
     1118       <field id="tnpeo"       long_name="Tendency of ocean potential energy content"          unit="W/m2"                           /> 
    9561119 
    9571120       <!-- PISCES light : variables available with key_pisces_reduced --> 
     
    9861149       <field id="qintC14b"    long_name="Cumulative air-sea flux of Bomb C14"     unit="mol/m2"     /> 
    9871150       <field id="fdecay"      long_name="Radiactive decay of Bomb C14"            unit="mol/m3"  grid_ref="grid_T_3D"  /> 
     1151 
     1152       <!-- Ideal Age tracer (added using MY_TRC for now) --> 
     1153       <field id="Age"         long_name="Sea Water Age Since Surface Contact" standard_name="sea_water_age_since_first_contact" unit="yr" grid_ref="grid_T_3D" /> 
    9881154     </field_group> 
    9891155 
  • branches/UKMO/dev_r5518_GO6_package_XIOS_read/NEMOGCM/CONFIG/SHARED/namelist_ref

    r6804 r7923  
    380380   ln_coupled_iceshelf_fluxes = .false. ! If true use rate of change of mass of Greenland and Antarctic icesheets to set the  
    381381                                        ! combined magnitude of the iceberg calving and iceshelf melting freshwater fluxes. 
     382   ln_iceshelf_init_atmos     = .true.  ! If true force ocean to initialise icesheet masses from atmospheric values rather than 
     383                                        ! from values in ocean restart file.  
    382384   rn_greenland_calving_fraction = 0.5  ! Set fraction of total freshwater flux for iceberg calving - remainder goes to iceshelf melting. 
    383385   rn_antarctica_calving_fraction = 0.5 ! Set fraction of total freshwater flux for iceberg calving - remainder goes to iceshelf melting. 
  • branches/UKMO/dev_r5518_GO6_package_XIOS_read/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/DIA/diaar5.F90

    r6793 r7923  
    2424   USE phycst         ! physical constant 
    2525   USE in_out_manager  ! I/O manager 
     26   USE zdfddm 
     27   USE zdf_oce 
    2628 
    2729   IMPLICIT NONE 
     
    4244   !! * Substitutions 
    4345#  include "domzgr_substitute.h90" 
     46#  include "zdfddm_substitute.h90" 
    4447   !!---------------------------------------------------------------------- 
    4548   !! NEMO/OPA 3.3 , NEMO Consortium (2010) 
     
    7578      INTEGER  ::   ji, jj, jk                      ! dummy loop arguments 
    7679      REAL(wp) ::   zvolssh, zvol, zssh_steric, zztmp, zarho, ztemp, zsal, zmass 
     80      REAL(wp) ::   zaw, zbw, zrw 
    7781      ! 
    7882      REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:)     :: zarea_ssh , zbotpres       ! 2D workspace  
     83      REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:)     :: pe                         ! 2D workspace  
    7984      REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:,:)   :: zrhd , zrhop               ! 3D workspace 
    8085      REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:,:,:) :: ztsn                       ! 4D workspace 
    8186      !!-------------------------------------------------------------------- 
    8287      IF( nn_timing == 1 )   CALL timing_start('dia_ar5') 
     88 
     89      !Call to init moved to here so that we can call iom_use in the 
     90      !initialisation 
     91      IF( kt == nit000 )     CALL dia_ar5_init 
    8392  
    84       CALL wrk_alloc( jpi , jpj              , zarea_ssh , zbotpres ) 
     93      CALL wrk_alloc( jpi , jpj              , zarea_ssh , zbotpres, pe ) 
    8594      CALL wrk_alloc( jpi , jpj , jpk        , zrhd      , zrhop    ) 
    8695      CALL wrk_alloc( jpi , jpj , jpk , jpts , ztsn                 ) 
     
    95104      CALL iom_put( 'voltot', zvol               ) 
    96105      CALL iom_put( 'sshtot', zvolssh / area_tot ) 
     106      CALL iom_put( 'sshdyn', sshn(:,:) - (zvolssh / area_tot) ) 
    97107 
    98108      !                      
    99       ztsn(:,:,:,jp_tem) = tsn(:,:,:,jp_tem)                    ! thermosteric ssh 
    100       ztsn(:,:,:,jp_sal) = sn0(:,:,:) 
    101       CALL eos( ztsn, zrhd, fsdept_n(:,:,:) )                       ! now in situ density using initial salinity 
    102       ! 
    103       zbotpres(:,:) = 0._wp                        ! no atmospheric surface pressure, levitating sea-ice 
    104       DO jk = 1, jpkm1 
    105          zbotpres(:,:) = zbotpres(:,:) + fse3t(:,:,jk) * zrhd(:,:,jk) 
    106       END DO 
    107       IF( .NOT.lk_vvl ) THEN 
    108          IF ( ln_isfcav ) THEN 
    109             DO ji=1,jpi 
    110                DO jj=1,jpj 
    111                   zbotpres(ji,jj) = zbotpres(ji,jj) + sshn(ji,jj) * zrhd(ji,jj,mikt(ji,jj)) + riceload(ji,jj) 
     109      IF( iom_use('sshthster')) THEN 
     110         ztsn(:,:,:,jp_tem) = tsn(:,:,:,jp_tem)                    ! thermosteric ssh 
     111         ztsn(:,:,:,jp_sal) = sn0(:,:,:) 
     112         CALL eos( ztsn, zrhd, fsdept_n(:,:,:) )                       ! now in situ density using initial salinity 
     113         ! 
     114         zbotpres(:,:) = 0._wp                        ! no atmospheric surface pressure, levitating sea-ice 
     115         DO jk = 1, jpkm1 
     116            zbotpres(:,:) = zbotpres(:,:) + fse3t(:,:,jk) * zrhd(:,:,jk) 
     117         END DO 
     118         IF( .NOT.lk_vvl ) THEN 
     119            IF ( ln_isfcav ) THEN 
     120               DO ji=1,jpi 
     121                  DO jj=1,jpj 
     122                     zbotpres(ji,jj) = zbotpres(ji,jj) + sshn(ji,jj) * zrhd(ji,jj,mikt(ji,jj)) + riceload(ji,jj) 
     123                  END DO 
    112124               END DO 
    113             END DO 
    114          ELSE 
    115             zbotpres(:,:) = zbotpres(:,:) + sshn(:,:) * zrhd(:,:,1) 
     125            ELSE 
     126               zbotpres(:,:) = zbotpres(:,:) + sshn(:,:) * zrhd(:,:,1) 
     127            END IF 
    116128         END IF 
    117       END IF 
    118129      !                                          
    119       zarho = SUM( area(:,:) * zbotpres(:,:) )  
    120       IF( lk_mpp )   CALL mpp_sum( zarho ) 
    121       zssh_steric = - zarho / area_tot 
    122       CALL iom_put( 'sshthster', zssh_steric ) 
     130         zarho = SUM( area(:,:) * zbotpres(:,:) )  
     131         IF( lk_mpp )   CALL mpp_sum( zarho ) 
     132         zssh_steric = - zarho / area_tot 
     133         CALL iom_put( 'sshthster', zssh_steric ) 
     134      ENDIF 
    123135       
    124136      !                                         ! steric sea surface height 
     
    190202      CALL iom_put( 'temptot', ztemp ) 
    191203      CALL iom_put( 'saltot' , zsal  ) 
    192       ! 
    193       CALL wrk_dealloc( jpi , jpj              , zarea_ssh , zbotpres ) 
     204 
     205      IF( iom_use( 'tnpeo' )) THEN     
     206      ! Work done against stratification by vertical mixing 
     207      ! Exclude points where rn2 is negative as convection kicks in here and 
     208      ! work is not being done against stratification 
     209          pe(:,:) = 0._wp 
     210          IF( lk_zdfddm ) THEN 
     211             DO ji=1,jpi 
     212                DO jj=1,jpj 
     213                   DO jk=1,jpk 
     214                      zrw =   ( fsdepw(ji,jj,jk  ) - fsdept(ji,jj,jk) )   & 
     215                         &  / ( fsdept(ji,jj,jk-1) - fsdept(ji,jj,jk) ) 
     216                      ! 
     217                      zaw = rab_n(ji,jj,jk,jp_tem) * (1. - zrw) + rab_n(ji,jj,jk-1,jp_tem)* zrw 
     218                      zbw = rab_n(ji,jj,jk,jp_sal) * (1. - zrw) + rab_n(ji,jj,jk-1,jp_sal)* zrw 
     219                      ! 
     220                      pe(ji, jj) = pe(ji, jj) - MIN(0._wp, rn2(ji,jj,jk)) * & 
     221                           &       grav * (avt(ji,jj,jk) * zaw * (tsn(ji,jj,jk-1,jp_tem) - tsn(ji,jj,jk,jp_tem) )  & 
     222                           &       - fsavs(ji,jj,jk) * zbw * (tsn(ji,jj,jk-1,jp_sal) - tsn(ji,jj,jk,jp_sal) ) ) 
     223 
     224                   ENDDO 
     225                ENDDO 
     226             ENDDO 
     227          ELSE 
     228             DO ji=1,jpi 
     229                DO jj=1,jpj 
     230                   DO jk=1,jpk 
     231                       pe(ji,jj) = pe(ji,jj) + avt(ji, jj, jk) * MIN(0._wp,rn2(ji, jj, jk)) * rau0 * fse3w(ji, jj, jk) 
     232                   ENDDO 
     233                ENDDO 
     234             ENDDO 
     235          ENDIF 
     236          CALL iom_put( 'tnpeo', pe ) 
     237      ENDIF 
     238      ! 
     239      CALL wrk_dealloc( jpi , jpj              , zarea_ssh , zbotpres, pe ) 
    194240      CALL wrk_dealloc( jpi , jpj , jpk        , zrhd      , zrhop    ) 
    195241      CALL wrk_dealloc( jpi , jpj , jpk , jpts , ztsn                 ) 
     
    232278      IF( lk_mpp )   CALL mpp_sum( vol0 ) 
    233279 
    234       CALL iom_open ( 'sali_ref_clim_monthly', inum ) 
    235       CALL iom_get  ( inum, jpdom_data, 'vosaline' , zsaldta(:,:,:,1), 1  ) 
    236       CALL iom_get  ( inum, jpdom_data, 'vosaline' , zsaldta(:,:,:,2), 12 ) 
    237       CALL iom_close( inum ) 
    238  
    239       sn0(:,:,:) = 0.5_wp * ( zsaldta(:,:,:,1) + zsaldta(:,:,:,2) )         
    240       sn0(:,:,:) = sn0(:,:,:) * tmask(:,:,:) 
    241       IF( ln_zps ) THEN               ! z-coord. partial steps 
    242          DO jj = 1, jpj               ! interpolation of salinity at the last ocean level (i.e. the partial step) 
    243             DO ji = 1, jpi 
    244                ik = mbkt(ji,jj) 
    245                IF( ik > 1 ) THEN 
    246                   zztmp = ( gdept_1d(ik) - gdept_0(ji,jj,ik) ) / ( gdept_1d(ik) - gdept_1d(ik-1) ) 
    247                   sn0(ji,jj,ik) = ( 1._wp - zztmp ) * sn0(ji,jj,ik) + zztmp * sn0(ji,jj,ik-1) 
    248                ENDIF 
     280      IF( iom_use('sshthster')) THEN 
     281         CALL iom_open ( 'sali_ref_clim_monthly', inum ) 
     282         CALL iom_get  ( inum, jpdom_data, 'vosaline' , zsaldta(:,:,:,1), 1  ) 
     283         CALL iom_get  ( inum, jpdom_data, 'vosaline' , zsaldta(:,:,:,2), 12 ) 
     284         CALL iom_close( inum ) 
     285 
     286         sn0(:,:,:) = 0.5_wp * ( zsaldta(:,:,:,1) + zsaldta(:,:,:,2) )         
     287         sn0(:,:,:) = sn0(:,:,:) * tmask(:,:,:) 
     288         IF( ln_zps ) THEN               ! z-coord. partial steps 
     289            DO jj = 1, jpj               ! interpolation of salinity at the last ocean level (i.e. the partial step) 
     290               DO ji = 1, jpi 
     291                  ik = mbkt(ji,jj) 
     292                  IF( ik > 1 ) THEN 
     293                     zztmp = ( gdept_1d(ik) - gdept_0(ji,jj,ik) ) / ( gdept_1d(ik) - gdept_1d(ik-1) ) 
     294                     sn0(ji,jj,ik) = ( 1._wp - zztmp ) * sn0(ji,jj,ik) + zztmp * sn0(ji,jj,ik-1) 
     295                  ENDIF 
     296               END DO 
    249297            END DO 
    250          END DO 
     298         ENDIF 
    251299      ENDIF 
    252300      ! 
  • branches/UKMO/dev_r5518_GO6_package_XIOS_read/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/DIA/diaprod.F90

    r6491 r7923  
    2525   USE timing          ! preformance summary 
    2626   USE wrk_nemo        ! working array 
     27   USE diaptr 
    2728 
    2829   IMPLICIT NONE 
     
    9899      ENDIF 
    99100 
    100       IF( iom_use("vt") ) THEN 
     101      IF( iom_use("vt") .OR. iom_use("sopht_vt") ) THEN 
    101102         z3d(:,:,:) = 0.e0  
    102103         DO jk = 1, jpkm1 
     
    108109         END DO 
    109110         CALL iom_put( "vt", z3d )                  ! product of temperature and meridional velocity at V points 
     111         DO jk = 1, jpkm1 
     112            DO jj = 2, jpjm1 
     113               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
     114                  z3d(ji,jj,jk) = z3d(ji,jj,jk) * fse3v(ji,jj,jk) * e1v(ji,jj) 
     115               END DO 
     116            END DO 
     117         END DO 
     118         IF(ln_diaptr) CALL dia_ptr_ohst_components( jp_tem, 'vts', z3d) 
    110119      ENDIF 
    111120 
     
    139148      ENDIF 
    140149 
    141       IF( iom_use("vs") ) THEN 
     150      IF( iom_use("vs") .OR. iom_use("sopst_vs") ) THEN 
    142151         z3d(:,:,:) = 0.e0  
    143152         DO jk = 1, jpkm1 
     
    149158         END DO 
    150159         CALL iom_put( "vs", z3d )                  ! product of salinity and meridional velocity at V points 
     160         DO jk = 1, jpkm1 
     161            DO jj = 2, jpjm1 
     162               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
     163                  z3d(ji,jj,jk) = z3d(ji,jj,jk) * fse3v(ji,jj,jk) * e1v(ji,jj) 
     164               END DO 
     165            END DO 
     166         END DO 
     167         IF(ln_diaptr) CALL dia_ptr_ohst_components( jp_sal, 'vts', z3d) 
    151168      ENDIF 
    152169 
  • branches/UKMO/dev_r5518_GO6_package_XIOS_read/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/DIA/diaptr.F90

    r6486 r7923  
    99   !!            3.3  ! 2010-10  (G. Madec)  dynamical allocation 
    1010   !!            3.6  ! 2014-12  (C. Ethe) use of IOM 
     11   !!            3.6  ! 2016-06  (T. Graham) Addition of diagnostics for CMIP6 
    1112   !!---------------------------------------------------------------------- 
    1213 
     
    2122   USE dom_oce          ! ocean space and time domain 
    2223   USE phycst           ! physical constants 
     24   USE ldftra_oce  
    2325   ! 
    2426   USE iom              ! IOM library 
     
    3840   PUBLIC   dia_ptr_init   ! call in step module 
    3941   PUBLIC   dia_ptr        ! call in step module 
     42   PUBLIC   dia_ptr_ohst_components        ! called from tra_ldf/tra_adv routines 
    4043 
    4144   !                                  !!** namelist  namptr  ** 
    42    REAL(wp), ALLOCATABLE, SAVE, PUBLIC, DIMENSION(:) ::   htr_adv, htr_ldf   !: Heat TRansports (adv, diff, overturn.) 
    43    REAL(wp), ALLOCATABLE, SAVE, PUBLIC, DIMENSION(:) ::   str_adv, str_ldf   !: Salt TRansports (adv, diff, overturn.) 
    44     
     45   REAL(wp), ALLOCATABLE, SAVE, PUBLIC, DIMENSION(:,:) ::   htr_adv, htr_ldf, htr_eiv, htr_vt   !: Heat TRansports (adv, diff, Bolus.) 
     46   REAL(wp), ALLOCATABLE, SAVE, PUBLIC, DIMENSION(:,:) ::   str_adv, str_ldf, str_eiv, str_vs   !: Salt TRansports (adv, diff, Bolus.) 
     47   REAL(wp), ALLOCATABLE, SAVE, PUBLIC, DIMENSION(:,:) ::   htr_ove, str_ove   !: heat Salt TRansports ( overturn.) 
     48   REAL(wp), ALLOCATABLE, SAVE, PUBLIC, DIMENSION(:,:) ::   htr_btr, str_btr   !: heat Salt TRansports ( barotropic ) 
    4549 
    4650   LOGICAL, PUBLIC ::   ln_diaptr   !  Poleward transport flag (T) or not (F) 
    4751   LOGICAL, PUBLIC ::   ln_subbas   !  Atlantic/Pacific/Indian basins calculation 
    48    INTEGER        ::   nptr        ! = 1 (l_subbas=F) or = 5 (glo, atl, pac, ind, ipc) (l_subbas=T)  
     52   INTEGER, PUBLIC ::   nptr        ! = 1 (l_subbas=F) or = 5 (glo, atl, pac, ind, ipc) (l_subbas=T)  
    4953 
    5054   REAL(wp) ::   rc_sv    = 1.e-6_wp   ! conversion from m3/s to Sverdrup 
     
    7781      ! 
    7882      INTEGER  ::   ji, jj, jk, jn   ! dummy loop indices 
    79       REAL(wp) ::   zv, zsfc               ! local scalar 
     83      REAL(wp) ::   zsfc,zvfc               ! local scalar 
    8084      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj)     ::  z2d   ! 2D workspace 
    8185      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk) ::  z3d   ! 3D workspace 
    8286      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk) ::  zmask   ! 3D workspace 
    8387      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk,jpts) ::  zts   ! 3D workspace 
    84       CHARACTER( len = 10 )  :: cl1 
     88      REAL(wp), DIMENSION(jpj)     ::  vsum   ! 1D workspace 
     89      REAL(wp), DIMENSION(jpj,jpts)     ::  tssum   ! 1D workspace 
     90  
     91      ! 
     92      !overturning calculation 
     93      REAL(wp), DIMENSION(jpj,jpk,nptr) ::   sjk  , r1_sjk ! i-mean i-k-surface and its inverse 
     94      REAL(wp), DIMENSION(jpj,jpk,nptr) ::   v_msf, sn_jk  , tn_jk ! i-mean T and S, j-Stream-Function 
     95      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk) ::  zvn   ! 3D workspace 
     96 
     97 
     98      CHARACTER( len = 12 )  :: cl1 
    8599      !!---------------------------------------------------------------------- 
    86100      ! 
     
    111125            END DO 
    112126         ENDIF 
     127         IF( iom_use("sopstove") .OR. iom_use("sophtove") .OR. iom_use("sopstbtr") .OR. iom_use("sophtbtr") ) THEN 
     128            ! define fields multiplied by scalar 
     129            zmask(:,:,:) = 0._wp 
     130            zts(:,:,:,:) = 0._wp 
     131            zvn(:,:,:) = 0._wp 
     132            DO jk = 1, jpkm1 
     133               DO jj = 1, jpjm1 
     134                  DO ji = 1, jpi 
     135                     zvfc = e1v(ji,jj) * fse3v(ji,jj,jk) 
     136                     zmask(ji,jj,jk)      = vmask(ji,jj,jk)      * zvfc 
     137                     zts(ji,jj,jk,jp_tem) = (tsn(ji,jj,jk,jp_tem)+tsn(ji,jj+1,jk,jp_tem)) * 0.5 * zvfc  !Tracers averaged onto V grid 
     138                     zts(ji,jj,jk,jp_sal) = (tsn(ji,jj,jk,jp_sal)+tsn(ji,jj+1,jk,jp_sal)) * 0.5 * zvfc 
     139                     zvn(ji,jj,jk)        = vn(ji,jj,jk)         * zvfc 
     140                  ENDDO 
     141               ENDDO 
     142             ENDDO 
     143         ENDIF 
     144         IF( iom_use("sopstove") .OR. iom_use("sophtove") ) THEN 
     145             sjk(:,:,1) = ptr_sjk( zmask(:,:,:), btmsk(:,:,1) ) 
     146             r1_sjk(:,:,1) = 0._wp 
     147             WHERE( sjk(:,:,1) /= 0._wp )   r1_sjk(:,:,1) = 1._wp / sjk(:,:,1) 
     148 
     149             ! i-mean T and S, j-Stream-Function, global 
     150             tn_jk(:,:,1) = ptr_sjk( zts(:,:,:,jp_tem) ) * r1_sjk(:,:,1) 
     151             sn_jk(:,:,1) = ptr_sjk( zts(:,:,:,jp_sal) ) * r1_sjk(:,:,1) 
     152             v_msf(:,:,1) = ptr_sjk( zvn(:,:,:) ) 
     153 
     154             htr_ove(:,1) = SUM( v_msf(:,:,1)*tn_jk(:,:,1) ,2 ) 
     155             str_ove(:,1) = SUM( v_msf(:,:,1)*sn_jk(:,:,1) ,2 ) 
     156 
     157             z2d(1,:) = htr_ove(:,1) * rc_pwatt        !  (conversion in PW) 
     158             DO ji = 1, jpi 
     159               z2d(ji,:) = z2d(1,:) 
     160             ENDDO 
     161             cl1 = 'sophtove' 
     162             CALL iom_put( TRIM(cl1), z2d ) 
     163             z2d(1,:) = str_ove(:,1) * rc_ggram        !  (conversion in Gg) 
     164             DO ji = 1, jpi 
     165               z2d(ji,:) = z2d(1,:) 
     166             ENDDO 
     167             cl1 = 'sopstove' 
     168             CALL iom_put( TRIM(cl1), z2d ) 
     169             IF( ln_subbas ) THEN 
     170                DO jn = 2, nptr 
     171                    sjk(:,:,jn) = ptr_sjk( zmask(:,:,:), btmsk(:,:,jn) ) 
     172                    r1_sjk(:,:,jn) = 0._wp 
     173                    WHERE( sjk(:,:,jn) /= 0._wp )   r1_sjk(:,:,jn) = 1._wp / sjk(:,:,jn) 
     174 
     175                    ! i-mean T and S, j-Stream-Function, basin 
     176                    tn_jk(:,:,jn) = ptr_sjk( zts(:,:,:,jp_tem), btmsk(:,:,jn) ) * r1_sjk(:,:,jn) 
     177                    sn_jk(:,:,jn) = ptr_sjk( zts(:,:,:,jp_sal), btmsk(:,:,jn) ) * r1_sjk(:,:,jn) 
     178                    v_msf(:,:,jn) = ptr_sjk( zvn(:,:,:), btmsk(:,:,jn) )  
     179                    htr_ove(:,jn) = SUM( v_msf(:,:,jn)*tn_jk(:,:,jn) ,2 ) 
     180                    str_ove(:,jn) = SUM( v_msf(:,:,jn)*sn_jk(:,:,jn) ,2 ) 
     181 
     182                    z2d(1,:) = htr_ove(:,jn) * rc_pwatt !  (conversion in PW) 
     183                    DO ji = 1, jpi 
     184                        z2d(ji,:) = z2d(1,:) 
     185                    ENDDO 
     186                    cl1 = TRIM('sophtove_'//clsubb(jn)) 
     187                    CALL iom_put( cl1, z2d ) 
     188                    z2d(1,:) = str_ove(:,jn) * rc_ggram        ! (conversion in Gg) 
     189                    DO ji = 1, jpi 
     190                        z2d(ji,:) = z2d(1,:) 
     191                    ENDDO 
     192                    cl1 = TRIM('sopstove_'//clsubb(jn)) 
     193                    CALL iom_put( cl1, z2d ) 
     194                END DO 
     195             ENDIF 
     196         ENDIF 
     197         IF( iom_use("sopstbtr") .OR. iom_use("sophtbtr") ) THEN 
     198         ! Calculate barotropic heat and salt transport here  
     199             sjk(:,1,1) = ptr_sj( zmask(:,:,:), btmsk(:,:,1) ) 
     200             r1_sjk(:,1,1) = 0._wp 
     201             WHERE( sjk(:,1,1) /= 0._wp )   r1_sjk(:,1,1) = 1._wp / sjk(:,1,1) 
     202             
     203            vsum = ptr_sj( zvn(:,:,:), btmsk(:,:,1)) 
     204            tssum(:,jp_tem) = ptr_sj( zts(:,:,:,jp_tem), btmsk(:,:,1) ) 
     205            tssum(:,jp_sal) = ptr_sj( zts(:,:,:,jp_sal), btmsk(:,:,1) ) 
     206            htr_btr(:,1) = vsum * tssum(:,jp_tem) * r1_sjk(:,1,1) 
     207            str_btr(:,1) = vsum * tssum(:,jp_sal) * r1_sjk(:,1,1) 
     208            z2d(1,:) = htr_btr(:,1) * rc_pwatt        !  (conversion in PW) 
     209            DO ji = 2, jpi 
     210               z2d(ji,:) = z2d(1,:) 
     211            ENDDO 
     212            cl1 = 'sophtbtr' 
     213            CALL iom_put( TRIM(cl1), z2d ) 
     214            z2d(1,:) = str_btr(:,1) * rc_ggram        !  (conversion in Gg) 
     215            DO ji = 2, jpi 
     216              z2d(ji,:) = z2d(1,:) 
     217            ENDDO 
     218            cl1 = 'sopstbtr' 
     219            CALL iom_put( TRIM(cl1), z2d ) 
     220            IF( ln_subbas ) THEN 
     221                DO jn = 2, nptr 
     222                    sjk(:,1,jn) = ptr_sj( zmask(:,:,:), btmsk(:,:,jn) ) 
     223                    r1_sjk(:,1,jn) = 0._wp 
     224                    WHERE( sjk(:,1,jn) /= 0._wp )   r1_sjk(:,1,jn) = 1._wp / sjk(:,1,jn) 
     225                    vsum = ptr_sj( zvn(:,:,:), btmsk(:,:,jn)) 
     226                    tssum(:,jp_tem) = ptr_sj( zts(:,:,:,jp_tem), btmsk(:,:,jn) ) 
     227                    tssum(:,jp_sal) = ptr_sj( zts(:,:,:,jp_sal), btmsk(:,:,jn) ) 
     228                    htr_btr(:,jn) = vsum * tssum(:,jp_tem) * r1_sjk(:,1,jn) 
     229                    str_btr(:,jn) = vsum * tssum(:,jp_sal) * r1_sjk(:,1,jn) 
     230                    z2d(1,:) = htr_btr(:,jn) * rc_pwatt !  (conversion in PW) 
     231                    DO ji = 1, jpi 
     232                        z2d(ji,:) = z2d(1,:) 
     233                    ENDDO 
     234                    cl1 = TRIM('sophtbtr_'//clsubb(jn)) 
     235                    CALL iom_put( cl1, z2d ) 
     236                    z2d(1,:) = str_btr(:,jn) * rc_ggram        ! (conversion in Gg) 
     237                    DO ji = 1, jpi 
     238                        z2d(ji,:) = z2d(1,:) 
     239                    ENDDO 
     240                    cl1 = TRIM('sopstbtr_'//clsubb(jn)) 
     241                    CALL iom_put( cl1, z2d ) 
     242               ENDDO 
     243            ENDIF !ln_subbas 
     244         ENDIF !iom_use("sopstbtr....) 
    113245         ! 
    114246      ELSE 
     
    150282         !                                ! Advective and diffusive heat and salt transport 
    151283         IF( iom_use("sophtadv") .OR. iom_use("sopstadv") ) THEN    
    152             z2d(1,:) = htr_adv(:) * rc_pwatt        !  (conversion in PW) 
     284            z2d(1,:) = htr_adv(:,1) * rc_pwatt        !  (conversion in PW) 
    153285            DO ji = 1, jpi 
    154286               z2d(ji,:) = z2d(1,:) 
     
    156288            cl1 = 'sophtadv'                  
    157289            CALL iom_put( TRIM(cl1), z2d ) 
    158             z2d(1,:) = str_adv(:) * rc_ggram        ! (conversion in Gg) 
     290            z2d(1,:) = str_adv(:,1) * rc_ggram        ! (conversion in Gg) 
    159291            DO ji = 1, jpi 
    160292               z2d(ji,:) = z2d(1,:) 
     
    162294            cl1 = 'sopstadv' 
    163295            CALL iom_put( TRIM(cl1), z2d ) 
     296            IF( ln_subbas ) THEN 
     297              DO jn=2,nptr 
     298               z2d(1,:) = htr_adv(:,jn) * rc_pwatt        !  (conversion in PW) 
     299               DO ji = 1, jpi 
     300                 z2d(ji,:) = z2d(1,:) 
     301               ENDDO 
     302               cl1 = TRIM('sophtadv_'//clsubb(jn))                  
     303               CALL iom_put( cl1, z2d ) 
     304               z2d(1,:) = str_adv(:,jn) * rc_ggram        ! (conversion in Gg) 
     305               DO ji = 1, jpi 
     306                  z2d(ji,:) = z2d(1,:) 
     307               ENDDO 
     308               cl1 = TRIM('sopstadv_'//clsubb(jn))                  
     309               CALL iom_put( cl1, z2d )               
     310              ENDDO 
     311            ENDIF 
    164312         ENDIF 
    165313         ! 
    166314         IF( iom_use("sophtldf") .OR. iom_use("sopstldf") ) THEN    
    167             z2d(1,:) = htr_ldf(:) * rc_pwatt        !  (conversion in PW)  
     315            z2d(1,:) = htr_ldf(:,1) * rc_pwatt        !  (conversion in PW)  
    168316            DO ji = 1, jpi 
    169317               z2d(ji,:) = z2d(1,:) 
     
    171319            cl1 = 'sophtldf' 
    172320            CALL iom_put( TRIM(cl1), z2d ) 
    173             z2d(1,:) = str_ldf(:) * rc_ggram        !  (conversion in Gg) 
     321            z2d(1,:) = str_ldf(:,1) * rc_ggram        !  (conversion in Gg) 
    174322            DO ji = 1, jpi 
    175323               z2d(ji,:) = z2d(1,:) 
     
    177325            cl1 = 'sopstldf' 
    178326            CALL iom_put( TRIM(cl1), z2d ) 
    179          ENDIF 
     327            IF( ln_subbas ) THEN 
     328              DO jn=2,nptr 
     329               z2d(1,:) = htr_ldf(:,jn) * rc_pwatt        !  (conversion in PW) 
     330               DO ji = 1, jpi 
     331                 z2d(ji,:) = z2d(1,:) 
     332               ENDDO 
     333               cl1 = TRIM('sophtldf_'//clsubb(jn))                  
     334               CALL iom_put( cl1, z2d ) 
     335               z2d(1,:) = str_ldf(:,jn) * rc_ggram        ! (conversion in Gg) 
     336               DO ji = 1, jpi 
     337                  z2d(ji,:) = z2d(1,:) 
     338               ENDDO 
     339               cl1 = TRIM('sopstldf_'//clsubb(jn))                  
     340               CALL iom_put( cl1, z2d )               
     341              ENDDO 
     342            ENDIF 
     343         ENDIF 
     344 
     345         IF( iom_use("sopht_vt") .OR. iom_use("sopst_vs") ) THEN    
     346            z2d(1,:) = htr_vt(:,1) * rc_pwatt        !  (conversion in PW)  
     347            DO ji = 1, jpi 
     348               z2d(ji,:) = z2d(1,:) 
     349            ENDDO 
     350            cl1 = 'sopht_vt' 
     351            CALL iom_put( TRIM(cl1), z2d ) 
     352            z2d(1,:) = str_vs(:,1) * rc_ggram        !  (conversion in Gg) 
     353            DO ji = 1, jpi 
     354               z2d(ji,:) = z2d(1,:) 
     355            ENDDO 
     356            cl1 = 'sopst_vs' 
     357            CALL iom_put( TRIM(cl1), z2d ) 
     358            IF( ln_subbas ) THEN 
     359              DO jn=2,nptr 
     360               z2d(1,:) = htr_vt(:,jn) * rc_pwatt        !  (conversion in PW) 
     361               DO ji = 1, jpi 
     362                 z2d(ji,:) = z2d(1,:) 
     363               ENDDO 
     364               cl1 = TRIM('sopht_vt_'//clsubb(jn))                  
     365               CALL iom_put( cl1, z2d ) 
     366               z2d(1,:) = str_vs(:,jn) * rc_ggram        ! (conversion in Gg) 
     367               DO ji = 1, jpi 
     368                  z2d(ji,:) = z2d(1,:) 
     369               ENDDO 
     370               cl1 = TRIM('sopst_vs_'//clsubb(jn))                  
     371               CALL iom_put( cl1, z2d )               
     372              ENDDO 
     373            ENDIF 
     374         ENDIF 
     375 
     376#ifdef key_diaeiv 
     377         IF(lk_traldf_eiv) THEN 
     378            IF( iom_use("sophteiv") .OR. iom_use("sopsteiv") ) THEN  
     379               z2d(1,:) = htr_eiv(:,1) * rc_pwatt        !  (conversion in PW)  
     380               DO ji = 1, jpi 
     381                  z2d(ji,:) = z2d(1,:) 
     382               ENDDO 
     383               cl1 = 'sophteiv' 
     384               CALL iom_put( TRIM(cl1), z2d ) 
     385               z2d(1,:) = str_eiv(:,1) * rc_ggram        !  (conversion in Gg) 
     386               DO ji = 1, jpi 
     387                  z2d(ji,:) = z2d(1,:) 
     388               ENDDO 
     389               cl1 = 'sopsteiv' 
     390               CALL iom_put( TRIM(cl1), z2d ) 
     391               IF( ln_subbas ) THEN 
     392                  DO jn=2,nptr 
     393                     z2d(1,:) = htr_eiv(:,jn) * rc_pwatt        !  (conversion in PW) 
     394                     DO ji = 1, jpi 
     395                        z2d(ji,:) = z2d(1,:) 
     396                     ENDDO 
     397                     cl1 = TRIM('sophteiv_'//clsubb(jn))                  
     398                     CALL iom_put( cl1, z2d ) 
     399                     z2d(1,:) = str_eiv(:,jn) * rc_ggram        ! (conversion in Gg) 
     400                     DO ji = 1, jpi 
     401                        z2d(ji,:) = z2d(1,:) 
     402                     ENDDO 
     403                     cl1 = TRIM('sopsteiv_'//clsubb(jn))  
     404                     CALL iom_put( cl1, z2d )               
     405                  ENDDO 
     406               ENDIF 
     407            ENDIF 
     408         ENDIF 
     409#endif 
    180410         ! 
    181411      ENDIF 
     
    256486         ! Initialise arrays to zero because diatpr is called before they are first calculated 
    257487         ! Note that this means diagnostics will not be exactly correct when model run is restarted. 
    258          htr_adv(:) = 0._wp  ;  str_adv(:) =  0._wp   
    259          htr_ldf(:) = 0._wp  ;  str_ldf(:) =  0._wp  
     488         htr_adv(:,:) = 0._wp  ;  str_adv(:,:) =  0._wp  
     489         htr_ldf(:,:) = 0._wp  ;  str_ldf(:,:) =  0._wp  
     490         htr_eiv(:,:) = 0._wp  ;  str_eiv(:,:) =  0._wp  
     491         htr_vt(:,:) = 0._wp  ;   str_vs(:,:) =  0._wp 
     492         htr_ove(:,:) = 0._wp  ;   str_ove(:,:) =  0._wp 
     493         htr_btr(:,:) = 0._wp  ;   str_btr(:,:) =  0._wp 
    260494         ! 
    261495      ENDIF  
     
    263497   END SUBROUTINE dia_ptr_init 
    264498 
     499   SUBROUTINE dia_ptr_ohst_components( ktra, cptr, pva )  
     500      !!---------------------------------------------------------------------- 
     501      !!                    ***  ROUTINE dia_ptr_ohst_components  *** 
     502      !!---------------------------------------------------------------------- 
     503      !! Wrapper for heat and salt transport calculations to calculate them for each basin 
     504      !! Called from all advection and/or diffusion routines 
     505      !!---------------------------------------------------------------------- 
     506      INTEGER                         , INTENT(in )  :: ktra  ! tracer index 
     507      CHARACTER(len=3)                , INTENT(in)   :: cptr  ! transport type  'adv'/'ldf'/'eiv' 
     508      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk), INTENT(in)   :: pva   ! 3D input array of advection/diffusion 
     509      INTEGER                                        :: jn    ! 
     510 
     511      IF( cptr == 'adv' ) THEN 
     512         IF( ktra == jp_tem )  htr_adv(:,1) = ptr_sj( pva(:,:,:) ) 
     513         IF( ktra == jp_sal )  str_adv(:,1) = ptr_sj( pva(:,:,:) ) 
     514      ENDIF 
     515      IF( cptr == 'ldf' ) THEN 
     516         IF( ktra == jp_tem )  htr_ldf(:,1) = ptr_sj( pva(:,:,:) ) 
     517         IF( ktra == jp_sal )  str_ldf(:,1) = ptr_sj( pva(:,:,:) ) 
     518      ENDIF 
     519      IF( cptr == 'eiv' ) THEN 
     520         IF( ktra == jp_tem )  htr_eiv(:,1) = ptr_sj( pva(:,:,:) ) 
     521         IF( ktra == jp_sal )  str_eiv(:,1) = ptr_sj( pva(:,:,:) ) 
     522      ENDIF 
     523      IF( cptr == 'vts' ) THEN 
     524         IF( ktra == jp_tem )  htr_vt(:,1) = ptr_sj( pva(:,:,:) ) 
     525         IF( ktra == jp_sal )  str_vs(:,1) = ptr_sj( pva(:,:,:) ) 
     526      ENDIF 
     527      ! 
     528      IF( ln_subbas ) THEN 
     529         ! 
     530         IF( cptr == 'adv' ) THEN 
     531             IF( ktra == jp_tem ) THEN  
     532                DO jn = 2, nptr 
     533                   htr_adv(:,jn) = ptr_sj( pva(:,:,:), btmsk(:,:,jn) ) 
     534                END DO 
     535             ENDIF 
     536             IF( ktra == jp_sal ) THEN  
     537                DO jn = 2, nptr 
     538                   str_adv(:,jn) = ptr_sj( pva(:,:,:), btmsk(:,:,jn) ) 
     539                END DO 
     540             ENDIF 
     541         ENDIF 
     542         IF( cptr == 'ldf' ) THEN 
     543             IF( ktra == jp_tem ) THEN  
     544                DO jn = 2, nptr 
     545                    htr_ldf(:,jn) = ptr_sj( pva(:,:,:), btmsk(:,:,jn) ) 
     546                 END DO 
     547             ENDIF 
     548             IF( ktra == jp_sal ) THEN  
     549                DO jn = 2, nptr 
     550                   str_ldf(:,jn) = ptr_sj( pva(:,:,:), btmsk(:,:,jn) ) 
     551                END DO 
     552             ENDIF 
     553         ENDIF 
     554         IF( cptr == 'eiv' ) THEN 
     555             IF( ktra == jp_tem ) THEN  
     556                DO jn = 2, nptr 
     557                    htr_eiv(:,jn) = ptr_sj( pva(:,:,:), btmsk(:,:,jn) ) 
     558                 END DO 
     559             ENDIF 
     560             IF( ktra == jp_sal ) THEN  
     561                DO jn = 2, nptr 
     562                   str_eiv(:,jn) = ptr_sj( pva(:,:,:), btmsk(:,:,jn) ) 
     563                END DO 
     564             ENDIF 
     565         ENDIF 
     566         IF( cptr == 'vts' ) THEN 
     567             IF( ktra == jp_tem ) THEN  
     568                DO jn = 2, nptr 
     569                    htr_vt(:,jn) = ptr_sj( pva(:,:,:), btmsk(:,:,jn) ) 
     570                 END DO 
     571             ENDIF 
     572             IF( ktra == jp_sal ) THEN  
     573                DO jn = 2, nptr 
     574                   str_vs(:,jn) = ptr_sj( pva(:,:,:), btmsk(:,:,jn) ) 
     575                END DO 
     576             ENDIF 
     577         ENDIF 
     578         ! 
     579      ENDIF 
     580   END SUBROUTINE dia_ptr_ohst_components 
     581 
    265582 
    266583   FUNCTION dia_ptr_alloc() 
     
    273590      ierr(:) = 0 
    274591      ! 
    275       ALLOCATE( btmsk(jpi,jpj,nptr) ,           & 
    276          &      htr_adv(jpj) , str_adv(jpj) ,   & 
    277          &      htr_ldf(jpj) , str_ldf(jpj) , STAT=ierr(1)  ) 
     592      ALLOCATE( btmsk(jpi,jpj,nptr) ,              & 
     593         &      htr_adv(jpj,nptr) , str_adv(jpj,nptr) ,   & 
     594         &      htr_eiv(jpj,nptr) , str_eiv(jpj,nptr) ,   & 
     595         &      htr_vt(jpj,nptr)  , str_vs(jpj,nptr)  ,   & 
     596         &      htr_ove(jpj,nptr) , str_ove(jpj,nptr) ,   & 
     597         &      htr_btr(jpj,nptr) , str_btr(jpj,nptr) ,   & 
     598         &      htr_ldf(jpj,nptr) , str_ldf(jpj,nptr) , STAT=ierr(1)  ) 
    278599         ! 
    279600      ALLOCATE( p_fval1d(jpj), p_fval2d(jpj,jpk), Stat=ierr(2)) 
     
    402723#endif 
    403724      !!-------------------------------------------------------------------- 
    404       ! 
     725     ! 
    405726      p_fval => p_fval2d 
    406727 
     
    434755#endif 
    435756      ! 
     757 
    436758   END FUNCTION ptr_sjk 
    437759 
  • branches/UKMO/dev_r5518_GO6_package_XIOS_read/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/DIA/diawri.F90

    r6498 r7923  
    157157      IF( iom_use("e3tdef") )   & 
    158158         CALL iom_put( "e3tdef"  , ( ( fse3t_n(:,:,:) - e3t_0(:,:,:) ) / e3t_0(:,:,:) * 100 * tmask(:,:,:) ) ** 2 ) 
     159      CALL iom_put("tpt_dep", fsdept_n(:,:,:) ) 
    159160 
    160161 
     
    323324      CALL iom_put( "hdiv", hdivn )                  ! Horizontal divergence 
    324325      ! 
    325       IF( iom_use("u_masstr") .OR. iom_use("u_heattr") .OR. iom_use("u_salttr") ) THEN 
     326      IF( iom_use("u_masstr") .OR. iom_use("u_masstr_vint") .OR. iom_use("u_heattr") .OR. iom_use("u_salttr") ) THEN 
    326327         z3d(:,:,jpk) = 0.e0 
     328         z2d(:,:) = 0.e0 
    327329         DO jk = 1, jpkm1 
    328330            z3d(:,:,jk) = rau0 * un(:,:,jk) * e2u(:,:) * fse3u(:,:,jk) * umask(:,:,jk) 
     331            z2d(:,:) = z2d(:,:) + z3d(:,:,jk) 
    329332         END DO 
    330333         CALL iom_put( "u_masstr", z3d )                  ! mass transport in i-direction 
     334         CALL iom_put( "u_masstr_vint", z2d )             ! mass transport in i-direction vertical sum 
    331335      ENDIF 
    332336       
     
    391395         CALL iom_put( "v_salttr", 0.5 * z2d )            !  heat transport in j-direction 
    392396      ENDIF 
     397 
     398      ! Vertical integral of temperature 
     399      IF( iom_use("tosmint") ) THEN 
     400         z2d(:,:)=0._wp 
     401         DO jk = 1, jpkm1 
     402            DO jj = 2, jpjm1 
     403               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
     404                  z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + rau0 * fse3t(ji,jj,jk) *  tsn(ji,jj,jk,jp_tem) 
     405               END DO 
     406            END DO 
     407         END DO 
     408         CALL lbc_lnk( z2d, 'T', -1. ) 
     409         CALL iom_put( "tosmint", z2d )  
     410      ENDIF 
     411 
     412      ! Vertical integral of salinity 
     413      IF( iom_use("somint") ) THEN 
     414         z2d(:,:)=0._wp 
     415         DO jk = 1, jpkm1 
     416            DO jj = 2, jpjm1 
     417               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
     418                  z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + rau0 * fse3t(ji,jj,jk) * tsn(ji,jj,jk,jp_sal) 
     419               END DO 
     420            END DO 
     421         END DO 
     422         CALL lbc_lnk( z2d, 'T', -1. ) 
     423         CALL iom_put( "somint", z2d )  
     424      ENDIF 
     425 
     426      CALL iom_put( "bn2", rn2 )  !Brunt-Vaisala buoyancy frequency (N^2) 
    393427      ! 
    394428      CALL wrk_dealloc( jpi , jpj      , z2d ) 
  • branches/UKMO/dev_r5518_GO6_package_XIOS_read/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/DYN/dynspg_flt.F90

    r6486 r7923  
    166166            ! 
    167167         ENDIF 
     168        IF( l_trddyn )   THEN                      ! Put here so code doesn't crash when doing KE trend but needs to be done properly 
     169            CALL wrk_alloc( jpi, jpj, jpk, ztrdu, ztrdv ) 
     170         ENDIF 
    168171         ! 
    169172      ELSE                       ! fixed volume  (add the surface pressure gradient + unweighted time stepping) 
  • branches/UKMO/dev_r5518_GO6_package_XIOS_read/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/IOM/iom.F90

    r6498 r7923  
    228228      ! automatic definitions of some of the xml attributs 
    229229      CALL set_xmlatt 
     230 
     231      CALL set_1point 
    230232 
    231233      ! end file definition 
     
    15791581   END SUBROUTINE set_scalar 
    15801582 
     1583   SUBROUTINE set_1point 
     1584      !!---------------------------------------------------------------------- 
     1585      !!                     ***  ROUTINE set_1point  *** 
     1586      !! 
     1587      !! ** Purpose :   define zoom grid for scalar fields 
     1588      !! 
     1589      !!---------------------------------------------------------------------- 
     1590      REAL(wp), DIMENSION(1)   ::   zz = 1. 
     1591      INTEGER  :: ix, iy 
     1592      !!---------------------------------------------------------------------- 
     1593      CALL dom_ngb( 180., 90., ix, iy, 'T' ) !  Nearest point to north pole should be ocean 
     1594      CALL iom_set_domain_attr('1point', zoom_ibegin=ix, zoom_jbegin=iy) 
     1595 
     1596   END SUBROUTINE set_1point 
     1597 
     1598 
    15811599 
    15821600   SUBROUTINE set_xmlatt 
  • branches/UKMO/dev_r5518_GO6_package_XIOS_read/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/SBC/sbc_oce.F90

    r6488 r7923  
    155155   LOGICAL, PUBLIC     ::   ln_coupled_iceshelf_fluxes     ! If true use rate of change of mass of Greenland and Antarctic icesheets to set the  
    156156                                                           ! combined magnitude of the iceberg calving and iceshelf melting freshwater fluxes. 
     157   LOGICAL, PUBLIC     ::   ln_iceshelf_init_atmos         ! If true force ocean to initialise iceshelf masses from atmospheric values rather 
     158                                                           ! than values in ocean restart. 
    157159   REAL(wp), PUBLIC    ::   rn_greenland_calving_fraction  ! Set fraction of total freshwater flux for iceberg calving - remainder goes to iceshelf melting. 
    158160   REAL(wp), PUBLIC    ::   rn_antarctica_calving_fraction ! Set fraction of total freshwater flux for iceberg calving - remainder goes to iceshelf melting. 
  • branches/UKMO/dev_r5518_GO6_package_XIOS_read/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/SBC/sbccpl.F90

    r6912 r7923  
    240240         &                  sn_rcv_qns , sn_rcv_emp   , sn_rcv_rnf   , sn_rcv_cal   , sn_rcv_iceflx,  & 
    241241         &                  sn_rcv_co2 , sn_rcv_grnm  , sn_rcv_antm  , sn_rcv_ts_ice, nn_cplmodel  ,  & 
    242          &                  ln_usecplmask, ln_coupled_iceshelf_fluxes, rn_greenland_calving_fraction, & 
     242         &                  ln_usecplmask, ln_coupled_iceshelf_fluxes, ln_iceshelf_init_atmos,        & 
     243         &                  rn_greenland_calving_fraction, & 
    243244         &                  rn_antarctica_calving_fraction, rn_iceshelf_fluxes_tolerance 
    244245      !!--------------------------------------------------------------------- 
     
    311312         WRITE(numout,*)'  ln_usecplmask                       = ', ln_usecplmask 
    312313         WRITE(numout,*)'  ln_coupled_iceshelf_fluxes          = ', ln_coupled_iceshelf_fluxes 
     314         WRITE(numout,*)'  ln_iceshelf_init_atmos              = ', ln_iceshelf_init_atmos 
    313315         WRITE(numout,*)'  rn_greenland_calving_fraction       = ', rn_greenland_calving_fraction 
    314316         WRITE(numout,*)'  rn_antarctica_calving_fraction      = ', rn_antarctica_calving_fraction 
     
    13441346         greenland_icesheet_mass_array(:,:) = frcv(jpr_grnm)%z3(:,:,1) 
    13451347         ! take average over ocean points of input array to avoid cumulative error over time 
    1346  
    13471348         ! The following must be bit reproducible over different PE decompositions 
    13481349         zgreenland_icesheet_mass_in = glob_sum( greenland_icesheet_mass_array(:,:) * tmask(:,:,1) ) 
     
    13501351         zgreenland_icesheet_mass_in = zgreenland_icesheet_mass_in / zmask_sum 
    13511352         greenland_icesheet_timelapsed = greenland_icesheet_timelapsed + rdt          
     1353 
     1354         IF( ln_iceshelf_init_atmos .AND. kt == 1 ) THEN 
     1355            ! On the first timestep (of an NRUN) force the ocean to ignore the icesheet masses in the ocean restart 
     1356            ! and take them from the atmosphere to avoid problems with using inconsistent ocean and atmosphere restarts. 
     1357            zgreenland_icesheet_mass_b = zgreenland_icesheet_mass_in 
     1358            greenland_icesheet_mass = zgreenland_icesheet_mass_in 
     1359         ENDIF 
     1360 
    13521361         IF( ABS( zgreenland_icesheet_mass_in - greenland_icesheet_mass ) > zepsilon ) THEN 
    13531362            zgreenland_icesheet_mass_b = greenland_icesheet_mass 
    13541363             
    1355             ! Only update the mass if it has increased 
     1364            ! Only update the mass if it has increased. 
    13561365            IF ( (zgreenland_icesheet_mass_in - greenland_icesheet_mass) > 0.0 ) THEN 
    13571366               greenland_icesheet_mass = zgreenland_icesheet_mass_in 
     
    13771386         zantarctica_icesheet_mass_in = zantarctica_icesheet_mass_in / zmask_sum 
    13781387         antarctica_icesheet_timelapsed = antarctica_icesheet_timelapsed + rdt          
     1388 
     1389         IF( ln_iceshelf_init_atmos .AND. kt == 1 ) THEN 
     1390            ! On the first timestep (of an NRUN) force the ocean to ignore the icesheet masses in the ocean restart 
     1391            ! and take them from the atmosphere to avoid problems with using inconsistent ocean and atmosphere restarts. 
     1392            zantarctica_icesheet_mass_b = zantarctica_icesheet_mass_in 
     1393            antarctica_icesheet_mass = zantarctica_icesheet_mass_in 
     1394         ENDIF 
     1395 
    13791396         IF( ABS( zantarctica_icesheet_mass_in - antarctica_icesheet_mass ) > zepsilon ) THEN 
    13801397            zantarctica_icesheet_mass_b = antarctica_icesheet_mass 
    13811398             
    1382             ! Only update the mass if it has increased 
     1399            ! Only update the mass if it has increased. 
    13831400            IF ( (zantarctica_icesheet_mass_in - antarctica_icesheet_mass) > 0.0 ) THEN 
    13841401               antarctica_icesheet_mass = zantarctica_icesheet_mass_in 
     
    17281745         zemp_ice(:,:) = ( frcv(jpr_ievp)%z3(:,:,1) - frcv(jpr_snow)%z3(:,:,1) ) * zicefr(:,:) 
    17291746#endif                   
    1730             CALL iom_put( 'rain'         , frcv(jpr_rain)%z3(:,:,1)              )   ! liquid precipitation  
     1747         CALL iom_put( 'rain'         , frcv(jpr_rain)%z3(:,:,1) * tmask(:,:,1)      )   ! liquid precipitation  
     1748         CALL iom_put( 'rain_ao_cea'  , frcv(jpr_rain)%z3(:,:,1)* p_frld(:,:) * tmask(:,:,1)      )   ! liquid precipitation  
    17311749         IF( iom_use('hflx_rain_cea') )   & 
    1732             &  CALL iom_put( 'hflx_rain_cea',   frcv(jpr_rain)%z3(:,:,1) * zcptn(:,:)                                            )  ! heat flux from liq. precip.  
     1750            &  CALL iom_put( 'hflx_rain_cea', frcv(jpr_rain)%z3(:,:,1) * zcptn(:,:) * tmask(:,:,1))   ! heat flux from liq. precip.  
     1751         IF( iom_use('hflx_prec_cea') )   & 
     1752            & CALL iom_put( 'hflx_prec_cea', ztprecip * zcptn(:,:) * tmask(:,:,1) * p_frld(:,:) )   ! heat content flux from all precip  (cell avg) 
     1753         IF( iom_use('evap_ao_cea') .OR. iom_use('hflx_evap_cea') )   & 
     1754            & ztmp(:,:) = frcv(jpr_tevp)%z3(:,:,1) - frcv(jpr_ievp)%z3(:,:,1) * zicefr(:,:) 
    17331755         IF( iom_use('evap_ao_cea'  ) )   & 
    1734             &  CALL iom_put( 'evap_ao_cea'  ,   frcv(jpr_tevp)%z3(:,:,1) - frcv(jpr_ievp)%z3(:,:,1) * zicefr(:,:)                )  ! ice-free oce evap (cell average) 
     1756            &  CALL iom_put( 'evap_ao_cea'  , ztmp * tmask(:,:,1)                  )   ! ice-free oce evap (cell average) 
    17351757         IF( iom_use('hflx_evap_cea') )   & 
    1736             &  CALL iom_put( 'hflx_evap_cea', ( frcv(jpr_tevp)%z3(:,:,1) - frcv(jpr_ievp)%z3(:,:,1) * zicefr(:,:) ) * zcptn(:,:) )  ! heat flux from from evap (cell average) 
     1758            &  CALL iom_put( 'hflx_evap_cea', ztmp(:,:) * zcptn(:,:) * tmask(:,:,1) )   ! heat flux from from evap (cell average) 
    17371759      CASE( 'oce and ice' )   ! received fields: jpr_sbpr, jpr_semp, jpr_oemp, jpr_ievp 
    17381760         zemp_tot(:,:) = p_frld(:,:) * frcv(jpr_oemp)%z3(:,:,1) + zicefr(:,:) * frcv(jpr_sbpr)%z3(:,:,1) 
     
    17981820      ! runoffs and calving (put in emp_tot) 
    17991821      IF( srcv(jpr_rnf)%laction )   rnf(:,:) = frcv(jpr_rnf)%z3(:,:,1) 
     1822      IF( iom_use('hflx_rnf_cea') )   & 
     1823         CALL iom_put( 'hflx_rnf_cea' , rnf(:,:) * zcptn(:,:) ) 
    18001824      IF( srcv(jpr_cal)%laction ) THEN  
    18011825         zemp_tot(:,:) = zemp_tot(:,:) - frcv(jpr_cal)%z3(:,:,1) 
  • branches/UKMO/dev_r5518_GO6_package_XIOS_read/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/SBC/sbcisf.F90

    r6755 r7923  
    9191    CHARACTER (LEN=32)           :: cvarLeff                    ! variable name for efficient Length scale 
    9292    INTEGER           ::   ios           ! Local integer output status for namelist read 
     93 
     94    REAL(wp), DIMENSION(:,:,:), POINTER :: zfwfisf3d, zqhcisf3d, zqlatisf3d 
     95    REAL(wp), DIMENSION(:,:  ), POINTER :: zqhcisf2d 
    9396      ! 
    9497      !!--------------------------------------------------------------------- 
     
    355358 
    356359         ! output 
    357          IF( iom_use('qisf'  ) )   CALL iom_put('qisf'  , qisf) 
    358          IF( iom_use('fwfisf') )   CALL iom_put('fwfisf', fwfisf * stbl(:,:) / soce ) 
     360         IF( iom_use('qlatisf' ) )   CALL iom_put('qlatisf', qisf) 
     361         IF( iom_use('fwfisf'  ) )   CALL iom_put('fwfisf' , fwfisf * stbl(:,:) / soce ) 
    359362 
    360363         ! if apply only on the trend and not as a volume flux (rdivisf = 0), fwfisf have to be set to 0 now 
     
    366369         CALL lbc_lnk(fwfisf(:,:)   ,'T',1.) 
    367370         CALL lbc_lnk(qisf(:,:)     ,'T',1.) 
     371 
     372!============================================================================================================================================= 
     373         IF ( iom_use('fwfisf3d') .OR. iom_use('qlatisf3d') .OR. iom_use('qhcisf3d') .OR. iom_use('qhcisf')) THEN 
     374            CALL wrk_alloc( jpi,jpj,jpk, zfwfisf3d, zqhcisf3d, zqlatisf3d ) 
     375            CALL wrk_alloc( jpi,jpj,     zqhcisf2d                        ) 
     376 
     377            zfwfisf3d(:,:,:) = 0.0_wp                         ! 3d ice shelf melting (kg/m2/s) 
     378            zqhcisf3d(:,:,:) = 0.0_wp                         ! 3d heat content flux (W/m2) 
     379            zqlatisf3d(:,:,:)= 0.0_wp                         ! 3d ice shelf melting latent heat flux (W/m2) 
     380            zqhcisf2d(:,:)   = fwfisf(:,:) * zt_frz * rcp     ! 2d heat content flux (W/m2) 
     381 
     382            DO jj = 1,jpj 
     383               DO ji = 1,jpi 
     384                  ikt = misfkt(ji,jj) 
     385                  ikb = misfkb(ji,jj) 
     386                  DO jk = ikt, ikb - 1 
     387                     zfwfisf3d (ji,jj,jk) = zfwfisf3d (ji,jj,jk) + fwfisf   (ji,jj) * r1_hisf_tbl(ji,jj) * fse3t(ji,jj,jk) 
     388                     zqhcisf3d (ji,jj,jk) = zqhcisf3d (ji,jj,jk) + zqhcisf2d(ji,jj) * r1_hisf_tbl(ji,jj) * fse3t(ji,jj,jk) 
     389                     zqlatisf3d(ji,jj,jk) = zqlatisf3d(ji,jj,jk) + qisf     (ji,jj) * r1_hisf_tbl(ji,jj) * fse3t(ji,jj,jk) 
     390                  END DO 
     391                  zfwfisf3d (ji,jj,jk) = zfwfisf3d (ji,jj,jk) + fwfisf   (ji,jj) * r1_hisf_tbl(ji,jj) * ralpha(ji,jj) * fse3t(ji,jj,jk) 
     392                  zqhcisf3d (ji,jj,jk) = zqhcisf3d (ji,jj,jk) + zqhcisf2d(ji,jj) * r1_hisf_tbl(ji,jj) * ralpha(ji,jj) * fse3t(ji,jj,jk) 
     393                  zqlatisf3d(ji,jj,jk) = zqlatisf3d(ji,jj,jk) + qisf     (ji,jj) * r1_hisf_tbl(ji,jj) * ralpha(ji,jj) * fse3t(ji,jj,jk) 
     394               END DO 
     395            END DO 
     396 
     397            CALL iom_put('fwfisf3d' , zfwfisf3d (:,:,:)) 
     398            CALL iom_put('qlatisf3d', zqlatisf3d(:,:,:)) 
     399            CALL iom_put('qhcisf3d' , zqhcisf3d (:,:,:)) 
     400            CALL iom_put('qhcisf'   , zqhcisf2d (:,:  )) 
     401 
     402            CALL wrk_dealloc( jpi,jpj,jpk, zfwfisf3d, zqhcisf3d, zqlatisf3d ) 
     403            CALL wrk_dealloc( jpi,jpj,     zqhcisf2d                        ) 
     404         END IF 
     405!============================================================================================================================================= 
    368406 
    369407         IF( kt == nit000 ) THEN                          !   set the forcing field at nit000 - 1    ! 
  • branches/UKMO/dev_r5518_GO6_package_XIOS_read/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/TRA/traadv.F90

    r6486 r7923  
    2626   USE cla             ! cross land advection      (cla_traadv     routine) 
    2727   USE ldftra_oce      ! lateral diffusion coefficient on tracers 
     28   USE trd_oce         ! trends: ocean variables 
     29   USE trdtra          ! trends manager: tracers  
    2830   ! 
    2931   USE in_out_manager  ! I/O manager 
     
    7981      INTEGER ::   jk   ! dummy loop index 
    8082      REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:,:) :: zun, zvn, zwn 
     83      REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:,:) ::   ztrdt, ztrds   ! 3D workspace 
    8184      !!---------------------------------------------------------------------- 
    8285      ! 
     
    120123      IF( ln_diaptr )   CALL dia_ptr( zvn )                                     ! diagnose the effective MSF  
    121124      ! 
    122     
     125      IF( l_trdtra )   THEN                    !* Save ta and sa trends 
     126         CALL wrk_alloc( jpi, jpj, jpk, ztrdt, ztrds ) 
     127         ztrdt(:,:,:) = tsa(:,:,:,jp_tem) 
     128         ztrds(:,:,:) = tsa(:,:,:,jp_sal) 
     129      ENDIF 
     130      ! 
    123131      SELECT CASE ( nadv )                            !==  compute advection trend and add it to general trend  ==! 
    124132      CASE ( 1 )   ;    CALL tra_adv_cen2   ( kt, nit000, 'TRA',         zun, zvn, zwn, tsb, tsn, tsa, jpts )   !  2nd order centered 
     
    151159      END SELECT 
    152160      ! 
     161      IF( l_trdtra )   THEN                      ! save the advective trends for further diagnostics 
     162         DO jk = 1, jpkm1 
     163            ztrdt(:,:,jk) = tsa(:,:,jk,jp_tem) - ztrdt(:,:,jk) 
     164            ztrds(:,:,jk) = tsa(:,:,jk,jp_sal) - ztrds(:,:,jk) 
     165         END DO 
     166         CALL trd_tra( kt, 'TRA', jp_tem, jptra_totad, ztrdt ) 
     167         CALL trd_tra( kt, 'TRA', jp_sal, jptra_totad, ztrds ) 
     168         CALL wrk_dealloc( jpi, jpj, jpk, ztrdt, ztrds ) 
     169      ENDIF 
    153170      !                                              ! print mean trends (used for debugging) 
    154171      IF(ln_ctl)   CALL prt_ctl( tab3d_1=tsa(:,:,:,jp_tem), clinfo1=' adv  - Ta: ', mask1=tmask,               & 
  • branches/UKMO/dev_r5518_GO6_package_XIOS_read/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/TRA/traadv_cen2.F90

    r6498 r7923  
    279279         END IF 
    280280         !                                 ! "Poleward" heat and salt transports (contribution of upstream fluxes) 
    281          IF( cdtype == 'TRA' .AND. ln_diaptr ) THEN   
    282            IF( jn == jp_tem )   htr_adv(:) = ptr_sj( zwy(:,:,:) ) 
    283            IF( jn == jp_sal )   str_adv(:) = ptr_sj( zwy(:,:,:) ) 
    284          ENDIF 
     281         IF( cdtype == 'TRA' .AND. ln_diaptr ) CALL dia_ptr_ohst_components( jn, 'adv', zwy(:,:,:) ) 
    285282         ! 
    286283      END DO 
  • branches/UKMO/dev_r5518_GO6_package_XIOS_read/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/TRA/traadv_eiv.F90

    r6487 r7923  
    2828   USE wrk_nemo        ! Memory Allocation 
    2929   USE timing          ! Timing 
     30   USE diaptr         ! Heat/Salt transport diagnostics 
     31   USE trddyn 
     32   USE trd_oce 
    3033 
    3134   IMPLICIT NONE 
     
    7881# endif   
    7982      REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:) :: zu_eiv, zv_eiv, zw_eiv, z2d 
     83      REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:,:) :: z3d, z3d_T 
    8084      !!---------------------------------------------------------------------- 
    8185      ! 
     
    8488# if defined key_diaeiv  
    8589      CALL wrk_alloc( jpi, jpj, zu_eiv, zv_eiv, zw_eiv, z2d ) 
     90      CALL wrk_alloc( jpi, jpj, jpk, z3d, z3d_T ) 
    8691# else 
    8792      CALL wrk_alloc( jpi, jpj, zu_eiv, zv_eiv, zw_eiv ) 
     
    160165         CALL iom_put( "voce_eiv", v_eiv )    ! j-eiv current 
    161166         CALL iom_put( "woce_eiv", w_eiv )    ! vert. eiv current 
    162          IF( iom_use('ueiv_heattr') ) THEN 
    163             zztmp = 0.5 * rau0 * rcp  
     167         IF( iom_use('weiv_masstr') ) THEN   ! vertical mass transport & its square value 
     168           z2d(:,:) = rau0 * e12t(:,:) 
     169           DO jk = 1, jpk 
     170              z3d(:,:,jk) = w_eiv(:,:,jk) * z2d(:,:) 
     171           END DO 
     172           CALL iom_put( "weiv_masstr" , z3d )   
     173         ENDIF 
     174         IF( iom_use("ueiv_masstr") .OR. iom_use("ueiv_heattr") .OR. iom_use('ueiv_heattr3d')        & 
     175                                    .OR. iom_use("ueiv_salttr") .OR. iom_use('ueiv_salttr3d') ) THEN 
     176            z3d(:,:,jpk) = 0.e0 
     177            z2d(:,:) = 0.e0 
     178            DO jk = 1, jpkm1 
     179               z3d(:,:,jk) = rau0 * u_eiv(:,:,jk) * e2u(:,:) * fse3u(:,:,jk) * umask(:,:,jk) 
     180               z2d(:,:) = z2d(:,:) + z3d(:,:,jk) 
     181            END DO 
     182            CALL iom_put( "ueiv_masstr", z3d )                  ! mass transport in i-direction 
     183         ENDIF 
     184 
     185         IF( iom_use('ueiv_heattr') .OR. iom_use('ueiv_heattr3d') ) THEN 
     186            zztmp = 0.5 * rcp  
    164187            z2d(:,:) = 0.e0  
    165             DO jk = 1, jpkm1 
    166                DO jj = 2, jpjm1 
    167                   DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
    168                      z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + u_eiv(ji,jj,jk) & 
    169                        &         * (tsn(ji,jj,jk,jp_tem)+tsn(ji+1,jj,jk,jp_tem)) * e2u(ji,jj) * fse3u(ji,jj,jk)  
    170                   END DO 
    171                END DO 
    172             END DO 
    173             CALL lbc_lnk( z2d, 'U', -1. ) 
    174             CALL iom_put( "ueiv_heattr", zztmp * z2d )                  ! heat transport in i-direction 
     188            z3d_T(:,:,:) = 0.e0  
     189            DO jk = 1, jpkm1 
     190               DO jj = 2, jpjm1 
     191                  DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
     192                     z3d_T(ji,jj,jk) = z3d(ji,jj,jk) * ( tsn(ji,jj,jk,jp_tem) + tsn(ji+1,jj,jk,jp_tem) ) 
     193                     z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + z3d_T(ji,jj,jk)  
     194                  END DO 
     195               END DO 
     196            END DO 
     197            IF (iom_use('ueiv_heattr') ) THEN 
     198               CALL lbc_lnk( z2d, 'U', -1. ) 
     199               CALL iom_put( "ueiv_heattr", zztmp * z2d )                  ! 2D heat transport in i-direction 
     200            ENDIF 
     201            IF (iom_use('ueiv_heattr3d') ) THEN 
     202               CALL lbc_lnk( z3d_T, 'U', -1. ) 
     203               CALL iom_put( "ueiv_heattr3d", zztmp * z3d_T )              ! 3D heat transport in i-direction 
     204            ENDIF 
     205         ENDIF 
     206 
     207         IF( iom_use('ueiv_salttr') .OR. iom_use('ueiv_salttr3d') ) THEN 
     208            zztmp = 0.5 * 0.001 
     209            z2d(:,:) = 0.e0  
     210            z3d_T(:,:,:) = 0.e0  
     211            DO jk = 1, jpkm1 
     212               DO jj = 2, jpjm1 
     213                  DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
     214                     z3d_T(ji,jj,jk) = z3d(ji,jj,jk) * ( tsn(ji,jj,jk,jp_sal) + tsn(ji+1,jj,jk,jp_sal) ) 
     215                     z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + z3d_T(ji,jj,jk)  
     216                  END DO 
     217               END DO 
     218            END DO 
     219            IF (iom_use('ueiv_salttr') ) THEN 
     220               CALL lbc_lnk( z2d, 'U', -1. ) 
     221               CALL iom_put( "ueiv_salttr", zztmp * z2d )                  ! 2D salt transport in i-direction 
     222            ENDIF 
     223            IF (iom_use('ueiv_salttr3d') ) THEN 
     224               CALL lbc_lnk( z3d_T, 'U', -1. ) 
     225               CALL iom_put( "ueiv_salttr3d", zztmp * z3d_T )              ! 3D salt transport in i-direction 
     226            ENDIF 
     227         ENDIF 
     228 
     229         IF( iom_use("veiv_masstr") .OR. iom_use("veiv_heattr") .OR. iom_use('veiv_heattr3d')       & 
     230                                    .OR. iom_use("veiv_salttr") .OR. iom_use('veiv_salttr3d') ) THEN 
     231            z3d(:,:,jpk) = 0.e0 
     232            DO jk = 1, jpkm1 
     233               z3d(:,:,jk) = rau0 * v_eiv(:,:,jk) * e1v(:,:) * fse3v(:,:,jk) * vmask(:,:,jk) 
     234            END DO 
     235            CALL iom_put( "veiv_masstr", z3d )                  ! mass transport in j-direction 
    175236         ENDIF 
    176237             
    177          IF( iom_use('veiv_heattr') ) THEN 
    178             zztmp = 0.5 * rau0 * rcp  
     238         IF( iom_use('veiv_heattr') .OR. iom_use('veiv_heattr3d') ) THEN 
     239            zztmp = 0.5 * rcp  
    179240            z2d(:,:) = 0.e0  
    180             DO jk = 1, jpkm1 
    181                DO jj = 2, jpjm1 
    182                   DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
    183                      z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + v_eiv(ji,jj,jk) & 
    184                      &           * (tsn(ji,jj,jk,jp_tem)+tsn(ji,jj+1,jk,jp_tem)) * e1v(ji,jj) * fse3v(ji,jj,jk)  
    185                   END DO 
    186                END DO 
    187             END DO 
    188             CALL lbc_lnk( z2d, 'V', -1. ) 
    189             CALL iom_put( "veiv_heattr", zztmp * z2d )                  !  heat transport in i-direction 
    190          ENDIF 
     241            z3d_T(:,:,:) = 0.e0  
     242            DO jk = 1, jpkm1 
     243               DO jj = 2, jpjm1 
     244                  DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
     245                     z3d_T(ji,jj,jk) = z3d(ji,jj,jk) * ( tsn(ji,jj,jk,jp_tem) + tsn(ji,jj+1,jk,jp_tem) ) 
     246                     z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + z3d_T(ji,jj,jk)  
     247                  END DO 
     248               END DO 
     249            END DO 
     250            IF (iom_use('veiv_heattr') ) THEN 
     251               CALL lbc_lnk( z2d, 'V', -1. ) 
     252               CALL iom_put( "veiv_heattr", zztmp * z2d )                  ! 2D heat transport in j-direction 
     253            ENDIF 
     254            IF (iom_use('veiv_heattr3d') ) THEN 
     255               CALL lbc_lnk( z3d_T, 'V', -1. ) 
     256               CALL iom_put( "veiv_heattr3d", zztmp * z3d_T )              ! 3D heat transport in j-direction 
     257            ENDIF 
     258         ENDIF 
     259 
     260         IF( iom_use('veiv_salttr') .OR. iom_use('veiv_salttr3d') ) THEN 
     261            zztmp = 0.5 * 0.001 
     262            z2d(:,:) = 0.e0  
     263            z3d_T(:,:,:) = 0.e0  
     264            DO jk = 1, jpkm1 
     265               DO jj = 2, jpjm1 
     266                  DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
     267                     z3d_T(ji,jj,jk) = z3d(ji,jj,jk) * ( tsn(ji,jj,jk,jp_sal) + tsn(ji,jj+1,jk,jp_sal) ) 
     268                     z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + z3d_T(ji,jj,jk) 
     269                  END DO 
     270               END DO 
     271            END DO 
     272            IF (iom_use('veiv_salttr') ) THEN 
     273               CALL lbc_lnk( z2d, 'V', -1. ) 
     274               CALL iom_put( "veiv_salttr", zztmp * z2d )                  ! 2D salt transport in i-direction 
     275            ENDIF 
     276            IF (iom_use('veiv_salttr3d') ) THEN 
     277               CALL lbc_lnk( z3d_T, 'V', -1. ) 
     278               CALL iom_put( "veiv_salttr3d", zztmp * z3d_T )              ! 3D salt transport in i-direction 
     279            ENDIF 
     280         ENDIF 
     281 
     282         IF( iom_use('weiv_masstr') .OR. iom_use('weiv_heattr3d') .OR. iom_use('weiv_salttr3d')) THEN   ! vertical mass transport & its square value 
     283           z2d(:,:) = rau0 * e12t(:,:) 
     284           DO jk = 1, jpk 
     285              z3d(:,:,jk) = w_eiv(:,:,jk) * z2d(:,:) 
     286           END DO 
     287           CALL iom_put( "weiv_masstr" , z3d )                  ! mass transport in k-direction 
     288         ENDIF 
     289 
     290         IF( iom_use('weiv_heattr3d') ) THEN 
     291            zztmp = 0.5 * rcp  
     292            DO jk = 1, jpkm1 
     293               DO jj = 2, jpjm1 
     294                  DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
     295                     z3d_T(ji,jj,jk) = z3d(ji,jj,jk) * ( tsn(ji,jj,jk,jp_tem) + tsn(ji,jj,jk+1,jp_tem) ) 
     296                  END DO 
     297               END DO 
     298            END DO 
     299            CALL lbc_lnk( z3d_T, 'T', 1. ) 
     300            CALL iom_put( "weiv_heattr3d", zztmp * z3d_T )                 ! 3D heat transport in k-direction 
     301         ENDIF 
     302 
     303         IF( iom_use('weiv_salttr3d') ) THEN 
     304            zztmp = 0.5 * 0.001  
     305            DO jk = 1, jpkm1 
     306               DO jj = 2, jpjm1 
     307                  DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
     308                     z3d_T(ji,jj,jk) = z3d(ji,jj,jk) * ( tsn(ji,jj,jk,jp_sal) + tsn(ji,jj,jk+1,jp_sal) ) 
     309                  END DO 
     310               END DO 
     311            END DO 
     312            CALL lbc_lnk( z3d_T, 'T', 1. ) 
     313            CALL iom_put( "weiv_salttr3d", zztmp * z3d_T )                 ! 3D salt transport in k-direction 
     314         ENDIF 
     315 
    191316    END IF 
     317! 
     318    IF( ln_diaptr .AND. cdtype == 'TRA' ) THEN 
     319       z3d(:,:,:) = 0._wp 
     320       DO jk = 1, jpkm1 
     321          DO jj = 2, jpjm1 
     322             DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
     323                z3d(ji,jj,jk) = v_eiv(ji,jj,jk) * 0.5 * (tsn(ji,jj,jk,jp_tem)+tsn(ji,jj+1,jk,jp_tem)) & 
     324                &             * e1v(ji,jj) * fse3v(ji,jj,jk) 
     325             END DO 
     326          END DO 
     327       END DO 
     328       CALL dia_ptr_ohst_components( jp_tem, 'eiv', z3d ) 
     329       z3d(:,:,:) = 0._wp 
     330       DO jk = 1, jpkm1 
     331          DO jj = 2, jpjm1 
     332             DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
     333                z3d(ji,jj,jk) = v_eiv(ji,jj,jk) * 0.5 * (tsn(ji,jj,jk,jp_sal)+tsn(ji,jj+1,jk,jp_sal)) & 
     334                &             * e1v(ji,jj) * fse3v(ji,jj,jk) 
     335             END DO 
     336          END DO 
     337       END DO 
     338       CALL dia_ptr_ohst_components( jp_sal, 'eiv', z3d ) 
     339    ENDIF 
     340 
     341    IF( ln_KE_trd ) CALL trd_dyn(u_eiv, v_eiv, jpdyn_eivke, kt ) 
    192342# endif   
    193       !  
     343 
    194344# if defined key_diaeiv  
    195345      CALL wrk_dealloc( jpi, jpj, zu_eiv, zv_eiv, zw_eiv, z2d ) 
     346      CALL wrk_dealloc( jpi, jpj, jpk, z3d, z3d_T ) 
    196347# else 
    197348      CALL wrk_dealloc( jpi, jpj, zu_eiv, zv_eiv, zw_eiv ) 
  • branches/UKMO/dev_r5518_GO6_package_XIOS_read/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/TRA/traadv_muscl.F90

    r6486 r7923  
    219219         END IF 
    220220         !                                 ! "Poleward" heat and salt transports (contribution of upstream fluxes) 
    221          IF( cdtype == 'TRA' .AND. ln_diaptr ) THEN   
    222             IF( jn == jp_tem )  htr_adv(:) = ptr_sj( zwy(:,:,:) ) 
    223             IF( jn == jp_sal )  str_adv(:) = ptr_sj( zwy(:,:,:) ) 
    224          ENDIF 
     221         IF( cdtype == 'TRA' .AND. ln_diaptr )  CALL dia_ptr_ohst_components( jn, 'adv', zwy(:,:,:)  ) 
    225222 
    226223         ! II. Vertical advective fluxes 
  • branches/UKMO/dev_r5518_GO6_package_XIOS_read/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/TRA/traadv_muscl2.F90

    r6486 r7923  
    200200 
    201201         !                                 ! "Poleward" heat and salt transports (contribution of upstream fluxes) 
    202          IF( cdtype == 'TRA' .AND. ln_diaptr ) THEN 
    203             IF( jn == jp_tem )  htr_adv(:) = ptr_sj( zwy(:,:,:) ) 
    204             IF( jn == jp_sal )  str_adv(:) = ptr_sj( zwy(:,:,:) ) 
    205          ENDIF 
     202         IF( cdtype == 'TRA' .AND. ln_diaptr ) CALL dia_ptr_ohst_components( jn, 'adv', zwy(:,:,:)  ) 
    206203 
    207204         ! II. Vertical advective fluxes 
  • branches/UKMO/dev_r5518_GO6_package_XIOS_read/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/TRA/traadv_qck.F90

    r6486 r7923  
    355355         IF( l_trd )   CALL trd_tra( kt, cdtype, jn, jptra_yad, zwy, pvn, ptn(:,:,:,jn) ) 
    356356         !                                 ! "Poleward" heat and salt transports (contribution of upstream fluxes) 
    357          IF( cdtype == 'TRA' .AND. ln_diaptr ) THEN   
    358            IF( jn == jp_tem )  htr_adv(:) = ptr_sj( zwy(:,:,:) ) 
    359            IF( jn == jp_sal )  str_adv(:) = ptr_sj( zwy(:,:,:) ) 
    360          ENDIF 
     357         IF( cdtype == 'TRA' .AND. ln_diaptr )  CALL dia_ptr_ohst_components( jn, 'adv', zwy(:,:,:) ) 
    361358         ! 
    362359      END DO 
  • branches/UKMO/dev_r5518_GO6_package_XIOS_read/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/TRA/traadv_tvd.F90

    r6795 r7923  
    3434   USE timing         ! Timing 
    3535   USE lib_fortran    ! Fortran utilities (allows no signed zero when 'key_nosignedzero' defined)   
     36   USE iom 
    3637 
    3738   IMPLICIT NONE 
     
    4243 
    4344   LOGICAL ::   l_trd   ! flag to compute trends 
     45   LOGICAL ::   l_trans   ! flag to output vertically integrated transports 
    4446 
    4547   !! * Substitutions 
     
    8587      REAL(wp) ::   zfm_ui, zfm_vj, zfm_wk   !   -      - 
    8688      REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:,:) :: zwi, zwz 
    87       REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:,:) :: ztrdx, ztrdy, ztrdz 
     89      REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:,:) :: ztrdx, ztrdy, ztrdz, zptry 
     90      REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:)   :: z2d 
    8891      !!---------------------------------------------------------------------- 
    8992      ! 
     
    97100         IF(lwp) WRITE(numout,*) '~~~~~~~~~~~' 
    98101         ! 
    99          l_trd = .FALSE. 
    100          IF( ( cdtype == 'TRA' .AND. l_trdtra ) .OR. ( cdtype == 'TRC' .AND. l_trdtrc ) ) l_trd = .TRUE. 
    101102      ENDIF 
    102       ! 
    103       IF( l_trd )  THEN 
     103      l_trd = .FALSE. 
     104      l_trans = .FALSE. 
     105      IF( ( cdtype == 'TRA' .AND. l_trdtra ) .OR. ( cdtype == 'TRC' .AND. l_trdtrc ) ) l_trd = .TRUE. 
     106      IF( cdtype == 'TRA' .AND. (iom_use("uadv_heattr") .OR. iom_use("vadv_heattr") ) ) l_trans = .TRUE. 
     107      ! 
     108      IF( l_trd .OR. l_trans )  THEN 
    104109         CALL wrk_alloc( jpi, jpj, jpk, ztrdx, ztrdy, ztrdz ) 
    105110         ztrdx(:,:,:) = 0.e0   ;    ztrdy(:,:,:) = 0.e0   ;   ztrdz(:,:,:) = 0.e0 
     111         CALL wrk_alloc( jpi, jpj, z2d ) 
     112      ENDIF 
     113      ! 
     114      IF( cdtype == 'TRA' .AND. ln_diaptr ) THEN   
     115         CALL wrk_alloc( jpi, jpj, jpk, zptry ) 
     116         zptry(:,:,:) = 0._wp 
    106117      ENDIF 
    107118      ! 
     
    187198 
    188199         !                                 ! trend diagnostics (contribution of upstream fluxes) 
    189          IF( l_trd )  THEN  
     200         IF( l_trd .OR. l_trans )  THEN  
    190201            ! store intermediate advective trends 
    191202            ztrdx(:,:,:) = zwx(:,:,:)   ;    ztrdy(:,:,:) = zwy(:,:,:)  ;   ztrdz(:,:,:) = zwz(:,:,:) 
    192203         END IF 
    193204         !                                 ! "Poleward" heat and salt transports (contribution of upstream fluxes) 
    194          IF( cdtype == 'TRA' .AND. ln_diaptr ) THEN   
    195            IF( jn == jp_tem )  htr_adv(:) = ptr_sj( zwy(:,:,:) ) 
    196            IF( jn == jp_sal )  str_adv(:) = ptr_sj( zwy(:,:,:) ) 
    197          ENDIF 
     205         IF( cdtype == 'TRA' .AND. ln_diaptr )    zptry(:,:,:) = zwy(:,:,:)  
    198206 
    199207         ! 3. antidiffusive flux : high order minus low order 
     
    253261 
    254262         !                                 ! trend diagnostics (contribution of upstream fluxes) 
    255          IF( l_trd )  THEN  
     263         IF( l_trd .OR. l_trans )  THEN  
    256264            ztrdx(:,:,:) = ztrdx(:,:,:) + zwx(:,:,:)  ! <<< Add to previously computed 
    257265            ztrdy(:,:,:) = ztrdy(:,:,:) + zwy(:,:,:)  ! <<< Add to previously computed 
    258266            ztrdz(:,:,:) = ztrdz(:,:,:) + zwz(:,:,:)  ! <<< Add to previously computed 
    259              
    260             CALL trd_tra( kt, cdtype, jn, jptra_xad, ztrdx, pun, ptn(:,:,:,jn) )    
    261             CALL trd_tra( kt, cdtype, jn, jptra_yad, ztrdy, pvn, ptn(:,:,:,jn) )   
    262             CALL trd_tra( kt, cdtype, jn, jptra_zad, ztrdz, pwn, ptn(:,:,:,jn) )  
     267         ENDIF 
     268          
     269         IF( l_trd ) THEN  
     270            CALL trd_tra( kt, cdtype, jn, jptra_xad, ztrdx, pun, ptn(:,:,:,jn) ) 
     271            CALL trd_tra( kt, cdtype, jn, jptra_yad, ztrdy, pvn, ptn(:,:,:,jn) ) 
     272            CALL trd_tra( kt, cdtype, jn, jptra_zad, ztrdz, pwn, ptn(:,:,:,jn) ) 
    263273         END IF 
    264          !                                 ! "Poleward" heat and salt transports (contribution of upstream fluxes) 
     274 
     275         IF( l_trans .AND. jn==jp_tem ) THEN 
     276            z2d(:,:) = 0._wp  
     277            DO jk = 1, jpkm1 
     278               DO jj = 2, jpjm1 
     279                  DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
     280                     z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + ztrdx(ji,jj,jk)  
     281                  END DO 
     282               END DO 
     283            END DO 
     284            CALL lbc_lnk( z2d, 'U', -1. ) 
     285            CALL iom_put( "uadv_heattr", rau0_rcp * z2d )       ! heat transport in i-direction 
     286              ! 
     287            z2d(:,:) = 0._wp  
     288            DO jk = 1, jpkm1 
     289               DO jj = 2, jpjm1 
     290                  DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
     291                     z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + ztrdy(ji,jj,jk)  
     292                  END DO 
     293               END DO 
     294            END DO 
     295            CALL lbc_lnk( z2d, 'V', -1. ) 
     296            CALL iom_put( "vadv_heattr", rau0_rcp * z2d )       ! heat transport in j-direction 
     297         ENDIF 
     298         ! "Poleward" heat and salt transports (contribution of upstream fluxes) 
    265299         IF( cdtype == 'TRA' .AND. ln_diaptr ) THEN   
    266            IF( jn == jp_tem )  htr_adv(:) = ptr_sj( zwy(:,:,:) ) + htr_adv(:) 
    267            IF( jn == jp_sal )  str_adv(:) = ptr_sj( zwy(:,:,:) ) + str_adv(:) 
     300            zptry(:,:,:) = zptry(:,:,:) + zwy(:,:,:)  ! <<< Add to previously computed 
     301            CALL dia_ptr_ohst_components( jn, 'adv', zptry(:,:,:) ) 
    268302         ENDIF 
    269303         ! 
    270304      END DO 
    271305      ! 
    272                    CALL wrk_dealloc( jpi, jpj, jpk, zwi, zwz ) 
    273       IF( l_trd )  CALL wrk_dealloc( jpi, jpj, jpk, ztrdx, ztrdy, ztrdz ) 
     306      CALL wrk_dealloc( jpi, jpj, jpk, zwi, zwz ) 
     307      IF( l_trd .OR. l_trans )  THEN  
     308         CALL wrk_dealloc( jpi, jpj, jpk, ztrdx, ztrdy, ztrdz ) 
     309         CALL wrk_dealloc( jpi, jpj, z2d ) 
     310      ENDIF 
     311      IF( cdtype == 'TRA' .AND. ln_diaptr ) CALL wrk_dealloc( jpi, jpj, jpk, zptry ) 
    274312      ! 
    275313      IF( nn_timing == 1 )  CALL timing_stop('tra_adv_tvd') 
     
    318356      REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:,:) :: zwi, zwz, zhdiv, zwz_sav, zwzts 
    319357      REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:,:) :: ztrdx, ztrdy, ztrdz 
     358      REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:,:) :: zptry 
    320359      REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:,:,:) :: ztrs 
    321360      !!---------------------------------------------------------------------- 
     
    339378         CALL wrk_alloc( jpi, jpj, jpk, ztrdx, ztrdy, ztrdz ) 
    340379         ztrdx(:,:,:) = 0._wp  ;    ztrdy(:,:,:) = 0._wp  ;   ztrdz(:,:,:) = 0._wp 
     380      ENDIF 
     381      ! 
     382      IF( cdtype == 'TRA' .AND. ln_diaptr ) THEN   
     383         CALL wrk_alloc( jpi, jpj,jpk, zptry ) 
     384         zptry(:,:,:) = 0._wp 
    341385      ENDIF 
    342386      ! 
     
    428472         END IF 
    429473         !                                 ! "Poleward" heat and salt transports (contribution of upstream fluxes) 
    430          IF( cdtype == 'TRA' .AND. ln_diaptr ) THEN   
    431            IF( jn == jp_tem )  htr_adv(:) = ptr_sj( zwy(:,:,:) ) 
    432            IF( jn == jp_sal )  str_adv(:) = ptr_sj( zwy(:,:,:) ) 
    433          ENDIF 
     474         IF( cdtype == 'TRA' .AND. ln_diaptr )  zptry(:,:,:) = zwy(:,:,:) 
    434475 
    435476         ! 3. antidiffusive flux : high order minus low order 
     
    556597         !                                 ! "Poleward" heat and salt transports (contribution of upstream fluxes) 
    557598         IF( cdtype == 'TRA' .AND. ln_diaptr ) THEN   
    558            IF( jn == jp_tem )  htr_adv(:) = ptr_sj( zwy(:,:,:) ) + htr_adv(:) 
    559            IF( jn == jp_sal )  str_adv(:) = ptr_sj( zwy(:,:,:) ) + str_adv(:) 
     599            zptry(:,:,:) = zptry(:,:,:) + zwy(:,:,:)  
     600            CALL dia_ptr_ohst_components( jn, 'adv', zptry(:,:,:) ) 
    560601         ENDIF 
    561602         ! 
     
    566607                   CALL wrk_dealloc( jpi, jpj, zwx_sav, zwy_sav ) 
    567608      IF( l_trd )  CALL wrk_dealloc( jpi, jpj, jpk, ztrdx, ztrdy, ztrdz ) 
     609      IF( cdtype == 'TRA' .AND. ln_diaptr ) CALL wrk_dealloc( jpi, jpj, jpk, zptry ) 
    568610      ! 
    569611      IF( nn_timing == 1 )  CALL timing_stop('tra_adv_tvd_zts') 
  • branches/UKMO/dev_r5518_GO6_package_XIOS_read/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/TRA/traadv_ubs.F90

    r6486 r7923  
    177177         END IF 
    178178         !                                 ! "Poleward" heat and salt transports (contribution of upstream fluxes) 
    179          IF( cdtype == 'TRA' .AND. ln_diaptr ) THEN   
    180             IF( jn == jp_tem )  htr_adv(:) = ptr_sj( ztv(:,:,:) ) 
    181             IF( jn == jp_sal )  str_adv(:) = ptr_sj( ztv(:,:,:) ) 
    182          ENDIF 
     179         IF( cdtype == 'TRA' .AND. ln_diaptr ) CALL dia_ptr_ohst_components( jn, 'adv', ztv(:,:,:) ) 
    183180          
    184181         ! TVD scheme for the vertical direction   
  • branches/UKMO/dev_r5518_GO6_package_XIOS_read/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/TRA/traldf_bilap.F90

    r6486 r7923  
    173173         !                                                 
    174174         ! "zonal" mean lateral diffusive heat and salt transport 
    175          IF( cdtype == 'TRA' .AND. ln_diaptr ) THEN   
    176            IF( jn == jp_tem )  htr_ldf(:) = ptr_sj( ztv(:,:,:) ) 
    177            IF( jn == jp_sal )  str_ldf(:) = ptr_sj( ztv(:,:,:) ) 
    178          ENDIF 
     175         IF( cdtype == 'TRA' .AND. ln_diaptr )   CALL dia_ptr_ohst_components( jn, 'ldf', ztv(:,:,:) ) 
    179176         !                                                ! =========== 
    180177      END DO                                              ! tracer loop 
  • branches/UKMO/dev_r5518_GO6_package_XIOS_read/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/TRA/traldf_bilapg.F90

    r6486 r7923  
    247247         !                                                ! =============== 
    248248         ! "Poleward" diffusive heat or salt transport 
    249          IF( cdtype == 'TRA' .AND. ln_diaptr .AND. ( kaht == 2 ) ) THEN 
    250             ! note sign is reversed to give down-gradient diffusive transports (#1043) 
    251             IF( jn == jp_tem)   htr_ldf(:) = ptr_sj( -zftv(:,:,:) ) 
    252             IF( jn == jp_sal)   str_ldf(:) = ptr_sj( -zftv(:,:,:) ) 
    253          ENDIF 
     249        ! note sign is reversed to give down-gradient diffusive transports (#1043) 
     250         IF( cdtype == 'TRA' .AND. ln_diaptr .AND. ( kaht == 2 ) ) CALL dia_ptr_ohst_components( jn, 'ldf', -zftv(:,:,:) ) 
    254251 
    255252         !                             ! ************ !   ! =============== 
  • branches/UKMO/dev_r5518_GO6_package_XIOS_read/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/TRA/traldf_iso.F90

    r6486 r7923  
    2626   USE ldfslp          ! iso-neutral slopes 
    2727   USE diaptr          ! poleward transport diagnostics 
     28   USE trd_oce         ! trends: ocean variables 
     29   USE trdtra          ! trends manager: tracers  
    2830   USE in_out_manager  ! I/O manager 
    2931   USE iom             ! I/O library 
     
    105107      INTEGER  ::  ji, jj, jk, jn   ! dummy loop indices 
    106108      INTEGER  ::  ikt 
    107       REAL(wp) ::  zmsku, zabe1, zcof1, zcoef3   ! local scalars 
    108       REAL(wp) ::  zmskv, zabe2, zcof2, zcoef4   !   -      - 
    109       REAL(wp) ::  zcoef0, zbtr, ztra            !   -      - 
     109      REAL(wp) ::  zmsku, zabe1, zcof1, zcoef3       ! local scalars 
     110      REAL(wp) ::  zmskv, zabe2, zcof2, zcoef4       !   -      - 
     111      REAL(wp) ::  zcoef0, zbtr                      !   -      - 
    110112      REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:  ) ::  z2d 
    111113      REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:,:) ::  zdkt, zdk1t, zdit, zdjt, ztfw  
     114      REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:,:), TARGET ::  ztrax, ztray, ztraz  
     115      REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:,:), TARGET ::  ztrax_T, ztray_T, ztraz_T 
    112116      !!---------------------------------------------------------------------- 
    113117      ! 
     
    115119      ! 
    116120      CALL wrk_alloc( jpi, jpj,      z2d )  
    117       CALL wrk_alloc( jpi, jpj, jpk, zdit, zdjt, ztfw, zdkt, zdk1t )  
     121      CALL wrk_alloc( jpi, jpj, jpk, zdit, zdjt, ztfw, zdkt, zdk1t)  
     122      ALLOCATE( ztrax(jpi,jpj,jpk), ztray(jpi,jpj,jpk), ztraz(jpi,jpj,jpk) )  
     123      IF( l_trdtra .and. cdtype == 'TRA' ) ALLOCATE( ztrax_T(jpi,jpj,jpk), ztray_T(jpi,jpj,jpk), ztraz_T(jpi,jpj,jpk) )  
    118124      ! 
    119125 
     
    127133      DO jn = 1, kjpt                                            ! tracer loop 
    128134         !                                                       ! =========== 
     135         ztrax(:,:,:) = 0._wp ; ztray(:,:,:) = 0._wp ; ztraz(:,:,:) = 0._wp ;  
    129136         !                                                
    130137         !!---------------------------------------------------------------------- 
     
    226233               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
    227234                  zbtr = 1.0 / ( e12t(ji,jj) * fse3t_n(ji,jj,jk) ) 
    228                   ztra = zbtr * ( zftu(ji,jj,jk) - zftu(ji-1,jj,jk) + zftv(ji,jj,jk) - zftv(ji,jj-1,jk) ) 
    229                   pta(ji,jj,jk,jn) = pta(ji,jj,jk,jn) + ztra 
     235                  ztrax(ji,jj,jk) = zbtr * ( zftu(ji,jj,jk) - zftu(ji-1,jj,jk) ) 
     236                  ztray(ji,jj,jk) = zbtr * ( zftv(ji,jj,jk) - zftv(ji,jj-1,jk) ) 
    230237               END DO 
    231238            END DO 
     
    234241         !                                             ! =============== 
    235242         ! 
     243         pta(:,:,:,jn) = pta(:,:,:,jn) + ztrax(:,:,:) + ztray(:,:,:) 
     244         ! 
    236245         ! "Poleward" diffusive heat or salt transports (T-S case only) 
    237          IF( cdtype == 'TRA' .AND. ln_diaptr ) THEN 
    238246            ! note sign is reversed to give down-gradient diffusive transports (#1043) 
    239             IF( jn == jp_tem)   htr_ldf(:) = ptr_sj( -zftv(:,:,:) ) 
    240             IF( jn == jp_sal)   str_ldf(:) = ptr_sj( -zftv(:,:,:) ) 
    241          ENDIF 
     247         IF( cdtype == 'TRA' .AND. ln_diaptr ) CALL dia_ptr_ohst_components( jn, 'ldf', -zftv(:,:,:)  ) 
    242248  
    243249         IF( iom_use("udiff_heattr") .OR. iom_use("vdiff_heattr") ) THEN 
     
    314320               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
    315321                  zbtr = 1.0 / ( e12t(ji,jj) * fse3t_n(ji,jj,jk) ) 
    316                   ztra = (  ztfw(ji,jj,jk) - ztfw(ji,jj,jk+1)  ) * zbtr 
    317                   pta(ji,jj,jk,jn) = pta(ji,jj,jk,jn) + ztra 
     322                  ztraz(ji,jj,jk) = (  ztfw(ji,jj,jk) - ztfw(ji,jj,jk+1)  ) * zbtr 
    318323               END DO 
    319324            END DO 
    320325         END DO 
     326         pta(:,:,:,jn) = pta(:,:,:,jn) + ztraz(:,:,:) 
    321327         ! 
     328         IF( l_trdtra .AND. cdtype == "TRA" .AND. jn .eq. 1 )  THEN      ! save the temperature trends 
     329            ztrax_T(:,:,:) = ztrax(:,:,:) 
     330            ztray_T(:,:,:) = ztray(:,:,:) 
     331            ztraz_T(:,:,:) = ztraz(:,:,:) 
     332         ENDIF 
     333         IF( l_trdtrc .AND. cdtype == "TRC" )   THEN      ! save the horizontal component of diffusive trends for further diagnostics 
     334            CALL trd_tra( kt, cdtype, jn, jptra_iso_x, ztrax ) 
     335            CALL trd_tra( kt, cdtype, jn, jptra_iso_y, ztray )  
     336            CALL trd_tra( kt, cdtype, jn, jptra_iso_z1, ztraz )  ! This is the first part of the vertical component. 
     337         ENDIF 
    322338      END DO 
     339      ! 
     340      IF( l_trdtra .AND. cdtype == "TRA" )   THEN      ! save the horizontal component of diffusive trends for further diagnostics 
     341         CALL trd_tra( kt, cdtype, jp_tem, jptra_iso_x, ztrax_T ) 
     342         CALL trd_tra( kt, cdtype, jp_sal, jptra_iso_x, ztrax ) 
     343         CALL trd_tra( kt, cdtype, jp_tem, jptra_iso_y, ztray_T ) 
     344         CALL trd_tra( kt, cdtype, jp_sal, jptra_iso_y, ztray ) 
     345         CALL trd_tra( kt, cdtype, jp_tem, jptra_iso_z1, ztraz_T )  ! This is the first part of the vertical component 
     346         CALL trd_tra( kt, cdtype, jp_sal, jptra_iso_z1, ztraz )    ! 
     347      ENDIF 
    323348      ! 
    324349      CALL wrk_dealloc( jpi, jpj, z2d )  
    325350      CALL wrk_dealloc( jpi, jpj, jpk, zdit, zdjt, ztfw, zdkt, zdk1t )  
     351      DEALLOCATE( ztrax, ztray, ztraz )  
     352      IF( l_trdtra  .and. cdtype == 'TRA' ) DEALLOCATE( ztrax_T, ztray_T, ztraz_T )  
    326353      ! 
    327354      IF( nn_timing == 1 )  CALL timing_stop('tra_ldf_iso') 
  • branches/UKMO/dev_r5518_GO6_package_XIOS_read/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/TRA/traldf_iso_grif.F90

    r6486 r7923  
    386386         ! 
    387387         !                             ! "Poleward" diffusive heat or salt transports (T-S case only) 
    388          IF( cdtype == 'TRA' .AND. ln_diaptr ) THEN 
    389             IF( jn == jp_tem)   htr_ldf(:) = ptr_sj( zftv(:,:,:) )        ! 3.3  names 
    390             IF( jn == jp_sal)   str_ldf(:) = ptr_sj( zftv(:,:,:) ) 
    391          ENDIF 
     388         IF( cdtype == 'TRA' .AND. ln_diaptr )  CALL dia_ptr_ohst_components( jn, 'ldf', zftv(:,:,:) ) 
    392389 
    393390         IF( iom_use("udiff_heattr") .OR. iom_use("vdiff_heattr") ) THEN 
  • branches/UKMO/dev_r5518_GO6_package_XIOS_read/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/TRA/traldf_lap.F90

    r6486 r7923  
    154154         ! 
    155155         ! "Poleward" diffusive heat or salt transports 
    156          IF( cdtype == 'TRA' .AND. ln_diaptr ) THEN 
    157             IF( jn  == jp_tem)   htr_ldf(:) = ptr_sj( ztv(:,:,:) ) 
    158             IF( jn  == jp_sal)   str_ldf(:) = ptr_sj( ztv(:,:,:) ) 
    159          ENDIF 
     156         IF( cdtype == 'TRA' .AND. ln_diaptr )    CALL dia_ptr_ohst_components( jn, 'ldf', ztv(:,:,:) ) 
    160157         !                                                  ! ================== 
    161158      END DO                                                ! end of tracer loop 
  • branches/UKMO/dev_r5518_GO6_package_XIOS_read/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/TRA/tranxt.F90

    r6487 r7923  
    127127 
    128128      ! trends computation initialisation 
    129       IF( l_trdtra )   THEN                    ! store now fields before applying the Asselin filter 
     129      IF( l_trdtra )   THEN                     
    130130         CALL wrk_alloc( jpi, jpj, jpk, ztrdt, ztrds ) 
    131          ztrdt(:,:,:) = tsn(:,:,:,jp_tem)  
    132          ztrds(:,:,:) = tsn(:,:,:,jp_sal) 
     131         ztrdt(:,:,jpk) = 0._wp 
     132         ztrds(:,:,jpk) = 0._wp 
    133133         IF( ln_traldf_iso ) THEN              ! diagnose the "pure" Kz diffusive trend  
    134134            CALL trd_tra( kt, 'TRA', jp_tem, jptra_zdfp, ztrdt ) 
    135135            CALL trd_tra( kt, 'TRA', jp_sal, jptra_zdfp, ztrds ) 
    136136         ENDIF 
     137         ! total trend for the non-time-filtered variables.  
     138         DO jk = 1, jpkm1 
     139            zfact = 1.0 / rdttra(jk) 
     140            ztrdt(:,:,jk) = ( tsa(:,:,jk,jp_tem) - tsn(:,:,jk,jp_tem) ) * zfact  
     141            ztrds(:,:,jk) = ( tsa(:,:,jk,jp_sal) - tsn(:,:,jk,jp_sal) ) * zfact  
     142         END DO 
     143         CALL trd_tra( kt, 'TRA', jp_tem, jptra_tot, ztrdt ) 
     144         CALL trd_tra( kt, 'TRA', jp_sal, jptra_tot, ztrds ) 
     145         ! Store now fields before applying the Asselin filter  
     146         ! in order to calculate Asselin filter trend later. 
     147         ztrdt(:,:,:) = tsn(:,:,:,jp_tem)  
     148         ztrds(:,:,:) = tsn(:,:,:,jp_sal) 
    137149      ENDIF 
    138150 
  • branches/UKMO/dev_r5518_GO6_package_XIOS_read/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/TRD/trd_oce.F90

    r6486 r7923  
    3333# endif 
    3434   !                                                  !!!* Active tracers trends indexes 
    35    INTEGER, PUBLIC, PARAMETER ::   jptot_tra  = 14     !: Total trend nb: change it when adding/removing one indice below 
     35   INTEGER, PUBLIC, PARAMETER ::   jptot_tra  = 20     !: Total trend nb: change it when adding/removing one indice below 
    3636   !                               ===============     !   
    3737   INTEGER, PUBLIC, PARAMETER ::   jptra_xad  =  1     !: x- horizontal advection 
     
    3939   INTEGER, PUBLIC, PARAMETER ::   jptra_zad  =  3     !: z- vertical   advection 
    4040   INTEGER, PUBLIC, PARAMETER ::   jptra_sad  =  4     !: z- vertical   advection 
    41    INTEGER, PUBLIC, PARAMETER ::   jptra_ldf  =  5     !: lateral       diffusion 
    42    INTEGER, PUBLIC, PARAMETER ::   jptra_zdf  =  6     !: vertical      diffusion 
    43    INTEGER, PUBLIC, PARAMETER ::   jptra_zdfp =  7     !: "PURE" vert.  diffusion (ln_traldf_iso=T) 
    44    INTEGER, PUBLIC, PARAMETER ::   jptra_bbc  =  8     !: Bottom Boundary Condition (geoth. heating)  
    45    INTEGER, PUBLIC, PARAMETER ::   jptra_bbl  =  9     !: Bottom Boundary Layer (diffusive and/or advective) 
    46    INTEGER, PUBLIC, PARAMETER ::   jptra_npc  = 10     !: non-penetrative convection treatment 
    47    INTEGER, PUBLIC, PARAMETER ::   jptra_dmp  = 11     !: internal restoring (damping) 
    48    INTEGER, PUBLIC, PARAMETER ::   jptra_qsr  = 12     !: penetrative solar radiation 
    49    INTEGER, PUBLIC, PARAMETER ::   jptra_nsr  = 13     !: non solar radiation / C/D on salinity  (+runoff if ln_rnf=T) 
    50    INTEGER, PUBLIC, PARAMETER ::   jptra_atf  = 14     !: Asselin time filter 
     41   INTEGER, PUBLIC, PARAMETER ::   jptra_totad  =  5   !: total         advection 
     42   INTEGER, PUBLIC, PARAMETER ::   jptra_ldf  =  6     !: lateral       diffusion 
     43   INTEGER, PUBLIC, PARAMETER ::   jptra_iso_x  =  7   !: x-component of isopycnal diffusion 
     44   INTEGER, PUBLIC, PARAMETER ::   jptra_iso_y  =  8   !: y-component of isopycnal diffusion 
     45   INTEGER, PUBLIC, PARAMETER ::   jptra_iso_z1 =  9   !: z-component of isopycnal diffusion 
     46   INTEGER, PUBLIC, PARAMETER ::   jptra_zdf  = 10     !: vertical      diffusion 
     47   INTEGER, PUBLIC, PARAMETER ::   jptra_zdfp = 11     !: "PURE" vert.  diffusion (ln_traldf_iso=T) 
     48   INTEGER, PUBLIC, PARAMETER ::   jptra_evd  = 12     !: EVD term (convection) 
     49   INTEGER, PUBLIC, PARAMETER ::   jptra_bbc  = 13     !: Bottom Boundary Condition (geoth. heating)  
     50   INTEGER, PUBLIC, PARAMETER ::   jptra_bbl  = 14     !: Bottom Boundary Layer (diffusive and/or advective) 
     51   INTEGER, PUBLIC, PARAMETER ::   jptra_npc  = 15     !: non-penetrative convection treatment 
     52   INTEGER, PUBLIC, PARAMETER ::   jptra_dmp  = 16     !: internal restoring (damping) 
     53   INTEGER, PUBLIC, PARAMETER ::   jptra_qsr  = 17     !: penetrative solar radiation 
     54   INTEGER, PUBLIC, PARAMETER ::   jptra_nsr  = 18     !: non solar radiation / C/D on salinity  (+runoff if ln_rnf=T) 
     55   INTEGER, PUBLIC, PARAMETER ::   jptra_atf  = 19     !: Asselin time filter 
     56   INTEGER, PUBLIC, PARAMETER ::   jptra_tot  = 20     !: Model total trend 
    5157   ! 
    5258   !                                                  !!!* Passive tracers trends indices (use if "key_top" defined) 
    53    INTEGER, PUBLIC, PARAMETER ::   jptra_sms  = 15     !: sources m. sinks 
    54    INTEGER, PUBLIC, PARAMETER ::   jptra_radn = 16     !: corr. trn<0 in trcrad 
    55    INTEGER, PUBLIC, PARAMETER ::   jptra_radb = 17     !: corr. trb<0 in trcrad (like atf) 
     59   INTEGER, PUBLIC, PARAMETER ::   jptra_sms  = 19     !: sources m. sinks 
     60   INTEGER, PUBLIC, PARAMETER ::   jptra_radn = 20     !: corr. trn<0 in trcrad 
     61   INTEGER, PUBLIC, PARAMETER ::   jptra_radb = 21     !: corr. trb<0 in trcrad (like atf) 
    5662   ! 
    5763   !                                                  !!!* Momentum trends indices 
    58    INTEGER, PUBLIC, PARAMETER ::   jptot_dyn  = 15     !: Total trend nb: change it when adding/removing one indice below 
     64   INTEGER, PUBLIC, PARAMETER ::   jptot_dyn  = 16     !: Total trend nb: change it when adding/removing one indice below 
    5965   !                               ===============     !   
    6066   INTEGER, PUBLIC, PARAMETER ::   jpdyn_hpg  =  1     !: hydrostatic pressure gradient  
     
    7379   INTEGER, PUBLIC, PARAMETER ::   jpdyn_spgflt  = 14  !: filter contribution to surface pressure gradient (spg_flt) 
    7480   INTEGER, PUBLIC, PARAMETER ::   jpdyn_spgexp  = 15  !: explicit contribution to surface pressure gradient (spg_flt) 
     81   INTEGER, PUBLIC, PARAMETER ::   jpdyn_eivke   = 16  !: K.E trend from Gent McWilliams scheme 
    7582   ! 
    7683   !!---------------------------------------------------------------------- 
  • branches/UKMO/dev_r5518_GO6_package_XIOS_read/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/TRD/trdini.F90

    r6486 r7923  
    9191!!gm end 
    9292      ! 
    93       IF( lk_vvl .AND. ( l_trdtra .OR. l_trddyn ) )  CALL ctl_stop( 'trend diagnostics with variable volume not validated' ) 
    9493       
    9594!!gm  : Potential BUG : 3D output only for vector invariant form!  add a ctl_stop or code the flux form case 
  • branches/UKMO/dev_r5518_GO6_package_XIOS_read/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/TRD/trdken.F90

    r6487 r7923  
    2727   USE lib_mpp        ! MPP library 
    2828   USE wrk_nemo       ! Memory allocation 
     29   USE ldfslp         ! Isopycnal slopes 
    2930 
    3031   IMPLICIT NONE 
     
    4243#  include "domzgr_substitute.h90" 
    4344#  include "vectopt_loop_substitute.h90" 
     45#  include "ldfeiv_substitute.h90" 
     46 
    4447   !!---------------------------------------------------------------------- 
    4548   !! NEMO/OPA 3.3 , NEMO Consortium (2010) 
     
    192195                    CALL ken_p2k( kt , zke ) 
    193196                      CALL iom_put( "ketrd_convP2K", zke )     ! conversion -rau*g*w 
     197        CASE( jpdyn_eivke ) 
     198            ! CMIP6 diagnostic tknebto = tendency of KE from 
     199            ! parameterized mesoscale eddy advection 
     200            ! = vertical_integral( k (N S)^2 ) rho dz 
     201            ! rho = reference density 
     202            ! S = isoneutral slope. 
     203            ! Most terms are on W grid so work on this grid 
     204            CALL wrk_alloc( jpi, jpj, zke2d ) 
     205            zke2d(:,:) = 0._wp 
     206            DO jk = 1,jpk 
     207               DO ji = 1,jpi 
     208                  DO jj = 1,jpj 
     209                     zke2d(ji,jj) = zke2d(ji,jj) +  rau0 * fsaeiw(ji, jj, jk)               & 
     210                          &                      * ( wslpi(ji, jj, jk) * wslpi(ji,jj,jk)    & 
     211                          &                      +   wslpj(ji, jj, jk) * wslpj(ji,jj,jk) )  & 
     212                          &                      *   rn2(ji,jj,jk) * fse3w(ji, jj, jk) 
     213                  ENDDO 
     214               ENDDO 
     215            ENDDO 
     216            CALL iom_put("ketrd_eiv", zke2d) 
     217            CALL wrk_dealloc( jpi, jpj, zke2d ) 
    194218         ! 
    195219      END SELECT 
  • branches/UKMO/dev_r5518_GO6_package_XIOS_read/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/TRD/trdpen.F90

    r6487 r7923  
    150150      rab_pe(:,:,:,:) = 0._wp 
    151151      ! 
    152       IF ( lk_vvl               )   CALL ctl_stop('trd_pen_init : PE trends not coded for variable volume') 
     152!      IF ( lk_vvl               )   CALL ctl_stop('trd_pen_init : PE trends not coded for variable volume') 
    153153      ! 
    154154      nkstp     = nit000 - 1 
  • branches/UKMO/dev_r5518_GO6_package_XIOS_read/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/TRD/trdtra.F90

    r6486 r7923  
    3838   REAL(wp) ::   r2dt   ! time-step, = 2 rdttra except at nit000 (=rdttra) if neuler=0 
    3939 
    40    REAL(wp), ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:) ::   trdtx, trdty, trdt   ! use to store the temperature trends 
     40   REAL(wp), ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:) ::   trdtx, trdty, trdt  ! use to store the temperature trends 
     41   REAL(wp), ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:) ::   avt_evd  ! store avt_evd to calculate EVD trend 
    4142 
    4243   !! * Substitutions 
     
    5556      !!                  ***  FUNCTION trd_tra_alloc  *** 
    5657      !!--------------------------------------------------------------------- 
    57       ALLOCATE( trdtx(jpi,jpj,jpk) , trdty(jpi,jpj,jpk) , trdt(jpi,jpj,jpk) , STAT= trd_tra_alloc ) 
     58      ALLOCATE( trdtx(jpi,jpj,jpk) , trdty(jpi,jpj,jpk) , trdt(jpi,jpj,jpk) , avt_evd(jpi,jpj,jpk), STAT= trd_tra_alloc ) 
    5859      ! 
    5960      IF( lk_mpp             )   CALL mpp_sum ( trd_tra_alloc ) 
     
    104105                                 ztrds(:,:,:) = 0._wp 
    105106                                 CALL trd_tra_mng( trdt, ztrds, ktrd, kt ) 
     107         CASE( jptra_evd )   ;   avt_evd(:,:,:) = ptrd(:,:,:) * tmask(:,:,:) 
    106108         CASE DEFAULT                 ! other trends: masked trends 
    107109            trdt(:,:,:) = ptrd(:,:,:) * tmask(:,:,:)              ! mask & store 
     
    128130            zwt(:,:,jpk) = 0._wp   ;   zws(:,:,jpk) = 0._wp 
    129131            DO jk = 2, jpk 
    130                zwt(:,:,jk) =   avt(:,:,jk) * ( tsa(:,:,jk-1,jp_tem) - tsa(:,:,jk,jp_tem) ) / fse3w(:,:,jk) * tmask(:,:,jk) 
     132               zwt(:,:,jk) = avt(:,:,jk) * ( tsa(:,:,jk-1,jp_tem) - tsa(:,:,jk,jp_tem) ) / fse3w(:,:,jk) * tmask(:,:,jk) 
    131133               zws(:,:,jk) = fsavs(:,:,jk) * ( tsa(:,:,jk-1,jp_sal) - tsa(:,:,jk,jp_sal) ) / fse3w(:,:,jk) * tmask(:,:,jk) 
    132134            END DO 
     
    138140            END DO 
    139141            CALL trd_tra_mng( ztrdt, ztrds, jptra_zdfp, kt )   
     142            ! 
     143            !                         ! Also calculate EVD trend at this point.  
     144            zwt(:,:,:) = 0._wp   ;   zws(:,:,:) = 0._wp            ! vertical diffusive fluxes 
     145            DO jk = 2, jpk 
     146               zwt(:,:,jk) = avt_evd(:,:,jk) * ( tsa(:,:,jk-1,jp_tem) - tsa(:,:,jk,jp_tem) ) / fse3w(:,:,jk) * tmask(:,:,jk) 
     147               zws(:,:,jk) = avt_evd(:,:,jk) * ( tsa(:,:,jk-1,jp_sal) - tsa(:,:,jk,jp_sal) ) / fse3w(:,:,jk) * tmask(:,:,jk) 
     148            END DO 
     149            ! 
     150            ztrdt(:,:,jpk) = 0._wp   ;   ztrds(:,:,jpk) = 0._wp 
     151            DO jk = 1, jpkm1 
     152               ztrdt(:,:,jk) = ( zwt(:,:,jk) - zwt(:,:,jk+1) ) / fse3t(:,:,jk) 
     153               ztrds(:,:,jk) = ( zws(:,:,jk) - zws(:,:,jk+1) ) / fse3t(:,:,jk)  
     154            END DO 
     155            CALL trd_tra_mng( ztrdt, ztrds, jptra_evd, kt )   
    140156            ! 
    141157            CALL wrk_dealloc( jpi, jpj, jpk, zwt, zws, ztrdt ) 
     
    312328                                  CALL wrk_dealloc( jpi, jpj, z2dx, z2dy ) 
    313329                               ENDIF 
     330      CASE( jptra_totad  ) ;   CALL iom_put( "ttrd_totad" , ptrdx )        ! total   advection 
     331                               CALL iom_put( "strd_totad" , ptrdy ) 
    314332      CASE( jptra_ldf  )   ;   CALL iom_put( "ttrd_ldf" , ptrdx )        ! lateral diffusion 
    315333                               CALL iom_put( "strd_ldf" , ptrdy ) 
     
    318336      CASE( jptra_zdfp )   ;   CALL iom_put( "ttrd_zdfp", ptrdx )        ! PURE vertical diffusion (no isoneutral contribution) 
    319337                               CALL iom_put( "strd_zdfp", ptrdy ) 
     338      CASE( jptra_evd )    ;   CALL iom_put( "ttrd_evd", ptrdx )         ! EVD trend (convection) 
     339                               CALL iom_put( "strd_evd", ptrdy ) 
     340      CASE( jptra_iso_x )  ;   CALL iom_put( "ttrd_iso_x", ptrdx )       ! x-component of isopycnal mixing 
     341                               CALL iom_put( "strd_iso_x", ptrdy ) 
     342      CASE( jptra_iso_y )  ;   CALL iom_put( "ttrd_iso_y", ptrdx )       ! y-component of isopycnal mixing 
     343                               CALL iom_put( "strd_iso_y", ptrdy ) 
     344      CASE( jptra_iso_z1 ) ;   CALL iom_put( "ttrd_iso_z1", ptrdx )      ! first part of z-component of isopycnal mixing 
     345                               CALL iom_put( "strd_iso_z1", ptrdy ) 
    320346      CASE( jptra_dmp  )   ;   CALL iom_put( "ttrd_dmp" , ptrdx )        ! internal restoring (damping) 
    321347                               CALL iom_put( "strd_dmp" , ptrdy ) 
     
    324350      CASE( jptra_npc  )   ;   CALL iom_put( "ttrd_npc" , ptrdx )        ! static instability mixing 
    325351                               CALL iom_put( "strd_npc" , ptrdy ) 
    326       CASE( jptra_nsr  )   ;   CALL iom_put( "ttrd_qns" , ptrdx )        ! surface forcing + runoff (ln_rnf=T) 
    327                                CALL iom_put( "strd_cdt" , ptrdy ) 
     352      CASE( jptra_nsr  )   ;   CALL iom_put( "ttrd_qns" , ptrdx(:,:,1) )        ! surface forcing + runoff (ln_rnf=T) 
     353                               CALL iom_put( "strd_cdt" , ptrdy(:,:,1) )        ! output as 2D surface fields 
    328354      CASE( jptra_qsr  )   ;   CALL iom_put( "ttrd_qsr" , ptrdx )        ! penetrative solar radiat. (only on temperature) 
    329355      CASE( jptra_bbc  )   ;   CALL iom_put( "ttrd_bbc" , ptrdx )        ! geothermal heating   (only on temperature) 
    330356      CASE( jptra_atf  )   ;   CALL iom_put( "ttrd_atf" , ptrdx )        ! asselin time Filter 
    331357                               CALL iom_put( "strd_atf" , ptrdy ) 
     358      CASE( jptra_tot  )   ;   CALL iom_put( "ttrd_tot" , ptrdx )        ! model total trend 
     359                               CALL iom_put( "strd_tot" , ptrdy ) 
    332360      END SELECT 
    333361      ! 
  • branches/UKMO/dev_r5518_GO6_package_XIOS_read/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/ZDF/zdfevd.F90

    r6486 r7923  
    1919   USE zdf_oce         ! ocean vertical physics variables 
    2020   USE zdfkpp          ! KPP vertical mixing 
     21   USE trd_oce         ! trends: ocean variables 
     22   USE trdtra          ! trends manager: tracers  
    2123   USE in_out_manager  ! I/O manager 
    2224   USE iom             ! for iom_put 
     
    122124      zavt_evd(:,:,:) = avt(:,:,:) - zavt_evd(:,:,:)   ! change in avt due to evd 
    123125      CALL iom_put( "avt_evd", zavt_evd )              ! output this change 
     126      IF( l_trdtra ) CALL trd_tra( kt, 'TRA', jp_tem, jptra_evd, zavt_evd ) 
    124127      ! 
    125128      IF( nn_timing == 1 )  CALL timing_stop('zdf_evd') 
  • branches/UKMO/dev_r5518_GO6_package_XIOS_read/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/ZDF/zdfmxl.F90

    r6533 r7923  
    147147      ! no need to output in offline mode 
    148148      IF( .NOT.lk_offline ) THEN    
    149       IF( kt >= nit000 ) THEN               ! workaround for calls before SOMETHING reads the XIOS namelist 
    150149         IF ( iom_use("mldr10_1") ) THEN 
    151150            IF( ln_isfcav ) THEN 
     
    162161            END IF 
    163162         END IF 
    164       ENDIF 
    165163      ENDIF 
    166164       
     
    482480         mld_diags(5) = sn_mld5 
    483481 
    484          IF( nn_mld_diag > 0 ) THEN 
     482         IF( lwp .AND. (nn_mld_diag > 0) ) THEN 
    485483            WRITE(numout,*) '=============== Vertically-interpolated mixed layer ================' 
    486484            WRITE(numout,*) '(Diagnostic number, nn_mld_type, rn_zref, rn_dT_crit, rn_iso_frac)' 
  • branches/UKMO/dev_r5518_GO6_package_XIOS_read/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/ZDF/zdftmx.F90

    r6498 r7923  
    918918         CALL iom_put( "pcmap_tmx", pcmap_tmx ) 
    919919      ENDIF 
    920       CALL iom_put( "bn2", rn2 ) 
    921920      CALL iom_put( "emix_tmx", emix_tmx ) 
    922921       
  • branches/UKMO/dev_r5518_GO6_package_XIOS_read/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/nemogcm.F90

    r6487 r7923  
    462462      !                                     ! Diagnostics 
    463463      IF( lk_floats     )   CALL     flo_init   ! drifting Floats 
    464       IF( lk_diaar5     )   CALL dia_ar5_init   ! ar5 diag 
    465464                            CALL dia_ptr_init   ! Poleward TRansports initialization 
    466465      IF( lk_diadct     )   CALL dia_dct_init   ! Sections tranports 
  • branches/UKMO/dev_r5518_GO6_package_XIOS_read/NEMOGCM/NEMO/TOP_SRC/TRP/trcadv.F90

    r6486 r7923  
    2626   USE traadv_mle      ! ML eddy induced velocity  (tra_adv_mle    routine) 
    2727   USE ldftra_oce      ! lateral diffusion coefficient on tracers 
     28   USE trd_oce 
     29   USE trdtra 
    2830   USE prtctl_trc      ! Print control 
    2931 
     
    7476      CHARACTER (len=22) ::   charout 
    7577      REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:,:) :: zun, zvn, zwn  ! effective velocity 
     78      REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:,:,:) ::   ztrtrd 
    7679      !!---------------------------------------------------------------------- 
    7780      ! 
     
    111114      IF( ln_mle    )   CALL tra_adv_mle( kt, nittrc000, zun, zvn, zwn, 'TRC' )    ! add the mle transport (if necessary) 
    112115      ! 
     116      IF( l_trdtrc )  THEN 
     117         CALL wrk_alloc( jpi, jpj, jpk, jptra, ztrtrd ) 
     118         ztrtrd(:,:,:,:)  = tra(:,:,:,:) 
     119      ENDIF 
     120      ! 
    113121      SELECT CASE ( nadv )                            !==  compute advection trend and add it to general trend  ==! 
    114122      CASE ( 1 )   ;    CALL tra_adv_cen2  ( kt, nittrc000, 'TRC',       zun, zvn, zwn, trb, trn, tra, jptra )   !  2nd order centered 
     
    140148         ! 
    141149      END SELECT 
     150      ! 
     151      IF( l_trdtrc )   THEN                      ! save the advective trends for further diagnostics 
     152        DO jn = 1, jptra 
     153           ztrtrd(:,:,:,jn) = tra(:,:,:,jn) - ztrtrd(:,:,:,jn) 
     154           CALL trd_tra( kt, 'TRC', jn, jptra_totad, ztrtrd(:,:,:,jn) ) 
     155        END DO 
     156        CALL wrk_dealloc( jpi, jpj, jpk, jptra, ztrtrd ) 
     157      ENDIF 
    142158 
    143159      !                                              ! print mean trends (used for debugging) 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.